View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8569_low_16 (Length: 314)

Name: NF8569_low_16
Description: NF8569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8569_low_16
NF8569_low_16
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-303)||(22236071-22236373)
chr5 (1-302)||(22381114-22381415)
chr5 (1-303)||(23080240-23080542)
chr5 (1-303)||(17269484-17269786)
chr5 (1-299)||(20821368-20821666)
chr5 (1-299)||(21890914-21891212)
chr5 (1-299)||(23442448-23442746)
chr5 (4-302)||(22502597-22502895)
chr5 (4-299)||(14887146-14887441)
chr5 (1-299)||(22461867-22462165)
chr5 (4-299)||(37545651-37545947)
chr5 (4-302)||(20342200-20342498)
chr5 (4-302)||(25847993-25848291)
chr5 (1-299)||(28923923-28924221)
chr5 (4-299)||(24798552-24798847)
chr5 (1-299)||(28895097-28895395)
chr5 (1-297)||(20773675-20773971)
chr5 (1-292)||(24735773-24736064)
chr5 (1-292)||(24749716-24750007)
chr5 (1-228)||(24737011-24737238)
chr5 (4-275)||(22134604-22134875)
chr5 (4-266)||(26738893-26739155)
chr5 (4-275)||(16356438-16356709)
chr5 (4-275)||(22333066-22333337)
chr5 (4-275)||(27685579-27685850)
chr5 (4-275)||(34566430-34566701)
chr5 (4-275)||(14999918-15000189)
chr5 (4-275)||(23573678-23573949)
chr5 (40-275)||(27610326-27610561)
chr5 (40-275)||(27518379-27518614)
chr5 (4-275)||(27668669-27668940)
chr5 (4-275)||(37291675-37291946)
chr5 (4-275)||(40708716-40708987)
chr5 (1-275)||(20468275-20468549)
chr5 (1-299)||(21564121-21564419)
chr5 (11-275)||(21498215-21498479)
chr5 (4-275)||(22348361-22348630)
chr5 (4-275)||(18775713-18775984)
chr5 (40-275)||(19769932-19770167)
chr5 (4-275)||(21984484-21984755)
chr5 (40-275)||(41770814-41771049)
chr5 (4-240)||(23516477-23516713)
chr5 (4-275)||(25423125-25423396)
chr5 (4-275)||(29476252-29476523)
chr5 (1-275)||(20798693-20798967)
chr5 (4-161)||(20573457-20573614)
chr5 (4-275)||(23440161-23440432)
chr5 (4-275)||(23471165-23471436)
chr5 (1-140)||(21343672-21343811)
chr5 (169-275)||(21339465-21339571)
chr5 (1-197)||(21662297-21662492)
chr5 (1-197)||(21665758-21665953)
chr5 (91-303)||(11210845-11211057)
chr5 (202-298)||(21831899-21831995)
chr5 (184-275)||(21404936-21405027)
chr5 (91-236)||(21937406-21937551)
chr5 (91-236)||(24581216-24581361)
chr5 (91-236)||(27011089-27011234)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (4-303)||(4925-5224)
scaffold0034 (1-303)||(13873-14175)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-303)||(117600-117902)
scaffold0004 (1-303)||(322736-323038)
scaffold0004 (1-299)||(385851-386149)
scaffold0004 (1-303)||(112053-112355)
scaffold0004 (4-302)||(203441-203739)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-303)||(23293590-23293892)
chr2 (1-303)||(23276408-23276710)
chr2 (1-299)||(12573985-12574283)
chr2 (4-302)||(11358384-11358682)
chr2 (4-302)||(20832620-20832918)
chr2 (1-299)||(27787373-27787671)
chr2 (4-299)||(31830293-31830588)
chr2 (1-211)||(24653977-24654187)
chr2 (4-302)||(1063386-1063684)
chr2 (4-169)||(24945002-24945167)
chr2 (1-242)||(27365649-27365890)
chr2 (1-292)||(23087082-23087373)
chr2 (4-275)||(24878532-24878803)
chr2 (4-275)||(9609771-9610042)
chr2 (4-275)||(24262005-24262276)
chr2 (4-275)||(16924895-16925166)
chr2 (4-275)||(16998635-16998906)
chr2 (4-275)||(44386106-44386377)
chr2 (4-266)||(21145576-21145838)
chr2 (28-302)||(24825792-24826066)
chr2 (4-266)||(27217651-27217913)
chr2 (4-275)||(10868485-10868756)
chr2 (4-275)||(16981787-16982058)
chr2 (4-275)||(17063352-17063623)
chr2 (40-275)||(22325393-22325628)
chr2 (40-275)||(24709704-24709939)
chr2 (1-275)||(24675121-24675395)
chr2 (1-275)||(24708019-24708293)
chr2 (40-275)||(27370940-27371175)
chr2 (41-275)||(17067047-17067281)
chr2 (1-263)||(21325815-21326077)
chr2 (1-275)||(22757000-22757274)
chr2 (2-240)||(23138670-23138908)
chr2 (2-240)||(23550460-23550698)
chr2 (4-266)||(23063712-23063974)
chr2 (4-233)||(23188643-23188872)
chr2 (4-179)||(27377104-27377279)
chr2 (169-274)||(30211455-30211560)
chr2 (171-302)||(45529313-45529444)
chr2 (4-102)||(41609054-41609152)
chr2 (91-236)||(12640495-12640640)
chr2 (91-236)||(22276001-22276146)
chr2 (91-212)||(24831787-24831908)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-303)||(17103-17405)
scaffold0298 (1-303)||(13333-13635)
scaffold0298 (2-303)||(20016-20317)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-303)||(10920-11222)
scaffold0124 (2-303)||(371-672)
scaffold0124 (91-236)||(7849-7994)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-303)||(20940104-20940406)
chr1 (1-303)||(19664917-19665219)
chr1 (1-303)||(19854330-19854632)
chr1 (1-303)||(20835929-20836234)
chr1 (1-300)||(22433160-22433459)
chr1 (4-302)||(20294431-20294729)
chr1 (4-302)||(37677098-37677397)
chr1 (4-299)||(31550226-31550521)
chr1 (1-299)||(20856806-20857104)
chr1 (51-299)||(41307891-41308139)
chr1 (1-275)||(20075128-20075402)
chr1 (1-218)||(20244216-20244433)
chr1 (58-294)||(11382667-11382903)
chr1 (4-275)||(19106386-19106657)
chr1 (1-266)||(50620322-50620587)
chr1 (4-275)||(17045084-17045355)
chr1 (1-302)||(19760908-19761209)
chr1 (4-275)||(16350668-16350939)
chr1 (40-275)||(33391098-33391333)
chr1 (4-275)||(20249869-20250140)
chr1 (1-164)||(20395173-20395336)
chr1 (4-275)||(21830322-21830593)
chr1 (40-275)||(21837005-21837240)
chr1 (4-275)||(51333562-51333833)
chr1 (1-240)||(16369313-16369552)
chr1 (4-275)||(21747554-21747824)
chr1 (4-263)||(41354550-41354809)
chr1 (4-275)||(20136797-20137068)
chr1 (1-155)||(50612605-50612759)
chr1 (4-140)||(16078837-16078973)
chr1 (182-275)||(16078721-16078814)
chr1 (91-178)||(20914316-20914403)
chr1 (4-83)||(21163299-21163378)
chr1 (91-212)||(46518827-46518948)
chr1 (91-236)||(20831500-20831645)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (5-303)||(42305-42603)
scaffold0010 (5-303)||(47371-47669)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (1-303)||(22061845-22062147)
chr8 (1-299)||(21324825-21325124)
chr8 (1-303)||(21681882-21682184)
chr8 (1-303)||(1266306-1266607)
chr8 (1-303)||(31416886-31417188)
chr8 (1-299)||(20007917-20008215)
chr8 (1-302)||(29303839-29304140)
chr8 (1-299)||(23654994-23655292)
chr8 (4-302)||(6679181-6679479)
chr8 (4-302)||(12304828-12305126)
chr8 (4-302)||(6603728-6604026)
chr8 (1-299)||(31571258-31571556)
chr8 (4-295)||(14565212-14565503)
chr8 (4-302)||(804086-804384)
chr8 (1-292)||(20010323-20010614)
chr8 (1-299)||(21840484-21840782)
chr8 (1-299)||(19851478-19851776)
chr8 (1-299)||(19857514-19857812)
chr8 (79-303)||(22051008-22051232)
chr8 (4-206)||(16265127-16265329)
chr8 (4-212)||(28982427-28982635)
chr8 (4-212)||(28987647-28987855)
chr8 (4-275)||(15533450-15533721)
chr8 (13-275)||(22120614-22120876)
chr8 (1-302)||(20396538-20396839)
chr8 (4-268)||(32600214-32600478)
chr8 (4-275)||(17674463-17674734)
chr8 (4-275)||(23650111-23650382)
chr8 (43-275)||(19978076-19978308)
chr8 (4-140)||(27347296-27347432)
chr8 (40-275)||(20018190-20018425)
chr8 (4-275)||(30313584-30313855)
chr8 (4-266)||(19112760-19113022)
chr8 (1-275)||(21166977-21167251)
chr8 (1-293)||(20388166-20388458)
chr8 (4-275)||(22046443-22046714)
chr8 (4-263)||(19485322-19485581)
chr8 (4-236)||(22987271-22987503)
chr8 (4-275)||(16408485-16408756)
chr8 (91-266)||(22377902-22378077)
chr8 (91-266)||(22384077-22384252)
chr8 (4-235)||(21251012-21251243)
chr8 (4-275)||(22133481-22133752)
chr8 (4-275)||(22164631-22164902)
chr8 (4-275)||(21922175-21922446)
chr8 (172-266)||(23949158-23949252)
chr8 (201-302)||(16271637-16271738)
chr8 (10-233)||(22032108-22032331)
chr8 (43-266)||(21394314-21394537)
chr8 (43-266)||(21788807-21789030)
chr8 (4-128)||(15441251-15441375)
chr8 (91-236)||(22315348-22315493)
chr8 (10-199)||(23948965-23949154)
chr8 (91-268)||(20652780-20652957)
chr8 (91-236)||(16877574-16877719)
chr8 (91-239)||(21850813-21850961)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (1-303)||(14223-14525)
scaffold0203 (1-116)||(9036-9151)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (1-301)||(16145913-16146213)
chr4 (3-299)||(15245927-15246223)
chr4 (1-303)||(1649246-1649548)
chr4 (4-302)||(3264764-3265062)
chr4 (1-303)||(33222919-33223221)
chr4 (4-302)||(44661836-44662134)
chr4 (4-302)||(11207201-11207499)
chr4 (49-303)||(15359059-15359313)
chr4 (1-299)||(15003337-15003635)
chr4 (1-299)||(51606154-51606452)
chr4 (1-302)||(20890984-20891284)
chr4 (4-302)||(29453507-29453805)
chr4 (73-299)||(27900459-27900685)
chr4 (1-299)||(15070414-15070712)
chr4 (72-281)||(16752665-16752874)
chr4 (1-202)||(42702904-42703105)
chr4 (4-275)||(12523680-12523951)
chr4 (4-275)||(8386416-8386687)
chr4 (4-275)||(12476604-12476875)
chr4 (4-275)||(14652312-14652583)
chr4 (4-275)||(14680571-14680842)
chr4 (4-275)||(19778530-19778801)
chr4 (4-275)||(29039141-29039412)
chr4 (1-275)||(14851103-14851377)
chr4 (3-275)||(23955750-23956022)
chr4 (4-275)||(18297209-18297480)
chr4 (4-275)||(14266636-14266907)
chr4 (4-275)||(14303715-14303985)
chr4 (4-290)||(14159496-14159782)
chr4 (1-275)||(15149743-15150017)
chr4 (4-274)||(16252183-16252453)
chr4 (1-128)||(18164333-18164460)
chr4 (40-275)||(27711376-27711611)
chr4 (4-275)||(40473044-40473315)
chr4 (190-299)||(15077825-15077934)
chr4 (40-275)||(8053360-8053595)
chr4 (4-268)||(18227190-18227454)
chr4 (1-275)||(16355182-16355456)
chr4 (4-275)||(7090437-7090707)
chr4 (4-179)||(15364390-15364565)
chr4 (166-299)||(8706084-8706217)
chr4 (145-275)||(1640162-1640292)
chr4 (104-292)||(15415006-15415194)
chr4 (168-275)||(16676440-16676547)
chr4 (4-120)||(14927151-14927267)
chr4 (91-236)||(9290926-9291071)
chr4 (91-236)||(12132445-12132590)
chr4 (91-236)||(16445248-16445393)
chr4 (91-240)||(14997407-14997556)
chr4 (91-236)||(15293193-15293338)
chr4 (1-41)||(15415210-15415250)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-303)||(18134543-18134845)
chr3 (1-303)||(11303970-11304272)
chr3 (1-303)||(12360739-12361041)
chr3 (1-299)||(15953169-15953467)
chr3 (1-299)||(14571478-14571776)
chr3 (19-303)||(16836707-16836991)
chr3 (2-301)||(13322851-13323150)
chr3 (1-299)||(8759283-8759581)
chr3 (1-302)||(16329857-16330158)
chr3 (1-299)||(10420246-10420544)
chr3 (1-299)||(13941654-13941952)
chr3 (1-302)||(11961232-11961533)
chr3 (1-299)||(41177152-41177450)
chr3 (4-295)||(10383602-10383893)
chr3 (4-299)||(47123577-47123872)
chr3 (1-299)||(44776877-44777175)
chr3 (1-288)||(16381142-16381426)
chr3 (1-299)||(12850480-12850778)
chr3 (1-292)||(15227279-15227570)
chr3 (1-234)||(13972386-13972619)
chr3 (1-234)||(14086303-14086536)
chr3 (10-275)||(16412518-16412783)
chr3 (1-275)||(12497868-12498142)
chr3 (1-275)||(14876735-14877009)
chr3 (4-275)||(10005223-10005494)
chr3 (4-275)||(10905833-10906104)
chr3 (4-275)||(15247770-15248041)
chr3 (4-275)||(16635396-16635667)
chr3 (4-275)||(43162720-43162991)
chr3 (4-275)||(5425166-5425436)
chr3 (4-275)||(13252313-13252584)
chr3 (40-275)||(15348481-15348716)
chr3 (40-275)||(15589628-15589863)
chr3 (4-275)||(15725170-15725440)
chr3 (10-275)||(15208520-15208785)
chr3 (40-275)||(20062290-20062525)
chr3 (4-275)||(48425070-48425341)
chr3 (4-275)||(15338892-15339163)
chr3 (4-275)||(15402746-15403017)
chr3 (4-275)||(16691783-16692054)
chr3 (4-275)||(16756821-16757092)
chr3 (4-275)||(17489473-17489744)
chr3 (40-275)||(26792635-26792870)
chr3 (4-275)||(53385254-53385525)
chr3 (2-275)||(16371034-16371307)
chr3 (4-275)||(6600370-6600641)
chr3 (10-275)||(16492417-16492682)
chr3 (4-275)||(9522342-9522613)
chr3 (4-275)||(16807162-16807433)
chr3 (230-303)||(17492489-17492562)
chr3 (1-76)||(31945102-31945177)
chr3 (1-74)||(31689049-31689122)
chr3 (70-275)||(15015980-15016185)
chr3 (230-299)||(28754177-28754246)
chr3 (235-299)||(4678302-4678366)
chr3 (91-236)||(8274674-8274819)
chr3 (91-236)||(15576470-15576615)
chr3 (232-299)||(13001770-13001837)
chr3 (167-236)||(6712684-6712753)
chr3 (91-236)||(16742978-16743123)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-303)||(195675-195976)
scaffold0011 (1-303)||(148602-148904)
scaffold0011 (1-275)||(26533-26807)
scaffold0011 (1-140)||(68575-68714)
scaffold0011 (91-236)||(121989-122134)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (1-298)||(21648-21945)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (2-301)||(19153-19452)
scaffold0058 (13-238)||(58443-58668)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (1-302)||(16950428-16950729)
chr7 (1-303)||(6413502-6413804)
chr7 (1-292)||(15102568-15102859)
chr7 (1-303)||(1363-1665)
chr7 (1-303)||(14286332-14286634)
chr7 (1-303)||(12455693-12455995)
chr7 (4-299)||(49152295-49152590)
chr7 (1-303)||(14129864-14130166)
chr7 (5-299)||(14264204-14264498)
chr7 (1-303)||(14433682-14433984)
chr7 (1-299)||(16072254-16072552)
chr7 (1-301)||(13021348-13021648)
chr7 (3-299)||(19147204-19147500)
chr7 (4-295)||(11306227-11306518)
chr7 (1-296)||(18053916-18054211)
chr7 (4-302)||(8212085-8212383)
chr7 (3-299)||(20746603-20746899)
chr7 (1-276)||(13665544-13665814)
chr7 (1-299)||(23199703-23200001)
chr7 (1-299)||(23505830-23506128)
chr7 (1-251)||(26288045-26288294)
chr7 (71-299)||(26118565-26118793)
chr7 (1-292)||(11388395-11388685)
chr7 (4-275)||(11553108-11553379)
chr7 (4-269)||(12687494-12687759)
chr7 (4-269)||(14954613-14954878)
chr7 (153-303)||(15340574-15340724)
chr7 (4-275)||(8707598-8707869)
chr7 (1-304)||(14037797-14038100)
chr7 (1-304)||(14347827-14348130)
chr7 (4-275)||(10870988-10871259)
chr7 (1-292)||(12206767-12207058)
chr7 (4-275)||(15161063-15161334)
chr7 (1-275)||(15624542-15624816)
chr7 (4-275)||(14332390-14332661)
chr7 (40-275)||(18551764-18551999)
chr7 (4-275)||(8198621-8198892)
chr7 (4-275)||(15154658-15154929)
chr7 (4-275)||(23516775-23517046)
chr7 (171-303)||(12456940-12457072)
chr7 (4-275)||(17322-17593)
chr7 (4-275)||(11237219-11237490)
chr7 (40-275)||(13686093-13686328)
chr7 (4-275)||(18177735-18178006)
chr7 (40-275)||(44791357-44791592)
chr7 (1-88)||(15340487-15340574)
chr7 (1-299)||(15203869-15204167)
chr7 (91-236)||(4440008-4440153)
chr7 (115-275)||(35964856-35965016)
chr7 (150-302)||(11772220-11772372)
chr7 (226-302)||(13968625-13968701)
chr7 (169-275)||(21662119-21662225)
chr7 (91-236)||(14936427-14936572)
chr7 (91-266)||(12193636-12193811)
chr7 (190-275)||(9596236-9596321)
chr7 (91-236)||(15364020-15364165)
chr7 (4-40)||(26118803-26118839)
chr7 (91-236)||(7823980-7824125)
chr7 (91-236)||(27107819-27107964)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (26-303)||(14381581-14381858)
chr6 (1-302)||(10468964-10469265)
chr6 (1-303)||(8766262-8766564)
chr6 (15-299)||(17415365-17415649)
chr6 (1-303)||(22796746-22797048)
chr6 (1-299)||(27560735-27561033)
chr6 (52-299)||(18800858-18801105)
chr6 (4-302)||(24364280-24364578)
chr6 (1-299)||(15459201-15459499)
chr6 (4-299)||(28282931-28283226)
chr6 (1-293)||(21471466-21471758)
chr6 (1-287)||(25768056-25768342)
chr6 (1-275)||(14131321-14131595)
chr6 (1-292)||(34645711-34646002)
chr6 (1-227)||(25750674-25750900)
chr6 (1-242)||(19879163-19879404)
chr6 (1-247)||(21564302-21564548)
chr6 (1-242)||(11287773-11288014)
chr6 (1-275)||(5839361-5839635)
chr6 (1-269)||(18794555-18794823)
chr6 (4-275)||(1543226-1543497)
chr6 (4-275)||(27331575-27331846)
chr6 (4-275)||(27392315-27392586)
chr6 (1-242)||(11280680-11280921)
chr6 (4-275)||(29592062-29592333)
chr6 (4-275)||(23078337-23078608)
chr6 (4-275)||(24313310-24313581)
chr6 (4-275)||(28263339-28263610)
chr6 (4-275)||(28342088-28342359)
chr6 (40-275)||(16626859-16627094)
chr6 (4-275)||(25112420-25112691)
chr6 (1-275)||(12497891-12498165)
chr6 (1-275)||(12510736-12511010)
chr6 (1-269)||(18197695-18197963)
chr6 (4-275)||(16963509-16963780)
chr6 (40-275)||(27187340-27187575)
chr6 (40-275)||(27261665-27261900)
chr6 (11-275)||(12505230-12505494)
chr6 (4-263)||(22078842-22079101)
chr6 (4-275)||(28292514-28292785)
chr6 (5-275)||(25610003-25610273)
chr6 (4-275)||(2874945-2875216)
chr6 (4-275)||(25765432-25765702)
chr6 (94-292)||(1640730-1640928)
chr6 (43-236)||(18408124-18408317)
chr6 (4-140)||(17032430-17032566)
chr6 (1-269)||(19864552-19864820)
chr6 (10-275)||(16927782-16928047)
chr6 (91-212)||(25750901-25751022)
chr6 (227-303)||(19453511-19453587)
chr6 (4-208)||(22762664-22762868)
chr6 (1-140)||(21833258-21833397)
chr6 (196-275)||(22433929-22434008)
chr6 (91-268)||(15078513-15078690)
chr6 (91-251)||(16098005-16098165)
chr6 (91-236)||(23996203-23996348)
chr6 (94-240)||(16233167-16233313)
chr6 (91-236)||(16382554-16382699)
chr6 (91-239)||(1648962-1649110)
chr6 (91-231)||(18571606-18571746)
chr6 (1-69)||(22433862-22433930)
chr6 (145-257)||(25655492-25655604)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-303)||(7210-7510)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-299)||(27551-27849)
scaffold0139 (1-293)||(1131-1422)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (1-303)||(20154-20456)
scaffold0114 (1-303)||(43537-43839)
scaffold0114 (1-303)||(44549-44851)
scaffold0114 (4-134)||(36090-36220)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-299)||(47156-47454)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-303)||(49179-49481)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-303)||(42815-43117)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-303)||(2783-3085)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-303)||(248645-248947)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-299)||(4782-5080)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-303)||(1496-1798)
scaffold0120 (4-275)||(6058-6329)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-296)||(31442-31737)
scaffold0106 (10-236)||(14080-14306)
scaffold0106 (181-275)||(17654-17748)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-303)||(130-432)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-299)||(10059-10357)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-303)||(52151-52453)
scaffold0067 (1-303)||(61185-61487)
scaffold0067 (1-303)||(67573-67875)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-303)||(25837-26139)
scaffold0113 (4-239)||(16711-16946)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-303)||(260340-260642)
scaffold0005 (4-275)||(164709-164980)
scaffold0005 (4-275)||(308694-308965)
scaffold0005 (1-275)||(278830-279104)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-299)||(1145-1443)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-303)||(57789-58090)
scaffold0053 (10-299)||(49009-49298)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-297)||(27258-27553)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-299)||(39771-40069)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-291)||(90916-91206)
scaffold0001 (4-275)||(448094-448365)
scaffold0001 (61-137)||(175355-175431)
scaffold0001 (4-232)||(162148-162376)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (3-299)||(3925-4221)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-297)||(26293-26589)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-299)||(51839-52137)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-299)||(6215-6514)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (37-303)||(10837-11103)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (49-299)||(38150-38400)
scaffold0026 (1-297)||(37234-37530)
scaffold0026 (49-242)||(27370-27563)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (1-291)||(18521-18811)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-303)||(12753-13055)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (4-302)||(16686-16984)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (71-303)||(5315-5547)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-293)||(26174-26466)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-299)||(3907-4205)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-299)||(9830-10123)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-299)||(95978-96276)
scaffold0029 (1-247)||(112591-112837)
scaffold0029 (4-275)||(109811-110082)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-304)||(7007-7310)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (5-299)||(5890-6184)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-291)||(14118-14407)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (4-302)||(38860-39158)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (1-252)||(223-474)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-299)||(4978-5276)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (106-299)||(7-200)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-197)||(4217-4413)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (83-299)||(1908-2124)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-292)||(560-851)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (141-303)||(3327-3489)
scaffold0222 (1-60)||(3483-3542)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (158-303)||(78-223)
scaffold1710 (91-236)||(949-1094)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-302)||(15052-15353)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-266)||(4064-4329)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (124-299)||(1210-1385)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (4-275)||(7412-7683)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-275)||(16465-16739)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (174-303)||(5424-5553)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-234)||(33718-33951)
scaffold0076 (91-236)||(40380-40525)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-266)||(3172-3437)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-240)||(18881-19120)
scaffold0090 (52-240)||(23094-23282)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (4-275)||(43189-43460)
scaffold0028 (1-234)||(50555-50788)
scaffold0028 (4-275)||(8520-8791)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-128)||(136151-136278)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (43-275)||(229117-229349)
scaffold0012 (43-275)||(219417-219649)
scaffold0012 (91-239)||(33031-33179)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-275)||(708-982)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-275)||(180249-180523)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-233)||(27999-28231)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (4-275)||(14395-14666)
scaffold0044 (40-275)||(691-926)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (4-275)||(65440-65711)
scaffold0042 (1-140)||(39924-40063)
scaffold0042 (188-275)||(39819-39906)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (4-302)||(25692-25990)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (1-266)||(269-534)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (46-275)||(9047-9276)
scaffold0507 (91-257)||(351-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (3-292)||(10723-11011)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-177)||(1209-1385)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (4-275)||(449-720)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-148)||(13380-13527)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-231)||(26-256)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-299)||(25047-25345)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-275)||(14909-15183)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (34-275)||(7855-8096)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (4-275)||(15528-15798)
scaffold0333 (184-275)||(15870-15961)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (4-266)||(17022-17284)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-275)||(127199-127473)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (13-275)||(46-308)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-266)||(1040-1301)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (1-118)||(2023-2140)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-293)||(28750-29043)
scaffold0064 (1-293)||(40741-41034)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (4-275)||(33573-33844)
scaffold0109 (4-275)||(8631-8902)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-275)||(32752-33026)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-266)||(6046-6311)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (34-275)||(21932-22173)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (40-275)||(7009-7245)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (71-275)||(780-984)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (4-275)||(1174-1445)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (4-275)||(49528-49799)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (1-275)||(116905-117179)
scaffold0037 (91-178)||(23563-23650)
scaffold0037 (91-236)||(98137-98282)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-275)||(64031-64305)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-302)||(940-1241)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (94-275)||(7522-7703)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (4-236)||(9378-9610)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (93-266)||(12986-13159)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (10-275)||(16416-16681)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (4-275)||(4405-4676)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (4-275)||(694-964)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (4-275)||(5256-5527)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (52-235)||(6455-6638)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (237-303)||(6309-6375)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-133)||(16989-17121)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-133)||(4567-4699)
scaffold0023 (184-240)||(4489-4545)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (65-275)||(823-1032)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (169-274)||(86505-86610)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (7-67)||(8768-8828)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (1-260)||(5606-5864)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (145-236)||(10832-10923)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-67)||(45877-45943)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (91-236)||(8930-9075)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (91-236)||(3281-3426)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (91-236)||(5863-6008)
scaffold0447 (91-236)||(10477-10622)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (91-236)||(8472-8617)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (91-236)||(14645-14790)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (1-41)||(871-911)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (187-260)||(3734-3807)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (91-236)||(13030-13175)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (91-233)||(8217-8359)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (91-236)||(425-570)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (91-236)||(3914-4059)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (91-236)||(14776-14921)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (91-236)||(46276-46421)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (91-212)||(24002-24123)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22236373 - 22236071
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22236373 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 22236274  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22236273 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 22236174  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22236173 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaacacaacactc 22236074  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  22236073 tct 22236071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 22381114 - 22381415
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381114 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 22381213  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22381214 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatg 22381313  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381314 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 22381413  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  22381414 tc 22381415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23080542 - 23080240
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23080542 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 23080443  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  23080442 tcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatg 23080343  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23080342 ataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtctggtcccaacaccacactc 23080243  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  23080242 tct 23080240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17269786 - 17269484
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17269786 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 17269687  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17269686 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 17269587  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17269586 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 17269487  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  17269486 tct 17269484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20821368 - 20821666
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20821368 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaact 20821467  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  20821468 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatg 20821567  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20821568 gtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacact 20821666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21891212 - 21890914
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21891212 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaact 21891113  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891112 tcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 21891013  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21891012 gtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaacactacact 21890914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23442746 - 23442448
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| | || ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23442746 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaaca 23442647  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23442646 tcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatg 23442547  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23442546 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 23442448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 22502597 - 22502895
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22502597 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcc 22502696  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22502697 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggta 22502796  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22502797 actcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtcccaacacaacactctc 22502895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14887441 - 14887146
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14887441 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttc 14887342  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14887341 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 14887242  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14887241 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacact 14887146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 22461867 - 22462165
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  22461867 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaact 22461966  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22461967 tcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 22462066  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22462067 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaacacaacact 22462165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37545947 - 37545651
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37545947 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 37545848  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaata-catgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  37545847 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggt 37545748  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37545747 aactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacacaacact 37545651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 20342200 - 20342498
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20342200 tgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 20342299  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  20342300 tcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 20342399  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20342400 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 20342498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 25847993 - 25848291
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  25847993 tgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttc 25848092  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||    
T  25848093 tcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggta 25848192  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25848193 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 25848291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28924221 - 28923923
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28924221 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaact 28924122  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  28924121 ttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatg 28924022  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28924021 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacact 28923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24798847 - 24798552
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24798847 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcc 24798748  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24798747 tcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggta 24798648  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24798647 actcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccagtcccaacacaacact 24798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28895395 - 28895097
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||  |||||||| || || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28895395 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaact 28895296  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  28895295 ttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatg 28895196  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28895195 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacact 28895097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 20773675 - 20773971
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20773675 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaact 20773774  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  | || |||||||||| |||  | |||| ||||||||||||    
T  20773775 ttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatg 20773874  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 297  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20773875 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaaca 20773971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24736064 - 24735773
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24736064 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 24735965  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24735964 tcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 24735865  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || |||||||| ||||| |  || ||||||||||    
T  24735864 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaaca 24735773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24750007 - 24749716
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24750007 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 24749908  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24749907 tcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 24749808  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || |||||||| ||||| |  || ||||||||||    
T  24749807 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaaca 24749716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24737238 - 24737011
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24737238 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 24737139  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24737138 tcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 24737039  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgct 228  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||    
T  24737038 atagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 22134604 - 22134875
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  22134604 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 22134703  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||    
T  22134704 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggta 22134803  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22134804 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaac 22134875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26739155 - 26738893
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| | | | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  26739155 tgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttct 26739056  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |  || |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  26739055 ttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgata 26738956  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  26738955 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 26738893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16356438 - 16356709
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16356438 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16356537  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16356538 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 16356637  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16356638 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16356709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22333337 - 22333066
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  22333337 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 22333238  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  22333237 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 22333138  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| ||||| || |||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  22333137 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaac 22333066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27685850 - 27685579
