View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8570_low_17 (Length: 283)

Name: NF8570_low_17
Description: NF8570
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8570_low_17
NF8570_low_17
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (16-274)||(18630846-18631105)
chr6 (23-228)||(32350829-32351036)
chr6 (75-220)||(29604317-29604463)
chr6 (17-188)||(22463342-22463514)
chr6 (108-220)||(25649907-25650019)
chr6 (90-220)||(22363497-22363628)
chr6 (141-220)||(11374209-11374288)
chr6 (130-220)||(25918432-25918522)
chr6 (141-220)||(29161868-29161947)
chr6 (31-125)||(33539650-33539747)
chr6 (77-220)||(21621879-21622023)
chr6 (149-220)||(15006013-15006084)
chr6 (141-208)||(31162241-31162308)
chr6 (110-208)||(16375134-16375232)
chr6 (142-208)||(17857741-17857807)
chr6 (128-220)||(5485675-5485766)
chr6 (141-207)||(23220448-23220513)
chr6 (141-183)||(16135054-16135096)
chr6 (141-179)||(18104827-18104865)
chr6 (142-174)||(14874841-14874873)
chr6 (141-180)||(4173032-4173071)
chr6 (145-180)||(19852973-19853008)
chr6 (141-183)||(21930667-21930709)
chr6 (145-183)||(34965681-34965719)
chr6 (148-180)||(18383047-18383079)
chr6 (145-181)||(22846904-22846940)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (9-274)||(23264-23529)
scaffold0021 (84-274)||(19073-19264)
scaffold0021 (84-274)||(28649-28840)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (66-274)||(29296601-29296810)
chr8 (16-229)||(24266752-24266967)
chr8 (17-229)||(24553806-24554020)
chr8 (141-274)||(23227377-23227511)
chr8 (51-229)||(7468999-7469179)
chr8 (51-220)||(38636930-38637100)
chr8 (77-270)||(15932034-15932224)
chr8 (65-274)||(26010148-26010346)
chr8 (108-274)||(17283962-17284124)
chr8 (141-220)||(17265633-17265712)
chr8 (141-220)||(19332983-19333062)
chr8 (110-190)||(25608794-25608875)
chr8 (141-207)||(24238291-24238357)
chr8 (141-183)||(18042914-18042956)
chr8 (141-183)||(22312439-22312481)
chr8 (141-183)||(11543284-11543326)
chr8 (145-183)||(33171032-33171070)
chr8 (141-183)||(45560571-45560613)
chr8 (145-181)||(37655004-37655040)
chr8 (141-183)||(22498654-22498696)
chr8 (145-183)||(23116175-23116213)
chr8 (145-178)||(24270964-24270997)
chr8 (145-181)||(25756725-25756761)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (17-274)||(1284-1546)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (9-274)||(24082813-24083083)
chr5 (16-229)||(5622665-5622880)
chr5 (25-274)||(6455377-6455631)
chr5 (9-274)||(29912756-29913026)
chr5 (16-229)||(26561024-26561238)
chr5 (51-218)||(33627655-33627823)
chr5 (74-220)||(21223998-21224143)
chr5 (145-274)||(18532161-18532290)
chr5 (108-220)||(14343085-14343197)
chr5 (145-274)||(22055125-22055254)
chr5 (141-214)||(21108292-21108365)
chr5 (141-183)||(11964721-11964763)
chr5 (141-183)||(20455450-20455492)
chr5 (141-174)||(24851820-24851853)
chr5 (145-181)||(24226825-24226861)
chr5 (145-181)||(37982199-37982235)
chr5 (141-175)||(17301586-17301620)
chr5 (145-181)||(3672761-3672797)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (16-271)||(42707458-42707714)
chr4 (62-220)||(18275572-18275730)
chr4 (51-274)||(38763485-38763707)
chr4 (141-274)||(7187268-7187402)
chr4 (51-229)||(12732898-12733078)
chr4 (145-274)||(15676248-15676377)
chr4 (16-125)||(18240968-18241078)
chr4 (145-274)||(31114478-31114607)
chr4 (145-250)||(10105523-10105629)
chr4 (146-220)||(19823802-19823876)
chr4 (141-189)||(17213199-17213247)
chr4 (141-183)||(19558103-19558145)
chr4 (141-207)||(54364926-54364992)
chr4 (128-214)||(10115707-10115795)
chr4 (141-183)||(24237659-24237701)
chr4 (145-183)||(41257711-41257749)
chr4 (141-183)||(5372051-5372093)
chr4 (145-183)||(10238812-10238850)
chr4 (128-174)||(11923442-11923488)
chr4 (141-183)||(49070598-49070640)
chr4 (141-174)||(13933541-13933574)
chr4 (145-181)||(47469693-47469729)
chr4 (145-181)||(50223519-50223555)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (9-210)||(2183-2385)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (16-274)||(31499910-31500174)
chr7 (25-274)||(34242353-34242600)
chr7 (17-220)||(4437612-4437816)
chr7 (65-274)||(16921205-16921411)
chr7 (17-220)||(4445013-4445217)
chr7 (65-274)||(48354045-48354252)
chr7 (51-220)||(33558452-33558622)
chr7 (65-274)||(9609947-9610153)
chr7 (65-274)||(9837519-9837725)
chr7 (62-220)||(14939534-14939693)
chr7 (62-220)||(15367127-15367286)
chr7 (74-220)||(17225204-17225351)
chr7 (74-220)||(16918329-16918476)
chr7 (141-220)||(16382288-16382367)
chr7 (141-205)||(21539528-21539592)
chr7 (141-220)||(45148320-45148399)
chr7 (139-207)||(19066362-19066430)
chr7 (141-208)||(15979429-15979496)
chr7 (141-183)||(4483499-4483541)
chr7 (141-183)||(21676386-21676428)
chr7 (141-183)||(28719225-28719267)
chr7 (141-183)||(8564931-8564973)
chr7 (141-175)||(17910748-17910782)
chr7 (145-183)||(20584240-20584278)
chr7 (145-181)||(9057990-9058026)
chr7 (145-183)||(9322420-9322458)
chr7 (144-189)||(3193397-3193442)
chr7 (141-177)||(17150779-17150815)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (9-216)||(6229858-6230065)
chr3 (16-229)||(21167952-21168167)
chr3 (16-274)||(14816927-14817190)
chr3 (9-274)||(4146901-4147171)
chr3 (23-213)||(17319814-17320006)
chr3 (51-274)||(18968794-18969021)
chr3 (50-274)||(4163449-4163678)
chr3 (66-273)||(34558573-34558777)
chr3 (62-229)||(25105236-25105405)
chr3 (51-229)||(43428801-43428981)
chr3 (74-274)||(17203368-17203565)
chr3 (80-220)||(15549270-15549411)
chr3 (90-220)||(12020703-12020834)
chr3 (108-220)||(8603430-8603542)
chr3 (141-220)||(17759793-17759871)
chr3 (141-220)||(19061113-19061191)
chr3 (134-204)||(17392099-17392171)
chr3 (107-220)||(27050476-27050588)
chr3 (141-183)||(5229430-5229472)
chr3 (133-175)||(21663499-21663541)
chr3 (145-183)||(41660383-41660421)
chr3 (128-180)||(17385638-17385690)
chr3 (145-181)||(38812350-38812386)
chr3 (141-174)||(10711366-10711399)
chr3 (145-181)||(12951819-12951855)
chr3 (146-174)||(16018474-16018502)
chr3 (141-181)||(38377166-38377206)
chr3 (145-181)||(47983668-47983704)
chr3 (145-181)||(47992955-47992991)
chr3 (145-181)||(48002242-48002278)
chr3 (145-181)||(48011528-48011564)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (9-274)||(24881305-24881575)
chr2 (17-274)||(25132885-25133142)
chr2 (141-233)||(19665382-19665475)
chr2 (145-274)||(24342740-24342869)
chr2 (141-220)||(6093582-6093661)
chr2 (128-218)||(40641635-40641725)
chr2 (74-189)||(9782199-9782314)
chr2 (141-206)||(45619390-45619455)
chr2 (141-220)||(20272132-20272211)
chr2 (141-207)||(24562225-24562291)
chr2 (229-274)||(19661036-19661081)
chr2 (145-181)||(43641597-43641633)
chr2 (141-183)||(18534599-18534640)
chr2 (145-182)||(22137184-22137221)
chr2 (145-181)||(19434827-19434863)
chr2 (155-183)||(24276655-24276683)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (51-274)||(46144473-46144701)
chr1 (51-274)||(49998583-49998811)
chr1 (17-214)||(40437503-40437701)
chr1 (82-274)||(17607641-17607829)
chr1 (51-220)||(52399382-52399545)
chr1 (108-220)||(17022311-17022423)
chr1 (109-220)||(33396076-33396188)
chr1 (141-183)||(20821725-20821767)
chr1 (145-183)||(41213023-41213061)
chr1 (145-181)||(37235319-37235355)
chr1 (145-183)||(5769570-5769608)
chr1 (145-178)||(5471741-5471774)
chr1 (145-181)||(8539310-8539346)
chr1 (145-181)||(8604549-8604585)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (65-274)||(29800-30006)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (16-229)||(3194-3409)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (65-274)||(198640-198846)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (65-274)||(98442-98648)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (65-271)||(68199-68402)
scaffold0009 (142-188)||(255777-255823)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (65-274)||(12142-12348)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (142-265)||(105965-106089)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (24-199)||(1036-1210)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (51-274)||(6437-6665)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (65-274)||(1356-1563)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (82-265)||(52009-52188)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (169-274)||(6543-6648)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (74-220)||(483-630)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (74-220)||(5475-5622)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (141-220)||(11351-11430)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (188-274)||(63867-63954)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (141-220)||(10710-10789)
scaffold0013 (145-180)||(34243-34278)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (141-220)||(1570-1649)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (145-220)||(50315-50390)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (141-207)||(9532-9598)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (142-208)||(326-392)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (141-208)||(12464-12531)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (141-183)||(44964-45006)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (141-183)||(4715-4757)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (145-183)||(85190-85228)
scaffold0004 (145-183)||(26328-26366)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (145-180)||(12358-12393)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (145-183)||(34819-34857)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (145-183)||(130657-130695)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (145-177)||(23832-23864)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (145-181)||(6004-6040)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (145-181)||(24970-25006)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (145-181)||(78191-78227)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 18630846 - 18631105
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga 115  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18630846 ttttacttggatggtgataaattgtgcaaagttgatgaactatggaatatagctaaagttgattaatgaatatatgttgatgaattatgatatttggtga 18630945  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18630946 tgattcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtactttt 18631045  T
