View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8561_low_10 (Length: 274)

Name: NF8561_low_10
Description: NF8561
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8561_low_10
NF8561_low_10
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (14-258)||(10254419-10254648)
chr4 (21-241)||(10217265-10217485)
chr4 (36-256)||(10217190-10217410)
chr4 (18-229)||(10264686-10264897)
chr4 (14-256)||(10217078-10217320)
chr4 (14-258)||(10264922-10265166)
chr4 (18-244)||(10217502-10217728)
chr4 (112-258)||(10264630-10264776)
chr4 (21-256)||(10217355-10217590)
chr4 (18-249)||(10254273-10254504)
chr4 (33-258)||(10217547-10217772)
chr4 (18-214)||(10254363-10254559)
chr4 (22-249)||(10264630-10264857)
chr4 (15-249)||(10254210-10254444)
chr4 (18-258)||(10217142-10217382)
chr4 (22-258)||(10264780-10265016)
chr4 (36-238)||(10217460-10217662)
chr4 (18-258)||(10217412-10217652)
chr4 (14-249)||(10217288-10217523)
chr4 (14-249)||(10217378-10217613)
chr4 (21-223)||(10254336-10254538)
chr4 (18-223)||(10217232-10217437)
chr4 (18-258)||(10254303-10254543)
chr4 (18-249)||(10217322-10217553)
chr4 (15-249)||(10217199-10217433)
chr4 (21-249)||(10217115-10217343)
chr4 (70-249)||(10254205-10254384)
chr4 (70-256)||(10217044-10217230)
chr4 (24-238)||(10254534-10254748)
chr4 (39-227)||(10254519-10254707)
chr4 (21-249)||(10254591-10254819)
chr4 (21-249)||(10264719-10264947)
chr4 (21-244)||(10217565-10217788)
chr4 (30-249)||(10264878-10265097)
chr4 (21-258)||(10217055-10217292)
chr4 (22-223)||(10265020-10265221)
chr4 (18-193)||(10217592-10217767)
chr4 (24-154)||(10243713-10243843)
chr4 (18-151)||(10254558-10254691)
chr4 (18-214)||(10243377-10243573)
chr4 (14-229)||(10217648-10217863)
chr4 (69-148)||(10243653-10243732)
chr4 (14-229)||(10264652-10264867)
chr4 (15-211)||(10243659-10243840)
chr4 (22-221)||(10264750-10264949)
chr4 (48-258)||(10254213-10254423)
chr4 (27-241)||(10264605-10264819)
chr4 (69-241)||(10243533-10243705)
chr4 (36-136)||(10265124-10265224)
chr4 (147-249)||(10264605-10264707)
chr4 (18-148)||(10265076-10265206)
chr4 (14-241)||(10254479-10254691)
chr4 (22-238)||(10264990-10265206)
chr4 (14-160)||(10264802-10264948)
chr4 (18-107)||(10254618-10254707)
chr4 (27-247)||(10253862-10254082)
chr4 (51-143)||(10254111-10254203)
chr4 (54-241)||(10243383-10243570)
chr4 (24-235)||(10243443-10243654)
chr4 (160-241)||(10243369-10243450)
chr4 (144-244)||(10243383-10243483)
chr4 (24-73)||(10254144-10254193)
chr4 (141-241)||(10243740-10243840)
chr4 (75-163)||(10254105-10254193)
chr4 (171-238)||(10243665-10243732)
chr4 (18-148)||(10254738-10254868)
chr4 (14-76)||(10265162-10265224)
chr4 (129-226)||(10254099-10254196)
chr4 (15-91)||(10243539-10243615)
chr4 (14-166)||(10243763-10243915)
chr4 (195-245)||(10217784-10217834)
chr4 (39-125)||(10243833-10243919)
chr4 (164-220)||(10360818-10360874)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 10254419 - 10254648
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10254419 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccaatttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 10254518  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    |||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10254519 aagccaccagttgag---------------aagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccggttgagaagcccccaatttacaaaccaccag 10254603  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10254604 ttgagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagaaaccacctg 10254648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 10217265 - 10217485
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  10217265 tacaaaccacctgtagagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcctccggtctacaaaccac 10217364  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  10217365 ctgtagagaagccacctgtttataagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcccccggtctacaaaccccctgtagagaa 10217464  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccacc 241  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  10217465 gcctcctgtctacaagccacc 10217485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 256
Target Start/End: Original strand, 10217190 - 10217410
Alignment:
Q  36 gagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccac 135  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  10217190 gagaagcctcctgtttacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccac 10217289  T
Q  136 ctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  10217290 ctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttataa 10217389  T
Q  236 gccaccggttgagagaccacc 256  Q
    |||||| || |||| ||||||    
T  10217390 gccacctgtagagaaaccacc 10217410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 10264686 - 10264897
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||| || || || |   ||||||    
T  10264686 gtgtacaagccacctgttgagaagcccccagtttacaaacctccagtagagaagcctctagtgcacaagccaccagttgataaaccacctgtacacaagc 10264785  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10264786 caccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagcccccagttcacaaacctccagtaga 10264885  T
Q  218 gaagcctccagt 229  Q
    ||||||||||||    
T  10264886 gaagcctccagt 10264897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 10217078 - 10217320
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    ||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  |||    
