View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8577_low_25 (Length: 355)

Name: NF8577_low_25
Description: NF8577
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8577_low_25
NF8577_low_25
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-343)||(15229269-15229611)
chr4 (1-343)||(1901657-1901999)
chr4 (1-343)||(15283457-15283799)
chr4 (1-343)||(15389907-15390249)
chr4 (29-344)||(6571252-6571567)
chr4 (3-344)||(34187491-34187832)
chr4 (29-344)||(5007272-5007587)
chr4 (29-344)||(31125075-31125390)
chr4 (21-343)||(24590904-24591226)
chr4 (21-344)||(36343064-36343387)
chr4 (29-344)||(18799170-18799485)
chr4 (29-344)||(39852037-39852352)
chr4 (3-328)||(14666433-14666758)
chr4 (29-344)||(30755153-30755468)
chr4 (29-344)||(33672355-33672670)
chr4 (29-344)||(54834786-54835101)
chr4 (29-344)||(14099940-14100255)
chr4 (29-344)||(40104195-40104510)
chr4 (3-344)||(14761835-14762176)
chr4 (29-344)||(21971100-21971415)
chr4 (29-344)||(27161873-27162188)
chr4 (3-343)||(24114062-24114402)
chr4 (3-235)||(17014551-17014783)
chr4 (244-307)||(14731187-14731250)
chr4 (3-58)||(24460294-24460349)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-343)||(19454940-19455281)
chr2 (1-343)||(21701682-21702024)
chr2 (29-344)||(27805087-27805402)
chr2 (29-344)||(27778602-27778917)
chr2 (29-344)||(9348528-9348843)
chr2 (29-344)||(12588190-12588505)
chr2 (29-344)||(27818360-27818675)
chr2 (3-344)||(37376541-37376882)
chr2 (29-344)||(13935090-13935405)
chr2 (29-344)||(34287734-34288049)
chr2 (29-344)||(34292794-34293109)
chr2 (29-344)||(16827884-16828199)
chr2 (29-344)||(16893282-16893597)
chr2 (29-344)||(32051178-32051493)
chr2 (29-344)||(39050368-39050683)
chr2 (29-344)||(40234891-40235206)
chr2 (29-344)||(259299-259614)
chr2 (29-344)||(11633731-11634046)
chr2 (29-344)||(12715148-12715463)
chr2 (4-313)||(19415020-19415329)
chr2 (3-328)||(28883610-28883935)
chr2 (21-343)||(23127104-23127426)
chr2 (29-344)||(31877661-31877976)
chr2 (4-344)||(21675703-21676043)
chr2 (3-343)||(27432964-27433304)
chr2 (3-343)||(12656923-12657263)
chr2 (3-235)||(20839390-20839622)
chr2 (29-344)||(39891454-39891769)
chr2 (29-312)||(34863092-34863375)
chr2 (29-344)||(37949868-37950183)
chr2 (1-58)||(34302979-34303036)
chr2 (225-344)||(11640117-11640236)
chr2 (3-58)||(3785162-3785217)
chr2 (3-58)||(27119196-27119251)
chr2 (3-58)||(31891006-31891061)
chr2 (3-58)||(34157518-34157573)
chr2 (29-102)||(37926992-37927065)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-343)||(16625171-16625513)
chr3 (1-343)||(18531734-18532076)
chr3 (29-344)||(20575445-20575760)
chr3 (29-344)||(29663568-29663883)
chr3 (3-343)||(8297318-8297658)
chr3 (29-344)||(18226536-18226851)
chr3 (29-344)||(28114552-28114867)
chr3 (3-344)||(7074557-7074898)
chr3 (3-328)||(18052623-18052948)
chr3 (3-344)||(20067388-20067729)
chr3 (3-343)||(15891278-15891618)
chr3 (81-344)||(10397478-10397741)
chr3 (21-343)||(6193661-6193983)
chr3 (29-344)||(5607920-5608235)
chr3 (3-343)||(22386150-22386490)
chr3 (29-344)||(11108947-11109262)
chr3 (29-344)||(5594955-5595270)
chr3 (29-344)||(4345285-4345600)
chr3 (29-344)||(5015057-5015372)
chr3 (29-344)||(18244084-18244399)
chr3 (81-343)||(35882112-35882374)
chr3 (3-344)||(18290925-18291266)
chr3 (3-344)||(18306226-18306567)
chr3 (3-343)||(4722977-4723317)
chr3 (3-343)||(15739666-15740006)
chr3 (3-343)||(29147327-29147667)
chr3 (29-344)||(31963071-31963386)
chr3 (29-344)||(4418264-4418579)
chr3 (29-312)||(5468362-5468645)
chr3 (29-343)||(22869454-22869768)
chr3 (29-343)||(22884513-22884827)
chr3 (81-344)||(48467272-48467535)
chr3 (166-343)||(8288206-8288383)
chr3 (3-344)||(18275624-18275965)
chr3 (3-344)||(32440499-32440840)
chr3 (81-328)||(4795303-4795550)
chr3 (29-344)||(10644415-10644730)
chr3 (29-344)||(17983554-17983869)
chr3 (29-344)||(24329504-24329819)
chr3 (29-344)||(51783368-51783683)
chr3 (29-344)||(8213083-8213398)
chr3 (21-320)||(18331997-18332296)
chr3 (29-344)||(21676038-21676353)
chr3 (29-344)||(6541060-6541375)
chr3 (29-313)||(7997938-7998222)
chr3 (29-344)||(47024798-47025113)
chr3 (30-343)||(28022621-28022934)
chr3 (1-58)||(5652860-5652917)
chr3 (231-344)||(20441462-20441575)
chr3 (231-344)||(41438588-41438701)
chr3 (3-58)||(4626417-4626472)
chr3 (3-58)||(5713700-5713755)
chr3 (3-58)||(5724610-5724665)
chr3 (3-58)||(5767703-5767758)
chr3 (244-307)||(7090873-7090936)
chr3 (3-58)||(17993514-17993569)
chr3 (33-102)||(28340766-28340835)
chr3 (29-102)||(36995798-36995871)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-343)||(22889863-22890205)
chr5 (1-339)||(25200427-25200765)
chr5 (1-235)||(25264686-25264920)
chr5 (3-343)||(23893600-23893940)
chr5 (3-344)||(15657188-15657529)
chr5 (29-344)||(40472003-40472318)
chr5 (3-344)||(41676102-41676443)
chr5 (4-344)||(9318844-9319184)
chr5 (29-344)||(12133548-12133863)
chr5 (29-344)||(26481784-26482099)
chr5 (29-344)||(33517749-33518064)
chr5 (3-343)||(11550748-11551088)
chr5 (3-343)||(30936027-30936367)
chr5 (29-344)||(3790934-3791249)
chr5 (29-344)||(28650628-28650943)
chr5 (29-344)||(43079645-43079960)
chr5 (3-344)||(33293918-33294259)
chr5 (3-343)||(24686585-24686925)
chr5 (3-343)||(24971412-24971752)
chr5 (3-343)||(33778881-33779221)
chr5 (29-344)||(24682833-24683148)
chr5 (29-344)||(24725360-24725675)
chr5 (29-344)||(15757311-15757626)
chr5 (3-343)||(23750878-23751218)
chr5 (29-344)||(18499184-18499499)
chr5 (29-344)||(37669937-37670252)
chr5 (29-344)||(13323283-13323598)
chr5 (3-343)||(22997542-22997882)
chr5 (3-343)||(23716416-23716756)
chr5 (29-344)||(28958240-28958555)
chr5 (29-344)||(37357097-37357412)
chr5 (4-344)||(8663904-8664244)
chr5 (29-344)||(30030808-30031123)
chr5 (29-344)||(30153411-30153726)
chr5 (29-344)||(30169862-30170177)
chr5 (29-344)||(37756373-37756688)
chr5 (3-344)||(18125823-18126164)
chr5 (29-344)||(6875698-6876013)
chr5 (29-344)||(31824861-31825176)
chr5 (29-344)||(34617911-34618226)
chr5 (29-313)||(37769441-37769725)
chr5 (29-343)||(31432834-31433148)
chr5 (29-344)||(2512444-2512759)
chr5 (3-58)||(13440080-13440135)
chr5 (29-102)||(18373989-18374062)
chr5 (3-58)||(9548129-9548184)
chr5 (3-58)||(11326315-11326370)
chr5 (3-58)||(13184235-13184290)
chr5 (231-306)||(34467047-34467122)
chr5 (29-102)||(5639422-5639495)
chr5 (29-102)||(32594728-32594801)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (3-343)||(16206562-16206902)
chr1 (157-343)||(20462469-20462655)
chr1 (29-344)||(10964053-10964368)
chr1 (29-344)||(51639601-51639916)
chr1 (29-344)||(28586364-28586679)
chr1 (29-344)||(41791865-41792180)
chr1 (29-344)||(10946462-10946777)
chr1 (1-52)||(20462656-20462707)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-343)||(16042709-16043051)
chr7 (1-343)||(16448413-16448755)
chr7 (29-344)||(5145783-5146098)
chr7 (3-343)||(5129378-5129718)
chr7 (29-344)||(26318312-26318627)
chr7 (29-344)||(26436642-26436957)
chr7 (29-344)||(26536313-26536628)
chr7 (3-343)||(5160905-5161245)
chr7 (31-343)||(10915313-10915625)
chr7 (29-344)||(26514166-26514481)
chr7 (29-344)||(31126305-31126620)
chr7 (81-343)||(11423272-11423534)
chr7 (3-328)||(16501818-16502143)
chr7 (29-344)||(31562833-31563148)
chr7 (21-343)||(2155959-2156281)
chr7 (29-344)||(3446691-3447006)
chr7 (29-344)||(9620036-9620351)
chr7 (81-328)||(16516932-16517179)
chr7 (29-344)||(11442264-11442579)
chr7 (29-344)||(26273537-26273852)
chr7 (29-344)||(16734903-16735218)
chr7 (29-344)||(16749957-16750272)
chr7 (29-344)||(17524917-17525232)
chr7 (29-344)||(17527983-17528298)
chr7 (29-344)||(24590984-24591299)
chr7 (29-312)||(26668357-26668640)
chr7 (237-344)||(18542184-18542291)
chr7 (29-160)||(45388789-45388920)
chr7 (1-58)||(2108578-2108635)
chr7 (231-306)||(800159-800234)
chr7 (3-58)||(31088039-31088094)
chr7 (3-58)||(45733973-45734028)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-343)||(22079390-22079732)
chr8 (3-343)||(16284834-16285174)
chr8 (3-343)||(27607395-27607735)
chr8 (3-343)||(18792092-18792432)
chr8 (29-344)||(19675825-19676140)
chr8 (29-343)||(19206876-19207190)
chr8 (3-328)||(19689498-19689823)
chr8 (29-344)||(9356007-9356322)
chr8 (21-343)||(14559009-14559331)
chr8 (4-344)||(3327998-3328338)
chr8 (3-343)||(16278939-16279278)
chr8 (3-343)||(2135749-2136089)
chr8 (29-344)||(12091240-12091555)
chr8 (29-343)||(29830707-29831021)
chr8 (29-344)||(28360471-28360786)
chr8 (29-344)||(31355909-31356224)
chr8 (81-344)||(33260107-33260370)
chr8 (29-160)||(31488389-31488520)
chr8 (1-58)||(33245177-33245234)
chr8 (1-58)||(19658686-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (17-343)||(17090934-17091260)
chr6 (29-343)||(27628206-27628520)
chr6 (29-344)||(16675520-16675835)
chr6 (3-344)||(29550856-29551197)
chr6 (29-344)||(3697462-3697777)
chr6 (29-344)||(26776110-26776425)
chr6 (3-343)||(22933354-22933694)
chr6 (3-343)||(23855799-23856139)
chr6 (3-343)||(24303092-24303432)
chr6 (27-343)||(27271078-27271394)
chr6 (237-343)||(20162073-20162179)
chr6 (237-343)||(22170652-22170758)
chr6 (3-343)||(15422791-15423131)
chr6 (29-344)||(29502796-29503111)
chr6 (29-344)||(27045769-27046084)
chr6 (3-343)||(27020520-27020861)
chr6 (3-343)||(13297425-13297765)
chr6 (3-343)||(24865099-24865439)
chr6 (29-344)||(26114910-26115225)
chr6 (3-343)||(26919762-26920102)
chr6 (29-344)||(27486510-27486825)
chr6 (29-344)||(28208835-28209150)
chr6 (4-165)||(20162176-20162337)
chr6 (4-165)||(22170494-22170655)
chr6 (3-343)||(16751236-16751576)
chr6 (29-344)||(27009111-27009426)
chr6 (29-344)||(30556516-30556831)
chr6 (29-344)||(4759145-4759460)
chr6 (4-343)||(27288845-27289184)
chr6 (29-344)||(4544275-4544590)
chr6 (29-344)||(4526667-4526982)
chr6 (29-344)||(16942527-16942842)
chr6 (150-343)||(26990271-26990464)
chr6 (29-344)||(4722634-4722949)
chr6 (29-344)||(29574394-29574709)
chr6 (3-235)||(34913563-34913795)
chr6 (3-58)||(8891943-8891998)
chr6 (3-58)||(8903178-8903233)
chr6 (3-58)||(28163166-28163221)
chr6 (3-58)||(33373888-33373943)
chr6 (29-102)||(4774506-4774579)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (29-344)||(997-1312)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (29-343)||(5794-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (21-343)||(31838-32160)
scaffold0124 (1-88)||(46145-46232)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-343)||(31142-31482)
scaffold0089 (3-343)||(38600-38940)
scaffold0089 (3-328)||(45516-45841)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (29-344)||(10950-11265)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (29-344)||(9333-9648)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (26-328)||(28693-28995)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (29-344)||(7399-7714)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (29-344)||(13487-13802)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (29-344)||(24758-25073)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-58)||(22073-22130)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-58)||(119585-119642)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (29-222)||(27711-27904)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (29-102)||(7746-7819)
scaffold0159 (29-102)||(21299-21372)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15229611 - 15229269
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229611 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 15229512  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229511 agtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 15229412  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15229411 aaatatgcctcttctccatggactgtaacaagttttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatcc 15229312  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229311 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 15229269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1901999 - 1901657
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901999 tgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 1901900  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901899 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 1901800  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1901799 aaatatgcctcctctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttcttatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatcc 1901700  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901699 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 1901657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 15283457 - 15283799
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15283457 tgtgcttattcccgcggagttgtattaacttgccctagccgacagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagcccc 15283556  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283557 agccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 15283656  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15283657 aaatatgtctcttctccatggattgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtgtcc 15283756  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283757 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 15283799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 15389907 - 15390249
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||  ||    
T  15389907 tgtgcttattcttaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttcttggacagccctctgagcatccttcaaagaggccatagcagctcc 15390006  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15390007 agccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgatagctggctaacc 15390106  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15390107 aaatatgcctcctctccatggattgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcactgccccagcgtcatgtatcc 15390206  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15390207 acggtctttctaggagacagctataagaggcattgatgtccat 15390249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6571567 - 6571252
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  6571567 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 6571468  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||    
T  6571467 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaa 6571368  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  6571367 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 6571268  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  6571267 tgcattaatgtccatc 6571252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 34187491 - 34187832
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  34187491 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 34187590  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  34187591 ccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcagtcccctctgcagaccctgcttctatgcaggagaaagatgatagctggctaaccag 34187690  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  34187691 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 34187790  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  34187791 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 34187832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5007587 - 5007272
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| |||||     
T  5007587 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatg 5007488  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| || ||||    
T  5007487 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttccccatgaacggtaa 5007388  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  5007387 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 5007288  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  5007287 tgcattaatgtccatc 5007272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 31125075 - 31125390
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  31125075 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 31125174  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  31125175 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 31125274  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  31125275 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 31125374  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  31125375 tgcattaatgtccatc 31125390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 24590904 - 24591226
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  24590904 tgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtac 24591003  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  24591004 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 24591103  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24591104 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccaaggtctccccaagagacag 24591203  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  24591204 ctgtaagaggcattaatgtccat 24591226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 344
Target Start/End: Original strand, 36343064 - 36343387
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  36343064 tgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtac 36343163  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  36343164 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaagtatgcttcctctccatg 36343263  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  36343264 aatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaa 36343363  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    || || || ||||| |||||||||    
T  36343364 ctgtaggatgcattaatgtccatc 36343387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 18799170 - 18799485
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18799170 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18799269  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || ||  |||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18799270 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccccgcttcaatacaagaaaaggacaacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18799369  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  18799370 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 18799469  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  18799470 tgcattaatgtccatc 18799485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39852352 - 39852037
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  39852352 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 39852253  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| || || || ||||    
T  39852252 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccgtgaacggtaa 39852153  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39852152 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 39852053  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  39852052 tgcattaatgtccatc 39852037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14666758 - 14666433
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  14666758 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccatccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttcca- 14666660  T
Q  103 tct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacca 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14666659 tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaacca 14666560  T
Q  202 aatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcca 301  Q
      |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  14666559 ggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggttaccgctcccgcgtcatgtatcca 14666460  T
Q  302 tggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14666459 tggtctccccaagagacagctgtaaga 14666433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30755468 - 30755153
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  30755468 cttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 30755369  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  30755368 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 30755269  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  30755268 cgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 30755169  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  30755168 tgcattaatgtccatc 30755153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 33672355 - 33672670
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  33672355 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 33672454  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  33672455 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 33672554  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  33672555 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 33672654  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  33672655 tgcattaatgtccatc 33672670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54835101 - 54834786
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  54835101 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 54835002  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
     |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  54835001 atcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 54834902  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  54834901 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 54834802  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  54834801 tgcattaatgtccatc 54834786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14100255 - 14099940
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  14100255 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaaagaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 14100157  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  14100156 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 14100057  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  14100056 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 14099957  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  14099956 atgcattaatgtccatc 14099940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 40104195 - 40104510
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||   ||| | |||||||||     
T  40104195 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttagactctgcaccttcaatg 40104294  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40104295 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 40104394  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  40104395 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 40104494  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  40104495 tgcattaatgtccatc 40104510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 14761835 - 14762176
