View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8586_low_11 (Length: 378)

Name: NF8586_low_11
Description: NF8586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8586_low_11
NF8586_low_11
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-364)||(9315-9675)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (15-364)||(14079326-14079686)
chr8 (15-364)||(41628033-41628382)
chr8 (15-364)||(33424754-33425114)
chr8 (28-364)||(30825595-30825942)
chr8 (15-364)||(38961306-38961666)
chr8 (15-364)||(38991651-38992010)
chr8 (15-364)||(41976600-41976950)
chr8 (18-364)||(6477988-6478345)
chr8 (15-364)||(39203773-39204122)
chr8 (15-364)||(20663440-20663800)
chr8 (15-364)||(30548803-30549163)
chr8 (15-364)||(41906990-41907349)
chr8 (15-364)||(19247244-19247603)
chr8 (15-364)||(19320428-19320787)
chr8 (15-364)||(44383436-44383796)
chr8 (15-364)||(44213557-44213916)
chr8 (15-364)||(12759605-12759967)
chr8 (15-364)||(41155770-41156130)
chr8 (55-364)||(23626840-23627160)
chr8 (28-364)||(29433200-29433530)
chr8 (15-243)||(6301103-6301330)
chr8 (174-369)||(42811426-42811621)
chr8 (15-243)||(23967006-23967244)
chr8 (15-243)||(37029101-37029339)
chr8 (15-243)||(42061280-42061518)
chr8 (15-243)||(44939705-44939943)
chr8 (91-262)||(22343102-22343271)
chr8 (91-262)||(22354762-22354931)
chr8 (15-206)||(36602722-36602924)
chr8 (201-364)||(36598035-36598198)
chr8 (176-364)||(12250690-12250878)
chr8 (176-364)||(39444329-39444517)
chr8 (15-178)||(42811643-42811806)
chr8 (18-168)||(45294755-45294905)
chr8 (15-210)||(19396015-19396221)
chr8 (258-364)||(22342308-22342414)
chr8 (206-312)||(45294646-45294752)
chr8 (305-364)||(45294073-45294132)
chr8 (15-97)||(22345559-22345641)
chr8 (15-97)||(22357219-22357301)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (15-364)||(1073779-1074139)
chr6 (15-364)||(18599502-18599862)
chr6 (15-364)||(14888453-14888813)
chr6 (16-364)||(34855327-34855686)
chr6 (23-353)||(4423763-4424092)
chr6 (15-364)||(11945985-11946345)
chr6 (15-360)||(9979579-9979924)
chr6 (15-360)||(24445351-24445696)
chr6 (15-364)||(2520534-2520894)
chr6 (15-360)||(1219948-1220287)
chr6 (15-360)||(25532636-25532980)
chr6 (61-364)||(11935196-11935510)
chr6 (15-364)||(7222115-7222475)
chr6 (15-364)||(15275029-15275389)
chr6 (15-364)||(33978344-33978693)
chr6 (15-364)||(7219380-7219740)
chr6 (15-364)||(33321969-33322329)
chr6 (15-364)||(249283-249643)
chr6 (15-364)||(12580312-12580672)
chr6 (15-364)||(17938893-17939253)
chr6 (15-364)||(34320463-34320823)
chr6 (23-361)||(1931422-1931761)
chr6 (15-364)||(22374357-22374728)
chr6 (15-243)||(13457350-13457588)
chr6 (233-364)||(4424087-4424218)
chr6 (281-364)||(14831133-14831216)
chr6 (15-108)||(1080374-1080467)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (15-364)||(34686982-34687342)
chr1 (15-364)||(41830544-41830904)
chr1 (15-364)||(18813614-18813974)
chr1 (15-364)||(31619084-31619444)
chr1 (15-360)||(4891524-4891869)
chr1 (15-360)||(29186618-29186963)
chr1 (15-364)||(52522063-52522423)
chr1 (15-364)||(15314656-15315005)
chr1 (15-360)||(33361133-33361472)
chr1 (15-364)||(38845719-38846079)
chr1 (15-363)||(41963426-41963785)
chr1 (15-346)||(50560448-50560779)
chr1 (15-364)||(51966228-51966577)
chr1 (15-364)||(34691520-34691870)
chr1 (15-364)||(28566214-28566572)
chr1 (15-364)||(52309229-52309589)
chr1 (15-364)||(12713872-12714232)
chr1 (15-364)||(42681785-42682145)
chr1 (15-364)||(29841182-29841542)
chr1 (33-364)||(48339737-48340084)
chr1 (15-359)||(10694689-10695044)
chr1 (15-364)||(13662900-13663257)
chr1 (15-243)||(18111113-18111351)
chr1 (15-243)||(43255170-43255408)
chr1 (15-243)||(50395584-50395822)
chr1 (257-364)||(10763030-10763137)
chr1 (15-89)||(10762949-10763023)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (15-364)||(36633596-36633945)
chr2 (15-364)||(30567375-30567724)
chr2 (15-360)||(21097121-21097477)
chr2 (15-360)||(9544132-9544477)
chr2 (15-364)||(33664305-33664654)
chr2 (15-364)||(16724859-16725219)
chr2 (15-364)||(26821042-26821402)
chr2 (74-364)||(30571060-30571350)
chr2 (15-361)||(10048508-10048854)
chr2 (15-360)||(4291166-4291505)
chr2 (15-364)||(1515500-1515860)
chr2 (23-364)||(4810979-4811331)
chr2 (23-364)||(14752603-14752955)
chr2 (15-364)||(42884813-42885173)
chr2 (15-364)||(18093223-18093582)
chr2 (65-364)||(19168153-19168449)
chr2 (28-364)||(10822436-10822779)
chr2 (15-363)||(16883358-16883705)
chr2 (15-363)||(17041048-17041395)
chr2 (15-364)||(3710317-3710677)
chr2 (15-364)||(11866739-11867099)
chr2 (15-364)||(35358132-35358492)
chr2 (15-364)||(9917199-9917562)
chr2 (15-364)||(45205528-45205893)
chr2 (55-364)||(17036731-17037051)
chr2 (55-364)||(17091239-17091559)
chr2 (55-364)||(17025054-17025374)
chr2 (166-364)||(11447950-11448148)
chr2 (15-243)||(6343343-6343581)
chr2 (15-243)||(14323827-14324065)
chr2 (15-243)||(28501705-28501943)
chr2 (15-243)||(1993555-1993793)
chr2 (15-156)||(11447071-11447212)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (15-364)||(23766951-23767311)
chr7 (15-364)||(8926403-8926763)
chr7 (15-360)||(17170450-17170795)
chr7 (15-360)||(31898306-31898651)
chr7 (15-361)||(39649464-39649812)
chr7 (18-364)||(14308324-14308681)
chr7 (15-360)||(48528275-48528621)
chr7 (15-363)||(33030199-33030546)
chr7 (28-364)||(42245368-42245704)
chr7 (23-364)||(19520573-19520917)
chr7 (31-364)||(47173894-47174227)
chr7 (17-364)||(5962092-5962450)
chr7 (15-364)||(9226733-9227093)
chr7 (15-364)||(17477291-17477640)
chr7 (15-364)||(17575574-17575923)
chr7 (15-364)||(17481737-17482087)
chr7 (15-364)||(17571127-17571477)
chr7 (15-364)||(42686960-42687303)
chr7 (15-364)||(27735561-27735921)
chr7 (15-364)||(23300232-23300581)
chr7 (15-364)||(19034168-19034528)
chr7 (15-364)||(20720108-20720468)
chr7 (15-364)||(29490348-29490708)
chr7 (15-364)||(33230474-33230834)
chr7 (15-364)||(33639187-33639547)
chr7 (15-364)||(9148752-9149112)
chr7 (15-364)||(34282617-34282977)
chr7 (23-364)||(42917249-42917601)
chr7 (15-364)||(20764770-20765129)
chr7 (15-364)||(3794901-3795261)
chr7 (15-364)||(47164064-47164431)
chr7 (15-287)||(4481789-4482072)
chr7 (15-243)||(6911977-6912215)
chr7 (15-243)||(47573955-47574193)
chr7 (176-364)||(38435062-38435250)
chr7 (176-364)||(42996016-42996204)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (15-364)||(51247759-51248107)
chr3 (15-363)||(6104635-6104983)
chr3 (15-364)||(31369525-31369885)
chr3 (15-364)||(35088346-35088703)
chr3 (15-364)||(50771755-50772104)
chr3 (15-364)||(52841041-52841391)
chr3 (15-364)||(21700078-21700427)
chr3 (15-364)||(50740750-50741099)
chr3 (15-364)||(11326150-11326510)
chr3 (15-364)||(36167959-36168319)
chr3 (15-364)||(918068-918417)
chr3 (18-364)||(19893877-19894223)
chr3 (15-364)||(48976071-48976431)
chr3 (15-364)||(52853950-52854310)
chr3 (15-364)||(23192848-23193208)
chr3 (15-364)||(55295287-55295647)
chr3 (29-364)||(49112475-49112821)
chr3 (18-364)||(8242095-8242446)
chr3 (15-364)||(11951483-11951843)
chr3 (15-364)||(44073229-44073584)
chr3 (15-364)||(11598472-11598832)
chr3 (15-364)||(22477094-22477454)
chr3 (40-364)||(40827543-40827878)
chr3 (15-287)||(35436368-35436651)
chr3 (28-352)||(11382573-11382903)
chr3 (15-364)||(16495280-16495637)
chr3 (23-243)||(39796971-39797190)
chr3 (23-246)||(9879550-9879773)
chr3 (159-364)||(48521530-48521736)
chr3 (15-243)||(5252872-5253110)
chr3 (171-364)||(2845365-2845558)
chr3 (194-364)||(54793473-54793643)
chr3 (15-160)||(28164809-28164954)
chr3 (15-150)||(54793688-54793822)
chr3 (15-136)||(54512345-54512466)
chr3 (15-108)||(11952053-11952146)
chr3 (15-108)||(2845558-2845651)
chr3 (302-364)||(54512465-54512527)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (15-364)||(26321581-26321941)
chr5 (15-364)||(2194518-2194878)
chr5 (15-361)||(30141927-30142273)
chr5 (15-360)||(25697033-25697378)
chr5 (15-360)||(41690700-41691045)
chr5 (15-364)||(20996450-20996810)
chr5 (15-364)||(33611646-33612006)
chr5 (15-360)||(34717014-34717359)
chr5 (15-362)||(4881638-4881984)
chr5 (15-364)||(1852436-1852783)
chr5 (23-364)||(21029469-21029821)
chr5 (15-364)||(7285030-7285390)
chr5 (15-364)||(20349293-20349636)
chr5 (15-364)||(30688668-30689022)
chr5 (15-364)||(27065255-27065613)
chr5 (15-364)||(289961-290321)
chr5 (15-364)||(3151110-3151469)
chr5 (15-364)||(37463737-37464097)
chr5 (15-364)||(3397644-3398007)
chr5 (15-364)||(12588786-12589146)
chr5 (55-364)||(9701645-9701965)
chr5 (15-364)||(3210704-3211063)
chr5 (28-243)||(31296170-31296384)
chr5 (15-216)||(3027813-3028014)
chr5 (15-243)||(19394842-19395079)
chr5 (196-364)||(19447546-19447716)
chr5 (215-361)||(3028312-3028458)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (15-364)||(19831920-19832269)
chr4 (15-364)||(14830034-14830394)
chr4 (23-364)||(28135589-28135930)
chr4 (15-364)||(36856507-36856854)
chr4 (15-360)||(39715037-39715382)
chr4 (15-360)||(52800449-52800794)
chr4 (15-364)||(19590252-19590601)
chr4 (15-364)||(28120744-28121092)
chr4 (15-364)||(23478314-23478676)
chr4 (18-364)||(33503521-33503867)
chr4 (15-363)||(34057087-34057447)
chr4 (30-364)||(54332166-54332510)
chr4 (15-369)||(53341816-53342181)
chr4 (15-360)||(13627458-13627814)
chr4 (48-364)||(55999220-55999547)
chr4 (15-364)||(10259846-10260206)
chr4 (15-364)||(17739446-17739806)
chr4 (15-364)||(21564249-21564609)
chr4 (15-364)||(26924785-26925145)
chr4 (15-364)||(43331770-43332130)
chr4 (15-364)||(51451837-51452197)
chr4 (15-364)||(24077915-24078275)
chr4 (15-364)||(40621552-40621914)
chr4 (33-364)||(1943920-1944257)
chr4 (15-364)||(35496066-35496395)
chr4 (15-364)||(47720592-47720942)
chr4 (40-364)||(574669-575001)
chr4 (152-364)||(17698730-17698942)
chr4 (15-247)||(39745486-39745729)
chr4 (15-243)||(15520254-15520492)
chr4 (15-222)||(5274409-5274627)
chr4 (15-243)||(740923-741161)
chr4 (176-364)||(26870807-26870995)
chr4 (217-364)||(5272778-5272925)
chr4 (215-364)||(7644307-7644456)
chr4 (219-360)||(37702126-37702267)
chr4 (28-223)||(7644773-7644979)
chr4 (241-364)||(39743269-39743392)
chr4 (23-150)||(17698420-17698547)
chr4 (246-364)||(38007492-38007610)
chr4 (257-364)||(35708151-35708258)
chr4 (15-86)||(35712922-35712993)
chr4 (290-363)||(3839895-3839968)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (15-364)||(26868-27228)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-360)||(18898-19243)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (31-360)||(119443-119783)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (33-364)||(65143-65480)
scaffold0006 (15-364)||(152662-153022)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (15-219)||(13191-13395)
scaffold0069 (252-360)||(13394-13502)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (15-364)||(49455-49798)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (95-364)||(4597-4877)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (15-261)||(4866-5123)
scaffold0032 (15-261)||(11315-11572)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (200-364)||(1-165)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (176-364)||(898-1086)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-210)||(10991-11197)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (15-225)||(13493-13714)
scaffold0045 (310-364)||(13439-13493)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (176-308)||(54664-54796)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (90-206)||(1521-1648)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (257-364)||(30505-30612)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9675
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9315 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 9414  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9415 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9514  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9515 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 9614  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9615 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 9675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14079686 - 14079326
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079686 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14079587  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079586 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14079487  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14079486 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 14079387  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079386 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14079326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 41628033 - 41628382
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41628033 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgtaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 41628132  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628133 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcctgctacattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 41628232  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41628233 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcatttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 41628332  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41628333 gtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 41628382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33425114 - 33424754
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33425114 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 33425015  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33425014 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatccgttatgcta 33424915  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33424914 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccgtgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 33424815  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33424814 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 33424754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Original strand, 30825595 - 30825942
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825595 aatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 30825694  T
Q  128 gcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 216  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825695 gcatttatctagactttataggaggataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 30825794  T
Q  217 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30825795 aattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttttcaaacgaggtgt 30825894  T
Q  317 caagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825895 caagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 30825942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 38961306 - 38961666
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || || |||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38961306 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38961405  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38961406 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38961505  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961506 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 38961605  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961606 ccaaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38961666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 38991651 - 38992010
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || || |||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38991651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 38991750  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38991751 aatctacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 38991850  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991851 cctttattt-ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 38991949  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991950 ccaaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38992010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 41976600 - 41976950
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41976600 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacattgttaattggtcaacggggttcatat 41976699  T
Q  115 aatgtacatgcatgcattt-atctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 213  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41976700 aatgcacatgaatgcattttatttagcctttttaggaagataaattagaagtcattgtacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 41976799  T
Q  214 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  41976800 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccttgtttagcatttcccaaaagagg 41976899  T
Q  314 tgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41976900 tgtcaagaacaattctaaaagtaaagcgcaaaacaatcgctctcattgatg 41976950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6478345 - 6477988
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6478345 atcaatgtcaaatggtggcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaacttccatttgttttaacaatattaattgatcaacggggtacatataat 6478246  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6478245 gtacatgcatgcatttatctagactttatgggaagataataggaaaataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacat 6478146  T
Q  207 ttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6478145 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttaacatttccca 6478046  T
Q  307 aacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478045 aatgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 6477988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 39203773 - 39204122
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  39203773 gacatcaatgtcaaatggttctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcgaacggggtacatat 39203872  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  39203873 aatccacattcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcgtggtacattttctttagcttaaaatcaattatgctacattcatttta 39203972  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203973 taaattttatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 39204072  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||    | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39204073 gtcaagaaattttttgaaagaaaagcgcaaaacaataactctcattgatg 39204122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20663800 - 20663440
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20663800 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20663701  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20663700 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20663601  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  20663600 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 20663501  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20663500 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20663440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30549163 - 30548803
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30549163 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 30549064  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30549063 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 30548964  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  30548963 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 30548864  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30548863 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 30548803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 41906990 - 41907349
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41906990 gacatcaatgtcaaatggtgctcgctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcgtttgtttcaacaatgtta-ttggccaacggggtacatat 41907088  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41907089 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41907188  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41907189 ccttcattttataaattatatgtaattatatttgtatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttc 41907288  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41907289 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacattcactctcattgatg 41907349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 19247244 - 19247603
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  19247244 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19247343  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19247344 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19247443  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  19247444 cctttattt-atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttc 19247542  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19247543 ccgaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 19247603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 19320428 - 19320787
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  19320428 gacatcaatgtcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatat 19320527  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19320528 aatgcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 19320627  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  19320628 cctttattt-atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttc 19320726  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19320727 ccgaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 19320787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44383796 - 44383436
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44383796 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44383697  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||            |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44383696 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaaaaaaaaaagaagataaattagaagtcatgatacatgttctttaacttaaaatcagttatgcta 44383597  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  44383596 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttgatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtatagcatttc 44383497  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  44383496 ccaaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgtaagacaatcactttcattgatg 44383436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44213916 - 44213557
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44213916 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatg-gagagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 44213818  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44213817 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 44213718  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  44213717 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 44213618  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44213617 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 44213557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 12759605 - 12759967
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccat---ttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgca 111  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||    
T  12759605 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccataatttgtttcaacaattttaattggttaacgggtt-ca 12759703  T
Q  112 tataatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatg 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  12759704 tataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacaatttttttagcttaaaatcaattatg 12759803  T
Q  201 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12759804 ctacctttattttataaattatatataactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgaattagactaatattgttgttattttcctgtttagcat 12759903  T
Q  301 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759904 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 12759967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 41155770 - 41156130
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||    