Q  216 acatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18631046 acattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 18631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32351036 - 32350829
Alignment:
Q  23 tggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattc 121  Q
    ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  32351036 tggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggagatgactc 32350937  T
Q  122 ttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt- 220  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32350936 ttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattg 32350837  T
Q  221 tgttggtg 228  Q
    ||||||||    
T  32350836 tgttggtg 32350829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29604463 - 29604317
Alignment:
Q  75 tgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgca 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29604463 tgattaatgaatatatgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgca 29604364  T
Q  174 attgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29604363 attgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacatt 29604317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 22463342 - 22463514
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtga 115  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22463342 tttacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 22463441  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 188  Q
    ||| |||||   ||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22463442 tgactcttatttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25650019 - 25649907
Alignment:
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  25650019 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattcgaggt 25649920  T
Q  208 gtacttttacatt 220  Q
    ||| |||||||||    
T  25649919 gtaattttacatt 25649907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Original strand, 22363497 - 22363628
Alignment:
Q  90 tgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  22363497 tgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagtt 22363596  T
Q  189 gaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22363597 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 22363628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 11374209 - 11374288
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11374209 ttgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 11374288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25918522 - 25918432
Alignment:
Q  130 ataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25918522 ataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctacttttacatt 25918432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 29161868 - 29161947
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29161868 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtgtacttttacatt 29161947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 125
Target Start/End: Original strand, 33539650 - 33539747
Alignment:
Q  31 gatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgatta--atgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaa 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33539650 gatgaattgcgcaaagttgatgaactatagaatatagatgaagttgattaatatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaa 33539747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21622023 - 21621879
Alignment:
Q  77 attaatgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 175  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  21622023 attaatgaatgtgtgttgatgaactgtgatagtttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaat 21621924  T
Q  176 tgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21621923 tgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacatt 21621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 220
Target Start/End: Original strand, 15006013 - 15006084
Alignment:
Q  149 gtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15006013 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15006084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 31162241 - 31162308
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  31162241 ttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 31162308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16375232 - 16375134
Alignment:
Q  110 tggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||||||||| |||||   |||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  16375232 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaaatgaaggtg 16375134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 17857741 - 17857807
Alignment:
Q  142 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  17857741 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggaggtg 17857807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 5485675 - 5485766
Alignment:
Q  128 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5485675 gaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggt-gaactaatcaatgtaaatggatgtgtacttttacatt 5485766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23220513 - 23220448
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  23220513 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgg-gttgatcaatataaatggaggt 23220448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16135096 - 16135054
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16135096 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttg 16135054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 179
Target Start/End: Original strand, 18104827 - 18104865
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtt 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18104827 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtt 18104865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 14874841 - 14874873
Alignment:
Q  142 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874841 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 14874873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 180
Target Start/End: Original strand, 4173032 - 4173071
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4173032 ttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttg 4173071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19853008 - 19852973
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19853008 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21930709 - 21930667
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21930709 ttgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttg 21930667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34965719 - 34965681
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965719 ttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 34965681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 180
Target Start/End: Original strand, 18383047 - 18383079
Alignment:
Q  148 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18383047 tgtggatgtaattacttgataatgcaattgttg 18383079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22846940 - 22846904
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22846940 ttgtgtggacgtaaatacttgataattcaattgttgt 22846904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 23264 - 23529
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23264 ttttccattttacttggaaggagataaattgtgcaaagttgatgaactatggaatatagttaaagttgattaatgaatatatgttgatgaagtatgatat 23363  T
Q  109 ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23364 ttg-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 23462  T
Q  209 tacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23463 tacttttagattgtgttgctgtgtataagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 274
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19264
Alignment:
Q  84 aatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19073 aatatatgttgatgaagtatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 19172  T
Q  184 gagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19173 gagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 19264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 274
Target Start/End: Original strand, 28649 - 28840
Alignment:
Q  84 aatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649 aatatatgttgatgaagtatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 28748  T
Q  184 gagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28749 gagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 28840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29296810 - 29296601
Alignment:
Q  66 agttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttg 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29296810 agttgaagttgattaatgaatacatgttgatgtactatgatatttggtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttg 29296711  T
Q  166 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29296710 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattatttggtctttgc 29296611  T
Q  265 tgatgtccat 274  Q
    | ||||||||    
T  29296610 ttatgtccat 29296601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24266967 - 24266752
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| ||||| ||| || | |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24266967 ttttacttggaaggttataagttgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtg 24266868  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24266867 atgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttt 24266768  T
Q  215 tacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  24266767 tacattgtgttggtgt 24266752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 24553806 - 24554020
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttg-gtga 115  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||    
T  24553806 tttacttggatggtgataagttgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttcgaga 24553905  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24553906 tgactcttaattgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 24554005  T
