View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8552_high_10 (Length: 322)

Name: NF8552_high_10
Description: NF8552
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8552_high_10
NF8552_high_10
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-204)||(54534324-54534525)
chr3 (1-204)||(37698139-37698342)
chr3 (1-197)||(38856089-38856285)
chr3 (1-205)||(15520138-15520342)
chr3 (1-200)||(8042600-8042799)
chr3 (1-200)||(42307901-42308100)
chr3 (1-199)||(25999382-25999580)
chr3 (1-200)||(22174986-22175185)
chr3 (1-196)||(32244117-32244312)
chr3 (1-200)||(46452158-46452357)
chr3 (1-204)||(50528918-50529121)
chr3 (1-199)||(25494281-25494479)
chr3 (1-193)||(21581042-21581234)
chr3 (2-201)||(29445480-29445679)
chr3 (1-202)||(24835695-24835896)
chr3 (1-201)||(54870170-54870370)
chr3 (1-200)||(20842344-20842543)
chr3 (1-202)||(15520627-15520828)
chr3 (1-202)||(42104967-42105168)
chr3 (1-200)||(12117654-12117853)
chr3 (1-196)||(32359256-32359451)
chr3 (1-198)||(20699144-20699341)
chr3 (1-202)||(35226438-35226639)
chr3 (1-202)||(38933937-38934137)
chr3 (1-203)||(44609329-44609531)
chr3 (15-199)||(26122808-26122992)
chr3 (1-199)||(2895179-2895381)
chr3 (3-203)||(34700331-34700531)
chr3 (1-203)||(53028215-53028409)
chr3 (1-193)||(48924999-48925189)
chr3 (41-198)||(35643212-35643369)
chr3 (1-172)||(44688782-44688952)
chr3 (59-193)||(50529827-50529961)
chr3 (4-160)||(16354379-16354535)
chr3 (1-170)||(12915930-12916098)
chr3 (65-200)||(49128042-49128177)
chr3 (3-79)||(24366143-24366219)
chr3 (3-69)||(13696917-13696983)
chr3 (143-200)||(24366085-24366142)
chr3 (166-196)||(40240485-40240515)
chr3 (1-39)||(50528878-50528916)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-202)||(1579033-1579234)
chr5 (1-202)||(1605581-1605782)
chr5 (1-205)||(9008067-9008271)
chr5 (1-196)||(16069356-16069551)
chr5 (1-200)||(27420857-27421056)
chr5 (1-199)||(5202972-5203170)
chr5 (1-201)||(27679179-27679379)
chr5 (1-201)||(8374349-8374548)
chr5 (1-200)||(24105681-24105880)
chr5 (1-200)||(31883143-31883342)
chr5 (1-200)||(33491206-33491405)
chr5 (3-200)||(4120936-4121133)
chr5 (1-194)||(16737457-16737650)
chr5 (1-193)||(3386496-3386688)
chr5 (1-202)||(33991137-33991338)
chr5 (1-192)||(1165611-1165802)
chr5 (1-205)||(3921575-3921779)
chr5 (1-200)||(19358525-19358724)
chr5 (1-200)||(35782654-35782853)
chr5 (1-200)||(20992156-20992355)
chr5 (1-202)||(38598460-38598661)
chr5 (1-199)||(31410476-31410674)
chr5 (1-162)||(26602952-26603113)
chr5 (1-154)||(27025001-27025154)
chr5 (58-191)||(33284642-33284775)
chr5 (64-209)||(20992354-20992503)
chr5 (47-204)||(25634577-25634732)
chr5 (1-49)||(35420434-35420482)
chr5 (63-187)||(31638157-31638281)
chr5 (80-133)||(41818552-41818605)
chr5 (167-199)||(26603108-26603140)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-200)||(6394748-6394947)
chr7 (1-195)||(4477321-4477515)
chr7 (1-205)||(7164176-7164380)
chr7 (1-200)||(43067973-43068172)
chr7 (1-201)||(24792332-24792532)
chr7 (1-196)||(5280861-5281056)
chr7 (1-200)||(30181024-30181223)
chr7 (1-200)||(36890830-36891028)
chr7 (1-199)||(22649694-22649892)
chr7 (1-206)||(3511314-3511519)
chr7 (1-198)||(20346487-20346684)
chr7 (1-200)||(42204151-42204351)
chr7 (1-200)||(12101178-12101377)
chr7 (1-200)||(42964996-42965195)
chr7 (1-199)||(33359090-33359288)
chr7 (1-200)||(933282-933481)
chr7 (1-194)||(1803029-1803222)
chr7 (1-194)||(38866547-38866740)
chr7 (12-200)||(4347270-4347458)
chr7 (1-205)||(25748479-25748683)
chr7 (1-196)||(9452591-9452786)
chr7 (1-200)||(15655909-15656108)
chr7 (1-192)||(43156718-43156909)
chr7 (1-201)||(33846529-33846724)
chr7 (1-205)||(42673457-42673657)
chr7 (1-199)||(12097590-12097788)
chr7 (12-198)||(8630665-8630851)
chr7 (7-201)||(32041538-32041732)
chr7 (1-197)||(46134304-46134500)
chr7 (1-196)||(46891339-46891535)
chr7 (1-162)||(48865665-48865829)
chr7 (1-205)||(16894507-16894701)
chr7 (1-197)||(17753600-17753796)
chr7 (1-200)||(43021580-43021775)
chr7 (52-200)||(19828267-19828415)
chr7 (102-200)||(37704977-37705075)
chr7 (47-200)||(37005857-37006010)
chr7 (47-200)||(43405017-43405170)
chr7 (54-199)||(36849590-36849735)
chr7 (103-181)||(27691428-27691506)
chr7 (47-199)||(30075277-30075426)
chr7 (71-202)||(20163814-20163945)
chr7 (47-200)||(15655458-15655611)
chr7 (166-205)||(22032910-22032950)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-203)||(39218772-39218974)
chr8 (1-206)||(24113176-24113381)
chr8 (1-199)||(14422702-14422900)
chr8 (1-198)||(34842375-34842572)
chr8 (1-202)||(39206582-39206783)
chr8 (1-200)||(18594535-18594734)
chr8 (1-195)||(144397-144591)
chr8 (1-202)||(10836765-10836966)
chr8 (1-199)||(29938060-29938258)
chr8 (1-196)||(13110406-13110601)
chr8 (1-194)||(2042534-2042727)
chr8 (1-201)||(22260640-22260840)
chr8 (1-200)||(6144283-6144482)
chr8 (1-199)||(35118041-35118239)
chr8 (1-193)||(34679467-34679659)
chr8 (1-200)||(4035845-4036044)
chr8 (1-203)||(7791406-7791608)
chr8 (1-199)||(33278399-33278597)
chr8 (1-203)||(7774759-7774961)
chr8 (1-199)||(38167165-38167363)
chr8 (1-195)||(41575516-41575710)
chr8 (1-199)||(5320563-5320761)
chr8 (42-202)||(33287076-33287236)
chr8 (1-203)||(7811990-7812192)
chr8 (1-205)||(34998906-34999110)
chr8 (1-192)||(44804954-44805145)
chr8 (1-204)||(28639272-28639477)
chr8 (1-196)||(8021721-8021908)
chr8 (42-200)||(40117903-40118061)
chr8 (1-200)||(36491155-36491354)
chr8 (13-194)||(42571598-42571776)
chr8 (1-195)||(66189-66384)
chr8 (59-200)||(26783801-26783942)
chr8 (1-119)||(9807339-9807457)
chr8 (47-200)||(2322068-2322221)
chr8 (71-204)||(5005160-5005293)
chr8 (111-196)||(9806875-9806960)
chr8 (47-196)||(39220258-39220407)
chr8 (102-204)||(18683704-18683805)
chr8 (102-204)||(18729266-18729367)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (1-202)||(50055099-50055300)
chr4 (5-199)||(38055154-38055348)
chr4 (1-202)||(1756762-1756963)
chr4 (1-204)||(28032710-28032913)
chr4 (1-200)||(45424532-45424731)
chr4 (1-198)||(37968755-37968952)
chr4 (1-204)||(53717462-53717665)
chr4 (1-200)||(54189541-54189740)
chr4 (1-199)||(19913628-19913826)
chr4 (1-199)||(23776457-23776655)
chr4 (3-196)||(20877047-20877240)
chr4 (1-205)||(27488646-27488850)
chr4 (1-200)||(15241026-15241225)
chr4 (1-195)||(19164971-19165164)
chr4 (1-196)||(31969681-31969876)
chr4 (1-200)||(50353797-50353996)
chr4 (1-202)||(2481406-2481607)
chr4 (1-202)||(6611358-6611559)
chr4 (1-202)||(35490771-35490972)
chr4 (1-205)||(54412619-54412823)
chr4 (1-199)||(6688625-6688817)
chr4 (1-200)||(14987788-14987987)
chr4 (1-196)||(30423563-30423757)
chr4 (1-200)||(37464717-37464916)
chr4 (1-200)||(44784915-44785114)
chr4 (6-200)||(23704212-23704406)
chr4 (1-198)||(40428718-40428915)
chr4 (1-202)||(48909840-48910041)
chr4 (6-198)||(11639581-11639773)
chr4 (1-195)||(16700782-16700976)
chr4 (1-195)||(53875658-53875852)
chr4 (1-202)||(27536102-27536299)
chr4 (1-201)||(43289958-43290158)
chr4 (1-201)||(44379185-44379385)
chr4 (1-196)||(1617084-1617279)
chr4 (2-198)||(47632032-47632229)
chr4 (2-202)||(15669177-15669377)
chr4 (1-196)||(8591090-8591285)
chr4 (1-200)||(8932176-8932375)
chr4 (1-196)||(52139203-52139398)
chr4 (2-192)||(27583631-27583821)
chr4 (1-195)||(30171581-30171775)
chr4 (25-193)||(28360433-28360602)
chr4 (1-187)||(33703850-33704036)
chr4 (1-200)||(53353051-53353258)
chr4 (1-197)||(44375844-44376040)
chr4 (7-187)||(38071327-38071504)
chr4 (3-201)||(55344825-55345023)
chr4 (1-203)||(16703818-16704016)
chr4 (1-201)||(40680036-40680236)
chr4 (47-202)||(50053437-50053592)
chr4 (1-119)||(23269044-23269162)
chr4 (111-196)||(23265865-23265950)
chr4 (47-200)||(44548185-44548339)
chr4 (1-78)||(53408137-53408215)
chr4 (48-130)||(51780763-51780845)
chr4 (1-54)||(23261884-23261937)
chr4 (47-189)||(17493340-17493482)
chr4 (1-94)||(9595900-9595982)
chr4 (142-201)||(9595974-9596032)
chr4 (2-57)||(48748197-48748252)
chr4 (1-40)||(50055301-50055340)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (1-202)||(25897368-25897569)
chr1 (1-202)||(29288143-29288342)
chr1 (1-202)||(39260356-39260557)
chr1 (1-200)||(16052092-16052291)
chr1 (1-204)||(33510476-33510679)
chr1 (1-203)||(52753157-52753359)
chr1 (1-206)||(20089461-20089666)
chr1 (3-202)||(1168497-1168696)
chr1 (1-202)||(26580280-26580481)
chr1 (1-197)||(26663257-26663453)
chr1 (1-193)||(29078519-29078711)
chr1 (1-204)||(42370805-42371008)
chr1 (1-199)||(970534-970734)
chr1 (1-202)||(41928505-41928706)
chr1 (2-201)||(1940758-1940957)
chr1 (1-200)||(46409431-46409632)
chr1 (1-199)||(52696788-52696986)
chr1 (1-202)||(2473716-2473917)
chr1 (1-205)||(1170454-1170658)
chr1 (5-193)||(38829072-38829260)
chr1 (1-204)||(46760958-46761161)
chr1 (1-202)||(2347650-2347852)
chr1 (1-199)||(12682817-12683015)
chr1 (1-196)||(19715171-19715366)
chr1 (1-200)||(32671575-32671774)
chr1 (1-200)||(43905650-43905849)
chr1 (3-201)||(8079721-8079919)
chr1 (1-195)||(8120870-8121064)
chr1 (1-199)||(15203109-15203307)
chr1 (1-205)||(17591682-17591883)
chr1 (1-197)||(5215384-5215580)
chr1 (7-199)||(40092488-40092680)
chr1 (1-196)||(7145207-7145402)
chr1 (12-200)||(49146168-49146356)
chr1 (1-200)||(13996733-13996932)
chr1 (1-199)||(51359227-51359424)
chr1 (1-199)||(23498457-23498655)
chr1 (1-162)||(40149497-40149658)
chr1 (2-194)||(15717787-15717978)
chr1 (1-180)||(17587515-17587694)
chr1 (1-201)||(15554162-15554354)
chr1 (1-197)||(6765458-6765654)
chr1 (30-198)||(29695673-29695842)
chr1 (1-200)||(38171828-38172014)
chr1 (74-202)||(52086261-52086389)
chr1 (48-182)||(23322897-23323031)
chr1 (251-307)||(12489653-12489709)
chr1 (125-205)||(5675096-5675176)
chr1 (47-202)||(5217840-5217994)
chr1 (203-252)||(12489420-12489469)
chr1 (245-305)||(12487770-12487830)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-202)||(36699-36900)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-205)||(22961-23165)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-201)||(6086609-6086809)
chr6 (1-203)||(2837540-2837742)
chr6 (1-199)||(26946886-26947084)
chr6 (1-195)||(34887302-34887496)
chr6 (1-201)||(21893452-21893652)
chr6 (1-200)||(3347533-3347732)
chr6 (1-199)||(26704349-26704547)
chr6 (1-199)||(30691850-30692048)
chr6 (1-200)||(18613536-18613735)
chr6 (1-203)||(16307018-16307220)
chr6 (1-202)||(17261083-17261284)
chr6 (7-197)||(3955782-3955972)
chr6 (1-199)||(9459562-9459760)
chr6 (1-203)||(11167235-11167437)
chr6 (1-202)||(35198280-35198480)
chr6 (1-199)||(20726790-20726984)
chr6 (1-201)||(28199518-28199719)
chr6 (1-188)||(1153603-1153790)
chr6 (35-202)||(52832-52999)
chr6 (1-194)||(30698939-30699132)
chr6 (1-128)||(33464399-33464526)
chr6 (1-105)||(53001-53105)
chr6 (120-196)||(33463703-33463779)
chr6 (167-202)||(34800920-34800956)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-200)||(33906057-33906256)
chr2 (1-203)||(6174838-6175040)
chr2 (1-199)||(31517225-31517423)
chr2 (12-200)||(1108276-1108463)
chr2 (1-201)||(18806894-18807094)
chr2 (1-199)||(3873254-3873452)
chr2 (1-200)||(26323196-26323395)
chr2 (1-202)||(39635446-39635647)
chr2 (1-201)||(42937714-42937915)
chr2 (1-196)||(28329849-28330042)
chr2 (1-205)||(2178779-2178983)
chr2 (1-196)||(4016039-4016234)
chr2 (1-200)||(4232152-4232351)
chr2 (1-200)||(5733395-5733594)
chr2 (1-200)||(19901148-19901346)
chr2 (1-195)||(1482913-1483106)
chr2 (1-200)||(30270689-30270888)
chr2 (1-183)||(19383945-19384127)
chr2 (1-196)||(850997-851192)
chr2 (47-202)||(30420223-30420378)
chr2 (1-192)||(16066304-16066495)
chr2 (5-201)||(16588790-16588986)
chr2 (1-204)||(44947559-44947755)
chr2 (1-195)||(429817-430011)
chr2 (47-201)||(42446625-42446779)
chr2 (47-195)||(3585291-3585439)
chr2 (54-160)||(22101210-22101316)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-200)||(10234-10433)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-196)||(145255-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-203)||(305-507)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-202)||(16-217)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (6-198)||(3708-3900)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-201)||(16-217)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 54534324 - 54534525
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  54534324 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccat 54534421  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54534422 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54534521  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  54534522 aaat 54534525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 37698139 - 37698342
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  37698139 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 37698238  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37698239 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 37698338  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  37698339 aaat 37698342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38856285 - 38856089
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38856285 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 38856186  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38856185 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 15520138 - 15520342
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15520138 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgat 15520237  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520238 gataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520337  T
Q  201 aaatc 205  Q
     ||||    
T  15520338 taatc 15520342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8042799 - 8042600
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8042799 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 8042700  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8042699 gataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcct 8042600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 42307901 - 42308100
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42307901 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 42308000  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42308001 gataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 42308100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25999580 - 25999382
