View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8563_low_8 (Length: 397)

Name: NF8563_low_8
Description: NF8563
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8563_low_8
NF8563_low_8
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-397)||(32706984-32707375)
chr7 (1-133)||(8769534-8769666)
chr7 (1-132)||(43140701-43140832)
chr7 (1-135)||(18731019-18731153)
chr7 (1-137)||(31715631-31715767)
chr7 (1-138)||(23437149-23437286)
chr7 (1-138)||(35085736-35085873)
chr7 (1-136)||(10625336-10625471)
chr7 (1-136)||(47250798-47250933)
chr7 (1-138)||(2357307-2357444)
chr7 (1-137)||(9034567-9034703)
chr7 (1-133)||(34568585-34568717)
chr7 (1-132)||(44448164-44448295)
chr7 (1-137)||(9230929-9231065)
chr7 (1-136)||(11678702-11678837)
chr7 (8-135)||(11678961-11679088)
chr7 (1-136)||(31715874-31716008)
chr7 (1-136)||(35085992-35086127)
chr7 (5-135)||(23472812-23472942)
chr7 (1-138)||(23472590-23472727)
chr7 (1-136)||(2357066-2357201)
chr7 (1-132)||(39118013-39118144)
chr7 (4-135)||(44486187-44486318)
chr7 (1-123)||(41758691-41758813)
chr7 (1-129)||(21522226-21522352)
chr7 (1-134)||(26920169-26920302)
chr7 (1-137)||(5238449-5238585)
chr7 (1-136)||(24119713-24119848)
chr7 (1-138)||(8769279-8769416)
chr7 (1-137)||(43726494-43726630)
chr7 (1-132)||(21522470-21522599)
chr7 (1-136)||(47251149-47251283)
chr7 (1-138)||(32706729-32706866)
chr7 (1-122)||(47250570-47250691)
chr7 (1-133)||(38842035-38842165)
chr7 (1-133)||(44447916-44448047)
chr7 (1-136)||(36507061-36507196)
chr7 (1-134)||(48704061-48704193)
chr7 (1-138)||(473432-473569)
chr7 (1-138)||(34568836-34568977)
chr7 (4-135)||(44485587-44485718)
chr7 (56-135)||(47305127-47305206)
chr7 (1-95)||(9230716-9230810)
chr7 (1-135)||(37143764-37143897)
chr7 (1-138)||(38842274-38842410)
chr7 (1-138)||(43726241-43726376)
chr7 (1-135)||(22338272-22338407)
chr7 (34-136)||(473191-473293)
chr7 (1-135)||(31623676-31623810)
chr7 (1-132)||(28349633-28349763)
chr7 (56-137)||(37144070-37144151)
chr7 (1-136)||(22338525-22338663)
chr7 (10-136)||(43050383-43050510)
chr7 (56-138)||(15326869-15326951)
chr7 (72-122)||(19543503-19543553)
chr7 (64-137)||(10625104-10625177)
chr7 (6-90)||(47250942-47251027)
chr7 (1-91)||(23437404-23437494)
chr7 (72-122)||(40740044-40740094)
chr7 (72-136)||(24446296-24446360)
chr7 (72-123)||(36720491-36720542)
chr7 (72-123)||(43704957-43705008)
chr7 (1-112)||(47305379-47305490)
chr7 (5-99)||(36506848-36506942)
chr7 (72-122)||(45457099-45457149)
chr7 (5-46)||(24119961-24120002)
chr7 (74-122)||(42287324-42287372)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (1-137)||(52914950-52915086)
chr4 (1-136)||(29864175-29864310)
chr4 (1-136)||(40067347-40067482)
chr4 (1-135)||(21218099-21218233)
chr4 (1-135)||(32384653-32384787)
chr4 (1-137)||(9010503-9010639)
chr4 (1-133)||(29864427-29864559)
chr4 (1-132)||(1157458-1157589)
chr4 (1-136)||(21217846-21217981)
chr4 (1-124)||(25218095-25218218)
chr4 (1-136)||(54136090-54136225)
chr4 (1-136)||(9010757-9010892)
chr4 (1-136)||(12381306-12381441)
chr4 (9-136)||(46200483-46200610)
chr4 (1-137)||(52915195-52915333)
chr4 (1-135)||(10014465-10014598)
chr4 (1-135)||(10021606-10021739)
chr4 (1-135)||(27347597-27347731)
chr4 (1-131)||(33625868-33625998)
chr4 (5-135)||(33626120-33626250)
chr4 (1-123)||(53645463-53645585)
chr4 (5-137)||(43317135-43317267)
chr4 (1-132)||(2738883-2739014)
chr4 (1-136)||(44432876-44433011)
chr4 (5-136)||(45911830-45911961)
chr4 (1-131)||(33882201-33882331)
chr4 (1-135)||(34958832-34958965)
chr4 (1-138)||(25058830-25058967)
chr4 (1-138)||(43316877-43317013)
chr4 (1-117)||(4965889-4966005)
chr4 (1-113)||(25218336-25218448)
chr4 (24-132)||(37515728-37515836)
chr4 (5-135)||(18862696-18862827)
chr4 (1-132)||(45911582-45911713)
chr4 (5-132)||(46621183-46621310)
chr4 (1-136)||(48209947-48210082)
chr4 (5-135)||(25593347-25593477)
chr4 (1-135)||(40067600-40067734)
chr4 (1-135)||(44710403-44710537)
chr4 (1-135)||(45683117-45683251)
chr4 (1-131)||(46620931-46621061)
chr4 (20-134)||(54191855-54191969)
chr4 (1-138)||(38866395-38866532)
chr4 (1-136)||(22830795-22830931)
chr4 (1-137)||(27347849-27347985)
chr4 (1-132)||(29970196-29970326)
chr4 (1-135)||(45683369-45683503)
chr4 (1-134)||(28570673-28570806)
chr4 (1-132)||(8246998-8247129)
chr4 (1-132)||(34959083-34959214)
chr4 (1-135)||(1205629-1205763)
chr4 (1-131)||(44710655-44710785)
chr4 (1-135)||(46535523-46535656)
chr4 (1-138)||(43969779-43969916)
chr4 (1-132)||(1157206-1157340)
chr4 (5-133)||(8751289-8751417)
chr4 (1-132)||(25977771-25977903)
chr4 (5-137)||(32385068-32385199)
chr4 (29-132)||(1205381-1205483)
chr4 (1-132)||(4793851-4793981)
chr4 (1-135)||(24503939-24504074)
chr4 (1-124)||(24504192-24504315)
chr4 (1-135)||(8246769-8246901)
chr4 (1-138)||(11102226-11102364)
chr4 (7-132)||(38866657-38866783)
chr4 (1-135)||(46200737-46200871)
chr4 (1-134)||(21051360-21051493)
chr4 (5-134)||(46535778-46535907)
chr4 (1-137)||(10014716-10014851)
chr4 (1-137)||(10021857-10021992)
chr4 (1-132)||(22831049-22831181)
chr4 (1-136)||(44169978-44170114)
chr4 (1-85)||(54191638-54191722)
chr4 (1-138)||(4966120-4966257)
chr4 (25-134)||(11242740-11242849)
chr4 (1-132)||(15985469-15985601)
chr4 (58-135)||(9657667-9657744)
chr4 (1-90)||(44428616-44428705)
chr4 (1-103)||(21885076-21885178)
chr4 (56-138)||(44170288-44170370)
chr4 (1-136)||(54136343-54136474)
chr4 (54-136)||(44428512-44428594)
chr4 (1-90)||(21051599-21051688)
chr4 (1-136)||(9657899-9658034)
chr4 (78-133)||(43969556-43969611)
chr4 (72-122)||(28504590-28504640)
chr4 (72-122)||(41610528-41610578)
chr4 (72-122)||(46307569-46307619)
chr4 (94-135)||(10017815-10017856)
chr4 (1-82)||(42779573-42779654)
chr4 (20-61)||(43969599-43969640)
chr4 (29-113)||(37515550-37515634)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (1-132)||(1826043-1826174)
chr8 (1-132)||(1860488-1860619)
chr8 (1-138)||(23244767-23244904)
chr8 (1-138)||(24456904-24457041)
chr8 (1-138)||(37393729-37393866)
chr8 (1-137)||(37393475-37393611)
chr8 (1-136)||(3869201-3869336)
chr8 (1-138)||(18017787-18017924)
chr8 (5-137)||(30872781-30872913)
chr8 (1-137)||(35224019-35224155)
chr8 (1-135)||(40040162-40040296)
chr8 (5-138)||(11198461-11198594)
chr8 (1-137)||(5416810-5416946)
chr8 (1-124)||(31230624-31230747)
chr8 (4-130)||(14920666-14920792)
chr8 (1-135)||(18621999-18622133)
chr8 (1-135)||(21515452-21515586)
chr8 (1-135)||(31230865-31230999)
chr8 (5-138)||(30650187-30650320)
chr8 (1-133)||(119119-119250)
chr8 (1-137)||(11639050-11639186)
chr8 (1-137)||(35223772-35223908)
chr8 (5-137)||(6843493-6843627)
chr8 (5-132)||(18018042-18018169)
chr8 (5-135)||(40032426-40032557)
chr8 (1-135)||(18914503-18914637)
chr8 (25-139)||(29027244-29027358)
chr8 (1-135)||(39911917-39912051)
chr8 (2-123)||(40094487-40094608)
chr8 (1-136)||(8653935-8654070)
chr8 (1-132)||(26736128-26736259)
chr8 (1-134)||(39240031-39240164)
chr8 (1-137)||(7041881-7042012)
chr8 (1-133)||(30568528-30568660)
chr8 (1-136)||(1825809-1825943)
chr8 (1-136)||(1860254-1860388)
chr8 (20-111)||(7041653-7041744)
chr8 (1-136)||(14920410-14920545)
chr8 (1-124)||(39912171-39912294)
chr8 (54-136)||(24456733-24456815)
chr8 (16-137)||(21512411-21512531)
chr8 (1-138)||(44254862-44254999)
chr8 (1-132)||(16645797-16645931)
chr8 (1-136)||(33542383-33542518)
chr8 (1-132)||(8654188-8654319)
chr8 (1-132)||(9495275-9495406)
chr8 (1-132)||(23244518-23244649)
chr8 (1-132)||(39240271-39240402)
chr8 (1-136)||(44255114-44255249)
chr8 (1-135)||(119368-119502)
chr8 (1-138)||(758596-758733)
chr8 (1-138)||(12873300-12873435)
chr8 (27-135)||(40032706-40032815)
chr8 (24-132)||(758347-758455)
chr8 (24-132)||(6844715-6844823)
chr8 (1-137)||(36343960-36344095)
chr8 (1-116)||(26736377-26736492)
chr8 (1-138)||(28207005-28207142)
chr8 (1-133)||(3868946-3869081)
chr8 (1-137)||(18914262-18914394)
chr8 (1-138)||(40094727-40094864)
chr8 (1-137)||(12873055-12873191)
chr8 (56-136)||(44678316-44678396)
chr8 (1-135)||(28206766-28206900)
chr8 (4-132)||(29026971-29027103)
chr8 (1-96)||(33542636-33542731)
chr8 (1-80)||(44678436-44678515)
chr8 (1-133)||(5417065-5417197)
chr8 (1-137)||(30873030-30873166)
chr8 (54-133)||(44678518-44678596)
chr8 (1-116)||(410614-410729)
chr8 (54-124)||(5525882-5525952)
chr8 (1-138)||(35485868-35486005)
chr8 (1-80)||(30568331-30568410)
chr8 (72-129)||(35486186-35486243)
chr8 (1-62)||(40040414-40040475)
chr8 (92-136)||(11639378-11639422)
chr8 (5-133)||(26217072-26217199)
chr8 (72-123)||(7117111-7117162)
chr8 (72-123)||(43633135-43633186)
chr8 (1-61)||(9495106-9495166)
chr8 (73-125)||(9630797-9630849)
chr8 (1-81)||(32733765-32733845)
chr8 (48-132)||(36344260-36344344)
chr8 (24-136)||(45436434-45436549)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-135)||(9173901-9174035)
chr6 (1-138)||(33545074-33545211)
chr6 (1-137)||(3338475-3338611)
chr6 (1-136)||(25551346-25551481)
chr6 (1-132)||(25551588-25551719)
chr6 (1-136)||(33329205-33329340)
chr6 (1-136)||(35132600-35132735)
chr6 (1-134)||(6220308-6220441)
chr6 (1-136)||(3288929-3289064)
chr6 (1-132)||(24604878-24605008)
chr6 (1-132)||(33544825-33544956)
chr6 (1-112)||(35119063-35119174)
chr6 (1-122)||(11524778-11524899)
chr6 (1-133)||(29009956-29010088)
chr6 (1-135)||(3289162-3289296)
chr6 (1-135)||(12903221-12903355)
chr6 (1-135)||(14336902-14337036)
chr6 (4-136)||(3338732-3338862)
chr6 (1-132)||(6220059-6220190)
chr6 (1-135)||(7537857-7537992)
chr6 (1-124)||(24605126-24605248)
chr6 (1-132)||(31029527-31029658)
chr6 (1-112)||(33346501-33346612)
chr6 (1-124)||(1158599-1158724)
chr6 (5-139)||(19135702-19135836)
chr6 (1-135)||(31029776-31029910)
chr6 (1-138)||(2949293-2949425)
chr6 (1-136)||(14337154-14337288)
chr6 (1-135)||(1860738-1860871)
chr6 (48-134)||(11524706-11524792)
chr6 (1-123)||(24548493-24548615)
chr6 (27-135)||(32283026-32283134)
chr6 (72-136)||(33548180-33548244)
chr6 (1-136)||(2814563-2814698)
chr6 (5-136)||(11525022-11525152)
chr6 (1-132)||(13155842-13155973)
chr6 (1-132)||(13160698-13160829)
chr6 (1-136)||(29010206-29010341)
chr6 (1-138)||(1158843-1158978)
chr6 (1-90)||(33972458-33972547)
chr6 (1-136)||(35132853-35132977)
chr6 (2-90)||(2949544-2949632)
chr6 (1-113)||(29999655-29999767)
chr6 (1-124)||(13156091-13156209)
chr6 (1-124)||(13160947-13161065)
chr6 (1-113)||(2315601-2315713)
chr6 (1-135)||(24548241-24548375)
chr6 (72-132)||(33971931-33971991)
chr6 (49-136)||(17245624-17245711)
chr6 (1-132)||(31754207-31754338)
chr6 (1-107)||(12903463-12903569)
chr6 (1-137)||(17544705-17544840)
chr6 (1-57)||(33329458-33329514)
chr6 (72-123)||(3618793-3618844)
chr6 (49-135)||(6229687-6229772)
chr6 (59-132)||(17544457-17544529)
chr6 (1-46)||(33972293-33972338)
chr6 (102-138)||(33548124-33548160)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (1-138)||(13354429-13354566)
chr2 (1-136)||(5961668-5961803)
chr2 (1-136)||(31450665-31450800)
chr2 (1-136)||(41377354-41377488)
chr2 (1-133)||(43183585-43183717)
chr2 (1-135)||(4104411-4104545)
chr2 (1-135)||(20908763-20908897)
chr2 (1-138)||(21470292-21470429)
chr2 (1-132)||(39912630-39912762)
chr2 (1-136)||(13354176-13354311)
chr2 (1-136)||(28203112-28203247)
chr2 (1-135)||(4104159-4104293)
chr2 (2-136)||(27476620-27476754)
chr2 (20-136)||(16736100-16736216)
chr2 (1-137)||(27132509-27132645)
chr2 (1-136)||(25642520-25642655)
chr2 (1-135)||(4120764-4120898)
chr2 (1-131)||(16655610-16655740)
chr2 (1-135)||(37412830-37412964)
chr2 (1-134)||(12303786-12303919)
chr2 (1-134)||(16260872-16261004)
chr2 (5-138)||(34820535-34820668)
chr2 (1-137)||(18565064-18565200)
chr2 (1-134)||(38275707-38275842)
chr2 (1-137)||(39454449-39454585)
chr2 (1-132)||(28631526-28631657)
chr2 (1-132)||(37744640-37744771)
chr2 (1-135)||(27132762-27132896)
chr2 (1-135)||(27883468-27883602)
chr2 (1-135)||(31450918-31451052)
chr2 (5-135)||(32933847-32933977)
chr2 (1-131)||(34820283-34820413)
chr2 (1-135)||(41377606-41377740)
chr2 (1-135)||(41659745-41659879)
chr2 (1-130)||(25642273-25642402)
chr2 (2-135)||(28202860-28202993)
chr2 (1-134)||(36442386-36442519)
chr2 (1-137)||(5921638-5921774)
chr2 (1-137)||(12304406-12304542)
chr2 (1-137)||(32933589-32933725)
chr2 (1-137)||(43183835-43183971)
chr2 (1-136)||(16261122-16261257)
chr2 (5-124)||(21470551-21470669)
chr2 (1-135)||(17856199-17856333)
chr2 (3-135)||(16736352-16736484)
chr2 (1-133)||(34127817-34127948)
chr2 (1-137)||(35408773-35408909)
chr2 (1-133)||(37412595-37412727)
chr2 (1-137)||(45389129-45389265)
chr2 (1-136)||(20908510-20908645)
chr2 (1-132)||(38275480-38275611)
chr2 (1-138)||(39912878-39913017)
chr2 (5-135)||(10833291-10833421)
chr2 (22-132)||(18565276-18565386)
chr2 (1-136)||(44612735-44612871)
chr2 (20-137)||(16655877-16655994)
chr2 (1-132)||(27476369-27476501)
chr2 (1-137)||(39150077-39150213)
chr2 (1-132)||(4121015-4121146)
chr2 (1-124)||(28631285-28631408)
chr2 (1-135)||(36211350-36211484)
chr2 (1-137)||(14877481-14877615)
chr2 (5-138)||(36442130-36442263)
chr2 (1-138)||(44915737-44915873)
chr2 (5-137)||(17856445-17856577)
chr2 (1-124)||(12304037-12304160)
chr2 (1-136)||(15137056-15137191)
chr2 (48-135)||(36211698-36211785)
chr2 (1-131)||(34127570-34127700)
chr2 (28-138)||(39454712-39454822)
chr2 (1-138)||(27883709-27883850)
chr2 (4-132)||(32503792-32503920)
chr2 (1-132)||(27913897-27914028)
chr2 (1-136)||(33819648-33819781)
chr2 (6-117)||(34484303-34484414)
chr2 (1-136)||(40694194-40694329)
chr2 (1-112)||(40694427-40694538)
chr2 (1-122)||(15829733-15829854)
chr2 (24-133)||(37744451-37744560)
chr2 (25-116)||(11943764-11943855)
chr2 (48-135)||(20297410-20297497)
chr2 (56-136)||(27246290-27246370)
chr2 (1-112)||(39149867-39149978)
chr2 (1-96)||(44915991-44916086)
chr2 (27-132)||(32503549-32503654)
chr2 (1-138)||(33819394-33819530)
chr2 (1-90)||(36211593-36211682)
chr2 (56-132)||(1580148-1580224)
chr2 (1-136)||(27914145-27914280)
chr2 (1-132)||(41659988-41660119)
chr2 (72-138)||(44610859-44610924)
chr2 (72-132)||(34484238-34484298)
chr2 (5-116)||(16350327-16350438)
chr2 (72-122)||(677915-677965)
chr2 (49-135)||(23992206-23992292)
chr2 (58-135)||(38073790-38073867)
chr2 (72-135)||(3603504-3603567)
chr2 (72-138)||(2822301-2822367)
chr2 (72-122)||(15136364-15136414)
chr2 (72-122)||(26424819-26424869)
chr2 (72-122)||(31557104-31557154)
chr2 (72-122)||(34618517-34618567)
chr2 (56-132)||(16350080-16350156)
[»] chr1 (124 HSPs)
chr1 (1-138)||(23281262-23281399)
chr1 (1-132)||(29256835-29256966)
chr1 (1-138)||(25088013-25088150)
chr1 (1-136)||(5463370-5463505)
chr1 (1-135)||(51691874-51692008)
chr1 (5-138)||(45305666-45305798)
chr1 (1-137)||(16267942-16268077)
chr1 (1-136)||(10923615-10923750)
chr1 (1-138)||(33753222-33753359)
chr1 (1-133)||(18793693-18793825)
chr1 (5-137)||(30611218-30611350)
chr1 (1-137)||(30792438-30792574)
chr1 (1-137)||(32564202-32564337)
chr1 (1-137)||(34028973-34029109)
chr1 (1-124)||(10654281-10654404)
chr1 (5-136)||(28970418-28970549)
chr1 (9-136)||(34279501-34279628)
chr1 (1-132)||(42607525-42607656)
chr1 (5-135)||(22584608-22584738)
chr1 (1-137)||(6181868-6182004)
chr1 (5-133)||(21035987-21036115)
chr1 (1-137)||(34028719-34028855)
chr1 (1-133)||(35986234-35986366)
chr1 (5-129)||(50574773-50574897)
chr1 (1-124)||(24590237-24590360)
chr1 (1-132)||(49291235-49291366)
chr1 (1-132)||(50118350-50118481)
chr1 (1-135)||(13944763-13944897)
chr1 (1-135)||(22584351-22584485)
chr1 (1-135)||(24590477-24590611)
chr1 (1-138)||(37199173-37199310)
chr1 (1-137)||(9881550-9881685)
chr1 (1-137)||(10654028-10654163)
chr1 (1-133)||(11787742-11787874)
chr1 (1-133)||(51692123-51692254)
chr1 (4-124)||(52412609-52412729)
chr1 (1-132)||(6181619-6181750)
chr1 (1-132)||(30293265-30293395)
chr1 (1-136)||(33753468-33753602)
chr1 (1-136)||(37198931-37199066)
chr1 (1-136)||(46738976-46739110)
chr1 (1-136)||(51810136-51810271)
chr1 (1-136)||(52412850-52412985)
chr1 (1-138)||(14118527-14118664)
chr1 (1-134)||(16267716-16267849)
chr1 (1-138)||(24655838-24655975)
chr1 (1-134)||(42607754-42607887)
chr1 (23-136)||(50921365-50921478)
chr1 (1-126)||(51810390-51810515)
chr1 (2-122)||(50574527-50574647)
chr1 (1-136)||(14775744-14775879)
chr1 (1-132)||(24655589-24655720)
chr1 (1-136)||(32563958-32564093)
chr1 (1-136)||(36657753-36657888)
chr1 (1-136)||(46949755-46949890)
chr1 (24-138)||(4045096-4045210)
chr1 (1-135)||(14775987-14776121)
chr1 (1-138)||(30293010-30293147)
chr1 (1-134)||(50921061-50921194)
chr1 (1-133)||(11394912-11395044)
chr1 (1-137)||(19986374-19986510)
chr1 (1-137)||(44222190-44222326)
chr1 (1-138)||(4054545-4054683)
chr1 (1-134)||(30611472-30611606)
chr1 (5-111)||(32517629-32517735)
chr1 (1-138)||(18793944-18794082)
chr1 (1-137)||(25088268-25088403)
chr1 (20-132)||(36884725-36884837)
chr1 (7-138)||(1831661-1831792)
chr1 (1-136)||(4045351-4045486)
chr1 (5-112)||(5463140-5463247)
chr1 (1-112)||(21384960-21385070)
chr1 (1-148)||(29257075-29257222)
chr1 (1-132)||(34621887-34622018)
chr1 (5-138)||(20260635-20260768)
chr1 (1-135)||(34279240-34279374)
chr1 (1-90)||(5118096-5118185)
chr1 (1-138)||(21385188-21385325)
chr1 (25-138)||(36077268-36077381)
chr1 (49-133)||(5117995-5118079)
chr1 (1-132)||(10923365-10923497)
chr1 (1-85)||(13831274-13831358)
chr1 (1-137)||(13944509-13944645)
chr1 (1-136)||(11787993-11788127)
chr1 (29-132)||(19885985-19886088)
chr1 (1-90)||(28112795-28112884)
chr1 (2-90)||(11797220-11797308)
chr1 (1-132)||(1831916-1832047)
chr1 (1-136)||(27209168-27209303)
chr1 (5-132)||(40533928-40534055)
chr1 (56-137)||(4550907-4550988)
chr1 (49-138)||(28112718-28112807)
chr1 (1-134)||(36657501-36657635)
chr1 (1-132)||(45305412-45305544)
chr1 (49-132)||(19886214-19886297)
chr1 (1-112)||(49291016-49291127)
chr1 (1-75)||(9119544-9119618)
chr1 (56-138)||(48702187-48702269)
chr1 (48-137)||(9119290-9119379)
chr1 (58-131)||(11394697-11394769)
chr1 (49-134)||(11797147-11797232)
chr1 (1-98)||(46949988-46950085)
chr1 (5-136)||(40703121-40703252)
chr1 (1-68)||(30792692-30792759)
chr1 (5-124)||(2125465-2125577)
chr1 (1-132)||(32517765-32517894)
chr1 (5-116)||(40534181-40534292)
chr1 (54-136)||(19269359-19269441)
chr1 (1-136)||(40702867-40702999)
chr1 (27-123)||(20260440-20260536)
chr1 (56-136)||(27209456-27209536)
chr1 (72-114)||(6241274-6241316)
chr1 (72-122)||(6714698-6714748)
chr1 (2-112)||(21036235-21036345)
chr1 (5-133)||(31125938-31126059)
chr1 (72-122)||(32193530-32193580)
chr1 (76-138)||(33784299-33784361)
chr1 (72-122)||(34023569-34023619)
chr1 (72-122)||(37708574-37708624)
chr1 (72-122)||(46448736-46448786)
chr1 (72-137)||(29021580-29021645)
chr1 (5-82)||(36884960-36885037)
chr1 (1-62)||(50921312-50921373)
chr1 (72-116)||(6242692-6242736)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (1-137)||(34521264-34521400)
chr3 (1-137)||(41208652-41208788)
chr3 (1-136)||(44069375-44069510)
chr3 (1-135)||(54107669-54107803)
chr3 (1-137)||(4846848-4846984)
chr3 (1-136)||(26332318-26332453)
chr3 (1-132)||(34629985-34630116)
chr3 (1-133)||(10756720-10756852)
chr3 (5-132)||(54081287-54081413)
chr3 (1-138)||(15862427-15862564)
chr3 (5-138)||(43899330-43899463)
chr3 (1-137)||(45171066-45171202)
chr3 (1-136)||(54081535-54081671)
chr3 (1-136)||(7950274-7950409)
chr3 (1-139)||(26332570-26332712)
chr3 (1-136)||(28688242-28688377)
chr3 (1-136)||(41997818-41997953)
chr3 (5-136)||(45871696-45871827)
chr3 (1-136)||(54108372-54108507)
chr3 (1-123)||(7743017-7743139)
chr3 (1-135)||(31513863-31513997)
chr3 (1-138)||(28691365-28691502)
chr3 (1-134)||(45171319-45171452)
chr3 (1-137)||(12123088-12123224)
chr3 (1-137)||(12123331-12123467)
chr3 (1-132)||(21169669-21169800)
chr3 (1-132)||(34521509-34521640)
chr3 (5-132)||(40410715-40410842)
chr3 (1-131)||(7274895-7275024)
chr3 (1-135)||(7937815-7937949)
chr3 (1-135)||(8846328-8846462)
chr3 (1-135)||(15862182-15862316)
chr3 (1-131)||(22354946-22355076)
chr3 (1-135)||(44069123-44069257)
chr3 (1-135)||(50819469-50819603)
chr3 (1-135)||(50856261-50856395)
chr3 (1-138)||(41208398-41208535)
chr3 (1-138)||(50819217-50819354)
chr3 (1-138)||(50856510-50856647)
chr3 (26-135)||(52609639-52609748)
chr3 (1-137)||(31514115-31514250)
chr3 (1-137)||(35753683-35753819)
chr3 (1-132)||(14353300-14353430)
chr3 (20-135)||(43899111-43899226)
chr3 (10-132)||(35580210-35580332)
chr3 (5-137)||(46766869-46767002)
chr3 (1-130)||(53841278-53841407)
chr3 (5-137)||(40926009-40926141)
chr3 (1-136)||(19124188-19124323)
chr3 (5-136)||(28691113-28691244)
chr3 (1-135)||(8846076-8846210)
chr3 (1-138)||(40639369-40639506)
chr3 (7-136)||(52606128-52606256)
chr3 (5-133)||(40926267-40926394)
chr3 (5-133)||(51170637-51170765)
chr3 (5-124)||(17273788-17273907)
chr3 (5-124)||(45871945-45872064)
chr3 (1-107)||(17102629-17102735)
chr3 (1-135)||(27940272-27940406)
chr3 (1-135)||(47891513-47891647)
chr3 (1-134)||(19124424-19124556)
chr3 (25-138)||(38911494-38911607)
chr3 (1-132)||(2078724-2078855)
chr3 (1-136)||(5348820-5348955)
chr3 (1-132)||(10756960-10757091)
chr3 (1-136)||(17102383-17102518)
chr3 (1-108)||(28688017-28688124)
chr3 (1-132)||(37133280-37133411)
chr3 (56-135)||(40969255-40969334)
chr3 (1-136)||(52268356-52268490)
chr3 (1-139)||(14353042-14353180)
chr3 (72-138)||(41998137-41998203)
chr3 (1-134)||(29248320-29248453)
chr3 (1-132)||(2829410-2829542)
chr3 (1-112)||(27254007-27254118)
chr3 (1-132)||(29248560-29248691)
chr3 (24-131)||(49222040-49222147)
chr3 (9-135)||(51883859-51883985)
chr3 (4-90)||(22444441-22444527)
chr3 (1-123)||(53678445-53678567)
chr3 (56-137)||(5348577-5348658)
chr3 (5-133)||(33773046-33773175)
chr3 (49-130)||(35753408-35753489)
chr3 (48-136)||(54247271-54247358)
chr3 (1-132)||(17274028-17274159)
chr3 (1-90)||(35753477-35753566)
chr3 (1-137)||(40969506-40969642)
chr3 (28-133)||(53310001-53310106)
chr3 (1-137)||(2829660-2829795)
chr3 (72-136)||(7274652-7274716)
chr3 (65-133)||(7937645-7937713)
chr3 (1-137)||(9028189-9028325)
chr3 (1-97)||(53841065-53841161)
chr3 (5-135)||(588406-588537)
chr3 (56-135)||(53678740-53678818)
chr3 (1-135)||(9028443-9028577)
chr3 (49-135)||(13866964-13867050)
chr3 (8-137)||(20963547-20963677)
chr3 (56-138)||(51311825-51311907)
chr3 (28-124)||(33812735-33812831)
chr3 (56-132)||(40639120-40639196)
chr3 (20-138)||(43839959-43840076)
chr3 (49-133)||(49529120-49529204)
chr3 (72-122)||(13355188-13355238)
chr3 (5-138)||(46766619-46766753)
chr3 (1-35)||(52606370-52606404)
chr3 (59-132)||(21918500-21918573)
chr3 (58-135)||(33812852-33812929)
chr3 (78-135)||(43527023-43527080)
chr3 (72-123)||(31049073-31049124)
chr3 (85-116)||(38911432-38911463)
chr3 (72-122)||(47872529-47872579)
chr3 (56-138)||(51885671-51885753)
chr3 (10-134)||(43844359-43844484)
chr3 (92-136)||(44316626-44316670)
chr3 (73-113)||(49222349-49222389)
chr3 (24-115)||(50393337-50393429)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (1-138)||(4570-4707)
scaffold0809 (1-132)||(4341-4472)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (1-137)||(7399075-7399211)
chr5 (5-138)||(35263491-35263624)
chr5 (1-131)||(15267492-15267622)
chr5 (1-138)||(40589306-40589443)
chr5 (1-138)||(40589909-40590046)
chr5 (1-134)||(42710351-42710484)
chr5 (1-135)||(28392021-28392156)
chr5 (7-137)||(5088386-5088516)
chr5 (1-135)||(10656346-10656480)
chr5 (1-135)||(42710602-42710736)
chr5 (2-135)||(9692919-9693051)
chr5 (5-138)||(12593712-12593845)
chr5 (5-137)||(16353410-16353542)
chr5 (1-137)||(33699273-33699409)
chr5 (1-132)||(9693170-9693301)
chr5 (1-136)||(10656093-10656228)
chr5 (1-136)||(35263746-35263881)
chr5 (1-123)||(7399330-7399452)
chr5 (1-134)||(7210697-7210830)
chr5 (5-134)||(8418440-8418569)
chr5 (1-138)||(12694938-12695075)
chr5 (1-136)||(29023936-29024068)
chr5 (5-133)||(32272096-32272224)
chr5 (1-133)||(36751904-36752036)
chr5 (1-136)||(3878480-3878615)
chr5 (1-132)||(5624382-5624513)
chr5 (1-132)||(19205195-19205326)
chr5 (1-136)||(38416386-38416521)
chr5 (1-135)||(334296-334430)
chr5 (1-123)||(31656370-31656492)
chr5 (1-135)||(31656610-31656744)
chr5 (1-131)||(39706303-39706433)
chr5 (1-130)||(7210461-7210590)
chr5 (1-135)||(31908928-31909064)
chr5 (1-133)||(43570023-43570155)
chr5 (1-136)||(5087806-5087941)
chr5 (1-135)||(40589054-40589188)
chr5 (1-135)||(40589657-40589791)
chr5 (1-122)||(15476511-15476632)
chr5 (1-138)||(18514285-18514422)
chr5 (20-137)||(36752173-36752289)
chr5 (1-134)||(40774339-40774471)
chr5 (24-132)||(15476269-15476377)
chr5 (5-128)||(26289027-26289150)
chr5 (1-132)||(41859929-41860062)
chr5 (59-136)||(5460187-5460264)
chr5 (1-138)||(38416140-38416277)
chr5 (27-135)||(33763186-33763293)
chr5 (1-132)||(25923121-25923252)
chr5 (5-132)||(31909186-31909313)
chr5 (1-137)||(39706053-39706185)
chr5 (1-135)||(17861039-17861172)
chr5 (48-138)||(21750807-21750897)
chr5 (1-115)||(33762922-33763039)
chr5 (1-134)||(5152867-5153000)
chr5 (1-130)||(8418206-8418334)
chr5 (1-137)||(12593454-12593590)
chr5 (1-135)||(28391768-28391903)
chr5 (1-136)||(40774589-40774724)
chr5 (1-132)||(41372410-41372541)
chr5 (24-122)||(17736522-17736620)
chr5 (75-132)||(5460272-5460329)
chr5 (1-138)||(15267239-15267375)
chr5 (1-138)||(19204941-19205077)
chr5 (1-136)||(14143511-14143642)
chr5 (1-132)||(15670403-15670534)
chr5 (1-135)||(16353151-16353288)
chr5 (1-137)||(5152614-5152750)
chr5 (1-138)||(14051886-14052023)
chr5 (1-110)||(25923371-25923480)
chr5 (5-136)||(14143761-14143892)
chr5 (1-138)||(17861290-17861419)
chr5 (20-136)||(26289292-26289407)
chr5 (101-138)||(26288988-26289025)
chr5 (42-136)||(3879305-3879399)
chr5 (72-138)||(37192467-37192533)
chr5 (72-116)||(38384887-38384931)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-135)||(40604-40738)
scaffold0051 (1-137)||(40350-40486)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (1-136)||(11466-11601)
scaffold0236 (1-117)||(11231-11347)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (1-135)||(11739-11873)
scaffold0168 (5-138)||(11485-11618)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (1-135)||(45088-45222)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (25-132)||(13817-13924)
scaffold0188 (1-136)||(13541-13675)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-135)||(90805-90939)
scaffold0016 (1-85)||(91760-91844)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (1-133)||(65991-66123)
scaffold0045 (1-133)||(73323-73455)
scaffold0045 (4-124)||(65750-65870)
scaffold0045 (4-124)||(73082-73202)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-137)||(177317-177453)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (1-137)||(1474-1609)
scaffold1436 (1-90)||(1727-1815)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-135)||(93188-93324)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-90)||(11713-11802)
scaffold0444 (54-136)||(11638-11720)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (54-132)||(25970-26048)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (49-130)||(10920-11001)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (72-122)||(6231-6281)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (72-138)||(57019-57085)
scaffold0054 (72-136)||(57553-57617)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 32706984 - 32707375
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32706984 tttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggaccaaagcgatactat 32707082  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaattaggacgaactaaatatagtttatagacatgtcatgtcacaatacacaaga 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32707083 ctaaataattaagggactaaaaatacaatttagcctaacatttattaattaggatgaattaaatatactttatagacatgtcaagtcacaatacacaaga 32707182  T
Q  201 ttttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaataggaataaggatgatttggcgcgcagtttgggtggaagaattaaggaatttagtgataagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707183 ttttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaattggaataaggatgatttg----gcagtttgggtggaagaattaaggaatttagtgataagga 32707278  T
Q  301 aattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacccttagttatttaaaaaatgctaacaat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32707279 aattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacctttagttatttaaaaaatgttaacaat 32707375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 8769534 - 8769666
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  8769534 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 8769633  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8769634 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttag 8769666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43140832 - 43140701
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43140832 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactat 43140733  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43140732 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 43140701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18731153 - 18731019
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731153 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactat 18731054  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18731053 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18731019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31715767 - 31715631
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31715767 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggtcaaagcgatactac 31715668  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31715667 ctaaatagttaagagacaaaaaatacaatttagccta 31715631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23437286 - 23437149
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  23437286 tttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 23437187  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  23437186 ctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagcctaa 23437149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35085873 - 35085736
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  35085873 tttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 35085774  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35085773 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35085736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 10625336 - 10625471
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||  |||||||     
T  10625336 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaatgatactac 10625435  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10625436 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10625471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 47250798 - 47250933
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  47250798 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactac 47250897  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47250898 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 47250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 2357307 - 2357444
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||  |||| ||||||||     
T  2357307 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacgatactac 2357406  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2357407 ctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagtctaa 2357444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 9034567 - 9034703
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||     
T  9034567 tttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagcgatactac 9034666  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9034667 ctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagccta 9034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34568717 - 34568585
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  34568717 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 34568618  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34568617 ctaaatagttaaaggacaaaaaatacaatttag 34568585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 44448164 - 44448295
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  44448164 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 44448263  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44448264 ttaaataattaaaggactaaaaatccaattta 44448295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 9230929 - 9231065
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||     
T  9230929 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtgaccaaaataaatcaaatcttaattaagggaccaaaacgatactac 9231028  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9231029 ctaaatcgttaagggaccaaaaatacaacttagccta 9231065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11678837 - 11678702
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  11678837 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatattat 11678738  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11678737 ctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 11678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 11678961 - 11679088
Alignment:
Q  8 taaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaata 107  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  11678961 taaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacttaaata 11679060  T
Q  108 gttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11679061 gttaagggaccaaaaatacaatttagcc 11679088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 31715874 - 31716008
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  31715874 tttgaattaaaactaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttataggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 31715972  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31715973 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31716008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 35085992 - 35086127
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  35085992 tttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatactac 35086091  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35086092 ctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 35086127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 23472812 - 23472942
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23472812 aattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgaaactacctaa 23472911  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23472912 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 23472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23472727 - 23472590