T  10217078 acctgtgtataagccaccggtagaaaaacctccagtttacaaaccaccggtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagccccccgtctac 10217177  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  10217178 aaacctcctgtagagaagcctcctgtttacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctg 10217277  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacc 256  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||||    
T  10217278 tagagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccacc 10217320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 10264922 - 10265166
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| || | ||||||||| || || ||  ||||||||| ||||||||| || || |   ||    
T  10264922 acctgtatacaagccaccagttgagaagtttccaatttacaaacctctagtagagaagcctccagtgcacaagccacgagttgagaaaccacctgtacac 10265021  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||      
T  10265022 aagccaccagttgagaagctacctttttacaagccacctgcaaagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagtccccagtttacaaacctccgt 10265121  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10265122 tagagaagcctccagtgcacaagccaccggttgagaaaccacctg 10265166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 10217502 - 10217728
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  10217502 gtgtacaagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgttgagaagcctcctatctacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagc 10217601  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  10217602 cacctgttgagaagcctccagtttataagccaccagttgagaagccacctgtgtacaagcccccagtcgagaaacccccggtctacaaacctcctgtaga 10217701  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggt 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10217702 gaagcctccagtttacaagccaccggt 10217728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Original strand, 10264630 - 10264776
Alignment:
Q  112 acaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10264630 acaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacctgttgagaagcccccagtttacaaacctcc 10264729  T
Q  212 agtagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  10264730 agtagagaagcctctagtgcacaagccaccagttgataaaccacctg 10264776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 10217355 - 10217590
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || |    
T  10217355 tacaaaccacctgtagagaagccacctgtttataagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcccccggtctacaaacccc 10217454  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  10217455 ctgtagagaagcctcctgtctacaagccaccagtagagaaaccgccagtgtacaagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgttgagaa 10217554  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacc 256  Q
    ||||||  | ||||||||||| || |||| ||||||    
T  10217555 gcctcctatctacaagccaccagtagagaaaccacc 10217590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 10254273 - 10254504
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |    
T  10254273 gtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtacaagccacctgtagaaaagcctcctatatacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaac 10254372  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  10254373 cacccgttgagaaacccccggtttataagccaccagtagagaaaccacctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccaatttacaagccaccagtaga 10254472  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  10254473 gaaaccacctgtatacaagccaccagttgaga 10254504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 258
Target Start/End: Original strand, 10217547 - 10217772
Alignment:
Q  33 gttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagc 132  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10217547 gttgagaagcctcctatctacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccacctgttgagaagcctccagtttataagccaccagttgagaagc 10217646  T
Q  133 cacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgta 232  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||    
T  10217647 cacctgtgtacaagcccccagtcgagaaacccccggtctacaaacctcctgtagagaagcctccagtttacaagccaccggtgtacaaacctccagttta 10217746  T
Q  233 caagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||    
T  10217747 caagccaccagtagagaagccacctg 10217772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 10254363 - 10254559
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10254363 gtgtacaaaccacccgttgagaaacccccggtttataagccaccagtagagaaaccacctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccaatttacaagc 10254462  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagt 214  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  10254463 caccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtagagaaaccaccagt 10254559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 10264630 - 10264857
Alignment:
Q  22 acaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccacc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||    
T  10264630 acaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacctgttgagaagcccccagtttacaaacctcc 10264729  T
Q  122 agttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaag 221  Q
    ||| |||||||| |  ||  |||||||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||     
T  10264730 agtagagaagcctctagtgcacaagccaccagttgataaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaa 10264829  T
Q  222 cctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10264830 cctccggtgtacaagccaccagttgaga 10264857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 10254210 - 10254444
Alignment:
Q  15 cctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||    
T  10254210 cctgtttacaagcccccagttgagaaacctccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtaca 10254309  T
