View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8581_low_22 (Length: 372)

Name: NF8581_low_22
Description: NF8581
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8581_low_22
NF8581_low_22
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (79-357)||(48808773-48809051)
chr7 (79-357)||(15729498-15729776)
chr7 (79-357)||(18399851-18400129)
chr7 (79-357)||(18406835-18407113)
chr7 (79-357)||(19858869-19859147)
chr7 (79-357)||(30253885-30254163)
chr7 (79-357)||(2204298-2204577)
chr7 (79-357)||(8464746-8465024)
chr7 (79-357)||(18139615-18139895)
chr7 (79-357)||(19230634-19230913)
chr7 (79-357)||(10669179-10669456)
chr7 (79-357)||(47167136-47167413)
chr7 (79-356)||(18259402-18259678)
chr7 (105-357)||(41681250-41681502)
chr7 (79-357)||(34128322-34128598)
chr7 (79-357)||(28130309-28130586)
chr7 (94-353)||(19393705-19393963)
chr7 (101-357)||(14585930-14586191)
chr7 (140-357)||(15999791-16000007)
chr7 (144-357)||(2935846-2936056)
chr7 (79-357)||(22968697-22968975)
chr7 (79-357)||(3587657-3587934)
chr7 (186-357)||(24443604-24443772)
chr7 (87-349)||(42150363-42150618)
chr7 (79-199)||(22994055-22994176)
chr7 (102-356)||(15170307-15170561)
chr7 (79-155)||(48813749-48813825)
chr7 (79-220)||(24443932-24444074)
chr7 (149-355)||(31190722-31190926)
chr7 (94-158)||(25846379-25846443)
chr7 (314-372)||(25845736-25845796)
chr7 (314-372)||(25846155-25846215)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (79-357)||(24933583-24933861)
chr5 (78-357)||(12789940-12790219)
chr5 (79-357)||(31646-31924)
chr5 (79-357)||(23545669-23545947)
chr5 (77-357)||(25805662-25805942)
chr5 (79-357)||(22940997-22941275)
chr5 (79-357)||(31096563-31096841)
chr5 (85-357)||(20940780-20941052)
chr5 (85-357)||(12765271-12765541)
chr5 (87-357)||(7865711-7865979)
chr5 (85-357)||(12704155-12704425)
chr5 (85-357)||(9812014-9812284)
chr5 (79-357)||(26244850-26245127)
chr5 (107-357)||(5097427-5097676)
chr5 (79-357)||(39535211-39535489)
chr5 (85-357)||(20100520-20100789)
chr5 (79-353)||(26129974-26130249)
chr5 (128-212)||(31652208-31652293)
chr5 (314-357)||(31267939-31267982)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (79-357)||(20243684-20243962)
chr4 (79-357)||(2676760-2677038)
chr4 (79-357)||(15461244-15461522)
chr4 (79-357)||(18162909-18163187)
chr4 (79-357)||(4676260-4676538)
chr4 (79-357)||(15814768-15815046)
chr4 (79-357)||(18111320-18111598)
chr4 (79-357)||(26531360-26531638)
chr4 (79-357)||(3369300-3369578)
chr4 (77-357)||(17300236-17300516)
chr4 (79-357)||(5870159-5870443)
chr4 (79-357)||(34975298-34975576)
chr4 (78-313)||(38816459-38816694)
chr4 (79-357)||(1941472-1941749)
chr4 (79-286)||(11484265-11484472)
chr4 (85-356)||(9487305-9487575)
chr4 (88-357)||(11420773-11421041)
chr4 (76-357)||(30040751-30041031)
chr4 (198-356)||(4545948-4546104)
chr4 (200-357)||(19365389-19365544)
chr4 (79-169)||(4545860-4545950)
chr4 (144-357)||(19362229-19362435)
chr4 (79-295)||(9537710-9537926)
chr4 (79-347)||(39422426-39422694)
chr4 (101-351)||(5528762-5529011)
chr4 (313-357)||(32636465-32636509)
chr4 (128-256)||(23056437-23056566)
chr4 (186-351)||(56516093-56516255)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (77-357)||(21969078-21969358)
chr8 (79-357)||(27007794-27008072)
chr8 (79-357)||(27014937-27015215)
chr8 (79-357)||(28498240-28498518)
chr8 (79-357)||(45534550-45534828)
chr8 (76-357)||(12561867-12562148)
chr8 (77-357)||(22130886-22131166)
chr8 (79-357)||(26240231-26240509)
chr8 (79-357)||(27880764-27881043)
chr8 (79-357)||(28020945-28021224)
chr8 (85-357)||(25610947-25611220)
chr8 (79-357)||(8371530-8371808)
chr8 (79-357)||(22659771-22660049)
chr8 (180-357)||(21916524-21916701)
chr8 (79-353)||(2963217-2963489)
chr8 (78-310)||(36970022-36970253)
chr8 (79-342)||(6430692-6430952)
chr8 (102-356)||(18835124-18835374)
chr8 (79-357)||(20539674-20539953)
chr8 (1-78)||(33843147-33843224)
chr8 (79-163)||(21914310-21914394)
chr8 (79-159)||(21862147-21862227)
chr8 (79-257)||(8782188-8782365)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (78-357)||(30174123-30174402)
chr2 (79-357)||(24250309-24250587)
chr2 (78-357)||(24229492-24229771)
chr2 (93-357)||(19616197-19616460)
chr2 (79-357)||(24763834-24764111)
chr2 (88-357)||(15342280-15342548)
chr2 (79-220)||(29800175-29800317)
chr2 (79-296)||(21626429-21626647)
chr2 (186-257)||(28719170-28719241)
chr2 (129-247)||(18852167-18852286)
chr2 (315-362)||(28719053-28719100)
chr2 (314-357)||(29800449-29800492)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (79-357)||(3952-4230)
scaffold0264 (79-313)||(10851-11085)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (79-357)||(130501-130779)
scaffold0001 (119-298)||(138471-138650)
scaffold0001 (76-114)||(141112-141150)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (79-357)||(1586385-1586663)
chr6 (79-357)||(16788818-16789096)
chr6 (77-357)||(22860165-22860445)
chr6 (87-357)||(13995220-13995490)
chr6 (79-357)||(18020118-18020396)
chr6 (79-357)||(27508624-27508903)
chr6 (79-357)||(27528210-27528489)
chr6 (78-357)||(14074226-14074505)
chr6 (79-357)||(8612664-8612940)
chr6 (79-281)||(13947501-13947704)
chr6 (79-357)||(5758758-5759034)
chr6 (79-342)||(17120741-17121002)
chr6 (79-357)||(20736605-20736882)
chr6 (78-357)||(19218178-19218454)
chr6 (79-227)||(14996859-14997007)
chr6 (79-357)||(22560461-22560740)
chr6 (79-351)||(4073320-4073595)
chr6 (149-357)||(21994406-21994613)
chr6 (94-257)||(10359410-10359574)
chr6 (79-155)||(21993711-21993786)
chr6 (78-117)||(11248530-11248569)
chr6 (315-357)||(10359326-10359368)
chr6 (264-353)||(23846668-23846755)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (79-357)||(21033985-21034263)
chr3 (79-357)||(12299658-12299936)
chr3 (79-357)||(55426768-55427046)
chr3 (79-357)||(15846813-15847091)
chr3 (79-357)||(14890138-14890416)
chr3 (79-357)||(20147831-20148110)
chr3 (79-353)||(21398539-21398813)
chr3 (79-356)||(25979006-25979282)
chr3 (85-325)||(28087971-28088211)
chr3 (128-356)||(11787384-11787611)
chr3 (79-357)||(14146769-14147046)
chr3 (79-356)||(15526503-15526777)
chr3 (79-213)||(14225954-14226090)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (79-357)||(9455863-9456141)
chr1 (79-357)||(42817266-42817544)
chr1 (77-357)||(47667751-47668031)
chr1 (77-357)||(20391516-20391796)
chr1 (78-357)||(20779922-20780201)
chr1 (79-357)||(22670534-22670812)
chr1 (79-357)||(19706716-19706994)
chr1 (79-357)||(28135000-28135278)
chr1 (78-357)||(43802642-43802921)
chr1 (79-357)||(22612234-22612517)
chr1 (79-357)||(35930329-35930607)
chr1 (79-281)||(22234827-22235029)
chr1 (79-357)||(8727412-8727692)
chr1 (210-357)||(633814-633959)
chr1 (79-357)||(21881653-21881931)
chr1 (108-307)||(26923675-26923871)
chr1 (186-348)||(29096580-29096739)
chr1 (316-356)||(16435837-16435877)
chr1 (131-209)||(16435649-16435728)
chr1 (85-118)||(14482305-14482338)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (79-357)||(119477-119755)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (79-357)||(8052-8330)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (85-357)||(15100-15372)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (79-347)||(1-273)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (79-313)||(40015-40249)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (79-357)||(67651-67928)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (78-308)||(19160-19390)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (79-357)||(8847-9135)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (150-357)||(1-208)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (79-356)||(45226-45502)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (79-357)||(11807-12083)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (79-262)||(18786-18969)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (79-287)||(961-1169)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (79-268)||(76307-76496)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (94-357)||(13226-13489)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (79-357)||(40265-40542)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (79-357)||(53521-53790)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (79-235)||(9516-9672)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (79-212)||(33927-34060)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (138-291)||(26413-26567)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (79-199)||(13740-13861)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (79-357)||(8479-8756)
[»] scaffold0783 (1 HSPs)
scaffold0783 (79-136)||(6227-6284)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (224-357)||(83292-83423)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (78-126)||(1825-1873)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48809051 - 48808773
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809051 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 48808952  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 48808852  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808851 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 48808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 15729498 - 15729776
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729498 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15729597  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15729598 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 15729697  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729698 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15729776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 18399851 - 18400129
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399851 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18399950  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399951 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18400050  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400051 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 18406835 - 18407113
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406835 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18406934  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406935 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18407034  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407035 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 19858869 - 19859147
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858869 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 19858968  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858969 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtttaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 19859068  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859069 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19859147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 30253885 - 30254163
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30253885 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatattta 30253984  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30253985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagatcgctattctta 30254084  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254085 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30254163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 2204298 - 2204577
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2204298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatattta 2204397  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204398 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2204497  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204498 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2204577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8464746 - 8465024
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464746 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgaatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8464845  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8464846 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 8464945  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8464946 aatgtatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgacgagactattatgtatgtagactgatg 8465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18139895 - 18139615
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18139895 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatattta 18139796  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18139795 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgttattctta 18139696  T
Q  279 a--atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139695 aatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18139615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 19230634 - 19230913
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19230634 tgttggtgtacgccctagaggccaatagttaatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 19230733  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19230734 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 19230833  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230834 aaatgtatccgtagtcaaaacattaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19230913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10669456 - 10669179
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10669456 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 10669357  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  10669356 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatataataagtgtgacttaatcatcagattacattatcataaagaacgttattctt 10669257  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669256 aaatgtatccgtagtc-aatcttt-atattaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 10669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47167413 - 47167136
