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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8548A_low_89 (Length: 322)

Name: NF8548A_low_89
Description: NF8548A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8548A_low_89
NF8548A_low_89
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-311)||(134455-134765)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-311)||(312282-312592)
scaffold0002 (1-311)||(327736-328046)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (1-288)||(8654697-8654984)
chr4 (1-317)||(3129577-3129890)
chr4 (1-254)||(47541154-47541406)
chr4 (1-185)||(7662966-7663150)
chr4 (1-194)||(2631627-2631820)
chr4 (1-148)||(23873240-23873387)
chr4 (1-148)||(55298849-55298996)
chr4 (1-194)||(20675251-20675444)
chr4 (1-194)||(8486699-8486892)
chr4 (268-317)||(7662904-7662953)
chr4 (1-66)||(49926112-49926177)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (1-317)||(10486515-10486831)
chr5 (1-194)||(34481176-34481369)
chr5 (1-115)||(587745-587859)
chr5 (15-56)||(23923092-23923133)
chr5 (9-46)||(27795720-27795757)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-292)||(21528390-21528685)
chr1 (1-309)||(36306013-36306321)
chr1 (1-194)||(37530795-37530988)
chr1 (1-148)||(32353061-32353208)
chr1 (1-194)||(48073149-48073342)
chr1 (1-82)||(48265548-48265629)
chr1 (1-73)||(30970447-30970519)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (1-285)||(49731559-49731843)
chr3 (1-312)||(30166944-30167255)
chr3 (1-194)||(2813218-2813411)
chr3 (1-194)||(29309637-29309830)
chr3 (1-194)||(6176196-6176389)
chr3 (1-122)||(9379326-9379447)
chr3 (1-73)||(23602002-23602074)
chr3 (1-65)||(25872955-25873019)
chr3 (16-73)||(8943596-8943653)
chr3 (7-46)||(48569905-48569944)
chr3 (6-44)||(46248738-46248776)
chr3 (7-59)||(18368808-18368860)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (1-312)||(15653305-15653616)
chr7 (47-312)||(46623968-46624233)
chr7 (1-194)||(13440282-13440475)
chr7 (13-194)||(12378446-12378627)
chr7 (1-73)||(45943080-45943152)
chr7 (7-130)||(43105546-43105669)
chr7 (6-44)||(27723973-27724011)
chr7 (7-72)||(41339760-41339825)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (1-317)||(7452581-7452897)
chr8 (4-194)||(16420728-16420918)
chr8 (7-72)||(12134563-12134628)
chr8 (1-50)||(19384572-19384621)
chr8 (9-55)||(13879344-13879390)
chr8 (9-57)||(7555684-7555732)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-312)||(45421748-45422060)
chr2 (1-311)||(13550353-13550663)
chr2 (2-194)||(26894330-26894522)
chr2 (2-194)||(26899769-26899961)
chr2 (1-148)||(43627728-43627875)
chr2 (1-97)||(31085452-31085548)
chr2 (1-97)||(33548101-33548197)
chr2 (79-311)||(13550884-13551116)
chr2 (7-56)||(36804147-36804196)
chr2 (1-56)||(22052856-22052911)
chr2 (7-45)||(36804362-36804400)
chr2 (9-55)||(40176905-40176951)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (124-317)||(4144-4337)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-185)||(7904-8088)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-148)||(25318083-25318230)
chr6 (1-148)||(26205577-26205724)
chr6 (1-194)||(23347185-23347378)
chr6 (1-148)||(15674054-15674205)
chr6 (9-53)||(33630334-33630378)
chr6 (9-72)||(4474935-4474998)
chr6 (1-31)||(1683269-1683299)
chr6 (7-73)||(5041753-5041819)
chr6 (265-311)||(26205841-26205887)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (7-72)||(15490-15555)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 134765 - 134455
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  134765 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatcaatag 134666  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  134665 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaacca 134566  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  134565 aaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcacctcc 134466  T
Q  301 ctccaccaaca 311  Q
    |||||||||||    
T  134465 ctccaccaaca 134455  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 312592 - 312282
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  312592 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatcaatag 312493  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  312492 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaacca 312393  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  312392 aaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcacctcc 312293  T
Q  301 ctccaccaaca 311  Q
    |||||||||||    
T  312292 ctccaccaaca 312282  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 328046 - 327736
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  328046 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatcaatag 327947  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  327946 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaacca 327847  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  327846 aaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcacctcc 327747  T
Q  301 ctccaccaaca 311  Q
    |||||||||||    
T  327746 ctccaccaaca 327736  T