Q  115 agccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagt 214  Q
    ||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  10254310 agccacctgtagaaaagcctcctatatacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaaccacccgttgagaaacccccggtttataagccaccagt 10254409  T
Q  215 agagaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  10254410 agagaaaccacctgtgtacaagccaccagttgaga 10254444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Original strand, 10217142 - 10217382
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  10217142 gtgtacaagccaccagttgagaagccccccgtctacaaacctcctgtagagaagcctcctgtttacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagc 10217241  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  10217242 caccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttga 10217341  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  10217342 gaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctg 10217382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Original strand, 10264780 - 10265016
Alignment:
Q  22 acaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccacc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||    
T  10264780 acaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagcccccagttcacaaacctcc 10264879  T
Q  122 agttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaag 221  Q
    ||| |||||||| || ||| |||| || |  || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||   ||  |||||||||| | ||||||||||    
T  10264880 agtagagaagcctccagttcacaaacctcaagtggagaagccacctgtatacaagccaccagttgagaagtttccaatttacaaacctctagtagagaag 10264979  T
Q  222 cctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10264980 cctccagtgcacaagccacgagttgagaaaccacctg 10265016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 10217460 - 10217662
Alignment:
Q  36 gagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccac 135  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || |  ||||| || || ||||||||||| |    
T  10217460 gagaagcctcctgtctacaagccaccagtagagaaaccgccagtgtacaagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgttgagaagcctc 10217559  T
Q  136 ctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaa 235  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  10217560 ctatctacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccacctgttgagaagcctccagtttataagccaccagttgagaagccacctgtgtacaa 10217659  T
Q  236 gcc 238  Q
    |||    
T  10217660 gcc 10217662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Original strand, 10217412 - 10217652
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  10217412 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccggtctacaaaccccctgtagagaagcctcctgtctacaagccaccagtagagaaaccgccagtgtacaagc 10217511  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||    
T  10217512 caccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgttgagaagcctcctatctacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccacctgttga 10217611  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||    
T  10217612 gaagcctccagtttataagccaccagttgagaagccacctg 10217652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 10217288 - 10217523
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || | |||     
T  10217288 acctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttat 10217387  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||    
T  10217388 aagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcccccggtctacaaaccccctgtagagaagcctcctgtctacaagccaccag 10217487  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10217488 tagagaaaccgccagtgtacaagccaccagttgaga 10217523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 10217378 - 10217613
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| |  |||    
T  10217378 acctgtttataagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcccccggtctacaaaccccctgtagagaagcctcctgtctac 10217477  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  10217478 aagccaccagtagagaaaccgccagtgtacaagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgttgagaagcctcctatctacaagccaccag 10217577  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10217578 tagagaaaccaccagtgtacaagccacctgttgaga 10217613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 10254336 - 10254538
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||    
T  10254336 tacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaaccacccgttgagaaacccccggtttataagccaccagtagagaaaccacctgtgtacaagccac 10254435  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||    
T  10254436 cagttgagaagcccccaatttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaa 10254535  T
Q  221 gcc 223  Q
    |||    
T  10254536 gcc 10254538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 10217232 - 10217437
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||    
T  10217232 gtgtacaagccaccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagc 10217331  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  10217332 caccagttgagaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttataagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttga 10217431  T
Q  218 gaagcc 223  Q
    ||||||    
T  10217432 gaagcc 10217437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Original strand, 10254303 - 10254543
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || | ||| ||||    