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47167413 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatattta 47167314  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  47167313 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactttatcatgagattacattatcataaagaacgttattctt 47167214  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47167213 aaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18259678 - 18259402
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259678 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18259579  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  18259578 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattctt 18259479  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18259478 aaatgtatccatagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaatcgtcgagagtattatgtatgttgactgat 18259402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 105 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41681502 - 41681250
Alignment:
Q  105 agtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaat 204  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41681502 agtttatattaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatataacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttggaat 41681403  T
Q  205 agatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaat 304  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41681402 agatagtttatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcttatagaatgttattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaat 41681303  T
Q  305 atgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41681302 atgaataaaggataataataaagctttgagactattatgtatgtagactgatg 41681250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 34128322 - 34128598
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34128322 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 34128421  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  34128422 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattttt 34128521  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34128522 aaatgtatccgtagt-taagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagattattatgtatgtagactgatg 34128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 28130309 - 28130586
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  28130309 tgttggtgtaagccctatatgccaatagtttatgttgaacttatcttatgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatattta 28130408  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  28130409 taataatgttaatgaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaaaacgctattctt 28130508  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28130509 aaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatg 28130586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19393963 - 19393705
Alignment:
Q  94 tagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  19393963 tagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattatatctgtagtaatgttaataa 19393864  T
Q  193 agtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagt 292  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19393863 agtctctataatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaatgctattcttaaatgtatctgtagt 19393764  T
Q  293 caaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 353  Q
    | |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19393763 c-aagctttaatatgagt-tgggataattataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 19393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 357
Target Start/End: Original strand, 14585930 - 14586191
Alignment:
Q  101 caatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttatta------ttgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaa 193  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  14585930 caatagtttaagttaaatttatgttatgtatcatgacttttattactattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaataaa 14586029  T
Q  194 gtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc 293  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14586030 gtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaatgaacgctattattaaatgtatccttagtc 14586129  T
Q  294 aaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14586130 aaa-ctttaatatgaat-tggaataataataaagcgtcgagacttttatgtatgcagactgatg 14586191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 357
Target Start/End: Original strand, 15999791 - 16000007
Alignment:
Q  140 ttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgact 238  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15999791 ttattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaattaagtacctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgact 15999890  T
Q  239 taatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacta 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15999891 taatcatgagattacattaccttaaagaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactt 15999988  T
Q  339 ttatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15999989 ttatgtatgcagactgatg 16000007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 357
Target Start/End: Original strand, 2935846 - 2936056
Alignment:
Q  144 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 242  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2935846 tattaaataatatatgtcactcttcattatatttgttgtaatgttaataaagtccctagaataaatagttcatgtaattatatattaagtg--acttaat 2935943  T
Q  243 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 342  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2935944 catgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgcgataataataaagcatcgagactgttat 2936041  T
Q  343 gtatgtagactgatg 357  Q
     ||||||||||||||    
T  2936042 ttatgtagactgatg 2936056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 22968697 - 22968975
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 176  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  22968697 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 22968795  T
Q  177 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 275  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  22968796 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 22968895  T
Q  276 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22968896 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 22968975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 3587657 - 3587934
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||     
T  3587657 tgttggtgtaagccctaaatgtcaatagtttatgtgaaacttatgctatgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattataattg 3587756  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
       |||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||    
T  3587757 ttgtaagattaataaagtccatagaataggtagtttatgtgatgaaatattaactgtgacttaatcatgagattactttaacataaaaaacgttattctt 3587856  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3587857 aaatgaatctatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgtagagactattatgtatatagaccgatg 3587934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24443772 - 24443604
Alignment:
Q  186 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 285  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  24443772 ttaataaagtccctataatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcacgagattacattaacataaagaacgatattcttaaatgtat 24443673  T
Q  286 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24443672 ccgtag-ccaagctttaatataaat--gggatgataacaaagtgtaaagactattatgtatgtagactgatg 24443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42150618 - 42150363
Alignment:
Q  87 taagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatctt-acgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga----- 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |         
T  42150618 taagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatctttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatatttgtaggtag 42150519  T
Q  181 taatgttaataaagtcctta--gaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||    
T  42150518 taatgttaataaagcccctatagaatagatagttc-tgt-------------gtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattc-ta 42150434  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagact--attatgtatgta 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42150433 aatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcgagactaaattatgtatgta 42150363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Original strand, 22994055 - 22994176
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22994055 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22994154  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtcctt 199  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  22994155 tagtaatgttaataaagtcctt 22994176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15170561 - 15170307
Alignment:
Q  102 aatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtcctta 200  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||||| ||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    |||  |||||||||||| ||    
T  15170561 aatagtttatgttaaatttattctatgtatcgtgagttttaatattaaataatatacgacattctttattataattgttgtaaaattaataaagtccata 15170462  T
Q  201 gaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctt 300  Q
     ||||||| |||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  15170461 aaatagat-gttcatgtaatggaatattaagtgggacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatttgtagtc-aagctt 15170364  T
Q  301 taatatgaataaa---ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    ||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15170363 taatat--ataaattgggataataataaagcgtagagactattatatatgtagactgat 15170307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 48813749 - 48813825
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataata 155  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813749 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataata 48813825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24444074 - 24443932
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 177  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  24444074 tgttggtgtaagtcttagaggtcaatagcttatgttaaacttatgttatctatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatatttg 24443975  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 220  Q
      ||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24443974 ttataagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaat 24443932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31190926 - 31190722
Alignment:
Q  149 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |      
T  31190926 aataatatatggcactttttattatatttgttgtaatgttaataaagtccccaga-tagatagttcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcgttt 31190828  T
Q  248 gattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 347  Q
    | |||||||| | || | |||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31190827 gcttacattaacataaataacattattattaaatatatccttagtc-aagctttagtataaat-tgggataataataaagcaccgagactattacgtatg 31190730  T
Q  348 tagactga 355  Q
    ||| ||||    
T  31190729 taggctga 31190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25846443 - 25846379
Alignment:
Q  94 tagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatat 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25846443 tagaggtcaatattttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataaaatat 25846379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25845796 - 25845736
Alignment:
Q  314 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 372  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25845796 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25845736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25846215 - 25846155
Alignment:
Q  314 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 372  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25846215 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25846155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24933861 - 24933583
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933861 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 24933762  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933761 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24933662  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933661 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24933583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12790219 - 12789940
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790219 ctgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 12790120  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790119 agataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 12790020  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790019 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 31646 - 31924
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31646 tgttggtgtaagccttagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31745  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31746 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 31845  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 23545669 - 23545947
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545669 tgttggtgtgagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatattta 23545768  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545769 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 23545868  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545869 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 23545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25805942 - 25805662