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  14761835 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 14761934  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14761935 ccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 14762034  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  |  |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  14762035 gtatgccttctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 14762134  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  14762135 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 14762176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21971415 - 21971100
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  21971415 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 21971317  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  21971316 ggtcaaaccctggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 21971217  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |    
T  21971216 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccatggtcttcccagcaggcaactgtagg 21971117  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  21971116 atgcattaatgtccatc 21971100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 27161873 - 27162188
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  27161873 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 27161971  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  27161972 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 27162071  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  27162072 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 27162171  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  27162172 atgcattaatgtccatc 27162188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24114402 - 24114062
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  24114402 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 24114303  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24114302 cccttttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 24114203  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||||||     
T  24114202 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccac 24114103  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  24114102 ggtcttcccagcagacaactgtaagaggcattaatatccat 24114062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17014783 - 17014551
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  17014783 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 17014684  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17014683 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 17014584  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 235  Q
     |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  17014583 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 17014551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 307
Target Start/End: Original strand, 14731187 - 14731250
Alignment:
Q  244 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 307  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14731187 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 14731250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 24460294 - 24460349
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24460294 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 24460349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 19454940 - 19455281
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19454940 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtccttcttggacagccttctaagcgtcttttaaagaagccatagcagcccc 19455039  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19455040 agccttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaaga-aaagatgacagctggctaacc 19455138  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19455139 aaatatgtctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccaacatcatgtatcc 19455238  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455239 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 19455281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 21701682 - 21702024
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701682 tgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccggccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 21701781  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21701782 agtcttcttgagctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatacaagagaaagacgacaactggctaacc 21701881  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21701882 aaatatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttaaaattctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatcc 21701981  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21701982 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 21702024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27805402 - 27805087
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  27805402 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 27805303  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  27805302 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 27805203  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  27805202 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtagggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 27805103  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  27805102 tgcattaatgtccatc 27805087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27778917 - 27778602
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||| ||||     
T  27778917 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatg 27778818  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  27778817 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 27778718  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27778717 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 27778618  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  27778617 tgcattaatgtccatc 27778602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 9348528 - 9348843
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  9348528 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 9348627  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  9348628 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 9348727  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  9348728 caagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 9348827  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  9348828 tgcattaatgtccatc 9348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12588505 - 12588190
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  12588505 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 12588406  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  12588405 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctgactgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 12588306  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  12588305 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 12588206  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  12588205 tgcattaatgtccatc 12588190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27818675 - 27818360
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||| ||||     
T  27818675 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcacctccaatg 27818576  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  27818575 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtgagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 27818476  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27818475 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 27818376  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  27818375 tgcattaatgtccatc 27818360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37376882 - 37376541
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  37376882 tgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 37376783  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37376782 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 37376683  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  37376682 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 37376583  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  37376582 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 37376541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 13935090 - 13935405
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  13935090 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 13935189  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  13935190 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaa 13935289  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  13935290 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 13935389  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  13935390 tgcattaatgtccatc 13935405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34288049 - 34287734
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  34288049 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 34287950  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  34287949 gtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 34287850  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  34287849 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 34287750  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  34287749 tgcattaatgtccatc 34287734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34293109 - 34292794
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  34293109 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 34293010  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || | ||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  34293009 gtcaaaccttggaaagtagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 34292910  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  34292909 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 34292810  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  34292809 tgcattaatgtccatc 34292794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 16827884 - 16828199
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  16827884 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 16827983  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  16827984 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 16828083  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16828084 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 16828183  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16828184 tgcattaatgtccatc 16828199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16893597 - 16893282
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  16893597 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 16893498  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  16893497 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 16893398  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16893397 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 16893298  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16893297 tgcattaatgtccatc 16893282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32051493 - 32051178
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  32051493 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 32051394  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  32051393 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 32051294  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  32051293 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 32051194  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  32051193 tgcattaatgtccatc 32051178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 39050368 - 39050683
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  | || | ||||||||||    
T  39050368 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggttctgcaccttcaata 39050467  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  39050468 gtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtaa 39050567  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    |||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  39050568 caagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 39050667  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  39050668 tgcattaatgtccatc 39050683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40235206 - 40234891
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  40235206 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 40235107  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | || |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40235106 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 40235007  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  40235006 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 40234907  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  40234906 tgcattaatgtccatc 40234891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 259299 - 259614
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  259299 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 259398  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  259399 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 259498  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  259499 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 259598  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  259599 tgcattaatgtccatc 259614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 11633731 - 11634046
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||  |||||| |||||||||     
T  11633731 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttttttaggctccgcaccttcaatg 11633830  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||| || ||||    
T  11633831 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaacggtaa 11633930  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  11633931 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 11634030  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  11634031 tgcattaatgtccatc 11634046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 12715148 - 12715463
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  12715148 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 12715247  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12715248 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 12715347  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12715348 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 12715447  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  12715448 tgcattaatgtccatc 12715463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Original strand, 19415020 - 19415329
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || |||||||||||||||| |||||     
T  19415020 gcttgttctcacagagctgtattaccttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaaagaagccatagcagccccag- 19415118  T
Q  104 cttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
    |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||    
T  19415119 cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaa 19415218  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| ||||||||     
T  19415219 gtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccac 19415318  T
Q  303 ggtcttcccag 313  Q
    |||||||||||    
T  19415319 ggtcttcccag 19415329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28883935 - 28883610
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  28883935 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 28883836  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  28883835 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctagccag 28883736  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || |||||||||||     
T  28883735 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccaa 28883636  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28883635 ggtctacccaagagacagctgtaaga 28883610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 23127104 - 23127426
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||    
T  23127104 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagtcccatccctcttgggctccgtac 23127203  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  23127204 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagatcctgcccctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatg 23127303  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23127304 tatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacag 23127403  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  23127404 ctgtaagaggcattaatatccat 23127426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31877976 - 31877661
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  31877976 cttgccccagccgacagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 31877877  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||    
T  31877876 gtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaa 31877777  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  31877776 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 31877677  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  31877676 tgcattaatgtccatc 31877661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Original strand, 21675703 - 21676043
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||     
T  21675703 gcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag- 21675801  T
Q  104 cttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
    |||||| || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || ||    
T  21675802 cttctttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaa 21675901  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| ||||||||     
T  21675902 gtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccac 21676001  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  21676002 ggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 21676043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 27432964 - 27433304
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  27432964 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 27433063  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27433064 cccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 27433163  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  ||| |||| || || |  || ||||||||||||    
T  27433164 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaaaggtcaccgctctcgcgtcatgtatccat 27433263  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27433264 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27433304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12657263 - 12656923
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  12657263 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 12657164  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||| || ||||| | ||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12657163 cccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaggcggtcccctctgtagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 12657064  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || | |||||||||     
T  12657063 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgttatgtatccac 12656964  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  12656963 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 12656923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20839622 - 20839390
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| |||||||||     
T  20839622 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagtcccat 20839523  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20839522 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 20839423  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 235  Q
     |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  20839422 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 20839390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39891769 - 39891454
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || ||||||    
T  39891769 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaat 39891671  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
      |||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  39891670 gatcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 39891571  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  39891570 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 39891471  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  39891470 atgcattaatgtccatc 39891454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34863375 - 34863092
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  34863375 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 34863276  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||    
T  34863275 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaa 34863176  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 312  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34863175 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 34863092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 37949868 - 37950183
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |  ||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||| |  |||||  |||| | | |||||||     
T  37949868 cttgccccagccggcagtctgaccctcctggatggctctctgagcatctttcaatgaagccacagcagccccggctttcttaggctctgcatcttcaatg 37949967  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  37949968 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 37950067  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  37950068 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 37950167  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  37950168 tgcattaatgtccatc 37950183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 34302979 - 34303036
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34302979 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttaccccagccggcagcctgtccttcttg 34303036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 11640117 - 11640236
Alignment:
Q  225 gtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctat 324  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || |  || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11640117 gtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaagtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgt 11640216  T
Q  325 aagaagcattgatgtccatc 344  Q
    | || ||||| |||||||||    
T  11640217 aggatgcattaatgtccatc 11640236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3785217 - 3785162
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3785217 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 3785162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27119251 - 27119196
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27119251 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 27119196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 31891006 - 31891061
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31891006 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31891061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34157573 - 34157518
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34157573 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 34157518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 37927065 - 37926992
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  37927065 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 37926992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16625171 - 16625513
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16625171 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttggacagccttctgagcgtcttttaaagaagccacagcagcccc 16625270  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625271 agccttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 16625370  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625371 aaatatgcctcttatccatggactataacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 16625470  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16625471 atggtcttcccaggatacagctataagaagcattgatgtccat 16625513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18532076 - 18531734
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  18532076 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagatgccatggcagcccc 18531977  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531976 agtcttcttaggctccataccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcggtagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 18531877  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18531876 aaatatgtctcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatcc 18531777  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531776 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 18531734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 20575445 - 20575760
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  20575445 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 20575544  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20575545 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 20575644  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  20575645 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 20575744  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  20575745 tgcattaatgtccatc 20575760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 29663568 - 29663883
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  29663568 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 29663667  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  29663668 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaacggtaa 29663767  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    |||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  29663768 caagcttttcattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 29663867  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  29663868 tgcattaatgtccatc 29663883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8297658 - 8297318
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  8297658 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttcca- 8297560  T
Q  103 tct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacca 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8297559 tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaacca 8297460  T
Q  202 aatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcca 301  Q
      |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || |||||||||||    
T  8297459 ggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatcca 8297360  T
Q  302 tggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8297359 tggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 8297318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18226851 - 18226536
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  18226851 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 18226752  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  18226751 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 18226652  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  18226651 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 18226552  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  18226551 tgcattaatgtccatc 18226536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 28114552 - 28114867
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| |||||     
T  28114552 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaatg 28114651  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| || ||||    
T  28114652 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaacggtaa 28114751  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28114752 caagctttccattcctctcaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 28114851  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  28114852 tgcattaatgtccatc 28114867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7074898 - 7074557
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  7074898 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 7074799  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  7074798 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgacagctgactaaccag 7074699  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  7074698 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 7074599  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  7074598 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 7074557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18052948 - 18052623
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  18052948 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttcaaagaagccattgcagttccat 18052849  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18052848 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 18052749  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||||||     
T  18052748 atatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccac 18052649  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18052648 ggtctccccaggagacagctgtaaga 18052623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20067729 - 20067388
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  20067729 tgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccggccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 20067630  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20067629 ccctcttgggctccgtaccttcgagagttaaaccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 20067530  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  20067529 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 20067430  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  20067429 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 20067388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 15891278 - 15891618
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  15891278 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 15891377  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     ||| ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15891378 cctttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 15891477  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  15891478 atatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 15891577  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15891578 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15891618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10397741 - 10397478
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | ||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  10397741 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaga 10397642  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  10397641 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttac 10397542  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  10397541 cgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 10397478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6193983 - 6193661
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  6193983 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagccatagcagttccatccctcttgggctccgtac 6193884  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    ||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  6193883 cttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 6193784  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6193783 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccacggtcttcccaagagacag 6193684  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  6193683 ctgtaagaggcattaatatccat 6193661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 5607920 - 5608235
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | |||||||||    
T  5607920 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttctttagactctgcaccttcaat 5608018  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  5608019 ggtcagaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 5608118  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  5608119 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 5608218  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  5608219 atgcattaatgtccatc 5608235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 22386150 - 22386490
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| |  || |||||||||||||| ||||| |||     
T  22386150 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgtatcctttaaagaagccatcgcagttccat 22386249  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22386250 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 22386349  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  22386350 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcatcgtgtatccat 22386449  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22386450 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22386490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 11108947 - 11109262
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  11108947 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 11109046  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  11109047 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 11109146  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  11109147 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 11109246  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  11109247 tgcattaatgtccatc 11109262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 5594955 - 5595270
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  5594955 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 5595053  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  5595054 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 5595153  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  5595154 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccatggtcttcccagcagacaactgtagg 5595253  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  5595254 atgcattaatgtccatc 5595270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 4345285 - 4345600
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  4345285 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcgtctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 4345384  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    || |  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  4345385 gttaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 4345484  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||| ||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  4345485 cgagttttccatgcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 4345584  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     || ||||||||||||    
T  4345585 tgcgttgatgtccatc 4345600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5015372 - 5015057
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  5015372 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 5015273  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||    
T  5015272 gtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaa 5015173  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  5015172 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 5015073  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  5015072 tgcattaatgtccatc 5015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18244399 - 18244084
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  18244399 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 18244300  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18244299 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 18244200  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  18244199 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 18244100  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  18244099 tgcattaatgtccatc 18244084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35882374 - 35882112
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  35882374 aaagaagccattgcagtcccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 35882275  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  35882274 aagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 35882175  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  35882174 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 35882112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 18290925 - 18291266
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  18290925 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 18291024  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18291025 ccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 18291124  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  18291125 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 18291224  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18291225 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18291266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 18306226 - 18306567
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  18306226 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 18306325  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18306326 ccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 18306425  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  18306426 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 18306525  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18306526 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18306567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4723317 - 4722977
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  4723317 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 4723218  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||  |||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4723217 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctacagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 4723118  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || ||||||||||||||     
T  4723117 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcatcatgtatccac 4723018  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  4723017 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 4722977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 15739666 - 15740006
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  15739666 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 15739765  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15739766 ccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 15739865  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||    
T  15739866 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 15739965  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15739966 ggtctccctaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 29147327 - 29147667
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||   || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  29147327 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcaacttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 29147426  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | |||||  |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  29147427 ccctcttggactccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccccgcctctatgcaagagaaagatgatagttggctaaccag 29147526  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  29147527 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 29147626  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29147627 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatgtccat 29147667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 31963071 - 31963386
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  31963071 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 31963169  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  31963170 ggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 31963269  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  31963270 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 31963369  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  31963370 atgcattaatgtccatc 31963386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4418579 - 4418264
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  4418579 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 4418480  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  4418479 gtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatgaatggtaa 4418380  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| || ||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  4418379 caagctttcccttccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 4418280  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  4418279 tgcattaatgtccatc 4418264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5468645 - 5468362
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||||||      
T  5468645 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaacg 5468546  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  5468545 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 5468446  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 312  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5468445 cgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 5468362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 22869454 - 22869768
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  22869454 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 22869552  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  22869553 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 22869652  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  22869653 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 22869752  T
Q  328 aagcattgatgtccat 343  Q
    | ||||| ||||||||    
T  22869753 atgcattaatgtccat 22869768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 22884513 - 22884827
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  22884513 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 22884611  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  22884612 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 22884711  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  22884712 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 22884811  T
Q  328 aagcattgatgtccat 343  Q
    | ||||| ||||||||    
T  22884812 atgcattaatgtccat 22884827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48467535 - 48467272
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  48467535 aaagaagccatagcagtcccagctttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 48467436  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    | || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  48467435 aggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtgacgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 48467336  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  48467335 cgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 48467272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 343
Target Start/End: Original strand, 8288206 - 8288383
Alignment:
Q  166 cttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtg 265  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||    
T  8288206 cttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtg 8288305  T
Q  266 cagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||  |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  8288306 caaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 8288383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 18275624 - 18275965
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  18275624 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgctccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 18275723  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     ||||||  | ||||| ||||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18275724 ccttcttaggttccgttccttcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 18275823  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  18275824 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 18275923  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18275924 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18275965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32440840 - 32440499