Q  216 acatt-tgttggtgt 229  Q
    ||||| |||||||||    
T  24554006 acattgtgttggtgt 24554020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 274
Target Start/End: Original strand, 23227377 - 23227511
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23227377 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 23227476  T
Q  240 agtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23227477 agtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 23227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7469179 - 7468999
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7469179 tgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 7469080  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7469079 tgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 7468999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Original strand, 38636930 - 38637100
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38636930 tgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttgatgatgactcttaattgaataatgacatattgattgtg 38637029  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38637030 tggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 38637100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15932224 - 15932034
Alignment:
Q  77 attaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatt 176  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15932224 attaatgaatgcatattgatgaattgtgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaaat 15932125  T
Q  177 gttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgt 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15932124 gttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgt-tgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgt 15932034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26010346 - 26010148
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||        |    
T  26010346 tagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatg--------t 26010255  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| |||||||||| |||||||||   | || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26010254 gataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtattgt-tgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgc 26010158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17284124 - 17283962
Alignment:
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  17284124 tttggtggtgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggt 17284025  T
Q  208 gtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||| ||||| ||    ||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17284024 gtacttttacattatgttgttg----tgagttgtggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 17283962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17265712 - 17265633
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17265712 ttgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 17265633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 19332983 - 19333062
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19332983 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 19333062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25608875 - 25608794
Alignment:
Q  110 tggtgatgattcttaacagaataatgacatt-ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 190  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25608875 tggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25608794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24238357 - 24238291
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  24238357 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatataaatggaggt 24238291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 18042914 - 18042956
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18042914 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 18042956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22312481 - 22312439
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312481 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 22312439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11543326 - 11543284
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11543326 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttg 11543284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33171070 - 33171032
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33171070 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 33171032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 45560571 - 45560613
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45560571 ttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 45560613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 37655004 - 37655040
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37655004 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37655040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 22498654 - 22498696
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22498654 ttgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttg 22498696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 23116175 - 23116213
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116175 ttgtgtgtacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 23116213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24270997 - 24270964
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270997 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 24270964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25756761 - 25756725
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25756761 ttgtgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgt 25756725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1546 - 1284
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 115  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1546 tttaattggattgtgataaattgtgcaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgactaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 1447  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1446 tgactcttaattgaataatgacttcttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtactttt 1347  T
Q  216 acatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     |||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1346 gcattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24083083 - 24082813
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24083083 ttttccattttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttaattaatgattatatgttgatgaattgtgatat 24082984  T
Q  109 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24082983 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 24082884  T
Q  208 gtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||||   |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24082883 gtacttttacattgtgttgatgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgggtctttacttatgtccat 24082813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 5622665 - 5622880
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5622665 ttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtg 5622764  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5622765 atgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttt 5622864  T
Q  215 tacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  5622865 tacattgtgttggtgt 5622880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6455631 - 6455377
Alignment:
Q  25 gatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattctt 123  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6455631 gatggtgataaattgtacaaagttgatgaactataaaatataattgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactctt 6455532  T
Q  124 aacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tg 222  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |    
T  6455531 aattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtactcttacattgcg 6455432  T
Q  223 ttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6455431 ttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 6455377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29913026 - 29912756
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29913026 ttttccattttacttggatgttgataaattatgcaaagttcatgaactataaaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatat 29912927  T
Q  109 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    || || || || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  29912926 tttggggacgactcttaatggaatgatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggt 29912827  T
Q  208 gtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  29912826 gtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 29912756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 26561024 - 26561238
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26561024 ttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactata-aatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatatgttggtg 26561122  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26561123 atgactcttaattgaataacgacatgttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttt 26561222  T
Q  215 tacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  26561223 tacattgtgttggtgt 26561238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 33627655 - 33627823
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  33627655 tgaactatatgatatagttgaagttgattaataaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgactgtg 33627754  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33627755 tggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 21223998 - 21224143
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21223998 ttgattaatgaatgagtgttgatgaattgtgatattttggtg--gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 21224095  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21224096 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacatt 21224143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532290