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25999580 cgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 25999481  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25999480 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 22174986 - 22175185
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22174986 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 22175085  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22175086 gataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32244312 - 32244117
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32244312 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 32244213  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32244212 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 46452158 - 46452357
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  46452158 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 46452257  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  46452258 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50529121 - 50528918
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50529121 cgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 50529022  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50529021 gataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50528922  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  50528921 aaat 50528918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25494281 - 25494479
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25494281 cgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 25494380  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494381 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21581234 - 21581042
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21581234 cgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 21581135  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581134 gataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29445679 - 29445480
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  29445679 gaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatg 29445580  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29445579 ataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 29445480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24835695 - 24835896
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24835695 cgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 24835794  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24835795 aataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcct 24835894  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24835895 aa 24835896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 54870170 - 54870370
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  54870170 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgat 54870269  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54870270 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 54870369  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  54870370 a 54870370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20842344 - 20842543
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  20842344 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactat 20842443  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20842444 gataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20842543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15520828 - 15520627
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520828 cgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 15520729  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15520728 gataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520629  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  15520628 aa 15520627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42104967 - 42105168
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  42104967 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 42105066  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  42105067 gataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcctaatggggtct 42105166  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42105167 aa 42105168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 12117654 - 12117853
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  12117654 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactat 12117753  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12117754 gataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 12117853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32359451 - 32359256
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32359451 cgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 32359352  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32359351 gataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20699341 - 20699144
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20699341 cgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 20699242  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20699241 gataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35226639 - 35226438
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35226639 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 35226540  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35226539 gataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcct 35226440  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35226439 aa 35226438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38934137 - 38933937
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38934137 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 38934038  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38934037 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 38933939  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38933938 aa 38933937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 44609329 - 44609531
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44609329 cgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 44609428  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  44609429 gataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggtct 44609528  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  44609529 aaa 44609531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26122992 - 26122808
Alignment:
Q  15 taaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactattttt 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26122992 taaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttt 26122893  T
Q  115 atttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26122892 atttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2895381 - 2895179
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattc----ataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaa 96  Q
    |||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2895381 cgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaa 2895282  T
Q  97 ccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    | |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2895281 ctatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggg 2895182  T
Q  197 gcc 199  Q
    |||    
T  2895181 gcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34700531 - 34700331
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34700531 aaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 34700432  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  34700431 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcctaa 34700332  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  34700331 a 34700331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53028409 - 53028215
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  53028409 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatat 53028310  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||        |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53028309 gataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 48924999 - 48925189
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  48924999 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactat 48925098  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  48925099 gataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  41 ggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  141 aagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44688952 - 44688782
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44688952 cgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactat 44688854  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagc 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44688853 gataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 193
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  59 ttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 158  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  159 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354379
Alignment:
Q  4 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  104 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 160  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12916098 - 12915930
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  12916098 cgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattat 12915999  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12915998 gataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128042
Alignment:
Q  65 ttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagccc 164  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  165 acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcct 49128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24366219 - 24366143
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggc 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24366219 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13696983 - 13696917
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 69  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696983 aaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt 13696917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366085
Alignment:
Q  143 gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcct 24366085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40240515 - 40240485
Alignment:
Q  166 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240515 cataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 40240485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 50528878 - 50528916
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagc 39  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528878 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1579234 - 1579033
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1579234 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 1579135  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1579134 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1579035  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1579034 aa 1579033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1605581 - 1605782
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1605581 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 1605680  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1605681 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1605780  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1605781 aa 1605782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 9008067 - 9008271
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9008067 cgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 9008166  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9008167 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 9008266  T
Q  201 aaatc 205  Q
     ||||    
T  9008267 taatc 9008271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16069551 - 16069356
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16069551 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16069452  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069451 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27421056 - 27420857
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27421056 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 27420957  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27420956 gataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27420857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5203170 - 5202972
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5203170 cgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 5203071  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5203070 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27679179 - 27679379
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27679179 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 27679278  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27679279 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27679378  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  27679379 a 27679379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 8374349 - 8374548
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8374349 cgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 8374447  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8374448 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 24105681 - 24105880
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24105681 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 24105780  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24105781 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 24105880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31883342 - 31883143
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  31883342 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 31883243  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31883242 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 31883143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 33491206 - 33491405
