View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8548A_low_103 (Length: 305)

Name: NF8548A_low_103
Description: NF8548A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8548A_low_103
NF8548A_low_103
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (3-294)||(11279-11570)
[»] chr6 (82 HSPs)
chr6 (3-294)||(34963364-34963654)
chr6 (3-294)||(30676591-30676881)
chr6 (3-280)||(8055034-8055310)
chr6 (3-280)||(12742322-12742598)
chr6 (3-280)||(19005051-19005326)
chr6 (3-280)||(22782232-22782507)
chr6 (3-280)||(24422552-24422827)
chr6 (3-280)||(33861799-33862074)
chr6 (3-280)||(33864283-33864558)
chr6 (3-280)||(18334474-18334749)
chr6 (3-280)||(19858801-19859076)
chr6 (3-280)||(26924522-26924797)
chr6 (3-280)||(1540793-1541068)
chr6 (3-280)||(2291062-2291337)
chr6 (3-280)||(25688507-25688783)
chr6 (16-280)||(25656634-25656897)
chr6 (93-280)||(25754814-25755001)
chr6 (70-280)||(1595554-1595763)
chr6 (93-280)||(20556864-20557049)
chr6 (106-269)||(18456735-18456898)
chr6 (111-280)||(16448514-16448684)
chr6 (107-280)||(3852001-3852174)
chr6 (3-294)||(19847849-19848122)
chr6 (136-269)||(18461895-18462028)
chr6 (123-280)||(25629310-25629468)
chr6 (3-123)||(12942363-12942482)
chr6 (123-290)||(18409782-18409950)
chr6 (126-280)||(29060548-29060703)
chr6 (123-274)||(20360915-20361067)
chr6 (163-280)||(20593781-20593899)
chr6 (140-280)||(17287768-17287909)
chr6 (3-102)||(31630528-31630626)
chr6 (123-272)||(16496260-16496410)
chr6 (123-273)||(25644335-25644487)
chr6 (3-118)||(18913994-18914107)
chr6 (163-280)||(19303536-19303653)
chr6 (3-294)||(23992421-23992703)
chr6 (3-122)||(28289218-28289334)
chr6 (3-122)||(15875469-15875586)
chr6 (123-269)||(18821801-18821946)
chr6 (108-280)||(22780166-22780340)
chr6 (176-280)||(20076708-20076812)
chr6 (138-280)||(20638253-20638396)
chr6 (3-81)||(17377729-17377807)
chr6 (3-74)||(18914142-18914213)
chr6 (108-273)||(20109153-20109322)
chr6 (3-74)||(31630422-31630493)
chr6 (3-75)||(1598266-1598337)
chr6 (106-287)||(8227448-8227631)
chr6 (227-280)||(25714425-25714478)
chr6 (3-74)||(19005361-19005432)
chr6 (3-50)||(25535641-25535688)
chr6 (52-118)||(18937252-18937317)
chr6 (25-74)||(15875621-15875670)
chr6 (167-269)||(23019425-23019528)
chr6 (160-261)||(15041542-15041644)
chr6 (227-280)||(27333277-27333331)
chr6 (227-280)||(27394017-27394071)
chr6 (123-269)||(35245605-35245749)
chr6 (171-273)||(19668386-19668491)
chr6 (174-273)||(9098518-9098620)
chr6 (167-274)||(19652209-19652316)
chr6 (174-271)||(28496477-28496575)
chr6 (174-271)||(29808888-29808986)
chr6 (3-74)||(35056707-35056778)
chr6 (190-294)||(25603406-25603512)
chr6 (190-294)||(25611744-25611850)
chr6 (138-265)||(16920602-16920728)
chr6 (230-261)||(19790842-19790873)
chr6 (241-280)||(22080799-22080838)
chr6 (3-58)||(32259078-32259133)
chr6 (235-269)||(11185524-11185558)
chr6 (3-77)||(15875565-15875639)
chr6 (36-66)||(17883303-17883333)
chr6 (230-280)||(19862982-19863032)
chr6 (230-280)||(19873124-19873174)
chr6 (227-261)||(21766718-21766752)
chr6 (235-272)||(1561319-1561356)
chr6 (200-280)||(22432253-22432334)
chr6 (200-280)||(22438803-22438884)
chr6 (227-267)||(22831524-22831565)
chr6 (227-267)||(33443068-33443108)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (3-280)||(16413197-16413473)
chr8 (3-280)||(14409326-14409601)
chr8 (3-280)||(20403232-20403507)
chr8 (3-280)||(1484407-1484682)
chr8 (3-280)||(5853174-5853449)
chr8 (3-280)||(22001758-22002033)
chr8 (3-280)||(4483286-4483561)
chr8 (3-280)||(15203113-15203388)
chr8 (3-280)||(4542255-4542530)
chr8 (3-280)||(20046077-20046352)
chr8 (3-280)||(19896270-19896549)
chr8 (3-285)||(45290576-45290857)
chr8 (3-272)||(15070571-15070841)
chr8 (3-280)||(14823779-14824055)
chr8 (3-280)||(19936885-19937163)
chr8 (106-280)||(41598193-41598367)
chr8 (3-172)||(24485925-24486093)
chr8 (106-290)||(26223914-26224098)
chr8 (108-269)||(19801367-19801527)
chr8 (93-280)||(25484245-25484425)
chr8 (3-162)||(32810054-32810211)
chr8 (123-280)||(16092297-16092455)
chr8 (108-280)||(18818348-18818522)
chr8 (123-280)||(6759266-6759421)
chr8 (123-290)||(28648999-28649167)
chr8 (135-280)||(7372786-7372932)
chr8 (123-280)||(20536216-20536374)
chr8 (3-294)||(32121726-32122009)
chr8 (143-276)||(26219726-26219858)
chr8 (138-272)||(21918969-21919105)
chr8 (3-102)||(27472298-27472395)
chr8 (123-280)||(22875073-22875230)
chr8 (122-280)||(23406387-23406548)
chr8 (3-294)||(18677946-18678229)
chr8 (140-280)||(21923900-21924041)
chr8 (167-280)||(26225292-26225404)
chr8 (3-102)||(38549992-38550090)
chr8 (123-280)||(22626744-22626901)
chr8 (3-102)||(20982608-20982710)
chr8 (106-270)||(13508022-13508188)
chr8 (106-270)||(13597554-13597720)
chr8 (123-280)||(18879191-18879344)
chr8 (106-269)||(20498581-20498746)
chr8 (3-74)||(13425340-13425411)
chr8 (3-74)||(20982502-20982573)
chr8 (160-294)||(23648547-23648682)
chr8 (3-74)||(38549886-38549957)
chr8 (138-272)||(31971273-31971407)
chr8 (3-122)||(1326919-1327042)
chr8 (10-74)||(13425241-13425305)
chr8 (3-63)||(16198115-16198175)
chr8 (117-287)||(17612059-17612230)
chr8 (3-72)||(16401806-16401875)
chr8 (127-280)||(38855212-38855364)
chr8 (3-74)||(1326813-1326884)
chr8 (3-111)||(16401912-16402020)
chr8 (167-279)||(21285606-21285719)
chr8 (3-63)||(25658034-25658094)
chr8 (171-280)||(6520376-6520486)
chr8 (189-269)||(45131019-45131098)
chr8 (106-269)||(37116366-37116532)
chr8 (3-54)||(24048841-24048892)
chr8 (3-74)||(21513636-21513707)
chr8 (138-269)||(16199615-16199746)
chr8 (171-273)||(983407-983512)
chr8 (3-74)||(18815612-18815683)
chr8 (170-269)||(21389454-21389552)
chr8 (170-269)||(21395984-21396082)
chr8 (170-269)||(21778780-21778878)
chr8 (170-269)||(21790477-21790575)
chr8 (106-207)||(17266930-17267031)
chr8 (3-81)||(19896524-19896602)
chr8 (3-77)||(20403486-20403560)
chr8 (174-269)||(5866280-5866376)
chr8 (25-74)||(19936801-19936850)
chr8 (167-274)||(21673718-21673826)
chr8 (127-273)||(23760805-23760950)
chr8 (186-272)||(17140932-17141019)
chr8 (123-207)||(17439461-17439544)
chr8 (174-272)||(21491011-21491110)
chr8 (7-74)||(5083001-5083068)
chr8 (3-74)||(36733305-36733376)
chr8 (3-74)||(38988730-38988801)
chr8 (3-74)||(39019827-39019898)
chr8 (168-274)||(26355699-26355805)
chr8 (3-77)||(15203060-15203134)
chr8 (3-77)||(19936832-19936906)
chr8 (238-272)||(21249400-21249434)
chr8 (238-272)||(21255238-21255272)
chr8 (12-77)||(32810190-32810255)
chr8 (3-64)||(38549939-38550000)
chr8 (82-122)||(35026855-35026895)
chr8 (167-207)||(40492850-40492890)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (3-276)||(4703-4975)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (3-280)||(3515012-3515288)
chr4 (3-294)||(14970588-14970878)
chr4 (3-294)||(19618054-19618343)
chr4 (3-280)||(18215156-18215431)
chr4 (3-280)||(19242704-19242981)
chr4 (3-280)||(12189-12464)
chr4 (3-280)||(15118234-15118509)
chr4 (3-280)||(44615293-44615569)
chr4 (3-280)||(52312515-52312790)
chr4 (3-285)||(15355206-15355487)
chr4 (3-280)||(50222221-50222496)
chr4 (3-280)||(44772965-44773244)
chr4 (3-280)||(18239301-18239576)
chr4 (33-280)||(1837420-1837666)
chr4 (3-280)||(7641068-7641339)
chr4 (93-280)||(51463838-51464025)
chr4 (93-280)||(23803235-23803422)
chr4 (106-280)||(44102219-44102393)
chr4 (93-280)||(12610955-12611135)
chr4 (117-280)||(44928873-44929037)
chr4 (106-269)||(21815568-21815731)
chr4 (106-287)||(15367691-15367873)
chr4 (106-287)||(15402704-15402886)
chr4 (106-287)||(15371203-15371385)
chr4 (106-287)||(15373484-15373666)
chr4 (111-280)||(20149834-20150004)
chr4 (106-287)||(15370019-15370200)
chr4 (109-287)||(16223533-16223712)
chr4 (167-280)||(14280321-14280434)
chr4 (143-280)||(54798729-54798867)
chr4 (123-280)||(16377478-16377634)
chr4 (123-280)||(7088885-7089043)
chr4 (108-280)||(7798782-7798956)
chr4 (123-280)||(14038656-14038814)
chr4 (3-123)||(15534343-15534462)
chr4 (123-272)||(12902773-12902923)
chr4 (123-280)||(22636443-22636601)
chr4 (3-122)||(14048740-14048858)
chr4 (3-122)||(36038033-36038151)
chr4 (3-122)||(49547655-49547773)
chr4 (170-280)||(52873369-52873480)
chr4 (123-280)||(7893711-7893869)
chr4 (3-122)||(15496953-15497070)
chr4 (123-280)||(16270191-16270348)
chr4 (112-269)||(22353852-22354010)
chr4 (123-280)||(44052837-44052995)
chr4 (3-121)||(52873060-52873176)
chr4 (167-280)||(8574868-8574980)
chr4 (125-280)||(16239927-16240082)
chr4 (106-269)||(13788-13953)
chr4 (123-280)||(6899899-6900056)
chr4 (123-272)||(23374314-23374464)
chr4 (106-273)||(52243131-52243302)
chr4 (3-74)||(362390-362461)
chr4 (3-122)||(14746499-14746618)
chr4 (108-273)||(43198492-43198661)
chr4 (3-74)||(15355100-15355171)
chr4 (3-74)||(19617948-19618019)
chr4 (3-74)||(52872954-52873025)
chr4 (3-81)||(19857685-19857763)
chr4 (3-74)||(15496055-15496126)
chr4 (3-74)||(18215050-18215121)
chr4 (3-66)||(29267571-29267634)
chr4 (203-272)||(3096309-3096379)
chr4 (3-74)||(14746393-14746464)
chr4 (33-102)||(362268-362336)
chr4 (125-214)||(15464888-15464977)
chr4 (163-274)||(12774021-12774132)
chr4 (25-74)||(19857798-19857847)
chr4 (171-273)||(12288211-12288316)
chr4 (179-280)||(39706299-39706401)
chr4 (172-269)||(14053306-14053403)
chr4 (106-269)||(46640393-46640558)
chr4 (3-77)||(52312769-52312843)
chr4 (106-269)||(53082089-53082254)
chr4 (160-269)||(6190481-6190592)
chr4 (170-269)||(17046506-17046604)
chr4 (227-272)||(15551833-15551879)
chr4 (69-122)||(19857607-19857661)
chr4 (22-86)||(26922388-26922452)
chr4 (3-77)||(12136-12210)
chr4 (227-261)||(11250621-11250655)
chr4 (227-261)||(15353367-15353401)
chr4 (108-196)||(8846465-8846553)
chr4 (230-279)||(20157522-20157571)
chr4 (227-274)||(8846370-8846418)
chr4 (38-86)||(13164582-13164630)
chr4 (22-74)||(26922437-26922489)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (3-280)||(9707488-9707764)
chr3 (3-294)||(13544016-13544305)
chr3 (3-280)||(45606788-45607064)
chr3 (3-294)||(12567551-12567840)
chr3 (6-280)||(7781231-7781504)
chr3 (3-280)||(8899099-8899374)
chr3 (3-280)||(16454163-16454438)
chr3 (3-280)||(17463183-17463458)
chr3 (3-277)||(38961773-38962045)
chr3 (3-280)||(16282693-16282968)
chr3 (3-280)||(34159331-34159606)
chr3 (3-280)||(55476496-55476771)
chr3 (3-280)||(6469016-6469291)
chr3 (3-280)||(13154137-13154413)
chr3 (3-280)||(41123895-41124167)
chr3 (13-280)||(10247615-10247880)
chr3 (3-280)||(8499523-8499801)
chr3 (3-280)||(13151672-13151948)
chr3 (6-280)||(15412434-15412709)
chr3 (33-280)||(28848522-28848768)
chr3 (3-280)||(27165255-27165533)
chr3 (82-280)||(17446614-17446811)
chr3 (3-280)||(53301385-53301664)
chr3 (93-277)||(50242830-50243014)
chr3 (106-280)||(29172565-29172740)
chr3 (106-280)||(17672631-17672805)
chr3 (106-280)||(12119707-12119882)
chr3 (106-269)||(53070636-53070799)
chr3 (93-269)||(43550448-43550625)
chr3 (155-280)||(15977520-15977645)
chr3 (123-280)||(14972862-14973020)
chr3 (123-280)||(40213676-40213833)
chr3 (172-280)||(55500947-55501055)
chr3 (143-280)||(36166603-36166739)
chr3 (123-280)||(17487864-17488022)
chr3 (123-280)||(17499346-17499504)
chr3 (107-270)||(42386428-42386593)
chr3 (3-294)||(46822259-46822542)
chr3 (3-122)||(54520985-54521103)
chr3 (123-280)||(25476340-25476498)
chr3 (108-280)||(43840940-43841114)
chr3 (123-274)||(14576788-14576939)
chr3 (143-275)||(21618459-21618590)
chr3 (108-273)||(26686902-26687069)
chr3 (123-280)||(13442282-13442440)
chr3 (3-115)||(12305315-12305426)
chr3 (138-272)||(12399225-12399360)
chr3 (170-280)||(18438542-18438653)
chr3 (138-280)||(20698405-20698548)
chr3 (167-280)||(10556990-10557104)
chr3 (123-280)||(23083316-23083474)
chr3 (123-280)||(24153164-24153321)
chr3 (186-280)||(44494814-44494908)
chr3 (106-287)||(24340660-24340843)
chr3 (3-102)||(10557091-10557189)
chr3 (3-122)||(15977696-15977813)
chr3 (3-120)||(29544723-29544839)
chr3 (160-274)||(14572603-14572717)
chr3 (106-270)||(23274705-23274871)
chr3 (187-280)||(17737241-17737337)
chr3 (3-74)||(12119535-12119606)
chr3 (108-269)||(52523666-52523831)
chr3 (3-122)||(11913932-11914051)
chr3 (123-280)||(11424718-11424872)
chr3 (3-79)||(17444698-17444773)
chr3 (108-207)||(2051138-2051238)
chr3 (3-63)||(13436520-13436580)
chr3 (106-287)||(37642202-37642385)
chr3 (170-294)||(12511051-12511176)
chr3 (106-169)||(17248224-17248287)
chr3 (117-214)||(22147474-22147571)
chr3 (190-294)||(30029834-30029939)
chr3 (163-274)||(32307691-32307802)
chr3 (167-273)||(15470939-15471046)
chr3 (3-66)||(25237009-25237071)
chr3 (108-274)||(16097342-16097509)
chr3 (108-274)||(16103794-16103960)
chr3 (232-280)||(45577947-45577995)
chr3 (171-280)||(14234495-14234605)
chr3 (3-50)||(24513910-24513957)
chr3 (227-280)||(28194698-28194752)
chr3 (106-269)||(37251105-37251270)
chr3 (174-272)||(13210333-13210432)
chr3 (174-274)||(12174265-12174366)
chr3 (3-77)||(17444645-17444719)
chr3 (3-77)||(38961720-38961794)
chr3 (3-64)||(25229476-25229537)
chr3 (3-64)||(25237063-25237124)
chr3 (125-269)||(43925977-43926123)
chr3 (3-74)||(25201323-25201394)
chr3 (3-77)||(41124146-41124220)
chr3 (163-274)||(49668071-49668183)
chr3 (227-280)||(856144-856197)
chr3 (227-280)||(14665405-14665458)
chr3 (227-280)||(23077537-23077590)
chr3 (230-261)||(3389999-3390030)
chr3 (3-58)||(15025937-15025992)
chr3 (3-77)||(16282639-16282714)
chr3 (230-280)||(14668561-14668611)
chr3 (230-280)||(15878114-15878164)
chr3 (16-74)||(40812144-40812202)
chr3 (183-274)||(9512934-9513026)
chr3 (183-274)||(9520909-9521001)
chr3 (3-64)||(17044330-17044391)
chr3 (227-267)||(13919350-13919390)
chr3 (236-280)||(26196500-26196544)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (6-280)||(17324-17597)
scaffold0023 (3-280)||(94416-94691)
scaffold0023 (126-280)||(44459-44614)
scaffold0023 (127-274)||(100388-100534)
scaffold0023 (127-274)||(40135-40281)
scaffold0023 (227-272)||(119891-119937)
scaffold0023 (230-280)||(38542-38592)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (3-280)||(23593615-23593892)
chr1 (3-286)||(21840766-21841047)
chr1 (3-280)||(21474968-21475244)
chr1 (3-294)||(16361908-16362199)
chr1 (3-280)||(13988871-13989146)
chr1 (3-280)||(21923173-21923448)
chr1 (3-280)||(29776693-29776968)
chr1 (3-280)||(31612318-31612593)
chr1 (3-280)||(29298142-29298416)
chr1 (3-280)||(16275244-16275521)
chr1 (3-280)||(22122949-22123225)
chr1 (3-280)||(15859890-15860166)
chr1 (106-280)||(13212844-13213019)
chr1 (106-280)||(21346966-21347141)
chr1 (93-269)||(45574812-45574989)
chr1 (106-280)||(21342101-21342276)
chr1 (106-280)||(433017-433190)
chr1 (106-280)||(21707172-21707346)
chr1 (106-280)||(21711714-21711888)
chr1 (111-280)||(40389159-40389329)
chr1 (123-290)||(50210168-50210336)
chr1 (123-272)||(27250684-27250834)
chr1 (163-280)||(34509788-34509906)
chr1 (123-280)||(22532277-22532435)
chr1 (123-294)||(22468651-22468823)
chr1 (106-269)||(21896193-21896358)
chr1 (3-100)||(22050771-22050866)
chr1 (160-294)||(20135181-20135316)
chr1 (109-269)||(21861510-21861672)
chr1 (123-272)||(21026696-21026846)
chr1 (117-273)||(16758664-16758822)
chr1 (3-74)||(16275138-16275209)
chr1 (108-273)||(33681022-33681188)
chr1 (106-269)||(35261018-35261180)
chr1 (227-294)||(20454613-20454680)
chr1 (187-272)||(20847173-20847259)
chr1 (3-81)||(27161521-27161598)
chr1 (163-274)||(21754059-21754170)
chr1 (3-64)||(27161468-27161529)
chr1 (106-269)||(41049973-41050138)
chr1 (123-212)||(22354527-22354616)
chr1 (167-274)||(22921868-22921976)
chr1 (127-273)||(22237642-22237788)
chr1 (106-268)||(14295493-14295652)
chr1 (174-274)||(20248293-20248394)
chr1 (3-77)||(22050718-22050792)
chr1 (3-77)||(22122896-22122970)
chr1 (3-77)||(29776947-29777021)
chr1 (3-77)||(31612572-31612646)
chr1 (68-122)||(43543214-43543267)
chr1 (3-64)||(29298408-29298469)
chr1 (3-64)||(29298461-29298522)
chr1 (106-269)||(50614053-50614219)
chr1 (106-269)||(50621881-50622047)
chr1 (174-272)||(20918620-20918719)
chr1 (230-280)||(21714550-21714600)
chr1 (110-207)||(50686695-50686792)
chr1 (235-273)||(52928038-52928076)
chr1 (117-201)||(12271642-12271725)
chr1 (3-82)||(12710129-12710208)
chr1 (213-274)||(21161730-21161792)
chr1 (230-280)||(24783155-24783205)
chr1 (227-280)||(42865273-42865326)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-280)||(20752-21028)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (3-280)||(37826-38102)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (3-280)||(456326-456602)
chr7 (3-280)||(11393168-11393444)
chr7 (3-280)||(16232525-16232801)
chr7 (3-280)||(41522922-41523198)
chr7 (3-280)||(41525384-41525660)
chr7 (3-280)||(16213689-16213965)
chr7 (3-280)||(27216865-27217141)
chr7 (3-280)||(15376595-15376870)
chr7 (3-280)||(20385005-20385280)
chr7 (3-280)||(21189477-21189752)
chr7 (3-280)||(32125496-32125771)
chr7 (3-280)||(14949004-14949279)
chr7 (3-280)||(11972501-11972776)
chr7 (3-280)||(18430717-18430992)
chr7 (25-280)||(24702243-24702497)
chr7 (3-280)||(18640277-18640552)
chr7 (3-280)||(16410064-16410339)
chr7 (25-280)||(24704693-24704944)
chr7 (3-280)||(13869351-13869629)
chr7 (3-230)||(26355863-26356090)
chr7 (3-230)||(26358315-26358542)
chr7 (106-280)||(44116514-44116688)
chr7 (107-280)||(3386338-3386511)
chr7 (93-269)||(13647344-13647521)
chr7 (136-294)||(24275162-24275320)
chr7 (106-280)||(17061898-17062072)
chr7 (106-280)||(38898359-38898534)
chr7 (108-280)||(20110561-20110723)
chr7 (106-269)||(12756654-12756817)
chr7 (3-192)||(15081829-15082019)
chr7 (166-280)||(48273397-48273512)
chr7 (123-280)||(3564319-3564477)
chr7 (3-123)||(11303409-11303528)
chr7 (159-280)||(13831378-13831499)
chr7 (123-280)||(12698839-12698998)
chr7 (123-280)||(18456368-18456525)
chr7 (117-272)||(26212012-26212168)
chr7 (3-122)||(29796771-29796891)
chr7 (3-122)||(29800590-29800710)
chr7 (3-122)||(14269944-14270061)
chr7 (3-122)||(16108570-16108688)
chr7 (123-280)||(9509197-9509355)
chr7 (123-280)||(38227489-38227646)
chr7 (25-140)||(13841157-13841270)
chr7 (3-134)||(18627717-18627846)
chr7 (3-122)||(23664834-23664952)
chr7 (3-102)||(45847642-45847739)
chr7 (106-273)||(2280056-2280225)
chr7 (3-122)||(38898110-38898229)
chr7 (170-272)||(10589055-10589158)
chr7 (3-74)||(14269838-14269909)
chr7 (3-122)||(8940335-8940454)
chr7 (167-273)||(15144037-15144143)
chr7 (3-74)||(8940489-8940560)
chr7 (3-74)||(15081723-15081794)
chr7 (3-74)||(38898004-38898075)
chr7 (33-122)||(8468803-8468891)
chr7 (3-74)||(8468945-8469016)
chr7 (3-72)||(45847536-45847605)
chr7 (166-280)||(67753-67868)
chr7 (167-280)||(22072921-22073036)
chr7 (106-287)||(19486681-19486864)
chr7 (106-270)||(10063760-10063921)
chr7 (108-266)||(12255730-12255892)
chr7 (127-274)||(18005660-18005806)
chr7 (138-269)||(40443410-40443541)
chr7 (167-273)||(16056343-16056449)
chr7 (117-201)||(15113031-15113114)
chr7 (171-280)||(47831815-47831925)
chr7 (183-280)||(14932749-14932847)
chr7 (183-280)||(15356184-15356282)
chr7 (183-280)||(15360298-15360396)
chr7 (160-272)||(16386239-16386353)
chr7 (106-273)||(1867932-1868101)
chr7 (117-201)||(15116568-15116651)
chr7 (174-272)||(34200802-34200901)
chr7 (106-269)||(16495421-16495581)
chr7 (179-274)||(811142-811238)
chr7 (3-64)||(13841274-13841335)
chr7 (160-294)||(15211450-15211586)
chr7 (170-273)||(16219719-16219823)
chr7 (3-79)||(13745572-13745648)
chr7 (176-274)||(44014192-44014291)
chr7 (7-74)||(15119926-15119993)
chr7 (191-280)||(28505321-28505411)
chr7 (3-77)||(11972755-11972829)
chr7 (106-207)||(15008436-15008536)
chr7 (227-280)||(18154901-18154954)
chr7 (3-64)||(38294567-38294628)
chr7 (106-207)||(20220127-20220225)
chr7 (170-269)||(27847834-27847932)
chr7 (230-280)||(2832504-2832554)
chr7 (227-261)||(9446218-9446252)
chr7 (230-280)||(19649552-19649602)
chr7 (227-261)||(20569656-20569690)
chr7 (235-272)||(11996095-11996132)
chr7 (227-280)||(12187023-12187076)
chr7 (235-272)||(15754955-15754992)
chr7 (227-280)||(17138120-17138173)
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (25-294)||(32214824-32215092)
chr2 (3-280)||(39682318-39682594)
chr2 (3-280)||(571402-571678)
chr2 (3-280)||(6726000-6726275)
chr2 (3-280)||(18808948-18809223)
chr2 (3-280)||(21154942-21155217)
chr2 (3-280)||(23130867-23131143)
chr2 (3-280)||(23133334-23133610)
chr2 (3-280)||(23709414-23709689)
chr2 (3-280)||(23711895-23712170)
chr2 (3-280)||(34402403-34402679)
chr2 (3-277)||(24367782-24368054)
chr2 (3-280)||(26505384-26505659)
chr2 (3-280)||(26507862-26508137)
chr2 (3-280)||(22105417-22105693)
chr2 (3-280)||(24898077-24898353)
chr2 (3-280)||(24905514-24905790)
chr2 (3-280)||(24907989-24908265)
chr2 (3-280)||(24900560-24900836)
chr2 (3-280)||(24903037-24903313)
chr2 (3-280)||(28577104-28577379)
chr2 (3-280)||(32039380-32039655)
chr2 (33-280)||(23135595-23135841)
chr2 (3-280)||(38967379-38967654)
chr2 (52-280)||(45029784-45030011)
chr2 (3-280)||(24529428-24529686)
chr2 (107-280)||(43137304-43137477)
chr2 (3-200)||(24642736-24642933)
chr2 (123-280)||(22337123-22337281)
chr2 (3-123)||(20261381-20261500)
chr2 (123-280)||(23060521-23060679)
chr2 (123-280)||(23076450-23076608)
chr2 (3-294)||(25616179-25616462)
chr2 (3-122)||(10684644-10684764)
chr2 (123-280)||(22731189-22731347)
chr2 (108-287)||(19671831-19672010)
chr2 (123-280)||(22738135-22738292)
chr2 (123-280)||(298769-298928)
chr2 (123-280)||(23285873-23286027)
chr2 (123-280)||(23660031-23660188)
chr2 (3-122)||(23707204-23707323)
chr2 (123-272)||(23654341-23654491)
chr2 (3-122)||(24671081-24671200)
chr2 (3-122)||(24918196-24918315)
chr2 (207-280)||(24643034-24643107)
chr2 (108-273)||(23708558-23708725)
chr2 (3-74)||(23707098-23707169)
chr2 (3-74)||(24642630-24642701)
chr2 (3-74)||(24671235-24671306)
chr2 (3-74)||(24681654-24681725)
chr2 (3-74)||(24918350-24918421)
chr2 (3-122)||(24681500-24681619)
chr2 (167-274)||(28405990-28406099)
chr2 (189-272)||(38136-38219)
chr2 (3-74)||(38967689-38967760)
chr2 (123-269)||(7688-7835)
chr2 (160-269)||(23103389-23103497)
chr2 (93-162)||(22173799-22173868)
chr2 (138-269)||(20309127-20309257)
chr2 (227-280)||(23040249-23040302)
chr2 (117-193)||(22459511-22459587)
chr2 (106-207)||(23791357-23791458)
chr2 (127-274)||(25175864-25176010)
chr2 (212-280)||(8946665-8946734)
chr2 (106-269)||(20520130-20520295)
chr2 (106-269)||(23207296-23207461)
chr2 (106-146)||(29601478-29601518)
chr2 (160-269)||(32451920-32452031)
chr2 (171-280)||(7679593-7679702)
chr2 (3-74)||(21368365-21368436)
chr2 (3-58)||(45027786-45027840)
chr2 (3-77)||(22105672-22105746)
chr2 (5-81)||(22686145-22686221)
chr2 (3-74)||(23799457-23799528)
chr2 (3-77)||(6726254-6726328)
chr2 (235-273)||(18786971-18787009)
chr2 (3-77)||(21154889-21154963)
chr2 (3-77)||(24368033-24368107)
chr2 (106-207)||(24697543-24697644)
chr2 (3-77)||(41523954-41524028)
chr2 (163-267)||(22134203-22134306)
chr2 (230-261)||(24869903-24869934)
chr2 (230-261)||(25961597-25961628)
chr2 (3-42)||(41524007-41524045)
chr2 (160-261)||(22799118-22799220)
chr2 (167-201)||(23004838-23004872)
chr2 (227-261)||(24655398-24655432)
chr2 (227-267)||(23287384-23287424)
chr2 (227-267)||(26392403-26392443)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (3-286)||(10772-11053)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (3-280)||(13952-14228)
scaffold0230 (3-75)||(23412-23484)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (3-286)||(9241-9522)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (3-280)||(13397-13673)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (17-294)||(501075-501351)
scaffold0001 (106-280)||(85562-85737)
scaffold0001 (167-274)||(160698-160805)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (3-280)||(264650-264925)
chr5 (3-280)||(39363389-39363665)
chr5 (3-280)||(42245247-42245522)
chr5 (3-280)||(32027398-32027673)
chr5 (3-280)||(20909017-20909292)
chr5 (3-280)||(10732822-10733097)
chr5 (3-280)||(39245141-39245416)
chr5 (3-280)||(29329939-29330211)
chr5 (13-280)||(29345985-29346250)
chr5 (13-280)||(29348458-29348723)
chr5 (13-280)||(29350931-29351196)
chr5 (3-280)||(20917834-20918105)
chr5 (3-280)||(23064516-23064794)
chr5 (3-280)||(38619439-38619717)
chr5 (3-273)||(20901908-20902159)
chr5 (3-280)||(2154513-2154771)
chr5 (106-280)||(36154766-36154937)
chr5 (108-280)||(11581184-11581356)
chr5 (111-280)||(18319021-18319191)
chr5 (106-280)||(31061073-31061248)
chr5 (106-280)||(10775659-10775833)
chr5 (111-280)||(24067112-24067282)
chr5 (123-280)||(23390451-23390609)
chr5 (123-287)||(1096468-1096633)
chr5 (3-294)||(17517045-17517328)
chr5 (123-280)||(9077960-9078118)
chr5 (123-280)||(25421540-25421698)
chr5 (123-272)||(21729019-21729169)
chr5 (123-272)||(21808344-21808494)
chr5 (163-280)||(24529228-24529346)
chr5 (123-268)||(25431414-25431560)
chr5 (123-280)||(8286797-8286956)
chr5 (3-122)||(9776521-9776639)
chr5 (123-280)||(24493577-24493734)
chr5 (181-280)||(21997547-21997647)
chr5 (143-280)||(22412192-22412329)
chr5 (3-122)||(37804784-37804902)
chr5 (123-280)||(13025319-13025476)
chr5 (123-280)||(13095503-13095660)
chr5 (123-272)||(22075035-22075185)
chr5 (3-74)||(20901802-20901873)
chr5 (123-269)||(22144068-22144215)
chr5 (143-230)||(20766095-20766181)
chr5 (106-207)||(40725935-40726037)
chr5 (108-274)||(21565556-21565723)
chr5 (190-278)||(18418590-18418678)
chr5 (171-269)||(20026942-20027043)
chr5 (110-269)||(22178161-22178323)
chr5 (140-269)||(37723922-37724050)
chr5 (3-74)||(18743965-18744036)
chr5 (171-280)||(21329500-21329610)
chr5 (189-269)||(21292992-21293071)
chr5 (170-280)||(21502158-21502269)
chr5 (226-280)||(20806845-20806899)
chr5 (174-274)||(22959538-22959639)
chr5 (3-77)||(32027652-32027726)
chr5 (3-64)||(20917728-20917789)
chr5 (167-273)||(26012034-26012141)
chr5 (3-74)||(1628172-1628243)
chr5 (3-74)||(21399897-21399968)
chr5 (227-272)||(19660894-19660940)
chr5 (3-77)||(20917781-20917855)
chr5 (3-77)||(29330190-29330264)
chr5 (189-261)||(21873277-21873350)
chr5 (117-213)||(18356389-18356485)
chr5 (170-213)||(20910801-20910844)
chr5 (230-261)||(26680605-26680636)
chr5 (230-261)||(26952212-26952243)
chr5 (227-269)||(36314596-36314639)
chr5 (230-280)||(26704079-26704129)
chr5 (227-269)||(26740705-26740747)
chr5 (230-280)||(26973812-26973862)
chr5 (227-280)||(22032327-22032380)
chr5 (227-272)||(26732892-26732937)
chr5 (224-280)||(23501412-23501468)
chr5 (230-274)||(23535642-23535686)
chr5 (167-207)||(29448086-29448126)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (3-280)||(136685-136960)
scaffold0028 (3-280)||(139154-139429)
scaffold0028 (3-280)||(144092-144367)
scaffold0028 (3-280)||(134216-134491)
scaffold0028 (3-280)||(141623-141898)
scaffold0028 (127-270)||(62216-62355)
scaffold0028 (163-274)||(132672-132784)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (3-280)||(40405-40680)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (68-294)||(12195-12420)
scaffold0494 (3-74)||(511-582)
scaffold0494 (3-74)||(405-476)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-280)||(38537-38815)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (93-280)||(82077-82264)
scaffold0037 (108-273)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (106-280)||(158433-158607)
scaffold0003 (123-273)||(339905-340053)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (3-271)||(29946-30194)
scaffold0149 (3-74)||(30229-30300)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (3-280)||(9754-10012)
scaffold0145 (123-280)||(32950-33107)
scaffold0145 (123-280)||(38769-38926)