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  32440840 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 32440741  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  32440740 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 32440641  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||  | || ||||| ||||||||     
T  32440640 gtatgcctcttctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccacacccgcatcgtgtatccac 32440541  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  32440540 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 32440499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 4795303 - 4795550
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  4795303 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 4795402  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  4795403 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 4795502  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
     || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4795503 cgctcctgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaaga 4795550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10644730 - 10644415
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  10644730 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 10644632  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  10644631 ggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 10644532  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| || || || || |    
T  10644531 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacgatcttcccagcaggcaactgtagg 10644432  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  10644431 atgcattaatgtccatc 10644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 17983554 - 17983869
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  17983554 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 17983652  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  17983653 ggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 17983752  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  17983753 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 17983852  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  17983853 atgcattaatgtccatc 17983869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24329819 - 24329504
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  24329819 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 24329721  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  24329720 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 24329621  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  24329620 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 24329521  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  24329520 atgcattaatgtccatc 24329504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51783683 - 51783368
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  51783683 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 51783585  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  51783584 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 51783485  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  51783484 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 51783385  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  51783384 atgcattaatgtccatc 51783368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8213398 - 8213083
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||  |||||  |||| | || ||||||     
T  8213398 cttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagccatagcagctccagctttcttaggctctgcactttcaatg 8213299  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  8213298 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 8213199  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  8213198 cgagttttccattcgtcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 8213099  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  8213098 tgcattaatgtccatc 8213083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18332296 - 18331997
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||| ||| ||||| |||  | ||||| |||||||||    
T  18332296 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagtcattgcagttccatccctcttgggctccgtac 18332197  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| |    
T  18332196 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccacg 18332097  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||  || || || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18332096 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgttcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacag 18331997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21676353 - 21676038
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | |||||||     
T  21676353 cttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatccttcaaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatg 21676254  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  21676253 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 21676154  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | |  || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  21676153 cgatttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 21676054  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  21676053 tgcattaatgtccatc 21676038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 6541060 - 6541375
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || ||||||    
T  6541060 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgaacatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaat 6541158  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  6541159 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 6541258  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  6541259 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 6541358  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  6541359 atgcattaatgtccatc 6541375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7998222 - 7997938
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  7998222 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcggccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 7998124  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| ||||    
T  7998123 ggtcaaaccttggaacgcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgta 7998024  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 313  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7998023 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 7997938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47025113 - 47024798
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | || ||||||    
T  47025113 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcactttcaat 47025015  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  47025014 ggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 47024915  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| || || || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  47024914 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttttgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtagg 47024815  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  47024814 atgcattaatgtccatc 47024798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28022934 - 28022621
Alignment:
Q  30 ttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaata 128  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | | |||||||     
T  28022934 ttgccccagccggcggtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcatcttcaatg 28022836  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||| ||| |||||    
T  28022835 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccacggattgtaa 28022736  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28022735 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 28022636  T
Q  329 agcattgatgtccat 343  Q
     ||||| ||||||||    
T  28022635 cgcattaatgtccat 28022621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5652917 - 5652860
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5652917 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5652860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20441575 - 20441462
Alignment:
Q  231 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaag 330  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||  || || |||||||| || || |    
T  20441575 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtcggcctagtagacagctgtaggatg 20441476  T
Q  331 cattgatgtccatc 344  Q
    | | ||||||||||    
T  20441475 cttggatgtccatc 20441462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41438701 - 41438588
Alignment:
Q  231 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaag 330  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||  || || |||||||| || || |    
T  41438701 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtcggcctagtagacagctgtaggatg 41438602  T
Q  331 cattgatgtccatc 344  Q
    | | ||||||||||    
T  41438601 cttggatgtccatc 41438588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 4626472 - 4626417
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4626472 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 4626417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5713755 - 5713700
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5713755 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5713700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5724665 - 5724610
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5724665 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5724610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 5767703 - 5767758
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5767703 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 5767758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 307
Target Start/End: Original strand, 7090873 - 7090936
Alignment:
Q  244 ttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtct 307  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7090873 ttacaaacttcaatttctgatggagagtagatgtcactgccccagcgtcatgaatccatggtct 7090936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 17993514 - 17993569
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17993514 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 17993569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28340835 - 28340766
Alignment:
Q  33 ccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  28340835 ccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 28340766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 36995798 - 36995871
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  36995798 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 36995871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22890205 - 22889863
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890205 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccgacagcttgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 22890106  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  22890105 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggtagttccttcagcagatcctgcttcaatgcaggagaaagacgatagctggctaacc 22890006  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22890005 aaatatgcttcttctccatggattgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcaccagcatcgtgtatcc 22889906  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889905 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 22889863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25200765 - 25200427
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25200765 tgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagccatagcagtccc 25200666  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25200665 agtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgatagctggctaacc 25200566  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25200565 aaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatcc 25200466  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25200465 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgt 25200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25264920 - 25264686
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25264920 tgtgcttattctcacggagttggattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaatagccttctgagcgtctttaaaagaagccatagcagtccc 25264821  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25264820 agtcttcttaggttccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaggagaaagacgatagctggctaacc 25264721  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25264720 aaatatgcttcttctccatggactgtaacaagctt 25264686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23893940 - 23893600
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |  || |||||||| || ||| | || || || || ||||||||||||||||  | |     
T  23893940 tgcttgttctcacggagttgtattaatctgccccagccggcggcttgaccttcttggacggccctatgtgcatccttcaaagaagccatagcagctcaat 23893841  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23893840 cccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 23893741  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| | |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||     
T  23893740 gtatgcttcctctccatgaattgtaacgagctttccactctttgcaaactttaacttctggtgcagggtagaggtcaccgccccagcgtcatgtatccac 23893641  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23893640 ggtcttcctaagagacagctataagaggcattgatgtccat 23893600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 15657188 - 15657529
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  15657188 tgcttattctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 15657287  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15657288 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 15657387  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |  |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  15657388 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccacttcttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 15657487  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  15657488 ggtcttcccagcagacaactgtaagatgcattaatgtccatc 15657529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 40472003 - 40472318
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  40472003 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcggccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 40472102  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  40472103 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 40472202  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| || ||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||    
T  40472203 caagctttccgttccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaaacaactgtagga 40472302  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  40472303 tgcattaatgtccatc 40472318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41676443 - 41676102
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  41676443 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 41676344  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | |||||  |||||||| ||||| ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41676343 ccctcttggactccgtacattcaacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctgaccaa 41676244  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  41676243 gtatgcttcttctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 41676144  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  41676143 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 41676102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9319184 - 9318844
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||     
T  9319184 gcttgttctcacagagctgtaccaccttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagc 9319085  T
Q  104 cttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaa 203  Q
     |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||     
T  9319084 tttcttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaag 9318985  T
Q  204 tatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatg 303  Q
    ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  9318984 tatgcctcttcaccatgaatggtaacaagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacg 9318885  T
Q  304 gtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  9318884 gtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 9318844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12133863 - 12133548
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  12133863 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 12133764  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  12133763 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 12133664  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  12133663 caagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 12133564  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  12133563 tgcattaatgtccatc 12133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26482099 - 26481784
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||     
T  26482099 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatg 26482000  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  26481999 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 26481900  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  26481899 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 26481800  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26481799 tgcattaatgtccatc 26481784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33518064 - 33517749
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||     
T  33518064 cttgccccaaccggcagtctgaccgtcctgaataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagtcccagctttcttaggctccgcaccttcaatg 33517965  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  33517964 gtcaatccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctaactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 33517865  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  33517864 caagctttccattccttatgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 33517765  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  33517764 tgcattaatgtccatc 33517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11551088 - 11550748
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| |||     
T  11551088 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaggccatggcagttccat 11550989  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11550988 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 11550889  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  11550888 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaacttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 11550789  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11550788 ggtctccccacgagacagctgtaagaggcattaatatccat 11550748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30936367 - 30936027
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  30936367 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 30936268  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30936267 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 30936168  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  30936167 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 30936068  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  30936067 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 30936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3791249 - 3790934
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | ||||| |||| ||||| || |||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||| |||||     
T  3791249 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttccgagcatctttcaatgaagtcatagcaaccccagctttcttaggctctgcaccctcaatg 3791150  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  3791149 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaatggtaa 3791050  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  3791049 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 3790950  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  3790949 tgcattaatgtccatc 3790934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28650943 - 28650628
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  28650943 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatg 28650844  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28650843 gtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 28650744  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28650743 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 28650644  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  28650643 tgcattaatgtccatc 28650628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43079960 - 43079645
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  43079960 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttggctctgcaccttcaatg 43079861  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  43079860 gtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctaactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 43079761  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  43079760 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtgaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 43079661  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  43079660 tgcattaatgtccatc 43079645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33294259 - 33293918
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  33294259 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 33294160  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33294159 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 33294060  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  33294059 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 33293960  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| | |||||||    
T  33293959 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaacgtccatc 33293918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 24686585 - 24686925
