View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8548A_low_133 (Length: 283)

Name: NF8548A_low_133
Description: NF8548A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8548A_low_133
NF8548A_low_133
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-283)||(10455-10737)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (1-277)||(36229-36505)
scaffold0079 (142-283)||(28803-28944)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-283)||(29225-29507)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-283)||(19980729-19981011)
chr8 (1-283)||(18859339-18859621)
chr8 (1-283)||(30310881-30311163)
chr8 (1-283)||(17671759-17672041)
chr8 (5-283)||(22129358-22129636)
chr8 (1-283)||(20016000-20016282)
chr8 (1-283)||(21164275-21164557)
chr8 (1-283)||(22126696-22126978)
chr8 (1-283)||(32602907-32603189)
chr8 (1-283)||(19115162-19115444)
chr8 (1-283)||(22117912-22118194)
chr8 (1-283)||(15536145-15536427)
chr8 (1-283)||(19481809-19482091)
chr8 (1-283)||(22042589-22042871)
chr8 (1-283)||(22030865-22031147)
chr8 (1-283)||(22989807-22990089)
chr8 (1-275)||(22421629-22421903)
chr8 (1-275)||(21253715-21253989)
chr8 (1-283)||(21391598-21391880)
chr8 (1-283)||(21780924-21781206)
chr8 (1-283)||(21786092-21786374)
chr8 (5-275)||(22246174-22246444)
chr8 (1-261)||(22523330-22523590)
chr8 (1-257)||(22375191-22375446)
chr8 (5-95)||(22245756-22245846)
chr8 (1-176)||(22053732-22053907)
chr8 (1-186)||(22028017-22028202)
chr8 (1-281)||(20390850-20391130)
chr8 (1-161)||(28983795-28983955)
chr8 (7-176)||(16268967-16269136)
chr8 (7-176)||(27357405-27357574)
chr8 (1-161)||(28989014-28989174)
chr8 (163-260)||(21920003-21920100)
chr8 (1-186)||(22373728-22373913)
chr8 (1-84)||(19985141-19985224)
chr8 (7-178)||(21928295-21928466)
chr8 (1-84)||(31414269-31414352)
chr8 (1-161)||(29301163-29301323)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-283)||(27559408-27559690)
chr6 (3-283)||(19867247-19867527)
chr6 (1-283)||(29589878-29590160)
chr6 (1-283)||(2872241-2872524)
chr6 (4-283)||(27189996-27190275)
chr6 (4-283)||(27258965-27259244)
chr6 (1-283)||(28312190-28312472)
chr6 (1-283)||(16574450-16574732)
chr6 (1-283)||(16620648-16620930)
chr6 (1-283)||(24293221-24293503)
chr6 (1-283)||(25115112-25115394)
chr6 (1-283)||(28260636-28260918)
chr6 (1-283)||(28284998-28285280)
chr6 (1-283)||(28339385-28339667)
chr6 (1-283)||(22436429-22436711)
chr6 (1-283)||(5836667-5836949)
chr6 (1-283)||(16925079-16925361)
chr6 (48-283)||(22827841-22828076)
chr6 (1-278)||(18405383-18405660)
chr6 (1-261)||(18182806-18183066)
chr6 (1-275)||(23080991-23081265)
chr6 (182-283)||(16961102-16961203)
chr6 (7-260)||(30678469-30678721)
chr6 (73-261)||(20135556-20135744)
chr6 (73-261)||(22197125-22197313)
chr6 (1-145)||(23085264-23085408)
chr6 (1-176)||(18797357-18797532)
chr6 (1-176)||(21567430-21567605)
chr6 (1-176)||(34643025-34643200)
chr6 (7-176)||(10466293-10466462)
chr6 (1-158)||(15462021-15462178)
chr6 (7-160)||(24367083-24367236)
chr6 (7-176)||(19455690-19455859)
chr6 (2-186)||(19486734-19486916)
chr6 (1-192)||(19437653-19437844)
chr6 (7-186)||(21474257-21474436)
chr6 (229-257)||(23085438-23085466)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-283)||(21882402-21882684)
chr5 (1-283)||(22330363-22330645)
chr5 (1-283)||(16359130-16359412)
chr5 (5-283)||(20803225-20803503)
chr5 (1-283)||(22350547-22350829)
chr5 (1-283)||(34569122-34569404)
chr5 (1-283)||(22137296-22137578)
chr5 (1-283)||(27521034-27521316)
chr5 (1-283)||(29473549-29473831)
chr5 (1-283)||(40711408-40711690)
chr5 (1-283)||(14997215-14997497)
chr5 (1-283)||(18781742-18782024)
chr5 (1-283)||(27682876-27683158)
chr5 (1-283)||(37288972-37289254)
chr5 (1-283)||(19772588-19772870)
chr5 (1-283)||(27612984-27613266)
chr5 (1-283)||(27665966-27666248)
chr5 (1-283)||(41773470-41773752)
chr5 (1-278)||(21342890-21343167)
chr5 (1-283)||(25429049-25429331)
chr5 (1-261)||(26736203-26736463)
chr5 (1-275)||(23473831-23474105)
chr5 (1-274)||(21336770-21337043)
chr5 (48-131)||(23525867-23525950)
chr5 (7-186)||(20311575-20311754)
chr5 (1-166)||(20778640-20778805)
chr5 (1-186)||(21561501-21561686)
chr5 (1-186)||(21983653-21983838)
chr5 (7-176)||(22505396-22505565)
chr5 (7-158)||(14884473-14884624)
chr5 (7-166)||(22464677-22464836)
chr5 (3-58)||(23460824-23460879)
chr5 (1-166)||(20824180-20824345)
chr5 (1-161)||(17266810-17266970)
chr5 (7-178)||(21409867-21410038)
chr5 (7-158)||(25850807-25850958)
chr5 (7-46)||(21631881-21631920)
chr5 (1-84)||(23078381-23078464)
chr5 (1-176)||(23563644-23563819)
chr5 (1-166)||(28892418-28892583)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-283)||(1329-1611)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-283)||(21329-21611)
scaffold0081 (1-283)||(36753-37035)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-283)||(37117-37399)
scaffold0042 (1-186)||(26174-26359)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-283)||(17363-17645)
scaffold0017 (1-278)||(195135-195412)
scaffold0017 (1-178)||(24136-24313)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-283)||(10873375-10873657)
chr7 (1-283)||(11234516-11234798)
chr7 (1-283)||(8200733-8201015)
chr7 (1-283)||(8710290-8710572)
chr7 (1-283)||(13688726-13689008)
chr7 (1-283)||(11550405-11550687)
chr7 (1-283)||(14335081-14335363)
chr7 (1-283)||(44788654-44788936)
chr7 (1-283)||(15158360-15158642)
chr7 (1-283)||(18587474-18587756)
chr7 (1-283)||(9591053-9591331)
chr7 (1-283)||(17703758-17704040)
chr7 (1-283)||(14957239-14957521)
chr7 (1-283)||(18180430-18180710)
chr7 (2-283)||(12690187-12690468)
chr7 (1-185)||(15146226-15146410)
chr7 (118-283)||(14149856-14150021)
chr7 (1-261)||(14042402-14042662)
chr7 (1-261)||(14352432-14352692)
chr7 (160-283)||(16726845-16726968)
chr7 (7-259)||(15627233-15627485)
chr7 (1-176)||(14140472-14140647)
chr7 (1-166)||(11385710-11385875)
chr7 (7-176)||(12459421-12459590)
chr7 (1-161)||(13024153-13024313)
chr7 (1-176)||(18051234-18051409)
chr7 (7-161)||(26092085-26092239)
chr7 (1-178)||(19149802-19149979)
chr7 (1-178)||(20749201-20749378)
chr7 (7-160)||(26115877-26116030)
chr7 (1-176)||(14283655-14283830)
chr7 (7-166)||(21755215-21755374)
chr7 (7-161)||(49155109-49155263)
chr7 (230-278)||(15146416-15146464)
chr7 (1-176)||(16947753-16947928)
chr7 (7-158)||(40925104-40925255)
chr7 (1-178)||(14261527-14261703)
chr7 (1-161)||(15343239-15343399)
chr7 (1-176)||(13676244-13676419)
chr7 (1-176)||(15099884-15100059)
chr7 (1-95)||(12204081-12204175)
chr7 (7-188)||(12798788-12798969)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (1-283)||(23958443-23958725)
chr4 (1-283)||(19634832-19635114)
chr4 (1-283)||(8050657-8050939)
chr4 (1-283)||(12479296-12479578)
chr4 (1-283)||(14301013-14301295)
chr4 (1-283)||(16234026-16234308)
chr4 (1-283)||(17092183-17092465)
chr4 (1-283)||(18224480-18224762)
chr4 (1-283)||(27714032-27714314)
chr4 (1-283)||(40475736-40476018)
chr4 (1-283)||(8389108-8389390)
chr4 (1-283)||(16250884-16251166)
chr4 (1-283)||(15144926-15145209)
chr4 (1-283)||(14683263-14683545)
chr4 (1-283)||(19775827-19776109)
chr4 (1-275)||(14188210-14188484)
chr4 (1-275)||(14696805-14697079)
chr4 (1-275)||(14162174-14162448)
chr4 (134-283)||(16352697-16352846)
chr4 (1-283)||(16069-16351)
chr4 (1-138)||(16350588-16350725)
chr4 (25-275)||(16218934-16219184)
chr4 (25-275)||(16222254-16222504)
chr4 (7-161)||(29450837-29450991)
chr4 (7-161)||(3262094-3262248)
chr4 (1-186)||(15073152-15073337)
chr4 (7-160)||(44659166-44659319)
chr4 (151-283)||(22632396-22632528)
chr4 (7-176)||(11204532-11204701)
chr4 (1-166)||(27903198-27903363)
chr4 (1-44)||(13513285-13513328)
chr4 (1-176)||(51604086-51604261)
chr4 (145-275)||(14848543-14848673)
chr4 (1-176)||(20892834-20893009)
chr4 (1-46)||(53750764-53750809)
chr4 (7-84)||(16150531-16150608)
chr4 (7-84)||(16154677-16154754)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-283)||(21142875-21143157)
chr2 (1-283)||(24677814-24678096)
chr2 (1-260)||(11351545-11351804)
chr2 (1-283)||(9337909-9338191)
chr2 (1-283)||(9486543-9486825)
chr2 (1-283)||(21323100-21323382)
chr2 (1-283)||(10871177-10871459)
chr2 (1-283)||(16983567-16983849)
chr2 (1-283)||(17001327-17001609)
chr2 (1-283)||(24657492-24657774)
chr2 (1-283)||(24874584-24874866)
chr2 (1-283)||(22323176-22323458)
chr2 (1-283)||(27220343-27220625)
chr2 (1-283)||(27373596-27373878)
chr2 (1-283)||(44383404-44383686)
chr2 (1-283)||(24712361-24712643)
chr2 (5-283)||(24264697-24264975)
chr2 (3-283)||(24705318-24705598)
chr2 (1-283)||(23204641-23204923)
chr2 (1-283)||(41606221-41606501)
chr2 (1-203)||(23029295-23029497)
chr2 (1-275)||(23105562-23105836)
chr2 (1-167)||(45673846-45674012)
chr2 (1-283)||(23074190-23074472)
chr2 (1-260)||(22733608-22733867)
chr2 (1-257)||(24817674-24817930)
chr2 (1-192)||(23097852-23098043)
chr2 (1-57)||(22742800-22742856)
chr2 (1-176)||(19716851-19717026)
chr2 (7-186)||(19817271-19817450)
chr2 (1-186)||(23113147-23113332)
chr2 (1-176)||(12576787-12576962)
chr2 (7-186)||(30208760-30208939)
chr2 (7-132)||(20848067-20848192)
chr2 (1-46)||(23064977-23065022)
chr2 (7-192)||(23274011-23274196)
chr2 (247-283)||(11351800-11351836)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-278)||(50642-50919)
scaffold0102 (1-178)||(42528-42705)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-283)||(31609-31890)
scaffold0080 (1-283)||(37075-37356)
scaffold0080 (1-283)||(10535-10817)
scaffold0080 (1-283)||(13190-13472)
scaffold0080 (1-282)||(54363-54644)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-283)||(15713589-15713871)
chr3 (1-283)||(16638088-16638370)
chr3 (1-283)||(26790946-26791228)
chr3 (1-283)||(43164990-43165272)
chr3 (1-269)||(15065400-15065668)
chr3 (1-283)||(10908525-10908807)
chr3 (1-283)||(12889024-12889306)
chr3 (1-283)||(13255005-13255287)
chr3 (1-283)||(14874101-14874383)
chr3 (1-283)||(16754234-16754516)
chr3 (1-283)||(3688258-3688540)
chr3 (1-283)||(6603051-6603332)
chr3 (1-283)||(10007915-10008197)
chr3 (1-283)||(15345778-15346060)
chr3 (1-283)||(15586925-15587207)
chr3 (1-283)||(20059587-20059869)
chr3 (1-283)||(48427762-48428044)
chr3 (1-283)||(24185505-24185787)
chr3 (1-283)||(5422463-5422745)
chr3 (1-283)||(15358398-15358680)
chr3 (1-283)||(15400050-15400332)
chr3 (1-283)||(16694479-16694761)
chr3 (1-283)||(53382551-53382833)
chr3 (1-283)||(16804480-16804762)
chr3 (1-260)||(14578941-14579200)
chr3 (1-283)||(17492166-17492448)
chr3 (1-275)||(15261953-15262227)
chr3 (89-272)||(26190937-26191120)
chr3 (1-260)||(12843636-12843895)
chr3 (142-281)||(18437457-18437596)
chr3 (1-176)||(24189736-24189911)
chr3 (7-161)||(10408415-10408569)
chr3 (1-95)||(17188887-17188981)
chr3 (7-161)||(47126391-47126545)
chr3 (1-176)||(13944456-13944631)
chr3 (1-178)||(14291054-14291231)
chr3 (7-176)||(16832056-16832225)
chr3 (1-161)||(11958703-11958863)
chr3 (1-176)||(16378456-16378631)
chr3 (7-158)||(28756769-28756920)
chr3 (9-186)||(12858025-12858202)
chr3 (7-84)||(15013297-15013374)
chr3 (7-176)||(12510011-12510180)
chr3 (1-161)||(10417567-10417727)
chr3 (1-176)||(12272770-12272945)
chr3 (1-275)||(31692707-31692981)
chr3 (1-161)||(8744912-8745072)
chr3 (1-176)||(16327231-16327406)
chr3 (64-186)||(13318087-13318209)
chr3 (7-191)||(12358055-12358239)
chr3 (1-95)||(15230116-15230210)
chr3 (1-95)||(15235984-15236078)
chr3 (1-158)||(14575436-14575593)
chr3 (1-176)||(17494078-17494254)
chr3 (7-50)||(11949453-11949496)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-283)||(16347961-16348243)
chr1 (1-283)||(51330858-51331140)
chr1 (1-283)||(19109079-19109361)
chr1 (1-283)||(21833013-21833295)
chr1 (1-283)||(33388395-33388677)
chr1 (1-283)||(17042381-17042663)
chr1 (1-283)||(24785223-24785505)
chr1 (1-283)||(41351034-41351316)
chr1 (1-275)||(16378813-16379087)
chr1 (1-155)||(20081742-20081896)
chr1 (97-283)||(22502751-22502937)
chr1 (85-283)||(21233181-21233379)
chr1 (1-140)||(21842066-21842205)
chr1 (136-283)||(21839661-21839808)
chr1 (54-281)||(21751650-21751877)
chr1 (1-84)||(22496622-22496705)
chr1 (53-184)||(429575-429706)
chr1 (7-161)||(38910198-38910352)
chr1 (7-161)||(12200382-12200536)
chr1 (1-178)||(21739402-21739579)
chr1 (7-158)||(31537369-31537520)
chr1 (7-161)||(48425737-48425891)
chr1 (7-161)||(52988605-52988759)
chr1 (7-176)||(20297230-20297399)
chr1 (142-283)||(22359751-22359892)
chr1 (7-160)||(37679914-37680067)
chr1 (142-283)||(21861880-21862021)
chr1 (7-166)||(20854132-20854291)
chr1 (1-178)||(21742918-21743095)
chr1 (3-46)||(21751995-21752038)
chr1 (1-176)||(22016111-22016286)
chr1 (1-176)||(24096981-24097156)
chr1 (1-192)||(19857107-19857298)
chr1 (7-192)||(20833272-20833457)
chr1 (7-84)||(18710326-18710403)
chr1 (214-283)||(20140794-20140863)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-283)||(10093-10375)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-283)||(7983-8265)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-283)||(40880-41162)
scaffold0109 (3-283)||(13423-13703)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-283)||(11194-11476)
scaffold0028 (1-283)||(17662-17944)
scaffold0028 (12-283)||(53452-53723)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-283)||(35012-35293)
scaffold0022 (2-283)||(41357-41638)
scaffold0022 (2-283)||(75077-75358)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-283)||(21972-22254)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-283)||(3149-3431)
scaffold0044 (1-283)||(16885-17167)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-283)||(12388-12670)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (17-283)||(11669-11935)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-226)||(14206-14431)
scaffold0010 (1-275)||(4648-4922)
scaffold0010 (7-161)||(39636-39790)
scaffold0010 (7-192)||(44730-44915)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-260)||(25009-25268)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-260)||(10534-10793)
scaffold0476 (1-176)||(842-1017)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-195)||(777-971)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-260)||(24242-24501)
scaffold0243 (7-192)||(10075-10260)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-258)||(18400-18657)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (1-260)||(4182-4441)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (97-283)||(15387-15573)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-283)||(7948-8230)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-275)||(151814-152088)
scaffold0023 (1-281)||(47280-47541)
scaffold0023 (115-283)||(1916-2084)
scaffold0023 (1-68)||(30871-30938)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-275)||(103960-104234)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-274)||(23830-24103)
scaffold0011 (1-192)||(151383-151574)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-226)||(13866-14091)
scaffold0120 (167-260)||(8770-8863)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (111-283)||(554-726)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-260)||(3349-3608)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-259)||(13776-14034)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-275)||(6606-6880)
scaffold0270 (1-275)||(13736-14010)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-275)||(5846-6120)
scaffold0074 (1-176)||(14955-15130)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-281)||(111204-111484)
scaffold0040 (7-275)||(17611-17879)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-252)||(8706-8957)
scaffold0358 (89-252)||(17902-18065)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-275)||(14563-14837)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-275)||(216717-216991)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-148)||(1-148)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (109-283)||(8146-8320)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-283)||(55767-56049)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-275)||(495753-496027)
scaffold0001 (1-154)||(441507-441660)
scaffold0001 (7-176)||(514656-514825)
scaffold0001 (211-257)||(441441-441487)
scaffold0001 (142-186)||(452651-452695)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (1-206)||(784-989)
scaffold0993 (112-260)||(630-778)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-257)||(15276-15532)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-184)||(11177-11360)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-275)||(17646-17914)
scaffold0114 (1-176)||(39890-40065)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-274)||(4317-4590)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-248)||(40804-41049)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-257)||(23595-23851)
scaffold0018 (1-257)||(9648-9904)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-260)||(675-934)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (136-283)||(9665-9812)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-168)||(2560-2727)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (133-283)||(1-151)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-140)||(8076-8217)
scaffold0130 (1-186)||(4186-4371)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (34-283)||(1177-1426)
scaffold0278 (1-38)||(3521-3558)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-176)||(15254-15429)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (5-149)||(57915-58059)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (1-132)||(1865-1996)
scaffold0324 (63-283)||(12573-12792)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (161-283)||(27952-28074)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-103)||(7141-7243)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-185)||(4911-5095)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (53-184)||(844-975)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (113-260)||(6496-6643)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (7-161)||(11656-11810)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-89)||(8329-8417)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-260)||(60487-60746)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-176)||(115394-115569)
scaffold0029 (1-158)||(94191-94348)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-176)||(263058-263233)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (209-283)||(52430-52504)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (1-166)||(25954-26119)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (7-176)||(293-462)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-132)||(21488-21613)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-186)||(200765-200950)
scaffold0004 (7-176)||(325539-325708)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-161)||(3467-3627)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-60)||(1066-1125)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (1-176)||(5146-5321)
scaffold0348 (1-176)||(17781-17956)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (7-186)||(1821-2000)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-176)||(21683-21858)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-176)||(53720-53895)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-176)||(49477-49652)
scaffold0067 (1-176)||(58511-58686)
scaffold0067 (1-176)||(64899-65074)
scaffold0067 (1-176)||(29456-29631)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-176)||(1180-1355)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-82)||(8036-8117)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-186)||(29349-29534)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-178)||(11790-11967)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-161)||(65595-65755)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (1-176)||(131-306)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-176)||(8446-8621)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-176)||(10083-10258)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-176)||(784-959)
scaffold0222 (7-192)||(20630-20815)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-176)||(63816-63991)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-96)||(203293-203388)
scaffold0003 (1-46)||(424270-424315)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-191)||(152-342)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (1-186)||(1569-1754)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-178)||(2701-2878)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-46)||(2-47)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-186)||(28582-28767)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (158-283)||(231-358)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (147-283)||(7102-7238)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (1-176)||(11662-11837)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-176)||(67405-67580)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (7-158)||(41585-41736)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (2-176)||(5443-5617)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (8-178)||(25046-25216)
scaffold0104 (7-178)||(43722-43893)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-46)||(14873-14918)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-166)||(70214-70379)
scaffold0034 (7-176)||(2255-2425)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-166)||(251464-251629)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (167-283)||(1196-1312)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-176)||(1608-1783)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-84)||(4386-4469)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-176)||(7576-7751)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-176)||(21954-22129)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-192)||(98880-99071)
scaffold0020 (1-95)||(175901-175995)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (7-94)||(83824-83911)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-161)||(29781-29935)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (7-176)||(415-584)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (7-192)||(6854-7039)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-178)||(5432-5609)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (11-176)||(10809-10974)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (7-84)||(30629-30706)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (7-176)||(41411-41579)
scaffold0035 (7-84)||(5729-5806)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (1-60)||(4601-4660)
scaffold0335 (124-186)||(4670-4732)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-84)||(12651-12734)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-176)||(1151-1326)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (143-257)||(5328-5442)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (117-186)||(8459-8528)
scaffold0083 (117-186)||(7148-7217)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (1-84)||(1112-1195)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-84)||(8759-8842)
scaffold0235 (1-84)||(18973-19056)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (151-257)||(20992-21098)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (10-176)||(952-1118)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (1-46)||(6554-6599)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (7-84)||(20831-20908)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-133)||(36814-36946)


Alignment Details
Target: scaffold0550 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10455 - 10737
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10455 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 10554  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10555 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagtcagtgta 10654  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10655 tttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggtatattga 10737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36505 - 36229
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36505 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 36406  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36405 atctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 36306  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36305 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28803
Alignment:
Q  142 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  242 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 28803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 29225 - 29507
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29225 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 29324  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  29325 atttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 29424  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29425 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggtattttga 29507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19981011 - 19980729
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981011 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 19980912  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||    
T  19980911 atttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagttagtgta 19980812  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19980811 tttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggtattttga 19980729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18859621 - 18859339
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18859621 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 18859522  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  18859521 atttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 18859422  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859421 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 18859339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 30310881 - 30311163
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30310881 ggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 30310980  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  30310981 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 30311080  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30311081 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 30311163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17671759 - 17672041
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17671759 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17671858  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  17671859 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 17671958  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17671959 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17672041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 22129358 - 22129636
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22129358 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 22129457  T
Q  105 agtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttc 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  22129458 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttc 22129557  T
Q  205 tcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22129558 tcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22129636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 20016000 - 20016282
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20016000 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 20016099  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  20016100 gtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 20016199  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20016200 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20016282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21164275 - 21164557
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21164275 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 21164374  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21164375 acttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 21164474  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21164475 tttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgatattttga 21164557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22126696 - 22126978
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22126696 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 22126795  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  22126796 atttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 22126895  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22126896 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22126978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32603189 - 32602907