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||  |||||| ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  23472727 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaattttaattaaaagaccaaaacgatactac 23472628  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23472627 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 23472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2357201 - 2357066
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2357201 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactat 2357102  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  2357101 ttaaatagttaagagatcaaaaatgcaatttagcct 2357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39118144 - 39118013
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||     
T  39118144 tttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaagggatcaaaacgatactac 39118045  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39118044 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39118013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 44486187 - 44486318
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||  | | |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  44486187 gaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaatattaattaaaggaccaaagcgatactaccta 44486286  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44486287 aatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44486318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41758813 - 41758691
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41758813 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactat 41758714  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  41758713 ttaaatagttaagggacaaaaaa 41758691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21522352 - 21522226
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21522352 tttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaattttaattaagggaccaaagcgatactac 21522255  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaat 129  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  21522254 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaat 21522226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 26920169 - 26920302
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  26920169 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacaac 26920268  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26920269 cgaaatagataagggattaaaaatgcaatttagc 26920302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5238585 - 5238449
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  5238585 tttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 5238486  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  5238485 ctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagccta 5238449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24119848 - 24119713
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24119848 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactat 24119749  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||  || ||||||  ||||||||||    
T  24119748 ctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaatttagcct 24119713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8769416 - 8769279
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||     
T  8769416 tttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattcagggaccaaaacaatactac 8769317  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8769316 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 8769279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 43726494 - 43726630
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||| | |||| |     
T  43726494 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggaactaaaacaataccac 43726593  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43726594 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 43726630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21522470 - 21522599
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  21522470 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatgctac 21522567  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21522568 ctaaatagttaagggaccaaaaacacaattta 21522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 47251149 - 47251283
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  47251149 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaagcaatactac 47251247  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47251248 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcct 47251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32706866 - 32706729
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||   ||| | ||||||     
T  32706866 tttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggtcaaaaacaatactac 32706767  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32706766 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 32706729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47250691 - 47250570
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||     
T  47250691 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaatgatactac 47250592  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  47250591 ctaaataattaagggacaaaaa 47250570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38842165 - 38842035
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  || | |||    
T  38842165 tttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggatcaaaataaatcgaattttaattaaggga-caaaatgacattat 38842068  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    | |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38842067 caaaatagttaaggaaccaaaattacaatttag 38842035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44448047 - 44447916
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  44448047 tttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaacaatactat 44447949  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  44447948 ctaaatagttaacggaccaaaaatgcaatttag 44447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 36507061 - 36507196
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  36507061 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactaa 36507160  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  36507161 ttaaatagttaagagaccaaaaacataatttagcct 36507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 48704061 - 48704193
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48704061 tttgaattaaa-ctaacataaaggaccaaa-tgtgtatcggacagaaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 48704158  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
     ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  48704159 cctaaatagttaagggaccaaaaatatcatttagc 48704193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 473432 - 473569
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||  || |||||||||||||     
T  473432 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaagcgatactac 473531  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||| |||||    
T  473532 ctaaatagttaaagaattaacaatgcaatttaacctaa 473569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 34568836 - 34568977
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac--- 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||       
T  34568836 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggacaaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagtgatactac 34568935  T
Q  98 -tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  34568936 ataaataaatagtaaagagaccaaaaatataatttagcctaa 34568977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 44485587 - 44485718
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||| || | |||||||| ||| |||||||||| ||  ||    
T  44485587 gaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaatattaattaaaggaccaaagcgataatactta 44485686  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44485687 aatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44485718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47305206 - 47305127
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47305206 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 47305127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9230810 - 9230716
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 95  Q
    |||||||||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9230810 tttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgat 9230716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37143897 - 37143764
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | |||||   ||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  37143897 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaagttaagataccaaat-aaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaa 37143799  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37143798 ttaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 37143764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 38842274 - 38842410
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |  ||| ||||  | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||     
T  38842274 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagttagag-accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatgctac 38842372  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  38842373 ctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttagtctaa 38842410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43726376 - 43726241
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  43726376 tttgaattaaaactaatgaaaag-atcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaat-aaatcaaattttaattaagggaccaaagcgagactac 43726279  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43726278 ttaaataattaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 43726241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22338407 - 22338272
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22338407 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggtaccaaagcaatacta 22338308  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
      |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22338307 attaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 22338272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 473293 - 473191
Alignment:
Q  34 tgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  473293 tgtaacagagaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaatttag 473194  T
Q  134 cct 136  Q
    |||    
T  473193 cct 473191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31623676 - 31623810
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||| | ||||| || ||||  |||| ||||||||     
T  31623676 tttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatcaaattttacttgagggtccaaaacgatactac 31623775  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31623776 ctgaataattaaggtactaaaaatgcaatttagcc 31623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 28349633 - 28349763
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| | ||||||     
T  28349633 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaaacaatactaa 28349731  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  28349732 ttaaatagttaagggaccaaaaacataattta 28349763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 37144070 - 37144151
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  37144070 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 37144151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 22338525 - 22338663
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gtta--atggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 97  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||  |   ||||||| ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22338525 tttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgacataccaaaataaatgaaattttaattaagggacgaaagcgatac 22338624  T
Q  98 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22338625 taattaattagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 22338663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050383
Alignment:
Q  10 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 108  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||  || || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| | ||| ||  |||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatag 43050411  T
Q  109 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  43050410 ttaagggaccaaaaagacaaattagcct 43050383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15326951 - 15326869
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  15326951 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaaaaactaaaaatgcaatttagcctaa 15326869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19543553 - 19543503
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  19543553 ttttaattaagggatcaaagcgatactaaataaatagttaagggacgaaaa 19543503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10625177 - 10625104
Alignment:
Q  64 aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10625177 aaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 10625104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 47251027 - 47250942
Alignment:
Q  6 attaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag-agacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47251027 attaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 23437404 - 23437494
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaag 91  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| | ||||   |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23437404 tttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 23437494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 40740044 - 40740094
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  40740044 ttttaattaagggaccaaagcgatactaaataaataattaagggactaaaa 40740094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 24446296 - 24446360
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24446296 ttttaattgtgggatcaaagcgatagtaattaaatagttaagggacaaaaataacaatttagcct 24446360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36720542 - 36720491
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  36720542 ttttagttaagggaccaaagcgataccaactaaatacttaagggactaaaaa 36720491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43705008 - 43704957
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43705008 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43704957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 47305379 - 47305490
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  ||| || |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  47305379 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggagcaaaacgatactaa 47305478  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
     |||||||||||    
T  47305479 ttaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36506942 - 36506848
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    |  | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36506942 aattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaaggatggaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaaacgatacta 36506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 45457099 - 45457149
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  45457099 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 24119961 - 24120002
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 46  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24119961 aattaaaattaacagaaagaaccaaaatatgtaacagagaga 24120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42287372 - 42287324
Alignment:
Q  74 ttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  42287372 ttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 42287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52915086 - 52914950
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  52915086 tttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 52914987  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52914986 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 52914950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29864310 - 29864175
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  29864310 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 29864211  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  29864210 ctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 29864175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40067482 - 40067347
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||     
T  40067482 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatattac 40067383  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40067382 ctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcct 40067347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 21218099 - 21218233
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21218099 tttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 21218198  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21218199 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 21218233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32384787 - 32384653
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||     
T  32384787 tttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactac 32384688  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32384687 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 32384653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9010639 - 9010503
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  9010639 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 9010540  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9010539 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9010503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 29864427 - 29864559
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  29864427 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 29864526  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29864527 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 29864559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1157458 - 1157589
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  1157458 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 1157557  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1157558 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 1157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21217981 - 21217846
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21217981 tttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 21217882  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21217881 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 21217846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25218218 - 25218095
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  25218218 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattac 25218119  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  25218118 ctaaatagttaagggaccaaaaat 25218095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54136225 - 54136090
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  54136225 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 54136126  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54136125 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54136090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 9010757 - 9010892
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  9010757 tttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagagatactac 9010856  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9010857 ctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 9010892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 12381306 - 12381441
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |      
T  12381306 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatgaaagcgatattgc 12381405  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  12381406 ctaaatagtttagggaccaaaaatacaattaagcct 12381441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46200610 - 46200483
Alignment:
Q  9 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 108  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  46200610 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 46200511  T
Q  109 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46200510 ttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 46200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 52915195 - 52915333
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  52915195 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatactac 52915294  T
Q  101 ctaaatagttaagggac--taaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  52915295 ctaaatagttaagggacaaaaaaaatgcaatttagccta 52915333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10014598 - 10014465
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  10014598 tttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaagcaatactac 10014500  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10014499 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10014465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10021739 - 10021606
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  10021739 tttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaagcaatactac 10021641  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10021640 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10021606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27347731 - 27347597
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27347731 tttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactat 27347632  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27347631 ctaaatagtcaagggaccaaaaatataatttagcc 27347597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33625998 - 33625868
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33625998 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 33625899  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33625898 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 33626120 - 33626250
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33626120 aattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaa 33626219  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33626220 atagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 33626250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 53645585 - 53645463
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53645585 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagggaccaaagcgatactat 53645486  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  53645485 ctaaatagttaagggacaaaaaa 53645463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 43317135 - 43317267
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43317135 aattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 43317234  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  43317235 atagttaggagactaaaaatgcaatttagccta 43317267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2739014 - 2738883
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  2739014 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 2738915  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2738914 ttaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 2738883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 44432876 - 44433011
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  44432876 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagtgatactat 44432975  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  44432976 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 44433011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 45911830 - 45911961
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  45911830 aattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaa 45911929  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45911930 atagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 45911961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33882201 - 33882331
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33882201 tttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 33882300  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33882301 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34958965 - 34958832
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  34958965 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagttaa-ggaacaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 34958867  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34958866 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 34958832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25058967 - 25058830
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  25058967 tttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 25058868  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  25058867 ctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatttaacctaa 25058830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43317013 - 43316877
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  43317013 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 43316914  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43316913 cttaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcctaa 43316877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4966005 - 4965889
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  4966005 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggagcaaagcgatactac 4965906  T
Q  101 ctaaatagttaagggac 117  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4965905 ctaaatagttaaaggac 4965889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25218336 - 25218448
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  25218336 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacgatactac 25218435  T
Q  101 ctaaatagttaag 113  Q
    |||||||||||||    
T  25218436 ctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 37515728 - 37515836
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37515728 gaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaa 37515827  T
Q  124 tacaattta 132  Q
    || ||||||    
T  37515828 taaaattta 37515836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 18862696 - 18862827
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18862696 aattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaagcgatactaccta 18862795  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18862796 aatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18862827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45911713 - 45911582
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  45911713 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 45911614  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  45911613 ctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 45911582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 46621183 - 46621310
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  46621183 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaa 46621282  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46621283 atagttaagggaccaaaaatgcaattta 46621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 48210082 - 48209947
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  48210082 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 48209983  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  48209982 ctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 48209947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 25593347 - 25593477
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  ||||    
T  25593347 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatactccctaa 25593446  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25593447 atagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 25593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 40067600 - 40067734
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  40067600 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 40067699  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40067700 ctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcc 40067734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44710537 - 44710403
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||||| || |||||||||||||     
T  44710537 tttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaatttttgttaagagaccaaagcgatactac 44710438  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44710437 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45683251 - 45683117
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  45683251 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatactac 45683152  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||    
T  45683151 ctaaatagttaagagatcaaaaatgtaatttagcc 45683117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46621061 - 46620931
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||     
T  46621061 tttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatactac 46620962  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46620961 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 46620931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 54191855 - 54191969
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54191855 aaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgctatctaaatagttaagggacca 54191954  T
Q  120 aaaatacaatttagc 134  Q
    |||||||||||||||    
T  54191955 aaaatacaatttagc 54191969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38866532 - 38866395
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  38866532 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaatggaccaaagcgatactac 38866433  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38866432 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 38866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22830931 - 22830795
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22830931 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagctatacta 22830832  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22830831 gcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattcagcct 22830795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 27347849 - 27347985
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  27347849 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatactac 27347948  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  27347949 ctaaatagttaaggaacataaaatgcaattaagccta 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29970326 - 29970196
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29970326 tttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagttaatg-accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatactac 29970228  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29970227 ctaaatagttatgggaccaaaaatgcaattta 29970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 45683369 - 45683503
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||||| ||| ||     
T  45683369 tttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaaggaaccaaagcaatattac 45683468  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45683469 ctaaatagttaaggaaccaaaaatacaatttagcc 45683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 28570673 - 28570806
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  28570673 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccac 28570772  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  28570773 ctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 28570806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 8246998 - 8247129
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||     
T  8246998 tttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagaaatattac 8247097  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8247098 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 8247129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34959083 - 34959214
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||     
T  34959083 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgataatac 34959182  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  34959183 ctaaatagttaagggaccaaaattgcaattta 34959214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1205629 - 1205763
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| || ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||      
T  1205629 tttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaagggacaaaaataaatcgaattttaattaagggagaaaagcgatactgc 1205728  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1205729 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1205763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44710655 - 44710785
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||     
T  44710655 tttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaaacgatactac 44710754  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
     |||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  44710755 ataaatacttaagggatcaaaaatgcaattt 44710785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 46535656 - 46535523
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |  ||| |||   ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  46535656 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgaacgaga-agaaactaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 46535558  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46535557 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 46535523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 43969779 - 43969916
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  43969779 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaagggaccaaagtaaatcgaattttaatcaagggatcaaaacgatactac 43969878  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  43969879 ataaatagttaacgaaccaaaaataaaatttagcctaa 43969916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1157340 - 1157206
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt---taatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| ||||||||| ||||  | |||||||||||| | ||||||||||     