T  41155770 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcttgagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaattttatttggtcaatggtgttcatat 41155869  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41155870 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaattcagttatgtta 41155969  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||  || |||| ||||||    
T  41155970 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatgttgttgttatttccctatttaacatttc 41156069  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41156070 ccaaacgcggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 41156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23627160 - 23626840
Alignment:
Q  55 gggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgat 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23627160 gggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatcaacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 23627061  T
Q  155 a-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23627060 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 23626961  T
Q  244 tcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgca 343  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23626960 tcttatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgca 23626861  T
Q  344 aaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  23626860 aaacaaacattctcattgatg 23626840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Original strand, 29433200 - 29433530
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||||    
T  29433200 aatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatgtaatccacatgcat 29433299  T
Q  128 gcatttatctagactttataggatgataa---attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 224  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29433300 gcatttatcttaactttataggaagataataggaaagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatctgttatgctaccttcattttataaattatat 29433399  T
Q  225 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 324  Q
    |||||| ||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29433400 gtaactttattcgcata---------catgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccatgtttagcatttcccaaaggaggtgtcaagaaca 29433490  T
Q  325 actctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29433491 attatgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 29433530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6301330 - 6301103
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6301330 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6301231  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6301230 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttta 6301132  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6301131 taaattatatgtaactatattcgcataca 6301103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 174 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42811621 - 42811426
Alignment:
Q  174 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811621 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 42811522  T
Q  274 tattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgtccat 369  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42811521 tattgcagttattttcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgaccat 42811426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23967244 - 23967006
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23967244 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 23967145  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23967144 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 23967046  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23967045 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 23967006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 37029101 - 37029339
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37029101 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 37029200  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37029201 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 37029299  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37029300 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 37029339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42061518 - 42061280
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42061518 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 42061419  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42061418 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 42061320  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42061319 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 42061280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 44939705 - 44939943
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44939705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 44939804  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44939805 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 44939903  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44939904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 44939943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22343271 - 22343102
Alignment:
Q  91 ttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22343271 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 22343172  T
Q  191 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22343171 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22343102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22354931 - 22354762
Alignment:
Q  91 ttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354931 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 22354832  T
Q  191 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22354831 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22354762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36602924 - 36602722
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36602924 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36602825  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36602824 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacattttctgtagcttaaaatcagttatgcta 36602725  T
Q  204 cct 206  Q
    |||    
T  36602724 cct 36602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36598198 - 36598035
Alignment:
Q  201 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36598198 ctacctttattttataaattatatgtaattatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcat 36598099  T
Q  301 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36598098 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaactatcactctcattgatg 36598035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12250878 - 12250690
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12250878 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 12250779  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  12250778 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 12250690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Original strand, 39444329 - 39444517
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39444329 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 39444428  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39444429 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 39444517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42811806 - 42811643
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42811806 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaacgttaattggtcaacggggtacatat 42811707  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacatttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42811706 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacatttt 42811643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45294905 - 45294755
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45294905 atcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcaaatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggttcatataat 45294806  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcat 168  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45294805 gcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataaattagaagtcat 45294755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19396221 - 19396015
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  19396221 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggagtacatat 19396122  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19396121 aatgtacatgcatacatttatctagactttatacgaagataattggaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttaagcta 19396022  T
Q  204 cctttat 210  Q
    |||||||    
T  19396021 cctttat 19396015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22342414 - 22342308
Alignment:
Q  258 atatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22342414 atatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaagaattctgaatggaaagcgcaaaacaatcactctc 22342315  T
Q  358 attgatg 364  Q
    |||||||    
T  22342314 attgatg 22342308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45294752 - 45294646
Alignment:
Q  206 tttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccc 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||    
T  45294752 tttattttatgaattatatgtaactatattcacatacattttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccccgtttagcatttccc 45294653  T
Q  306 aaacgag 312  Q
    |||||||    
T  45294652 aaacgag 45294646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45294132 - 45294073
Alignment:
Q  305 caaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45294132 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 45294073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22345641 - 22345559
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattg 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22345641 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22345559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22357301 - 22357219
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattg 97  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22357301 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22357219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1074139 - 1073779
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074139 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 1074040  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074039 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1073940  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1073939 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 1073840  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073839 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 1073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18599862 - 18599502
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599862 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 18599763  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599762 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18599663  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18599662 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 18599563  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599562 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14888813 - 14888453
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14888813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttcattggtcaacggggtgcatat 14888714  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888713 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14888614  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14888613 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 14888514  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888513 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14888453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 364
Target Start/End: Original strand, 34855327 - 34855686
Alignment:
Q  16 acatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatata 115  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34855327 acatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtgcatata 34855426  T
Q  116 atgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855427 atgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctac 34855526  T
Q  205 ctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34855527 ctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcc 34855626  T
Q  305 caaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855627 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34855686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 353
Target Start/End: Original strand, 4423763 - 4424092
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4423763 tgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataatgtaca 4423862  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423863 tgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 4423962  T
Q  223 atgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423963 atgtaactatattcgcatacattttatccatgtaaata-gcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 4424061  T
Q  323 caactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcac 353  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4424062 caattctgaaaggaaagcgcaaaacattcac 4424092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11946345 - 11945985
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11946345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11946246  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946245 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11946146  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11946145 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 11946046  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946045 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 11945985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9979924 - 9979579
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9979924 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9979825  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979824 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 9979725  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9979724 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 9979625  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9979624 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 9979579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 24445351 - 24445696
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24445351 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 24445450  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445451 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 24445550  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24445551 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 24445650  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24445651 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 24445696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 2520534 - 2520894
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520534 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagagatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2520633  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2520634 aatgtacttgcatgcatttatctagactttataggtagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgata 2520733  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2520734 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttc 2520833  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2520834 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgatg 2520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 1219948 - 1220287
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1219948 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1220047  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220048 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 1220147  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1220148 taaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 1220241  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1220242 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 1220287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 25532636 - 25532980
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25532636 gacatcaatgtcaaatggtgctatctatacatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25532735  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532736 aatgcacatgaatgcatttatctagcattt-taggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 25532834  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25532835 taaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 25532934  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25532935 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 25532980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 61 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11935510 - 11935196
Alignment:
Q  61 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------g 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  11935510 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagataatagg 11935411  T
Q  150 atgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11935410 atgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttat 11935311  T
Q  250 ccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11935310 ccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaa 11935211  T
Q  350 tcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||    
T  11935210 tcactctcattgatg 11935196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 7222115 - 7222475
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7222115 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcgtaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 7222214  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7222215 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagagaaattagaagtcatgctgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7222314  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7222315 cctttattttataaattatatgtaactgtattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 7222414  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222415 ccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 7222475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 15275029 - 15275389
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15275029 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatattcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 15275128  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15275129 aatgtacattcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 15275228  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  15275229 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgaacttatttccctgtttagcatttc 15275328  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275329 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 15275389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 33978344 - 33978693
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33978344 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaataatgttaattggtcaatggggtacatat 33978443  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33978444 aatgcacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttta 33978543  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33978544 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcatcatactaatattacaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 33978643  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33978644 gtcaagaataattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33978693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7219740 - 7219380
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| || |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7219740 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgccaatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatat 7219641  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7219640 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 7219541  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  7219540 cctttattttataaattagatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactattattacagttatttccctgtttagcatttc 7219441  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7219440 ccaaatgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 7219380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33322329 - 33321969
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33322329 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcaaatgtggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33322230  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322229 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33322130  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  33322129 cctttattttataaattatatgtaactatatctgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctctgtttcgcatttc 33322030  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322029 ccaaacgaggtgtcaagaacaattataaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33321969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 249283 - 249643
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  249283 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 249382  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  249383 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 249482  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  249483 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 249582  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  249583 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 249643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12580672 - 12580312
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12580672 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 12580573  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12580572 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 12580473  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12580472 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 12580373  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12580372 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 12580312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 17938893 - 17939253
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17938893 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacattt 17938992  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17938993 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagttatgctacatgttctttagcttaaaatcagttatggta 17939092  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17939093 cctttatttaataaattatttgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagcatttc 17939192  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17939193 tcaaatgatgtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaagcaatcactatcattgatg 17939253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 34320463 - 34320823
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34320463 gacatcaatgtcaaatggtgctagatatagatgcacaagcgggagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34320562  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||           ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34320563 aattcacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataataggaacatatattagaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 34320662  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||    
T  34320663 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataaatctcatccatgttaatatgtattagactaatgttgttgttatttccctgtttagcatttc 34320762  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34320763 acaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaactatcactctcattgatg 34320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 1931422 - 1931761
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||    