scaffold0145 (3-63)||(10005-10065)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (93-280)||(111-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (106-280)||(16789-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (106-280)||(4302-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (93-280)||(12069-12250)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (106-280)||(4219-4393)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (93-280)||(1250-1438)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (106-269)||(79267-79430)
scaffold0056 (123-290)||(17170-17340)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (106-269)||(20363-20524)
scaffold0031 (123-280)||(128759-128916)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (106-280)||(161072-161247)
scaffold0007 (106-206)||(164573-164674)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (106-277)||(2111-2283)
scaffold0247 (106-287)||(17964-18147)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (123-280)||(22891-23048)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (3-162)||(6070-6227)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (143-280)||(44682-44820)
scaffold0122 (123-280)||(26020-26178)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (123-280)||(3106-3263)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (123-280)||(13219-13377)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (123-274)||(4522-4673)
scaffold0228 (123-274)||(12104-12255)
scaffold0228 (123-274)||(22056-22207)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (117-280)||(51921-52085)
scaffold0011 (138-272)||(167948-168083)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (3-122)||(3186-3304)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (123-280)||(16555-16713)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (123-280)||(1859-2017)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (123-279)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (123-279)||(75170-75326)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (143-280)||(116435-116571)
scaffold0022 (3-122)||(53753-53873)
scaffold0022 (106-269)||(128907-129072)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (123-290)||(3141-3309)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (138-272)||(1018-1153)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (3-122)||(1591-1709)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (123-272)||(4865-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (123-280)||(3478-3636)
scaffold0292 (123-280)||(351-508)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (3-116)||(27958-28069)
scaffold0114 (123-272)||(15420-15568)
scaffold0114 (3-77)||(28048-28122)
scaffold0114 (227-280)||(7299-7352)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (123-280)||(32913-33069)
scaffold0120 (123-280)||(45936-46092)
scaffold0120 (124-280)||(16121-16278)
scaffold0120 (226-280)||(17388-17442)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (123-280)||(25904-26061)
scaffold0026 (123-280)||(39866-40023)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (123-270)||(24257-24406)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (108-280)||(8472-8642)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (123-280)||(6076-6237)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (108-273)||(8481-8650)
scaffold0621 (127-274)||(6549-6695)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (170-280)||(28422-28533)
scaffold0046 (174-272)||(11308-11407)
scaffold0046 (235-272)||(2013-2050)
scaffold0046 (235-272)||(4568-4605)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (3-122)||(4184-4304)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (3-122)||(15083-15203)
scaffold0306 (3-33)||(11221-11251)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (123-224)||(3485-3586)
scaffold0327 (230-280)||(293-343)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (170-280)||(8487-8598)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (3-122)||(10769-10886)
scaffold0513 (3-74)||(10663-10734)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (3-122)||(6817-6937)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (106-273)||(27686-27855)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (138-269)||(1971-2103)
[»] scaffold0747 (2 HSPs)
scaffold0747 (3-122)||(645-764)
scaffold0747 (3-74)||(799-870)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (3-122)||(15154-15273)
scaffold0106 (227-280)||(15298-15351)
scaffold0106 (170-269)||(1308-1406)
scaffold0106 (25-74)||(15070-15119)
scaffold0106 (170-269)||(7285-7383)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (106-269)||(53486-53651)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (106-287)||(11465-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (106-287)||(38193-38376)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (106-269)||(13147-13313)
scaffold0357 (106-273)||(16037-16206)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (3-74)||(10001-10072)
scaffold0043 (3-33)||(9936-9966)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (108-236)||(13144-13274)
scaffold0175 (232-280)||(281-329)
scaffold0175 (174-272)||(34139-34238)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (123-280)||(39921-40078)
scaffold0080 (168-269)||(19883-19987)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (128-201)||(13092-13165)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (106-214)||(225482-225590)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (3-75)||(416-488)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (11-122)||(35955-36065)
scaffold0100 (183-273)||(23898-23989)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (106-269)||(12587-12751)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (123-272)||(10381-10528)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (140-269)||(174785-174913)
scaffold0021 (227-280)||(121774-121827)
scaffold0021 (123-199)||(124675-124751)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (138-272)||(32083-32216)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (198-272)||(4728-4803)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-269)||(6220-6386)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (172-272)||(11447-11548)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (123-208)||(27911-27996)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (127-274)||(129919-130066)
scaffold0010 (106-269)||(60652-60818)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (108-273)||(10481-10647)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (189-272)||(13513-13596)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-66)||(13508-13571)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (106-207)||(7996-8098)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (127-274)||(19278-19424)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (123-287)||(20911-21077)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (138-267)||(4545-4675)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (209-269)||(11982-12042)
scaffold0503 (106-171)||(12047-12112)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (174-280)||(15669-15776)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (5-57)||(57708-57760)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (10-122)||(1215-1327)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (127-274)||(5657-5803)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (167-274)||(2805-2913)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (227-280)||(4893-4946)
scaffold0395 (123-212)||(918-1006)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (108-274)||(45732-45899)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (167-274)||(14696-14804)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (167-269)||(1051-1154)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (106-273)||(25121-25289)
scaffold0123 (3-86)||(16239-16324)
scaffold0123 (106-207)||(620-720)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (167-273)||(32551-32657)
scaffold0034 (123-269)||(51839-51985)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (179-280)||(6134-6236)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (138-224)||(6675-6761)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (106-207)||(97089-97190)
scaffold0006 (106-207)||(106367-106468)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (106-269)||(267679-267844)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (127-274)||(143-290)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (235-280)||(1102-1147)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (172-269)||(16301-16397)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (235-280)||(6619-6664)
scaffold0333 (235-280)||(13999-14044)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (235-280)||(15845-15890)
scaffold0020 (230-280)||(178902-178952)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (235-279)||(1091-1135)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (167-214)||(8090-8137)
scaffold0556 (174-274)||(6826-6927)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (106-269)||(1011-1171)
scaffold0184 (227-261)||(4286-4320)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (170-269)||(51601-51699)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (25-63)||(6682-6720)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (183-280)||(29562-29660)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (107-196)||(18176-18265)
scaffold0138 (171-273)||(12954-13057)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (3-79)||(15282-15358)
scaffold0174 (6-64)||(15350-15408)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (167-273)||(10542-10649)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (171-273)||(8075-8180)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (235-274)||(2713-2752)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (123-265)||(38339-38483)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (230-280)||(23847-23897)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (160-287)||(192968-193097)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (170-269)||(5132-5230)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (171-274)||(12780-12884)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (235-280)||(36458-36503)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (117-213)||(15365-15461)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (106-207)||(1735-1835)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (138-269)||(1021-1151)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (106-207)||(88-189)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (230-280)||(163-213)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (227-261)||(7330-7364)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (227-261)||(5003-5037)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (236-274)||(28839-28877)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (230-280)||(21866-21916)
scaffold0210 (230-280)||(29758-29808)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (230-280)||(69798-69848)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (227-280)||(1885-1938)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (227-280)||(10582-10635)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (163-274)||(32112-32224)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (160-280)||(4796-4917)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (167-207)||(2217-2257)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11570 - 11279
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11570 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 11471  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11470 accatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 11371  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11370 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 82)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34963654 - 34963364
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34963654 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 34963556  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963555 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 34963456  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34963455 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 30676591 - 30676881
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676591 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 30676689  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30676690 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattata 30676789  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676790 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8055310 - 8055034
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8055310 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 8055212  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055211 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 8055112  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055111 tcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 8055034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12742598 - 12742322
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12742598 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 12742500  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742499 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 12742400  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742399 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12742322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19005326 - 19005051
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19005326 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 19005229  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005228 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 19005129  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005128 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 19005051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22782507 - 22782232
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22782507 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 22782410  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782409 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 22782310  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782309 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22782232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24422827 - 24422552
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24422827 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24422730  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422729 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24422630  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422629 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24422552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33862074 - 33861799
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33862074 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 33861977  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861976 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 33861877  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861876 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 33861799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33864558 - 33864283
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33864558 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 33864461  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864460 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 33864361  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864360 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 33864283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 18334474 - 18334749
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18334474 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18334571  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334572 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18334671  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334672 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18334749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 19858801 - 19859076
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19858801 attgatgaattagtatatgaatgtatatgct-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 19858898  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858899 gttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 19858998  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858999 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 19859076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 26924522 - 26924797
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26924522 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatat-gatgttttaagatgttgatt 26924619  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924620 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 26924719  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924720 tcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 26924797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 1540793 - 1541068
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1540793 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 1540890  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540891 attatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 1540990  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1540991 tcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 1541068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 2291062 - 2291337
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2291062 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 2291159  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291160 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 2291259  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291260 tcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 2291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25688783 - 25688507
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25688783 attgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaat-gatgttttaagatgttgatt 25688685  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25688684 accatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatg 25688585  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688584 tcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656634
Alignment:
Q  16 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataa-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 25656799  T
Q  116 gttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656798 tttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 25656699  T
Q  216 gtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656698 gtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25656634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754814
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25754814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595554
Alignment:
Q  70 atatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattg 1595665  T
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1595664 agacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 1595565  T
Q  270 ttgattaagat 280  Q
    |||||||||||    
T  1595564 ttgattaagat 1595554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557049
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagat 20557049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448684
Alignment:
Q  111 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  210 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagat 16448684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 280
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852174
Alignment:
Q  107 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  207 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 3852174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 19847849 - 19848122
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||          
T  19847849 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-----------gatg------ 19847931  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || || |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19847932 ---atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttat 19848028  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||  |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19848029 gtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  136 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629468
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25629468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12942482 - 12942363
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12942482 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 12942384  T
Q  103 accatttgatgttgttatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12942383 accatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060548
Alignment:
Q  126 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 224  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  225 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagat 29060548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 274
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361067
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 20361067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593781
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  262 ggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagat 20593781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287909
Alignment:
Q  140 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 238  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  239 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17287909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 31630528 - 31630626
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31630528 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496260
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  223 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18914107 - 18913994
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18914107 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 18914010  T
Q  103 accatttgatgttgtt 118  Q
    |  |||||||||||||    
T  18914009 attatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303653
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  262 ggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagat 19303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23992703 - 23992421
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat--tgatgttttaagatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23992703 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttga 23992605  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattat 198  Q
    | |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || ||||   ||||| ||||| |||||||| |    
T  23992604 tga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagat---gttgaattgcaattgatatttt 23992518  T
Q  199 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23992517 tatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 28289218 - 28289334
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  28289218 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgag--cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttaatt 28289314  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  28289315 accatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15875586 - 15875469
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15875586 attgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 15875489  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  15875488 attatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 221  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  222 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780340
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagat 22780340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076708
Alignment:
Q  176 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  275 taagat 280  Q
     |||||    
T  20076713 gaagat 20076708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 280
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638396
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagat 20638396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Original strand, 17377729 - 17377807
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17377729 attgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 17377807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18914213 - 18914142
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914213 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 31630422 - 31630493
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31630422 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1598337 - 1598266
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1598337 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227631
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714425
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 25714425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19005432 - 19005361
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19005432 attgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25535688 - 25535641
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535688 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18937317 - 18937252
Alignment:
Q  52 catgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937317 catgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15875670 - 15875621
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15875670 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  265 ctaag 269  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 261
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  259 gtc 261  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333331
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 27333331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394071
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 27394071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245605
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  223 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  267 aagttga 273  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T
Q  271 tga 273  Q
    |||    
T  9098618 tga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652209
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||||||||    
T  19652218 ctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35056778 - 35056707
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35056778 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 294
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  190 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagattttgatg 287  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  288 atgatgt 294  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 294
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  190 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg-attaagattttgatg 287  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  288 atgatgt 294  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 265