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Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8654984 - 8654697
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8654984 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatcaacag 8654885  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8654884 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaacca 8654785  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaaga 288  Q
          ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8654784 aaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccatccactctctccagcaccaacactacccctaaga 8654697  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3129890 - 3129577
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| ||    
T  3129890 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacat---ctcctcccactgccacaaacaacgtctccacctccacgtaacccctagctgctccgaatcaatag 3129794  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  3129793 agaacaagtctgccacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctactaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctaccaaacca 3129694  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
           |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3129693 aaacaatgtatcagctccatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccagccgccctctccatcaccatcactacccctaaaacgactcacctcc 3129594  T
Q  301 ctccaccaacaccaaac 317  Q
    |||||||||||| ||||    
T  3129593 ctccaccaacacgaaac 3129577  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 47541154 - 47541406
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||    
T  47541154 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacatctcctccttccactgccacaaacgacgtctccacctccacataactcccggctgctccgaatcaacag 47541253  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47541254 aaaacaagtctgccacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctacaaaaacgaacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaaacca 47541353  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaacca 254  Q
          ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47541354 aaacaacgtatcatctccatctccaa-ccttctagccacatgatcaacaaacca 47541406  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7663150 - 7662966
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||    
T  7663150 tcaagaagtaaagccatacactccactaacatctcctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccaaaaaaacccctgctgctccaaatcaacag 7663051  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaa 185  Q
    | ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7663050 agaacaagtctgccatagacatgagcttattctctattaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaa 7662966  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 2631627 - 2631820
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  2631627 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 2631726  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  2631727 agagcaagtcggccacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 2631820  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23873387 - 23873240
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  23873387 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccattacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 23873288  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    | | |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23873287 agagcaagtcggcaacggacatagacttattctctgttaactcaaaca 23873240  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 55298849 - 55298996
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  55298849 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataaactacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 55298948  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    | | |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55298949 agagcaagtcggcaacggacatagacttattctctgttaactcaaaca 55298996  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 20675251 - 20675444
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||     
T  20675251 tcaagaagtaaagtcctacactcatcaagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacaa 20675350  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  20675351 agagcaagtcggccacggatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctaaccacctatc 20675444  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8486892 - 8486699
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||||    
T  8486892 tcaagaagtaaagccctacactaatctagcaactccttctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccggtccgaatcaacag 8486793  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | ||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  8486792 agagcaagtcgacgacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 8486699  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7662953 - 7662904
Alignment:
Q  268 tcaccaacactacccctaagacgactcacctccctccaccaacaccaaac 317  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7662953 tcaccaccactatccctaatacgactcacctccccccaccaacacgaaac 7662904  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 49926177 - 49926112
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccac 66  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||    
T  49926177 tcaagcagaaaagccctacactccactaacaactcctcctcccacgcccacaatctccgcctccac 49926112  T

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Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10486831 - 10486515
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  10486831 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacatgtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacataaccccccgctgctccgaatcaacag 10486732  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10486731 agaacaagtctgccacagacatgaacttattctatgttaactcaaacagcctacgaaaacggacacaaaaaggaagatcccctaaccacctatccaacca 10486632  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10486631 aaacaacgtatcagctccatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccagctgcactctccatcaccatcactacccctaagacgactcacctcc 10486532  T
Q  301 ctccaccaacaccaaac 317  Q
    |||||||||||| ||||    
T  10486531 ctccaccaacacgaaac 10486515  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 34481176 - 34481369
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  34481176 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacag 34481275  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  34481276 agagcaaatatgccacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatc 34481369  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 587745 - 587859
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| | | | ||||| |||||||||   ||||    
T  587745 tcaagaagtaaagccctacactcctctaacatatcctcctcccacatccatagcctacgcctccacctccagacatccccccaatgctccgaactcacag 587844  T
Q  101 ataacaagtctgcca 115  Q
    | ||||||| |||||    
T  587845 agaacaagtttgcca 587859  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Original strand, 23923092 - 23923133
Alignment:
Q  15 cctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacct 56  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23923092 cctacactccgctaacatctcctcctcccacacccacaacct 23923133  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Original strand, 27795720 - 27795757
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccaca 46  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27795720 taaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccaca 27795757  T