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33491206 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactat 33491305  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33491306 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33491405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4121133 - 4120936
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4121133 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4121034  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4121033 taaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcct 4120936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 16737457 - 16737650
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16737457 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16737556  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16737557 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 3386496 - 3386688
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3386496 cgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 3386595  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386596 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33991338 - 33991137
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  33991338 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 33991239  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33991238 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcct 33991139  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33991138 aa 33991137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1165611 - 1165802
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  1165611 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactat 1165710  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165711 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3921779 - 3921575
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3921779 cgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 3921680  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3921679 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgggacct 3921580  T
Q  201 aaatc 205  Q
     ||||    
T  3921579 taatc 3921575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19358724 - 19358525
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19358724 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 19358625  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19358624 gataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcct 19358525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 35782654 - 35782853
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagc-cggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaacca 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35782654 cgaatgaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 35782752  T
Q  100 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35782753 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcc 35782852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20992156 - 20992355
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20992156 cgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactat 20992255  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20992256 gatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 20992355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38598460 - 38598661
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38598460 cgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 38598559  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38598560 gataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcct 38598659  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38598660 aa 38598661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31410674 - 31410476
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31410674 cgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactat 31410575  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31410574 gataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 26602952 - 26603113
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26602952 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 26603051  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26603052 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27025154 - 27025001
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27025154 cgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactat 27025055  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagt 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  27025054 gataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 191
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  58 tttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  158 taagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992503
Alignment:
Q  64 cttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcc 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  164 c----acataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaaatcttgt 209  Q
    |    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggccttaatgttgt 20992503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634577
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| ||||||  || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||   | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| ||| |||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttta--ttatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaaat 204  Q
    |||  ||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcctaaat 25634577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 35420434 - 35420482
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaa 49  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35420434 cgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  63 gcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 162  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||   ||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  163 ccacataagctcaaaataagtcaat 187  Q
     ||||||| |  |||||||||||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  80 ataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacc 133  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 199
Target Start/End: Original strand, 26603108 - 26603140
Alignment:
Q  167 ataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603108 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6394947 - 6394748
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394947 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 6394848  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6394847 gataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcct 6394748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4477321 - 4477515
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477321 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 4477420  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477421 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7164380 - 7164176
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7164380 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 7164281  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7164280 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggtct 7164181  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  7164180 aaatc 7164176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 43067973 - 43068172
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  43067973 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactat 43068072  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068073 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 43068172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24792332 - 24792532
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24792332 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 24792431  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24792432 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 24792531  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  24792532 a 24792532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5281056 - 5280861
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5281056 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 5280957  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5280956 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 5280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 30181024 - 30181223
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30181024 cgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 30181123  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30181124 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 30181223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 36890830 - 36891028
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36890830 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactat 36890929  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36890930 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcct 36891028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 22649694 - 22649892
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22649694 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattat 22649793  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22649794 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3511519 - 3511314
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3511519 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 3511420  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3511419 gataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacgggacct 3511320  T
Q  201 aaatct 206  Q
     |||||    
T  3511319 taatct 3511314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20346684 - 20346487
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20346684 cgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 20346585  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20346584 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42204351 - 42204151
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42204351 cgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 42204252  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42204251 gataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 42204152  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  42204151 t 42204151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 12101178 - 12101377
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12101178 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 12101277  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12101278 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcct 12101377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 42964996 - 42965195
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42964996 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 42965095  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42965096 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcct 42965195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 33359090 - 33359288
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33359090 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 33359189  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33359190 gataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 933481 - 933282
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  933481 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 933382  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  933381 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcct 933282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1803222 - 1803029
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  1803222 cgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactat 1803123  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803122 gataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38866740 - 38866547
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38866740 cgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactat 38866641  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38866640 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4347458 - 4347270
Alignment:
Q  12 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4347458 acataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatt 4347359  T
Q  112 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4347358 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcct 4347270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25748683 - 25748479
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25748683 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 25748584  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | ||||||||||  |||| ||||||||||||||||     
T  25748583 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcca 25748484  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  25748483 aaatc 25748479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9452786 - 9452591
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  9452786 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactat 9452687  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452686 gataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15656108 - 15655909
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15656108 cgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 15656009  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15656008 gataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15655909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43156909 - 43156718
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  43156909 cgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactat 43156810  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43156809 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 33846529 - 33846724
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  33846529 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactat 33846623  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33846624 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42673657 - 42673457