Target Start/End: Original strand, 16920602 - 16920728
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||    
T  16920602 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtt 16920698  T
Q  237 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 265  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16920699 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790873
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 280
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080838
Alignment:
Q  241 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagat 22080838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32259133 - 32259078
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 58  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32259133 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15875639 - 15875565
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15875639 attgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 66
Target Start/End: Original strand, 17883303 - 17883333
Alignment:
Q  36 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883303 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862982
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 19862982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873124
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 19873124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766718
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561319
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432253
Alignment:
Q  200 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 22432253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438803
Alignment:
Q  200 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 22438803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 16413197 - 16413473
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16413197 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16413295  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413296 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 16413395  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413396 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16413473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 14409326 - 14409601
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14409326 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 14409423  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409424 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 14409523  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409524 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 14409601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20403507 - 20403232
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20403507 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20403410  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403409 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 20403310  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403309 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20403232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1484682 - 1484407
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1484682 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 1484585  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484584 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 1484485  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484484 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 1484407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 5853174 - 5853449
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5853174 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 5853271  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853272 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 5853371  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853372 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 5853449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22002033 - 22001758
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22002033 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 22001936  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001935 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 22001836  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001835 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22001758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4483561 - 4483286
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4483561 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 4483463  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483462 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 4483363  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483362 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 4483286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 15203113 - 15203388
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15203113 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 15203210  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15203211 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatg 15203310  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15203311 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagat 15203388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 4542255 - 4542530
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4542255 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 4542352  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542353 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 4542452  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542453 tcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 4542530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 20046077 - 20046352
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20046077 attgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20046174  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046175 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 20046274  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046275 tcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20046352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19896549 - 19896270
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttt-aagatgttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  19896549 attgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatatttttaagatgttgat 19896452  T
Q  102 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta---t 198  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |    
T  19896451 tattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 19896352  T
Q  199 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896351 tatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 19896270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 285
Target Start/End: Original strand, 45290576 - 45290857
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45290576 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 45290673  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  45290674 attatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattat 45290773  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45290774 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15070841 - 15070571
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15070841 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttat-gatgttttaagatgttgatt 15070743  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    | |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15070742 atcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15070643  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070642 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14824055 - 14823779
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14824055 attgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgat 14823957  T
Q  102 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823956 tattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 14823857  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14823856 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagat 14823779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 19936885 - 19937163
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||    
T  19936885 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttga 19936982  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  19936983 ttatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttatt 19937082  T
Q  200 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19937083 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 19937163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598193
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 41598193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 24485925 - 24486093
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24485925 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttctaagatgttgatt 24486023  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgaga 172  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24486024 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  108 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  208 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484425
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagat 25484425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32810211 - 32810054
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32810211 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 32810114  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 162  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32810113 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092455
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16092455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818522
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 18818522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759266
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 6759266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372786
Alignment:
Q  135 atatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct 233  Q
    ||||| ||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  234 gttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 7372786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536216
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 20536216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32122009 - 32121726
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  32122009 attgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgatg 32121911  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  32121910 a----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattttta 32121821  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32121820 tgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219726
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 242  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  243 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 26219726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919105
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcat-atgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 235  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 27472298 - 27472395
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27472298 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatata-tgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875073
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagat 22875073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406387
Alignment:
Q  122 ttgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 219  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  220 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23406387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 18677946 - 18678229
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  18677946 attgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtat-gatgttttaagatgttgatg 18678044  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18678045 a----ttgaa-----taagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattttta 18678134  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| |||||||  ||||  |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18678135 tgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924041
Alignment:
Q  140 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 238  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  239 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21924041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225404
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  267 aagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagat 26225404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 38549992 - 38550090
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38549992 attgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626744
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 22626744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 20982608 - 20982710
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat---tgatgttttaagatgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  20982608 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttg 20982707  T
Q  100 att 102  Q
    |||    
T  20982708 att 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508188
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    ||| || || || ||| || || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597720
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879344
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 18879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 13425340 - 13425411
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13425340 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 20982502 - 20982573
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20982502 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648547
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  259 gtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 38549886 - 38549957
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38549886 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971273
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 1326919 - 1327042
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-----tgatgttttaagatgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |      |||||||| ||||||    
T  1326919 attgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgt 1327017  T
Q  98 tgattaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  1327018 tgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  10 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16198175 - 16198115
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198175 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  217 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
     |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 16401806 - 16401875
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttata 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16401806 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855364
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 38855364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 1326813 - 1326884
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1326813 attgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 16401912 - 16402020
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  16401912 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 16402009  T
Q  101 ttaccatttga 111  Q
    ||| |||||||    
T  16402010 ttatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  265 ctaagttgattaaga 279  Q
    |||||||||||||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Original strand, 25658034 - 25658094
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25658034 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgatga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520376
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||    
T  6520387 gttgattaagat 6520376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131098
Alignment:
Q  189 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24048892 - 24048841
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24048892 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Original strand, 16199615 - 16199746
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || ||||||||||    
T  16199615 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtt 16199712  T
Q  237 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199713 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  268 agttga 273  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 18815612 - 18815683
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18815612 attgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389552
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396082
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778878
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790575
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19896602 - 19896524
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat 81  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19896602 attgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20403560 - 20403486
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20403560 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866376
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 19936801 - 19936850
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19936801 gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673718
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||||||||    
T  21673727 ctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Original strand, 23760805 - 23760950
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |    
T  23760805 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcct 23760901  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140932
Alignment:
Q  186 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21491011
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  7 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 36733305 - 36733376
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  36733305 attgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38988801 - 38988730
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  38988801 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39019898 - 39019827
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  39019898 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 274
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355805
Alignment:
Q  168 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 265  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  266 taagttgat 274  Q
    |||||||||    
T  26355797 taagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 15203060 - 15203134
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||| || || |||||||||||| |  |||||||||    
T  15203060 attgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 19936832 - 19936906
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19936832 attgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249400
Alignment:
Q  238 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255238
Alignment:
Q  238 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 32810255 - 32810190
Alignment:
Q  12 ttagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32810255 ttagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32810190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 38549939 - 38550000
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38549939 attgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 122
Target Start/End: Original strand, 35026855 - 35026895
Alignment:
Q  82 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026855 tgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Original strand, 40492850 - 40492890
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  40492850 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 40492890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4703
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4975 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gttgttttaagatgttgatt 4877  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4876 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 4777  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4776 tcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 4703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3515288 - 3515012
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3515288 attgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 3515190  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515189 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 3515090  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515089 tcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 3515012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 14970588 - 14970878
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14970588 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 14970686  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970687 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 14970786  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14970787 tcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 19618054 - 19618343
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19618054 attgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 19618151  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618152 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 19618251  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19618252 tcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 18215156 - 18215431
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215156 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18215253  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215254 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18215353  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215354 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18215431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19242981 - 19242704
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19242981 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 19242883  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242882 accatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 19242783  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242782 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 19242704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 12189 - 12464
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12189 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 12286  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287 attattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 12386  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 15118234 - 15118509
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15118234 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 15118331  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118332 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 15118431  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118432 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 15118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44615569 - 44615293
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44615569 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 44615471  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615470 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 44615371  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615370 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44615293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52312790 - 52312515
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52312790 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 52312693  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312692 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 52312593  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312592 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 52312515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 285
Target Start/End: Original strand, 15355206 - 15355487
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15355206 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 15355303  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355304 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 15355403  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15355404 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 50222221 - 50222496
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50222221 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 50222318  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222319 attatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 50222418  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222419 tcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 50222496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 44772965 - 44773244
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat---tgatgttttaagatgttg 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  44772965 attgatgaattagtatacgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttg 44773063  T
Q  100 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44773064 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 44773163  T
Q  200 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773164 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44773244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 18239301 - 18239576
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18239301 attgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18239398  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239399 attatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18239498  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239499 tcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18239576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Original strand, 1837420 - 1837666
Alignment:
Q  33 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataa 132  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837420 ttgtgaaaacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataa 1837518  T
Q  133 ttatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 232  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1837519 tcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 1837618  T
Q  233 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837619 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 1837666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 7641068 - 7641339