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Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 21528390 - 21528685
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctaca----ctccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatca 96  Q
    |||||||||||||||||||     | ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  21528390 tcaagaagtaaagccctacgtctccaccgctaacatgtcctcctcccactaccataacctacgtctccacctccacataaccccccattgctccgaatca 21528489  T
Q  97 acagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatcca 196  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528490 acagagaacaagtctccaacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcca 21528589  T
Q  197 accnnnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgac 292  Q
    |||       |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21528590 accaaaacaacgtatcagcttcatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccatccgctctctccatcaccatcactacccctaagacgac 21528685  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 36306013 - 36306321
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  36306013 tcaagaagtaaagccctacactcctctaacatctcctccttccactgccacaatctacgcctccacctccaaacaaccccctgctgctccaaatcaacag 36306112  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  36306113 agaacaagtctgccacatacatgagcttattctccgttaactcaaacagtctacgaaaaaggacacagaaaggaacatcccctaaccacctatcatacca 36306212  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||  || || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36306213 aaacaacgtatcagaaccatctccaaccctcctagccacgtggccgacaaaccacccacaatcaccctcactaacactatcactaagacgactcacctcc 36306312  T
Q  301 ctccaccaa 309  Q
    |||||||||    
T  36306313 ctccaccaa 36306321  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 37530795 - 37530988
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  37530795 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacag 37530894  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||  |  |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37530895 agagcaagtctgccacatacatagtcttattctctgttaactcaaacaaccgactaagtctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatc 37530988  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32353208 - 32353061
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  32353208 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctccttccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 32353109  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    | | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32353108 agagcaagtcggccacggacatagacttattctctgttaactcaaaca 32353061  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48073342 - 48073149
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  48073342 tcaagaagtaaagccccacactcatctagcaactcctcctcccactcccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 48073243  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  48073242 agagcaagtcggcaacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 48073149  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 48265629 - 48265548
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgcccc 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48265629 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaactcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacataacccccc 48265548  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 30970519 - 30970447
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccaca 73  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30970519 tcaagaagtaaggccctacactccgccaccatctcctcctcccacgcccacaatctacgcctccacctccaca 30970447  T

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Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49731843 - 49731559
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  49731843 tcaagaagtaaagccctacactccgccaacaactcctcctcccactgccacaaactacgtctccacctccacataaccccccgctgctccggatcaacag 49731744  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  49731743 agaacaagtctgccacatacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctacgaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaaacca 49731644  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactaccccta 285  Q
           || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  49731643 aaacaatgtgtcagctccatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccagccgcactctccatcaccatcactaccccta 49731559  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30167255 - 30166944
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||    
T  30167255 tcaagaagtaaagtcctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccaaaaaacaccctgctgctccagatcaacag 30167156  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30167155 agaacaagtctgccacaaacatgagcttattctctgttaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaaccacctatccaacca 30167056  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||||||  ||| | |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||  || || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  30167055 aaacaacgtatcagaaccatcaccaaccctcctagccacgtgaccaccaaaccacccacagtcaccctcaccagcactatccctaatacgactcacctcc 30166956  T
Q  301 ctccaccaacac 312  Q
    ||||||||||||    
T  30166955 ctccaccaacac 30166944  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2813411 - 2813218
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  2813411 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 2813312  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  2813311 agagcaagtcggcaacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 2813218  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 29309637 - 29309830
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||    
T  29309637 tcaagaagtaacgccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcgacag 29309736  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  29309737 agagcaagtcggccacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 29309830  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6176389 - 6176196
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  6176389 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgctataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 6176290  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  6176289 agagcaagtcggcgacggacatagacttattctctattaactcaaacaaccgtctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 6176196  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 9379326 - 9379447
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||     
T  9379326 tcaagtagtaatgccctacactccgctaacatcccctcctcccactgccataacctgcgcctccacctccacaaatccccccactgctctgaatcaacat 9379425  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacat 122  Q
    | ||||||| ||||||| ||||    
T  9379426 agaacaagtttgccacatacat 9379447  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 23602002 - 23602074
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  23602002 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctatgtctccacctccaca 23602074  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 25873019 - 25872955
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctcca 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25873019 tcaaaaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctcca 25872955  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Original strand, 8943596 - 8943653
Alignment:
Q  16 ctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccaca 73  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8943596 ctacactccgcttacaaatcttcctcccacgcccacaacctacgtctccacttccaca 8943653  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 48569944 - 48569905
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccaca 46  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48569944 agtaaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccaca 48569905  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 46248776 - 46248738
Alignment:
Q  6 aagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctccca 44  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  46248776 aagtaaagccctacactcccctaacaagtcttcctccca 46248738  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18368860 - 18368808
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacg 59  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18368860 agtaatgccctacactcctctagcaaagcctcctcccacacccacaacctacg 18368808  T