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42673657 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 42673558  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  42673557 gataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacggagcat 42673462  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  42673461 aaatc 42673457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 12097590 - 12097788
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  12097590 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactat 12097689  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  12097690 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8630851 - 8630665
Alignment:
Q  12 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630851 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatt 8630752  T
Q  112 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  8630751 tttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041538
Alignment:
Q  7 aggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaa 106  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  107 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggccta 32041538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 46134304 - 46134500
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  46134304 cgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactat 46134403  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134404 aataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 46891339 - 46891535
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  46891339 cgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactat 46891438  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaa-gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46891439 gacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48865829 - 48865665
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48865829 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 48865730  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaa---gcttatgggagtagataagc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  48865729 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16894507 - 16894701
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16894507 cgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16894606  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16894607 gataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataa----------gctcaaaataagccaatccaaacggggcct 16894696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17753796 - 17753600
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17753796 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 17753697  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17753696 gttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 43021580 - 43021775
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43021580 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagacc----gaaatatgccataagcagcttatgaaactat 43021675  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  43021676 aataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcct 43021775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828267
Alignment:
Q  52 tgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggg 151  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  152 agtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcct 19828267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704977
Alignment:
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcct 37704977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006010
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    || | ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcct 37006010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405017
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||| | | || || |||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcct 43405017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  54 aaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 153  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||   |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  154 tagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691506
Alignment:
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||   | | |||  ||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaat-at-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20163945 - 20163814
Alignment:
Q  71 aaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataa 170  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||| | |||||   ||| |||||| || ||||    
T  20163945 aaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagctcatataa 20163846  T
Q  171 gctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20163845 gcccaaaataagtcaatccaaaaagggcctaa 20163814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655611
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||   || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||  |||||| |||| |||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcct 15655611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 205
Target Start/End: Original strand, 22032910 - 22032950
Alignment:
Q  166 cataagctcaaaataag-tcaatccaaacggggcctaaatc 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22032910 cataagctcaaaataagctcaatccaaacggggcctaaatc 22032950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39218974 - 39218772
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39218974 cgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctat 39218875  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39218874 gataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39218775  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  39218774 aaa 39218772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24113176 - 24113381
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24113176 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 24113275  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113276 gataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 24113375  T
Q  201 aaatct 206  Q
    ||||||    
T  24113376 aaatct 24113381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14422900 - 14422702
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14422900 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 14422801  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14422800 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 34842375 - 34842572
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34842375 cgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 34842474  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34842475 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39206783 - 39206582
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39206783 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 39206684  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39206683 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39206584  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39206583 aa 39206582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18594734 - 18594535
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18594734 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 18594635  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18594634 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18594535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 144591 - 144397
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  144591 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 144492  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144491 gataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10836765 - 10836966
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10836765 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 10836864  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10836865 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 10836964  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10836965 aa 10836966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29938258 - 29938060
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29938258 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 29938159  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29938158 gataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13110601 - 13110406
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13110601 cgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactat 13110502  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13110501 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 2042534 - 2042727
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2042534 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 2042633  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2042634 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22260640 - 22260840
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22260640 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactag 22260739  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22260740 gataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22260839  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  22260840 a 22260840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 6144283 - 6144482
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6144283 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 6144382  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144383 gataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 6144482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 35118041 - 35118239
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35118041 cgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 35118140  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35118141 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34679467 - 34679659
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34679467 cgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactat 34679566  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34679567 gataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4036044 - 4035845
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4036044 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 4035945  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  4035944 gataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcct 4035845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7791608 - 7791406
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7791608 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 7791509  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7791508 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtct 7791409  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  7791408 aaa 7791406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33278597 - 33278399
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33278597 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 33278498  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33278497 gataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7774961 - 7774759
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7774961 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactat 7774862  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7774861 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcct 7774762  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  7774761 aaa 7774759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 38167165 - 38167363
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38167165 cgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 38167264  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  38167265 gataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41575710 - 41575516
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41575710 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 41575611  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575610 gataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5320761 - 5320563
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||    
T  5320761 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactat 5320662  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5320661 gataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287236
Alignment:
Q  42 gagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  142 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 33287236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7812192 - 7811990
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7812192 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 7812093  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7812092 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcct 7811993  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  7811992 aaa 7811990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 34998906 - 34999110
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34998906 cgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaa 34999005  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  34999006 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacgggacct 34999105  T
Q  201 aaatc 205  Q
     ||||    
T  34999106 taatc 34999110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 44804954 - 44805145
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44804954 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 44805053  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44805054 gataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28639477 - 28639272
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28639477 cgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 28639380  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagct----tatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28639379 gataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacggg 28639280  T
Q  197 gcctaaat 204  Q
     |||||||    
T  28639279 acctaaat 28639272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8021908 - 8021721
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8021908 cgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 8021817  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8021816 gataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118061