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||  || || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  24686585 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatctttcaaagaagccattgcagttccat 24686684  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24686685 ccctcttgggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttatatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 24686784  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || | ||||||||||    
T  24686785 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgttatgtatccat 24686884  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24686885 ggtctccccaggagacagctgtaagaggcattaatatccat 24686925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24971752 - 24971412
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  24971752 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 24971653  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  24971652 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaaaaagatgatagctggctaaccag 24971553  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  24971552 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 24971453  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24971452 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24971412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33779221 - 33778881
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  33779221 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 33779122  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||     
T  33779121 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagacgatagctggctaaccag 33779022  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  33779021 gtatgcttcctctccatgaatagtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 33778922  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  33778921 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 33778881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24683148 - 24682833
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  24683148 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 24683049  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24683048 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 24682949  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24682948 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 24682849  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  24682848 tgcattaatgtccatc 24682833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24725675 - 24725360
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  24725675 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 24725576  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24725575 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 24725476  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24725475 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 24725376  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  24725375 tgcattaatgtccatc 24725360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 15757311 - 15757626
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  15757311 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 15757409  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  15757410 ggtcaaaccttggaaagcagttccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 15757509  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  15757510 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 15757609  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  15757610 atgcattaatgtccatc 15757626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 23750878 - 23751218
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  23750878 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 23750977  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23750978 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 23751077  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||||||     
T  23751078 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccaa 23751177  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23751178 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23751218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 18499184 - 18499499
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| |||||||  || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | |||||||     
T  18499184 cttgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctttctgtgcatctttcaaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatg 18499283  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||    
T  18499284 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaa 18499383  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  18499384 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 18499483  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  18499484 tgcattaatgtccatc 18499499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 37669937 - 37670252
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  37669937 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 37670036  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  37670037 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 37670136  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  37670137 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 37670236  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  37670237 tgcattaatgtccatc 37670252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 13323283 - 13323598
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  13323283 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 13323381  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  13323382 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 13323481  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  13323482 acgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 13323581  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  13323582 atgcattaatgtccatc 13323598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 22997542 - 22997882
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| |||     
T  22997542 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaggccattgcagttccat 22997641  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| |||||||||||||   ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22997642 ccctcttgggctccgtaccttcggcagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 22997741  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  22997742 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 22997841  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22997842 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22997882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 23716416 - 23716756
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  23716416 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 23716515  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||  |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23716516 cccttttaggctccgtaccttcgacagctaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 23716615  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||    
T  23716616 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 23716715  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23716716 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23716756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 28958240 - 28958555
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | |||||||     
T  28958240 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatg 28958339  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||  |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28958340 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcctcaacacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 28958439  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28958440 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 28958539  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  28958540 tgcattaatgtccatc 28958555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 37357097 - 37357412
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  37357097 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 37357196  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  37357197 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 37357296  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  37357297 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 37357396  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  37357397 tgcattaatgtccatc 37357412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Original strand, 8663904 - 8664244
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||      
T  8663904 gcttgttctcgcagagctgtatcaccttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatcctttaatgaagccatagcagccccaa- 8664002  T
Q  104 cttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
    |||| | || ||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || ||    
T  8664003 cttccttagactctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaa 8664102  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| ||||||||     
T  8664103 gtatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccac 8664202  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  8664203 ggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 8664244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30031123 - 30030808
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  30031123 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatcctttaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 30031025  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  30031024 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 30030925  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  30030924 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 30030825  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  30030824 atgcattaatgtccatc 30030808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30153726 - 30153411
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  30153726 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 30153628  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  30153627 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 30153528  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  30153527 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 30153428  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  30153427 atgcattaatgtccatc 30153411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30170177 - 30169862
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  30170177 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 30170078  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  30170077 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 30169978  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  30169977 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 30169878  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  30169877 tgcattaatgtccatc 30169862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37756688 - 37756373
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  37756688 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 37756589  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  37756588 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 37756489  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  37756488 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtagga 37756389  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  37756388 tgcattaatgtccatc 37756373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Original strand, 18125823 - 18126164
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| || || |||     
T  18125823 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcggttccat 18125922  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||  |||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  18125923 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccctgaaaagcggtcccctctgccgaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctgaccag 18126022  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  |||| |||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  18126023 gtatgcctcttttccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccac 18126122  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  18126123 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 18126164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6876013 - 6875698
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  6876013 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 6875915  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  6875914 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 6875815  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  6875814 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 6875715  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  6875714 atgcattaatgtccatc 6875698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 31824861 - 31825176
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  31824861 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 31824959  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  31824960 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 31825059  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  31825060 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 31825159  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  31825160 atgcattaatgtccatc 31825176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34618226 - 34617911
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  34618226 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 34618128  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  34618127 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 34618028  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  34618027 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 34617928  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  34617927 atgcattaatgtccatc 34617911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 37769441 - 37769725
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  37769441 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 37769539  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  37769540 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 37769639  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccag 313  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37769640 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccag 37769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31433148 - 31432834
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  31433148 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 31433050  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || | |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  31433049 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagataactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 31432950  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  31432949 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtagg 31432850  T
Q  328 aagcattgatgtccat 343  Q
    | ||||| ||||||||    
T  31432849 atgcattaatgtccat 31432834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2512759 - 2512444
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  2512759 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 2512661  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     || |  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || | || |||||| ||||||| ||||    
T  2512660 ggttaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtgtgcttcttcaccatggattgta 2512561  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  2512560 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 2512461  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  2512460 atgcattaatgtccatc 2512444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 13440080 - 13440135
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13440080 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 13440135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 18373989 - 18374062
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  18373989 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 18374062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 9548129 - 9548184
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9548129 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 9548184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11326370 - 11326315
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11326370 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 11326315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 13184235 - 13184290
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13184235 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 13184290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34467122 - 34467047
Alignment:
Q  231 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  34467122 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 34467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5639495 - 5639422
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  5639495 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 5639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 32594728 - 32594801
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  32594728 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag 32594801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 16206562 - 16206902
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  16206562 tgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcctgaacagccttctgagcgtctttaaaagaagccatagtagccccag 16206661  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16206662 tctttttgagctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccggcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 16206761  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16206762 atatgcctcttctccatggactgtaacaagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcgtgtatccat 16206861  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16206862 ggtcttcccaagagacagctataataggcattgatgtccat 16206902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 157 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20462655 - 20462469
Alignment:
Q  157 cagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462655 cagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgcctcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaa 20462556  T
Q  257 tttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20462555 ttgttggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatatccat 20462469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10964368 - 10964053
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  10964368 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 10964270  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  10964269 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 10964170  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  10964169 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 10964070  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  10964069 atgcattaatgtccatc 10964053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51639916 - 51639601
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  51639916 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 51639818  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  51639817 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 51639718  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  51639717 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaactgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 51639618  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  51639617 atgcattaatgtccatc 51639601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28586679 - 28586364
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  28586679 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 28586580  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||    
T  28586579 gtcaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaa 28586480  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  28586479 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 28586380  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  28586379 tgcattaatgtccatc 28586364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 41791865 - 41792180
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  41791865 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 41791963  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  41791964 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagtagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 41792063  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  41792064 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 41792163  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  41792164 atgcattaatgtccatc 41792180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10946777 - 10946462
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  10946777 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 10946679  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| ||||    
T  10946678 ggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgta 10946579  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  10946578 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 10946479  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  10946478 atgcattaatgtccatc 10946462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20462707 - 20462656
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtcc 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20462707 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccatccggcagcctgtcc 20462656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16043051 - 16042709
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||    