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Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15653616 - 15653305
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  15653616 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccagaaaaccccctgctgctccaaatcaacag 15653517  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15653516 agaacaagtctgccatagacatgagcttattctccgttaactcaaacagtctacgaaaacgggcacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaaacca 15653417  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15653416 aaacaacgtatcagatccatctccaaccctcctagccacgtggccaacaaaccacccacaatcaccctcaccaacactatccctaagacgactcacctcc 15653317  T
Q  301 ctccaccaacac 312  Q
    ||||||||||||    
T  15653316 ctccaccaacac 15653305  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 312
Target Start/End: Original strand, 46623968 - 46624233
Alignment:
Q  47 gccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaa 146  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  46623968 gccacaaactacgcctccacctccaaaaaaatccctgctgctccaaatcaacagagaacaagtctgccacagacatgagcttattctccgttaactcaaa 46624067  T
Q  147 cagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccnnnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatca 246  Q
    ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  || ||    
T  46624068 cagtctgcgaaaacggacacagaaaggaacatcccctaaccacctatcaaaccaaaacaacgtatcagaaccatctctaaccctcctagccacgtgacca 46624167  T
Q  247 acaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctccctccaccaacac 312  Q
    |||||||| ||||  || || || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46624168 acaaaccacccacagtcaccctcgccaacactatccctaatacgactcacctccctccaccaacac 46624233  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 13440282 - 13440475
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  13440282 tcaagaagtaaagcccaacactcatctagcaactcctcctcccactaccataaactacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 13440381  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  13440382 agagcaagtcggcaacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 13440475  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12378627 - 12378446
Alignment:
Q  13 gccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacagataacaagtctg 112  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||| |||| ||||| | |||||| ||| ||| | |||| | ||||| | ||    
T  12378627 gccctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaacctgcgcctccgcctcaacaaatccccccaccgcttcgacttaacaaagaacaaatttg 12378528  T
Q  113 ccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||| || | ||  |||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  12378527 ccacagacatgatcttattctccattaactcaaacagtctatgataccgctcacagagaggaacatcccctatccacctatc 12378446  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 45943080 - 45943152
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||    
T  45943080 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataatctacatctccacctccaca 45943152  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 43105546 - 43105669
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacagataaca 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| || | ||||  |  ||| ||||    
T  43105546 agtaacgccctacactctgctaacatctcctcctcccattgccacaacctgcgcctccacctccacaaatctccccattgttgcgaactagtagagaaca 43105645  T
Q  107 agtctgccacagacataaacttat 130  Q
    |||||||||| |||| | ||||||    
T  43105646 agtctgccaccgacaaagacttat 43105669  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 27724011 - 27723973
Alignment:
Q  6 aagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctccca 44  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27724011 aagtaaagccctacactcccctaacaagtcttcctccca 27723973  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 41339760 - 41339825
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccac 72  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||    
T  41339760 agtaaagtcctacactcctctaataattcctcctcccacgcccacaacctgcatcgccacctccac 41339825  T