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32603189 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaatgg 32603090  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  32603089 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 32602990  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32602989 tttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 32602907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19115444 - 19115162
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19115444 ggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 19115345  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  19115344 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 19115245  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115244 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19115162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22117912 - 22118194
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22117912 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 22118011  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  22118012 atttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagcaagtcagtgca 22118111  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22118112 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22118194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15536427 - 15536145
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15536427 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatgg 15536328  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  15536327 atttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 15536228  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15536227 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 15536145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 19481809 - 19482091
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19481809 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatgg 19481908  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  19481909 atttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 19482008  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482009 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 19482091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22042871 - 22042589
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22042871 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 22042772  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | ||||    
T  22042771 atttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagttagtgta 22042672  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22042671 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22042589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22031147 - 22030865
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||    
T  22031147 ggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaatgg 22031048  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||     
T  22031047 atttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtg 22030948  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  || |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22030947 tttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22030865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22990089 - 22989807
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  22990089 ggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattg 22989990  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  22989989 acttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 22989890  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  22989889 tttctcttctgctgaagaggaaagtgacgcatagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 22989807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 22421629 - 22421903
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  22421629 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattg 22421728  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  22421729 acttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 22421828  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22421829 tttctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatgg 22421903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21253989 - 21253715
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21253989 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 21253890  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  21253889 atttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcgctgta 21253790  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21253789 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 21253715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21391598 - 21391880
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21391598 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 21391697  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || || | | |||||  ||||    
T  21391698 atttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgta 21391797  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||| || |  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21391798 ttactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21391880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21780924 - 21781206
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21780924 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 21781023  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || || | | |||||  ||||    
T  21781024 atttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgta 21781123  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||| || |  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21781124 ttactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21781206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21786092 - 21786374
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21786092 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 21786191  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || || | | |||||  ||||    
T  21786192 atttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgta 21786291  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||| || |  || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  21786292 ttactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 21786374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Original strand, 22246174 - 22246444
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  22246174 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaattt 22246273  T
Q  105 agtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttc 204  Q
     || ||| |||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||     
T  22246274 ggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaagtcgatgtatttt 22246373  T
Q  205 tcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    || || |  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22246374 tcttctgctgaagaggaaagtggtgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 22246444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22523590 - 22523330
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |    
T  22523590 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattg 22523491  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||    
T  22523490 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgta 22523391  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| || |  ||||| ||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22523390 tttctcttctgctgaagaagaaagtagcgcaaagttcttgtctaccaagcagctgaagcaa 22523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 22375191 - 22375446
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |    
T  22375191 ggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaaattg 22375289  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  22375290 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 22375389  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22375390 tttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcagaattcttgtctactaagtagctgaa 22375446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Original strand, 22245756 - 22245846
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22245756 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 22245846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22053907 - 22053732
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| |||  ||||||  ||||||||||||| | || |||| | | |    
T  22053907 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgtggttg 22053808  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22053807 atttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatat 22053732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22028017 - 22028202
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  22028017 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 22028116  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    | ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||    
T  22028117 acttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgtttt 22028202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20391130 - 20390850
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  20391130 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 20391031  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | || |||| | ||| | ||| |    
T  20391030 atcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgca 20390931  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    ||| || || |  || || || |||   || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  20390930 tttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatctt 20390850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28983955 - 28983795
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  28983955 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattg 28983856  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | || || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28983855 acttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28983795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 16268967 - 16269136
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||| | | | |||||||    
T  16268967 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttag 16269066  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16269067 tttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 16269136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27357574 - 27357405
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  27357574 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 27357475  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || || | |||||||||    
T  27357474 tttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagattataatcgtgttcatat 27357405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28989174 - 28989014
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  28989174 ggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattg 28989075  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | || || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28989074 acttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28989014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 260
Target Start/End: Original strand, 21920003 - 21920100
Alignment:
Q  163 aaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||  |||||||||  || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21920003 aaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 21920100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22373913 - 22373728
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||| | | || |||||  | |    
T  22373913 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagactttgaagttg 22373814  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || | || ||| | || | ||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  22373813 atcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgtttt 22373728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19985224 - 19985141
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  19985224 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 19985141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21928466 - 21928295
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||| | || |||||||||||| | || |||||  | ||| |||    
T  21928466 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctag 21928367  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    | ||| | || ||||  ||||||||| | ||| | || ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  21928366 tatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatatta 21928295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 31414269 - 31414352
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| || ||||||||||||    
T  31414269 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 31414352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 29301163 - 29301323
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| |||  ||||| || |||||||||||| | || |||| | | |    
T  29301163 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttg 29301262  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    ||||||| ||| | || ||    ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  29301263 atttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 29301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27559408 - 27559690
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559408 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 27559507  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  27559508 atttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 27559607  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559608 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggtattttga 27559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19867527 - 19867247
Alignment:
Q  3 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19867527 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggat 19867428  T
Q  103 ttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  19867427 ttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatt 19867328  T
Q  203 tctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19867327 tctcctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggtattttga 19867247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 29589878 - 29590160
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29589878 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 29589977  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  29589978 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 29590077  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29590078 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 29590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 2872241 - 2872524
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  2872241 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 2872340  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  2872341 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 2872440  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagag-ttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2872441 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttttatctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggtatcttga 2872524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27190275 - 27189996
Alignment:
Q  4 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27190275 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatt 27190176  T
Q  104 tagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtattt 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  ||||    
T  27190175 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 27190076  T
Q  204 ctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190075 ctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27189996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 27258965 - 27259244
Alignment:
Q  4 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27258965 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatt 27259064  T
Q  104 tagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtattt 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  ||||    
T  27259065 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 27259164  T
Q  204 ctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259165 ctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27259244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28312472 - 28312190
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28312472 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 28312373  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  28312372 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 28312273  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312272 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 28312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16574732 - 16574450
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  16574732 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 16574633  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  16574632 atttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgca 16574533  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16574532 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16574450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16620648 - 16620930
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  16620648 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 16620747  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  16620748 atttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgca 16620847  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16620848 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16620930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 24293221 - 24293503
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  24293221 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatgg 24293320  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  24293321 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagcaagtcagtgca 24293420  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24293421 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggtatcttga 24293503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25115394 - 25115112
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25115394 ggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 25115295  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  25115294 atttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 25115195  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115194 tttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagtttttatccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 25115112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28260636 - 28260918
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28260636 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 28260735  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  28260736 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 28260835  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28260836 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28260918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28285280 - 28284998
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28285280 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 28285181  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  28285180 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 28285081  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28285080 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28284998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28339385 - 28339667
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28339385 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 28339484  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  28339485 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 28339584  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339585 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28339667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22436711 - 22436429
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22436711 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattg 22436612  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || ||  | |||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22436611 atatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 22436512  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22436511 tttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 22436429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 5836667 - 5836949
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5836667 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 5836766  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||    
T  5836767 atttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagcaagtcagtgta 5836866  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5836867 tttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 5836949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16925079 - 16925361
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925079 ggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16925178  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16925179 atttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 16925278  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  16925279 tttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggtattttga 16925361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 283
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828076
Alignment:
Q  48 tctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  148 aattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctacta 247  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctacta 22828040  T
Q  248 agcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828041 agcaggtgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 22828076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 18405383 - 18405660
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||| ||      
T  18405383 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaatta 18405482  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||    
T  18405483 atttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagtaaatcagtgta 18405582  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 278  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405583 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 18182806 - 18183066
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || |    
T  18182806 ggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattg 18182905  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||    | ||| |||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  18182906 atacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtcagtgta 18183005  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
     || || || |  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18183006 cttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagtagctgaagcaa 18183066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23081265 - 23080991
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |    
T  23081265 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattg 23081166  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  23081165 acttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 23081066  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| ||    |||||||||||||  ||| | || | |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  23081065 tttctcttcttctgaagaggaaagtggcgcaaaattttggtctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatgg 23080991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Original strand, 16961102 - 16961203
Alignment:
Q  182 gttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16961102 gttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatatt 16961201  T
Q  282 ga 283  Q
    ||    
T  16961202 ga 16961203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Original strand, 30678469 - 30678721
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |||| ||| | || || ||||||||||| || |||||  | |||||||    
T  30678469 atggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttag 30678568  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctc 206  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||  |||| |||| ||    
T  30678569 tctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttagtaag-aaatgcatttttc 30678667  T
Q  207 ctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
     || |  ||||| || ||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30678668 ttctgctgaagaagagagtgaagctgagttcttgactactacgcagctgaagca 30678721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20135744 - 20135556
Alignment:
Q  73 tctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 172  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  20135744 tctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatgttc 20135645  T
Q  173 atattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||| || || |  |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135644 atattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 20135556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Original strand, 22197125 - 22197313
Alignment:
Q  73 tctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttc 172  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  22197125 tctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatgttc 22197224  T
Q  173 atattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||| || || |  |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22197225 atattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 22197313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 23085264 - 23085408
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  23085264 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattg 23085363  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggta 145  Q
    |||| || ||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  23085364 atttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18797532 - 18797357
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  | |||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  18797532 ggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtag 18797433  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  18797432 acttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 18797357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 21567430 - 21567605
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  21567430 ggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcg 21567529  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||    
T  21567530 acttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatat 21567605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 34643025 - 34643200
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  | |    
T  34643025 ggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 34643124  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |  |||| ||  |||||||||  || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  34643125 acctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 34643200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 10466293 - 10466462
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||  ||||||||||||||| | || |||| | | |||||||    
T  10466293 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttgtggttgatttag 10466392  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10466393 tttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatat 10466462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15462178 - 15462021
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  15462178 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagagattttgaggtcg 15462079  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  15462078 acttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttaga 15462021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24367236 - 24367083
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  24367236 atggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagagattttgtgattgatttag 24367137  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 160  Q
    | ||||| || || |  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  24367136 tttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19455859 - 19455690
