View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8586_low_2 (Length: 531)

Name: NF8586_low_2
Description: NF8586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8586_low_2
NF8586_low_2
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (13-510)||(37261294-37261789)
chr5 (13-510)||(25542526-25543033)
chr5 (13-510)||(14192545-14193052)
chr5 (13-510)||(27881063-27881570)
chr5 (13-510)||(39883162-39883669)
chr5 (18-510)||(3689961-3690463)
chr5 (18-510)||(3876324-3876826)
chr5 (22-506)||(17871375-17871868)
chr5 (13-510)||(37372915-37373422)
chr5 (13-510)||(8428318-8428814)
chr5 (235-510)||(30346362-30346637)
chr5 (245-510)||(10025199-10025464)
chr5 (235-510)||(24629686-24629954)
chr5 (13-160)||(24629954-24630101)
chr5 (13-160)||(30346637-30346784)
chr5 (13-160)||(10025042-10025189)
chr5 (23-56)||(6089199-6089232)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (17-510)||(10038623-10039116)
chr3 (13-510)||(10110579-10111086)
chr3 (13-510)||(10000386-10000893)
chr3 (13-510)||(10968515-10969021)
chr3 (13-510)||(13530018-13530525)
chr3 (13-510)||(50410151-50410654)
chr3 (13-510)||(32750-33257)
chr3 (13-510)||(10237535-10238040)
chr3 (13-510)||(11368625-11369125)
chr3 (15-444)||(11362239-11362681)
chr3 (13-289)||(52918045-52918330)
chr3 (13-201)||(46913050-46913238)
chr3 (330-510)||(52918332-52918512)
chr3 (13-180)||(47692948-47693115)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (13-510)||(186534-187040)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (13-510)||(5828288-5828795)
chr7 (13-510)||(21069795-21070302)
chr7 (13-510)||(9000878-9001385)
chr7 (13-510)||(7036699-7037206)
chr7 (13-510)||(12780881-12781389)
chr7 (22-506)||(22843792-22844285)
chr7 (13-442)||(12785790-12786218)
chr7 (235-510)||(42232210-42232486)
chr7 (13-160)||(42232063-42232210)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (13-510)||(2201912-2202419)
chr6 (13-465)||(10187523-10187985)
chr6 (13-510)||(18344104-18344611)
chr6 (22-506)||(30881315-30881808)
chr6 (13-400)||(15333622-15334019)
chr6 (15-324)||(29639947-29640266)
chr6 (15-324)||(31510118-31510437)
chr6 (270-510)||(12517520-12517760)
chr6 (13-168)||(12517367-12517522)
chr6 (332-477)||(18814054-18814199)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (13-510)||(1860656-1861163)
chr4 (13-510)||(35855886-35856393)
chr4 (13-510)||(49710152-49710658)
chr4 (13-501)||(38518075-38518573)
chr4 (13-442)||(49786640-49787068)
chr4 (119-510)||(13337320-13337721)
chr4 (201-510)||(617957-618266)
chr4 (235-510)||(55558856-55559131)
chr4 (13-160)||(55559131-55559278)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (13-510)||(24268803-24269310)
chr2 (13-510)||(27509353-27509860)
chr2 (21-501)||(24245812-24246302)
chr2 (13-510)||(27192468-27192975)
chr2 (13-510)||(27842282-27842789)
chr2 (13-510)||(21395349-21395856)
chr2 (13-475)||(17683597-17684069)
chr2 (13-442)||(28665984-28666412)
chr2 (13-442)||(37824818-37825246)
chr2 (13-441)||(41919986-41920413)
chr2 (238-510)||(35609867-35610139)
chr2 (13-201)||(35609664-35609852)
chr2 (352-503)||(3642920-3643071)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (13-510)||(2452850-2453357)
chr1 (13-510)||(36207194-36207701)
chr1 (13-510)||(16042004-16042511)
chr1 (13-499)||(2329148-2329641)
chr1 (16-510)||(37389885-37390389)
chr1 (13-510)||(48775068-48775575)
chr1 (13-506)||(6310731-6311235)
chr1 (13-410)||(18148667-18149074)
chr1 (154-510)||(48233498-48233864)
chr1 (235-510)||(52500795-52501063)
chr1 (13-201)||(48238529-48238717)
chr1 (13-160)||(52500648-52500795)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (16-510)||(18988-19491)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (13-510)||(21113477-21113984)
chr8 (13-510)||(25218298-25218805)
chr8 (13-510)||(25208780-25209272)
chr8 (13-510)||(7821817-7822324)
chr8 (13-422)||(30307156-30307575)
chr8 (13-201)||(31978579-31978767)
chr8 (426-510)||(30325877-30325961)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (13-510)||(17610-18109)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (13-510)||(31912-32418)
scaffold0073 (13-237)||(19436-19670)
scaffold0073 (274-510)||(1-237)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (13-501)||(314-812)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (13-510)||(4993-5499)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (13-510)||(321069-321576)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-510)||(182794-183297)
scaffold0003 (15-510)||(165511-166019)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (17-442)||(983-1418)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (13-442)||(48748-49176)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (235-510)||(28452-28727)
scaffold0118 (13-160)||(28727-28874)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (205-443)||(39937-40175)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (13-229)||(16663-16889)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (358-510)||(14010-14162)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (13-125)||(30-142)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (13-89)||(1627-1703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 37261294 - 37261789
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261294 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 37261393  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacgga 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37261394 caactgaatcaagtgttggcgcaagtattcccctttcttgaaaaaataacgggtcattaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacgg- 37261492  T
Q  213 tttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccaca 312  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37261493 -ttgttgtgtccaatataagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccact 37261591  T
Q  313 tgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctt 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  37261592 tgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctt 37261691  T
Q  413 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261692 tgatgaattgatcgagacatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 37261789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25543033 - 25542526
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25543033 tggacatcataattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 25542934  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  25542933 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 25542834  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25542833 catcaacatatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgag 25542734  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25542733 agtatccacttgccaaagttagcaatttctttctgctttgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 25542634  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  25542633 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatattctgccacgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 25542534  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  25542533 tgtcattc 25542526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 14193052 - 14192545
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14193052 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 14192953  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  14192952 caactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 14192853  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14192852 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgag 14192753  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14192752 agtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattataataag 14192653  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| |     
T  14192652 cccatatctttaatgaattaattggggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgggcaacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaac 14192553  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  14192552 tgtcattc 14192545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 27881063 - 27881570
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  27881063 tggacatcataattttcacccgatctacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 27881162  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  27881163 cagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 27881262  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27881263 catcaacggatttgttgggtccgatatcagcaaatcttcaggagtttctacctttatttcaccattgtcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 27881362  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  27881363 agtatccacttgccaaaattagcaatttctacctgctctgcatgtaccgaagatgcacccaatctcatattaacggtaagcctcaacacattacaataag 27881462  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  27881463 cccatatctttgatgaattgaccgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 27881562  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  27881563 tgtcattc 27881570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 39883162 - 39883669