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27685850 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 27685751  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  27685750 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 27685651  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27685650 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27685579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 34566430 - 34566701
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  34566430 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 34566529  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  34566530 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 34566629  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  34566630 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 34566701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15000189 - 14999918
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  15000189 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 15000090  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||| ||| ||||| ||    
T  15000089 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgata 14999990  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  14999989 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 14999918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 23573678 - 23573949
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  23573678 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 23573777  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  23573778 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 23573877  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23573878 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 23573949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 27610326 - 27610561
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27610326 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 27610425  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||    
T  27610426 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctc 27610525  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27610526 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27610561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 27518379 - 27518614
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27518379 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 27518478  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| ||  | || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27518479 tgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 27518578  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27518579 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27518614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27668940 - 27668669
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  27668940 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 27668841  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  27668840 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 27668741  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27668740 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27668669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37291946 - 37291675
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||      
T  37291946 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaactttt 37291847  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||    
T  37291846 ttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgata 37291747  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||||||||| || |||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  37291746 actcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaac 37291675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 40708716 - 40708987
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  40708716 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 40708815  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||  | || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  40708816 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 40708915  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  40708916 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 40708987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20468549 - 20468275
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| ||| | |  || ||  ||||| || |||||||||| ||| |  |||||||||    
T  20468549 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaact 20468450  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||| || |||||    
T  20468449 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatg 20468350  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || |||||    
T  20468349 ataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21564419 - 21564121
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || | ||| || || |||||| |||| |||||||| |||  ||||||||| |    
T  21564419 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaat 21564320  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |  ||||  |||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  21564319 tcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatg 21564220  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||    
T  21564219 ataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatctagtcccaacactacact 21564121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498215
Alignment:
Q  11 tcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgactt 110  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||  ||  ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  111 caatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttc 210  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| | |||| || |||| || ||||||||| ||||| |||||||| | | |  |||||||||| ||||||||||||||     
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  211 tgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaac 21498215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 22348361 - 22348630
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  22348361 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 22348460  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||| ||||||||||    || |||||||| || || ||    
T  22348461 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcccgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgata 22348558  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||| || || |||   |||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  22348559 actcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 22348630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 18775713 - 18775984
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  18775713 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 18775812  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  18775813 ttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 18775912  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18775913 actcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 18775984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 19769932 - 19770167
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19769932 taagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 19770031  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  19770032 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 19770131  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  19770132 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 19770167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21984755 - 21984484
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    |||||||||||||| || ||| | || || |||| ||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  21984755 tgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 21984656  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  21984655 ttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 21984556  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  21984555 acttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaac 21984484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 41770814 - 41771049
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41770814 taagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 41770913  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||    
T  41770914 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctc 41771013  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  41771014 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 41771049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 23516477 - 23516713
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  23516477 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 23516576  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  23516577 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgata 23516676  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23516677 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23516713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 25423125 - 25423396
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||   ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||     
T  25423125 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttct 25423224  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  25423225 ttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggta 25423324  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  25423325 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaac 25423396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29476523 - 29476252
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||| | |||| |||||||||||||| |  |||||||||     
T  29476523 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttct 29476424  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  29476423 ttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 29476324  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | || ||||| ||||| || |||  |||||||   ||||| ||||||||||| |||||    
T  29476323 actcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaac 29476252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 20798693 - 20798967
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || | || ||| ||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  20798693 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatatttgatacggaccaataaatctcggagtcaact 20798792  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  20798793 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 20798892  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20798893 ataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaac 20798967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Original strand, 20573457 - 20573614
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20573457 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttcc 20573556  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatc 161  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20573557 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatc 20573614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 23440161 - 23440432
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || ||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  23440161 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttca 23440260  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || || ||||||| |||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  23440261 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgata 23440360  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  23440361 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaac 23440432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 23471165 - 23471436
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| | | | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||| | ||||||||||||| ||| |   ||||||||||     
T  23471165 tgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttct 23471264  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||   |||| || |||| |||||||||||| || || |||||||||||| | | ||||||||| ||||| |     
T  23471265 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgatt 23471364  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |   |||||||| || |||||| |||| || |||||    
T  23471365 actcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaac 23471436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21343811 - 21343672
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21343811 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaact 21343712  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  21343711 tctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagt 21343672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21339571 - 21339465
Alignment:
Q  169 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |    
T  21339571 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 21339472  T
Q  269 gatgaac 275  Q
    | |||||    
T  21339471 gttgaac 21339465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21662492 - 21662297
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||| || ||||||||| |||||  |||||| ||| | | ||||||||    
T  21662492 tcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgataca-accaataaacctcgaagtcaact 21662394  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtc 197  Q
    || |||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| || || | ||| ||||||||  | || ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21662393 tcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21665953 - 21665758
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||| || ||||||||| |||||  |||||| ||| | | ||||||||    
T  21665953 tcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgataca-accaataaacctcgaagtcaact 21665855  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtc 197  Q
    || |||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| || || | ||| ||||||||  | || ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21665854 tcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210845
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   | ||||| |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctg-atcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtccca 289  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| || ||| |||||||| ||||| || |||||||  || || |  |||||||| |    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctc-ctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtccta 11210859  T
Q  290 acacaacactctct 303  Q
    ||| ||||||||||    
T  11210858 acaaaacactctct 11210845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21831995 - 21831899
Alignment:
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacac 298  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| || || |  |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21831995 taactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 21404936 - 21405027
Alignment:
Q  184 ttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| || ||| | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  21404936 ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaac 21405027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937406
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 21937406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581361
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| || ||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 24581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011234
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatctt 27011234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4925
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14175 - 13873
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14175 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatt 14076  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14075 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 13976  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 13876  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  13875 tct 13873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 117600 - 117902
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117600 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 117699  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117700 tcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 117799  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117800 ataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 117899  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  117900 tct 117902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 322736 - 323038
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  322736 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaact 322835  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322836 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 322935  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  322936 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggacccaacacaacactc 323035  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  323036 tct 323038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 385851 - 386149
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | ||| || ||||| ||||||||||    
T  385851 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaact 385950  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  385951 tcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatg 386050  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  386051 gtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacactacact 386149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 112053 - 112355
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  112053 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaact 112152  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  112153 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatg 112252  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||  ||||| ||| || |||||| |||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||    
T  112253 atatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactc 112352  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  112353 tct 112355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 203739 - 203441
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||     
T  203739 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttct 203640  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | | |||||| ||||| ||  |||| |||| | |||| || || | ||| ||||| || || || ||||| |||||| | ||||| ||||| || || ||    
T  203639 ttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgata 203540  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  |||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  203539 aatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatattcggtcccaacactacactctc 203441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23293590 - 23293892
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293590 tcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 23293689  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293690 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 23293789  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293790 ataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 23293889  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  23293890 tct 23293892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23276408 - 23276710
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23276408 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgact 23276507  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23276508 tactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 23276607  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23276608 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 23276707  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  23276708 tct 23276710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 12573985 - 12574283
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12573985 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 12574084  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12574085 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatg 12574184  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12574185 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacact 12574283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11358682 - 11358384
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11358682 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 11358583  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  11358582 tcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggta 11358483  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11358482 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 11358384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 20832620 - 20832918
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20832620 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 20832719  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  20832720 tcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 20832819  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20832820 actcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctc 20832918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 27787373 - 27787671
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27787373 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 27787472  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27787473 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 27787572  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27787573 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 27787671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 31830293 - 31830588
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31830293 tgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 31830392  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  31830393 tcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 31830492  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31830493 actcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacact 31830588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 24653977 - 24654187
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24653977 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 24654076  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24654077 tcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatg 24654176  T
Q  201 gtaactcttct 211  Q
     ||||||||||    
T  24654177 ataactcttct 24654187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 1063386 - 1063684
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1063386 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 1063485  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  1063486 tcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 1063585  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1063586 actcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtcccaacacaacactctc 1063684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 24945002 - 24945167
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24945002 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 24945101  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcct 169  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24945102 ttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24945167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27365890 - 27365649
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27365890 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaact 27365791  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27365790 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 27365691  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27365690 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctct 27365649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 23087082 - 23087373
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||    
T  23087082 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaact 23087181  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||| ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23087182 tcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatg 23087281  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  || || || ||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  23087282 ataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatctggtcccaaca 23087373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24878803 - 24878532
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||   ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  24878803 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 24878704  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  24878703 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 24878604  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   ||||||   |||||||||||||| || |||||    
T  24878603 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaac 24878532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 9609771 - 9610042
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  9609771 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 9609870  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  9609871 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 9609970  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  9609971 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 9610042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 24262005 - 24262276
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  24262005 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttct 24262104  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  24262105 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 24262204  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  24262205 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 24262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16924895 - 16925166
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16924895 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16924994  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16924995 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 16925094  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16925095 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16925166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16998635 - 16998906
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16998635 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16998734  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16998735 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 16998834  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16998835 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16998906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44386377 - 44386106
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||||     
T  44386377 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttct 44386278  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  44386277 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgata 44386178  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  44386177 actcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 44386106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21145838 - 21145576
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| || |||| ||||| || |||||||||     
T  21145838 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttct 21145739  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  21145738 ttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 21145639  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||    
T  21145638 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagt 21145576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24826066 - 24825792
Alignment:
Q  28 aaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 127  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  || || |||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  24826066 aaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacac 24825967  T
Q  128 ccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgc 227  Q
    | |||| |||||| || || | |||||||| ||| || |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  24825966 cagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgc 24825867  T
Q  228 tttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  || |||||||| || ||||||||    
T  24825866 tttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctc 24825792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 27217651 - 27217913
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27217651 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 27217750  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  27217751 ttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 27217850  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||    
T  27217851 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagt 27217913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 10868485 - 10868756
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  10868485 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 10868584  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  10868585 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgata 10868684  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||| || ||||| |||||| | ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10868685 gctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 10868756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16981787 - 16982058
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16981787 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16981886  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16981887 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 16981986  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16981987 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16982058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 17063352 - 17063623
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  17063352 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 17063451  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  17063452 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 17063551  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  17063552 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 17063623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22325628 - 22325393
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22325628 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 22325529  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  22325528 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 22325429  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  22325428 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 22325393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 24709704 - 24709939
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24709704 taagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 24709803  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24709804 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 24709903  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  24709904 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 24709939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 24675121 - 24675395
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  24675121 tcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 24675220  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||    
T  24675221 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatg 24675320  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24675321 ataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 24675395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24708293 - 24708019
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||  | ||||||||||    
T  24708293 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaact 24708194  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  24708193 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatg 24708094  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24708093 atatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 24708019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 27370940 - 27371175
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27370940 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggag 27371039  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  27371040 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 27371139  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27371140 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27371175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 275
Target Start/End: Original strand, 17067047 - 17067281
Alignment:
Q  41 aagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17067047 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 17067146  T
Q  141 aaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
     || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||    
T  17067147 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 17067246  T
Q  241 ctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
      ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  17067247 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 17067281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21326077 - 21325815
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||||||    
T  21326077 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaact 21325978  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  21325977 tctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 21325878  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagt 263  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  21325877 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagt 21325815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22757274 - 22757000
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  22757274 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 22757175  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || |  || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  22757174 tctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 22757075  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22757074 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaac 22757000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 23138670 - 23138908
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  23138670 catgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaactt 23138769  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| || || || || |||||||| ||| | ||| ||||||| |||||     
T  23138770 ctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatga 23138869  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23138870 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23138908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 23550460 - 23550698
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  23550460 catgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaactt 23550559  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| || || || || |||||||| ||| | ||| ||||||| |||||     
T  23550560 ctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatga 23550659  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23550660 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23550698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 23063712 - 23063974
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||| || ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| || |||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  23063712 tgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttct 23063811  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  23063812 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggta 23063911  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  23063912 actcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 23063974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 23188643 - 23188872
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || |  |||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  23188643 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttct 23188742  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |  || || || |||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  23188743 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 23188842  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23188843 actcttttgtcgactctgcgacgctttcat 23188872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27377279 - 27377104
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  27377279 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 27377180  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaag 179  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||    
T  27377179 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaag 27377104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30211560 - 30211455
Alignment:
Q  169 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  30211560 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 30211461  T
Q  269 gatgaa 274  Q
    | ||||    
T  30211460 gttgaa 30211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 302
Target Start/End: Original strand, 45529313 - 45529444
Alignment:
Q  171 aaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctga 270  Q
    |||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||     
T  45529313 aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgt 45529412  T
Q  271 tgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||||||    
T  45529413 tgaacaatgtccggtcccaataccacactctc 45529444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 41609152 - 41609054
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41609152 tgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttc 41609054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640495
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| | |||||||  || |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 12640495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276146
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 22276146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831787
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||| | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctg 24831787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17405 - 17103