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 18532260  T
Q  244 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  18532261 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 18532290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Original strand, 14343085 - 14343197
Alignment:
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |    
T  14343085 tttggtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagat 14343184  T
Q  208 gtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||    
T  14343185 gtacttttacatt 14343197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055254
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | | | |||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatgtaagttgagta 22055224  T
Q  244 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22055225 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 22055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21108365 - 21108292
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21108365 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttt 21108292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11964763 - 11964721
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964763 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 11964721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 20455450 - 20455492
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20455450 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttg 20455492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 174
Target Start/End: Original strand, 24851820 - 24851853
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851820 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 24851853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 24226825 - 24226861
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24226825 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 24226861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37982235 - 37982199
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37982235 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37982199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 175
Target Start/End: Original strand, 17301586 - 17301620
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17301586 ttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 17301620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3672797 - 3672761
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3672797 ttgtgtggacgtaaacacttgataatgcaattgttgt 3672761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42707714 - 42707458
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga 115  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42707714 ttttacttggataatgataaattgtgcaaggttgatgaactatgtaatatagttaaagttgattattggatatatgttgatgaattatgatatttggtga 42707615  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42707614 tgactcttgattgaataatgacatgctgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtactttt 42707515  T
Q  216 acatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtc 271  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42707514 acattgtgttggtgtatataagttgagtagttgcattattcggtatttgcttatgtc 42707458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18275730 - 18275572
Alignment:
Q  62 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaata 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18275730 atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatg 18275631  T
Q  162 cttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18275630 cttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 18275572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38763707 - 38763485
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaatta-tgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  38763707 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaatttgtgatatttggtgatgactcttaattgaataatggcatgttgattgtg 38763608  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtag-ttg 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||| |||    
T  38763607 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagtttg 38763512  T
Q  248 cattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38763511 cattattgggtctttgcttatgtccat 38763485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 274
Target Start/End: Original strand, 7187268 - 7187402
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7187268 ttgactgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 7187367  T
Q  240 agtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7187368 agtagttgcattattcgttctttgcttatgtccat 7187402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12733078 - 12732898
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||    
T  12733078 tgaactataggatatagttgaagttgattgatgaatacatgttgattaattgtgacattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgacgattgtg 12732979  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12732978 tggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 12732898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676377
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | | |||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgtaagttgagta 15676347  T
Q  244 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15676348 tttgcattgttgggtctttgct-atgtccat 15676377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 18240968 - 18241078
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18240968 ttttacttggatggtgataagttgtgtaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtg 18241067  T
Q  115 atgattcttaa 125  Q
    |||| ||||||    
T  18241068 atgactcttaa 18241078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114478
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 31114508  T
Q  244 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  31114507 attacattgttgggtctttgct-atgtccat 31114478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105629
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 10105622  T
Q  244 gttgcat 250  Q
     ||||||    
T  10105623 attgcat 10105629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19823876
Alignment:
Q  146 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 19823876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Original strand, 17213199 - 17213247
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17213199 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttg 17213247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19558145 - 19558103
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558145 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 19558103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 54364926 - 54364992
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||    
T  54364926 ttgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 54364992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 214
Target Start/End: Original strand, 10115707 - 10115795
Alignment:
Q  128 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagt--tgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10115707 gaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaatttatgaagaatgtaattggaggtgtacttt 10115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24237701 - 24237659
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237701 ttgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 24237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 41257711 - 41257749
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41257711 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 41257749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 5372051 - 5372093
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5372051 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttg 5372093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 10238812 - 10238850
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10238812 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttg 10238850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Original strand, 11923442 - 11923488
Alignment:
Q  128 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11923442 gaattatgacttgttgattgtgtggatgtaagtacttgataatgcaa 11923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49070640 - 49070598
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  49070640 ttgattatgtggacgttaatacttgataatgcaattgttgttg 49070598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13933574 - 13933541
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13933574 ttgattgtgtgaatgtaaatacttgataatgcaa 13933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 47469693 - 47469729
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47469693 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgt 47469729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 50223519 - 50223555
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50223519 ttgtgtggacgtaaatacttaataatgcaattgttgt 50223555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 2183 - 2385
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgata- 107  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  2183 ttttccattttacttggaaggtgataaattgtgcaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgataa 2282  T
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2283 ttttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaactggaggt 2382  T
Q  208 gta 210  Q
    |||    
T  2383 gta 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31500174 - 31499910
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  31500174 ttttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgctgatgaattgtgatattttggtg 31500075  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31500074 atgactcttaattgaatattgacatgttgattgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttt 31499975  T
Q  215 tacatt-tgttggtg---tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||| ||||||||   |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31499974 tacattgtgttggtgtattgtatatgttgagtagtttgcattatttagtctttgcttatgtccat 31499910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 34242353 - 34242600