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805942 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 25805843  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25805842 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattct 25805743  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805742 taaatatatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 22940997 - 22941275
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22940997 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22941096  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22941097 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaatgttattctta 22941196  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941197 aatgtatccgtagtcaaagctttaatttgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 31096563 - 31096841
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096563 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31096662  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31096663 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgggattacattatcttaaagaacgttattctta 31096762  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096763 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31096841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Original strand, 20940780 - 20941052
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 184  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940780 tgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 20940879  T
Q  185 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgta 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20940880 gttaataatgtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaactgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattcttaaatgta 20940979  T
Q  285 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940980 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12765541 - 12765271
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taa 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  12765541 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaa 12765442  T
Q  184 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12765441 tgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgt 12765342  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765341 atccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12765271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7865979 - 7865711
Alignment:
Q  87 taagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatg 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||    
T  7865979 taagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattcatagtaatg 7865880  T
Q  186 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7865879 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtat 7865780  T
Q  286 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865779 ccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 7865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12704425 - 12704155
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taa 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  12704425 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaa 12704326  T
Q  184 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12704325 tgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgt 12704226  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12704225 atccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 12704155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9812284 - 9812014
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taa 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  9812284 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaa 9812185  T
Q  184 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 283  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  9812184 tgctaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattattaaatgt 9812085  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9812084 atccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 9812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 26244850 - 26245127
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  26244850 tgttggtgtaagctctggaggccaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttatattta 26244949  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  26244950 tagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaatgttattctt 26245049  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26245050 aaatgtatctgtaatc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26245127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 107 - 357
Target Start/End: Original strand, 5097427 - 5097676
Alignment:
Q  107 tttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaata 205  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  5097427 tttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattatatttatagtaatgttaataaagtccctggaata 5097526  T
Q  206 gatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaata 305  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  5097527 gatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatttgtagtc-aagttttaata 5097625  T
Q  306 tgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097626 tgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 5097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 39535211 - 39535489
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39535211 tgttggtgtatgccctagaggtcaatagtttatgttaaatttacgttatgtatcatgaattttttttattaaataatatatgacactctttattatattt 39535310  T
Q  178 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
       |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  39535311 gttataatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaccttaaagaacgatattct 39535410  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39535411 taaatgtatccgtactcaaa-ctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 39535489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20100789 - 20100520
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taa 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||    |||    
T  20100789 tgtaagccctagaggccaatagtttatgtcagacttatgttatgtatcatgacttttattattcaataatat--gacattctttattatatttgttgtaa 20100692  T
Q  184 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 283  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||    
T  20100691 gattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaataacgttattcttaaatgt 20100592  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    || |||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20100591 attcgtagttaaa-ctttaatataaat-tgggataataataaagcgtcacgactattatgtatgtagactgatg 20100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26130249 - 26129974
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatt--atatt 176  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  26130249 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgataaacttatgttatgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaatact 26130150  T
Q  177 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 275  Q
    |    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| | | ||||| ||| | |  |||||||| |||    
T  26130149 tgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatggaatatttagtgtgacttaatcctaatattactttaacattaagaacgctcttc 26130050  T
Q  276 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26130049 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagaatattatgtatgtagact 26129974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31652293 - 31652208
Alignment:
Q  128 gtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||    |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31652293 gtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatttgttgtaagattaataaagtccctagaatagatagtt 31652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31267982 - 31267939
Alignment:
Q  314 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31267982 ggataacaataaagcgtggagactattatgtatgtagacggatg 31267939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 20243684 - 20243962
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243684 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20243783  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243784 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 20243883  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243884 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 2676760 - 2677038
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676760 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 2676859  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676860 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 2676959  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676960 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 15461244 - 15461522
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461244 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15461343  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461344 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 15461443  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461444 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 18162909 - 18163187
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18162909 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattacattta 18163008  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163009 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18163108  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163109 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4676538 - 4676260
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4676538 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatattta 4676439  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676438 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4676339  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676338 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 4676260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 15814768 - 15815046
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814768 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15814867  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814868 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 15814967  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814968 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15815046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18111598 - 18111320
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111598 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttgaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18111499  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111498 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 18111399  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111398 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18111320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 26531360 - 26531638
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531360 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatattaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26531459  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531460 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 26531559  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531560 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26531638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3369578 - 3369300
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369578 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 3369479  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369478 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 3369379  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369378 aatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17300516 - 17300236
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300516 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 17300417  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300416 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgaaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 17300317  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300316 taaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 17300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 5870159 - 5870443
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta------tta 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||      |||    
T  5870159 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatttttatta 5870258  T
Q  173 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870259 tatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgcta 5870358  T
Q  273 ttcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5870359 ttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 5870443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 34975298 - 34975576
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34975298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatattta 34975397  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34975398 gataatgttaataaagtccttagaatagatggttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 34975497  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975498 aatgtatttgtagtcaaagttttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 34975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 78 - 313
Target Start/End: Original strand, 38816459 - 38816694