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17405 tcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 17306  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17305 tcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatg 17206  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17205 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacacaacactc 17106  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  17105 tct 17103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13635 - 13333
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635 tcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 13536  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13535 tcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatg 13436  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13435 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacacaacactc 13336  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  13335 tct 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Original strand, 20016 - 20317
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20016 catgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaactt 20115  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20116 cttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatga 20215  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactct 301  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20216 taactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaagacaacactct 20315  T
Q  302 ct 303  Q
    ||    
T  20316 ct 20317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11222
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10920 tcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 11019  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11020 tcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatg 11119  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11120 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacacaacactc 11219  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  11220 tct 11222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 371
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  672 catgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 573  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  572 cgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatga 473  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactct 301  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  472 taactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaacacaacactct 373  T
Q  302 ct 303  Q
    ||    
T  372 ct 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7849
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 7849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20940406 - 20940104
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940406 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 20940307  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20940306 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatg 20940207  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940206 ataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 20940107  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  20940106 tct 20940104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19665219 - 19664917
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19665219 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaact 19665120  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19665119 tcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatg 19665020  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19665019 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacaacactc 19664920  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  19664919 tct 19664917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 19854330 - 19854632
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19854330 tcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 19854429  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19854430 tcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 19854529  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19854530 ataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 19854629  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  19854630 tct 19854632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20836234 - 20835929
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20836234 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 20836135  T
Q  101 tcctc---gacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtc 197  Q
    || ||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20836134 tcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtc 20836035  T
Q  198 atggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 297  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20836034 atgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaaca 20835935  T
Q  298 ctctct 303  Q
    ||||||    
T  20835934 ctctct 20835929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22433459 - 22433160
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22433459 tcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaact 22433360  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22433359 tcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatg 22433260  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22433259 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacaccacactc 22433160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 20294431 - 20294729
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20294431 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttc 20294530  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20294531 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggta 20294630  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20294631 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 20294729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 37677098 - 37677397
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37677098 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 37677197  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcat-aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  37677198 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggt 37677297  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677298 aactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 37677397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31550521 - 31550226
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31550521 tgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 31550422  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  31550421 tcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 31550322  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31550321 actcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaacact 31550226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20857104 - 20856806
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  20857104 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaact 20857005  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  20857004 tcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtg 20856905  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  20856904 atagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtttcatgaaccaattccagccccaacacaacact 20856806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 299
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308139
Alignment:
Q  51 tccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcata 150  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  151 aatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatct 250  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattt 41308090  T
Q  251 tgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41308091 tgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaacaccacact 41308139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20075402 - 20075128
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20075402 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaact 20075303  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20075302 ttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatg 20075203  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20075202 gtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaac 20075128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20244216 - 20244433
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20244216 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaatctgatatggaccgatgaactttggagtcaact 20244315  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20244316 ttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 20244415  T
Q  201 gtaactcttctgacgact 218  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20244416 gtaactcttctgtcgact 20244433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 11382667 - 11382903
Alignment:
Q  58 ctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacat 157  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| ||||    
T  11382667 ctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacat 11382766  T
Q  158 gatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgacttt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11382767 gatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgacttt 11382866  T
Q  258 ctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacaca 294  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11382867 ctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacaca 11382903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 19106386 - 19106657
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||     
T  19106386 tgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttct 19106485  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||    
T  19106486 ttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgata 19106585  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  19106586 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 19106657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50620587 - 50620322
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  50620587 tcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaact 50620488  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| |||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  50620487 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 50620388  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||| || |||||||||||    
T  50620387 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagt 50620322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17045355 - 17045084
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | || |||||||||     
T  17045355 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttct 17045256  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  17045255 ttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 17045156  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17045155 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 17045084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19761209 - 19760908
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||    
T  19761209 tcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaact 19761110  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  19761109 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 19761010  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||    
T  19761009 ataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactc 19760910  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  19760909 tc 19760908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16350939 - 16350668
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16350939 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16350840  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16350839 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 16350740  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16350739 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16350668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33391333 - 33391098
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33391333 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 33391234  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  33391233 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 33391134  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  33391133 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 33391098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 20249869 - 20250140
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || || ||||||  ||||||| |||| || || ||||||||||||     
T  20249869 tgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttct 20249968  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  20249969 ttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggta 20250068  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20250069 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 20250140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20395336 - 20395173
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  20395336 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaat 20395237  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcacc 164  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  20395236 tcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcacc 20395173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 21830322 - 21830593
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  21830322 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 21830421  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || | |||||| || || ||    
T  21830422 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgata 21830521  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  21830522 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaac 21830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 21837005 - 21837240
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21837005 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 21837104  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  21837105 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctc 21837204  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  ||| |||||||||| || |||||    
T  21837205 ttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaac 21837240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51333833 - 51333562
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  51333833 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 51333734  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |  || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  51333733 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 51333634  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  51333633 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 51333562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16369313 - 16369552
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |  || |||||||||||||| || || |||||| ||||  ||||||| ||| | | ||||||||    
T  16369313 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaact 16369412  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| || |||| |||||||||||| || || || || |||||| | ||||||||||| |||||    
T  16369413 tctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatg 16369512  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
     |||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16369513 ataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttct 16369552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 21747554 - 21747824
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||  | ||| ||||||||     
T  21747554 tgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttct 21747653  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| | |||  || || || ||  ||||||||| |  ||| |||||||| | ||||||    
T  21747654 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaa-gatctttctacgcttattatggta 21747752  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  21747753 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 21747824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41354809 - 41354550
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||     
T  41354809 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttct 41354710  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  41354709 tcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 41354610  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagt 263  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||    
T  41354609 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagt 41354550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 20136797 - 20137068
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||||||  || | |||||||| | ||| ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||     
T  20136797 tgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttct 20136896  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||  | || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  20136897 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggta 20136996  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  20136997 actcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaac 20137068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50612759 - 50612605
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  50612759 tcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaact 50612660  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatac 155  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||    
T  50612659 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatac 50612605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16078973 - 16078837
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  16078973 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 16078874  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  16078873 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 16078837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16078814 - 16078721
Alignment:
Q  182 ccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16078814 ccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 16078721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914403
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaa 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 20914403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 21163299 - 21163378
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaat 83  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21163299 tgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518948
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
     ||| ||||| || ||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctg 46518948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831500
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 20831500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42603 - 42305
Alignment:
Q  5 gcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42603 gcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 42504  T
Q  105 cgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaa 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42503 cgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataa 42404  T
Q  205 ctcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42403 ctcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctct 42305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47669 - 47371
Alignment:
Q  5 gcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669 gcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 47570  T
Q  105 cgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaa 204  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47569 cgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataa 47470  T
Q  205 ctcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47469 ctcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctct 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22062147 - 22061845
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062147 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaact 22062048  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22062047 tcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatg 22061948  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061947 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 22061848  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  22061847 tct 22061845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21325124 - 21324825
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaa-gatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaac 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325124 tcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaac 21325025  T
Q  100 ttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21325024 ttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcat 21324925  T
Q  200 ggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21324924 gataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacaccacact 21324825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21682184 - 21681882
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682184 tcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 21682085  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682084 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 21681985  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21681984 ataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactc 21681885  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  21681884 tct 21681882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 1266306 - 1266607
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266306 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 1266405  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  1266406 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtg 1266505  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266506 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatctt-accttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 1266604  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  1266605 tct 1266607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31417188 - 31416886
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31417188 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaact 31417089  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  31417088 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatg 31416989  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  31416988 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaacacaacactc 31416889  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  31416888 tct 31416886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20007917 - 20008215
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20007917 tcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcacct 20008016  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20008017 tgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 20008116  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20008117 gtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacact 20008215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29304140 - 29303839
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29304140 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaact 29304041  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  29304040 tccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatg 29303941  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29303940 gtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 29303841  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  29303840 tc 29303839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 23654994 - 23655292
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654994 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 23655093  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23655094 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 23655193  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655194 gtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 23655292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 6679181 - 6679479
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6679181 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttc 6679280  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  6679281 tcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 6679380  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679381 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 6679479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 12304828 - 12305126
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  12304828 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttc 12304927  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12304928 tcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggta 12305027  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12305028 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacagcactctc 12305126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 6603728 - 6604026
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6603728 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 6603827  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  6603828 tcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 6603927  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603928 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 6604026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31571556 - 31571258
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  31571556 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaatttcggagtcaact 31571457  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31571456 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 31571357  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31571356 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 31571258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 14565212 - 14565503
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14565212 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcc 14565311  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  14565312 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggta 14565411  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaa 295  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14565412 acttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaa 14565503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 804384 - 804086
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  804384 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 804285  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  804284 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggta 804185  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804184 acttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 804086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20010614 - 20010323
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20010614 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaact 20010515  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20010514 tcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatg 20010415  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20010414 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtcccaaca 20010323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 21840484 - 21840782
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21840484 tcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 21840583  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21840584 tcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatg 21840683  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21840684 gtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacact 21840782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 19851478 - 19851776
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  19851478 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaact 19851577  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19851578 tcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatg 19851677  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  19851678 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacact 19851776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 19857514 - 19857812
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  19857514 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaact 19857613  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19857614 tcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatg 19857713  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  19857714 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacact 19857812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 79 - 303
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051232
Alignment:
Q  79 ccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaa 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  179 gggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 278  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  279 atccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  22051208 atctggtcccaacacaacactctct 22051232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16265329 - 16265127
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16265329 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcc 16265230  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  16265229 tcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 16265130  T
Q  204 act 206  Q
    |||    
T  16265129 act 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 28982427 - 28982635
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28982427 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcc 28982526  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28982527 tcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 28982626  T
Q  204 actcttctg 212  Q
    |||||||||    
T  28982627 actcttctg 28982635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 28987647 - 28987855
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28987647 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcc 28987746  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28987747 tcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 28987846  T
Q  204 actcttctg 212  Q
    |||||||||    
T  28987847 actcttctg 28987855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 15533450 - 15533721
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  15533450 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 15533549  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| || |||| ||| |  || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  15533550 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 15533649  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15533650 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaac 15533721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22120876 - 22120614
Alignment:
Q  13 gaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttca 112  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  22120876 gaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttca 22120777  T
Q  113 atgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  22120776 atgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 22120677  T
Q  213 acgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||| | |||||||| ||||| || |||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  22120676 tcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaac 22120614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20396839 - 20396538
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||  || |||  || || |||||| ||||| ||||||| ||  || ||||||  |    
T  20396839 tcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtt 20396740  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  20396739 tccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatg 20396640  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||| || ||||||    
T  20396639 ataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactc 20396540  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  20396539 tc 20396538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 32600214 - 32600478
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | || |||||||||     
T  32600214 tgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttct 32600313  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  32600314 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 32600413  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| || |||||||||||||    
T  32600414 actcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 32600478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17674734 - 17674463
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  17674734 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 17674635  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  17674634 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 17674535  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  17674534 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 17674463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 23650111 - 23650382
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  23650111 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 23650210  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||| |  || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  23650211 ttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggta 23650310  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  23650311 actcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaac 23650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 275
Target Start/End: Original strand, 19978076 - 19978308
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  19978076 gccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtga 19978175  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
    | |||| ||| || || || || || |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||      
T  19978176 ctctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttg 19978275  T
Q  243 gatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19978276 aatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 19978308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 27347296 - 27347432
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27347296 tgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcc 27347395  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  27347396 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagt 27347432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20018425 - 20018190
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20018425 taagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 20018326  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  20018325 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 20018226  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  20018225 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 20018190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30313855 - 30313584
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  30313855 tgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 30313756  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  30313755 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 30313656  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30313655 actcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 30313584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 19112760 - 19113022
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  19112760 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 19112859  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  19112860 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 19112959  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  19112960 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 19113022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21167251 - 21166977
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21167251 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 21167152  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||    
T  21167151 tctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatg 21167052  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  21167051 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 21166977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 20388166 - 20388458
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| |||  ||| |||||||    
T  20388166 tcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagatatctaatatggaccaataaaccgtggggtcaact 20388265  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| || ||||| ||||   |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20388266 tcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatg 20388365  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
     |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |  |||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  20388366 ataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgatgaactatatctcgtcccaacac 20388458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 22046443 - 22046714
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||| |||     
T  22046443 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttct 22046542  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || |||| ||| || || || || |||| |||||||||  ||||||| || || ||||| ||    
T  22046543 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgata 22046642  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22046643 actcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 22046714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19485581 - 19485322
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||     
T  19485581 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttct 19485482  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  19485481 tcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 19485382  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagt 263  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||    
T  19485381 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagt 19485322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 22987271 - 22987503