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||| | || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  19455859 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 19455760  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  19455759 tttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 19455690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 19486734 - 19486916
Alignment:
Q  2 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgga 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||  ||||  || |||||||||||| | ||||||||  | ||    
T  19486734 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttga 19486833  T
Q  102 tttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    | |||| ||| | ||  |||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  19486834 tctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatgaattgtttt 19486916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19437844 - 19437653
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || | |||||||| | | || |||||  | |    
T  19437844 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagagactttgaagtcg 19437745  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  19437744 acttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 19437653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21474436 - 21474257
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | ||| | |    
T  21474436 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttg 21474337  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    | ||| |  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  21474336 tatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgtttt 21474257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 257
Target Start/End: Original strand, 23085438 - 23085466
Alignment:
Q  229 gcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23085438 gcagagttcttgtctactaagcagctgaa 23085466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21882684 - 21882402
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882684 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 21882585  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  21882584 atttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcggtgta 21882485  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21882484 tttctcctccgtctaggaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 21882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22330363 - 22330645
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22330363 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 22330462  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  22330463 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 22330562  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22330563 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22330645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16359412 - 16359130
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16359412 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16359313  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  16359312 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 16359213  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16359212 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16359130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20803503 - 20803225
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20803503 agatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 20803404  T
Q  105 agtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttc 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  20803403 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagcaagtcagtgtatttc 20803304  T
Q  205 tcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20803303 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggtatcttga 20803225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22350829 - 22350547
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22350829 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatgg 22350730  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| || |    
T  22350729 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagcaagtcagtgca 22350630  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350629 tttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 22350547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34569404 - 34569122
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34569404 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 34569305  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  34569304 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 34569205  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34569204 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 34569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22137578 - 22137296
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22137578 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaaatgg 22137479  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  22137478 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 22137379  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137378 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22137296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27521316 - 27521034
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27521316 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 27521217  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  27521216 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 27521117  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27521116 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27521034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 29473549 - 29473831
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  29473549 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 29473648  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  29473649 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 29473748  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29473749 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 29473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40711690 - 40711408
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40711690 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 40711591  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  40711590 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 40711491  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40711490 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40711408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 14997215 - 14997497
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  14997215 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 14997314  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  14997315 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 14997414  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997415 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 14997497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18782024 - 18781742
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18782024 ggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 18781925  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  18781924 attaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 18781825  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18781824 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18781742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27682876 - 27683158
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27682876 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 27682975  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27682976 atttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgta 27683075  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27683076 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggtatcttga 27683158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 37288972 - 37289254
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||    
T  37288972 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaatgg 37289071  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  37289072 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 37289171  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37289172 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 37289254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19772870 - 19772588
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  19772870 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 19772771  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  19772770 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 19772671  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19772670 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19772588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27613266 - 27612984
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27613266 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 27613167  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  27613166 atttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 27613067  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27613066 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27612984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27665966 - 27666248
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27665966 ggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 27666065  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  27666066 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 27666165  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27666166 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27666248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41773752 - 41773470
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41773752 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatgg 41773653  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  41773652 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 41773553  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41773552 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41773470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 21342890 - 21343167
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21342890 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatgg 21342989  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||    
T  21342990 atttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagttta 21343089  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 278  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343090 tttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25429331 - 25429049
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25429331 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttgagattg 25429232  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||| ||||    
T  25429231 atttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcagtgta 25429132  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  25429131 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 25429049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 26736203 - 26736463
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  26736203 ggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattg 26736302  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  26736303 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 26736402  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||| | || |||||||  |||||||||||||||    
T  26736403 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaa 26736463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23474105 - 23473831
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  23474105 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 23474006  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  23474005 acttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 23473906  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || |  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23473905 tttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21336770 - 21337043
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  21336770 ggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattttgaaattg 21336869  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || |  ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  21336870 acttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 21336969  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 274  Q
    ||| || || |  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21336970 tttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23525950 - 23525867
Alignment:
Q  48 tctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatgga 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23525950 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311575
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||   |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||||| |  | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||| | |||||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgtttt 20311575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20778805 - 20778640
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  20778805 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 20778706  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20778705 acttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 20778640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21561501 - 21561686
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  21561501 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 21561600  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||| ||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21561601 atctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgtttt 21561686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21983653 - 21983838
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||| || | |||||||||| | ||||||||  | |    
T  21983653 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttg 21983752  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21983753 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgtttt 21983838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22505565 - 22505396
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||  | | ||||||| | |||||||||    
T  22505565 atggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttgtggtggatttag 22505466  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22505465 tttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 22505396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 14884473 - 14884624
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  14884473 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 14884572  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  14884573 tttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 14884624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22464836 - 22464677
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | || ||||    
T  22464836 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttag 22464737  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  22464736 tatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaacc 22464677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23460879 - 23460824
Alignment:
Q  3 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23460879 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20824345 - 20824180
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||| ||| | |    
T  20824345 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcg 20824246  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    ||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20824245 atttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 20824180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 17266810 - 17266970
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  17266810 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 17266909  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  17266910 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 17266970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21410038 - 21409867
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||||   |||| ||||    
T  21410038 atggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 21409939  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    ||||| | || ||||  || |||||||| || || |||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||    
T  21409938 tctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggtatgaactggttggaatttaaccttgttcatatta 21409867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25850958 - 25850807
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  25850958 atggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 25850859  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | ||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  25850858 tttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 21631881 - 21631920
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631881 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21631920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 23078381 - 23078464
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| || ||||||||||||    
T  23078381 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 23078464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23563644 - 23563819
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||| | || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  23563644 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 23563743  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  23563744 acttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 23563819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 28892418 - 28892583
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  28892418 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcg 28892517  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||    
T  28892518 acttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataacc 28892583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 1329 - 1611
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1329 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 1428  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  1429 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 1528  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1529 tttctcttccatcgaagaggaaagtggtgtagagtttctatctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggtattttga 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21611 - 21329
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21611 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 21512  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21511 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 21412  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21411 tttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 21329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37035 - 36753
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37035 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 36936  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36935 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 36836  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36835 tttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 36753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 37117 - 37399
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  37117 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatgg 37216  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37217 acttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 37316  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37317 tttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 37399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26359 - 26174
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  26359 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattg 26260  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |||| || ||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26259 atttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttt 26174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17363 - 17645
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17363 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17462  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||    
T  17463 atttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtata 17562  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17563 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatggtattttga 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 195135 - 195412
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  195135 ggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatgg 195234  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||    
T  195235 atttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagcaagtcagtgta 195334  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195335 tttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24313 - 24136
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| || ||||||||| | |||||||   |||    
T  24313 ggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgtagtgg 24214  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    |  |||||||| |  | ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24213 acctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatatta 24136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10873657 - 10873375
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10873657 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 10873558  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  10873557 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 10873458  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873457 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 11234516 - 11234798
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  11234516 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 11234615  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  11234616 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 11234715  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11234716 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 11234798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8201015 - 8200733
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8201015 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 8200916  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  8200915 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 8200816  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8200815 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8200733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8710572 - 8710290
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  8710572 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 8710473  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  8710472 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 8710373  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8710372 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8710290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13689008 - 13688726
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  13689008 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 13688909  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  13688908 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 13688809  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13688808 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 11550405 - 11550687
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11550405 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 11550504  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  11550505 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 11550604  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  11550605 ttcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 11550687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14335363 - 14335081
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14335363 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 14335264  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  14335263 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 14335164  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14335163 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14335081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 44788654 - 44788936
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44788654 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 44788753  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  44788754 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 44788853  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44788854 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44788936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15158360 - 15158642
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  15158360 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatgg 15158459  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  15158460 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 15158559  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15158560 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15158642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 18587474 - 18587756
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  18587474 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 18587573  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  18587574 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 18587673  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18587674 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18587756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9591331 - 9591053
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9591331 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 9591232  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  9591231 atttagttt----acctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagcaagtcaatgta 9591136  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9591135 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 9591053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17703758 - 17704040
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17703758 ggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17703857  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  17703858 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 17703957  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17703958 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 17704040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14957521 - 14957239
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14957521 ggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 14957422  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14957421 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 14957322  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14957321 tttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14957239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18180710 - 18180430
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180710 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 18180611  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| |||||||| |  |    
T  18180610 atttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagcaagtcagtaca 18180511  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18180510 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt--ttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18180430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12690468 - 12690187
Alignment:
Q  2 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgga 101  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12690468 gagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 12690369  T
Q  102 tttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtat 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  12690368 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtat 12690269  T
Q  202 ttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12690268 ttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 12690187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15146226 - 15146410