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816459 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 38816558  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816559 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 38816658  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816659 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 38816694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 1941472 - 1941749
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1941472 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 1941571  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  1941572 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 1941671  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941672 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 1941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11484472 - 11484265
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484472 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 11484373  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11484372 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 11484273  T
Q  279 aatgtatc 286  Q
    ||||||||    
T  11484272 aatgtatc 11484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 9487305 - 9487575
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taa 183  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  9487305 tgtaagccctaggggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaa 9487404  T
Q  184 tgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgt 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  9487405 tgttaataaagcccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacgttattcttaaatgt 9487504  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9487505 atccgtagtc-aagatttaatatgaat-taggataataataaagcgttgagactattatgtatgttgactgat 9487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 357
Target Start/End: Original strand, 11420773 - 11421041
Alignment:
Q  88 aagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgt 186  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  11420773 aagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattttttgtaatgt 11420872  T
Q  187 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 286  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  11420873 taataaagtccctaaaatagatagttcgtgcaatgatatattaagtgtgatttaatcattagattacattaacataaagaacgctattcttaaatgtatc 11420972  T
Q  287 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420973 cgtagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcttcgagactattatgtatgtagactgatg 11421041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30041031 - 30040751
Alignment:
Q  76 aactgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  30041031 aactgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatat 30040932  T
Q  176 ttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctatt 274  Q
    ||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  30040931 ttgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactatt 30040832  T
Q  275 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30040831 cttaaatgtatctatagtc-aagcgttaatatgaat-tgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatg 30040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 356
Target Start/End: Original strand, 4545948 - 4546104
Alignment:
Q  198 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4545948 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttagtcatgagaatactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagt-taag 4546046  T
Q  298 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4546047 ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 4546104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 357
Target Start/End: Original strand, 19365389 - 19365544
Alignment:
Q  200 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 299  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19365389 agaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagct 19365487  T
Q  300 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||| |||   || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  19365488 ttaatataaat-tggggtaataataaagtgttgagactattatatacgtagactgatg 19365544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 169
Target Start/End: Original strand, 4545860 - 4545950
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4545860 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 357
Target Start/End: Original strand, 19362229 - 19362435
Alignment:
Q  144 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 242  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    |||  | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||    
T  19362229 tattaaataatatatgacattctttattatatttgttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaagtgtgagttaat 19362328  T
Q  243 catgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 342  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |       ||||||||| || | ||||||||||||    
T  19362329 catgagattacattaacgtaaggaacgcttttcttaaatgtatcagtagtc-aagctttaatataa-------ataataatacagtgccgagactattat 19362420  T
Q  343 gtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||    
T  19362421 gtatgtagattgatg 19362435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 295
Target Start/End: Original strand, 9537710 - 9537926
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-attt 177  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||     
T  9537710 tgttggtgtaagccccagaggccaatagtttatgttaaatttatgttatgtatcatgac-tttattattaaataatatatgtca-tttttattataattg 9537807  T
Q  178 agataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
       |||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||  || | ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  9537808 ttgtaagattaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaatatcaagtgtgactctataaagagtttacattaacataaagaacgctattct 9537907  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaa 295  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  9537908 taaatgtatatgtagtcaa 9537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39422694 - 39422426
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagttt-atgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||| | |||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||    
T  39422694 tgttggtgtaagtcgtagaggtcaatagttttatgttaaacttatgttacatatcatgattgttattattaaataaaatgacgcactatttattatattt 39422595  T
Q  178 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
        |||  ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||   | |||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||  ||||||    
T  39422594 gttgtaagattaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaaacgagacttaatcgtgagattacattaacatataagacattattct 39422495  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 347  Q
    |||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39422494 taaaagtatttgtagacaaa-ctttaatatgaattaagg-tagtaataaagcgtatagactattatttatg 39422426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5529011 - 5528762
Alignment:
Q  101 caatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattat-atttagataatgttaataaagtcctt 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| || | |||||||| |||    |||  |||||||| ||| |    
T  5529011 caatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacatttattattaaatataatatgacattttttattataattgttgtaagattaataaaatccct 5528912  T
Q  200 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 299  Q
    |||||||||||| | ||| ||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |  | |||||  |||||||||| || | | ||||| |||||    
T  5528911 agaatagatagtgcatgtgatggaatattcagtgcgacttaatcacgagattacattaacacaaagaactatattcttaaaagtgttcatagtc-aagct 5528813  T
Q  300 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 351  Q
    |||| || ||   | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5528812 ttaa-attaaatcatgataataataaagcgtatagactattatgtttgtaga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 357
Target Start/End: Original strand, 32636465 - 32636509
Alignment:
Q  313 aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32636465 aggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagactgatg 32636509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23056566 - 23056437
Alignment:
Q  128 gtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 226  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||| ||||||||   ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| | | |    
T  23056566 gtatcatgacttttattgttaattaaaataaggcattctttgttatattttctataaaattaataaagtccctagaatatatagttcaagtaatgagaca 23056467  T
Q  227 ttaagtgtgacttaatcatgagattacatt 256  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23056466 ttaagtgagacttaatcgtaagattacatt 23056437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 351
Target Start/End: Original strand, 56516093 - 56516255
Alignment:
Q  186 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||||||||||  ||||| | ||||| | ||||||||  ||||||| || ||||    
T  56516093 ttaataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaacatatagaacattattcttgaa-gtat 56516191  T
Q  286 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 351  Q
    |  ||||| |||||||| | ||||| || |||| || |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  56516192 ctatagtc-aagctttattgtgaat-aacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtaga 56516255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Original strand, 21969078 - 21969358
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969078 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 21969177  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969178 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 21969277  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969278 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21969358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27008072 - 27007794
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008072 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27007973  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007972 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27007873  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007872 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27007794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27015215 - 27014937
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015215 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 27015116  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015115 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27015016  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015015 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 28498240 - 28498518
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498240 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28498339  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498340 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 28498439  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498440 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28498518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45534828 - 45534550
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534828 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 45534729  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45534728 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctta 45534629  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534628 aatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 45534550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 76 - 357
Target Start/End: Original strand, 12561867 - 12562148
Alignment:
Q  76 aactgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatat 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12561867 aactgttggcgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatat 12561966  T
Q  176 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561967 ttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 12562066  T
Q  276 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562067 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12562148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22131166 - 22130886
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131166 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 22131067  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131066 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 22130967  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130966 taaatttatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22130886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 26240231 - 26240509
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240231 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26240330  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26240331 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 26240430  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26240431 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatg 26240509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27881043 - 27880764
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881043 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 27880944  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880943 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 27880844  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880843 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28021224 - 28020945
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021224 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 28021125  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021124 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 28021025  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021024 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28020945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Original strand, 25610947 - 25611220