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |  |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  22987271 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttct 22987370  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||||||| |||| ||| | ||||  ||||| || || | |||||||||||| || || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  22987371 ttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgata 22987470  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
    |||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  22987471 actcttttgtcgattctgcgacgctttcatctt 22987503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16408756 - 16408485
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  16408756 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 16408657  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||  ||||| || || || || || |||| |||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  16408656 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgata 16408557  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16408556 actcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 16408485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22378077 - 22377902
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||   | |||||||    
T  22378077 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22377978  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  22377977 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 22377902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22384252 - 22384077
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||   | |||||||    
T  22384252 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22384153  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||| |||||    
T  22384152 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 22384077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 21251012 - 21251243
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  21251012 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 21251111  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || |  |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  21251112 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 21251211  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatct 235  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||||    
T  21251212 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatct 21251243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22133752 - 22133481
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |  || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  22133752 tgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 22133653  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||  | |||| ||| |||   || || ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| ||    
T  22133652 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgata 22133553  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22133552 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 22133481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22164902 - 22164631
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||      
T  22164902 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttat 22164803  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||  ||| ||| |||   || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  22164802 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 22164703  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22164702 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 22164631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21922446 - 21922175
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||||||||     
T  21922446 tgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttct 21922347  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  21922346 tcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 21922247  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||   |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  21922246 actcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaac 21922175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949252
Alignment:
Q  172 aactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagt 23949252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16271738 - 16271637
Alignment:
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16271738 gtaactcctctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactc 16271639  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  16271638 tc 16271637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 22032108 - 22032331
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||||  |||||| ||  | |||||||| ||| | ||||    
T  22032108 ttcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgact 22032207  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || |||| |||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22032208 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactctt 22032307  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
     || ||||| ||||||||||||||    
T  22032308 ttgtcgactctgcgacgctttcat 22032331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21394537 - 21394314
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |    
T  21394537 gccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtga 21394438  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
    | |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||      
T  21394437 ctctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttg 21394338  T
Q  243 gatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||||||| || ||||| |||||    
T  21394337 aatcatcttaaccttctcggtagt 21394314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21789030 - 21788807
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    ||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |    
T  21789030 gccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtga 21788931  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
    | |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||      
T  21788930 ctctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttg 21788831  T
Q  243 gatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||||||| || ||||| |||||    
T  21788830 aatcatcttaaccttctcggtagt 21788807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 15441251 - 15441375
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || | ||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  15441251 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 15441350  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacc 128  Q
    | |||||||| |||||||| |||||    
T  15441351 ttgacttcaaggcacgtccaacacc 15441375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 22315348 - 22315493
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || | |||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  22315348 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 22315447  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  22315448 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 22315493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 23948965 - 23949154
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||| | ||  || || |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||| | || |    
T  23948965 ttcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatt 23949064  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 199  Q
    |||| |||||||  | ||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23949065 tcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcat 23949154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652780
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| | || | || |||| |||||||||||||||  | |||||||| |   |||| || |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
     ||| | ||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||| |||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877574
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| | |||||||  || |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 16877574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850813
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||| | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
     ||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttc 21850813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14525 - 14223
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14525 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 14426  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14425 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatg 14326  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14325 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaacacaacactc 14226  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  14225 tct 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9151 - 9036
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9151 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 9052  T
Q  101 tcctcgacttcaatgc 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  9051 tcctcgacttcaatgc 9036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16145913 - 16146213
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16145913 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 16146012  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16146013 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 16146112  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16146113 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactc 16146212  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16146213 t 16146213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 15245927 - 15246223
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15245927 atgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 15246026  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15246027 ttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggt 15246126  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15246127 aactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 15246223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1649548 - 1649246
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1649548 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaact 1649449  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  1649448 tcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtg 1649349  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1649348 gtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 1649249  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  1649248 tct 1649246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3265062 - 3264764
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3265062 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 3264963  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  3264962 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 3264863  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264862 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 3264764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 33222919 - 33223221
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33222919 tcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaact 33223018  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  33223019 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatg 33223118  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  33223119 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacaccacactc 33223218  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  33223219 tct 33223221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44662134 - 44661836
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44662134 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 44662035  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  44662034 tcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggta 44661935  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44661934 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 44661836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11207499 - 11207201
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11207499 tgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 11207400  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  11207399 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 11207300  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11207299 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 11207201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359059
Alignment:
Q  49 gttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 148  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  149 taaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcat 248  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcat 15359114  T
Q  249 cttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15359113 ctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 15359059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15003635 - 15003337
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15003635 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaact 15003536  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15003535 tcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatg 15003436  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15003435 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacact 15003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51606452 - 51606154
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51606452 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 51606353  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  51606352 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 51606253  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51606252 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 51606154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 20890984 - 20891284
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  20890984 tcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaact 20891082  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20891083 tcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatg 20891182  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20891183 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacacaacactc 20891282  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  20891283 tc 20891284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29453805 - 29453507
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29453805 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 29453706  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  29453705 tcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 29453606  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29453605 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtcccaatacaacactctc 29453507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 299
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900685
Alignment:
Q  73 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  173 actcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatg 272  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatg 27900658  T
Q  273 aaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27900659 aaccaaatccggtcccaacacaacact 27900685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15070414 - 15070712
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||| | || |||||||| ||||| | ||||||||    
T  15070414 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaact 15070513  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |  |||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15070514 tcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatg 15070613  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15070614 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacact 15070712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 281
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752874
Alignment:
Q  72 atacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctga 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  172 aactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgat 271  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtttgat 16752864  T
Q  272 gaaccaaatc 281  Q
    ||||||||||    
T  16752865 gaaccaaatc 16752874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42702904 - 42703105
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42702904 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 42703003  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  42703004 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  42703104 gt 42703105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 12523680 - 12523951
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  12523680 tgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttct 12523779  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  12523780 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgata 12523879  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12523880 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 12523951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 8386416 - 8386687
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  8386416 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 8386515  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  8386516 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 8386615  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  8386616 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 8386687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 12476604 - 12476875
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  12476604 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 12476703  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  12476704 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 12476803  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||| || |||||    
T  12476804 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaac 12476875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 14652312 - 14652583
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||     
T  14652312 tgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttct 14652411  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  14652412 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 14652511  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  14652512 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 14652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 14680571 - 14680842
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||||||      
T  14680571 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttat 14680670  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || |  ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  14680671 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 14680770  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14680771 actcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 14680842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19778801 - 19778530
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  19778801 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 19778702  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  19778701 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 19778602  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  19778601 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 19778530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29039412 - 29039141
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  29039412 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 29039313  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  29039312 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 29039213  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  29039212 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 29039141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14851377 - 14851103
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  14851377 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaact 14851278  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || | |||||||||||| || || ||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  14851277 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatg 14851178  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||||| |||| || |||||    
T  14851177 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaac 14851103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 275
Target Start/End: Original strand, 23955750 - 23956022
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| |||| |||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23955750 atgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttc 23955849  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |    
T  23955850 tttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgat 23955949  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  23955950 aactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 23956022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 18297209 - 18297480
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  18297209 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 18297308  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  18297309 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 18297408  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  18297409 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 18297480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14266907 - 14266636
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  14266907 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 14266808  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || |||| ||| |  || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  14266807 ttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 14266708  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  14266707 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaac 14266636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14303985 - 14303715
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  14303985 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttct 14303887  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  14303886 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 14303787  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| ||||| || |||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  14303786 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaac 14303715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 14159496 - 14159782
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||  || || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||     
T  14159496 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttct 14159595  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||  | ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  14159596 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 14159695  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 290  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || || ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  14159696 actcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaa 14159782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15150017 - 15149743
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||    
T  15150017 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaact 15149918  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  15149917 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 15149818  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15149817 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaac 15149743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16252453 - 16252183
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  16252453 tgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 16252354  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  16252353 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 16252254  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaa 274  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || || |||   |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16252253 actcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaa 16252183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18164460 - 18164333
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18164460 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcagct 18164361  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 128  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||    
T  18164360 tcttagacttcaatgcacatcctacacc 18164333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 27711376 - 27711611
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27711376 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggag 27711475  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27711476 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 27711575  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27711576 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27711611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 40473044 - 40473315
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  40473044 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttct 40473143  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||| || || ||    
T  40473144 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgata 40473243  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||| || |||   ||||| |  |||||||||||||| || |||||    
T  40473244 actcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaac 40473315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 299
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077934
Alignment:
Q  190 cgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtccca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  290 acacaacact 299  Q
    |||| |||||    
T  15077925 acactacact 15077934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8053595 - 8053360
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8053595 taagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 8053496  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  |  | |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  8053495 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 8053396  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  8053395 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 8053360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18227454 - 18227190
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| | || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||||     
T  18227454 tgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttct 18227355  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||    
T  18227354 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgata 18227255  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18227254 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16355456 - 16355182
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  16355456 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 16355357  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || |  || || ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||    
T  16355356 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatg 16355257  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||| | || || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16355256 ataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 16355182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 7090437 - 7090707
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||| ||  | ||||||||||||     
T  7090437 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttct 7090535  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  7090536 ttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggta 7090635  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  7090636 actcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaac 7090707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 15364390 - 15364565
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  15364390 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 15364489  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaag 179  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||    
T  15364490 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaag 15364565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 299
Target Start/End: Original strand, 8706084 - 8706217
Alignment:
Q  166 tcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtag 265  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||  |||    
T  8706084 tccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaactttttctatag 8706183  T
Q  266 tctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  8706184 tctggtgaacaatatccggtcccaacactacact 8706217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1640292 - 1640162
Alignment:
Q  145 ctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctga 244  Q
    |||| |||||||||||| || || || ||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||   |    
T  1640292 ctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttgaa 1640193  T
Q  245 tcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1640192 tcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 1640162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15415194 - 15415006
Alignment:
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||  ||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  15415194 tcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgata 15415095  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  15415094 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatcaatttgaccttttccgtagtctgttgaactatatctggtcccaaca 15415006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16676547 - 16676440
Alignment:
Q  168 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtc 267  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||    
T  16676547 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtc 16676448  T
Q  268 tgatgaac 275  Q
    || |||||    
T  16676447 tgctgaac 16676440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14927267 - 14927151
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||     
T  14927267 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattct 14927168  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgt 120  Q
    | |||||||||||||||    
T  14927167 ttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291071
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || ||| | |||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 9291071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12132590 - 12132445
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||| |   ||||||| |||||||| ||||| |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | ||||||| |    
T  12132590 ggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcc 12132491  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| |||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  12132490 tcttatcatgacaactcttctgcctactttgagacgccttcatctt 12132445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445248
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 16445248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997556
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
     ||| ||||| | ||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttct 14997556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293193
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
      || ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 15293193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 15415250 - 15415210
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctata 41  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  15415250 tcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctata 15415210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18134845 - 18134543
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134845 tcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 18134746  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134745 tcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 18134646  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134645 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 18134546  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  18134545 tct 18134543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11304272 - 11303970
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11304272 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 11304173  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11304172 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatg 11304073  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11304072 gtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattcggtcccaacacaacactc 11303973  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  11303972 tct 11303970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12361041 - 12360739
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12361041 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 12360942  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360941 tcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 12360842  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  12360841 ataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcccaatacagcactc 12360742  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  12360741 tct 12360739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15953467 - 15953169
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15953467 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacgaaccaatgaactttggagtcaact 15953368  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15953367 tcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 15953268  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15953267 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 15953169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 14571478 - 14571776
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  14571478 tcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaat 14571577  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14571578 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacg 14571677  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14571678 gtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 14571776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16836991 - 16836707
Alignment:
Q  19 tgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcac 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16836991 tgtggtggcaaaccaactctatatgtcaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcac 16836892  T
Q  119 gtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgact 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16836891 gtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgact 16836792  T
Q  219 atgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16836791 ctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctct 16836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13323150 - 13322851
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323150 catgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 13323051  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||     
T  13323050 cttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatga 13322951  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactct 301  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13322950 tagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacagcactct 13322851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8759581 - 8759283
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8759581 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 8759482  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8759481 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 8759382  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8759381 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacact 8759283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16330158 - 16329857
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16330158 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 16330059  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  16330058 acctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatg 16329959  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16329958 gtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactc 16329859  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  16329858 tc 16329857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10420544 - 10420246
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420544 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaact 10420445  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  10420444 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatg 10420345  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10420344 gtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 10420246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 13941654 - 13941952
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13941654 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 13941753  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13941754 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 13941853  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13941854 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacact 13941952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11961533 - 11961232
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11961533 tcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatt 11961434  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961433 tcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatg 11961334  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11961333 gtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacacaacactc 11961234  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  11961233 tc 11961232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 41177152 - 41177450
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41177152 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 41177251  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41177252 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 41177351  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41177352 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 41177450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 10383602 - 10383893