T  1157340 tttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaggaaccaaagcgatat 1157241  T
Q  98 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1157240 tacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 1157206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8751417 - 8751289
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||    
T  8751417 aattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaattatactacctaa 8751318  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  8751317 atagttaaaggaccaaaaatgcaatttag 8751289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25977903 - 25977771
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || |||||||||| ||     
T  25977903 tttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaagcgatagtac 25977804  T
Q  101 ctaaatagttaaggga-ctaaaaatacaattta 132  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25977803 ctagatagttaagggaccaaaaaatacaattta 25977771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 32385068 - 32385199
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32385068 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggat-aaagcgatactacctaa 32385166  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32385167 atagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32385199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1205483 - 1205381
Alignment:
Q  29 aaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 128  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  1205483 aaatgtgtaacagagaaa-gttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaa 1205385  T
Q  129 ttta 132  Q
    ||||    
T  1205384 ttta 1205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 4793851 - 4793981
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  4793851 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatactac 4793950  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  4793951 ctaaata-ataaggggtcaaaaatacaattta 4793981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24504074 - 24503939
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaa-ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | | |||| | ||||||    
T  24504074 tttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaaccaaaacaatacta 24503975  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24503974 cctaaataattaagggattaaaaatgcaatttagcc 24503939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 24504192 - 24504315
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||| ||||| ||     
T  24504192 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaaacgatattac 24504291  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  24504292 ctaaatagttaagggaccaaaaat 24504315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8246901 - 8246769
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  8246901 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatattat 8246803  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  8246802 ctaaataattaa-ggaccaaaaatacaatttagcc 8246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 11102226 - 11102364
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  11102226 tttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatacta 11102325  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11102326 attaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 11102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 38866657 - 38866783
Alignment:
Q  7 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaag-aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||| |||||    
T  38866657 ttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaaataaatcgaattttaattagagtaccaaagcgatactacctaaa 38866756  T
Q  106 tagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38866757 tagttaaggaatcaaaaatacaattta 38866783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 46200737 - 46200871
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  46200737 tttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgttactac 46200836  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  46200837 ctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 46200871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21051493 - 21051360
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||  ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||     
T  21051493 tttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaagagatcaaagcgatgctac 21051394  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21051393 ctaaataattaagggacaaaaaatgtaatttagc 21051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 46535778 - 46535907
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||| ||||| ||||||| | |||| || |||||||||  ||| |||| | |||||| ||||    
T  46535778 aattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaaggaccaagataaatagaattttaattagaggaccaaaacaatactacctaa 46535877  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46535878 atagttaagtgaccaaaaatacaatttagc 46535907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 10014716 - 10014851
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||     
T  10014716 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatacgatactac 10014814  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10014815 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10014851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 10021857 - 10021992
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||     
T  10021857 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatacgatactac 10021955  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10021956 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10021992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22831049 - 22831181
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831049 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatacta 22831148  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22831149 gcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattta 22831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44170114 - 44169978
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   || |||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44170114 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagcgatacta 44170015  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44170014 attaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44169978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 54191722 - 54191638
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  54191722 tttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga 54191638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 4966120 - 4966257
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||  |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |     
T  4966120 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagagacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaaacgataccac 4966219  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||    
T  4966220 ctaaatagttaaggggcaagaaatgcaatttaccctaa 4966257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 11242740 - 11242849
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||||| |||| || |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11242740 accaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 11242839  T
Q  125 acaatttagc 134  Q
      ||||||||    
T  11242840 gtaatttagc 11242849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15985601 - 15985469
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15985601 tttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatacta 15985502  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     | ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15985501 gcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 15985469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9657744 - 9657667
Alignment:
Q  58 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9657744 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44428705 - 44428616
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  44428705 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 44428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 21885076 - 21885178
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21885076 tttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagtgaccaaagcgatactat 21885175  T
Q  101 cta 103  Q
    |||    
T  21885176 cta 21885178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 44170288 - 44170370
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  44170288 accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagtctaa 44170370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 54136343 - 54136474
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| | || |||     
T  54136343 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaacagaa----gttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaaaggatcaaaacaattctac 54136438  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  54136439 ctaaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagcct 54136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44428594 - 44428512
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  44428594 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 44428512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 21051599 - 21051688
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  21051599 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 21051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 9657899 - 9658034
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||  | ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9657899 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaggggaccaaaacgatacta 9657997  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9657998 attaaatagttaagggatcaaaaatataatttagcct 9658034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43969611 - 43969556
Alignment:
Q  78 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43969611 ttaagggaccaaagcaatactacataaataattaagggaccaaaaatacaatttag 43969556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28504640 - 28504590
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  28504640 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 41610528 - 41610578
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  41610528 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 41610578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46307619 - 46307569
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  46307619 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 46307569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017815
Alignment:
Q  94 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10017815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42779654 - 42779573
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 82  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| |  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  42779654 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattttaattaag 42779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43969640 - 43969599
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  43969640 aaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37515634 - 37515550
Alignment:
Q  29 aaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaag 113  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||  | |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37515634 aaatgtgtaacgaagagaagttaagggacaaaaataaattaaattttaattaaaggatcaacgggatactacctaaatagttaag 37515550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1826043 - 1826174
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  1826043 tttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 1826142  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1826143 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1826174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1860488 - 1860619
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  1860488 tttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 1860587  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1860588 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1860619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 23244767 - 23244904
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23244767 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaactaagggaccaaagcgatactat 23244866  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23244867 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatctaacctaa 23244904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 24456904 - 24457041
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  24456904 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaggcgatactac 24457003  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24457004 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 24457041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 37393729 - 37393866
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  37393729 tttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactac 37393828  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37393829 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagtctaa 37393866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37393611 - 37393475
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  37393611 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 37393512  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37393511 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 37393475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 3869201 - 3869336
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  3869201 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaaaaaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 3869300  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3869301 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 3869336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18017924 - 18017787
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  18017924 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtgaccaaagcaatactac 18017825  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18017824 ctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagcctaa 18017787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30872913 - 30872781
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  30872913 aattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactacctaa 30872814  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30872813 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 30872781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 35224019 - 35224155
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  35224019 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatactaa 35224118  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35224119 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35224155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40040296 - 40040162
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  40040296 tttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaattttaattaaggtaccaaagcgatactac 40040197  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40040196 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 11198461 - 11198594
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11198461 aattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaa 11198560  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11198561 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11198594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5416946 - 5416810
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||     
T  5416946 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaaatcaatcgaattttaattagaggaccaaaacgatactac 5416847  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5416846 ctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 5416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31230747 - 31230624
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  31230747 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 31230648  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  31230647 ctaaatagttaagggaccaaaaat 31230624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 14920666 - 14920792
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  14920666 gaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactactta 14920765  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||    
T  14920766 aatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18621999 - 18622133
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18621999 tttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactat 18622098  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  18622099 ctaaatagttaagagaccaaaagtgcaatttagcc 18622133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 21515452 - 21515586
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21515452 tttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 21515551  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21515552 gtaaatagttaaaagactaaaaatgtaatttagcc 21515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31230865 - 31230999
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  31230865 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcaatactac 31230964  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31230965 ctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31230999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30650320 - 30650187
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  30650320 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaa 30650221  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30650220 atagttagaggactaaaaatgcaatttagcctaa 30650187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 119250 - 119119
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  119250 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaagtaatactac 119152  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  119151 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 119119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11639186 - 11639050
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||     
T  11639186 tttgaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgacgctac 11639087  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11639086 ctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagccta 11639050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35223908 - 35223772
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||     
T  35223908 tttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtcaagggaccaaagcgatactac 35223809  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35223808 ctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35223772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6843627 - 6843493
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtta--atggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatct 102  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  6843627 aattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcatagtgatactacct 6843528  T
Q  103 aaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  6843527 aaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 6843493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 18018042 - 18018169
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||  ||||    
T  18018042 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggagcaaagcaatacttcctaa 18018141  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18018142 atagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40032557 - 40032426
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  40032557 aattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaagagaccaaagcgatactaccta 40032458  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40032457 aataattaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 40032426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18914503 - 18914637
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  | |||||| |||     
T  18914503 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacaagagcgatgctac 18914602  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18914603 ctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 18914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Original strand, 29027244 - 29027358
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  29027244 accaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 29027343  T
Q  125 acaatttagcctaac 139  Q
    | |||||||||||||    
T  29027344 ataatttagcctaac 29027358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39912051 - 39911917
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  39912051 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagcgaccaaagagataatat 39911952  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  39911951 ctaaataattaagggacaaaaaatgcaaattagcc 39911917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 40094608 - 40094487
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40094608 ttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacc 40094509  T
Q  102 taaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40094508 taaatagttaagggacaaaaaa 40094487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8654070 - 8653935
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  8654070 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 8653971  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8653970 ctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 8653935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26736259 - 26736128
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | ||||||  |||||| |||||||||||||     
T  26736259 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaattttaaaaaagggaccaaagcgatactac 26736160  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26736159 ctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 26736128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39240164 - 39240031
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||     
T  39240164 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactac 39240065  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39240064 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 39240031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 7041881 - 7042012
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||     |||||| ||||||||||||||    
T  7041881 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt-----aagggaccaaagcgatactat 7041975  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7041976 ataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7042012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 30568528 - 30568660
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  30568528 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaaataagggaccaaatcgatactaa 30568627  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30568628 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 30568660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1825943 - 1825809
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || || | ||||||||||| ||||||| |||| ||      
T  1825943 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataa-tcaaattttaattaagagatcaaaacgatgctcc 1825845  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1825844 ttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1860388 - 1860254
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| || || | ||||||||||| ||||||| |||| ||      
T  1860388 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataa-tcaaattttaattaagagatcaaaacgatgctcc 1860290  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860289 ttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1860254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7041744 - 7041653
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagtta 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7041744 aaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14920545 - 14920410
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| | ||||||     
T  14920545 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgaccaaaacaatactac 14920446  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  14920445 ctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattaagcct 14920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 39912171 - 39912294
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  39912171 tttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 39912270  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  39912271 ctaaatagttaagggaccaaaaat 39912294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24456815 - 24456733
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24456815 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 24456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21512531 - 21512411
Alignment:
Q  16 acataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21512531 acataaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgatact-cctaaatagttaaggg 21512433  T
Q  116 actaaaaatacaatttagccta 137  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21512432 acgaaaaatacaatttagccta 21512411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44254999 - 44254862
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  44254999 tttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 44254900  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||    
T  44254899 ttaaatagttaaggatccaaaaatgcaatttagtctaa 44254862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16645797 - 16645931
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacaga---gagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 97  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| ||   |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  16645797 tttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgatgagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaatac 16645896  T
Q  98 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16645897 tacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33542518 - 33542383
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33542518 tttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaaggagagaga-gttaaaataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaagcgatacta 33542420  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
      ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33542419 attaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcct 33542383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 8654188 - 8654319
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | ||| ||     
T  8654188 tttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggagcaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacaatattac 8654287  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8654288 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 9495275 - 9495406
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||| ||||||     
T  9495275 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaactttaattaacggaccaaagcaatactac 9495374  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9495375 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23244649 - 23244518
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||||     
T  23244649 tttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatactac 23244550  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||| ||||  |||| |||||| |||||||    
T  23244549 ataaatggttagtggaccaaaaatgcaattta 23244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 39240271 - 39240402
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||| || |||| ||||||||     
T  39240271 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaaacgatactac 39240370  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  39240371 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 39240402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 44255114 - 44255249
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | || | |     
T  44255114 tttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacaatcccac 44255213  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  44255214 ctaaatagttaaaggatcaaaaatacattttagcct 44255249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 119368 - 119502
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| | | |||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  119368 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattttaattaagggactaaagcgatactac 119467  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  119468 ctaaatagttaagggatcaacaatgcaatttagcc 119502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 758596 - 758733
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||     
T  758596 tttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaaggaccaaagtgatactac 758695  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  758696 ttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcctaa 758733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 12873300 - 12873435
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||  |||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  12873300 tttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgatactaa 12873397  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12873398 ttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 12873435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Original strand, 40032706 - 40032815
Alignment:
Q  27 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac-taaaaata 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  40032706 caaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaagggacaaaaaaata 40032805  T
Q  126 caatttagcc 135  Q
    ||||||||||    
T  40032806 caatttagcc 40032815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 758455 - 758347
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  758455 gaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaa 758356  T
Q  124 tacaattta 132  Q
    | |||||||    
T  758355 tgcaattta 758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 6844715 - 6844823
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  6844715 gaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctacctaaatagttaagagaccaaaaa 6844814  T
Q  124 tacaattta 132  Q
    | |||||||    
T  6844815 tgcaattta 6844823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36344095 - 36343960
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||   ||||||     
T  36344095 tttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaaggaccaaaattaatcgaattttaattaagggaccaaaataatactac 36343996  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  36343995 ctaaataattaa-gaaccaaaaatacaatttagccta 36343960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 26736377 - 26736492
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  26736377 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtatcgaagagaagttaaaggaccacaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcaatactat 26736476  T
Q  101 ctaaatagttaaggga 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  26736477 ctaaatagttaaggga 26736492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 28207005 - 28207142
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28207005 tttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaac-gatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtcaaagcgatacta 28207103  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     | ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28207104 gcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcctaa 28207142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3869081 - 3868946
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatat---gtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 97  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  3869081 tttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatac 3868982  T
Q  98 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||  |||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  3868981 tacataaatagttaagggatcaaaagtgcaatttag 3868946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18914394 - 18914262
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcg-agttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||||||||     
T  18914394 tttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttttaattaaagaaccaaagcgatactt 18914295  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18914294 t-----tagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 18914262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40094727 - 40094864
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |  |||||     
T  40094727 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacagtactaa 40094826  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  40094827 ttaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgcctaa 40094864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12873191 - 12873055
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  12873191 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaaggaccaaagtgatactaa 12873092  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  12873091 ttaaatagttaagggattaaaatcataatttagccta 12873055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44678396 - 44678316
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44678396 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 44678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28206900 - 28206766
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||   ||||   ||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28206900 tttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaac-gatagaaaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagggaccaaagcgatacta 28206802  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  28206801 gcaaaatagttatgggaccaaaaattcaatttagcc 28206766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29027103 - 29026971