T  1931422 tgtcaaatgatgctagctatagatgcccatgcaggagcgatgtttaatttccgtttgcttcaacaatgttaattagccaacggggtacatataatccaca 1931521  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||    
T  1931522 tgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctta----------tgctacctttatt 1931611  T
Q  212 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1931612 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcattttccaaacga 1931711  T
Q  312 ggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 361  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  1931712 ggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagtgcaaaacaatcactctcattg 1931761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22374728 - 22374357
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22374728 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggaacatat 22374629  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaat---cagttatgc 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||          ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||   ||  ||||     
T  22374628 aatatacatgcatgcatttatctagacttttaagaagataataagaagataaattagaagtcatgctacattttctttagactaatattcgcatatatg- 22374530  T
Q  202 tacct-----ttattttataaat-----tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttct 291  Q
    || ||     ||||||||||  |     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374529 taactataaattattttatagttacatatatatgtaactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttct 22374430  T
Q  292 gtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  22374429 gtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaacagtcattctcattgatg 22374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13457588 - 13457350
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13457588 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13457489  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13457488 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 13457390  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13457389 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 13457350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 364
Target Start/End: Original strand, 4424087 - 4424218
Alignment:
Q  233 attcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4424087 attcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaa 4424186  T
Q  333 atgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4424187 aggaaagcgcaaaacaatcattctcaatgatg 4424218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 364
Target Start/End: Original strand, 14831133 - 14831216
Alignment:
Q  281 gttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14831133 gttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgttaagaacaattctaaaaagaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14831216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1080467 - 1080374
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1080467 gacatcaatgtcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 1080374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 34686982 - 34687342
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34686982 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 34687081  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687082 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34687181  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34687182 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 34687281  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687282 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34687342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41830904 - 41830544
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830904 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 41830805  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830804 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 41830705  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41830704 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 41830605  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830604 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 41830544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 18813614 - 18813974
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18813614 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 18813713  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813714 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 18813813  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18813814 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 18813913  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813914 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18813974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 31619084 - 31619444
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619084 gacatcaatgtcaaatgatgccagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31619183  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619184 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 31619283  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31619284 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattaaactaatattgcagttatttttctgtttggcatttc 31619383  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619384 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 31619444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 4891524 - 4891869
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4891524 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4891623  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891624 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 4891723  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4891724 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 4891823  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4891824 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 4891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29186963 - 29186618
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29186963 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 29186864  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186863 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 29186764  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29186763 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 29186664  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29186663 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 29186618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52522423 - 52522063
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  52522423 gacatcaatgttaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacggggtacatat 52522324  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52522323 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcaattatgcta 52522224  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  52522223 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatactgcagttattttcctatttagcatttc 52522124  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522123 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 52522063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 15314656 - 15315005
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15314656 gacatcaatgtcaaatggtgatagctataaatgcaaatgaaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 15314755  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15314756 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttta 15314855  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15314856 taaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 15314955  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314956 gtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 15315005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 33361133 - 33361472
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33361133 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33361232  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361233 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 33361332  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  33361333 taaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaatgaggt 33361426  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33361427 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 33361472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38846079 - 38845719
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38846079 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 38845980  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38845979 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 38845880  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38845879 cctttattttataaattatatgtaaatatattcaaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 38845780  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845779 ccaaacgaggtgtcaagaataattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38845719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41963785 - 41963426
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||| |  |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41963785 gacatcaatgtcaaatggtaccggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 41963686  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41963685 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataagaggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttacgcta 41963586  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41963585 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 41963486  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41963485 tcaaacggggtgtgaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 41963426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 346
Target Start/End: Original strand, 50560448 - 50560779
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50560448 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50560547  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50560548 aatgcacatgaatgaatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttatttagcttaaaatcagttatgctatctttatttta 50560647  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50560648 taaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcactagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 50560747  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaa 346  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  50560748 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaa 50560779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51966577 - 51966228
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51966577 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagagatgcttaatttccatttgtatcaacaatgttaattggtcaacggagttcatat 51966478  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51966477 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattatgctacctatatttta 51966378  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  51966377 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtattaaactaatattgttgttatttccctgtttagcattttccaaacgaggt 51966278  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51966277 gtcaagaacaattctaaaaggaatacgcaaaacaatcactctcattgatg 51966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 34691520 - 34691870
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34691520 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 34691619  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691620 aatgtacacgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 34691719  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  34691720 cctttattttataaa----------ctatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcatatttagcatttc 34691809  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691810 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34691870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28566572 - 28566214
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  28566572 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatat 28566473  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28566472 aatccacatgcatgcatatatctagactttataggaatataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 28566373  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||    
T  28566372 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttc 28566275  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566274 ccaaacgatgtgttaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 28566214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 52309229 - 52309589
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52309229 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttgcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52309328  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||            |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52309329 aatgcacatgaatgcatttacctagccttcttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 52309428  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  52309429 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtgtagcatttc 52309528  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52309529 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcgttgatg 52309589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 12713872 - 12714232
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12713872 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacaaggtgcatat 12713971  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  12713972 aatccacatgcatgcattaatctagactttataggaatataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttttttaacttaaaatcagttatgata 12714071  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||     
T  12714072 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatctccctgtttagcatttt 12714171  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12714172 ccaaacgatgtgttaaaaacaattctgaaagaaaatcgcaaaacaatcactctcattgatg 12714232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 42681785 - 42682145
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||    
T  42681785 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacgggattcatat 42681884  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681885 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 42681984  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  42681985 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttc 42682084  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42682085 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 42682145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29841542 - 29841182
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  29841542 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 29841443  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29841442 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 29841343  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  29841342 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttc 29841243  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29841242 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 29841182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Original strand, 48339737 - 48340084
Alignment:
Q  33 tgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 132  Q
    ||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48339737 tgctagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgtacatgcatgcatt 48339836  T
Q  133 tatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa--- 218  Q
    |||||||||||||||           ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  48339837 tatctagactttatattaagataataggaagataaattagaaatcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgatacctttattttataaatta 48339936  T
Q  219 --ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 316  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  48339937 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttctcaaatgaggtgt 48340036  T
Q  317 caagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48340037 caagaacaattatgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 48340084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10695044 - 10694689
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10695044 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtaatgcttagtttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 10694945  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10694944 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagatcaattagaggtcatgatacattttctttagcttaaagtaagttatgcta 10694845  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  10694844 catttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttcactgtttagcatttc 10694745  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcat 359  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  10694744 tcaaacaaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaggtgcaaaacaatcacactcat 10694689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13663257 - 13662900
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13663257 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 13663158  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||           ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13663157 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 13663058  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||    
T  13663057 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttc 13662960  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13662959 ccaaacaaggtattaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa-aatcactctcattgatg 13662900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 18111113 - 18111351
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18111113 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 18111212  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18111213 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 18111311  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18111312 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 18111351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43255408 - 43255170
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43255408 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 43255309  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43255308 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 43255210  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43255209 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 43255170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50395822 - 50395584
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50395822 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 50395723  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50395722 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 50395624  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50395623 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 50395584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 364
Target Start/End: Original strand, 10763030 - 10763137
Alignment:
Q  257 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  10763030 aatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactct 10763129  T
Q  357 cattgatg 364  Q
     |||||||    
T  10763130 aattgatg 10763137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 10762949 - 10763023
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 89  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10762949 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 10763023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36633945 - 36633596
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36633945 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 36633846  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633845 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 36633746  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36633745 taaattatatgtaactatattcgattacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 36633646  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36633645 gtcaagaacgattctgaaaggaaagcgcaaaactatcactcttattgatg 36633596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30567724 - 30567375
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| | || |||||| ||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30567724 gacatcaatttcaaatggttctagctatatatgcacatgtggtagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 30567625  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567624 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 30567525  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30567524 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 30567425  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30567424 gtcatgaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 30567375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 21097121 - 21097477
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097121 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 21097220  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21097221 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaattagttatgcta 21097320  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21097321 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 21097420  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21097421 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcatt 21097477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9544477 - 9544132
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9544477 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9544378  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544377 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 9544278  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9544277 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 9544178  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544177 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 9544132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33664654 - 33664305
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33664654 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatat 33664555  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33664554 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatggtacctttatttaa 33664455  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33664454 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtactagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 33664355  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33664354 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactttcattgatg 33664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16725219 - 16724859
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16725219 gacatcaatgtcaaatgatgctagttatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatgcatat 16725120  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16725119 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 16725020  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16725019 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttagccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctctttagcatttc 16724920  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724919 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 16724859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 26821042 - 26821402
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26821042 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 26821141  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821142 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataagatgataaattagaagccatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26821241  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26821242 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcctttc 26821341  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821342 ccaaacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 26821402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 74 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30571350 - 30571060