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  10383602 tgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttc 10383701  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  10383702 tcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 10383801  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaa 295  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10383802 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaa 10383893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 47123577 - 47123872
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47123577 tgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 47123676  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  47123677 tcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 47123776  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47123777 actcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacact 47123872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 44776877 - 44777175
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  44776877 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaact 44776976  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44776977 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatg 44777076  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44777077 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacact 44777175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16381426 - 16381142
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16381426 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 16381327  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16381326 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 16381227  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtccc 288  Q
    |||||   |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16381226 gtaac---tctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtccc 16381142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12850778 - 12850480
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12850778 tcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaact 12850679  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  12850678 tcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatg 12850579  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12850578 gtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacact 12850480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 15227279 - 15227570
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15227279 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaact 15227378  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  15227379 tcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatg 15227478  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||| || |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15227479 ataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgctgaactaaatctggtcccaaca 15227570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13972619 - 13972386
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13972619 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaact 13972520  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13972519 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 13972420  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatc 234  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13972419 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14086303 - 14086536
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  14086303 tcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaact 14086402  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14086403 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 14086502  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatc 234  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14086503 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16412783 - 16412518
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||    
T  16412783 ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 16412684  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16412683 tcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactctt 16412584  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     || | ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  16412583 ttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaac 16412518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 12497868 - 12498142
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  12497868 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 12497967  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  12497968 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatg 12498067  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12498068 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 12498142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14877009 - 14876735
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||||||  || | || ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  14877009 tcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 14876910  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  14876909 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatg 14876810  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14876809 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaac 14876735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 10005223 - 10005494
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  10005223 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 10005322  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  10005323 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 10005422  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10005423 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 10005494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 10905833 - 10906104
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  10905833 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 10905932  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  10905933 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 10906032  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10906033 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 10906104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 15247770 - 15248041
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||  || | ||||||||||||     
T  15247770 tgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttct 15247869  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| || || |||||||||  |   ||||||||||| ||||| ||    
T  15247870 ttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgata 15247969  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  15247970 actcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 15248041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16635396 - 16635667
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16635396 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16635495  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16635496 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 16635595  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16635596 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16635667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 43162720 - 43162991
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  43162720 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 43162819  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  43162820 ttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 43162919  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  43162920 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 43162991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5425436 - 5425166
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  5425436 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 5425337  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  || || || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  5425336 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca-aagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgata 5425238  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  5425237 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 5425166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 13252313 - 13252584
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  13252313 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 13252412  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  13252413 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 13252512  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  13252513 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 13252584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15348716 - 15348481
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15348716 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 15348617  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15348616 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 15348517  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  15348516 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 15348481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15589863 - 15589628
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15589863 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 15589764  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15589763 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 15589664  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  15589663 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 15589628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15725440 - 15725170
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  15725440 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttct 15725341  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  15725340 ttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 15725241  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| ||||| || |||  |||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  15725240 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc-cgaatttctcagtagtctgctgaac 15725170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Original strand, 15208520 - 15208785
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||  || || |||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |  |||    
T  15208520 ttcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttact 15208619  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| || || |||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15208620 tcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactctt 15208719  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  15208720 ctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 15208785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20062525 - 20062290
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20062525 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggag 20062426  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  20062425 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 20062326  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  20062325 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 20062290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 48425070 - 48425341
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  48425070 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 48425169  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  48425170 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 48425269  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  48425270 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 48425341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 15338892 - 15339163
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  15338892 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 15338991  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| |||||||||  | || |||||||| || || ||    
T  15338992 ttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgata 15339091  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||  ||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  15339092 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaac 15339163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15403017 - 15402746
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||     
T  15403017 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttct 15402918  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||||||||   | || |||||||| || || ||    
T  15402917 ttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgata 15402818  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  15402817 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaac 15402746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 16691783 - 16692054
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||  | ||||||||||||     
T  16691783 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttct 16691882  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||    
T  16691883 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgata 16691982  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16691983 actcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaac 16692054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16757092 - 16756821
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| | ||  |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  16757092 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 16756993  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |  || || || |||| ||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  16756992 tcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 16756893  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  16756892 actcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 16756821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 17489473 - 17489744
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||| || ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  17489473 tgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 17489572  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  17489573 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 17489672  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  17489673 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 17489744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26792870 - 26792635
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  26792870 taagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggag 26792771  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || || | ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  26792770 tgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 26792671  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  26792670 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 26792635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53385525 - 53385254
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||      
T  53385525 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttt 53385426  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  53385425 tcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 53385326  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  53385325 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 53385254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 16371034 - 16371307
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16371034 catgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaactt 16371133  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    | | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |  ||  | || ||||| |||||  | ||||||||||| |||||     
T  16371134 ctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatga 16371233  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16371234 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 16371307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 6600370 - 6600641
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| |||||  | ||| | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  6600370 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 6600469  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||  || |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  6600470 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 6600569  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  6600570 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 6600641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16492682 - 16492417
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | ||||    
T  16492682 ttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 16492583  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    | || || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16492582 ttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactctt 16492483  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  16492482 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 16492417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 9522342 - 9522613
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  9522342 tgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 9522441  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||    
T  9522442 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggta 9522541  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||   ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  9522542 actcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaac 9522613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16807433 - 16807162
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||   | | ||||||| |||||||||| |  ||  |  |||||||||||     
T  16807433 tgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttct 16807334  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  16807333 ttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgata 16807234  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16807233 attcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaac 16807162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 303
Target Start/End: Original strand, 17492489 - 17492562
Alignment:
Q  230 tcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17492489 tcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 17492562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 31945102 - 31945177
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  31945102 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31689122 - 31689049
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgata 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  31689122 tcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15016185 - 15015980
Alignment:
Q  70 cgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcct 169  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||| |  ||| ||||||| | ||| | ||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |    
T  15016185 cgatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 15016086  T
Q  170 gaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| ||||| ||    
T  15016085 gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttg 15015986  T
Q  270 atgaac 275  Q
     |||||    
T  15015985 ttgaac 15015980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 299
Target Start/End: Original strand, 28754177 - 28754246
Alignment:
Q  230 tcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28754177 tcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacgcaacact 28754246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 4678302 - 4678366
Alignment:
Q  235 ttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4678302 ttttctctgatcatcttgactttttatgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 4678366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274674
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 8274674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576615
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 15576615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 299
Target Start/End: Original strand, 13001770 - 13001837
Alignment:
Q  232 atcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13001770 atcttttctcttatcaacttgacattttctgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacact 13001837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6712753 - 6712684
Alignment:
Q  167 cctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  6712753 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatctt 6712684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742978
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||   |||| || |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 16742978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 195976 - 195675
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195976 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 195877  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195876 tcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 195778  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  195777 ataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacactc 195678  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  195677 tct 195675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 148602 - 148904
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148602 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 148701  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  148702 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatg 148801  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148802 gtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcctgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 148901  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  148902 tct 148904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26807 - 26533
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  26807 tcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaact 26708  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |  |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  26707 tctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 26608  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  26607 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 26533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 68714 - 68575
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68714 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 68615  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68614 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121989
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21945 - 21648
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21945 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaact 21846  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21845 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 21746  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacac 298  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21745 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacac 21648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 19153 - 19452
Alignment:
Q  2 catgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaactt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19153 catgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacgaaccaatgaattttggagtcaactt 19252  T
Q  102 cctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  19253 cctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatgg 19352  T
Q  202 taactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactct 301  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19353 taactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactct 19452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58443
Alignment:
Q  13 gaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttca 112  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  || || || ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||  ||| | || ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  113 atgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
     |||| |||| ||||| |||| | ||||  | |||| ||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  213 acgactatgcgacgctttcatctttt 238  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcatctttt 58443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16950729 - 16950428
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16950729 tcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 16950630  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16950629 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatg 16950530  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16950529 gtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactc 16950430  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  16950429 tc 16950428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6413502 - 6413804
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6413502 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaact 6413601  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  6413602 ttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatg 6413701  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6413702 gtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccagacccaacacaacactc 6413801  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  6413802 tct 6413804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15102859 - 15102568
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15102859 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 15102760  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15102759 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 15102660  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15102659 gtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaaca 15102568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1363
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1665 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 1566  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  1565 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatg 1466  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1465 gtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 1366  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  1365 tct 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14286634 - 14286332
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14286634 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 14286535  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14286534 tcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatg 14286435  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14286434 gtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 14286335  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  14286334 tct 14286332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12455693 - 12455995
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12455693 tcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaact 12455792  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12455793 tcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatg 12455892  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12455893 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtctcatgtaccaagtccggtcccaacaccacactc 12455992  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  12455993 tct 12455995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 49152295 - 49152590
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49152295 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 49152394  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  49152395 tcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggta 49152494  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49152495 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacact 49152590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 14129864 - 14130166
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14129864 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 14129963  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14129964 tcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatg 14130063  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14130064 gtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 14130163  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  14130164 tct 14130166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14264498 - 14264204
Alignment:
Q  5 gcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 104  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14264498 gcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttctt 14264399  T
Q  105 cgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14264398 agacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaa 14264299  T
Q  205 ctcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14264298 ctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacactacact 14264204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 14433682 - 14433984
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14433682 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 14433781  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14433782 tcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatg 14433881  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14433882 gtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 14433981  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  14433982 tct 14433984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16072552 - 16072254
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16072552 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaact 16072453  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16072452 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatg 16072353  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16072352 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaacactacact 16072254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 13021348 - 13021648
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13021348 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccact 13021447  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  13021448 tcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatg 13021547  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  13021548 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactc 13021647  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  13021648 t 13021648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 19147204 - 19147500
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19147204 atgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttc 19147303  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19147304 ttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggt 19147403  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19147404 aactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacactacact 19147500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11306518 - 11306227
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11306518 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcc 11306419  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  11306418 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 11306319  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaa 295  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11306318 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaa 11306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18054211 - 18053916
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18054211 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaact 18054112  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18054111 ttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatg 18054012  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaac 296  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18054011 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaac 18053916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8212383 - 8212085
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8212383 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcc 8212284  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  8212283 tcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 8212184  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8212183 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctc 8212085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 20746603 - 20746899
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20746603 atgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttc 20746702  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20746703 ttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggt 20746802  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20746803 aactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacact 20746899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 13665544 - 13665814
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||     ||||||||||||||||||    
T  13665544 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaact 13665638  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13665639 tcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatg 13665738  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaacc 276  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13665739 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtttgatgaacc 13665814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23200001 - 23199703
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23200001 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaact 23199902  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23199901 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 23199802  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23199801 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacact 23199703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23506128 - 23505830
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23506128 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaact 23506029  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23506028 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 23505929  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23505928 gtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacact 23505830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26288294 - 26288045
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26288294 tcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaatgaattttggagtcaact 26288195  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  26288194 tcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatg 26288096  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatctt 251  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26288095 gtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatctt 26288045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26118793 - 26118565
Alignment:
Q  71 gatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctg 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26118793 gatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctg 26118694  T
Q  171 aaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctga 270  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  26118693 aaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatcaacctgactttctcagtagtctca 26118594  T
Q  271 tgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118593 tgaaccaaatccggtcccaacacaacact 26118565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11388685 - 11388395
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11388685 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 11388586  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11388585 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatg 11388487  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || |||||||| ||||| |  || ||||||||||    
T  11388486 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaaca 11388395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11553379 - 11553108
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  11553379 tgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttct 11553280  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  11553279 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgata 11553180  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11553179 actcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 11553108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 12687494 - 12687759
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  12687494 tgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttct 12687593  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| || || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  12687594 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 12687693  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  12687694 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 12687759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 14954613 - 14954878
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  14954613 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttct 14954712  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  14954713 ttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgata 14954812  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  14954813 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 14954878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 303
Target Start/End: Original strand, 15340574 - 15340724
Alignment:
Q  153 tacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  15340574 tacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttg 15340673  T
Q  253 actttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15340674 accttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctct 15340724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 8707598 - 8707869
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  8707598 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 8707697  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  8707698 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 8707797  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  8707798 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaac 8707869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 14037797 - 14038100
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||| ||| ||| || ||||||||| |||| | |||||| ||  |||| |||||||    