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 184  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25610947 tgtaagccctaggggcaaatagtttatgataaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatatttagataat 25611046  T
Q  185 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt-aaatgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25611047 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttagagaacgctattcttaaaatgt 25611146  T
Q  284 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611147 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25611220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8371808 - 8371530
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8371808 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatattta 8371709  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  8371708 gataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaataacactattctta 8371609  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371608 aatgtgtctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 8371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22660049 - 22659771
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22660049 tgttggtgtaagtccaaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22659950  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22659949 tataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctta 22659850  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22659849 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 22659771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 21916524 - 21916701
Alignment:
Q  180 ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916524 ataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 21916623  T
Q  280 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916624 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21916701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2963489 - 2963217
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2963489 tgttggtgtaagccctagatgccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatattta 2963390  T
Q  179 ga-taatgtt-aataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  2963389 tagtaatgtttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 2963290  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 353  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2963289 taaatgtattcgt-gtcaaa-ctttaatataatt--aggataataataaagcgtagagactattatgtatgtagact 2963217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Original strand, 36970022 - 36970253
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36970022 ctgttggtgtaagcccta-aggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattt 36970120  T
Q  178 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||    
T  36970121 atagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaataatatattatgtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttgttct 36970220  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36970221 taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat 36970253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 342
Target Start/End: Original strand, 6430692 - 6430952
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6430692 tgttggtgtaagctctagagaccaatagtttacgttaaatttatcttatgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatattt 6430791  T
Q  178 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  6430792 atagtaatgttaataaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactta---atgagattacattatcataaataacactattct 6430888  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 342  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430889 taaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 6430952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 356
Target Start/End: Original strand, 18835124 - 18835374
Alignment:
Q  102 aatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtcctta 200  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  18835124 aatagtttatgttaaacttattttatttatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgttataatgttaataaagttctta 18835223  T
Q  201 gaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctt 300  Q
    ||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  18835224 gaatagatagtt---gcagtagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatctgtagtc-cagctt 18835319  T
Q  301 taatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    ||||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18835320 taatatggattga-aataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgat 18835374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20539953 - 20539674
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  20539953 tgttggtgtaagccattgagaccaatagtttatgttaaacttgtgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattataattg 20539854  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||    
T  20539853 ttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattaacataaagaacgttattctt 20539755  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||  ||  ||||| ||||||||||| | |||    |  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  20539754 aaatacatttgtagt-aaagctttaatgtaaattgggataataataataaagcgcatagacgattatgtatgtagactgatg 20539674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33843224 - 33843147
Alignment:
Q  1 caaagagttgcaaagaagaaatattcacaagaatcgtattgagatattagctgccaaatagatggcactccctccaac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33843224 caaagagttgcaaagaagaaatactcacaagaatcgtattgagatattagctgccaaatagatggcactccctccaac 33843147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 21914310 - 21914394
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21914310 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 21914394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 21862147 - 21862227
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatg 159  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21862147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8782365 - 8782188
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  8782365 tgttggtgtaagccctataggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcattacttt-attttt-aataaaatatgtcattctttattataattg 8782268  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 257  Q
       |||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8782267 ttgtaagattaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaaatgtgacttaatcatgggattacatta 8782188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 30174123 - 30174402
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174123 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 30174222  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174223 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 30174322  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174323 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30174402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24250587 - 24250309
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24250587 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatattta 24250488  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250487 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 24250388  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250387 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24250309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24229771 - 24229492
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24229771 ctgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 24229672  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  24229671 aaataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacattattctt 24229572  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229571 aaatgtgtccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24229492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Original strand, 19616197 - 19616460
Alignment:
Q  93 ctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga-taatgttaat 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||    
T  19616197 ctagcggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactcttttataatatttgttgtaatgttaat 19616296  T
Q  191 aaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgta 290  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||  |||    
T  19616297 aaagttcctagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcataagattacattaacataaagaacactattcttaaatgtatttgta 19616396  T
Q  291 gtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19616397 gtc-aagctttaatatgaat-tgggataataat-aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19616460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24764111 - 24763834
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||     
T  24764111 tgtttttgtaagccctggaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatatttg 24764012  T
Q  179 g-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
      ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | || | |||| |||||||    
T  24764011 ttataatgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaatagtatattaagcgtgacttaatcatgagattatattaacataaaaaacgatattctt 24763912  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24763911 aaatgcatctgtactc-aagctttaatatgaattga-gataataataaagcatcgagactattatttatgtagactgatg 24763834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15342548 - 15342280
Alignment:
Q  88 aagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatg-t 186  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||     ||| |    
T  15342548 aagccttagaggccaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattataattcttgtatgat 15342449  T
Q  187 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 286  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||     
T  15342448 taataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaccataaagaacactattctttaatgtata 15342349  T
Q  287 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
     |||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15342348 tgtagtc-aagatttaatataaat-tgggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagattgatg 15342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Original strand, 29800175 - 29800317
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  29800175 tgttggtgtaagccctagaggacaatattttatgttaaacttatactacgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattataatta 29800274  T
Q  179 -gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 220  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29800275 ttgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 29800317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Original strand, 21626429 - 21626647
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 177  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  || | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  21626429 tgttggtgtaagtcctagatgtcaatagtttatgttaaacttatgatatgcatcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatatttg 21626528  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
      ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||   | |||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||    
T  21626529 ttataagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacattaagtaagacttaatcatgacattacattaacataaagaacaatattctt 21626628  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaa 296  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21626629 aaaagtatccgaagtcaaa 21626647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28719241 - 28719170
Alignment:
Q  186 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28719241 ttaataaagtccttagaatatatagttcatgtgatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 28719170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18852286 - 18852167
Alignment:
Q  129 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 227  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||    |||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |  |    
T  18852286 tatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattatattttttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgt 18852187  T
Q  228 taagtgtgacttaatcatga 247  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18852186 taagtgtgacttaatcatga 18852167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28719100 - 28719053
Alignment:
Q  315 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtccat 362  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28719100 gataataataaaacgtagagactattatgtatgtagactgatgaccat 28719053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 357
Target Start/End: Original strand, 29800449 - 29800492
Alignment:
Q  314 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29800449 ggataataataaagcggaaagactattatgtatgtagactgatg 29800492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4230 - 3952
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4230 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 4131  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4130 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 4031  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11085 - 10851
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11085 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 10986  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10985 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 10886  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10885 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 130779 - 130501