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-----tgatgttttaagatgt 97  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||     |||| |||||||||||    
T  7641068 attgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgt 7641166  T
Q  98 tgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641167 tgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 7641266  T
Q  198 ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641267 ttatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 7641339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464025
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 51464025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803422
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23803422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102219
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44102219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610955
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12610955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 117 - 280
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929037
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  217 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44929037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149834
Alignment:
Q  111 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  210 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 20149834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  109 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  208 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280321
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  267 aagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagat 14280321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798867
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 241  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  242 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 54798867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088885
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 7088885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798782
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 7798782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038656
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagat 14038656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15534462 - 15534343
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15534462 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 15534364  T
Q  103 accatttgatgttgttatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15534363 accatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902773
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636443
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 22636443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14048858 - 14048740
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14048858 attgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 14048760  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14048759 accatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36038151 - 36038033
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36038151 attgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 36038053  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36038052 accatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 49547655 - 49547773
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49547655 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatcta-tgatgttttaagatgttgatt 49547753  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  49547754 atcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873480
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    |||||| |||||    
T  52873469 gttgatgaagat 52873480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893711
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 7893711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 15496953 - 15497070
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15496953 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 15497050  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  15497051 attatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270348
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagat 16270348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  112 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  212 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052837
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagat 44052837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 52873060 - 52873176
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52873060 attgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 52873157  T
Q  103 accatttgatgttgttata 121  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  52873158 attatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574980
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  267 aagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||    
T  8574967 aagttaattaagat 8574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240082
Alignment:
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 223  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  224 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagat 16240082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899899
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 6899899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374464
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||  |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 362461 - 362390
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  362461 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 14746499 - 14746618
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  14746499 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 14746596  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  14746597 ttatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  207 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 15355100 - 15355171
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15355100 attgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 19617948 - 19618019
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19617948 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 52872954 - 52873025
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52872954 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19857763 - 19857685
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857763 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 15496055 - 15496126
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15496055 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 18215050 - 18215121
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18215050 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29267634 - 29267571
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29267634 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29267571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096309
Alignment:
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 14746393 - 14746464
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14746393 attgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  33 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  261 cggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19857847 - 19857798
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19857847 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  267 aagttga 273  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 280
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706401
Alignment:
Q  179 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 276  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  277 agat 280  Q
    ||||    
T  39706398 agat 39706401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053403
Alignment:
Q  172 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  |||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 52312843 - 52312769
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  52312843 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6190592 - 6190481
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcat 256  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  6190592 tgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcat 6190494  T
Q  257 gagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||    
T  6190493 gagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17046604 - 17046506
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17046604 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17046508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551833
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19857661 - 19857607
Alignment:
Q  69 tatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857661 tatatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Original strand, 26922388 - 26922452
Alignment:
Q  22 tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatg 86  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26922388 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgactgatgaattattatatgtatatgttgatg 26922452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 12136 - 12210
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  12136 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 12210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 11250621 - 11250655
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11250621 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 15353367 - 15353401
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353367 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 196  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 279
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157571
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 279  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaaga 20157571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13164630 - 13164582
Alignment:
Q  38 aatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatg 86  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  13164630 aatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatgtattgatg 13164582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 26922437 - 26922489
Alignment:
Q  22 tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  26922437 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 26922489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 9707488 - 9707764
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9707488 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 9707586  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9707587 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatg 9707686  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707687 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 9707764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13544305 - 13544016
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544305 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13544208  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544207 atcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 13544108  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13544107 tcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 45606788 - 45607064
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45606788 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 45606886  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606887 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 45606986  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606987 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 45607064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12567840 - 12567551
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12567840 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 12567743  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567742 atcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 12567643  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  12567642 tcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Original strand, 7781231 - 7781504
Alignment:
Q  6 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattacc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  7781231 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatt 7781329  T
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7781330 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 7781429  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781430 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 7781504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8899374 - 8899099
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8899374 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 8899277  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899276 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 8899177  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899176 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagat 8899099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 16454163 - 16454438
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454163 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16454260  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454261 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 16454360  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454361 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16454438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17463458 - 17463183
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17463458 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 17463361  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463360 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 17463261  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463260 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17463183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 38961773 - 38962045
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38961773 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatgttggtt 38961870  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961871 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 38961970  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961971 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 16282693 - 16282968
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16282693 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16282790  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16282791 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatg 16282890  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282891 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16282968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34159606 - 34159331
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34159606 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 34159509  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159508 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 34159409  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159408 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 34159331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 55476771 - 55476496
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55476771 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 55476674  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476673 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 55476574  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476573 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 55476496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 6469016 - 6469291
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6469016 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 6469113  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469114 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 6469213  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469214 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 6469291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 13154137 - 13154413
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13154137 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13154234  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154235 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 13154334  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154335 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13154413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41124167 - 41123895
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41124167 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 41124070  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124069 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 41123970  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123969 tcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 41123895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 10247615 - 10247880
Alignment:
Q  13 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgat 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10247615 tagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgat 10247712  T
Q  113 gttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247713 gttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 10247812  T
Q  213 tttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10247813 tttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagat 10247880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8499801 - 8499523
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8499801 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 8499703  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8499702 atcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattatta 8499603  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499602 tgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 8499523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 13151672 - 13151948
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13151672 attgatgaattagtatatgaaggtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13151769  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151770 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 13151869  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151870 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13151948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15412709 - 15412434
Alignment:
Q  6 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattacc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  15412709 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatat-gaagttttaagatgttgattatc 15412611  T
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgt 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15412610 atttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 15412511  T
Q  204 catgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412510 catgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 15412434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Original strand, 28848522 - 28848768
Alignment:
Q  33 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataa 132  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||    
T  28848522 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaa 28848620  T
Q  133 ttatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 232  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28848621 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 28848720  T
Q  233 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848721 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 28848768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27165533 - 27165255
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27165533 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 27165435  T
Q  103 accatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  27165434 accatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtat 27165335  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     ||||| || ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165334 atcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 27165255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446811
Alignment:
Q  82 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttga 181  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  182 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagat 17446811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 53301385 - 53301664
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53301385 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 53301483  T
Q  103 accatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||    
T  53301484 accattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgtta 53301583  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53301584 tatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagat 53301664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172740
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 29172740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672631
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17672631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119882
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12119882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 269
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977520
Alignment:
Q  155 atatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgc 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 15977546  T
Q  255 atgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977545 atgagtcggtctaagttgattaagat 15977520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972862
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 14972862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213833
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  223 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagat 40213833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500947
Alignment:
Q  172 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55500956  T
Q  272 gattaagat 280  Q
    |||||||||    
T  55500955 gattaagat 55500947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166603
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 242  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  243 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 36166603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487864
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 17487864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499346
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 17499346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  107 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  206 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46822542 - 46822259
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  46822542 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgatg 46822444  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  46822443 a----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattttta 46822354  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| || ||||  ||||  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46822353 tgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54521103 - 54520985
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54521103 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 54521005  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54521004 accatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476498
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  223 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 25476498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840940
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 274
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618459
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 242  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  243 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686902
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442282
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 13442282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12305426 - 12305315
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12305426 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 12305328  T
Q  103 accatttgatgtt 115  Q
    |||||||||||||    
T  12305327 accatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399225
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438542
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 18438554  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    |||||| |||||    
T  18438553 gttgatgaagat 18438542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 280
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698548
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 20698548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556990
Alignment:
Q  167 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 265  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10557005  T
Q  266 taagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||    
T  10557004 taagttgattaagat 10556990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083474
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||  | |  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23083474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153321
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| |||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  223 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
      || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24153321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494814
Alignment:
Q  186 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 44494814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340843
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| || || || ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10557189 - 10557091
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10557189 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatata-tgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15977813 - 15977696
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15977813 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttggtt 15977716  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  15977715 attatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Original strand, 29544723 - 29544839
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29544723 attgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 29544821  T