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |  ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  29027103 gaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactaccta 29027004  T
Q  104 aa----tagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  29027003 aatagctagttaagggaccaaaaatgcaattta 29026971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 33542636 - 33542731
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||||||    
T  33542636 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaattttaattaaatgaccaaagcgata 33542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 44678436 - 44678515
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 80  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44678436 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatta 44678515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 5417065 - 5417197
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagaga-gacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || ||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5417065 tttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaac-gagaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatacta 5417163  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5417164 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcagtttag 5417197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 30873030 - 30873166
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||   ||||||     
T  30873030 tttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggaatcaaactaatactac 30873129  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30873130 caaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagccta 30873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 133
Target Start/End: Original strand, 44678518 - 44678596
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44678518 ggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaac-aaaaatacaatttag 44678596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 410614 - 410729
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||     
T  410614 tttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaaacgatactaa 410713  T
Q  101 ctaaatagttaaggga 116  Q
      ||||||||||||||    
T  410714 taaaatagttaaggga 410729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5525952 - 5525882
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||| |||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5525952 ggactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggactaaaaat 5525882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35486005 - 35485868
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||||||  ||||||||| ||     
T  35486005 tttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaagggactaaagcgatattaa 35485906  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     | |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  35485905 ttgaatagttaagggatcaaaaacataatttagcctaa 35485868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30568410 - 30568331
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 80  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30568410 tttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 30568331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 35486186 - 35486243
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  35486186 ttttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaat 35486243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 40040414 - 40040475
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 62  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40040414 tttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaa 40040475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 11639378 - 11639422
Alignment:
Q  92 cgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11639378 cgatactacctaaatagttaagggacgaaaaatgcaatttagcct 11639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26217199 - 26217072
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||| ||  ||||  |||||||  |||    
T  26217199 aattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaagggccaaaatgatactacttaa 26217101  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26217100 atagttaagggaccaaaaaaataatttag 26217072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 7117111 - 7117162
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  7117111 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 7117162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43633186 - 43633135
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43633186 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43633135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9495166 - 9495106
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 61  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  9495166 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagttaagagaccaaa 9495106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 9630797 - 9630849
Alignment:
Q  73 tttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaata 125  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9630797 tttaattaaggaattaaaatgatactacctaaatagttaaaggactaaaaata 9630849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32733845 - 32733765
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 81  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32733845 tttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 32733765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 132
Target Start/End: Original strand, 36344260 - 36344344
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  36344260 gttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaagcaatactacctaaatagttaaaggataaaaaatgcaattta 36344344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Original strand, 45436434 - 45436549
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggacc--aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||| |  |||| |||||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||| ||    
T  45436434 gaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaagggacccaaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggacaaa 45436533  T
Q  121 aaatacaatttagcct 136  Q
    ||||  ||||||||||    
T  45436534 aaatgtaatttagcct 45436549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9174035 - 9173901
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||     
T  9174035 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactac 9173936  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9173935 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9173901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 33545074 - 33545211
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  33545074 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgatactac 33545173  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  33545174 ctaaatagttaatgcaccaaaaatataatttagcctaa 33545211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3338611 - 3338475
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  3338611 tttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 3338512  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3338511 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 3338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25551481 - 25551346
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||     
T  25551481 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaagggaccaaagcaatactac 25551382  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25551381 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 25551346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 25551588 - 25551719
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  25551588 tttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatactac 25551687  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25551688 ttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 25551719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33329340 - 33329205
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  33329340 tttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactac 33329241  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33329240 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcct 33329205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35132735 - 35132600
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  35132735 tttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattatgggaccaaagcgatactac 35132636  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35132635 ctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 35132600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 6220308 - 6220441
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||     
T  6220308 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattgatggaccaaagcgatactac 6220407  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6220408 ctaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagc 6220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3289064 - 3288929
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  3289064 tttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 3288965  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  3288964 ctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcct 3288929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24605008 - 24604878
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  24605008 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagt-aagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 24604910  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24604909 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33544956 - 33544825
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  33544956 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactac 33544857  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33544856 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33544825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 35119063 - 35119174
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  35119063 tttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 35119162  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  35119163 ctaaatagttaa 35119174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11524899 - 11524778
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  11524899 tttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 11524800  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  11524799 ctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29010088 - 29009956
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  29010088 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 29009989  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29009988 gtaaatagttaagggaccaaaaattcaatttag 29009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 3289162 - 3289296
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||     
T  3289162 tttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggcaccaaagcgatattac 3289261  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  3289262 ctaaatagtttagggaccaaaaatgcaatttagcc 3289296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12903355 - 12903221
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12903355 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactat 12903256  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  12903255 ctaaataattaaagaaccaaaaatacaatttagcc 12903221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14337036 - 14336902
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  14337036 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactag 14336937  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  14336936 ctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcc 14336902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 3338732 - 3338862
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  3338732 gaattaaaactaacgaaa--gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaacgatactactta 3338829  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3338830 aatagttaagggaccaaaaataaaatttagcct 3338862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6220190 - 6220059
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||||||||| ||     
T  6220190 tttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagacgaaagcgatattaa 6220091  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6220090 ttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 6220059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7537857 - 7537992
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |     
T  7537857 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacaaaagcgataccac 7537956  T
Q  101 ctaaatagttaagggac-taaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7537957 ttaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttagcc 7537992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 24605126 - 24605248
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  24605126 tttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatcgatactac 24605224  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  24605225 ctaaatagttaagggaccaaaaat 24605248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31029658 - 31029527
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  31029658 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 31029559  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  31029558 ctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 31029527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33346612 - 33346501
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33346612 tttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 33346513  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  33346512 ctaaatagttaa 33346501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1158724 - 1158599
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacat--aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 98  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1158724 tttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatact 1158625  T
Q  99 atctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||    
T  1158624 acctaaatagttaaaggaccaaaaat 1158599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 19135702 - 19135836
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19135702 aattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagatcaaaacgatactacctaa 19135801  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 139  Q
    ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19135802 atacttaatggaccaaaaatgcaatttagcctaac 19135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31029776 - 31029910
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||    
T  31029776 tttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggactaaaacaatactat 31029875  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31029876 ttaaatggttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31029910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2949425 - 2949293
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  2949425 tttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaacaaag-----ttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 2949331  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  2949330 ttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagcctaa 2949293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14337154 - 14337288
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  14337154 tttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagtgatactac 14337253  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14337254 ctaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 14337288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1860738 - 1860871
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  1860738 tttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagagatac-ac 1860836  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1860837 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1860871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11524792 - 11524706
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11524792 gttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagc 11524706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24548493 - 24548615
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  24548493 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagtgatactaa 24548592  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  24548593 ttaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32283134 - 32283026
Alignment:
Q  27 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 126  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||     
T  32283134 caaaatgtgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatat 32283035  T
Q  127 aatttagcc 135  Q
    |||||||||    
T  32283034 aatttagcc 32283026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 33548180 - 33548244
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33548180 ttttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaattcaatttagcct 33548244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 2814563 - 2814698
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||||     
T  2814563 tttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatactaa 2814662  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  2814663 ttaaatagttaagagaccaaaaacataatttggcct 2814698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 11525022 - 11525152
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  || | |||||  |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  11525022 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaggaaa-gttaagagaccaaaataaattgaattttaaataagggaccaaaccgatactacctaa 11525120  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11525121 attgttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 11525152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13155973 - 13155842
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  13155973 tttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 13155874  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13155873 ctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13155842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13160829 - 13160698
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  13160829 tttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 13160730  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13160729 ctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 29010206 - 29010341
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||  ||  || ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||     
T  29010206 tttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggggccaaaataaatcgaattttagttaagggaccacagcgatactac 29010305  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  29010306 ataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaatttagcct 29010341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 1158843 - 1158978
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||     
T  1158843 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaagggaccaaaataaatcaaattt-aattaagggaccaaagcgatactac 1158940  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  1158941 ttaaatagttaaggtaccaaaaatgcaagttagcctaa 1158978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 33972458 - 33972547
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  33972458 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 33972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 35132853 - 35132977
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||           ||||||| ||||||| |||||     
T  35132853 tttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataaat-----------taagggaccaaagcggtactac 35132941  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35132942 ctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagcct 35132977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Original strand, 2949544 - 2949632
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2949544 ttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 2949632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 29999655 - 29999767
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  29999655 tttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatactaa 29999754  T
Q  101 ctaaatagttaag 113  Q
     ||||||||||||    
T  29999755 ttaaatagttaag 29999767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13156091 - 13156209
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||     ||||||     
T  13156091 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atactac 13156185  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  13156186 ctaaatagttaagggacaaaaaat 13156209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13160947 - 13161065
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||     ||||||     
T  13160947 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-----atactac 13161041  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  13161042 ctaaatagttaagggacaaaaaat 13161065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2315713 - 2315601
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2315713 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagcgaccaaagcgatacta 2315615  T
Q  100 tctaaatagttaag 113  Q
      ||||||||||||    
T  2315614 attaaatagttaag 2315601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24548375 - 24548241
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||| |||||    ||||||||||||    
T  24548375 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaactaaggctcaaaagcgatacta 24548277  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24548276 attaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24548241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33971991 - 33971931
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33971991 ttttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33971931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Original strand, 17245624 - 17245711
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17245624 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 17245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31754338 - 31754207
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||  |||| |||| || ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  31754338 tttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagagattaaaataaatagaattttaattaagagaccaaaacgattctat 31754239  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||  |||||||| || ||||||| ||||||    
T  31754238 ataatcagttaaggaacaaaaaatataattta 31754207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12903463 - 12903569
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | | || |||||| ||||| | | ||||| || |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  12903463 tttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaaggaatcaaaataattcgaattttaattaaaggaccaaagggatactac 12903562  T
Q  101 ctaaata 107  Q
    |||||||    
T  12903563 ctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 17544705 - 17544840
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |  | ||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  17544705 tttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaacgataga-aaatcaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatatta 17544803  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17544804 gcaaaatagttacgggac-aaaaatgcaatttaaccta 17544840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 33329458 - 33329514
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggac 57  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  33329458 tttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggac 33329514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3618844 - 3618793
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3618844 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 3618793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 6229687 - 6229772
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  6229687 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagtta-gggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 6229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17544529 - 17544457
Alignment:
Q  59 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17544529 aaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaagggac-aaaaatgcaattta 17544457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 33972338 - 33972293
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 46  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33972338 tttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagaga 33972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33548160 - 33548124
Alignment:
Q  102 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33548160 taaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 33548124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 13354429 - 13354566
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13354429 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactac 13354528  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13354529 ctaaatagttaagggaccaaaattacaatttagcctaa 13354566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5961803 - 5961668
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5961803 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaatttttaattatgggatcaaagcgatactac 5961704  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5961703 ctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcct 5961668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31450800 - 31450665
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  31450800 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatactac 31450701  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31450700 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31450665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41377488 - 41377354
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  41377488 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 41377389  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41377388 ctaaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcct 41377354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43183717 - 43183585
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  43183717 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagcgatactac 43183618  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43183617 ctaaatagttaagggactaaaaatgtaatttag 43183585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 4104411 - 4104545
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4104411 tttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactac 4104510  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4104511 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 4104545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 20908763 - 20908897
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||     
T  20908763 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactac 20908862  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20908863 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 20908897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21470429 - 21470292
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||      
T  21470429 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactgc 21470330  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  21470329 ctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcctaa 21470292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39912762 - 39912630
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39912762 tttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 39912663  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39912662 cctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13354311 - 13354176
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  13354311 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 13354212  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13354211 ctaaatagttaagggaccgaaaattcaatttagcct 13354176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 28203112 - 28203247
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  28203112 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacgac 28203211  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28203212 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 28203247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4104293 - 4104159
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  4104293 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagataccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 4104194  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4104193 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4104159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 27476620 - 27476754
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  27476620 ttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacc 27476719  T
Q  102 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27476720 taaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcct 27476754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16736216 - 16736100
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16736216 aaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacca 16736117  T
Q  120 aaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16736116 aaaatgcaatttagcct 16736100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27132645 - 27132509
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  27132645 tttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 27132546  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27132545 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 27132509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 25642520 - 25642655
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  25642520 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 25642619  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25642620 ctaaatagttaagggaacaaaaatacaatttagcct 25642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4120898 - 4120764
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||     
T  4120898 tttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttgattaagggaccaaagcgatactac 4120799  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4120798 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 4120764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16655740 - 16655610
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||     
T  16655740 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaatgatactac 16655641  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16655640 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 16655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 37412830 - 37412964
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  37412830 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaatgcgatactac 37412929  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  37412930 ttaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcc 37412964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12303919 - 12303786
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  12303919 tttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaagcgatactac 12303820  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12303819 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 12303786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16261004 - 16260872
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  16261004 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaaggaccaaaa-aaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 16260906  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16260905 ctaaatagttaagggaccaaaaatgctatttagc 16260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 34820535 - 34820668
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  34820535 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgagactacctaa 34820634  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34820635 atagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 34820668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18565200 - 18565064
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||      
T  18565200 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagcgatactgc 18565101  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  18565100 ctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 18565064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 38275707 - 38275842
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg--ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38275707 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttacgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgatact 38275806  T
Q  99 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38275807 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 38275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39454585 - 39454449
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  39454585 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 39454486  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39454485 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 39454449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 28631526 - 28631657
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  28631526 tttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagagagcaaagcgatactac 28631625  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28631626 ccaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 28631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37744640 - 37744771