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130779 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 130680  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130679 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 130580  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130579 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 130501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 138650 - 138471
Alignment:
Q  119 ctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgta 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138650 ctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgta 138551  T
Q  219 ataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  138550 ataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 138471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 141150 - 141112
Alignment:
Q  76 aactgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgtt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  141150 aactgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtt 141112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1586663 - 1586385
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586663 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1586564  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1586563 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 1586464  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586463 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 1586385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 16788818 - 16789096
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788818 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 16788917  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788918 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 16789017  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789018 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 16789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22860445 - 22860165
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22860445 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatt 22860346  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860345 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 22860246  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860245 taaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 87 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13995490 - 13995220
Alignment:
Q  87 taagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgt 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13995490 taagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgt 13995391  T
Q  187 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13995390 taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattcttaaatgtatc 13995291  T
Q  287 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995290 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 13995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18020396 - 18020118
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18020396 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattca 18020297  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18020296 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattattttaaagaacgctattctta 18020197  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020196 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27508903 - 27508624
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27508903 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27508804  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27508803 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattctt 27508704  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508703 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgtataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27508624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27528489 - 27528210
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27528489 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatattt 27528390  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27528389 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaaattacattatattatagaacgctattctt 27528290  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27528289 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27528210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 14074226 - 14074505
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074226 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaaaatatcttatgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatattt 14074325  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14074326 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactagtctt 14074425  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074426 aaatgtatatgtagtcaaagctttaatatgaataaagtataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 14074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8612664 - 8612940
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8612664 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattca 8612763  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8612764 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 8612863  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612864 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 281
Target Start/End: Original strand, 13947501 - 13947704
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947501 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatattt 13947600  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947601 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 13947700  T
Q  278 aaat 281  Q
    ||||    
T  13947701 aaat 13947704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5759034 - 5758758
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5759034 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattta 5758935  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  5758934 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacaatattatt 5758835  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5758834 aaatgtatccgtagt-aaagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagaatattatgtatgtagactgatg 5758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17121002 - 17120741
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccc-tagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17121002 tgttggtgtaagcccctagaggtcaatagtttatgttaaactcatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg--actctttattatattt 17120905  T
Q  178 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  17120904 ataataatgttaataaaatccctagaatagatagttcgtataataatatattaagtgtgacttagtcatgagattatattatcataaagaacgttattct 17120805  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 342  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17120804 taaatgtatccattgtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 17120741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20736882 - 20736605
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20736882 tgttggtgtatgccctagaggccaataggttatgttaatcttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatatttg 20736783  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||    
T  20736782 ttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaacataaagaacattattctt 20736683  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20736682 aaatgtatctgtagtc-aagctttaataagaa-ctgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 19218178 - 19218454
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19218178 ctgttggtgtaacccctatagtccaatagtttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattatattt 19218277  T
Q  178 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
        |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  19218278 gttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcataaagaatgctattct 19218377  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| | ||| |||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19218378 taaa-gcatcagtagtc-aagctttaatat--aaaggggataataataaagtgtagagactattatgtatgtagactgatg 19218454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 14996859 - 14997007
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14996859 tgttggtgtaagatctagaggccaatattttatgttaaacttatcttatgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttattatattta 14996958  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 227  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996959 tataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 14997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22560740 - 22560461
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||     |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22560740 tgttggtgtaagccctagaagccgatagtttatgttaaaattatgcagtgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttattatattta 22560641  T
Q  179 gat-aatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacg--ctattc 275  Q
        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  |||| |   ||| |    
T  22560640 ttgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggatattaagtgtgactcaatcatgagatgacattaacattaagaatgttttatcc 22560541  T
Q  276 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22560540 ttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatg 22560461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 351
Target Start/End: Original strand, 4073320 - 4073595
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| | |||| | ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||     
T  4073320 tgttggtgtaagtcttagatgccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgatttttatcattaaataaaatatggcattctttattacatttg 4073419  T
Q  179 gataatgt-----taataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 273  Q
      |  |||     ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||  |||    
T  4073420 tttgttgtaagattaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatggaaagaacattat 4073519  T
Q  274 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 351  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4073520 tcttaaaagtatccgtagtcaaa-ctttaatataaat-caggataataataaaacgtagagactattatgtttgtaga 4073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 357
Target Start/End: Original strand, 21994406 - 21994613
Alignment:
Q  149 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 247  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21994406 aataatatatgatactctttattatacttgttgtaatattaataaagtcccaataatagatagttcgtgtaatggtatattaattgtgacttaatcatga 21994505  T
Q  248 gattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 347  Q
    ||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  21994506 gattacattaatataaagaacactattcttaaatgtatccatagtc-gagctttaatataaat-tggaataataataaagcgcaaagactattatatatg 21994603  T
Q  348 tagactgatg 357  Q
    ||||||||||    
T  21994604 tagactgatg 21994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10359574 - 10359410
Alignment:
Q  94 tagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||| |||| ||||| ||||| || | ||||| ||| ||   ||||  |||||||    
T  10359574 tagaggtcaatagtttatgttaaacttatcgtatgtattatgatttttaatattaaataaaatatgacattatttatcataattgttataagattaataa 10359475  T
Q  193 agtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 257  Q
    ||||  || |||| ||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359474 agtctctataatatatagttgatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 10359410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 21993711 - 21993786
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataata 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21993711 tgttggtgtaagccctatagc-caataatttatgttaaacctatgatatgtatcatgacttttattattaaataata 21993786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 117
Target Start/End: Original strand, 11248530 - 11248569
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11248530 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaa 11248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10359368 - 10359326
Alignment:
Q  315 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10359368 gataataataaagcgtagagactattatatatgtagagtgatg 10359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23846755 - 23846668
Alignment:
Q  264 agaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  23846755 agaacactattcttaaaagtatctgtagtcaaa-ctttaatataaattg-ggataataatatagtacagagactattatgtatgtagact 23846668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 21033985 - 21034263
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033985 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 21034084  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034085 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 21034184  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034185 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21034263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 12299658 - 12299936
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12299658 tgttgatgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatattta 12299757  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299758 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 12299857  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299858 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 55426768 - 55427046