Alignment:
Q  74 catttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30571350 catttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctac 30571251  T
Q  174 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571250 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 30571151  T
Q  274 tattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30571150 tattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcatgaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 30571060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10048854 - 10048508
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10048854 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 10048755  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048754 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatatattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttta 10048655  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  10048654 taaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattattgttatttccctgtttagcatttcccaaaccaggt 10048555  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 361  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10048554 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctaattg 10048508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4291505 - 4291166
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4291505 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 4291406  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291405 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 4291306  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4291305 taaattatatgtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 4291212  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4291211 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 4291166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1515860 - 1515500
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1515860 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1515761  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515760 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 1515661  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  1515660 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtttttatttatctgtttagcatttc 1515561  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1515560 ccaaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacattcactctcattgatg 1515500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 4810979 - 4811331
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4810979 tgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgaaca 4811078  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||           ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4811079 tgcatgcatatatctagactttatatgaagataataggaatataaattagaagtcatgatacattttttttagcttaaaatcagttacgctacctttatt 4811178  T
Q  212 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  4811179 ttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactgatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaatga 4811278  T
Q  312 ggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811279 ggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 4811331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 14752603 - 14752955
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  14752603 tgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagcgatgcataattttcgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccaca 14752702  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14752703 tgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatt 14752802  T
Q  212 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||    
T  14752803 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccatgtttagcatttcccaaatga 14752902  T
Q  312 ggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14752903 ggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 14752955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 42884813 - 42885173
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42884813 gacatcaatgtcaaatggtgtcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttacatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 42884912  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42884913 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtaatgtta 42885012  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  42885013 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattaaactaatattgtagttattttcctgtttatcatttc 42885112  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42885113 ccgaacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaataactctcattgatg 42885173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18093582 - 18093223
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18093582 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcatctgtttcagcaatgttaattggtcaacggggttcatat 18093483  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18093482 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagt-atgcta 18093384  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  18093383 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttc 18093284  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093283 ccaaacgagatgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18093223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19168449 - 19168153
Alignment:
Q  65 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  19168449 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatatattgtacatgcatgcagttatctagact--ataggaagataaattagaag 19168352  T
Q  165 tcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgca 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19168351 tcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttaaaaattatatgtaactatattcgcagacatcttatccatgtaaatatgca 19168252  T
Q  265 ttagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168251 tta-actaatattgtagttattttcctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaataattctgaaaagaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19168153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10822779 - 10822436
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  10822779 aatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgtggtacatataatccacatgcat 10822680  T
Q  128 gcatttatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaatt 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  10822679 gcatttatctatactatataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttttgctaccttcattttataaatc 10822580  T
Q  221 atatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaag 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10822579 atatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcattttccaaacgaggtgtcaag 10822480  T
Q  321 aacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822479 aaaaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 10822436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 16883358 - 16883705
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  16883358 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 16883457  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16883458 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttta 16883557  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  16883558 taacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagca-ttcccaaacgaggt 16883656  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16883657 gtcaagaacaattttgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgat 16883705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 17041048 - 17041395
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  17041048 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatat 17041147  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17041148 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttta 17041247  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  17041248 taacttatatgtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagca-ttcccaaacgaggt 17041346  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17041347 gtcaagaacaattttgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgat 17041395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 3710317 - 3710677
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3710317 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 3710416  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3710417 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 3710516  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  3710517 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 3710616  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3710617 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 3710677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11867099 - 11866739
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11867099 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 11867000  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11866999 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 11866900  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  11866899 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 11866800  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11866799 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 11866739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35358492 - 35358132
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35358492 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 35358393  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35358392 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 35358293  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  35358292 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 35358193  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35358192 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 35358132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9917562 - 9917199
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9917562 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 9917463  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagctta---aaatcagttatg 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  9917462 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagcttattaaaatcagttatg 9917363  T
Q  201 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||    
T  9917362 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttattttcctgtttagtat 9917263  T
Q  301 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9917262 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcttaaagcaatcactctcattgatg 9917199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45205893 - 45205528
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||  ||| ||| |||| ||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45205893 gacatcaaggtcaaattgtgcaagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 45205794  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45205793 aatgtagatgcatgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaagtcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgcta 45205694  T
Q  204 cctttattttataaatta-----tatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagc 298  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45205693 cctttattttataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttccctgtttagc 45205594  T
Q  299 atttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45205593 atttcccaaacgaggtgtaaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 45205528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Original strand, 17036731 - 17037051
Alignment:
Q  55 gggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgat 154  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17036731 gggagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17036830  T
Q  155 a-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17036831 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17036930  T
Q  244 tcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgca 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17036931 tcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgca 17037030  T
Q  344 aaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  17037031 aaacaaacattctcattgatg 17037051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Original strand, 17091239 - 17091559
Alignment:
Q  55 gggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgat 154  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17091239 gggagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17091338  T
Q  155 a-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17091339 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17091438  T
Q  244 tcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgca 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17091439 tcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgca 17091538  T
Q  344 aaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  17091539 aaacaaacattctcattgatg 17091559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Original strand, 17025054 - 17025374
Alignment:
Q  55 gggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgat 154  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17025054 gggagtgatgtttcatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 17025153  T
Q  155 a-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17025154 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 17025253  T
Q  244 tcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgca 343  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17025254 tcttatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgca 17025353  T
Q  344 aaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| || ||| |||||||    
T  17025354 aaacaaacattcttattgatg 17025374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 364
Target Start/End: Original strand, 11447950 - 11448148
Alignment:
Q  166 catgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcat 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11447950 catggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaaatatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcat 11448049  T
Q  266 tagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448050 tagactaatattgaagttatttccctctttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 11448148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6343581 - 6343343
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6343581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6343482  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6343481 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6343383  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6343382 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14324065 - 14323827
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14324065 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 14323966  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14323965 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 14323867  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14323866 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 14323827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 28501705 - 28501943
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28501705 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 28501804  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||           ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28501805 aatgcacatacatgtatttatctagactttctaggaagataataagaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 28501903  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28501904 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 28501943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1993793 - 1993555
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1993793 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 1993694  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1993693 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 1993595  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1993594 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 1993555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 11447071 - 11447212
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11447071 gacatcaatgtcagatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttacatat 11447170  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447171 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataa 11447212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23767311 - 23766951
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767311 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23767212  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23767211 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagtcatgcta 23767112  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23767111 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 23767012  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23767011 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 23766951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8926763 - 8926403
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926763 gacatcaatgtcaaatggtgctggctataaatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 8926664  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttta-----------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926663 aatgtacatgcatgcatttatctagactttacaggaagataataggatgataaattaaaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 8926564  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8926563 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcatttc 8926464  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8926463 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaaaaatcactctcattgatg 8926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 17170450 - 17170795
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17170450 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17170549  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170550 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 17170649  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17170650 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 17170749  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17170750 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 17170795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31898651 - 31898306
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31898651 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 31898552  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898551 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 31898452  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31898451 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttattgccctgtttagcatttcccaaacgaggt 31898352  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31898351 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 31898306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39649812 - 39649464
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39649812 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39649713  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649712 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 39649613  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagacta--atattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgag 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39649612 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgag 39649513  T
Q  313 gtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 361  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39649512 gtgtcaagaacaattctaaaaggaaatcgcaaaacaatcactctcattg 39649464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 14308324 - 14308681
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14308324 atcaatgtcaaatggtgctggctatatatacacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttgcatataat 14308423  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308424 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 14308523  T
Q  207 ttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  14308524 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgttgttattttcctgtttagcatttccca 14308623  T
Q  307 aacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308624 aacgatgtgtcaagaacaattctgaaagtaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14308681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48528621 - 48528275
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgt-ttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcata 113  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48528621 gacatcatcgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtgttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 48528522  T
Q  114 taatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528521 taatgcacatgaatgcatttatctagcctttttacgaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 48528422  T
Q  214 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48528421 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 48528322  T
Q  314 tgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48528321 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 48528275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 33030199 - 33030546
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33030199 gacatcaatgtcaaatggtactagctatatatgcacatgcggaagtggtgcttaattttcatttgtttcaagaatgttaattggtcaacggggtacatat 33030298  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33030299 aatgtacatacatacatttatctagactttataggaagataaattagaagtcacgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttta-ttta 33030397  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33030398 taaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatgctaatattgcagttatttttctatttagcatttcccaaacgaggt 33030497  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33030498 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 33030546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42245704 - 42245368
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  42245704 aatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcaaacggggtacatataatccacatgcat 42245605  T
Q  128 gcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgta 227  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245604 gcatttatccaaactttataggaagataaattagaagtcatggtacagtttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatgta 42245505  T
Q  228 actatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaact 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42245504 actatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaggaggtgtcaagaacaatt 42245405  T
Q  328 ctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245404 ctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42245368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 19520573 - 19520917
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat---gt 119  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |     
T  19520573 tgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatcatgc 19520672  T
Q  120 acatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520673 acatgcatgaatttatctagactttataggaagataaactagaaatcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 19520772  T
Q  220 tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19520773 tatatgtaactatattcgcatacatcttatcaatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctctttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 19520872  T