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Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 7452581 - 7452897
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  7452581 tcaagaagtaaagccctacactcctctaataacacctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccaaacaaccccctgctgctccaaatcaacag 7452680  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  7452681 agaacaagtctgccacagacataagcttattctccgttaactcaaacagtctacgaaaacggacacagaaaggaacatcccctaaccacctatcatacca 7452780  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
          ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  | | |||||| ||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7452781 aaacaacgtatcagaaccatctccaaccctcctagccacgtgggcgagaaaccacccacaatcaccctcaccaacactatccctaagacgactcacctcc 7452880  T
Q  301 ctccaccaacaccaaac 317  Q
    |||||||||||| ||||    
T  7452881 ctccaccaacacgaaac 7452897  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16420918 - 16420728
Alignment:
Q  4 agaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacagata 103  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |    
T  16420918 agaagtaaagccctacgctcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagaga 16420819  T
Q  104 acaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  16420818 gcaagtcggccacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 16420728  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 12134563 - 12134628
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccac 72  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||    
T  12134563 agtaaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacgcccacaacgtacgccgccacctccac 12134628  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19384621 - 19384572
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagcca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  19384621 tcaagaagtaaagccctacactccactaacatctcctcctcccactgcca 19384572  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13879390 - 13879344
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacc 55  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13879390 taaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataacc 13879344  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 7555684 - 7555732
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaaccta 57  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  7555684 taaagccctacactcctctaataaattctcctcccacacccacaaccta 7555732  T

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Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 45421748 - 45422060
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgcccca-ctgctccgaatcaaca 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||  |||||||  |||||||    
T  45421748 tcaagaagaaaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgcgacaatctacgcctccacctccaaaaaaaacccctgctgctccagatcaaca 45421847  T
Q  100 gataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaacc 199  Q
    || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45421848 gagaacaagtctgccacatacatgagcttattctctgttaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaaccacctatccaacc 45421947  T
Q  200 nnnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctc 299  Q
           ||||||||  ||| | |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||  || || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  45421948 aaaacaacgtatcagaaccatcaccaaccctcctagccacgtgaccaccaaaccacccacagtcaccctcaccagcactatccctaatacgactcacctc 45422047  T
Q  300 cctccaccaacac 312  Q
    |||||||||||||    
T  45422048 cctccaccaacac 45422060  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 13550353 - 13550663
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  13550353 tcaagaattaaagccctgcactcctctagcaagtcctcatcccactgccataacctacgtctccacctccacacatccccccactgctccgaatcaacag 13550452  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccn 200  Q
    | | |||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||| || |||| | ||||||| ||||||||| ||||     
T  13550453 aaagcaagtccgccacgaatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggagcctcccctatccacctatcgaacca 13550552  T
Q  201 nnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctcc 300  Q
           ||||| || ||| | ||||| |||||   |||  ||||  ||||||| || ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13550553 aaatgatgtatctgccccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccagccgctaccaccaacaccaaccctacccctaagacgactcacctcc 13550652  T
Q  301 ctccaccaaca 311  Q
      |||||||||    
T  13550653 gaccaccaaca 13550663  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26894522 - 26894330
Alignment:
Q  2 caagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacaga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||| |||||||    
T  26894522 caagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacaccttcccccaccgctccgaagcaacaga 26894423  T
Q  102 taacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
     | |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  26894422 gagcaagtcggtgacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 26894330  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26899961 - 26899769
Alignment:
Q  2 caagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacaga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||| |||||||    
T  26899961 caagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacaccttcccccaccgctccgaagcaacaga 26899862  T
Q  102 taacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
     | |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  26899861 gagcaagtcggtgacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 26899769  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 43627728 - 43627875
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||| ||    
T  43627728 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccacctctccgaatcaatag 43627827  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    | | |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43627828 agagcaagtcggccacgaacatagacttattctctgttaactcaaaca 43627875  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31085548 - 31085452
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  31085548 tcaagaagtaaagccctacactctgctaacagctcctcctcccactgtcacaacctgcatctccacctccacacatccccccactgctctgaatcaa 31085452  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 33548101 - 33548197
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||    
T  33548101 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaa 33548197  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Original strand, 13550884 - 13551116
Alignment:
Q  79 ccccactgctccgaatcaacagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||| || |||| | |    
T  13550884 ccccactgctccgaatcaacagaaagcaagtccgccacgaatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggagcct 13550983  T
Q  179 cccctaaccacctatccaaccnnnnnnncgtatcagctccacctccaaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacact 278  Q
    |||||| ||||||||| ||||        ||||| || ||| | ||||| |||||   |||  ||||  ||||||| || ||  | ||| ||||||| ||    
T  13550984 cccctatccacctatcgaaccaaaatgatgtatctgccccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccagccgctaccaccaacaccaaccct 13551083  T
Q  279 acccctaagacgactcacctccctccaccaaca 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13551084 acccctaagacgactcacctccgaccaccaaca 13551116  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Original strand, 36804147 - 36804196
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacct 56  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36804147 agtaaagccctacactcctctaacaagtcctcctcccacgcccacaacct 36804196  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 22052856 - 22052911
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacct 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22052856 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacct 22052911  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Original strand, 36804362 - 36804400
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccac 45  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36804362 agtaaagccctacactcctctaacaagtcctcctcccac 36804400  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 55
Target Start/End: Original strand, 40176905 - 40176951
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacc 55  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40176905 taaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacacccataacc 40176951  T