Alignment:
Q  25 gatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattctta 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34242353 gatggcgatgaattgtgcaaaattgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctta 34242452  T
Q  125 acagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgt 223  Q
       |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  34242453 tttgaataatgacatgttaattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgt 34242552  T
Q  224 tggtgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||   ||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  34242553 tg--ttgtatg--ttgagtagtttgcattattgggtctttgtttatgtccat 34242600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4437816 - 4437612
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 115  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4437816 tttacttggatggtgataaattgtgcaaggtgaatgaattatagaatatagttgaagttgattactgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 4437717  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4437716 tgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 4437617  T
Q  216 acatt 220  Q
    |||||    
T  4437616 acatt 4437612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 16921205 - 16921411
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  16921205 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatagtgtggatgtaaatgctt 16921304  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16921305 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtaattgcattatttggtctttg 16921400  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  16921401 cttatgtccat 16921411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4445217 - 4445013
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 115  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4445217 tttacttggatggtgataaattgtgcaaggtgaatgaatgatagcatttagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 4445118  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4445117 tgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 4445018  T
Q  216 acatt 220  Q
    |||||    
T  4445017 acatt 4445013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48354252 - 48354045
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48354252 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 48354153  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtcttt 262  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  48354152 gataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagtttgcattattgggtcttt 48354057  T
Q  263 gctgatgtccat 274  Q
    ||| ||||||||    
T  48354056 gcttatgtccat 48354045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33558622 - 33558452
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  33558622 tgaactatataatatagttgaagttgattaatgaatacttgttgttgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataacgacatattgattgtg 33558523  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33558522 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 33558452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9610153 - 9609947
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  9610153 tagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgatt 9610054  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9610053 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 9609958  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  9609957 cttatgtccat 9609947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9837725 - 9837519
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  9837725 tagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgatt 9837626  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9837625 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 9837530  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  9837529 cttatgtccat 9837519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14939693 - 14939534
Alignment:
Q  62 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 160  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14939693 atatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaat 14939594  T
Q  161 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14939593 gcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 14939534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15367286 - 15367127
Alignment:
Q  62 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 160  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15367286 atatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaat 15367187  T
Q  161 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367186 gcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15367127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 17225204 - 17225351
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17225204 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 17225303  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17225304 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 17225351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16918476 - 16918329
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16918476 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 16918377  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16918376 aattgttgttgaagttgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacatt 16918329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16382367 - 16382288
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16382367 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 16382288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Original strand, 21539528 - 21539592
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggag 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21539528 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaaatggag 21539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45148399 - 45148320
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45148399 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtgtacttttacatt 45148320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19066430 - 19066362
Alignment:
Q  139 ttttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||    
T  19066430 ttttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgttcaatataaatggaggt 19066362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 15979429 - 15979496
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  15979429 ttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 15979496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4483541 - 4483499
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483541 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 4483499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 21676386 - 21676428
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676386 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 21676428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28719267 - 28719225
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28719267 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttg 28719225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 8564931 - 8564973
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564931 ttgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 8564973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17910782 - 17910748
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910782 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 17910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 20584240 - 20584278
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584240 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 20584278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 9057990 - 9058026
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9057990 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 9058026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 9322420 - 9322458
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322420 ttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 9322458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Original strand, 3193397 - 3193442
Alignment:
Q  144 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttg 189  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3193397 attgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttg 3193442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 177
Target Start/End: Original strand, 17150779 - 17150815
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattg 177  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17150779 ttgattgtatggatgtaaatagttgataatgcaattg 17150815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 6229858 - 6230065
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6229858 ttttccattttacttggatggtgataaattgtgcaaagttgatgaattatagaatatagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatat 6229957  T
Q  109 ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6229958 ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtg 6230057  T
Q  209 tactttta 216  Q
    ||||||||    
T  6230058 tactttta 6230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 21167952 - 21168167
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21167952 ttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtg 21168051  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  21168052 atgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtacttt 21168151  T
Q  215 tacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  21168152 tacattgtgttggtgt 21168167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 14816927 - 14817190
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14816927 ttttacttggatggtgataaattgtgtaaagttgatgaactatagaacatagttgaagttgatttatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtg 14817026  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14817027 atgactcttaaatgaataatgacatgttgatcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatataattggaggtgtacttt 14817126  T