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  39883162 tggacatcataattgtcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgct 39883261  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  39883262 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 39883361  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883362 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatctttaggaatatctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 39883461  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  39883462 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataag 39883561  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  39883562 ccaatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactac 39883661  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  39883662 tgtcattc 39883669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 510
Target Start/End: Original strand, 3689961 - 3690463
Alignment:
Q  18 atcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaact 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  3689961 atcagaattttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaacc 3690060  T
Q  118 gaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatca 207  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||    
T  3690061 gaatcaagcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatca 3690160  T
Q  208 acggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtat 307  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3690161 acgaatttgttgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagtgtcgttgccgtctccaattgagagtat 3690260  T
Q  308 ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccat 407  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3690261 ccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccat 3690360  T
Q  408 atctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  3690361 atctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatca 3690460  T
Q  508 ttc 510  Q
    |||    
T  3690461 ttc 3690463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 18 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3876826 - 3876324
Alignment:
Q  18 atcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaact 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  3876826 atcagaattttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaacc 3876727  T
Q  118 gaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatca 207  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||    
T  3876726 gaatcaagcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtccccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatca 3876627  T
Q  208 acggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtat 307  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876626 acgaatttgttgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtat 3876527  T
Q  308 ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccat 407  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3876526 ccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccat 3876427  T
Q  408 atctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtca 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  3876426 atctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatca 3876327  T
Q  508 ttc 510  Q
    |||    
T  3876326 ttc 3876324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17871868 - 17871375
Alignment:
Q  22 gaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  17871868 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 17871769  T
Q  122 caagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacgg 211  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          ||||||||||    
T  17871768 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 17871669  T
Q  212 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||     
T  17871668 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 17871570  T
Q  312 atgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatct 411  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  17871569 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 17871470  T
Q  412 ttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17871469 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtc 17871375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 37372915 - 37373422
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  37372915 tggacatcagaattatcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcataaattggttaacatgct 37373014  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  37373015 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttcgaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 37373114  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37373115 catcaacggatttgttatgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 37373214  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37373215 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 37373314  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||     
T  37373315 cccatatctttgacgaattgaccgacgcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcagacaacaggcaatatctgcttaaaatcaccacctaaaactac 37373414  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||| ||||    
T  37373415 tgtgattc 37373422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 8428814 - 8428318
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  8428814 tggacatcagaatattcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 8428715  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  8428714 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 8428615  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8428614 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 8428515  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  8428514 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 8428426  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  8428425 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 8428326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 30346637 - 30346362
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30346637 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 30346538  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30346537 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtcttaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 30346438  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30346437 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaactattgtcattc 30346362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 245 - 510
Target Start/End: Original strand, 10025199 - 10025464
Alignment:
Q  245 aatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 344  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10025199 aatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttaccgtctctaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgca 10025298  T
Q  345 cgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 444  Q
     ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10025299 ggtaccaaagatgcacccagtctcatattaacagtaagtctcaacacatcaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatatt 10025398  T
Q  445 acctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
     ||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  10025399 gcctcgttccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaactattgtcattc 10025464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24629954 - 24629686
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  24629954 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 24629862  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24629861 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 24629762  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24629761 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 24629686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24630101 - 24629954
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24630101 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 24630002  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24630001 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30346784 - 30346637
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  30346784 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 30346685  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30346684 caacttaatcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 10025042 - 10025189
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |    
T  10025042 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacttggaatcaatgacatcatatattcgttaacatgtt 10025141  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10025142 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 56
Target Start/End: Original strand, 6089199 - 6089232
Alignment:
Q  23 aattttcacccgatcgacaaacagaatcagagct 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089199 aattttcacccgatcgacaaacagaatcagagct 6089232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Original strand, 10038623 - 10039116