T  10254303 gtgtacaagccacctgtagaaaagcctcctatatacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaaccacccgttgagaaacccccggtttataagc 10254402  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||  | |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  10254403 caccagtagagaaaccacctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccaatttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttga 10254502  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  10254503 gaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctg 10254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 10217322 - 10217553
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||  |||||||    
T  10217322 gtgtacaagccaccagttgagaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttataagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagc 10217421  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtaga 217  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  10217422 caccagttgagaagcccccggtctacaaaccccctgtagagaagcctcctgtctacaagccaccagtagagaaaccgccagtgtacaagccaccagttga 10217521  T
Q  218 gaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||| || || || ||||| || || |||||||    
T  10217522 gaaacccccggtctacaaaccccctgttgaga 10217553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 10217199 - 10217433
Alignment:
Q  15 cctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||||| || | |||||    
T  10217199 cctgtttacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttaca 10217298  T
Q  115 agccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagt 214  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  10217299 agccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttataagccacctgt 10217398  T
Q  215 agagaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10217399 agagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaga 10217433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 10217115 - 10217343
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||    
T  10217115 tacaaaccaccggtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgagaagccccccgtctacaaacctcctgtagagaagcctcctgtttacaagccac 10217214  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  10217215 cagtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaaaagcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaa 10217314  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10217315 accaccagtgtacaagccaccagttgaga 10217343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Original strand, 10254205 - 10254384
Alignment:
Q  70 aaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggt 169  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  10254205 aacctcctgtttacaagcccccagttgagaaacctccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagt 10254304  T
Q  170 gtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10254305 gtacaagccacctgtagaaaagcctcctatatacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaaccacccgttgaga 10254384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 256
Target Start/End: Original strand, 10217044 - 10217230
Alignment:
Q  70 aaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggt 169  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |  || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10217044 aaccaccggtctacaagccccctgttgagaagccacctgtgtataagccaccggtagaaaaacctccagtttacaaaccaccggtagagaaaccaccagt 10217143  T
Q  170 gtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacc 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||    
T  10217144 gtacaagccaccagttgagaagccccccgtctacaaacctcctgtagagaagcctcctgtttacaagccaccagtagagaaaccacc 10217230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 10254534 - 10254748
Alignment:
Q  24 aagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccag 123  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  10254534 aagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccggttgagaagcccccaatttacaaaccaccagttgagaagcctccagtgtacaagccaccgg 10254633  T
Q  124 ttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcc 223  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||| | ||    
T  10254634 ttgagaaaccacctgtctacaagccacctgtagaaaatccacctgtttacaagccaccatttgagaaacctccaatttataaaccgccaatagagtatcc 10254733  T
Q  224 tccagtgtacaagcc 238  Q
     || |||||||||||    
T  10254734 acccgtgtacaagcc 10254748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Original strand, 10254519 - 10254707
Alignment:
Q  39 aagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctg 138  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10254519 aagccaccagttgagaagccacctgtagagaaaccaccagtgtacaagccaccggttgagaagcccccaatttacaaaccaccagttgagaagcctccag 10254618  T
Q  139 tttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctcca 227  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || || || || || |||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  10254619 tgtacaagccaccggttgagaaaccacctgtctacaagccacctgtagaaaatccacctgtttacaagccaccatttgagaaacctcca 10254707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 10254591 - 10254819
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || | |||||||||||    
T  10254591 tacaaaccaccagttgagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagaaaccacctgtctacaagccacctgtagaaaatccacctgtttacaagccac 10254690  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    || ||||||| || ||  |||| || || ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  10254691 catttgagaaacctccaatttataaaccgccaatagagtatccacccgtgtacaagcccccttttgagaaaccccccatctacaagccacctgtagagaa 10254790  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
     |||||  | |||||||| ||| ||||||    