T  14037797 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaact 14037896  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14037897 tctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 14037996  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || ||||| |  || |||||||| || ||||||    
T  14037997 ataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcccaaaaccacactc 14038096  T
Q  301 tctg 304  Q
    ||||    
T  14038097 tctg 14038100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 14347827 - 14348130
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||| ||| ||| || ||||||||| |||| | |||||| ||  |||| |||||||    
T  14347827 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaact 14347926  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14347927 tctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 14348026  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || ||||| |  || |||||||| || ||||||    
T  14348027 ataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcccaaaaccacactc 14348126  T
Q  301 tctg 304  Q
    ||||    
T  14348127 tctg 14348130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 10870988 - 10871259
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||     
T  10870988 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttct 10871087  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  10871088 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgata 10871187  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10871188 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 10871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12207058 - 12206767
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| | |||| |||||| ||||| || |||||||    
T  12207058 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaact 12206959  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || ||||||| |||  |||| |||| |||||||||    
T  12206958 tctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatg 12206859  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  12206858 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaactatatccggtcccaaca 12206767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15161334 - 15161063
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  15161334 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 15161235  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  15161234 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 15161135  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  15161134 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 15161063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 15624542 - 15624816
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||  || || |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||| |    
T  15624542 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatt 15624641  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15624642 tccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatg 15624741  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||| || |||| |||||| ||||||||    
T  15624742 ataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaac 15624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 14332390 - 14332661
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  14332390 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 14332489  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| || || ||    
T  14332490 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgata 14332589  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  14332590 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 14332661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18551999 - 18551764
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18551999 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 18551900  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18551899 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 18551800  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  18551799 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 18551764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 8198621 - 8198892
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  8198621 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 8198720  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  8198721 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 8198820  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  8198821 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 8198892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15154929 - 15154658
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||||||  || | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  15154929 tgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 15154830  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || || ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  15154829 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 15154730  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  15154729 actcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 15154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23517046 - 23516775
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  23517046 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 23516947  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  23516946 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 23516847  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  23516846 actcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 23516775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 303
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457072
Alignment:
Q  171 aaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctga 270  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  271 tgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactctct 12457072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17593 - 17322
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||  |  |||||||||||     
T  17593 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttct 17494  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  17493 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 17394  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17393 acttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 17322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11237490 - 11237219
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  11237490 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 11237391  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  11237390 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 11237291  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| |||||  | |||  |||||||   |||||||||||||| || |||||    
T  11237290 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaac 11237219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 13686093 - 13686328
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13686093 taagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 13686192  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||    
T  13686193 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctc 13686292  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  13686293 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 13686328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 18177735 - 18178006
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  18177735 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 18177834  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || ||||  || || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  18177835 ttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 18177934  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  18177935 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaac 18178006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44791592 - 44791357
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44791592 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 44791493  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || || |||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  44791492 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 44791393  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  44791392 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 44791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 15340487 - 15340574
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaact 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15340487 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15203869 - 15204167
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| |||  | ||||||||||  || || |  ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  15203869 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaact 15203968  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |  | ||||||||||| || || ||||| |||| |  ||| || || | ||| ||||| || || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15203969 tatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 15204068  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15204069 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacact 15204167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440153
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 4440153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964856
Alignment:
Q  115 gcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgac 214  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  215 gactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaac 35964856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11772372 - 11772220
Alignment:
Q  150 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 249  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||   ||||||    
T  11772372 aaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatc 11772273  T
Q  250 ttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    || || ||||||||||| || ||||| |  |||||||| || || ||||||||    
T  11772272 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctc 11772220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13968701 - 13968625
Alignment:
Q  226 gctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    |||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13968701 gctttcatcttttcccttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaacactctc 13968625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 275
Target Start/End: Original strand, 21662119 - 21662225
Alignment:
Q  169 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||| ||||||    
T  21662119 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagtct 21662218  T
Q  269 gatgaac 275  Q
    | |||||    
T  21662219 gttgaac 21662225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 14936427 - 14936572
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||| |||| | || | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | |||| || |    
T  14936427 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcc 14936526  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  14936527 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 14936572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 266
Target Start/End: Original strand, 12193636 - 12193811
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||| || | |||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| | | ||||| |    
T  12193636 ggagtcaacttccggcatttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaaatcaatgtcattcctcc 12193735  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||  |||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||   |||||||| || ||||| |||||    
T  12193736 tcttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 12193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596321
Alignment:
Q  190 cgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaac 9596321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 15364020 - 15364165
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||| |||| | || | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | |||| || |    
T  15364020 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcc 15364119  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  15364120 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 15364165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 26118839 - 26118803
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctat 40  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26118839 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctat 26118803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824125
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 7824125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107819
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 27107819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14381858 - 14381581
Alignment:
Q  26 gcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctac 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14381858 gcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctac 14381759  T
Q  126 acccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  14381758 acccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgac 14381659  T
Q  226 gctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14381658 gctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctct 14381581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10469265 - 10468964
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10469265 tcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 10469166  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  10469165 tcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatg 10469066  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10469065 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 10468966  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  10468965 tc 10468964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8766564 - 8766262
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8766564 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 8766465  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8766464 tcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 8766365  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8766364 gtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtccccacacgacactc 8766265  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  8766264 tct 8766262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415649
Alignment:
Q  15 aagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaat 114  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  115 gcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  215 gactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 17415649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22797048 - 22796746
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22797048 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaact 22796949  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22796948 tcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 22796849  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22796848 gtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcgcaacactacactc 22796749  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  22796748 tct 22796746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27561033 - 27560735
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27561033 tcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 27560934  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27560933 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 27560834  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27560833 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtcccaacacaacact 27560735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 299
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801105
Alignment:
Q  52 ccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataa 151  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  152 atacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatctt 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatctt 18801057  T
Q  252 gactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18801058 gactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 18801105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 24364280 - 24364578
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24364280 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 24364379  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  24364380 tcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggta 24364479  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24364480 actcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 24364578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15459201 - 15459499
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459201 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaact 15459300  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15459301 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatg 15459400  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459401 gtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacact 15459499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28283226 - 28282931
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  28283226 tgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttc 28283127  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28283126 tcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggta 28283027  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28283026 actcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacact 28282931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 21471466 - 21471758
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  21471466 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaact 21471565  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  21471566 tcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatg 21471665  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471666 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 21471758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 25768056 - 25768342
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  25768056 tcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaactttgaagtcaatt 25768155  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25768156 tcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatg 25768255  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcc 287  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25768256 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagtttgatgaactaaatccggtcc 25768342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14131595 - 14131321
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14131595 tcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaact 14131496  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14131495 tcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatg 14131396  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||| || || |||||||| |||||    
T  14131395 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcatatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaac 14131321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34646002 - 34645711
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  34646002 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 34645903  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34645902 tcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 34645803  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||| || || || ||||| || ||||| |  || ||||||||||    
T  34645802 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaaca 34645711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 25750674 - 25750900
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25750674 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaact 25750773  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  25750774 tcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatg 25750873  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgc 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25750874 gtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 19879163 - 19879404
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19879163 tcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 19879262  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19879263 tcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 19879362  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
     || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  19879363 atagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctct 19879404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21564548 - 21564302
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21564548 tcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 21564449  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21564448 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatg 21564349  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatca 247  Q
     || |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  21564348 atagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatca 21564302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11288014 - 11287773
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  11288014 tcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 11287915  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11287914 tcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 11287815  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11287814 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctct 11287773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5839635 - 5839361
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5839635 tcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaact 5839536  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||    || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  5839535 tcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 5839436  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5839435 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaac 5839361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 18794555 - 18794823
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  18794555 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaact 18794654  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  18794655 tcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatg 18794754  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || || || ||||||||    
T  18794755 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctg 18794823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1543497 - 1543226
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  1543497 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttct 1543398  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||    
T  1543397 ttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggta 1543298  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1543297 actcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 1543226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27331846 - 27331575
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||    
T  27331846 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcc 27331747  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27331746 tttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggta 27331647  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  27331646 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaac 27331575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27392586 - 27392315
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||    
T  27392586 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcc 27392487  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27392486 tttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggta 27392387  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  27392386 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaac 27392315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11280921 - 11280680
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  11280921 tcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 11280822  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||| |||||||||| |||||||| || |  ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11280821 tcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 11280722  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11280721 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctct 11280680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29592333 - 29592062
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  29592333 tgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 29592234  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  29592233 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 29592134  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  29592133 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 29592062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 23078337 - 23078608
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||  ||| || ||||||||| |||||| || ||| ||  | ||||||||||||     
T  23078337 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttct 23078436  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  23078437 ttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 23078536  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23078537 actcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 23078608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24313581 - 24313310
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  24313581 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 24313482  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | |||||| |||| ||||| ||    
T  24313481 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgata 24313382  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  24313381 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 24313310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28263610 - 28263339
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  28263610 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 28263511  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  28263510 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 28263411  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  28263410 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 28263339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28342359 - 28342088
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  28342359 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 28342260  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  28342259 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgata 28342160  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  28342159 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 28342088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16627094 - 16626859
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16627094 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 16626995  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  16626994 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 16626895  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  ||||||||| |||| || |||||    
T  16626894 ttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaac 16626859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 25112420 - 25112691
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  25112420 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttct 25112519  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  25112520 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 25112619  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    | |||| || ||||| ||||||||||| || || |||   |||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  25112620 agtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 25112691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 12497891 - 12498165
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  12497891 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaact 12497990  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  12497991 tctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 12498090  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12498091 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 12498165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12511010 - 12510736
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  12511010 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaact 12510911  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  12510910 tctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatg 12510811  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12510810 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 12510736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18197963 - 18197695
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| |||  ||  || |||||||||  |||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  18197963 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaact 18197864  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||  |||| | |||| ||  ||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||| | |||| |||||| |||||    
T  18197863 tctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatg 18197764  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||    
T  18197763 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtctg 18197695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16963780 - 16963509
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || ||||| | ||| |||| |||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||     
T  16963780 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttct 16963681  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  16963680 tttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 16963581  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16963580 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaac 16963509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 27187340 - 27187575
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27187340 taagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 27187439  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27187440 tgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 27187539  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27187540 tcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27187575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261665
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27261900 taagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 27261801  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27261800 tgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 27261701  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  27261700 tcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 27261665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 12505230 - 12505494
Alignment:
Q  11 tcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgactt 110  Q
    |||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||    
T  12505230 tcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaatt 12505329  T
Q  111 caatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttc 210  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  12505330 caaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 12505429  T
Q  211 tgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12505430 tgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaac 12505494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22079101 - 22078842
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||||||||     
T  22079101 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttct 22079002  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | |||||| |||| ||||| ||    
T  22079001 ttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgata 22078902  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagt 263  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||    
T  22078901 actcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagt 22078842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28292785 - 28292514
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  28292785 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 28292686  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||| ||| |||||  | || |||| ||| ||||| ||    
T  28292685 ttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgata 28292586  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  28292585 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 28292514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25610273 - 25610003
Alignment:
Q  5 gcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 104  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  | ||| |||||||| |    
T  25610273 gcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctt 25610174  T
Q  105 cgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaa 204  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || || |||| ||| |  || || || || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  25610173 tgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaa 25610074  T
Q  205 ctcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  25610073 ctcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 25610003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2875216 - 2874945
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  2875216 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttat 2875117  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||  | || || || || ||||||||||   | || |||||||| ||||| ||    
T  2875116 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgata 2875017  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||| | |||||||| ||||| || |||  |||||||   |||||||||||||| || |||||    
T  2875016 actcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaac 2874945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25765702 - 25765432
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || || |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||     
T  25765702 tgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttct 25765603  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | | || || |||| ||  || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  25765602 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcaca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 25765504  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25765503 actcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaac 25765432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 292
Target Start/End: Original strand, 1640730 - 1640928
Alignment:
Q  94 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgct 193  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || | ||| |||||||| || |||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  1640730 gtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaaggtcctttctacgct 1640829  T
Q  194 tgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  1640830 tgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatctggtcccaaca 1640928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18408317 - 18408124
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  18408317 gccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagtta 18408218  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
    | |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||    
T  18408217 ctctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatctt 18408124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 17032430 - 17032566
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  17032430 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttct 17032529  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  17032530 ttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagt 17032566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19864552 - 19864820
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19864552 tcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 19864651  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || || | ||| || || || || || |||||||||||  | || || | ||| |||||    
T  19864652 tctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatg 19864751  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctg 269  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||    
T  19864752 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctg 19864820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16928047 - 16927782
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||  | ||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||    
T  16928047 ttcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 16927948  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    |||| |||||||| ||||  |||| | |||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16927947 tcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 16927848  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  16927847 ttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaac 16927782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 25750901 - 25751022
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||| || || |||||||||||  |||| ||||    
T  25750901 ggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25751000  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25751001 gcttgtcatggtaactcttctg 25751022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Original strand, 19453511 - 19453587
Alignment:
Q  227 ctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19453511 ctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctct 19453587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22762868 - 22762664
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||  | || |||||||||     
T  22762868 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttct 22762769  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  |  |||||||||| |||| |||    
T  22762768 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgta 22762669  T
Q  204 actct 208  Q
    |||||    
T  22762668 actct 22762664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21833397 - 21833258
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||||    