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55426768 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaatctatcttatgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 55426867  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426868 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtatgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 55426967  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426968 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 55427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15847091 - 15846813
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847091 tgttggtgtaagcgctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15846992  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15846991 gataatgttaataaattccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattttcttaaagaacgctattctta 15846892  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846891 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15846813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 14890138 - 14890416
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14890138 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 14890237  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890238 tataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 14890337  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14890338 aatgtatccgtattcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgttgagactattatgtatgtagactgatg 14890416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20148110 - 20147831
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148110 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 20148011  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20148010 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctta 20147911  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147910 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 79 - 353
Target Start/End: Original strand, 21398539 - 21398813
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21398539 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 21398638  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21398639 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaattatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 21398738  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398739 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgtcgagactattatgtatgtagact 21398813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25979282 - 25979006
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25979282 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 25979183  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25979182 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 25979083  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25979082 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 25979006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 325
Target Start/End: Original strand, 28087971 - 28088211
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 184  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28087971 tgtaatccctaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttagataat 28088070  T
Q  185 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgta 284  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |    
T  28088071 attaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaataga 28088170  T
Q  285 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28088171 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataa 28088211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 356
Target Start/End: Original strand, 11787384 - 11787611
Alignment:
Q  128 gtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11787384 gtatcatgacttttcttattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 11787483  T
Q  227 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11787484 ttaaatgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaa 11787581  T
Q  327 gcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11787582 gcgtcgagactattatgtatgttgactgat 11787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 14146769 - 14147046
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt- 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14146769 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatttg 14146868  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
      ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |  | || ||||||  |    
T  14146869 ttataagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgaaactacattaacattaacaaagctatttct 14146968  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14146969 aaatgtatctgtagtc-aagctttaacataaat-tgggataataataaagcacagagactattatatatgtagactgatg 14147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Original strand, 15526503 - 15526777
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  15526503 tgttggtgtaagccctataggccattaatttatgttaaacttaagctacgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattatatttg 15526602  T
Q  179 g-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
      ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  15526603 ttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaatattaagggtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattctt 15526701  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    ||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15526702 aaatgcatatgtagtc-aagctttaatataaatga--gataataataaagcgtagagactattatgtttgtagactgat 15526777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 213
Target Start/End: Original strand, 14225954 - 14226090
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagttt-atgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  | |||||||||||     
T  14225954 tgttggtgtaagctctagagaccaatatttttatgttaaatttatgttatgtatcatgacttttattattaaataagataacgcgttttttattatatta 14226053  T
Q  178 a-gataatgttaataaagtccttagaatagatagttc 213  Q
    |   |||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  14226054 actgtaagattaataaagtccctaaaatagatagttc 14226090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 9455863 - 9456141
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455863 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 9455962  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455963 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 9456062  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456063 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 9456141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42817544 - 42817266
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817544 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 42817445  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817444 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 42817345  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817344 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 42817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47668031 - 47667751
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47668031 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 47667932  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667931 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 47667832  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667831 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 77 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20391796 - 20391516
Alignment:
Q  77 actgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391796 actgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgagaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 20391697  T
Q  177 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391696 tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 20391597  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391596 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20780201 - 20779922
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780201 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttatatttatcttatgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatattt 20780102  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780101 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 20780002  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780001 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20779922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22670812 - 22670534
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670812 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 22670713  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670712 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22670613  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670612 aatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19706994 - 19706716
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19706994 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattta 19706895  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19706894 aacaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctta 19706795  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706794 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19706716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28135278 - 28135000
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135278 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 28135179  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  28135178 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctttaagaacgctattatta 28135079  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28135078 aatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatg 28135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43802921 - 43802642
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43802921 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacatatcttatgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatattt 43802822  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43802821 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaattatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 43802722  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802721 aaatgtattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 43802642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 22612234 - 22612517
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaa-taatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22612234 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatattt 22612333  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612334 agataatgttaataaagtccttagaatagaaagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22612433  T
Q  278 aaatgtatc----cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612434 aaatatatatattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 35930329 - 35930607
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35930329 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 35930428  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35930429 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctta 35930528  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35930529 aatgtatccgtagtcaaaactttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 35930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 79 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22235029 - 22234827
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 22234930  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234929 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 22234830  T
Q  279 aat 281  Q
    |||    
T  22234829 aat 22234827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8727412 - 8727692
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatct-atcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| | || || |||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8727412 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttataacttatattacatatcataacatttactattaaataatatatggcactctttatcatactt 8727511  T
Q  178 ag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
       |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||    
T  8727512 gttataatgttaataaagtccctagaataaatt-ttcgtgtaattttatattaagtgtgactaaatcataagattactttaacataaagaacgttattct 8727610  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8727611 gaaatctatctgtagtcaaa-ctttaatatgaattgagataataataataaagcgtcgagactattatctatgtagactgatg 8727692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 357
Target Start/End: Original strand, 633814 - 633959
Alignment:
Q  210 gttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  633814 gttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattaaattatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaa 633912  T
Q  310 taaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  633913 t-aaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 633959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21881931 - 21881653
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatt 176  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  21881931 tgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatt 21881833  T
Q  177 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 275  Q
    |    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || ||||    
T  21881832 tgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattc 21881733  T
Q  276 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  21881732 ttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 21881653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26923871 - 26923675
Alignment:
Q  108 ttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatag 206  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||   ||||||||    
T  26923871 ttatgttaaacttatcttatgtatca---cttttattattaaataatatatgacactctttattatatttgtagtgatgttaataaagtttctagaatag 26923775  T