T  10254791 acctcctttttacaagcctccgtttgaga 10254819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 10264719 - 10264947
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  10264719 tacaaacctccagtagagaagcctctagtgcacaagccaccagttgataaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccac 10264818  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    | || ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || ||  |||| || ||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||| |||||    
T  10264819 ctgtagagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagcccccagttcacaaacctccagtagagaagcctccagttcacaaacctcaagtggagaa 10264918  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggttgaga 249  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  10264919 gccacctgtatacaagccaccagttgaga 10264947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 10217565 - 10217788
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |    
T  10217565 tacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccacctgttgagaagcctccagtttataagccaccagttgagaagccacctgtgtacaagcccc 10217664  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||  | || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  10217665 cagtcgagaaacccccggtctacaaacctcctgtagagaagcctccagtttacaagccaccggtgtacaaacctccagtttacaagccaccagtagagaa 10217764  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggt 244  Q
    ||| || ||||||||||| |||||    
T  10217765 gccacctgtgtacaagcctccggt 10217788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Original strand, 10264878 - 10265097
Alignment:
Q  30 ccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgaga 129  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| || | ||| ||||    
T  10264878 ccagtagagaagcctccagttcacaaacctcaagtggagaagccacctgtatacaagccaccagttgagaagtttccaatttacaaacctctagtagaga 10264977  T
Q  130 agccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagt 229  Q
    |||| || ||  |||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  ||  ||||||| ||||| | | |||| ||||| ||    
T  10264978 agcctccagtgcacaagccacgagttgagaaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctttttacaagccacctgcaaagaaacctccggt 10265077  T
Q  230 gtacaagccaccggttgaga 249  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  10265078 gtacaagccaccagttgaga 10265097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 10217055 - 10217292
Alignment:
Q  21 tacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccac 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||    
T  10217055 tacaagccccctgttgagaagccacctgtgtataagccaccggtagaaaaacctccagtttacaaaccaccggtagagaaaccaccagtgtacaagccac 10217154  T
Q  121 cagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||    
T  10217155 cagttgagaagccccccgtctacaaacctcctgtagagaagcctcctgtttacaagccaccagtagagaaaccaccagtgtacaagccaccagttgaaaa 10217254  T
Q  221 gcctccagtgtacaagccaccggttgagagaccacctg 258  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  10217255 gcctccggtctacaaaccacctgtagagaagccacctg 10217292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 10265020 - 10265221
Alignment:
Q  22 acaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccacc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | | ||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||    
T  10265020 acaagccaccagttgagaagctacctttttacaagccacctgcaaagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagtccccagtttacaaacctcc 10265119  T
Q  122 agttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaag 221  Q
      | |||||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| | ||||||    
T  10265120 gttagagaagcctccagtgcacaagccaccggttgagaaaccacctgtatacaagccaccaattgagaagcccccagttcacaagcctccattcgagaag 10265219  T
Q  222 cc 223  Q
    ||    
T  10265220 cc 10265221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 10217592 - 10217767
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||| |    
T  10217592 gtgtacaagccacctgttgagaagcctccagtttataagccaccagttgagaagccacctgtgtacaagcccccagtcgagaaacccccggtctacaaac 10217691  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcc 193  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  10217692 ctcctgtagagaagcctccagtttacaagccaccggtgtacaaacctccagtttacaagccaccagtagagaagcc 10217767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 10243713 - 10243843
Alignment:
Q  24 aagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccag 123  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | ||||||||| ||||    
T  10243713 aagccacctgtttacaagcccccagtctacaagccaccagtagtgaagccacctgtatacaagcctccagtctacaagccacccgtttacaagcctccag 10243812  T
Q  124 ttgagaagccacctgtttacaagccacctgt 154  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  10243813 ttgagaagcctccggtctacaagccacctgt 10243843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 10254558 - 10254691
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || || |  |||||||    
T  10254558 gtgtacaagccaccggttgagaagcccccaatttacaaaccaccagttgagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagaaaccacctgtctacaagc 10254657  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacc 151  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  10254658 cacctgtagaaaatccacctgtttacaagccacc 10254691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 10243377 - 10243573