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37744640 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactat 37744739  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  37744740 ctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 37744771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 27132762 - 27132896
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||     
T  27132762 tttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatcgacactac 27132861  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27132862 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27132896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27883602 - 27883468
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||     
T  27883602 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatattac 27883503  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27883502 ttaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 27883468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31450918 - 31451052
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  31450918 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaatcgatactac 31451017  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  31451018 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 31451052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 32933847 - 32933977
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| || ||||    
T  32933847 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttatttaaaggaccaaagcgatattacctaa 32933946  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32933947 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32933977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34820413 - 34820283
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||     
T  34820413 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaaggaaccaaagcgatactac 34820314  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34820313 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34820283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 41377606 - 41377740
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||     
T  41377606 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaagtgatactac 41377705  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41377706 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 41377740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41659879 - 41659745
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  41659879 tttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 41659780  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41659779 ttaaatagttaagggacaaaaaatataatttagcc 41659745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25642402 - 25642273
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | | |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  25642402 tttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactac 25642303  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642302 ttaaatagttaagggactaaaaatacaatt 25642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28202993 - 28202860
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |    
T  28202993 ttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacc 28202894  T
Q  102 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28202893 taaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28202860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 36442386 - 36442519
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36442386 tttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaataaattaaattttaattaaaggatcaaagcaatactat 36442485  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36442486 ctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagc 36442519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 5921638 - 5921774
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5921638 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggaacaaaaaaaaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactat 5921737  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5921738 ataaatagttaagggatcaaaaacacaatttagccta 5921774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 12304406 - 12304542
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  12304406 tttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 12304505  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12304506 ctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 12304542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32933725 - 32933589
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||     
T  32933725 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagggatcaaagtgatactac 32933626  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32933625 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32933589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 43183835 - 43183971
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  43183835 tttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 43183934  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  43183935 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 43183971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 16261122 - 16261257
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  16261122 tttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatactac 16261221  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16261222 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 16261257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 21470551 - 21470669
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21470551 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga-ccaagcgatactacctaa 21470649  T
Q  105 atagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21470650 atagttaagggactaaaaat 21470669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17856333 - 17856199
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  17856333 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 17856234  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  17856233 ctaaataattaagggaccgaaaatgaaatttagcc 17856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 16736352 - 16736484
Alignment:
Q  3 tgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatct 102  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||    
T  16736352 tgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaagggactacagcgatacaacct 16736451  T
Q  103 aaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16736452 aaacagttaagggaccaaaagtgcaatttagcc 16736484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34127817 - 34127948
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  34127817 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaa-tgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaactttagttaagggaccaaagcgatactac 34127915  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34127916 ttaaatagttaagggtccaaaaatacaatttag 34127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 35408773 - 35408909
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||     
T  35408773 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaagcgatactaa 35408872  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  35408873 ttaaatagttaatggaccaaaaacataatttagccta 35408909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37412727 - 37412595
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| || ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  37412727 tttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactaa 37412628  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37412627 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45389265 - 45389129
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||     
T  45389265 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgacactac 45389166  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  45389165 ctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagccta 45389129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20908645 - 20908510
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  20908645 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatactac 20908546  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20908545 ctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 20908510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38275611 - 38275480
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  38275611 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcaatactac 38275512  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38275511 ataaatagttaagggatcaaaaatacaattta 38275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 39912878 - 39913017
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39912878 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagtgatacta 39912977  T
Q  100 tct-aaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39912978 cctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 39913017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 10833291 - 10833421
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  10833291 aattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattgagggactaaagcgatactacctaa 10833390  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10833391 atagctaagggaccaaaaatgcaattcagcc 10833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Original strand, 18565276 - 18565386
Alignment:
Q  22 aggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18565276 aggaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaa 18565375  T
Q  122 aatacaattta 132  Q
    ||| |||||||    
T  18565376 aatgcaattta 18565386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 44612735 - 44612871
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44612735 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactat 44612834  T
Q  101 --ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
       ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  44612835 acgtaaatagttaa-ggaccaaacatgcaatttagcct 44612871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 16655877 - 16655994
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16655877 aaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggacca 16655976  T
Q  120 aaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16655977 aaaatacaatttaaccta 16655994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27476501 - 27476369
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27476501 tttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaagcgatacta 27476402  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27476401 cctaaatagtctagggaccaaaaatacaattta 27476369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 39150077 - 39150213
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||     
T  39150077 tttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggtacaaaagcgatactac 39150176  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  39150177 ctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagccta 39150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 4121015 - 4121146
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  4121015 tttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacgatactac 4121114  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4121115 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4121146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28631408 - 28631285
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  28631408 tttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatgctac 28631309  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  28631308 ctaaatagttaagggaccaaaaat 28631285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36211484 - 36211350
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | |||| |     
T  36211484 tttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacaatacaac 36211385  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  36211384 ctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 36211350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14877615 - 14877481
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  14877615 tttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaa--gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgatactac 14877518  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14877517 ctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagccta 14877481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36442263 - 36442130
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||  || |||| |||||||| ||||    
T  36442263 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaatttttattaatagaccaaaacgatactacctaa 36442164  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36442163 atagtgaagggaacaaaaatacaatttagcctaa 36442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44915873 - 44915737
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  44915873 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 44915775  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44915774 ttaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaacctaa 44915737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 17856445 - 17856577
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  17856445 aattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaccaatactacctaa 17856544  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17856545 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 17856577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 12304037 - 12304160
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||     
T  12304037 tttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacgaaagcgatactac 12304136  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12304137 ctaaatagttaagggaccaaaaat 12304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15137056 - 15137191
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| || |||||     
T  15137056 tttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcggtactac 15137155  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||    
T  15137156 ctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaatttagcct 15137191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 135
Target Start/End: Original strand, 36211698 - 36211785
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36211698 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttagcc 36211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34127700 - 34127570
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  || ||| |||||  ||| |||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34127700 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactat 34127601  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34127600 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 39454712 - 39454822
Alignment:
Q  28 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaataca 127  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  39454712 aaaatgtgtaacagagagaaattaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgca 39454811  T
Q  128 atttagcctaa 138  Q
    |||||| ||||    
T  39454812 atttagtctaa 39454822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 27883709 - 27883850
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  27883709 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 27883808  T
Q  101 ctaa----atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27883809 ctaaatatatagttaagggatcgaaaatgcaatttagcctaa 27883850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 32503792 - 32503920
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||| |||    
T  32503792 gaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaatcaatactaccta 32503891  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  32503892 aatagttaaaggactaagaatgcaattta 32503920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27914028 - 27913897
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||  | ||||||| ||||||  ||||||||||||     
T  27914028 tttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggactaaagcgatactaa 27913929  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  27913928 ttaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 27913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 33819648 - 33819781
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  33819648 tttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagtgatactac 33819746  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  33819747 ctaaacagttatgagac-aaaaatacaatttagcct 33819781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484414
Alignment:
Q  6 attaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaa 105  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  106 tagttaagggac 117  Q
    || |||||||||    
T  34484403 taattaagggac 34484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40694329 - 40694194
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| |||   ||| | ||||||| || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||     
T  40694329 tttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaattaagggactaaaacgatactac 40694230  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40694229 ctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 40694194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 40694427 - 40694538
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  40694427 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 40694526  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
    ||||||| ||||    
T  40694527 ctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15829854 - 15829733
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  15829854 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 15829755  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||| |||| ||| ||||    
T  15829754 ctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37744560 - 37744451
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37744560 gaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 37744461  T
Q  124 tacaatttag 133  Q
    |  |||||||    
T  37744460 tgtaatttag 37744451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Original strand, 11943764 - 11943855
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 116  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11943764 accaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaagtaccaaagcgatactacctaaatagttcaggga 11943855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20297497 - 20297410
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  20297497 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 20297410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 27246290 - 27246370
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27246290 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatcctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27246370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39149978 - 39149867
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||  |||| ||||||||    
T  39149978 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaaaggactaaagtgatactat 39149879  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
     |||||||||||    
T  39149878 ttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 44915991 - 44916086
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgata 96  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||    
T  44915991 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaattttaattaagggaccaaaacgata 44916086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32503654 - 32503549
Alignment:
Q  27 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 126  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||    
T  32503654 caaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaaggaagcaaaacgatactacctaaataattaatcgatcaaaaatac 32503555  T
Q  127 aattta 132  Q
    ||||||    
T  32503554 aattta 32503549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33819530 - 33819394
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| || |||| || |||||     
T  33819530 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaagggaccaaat-aaatcaaattttaattaagagaccaaaacggtactac 33819432  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||    
T  33819431 ctaaatagttaatggaccaaaagtgcaatttaacctaa 33819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 36211593 - 36211682
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  36211593 tttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 36211682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Original strand, 1580148 - 1580224
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  1580148 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 1580224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 27914145 - 27914280
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  27914145 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-agagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaaggaaccaaaacgatacta 27914243  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27914244 attaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcct 27914280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41659988 - 41660119
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | |||||   ||||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  41659988 tttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagagaaa-gttaagataccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaagtgatacta 41660086  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
      ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  41660087 attaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 41660119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44610924 - 44610859
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  44610924 ttttaattaaggga-caaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 44610859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34484298 - 34484238
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  34484298 ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 34484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 16350327 - 16350438
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||| | ||| ||  |||    
T  16350327 aattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaaacaataataattaa 16350426  T
Q  105 atagttaaggga 116  Q
    ||||||||||||    
T  16350427 atagttaaggga 16350438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 677915 - 677965
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  677915 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 23992206 - 23992292
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23992206 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttcagggaccaaaaagacaatttagcc 23992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Original strand, 38073790 - 38073867
Alignment:
Q  58 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  38073790 caaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaaatgatcaaaaatataatttagcc 38073867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3603567 - 3603504
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  3603567 ttttaatcaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagggacgaaaataacaattaagcc 3603504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2822367 - 2822301
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2822367 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaaacatttaagcctaa 2822301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15136414 - 15136364
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  15136414 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 15136364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 26424819 - 26424869
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  26424819 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 26424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31557154 - 31557104
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  31557154 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 31557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 34618517 - 34618567
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34618517 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16350156 - 16350080
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  16350156 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatacgatactaattaaatagtcaagagaccaaaaatgcaattta 16350080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 124)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 23281262 - 23281399
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  23281262 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 23281361  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23281362 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 23281399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29256966 - 29256835
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  29256966 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 29256867  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29256866 ctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 29256835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25088150 - 25088013
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  25088150 tttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaagcgatactac 25088051  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25088050 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 25088013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 5463370 - 5463505
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  5463370 tttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaacggaccaaagcgatactag 5463469  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5463470 ctaaatagttaagggactaaaaatgcattttagcct 5463505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51692008 - 51691874
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  51692008 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 51691909  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51691908 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 51691874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 45305666 - 45305798
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  45305666 aattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaa 45305764  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45305765 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 45305798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 16267942 - 16268077
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  16267942 tttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 16268040  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16268041 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 16268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 10923615 - 10923750
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  10923615 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgataccac 10923714  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10923715 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10923750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33753359 - 33753222
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  33753359 tttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 33753260  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33753259 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 33753222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18793825 - 18793693
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  18793825 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 18793726  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  18793725 ctaaataattaagggaccaaaaatgaaatttag 18793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30611350 - 30611218
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30611350 aattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagtgataatatctaa 30611251  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  30611250 atagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 30611218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30792574 - 30792438
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  30792574 tttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaagggatcaaagcgacagtac 30792475  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  30792474 ctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagccta 30792438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 32564202 - 32564337
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  32564202 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 32564300  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32564301 ctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagccta 32564337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 34028973 - 34029109
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  34028973 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagtgatactac 34029072  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34029073 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34029109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 10654281 - 10654404
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  10654281 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 10654380  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  10654381 ctaaatagttaagggaccaaaaat 10654404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28970549 - 28970418
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28970549 aattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaa 28970450  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  28970449 atagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 28970418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 34279501 - 34279628
Alignment:
Q  9 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 108  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  34279501 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 34279600  T
Q  109 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34279601 ttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 34279628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42607656 - 42607525
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||    
T  42607656 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaattaagggaccaaaacgatattat 42607557  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42607556 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 42607525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 22584608 - 22584738
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22584608 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaa 22584707  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22584708 ttagttaagggaccaaaaatataatttagcc 22584738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 6181868 - 6182004
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||     
T  6181868 tttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaagcgatactac 6181967  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6181968 ataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagccta 6182004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21036115 - 21035987
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  21036115 aattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaatggaccaaagtgatactatctaa 21036016  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  21036015 atagttaaggaatcaaaaatgcaatttag 21035987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34028855 - 34028719
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  34028855 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagtgatactac 34028756  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34028755 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34028719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35986366 - 35986234
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  35986366 tttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 35986267  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  35986266 ctaaatagttaagggaacaaaaatgcaatttag 35986234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Original strand, 50574773 - 50574897
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  50574773 aattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaa 50574872  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaat 129  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  50574873 atagttaagggaccaaaaatgcaat 50574897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24590360 - 24590237
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  24590360 tttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 24590261  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  24590260 ttaaatagttaagtgactaaaaat 24590237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 49291235 - 49291366
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49291235 tttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactat 49291334  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49291335 ctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 49291366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50118481 - 50118350
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  50118481 tttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaagggaccaaagcgatactac 50118382  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50118381 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 50118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 13944763 - 13944897
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  13944763 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattctaattaagggatcaaaacgatactac 13944862  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13944863 ctaaatgattaagggaccaaaaatacaatttagcc 13944897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22584485 - 22584351