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15146226 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattg 15146325  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttt 185  Q
    || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15146326 atatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 283
Target Start/End: Original strand, 14149856 - 14150021
Alignment:
Q  118 ttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaag 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| ||||  ||||    
T  14149856 ttgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaag 14149955  T
Q  218 aggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14149956 aggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttga 14150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14042662 - 14042402
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||  | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |    
T  14042662 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattg 14042563  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| ||||||| || ||||||||||| || |   | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||  ||||    
T  14042562 acttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgta 14042463  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| || |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14042462 tttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14352692 - 14352432
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||  | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |    
T  14352692 ggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattg 14352593  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| ||||||| || ||||||||||| || |   | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||  ||||    
T  14352592 acttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgta 14352493  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 261  Q
    |||||| || |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352492 tttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 283
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726968
Alignment:
Q  160 tacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagc 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  260 aactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttga 16726968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15627485 - 15627233
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | |  ||| ||||  | ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  15627485 atggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttag 15627386  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctc 206  Q
    | ||| | | |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||| ||    
T  15627385 tttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtgtatttttc 15627286  T
Q  207 ctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagc 259  Q
     || |  ||||| || ||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15627285 ttctgcggaagaagagagtggagcggagttcttaactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14140647 - 14140472
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  14140647 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 14140548  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  14140547 acttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatat 14140472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 11385710 - 11385875
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  11385710 ggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 11385809  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  11385810 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 11385875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12459590 - 12459421
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | || |||| | | |||||||    
T  12459590 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttgtggttgatttag 12459491  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12459490 tttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatat 12459421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13024313 - 13024153
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||  | | |    
T  13024313 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcg 13024214  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13024213 acttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18051234 - 18051409
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  18051234 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 18051333  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  18051334 atttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 18051409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 26092085 - 26092239
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  26092085 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 26092184  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26092185 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 26092239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19149979 - 19149802
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  |      
T  19149979 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtca 19149880  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19149879 atctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatta 19149802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20749378 - 20749201
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  |      
T  20749378 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtca 20749279  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20749278 atctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatta 20749201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 26115877 - 26116030
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  26115877 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 26115976  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 160  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  26115977 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 14283655 - 14283830
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  14283655 ggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 14283754  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  14283755 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 14283830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21755374 - 21755215
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| |||  |||||| |||||||||||||| | ||||| | | | |||||||    
T  21755374 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttag 21755275  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  21755274 tttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataacc 21755215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 49155263 - 49155109
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |    
T  49155263 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttgg 49155164  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | || || || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  49155163 tttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 49155109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  230 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16947753 - 16947928
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||| | || ||||   | |    
T  16947753 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcg 16947852  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||  | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16947853 acttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 16947928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 40925104 - 40925255
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||  |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  40925104 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttag 40925203  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  40925204 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 40925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 14261527 - 14261703
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||  ||||  | |    
T  14261527 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga-attgaagtcg 14261625  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  14261626 atctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatatta 14261703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15343399 - 15343239
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  15343399 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 15343300  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || |||||  | ||| | || |||||||||||||||||    
T  15343299 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagta 15343239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13676419 - 13676244
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  13676419 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 13676320  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13676319 acttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 13676244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 15099884 - 15100059
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||  || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  15099884 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 15099983  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |  |||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||    
T  15099984 acctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatat 15100059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 12204081 - 12204175
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  12204081 ggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 12204175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 12798788 - 12798969
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||  | ||| | |  ||||  || |||||||||||| | || |||||  | ||| |||    
T  12798788 atggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctag 12798887  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttgg 188  Q
    | ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  12798888 tatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttgg 12798969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23958725 - 23958443
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  23958725 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 23958626  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  23958625 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 23958526  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23958525 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 23958443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19635114 - 19634832
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19635114 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaatgg 19635015  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  19635014 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 19634915  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19634914 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19634832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 8050657 - 8050939
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  8050657 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 8050756  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  8050757 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 8050856  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8050857 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggtatcttga 8050939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12479578 - 12479296
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12479578 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 12479479  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  12479478 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 12479379  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12479378 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12479296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 14301013 - 14301295
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  14301013 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaatgg 14301112  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  14301113 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 14301212  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14301213 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14301295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16234026 - 16234308
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16234026 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16234125  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  16234126 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 16234225  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16234226 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16234308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17092183 - 17092465
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17092183 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17092282  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  17092283 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 17092382  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17092383 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17092465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 18224480 - 18224762
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18224480 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 18224579  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||    
T  18224580 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagcaagtcagtgta 18224679  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18224680 tttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18224762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27714314 - 27714032
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27714314 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 27714215  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | ||    
T  27714214 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtata 27714115  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27714114 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27714032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40476018 - 40475736
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40476018 ggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 40475919  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||| || |    
T  40475918 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagcaagtcagtgca 40475819  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475818 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttgtatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40475736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8389390 - 8389108
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8389390 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 8389291  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  8389290 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 8389191  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8389190 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8389108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16250884 - 16251166
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16250884 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16250983  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16250984 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 16251083  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16251084 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 16251166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15144926 - 15145209
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15144926 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 15145025  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt-ggcaagtcaatgt 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||    
T  15145026 atttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagtcaagtcagtgt 15145124  T
Q  200 atttctcctccgtcgaagaggaaagt-gttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15145125 atttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 15145209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14683545 - 14683263
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14683545 ggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 14683446  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  14683445 atttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcatgtcagtgta 14683346  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14683345 tttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14683263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 19775827 - 19776109
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  19775827 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 19775926  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  19775927 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 19776026  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19776027 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 19776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188210
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatgg 14188385  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||  |||     
T  14188384 atttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaattcggtgtc 14188285  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
     | |||||| |  ||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14188284 ctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagatgg 14188210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14697079 - 14696805
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |    
T  14697079 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 14696980  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  14696979 atttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgta 14696880  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || |  |||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14696879 tttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaattcttttctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14696805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14162448 - 14162174
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |  |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  14162448 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatgg 14162349  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||     
T  14162348 atttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagcaagtcggtgtc 14162249  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||| |  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14162248 cttctcctctgttgaagaagaaagcggagtagagttcttgtctaccaagcaactgaagcaactagaacgtgatgg 14162174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352846
Alignment:
Q  134 tgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcaga 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  234 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 16352846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16069 - 16351
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||  | || |    
T  16069 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattg 16168  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  16169 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 16268  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| | || |  |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  16269 tttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 16351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 16350588 - 16350725
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  16350588 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatgg 16350687  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 138  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350688 atctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16218934
Alignment:
Q  25 gctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcg 124  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  125 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaag 224  Q
    | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||||||| || |  |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16218985  T
Q  225 tgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16218984 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16218934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222254
Alignment:
Q  25 gctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcg 124  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||| |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  125 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaag 224  Q
    | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||||||| || |  |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16222305  T
Q  225 tgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16222304 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16222254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 29450837 - 29450991
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  29450837 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 29450936  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29450937 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 3262094 - 3262248
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  3262094 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 3262193  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  3262194 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 3262248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15073337 - 15073152
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||  |||||||| |||||||||||| | || |||||  | |    
T  15073337 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttg 15073238  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15073237 atcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgtttt 15073152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 44659166 - 44659319
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  44659166 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 44659265  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 160  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  44659266 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632396
Alignment:
Q  151 tggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagc 250  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||  |||||||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  251 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttga 22632396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 11204532 - 11204701
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   ||||||  ||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  11204532 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 11204631  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  11204632 tttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 11204701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27903363 - 27903198
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  27903363 ggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 27903264  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  27903263 acttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtataacc 27903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 13513328 - 13513285
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513328 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 51604086 - 51604261
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  51604086 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 51604185  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  51604186 acttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 51604261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848673
Alignment:
Q  145 atgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtcta 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||   || ||  ||||||| || || |  |||||||||||||  ||| |  |||||||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  245 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14848673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20893009 - 20892834
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||   | |||| |||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  20893009 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagagattttgtggttg 20892910  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || |||| ||  | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20892909 atctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtataaccgagttcatat 20892834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 53750764 - 53750809
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53750764 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactactt 53750809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16150608 - 16150531
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  16150608 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16150531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16154754 - 16154677
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  16154754 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16154677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21142875 - 21143157
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21142875 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 21142974  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  21142975 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 21143074  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143075 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 21143157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24678096 - 24677814
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24678096 ggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 24677997  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||    
T  24677996 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagcaagtcagtgta 24677897  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24677896 tttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggtattttga 24677814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 11351545 - 11351804
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351545 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 11351644  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  11351645 atttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 11351744  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11351745 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9338191 - 9337909
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9338191 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 9338092  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  9338091 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 9337992  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9337991 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9337909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9486825 - 9486543
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9486825 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 9486726  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  9486725 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 9486626  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9486625 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9486543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21323100 - 21323382
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21323100 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 21323199  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||    
T  21323200 atttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatgaactgttttagcaagtcagtgta 21323299  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21323300 tttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 21323382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10871459 - 10871177
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  10871459 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 10871360  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  10871359 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 10871260  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871259 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10871177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16983849 - 16983567