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  10243377 gtgtataagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgtagaaaagccaccagtatataagccaccagtagagaagcctccagtttacaaac 10243476  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagt 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||| || || |||| |||||| || || ||||| || || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10243477 caccggtgtacaagccacctgtgtacaaacccccagtagtgaaacccccagtctacaaacctcctgtttacaagccaccggtgtacaagccaccagt 10243573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10217648 - 10217863
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||    
T  10217648 acctgtgtacaagcccccagtcgagaaacccccggtctacaaacctcctgtagagaagcctccagtttacaagccaccggtgtacaaacctccagtttac 10217747  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| || ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||    
T  10217748 aagccaccagtagagaagccacctgtgtacaagcctccggtctacaaacccccagttgagaaacctccagtttacaagccaccggtttacaagcctccag 10217847  T
Q  214 tagagaagcctccagt 229  Q
    | |||||||| |||||    
T  10217848 tcgagaagccaccagt 10217863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 148
Target Start/End: Original strand, 10243653 - 10243732
Alignment:
Q  69 aaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagcc 148  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10243653 aaacctcctgtttacaagccaccagttgagaagcctccagtttacaagccaccagtagtgaagccacctgtttacaagcc 10243732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10264652 - 10264867
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||| ||   ||    
T  10264652 acctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacctgttgagaagcccccagtttacaaacctccagtagagaagcctctagtgcac 10264751  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10264752 aagccaccagttgataaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccaccag 10264851  T
Q  214 tagagaagcctccagt 229  Q
    | |||||||| |||||    
T  10264852 ttgagaagcccccagt 10264867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Original strand, 10243659 - 10243840
Alignment:
Q  15 cctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttaca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||                ||||    
T  10243659 cctgtttacaagccaccagttgagaagcctccagtttacaagccaccagtagtgaagccacctgtttacaagcccccagt---------------ctaca 10243743  T
Q  115 agccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccacc 211  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||  | || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10243744 agccaccagtagtgaagccacctgtatacaagcctccagtctacaagccacccgtttacaagcctccagttgagaagcctccggtctacaagccacc 10243840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 10264750 - 10264949
Alignment:
Q  22 acaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccacc 121  Q
    |||||||||||||||| || || || ||  ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  10264750 acaagccaccagttgataaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacc 10264849  T
Q  122 agttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaag 221  Q
    |||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| || || ||  |||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||    
T  10264850 agttgagaagcccccagttcacaaacctccagtagagaagcctccagttcacaaacctcaagtggagaagccacctgtatacaagccaccagttgagaag 10264949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 258
Target Start/End: Original strand, 10254213 - 10254423
Alignment:
Q  48 gtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagc 147  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||| || |||||||    
T  10254213 gtttacaagcccccagttgagaaacctccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtacaagccacctgtagaaaagccaccagtgtacaagc 10254312  T
Q  148 cacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccggttga 247  Q
    |||||||||| || || ||  | ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || ||    
T  10254313 cacctgtagaaaagcctcctatatacaaaccaccagtagagaaaccaccagtgtacaaaccacccgttgagaaacccccggtttataagccaccagtaga 10254412  T
Q  248 gagaccacctg 258  Q
    || ||||||||    
T  10254413 gaaaccacctg 10254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Original strand, 10264605 - 10264819
Alignment:
Q  27 ccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttg 126  Q
    ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  10264605 ccacctgttgagaaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacctgttg 10264704  T
Q  127 agaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctcc 226  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||||| || |  ||| ||||||| |||||||| || || || ||  |||| |||||||| |||||||  ||    
T  10264705 agaagcccccagtttacaaacctccagtagagaagcctctagtgcacaagccaccagttgataaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacc 10264804  T
Q  227 agtgtacaagccacc 241  Q
     || |||||||||||    
T  10264805 tgtttacaagccacc 10264819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Original strand, 10243533 - 10243705
Alignment:
Q  69 aaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccgg 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  10243533 aaacctcctgtttacaagccaccggtgtacaagccaccagtttacaaaccaccagtagagaagcccccagtttacaagccacctgtatacaaacccccag 10243632  T
Q  169 tgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccacc 241  Q
    |    || ||||||||  | || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10243633 tagtgaaacccccagtctacaaacctcctgtttacaagccaccagttgagaagcctccagtttacaagccacc 10243705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Original strand, 10265124 - 10265224
Alignment:
Q  36 gagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccac 135  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  10265124 gagaagcctccagtgcacaagccaccggttgagaaaccacctgtatacaagccaccaattgagaagcccccagttcacaagcctccattcgagaagccac 10265223  T