Q  320 gaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520873 aaacaattttgaaagggaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19520917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Original strand, 47173894 - 47174227
Alignment:
Q  31 ggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgca 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  47173894 ggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaagttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgcacatgcgtgca 47173993  T
Q  131 tttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaact 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  47173994 tttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcggttatgctacctttactttataaattatatataatt 47174093  T
Q  231 atattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47174094 atattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattaaactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaataattctg 47174193  T
Q  331 aaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  47174194 aaaggaaagcgcaaaacagtcgctctaattgatg 47174227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 364
Target Start/End: Original strand, 5962092 - 5962450
Alignment:
Q  17 catcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataa 116  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5962092 catcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgttttattaatgttaattggtcaacggggtacatataa 5962191  T
Q  117 tgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962192 tgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacc 5962291  T
Q  206 tttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5962292 tttattttataaattatatgtaattatattcgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttccc 5962391  T
Q  306 aaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5962392 aaacgaggtgtcaagaacatttctgaaaggaaagcgcaaaacaatcattctcattgatg 5962450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9227093 - 9226733
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9227093 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcatatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 9226994  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226993 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 9226894  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  9226893 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagcatttc 9226794  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9226793 ccaaacgaggtgtcaagaacaattttgaaagaaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 9226733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 17477291 - 17477640
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17477291 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17477390  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17477391 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaa 17477490  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17477491 taaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 17477590  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477591 gtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17477640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17575923 - 17575574
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17575923 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17575824  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17575823 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaa 17575724  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17575723 taaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 17575624  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575623 gtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17575574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 17481737 - 17482087
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17481737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17481836  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttcttt-agcttaaaatcagttatgctacctttatttt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17481837 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggtacctttattta 17481936  T
Q  214 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17481937 ataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 17482036  T
Q  314 tgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482037 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17482087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17571477 - 17571127
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17571477 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 17571378  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttcttt-agcttaaaatcagttatgctacctttatttt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17571377 aatgtacatgcatgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggtacctttattta 17571278  T
Q  214 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17571277 ataaactatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 17571178  T
Q  314 tgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571177 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17571127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 42686960 - 42687303
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42686960 gacatcaacgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 42687059  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||||||||   |  ||      |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42687060 aatgtacatgcatgcaggaagata------ataggaagataaattagaggtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttatttta 42687153  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  42687154 taaattacatgtatctatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaagt 42687253  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687254 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42687303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27735921 - 27735561
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27735921 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 27735822  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27735821 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 27735722  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  27735721 cctttcttttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttc 27735622  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27735621 acaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 27735561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23300581 - 23300232
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  23300581 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtaatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggatcctat 23300482  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23300481 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagatatattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 23300382  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| || ||||||||    
T  23300381 taaattacatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccatgtttagcattttccgaacgaggt 23300282  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23300281 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 23300232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19034528 - 19034168
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19034528 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 19034429  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19034428 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 19034329  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  19034328 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 19034229  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19034228 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 19034168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 20720108 - 20720468
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20720108 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20720207  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20720208 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20720307  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  20720308 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 20720407  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20720408 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20720468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 29490348 - 29490708
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29490348 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacattcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 29490447  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29490448 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 29490547  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29490548 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttattttcctgtttagcatttc 29490647  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29490648 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 29490708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33230834 - 33230474
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33230834 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaaaggggtacatat 33230735  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33230734 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 33230635  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  33230634 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 33230535  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33230534 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 33230474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33639547 - 33639187
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33639547 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 33639448  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||            |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639447 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaaaataatatgaagataaattagaattcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33639348  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||||  || |||||||||||    
T  33639347 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtaatagactaatattgtttttatttccctatttagcatttc 33639248  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639247 ccaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33639187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 9148752 - 9149112
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9148752 gacatcattgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagcgatacttaattttcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 9148851  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9148852 aatgcacatgaatgtatttatctaccctttttaggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttattcta 9148951  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||    
T  9148952 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccttgtttagcatttc 9149051  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9149052 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgaaaaacaatcactctcattgatg 9149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34282977 - 34282617
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34282977 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggaatgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 34282878  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34282877 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 34282778  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  34282777 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 34282678  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34282677 ccaaactaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 34282617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 42917249 - 42917601
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||    
T  42917249 tgtcaaatggtgctacctatagacgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacgaagttcatataatgcaca 42917348  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 211  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||           ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917349 tgcatgcatttatctaaccttcatatgaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 42917448  T
Q  212 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42917449 ttatgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacga 42917548  T
Q  312 ggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917549 ggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42917601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 20764770 - 20765129
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20764770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatg-gggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 20764868  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20764869 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 20764968  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  20764969 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccatgtttagcatttc 20765068  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20765069 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20765129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 3794901 - 3795261
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  3794901 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatat 3795000  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3795001 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgcta 3795100  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  3795101 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttc 3795200  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795201 tcaaacgaggtgtcaagaataattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 3795261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47164431 - 47164064
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  47164431 gacatcaatgttaaatggtgctagctataaatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 47164332  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagt 196  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||           |||||       |  || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47164331 agttcacatgcatgcatttatctatactctataggaagataatatgaagataaattagttatgctacttcctggtacattttctttagcttaaaatcagt 47164232  T
Q  197 tatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgttta 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||    
T  47164231 tatgctaccttcattttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagagtcatattgcagttatttccctgttta 47164132  T
Q  297 gcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47164131 gcatttcccaaacgaggtgtcaagaaaaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 47164064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4482072 - 4481789
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4482072 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 4481973  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4481972 aatccatatacatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgcta 4481873  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4481872 ccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgttaatatgcattaaactaatattgcagttattt 4481789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6912215 - 6911977
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6912215 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 6912116  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6912115 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 6912017  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6912016 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 6911977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47574193 - 47573955
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47574193 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 47574094  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47574093 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 47573995  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47573994 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 47573955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38435250 - 38435062
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38435250 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 38435151  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38435150 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 38435062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Original strand, 42996016 - 42996204
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42996016 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 42996115  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  42996116 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 42996204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 51247759 - 51248107
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51247759 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 51247858  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247859 aatgtacatgcgtgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 51247958  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51247959 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcatttcccaaacgaggt 51248058  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248059 g-cgagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 51248107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6104983 - 6104635
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6104983 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatggacatgcggaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtctacggggtgcatat 6104884  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104883 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 6104784  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  6104783 taaattatatgtaactatattcgcatgcatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcccgtttaacatttcccaaacgagtt 6104684  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104683 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 6104635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31369885 - 31369525
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369885 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 31369786  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttta-----------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31369785 aatgtacatgcatgcatttatctagactttagaggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaataagttatgcta 31369686  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31369685 cctttattttataaattatacgtaactatattcatatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 31369586  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369585 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 31369525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35088703 - 35088346
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35088703 gacatcaatgtcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 35088604  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt--------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088603 aatgtacatgcatgcatttatctagacttttgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 35088504  T
Q  207 ttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  35088503 ttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagccttttcca 35088404  T
Q  307 aacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088403 aacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 35088346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50772104 - 50771755
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50772104 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggtgcatat 50772005  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  50772004 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaa 50771905  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50771904 taaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 50771805  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771804 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 50771755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52841391 - 52841041
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52841391 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 52841292  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  52841291 aatgtacatgcatgcatttatctggactttgtaggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcggttatgccacctttatttca 52841192  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  52841191 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagacttatattgcagttatttccctgtttagcatttctcaaacgaggt 52841092  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatg-aaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841091 gtcaagaacaattctgaaaggaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 52841041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21700427 - 21700078
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  21700427 gacatcaatgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtaaatat 21700328  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700327 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 21700228  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  21700227 taaataatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattccagttattttcatgtttagcatttctcaaacgacgt 21700128  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700127 gtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 21700078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 50740750 - 50741099
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50740750 gacatcaatgtcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggttcatat 50740849  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  50740850 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaa 50740949  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50740950 taaattatatgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctttttagcatttcccaaacgaggt 50741049  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50741050 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 50741099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11326510 - 11326150
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11326510 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 11326411  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326410 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 11326311  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||    
T  11326310 cctttattttataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagagtaatattgtagttattttcctgtttggcgtttc 11326211  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11326210 ccaaacgaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 11326150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36168319 - 36167959
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36168319 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtgcatat 36168220  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36168219 aatccacatgcatgcatttttctagactttataggaagctaataagaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgata 36168120  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36168119 ccttgattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatacgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttc 36168020  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36168019 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 36167959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 918068 - 918417