Alignment:
Q  42 gagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  142 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 40118061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36491354 - 36491155
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  36491354 cgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactat 36491255  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  36491254 gataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcct 36491155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42571776 - 42571598
Alignment:
Q  13 cataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactattt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42571776 cataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattt 42571679  T
Q  113 ttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42571678 ttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 66189 - 66384
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaacca 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66189 cgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaacta 66288  T
Q  100 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  66289 ttataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 200
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783942
Alignment:
Q  59 ttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  159 aagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 26783942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9807457 - 9807339
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  9807457 cgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctat 9807358  T
Q  101 gataaactatttttattta 119  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  9807357 gataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322221
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||  |||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcct 2322221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5005293 - 5005160
Alignment:
Q  71 aaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataa 170  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |  |  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5005293 aaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataa 5005194  T
Q  171 gctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaaat 204  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || |||||||    
T  5005193 gcttaagataagccaatccaaacaggacctaaat 5005160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  111 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||| | || ||||||||||||||     |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18683805 - 18683704
Alignment:
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  18683805 ataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagctccaataagcttaaaataagtcagtccaaacgaggctta 18683707  T
Q  202 aat 204  Q
    |||    
T  18683706 aat 18683704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18729367 - 18729266
Alignment:
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  18729367 ataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagctccaataagcttaaaataagtcagtccaaacgaggctta 18729269  T
Q  202 aat 204  Q
    |||    
T  18729268 aat 18729266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 50055099 - 50055300
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055099 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 50055198  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50055199 gataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50055298  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  50055299 aa 50055300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055154
Alignment:
Q  5 ggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgata 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  105 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1756762 - 1756963
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1756762 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 1756861  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1756862 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggtct 1756961  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1756962 aa 1756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28032710 - 28032913
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28032710 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactat 28032809  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28032810 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcct 28032909  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  28032910 aaat 28032913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 45424532 - 45424731
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45424532 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 45424631  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424632 gataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 45424731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37968755 - 37968952
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37968755 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 37968854  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  37968855 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 53717462 - 53717665
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53717462 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactat 53717561  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53717562 gataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 53717661  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  53717662 aaat 53717665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 54189740 - 54189541
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54189740 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 54189641  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54189640 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54189541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 19913628 - 19913826
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19913628 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 19913727  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19913728 gataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 23776457 - 23776655
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23776457 cgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 23776556  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776557 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20877240 - 20877047
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20877240 aaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20877141  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20877140 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 20877047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27488646 - 27488850
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27488646 cgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 27488745  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27488746 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 27488845  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  27488846 aaatc 27488850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 15241026 - 15241225
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15241026 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 15241125  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15241126 gataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19164971 - 19165164
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19164971 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttatt-aaatatggcataagcagcttatgaaactat 19165068  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19165069 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31969876 - 31969681
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31969876 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactat 31969777  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31969776 gataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 50353996 - 50353797
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50353996 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 50353897  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50353896 cataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50353797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 2481406 - 2481607
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2481406 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 2481505  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2481506 gataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2481605  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  2481606 aa 2481607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6611358 - 6611559
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  6611358 cgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactat 6611457  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6611458 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 6611557  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  6611558 aa 6611559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35490771 - 35490972
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35490771 cgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 35490870  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35490871 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggacct 35490970  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35490971 aa 35490972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54412823 - 54412619
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  54412823 cgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactat 54412724  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  54412723 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggtct 54412624  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  54412623 aaatc 54412619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 6688625 - 6688817
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||| ||    
T  6688625 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactat 6688718  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688719 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14987987 - 14987788
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14987987 cgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 14987888  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14987887 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 14987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30423563 - 30423757
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30423563 cgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 30423661  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30423662 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37464916 - 37464717
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37464916 cgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 37464817  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37464816 gataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 44784915 - 44785114
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  44784915 cgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 44785014  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44785015 gataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 44785114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 200
Target Start/End: Original strand, 23704212 - 23704406
Alignment:
Q  6 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23704212 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 23704311  T
Q  106 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23704312 actatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 23704406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40428718 - 40428915
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  40428718 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactat 40428817  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40428818 gataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48910041 - 48909840
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48910041 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 48909942  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48909941 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 48909842  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  48909841 aa 48909840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 11639581 - 11639773
Alignment:
Q  6 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11639581 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 11639680  T
Q  106 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11639681 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16700976 - 16700782
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16700976 cgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 16700877  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700876 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53875852 - 53875658
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  53875852 cgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactat 53875753  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53875752 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 27536102 - 27536299
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27536102 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 27536201  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27536202 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 43289958 - 43290158
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43289958 cgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 43290057  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43290058 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43290157  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  43290158 a 43290158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44379185 - 44379385