Q  136 c 136  Q
    |    
T  10265224 c 10265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 249
Target Start/End: Original strand, 10264605 - 10264707
Alignment:
Q  147 ccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccggttg 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10264605 ccacctgttgagaaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccacctgttg 10264704  T
Q  247 aga 249  Q
    |||    
T  10264705 aga 10264707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 10265076 - 10265206
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || || |  |||||||    
T  10265076 gtgtacaagccaccagttgagaagtccccagtttacaaacctccgttagagaagcctccagtgcacaagccaccggttgagaaaccacctgtatacaagc 10265175  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagcc 148  Q
    ||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  10265176 caccaattgagaagcccccagttcacaagcc 10265206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 10254479 - 10254691
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||                |||    
T  10254479 acctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtagagaaaccaccagtg---------------tac 10254563  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccag 213  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| |    
T  10254564 aagccaccggttgagaagcccccaatttacaaaccaccagttgagaagcctccagtgtacaagccaccggttgagaaaccacctgtctacaagccacctg 10254663  T
Q  214 tagagaagcctccagtgtacaagccacc 241  Q
    |||| || || || || |||||||||||    
T  10254664 tagaaaatccacctgtttacaagccacc 10254691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 10264990 - 10265206
Alignment:
Q  22 acaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccacc 121  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |   |||| ||||| |  |||||||||||    
T  10264990 acaagccacgagttgagaaaccacctgtacacaagccaccagttgagaagctacctttttacaagccacctgcaaagaaacctccggtgtacaagccacc 10265089  T
Q  122 agttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaag 221  Q
    |||||||||| | || |||||||| || ||  ||||||| || || ||| ||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||| | ||||||    
T  10265090 agttgagaagtccccagtttacaaacctccgttagagaagcctccagtgcacaagccaccggttgagaaaccacctgtatacaagccaccaattgagaag 10265189  T
Q  222 cctccagtgtacaagcc 238  Q
    || |||||  |||||||    
T  10265190 cccccagttcacaagcc 10265206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 10264802 - 10264948
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || ||||| ||||||||||||| | ||    
T  10264802 acctgtttacaagccacctgtagagaaacctccggtgtacaagccaccagttgagaagcccccagttcacaaacctccagtagagaagcctccagttcac 10264901  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaa 160  Q
    || || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10264902 aaacctcaagtggagaagccacctgtatacaagccaccagttgagaa 10264948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 10254618 - 10254707
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctcca 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10254618 gtgtacaagccaccggttgagaaaccacctgtctacaagccacctgtagaaaatccacctgtttacaagccaccatttgagaaacctcca 10254707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 247
Target Start/End: Original strand, 10253862 - 10254082
Alignment:
Q  27 ccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttg 126  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | ||| | ||||||  ||| |||||||| || |    
T  10253862 ccaccagttgaaaatcccccattttataaaccaccggtagagaaaccacctgtgtataaaccaccaatagagcaacctccaatttataagccacctgtag 10253961  T
Q  127 agaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctcc 226  Q
    | || || ||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||| || ||  | ||| | |||||||||||||  || ||    
T  10253962 aaaatcctccaatttataaaccaccagtagagaaaccacccgtgtataaaccaccgtttgagaaacctccaatctaccatccaccagtagagataccacc 10254061  T
Q  227 agtgtacaagccaccggttga 247  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  10254062 agtgtacaacccaccagttga 10254082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Original strand, 10254111 - 10254203
Alignment:
Q  51 tacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttac 143  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  10254111 tacaaaccaccagtagagcaacctcccgtctataagccaccagtagagaagcctccaatttacaagccaccagtagagaaacctcctgtttac 10254203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 241
Target Start/End: Original strand, 10243383 - 10243570
Alignment:
Q  54 aagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctg 153  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  10243383 aagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgtagaaaagccaccagtatataagccaccagtagagaagcctccagtttacaaaccaccgg 10243482  T
Q  154 tagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccacc 241  Q
    |  | || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| || ||  | ||||| || ||||||||||||||    
T  10243483 tgtacaagccacctgtgtacaaacccccagtagtgaaacccccagtctacaaacctcctgtttacaagccaccggtgtacaagccacc 10243570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 10243443 - 10243654
Alignment:
Q  24 aagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccag 123  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||  ||||| || || |    
T  10243443 aagccaccagtagagaagcctccagtttacaaaccaccggtgtacaagccacctgtgtacaaacccccagtagtgaaacccccagtctacaaacctcctg 10243542  T
Q  124 ttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcc 223  Q