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  918068 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 918167  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  918168 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttca 918267  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  918268 taagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactatgt 918367  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  918368 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 918417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19894223 - 19893877
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19894223 atcattgtcaaatggtcttagctaaagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtctacggggttcatataat 19894124  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 217  Q
    | ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19894123 gcacatgaatgcatttatctagcctatttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 19894024  T
Q  218 attatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 317  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19894023 gttatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagagtaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgagatgtc 19893924  T
Q  318 aagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19893923 aagaacgattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 48976071 - 48976431
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48976071 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataattttcatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 48976170  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||           |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976171 aatgtacatgtatgcatttatctatactttataggaagataatatgaagataaattagaagtcaagctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 48976270  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976271 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 48976370  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48976371 ccaaacgaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcggaaaacaatcactctcattgatg 48976431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52854310 - 52853950
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52854310 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatccacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 52854211  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  52854210 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagatgataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgata 52854111  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52854110 tctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattatactaatattgcagttatttttctgtttagcatttg 52854011  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52854010 ccaaacgacgtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctctttgatg 52853950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 23192848 - 23193208
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| || | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23192848 gacatcaatgtcaaattgtgctagctatatatgcccatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatacatat 23192947  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23192948 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 23193047  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23193048 cctttattataaaaattaaatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttc 23193147  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193148 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 23193208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55295647 - 55295287
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  55295647 gacatcattgtcaaatggtgctagctataaattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatat 55295548  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55295547 aatgcacatgaatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaataagttatgcta 55295448  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  55295447 cctttcttttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttc 55295348  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295347 acaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 55295287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 49112475 - 49112821
Alignment:
Q  29 atggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatg 128  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49112475 atggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataatttccatttgtttcaacaatgttgtttggtcaacggggtacatataatgtacatgcatg 49112574  T
Q  129 catttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 217  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||           |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112575 catttatctagactttatatgaagataataagaagataaattagaattcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 49112674  T
Q  218 attatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49112675 attatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttttcaaacgaggtgtc 49112774  T
Q  318 aagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49112775 aagaacaattctgaaagaaaagtgcaaaacaatcactctcattgatg 49112821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Original strand, 8242095 - 8242446
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8242095 atcaatgtcaaatggtgctagcaatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataat 8242194  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     ||||||    
T  8242195 gcacatgcatgcatttatctagactctataagaagataagaggaagataaattagaagtcatgatacattt-ctttagcttaaaatcag-----ctacct 8242288  T
Q  207 ttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8242289 ttattttataaattatatgtaactacattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcatttctca 8242388  T
Q  307 aacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8242389 aacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 8242446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11951843 - 11951483
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11951843 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatat 11951744  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11951743 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttgaaatcagttatgcta 11951644  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||||    
T  11951643 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatactgttcttatttccctgtttagcatttc 11951544  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11951543 acaaatgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 11951483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44073584 - 44073229
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44073584 gacatcaatatcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatat 44073485  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttta------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttt 208  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |      ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  44073484 aatgcacatgcatgcatttctctagacttgaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttc 44073385  T
Q  209 attttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaa 308  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44073384 atttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaa 44073285  T
Q  309 cgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44073284 ctaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataattactctcattgatg 44073229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11598832 - 11598472
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11598832 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11598733  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| | |||  ||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  11598732 aatgcatatgagtgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattaagata 11598633  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||     
T  11598632 cctttattttataaattatatgtaactatattagcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctctgtttaacatttt 11598533  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  11598532 ccaaacgaggtgtcaagaacaaatctaaaaggaaagtgcaaaacaattaccctcattgatg 11598472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 22477094 - 22477454
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  22477094 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattagttggtcaacggagttcatat 22477193  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477194 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 22477293  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  22477294 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttc 22477393  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22477394 ccaaacgaggtgtcaagaacaattcaaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 22477454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40827878 - 40827543
Alignment:
Q  40 tatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctag 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40827878 tatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacgagtttcatataatgcacatgaatgcatttatctag 40827779  T
Q  140 acttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaa 228  Q
     ||||           |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827778 ccttttttggaagataataggaagataaattagaagtgatgatacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttataaattatatgtaa 40827679  T
Q  229 ctatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactc 328  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  40827678 ctatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagattaatattgttgttatttccttgtttagcattttccaaacgaggtgtcatgaacaattc 40827579  T
Q  329 tgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827578 taaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 40827543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 35436368 - 35436651
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35436368 gacatcaatgtcaactggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatat 35436467  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436468 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 35436567  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436568 ccttcattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattt 35436651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 352
Target Start/End: Original strand, 11382573 - 11382903
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  11382573 aatggtgctagctatagatgtacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatccacatgcat 11382672  T
Q  128 gcatttatctagactttataggatg------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaatta 221  Q
    | |||||| | |||||||||||| |      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11382673 ggatttatatggactttataggaagctgaggataaattacaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttacgttaccttcattttataaatta 11382772  T
Q  222 tatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaaga 321  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  11382773 tatataactatattcgcagacattttatccatgttaatgtgcattagactaatattgcagtcatttccctttttagcattttgaaaacgaggtgtgaaga 11382872  T
Q  322 acaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatca 352  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11382873 aaaaatctgaaaggaaagcgcaaaacaatca 11382903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 16495280 - 16495637
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16495280 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 16495379  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||           ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16495380 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 16495479  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||    
T  16495480 ccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttc 16495577  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16495578 ccaaacaaggtattaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa-aatcactctcattgatg 16495637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39797190 - 39796971
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39797190 tgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcaca 39797091  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 222  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39797090 tacatgtatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttattttataaattat 39796992  T
Q  223 atgtaactatattcacataca 243  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  39796991 atgtaactatattcgcataca 39796971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9879773 - 9879550
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||    
T  9879773 tgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatataatccaca 9879674  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9879673 tgcatgcatttatctagactttataggaagataaattaaaagtgatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgctaccttcattttataaattat 9879574  T
Q  223 atgtaactatattcacatacatct 246  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  9879573 atgtaattatattcgcatacatct 9879550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 159 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48521736 - 48521530
Alignment:
Q  159 tagaagtcatgttacattttctttagcttaaaa-tcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaa 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  48521736 tagaagtcatgatacattttctttagcttaaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgtta 48521637  T
Q  258 atatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctc 357  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48521636 atatgcattagactaatattgttgttatttccctgttaagcatttcccaaacgaggtgtcaagaagaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctc 48521537  T
Q  358 attgatg 364  Q
    |||||||    
T  48521536 attgatg 48521530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5253110 - 5252872
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5253110 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5253011  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5253010 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 5252912  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5252911 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 5252872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2845558 - 2845365
Alignment:
Q  171 tacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagac 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2845558 tacatttgctttagcttaaaatcaattatgctacctttattttataaattatatgtaactatatttacatacaccttacacatgttaatatgcattagac 2845459  T
Q  271 taatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2845458 taatattgcagttattttcctatttagcatttcctaaacgaggtgtcaataacaattccgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 2845365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54793643 - 54793473
Alignment:
Q  194 agttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgt 293  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  54793643 agttgtgctaccttcattttataaattatatgtaattatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttatatccctgt 54793544  T
Q  294 ttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793543 ttagcatttcccaaacgaggtgttaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 54793473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28164954 - 28164809
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  28164954 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgagggagtgatgcttaatttccattcgtttcaaaaatgttaattgatcaacgaggttcatat 28164855  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaatta 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28164854 aatgtgcatgcatgcatttatctagactttataggaagataaatta 28164809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 54793822 - 54793688
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  54793822 gacatcaatgtcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaac-gggtacatat 54793724  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga 150  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793723 aatccacatgcatgcatttatctagactttatagga 54793688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 54512345 - 54512466
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  54512345 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctaattgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacataa 54512444  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  54512445 aatgtacatgcatgcatttatc 54512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11952146 - 11952053
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11952146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggt 11952053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2845651 - 2845558
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2845651 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcatcaatgttaattggtcaaccgggt 2845558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 364
Target Start/End: Original strand, 54512465 - 54512527
Alignment:
Q  302 tcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54512465 tcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcattctcattgatg 54512527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26321941 - 26321581
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26321941 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtgcatat 26321842  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321841 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 26321742  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26321741 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 26321642  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321641 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 26321581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 2194518 - 2194878
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194518 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtaatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 2194617  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194618 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 2194717  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2194718 cctttattttataaattatatataactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 2194817  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194818 ccaaacgaagtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 2194878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 30141927 - 30142273
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30141927 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 30142026  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142027 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 30142126  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30142127 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 30142226  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 361  Q
     |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30142227 ttcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattg 30142273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25697378 - 25697033
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25697378 gacatcattgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 25697279  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697278 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 25697179  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25697178 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 25697079  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25697078 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 25697033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 41690700 - 41691045
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41690700 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 41690799  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690800 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 41690899  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41690900 taaattatatgtaactatattcacatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 41690999  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41691000 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 41691045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20996810 - 20996450
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20996810 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20996711  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20996710 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgttacgttttctttagcttaaaatatgttatgcta 20996611  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20996610 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 20996511  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20996510 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaactatcactctcattgatg 20996450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33612006 - 33611646
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33612006 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 33611907  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611906 aatgtacatgcttgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 33611807  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  33611806 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattttcatatttagcatttc 33611707  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611706 ccaaacgaggtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33611646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 34717014 - 34717359
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34717014 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 34717113  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717114 aatgcacatgaatgcatttatctaacctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 34717213  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34717214 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 34717313  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34717314 gttaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 34717359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 4881638 - 4881984
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4881638 gacatcaatatcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 4881737  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4881738 aatatacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaagatcagttatgctacctttatttta 4881837  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  4881838 taaattatatgtaactatattc-gatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttcccaaacgaggc 4881936  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattga 362  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4881937 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattga 4881984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1852783 - 1852436
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1852783 gacatcaatgtcaaatcgtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatat 1852684  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852683 aatgtacatgcatacatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 1852584  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||||||||   |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1852583 taaattatatgt--ttatattcgtgtatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 1852486  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1852485 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 1852436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 21029469 - 21029821
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21029469 tgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtaca 21029568  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029569 tgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcaaactacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 21029668  T