Q  207 atagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatat 306  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26923774 atagttcgtgtaattgtatattgagtgtgacttaatcattagattacattaacataaataatgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatat 26923676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 348
Target Start/End: Original strand, 29096580 - 29096739
Alignment:
Q  186 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtat 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  | |||||  |||||||||| ||||    
T  29096580 ttaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcgtaagattacattaacaaaaagaactttattcttaaaagtat 29096679  T
Q  286 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgt 348  Q
      |||||| ||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29096680 atgtagtc-aagcttt-atatatatcga-gataataataaagcgtagagactattatgtatgt 29096739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 356
Target Start/End: Original strand, 16435837 - 16435877
Alignment:
Q  316 ataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16435837 ataataataaagcgtagagactaatatgtatgtagactgat 16435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 209
Target Start/End: Original strand, 16435649 - 16435728
Alignment:
Q  131 tcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata-tttagataatgttaataaagtccttagaatagata 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16435649 tcatgacttttattattaaataaaatgagacattctttattatattttatataagattaataaagttcttagaatagata 16435728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 118
Target Start/End: Original strand, 14482305 - 14482338
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14482305 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaat 14482338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 119477 - 119755
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119477 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 119576  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119577 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 119676  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119677 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatg 119755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8052 - 8330
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8151  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8152 tataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 8251  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8252 aatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15372 - 15100
Alignment:
Q  85 tgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15372 tgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataat 15273  T
Q  185 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15272 gttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgta 15173  T
Q  285 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15172 tccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 1
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  273 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttttgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatattta 174  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 74  T
Q  279 a----atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 347  Q
    |    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73 aatatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40249 - 40015
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40249 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 40150  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40149 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattctta 40050  T
Q  279 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40049 aatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 40015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 67928 - 67651
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67928 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 67829  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  67828 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattctt 67729  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67728 aaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 67651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19160
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttataaaaaaaatatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 19291  T
Q  178 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19290 agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 19191  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19190 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 19160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8847 - 9135
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatg-acttttattatt-gaataatatatggcactctttattatatt 176  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8847 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatatt 8946  T
Q  177 tagataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatag-aacgctatt 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8947 tagataatgttaataaagtaccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagtaacgctatt 9046  T
Q  275 ctt-aaatgtatccgtagtc-aaagc-tttaatatgaat-aaaggataat-aataaagcgt-cgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9047 cttaaaatgtatccgtagtcaaaagcttttaatatgaataaaaggataataaataaagcgtacgagactattatgtatgtagactgatg 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 150 - 357
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  150 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaataatgaga 100  T
Q  250 ttacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgta 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 ttacattatcttatagaacgctgttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataatggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtc 200  T
Q  350 gactgatg 357  Q
    ||||||||    
T  201 gactgatg 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45502 - 45226
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45502 tgttggtgtaagcccaaaaggccaatagtttctgttaaacttatcttatgcatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 45403  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45402 tagtaatgttaataaagtccttacaatagatagttcttgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 45303  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45302 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatattaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 45226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12083 - 11807
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12083 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtattta 11984  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11983 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 11884  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11883 aaatgtatctgtagtc-aatctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgaaactattatgtatgtagattgatg 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18969 - 18786
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18870  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctta 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18869 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctta 18786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 79 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 961
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1070  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctta 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1069 gataatgttaataaagtccttataatagatagtttttttaataatatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcttaaagaacgttattctta 970  T
Q  279 aatgtatcc 287  Q
    |||||||||    
T  969 aatgtatcc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Original strand, 76307 - 76496
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  76307 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatattta 76406  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  76407 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaac 76496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13489 - 13226
Alignment:
Q  94 tagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||    
T  13489 tagaggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatatttgtagtaatgctaataa 13390  T
Q  193 agtccttagaatagatagttcgtgt-aataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 291  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13389 agtccctagaatagatagttcatgtaaatgatatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaacataaaaaacagtattcttaaatgtatccatag 13290  T
Q  292 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13289 tc-aagctttaatattaat-tgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatg 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40542 - 40265
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  40542 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgctatgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttt 40443  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
       |||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  40442 ttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcatgagaatacattaacgtaaagaacgctattctt 40343  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40342 aaatgtatccatagtc-aagctttaatataaattga-gataataataaagcgccgagactattatgtatgtagactgatg 40265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 53521 - 53790
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  53521 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattcgattca 53620  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 277  Q
     | ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  53621 tagtaatgttaataaagtccctagagtaaatagttcatgtaatgatatattaagtgtg--------atgagattacattaacataaagaacactattctt 53712  T
Q  278 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53713 aaatgtatccgtattc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagtgtcaagactattatgtatgtagattgatg 53790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9672
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9516 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatattta 9615  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9616 gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34060 - 33927
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34060 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatattta 33961  T
Q  179 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33960 gataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 33927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26567
Alignment:
Q  138 ttttattattgaataatatatggcactctttattatatt--tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattatattcgttg-taatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatcgtatattaagtgtg 26511  T
Q  236 acttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 291  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26512 acttaatcatgagattacattataataaagaacgttattcttaaatgtatcagtag 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Original strand, 13740 - 13861
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 178  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13740 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13839  T
Q  179 ga-taatgttaataaagtcctt 199  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  13840 tagtaatgttaataaagtcctt 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8756
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagttt-atgttaaatctatcttacgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 177  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | ||||    
T  8479 tgttggtgtaaatcctagaggttaatagttttatgttaaaattattttatgtatcgtgatttttattattaaataaaatgaggtattctttatgaaattt 8578  T
Q  178 -agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 276  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  8579 gatataatattaataaagtccttagaatatatagttcaagtaatgg-acattatgtgagacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattct 8677  T
Q  277 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||||  |||||| ||| |||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8678 taaaagtatttgtagtc-aagttttaatataaattga-gatagtaataaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatg 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0783 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:

Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6284
Alignment:
Q  79 tgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatcttacgtatcatga 136  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6227 tgttggtgtaagccctagaagccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 83423 - 83292
Alignment:
Q  224 atattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataat 323  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| |||  |  | ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||  || ||||||||    
T  83423 atattaagtgagacttaattgtgagattaaattcacacaaagaatactattcttaaaagtatccgtagtcgaaa-tttaatataaattgag-ataataat 83326  T
Q  324 aaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 357  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  83325 aaagtgtatagactattatgtatgtagactgatg 83292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 126
Target Start/End: Original strand, 1825 - 1873
Alignment:
Q  78 ctgttgttgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaatctatctta 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1825 ctgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatctta 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University