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16983849 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16983750  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  16983749 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 16983650  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16983649 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16983567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17001609 - 17001327
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17001609 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17001510  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  17001509 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 17001410  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17001409 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17001327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 24657492 - 24657774
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24657492 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 24657591  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||||    
T  24657592 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagtcagtcagtgta 24657691  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24657692 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24657774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 24874584 - 24874866
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24874584 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 24874683  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  24874684 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagcaagtcagtgca 24874783  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874784 tttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 24874866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22323176 - 22323458
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22323176 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 22323275  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  22323276 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 22323375  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323376 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22323458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27220625 - 27220343
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27220625 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 27220526  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |       
T  27220525 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacg 27220426  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27220425 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27220343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27373878 - 27373596
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27373878 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 27373779  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  27373778 atttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 27373679  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27373678 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 27373596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 44383404 - 44383686
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44383404 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 44383503  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  44383504 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 44383603  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44383604 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44383686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24712643 - 24712361
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24712643 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 24712544  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||| |  |    
T  24712543 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaaatcagtaca 24712444  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24712443 tttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24712361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24264975 - 24264697
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24264975 agatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggattt 24264876  T
Q  105 agtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttc 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  24264875 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttc 24264776  T
Q  205 tcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24264775 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttctatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24264697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 24705318 - 24705598
Alignment:
Q  3 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24705318 agagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggat 24705417  T
Q  103 ttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatt 202  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  24705418 ttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatt 24705517  T
Q  203 tctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24705518 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24705598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23204923 - 23204641
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  23204923 ggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgtaatgg 23204824  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  23204823 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 23204724  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23204723 tttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagttcttatctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttga 23204641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 41606221 - 41606501
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||    
T  41606221 ggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtccttg-tctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 41606318  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||  || |    
T  41606319 atttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtctgtgca 41606418  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41606419 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41606501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 23029295 - 23029497
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23029295 ggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgg 23029394  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  23029395 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 23029494  T
Q  201 ttt 203  Q
    |||    
T  23029495 ttt 23029497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 23105562 - 23105836
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23105562 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 23105661  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  23105662 atttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 23105761  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  23105762 tttctcttctgatgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatgg 23105836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 45673846 - 45674012
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  45673846 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatga 45673945  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673946 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23074472 - 23074190
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |    
T  23074472 ggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattg 23074373  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  23074372 atttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 23074273  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||| |||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  23074272 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttatctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 23074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 22733608 - 22733867
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |    
T  22733608 ggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattg 22733707  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  |||     
T  22733708 atttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtt 22733807  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22733808 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 22733867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 24817674 - 24817930
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  24817674 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattg 24817773  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| |   |||||  ||||    
T  24817774 atttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgta 24817873  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    ||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24817874 tttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 23097852 - 23098043
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  23097852 ggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcg 23097951  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  23097952 acttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagcaag 23098043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22742800 - 22742856
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22742800 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19716851 - 19717026
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  19716851 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 19716950  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  19716951 acttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 19717026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19817450 - 19817271
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| || || |||||| | |||||||   |||| ||||    
T  19817450 atggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttag 19817351  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||||| | || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||| |||||||    
T  19817350 tctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgtttt 19817271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23113332 - 23113147
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  23113332 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttg 23113233  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||    
T  23113232 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgtttt 23113147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12576962 - 12576787
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  12576962 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 12576863  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12576862 acttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 12576787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 30208760 - 30208939
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| || || || || |||||||| || ||||||| | | |||||||   |||| ||||    
T  30208760 atggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagattttgcagtggacttag 30208859  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||||| | || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |  || || |  ||| |||||||||||| |||||||    
T  30208860 tctgtttgccattgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactaattggaatttaactatgttcatattaattgtttt 30208939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20848192 - 20848067
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  20848192 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 20848093  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggat 132  Q
    | ||||| || ||||  |||||||||    
T  20848092 tttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 23065022 - 23064977
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065022 ggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 23064977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23274196 - 23274011
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  23274196 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 23274097  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  23274096 tttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 283
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351836
Alignment:
Q  247 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 11351836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 50642 - 50919
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50642 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 50741  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  50742 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 50841  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50842 tttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtat 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42705 - 42528
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  42705 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 42606  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42605 acttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatta 42528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31890 - 31609
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31890 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatgg 31791  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||     
T  31790 atttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagtgt- 31692  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  31691 tttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 31609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37356 - 37075
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37356 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatgg 37257  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||     
T  37256 atttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagtgt- 37158  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  37157 tttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 37075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10535 - 10817
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10535 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatgg 10634  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  10635 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgta 10734  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10735 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 10817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 13190 - 13472
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13190 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatgg 13289  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  13290 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgta 13389  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13390 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 54644 - 54363
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54644 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatgg 54545  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  54544 atttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 54445  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 282  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54444 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15713589 - 15713871
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  15713589 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 15713688  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  15713689 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 15713788  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15713789 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 15713871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16638370 - 16638088
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16638370 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16638271  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  16638270 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 16638171  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16638170 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16638088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 26790946 - 26791228
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  26790946 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 26791045  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  26791046 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 26791145  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791146 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 26791228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43165272 - 43164990
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43165272 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 43165173  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  43165172 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 43165073  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43165072 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 43164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15065668 - 15065400
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065668 ggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 15065569  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||    
T  15065568 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagaaagtcagtgta 15065469  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065468 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10908807 - 10908525
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||    
T  10908807 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaatgg 10908708  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  10908707 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 10908608  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10908607 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10908525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12889306 - 12889024
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12889306 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 12889207  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  12889206 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 12889107  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12889106 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12889024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13255287 - 13255005
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13255287 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 13255188  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  13255187 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 13255088  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13255087 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13255005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 14874101 - 14874383
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874101 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 14874200  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  14874201 atttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaagtcagtgta 14874300  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14874301 tttctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagttcttgtttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattga 14874383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16754234 - 16754516
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16754234 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16754333  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  16754334 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 16754433  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754434 tttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16754516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3688540 - 3688258
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3688540 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 3688441  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  3688440 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 3688341  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688340 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 3688258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6603332 - 6603051
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6603332 ggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 6603233  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  6603232 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcaataca 6603134  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6603133 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 6603051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10008197 - 10007915
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  10008197 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaatgg 10008098  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  10008097 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 10007998  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10007997 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10007915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15345778 - 15346060
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  15345778 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 15345877  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  15345878 atttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 15345977  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15345978 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 15346060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15586925 - 15587207
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15586925 ggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 15587024  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  15587025 atttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 15587124  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15587125 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15587207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 20059587 - 20059869
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20059587 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 20059686  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  20059687 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 20059786  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20059787 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20059869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48428044 - 48427762
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48428044 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 48427945  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| |  |    
T  48427944 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagcaagtcagtaca 48427845  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48427844 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 48427762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24185787 - 24185505
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24185787 ggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 24185688  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24185687 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 24185588  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24185587 tttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 24185505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 5422463 - 5422745
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5422463 ggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 5422562  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  5422563 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 5422662  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5422663 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 5422745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15358680 - 15358398
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15358680 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 15358581  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  15358580 atttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 15358481  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15358480 tttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggtatcttga 15358398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15400050 - 15400332
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15400050 ggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 15400149  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||| || |    
T  15400150 atttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagtaagtcagtgca 15400249  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400250 tttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 15400332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16694761 - 16694479
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16694761 ggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16694662  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16694661 atttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcaatgta 16694562  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16694561 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 53382551 - 53382833
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53382551 ggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 53382650  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  53382651 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 53382750  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382751 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53382833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16804480 - 16804762
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16804480 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16804579  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||| ||||    
T  16804580 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttaccaagtcagtgta 16804679  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16804680 tttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 14578941 - 14579200
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  14578941 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattg 14579040  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  14579041 atttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 14579140  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  14579141 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaatttttatctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17492448 - 17492166
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |    
T  17492448 ggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtgattttgagattg 17492349  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||  ||||    
T  17492348 atttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatctgtgta 17492249  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  17492248 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 17492166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15262227 - 15261953
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  15262227 ggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 15262128  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  15262127 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgta 15262028  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || ||    ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15262027 tttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 15261953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 272
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  89 attttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttgg 188  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  189 caagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 272  Q
    ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12843636 - 12843895
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    