T  16043051 tgtgcttattctcgcggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacaaccttctgagcatctttaaaagaagccatagtagcccc 16042952  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042951 agtcttcttaggctccgtaccttcaatagtcaaaccttgaaaggcagttccttcagcagatccagcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 16042852  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16042851 aaatatgcctcttctccatggaccgtaacgagctttccattcttcacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttattgcgccagcatcgtgtatcc 16042752  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16042751 atggtcttcccaggagacagctataagaagcgttgatgtccat 16042709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16448413 - 16448755
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16448413 tgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaaaccatagcagcccc 16448512  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    ||  |||||  |||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16448513 agctttcttaggctctgtaccttcaatagtcaaaccttggaaggtagtttcttcagcagatccagattcaatgctagagaaagatgacagctggctaacc 16448612  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448613 aaatatgcttcttctccatggaccgtaacaagctttccattctttacaaacttcaatttctgatgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 16448712  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448713 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 16448755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 5145783 - 5146098
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  5145783 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaacgaagccaaagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 5145882  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||| |||||||||||| || ||||    
T  5145883 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaagtatgcttcttctccatgaacggtaa 5145982  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  5145983 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 5146082  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  5146083 tgcattaatgtccatc 5146098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5129718 - 5129378
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  5129718 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 5129619  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5129618 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 5129519  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||    
T  5129518 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 5129419  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5129418 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 5129378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 26318312 - 26318627
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  26318312 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 26318411  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  26318412 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 26318511  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  26318512 caagctttcccttccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 26318611  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26318612 tgcattaatgtccatc 26318627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26436957 - 26436642
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  26436957 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 26436858  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| ||| |    
T  26436857 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtga 26436758  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  26436757 cgagttttccattcttcacaaacttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 26436658  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26436657 tgcattaatgtccatc 26436642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 26536313 - 26536628
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  26536313 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 26536412  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  26536413 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggacgacagctggctgactaagtatgcttcttcgccatggattgtaa 26536512  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  26536513 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaggtaaccgcgcccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 26536612  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26536613 tgcattaatgtccatc 26536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5161245 - 5160905
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| |  ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  5161245 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttggccctcttggatggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 5161146  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  5161145 ccctcttgggctccgtaccttcgacagtcaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgctactatgcaagagaaagatgatagctggctaatcag 5161046  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  5161045 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 5160946  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  5160945 ggtctccccaggagacagctgtaagaggcattaatatccat 5160905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 343
Target Start/End: Original strand, 10915313 - 10915625
Alignment:
Q  31 tgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagt 130  Q
    |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | |||    
T  10915313 tgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagt 10915412  T
Q  131 caggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaaca 230  Q
     |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  10915413 taatccttgaaaagcggtcccctctgcagaacctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaattgtaaca 10915512  T
Q  231 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaag 330  Q
    ||||| ||  | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  10915513 agctttccgctttttgcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagagg 10915612  T
Q  331 cattgatgtccat 343  Q
    |||| || |||||    
T  10915613 cattaatatccat 10915625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26514481 - 26514166
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  26514481 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 26514382  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  26514381 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 26514282  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  26514281 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 26514182  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26514181 tgcattaatgtccatc 26514166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31126620 - 31126305
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  31126620 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 31126521  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  31126520 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 31126421  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  31126420 cgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 31126321  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  31126320 tgcattaatgtccatc 31126305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 343
Target Start/End: Original strand, 11423272 - 11423534
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||| ||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  11423272 aaagaagccatggcagttccatccctcttgggcttcgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagaga 11423371  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  11423372 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 11423471  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11423472 tgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 11423534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 16501818 - 16502143
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  16501818 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 16501917  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16501918 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 16502017  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||  | || || ||||||||||||    
T  16502018 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccacccccgcgtcatgtatccat 16502117  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16502118 ggtctccccaagagacagctgtaaga 16502143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 31562833 - 31563148
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  31562833 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 31562932  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  31562933 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 31563032  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  31563033 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 31563132  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  31563133 tgcattaatgtccatc 31563148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2156281 - 2155959
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||  |||| || || || |||||||||||  |||| |||  | ||||  | |||||||    
T  2156281 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatgtcagttccatccctcttaggttccgtac 2156182  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  2156181 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctacctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 2156082  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  2156081 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacag 2155982  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  2155981 ctgtaagaggcattaatatccat 2155959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3447006 - 3446691
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  3447006 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 3446908  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  3446907 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 3446808  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  3446807 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 3446708  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  3446707 atgcattaatgtccatc 3446691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9620351 - 9620036
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  9620351 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 9620253  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  9620252 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 9620153  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  9620152 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 9620053  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  9620052 atgcattaatgtccatc 9620036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 16516932 - 16517179
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||    
T  16516932 aaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagaga 16517031  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||    
T  16517032 aagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcac 16517131  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
      | || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16517132 cacccccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacagctgtaaga 16517179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11442579 - 11442264
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| | |||| | || ||| | |||||||||    
T  11442579 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccgg-cttccttagactctgcaccttcaat 11442481  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  11442480 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 11442381  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  11442380 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 11442281  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  11442280 atgcattaatgtccatc 11442264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 26273537 - 26273852
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  26273537 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 26273635  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  26273636 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 26273735  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  26273736 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 26273835  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  26273836 atgcattaatgtccatc 26273852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 16734903 - 16735218
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  16734903 cttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 16735002  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  16735003 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaa 16735102  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16735103 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 16735202  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16735203 tgcattaatgtccatc 16735218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 16749957 - 16750272
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  16749957 cttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 16750056  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  16750057 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaa 16750156  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16750157 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 16750256  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16750257 tgcattaatgtccatc 16750272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17525232 - 17524917
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  17525232 cttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 17525133  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  17525132 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaa 17525033  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  17525032 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 17524933  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  17524932 tgcattaatgtccatc 17524917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 17527983 - 17528298
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  17527983 cttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 17528082  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  17528083 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaggtatgcctcttcaccatggattgtaa 17528182  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  17528183 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 17528282  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  17528283 tgcattaatgtccatc 17528298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 24590984 - 24591299
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  24590984 cttgccccaaccggcggtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 24591083  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24591084 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 24591183  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24591184 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 24591283  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  24591284 tgcattaatgtccatc 24591299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Original strand, 26668357 - 26668640
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || |||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  26668357 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctccgagcatcctttaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 26668455  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||| ||||    
T  26668456 ggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgta 26668555  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttccca 312  Q
    || || || ||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  26668556 acgagttttccatttttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttccca 26668640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18542291 - 18542184
Alignment:
Q  237 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 336  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  18542291 ccattctttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaa 18542192  T
Q  337 tgtccatc 344  Q
    ||||||||    
T  18542191 tgtccatc 18542184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45388920 - 45388789
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  45388920 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 45388821  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 160  Q
    ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  45388820 gtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 45388789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 2108578 - 2108635
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2108578 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 2108635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 800159 - 800234
Alignment:
Q  231 agcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtc 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  800159 agcttcccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtagacgttactgcccccgcttcatgaatccagggtc 800234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 31088039 - 31088094
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31088039 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 31088094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45734028 - 45733973
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  45734028 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 45733973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22079390 - 22079732
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtccc 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||  ||    
T  22079390 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggtagcttgaccttctaggacagccctctgagcatccttcaaagaggccatagcagctcc 22079489  T
Q  101 agtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacc 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||  |||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22079490 agccctcttgggctccgtaccttcgatagtcaaaccctgaaaagcggttccttctgcagaccctgcttcaatgcaagagaaagatgatagctggctaacc 22079589  T
Q  201 aaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcc 300  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22079590 aaatatgcctcctctccatggactgtaacgagctttccattctttacaaactttaacttttggtgcagggtagaggtcactgccccagcgtcatgtatcc 22079689  T
Q  301 atggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22079690 acggtcttcctaggagacagctataagaagcattgatgtccat 22079732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16285174 - 16284834
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||  || ||  |||| || || || ||||||||||||||||| |||     
T  16285174 tgcttgttctcacgaagttgtattaacctgccccagccggcagcttgaccttcttagacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatagcagttccat 16285075  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16285074 cccttttgggctccgtaccttcgacagttaaaccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 16284975  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||     
T  16284974 gtatgcttcctctccatgaattgtaacaagctttccgctttttgcaaacttcaacttctggtgcaaggtagaggtcaccgccccagcgtcatgtatccac 16284875  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  16284874 ggtcttcccaagagacagatataagaggcattgatatccat 16284834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 27607395 - 27607735
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  27607395 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 27607494  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27607495 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttagtccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 27607594  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  27607595 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 27607694  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27607695 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27607735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18792432 - 18792092
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  18792432 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 18792333  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18792332 ccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 18792233  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  18792232 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcatgtatccat 18792133  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  18792132 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 18792092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19676140 - 19675825
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  19676140 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 19676041  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19676040 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctacttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 19675941  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  19675940 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcaccagcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 19675841  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  19675840 ggcattaatgtccatc 19675825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 19206876 - 19207190
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||     
T  19206876 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatg 19206975  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  19206976 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagatagctggctgactaagtatgcctcttcaccatggattgtaa 19207075  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  19207076 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 19207175  T
Q  329 agcattgatgtccat 343  Q
     ||||| ||||||||    
T  19207176 tgcattaatgtccat 19207190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19689823 - 19689498
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  19689823 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatcgcagttccat 19689724  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  | ||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19689723 ccctcttaggttccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 19689624  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
    ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  19689623 atatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 19689524  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19689523 ggtctccccaagagacagctgtaaga 19689498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9356322 - 9356007
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  9356322 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 9356224  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  9356223 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 9356124  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  9356123 acgagttttccattctttacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 9356024  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  9356023 atgcattaatgtccatc 9356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14559331 - 14559009
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| ||   | ||||| |||||||||    
T  14559331 tgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccctccctcttgggctccgtac 14559232  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| ||||||||    
T  14559231 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggttaaccaggtatgcttcctctccatg 14559132  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     | |||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14559131 aattgtaacaagctttccgcttttggcaaatttcaacttctgatgcaaggtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccatggtctccccaagagacag 14559032  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| || |||||    
T  14559031 ctgtaagaggcattaatatccat 14559009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Original strand, 3327998 - 3328338
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||     
T  3327998 gcttgttctcacagagttgtatcatcttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagc 3328097  T
Q  104 cttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaa 203  Q
     | |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||     
T  3328098 ttccttaggctctgcaccttcaatggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaag 3328197  T
Q  204 tatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatg 303  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| |    
T  3328198 tatgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacg 3328297  T
Q  304 gtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    |||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  3328298 gtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 3328338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16279278 - 16278939
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  16279278 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttcca- 16279180  T
Q  103 tct-tcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacca 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| ||||| | || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16279179 tctctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaag-cggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaacca 16279081  T
Q  202 aatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcca 301  Q
      ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || |||||||||||    
T  16279080 ggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatcca 16278981  T
Q  302 tggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
     ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16278980 aggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 16278939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 2135749 - 2136089
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  2135749 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccaaccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 2135848  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  2135849 ccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccgg 2135948  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  2135949 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 2136048  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  2136049 ggtctccccaagagacaactgtaagaggcattaatatccat 2136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 12091240 - 12091555
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  12091240 cttgccccagccggtagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 12091339  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12091340 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 12091439  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12091440 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 12091539  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  12091540 tgcattaatgtccatc 12091555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29831021 - 29830707
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  29831021 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 29830923  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  29830922 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcaggccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 29830823  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  29830822 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 29830723  T
Q  328 aagcattgatgtccat 343  Q
    | ||||| ||||||||    
T  29830722 atgcattaatgtccat 29830707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 28360471 - 28360786
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagc-tccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| | ||| || | |||||||||    
T  28360471 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcggccccag-cttccttagcctctgcaccttcaat 28360569  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  28360570 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 28360669  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  28360670 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 28360769  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28360770 atgcattaatgtccatc 28360786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31356224 - 31355909
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  31356224 cttgccccaaccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 31356126  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  31356125 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 31356026  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  31356025 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 31355926  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  31355925 atgcattaatgtccatc 31355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33260370 - 33260107
Alignment:
Q  81 aaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagaga 180  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||||||||| || |  ||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  33260370 aaagaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatggttaaaccttggaaagcagttccctcagcagaccctgcttcaatacaagaaa 33260271  T
Q  181 aagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttac 280  Q
    |||| ||||  ||||| || || || | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || ||    
T  33260270 aagaagacaattggctgactaagtacgcttcttcaccatggattgtaacgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaac 33260171  T
Q  281 tgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  33260170 cgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtaggatgcattaatgtccatc 33260107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Original strand, 31488389 - 31488520
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  31488389 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 31488488  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcaga 160  Q
    ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  31488489 gtcaaaccttggaaagcagttccctcagcaga 31488520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33245234 - 33245177
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33245234 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33245177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 19658686 - 19658743
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19658686 tgtgcttattctcaaggagttgtattatcttgccccagccagcagcttgtccttcttg 19658743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 17090934 - 17091260
Alignment:
Q  17 gagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctcc 116  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |  ||||||| |||||    
T  17090934 gagttgtatcaacttaccccaaccggcagcctgtccttcttgaatagccttctgagcgtccttcaaagaagccatagcagccctaaccttcttgggctcc 17091033  T
Q  117 gtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctc 216  Q
    ||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||| |    
T  17091034 gtaccttcaatggtcaatccttgaaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaggagaaggatgacagttggctaactaagtatgcttcttcac 17091133  T
Q  217 catggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggag 316  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  17091134 catggactgtgacgagctttccattcctcacaaactttaacttctggtgcagggtggaggttactgcgcccgcgtcatgtatccacggccttcccagaag 17091233  T
Q  317 acagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17091234 acagctataagaagcgttgatatccat 17091260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 27628206 - 27628520
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||     
T  27628206 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctccgcgccttcaatg 27628305  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27628306 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggactgtaa 27628405  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||    
T  27628406 cgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttcccaagaggcagctgtatga 27628505  T
Q  329 agcattgatgtccat 343  Q
    |||||| || |||||    
T  27628506 agcattaatatccat 27628520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16675835 - 16675520
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  16675835 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 16675736  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  16675735 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttctccatgaacggtaa 16675636  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  16675635 caagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 16675536  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16675535 tgcattaatgtccatc 16675520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29551197 - 29550856
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  29551197 tgcttgttctcacgaagctgtactaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 29551098  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29551097 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaa 29550998  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  29550997 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccat 29550898  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  29550897 ggtcttcccagcagacaactgtaggatgcattaatgtccatc 29550856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3697777 - 3697462
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  3697777 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 3697678  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  3697677 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatggattgtga 3697578  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  3697577 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctggtgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 3697478  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  3697477 tgcattaatgtccatc 3697462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 26776110 - 26776425
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||     
T  26776110 cttgccccatccggcagtctgaccttcctggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaagctccgcaccttcaatg 26776209  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  26776210 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcctcttcaccatgaatggtaa 26776309  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | |||||  ||||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  26776310 cgagcttttcattccttacgaatttcaacttctgatgtaaggtagaggttaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 26776409  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  26776410 tgcattaatgtccatc 26776425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 22933354 - 22933694
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  22933354 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 22933453  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22933454 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 22933553  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  22933554 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 22933653  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22933654 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 22933694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 23855799 - 23856139
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  23855799 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 23855898  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23855899 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctcaacagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 23855998  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  23855999 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgtaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 23856098  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  23856099 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 23856139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 24303092 - 24303432
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  24303092 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 24303191  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24303192 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 24303291  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  24303292 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 24303391  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24303392 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24303432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 343
Target Start/End: Original strand, 27271078 - 27271394
Alignment:
Q  27 aacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaa 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||  | ||||  ||||   ||||||||    
T  27271078 aacttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataaccctctgagcatcttttaatgaagccatggcagctccatccctcttaggctctacaccttcaa 27271177  T
Q  127 tagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgt 226  Q
    | ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||    
T  27271178 tggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgt 27271277  T
Q  227 aacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataa 326  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| || || ||     
T  27271278 gacgagttttccattcttcacaaactttaatttctgatgcaaggtggaggttaccgcgcccgcgtcatgtatccaaggccttcccaagaggcaactgtat 27271377  T
Q  327 gaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||||| || |||||    
T  27271378 gaagcattaatatccat 27271394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20162179 - 20162073
Alignment:
Q  237 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20162179 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagcattga 20162080  T
Q  337 tgtccat 343  Q
    | |||||    
T  20162079 tatccat 20162073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 343
Target Start/End: Original strand, 22170652 - 22170758
Alignment:
Q  237 ccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattga 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22170652 ccattcttcacaaatttcaacttctggtgtagggtagaggttaccgcgccagcgtcatgtatccaaggtcttcccaggagacagctatacgaagcattga 22170751  T
Q  337 tgtccat 343  Q
    | |||||    
T  22170752 tatccat 22170758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 15422791 - 15423131
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||  || || || ||||||||||| |||||||||     
T  15422791 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctatgcatccttcaaagaagccattgcagtcccat 15422890  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15422891 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 15422990  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  15422991 gtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcctgcgtcatgtatccat 15423090  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15423091 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 15423131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29503111 - 29502796
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  29503111 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 29503013  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  29503012 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 29502913  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  29502912 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccatggtcttcccagcagacaactgtagg 29502813  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  29502812 atgcattaatgtccatc 29502796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27046084 - 27045769
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | | || ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | | |||||||     
T  27046084 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctggataaccctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcatcttcaatg 27045985  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  27045984 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaggaagacagctggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 27045885  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  27045884 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 27045785  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  27045784 tgcattaatgtccatc 27045769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27020861 - 27020520
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  27020861 tgcttgttctcacgaagctgtattaacttgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 27020762  T
Q  103 tcttcttgag-ctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaacca 201  Q
     | || | || |||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27020761 ccctccttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaacca 27020662  T
Q  202 aatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatcca 301  Q
      |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  27020661 ggtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatcca 27020562  T
Q  302 tggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27020561 tggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27020520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 13297425 - 13297765
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  || || |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  13297425 tgcttgttctcgcgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttgaacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 13297524  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13297525 cccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 13297624  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |  || |  || ||||||||||||    
T  13297625 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcatcgctctcgcgtcatgtatccat 13297724  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  13297725 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcgttaatgtccat 13297765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24865439 - 24865099
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| ||||||||||| |||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  24865439 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccgacagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 24865340  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  ||||||| ||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24865339 ccctcttaggctccgttccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagacccggcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 24865240  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  24865239 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 24865140  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24865139 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 24865099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 26114910 - 26115225
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  26114910 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 26115008  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  26115009 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagatcctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 26115108  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  26115109 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 26115208  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  26115209 atgcattaatgtccatc 26115225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26920102 - 26919762
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  26920102 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 26920003  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  26920002 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctgactaaccag 26919903  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  26919902 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccattttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccat 26919803  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||| | |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  26919802 ggtttccccaagaggcaactgtaagaggcattaatatccat 26919762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27486825 - 27486510
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  27486825 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 27486726  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || || ||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  27486725 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcggcagatcctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 27486626  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  27486625 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagtaggcaactgtagga 27486526  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  27486525 tgcattaatgtccatc 27486510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28209150 - 28208835