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  44379185 cgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactat 44379284  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44379285 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcct 44379384  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  44379385 a 44379385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1617279 - 1617084
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  1617279 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactat 1617180  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1617179 gataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47632229 - 47632032
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47632229 gaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 47632130  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47632129 agaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15669377 - 15669177
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15669377 gaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatg 15669278  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15669277 ataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 15669178  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  15669177 a 15669177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 8591090 - 8591285
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8591090 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactat 8591189  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  8591190 gataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 8932176 - 8932375
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8932176 cgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactac 8932275  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8932276 gttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 8932375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52139398 - 52139203
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52139398 cgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 52139299  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52139298 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 27583631 - 27583821
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27583631 gaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatg 27583730  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583731 ataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30171775 - 30171581
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  30171775 cgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactat 30171676  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30171675 gataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  25 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaata-tggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttattta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  124 cccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33704036 - 33703850
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33704036 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 33703937  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 187  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33703936 gataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 53353258 - 53353051
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat----tgaaatatggcataagcagcttatgaaa 96  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53353258 cgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaa 53353159  T
Q  97 ccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccaca----taagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||| |||||||||    
T  53353158 ctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaa 53353059  T
Q  193 cggggcct 200  Q
    ||||||||    
T  53353058 cggggcct 53353051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44376040 - 44375844
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  44376040 cgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactat 44375941  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44375940 gataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  7 aggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  107 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 55344825 - 55345023
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || || ||| ||  ||||    
T  55344825 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatga 55344924  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55344925 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggccta 55345023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16704016 - 16703818
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16704016 cgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16703917  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  16703916 gataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcct 16703821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40680036 - 40680236
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40680036 cgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 40680135  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40680136 gataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaagcgggcct 40680235  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  40680236 a 40680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053437
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 50053437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 23269044 - 23269162
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23269044 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactat 23269143  T
Q  101 gataaactatttttattta 119  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  23269144 gataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  111 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548339
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||| || ||||| |||   ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcct 44548339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53408215 - 53408137
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccgg-agggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgg 78  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53408215 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 130
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  48 aagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaac 130  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 23261884 - 23261937
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 54  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261884 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |  ||||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 189  Q
    || |||||||||| |  || ||||  |||||||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9595900 - 9595982
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatga 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9595900 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagt-----------ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 201
Target Start/End: Original strand, 9595974 - 9596032
Alignment:
Q  142 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9595974 agcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggccta 9596032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48748252 - 48748197
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaa 57  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748252 gaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 50055340 - 50055301
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagcc 40  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055340 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25897569 - 25897368
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25897569 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 25897470  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897469 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 25897370  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  25897369 aa 25897368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29288342 - 29288143
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29288342 cgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 29288245  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288244 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 39260356 - 39260557
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39260356 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 39260455  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39260456 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 39260555  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39260556 aa 39260557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16052291 - 16052092
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16052291 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16052192  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16052191 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 16052092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33510679 - 33510476
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33510679 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 33510580  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33510579 gataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33510480  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  33510479 aaat 33510476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 52753157 - 52753359
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  52753157 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactat 52753256  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753257 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52753356  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  52753357 aaa 52753359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20089666 - 20089461
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20089666 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 20089567  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20089566 gataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20089467  T
Q  201 aaatct 206  Q
     |||||    
T  20089466 taatct 20089461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1168696 - 1168497
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1168696 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1168597  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1168596 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 1168497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26580280 - 26580481
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26580280 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 26580379  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26580380 gataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 26580479  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26580480 aa 26580481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26663453 - 26663257
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26663453 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactat 26663354  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26663353 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29078711 - 29078519
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29078711 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 29078612  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29078611 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 42370805 - 42371008
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  42370805 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactat 42370904  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42370905 gataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 42371004  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  42371005 aaat 42371008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 970534 - 970734
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  970534 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 970633  T
Q  101 --gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970634 atgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 970733  T
Q  199 c 199  Q
    |    
T  970734 c 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 41928505 - 41928706
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41928505 cgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 41928604  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41928605 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcct 41928704  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  41928705 aa 41928706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 1940758 - 1940957
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  1940758 gaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatg 1940857  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1940858 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1940957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46409632 - 46409431
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaa--gccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46409632 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaact 46409533  T
Q  99 atgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46409532 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagc 46409433  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  46409432 ct 46409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52696986 - 52696788
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52696986 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 52696887  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52696886 gataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2473917 - 2473716
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2473917 cgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 2473818  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||    