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Target: scaffold0131 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 124 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4337 - 4144
Alignment:
Q  124 aacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccnnnnnnncgtatcagctccacctc 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| |||    
T  4337 aacttattctctattaactcaaacagcctacgaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccaaaacaacgtatgagctccatctc 4238  T
Q  224 caaccctcctagccacaagatcaacaaaccatccactctctccatcaccaacactacccctaagacgactcacctccctccaccaacaccaaac 317  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4237 caaccctccgagccacatgatcaacaaaccaaccgctctctccatcaccatcactacccctaatacgactcacctccctccaccaccacgaaac 4144  T

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Target: scaffold0418 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 7904 - 8088
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||    
T  7904 tcaagaagtaaagccatacactccactaacatctcctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccaaaaaaacccctgctgctccaaatcaacag 8003  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaa 185  Q
    | ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  8004 agaacaagtctgccatagacatgagcttattctctattaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaa 8088  T

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Target: chr6 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 25318083 - 25318230
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||    
T  25318083 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtatccacctccacaaatccccccaccgctttgaatcaacag 25318182  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25318183 atagcaagtccgccacggacataaacttattctttgttaactcaaaca 25318230  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 26205577 - 26205724
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||    
T  26205577 tcaagaagtaaagccctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtatccacctccacaaatccccccaccgctttgaatcaacag 26205676  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26205677 atagcaagtccgccacggacataaacttattctttgttaactcaaaca 26205724  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23347378 - 23347185
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaacgccccactgctccgaatcaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||    
T  23347378 tcaagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacag 23347279  T
Q  101 ataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacgaaaacggacactaaaaggaacatcccctaaccacctatc 194  Q
    | | |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| || |||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  23347278 agagcaagtcggcgacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 23347185  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 15674054 - 15674205
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccacaaaac----gccccactgctccgaatca 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |    ||||||  |||| ||||||    
T  15674054 tcaagaagtaaagccctgcactcatctagcaactcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacacctccccggccccaacgctctgaatca 15674153  T
Q  97 acagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaaca 148  Q
    ||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15674154 acagagagtaagtcggccacagacatagacttattctccgttaactcaaaca 15674205  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 33630334 - 33630378
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  33630334 taaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaa 33630378  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 4474935 - 4474998
Alignment:
Q  9 taaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccac 72  Q
    ||||| |||| ||||| |||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4474935 taaagtcctaaactcctctaataaattctcctcccacgcccacaacctacgtctccacctccac 4474998  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 1683269 - 1683299
Alignment:
Q  1 tcaagaagtaaagccctacactccgctaaca 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1683269 tcaagaagtaaagccctacactccgctaaca 1683299  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 5041753 - 5041819
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccaca 73  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||    
T  5041753 agtaatgccctacactcctctaacaactcttcctcccacacccacaaaccacgacgccacctccaca 5041819  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Original strand, 26205841 - 26205887
Alignment:
Q  265 ccatcaccaacactacccctaagacgactcacctccctccaccaaca 311  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26205841 ccaacaccaaccctacccctaagacgactcacctccgaccaccaaca 26205887  T

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Target: scaffold0112 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15555 - 15490
Alignment:
Q  7 agtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccacagccacaacctacgtctccacctccac 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||| || || | ||||||||||    
T  15555 agtaaagccctacactcctctaacatatcctcctcccacgcccacaatctgcgacgccacctccac 15490  T

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