Q  212 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21029669 ttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattacactaatattgcagttattttcctgtttagcattttccaaacga 21029768  T
Q  312 ggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21029769 ggtgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgcaaatcaatcactctcattgatg 21029821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 7285030 - 7285390
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||  ||| |||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7285030 gacatcaacgtcaaatggtgctaactatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtacatat 7285129  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285130 aatgtacatgcatgcatttatctagactttattggaagataataagatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 7285229  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  7285230 cctttattttatagattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattattttcctgtttaacatttc 7285329  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285330 ccaaacgatatgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 7285390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 20349293 - 20349636
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20349293 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 20349392  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20349393 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaa 20349492  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    ||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20349493 taaattatatgtaact------ggatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 20349586  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349587 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 20349636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 30688668 - 30689022
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688668 gacatcaatgtcagatggtgctggctatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 30688767  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688768 aatgtacatgcatgcatttatctagaatttataggaagataataggatgataaagtagaagtcaagttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 30688867  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30688868 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatcc------atatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttc 30688961  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30688962 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactcttattgatg 30689022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 27065255 - 27065613
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27065255 gacatcaatgtcaaatggtgctagctgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaataatgttaattggtcaacggggtacatat 27065354  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaa-----------ttagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27065355 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataatttagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatacta 27065454  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  27065455 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattctcctatttagcatttc 27065554  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27065555 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaagcaat--ctctcattgatg 27065613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 289961 - 290321
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  289961 gacatcaatgtaaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatat 290060  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |           ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  290061 aatctacatgcatgcatttacctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcattgtatattttctttagtttaaaatcagttatgcta 290160  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  290161 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatatatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttctctgtttagcatttc 290260  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  290261 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgtaaaacaagcactctcattgatg 290321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3151469 - 3151110
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3151469 gacatcaatgtcaaatggagctagctatatgtgcacatgcagaagtgatgcttaatttt-agttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 3151371  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3151370 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagaagtaatgctacattttctttagcttaaaattagttatgcta 3151271  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3151270 cctttattttataaattatatgtaattatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgaagttattttcctgtttagcatttc 3151171  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3151170 ccaaacgaggtgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3151110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 37463737 - 37464097
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37463737 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatat 37463836  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37463837 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 37463936  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  37463937 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 37464036  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37464037 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 37464097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3398007 - 3397644
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3398007 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcaaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtaaatat 3397908  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397907 a-tgtacatgtatacatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 3397809  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacata----catcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3397808 cctttattttataaattatatgtaactatatttgcataagatcatcttatctatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattttcctgtttatca 3397709  T
Q  300 tttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397708 tttcccaaaagaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3397644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12589146 - 12588786
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  12589146 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacggggttcatat 12589047  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589046 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 12588947  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  12588946 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagattaatattgttcttatttccctgtttagcatttc 12588847  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12588846 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 12588786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Original strand, 9701645 - 9701965
Alignment:
Q  55 gggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgat 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9701645 gggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatctacatgcatgcatttatctagaatttataggaagat 9701744  T
Q  155 a-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    |           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9701745 agtaggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcataca 9701844  T
Q  244 tcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgca 343  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  9701845 tcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccgtgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgca 9701944  T
Q  344 aaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  9701945 aaacaaacattctcattgatg 9701965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3211063 - 3210704
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  3211063 gacatcaatgtcaaatggtgctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggg-tacatat 3210965  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3210964 aatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatgaattatgcta 3210865  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  3210864 cattcattttataaattacatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttatttccctgtttagcatttc 3210765  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210764 ccaaacgaggtgttaagaaaaattatgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31296384 - 31296170
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  31296384 aatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatacat 31296285  T
Q  128 gcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgta 227  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296284 gtatttatctaaactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttattttataaattatatgta 31296186  T
Q  228 actatattcacataca 243  Q
    ||||||||| ||||||    
T  31296185 actatattcgcataca 31296170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 3027813 - 3028014
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3027813 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatat 3027912  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027913 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagttatgctacattttctatagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 3028012  T
Q  215 ta 216  Q
    ||    
T  3028013 ta 3028014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 19394842 - 19395079
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19394842 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatat 19394941  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| | || |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19394942 aatgca-atacatgtatttatctagactttataagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 19395039  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19395040 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 19395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 196 - 364
Target Start/End: Original strand, 19447546 - 19447716
Alignment:
Q  196 ttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19447546 ttatgctacctttattttataaattatatataactatattcgtatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattttcctgttt 19447645  T
Q  296 agcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaa--acaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19447646 agcatttctcaaatgagatgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacacaatcactctcattgatg 19447716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 215 - 361
Target Start/End: Original strand, 3028312 - 3028458
Alignment:
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  3028312 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattggactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaatgaggt 3028411  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 361  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3028412 gtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattg 3028458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19832269 - 19831920
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19832269 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatacacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 19832170  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19832169 aatgtagatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagctcaaaatcagttatgctacctttatttta 19832070  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  19832069 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttaacattttccaaacgaggt 19831970  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19831969 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactatcattgatg 19831920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14830394 - 14830034
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830394 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 14830295  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830294 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 14830195  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14830194 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttggcatttc 14830095  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14830094 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 14830034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28135930 - 28135589
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28135930 tgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatataatgtaca 28135831  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135830 tgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagataaaaatcagttatgctacctttattttataaattat 28135731  T
Q  223 atgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135730 atgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 28135631  T
Q  323 caactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28135630 caattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcaatgatg 28135589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 36856507 - 36856854
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36856507 gacatcaatgttaaatgatgctagctatatatgca-atgcggaagtgatgcttaatttcaatttgtttcaa-aatgttaattggtcaacggggtacatat 36856604  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36856605 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgatacttttatttta 36856704  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36856705 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 36856804  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856805 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 36856854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39715382 - 39715037
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39715382 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 39715283  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715282 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 39715183  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39715182 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatctatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 39715083  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39715082 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 39715037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 52800449 - 52800794
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52800449 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 52800548  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800549 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 52800648  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52800649 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 52800748  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52800749 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 52800794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 19590252 - 19590601
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  19590252 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatgggatacatat 19590351  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19590352 aatgcacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttta 19590451  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  19590452 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattatactaatattacagttatttccctgtttaacatttcccaaacgaggt 19590551  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19590552 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19590601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28121092 - 28120744
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  28121092 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatagggtacatat 28120993  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28120992 aatgcacatggatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttta 28120893  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  28120892 taaattatatgt-actatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttccaaaacgaggc 28120794  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28120793 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 28120744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 23478314 - 23478676
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478314 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 23478413  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacatttt-ctttag-cttaaaatcagttatgc 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23478414 aatgtacatgcatgcgtttatctagactttataggaagataataggataataaattagaagtcatgttacattttactttagtcttaaaatcagttatgc 23478513  T
Q  202 tacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478514 tacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 23478613  T
Q  302 tcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23478614 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcattctcattgatg 23478676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33503867 - 33503521
Alignment:
Q  18 atcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat 117  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  || || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||    
T  33503867 atcaatgtcaaatggtgctagctatttatgcagatgcggaagtgatgcttaatctccatttgtttcaacaatgttaattgattaacgagatacatataat 33503768  T
Q  118 gtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503767 gtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 33503668  T
Q  218 attatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  33503667 attatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcattttccaaacgaggtgtc 33503568  T
Q  318 aagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503567 aagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33503521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34057447 - 34057087
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaattt-ccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcata 113  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34057447 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcata 34057348  T
Q  114 taatgtacatgcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgct 202  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057347 taatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgct 34057248  T
Q  203 acctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcattt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34057247 acctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcattt 34057148  T
Q  303 cccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057147 cccaaacgacgtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 34057087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54332510 - 54332166
Alignment:
Q  30 tggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgc 129  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54332510 tggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgc 54332411  T
Q  130 atttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332410 atttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa 54332311  T
Q  219 ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtca 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  54332310 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcctttcccaaacgaggtgtca 54332211  T
Q  319 agaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332210 agaacaattgtgaaa-ggaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 54332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 53341816 - 53342181
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53341816 gacatcaatgtcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtctcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 53341915  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53341916 aatgtacatgcattcatttatctagactttataggaagataataggaagacaaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 53342015  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  53342016 cctttattttataaattatatataactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatagtgcaattattttcctgtttagcatttc 53342115  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgtccat 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53342116 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgaccat 53342181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 13627458 - 13627814
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13627458 gacatcaatgtcaaatggttctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatgt 13627557  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13627558 aatgtacatgaatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagtttaaaatcagttatgcta 13627657  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13627658 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatggattagattaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 13627757  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13627758 tcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcatt 13627814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 48 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55999547 - 55999220
Alignment:
Q  48 cacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttata 147  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55999547 cacatgcggaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgttcatgcatgcatttatctagactttata 55999448  T
Q  148 ggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattc 236  Q
    ||| |||||           |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55999447 ggaagataatatcaagataaattataagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattt 55999348  T
Q  237 acatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatga 336  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  55999347 gcatacatcttatacatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagga 55999248  T
Q  337 aagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  55999247 aagcgcaaaataatcactctcattgatg 55999220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10260206 - 10259846
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10260206 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 10260107  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10260106 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 10260007  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  10260006 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 10259907  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10259906 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 10259846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 17739446 - 17739806
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17739446 gacatcaatgtcaaatggtactaactatagatgcaaatgaggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 17739545  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  |||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739546 aatgcacatgaatgcatttatccagcttttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 17739645  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||     
T  17739646 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccatgtttagcatttt 17739745  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739746 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17739806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 21564249 - 21564609
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21564249 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 21564348  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21564349 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 21564448  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  21564449 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 21564548  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21564549 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 21564609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26925145 - 26924785