Q  215 tacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  14817127 tacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 14817190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 4146901 - 4147171
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4146901 ttttccattttacttggatggtgatatattgtgtaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatat 4147000  T
Q  109 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4147001 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 4147100  T
Q  208 gtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    || |||||||||| ||||||  | |||||   | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4147101 gttcttttacattgtgttggcatatgtatatgtcgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccat 4147171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 17319814 - 17320006
Alignment:
Q  23 tggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgatt-aatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgatt 120  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  17319814 tggatggtcataaattgtgcgaagtttttgaactataggatatagttgaagttgatttaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgact 17319913  T
Q  121 cttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactt 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17319914 cttaattgaataatgacattttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtactt 17320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18969021 - 18968794
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18969021 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 18968922  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagtagtt 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||  | |||||   ||||||||||    
T  18968921 tcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaatgtgtacttttacattgtgttggtatatgtatatgttgagtagtt 18968822  T
Q  247 gcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18968821 gcattattgggtctttgcttatgtccat 18968794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 274
Target Start/End: Original strand, 4163449 - 4163678
Alignment:
Q  50 atgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||     
T  4163449 atgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgg 4163548  T
Q  149 gtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagta-g 244  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   | |||||      
T  4163549 gtggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggcatgtgtatatgtcgagtact 4163648  T
Q  245 ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4163649 ttgcattattgggtctttgcttatgtccat 4163678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34558777 - 34558573
Alignment:
Q  66 agttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttg 165  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  34558777 agttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtggatgtaaatgcttg 34558678  T
Q  166 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34558677 ataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgc 34558582  T
Q  265 tgatgtcca 273  Q
    | |||||||    
T  34558581 ttatgtcca 34558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 25105236 - 25105405
Alignment:
Q  62 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25105236 atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaat 25105335  T
Q  161 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25105336 acttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 25105405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Original strand, 43428801 - 43428981
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  43428801 tgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgcg 43428900  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43428901 tggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 43428981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17203565 - 17203368
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17203565 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 17203466  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtc 271  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    | | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17203465 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg----taagttgaggagttgcattatttggtctttgct-atgtc 17203371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15549411 - 15549270
Alignment:
Q  80 aatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 178  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15549411 aatgaatgtatgttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgt 15549312  T
Q  179 tgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15549311 tgttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15549270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12020834 - 12020703
Alignment:
Q  90 tgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 188  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  12020834 tgttgatgaattgtgatattttggcggtgtctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagtt 12020735  T
Q  189 gaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12020734 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 12020703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8603542 - 8603430
Alignment:
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  8603542 tttggtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggt 8603443  T
Q  208 gtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||    
T  8603442 gtacttttacatt 8603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 17759793 - 17759871
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17759793 ttgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 17759871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 19061113 - 19061191
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19061113 ttgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 19061191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17392171 - 17392099
Alignment:
Q  134 tgacattttgattgtgtggatgtaaata--cttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactgga 204  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17392171 tgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatgga 17392099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27050588 - 27050476
Alignment:
Q  107 atttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggagg 206  Q
    |||||||||||| |||||   |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||   |||||||| ||||||    
T  27050588 atttggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggt-gaattactcaatgtaaatggagg 27050490  T
Q  207 tgtacttttacatt 220  Q
     |||||||||||||    
T  27050489 ggtacttttacatt 27050476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 5229430 - 5229472
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229430 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 5229472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21663541 - 21663499
Alignment:
Q  133 atgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21663541 atgactttttgattgtgtggatgtaaattcttgataatgcaat 21663499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41660421 - 41660383
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41660421 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 41660383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17385690 - 17385638
Alignment:
Q  128 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17385690 gaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttg 17385638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 38812350 - 38812386
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38812350 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 38812386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 174
Target Start/End: Original strand, 10711366 - 10711399
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10711366 ttgattgtgtggatctaaatacttgataatgcaa 10711399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12951855 - 12951819
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12951855 ttgtgtggaagtaaatactggataatgcaattgttgt 12951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 174
Target Start/End: Original strand, 16018474 - 16018502
Alignment:
Q  146 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16018474 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 16018502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 181
Target Start/End: Original strand, 38377166 - 38377206
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38377166 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgt 38377206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47983704 - 47983668
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47983704 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 47983668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47992991 - 47992955
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47992991 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 47992955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48002278 - 48002242
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48002278 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 48002242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48011564 - 48011528
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48011564 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 48011528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24881575 - 24881305
Alignment:
Q  9 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 108  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24881575 ttttccattttacttggatattgataaattgtgtaaggttgatgaactatagaacatagttgaagttgattaatgattatatgttgatgaattgtgatat 24881476  T
Q  109 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    || |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24881475 tttggtgatgactcttgaatgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 24881376  T