Q  103 accatttgatgttgttat 120  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29544822 accatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    |||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  259 gtcggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737241
Alignment:
Q  187 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17737241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 12119535 - 12119606
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12119535 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  207 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 11913932 - 11914051
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  11913932 attgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 11914029  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  11914030 ttatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424872
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| |   ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagat 11424872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 17444698 - 17444773
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17444698 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13436580 - 13436520
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436580 attgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642385
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||    
T  37642302 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12511176 - 12511051
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12511176 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaa 12511077  T
Q  269 gttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  12511076 gttgattaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029834
Alignment:
Q  190 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatga 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatga 30029840  T
Q  289 tgatgt 294  Q
    ||||||    
T  30029839 tgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  261 cggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470939
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  265 ctaagttga 273  Q
    |||||||||    
T  15470947 ctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25237071 - 25237009
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25237071 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577995
Alignment:
Q  232 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 45577995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234495
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaa 14234507  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||    
T  14234506 gttgattaagat 14234495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24513957 - 24513910
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24513957 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194698
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 28194698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210432
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174366
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  272 gat 274  Q
    |||    
T  12174364 gat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 17444645 - 17444719
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  17444645 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 38961720 - 38961794
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38961720 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25229537 - 25229476
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  25229537 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25237124 - 25237063
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  25237124 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  223 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25201394 - 25201323
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25201394 attgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41124220 - 41124146
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41124220 attgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Original strand, 49668071 - 49668183
Alignment:
Q  163 ataattgagatgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgag 259  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49668071 ataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T
Q  260 tcggtctaagttgat 274  Q
    |||||||||| ||||    
T  49668169 tcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856144
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 856144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665405
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 14665405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077590
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 23077590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390030
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 15025937 - 15025992
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 58  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  15025937 attgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 16282639 - 16282714
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg-ttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||| || |||||||||||| |  |||||||||    
T  16282639 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttttatgattgatgaattagtatatgtat 16282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668561
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 14668561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878164
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 15878164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40812202 - 40812144
Alignment:
Q  16 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40812202 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtttatgattgatgaatttttatatg 40812144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512934
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520909
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17044391 - 17044330
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17044391 attgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196544
Alignment:
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 26196544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Original strand, 17324 - 17597
Alignment:
Q  6 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattacc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17324 gatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattacc 17422  T
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423 atttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 17522  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 94691 - 94416
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  94691 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 94594  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94593 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 94494  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94493 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 94416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44459
Alignment:
Q  126 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  225 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  226 gtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119891
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38592
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagat 38592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 23593615 - 23593892
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23593615 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 23593713  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593714 accatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 23593813  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593814 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23593892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21841047 - 21840766
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21841047 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 21840950  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840949 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 21840850  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgat 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21840849 tcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 21474968 - 21475244
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21474968 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 21475066  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475067 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 21475166  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21475167 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagat 21475244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16362199 - 16361908
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16362199 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16362101  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362100 accatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 16362001  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16362000 gtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13989146 - 13988871
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13989146 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13989049  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989048 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 13988949  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988948 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13988871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 21923173 - 21923448
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923173 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 21923270  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923271 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 21923370  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923371 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21923448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29776968 - 29776693
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29776968 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 29776871  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776870 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 29776771  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776770 tcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 29776693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31612593 - 31612318
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31612593 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatattgatt 31612496  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612495 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 31612396  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612395 tcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 31612318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29298416 - 29298142
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298416 attgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 29298319  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29298318 attatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat- 29298220  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298219 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 29298142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 16275244 - 16275521
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16275244 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttcaagatattgatt 16275342  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16275343 attatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattat 16275442  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16275443 gtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagat 16275521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 22122949 - 22123225
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22122949 attgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatattgatt 22123046  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123047 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatg 22123146  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22123147 tcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagat 22123225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 15859890 - 15860166
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15859890 attgatgaattagtatatgtatgtatatctt-gcgaatacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtcttaagatgttgatt 15859987  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15859988 accatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattat 15860087  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15860088 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 15860166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213019
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13213019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346966
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21346966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 93 - 269
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342101
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21342101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433017
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 433017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707172
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21707172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711714
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21711714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389159
Alignment:
Q  111 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  210 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagat 40389159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250834
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509788
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  262 ggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagat 34509788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532277
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagat 22532277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 294
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatc 22468749  T
Q  222 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22468750 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 22050771 - 22050866
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22050771 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135181
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  259 gtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 269
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  109 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  208 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  215 tgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
     | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758723 -gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 16275138 - 16275209
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16275138 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 272
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847259
Alignment:
Q  187 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Original strand, 27161521 - 27161598
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27161521 attgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 27161598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  261 cggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 27161468 - 27161529
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161468 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  205 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 212
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921976
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||| ||||    
T  22921967 ctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248293
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  272 gat 274  Q
    |||    
T  20248295 gat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 22050718 - 22050792
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22050718 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 22122896 - 22122970
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22122896 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29777021 - 29776947
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29777021 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 31612646 - 31612572
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  31612646 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  68 ttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29298469 - 29298408
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298469 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29298522 - 29298461
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298522 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 50614053 - 50614219
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||   || |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  50614053 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaaga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50614152 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 50621881 - 50622047
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||   || |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  50621881 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaaga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50621980 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714550
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagat 21714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  110 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 273
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | | ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12710208 - 12710129
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatt 82  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| || | | ||||||| |||||||    
T  12710208 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatgaatatatt 12710129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161730
Alignment:
Q  213 tttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783205
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagat 24783205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865326
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagat 42865326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21028 - 20752
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21028 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20930  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 20830  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38102 - 37826
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38102 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 38004  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38003 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 37904  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37903 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 37826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 456602 - 456326
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  456602 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 456504  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456503 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 456404  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456403 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 456326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 11393168 - 11393444
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11393168 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 11393266  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393267 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 11393366  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393367 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 11393444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16232801 - 16232525
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16232801 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16232703  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232702 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 16232603  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232602 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16232525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41523198 - 41522922
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41523198 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 41523100  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523099 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 41523000  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522999 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 41522922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41525660 - 41525384
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41525660 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 41525562  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525561 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 41525462  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525461 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 41525384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16213965 - 16213689
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  16213965 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttcatatgttgatt 16213867  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16213866 accatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatg 16213767  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213766 tcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16213689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27217141 - 27216865
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27217141 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 27217043  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217042 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 27216943  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27216942 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagat 27216865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 15376595 - 15376870
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15376595 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 15376692  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376693 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 15376792  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376793 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 15376870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 20385005 - 20385280
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20385005 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20385102  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385103 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 20385202  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385203 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20385280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 21189477 - 21189752
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21189477 attgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 21189574  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189575 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 21189674  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189675 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21189752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32125771 - 32125496
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32125771 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 32125674  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125673 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 32125574  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125573 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 32125496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 14949004 - 14949279
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14949004 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 14949101  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949102 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 14949201  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949202 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 14949279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11972776 - 11972501
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11972776 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatattgatt 11972679  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972678 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 11972579  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972578 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 11972501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18430992 - 18430717
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18430992 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18430895  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430894 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 18430795  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430794 tcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18430717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24702497 - 24702243
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24702497 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24702399  T
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24702398 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt 24702299  T
Q  225 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702298 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24702243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18640552 - 18640277
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18640552 attgatgaattactatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18640455  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640454 attattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18640355  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640354 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18640277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16410339 - 16410064
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16410339 attgatgaattagtatatcaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 16410242  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410241 attatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 16410142  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410141 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16410064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24704944 - 24704693
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24704944 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 24704846  T