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||     
T  22584485 tttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaatgtgatactac 22584386  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  22584385 ctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatatagcc 22584351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 24590477 - 24590611
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  24590477 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagtgatactac 24590576  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24590577 ctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 24590611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 37199173 - 37199310
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  37199173 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccagaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 37199272  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  37199273 ctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttaacctaa 37199310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9881685 - 9881550
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  9881685 tttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttagggaccaaagcgatactac 9881587  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9881586 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9881550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10654163 - 10654028
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  10654163 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcg-tactac 10654065  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10654064 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 10654028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11787874 - 11787742
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  11787874 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataattcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 11787775  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  11787774 ctaaatagttaagggatcaaaaattcaatttag 11787742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 51692123 - 51692254
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||     
T  51692123 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaaacgatattac 51692221  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51692222 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 51692254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52412729 - 52412609
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  52412729 gaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactaccta 52412630  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  52412629 aatagttaagggaccaaaaat 52412609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6181750 - 6181619
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  6181750 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactaa 6181651  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  6181650 ctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 6181619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 30293265 - 30293395
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  30293265 tttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaagcgatactac 30293363  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30293364 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30293395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 33753468 - 33753602
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  33753468 tttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 33753567  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33753568 ctaaatagttatgggac-caaaatacaatttagcct 33753602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37199066 - 37198931
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |      
T  37199066 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatattgc 37198967  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  37198966 ctaaatagttaagaaaccaaaaatacaatttagcct 37198931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 46738976 - 46739110
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  46738976 tttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 46739075  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46739076 ctaaatagttaggggac-aaaaatacaatttagcct 46739110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 51810271 - 51810136
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  51810271 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactac 51810172  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  51810171 ctaaatagttaagagactaaaaatgcaattttgcct 51810136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 52412850 - 52412985
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  52412850 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgataccac 52412949  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  52412950 ctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 52412985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14118664 - 14118527
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||     
T  14118664 tttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagtaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagtgatactac 14118565  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14118564 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 14118527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16267849 - 16267716
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||   || ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  16267849 tttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatattac 16267750  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16267749 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 16267716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 24655838 - 24655975
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||     
T  24655838 tttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaagcgatactac 24655937  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24655938 ttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagcctaa 24655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 42607754 - 42607887
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  42607754 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaaacgatactat 42607853  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  42607854 ctaaataattaagggatcaaaaatacaatttagc 42607887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 50921365 - 50921478
Alignment:
Q  23 ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50921365 ggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 50921464  T
Q  123 atacaatttagcct 136  Q
    ||  ||||||||||    
T  50921465 atgtaatttagcct 50921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 51810390 - 51810515
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||||     
T  51810390 tttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcaatttttaattcaggaacaaaagcgatactac 51810489  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatac 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51810490 ctaaatagttaagggaccaaaaatac 51810515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50574647 - 50574527
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  50574647 ttgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatagaccaaagcgatactacc 50574548  T
Q  102 taaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  50574547 taaatagttaagggacaaaaa 50574527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14775879 - 14775744
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | | |||| | ||||||     
T  14775879 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaaagaagcaaaacaatactac 14775780  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14775779 ctaaataattaagggaacaaaaatacaatttagcct 14775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24655720 - 24655589
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  24655720 tttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagagaccaaaatgaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactac 24655621  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  24655620 ctaaatacttaagggaccaaatatgcaattta 24655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32564093 - 32563958
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||       
T  32564093 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatacagc 32563994  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32563993 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 32563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 36657753 - 36657888
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  36657753 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgc 36657852  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36657853 ataaatagttaagggaccaaaaatacaattttgcct 36657888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46949890 - 46949755
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  46949890 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 46949791  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  46949790 ctaaatagttaatgaattaaaaatgcaatttagcct 46949755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4045210 - 4045096
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4045210 gaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggggctaaaaa 4045111  T
Q  124 tacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||| |||||    
T  4045110 tacaatttaacctaa 4045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 14775987 - 14776121
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  14775987 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaaacgatactac 14776086  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14776087 ctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 14776121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30293147 - 30293010
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||     
T  30293147 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaataaagagaccaaagcgatactac 30293048  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  30293047 ctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttaacctaa 30293010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50921194 - 50921061
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  || ||||| |||||||||||||  | || ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  50921194 tttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaagggaccaaaataaatcggattttaattaagggaccaaagtgatactac 50921095  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50921094 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 50921061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 11394912 - 11395044
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||     
T  11394912 tttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacaaaactac 11395011  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11395012 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 11395044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19986374 - 19986510
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||     
T  19986374 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttatttaagagaccaaagtgatactac 19986473  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  19986474 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttatccta 19986510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44222326 - 44222190
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  44222326 tttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattac 44222227  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  44222226 ataaataattaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 44222190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4054683 - 4054545
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatg-gaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||   ||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||    
T  4054683 tttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaatcgatacta 4054584  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  4054583 tctaaatagttaaggggataaaaatacaatttagtctaa 4054545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30611472 - 30611606
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaag-aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30611472 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaattttaatttagggaccaaagcgatacaa 30611571  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30611572 cctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagc 30611606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  105 atagtta 111  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 18793944 - 18794082
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcg--atact 98  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  18793944 tttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaa-tgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatatact 18794042  T
Q  99 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18794043 acttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18794082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 25088268 - 25088403
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||     
T  25088268 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaagggaccgaactaaatcgaattttagttaa-ggaccaaaacgatactac 25088366  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  25088367 ctaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 25088403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36884837 - 36884725
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  36884837 aaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaaca 36884738  T
Q  120 aaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||||    
T  36884737 aaaatacaattta 36884725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1831792 - 1831661
Alignment:
Q  7 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||    
T  1831792 ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaagaccaaagtgatactacctaaat 1831693  T
Q  107 agttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  1831692 agttaagagaccgaaaattcaatttagcctaa 1831661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 4045351 - 4045486
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||     
T  4045351 tttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaaggactaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagtgatactac 4045450  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4045451 ttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcct 4045486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5463247 - 5463140
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  5463247 aattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatattatctaa 5463148  T
Q  105 atagttaa 112  Q
    ||| ||||    
T  5463147 ataattaa 5463140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21385070 - 21384960
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21385070 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaag-accaaaataaatcgaattttaattaagggataaaagcgatactac 21384972  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
     |||||||||||    
T  21384971 ataaatagttaa 21384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 29257075 - 29257222
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||  |||   ||||||     
T  29257075 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaggggacaaaattaatactag 29257174  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaa 148  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||  ||||||||    
T  29257175 ctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattaaacctaaattttattaa 29257222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34621887 - 34622018
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34621887 tttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacgatactaa 34621986  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  34621987 ttaaatagttaagggaccaaaaacataattta 34622018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 20260635 - 20260768
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  20260635 aattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaaggagagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaacgatactaatta 20260733  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20260734 aataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 20260768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34279374 - 34279240
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  34279374 tttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgttactac 34279275  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  34279274 ctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 34279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5118185 - 5118096
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5118185 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 5118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21385188 - 21385325
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21385188 tttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 21385287  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21385288 ttaaatagttaagggattaaaagtgcaatttagcctaa 21385325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36077381 - 36077268
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  36077381 accaaaatttgtaacgaagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 36077282  T
Q  125 acaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||    
T  36077281 gcaatttagcctaa 36077268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5118079 - 5117995
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5118079 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 5117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10923497 - 10923365
Alignment:
Q  1 tttgaattaaa-actaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10923497 tttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaagggaccaaagcgatacta 10923398  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10923397 cctaaataattaagggaccaaaaatataattta 10923365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 13831274 - 13831358
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13831274 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga 13831358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13944645 - 13944509
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  13944645 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaagggaccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactag 13944546  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  13944545 ctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 13944509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 11787993 - 11788127
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  11787993 tttgaattaaaactaacagaaag-agcaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgc 11788091  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  11788092 ttaaataattaaaagaccaaaaatgcaatttagcct 11788127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19886088 - 19885985
Alignment:
Q  29 aaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 128  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||    
T  19886088 aaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 19885989  T
Q  129 ttta 132  Q
    ||||    
T  19885988 ttta 19885985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28112884 - 28112795
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28112884 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 28112795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11797308 - 11797220
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11797308 ttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 11797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 1831916 - 1832047
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||     
T  1831916 tttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaaacgatactac 1832015  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1832016 atatatagttaagggaccaaaaatacaattta 1832047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27209303 - 27209168
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||     
T  27209303 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatattaa 27209204  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27209203 ttaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 27209168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40534055 - 40533928
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   | | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40534055 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagatagcgaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatactaattaa 40533956  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40533955 atagttaagagactaaaaatgcaattta 40533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 4550907 - 4550988
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  4550907 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 4550988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28112807 - 28112718
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 28112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36657635 - 36657501
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg--ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| ||| |     
T  36657635 tttgaattaaaactaacggaaaggac-aaaatatgtaacggagagaggagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggacccaagagatgca 36657537  T
Q  99 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  36657536 aactaaatagttaggggacgaaaaatgcaatttagc 36657501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45305544 - 45305412
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  45305544 tttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaattaaaggaccaaagcaatacta 45305445  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  45305444 cctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 132
Target Start/End: Original strand, 19886214 - 19886297
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  19886214 ttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaattta 19886297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 49291127 - 49291016
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||   ||||| ||||| | || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  49291127 tttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 49291028  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  49291027 ctaaatagttaa 49291016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9119544 - 9119618
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagtttt 75  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9119544 tttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 48702187 - 48702269
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48702187 accaaaataaatccaattttaattaaaggaccaaaacgatactaacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 48702269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9119379 - 9119290
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  9119379 gttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaagtagttaagggataaaaaatataatttaaccta 9119290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11394769 - 11394697
Alignment:
Q  58 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  11394769 caaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagagac-aaaaatgcaattt 11394697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11797232 - 11797147
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  11797232 ttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaatttagc 11797147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 46949988 - 46950085
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  46949988 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggagcaatgtgatact 46950085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 40703121 - 40703252
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||    |||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||  ||    
T  40703121 aattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagcgatactaatta 40703219  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  40703220 aatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 40703252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 30792692 - 30792759
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatc 68  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  30792692 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatc 30792759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 2125465 - 2125577
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||      ||||| ||||||||||||| ||||    
T  2125465 aattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt------agggaccaaagcgatactacctaa 2125557  T
Q  105 atagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  2125558 ataattaagggaccaaaaat 2125577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 32517765 - 32517894
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||     
T  32517765 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa--aaccaaagtgatactac 32517862  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  32517863 ctaaatagataagggatcaaaaatgcaattta 32517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 40534181 - 40534292
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||  |||| | |||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  |||    
T  40534181 aattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagcgatactaattaa 40534280  T
Q  105 atagttaaggga 116  Q
    ||||||||||||    
T  40534281 atagttaaggga 40534292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19269441 - 19269359
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19269441 ggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19269359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40702999 - 40702867
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||| ||||| |   | |||||||     
T  40702999 tttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatttagggacc---gtgatactaa 40702903  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40702902 ttaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 40702867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20260536 - 20260440
Alignment:
Q  27 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  20260536 caaaatgtgtaacggagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 27209456 - 27209536
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27209456 accaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6241316 - 6241274
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6241316 ttttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagg 6241274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 6714698 - 6714748
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  6714698 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6714748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 21036235 - 21036345
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||||||||| | |||||  |||||||| ||||| | |||||||||| | | ||||| |||  || |    
T  21036235 ttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagtgatggtacc 21036334  T
Q  102 taaatagttaa 112  Q
    |||||||||||    
T  21036335 taaatagttaa 21036345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31126059 - 31125938
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||  ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||    
T  31126059 aattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaa-------aagcgatactacctaa 31125967  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31125966 atagttaagggatcaaaaatgcaatttag 31125938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32193580 - 32193530
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  32193580 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggattaaaa 32193530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33784361 - 33784299
Alignment:
Q  76 aattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  33784361 aattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 33784299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 34023569 - 34023619
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34023569 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34023619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 37708574 - 37708624
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  37708574 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 37708624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 46448736 - 46448786
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  46448736 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 46448786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29021645 - 29021580
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  29021645 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagccta 29021580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 36884960 - 36885037
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 82  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36884960 aattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaag 36885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 50921312 - 50921373
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 62  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  50921312 tttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaa 50921373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Original strand, 6242692 - 6242736
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  6242692 ttttaattaagggaccaaagcgatactaattaattagttaaggga 6242736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34521400 - 34521264
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  34521400 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 34521301  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34521300 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34521264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 41208652 - 41208788
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  41208652 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 41208751  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41208752 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 41208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 44069375 - 44069510
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||     
T  44069375 tttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactac 44069474  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44069475 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44069510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54107803 - 54107669
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  54107803 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 54107704  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  54107703 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54107669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 4846848 - 4846984
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4846848 tttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagcgatactac 4846947  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4846948 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 4846984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26332453 - 26332318
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  26332453 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaagggaccaaagcgatactac 26332354  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  26332353 ctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcct 26332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34630116 - 34629985
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  34630116 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 34630017  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34630016 ttaaatagttaagggaccaaaaatataattta 34629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10756852 - 10756720
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  10756852 tttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 10756753  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10756752 ctaaatagctaagggaccaaaaatacaatttag 10756720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54081413 - 54081287
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||    
T  54081413 aattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa-ggaccaaagcgatactgcctaa 54081315  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54081314 atagttaagggaccaaaaatacaattta 54081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 15862427 - 15862564
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||| |||||||     
T  15862427 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaataaagggacaaaagagatactac 15862526  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15862527 ctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcctaa 15862564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 43899330 - 43899463
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  43899330 aattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatattacctaa 43899429  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  43899430 atagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 43899463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45171202 - 45171066
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||     
T  45171202 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggccaaagcaatactac 45171103  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45171102 ctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagccta 45171066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 54081535 - 54081671