T  12843636 ggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattg 12843735  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  12843736 acttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 12843835  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| |  |  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12843836 tttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagcagaagca 12843895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437457
Alignment:
Q  142 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||  |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  242 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 18437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24189911 - 24189736
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  24189911 ggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 24189812  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| | | ||||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  24189811 acttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataaccgagttcatat 24189736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10408569 - 10408415
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  10408569 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 10408470  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10408469 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 10408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17188981 - 17188887
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17188981 ggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 17188887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47126545 - 47126391
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  47126545 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtaattgatttag 47126446  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47126445 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 47126391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13944631 - 13944456
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  13944631 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 13944532  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13944531 acttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 13944456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 14291054 - 14291231
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  14291054 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 14291153  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || | || ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14291154 atcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatatta 14291231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 16832056 - 16832225
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||    
T  16832056 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttag 16832155  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16832156 tttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 16832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 11958703 - 11958863
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | || |||| | | |    
T  11958703 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagactttgtggttg 11958802  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    ||||||| ||| |  | |||   ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  11958803 atttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16378456 - 16378631
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||  |||||  |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  16378456 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtag 16378555  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16378556 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 16378631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28756920 - 28756769
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| |    |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  28756920 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 28756821  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  28756820 tttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 28756769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Original strand, 12858025 - 12858202
Alignment:
Q  9 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| |||| |||||  | ||| | ||     
T  12858025 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttgaagttgatcttgta 12858124  T
Q  109 tgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12858125 tgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgtttt 12858202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 15013297 - 15013374
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  15013297 atggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 15013374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 12510011 - 12510180
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |  || |||| ||| || ||||||   |||| | |||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  12510011 atggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 12510110  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12510111 tttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 12510180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 10417567 - 10417727
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||| ||| | |    
T  10417567 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcg 10417666  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  10417667 acttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 10417727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12272945 - 12272770
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  12272945 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 12272846  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || |||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12272845 atctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 12272770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 31692707 - 31692981
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  31692707 ggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 31692806  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||||  |||||||| | ||||||| ||||| |  || |    
T  31692807 acttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgca 31692906  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || |  ||||| || ||||||||||| ||| |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31692907 tttttcttctgcggaagaagagagtgttgcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 8744912 - 8745072
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  8744912 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtag 8745011  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| ||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  8745012 acttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16327231 - 16327406
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||| | | | |    
T  16327231 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttg 16327330  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||  | || |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  16327331 atttagtttgcttgccgttgtcgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 16327406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 186
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318209
Alignment:
Q  64 tgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtaca 163  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13318186  T
Q  164 accatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |||  |||||||| | |||||||    
T  13318187 accgagttcatataaattgtttt 13318209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 12358055 - 12358239
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  12358055 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 12358154  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaa 191  Q
    | ||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| ||||    
T  12358155 tttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15230210 - 15230116
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||  ||||| || ||||||||| || | ||||||||    
T  15230210 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15230116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15236078 - 15235984
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||  ||||| || ||||||||| || | ||||||||    
T  15236078 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15235984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14575593 - 14575436
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  14575593 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 14575494  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    |  |||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  14575493 acctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttaga 14575436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17494254 - 17494078
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatg 99  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || ||| || ||| | | |||||| || |||||||||||| | || |||||  |     
T  17494254 ggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtc 17494155  T
Q  100 gatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || ||||| ||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17494154 gacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 17494078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 11949453 - 11949496
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttct 50  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11949453 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttct 11949496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16347961 - 16348243
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16347961 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 16348060  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  16348061 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 16348160  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348161 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16348243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 51330858 - 51331140
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51330858 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 51330957  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  51330958 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 51331057  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331058 tttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 51331140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19109361 - 19109079
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19109361 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaaatgg 19109262  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  19109261 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 19109162  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19109161 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 19109079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21833295 - 21833013
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  21833295 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaatgg 21833196  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  21833195 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 21833096  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21833095 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21833013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 33388395 - 33388677
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  33388395 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 33388494  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  33388495 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 33388594  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33388595 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 33388677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 17042381 - 17042663
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17042381 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17042480  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  17042481 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 17042580  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  17042581 tttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagtattttga 17042663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 24785223 - 24785505
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24785223 ggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 24785322  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||    
T  24785323 atctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaaatcagtgta 24785422  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24785423 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24785505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 41351034 - 41351316
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41351034 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatgg 41351133  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  |    
T  41351134 atttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 41351233  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351234 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 41351316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16379087 - 16378813
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16379087 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattg 16378988  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16378987 atttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 16378888  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  || || || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16378887 tttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 20081742 - 20081896
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081742 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgg 20081841  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20081842 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502937
Alignment:
Q  97 atggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  197 tgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 22502937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 283
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233379
Alignment:
Q  85 cgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtt 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  185 ttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttga 21233379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21842205 - 21842066
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21842205 ggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 21842106  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 140  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21842105 atttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839661
Alignment:
Q  136 attctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  236 tcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21839661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21751877 - 21751650
Alignment:
Q  54 atgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattgg 153  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || || | |    
T  21751877 atgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcg 21751778  T
Q  154 ttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagc 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||  |||||||||| ||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21751777 ttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagc 21751678  T
Q  254 tgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    |||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  21751677 tgaagcagttagaacgtgatggaatctt 21751650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 22496622 - 22496705
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22496622 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Original strand, 429575 - 429706
Alignment:
Q  53 tatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattg 152  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  429575 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 429674  T
Q  153 gttagagtacaaccatgttcatattacttgtt 184  Q
    ||| || ||||||||||| || |||| |||||    
T  429675 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgtt 429706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 38910198 - 38910352
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  38910198 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 38910297  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38910298 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12200536 - 12200382
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||  |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  12200536 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 12200437  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12200436 tgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 21739402 - 21739579
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  21739402 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 21739501  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21739502 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatta 21739579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 31537369 - 31537520
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  31537369 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 31537468  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  31537469 tttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 31537520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 48425891 - 48425737
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  48425891 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 48425792  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  48425791 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 48425737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52988759 - 52988605
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  52988759 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 52988660  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  52988659 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 52988605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20297399 - 20297230
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| ||   |||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  20297399 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagagattttgtggttgatttag 20297300  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20297299 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 20297230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359892
Alignment:
Q  142 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgt 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||| |||| || |  |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  242 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttga 22359892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37680067 - 37679914
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  37680067 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 37679968  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 160  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  37679967 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862021
Alignment:
Q  142 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgt 241  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||  |||||||||| || |  ||||| ||| |||  ||||||||||| |    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  242 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 21862021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 20854132 - 20854291
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | || ||||    
T  20854132 atggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttag 20854231  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20854232 tgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 20854291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 21742918 - 21743095
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||  ||||  || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  21742918 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 21743017  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | || |||   ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21743018 atctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccattttcatatta 21743095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21752038 - 21751995
Alignment:
Q  3 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752038 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21751995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22016111 - 22016286
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  22016111 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 22016210  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |  |||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22016211 acctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 22016286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 24096981 - 24097156
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||| | || ||||   | |    
T  24096981 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcg 24097080  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  24097081 acttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 24097156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19857298 - 19857107
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||  | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  19857298 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 19857199  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  19857198 acttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 19857107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 20833272 - 20833457
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  20833272 atggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 20833371  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  20833372 tttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 20833457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18710403 - 18710326
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  18710403 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 18710326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20140863 - 20140794
Alignment:
Q  214 gaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  20140863 gaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 20140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10375 - 10093
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10375 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 10276  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  10275 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagcaagtcagtgca 10176  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10175 tttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggtatcttga 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8265 - 7983
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8265 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 8166  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8165 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 8066  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8065 tttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41162 - 40880
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41162 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 41063  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| |||||||| || |    
T  41062 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagcaagtcagtgca 40963  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40962 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 40880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 13423 - 13703
Alignment:
Q  3 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13423 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaatggat 13522  T
Q  103 ttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  13523 ttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatt 13622  T
Q  203 tctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13623 tctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11476 - 11194
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11476 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 11377  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  11376 atttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 11277  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11276 tttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggtatcttga 11194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17944 - 17662
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17944 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 17845  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  17844 atttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 17745  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17744 tttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggtatcttga 17662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53452
Alignment:
Q  12 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  112 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccg 53524  T
Q  212 tcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53523 tcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 35012 - 35293
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35012 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 35111  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  35112 atttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgta 35210  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35211 tttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 35293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41638 - 41357
Alignment:
Q  2 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||    
T  41638 gagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattga 41539  T
Q  102 tttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtat 201  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||    
T  41538 cttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtat 41439  T
Q  202 ttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  41438 ttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 41357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 75358 - 75077
Alignment:
Q  2 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||    
T  75358 gagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattga 75259  T
Q  102 tttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtat 201  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||    
T  75258 cttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtat 75159  T
Q  202 ttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  75158 ttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 75077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22254 - 21972
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22254 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 22155  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  22154 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 22055  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22054 tttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 21972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3431 - 3149
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  3431 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatgg 3332  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || |    
T  3331 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgca 3232  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3231 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17167 - 16885
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17167 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgg 17068  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  17067 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 16968  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16967 cttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggtattttga 16885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12670 - 12388
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12670 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattg 12571  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12570 atatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgta 12471  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12470 tttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 12388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 11669 - 11935