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||     
T  24704845 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgt 24704749  T
Q  225 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704748 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24704693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13869629 - 13869351
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13869629 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13869531  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869530 atcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 13869431  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869430 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13869351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 26355863 - 26356090
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355863 attgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgat 26355961  T
Q  102 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355962 tattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26356061  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 230  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26356062 gttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 26358315 - 26358542
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26358315 attgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgat 26358413  T
Q  102 taccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358414 tattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26358513  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 230  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358514 gttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116514
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 44116514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 107 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386338
Alignment:
Q  107 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  207 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 3386338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  136 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062072
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17062072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898534
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagat 38898534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110561
Alignment:
Q  108 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  208 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20110561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Original strand, 15081829 - 15082019
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||    
T  15081829 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttga 15081926  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttga 192  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  15081927 ttatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 166 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273397
Alignment:
Q  166 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  265 ctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagat 48273397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564477
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 3564477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11303528 - 11303409
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11303528 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 11303430  T
Q  103 accatttgatgttgttatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11303429 accatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831378
Alignment:
Q  159 gtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  259 gtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagat 13831378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698839
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  222 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 12698839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456525
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18456525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 216  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  217 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29796891 - 29796771
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29796891 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaat 29796792  T
Q  102 taccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29796791 taccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29800710 - 29800590
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29800710 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaat 29800611  T
Q  102 taccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29800610 taccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 14269944 - 14270061
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14269944 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 14270041  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  14270042 attatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 16108570 - 16108688
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16108570 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 16108668  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  16108669 accgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509197
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 9509197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227489
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagat 38227489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattg 13841173  T
Q  125 tgatataattatatat 140  Q
    |||||||||| |||||    
T  13841172 tgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18627846 - 18627717
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18627846 attgatgaattattatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18627749  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataatt 134  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627748 agtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 23664834 - 23664952
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23664834 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatata-tgatgttttaagatgttaatt 23664932  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23664933 accatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 45847642 - 45847739
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45847642 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatata-tgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 38898110 - 38898229
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  38898110 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 38898207  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  38898208 ttatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 10589059  T
Q  269 gttg 272  Q
    ||||    
T  10589058 gttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 14269838 - 14269909
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14269838 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8940454 - 8940335
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  8940454 attgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 8940357  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  8940356 ttatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  267 aagttga 273  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 8940560 - 8940489
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8940560 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 15081723 - 15081794
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15081723 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 38898004 - 38898075
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38898004 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468803
Alignment:
Q  33 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 8469016 - 8468945
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8469016 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 45847536 - 45847605
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttata 72  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45847536 attgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67753
Alignment:
Q  166 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  264 tctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagat 67753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072921
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  265 ctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagat 22072921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486864
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||    
T  19486781 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063921
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    ||| || || || |||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 266
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  207 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 226  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  227 -tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443410
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-t 235  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||||| |    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  265 ctaagttga 273  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831815
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||    
T  47831826 gttgattaagat 47831815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932847
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagat 14932847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356282
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagat 15356282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360396
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagat 15360396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Original strand, 16386239 - 16386353
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatg 257  Q
    |||||| || |||||||| |||  | || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16386239 tgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatg 16386338  T
Q  258 agtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||    
T  16386339 agtcggtctaagttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  205 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||  |||| |||| ||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200802
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495421
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811238
Alignment:
Q  179 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13841335 - 13841274
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13841335 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15211586 - 15211450
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 257  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15211586 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 15211488  T
Q  258 agtcggtctaagttg-attaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| ||| | |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  15211487 agtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 273
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219823
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  268 agttga 273  Q
    ||||||    
T  16219818 agttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 13745572 - 13745648
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatat 79  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745572 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014192
Alignment:
Q  176 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 15119926 - 15119993
Alignment:
Q  7 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15119926 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505411
Alignment:
Q  191 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagat 28505411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11972829 - 11972755
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11972829 attgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154954
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagat 18154954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38294628 - 38294567
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38294628 attgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 27847834 - 27847932
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27847834 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtcta 27847930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832554
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 2832554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 9446218 - 9446252
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9446218 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649602
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 19649602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 20569656 - 20569690
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20569656 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996132
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187023
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 12187023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15754992
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138173
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 17138173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 32214824 - 32215092
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214824 gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattg 32214922  T
Q  125 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214923 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 32215022  T
Q  225 tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215023 tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39682594 - 39682318
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39682594 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 39682496  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682495 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 39682396  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682395 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 39682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 571678 - 571402
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  571678 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 571580  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  571579 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 571480  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  571479 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 571402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6726275 - 6726000
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6726275 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 6726178  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726177 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatg 6726078  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726077 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 6726000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18809223 - 18808948
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18809223 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 18809126  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809125 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18809026  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809025 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 18808948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155217
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 21155039  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21155040 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatg 21155139  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155140 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 21155217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23131143 - 23130867
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23131143 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 23131045  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131044 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 23130945  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130944 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23130867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23133610 - 23133334
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133610 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 23133512  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133511 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 23133412  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133411 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23133334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 23709414 - 23709689
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23709414 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 23709511  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709512 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 23709611  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709612 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23709689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 23711895 - 23712170
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23711895 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 23711992  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711993 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 23712092  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712093 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23712170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 34402403 - 34402679
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34402403 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 34402501  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402502 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 34402601  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402602 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 34402679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24368054 - 24367782
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24368054 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatgttggtt 24367957  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367956 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24367857  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24367856 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26505659 - 26505384
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26505659 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 26505562  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505561 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 26505462  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505461 tcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 26505384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26508137 - 26507862
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26508137 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 26508040  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508039 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 26507940  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507939 tcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 26507862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22105693 - 22105417
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22105693 attgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 22105596  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105595 ataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatg 22105496  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105495 tcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22105417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24898077 - 24898353
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24898077 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24898174  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898175 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24898274  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898275 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24898353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24905514 - 24905790
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24905514 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24905611  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905612 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24905711  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905712 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24905790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24907989 - 24908265
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24907989 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24908086  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908087 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24908186  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908187 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24908265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24900560 - 24900836
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24900560 attgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24900657  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900658 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24900757  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900758 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24900836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24903037 - 24903313
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24903037 attgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 24903134  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903135 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 24903234  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact-aagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903235 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24903313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28577379 - 28577104
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577379 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 28577282  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28577281 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattata 28577182  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577181 tcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 28577104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 32039380 - 32039655
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32039380 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 32039477  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039478 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 32039577  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32039578 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagat 32039655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23135841 - 23135595
Alignment:
Q  33 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataa 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23135841 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaa 23135743  T
Q  133 ttatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 232  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23135742 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 23135643  T
Q  233 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135642 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23135595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38967654 - 38967379
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38967654 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtcttaagatgttgatt 38967557  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967556 attatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattat 38967458  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967457 ttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 38967379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 280
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030011
Alignment:
Q  52 catgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttga 45029882  T
Q  152 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagt 251  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||     
T  45029883 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagc 45029982  T
Q  252 tgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029983 tgcatgagtcggtctaagttgattaagat 45030011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 24529428 - 24529686
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||           ||||          
T  24529428 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatat-----------gatg------ 24529510  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24529511 ---atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattat 24529607  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529608 gtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24529686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 107 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137304
Alignment:
Q  107 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  207 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 43137304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 24642736 - 24642933
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||    
T  24642736 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttga 24642833  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642834 ttatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337123
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 22337123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20261500 - 20261381
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20261500 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 20261402  T
Q  103 accatttgatgttgttatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20261401 accatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060521
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23060521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076450
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagat 23076450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25616462 - 25616179
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  25616462 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgatg 25616364  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataatta-tatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  25616363 a----ttga-----ataagatgtgatacattgattatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattttta 25616274  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25616273 tgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 10684644 - 10684764
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10684644 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaat 10684743  T