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  54081535 tttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatacta 54081634  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54081635 cctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 54081671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7950409 - 7950274
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||     
T  7950409 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaaacaatactac 7950310  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7950309 ataaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcct 7950274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 26332570 - 26332712
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaat-----ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26332570 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgat 26332669  T
Q  96 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 139  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  26332670 actacctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcctaac 26332712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 28688242 - 28688377
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  28688242 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 28688341  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  28688342 ctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcct 28688377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41997953 - 41997818
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  41997953 tttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaaacgatactac 41997854  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41997853 ctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 41997818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45871827 - 45871696
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45871827 aattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 45871728  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45871727 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 45871696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 54108372 - 54108507
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  54108372 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactag 54108471  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54108472 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54108507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 7743017 - 7743139
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||   |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7743017 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagcgatactac 7743116  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  7743117 ctaaatagttaagggaccaaaaa 7743139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31513997 - 31513863
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||     
T  31513997 tttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaatcaaagcgatactac 31513898  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31513897 ctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 31513863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 28691365 - 28691502
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||     
T  28691365 tttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatgatcaaaataaatcaaattttaatttagggacaaaagcgatactac 28691464  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28691465 ctaaataattaagggacaaaaaatacaatttaacctaa 28691502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 45171319 - 45171452
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  || |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  45171319 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactac 45171418  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45171419 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagc 45171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12123224 - 12123088
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||     
T  12123224 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactac 12123125  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12123124 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 12123088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 12123331 - 12123467
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  12123331 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 12123430  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12123431 ctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaaccta 12123467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21169800 - 21169669
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  21169800 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactac 21169701  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21169700 ctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 21169669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34521509 - 34521640
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || |||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  34521509 tttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 34521608  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34521609 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40410842 - 40410715
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40410842 aattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 40410743  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40410742 atagttaagggaccaaaaatgcaattta 40410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 7274895 - 7275024
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  7274895 tttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 7274993  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  7274994 ctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7937815 - 7937949
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  7937815 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataattcgaattttaattaagggaccaaagtgatactac 7937914  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  7937915 ctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaatttagcc 7937949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 8846328 - 8846462
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||     
T  8846328 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagtgaccaaagcgatactac 8846427  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846428 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15862316 - 15862182
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  15862316 tttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 15862217  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  15862216 ctaaataattaagggacctaaaatggaatttagcc 15862182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22355076 - 22354946
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | |||| ||||||||     
T  22355076 tttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatactac 22354977  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354976 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 22354946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44069257 - 44069123
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  44069257 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaacgatactac 44069158  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44069157 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44069123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 50819469 - 50819603
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  50819469 tttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 50819568  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50819569 cttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50819603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 50856395 - 50856261
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  50856395 tttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 50856296  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50856295 cttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41208535 - 41208398
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  41208535 tttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 41208436  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41208435 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 41208398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50819354 - 50819217
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||     
T  50819354 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgctac 50819255  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50819254 gtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50819217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 50856510 - 50856647
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||     
T  50856510 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcgatgctac 50856609  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50856610 gtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50856647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 52609639 - 52609748
Alignment:
Q  26 ccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaata 125  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  52609639 ccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatg 52609738  T
Q  126 caatttagcc 135  Q
     |||||||||    
T  52609739 gaatttagcc 52609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 31514115 - 31514250
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  31514115 tttgaattaaagctaacggaaag-accaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 31514213  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31514214 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 31514250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 35753683 - 35753819
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  35753683 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatttaaattaatggaccaaagcgatactac 35753782  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||    
T  35753783 ctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 35753819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 14353300 - 14353430
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  14353300 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaaggaccaagataaatcgaattttatttaagggaccaatgcgatactac 14353398  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353399 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 14353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43899226 - 43899111
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||| |||| |    
T  43899226 aaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaaaggacca 43899127  T
Q  120 aaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43899126 aaaatgcaatttagcc 43899111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580332
Alignment:
Q  10 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagt 109  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  110 taagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaattta 35580332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 46766869 - 46767002
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  46766869 aattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactagcaa 46766968  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46766969 aatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 46767002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 53841278 - 53841407
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||     
T  53841278 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaagcaatactag 53841377  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53841378 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40926141 - 40926009
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  40926141 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggatcaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaagcgatactacataa 40926042  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  40926041 atagttaaaagaccaaaaatgcaatttaaccta 40926009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19124323 - 19124188
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||  || ||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||     
T  19124323 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaattttaattaggggaccaaagcaatattac 19124224  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19124223 ttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19124188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28691244 - 28691113
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||    
T  28691244 aattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaacaaagcaataccacctaa 28691145  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28691144 ataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 28691113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8846210 - 8846076
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| || |||| | ||||||     
T  8846210 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaattaatcgaattttagttaagagaccaaaacaatactac 8846111  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846110 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40639369 - 40639506
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  40639369 tttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 40639468  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
     ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  40639469 ttaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagcctaa 40639506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52606256 - 52606128
Alignment:
Q  7 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 106  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  52606256 ttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactacataaat 52606157  T
Q  107 agttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  52606156 agttaagggac-caaaatgcaatttagcct 52606128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 40926267 - 40926394
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  40926267 aattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaatggaccaaagtgatactacctaa 40926365  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40926366 atagttaggggactaaaaatgcaatttag 40926394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 51170637 - 51170765
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    ||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  51170637 aattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgatcaaaacgatactacctaa 51170736  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  51170737 atagttaagggatcaaaaatgcaatttag 51170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17273907 - 17273788
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||   ||||    
T  17273907 aattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaaacgatacggcctaa 17273808  T
Q  105 atagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  17273807 atagttaagggaccaaaaat 17273788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 45871945 - 45872064
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  45871945 aattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaatttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaa 45872044  T
Q  105 atagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  45872045 atagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 17102629 - 17102735
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  17102629 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaatggaccaaagcgatactac 17102728  T
Q  101 ctaaata 107  Q
    |||||||    
T  17102729 ctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27940406 - 27940272
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||     
T  27940406 tttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaagggaccaaagtgatactac 27940307  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  27940306 ctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 27940272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47891647 - 47891513
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  47891647 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 47891548  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||| |||||||||| ||| | | |||||||||    
T  47891547 ttaaattgttaagggaccaaatacataatttagcc 47891513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 19124424 - 19124556
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| | || ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19124424 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactac 19124523  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  19124524 ctaaatagttaa-ggaccaaaaatataatttagc 19124556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 38911494 - 38911607
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| |||| |||| ||||||    
T  38911494 accaaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaat 38911593  T
Q  125 acaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||    
T  38911594 acaatttagcctaa 38911607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 2078724 - 2078855
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  2078724 tttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatatta 2078822  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2078823 attaaatagttaagggactaaaaatacaattta 2078855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 5348820 - 5348955
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  5348820 tttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaagcgatactaa 5348919  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
     ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5348920 ttaaatagttaaaggacaaaaaacataatttagcct 5348955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757091
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||      
T  10756960 tttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacgatactgc 10757059  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10757060 ctaaatagttaaaggacaaaaaatacaattta 10757091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17102518 - 17102383
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | ||| ||     
T  17102518 tttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaagaaaacaatattac 17102419  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| |||||  || |||||| |||||||||||    
T  17102418 ctaaataattaagaaaccaaaaatgcaatttagcct 17102383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28688124 - 28688017
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||     
T  28688124 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagtgatactac 28688025  T
Q  101 ctaaatag 108  Q
    ||||||||    
T  28688024 ctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 37133411 - 37133280
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  37133411 tttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 37133312  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  37133311 ttaaatagctaagggaccaaaaacataattta 37133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40969334 - 40969255
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40969334 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 40969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 52268356 - 52268490
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  52268356 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaag-accaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacgatactaa 52268454  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  52268455 ctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 52268490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14353180 - 14353042
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||| ||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  14353180 tttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 14353081  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 139  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  14353080 ctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaacctaac 14353042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 41998137 - 41998203
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41998137 ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 41998203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29248453 - 29248320
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||  ||| |||||| |     
T  29248453 tttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaattaaattttaattaagggactaaaacgataccac 29248354  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||   ||||||||| || ||||||    
T  29248353 ctaaatagttaaataactaaaaatgcactttagc 29248320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2829542 - 2829410
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa-tggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    ||||||| ||||| | | ||||||||| || |||| | ||||||    
T  2829542 tttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaaaaccaaaataaatcaaatgttaattaagagaccaaaacaatacta 2829443  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2829442 cctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27254118 - 27254007
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||      
T  27254118 tttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactgc 27254019  T
Q  101 ctaaatagttaa 112  Q
    ||||||||||||    
T  27254018 ctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 29248560 - 29248691
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |||||||||| |||  ||||  |||||||    
T  29248560 tttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaaggactaaagtaatactat 29248659  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29248660 ctaaatagttaagggagcataaatacaattta 29248691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49222147 - 49222040
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||  || | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49222147 gaccaaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaaaagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 49222048  T
Q  124 tacaattt 131  Q
    ||||||||    
T  49222047 tacaattt 49222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51883985 - 51883859
Alignment:
Q  9 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaata 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  51883985 aaaactaacataaaagaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaata 51883887  T
Q  108 gttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51883886 gttaagggattaaaaatgcaatttagcc 51883859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 22444441 - 22444527
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22444441 gaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaaggaaccgaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 53678567 - 53678445
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   || |||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53678567 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatactat 53678468  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
     |||||| ||||||||| |||||    
T  53678467 ttaaataattaagggaccaaaaa 53678445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5348658 - 5348577
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5348658 accaaaataaatcaaattttaattgagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaaccta 5348577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 33773046 - 33773175
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||   ||||   ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||  ||    
T  33773046 aattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaatcaagggatcaaagtgatactaatta 33773145  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33773146 aatagttaagggaccaaaaacacaatttag 33773175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35753489 - 35753408
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35753489 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54247358 - 54247271
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54247358 gttaagggaccaaaataaatcaaattttaatcaatggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 54247271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 17274028 - 17274159
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||   ||||  ||||  |||||||| || |||| ||||||||||  || |||||||||||||     
T  17274028 tttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaacgatgagaaattaagagaccaaaataattcgaattttaattaaaagaccaaagcgatactac 17274127  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17274128 ctaaatagttaaaggaccaaaaatacaattta 17274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 35753566 - 35753477
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35753566 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35753477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 40969506 - 40969642
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  40969506 tttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagactaaagcgatacta 40969604  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  40969605 attaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 40969642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 133
Target Start/End: Original strand, 53310001 - 53310106
Alignment:
Q  28 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaataca 127  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||    
T  53310001 aaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactacctaaataattaggagactaaaaatgca 53310100  T
Q  128 atttag 133  Q
    ||||||    
T  53310101 atttag 53310106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2829660 - 2829795
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||  || |||| | ||| ||     
T  2829660 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaatcaataatac 2829759  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  2829760 ataaatagttaa-ggatcaaaaatgcaatttagccta 2829795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7274716 - 7274652
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7274716 ttttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 7274652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7937713 - 7937645
Alignment:
Q  65 aatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  7937713 aatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaatttag 7937645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9028325 - 9028189
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||  ||  |||||  || ||||| ||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||     
T  9028325 tttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaattttaacttagggaccaaagtgatactac 9028226  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9028225 ctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 9028189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53841161 - 53841065
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 97  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  53841161 tttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagcgaccaaagcgatac 53841065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 588406 - 588537
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||||| ||||| | |||||||||||| | | |||||||| ||  ||    
T  588406 aattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaatcaaattttaattaaggaaccgaagcgatattaatta 588505  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||  |  |||||| ||||||||||    
T  588506 aatagttaagatatcaaaaatgcaatttagcc 588537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 53678740 - 53678818
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  53678740 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga-taaaaacgcaatttagcc 53678818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 9028443 - 9028577
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  || ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| | ||||||     
T  9028443 tttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacaatactag 9028542  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    || ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  9028543 cttaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttagcc 9028577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 13866964 - 13867050
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13866964 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 13867050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963677
Alignment:
Q  8 taaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 106  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  107 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaaggcaattaagccta 20963677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 51311825 - 51311907
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||    
T  51311825 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagcctaa 51311907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33812831 - 33812735
Alignment:
Q  28 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33812831 aaaatgtgtaacggatagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 33812735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40639196 - 40639120
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40639196 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaagaactaaaaatgcaattta 40639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43840076 - 43839959
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggact 118  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||  || || ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  43840076 aaaggaccaaaacgtgtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagttaaggga-- 43839979  T
Q  119 aaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  43839978 aaaaaaacaatttagcctaa 43839959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Original strand, 49529120 - 49529204
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49529120 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 49529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13355238 - 13355188
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13355238 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 13355188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 46766753 - 46766619
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||| || | |    
T  46766753 aattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatattagcaa 46766654  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  46766653 aatagtaaaaggaccaaaaatgcaatttaacctaa 46766619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 52606370 - 52606404
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52606370 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 52606404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21918573 - 21918500
Alignment:
Q  59 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21918573 aaaaaaaatcaaattttaatttagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Original strand, 33812852 - 33812929
Alignment:
Q  58 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  33812852 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaatttagcc 33812929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43527080 - 43527023
Alignment:
Q  78 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  43527080 ttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 43527023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Original strand, 31049073 - 31049124
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31049073 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 31049124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 38911463 - 38911432
Alignment:
Q  85 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38911463 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 38911432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47872579 - 47872529
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  47872579 ttttagttaagggagcaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaa 47872529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 51885671 - 51885753
Alignment:
Q  56 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  51885671 accaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacctaa 51885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 43844359 - 43844484
Alignment:
Q  10 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 108  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  || || |||| |||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  43844359 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatag 43844458  T
Q  109 ttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||    
T  43844459 ttaaaggaccaaaaaaataatttagc 43844484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44316670 - 44316626
Alignment:
Q  92 cgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44316670 cgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 44316626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 49222349 - 49222389
Alignment:
Q  73 tttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaag 113  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49222349 tttaactaagggaccaaaacgatactatctaaatagttaag 49222389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 50393429 - 50393337
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggg 115  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||    
T  50393429 gaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaactaattaaataattaaggg 50393337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 4570 - 4707
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  4570 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 4669  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4670 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4472 - 4341
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||| |||| ||     