Alignment:
Q  17 catcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10038623 catcagaattttcacccgatcgacaaacagaatgagagcttaaataatatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaat 10038722  T
Q  117 tgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacggatttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10038723 tgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacagatttg 10038822  T
Q  217 ttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgcc 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10038823 ttgtgtctgatataagcaaatcttcgaaaatttataccttcgtttcaccattctcatctaaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgcc 10038922  T
Q  317 aaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgat 416  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10038923 aaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagcccatatctttgat 10039022  T
Q  417 gaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039023 gaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaactattgtcattc 10039116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 10110579 - 10111086
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10110579 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10110678  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  10110679 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10110778  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  10110779 catcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcat 10110878  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||    
T  10110879 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgtaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcattaacacattaaaataag 10110978  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10110979 ctcatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 10111078  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  10111079 tgtcattc 10111086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 10000386 - 10000893
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10000386 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10000485  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac--------- 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |             
T  10000486 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10000585  T
Q  204 -atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
     |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  10000586 tatcaacagatttgttgcatctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcat 10000685  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  10000686 agtatccacttgccaaaattaacaatttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 10000785  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10000786 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatccccacctaaaactat 10000885  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  10000886 tgtcattc 10000893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10969021 - 10968515
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10969021 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10968922  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac--------- 203  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |             
T  10968921 aaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttgcttagaaaaatagcaggtcacgaagtttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgg 10968822  T
Q  204 -atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10968821 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatct-cagaaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccatctccaattgag 10968723  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  10968722 agtgtccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctataggtactgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaa 10968623  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| || | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  10968622 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctccctcgatccgtttcggactacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaactac 10968523  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  10968522 tgtcattc 10968515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 13530018 - 13530525
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13530018 tggacaccaaaattttcacctgatcgacaagcagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggactcagtgacatcatatattcgttaaaatgct 13530117  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  13530118 caactgaatgaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 13530217  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13530218 catcaacggatttgttgtgtctgatatgaccaaatcttctagaatttctaccttcatttcaccattctcacctgatgcgtcgttgccgtctccaattgag 13530317  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  13530318 agtatatacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctctacacattacaataag 13530417  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  13530418 cccatatctgtgatgaattgattgaggcatcaacaatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaactac 13530517  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  13530518 tgtcattc 13530525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 50410151 - 50410654
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  50410151 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatatttgttaacatgct 50410250  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  50410251 cgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtgggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 50410350  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  50410351 catcagcggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaattt----cttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttaccgtctctaattgag 50410446  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  50410447 agtatccacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattagaataag 50410546  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  50410547 ccaatatctttgatgaattgattgaggcatcaaaaatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 50410646  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  50410647 tgtcattc 50410654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 32750 - 33257
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  32750 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 32849  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  32850 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtccataagtga 32949  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  32950 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcattgttgccgtctctaattgag 33049  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33050 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 33149  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33150 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcgtcgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactat 33249  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  33250 tgtcattc 33257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 10237535 - 10238040
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  10237535 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaa-tactctttctcttcacctggaatcagtaacatcatatattcgttaacatgct 10237633  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  10237634 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10237733  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10237734 catcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaattcttcaggaatttctaccgttatttcaccattccc-tccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 10237832  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  10237833 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctcagcaggtaccaaagatgcatccaatcttatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 10237932  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10237933 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 10238032  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  10238033 tgtcattc 10238040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 11368625 - 11369125
Alignment:
Q  13 tggacatcagaatttt-cacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgc 111  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11368625 tggacatcagactttttcacccaatcgacaaattgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgc 11368724  T
Q  112 tcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaat-agcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag--------- 201  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||             
T  11368725 tcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaaagagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtctatgagt 11368824  T
Q  202 -acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattg 300  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||         |||| | ||||||||||    