Q  102 taccatttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10684744 taccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731347
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagat 22731347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  108 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  208 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738292
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  223 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagat 22738292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298928
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  223 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 298928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285873
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23285873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660031
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagat 23660031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 23707204 - 23707323
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  23707204 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 23707301  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  23707302 ttatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654491
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24671200 - 24671081
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  24671200 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24918315 - 24918196
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  24918315 attgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 24918218  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  24918217 ttatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643107
Alignment:
Q  207 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 24643107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 23707098 - 23707169
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23707098 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 24642630 - 24642701
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642630 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24671306 - 24671235
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24671306 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24681725 - 24681654
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24681725 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24918421 - 24918350
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918421 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24681619 - 24681500
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  24681619 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 24681522  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  24681521 tcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38219
Alignment:
Q  189 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38967760 - 38967689
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38967760 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  223 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103497
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  259 gtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 162  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309127
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  237 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040302
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23040302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgat 193  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946665
Alignment:
Q  212 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8946665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| || | | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 32451920 - 32452031
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcat 256  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||| ||| |||||    
T  32451920 tgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcat 32452018  T
Q  257 gagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||    
T  32452019 gagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679593
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 7679605  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||    
T  7679604 gttgattaagat 7679593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21368436 - 21368365
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21368436 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 45027786 - 45027840
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 58  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45027786 attgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22105746 - 22105672
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22105746 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  5 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatat 81  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23799528 - 23799457
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  23799528 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6726328 - 6726254
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  6726328 attgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 273
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 21154889 - 21154963
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| || ||||||||| |  |||||||||    
T  21154889 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24368107 - 24368033
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24368107 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 41523954 - 41524028
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41523954 attgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 267
Target Start/End: Original strand, 22134203 - 22134306
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22134203 ataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtc 22134300  T
Q  262 ggtcta 267  Q
    ||||||    
T  22134301 ggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24869934 - 24869903
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961628
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Original strand, 41524007 - 41524045
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524007 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 261
Target Start/End: Original strand, 22799118 - 22799220
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||||| |||| ||||   |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22799118 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22799217  T
Q  259 gtc 261  Q
    |||    
T  22799218 gtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004838
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 24655398 - 24655432
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24655398 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10772
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11053 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 10956  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 10856  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgat 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10855 tcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14228 - 13952
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14228 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 14130  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14129 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 14030  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14029 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Original strand, 23412 - 23484
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23412 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9522 - 9241
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9522 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat-ttgatgttttaagatgttgatt 9425  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9424 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 9325  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgat 286  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9324 tcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13673 - 13397
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13673 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 13575  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13574 attatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 13475  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13474 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501075
Alignment:
Q  17 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatata-atgttttaagatgttgattactatttgatgttg 501253  T
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  501252 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 501153  T
Q  217 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  501152 tatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85737
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagat 85737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 160805 - 160698
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  160805 ttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 160708  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||||||||    
T  160707 ctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 264650 - 264925
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  264650 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 264747  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264748 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 264847  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264848 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 264925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39363665 - 39363389
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39363665 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 39363567  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363566 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 39363467  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363466 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 39363389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 42245247 - 42245522
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42245247 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 42245344  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245345 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 42245444  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245445 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 42245522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32027673 - 32027398
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32027673 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 32027576  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32027575 attatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatg 32027476  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32027475 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagat 32027398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20909292 - 20909017
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20909292 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20909195  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909194 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 20909095  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909094 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20909017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 10732822 - 10733097
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10732822 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 10732919  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732920 attatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 10733019  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733020 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 10733097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39245416 - 39245141
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39245416 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 39245319  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39245318 attatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatg 39245219  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245218 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 39245141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29330211 - 29329939
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  29330211 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgattatt 29330114  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330113 a---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 29330017  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330016 tcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 29329939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29346250 - 29345985
Alignment:
Q  13 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgat 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29346250 tagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgat 29346153  T
Q  113 gttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346152 gttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 29346053  T
Q  213 tttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29346052 tttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagat 29345985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29348723 - 29348458
Alignment:
Q  13 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgat 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29348723 tagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgat 29348626  T
Q  113 gttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348625 gttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 29348526  T
Q  213 tttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29348525 tttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagat 29348458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29351196 - 29350931
Alignment:
Q  13 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgat 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29351196 tagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgat 29351099  T
Q  113 gttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351098 gttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 29350999  T
Q  213 tttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29350998 tttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagat 29350931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 20917834 - 20918105
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20917834 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 20917931  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| ||    
T  20917932 attatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttg 20918027  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918028 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 20918105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23064794 - 23064516
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064794 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatt-atgttttaagatgttgatt 23064696  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23064695 atcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 23064596  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064595 ggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 23064516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38619717 - 38619439
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38619717 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 38619619  T
Q  103 accatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619618 atcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 38619519  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619518 tgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 38619439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 20901908 - 20902159
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||          
T  20901908 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-----------gatg------ 20901990  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20901991 ---atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattat 20902087  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20902088 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 2154513 - 2154771
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||          
T  2154513 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-----------gatg------ 2154595  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154596 ---atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattat 2154692  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154693 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 2154771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154937
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 36154937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581356
Alignment:
Q  108 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  208 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 11581356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319191
Alignment:
Q  111 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  210 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagat 18319191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061073
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 31061073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775833
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 10775833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067112
Alignment:
Q  111 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  210 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagat 24067112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390609
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 23390609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 17517045 - 17517328
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  17517045 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgatg 17517143  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 200  Q
    |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  17517144 a----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattat-tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatattttta 17517233  T
Q  201 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    |||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17517234 tgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077960
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagat 9077960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421540
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25421540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729169
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808494
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529228
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  262 ggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagat 24529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286956
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  222 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8286956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9776639 - 9776521
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9776639 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatata-tgatgttttaagatgttaatt 9776541  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9776540 accatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493577
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 24493577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 280
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997647
Alignment:
Q  181 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  280 t 280  Q
    |    
T  21997647 t 21997647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412192
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 241  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  242 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagat 22412192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 37804784 - 37804902
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37804784 attgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttaatt 37804882  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  37804883 agaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025319
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13025378  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 13025319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095503
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13095562  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 13095503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 221  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  222 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 20901802 - 20901873
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20901802 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  223 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 230  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725935
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  40725937 atg 40725935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  190 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaag 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 269
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  267 aag 269  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 269
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  110 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 206  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  140 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tg 237  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  238 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329610
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21329598  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||    
T  21329599 gttgattaagat 21329610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293071
Alignment:
Q  189 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502269
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 21502256  T
Q  268 agttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||    
T  21502257 agttgattaagat 21502269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806899
Alignment:
Q  226 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagat 20806899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959639
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  272 gat 274  Q
    |||    
T  22959637 gat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 32027726 - 32027652
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32027726 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 20917728 - 20917789
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20917728 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012141
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  265 ctaagttga 273  Q
    |||||||||    
T  26012133 ctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 1628172 - 1628243
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1628172 attgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 21399897 - 21399968
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21399897 attgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660940
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 20917781 - 20917855
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917781 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29330264 - 29330190
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29330264 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873277
Alignment:
Q  189 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Original strand, 20910801 - 20910844
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 213  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20910801 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt 20910844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26680636 - 26680605
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680636 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26952243 - 26952212
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952243 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314596
Alignment:
Q  227 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704079
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagat 26704079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 269
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973812
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagat 26973812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032327
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 22032327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 280
Target Start/End: Original strand, 23501412 - 23501468
Alignment:
Q  224 ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  23501412 ctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagat 23501468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 23535642 - 23535686
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23535642 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgat 23535686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448086
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 29448086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 136960 - 136685
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  136960 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 136863  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  136862 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 136763  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  136762 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 136685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 139429 - 139154
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139429 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 139332  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139331 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 139232  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139231 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 139154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 144367 - 144092
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  144367 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 144270  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144269 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 144170  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144169 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 144092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 134491 - 134216