T  21833397 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaact 21833298  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    || | |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  21833297 tctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagt 21833258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434008
Alignment:
Q  196 tcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 22434008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078513
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| | |  |||| |||||||||||||||  |||||||||| |   |||| ||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
     ||| ||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtct 15078513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 251
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098165
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||  | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatctt 251  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatctt 16098165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996348
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 23996348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 240
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233313
Alignment:
Q  94 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgct 193  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  194 tgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttct 16233313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382554
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 16382554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1649110 - 1648962
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  1649110 ggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 1649011  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
     ||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1649010 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttc 1648962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 18571606 - 18571746
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| || ||| | |||| | || | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  18571606 ggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18571705  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttc 231  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  18571706 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttc 18571746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22433862 - 22433930
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatc 69  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  22433862 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 257
Target Start/End: Original strand, 25655492 - 25655604
Alignment:
Q  145 ctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctga 244  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | |||| || | ||| | ||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||   |    
T  25655492 ctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaa 25655591  T
Q  245 tcatcttgacttt 257  Q
    ||||||| |||||    
T  25655592 tcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7510 - 7210
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7510 tcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttct--gaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 7413  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7412 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatg 7313  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7312 ataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccc 7213  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  7212 tct 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 27551 - 27849
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551 tcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaact 27650  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651 tcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 27750  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27751 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaacacaacact 27849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1131
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1422 tcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaat-aacttcggagtcaact 1324  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1323 tcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 1224  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1223 gtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacac 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 20154 - 20456
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20154 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 20253  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20254 tcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 20353  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20354 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactc 20453  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  20454 tct 20456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 43537 - 43839
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43537 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 43636  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43637 tcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 43736  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    | |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43737 gcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactc 43836  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  43837 tct 43839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 44549 - 44851
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44549 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 44648  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44649 tcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 44748  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    | |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44749 gcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactc 44848  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  44849 tct 44851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 36090 - 36220
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  36090 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttct 36189  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36190 tcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 47156 - 47454
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47156 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaact 47255  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47256 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatg 47355  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47356 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtcccaacacaacact 47454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49481 - 49179
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49481 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 49382  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49381 tcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 49282  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49281 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacaccacactc 49182  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  49181 tct 49179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 42815 - 43117
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42815 tcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 42914  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  42915 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatg 43014  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43015 gtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacaccacactc 43114  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  43115 tct 43117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 2783 - 3085
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2783 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 2882  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2883 tctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatg 2982  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2983 gtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 3082  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  3083 tct 3085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 248645 - 248947
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248645 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 248744  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  248745 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatg 248844  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  248845 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaacaccacactc 248944  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  248945 tct 248947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 4782 - 5080
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4782 tcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaatt 4881  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4882 tcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatg 4981  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4982 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacact 5080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1798 - 1496
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1798 tcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacggactaatgaactttggagtcaact 1699  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1698 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatg 1599  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1598 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactc 1499  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  1498 tct 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 6058 - 6329
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||     
T  6058 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttct 6157  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  6158 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggta 6257  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  6258 actcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaac 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 31442 - 31737
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31442 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 31541  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 31641  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaac 296  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31642 gtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaacacaac 31737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 14080 - 14306
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | || |  |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||| ||  | |||||||||| | | ||||    
T  14080 ttcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgact 14179  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||  ||| ||| |  || || || || |||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  14180 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactctt 14279  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     || ||||| |||||||||||||||||    
T  14280 ttgtcgactctgcgacgctttcatctt 14306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 17654 - 17748
Alignment:
Q  181 gccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  17654 gccttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaac 17748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 130 - 432
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 229  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  230 tcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatg 329  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  330 gtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 429  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  430 tct 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10357 - 10059
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10357 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaact 10258  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10257 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatg 10158  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10157 atagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52453 - 52151
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52453 tcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 52354  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52353 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 52254  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  52253 gtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctc 52154  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  52153 tct 52151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 61487 - 61185
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  61487 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 61388  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  61387 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 61288  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  61287 gtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctc 61188  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  61187 tct 61185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 67875 - 67573
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  67875 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaact 67776  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  67775 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatg 67676  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  67675 gtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctc 67576  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  67575 tct 67573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26139 - 25837
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26139 tcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 26040  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26039 tcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatg 25940  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25939 gtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcccagcacaacactc 25840  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  25839 tct 25837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 16711 - 16946
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16711 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcc 16810  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16811 tcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggta 16910  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16911 actcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttc 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 260340 - 260642
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  260340 tcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaact 260439  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  260440 tcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatg 260539  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  260540 gtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactc 260639  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  260640 tct 260642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 164980 - 164709
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||     
T  164980 tgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttct 164881  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  164880 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 164781  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  164780 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 164709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 308694 - 308965
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||     
T  308694 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttct 308793  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  308794 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 308893  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  308894 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaac 308965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 279104 - 278830
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||||    
T  279104 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaact 279005  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||    
T  279004 tctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatg 278905  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  278904 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 278830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1443 - 1145
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1443 tcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaact 1344  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1343 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 1244  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1243 gtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttattatcttgaccttctccgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacataacact 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 58090 - 57789
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  58090 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaact 57991  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  57990 tcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatg 57891  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| || || | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57890 gtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 57792  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  57791 tct 57789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49298 - 49009
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  49298 ttcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagact 49199  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49198 tcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 49099  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  49098 ctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaataccacact 49009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27258 - 27553
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 27357  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  27358 tcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcagaaatacatgatatccctcttgaaattcaa-ggccttcctacgctcgtcatg 27456  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 297  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27457 gtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaaca 27553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 39771 - 40069
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39771 tcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaact 39870  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  39871 tcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcata 39970  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39971 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatcttgactttctcgttagtctgatgaaccaaatccggtcccaataccacact 40069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 91206 - 90916
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  91206 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctaatatggactaataaactttgaagtcaact 91107  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91106 tcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 91007  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaac 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  91006 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaac 90916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 448094 - 448365
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||  ||  |||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  448094 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttct 448193  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||| ||||| |||   || | |||||| || || | |||||| ||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  448194 ttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 448293  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  448294 gctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 448365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Original strand, 175355 - 175431
Alignment:
Q  61 tccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175355 tccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 162148 - 162376
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| |||     
T  162148 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttct 162247  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| || ||  | || |||||| ||||  | ||  ||||||| ||||| ||    
T  162248 ttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgata 162347  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttca 232  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  162348 actcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 3925 - 4221
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3925 atgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttc 4024  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4025 ttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 4124  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4125 aactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgataaactaaatccggtcccaacactacact 4221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 26293 - 26589
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26293 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaact 26392  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  26393 tcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatg 26492  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26493 gtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaaca 26589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52137 - 51839
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  52137 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccactaaactttggagtcaact 52038  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52037 tcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 51938  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51937 gtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 51839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6514
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||| |||||||  || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6215 tcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaact 6314  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcat-aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6315 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcat 6414  T
Q  200 ggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6415 gatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 10837 - 11103
Alignment:
Q  37 ctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatag 136  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10837 ctataggccactgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatag 10936  T
Q  137 gagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  10937 aagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatctt 11036  T
Q  237 ttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11037 ttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctct 11103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38150
Alignment:
Q  49 gttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 148  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  149 taaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcat 248  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  249 cttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38200 cttgactttctccgtagtctgatgattcaaatccggtcccaacacaacact 38150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 37234 - 37530
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  37234 tcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatagaccaataaacttcggagtcaact 37333  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || | ||| |||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37334 tcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatg 37433  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37434 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaaca 37530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27370
Alignment:
Q  49 gttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 148  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  149 taaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctct 27370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18811 - 18521
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  18811 tcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaact 18712  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711 tcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 18612  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaac 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18611 gtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaac 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13055 - 12753
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13055 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttcggagttaact 12956  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12955 tccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatg 12856  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
    |||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  12855 gtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcctaatacaacactc 12756  T
Q  301 tct 303  Q
    |||    
T  12755 tct 12753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16984 - 16686
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16984 tgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttc 16885  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  16884 tcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggta 16785  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16784 actcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctc 16686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 5315 - 5547
Alignment:
Q  71 gatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctg 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5315 gatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctg 5414  T
Q  171 aaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctga 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5415 aaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttccttatcatcttgaccttctcagtcgtctga 5514  T
Q  271 tgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5515 tgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 26174 - 26466
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26174 tcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaact 26273  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26274 tcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatg 26373  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26374 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaacac 26466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 3907 - 4205
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3907 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaact 4006  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4007 tcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatg 4106  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  4107 gtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacact 4205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 9830 - 10123
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  9830 tcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaact 9929  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||     | ||||||||||||||||    
T  9930 tcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctacgcttgtcatg 10024  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10025 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacact 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 96276 - 95978
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  96276 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaact 96177  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  96176 ttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatg 96077  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  96076 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacacaacact 95978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 112591 - 112837
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  112591 tcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 112690  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  112691 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatg 112790  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatca 247  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112791 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatca 112837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 110082 - 109811
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  110082 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 109983  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||    
T  109982 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 109883  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  109882 actcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 109811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7310 - 7007
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  7310 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaact 7211  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  7210 tcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatg 7111  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  7110 ataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacaccacactt 7011  T
Q  301 tctg 304  Q
    ||||    
T  7010 tctg 7007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6184 - 5890
Alignment:
Q  5 gcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcct 104  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  6184 gcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttctt 6085  T
Q  105 cgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaa 204  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6084 agacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaa 5985  T
Q  205 ctcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  5984 ctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgacgaactaaatctggtcccaacactacact 5890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 14118 - 14407
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||||||| | || ||||||   |||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  14118 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaacctt-tcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaact 14216  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14217 tcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatg 14316  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaac 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14317 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgacattctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaac 14407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39158 - 38860
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39158 tgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcc 39059  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||    
T  39058 tcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgata 38959  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38958 actcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacgctctc 38860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 223 - 474
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  223 tcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagt 322  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  323 tcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatg 422  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttg 252  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  423 atagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttg 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5276 - 4978
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  5276 tcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatatctgatacgaaccaataaacttcggagtcaact 5177  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5176 tcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatg 5077  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||    
T  5076 gtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtctgatgaactaaatatggttccaacaccacact 4978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 299
Target Start/End: Original strand, 7 - 200
Alignment:
Q  106 gacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7 gacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaac 106  T
Q  206 tcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  107 tcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4413 - 4217
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4413 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaact 4314  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4313 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 299
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2124
Alignment:
Q  83 tgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggc 182  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  183 cttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatcc 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||     
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctcttatcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaatct 2107  T
Q  283 ggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2108 ggtcccaacaccacact 2124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 560 - 851
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  560 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaact 659  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  660 tcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacg 759  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
     || ||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||| || || || |||||||| ||||| |  || ||||||||||    
T  760 atagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaaca 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3489 - 3327
Alignment:
Q  141 aaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3489 aaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacaaaagggccttcctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 3390  T
Q  241 ctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3389 ctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttcccaacacaacactctct 3327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3542 - 3483
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctc 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3542 tcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctc 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 303
Target Start/End: Original strand, 78 - 223
Alignment:
Q  158 gatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgacttt 257  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  78 gatcacactcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgacttt 177  T
Q  258 ctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  178 ctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctct 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 949
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatctt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15353 - 15052
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  15353 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaact 15254  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| | |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15253 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 15154  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||    
T  15153 ataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactc 15054  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  15053 tc 15052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 4064 - 4329
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  4064 tcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaact 4163  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| || || | |||||||||| | ||||||||||| ||||     
T  4164 tctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcata 4263  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  4264 gtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1210
Alignment:
Q  124 acacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  224 acgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacact 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 7412 - 7683
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  7412 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 7511  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || ||||| || || || ||    
T  7512 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgata 7611  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  7612 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaac 7683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16739 - 16465
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| | ||| |  |||||||||    
T  16739 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaact 16640  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16639 tctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 16540  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  16539 gtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 16465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5553 - 5424
Alignment:
Q  174 ctcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatga 273  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  5553 ctcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatga 5454  T
Q  274 accaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5453 accaaatccggtcccaacaccacactctct 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33951 - 33718
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  33951 tcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaact 33852  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33851 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatg 33752  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatc 234  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33751 atagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40525
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 40525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3172 - 3437