T  2473817 aataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacgggacct 2473718  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  2473717 aa 2473716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1170454 - 1170658
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1170454 cgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 1170553  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1170554 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T
Q  201 aaatc 205  Q
     ||||    
T  1170654 gaatc 1170658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  5 ggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgata 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  105 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46761161 - 46760958
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  46761161 cgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 46761062  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  46761061 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacgggacct 46760962  T
Q  201 aaat 204  Q
    ||||    
T  46760961 aaat 46760958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2347852 - 2347650
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-tatggcataagcagcttatgaaacca 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  2347852 cgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 2347753  T
Q  100 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  2347752 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcc 2347653  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  2347652 taa 2347650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12683015 - 12682817
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12683015 cgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 12682916  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12682915 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19715171 - 19715366
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19715171 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaat 19715270  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19715271 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32671774 - 32671575
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32671774 cgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactat 32671675  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32671674 gataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 32671575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43905849 - 43905650
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43905849 cgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 43905750  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43905749 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43905650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 8079721 - 8079919
Alignment:
Q  3 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 102  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8079721 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 8079820  T
Q  103 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8079821 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccta 8079919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8121064 - 8120870
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8121064 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 8120965  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8120964 gataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15203307 - 15203109
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15203307 cgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactat 15203208  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15203207 gataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17591883 - 17591682
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17591883 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 17591784  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17591783 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcct 17591687  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  17591686 aaatc 17591682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5215580 - 5215384
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5215580 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactat 5215481  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215480 gataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  7 aggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  107 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7145402 - 7145207
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7145402 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 7145303  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctc-aaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7145302 gataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49146356 - 49146168
Alignment:
Q  12 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49146356 acataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 49146257  T
Q  112 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  49146256 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcct 49146168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 13996733 - 13996932
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996733 cgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 13996832  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13996833 tataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcct 13996932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 51359227 - 51359424
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51359227 cgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactat 51359326  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359327 gataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23498655 - 23498457
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  23498655 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactat 23498556  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  23498555 gatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40149658 - 40149497
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  40149658 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactat 40149559  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149558 gataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15717978 - 15717787
Alignment:
Q  2 gaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatg 101  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15717978 gaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatg 15717879  T
Q  102 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15717878 a-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 17587515 - 17587694
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17587515 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatat 17587614  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 180  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587615 gataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15554162 - 15554354
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||    
T  15554162 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa---at 15554258  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15554259 g-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6765654 - 6765458
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  6765654 cgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatat 6765555  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765554 gataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  30 cttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaa 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  130 cacctttaa-aaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38172014 - 38171828
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||| ||    
T  38172014 cgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactat 38171928  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38171927 gataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagcct 38171828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52086389 - 52086261
Alignment:
Q  74 tatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52086389 tatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccacataagct 52086290  T
Q  174 caaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52086289 taaaataagtcaatccaaacagggcctaa 52086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323031
Alignment:
Q  48 aagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctta 147  Q
    ||||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  148 tgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataag 23323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 307
Target Start/End: Original strand, 12489653 - 12489709
Alignment:
Q  251 aattatacaaattaacaaattttccccaccttgcaaattgcaatgaatacacacaac 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489653 aattatacaaattaacaaattttccacaccttgcaaattgcaatgaatacacacaac 12489709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675096
Alignment:
Q  125 ccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaaatc 205  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggccttaatc 5675096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217994
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| ||||||  |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||     |||| ||||||||||| |||||||||||    ||| ||| |||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcctaa 5217994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Original strand, 12489420 - 12489469
Alignment:
Q  203 atcttgtaccccacatcatgacacaacacatgcgatatcattttccacaa 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12489420 atcttctaccccacatcatgacacaacacatgcgatatcattttcgacaa 12489469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 12487770 - 12487830
Alignment:
Q  245 ttccacaattatacaaattaacaaattttccccaccttgcaaattgcaatgaatacacaca 305  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||    
T  12487770 ttccacaattatagtaagtaacaaattttccccaccttgcaaactgtactgaattcacaca 12487830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36900 - 36699
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36900 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 36801  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36800 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 36701  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  36700 aa 36699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 22961 - 23165
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22961 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 23060  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23061 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccc 23160  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  23161 aaatc 23165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6086609 - 6086809
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6086609 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 6086708  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6086709 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6086808  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  6086809 a 6086809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2837742 - 2837540
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  2837742 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactat 2837643  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2837642 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 2837543  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  2837542 aaa 2837540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 26946886 - 26947084
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26946886 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 26946985  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26946986 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34887302 - 34887496
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34887302 cgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactat 34887401  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887402 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21893652 - 21893452
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21893652 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 21893553  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21893552 gataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcct 21893453  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  21893452 a 21893452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 3347533 - 3347732
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3347533 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 3347632  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3347633 gataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 3347732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 26704349 - 26704547
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26704349 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 26704448  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26704449 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30692048 - 30691850
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30692048 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 30691949  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30691948 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18613735 - 18613536
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  18613735 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactat 18613636  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613635 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 18613536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16307018 - 16307220
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16307018 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16307117  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307118 gataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 16307217  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  16307218 aaa 16307220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17261083 - 17261284