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  134491 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 134394  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134393 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 134294  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  134293 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagat 134216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 141898 - 141623
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  141898 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 141801  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141800 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 141701  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  141700 tcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagat 141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 62355 - 62216
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| |    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcct 62262  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
     |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  62261 atgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 260  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  261 cggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40680 - 40405
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40680 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gaagttttaagatgttgatt 40583  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40582 attatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 40483  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40482 tcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagat 40405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 68 - 294
Target Start/End: Original strand, 12195 - 12420
Alignment:
Q  68 ttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataat 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12195 ttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  168 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  268 agttgattaagattttgatgatgatgt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 511 - 582
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  511 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 405 - 476
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  405 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Original strand, 38537 - 38815
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38537 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 38635  T
Q  103 accatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38636 accatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttat 38735  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38736 atcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagat 38815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82077
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagat 82077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158607
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 158607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30194 - 29946
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||          
T  30194 attgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-----------gatg------ 30112  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 202  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30111 ---atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatg 30015  T
Q  203 tcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30014 tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30300 - 30229
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30300 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10012 - 9754
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||                         
T  10012 attgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatg-------------------- 9933  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9932 acgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattat 9833  T
Q  202 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9832 gtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 9754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32950
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagat 32950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38769
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagat 38769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 10065 - 10005
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10065 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 111
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagat 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16789
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 16789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4302
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 4302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12069
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  193 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4219
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 4219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 93 - 280
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1438
Alignment:
Q  93 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttg 191  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  192 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttttgtata 220  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  221 ctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128759
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  223 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagat 128759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161247
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagat 161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  205 at 206  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaa 277  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18147
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22891
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  223 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6227 - 6070
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6227 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgatt 6130  T
Q  103 accatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 162  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6129 attatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44820
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 241  Q
    ||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  242 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagat 44820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26178
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3263
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 3263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13219
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagat 13219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51921
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 216  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  217 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 51921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168083
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3186
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3304 attgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagata-tgatgttttaagatgttgatt 3206  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3205 accatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16713
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagat 16713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1859
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 1859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 279  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 279
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 279  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116435
Alignment:
Q  143 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 242  Q
    ||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  243 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 116435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 53753 - 53873
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  53753 attgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagtagatgttga 53851  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  53852 ttatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  205 atg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  |  |||| | ||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 290
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatgatg 290  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1153
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1709 - 1591
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1709 attgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgattttttaagatgttgatt 1611  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1610 accatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4865
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3478
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 3478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 351
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagat 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28069 - 27958
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28069 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 27972  T
Q  103 accatttgatgttg 116  Q
    |  |||||||||||    
T  27971 attatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15568
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 28122 - 28048
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtat 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  28122 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7299
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagat 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33069
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 33069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45936
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 45936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16121
Alignment:
Q  124 gtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 223  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||   || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  224 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17442
Alignment:
Q  226 gtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagat 17442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39866
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  223 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagat 39866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  222 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8642
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6237
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  223 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
     |   || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6549
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28422
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    |||||| |||||    
T  28433 gttgatgaagat 28422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11308
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2013
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4568
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 4184 - 4304
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  4184 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 4282  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4283 ttatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15203 - 15083
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  15203 attgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 15105  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  15104 ttatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 33
Target Start/End: Original strand, 11221 - 11251
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11221 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 224
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  223 gc 224  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 293
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8487
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 8499  T
Q  269 gttgattaagat 280  Q
    |||||| |||||    
T  8498 gttgatgaagat 8487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 10769 - 10886
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  10769 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaaaatgttgagt 10866  T
Q  103 accatttgatgttgttatat 122  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  10867 attatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 10663 - 10734
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10663 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 6817 - 6937
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  6817 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 6915  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  6916 gtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  106 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  205 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    |||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 764 - 645
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  764 attgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 667  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  666 ttatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 799
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  870 attgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 15154 - 15273
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  15154 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttga 15251  T
Q  101 ttaccatttgatgttgttatat 122  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  15252 ttatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15351
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1308
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 15070 - 15119
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15070 gtatatgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7285
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11465
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38376
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  106 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg-agatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  204 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  106 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  205 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||| || ||||| |||||  || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10072 - 10001
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatg 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10072 attgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 9966 - 9936
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9966 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  108 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  207 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 236  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  232 ctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34139
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39921
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||    |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  223 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagat 39921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 269
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  168 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcgg 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  264 tctaag 269  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  128 tataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  205 atgctgtttt 214  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 416
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  488 attgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36065
Alignment:
Q  11 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa-gttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccattt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatttttt 36052  T
Q  110 gatgttgttatat 122  Q
    |||||| ||||||    
T  36053 gatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  205 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10528
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  223 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  140 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 237  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  238 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121774
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 121774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32083
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4728
Alignment:
Q  198 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11548
Alignment:
Q  172 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 270  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  271 tg 272  Q
    ||    
T  11547 tg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 208  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  226 gtgttgctgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  205 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  189 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 272  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 13508 - 13571
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13508 attgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20911
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 222  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  223 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagattttgatg 287  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  237 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  209 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12047
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgag 171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgag 12047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15669
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  272 gattaagat 280  Q
    |||||||||    
T  15677 gattaagat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 57760 - 57708
Alignment:
Q  5 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57760 tgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 1215 - 1327
Alignment:
Q  10 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttgattaccat 107  Q
    |||||||||||| || || ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||    
T  1215 aattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttgattatcat 1312  T
Q  108 ttgatgttgttatat 122  Q
    |||||||||||||||    
T  1313 ttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4946
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 212
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 212  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 206  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  207 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14804
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  265 ctaagttgat 274  Q
    ||||||||||    
T  14795 ctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  265 ctaag 269  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatca 25192  T
Q  206 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 273  Q
    ||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16324 - 16239
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttat--atgtatatattgatg 86  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||    
T  16324 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaatttatatgaatgtatatgttgatg 16239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  265 ctaagttga 273  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 221  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  222 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || || || ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 280
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6236
Alignment:
Q  179 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 276  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  277 agat 280  Q
    ||||    
T  6233 agat 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 224  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  205 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  127 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 225  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1147
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16301
Alignment:
Q  172 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6619
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 6619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13999
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 13999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15890
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178902
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagat 178902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 271  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  272 gat 274  Q
    |||    
T  6828 gat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1171
Alignment:
Q  106 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 205  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  206 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 4286 - 4320
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4286 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 267  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 6720 - 6682
Alignment:
Q  25 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6720 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29562
Alignment:
Q  183 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagat 29562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  107 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 196  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12954
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  269 gttga 273  Q
    |||||    
T  12958 gttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15358 - 15282
Alignment:
Q  3 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatat 79  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15358 attgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15350
Alignment:
Q  6 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 64  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaa 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  265 ctaagttga 273  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 266  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  267 aagttga 273  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 274
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  123 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 220  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  221 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 265  Q
    ||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23847
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagat 23847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193097
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatg 257  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  258 agtcggtctaagttg-attaagattttgatg 287  Q
    |||| ||| | |||| |||||||| ||||||    
T  193067 agtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5230
Alignment:
Q  170 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||  || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatac--ctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12780
Alignment:
Q  171 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 268  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  269 gttgat 274  Q
    ||||||    
T  12785 gttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36458
Alignment:
Q  235 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagat 36458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 15365 - 15461
Alignment:
Q  117 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 213  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |    ||| |||||| |  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15365 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt 15461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1835
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | ||| |||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1735 atttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 1832  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  1833 atg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 269
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1151
Alignment:
Q  138 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 236  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  237 g-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 269  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  205 atg 207  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 163
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagat 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7364
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Original strand, 5003 - 5037
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5003 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 274
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  236 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 274  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21916
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 21916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29808
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 29808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69798
Alignment:
Q  230 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagat 69798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1885
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagat 1885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10635
Alignment:
Q  227 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagat 10635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  163 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 260  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  261 cggtctaagttgat 274  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 4796 - 4917
Alignment:
Q  160 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatga 258  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||| |||||| ||||   |||| | || |||| || |||||||||||||||||||||    
T  4796 tgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatga 4895  T
Q  259 gtcggtctaagttgattaagat 280  Q
    |||  | |||| ||||||||||    
T  4896 gtcaatataagatgattaagat 4917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2257
Alignment:
Q  167 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University