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26925145 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 26925046  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26925045 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 26924946  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  26924945 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 26924846  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924845 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 26924785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 43331770 - 43332130
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43331770 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 43331869  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43331870 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 43331969  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  43331970 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 43332069  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43332070 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 43332130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 51451837 - 51452197
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51451837 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 51451936  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51451937 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaaaataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 51452036  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  51452037 ccttcatttcataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 51452136  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51452137 ccaaactaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 51452197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24078275 - 24077915
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24078275 gacatcaatgtcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatat 24078176  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24078175 aatgcacatgcatgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgtta 24078076  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  24078075 ccttcatttcataagttatatataactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttc 24077976  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24077975 ccaaactaggtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 24077915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 40621552 - 40621914
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaattt--ccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcat 112  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40621552 gacatcaatgtcaaacggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggttcat 40621651  T
Q  113 ataatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgc 201  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621652 ataatgcacatgaatgcatttatctagcatttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgc 40621751  T
Q  202 tacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||    
T  40621752 tacctttattttataaattatatgtaactatatttgcatacgtcttatccatgttaatatgtattagactaatattgttgttatttccctgtttaacatt 40621851  T
Q  302 tcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621852 ttccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 40621914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Original strand, 1943920 - 1944257
Alignment:
Q  33 tgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1943920 tgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatataatccacatgcatgcatt 1944018  T
Q  133 tatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatg 225  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1944019 tatctatactctataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatg 1944118  T
Q  226 taactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaa 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1944119 taactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaaaa 1944218  T
Q  326 ctctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1944219 ttctgaaagaaaggcgtaaaacaatcactctcattgatg 1944257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35496395 - 35496066
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35496395 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatcagtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 35496296  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35496295 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 35496196  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||                    |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35496195 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttacccatgtaaatat--------------------ttattttcatgtttagcattttccaaacgaggt 35496116  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35496115 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaattatcactctcattgatg 35496066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47720942 - 47720592
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  47720942 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattagccaacgaggtacatat 47720843  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||| |    
T  47720842 aattcacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaatatgaagataaattagaagtcatggtacattttctttagctta----------tgcca 47720753  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  47720752 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagtatttt 47720653  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  47720652 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaatgcgcaaaacaatcactatcattgatg 47720592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 575001 - 574669
Alignment:
Q  40 tatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctag 139  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  575001 tatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctag 574902  T
Q  140 actttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaa 228  Q
     |||| ||||| |||||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  574901 cctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagctta---tcagttatgctacctttattttataaattatatgtaa 574805  T
Q  229 ctatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactc 328  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  574804 ctatattcgcatacgtcttatctatgttaatatgcattagactaatattgttctaatttccctgtttagcatttcccgaacgaggtgtcaagaacaattc 574705  T
Q  329 tgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  574704 taaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 574669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 17698730 - 17698942
Alignment:
Q  152 gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatcc 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17698730 gataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatggtacctttattttataaattatatgtaaatatattcgcatacatcttatcc 17698829  T
Q  252 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17698830 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaagtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatc 17698929  T
Q  352 actctcattgatg 364  Q
    | |||||||||||    
T  17698930 aatctcattgatg 17698942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39745729 - 39745486
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39745729 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatat 39745630  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagact-----------ttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39745629 aatgtacatgcatgcatttatctagactctataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatgcta 39745530  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatctt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39745529 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatctt 39745486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 15520254 - 15520492
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520254 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 15520353  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15520354 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 15520452  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15520453 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 15520492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5274627 - 5274409
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| | || ||||||| | |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5274627 gacatcaatatcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 5274528  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5274527 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagatgatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 5274428  T
Q  204 cctttattttataaattat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5274427 cctttattttataaattat 5274409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 741161 - 740923
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  741161 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcatcggggttcatat 741062  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  741061 aatgcacatacatgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagcta 740963  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacataca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  740962 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcataca 740923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26870995 - 26870807
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26870995 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 26870896  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26870895 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 26870807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 217 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5272925 - 5272778
Alignment:
Q  217 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5272925 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagtatttcccaaacgaggtgt 5272826  T
Q  317 caagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5272825 caagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatcgatg 5272778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7644456 - 7644307
Alignment:
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7644456 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattgcaattattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 7644357  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7644356 gttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacagtcactctcattgatg 7644307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37702267 - 37702126
Alignment:
Q  219 ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtca 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37702267 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacaaggtgtca 37702168  T
Q  319 agaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37702167 aaaacaattctgaaaggaaagcgcaattcaatcactctcatt 37702126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7644979 - 7644773
Alignment:
Q  28 aatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 127  Q
    |||||||||||||||| || || |||| | || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7644979 aatggtgctagctatatatgcatatgcagaagtgatgattaattcccatttgttttaacaatgttaattggtcaacgggctacatataatgtacatgcat 7644880  T
Q  128 gcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 216  Q
    |||||||||||||||||||||           || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644879 gcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcgtaaaatcagttatgctacctttattttata 7644780  T
Q  217 aattata 223  Q
    |||||||    
T  7644779 aattata 7644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39743392 - 39743269
Alignment:
Q  241 acatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagc 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39743392 acatcttatccatgtaaatatacattagactaatattacagttattttcccgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 39743293  T
Q  341 gcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39743292 gcaaaacaatcactctcattgatg 39743269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 150
Target Start/End: Original strand, 17698420 - 17698547
Alignment:
Q  23 tgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  17698420 tgtcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatcggtcaacgggttacatataatgtaca 17698519  T
Q  123 tgcatgcatttatctagactttatagga 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698520 tgcatgcatttatctagactttatagga 17698547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Original strand, 38007492 - 38007610
Alignment:
Q  246 ttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  38007492 ttatccatgtaaatatgcattagactgatattgcagttattttcctgtataacattttccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaacggaaagtgcaaa 38007591  T
Q  346 acaatcactctcattgatg 364  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38007592 aaaatcactctcattgatg 38007610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35708258 - 35708151
Alignment:
Q  257 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  35708258 aatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactct 35708159  T
Q  357 cattgatg 364  Q
    ||||||||    
T  35708158 cattgatg 35708151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35712993 - 35712922
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaac 86  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35712993 gacatcaatgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaac 35712922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3839968 - 3839895
Alignment:
Q  290 ctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 363  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3839968 ctgtttagcatttaccgaaggaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 3839895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27228 - 26868
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27228 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 27129  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27128 aatgcacatgcatgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 27029  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27028 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttggcatttc 26929  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26928 ccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 26868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19243 - 18898
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19243 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 19144  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 19044  T
Q  215 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19043 taaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggt 18944  T
Q  315 gtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18943 gtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 18898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 360
Target Start/End: Original strand, 119443 - 119783
Alignment:
Q  31 ggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgca 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  119443 ggtgctggctatagatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgctcaacggggtacatataatgcacatgcattca 119542  T
Q  131 tttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119543 tttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 119642  T
Q  220 tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119643 tatatgtaactatattcacttacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtggttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 119742  T
Q  320 gaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 360  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  119743 gaataattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 119783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 65480 - 65143
Alignment:
Q  33 tgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  65480 tgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatataatccacatgcatgcatt 65382  T
Q  133 tatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatg 225  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65381 tatctatactctataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatg 65282  T
Q  226 taactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaa 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  65281 taactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaaaa 65182  T
Q  326 ctctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
     |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  65181 ttctgaaagaaaggcgcaaaacaatcactctcattgatg 65143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 153022 - 152662
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  153022 gacatcaatgtaaaatggtgttagctataaatgcgcatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatat 152923  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||           ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  152922 aatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataataggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgcta 152823  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  152822 ccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttc 152723  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  152722 ccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaggaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 152662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 13191 - 13395
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13191 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 13290  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13291 aatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 13390  T
Q  215 taaat 219  Q
    |||||    
T  13391 taaat 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Original strand, 13394 - 13502
Alignment:
Q  252 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatc 351  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  13394 atgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttccaaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatc 13493  T
Q  352 actctcatt 360  Q
    |||||||||    
T  13494 actctcatt 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 49455 - 49798
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  49455 gacatcaatgtcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattagccaacggggtacatat 49554  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||           ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||          ||||||||    
T  49555 aatccacatgcatgcatttatctaggctttataagaagctaataggaatataaattagaagtcatggtacattttatttagc----------ttatgcta 49644  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  49645 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatc-------tgttaatatgcattagactaatgttgcaattatttctctatttagcatttc 49737  T
Q  304 ccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49738 ctaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 49798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4877 - 4597
Alignment:
Q  95 ttggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttcttta 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4877 ttggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttcttta 4778  T
Q  184 gcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagtt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  4777 gcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttctt 4678  T
Q  284 atttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4677 atttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 4597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5123 - 4866
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5123 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 5024  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||  || |||||||||| ||||           |||||| ||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5023 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 4924  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4923 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11572 - 11315
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11572 gacatcaatgtctaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11473  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| |||||  || |||||||||| ||||           |||||| ||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11472 aatgcacatgagtggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgcta 11373  T
Q  204 cctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  11372 cctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 1 - 165
Alignment:
Q  200 gctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1 gctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcctatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagctattttcctgtttagca 100  T
Q  300 tttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Original strand, 898 - 1086
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  898 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 997  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  998 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaagtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 10991
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11197 gacatcattgtcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatat 11098  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||  |||||||||||||  ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11097 aatgcacatcaatgcatttatctaacctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaattagttatgcta 10998  T
Q  204 cctttat 210  Q
    |||||||    
T  10997 cctttat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13714 - 13493
Alignment:
Q  15 gacatcattgtctaatggtgctagctatagattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatat 114  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||    
T  13714 gacatcaatgtcaaatagtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaattgggctcatat 13615  T
Q  115 aatgtacatgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 203  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||           |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13614 aatgcacatgaatgcttttatctagcctttttatgaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgcta 13515  T
Q  204 cctttattttataaattatatg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  13514 cctttattttataacttatatg 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13493 - 13439
Alignment:
Q  310 gaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 364  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493 gaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54796 - 54664
Alignment:
Q  176 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54796 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 54697  T
Q  276 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaa 308  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54696 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaa 54664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1521
Alignment:
Q  90 gttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacatttt 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  1648 gttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacatttt 1549  T
Q  179 ctttagcttaaaatcagttatgctacct 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  1548 ctgtagcttaaaatcagttatgctacct 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 257 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30612 - 30505
Alignment:
Q  257 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaactctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30612 aatatgcattagactaatattgttgttatttccctatttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgcaaaacaatcactct 30513  T
Q  357 cattgatg 364  Q
    ||||||||    
T  30512 cattgatg 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University