T  4472 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatcaaatttcaattaaggaaccaaagtgatagtac 4373  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4372 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7399211 - 7399075
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  7399211 tttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 7399112  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7399111 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7399075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35263624 - 35263491
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35263624 aattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactacctaa 35263525  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35263524 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35263491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15267492 - 15267622
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  15267492 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 15267591  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  15267592 ctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaattt 15267622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40589306 - 40589443
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  40589306 tttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 40589405  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40589406 ctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 40589909 - 40590046
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  40589909 tttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactac 40590008  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40590009 ctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40590046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42710484 - 42710351
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||     
T  42710484 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaagaactaaagcgatactac 42710385  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    | ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  42710384 cgaaatagttaaatgactaaaaatgcaatttagc 42710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28392021 - 28392156
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28392021 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatacta 28392120  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  28392121 cctaaatagttaagagaccaaaaatagaatttagcc 28392156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088516
Alignment:
Q  7 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  107 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagccta 5088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 10656346 - 10656480
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  10656346 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaagcgatactac 10656445  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10656446 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 10656480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 42710602 - 42710736
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  42710602 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 42710701  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42710702 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 42710736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9693051 - 9692919
Alignment:
Q  2 ttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatc 101  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9693051 ttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacc 9692952  T
Q  102 taaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9692951 taaatagtt-agggaccaaaaatacaatttagcc 9692919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 12593712 - 12593845
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  12593712 aattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcaatactacctaa 12593811  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  12593812 atagttaaaggactaaaaatgtaatttaacctaa 12593845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 16353410 - 16353542
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  16353410 aattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaagcgatactacttaa 16353509  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16353510 atagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 16353542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33699409 - 33699273
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||     
T  33699409 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaacgatactac 33699310  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  33699309 ctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagccta 33699273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 9693170 - 9693301
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  9693170 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgatttttaattaagggaccaaatcgatactac 9693269  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9693270 ctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10656228 - 10656093
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  10656228 tttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgatactac 10656129  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10656128 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 10656093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 35263746 - 35263881
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||     
T  35263746 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagtcatactac 35263845  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35263846 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 35263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 7399330 - 7399452
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  7399330 tttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 7399429  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  7399430 ctaaataattaagggacaaaaaa 7399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 7210697 - 7210830
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  7210697 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 7210796  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  7210797 ctaaatagttaagtgaccaagaatgcaatttagc 7210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 8418440 - 8418569
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8418440 aattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaacggaccaaagcgatactacctaa 8418539  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8418540 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 8418569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 12694938 - 12695075
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  12694938 tttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 12695037  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12695038 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttggcctaa 12695075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29024068 - 29023936
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  29024068 tttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaa---atcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactac 29023972  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29023971 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 29023936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 32272096 - 32272224
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32272096 aattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattatctaa 32272195  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  32272196 atagttaagagaccaaaaatgcaatttag 32272224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36752036 - 36751904
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  36752036 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactac 36751937  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36751936 ctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttag 36751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3878615 - 3878480
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||     
T  3878615 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaacgaccaaagcgatactac 3878516  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3878515 ctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 3878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5624513 - 5624382
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5624513 tttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactac 5624414  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5624413 ctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 5624382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 19205195 - 19205326
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  19205195 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 19205294  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  19205295 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38416386 - 38416521
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| || ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  38416386 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgagcaaagcgatactac 38416485  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38416486 ctaaataattaagagaccaaaaatacaatttagcct 38416521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 334430 - 334296
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  334430 tttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 334331  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  334330 ctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcc 334296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31656492 - 31656370
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  31656492 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 31656393  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  31656392 ctaaatagttaagggaccaaaaa 31656370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31656610 - 31656744
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  31656610 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgc 31656709  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31656710 ctaataagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31656744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39706303 - 39706433
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||     
T  39706303 tttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaagaatactac 39706402  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39706403 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7210590 - 7210461
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  7210590 tttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaaacgatagtac 7210491  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  7210490 ctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31909064 - 31908928
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31909064 tttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggatcaaagcgatactac 31908965  T
Q  101 ctaa--atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31908964 ctaaatatagttaaggcaccaaaaatacaatttagcc 31908928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 43570023 - 43570155
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||| ||||||||   ||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43570023 tttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaagggaacaaagcgatgctat 43570122  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43570123 ctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttag 43570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5087941 - 5087806
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  5087941 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaagcgatactac 5087842  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  5087841 ctaaatagttaagggaccaaaaattcaatttcgcct 5087806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40589188 - 40589054
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||     
T  40589188 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaactac 40589089  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589088 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40589791 - 40589657
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||     
T  40589791 tttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagtgaaactac 40589692  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589691 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 15476511 - 15476632
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  15476511 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactac 15476610  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15476611 ctaaataattaagggactaaaa 15476632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18514422 - 18514285
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||| |||| || ||||| ||||||      
T  18514422 tttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagggatacttc 18514323  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18514322 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18514285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 36752173 - 36752289
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  36752173 aaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa-ggattgaagcgatactacataaatagttaagggacca 36752271  T
Q  120 aaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  36752272 aaaatgcaatttagccta 36752289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40774471 - 40774339
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||     
T  40774471 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaatcga-ttttaattaagggactaaaacaatactac 40774373  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40774372 ctaaatagttaagggacaaaaaatgaaatttagc 40774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15476377 - 15476269
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 123  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15476377 gaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 15476278  T
Q  124 tacaattta 132  Q
    || ||||||    
T  15476277 tataattta 15476269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26289150 - 26289027
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  26289150 aattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaa 26289051  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  26289050 atagttaagggaccaaaaatacaa 26289027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41859929 - 41860062
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41859929 tttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactat 41860028  T
Q  101 --ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
      ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  41860029 acctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 41860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460187
Alignment:
Q  59 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 5460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38416277 - 38416140
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   | ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  38416277 tttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 38416178  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  38416177 ctaaataattaagagattaaaaatgcaatttagcctaa 38416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Original strand, 33763186 - 33763293
Alignment:
Q  27 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 126  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  33763186 caaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatacta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgc 33763284  T
Q  127 aatttagcc 135  Q
    |||||||||    
T  33763285 aatttagcc 33763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25923252 - 25923121
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |   ||||| | |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  25923252 tttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaccgatactac 25923153  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25923152 ctaaatagttaagggatcaaaaatacaattta 25923121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 31909186 - 31909313
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  31909186 aattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaaacgatactacctaa 31909285  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  31909286 acagttaagggaccaaaaatgcaattta 31909313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39706185 - 39706053
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||    ||     
T  39706185 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcg----tac 39706090  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
     |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39706089 ataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 39706053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17861172 - 17861039
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||     
T  17861172 tttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaacattac 17861074  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  17861073 ctaaatagttaaaggaccaaaaatataatttagcc 17861039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21750897 - 21750807
Alignment:
Q  48 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21750897 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcctaa 21750807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33763039 - 33762922
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt--taatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaagggatcaaagcgatac 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  33763039 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataagggatcaaaataaatcgaattttaatttaagggaccaaagcgatac 33762940  T
Q  98 tatctaaatagttaaggg 115  Q
    || ||||||| |||||||    
T  33762939 tacctaaataattaaggg 33762922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 5152867 - 5153000
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  5152867 tttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaa 5152966  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 134  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5152967 ataaatagttaagggaccaaaaacataatttagc 5153000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8418334 - 8418206
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||     
T  8418334 tttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaa-gaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatactac 8418236  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  8418235 ctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12593590 - 12593454
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||| | ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||     
T  12593590 tttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggaaccaatataaatcgaattttagttaagggactgaagcgatactac 12593491  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12593490 ctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 12593454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28391903 - 28391768
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  |||||     
T  28391903 tttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagggatcaaaataaatcgaactttaattaagggaccaaagtaatactg 28391804  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28391803 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattgagcc 28391768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 40774589 - 40774724
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  40774589 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagcgatactag 40774688  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||    
T  40774689 ctaaataattaaggaatcaaaaatgcaatttagcct 40774724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41372410 - 41372541
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  41372410 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatattaa 41372509  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  41372510 ttaaatagttaagggaccaaaaacataattta 41372541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Original strand, 17736522 - 17736620
Alignment:
Q  24 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17736522 gaccaacatgtgtaacagagagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 132
Target Start/End: Original strand, 5460272 - 5460329
Alignment:
Q  75 taattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5460272 taattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 5460329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15267375 - 15267239
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  15267375 tttgaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactac 15267276  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15267275 ct-aatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 15267239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19205077 - 19204941
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | |   || |  ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  19205077 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaaggtatttaa-gccatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactac 19204979  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19204978 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 19204941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14143642 - 14143511
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||   | |||| |||||||||    
T  14143642 tttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggactaaaataaatcaa-ttttaattaaaa-accaaaacgatactat 14143546  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14143545 ctaaatagttaagggac-aaaaatataatttagcct 14143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 15670403 - 15670534
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| || |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||   | |||| ||||||||     
T  15670403 tttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaataaccaaaacgatactac 15670502  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15670503 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 15670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16353288 - 16353151
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  16353288 tttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactac 16353189  T
Q  101 ctaaa---tagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||   |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16353188 ctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 16353151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5152750 - 5152614
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaaca-gagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  5152750 tttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaagaagataga-gttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggccaaagtcatacta 5152652  T
Q  100 tctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
      || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5152651 attacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 5152614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14052023 - 14051886
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||   | |||| | ||| ||     
T  14052023 tttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaattttaattaaaaaaccaaaacaatattac 14051924  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14051923 ctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaacctaa 14051886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 25923371 - 25923480
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | ||||||     
T  25923371 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaacaatactac 25923470  T
Q  101 ctaaatagtt 110  Q
     |||||||||    
T  25923471 ataaatagtt 25923480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 14143761 - 14143892
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||| ||| || |||||  ||||||  |||    
T  14143761 aattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagagaccaaagtaatactacttaa 14143860  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14143861 atagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 14143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 17861290 - 17861419
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| |||      ||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  17861290 tttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------tttaattaa-ggaccaaagtgatactac 17861382  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17861383 ctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagcctaa 17861419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 26289292 - 26289407
Alignment:
Q  20 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 119  Q
    ||||||| ||||| || ||  |||||| ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  26289292 aaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagttaa-ggatcaaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactatttaaatagttaaaggacca 26289390  T
Q  120 aaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  26289391 aaaatgcaatctagcct 26289407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26289025 - 26288988
Alignment:
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26289025 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 26288988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Original strand, 3879305 - 3879399
Alignment:
Q  42 agagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||| ||| | | |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3879305 agagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 3879399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 37192467 - 37192533
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  37192467 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 37192533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 38384931 - 38384887
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  38384931 ttttaattaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaaggga 38384887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 40604 - 40738
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  40604 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatactac 40703  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40704 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40486 - 40350
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40486 tttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactat 40387  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40386 ctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagccta 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11601
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  11466 tttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactac 11565  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11566 ctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 11601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11347 - 11231
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  11347 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcaatactac 11248  T
Q  101 ctaaatagttaagggac 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  11247 ctaaatagttaagggac 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 11739 - 11873
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  11739 tttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactac 11838  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11839 ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11618 - 11485
Alignment:
Q  5 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 104  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11618 aattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactttctaa 11519  T
Q  105 atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11518 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 45088 - 45222
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  45088 tttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaatttttaattaagggagcaaagcgataatac 45187  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45188 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 45222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 132
Target Start/End: Original strand, 13817 - 13924
Alignment:
Q  25 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13817 accaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaat 13916  T
Q  125 acaattta 132  Q
    ||||||||    
T  13917 acaattta 13924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13675 - 13541
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| || |||     
T  13675 tttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcggattttaactaagggaccaaagcaattctaa 13576  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  13575 ctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcct 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 90939 - 90805
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||     
T  90939 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaatttcaattaagggacaaaagcgatactac 90840  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  90839 ctaaatagttaagggactaaaaatgcaatgtagcc 90805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 91760 - 91844
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 85  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  91760 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattttaattaaggga 91844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 65991 - 66123
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||| |  ||| ||||||||     
T  65991 tttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaaacgatactac 66090  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  66091 ctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 66123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 73323 - 73455
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||| |  ||| ||||||||     
T  73323 tttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaaacgatactac 73422  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  73423 ctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 73455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 65870 - 65750
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || |||    
T  65870 gaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatattaccta 65771  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  65770 aatagttaagagaccaaaaat 65750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 73202 - 73082
Alignment:
Q  4 gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatcta 103  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || |||    
T  73202 gaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcaatattaccta 73103  T
Q  104 aatagttaagggactaaaaat 124  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  73102 aatagttaagagaccaaaaat 73082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 177317 - 177453
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |   |||| ||     
T  177317 tttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggatcgatctgataatac 177416  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  177417 ctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 177453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1609 - 1474
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  1609 tttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatgcgatactac 1511  T
Q  101 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 137  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  1510 ctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagccta 1474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1815
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1727 tttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaattaagggaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 93324 - 93188
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  93324 tttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagtgactaaaacgatact 93225  T
Q  99 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 135  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  93224 aattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 93188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11802 - 11713
Alignment:
Q  1 tttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 90  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||    
T  11802 tttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaagggaccaaa 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11638
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  11720 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 11638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26048 - 25970
Alignment:
Q  54 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 132  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| |||| | |||||||    
T  26048 ggaccaaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaattta 25970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11001
Alignment:
Q  49 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 130  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10920 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaagacaatt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6281
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  6231 ttttaattatgggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagacgaaaa 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 57085 - 57019
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  57085 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagaacaattaagcctaa 57019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 57553 - 57617
Alignment:
Q  72 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  57553 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagaacaattaagcct 57617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University