    || | |||||||| || ||||||||||| ||  | |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||||| ||| ||    
T  10243543 tttacaagccaccggtgtacaagccaccagtttacaaaccaccagtagagaagcccccagtttacaagccacctgtatacaaacccccagtagtgaaacc 10243642  T
Q  224 tccagtgtacaa 235  Q
     ||||| |||||    
T  10243643 cccagtctacaa 10243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Original strand, 10243369 - 10243450
Alignment:
Q  160 aaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccacc 241  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  10243369 aaccaccggtgtataagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgtagaaaagccaccagtatataagccacc 10243450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 10243383 - 10243483
Alignment:
Q  144 aagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccgg 243  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10243383 aagccaccagttgagaaacccccggtctacaaaccccctgtagaaaagccaccagtatataagccaccagtagagaagcctccagtttacaaaccaccgg 10243482  T
Q  244 t 244  Q
    |    
T  10243483 t 10243483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 10254144 - 10254193
Alignment:
Q  24 aagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaacc 73  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10254144 aagccaccagtagagaagcctccaatttacaagccaccagtagagaaacc 10254193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 10243740 - 10243840
Alignment:
Q  141 tacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccac 240  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||  | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10243740 tacaagccaccagtagtgaagccacctgtatacaagcctccagtctacaagccacccgtttacaagcctccagttgagaagcctccggtctacaagccac 10243839  T
Q  241 c 241  Q
    |    
T  10243840 c 10243840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 10254105 - 10254193
Alignment:
Q  75 cctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaacc 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  10254105 cctgtatacaaaccaccagtagagcaacctcccgtctataagccaccagtagagaagcctccaatttacaagccaccagtagagaaacc 10254193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 238
Target Start/End: Original strand, 10243665 - 10243732
Alignment:
Q  171 tacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagcc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  10243665 tacaagccaccagttgagaagcctccagtttacaagccaccagtagtgaagccacctgtttacaagcc 10243732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 10254738 - 10254868
Alignment:
Q  18 gtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagc 117  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||| || |||  ||| |  |    
T  10254738 gtgtacaagcccccttttgagaaaccccccatctacaagccacctgtagagaaacctcctttttacaagcctccgtttgagaatccaccattttatatac 10254837  T
Q  118 caccagttgagaagccacctgtttacaagcc 148  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10254838 ctccagttgaggagcctcctgtttacaagcc 10254868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 10265162 - 10265224
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacc 76  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||    
T  10265162 acctgtatacaagccaccaattgagaagcccccagttcacaagcctccattcgagaagccacc 10265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 226
Target Start/End: Original strand, 10254099 - 10254196
Alignment:
Q  129 aagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccaccggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaagcctcc 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10254099 aagcctcctgtatacaaaccaccagtagagcaacctcccgtctataagccaccagtagagaagcctccaatttacaagccaccagtagagaaacctcc 10254196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 10243539 - 10243615
Alignment:
Q  15 cctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccacc 91  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  10243539 cctgtttacaagccaccggtgtacaagccaccagtttacaaaccaccagtagagaagcccccagtttacaagccacc 10243615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 10243763 - 10243915
Alignment:
Q  14 acctgtgtacaagccaccagttgagaagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttac 113  Q
    |||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||| | ||||| |||| | |     
T  10243763 acctgtatacaagcctccagtctacaagccacccgtttacaagcctccagttgagaagcctccggtctacaagccacctgtttacaagcccccagttgag 10243862  T
Q  114 aagccaccagttgagaagccacctgtttacaagccacctgtagagaaaccacc 166  Q
    || || |||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  10243863 aaacctccagtctacaagccaccggtttacaagcctccagtcgagaagccacc 10243915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Original strand, 10217784 - 10217834
Alignment:
Q  195 ccggtttacaaaccaccagtagagaagcctccagtgtacaagccaccggtt 245  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10217784 ccggtctacaaacccccagttgagaaacctccagtttacaagccaccggtt 10217834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Original strand, 10243833 - 10243919
Alignment:
Q  39 aagcccccagtttacaagccaccagtagagaaaccacctgtatacaagccaccagttgagaagcctccagcttacaagccaccagtt 125  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||||   | ||||||||||||    
T  10243833 aagccacctgtttacaagcccccagttgagaaacctccagtctacaagccaccggtttacaagcctccagtcgagaagccaccagtt 10243919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 10360818 - 10360874
Alignment:
Q  164 accggtgtacaagcccccagttgagaagcccccggtttacaaaccaccagtagagaa 220  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10360818 accggtgtacaaaccatcaattgagaagccaccggtttacaaaccatcagcagagaa 10360874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University