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||  ||||| |||||| |||||| ||| | | ||||||||    
T  3172 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaact 3271  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| || || ||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  3272 tctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatg 3371  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  3372 ataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18881 - 19120
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  18881 tcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaact 18980  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18981 tcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatg 19080  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
     || ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19081 atagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttct 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23282
Alignment:
Q  52 ccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataa 151  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  152 atacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttct 23282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 43189 - 43460
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  43189 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 43288  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || || | ||| ||||||||    
T  43289 ttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggta 43388  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  43389 actcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 43460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50788 - 50555
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  50788 tcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaact 50689  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50688 tcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatg 50589  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatc 234  Q
      | |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  50588 acagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 8520 - 8791
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  8520 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttct 8619  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || |||| |||||||||  | || ||||| || || || ||    
T  8620 ttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgata 8719  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  8720 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaac 8791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 136151 - 136278
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136151 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 136250  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  136251 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 275
Target Start/End: Original strand, 229117 - 229349
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  229117 gccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtga 229216  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
    | |||| |||||||||||| || || ||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||      
T  229217 ctctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 229316  T
Q  243 gatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  229317 aatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 229349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 219649 - 219417
Alignment:
Q  43 gccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 142  Q
    |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  219649 gccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtga 219550  T
Q  143 ccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctct 242  Q
    | |||| |||||| |||||  | || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||      
T  219549 ctctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttg 219450  T
Q  243 gatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  219449 aatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 219417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33031
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||  | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttc 33031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 708 - 982
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  708 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 807  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || ||| |||| |||||    
T  808 tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatg 907  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  908 ataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 180249 - 180523
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| |||| ||| || || |||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||||||    
T  180249 tcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaact 180348  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  180349 tctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatg 180448  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  180449 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaac 180523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27999 - 28231
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||| ||||||    
T  27999 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaact 28098  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||    
T  28099 tctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatg 28198  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28199 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 14395 - 14666
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || || | ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  14395 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 14494  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || |  || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  14495 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgata 14594  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14595 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 14666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 691 - 926
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  691 taagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 790  T
Q  140 taaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttc 239  Q
    | || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |  || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  791 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 890  T
Q  240 tctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |  ||||||||  ||||||| | ||||||| |||||    
T  891 ttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaac 926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 65440 - 65711
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  65440 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 65539  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  65540 ttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 65639  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  65640 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 65711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40063 - 39924
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |    
T  40063 tcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaat 39964  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 140  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  39963 tctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39819
Alignment:
Q  188 tacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaac 39819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25990 - 25692
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |  ||||    
T  25990 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttcc 25891  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || | ||||||||| |  || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  25890 ttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgata 25791  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctc 302  Q
    | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||    
T  25790 attcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctc 25692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 534 - 269
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  534 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 435  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| || | |||| | || |||| ||| ||||| || || || |||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  434 tcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatg 335  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||  | || || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  334 gtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9276
Alignment:
Q  46 accgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccc 145  Q
    ||||||||||  || || |||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  146 tcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgat 245  Q
    ||| |||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  246 catcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||| || ||||||| ||| || |||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaac 9276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 351
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||  || | |||| | || ||||  || |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgacttt 257  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||||||||| |||   |||||||| |||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11011 - 10723
Alignment:
Q  3 atgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||    
T  11011 atgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttc 10912  T
Q  103 ctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggt 202  Q
     |||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||||| || |||| ||| ||||| || || || || ||||||||  |||| |||| ||||||||| |    
T  10911 ttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgat 10812  T
Q  203 aactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaaca 292  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  10811 aactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatca-attggccttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaaca 10723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 1209 - 1385
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  1209 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaact 1308  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactca 177  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  1309 tcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 449 - 720
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||||     
T  449 tgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttct 548  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  549 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgata 648  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||  ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  649 actcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13527 - 13380
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13527 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagatatctgatacttaccaattaactttggagtcaact 13428  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 148  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13427 tcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 26
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||  |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |  |||||||||    
T  256 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaact 157  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || | |||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  156 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 57  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttc 231  Q
     ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  56 ataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25047
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||| |  | |||||||    
T  25345 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaact 25246  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || | ||| ||||| || ||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||    
T  25245 tcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtg 25146  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacact 299  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||| || || || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  25145 ataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacact 25047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 14909 - 15183
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||  || |||||||||||||  || || |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  14909 tcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaact 15008  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    |  | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||  ||| |||||||||||| || || |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15009 tatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatg 15108  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  15109 ataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 15183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8096
Alignment:
Q  34 actctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  134 taggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
      | ||| || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 8054  T
Q  234 cttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     || |||   |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  8055 tttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaac 8096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 15528 - 15798
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||  | ||||||||||||     
T  15528 tgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttct 15626  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | || | ||  ||| |||||| || || || || |||||||| |||   ||||||||||| ||||||||    
T  15627 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggta 15726  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  15727 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaac 15798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 15870 - 15961
Alignment:
Q  184 ttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  15870 ttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaac 15961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 17022 - 17284
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||  ||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  17022 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttct 17121  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||   ||| | |||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  17122 ttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 17221  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  17222 actcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagt 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 127473 - 127199
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || || |||||| |||||||| |||| ||  | ||||||||||    
T  127473 tcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaact 127374  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  127373 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 127274  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  127273 ataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 127199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 46 - 308
Alignment:
Q  13 gaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttca 112  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||  |  ||||||    
T  46 gaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttca 145  T
Q  113 atgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
    | |||||||| ||||| ||||  ||| | || |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  146 aagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctcttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttg 245  T
Q  213 acgactatgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  246 tcgactctgcgacgctttcatcttctct-tgactcatcttaactttctcaatagtctgctgaac 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 1040 - 1301
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  1040 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 1139  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||  ||||||||||| || || |  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||    
T  1140 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgata 1239  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||  |||||| | ||| |||| || |||||||||||    
T  1240 actcttttgccgactctgcgacgatttcactttttct-taatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2140 - 2023
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2140 tcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaact 2041  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcac 118  Q
    || | |||||||||||||    
T  2040 tcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29043 - 28750
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |  |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  29043 tcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaact 28944  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |  ||||| |||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28943 tctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatg 28844  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt-ttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| || ||  ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  28843 ataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtcccaacac 28750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41034 - 40741
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |  |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  41034 tcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaact 40935  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| ||||| |  ||||| |||| | |||| || |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40934 tctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatg 40835  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt-ttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacac 293  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| || ||  ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  40834 ataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtcccaacac 40741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33844 - 33573
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  33844 tgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 33745  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||  |||  || || || || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  33744 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 33645  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  33644 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaac 33573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 8631 - 8902
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||| ||||||     
T  8631 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttct 8730  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||  |||  || || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  8731 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 8830  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8831 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaac 8902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33026 - 32752
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | | ||||||||    
T  33026 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaact 32927  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |  ||||||||||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  32926 tctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatg 32827  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||| || |||||    
T  32826 ataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaac 32752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6046 - 6311
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | || ||||||| ||| |||||| ||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  6046 tcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaact 6145  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| || || | ||| || || || ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| | |||    
T  6146 tctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatg 6245  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||    
T  6246 ataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 6311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22173
Alignment:
Q  34 actctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  134 taggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
     |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  234 cttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||| |||   ||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaac 22173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7245
Alignment:
Q  40 taagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggag 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7009 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 7108  T
Q  140 taaccctc-ataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctttt 238  Q
    | || ||| | ||| || || || || || |||||||||||  | || | |||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |    
T  7109 tgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 7208  T
Q  239 ctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||  ||||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  7209 cttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaac 7245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 780
Alignment:
Q  71 gatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctg 170  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||| || || || ||||     
T  984 gatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcctt 885  T
Q  171 aaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctga 270  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||   |||||||  |||||||||||||| ||     
T  884 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgc 785  T
Q  271 tgaac 275  Q
    |||||    
T  784 tgaac 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 1174 - 1445
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||  | ||||||||||||     
T  1174 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttct 1273  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| || || | |||||| || || || || |||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||    
T  1274 ttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggta 1373  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  1374 acttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaac 1445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 49528 - 49799
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||     
T  49528 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctaggagtcaacttct 49627  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||| || || | |||||  || || || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  49628 ttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 49727  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    | |||| || | ||| |||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  49728 aatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaac 49799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 117179 - 116905
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||| | ||||| |||| ||| ||||||||| |||  || || |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  117179 tcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaact 117080  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||   ||| | |||| || |||| |||||| || || |  || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  117079 tctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatg 116980  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || |||||    
T  116979 ataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23563
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaa 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacatgaaactcaa 23563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98282
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 98282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 64305 - 64031
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  |   ||||||||    
T  64305 tcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaact 64206  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || | |||||||| |||||||| || || | || |||||| || |||| ||| || || || || || || ||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  64205 tctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatg 64106  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  64105 ataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaac 64031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 940 - 1241
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| | ||||| | || ||| ||||| |||||||  || || |||||| |||| |||||||| ||| | ||| |||| |    
T  940 tcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatt 1039  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || |  | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  1040 tctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatg 1139  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactc 300  Q
     |||||||| || | | | ||||||||||| |||||||||  ||||  ||| |  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||    
T  1140 ataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactc 1239  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  1240 tc 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 275
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7703
Alignment:
Q  94 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgct 193  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | || |||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  194 tgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    | ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaac 7703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 9378 - 9610
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||||| ||||     
T  9378 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttct 9477  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||  ||||| || || || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  9478 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgata 9577  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
    |||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  9578 actcttttgtcgactctacgacgccttcatctt 9610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13159 - 12986
Alignment:
Q  93 agtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgc 192  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||  || ||||| || || || ||||| |||||  | |||||||||    
T  13159 agtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgc 13060  T
Q  193 ttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagt 266  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  13059 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagt 12986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16681 - 16416
Alignment:
Q  10 ttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgact 109  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||   ||| |||||| ||||||  || || ||||||  |||||||||||| ||  | || ||||||||| ||||||    
T  16681 ttcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgact 16582  T
Q  110 tcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactctt 209  Q
    ||||||||||||| |||||  |||  ||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||   |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  16581 tcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactctt 16482  T
Q  210 ctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  16481 ttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 16416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4676 - 4405
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || |||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||| ||||||     
T  4676 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttct 4577  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||  |||  || || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  4576 ttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgata 4477  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  4476 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaac 4405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 694
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || || | ||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  964 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 865  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||  || |||| ||| || || || || || ||||||| |||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  864 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctca-aaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgata 766  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  765 actcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaac 694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 5256 - 5527
Alignment:
Q  4 tgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 103  Q
    ||||| |||||||||||  || | || || |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||| ||  | |||||| ||||||    
T  5256 tgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttcc 5355  T
Q  104 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggta 203  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||  || || || || | |||||||||  | ||||| || ||  |||| ||    
T  5356 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgata 5455  T
Q  204 actcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 275  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  5456 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaac 5527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 6455 - 6638
Alignment:
Q  52 ccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataa 151  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||    
T  6455 ccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 6554  T
Q  152 atacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatct 235  Q
    | || || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  6555 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6375 - 6309
Alignment:
Q  237 ttctctgatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6375 ttctctgatcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctct 6309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16989 - 17121
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||  ||| || ||||||||| |||||| || ||| ||  | ||||||||||    
T  16989 tcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaact 17088  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 133  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17089 tctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtca 17121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4699 - 4567
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| | | | ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  4699 tcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaataaatctcggagtaaact 4600  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 133  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4599 tctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4545 - 4489
Alignment:
Q  184 ttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttct 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4545 ttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 4489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1032 - 823
Alignment:
Q  65 atatccgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcacc 164  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || ||    
T  1032 atatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca-aaaaacgtggtctcc 934  T
Q  165 ctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagta 264  Q
     || || ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||   |||||||| |||||||| |||    
T  933 ttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggta 834  T
Q  265 gtctgatgaac 275  Q
    || || |||||    
T  833 gtttgttgaac 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 86610 - 86505
Alignment:
Q  169 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctcagtagtct 268  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  86610 tgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtct 86511  T
Q  269 gatgaa 274  Q
    | ||||    
T  86510 gttgaa 86505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 8768 - 8828
Alignment:
Q  7 aagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgata 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  8768 aagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatactctccgata 8828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5864 - 5606
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgatatccgatacggaccaatgaactttggagtcaact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||| || || || ||||| || |  || ||  |||||| |||| | ||| | |||| ||  |    
T  5864 tcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtt 5765  T
Q  101 tcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatg 200  Q
    || ||||||| | ||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || || || |||||||||||  ||||  | ||||| |||||    
T  5764 tcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatg 5666  T
Q  201 gtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 260  Q
     |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||    
T  5665 ataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctc 5606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Original strand, 10832 - 10923
Alignment:
Q  145 ctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  10832 ctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatctt 10923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 45877 - 45943
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctccgata 67  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  45877 tcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9075 - 8930
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||| || | | || | ||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  9075 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 8976  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  8975 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 8930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3426
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || | ||| |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||| | | |||| || |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 5863 - 6008
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||   |||| || |    
T  5863 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcc 5962  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  5963 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 6008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 10477 - 10622
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  10477 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 10576  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  10577 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 10622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8617
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||   |||| || |    
T  8472 ggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcc 8571  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  8572 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 8617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 14645 - 14790
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||| |||| | || | || |||| ||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  14645 ggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 14744  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||    
T  14745 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactctttcatctt 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 911 - 871
Alignment:
Q  1 tcatgcaagttcgaaagatgtggtagcaaaccaactctata 41  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  911 tcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctata 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3807 - 3734
Alignment:
Q  187 ctacgcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 260  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  3807 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctc 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13175
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| |||  | || ||||  || |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 13175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8359
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| || ||||| |||| | || | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcat 233  Q
     ||| ||||| ||| ||||||| | ||| || |||||||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcat 8359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 425
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||| ||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3914
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||| |||| | || || | ||| ||||||||| |  ||||||||||||   |||| || |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatctt 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14776
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||  |||| | || | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||   |||| || |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatctt 14776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46421
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || | |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctgacgactatgcgacgctttcatctt 236  Q
     ||| ||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatctt 46421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24123
Alignment:
Q  91 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcataaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 190  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  191 gcttgtcatggtaactcttctg 212  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctg 24123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University