Alignment:
Q  17 aaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11669 aaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacc 11768  T
Q  117 tttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaa 216  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||    
T  11769 cttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgtcgaa 11868  T
Q  217 gaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11869 gaggaaagtggtgtagagttcttatctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggtattttga 11935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14431 - 14206
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14431 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 14332  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  14331 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgta 14232  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtg 226  Q
    ||| || ||||  |||||||||||||    
T  14231 tttttcttccgctgaagaggaaagtg 14206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4922 - 4648
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||| | ||||||||| ||| |||||||||  || ||||| || |    
T  4922 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttgaaattg 4823  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | ||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||    
T  4822 acttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtata 4723  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || ||   |||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4722 tttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatgg 4648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 39636 - 39790
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  39636 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 39735  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  39736 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 39790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 44730 - 44915
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  44730 atggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 44829  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  44830 tttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 44915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 25009 - 25268
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25009 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatgg 25108  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  25109 atttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 25208  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25209 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10793 - 10534
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  10793 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattg 10694  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||    
T  10693 atttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgta 10594  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  ||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10593 tttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttgtctactaagcagctgaagca 10534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 842 - 1017
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  842 ggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttgaggtag 941  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  942 acttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 777 - 971
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  777 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaatgg 876  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtca 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  877 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagcaagtca 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 24242 - 24501
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  24242 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattg 24341  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||  ||||    
T  24342 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgta 24441  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24442 tttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 24501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10260
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||||| || ||||||||| || | || |||||  | || ||||    
T  10075 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttag 10174  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  10175 tttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18657 - 18400
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |    
T  18657 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattg 18558  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  18557 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 18458  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaag 258  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18457 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4441 - 4182
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4441 ggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcg 4342  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  4341 atttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 4242  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4241 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtttttgtctactaagcagctgaagca 4182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 15387 - 15573
Alignment:
Q  97 atggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaa 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||      
T  15387 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttagcaagtcgg 15486  T
Q  197 tgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15487 tgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8230 - 7948
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      
T  8230 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattc 8131  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||  ||||    
T  8130 atttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaattctgtgta 8031  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  8030 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtcaattaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 152088 - 151814
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  152088 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattg 151989  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  151988 atttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 151889  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||| | || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  151888 tttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 151814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 47280 - 47541
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||| |  |||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  47280 ggagagatggttgtcgaaactccatctaagg-ttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattg 47378  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||              ||    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  47379 atttggtttgtctacctttga--------------at----ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaagtcaatgta 47460  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  47461 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttagtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 47541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2084
Alignment:
Q  115 cctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcg 214  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| || || |  |    
T  1916 cctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctg 2015  T
Q  215 aagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  2016 aagaagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttga 2084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 30871 - 30938
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30871 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 104234 - 103960
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  104234 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattg 104135  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||    
T  104134 acttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaagtcggtgta 104035  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  104034 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 23830 - 24103
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  23830 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 23929  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  | ||    
T  23930 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtata 24029  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 274  Q
    ||| || || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24030 tttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 151574 - 151383
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||||| || |||||||||||| | ||  ||||  | |    
T  151574 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaagtcg 151475  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||||| ||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  151474 acttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 151383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14091 - 13866
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  14091 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattg 13992  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  13991 atttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 13892  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtg 226  Q
    |||||| || || |||||||||||||    
T  13891 tttctcttctgttgaagaggaaagtg 13866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8863 - 8770
Alignment:
Q  167 atgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    ||||||| |||| ||||||| | || ||| |||||||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8863 atgttcacattaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 554
Alignment:
Q  111 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  211 gtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3349
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  3608 ggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattg 3509  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  3508 atttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 3409  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3408 tttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 13776 - 14034
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || || | |||||| || |||||||||||||| |||||| | || |    
T  13776 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattg 13875  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  13876 atttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgta 13975  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagc 259  Q
    ||| || || |  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13976 tttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagc 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6606
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  6880 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 6781  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  6780 acttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 6681  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6680 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14010 - 13736
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  14010 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 13911  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  13910 acttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 13811  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  13810 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6120 - 5846
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || |    
T  6120 ggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattg 6021  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  6020 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 5921  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5920 tttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15130 - 14955
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||| || | ||||||||  | |    
T  15130 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttgaagtcg 15031  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15030 acttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 14955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 111204 - 111484
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| | ||| ||||| | |||||||| |||||||||||| || |    
T  111204 ggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattg 111303  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  111304 acttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 111403  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 281  Q
    |||||| || |  ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  111404 tttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 111484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17879 - 17611
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  17879 atggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttgaaattgatttgg 17780  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctc 206  Q
    | ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||| ||    
T  17779 tttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttgttaagtcggtgtatttttc 17680  T
Q  207 ctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
     ||    | ||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17679 ttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatgg 17611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8706
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  8957 ggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatgg 8858  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  8857 atttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 8758  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcag 252  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  8757 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcag 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17902
Alignment:
Q  89 attttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttgg 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | |    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  189 caagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcag 252  Q
     |||||  |||||||||| || |  |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcag 17902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14837
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  14563 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattg 14662  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||    
T  14663 atttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgta 14762  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || |  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14763 tttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 216717 - 216991
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | || |    
T  216717 ggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattg 216816  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  216817 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgta 216916  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || || |  |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  216917 tttttcttctgctgaagcggaaagtggcgcaaaattcttgtctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgg 216991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 1
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  148 ggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatgg 49  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48 atttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 109 - 283
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8320
Alignment:
Q  109 tgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  209 ccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttga 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 55767 - 56049
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||  | || |    
T  55767 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattg 55866  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  55867 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 55966  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| | || |  |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  55967 tttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 56049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 496027 - 495753
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||| | || |    
T  496027 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattg 495928  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  | ||    
T  495927 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggttta 495828  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    ||| || ||    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  495827 tttttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 495753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 441660 - 441507
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |    
T  441660 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattg 441561  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggt 154  Q
    |||| || ||| | |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  441560 atttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtatgaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 514656 - 514825
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  514656 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 514755  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  514756 tttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagaataaccgagttcatat 514825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 441487 - 441441
Alignment:
Q  211 gtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  441487 gtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 186
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452695
Alignment:
Q  142 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttt 452695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 784
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  989 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattg 890  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    | || || ||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||    
T  889 aattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgta 790  T
Q  201 tttctc 206  Q
    ||||||    
T  789 tttctc 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 630
Alignment:
Q  112 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccg 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||| || |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  212 tcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
       ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15276 - 15532
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| | || ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  15276 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattg 15375  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||||| ||||    
T  15376 atttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcagtgta 15475  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    ||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15476 tttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11177 - 11360
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11177 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgg 11276  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtt 184  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||    
T  11277 atttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 17646 - 17914
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17646 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtccttg-tctatgtttgatcgtgattttgagatgg 17744  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||     ||||||||| |||| ||||| | | |||||| ||||    
T  17745 atttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagtaagtcagtgta 17839  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 275  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17840 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 17914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39890
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||| | | |    
T  40065 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcg 39966  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  39965 acttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 39890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4590 - 4317
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || || ||||| | | ||||||| |||||||||| || ||||||||| || |    
T  4590 ggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattg 4491  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||    
T  4490 atttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgta 4391  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 274  Q
    |||||| || |  ||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  4390 tttctcttctgctgaagaggaaagttgcgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 40804 - 41049
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |    
T  40804 ggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaatatgtccttt--ctatgtttgatcctgattttgagattg 40901  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||  ||||    
T  40902 atatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgttttagtaagtcggtgta 41001  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaa 248  Q
    |||||| || |  |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  41002 tttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaa 41049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 23595 - 23851
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  23595 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattg 23694  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||||  ||||    
T  23695 atttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcggtgta 23794  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    ||| || || |||||| | || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23795 tttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagttcttgtcaactaagcagctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 9648 - 9904
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  9648 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattg 9747  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    |||| || ||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| |   |||||  ||||    
T  9748 atttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgta 9847  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaa 257  Q
    ||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9848 tttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 675 - 934
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  675 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattg 774  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | | |||||  ||||    
T  775 atatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgta 874  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||| ||    |||||||||||||  | | |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  875 tttctcttctactgaagaggaaagtggcgaaaagtttttatctacaaagcagctgaagca 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9665
Alignment:
Q  136 attctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  236 tcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2727
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2560 ggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatag 2659  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccat 168  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  2660 atttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Original strand, 1 - 151
Alignment:
Q  133 gtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  233 agttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8076 - 8217
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctc--gtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8076 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaat 8175  T
Q  99 ggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8176 ggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 4186 - 4371
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||||  || |||||||||||| | || | |||  | |    
T  4186 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatatgaagtag 4285  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |  |||| ||| |||| || |  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  4286 aaatagtatgtttaccgttaaagggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgtttt 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1177
Alignment:
Q  34 tcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatg 133  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  134 tgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcaga 233  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||   |||||||||| || |  |||||||||||||  | |||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtaga 1227  T
Q  234 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  1226 gtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 3558 - 3521
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 38  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3558 ggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15429 - 15254
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||||| || |    
T  15429 ggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttgaaattg 15330  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15329 atttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatat 15254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 57915 - 58059
Alignment:
Q  5 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  57915 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgattt 58014  T
Q  105 agtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 149  Q
     || ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  58015 ggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaa 58059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1996 - 1865
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1996 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattg 1897  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggat 132  Q
    || | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  1896 atatggtttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 283
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12792
Alignment:
Q  63 atgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| || ||  |||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| | ||||||||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  163 aaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaac 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || |   |||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  12673 aaccatgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagttc-tatctactaagcagctgaagcagt 12771  T
Q  263 tggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  12772 tagaacgtgatggaatcttga 12792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28074
Alignment:
Q  161 acaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  261 actggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttga 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7243 - 7141
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||    
T  7243 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgattttgaaatgg 7144  T
Q  101 att 103  Q
    |||    
T  7143 att 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5095 - 4911
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |    
T  5095 ggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattg 4996  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttt 185  Q
    ||||||| ||| |  ||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4995 atttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttt 4911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 844
Alignment:
Q  53 tatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattg 152  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  975 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 876  T
Q  153 gttagagtacaaccatgttcatattacttgtt 184  Q
    ||| || ||||||||||| || |||| |||||    
T  875 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgtt 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 6496 - 6643
Alignment:
Q  113 tacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||  |||||||||| || |     
T  6496 tacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttctcttctgc 6595  T
Q  213 cgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
     |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6596 tgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagca 6643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11656
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  11810 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 11711  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11710 tttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8329
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtga 89  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8417 ggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 60746 - 60487
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  60746 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 60647  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgta 200  Q
    || |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| | ||| |  || |    
T  60646 atctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtgca 60547  T
Q  201 tttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagca 260  Q
    ||| || || |  ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  60546 tttttcttctgctgaagaagaaagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 115569 - 115394
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  | |    
T  115569 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 115470  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||  ||||  |||  || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  115469 atttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 115394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 94191 - 94348
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  94191 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcg 94290  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    ||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  94291 atttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttaga 94348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 263233 - 263058
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  263233 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 263134  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  263133 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 263058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52504
Alignment:
Q  209 ccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttga 52504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26119 - 25954
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  26119 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 26020  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  26019 acttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 25954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 293
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  462 atggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 363  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  362 tttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 21488 - 21613
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||  | |||||||    
T  21488 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttag 21587  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggat 132  Q
    | ||| | |||||||| || ||||||    
T  21588 tttgtttgcctttgagtggaatggat 21613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 200765 - 200950
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  200765 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 200864  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  200865 atctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgtttt 200950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 325708 - 325539
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||||  || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  325708 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 325609  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  325608 tgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 325539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 3467 - 3627
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  | |    
T  3467 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtag 3566  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| ||  ||||  |||  || |||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  3567 acttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 1066 - 1125
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttg 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1066 ggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 5146 - 5321
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || | ||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||| | | |    
T  5146 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcg 5245  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5246 acttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 5321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17781 - 17956
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |   |||  ||  ||||||||||| | ||||||| | | |    
T  17781 ggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagagattttgtggtcg 17880  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  17881 acttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagtataatcaagttcatat 17956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2000 - 1821
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||   || | ||||    
T  2000 atggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtgaacttag 1901  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||||  | || || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||| | |||||||    
T  1900 tctgcttgccattcagtgggatggatgtgatactaggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgtttt 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21858 - 21683
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||| ||| | ||||||||| | |    
T  21858 ggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtag 21759  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  21758 acttagtttgtttaccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtataaccgagttcatat 21683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 53720 - 53895
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  53720 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 53819  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  53820 acttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatat 53895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 49477 - 49652
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  49477 ggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 49576  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  49577 acttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 58511 - 58686
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  58511 ggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 58610  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  58611 acttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 58686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 64899 - 65074
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  64899 ggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 64998  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  64999 acttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 65074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29631 - 29456
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  29631 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 29532  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |  |||  ||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  29531 acctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 29456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1180 - 1355
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||||| || |||||||||||| | || |||||  |||    
T  1180 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtgg 1279  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1280 acttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 1355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 8036 - 8117
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8036 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29534 - 29349
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||| | |    
T  29534 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaggttg 29435  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  29434 atcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgtttt 29349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11967 - 11790
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| |  | |||||| | |    
T  11967 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagatactttgaggttg 11868  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11867 atcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatta 11790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 65595 - 65755
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  |||||| |||| ||||||||| | ||||||||  | |    
T  65595 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagagattttgaagttg 65694  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  65695 acttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 65755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 131 - 306
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||| || ||||||   |||||| |||||||||||| | | || |||| | |||    
T  131 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttagggactttgtggtgg 230  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||| | || |||   |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  231 atttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatat 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8621 - 8446
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  8621 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 8522  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||   |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  8521 acttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 8446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10083 - 10258
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  10083 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtag 10182  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| | || ||||  || ||||| || ||| |  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10183 acttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 10258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 784 - 959
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| || | || |||||  | |    
T  784 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcg 883  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | |||||  || | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  884 acttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20815 - 20630
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  20815 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 20716  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  20715 tttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 20630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 63816 - 63991
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  63816 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 63915  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  63916 atctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 63991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 203388 - 203293
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgag 96  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  203388 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgag 203293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 424315 - 424270
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424315 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 152 - 342
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||| | || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  152 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 251  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaa 191  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||    
T  252 acttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagcaa 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1569 - 1754
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  1569 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttg 1668  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  1669 atcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgtttt 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2878 - 2701
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  2878 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 2779  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2778 atctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatta 2701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 47 - 2
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 28582 - 28767
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  28582 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttg 28681  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    || | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  28682 atcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgtttt 28767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 231 - 358
Alignment:
Q  158 agtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttctt--gtctactaagcagctg 255  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||  |||||||||| || |  |||||||||||||  |||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  256 aagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttga 358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 283
Target Start/End: Original strand, 7102 - 7238
Alignment:
Q  147 gaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctact 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| | | |||||  |||||||||| || |  |||||||||||||  | ||| || |||||||||    
T  7102 gaattggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctact 7201  T
Q  247 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 283  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  7202 aagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11662
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||  | |    
T  11837 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttg 11738  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || | || ||| | |  |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11737 atcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatat 11662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 67405 - 67580
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  67405 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttg 67504  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || |||| ||  | || |||   |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  67505 atctagtttgcttgccgttgtcgggtatggacgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 67580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41736 - 41585
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||  |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  41736 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttag 41637  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 158  Q
    | ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  41636 tttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 41585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 5443 - 5617
Alignment:
Q  2 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgga 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||  ||||| || | |||||||||| | ||||||| | | ||    
T  5443 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttgtggttga 5542  T
Q  102 tttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    |||||| ||| | || |||    |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5543 tttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 5617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25046
Alignment:
Q  8 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | | || |||||||  ||||| || ||||||| |||| | ||||||||| |  | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  108 ctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
     ||| |||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatatta 25046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 43722 - 43893
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| |  | |||||  | ||| |||    
T  43722 atggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctag 43821  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    | ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43822 tatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatta 43893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14873
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14918 ggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 70379 - 70214
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  70379 ggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 70280  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    | ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  70279 acttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 70214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 2255 - 2425
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||| | || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  2255 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 2354  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtga-ttctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||  |||| || ||||||||| | || || | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2355 tttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 2425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 251629 - 251464
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||| | || ||||   | |    
T  251629 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcg 251530  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacc 166  Q
    || |||| ||| | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  251529 atctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 251464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 283
Target Start/End: Original strand, 1196 - 1312
Alignment:
Q  167 atgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactgga 266  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||| || |   ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  1196 atgttcatattatttgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctaaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttaga 1295  T
Q  267 acgcgatggtatcttga 283  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  1296 acgtgatggtattttga 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1608 - 1783
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  1608 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 1707  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || | || ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1708 atcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 1783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 4386 - 4469
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | | || |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  4386 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7751 - 7576
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  7751 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 7652  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || | || ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  7651 atcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22129 - 21954
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  22129 ggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcg 22030  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||||| ||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22029 atttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 21954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 98880 - 99071
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||| | || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  98880 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 98979  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  98980 acttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 99071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 175995 - 175901
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttga 95  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  175995 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 83824 - 83911
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttg 94  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 83911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29935 - 29781
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | |||||||    
T  29935 atggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttag 29836  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 161  Q
    | ||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  29835 tttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 584 - 415
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || ||||    
T  584 atggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttag 485  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  484 tttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatat 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7039 - 6854
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || ||| |  | || ||||    
T  7039 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttag 6940  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaag 192  Q
    | ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||| |||||    
T  6939 tgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5609 - 5432
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||  | |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||  |      
T  5609 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtca 5510  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatta 178  Q
    || |||| ||| | || |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5509 atctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatatta 5432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10974 - 10809
Alignment:
Q  11 ttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtctg 110  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||||||   |||||| |||||||||||||| | || |||| | | |||||||| ||    
T  10974 ttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttg 10875  T
Q  111 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
      | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10874 cttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 10809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 30629 - 30706
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  30629 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 41411 - 41579
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| | ||| || || |||||||||   |||||||   |||| ||||    
T  41411 atggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttctttattatgcttgaagtatcc-ttgtcgatgtttggtatagattttgtagtggacttag 41509  T
Q  107 tctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    ||||| | || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  41510 tctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggcatgaactggttggagtttaactatgttcatat 41579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5806 - 5729
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| || ||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  5806 atggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggt 5729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 4601 - 4660
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttg 60  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  4601 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 186
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4732
Alignment:
Q  124 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgtttt 4732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12651
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||||    
T  12734 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggt 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1151 - 1326
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  1151 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 1250  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    | ||||| ||| |||| ||||   | |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1251 acttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  143 gtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtc 242  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| | | |||||  ||||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  243 tactaagcagctgaa 257  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 186
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8528
Alignment:
Q  117 tttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgtttt 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7148
Alignment:
Q  117 tttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattacttgtttt 186  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7217 tttgagtggaatggatgtaatacttggtattaactggttggagtataaccatgttcatattagttgtttt 7148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1195
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | | | | |||||| || ||||||||||||    
T  1112 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggt 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 8759 - 8842
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  8759 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 8842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 18973 - 19056
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  18973 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 19056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21098 - 20992
Alignment:
Q  151 tggttagagtacaaccatgttcatattacttgttttggcaagtcaatgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtgttgcagagttcttgtctactaagc 250  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||  |||||||||| ||    ||| |||||||||  ||| | || |||||||||||||    
T  21098 tggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctactaagc 20999  T
Q  251 agctgaa 257  Q
    |||||||    
T  20998 agctgaa 20992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1118 - 952
Alignment:
Q  10 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtct 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||  || |||||||||||| | || |||||  | || ||||| |    
T  1118 gttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagttt 1019  T
Q  110 gtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatat 176  Q
    || |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1018 gtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6599
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 46  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6554 ggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactactt 6599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 20831 - 20908
Alignment:
Q  7 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggt 84  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || ||||||||||||    
T  20831 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 20908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36946 - 36814
Alignment:
Q  1 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttttctcgtatgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgagatgg 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | || |||||  | |    
T  36946 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcg 36847  T
Q  101 atttagtctgtctacctttgagcggtatggatg 133  Q
    | ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||    
T  36846 acttagtttgtttaccgttgacgggtatggatg 36814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University