Q  208 gtacttttacatt-tgttgg----tgtgtatgaattgagtagtt-gcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||| ||||||    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24881375 gtacttttacattgtgttggtgcatgtgtatg--ttgagtagttggcattattgggtctttgcttatgtccat 24881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25133142 - 25132885
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 115  Q
    |||| |||||||||||| | || || |||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  25133142 tttacttggatggtgataagttatgaaaagtggttgaacaatagaatatagttgaagttgattaatgaatacctgatgatgaattgtgatattttggtga 25133043  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 215  Q
    ||| |||     |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25133042 tgactct-----gaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 25132948  T
Q  216 acatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  25132947 acattgtgttggtgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtcttcgcttatgtccat 25132885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19665475 - 19665382
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19665475 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtat 19665382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342869
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 24342839  T
Q  244 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  24342840 attgcattgttaggtctttgct-atgtccat 24342869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6093661 - 6093582
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6093661 ttgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 6093582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Original strand, 40641635 - 40641725
Alignment:
Q  128 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca 218  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  40641635 gaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 40641725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Original strand, 9782199 - 9782314
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgca 173  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9782199 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataattggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgca 9782298  T
Q  174 attgttgttggagttg 189  Q
    |||||||||| |||||    
T  9782299 attgttgttgaagttg 9782314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Original strand, 45619390 - 45619455
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggagg 206  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  45619390 ttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaaatggagg 45619455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20272211 - 20272132
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  20272211 ttgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtgtacttttacatt 20272132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 24562225 - 24562291
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||    
T  24562225 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 24562291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19661081 - 19661036
Alignment:
Q  229 tgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19661081 tgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 19661036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43641633 - 43641597
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43641633 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 43641597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18534640 - 18534599
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18534640 ttgattgtgtggacgtaa-tacttgataatgcaattgttgttg 18534599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 182
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137221
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22137184 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaaatgttgtt 22137221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 19434827 - 19434863
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19434827 ttgtgtggacgtaaatacttgataattcaattgttgt 19434863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24276683 - 24276655
Alignment:
Q  155 gtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24276683 gtaaatacttgataatgcaattgttgttg 24276655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46144701 - 46144473
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46144701 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 46144602  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  46144601 tggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 46144502  T
Q  246 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  46144501 tgcattattgagtctttgcttatgtccat 46144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Original strand, 49998583 - 49998811
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  49998583 tgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 49998682  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  49998683 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 49998782  T
Q  246 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  49998783 tgcattatcgagtctttgcttatgtccat 49998811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 40437503 - 40437701
Alignment:
Q  17 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 115  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  40437503 tttacttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgttgattaattgtgacattttggtga 40437602  T
Q  116 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40437603 tgactcttaattggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttt 40437701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17607829 - 17607641
Alignment:
Q  82 tgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17607829 tgaatacatgttgatgaattatgatcatta-taatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 17607731  T
Q  182 tggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    ||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17607730 tgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg--tcgtatg--ttgcgtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 17607641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52399545 - 52399382
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||        ||| || |||||||||    
T  52399545 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgttgactcttaat-------tgatatgttgattgtg 52399453  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52399452 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 52399382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17022423 - 17022311
Alignment:
Q  108 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  17022423 tttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggagat 17022324  T
Q  208 gtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||    
T  17022323 gtacttttacatt 17022311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33396188 - 33396076
Alignment:
Q  109 ttggtgatgattcttaacagaataatgacatt-ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33396188 ttggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33396089  T
Q  208 gtacttttacatt 220  Q
    |||||||||||||    
T  33396088 gtacttttacatt 33396076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20821767 - 20821725
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821767 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 20821725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 41213023 - 41213061
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213023 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 41213061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 37235319 - 37235355
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37235319 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37235355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 5769570 - 5769608
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5769570 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 5769608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 178
Target Start/End: Original strand, 5471741 - 5471774
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5471741 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgt 5471774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 8539310 - 8539346
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8539310 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgt 8539346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 8604549 - 8604585
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8604549 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgt 8604585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30006 - 29800
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30006 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgacctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 29907  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29906 ggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtatttgcattatttggtctttg 29811  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  29810 cttatgtccat 29800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 3194 - 3409
Alignment:
Q  16 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 114  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  3194 ttttacttagatggtgataaattgtgcaaagtcgataaactatagaatatagttgaagttgattaatcaatacgtgttgatgaattgtgatattttggtg 3293  T
Q  115 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 214  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3294 atgactcttaattgaataatgacatgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttt 3393  T
Q  215 tacatt-tgttggtgt 229  Q
    |||||| |||||||||    
T  3394 tacattgtgttggtgt 3409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 198640 - 198846
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  198640 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttt 198739  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || || |||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  198740 gataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgt-tgaatg--ttgagtagttgcattatttggtatttgc 198836  T