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  17261083 cgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatat 17261182  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17261183 tataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacct 17261282  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  17261283 aa 17261284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  7 aggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  107 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9459760 - 9459562
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9459760 cgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 9459661  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459660 gataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11167437 - 11167235
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11167437 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 11167338  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11167337 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 11167238  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  11167237 aaa 11167235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35198480 - 35198280
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35198480 cgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 35198381  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35198380 gataagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaagcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcct 35198282  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35198281 aa 35198280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20726984 - 20726790
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20726984 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 20726885  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20726884 gataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 28199518 - 28199719
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28199518 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactat 28199616  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28199617 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggga 28199715  T
Q  198 ccta 201  Q
    ||||    
T  28199716 ccta 28199719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1153790 - 1153603
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1153790 cgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 1153691  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 188  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1153690 gataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52832
Alignment:
Q  35 taagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacct 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  135 ttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 52832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 30698939 - 30699132
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  30698939 cgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactat 30699038  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30699039 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33464526 - 33464399
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33464526 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 33464427  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464426 gataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 53105 - 53001
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  53105 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 53006  T
Q  101 gataa 105  Q
    |||||    
T  53005 gataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463703
Alignment:
Q  120 tttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 33463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34800956 - 34800920
Alignment:
Q  167 ataagctcaaaataag-tcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34800956 ataagctcaaaataagctcaatccaaacggggcctaa 34800920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 33906057 - 33906256
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33906057 cgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 33906156  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33906157 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcct 33906256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6174838 - 6175040
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6174838 cgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 6174937  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6174938 gataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 6175037  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  6175038 aaa 6175040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 31517225 - 31517423
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31517225 cgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 31517324  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31517325 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1108463 - 1108276
Alignment:
Q  12 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1108463 acataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatt 1108364  T
Q  112 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1108363 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 1108276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18806894 - 18807094
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18806894 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactat 18806993  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18806994 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18807093  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  18807094 a 18807094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 3873254 - 3873452
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3873254 cgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 3873353  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3873354 gataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 26323196 - 26323395
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26323196 cgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 26323295  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26323296 gataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 26323395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39635647 - 39635446
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39635647 cgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactat 39635548  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39635547 gataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcct 39635448  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39635447 aa 39635446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42937915 - 42937714
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctt-attgaaatatggcataagcagcttatgaaacca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42937915 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 42937816  T
Q  100 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42937815 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcc 42937716  T
Q  200 ta 201  Q
    ||    
T  42937715 ta 42937714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 28329849 - 28330042
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28329849 cgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactat 28329946  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329947 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2178779 - 2178983
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2178779 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 2178878  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2178879 gataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcct 2178978  T
Q  201 aaatc 205  Q
    |||||    
T  2178979 aaatc 2178983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4016234 - 4016039
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4016234 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 4016135  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4016134 gatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 4232152 - 4232351
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4232152 cgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 4232251  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4232252 gataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5733594 - 5733395
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5733594 cgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 5733495  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  5733494 gataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 19901148 - 19901346
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19901148 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactat 19901247  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901248 gataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 19901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1482913 - 1483106
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1482913 cgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaat 1483012  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1483013 aataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 30270689 - 30270888
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30270689 cgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 30270788  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30270789 gataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcct 30270888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 19383945 - 19384127
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  19383945 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactat 19384044  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19384045 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataagt 19384127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 851192 - 850997
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  851192 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattat 851093  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  851092 gataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420378
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggactaa 30420378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16066304 - 16066495
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16066304 cgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 16066403  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16066404 gataagctatttttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588986
Alignment:
Q  5 ggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgata 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  105 aactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagccta 16588986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44947559 - 44947755
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44947559 cgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactat 44947651  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |    
T  44947652 gataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggctt 44947751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 430011 - 429817
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  430011 cgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattat 429912  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429911 gataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446779
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 201  Q
    |||  ||||||||||  | ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggccta 42446779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  47 taagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagctt 146  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| || | ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  147 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 195  Q
    |||  ||| |||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  54 aaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 153  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  154 tagataa 160  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10433 - 10234
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  10433 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactat 10334  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10333 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 145255 - 145450
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  145255 cgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 145354  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145355 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 305 - 507
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  305 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactat 404  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  405 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtct 504  T
Q  201 aaa 203  Q
    |||    
T  505 aaa 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16 - 217
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 115  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  116 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcct 215  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  216 aa 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3708
Alignment:
Q  6 gaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgataa 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3900 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3801  T
Q  106 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  3800 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16 - 217
Alignment:
Q  1 cgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16 cgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactat 114  T
Q  101 gataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  115 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggga 213  T
Q  198 ccta 201  Q
    ||||    
T  214 ccta 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University