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  28209150 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 28209051  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28209050 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 28208951  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  28208950 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 28208851  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  28208850 tgcattaatgtccatc 28208835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20162337 - 20162176
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||      
T  20162337 gcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttcaaagaagccattgcagctccaac 20162238  T
Q  104 cttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 165  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20162237 cttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 20162176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 22170494 - 22170655
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||      
T  22170494 gcttattctcacagagttggattaacttgccccagtcggcagcctgtccctcctgaacagccttctgggcgtccttcaaagaagccattgcagctccaac 22170593  T
Q  104 cttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccat 165  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22170594 cttcttgggctctgcaccttccatagacaacccttgaaaagcagttccctcagcagatccat 22170655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16751576 - 16751236
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| |||||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  16751576 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacagctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 16751477  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  | ||| ||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16751476 ccctcttaggttccataccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 16751377  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||||||     
T  16751376 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccac 16751277  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16751276 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 16751236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27009426 - 27009111
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  27009426 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 27009328  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  27009327 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 27009228  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  27009227 acgagttttccattcttcataaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 27009128  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  27009127 atgcattaatgtccatc 27009111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 30556516 - 30556831
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  30556516 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 30556614  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  30556615 ggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 30556714  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  30556715 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 30556814  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  30556815 atgcattaatgtccatc 30556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4759460 - 4759145
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  4759460 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 4759361  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  4759360 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 4759261  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  4759260 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 4759161  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  4759160 tgcattaatgtccatc 4759145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 27288845 - 27289184
Alignment:
Q  4 gcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagt 103  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||| || |||||||| || ||||| || ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||      
T  27288845 gcttgttctcacggagctgtatcaccttgccccacccagcagtctgaccctcttggacggctctctgcgcatctttcaaagaagccatggcagctccatc 27288944  T
Q  104 cttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaa 203  Q
    | | ||  |||| |||||||| | ||| |  ||| |||| || |||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||      
T  27288945 ccttttaggctctgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggttccctctgcagaccctgcttctatgcaggagaaagatgatagttggctaaccagg 27289044  T
Q  204 tatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatg 303  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || |||||||||||||    
T  27289045 tatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccatg 27289144  T
Q  304 gtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27289145 gtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 27289184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 4544275 - 4544590
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| ||    
T  4544275 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgat 4544373  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  4544374 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 4544473  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  4544474 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 4544573  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  4544574 atgcattaatgtccatc 4544590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4526982 - 4526667
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| |  ||||||||     
T  4526982 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcgccttcaatg 4526883  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  4526882 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 4526783  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  4526782 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaagtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 4526683  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  4526682 tgcattaatgtccatc 4526667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 16942527 - 16942842
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | ||||||||      
T  16942527 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaacg 16942626  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16942627 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 16942726  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16942727 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 16942826  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  16942827 tgcattaatgtccatc 16942842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26990464 - 26990271
Alignment:
Q  150 ccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaa 249  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||    
T  26990464 ccctctgcagatcctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcctcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaa 26990365  T
Q  250 acttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    | ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  26990364 atttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 26990271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 4722634 - 4722949
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||| ||    
T  4722634 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcgat 4722732  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  4722733 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 4722832  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  4722833 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtctccccagcaggcaactgtagg 4722932  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  4722933 atgcattaatgtccatc 4722949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29574709 - 29574394
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  29574709 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 29574611  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || ||||  ||||| || || | ||||    
T  29574610 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcctcttcaccgtgaattgta 29574511  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  29574510 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagg 29574411  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  29574410 atgcattaatgtccatc 29574394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 34913563 - 34913795
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || |  ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  34913563 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgactctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 34913662  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  34913663 ccctcttgggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaatcag 34913762  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagctt 235  Q
     |||| ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  34913763 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctt 34913795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 8891943 - 8891998
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8891943 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8891998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 8903178 - 8903233
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8903178 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 8903233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28163221 - 28163166
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28163221 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 28163166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 33373888 - 33373943
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33373888 tgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccagcagcttgtccttcttg 33373943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 4774579 - 4774506
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  4774579 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 4774506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 997 - 1312
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | | |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | ||| ||||      
T  997 cttgccccaaccggcagtctgaccttcctgaataactttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccctcaaag 1096  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  1097 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctggctgaccaaatatgcttcttcaccatggattgtaa 1196  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  1197 cgagttttccattcttcacaaactttaacttctgatgcaaggtggaggttaccgcacccgcgtcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 1296  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  1297 tgcattaatgtccatc 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 5794 - 6108
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||  |||| | |||||||||     
T  5794 cttgccccagccggcagtctgaccctcttggataaccttctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagctttcttaggctctgcaccttcaatg 5893  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  ||||    
T  5894 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaagaagtcagctggctgactaaatatgcttcttcaccatgaatggtaa 5993  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    |||| || |||||| |||  |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || ||    
T  5994 caagttttccattccttatgaacttcaacttctgatgtaaggtggaggttaccgcacccgcatcgtgtatccatggtcttcccagcaaacaactgtagga 6093  T
Q  329 agcattgatgtccat 343  Q
     ||||| ||||||||    
T  6094 tgcattaatgtccat 6108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32160 - 31838
Alignment:
Q  21 tgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtac 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||  |||||||||    
T  32160 tgtattaacttgccccagccggcagcttgaccttcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccatccctcttaggctccgtac 32061  T
Q  121 cttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatg 220  Q
    |||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  32060 cttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcctctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatg 31961  T
Q  221 gactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacag 320  Q
     |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  31960 aatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcactgctcccgcgtcgtgtatccatggtctccccaagagacag 31861  T
Q  321 ctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  31860 ctgtaagaggcattaatgtccat 31838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46232
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46145 tgtgcttattctcacggagttgtattaacttgccccagccggcagcctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagc 46232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31482 - 31142
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  31482 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccatggcagttccat 31383  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31382 cccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 31283  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  31282 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttctggtgcaaagtagaggtcaccgcccccgcgtcatgtatccat 31183  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  31182 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 31142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Original strand, 38600 - 38940
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||     
T  38600 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccat 38699  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | ||||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  38700 ccctcttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 38799  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  38800 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 38899  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataagaagcattgatgtccat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  38900 ggtctccccaagagacagctgtaagaggcattaatatccat 38940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 45516 - 45841
Alignment:
Q  3 tgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||| ||||| || || |||| |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| |||||||||     
T  45516 tgcttgttctcacgaagctgtattaacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagtcccat 45615  T
Q  103 tcttcttgagctccgtaccttcaatagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaa 202  Q
     | | ||  ||||||||||||| | ||| |  ||| |||| || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  45616 cccttttaggctccgtaccttcgacagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcggaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccag 45715  T
Q  203 atatgtttcttctccatggactgtaacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccat 302  Q
     |||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| || || || || ||||||||||||    
T  45716 gtatgcttcctctccatgaatggtaacaagcttcccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtagaggtcaccgctcccgcgtcatgtatccat 45815  T
Q  303 ggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  45816 ggtctccccaagagacagctgtaaga 45841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11265 - 10950
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  11265 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 11166  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||| ||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  11165 gtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagagaaggaagacagctagctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 11066  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  11065 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacccacatcgtgtatccacggtcttcccagcagacaactgtagga 10966  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  10965 tgcattaatgtccatc 10950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9333
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||  |||| | |||||||||     
T  9648 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatctttcaatgaagccatagcagccccagcttccttaggctctgcaccttcaatg 9549  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || ||||| || |||||||| ||  ||||||  ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  9548 gtcaacccttggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaacacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 9449  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  9448 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 9349  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  9348 tgcattaatgtccatc 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28995 - 28693
Alignment:
Q  26 taacttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttca 125  Q
    |||| |||||||||||||||  || || ||||| || ||  |||| || || || ||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||||||||||||     
T  28995 taacctgccccagccggcagcttgaccctcttggacggctctctgtgcatccttcaaagaagccattgcagttccatccctcttgggctccgtaccttcg 28896  T
Q  126 atagtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactg 225  Q
    | ||| |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |  |    
T  28895 acagttaatccttgaaaagcggtcccctctgcagaccctgcttctatgcaagagaaagatgatagctggctaaccaggtatgcttcctctccatgaatgg 28796  T
Q  226 taacaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctata 325  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||||  |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  28795 taacaagctttccactttttgcaaatttcaacttttggtgcaaagtaggggtcaccgcccccgcgtcatgtatccaaggtctccccaagagacagctgta 28696  T
Q  326 aga 328  Q
    |||    
T  28695 aga 28693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7714 - 7399
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  || |||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  7714 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctccgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 7616  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  7615 ggtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 7516  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  7515 acgagctttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 7416  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  7415 atgcattaatgtccatc 7399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 13487 - 13802
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | |||||||||    
T  13487 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaat 13585  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgta 227  Q
     ||||  ||  | || ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  13586 ggtcaaaccctggaaagcagtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaattggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgta 13685  T
Q  228 acaagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataag 327  Q
    || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  13686 acgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagg 13785  T
Q  328 aagcattgatgtccatc 344  Q
    | ||||| |||||||||    
T  13786 atgcattaatgtccatc 13802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 24758 - 25073
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgagctccgtaccttcaata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||  | |||   ||| | |||||||||     
T  24758 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccagcttcctttgactctgcaccttcaatg 24857  T
Q  129 gtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatggactgtaa 228  Q
    ||||  ||| | || || || || |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  24858 gtcaaaccttggaaagcggtcccttcagcagaccctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatggattgtaa 24957  T
Q  229 caagcttcccattctttacaaacttcaatttctggtgcagggtagaggttactgcgccagcatcatgtatccatggtcttcccaggagacagctataaga 328  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24958 cgagttttccattcttcacaaatttcaacttctgatgtaaggtggaagtaaccgcacctgcatcgtgtatccacggtcttcccagcaggcaactgtagga 25057  T
Q  329 agcattgatgtccatc 344  Q
     ||||| |||||||||    
T  25058 tgcattaatgtccatc 25073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22130 - 22073
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22130 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 22073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 119585 - 119642
Alignment:
Q  1 tgtgcttattctcgcggagttgtactaacttgccccagccggcagtctgtccttcttg 58  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  119585 tgtgcttattctcaaggagttgtattaacttgccccagccggcagcttgtccttcttg 119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27904 - 27711
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccagtcttcttgag-ctccgtaccttcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||| | ||||||||     
T  27904 cttgccccagccggcagtctgaccttcttggatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag-cttccttagactctgcaccttcaac 27806  T
Q  128 agtcaggcctcgaaaggcagttccctcagcagatccatcttcaatgcaagagaaagatgacagctggctaaccaaatatgtttcttctccatgga 222  Q
     ||||  ||| | || ||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||| |||||| |||||||    
T  27805 ggtcaaaccttggaaagcagtcccttcagcaaatcctgcttcaatacaagaaaaagaagacaactggctgactaagtatgcttcttcaccatgga 27711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 7746 - 7819
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  7746 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 7819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 21299 - 21372
Alignment:
Q  29 cttgccccagccggcagtctgtccttcttgaacagccttctgagcgtcttttaaagaagccatagcagtcccag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  21299 cttgccccagccggcagtctgaccttcttgaatggctctctgagcatccttcaatgaagccatagcagccccag 21372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University