Q  265 tgatgtccat 274  Q
    | ||||||||    
T  198837 ttatgtccat 198846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 98442 - 98648
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  98442 tagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatctttggtgacgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 98541  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  98542 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 98637  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  98638 cttatgtccat 98648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 68402 - 68199
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  68402 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgattaatgacatgttgattgtgtggacgtaaatgctt 68303  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  68302 gataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 68207  T
Q  264 ctgatgtc 271  Q
    || |||||    
T  68206 cttatgtc 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 255777 - 255823
Alignment:
Q  142 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  255777 tgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 255823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12348 - 12142
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12348 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttagtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 12249  T
Q  165 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 263  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   | ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248 gataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgttg--ttatatg--ttgagtagttgtattatttggtctttg 12153  T
Q  264 ctgatgtccat 274  Q
    || ||||||||    
T  12152 cttatgtccat 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 265
Target Start/End: Original strand, 105965 - 106089
Alignment:
Q  142 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  105965 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttgatgtgtatgaattga 106064  T
Q  241 gtagttgcattattcggtctttgct 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  106065 gtagttgcattattcggtctttgct 106089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 1036 - 1210
Alignment:
Q  24 ggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattct 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  ||    
T  1036 ggatggtgataaattgtgcaaagtggttgaactatagagtatagttgaagttgattaatgaatacatgatgatgaattgtgatattttgatgatga--ct 1133  T
Q  123 taacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaa 199  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1134 taattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6437
Alignment:
Q  51 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 149  Q
    |||||||||  ||||| ||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||     
T  6665 tgaactatatgatatacttggagtggattaatatatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgta 6566  T
Q  150 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca-tttgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  6565 tggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaagttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 6466  T
Q  246 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6465 tgcattattgagtctttgcttatgtccat 6437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Original strand, 1356 - 1563
Alignment:
Q  65 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatact 163  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  1356 tagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgca 1455  T
Q  164 tgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtcttt 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||| ||||| |    
T  1456 tgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttaagtagttgcattatttggtctat 1551  T
Q  263 gctgatgtccat 274  Q
     || ||||||||    
T  1552 acttatgtccat 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52188 - 52009
Alignment:
Q  82 tgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52188 tgaatacatgttgatgaattataatccttg-tcatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 52090  T
Q  182 tggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgct 265  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | || |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52089 tgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttttacattgtgtagt-tgtacg--ttgagtagttgcattatttggtctttgct 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6648
Alignment:
Q  169 atgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctga 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6543 atgcaattgttgt-ggagttgtacaatgtaactggaagtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctta 6641  T
Q  268 tgtccat 274  Q
    |||||||    
T  6642 tgtccat 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 483
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga-tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||  || |||||||    
T  630 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaatggtgatatttggtgaatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgc 531  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  530 aattgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttttacatt 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5622 - 5475
Alignment:
Q  74 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 172  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||   || |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5622 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgc 5523  T
Q  173 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5522 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacatt 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11430 - 11351
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11430 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgtacttttacatt 11351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 274
Target Start/End: Original strand, 63867 - 63954
Alignment:
Q  188 tgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 274  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  63867 tgaaaaatgtaactggatgagtacttttacattgtgttggtgtatatgaattgagtagttgcattattctgtctttgcttatgtccat 63954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 10710 - 10789
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10710 ttgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgtacttttacatt 10789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34278 - 34243
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34278 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 34243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 220
Target Start/End: Original strand, 1570 - 1649
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1570 ttgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtgtacttttacatt 1649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50315
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 220  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacatt 50315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9598 - 9532
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||    
T  9598 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtcgatcaatataaatggaggt 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 326
Alignment:
Q  142 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  392 tgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaaatggaggtg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12531 - 12464
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 208  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  12531 ttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaaatggaggtg 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 44964 - 45006
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44964 ttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttg 45006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4757 - 4715
Alignment:
Q  141 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757 ttgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttg 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 85228 - 85190
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85228 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 85190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26366 - 26328
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26366 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgttg 26328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 180
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12393
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12358 ttgtgtggatgtgaatacttgataatgcaattgttg 12393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 34819 - 34857
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34819 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttg 34857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 130695 - 130657
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130695 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 130657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Original strand, 23832 - 23864
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattg 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23832 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattg 23864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6040
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6004 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgt 6040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 24970 - 25006
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24970 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgt 25006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 78191 - 78227
Alignment:
Q  145 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 181  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  78191 ttgtgtggacgtaaattcttgataatgcaattgttgt 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University