T  11368825 gacatcaacggatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatc---------gttgtcctctccaattg 11368915  T
Q  301 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 400  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11368916 agggtatccacttgccaaaattatcagtttcttccttctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaata 11369015  T
Q  401 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 500  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  11369016 agtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaact 11369115  T
Q  501 attgtcattc 510  Q
    | ||||||||    
T  11369116 actgtcattc 11369125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 11362239 - 11362681
Alignment:
Q  15 gacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctc 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11362239 gacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctc 11362338  T
Q  114 aactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------ac 203  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||    
T  11362339 aaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgac 11362438  T
Q  204 atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgaga 303  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11362439 atcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgaga 11362538  T
Q  304 gtat--ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataa 401  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  11362539 gtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataa 11362638  T
Q  402 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362639 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 11362681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 52918045 - 52918330
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52918045 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 52918144  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||          |     
T  52918145 caactgaatcaagcgttggtgcgggtattcccctttcttggaaaaatagcgagtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgaagtctataagtgg 52918244  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgcc 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52918245 catcaacagatttgttgtgtccggtaacggcaaatc-tcaggaatttctaccttcatttcaccattcccatccgaagcgtcgttgcc 52918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 46913050 - 46913238
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46913050 tggacatcagaatttccccccgatcgacaaacataatcaaagcttaaatactatttttcttcacctggaattggtgacatcatatattcgttaacatgct 46913149  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46913150 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattctcctttcttggaaaaatagcgggtcgccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaag 46913238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 330 - 510
Target Start/End: Original strand, 52918332 - 52918512
Alignment:
Q  330 tcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgagg 429  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  52918332 tcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcgtatctttgatgaattgattgagg 52918431  T
Q  430 catcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52918432 catcaacaatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 52918512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 47692948 - 47693115
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47692948 tggacatcagaattttcgtccgatcgacaaacagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatgtattcgttaacatgct 47693047  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatca 180  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  47693048 caactgaatcaagcgttggtgcgaggattcccctttcttgggaaaattgtgggtcaccaaggttatca 47693115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 186534 - 187040
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  186534 tggacatcagaattt-cacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 186632  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  186633 cagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 186732  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  186733 catcaacagatttgttgtgtacgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgag 186832  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||    
T  186833 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaggccttaaaacattacaataag 186932  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  186933 cccatatctttgatgaattgattggtgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaactac 187032  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  187033 tgtcattc 187040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5828795 - 5828288
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5828795 tggacatcataattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 5828696  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  5828695 caactgagtcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 5828596  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5828595 catcaaaagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcag 5828496  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||     
T  5828495 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaatagtaagcctcaacacattaaaataaa 5828396  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5828395 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaa 5828296  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    | ||||||    
T  5828295 tatcattc 5828288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21070302 - 21069795
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21070302 tggacatctaaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcaccaggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 21070203  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  21070202 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggttaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 21070103  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21070102 catcaacggatttgttgtgtctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaacgtcgttgccgtctccaattgag 21070003  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||     
T  21070002 agtatccacttgtcaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgatacattacaataaa 21069903  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  21069902 cccatatctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactac 21069803  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||| ||||    
T  21069802 tgtgattc 21069795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 9001385 - 9000878
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  9001385 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 9001286  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||          |    
T  9001285 caactgaatcaagcgttagtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcaatcagatcgggataaacaaagtctataagaga 9001186  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9001185 catcaacggatttgttgtgtccgatatcaacaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgag 9001086  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9001085 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctatgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 9000986  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||     
T  9000985 cccatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactac 9000886  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  9000885 tgtcattc 9000878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 7036699 - 7037206
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  7036699 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 7036798  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  7036799 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaagtagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 7036898  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7036899 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 7036998  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7036999 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 7037098  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  7037099 cctatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 7037198  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  7037199 tgtcattc 7037206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12781389 - 12780881
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcg-acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  12781389 tggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgc 12781290  T
Q  112 tcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag---------- 201  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||              
T  12781289 tcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtg 12781190  T
Q  202 acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  12781189 acatcaacggatttgttgtgtcttatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcattgtcgtctccaattga 12781090  T
Q  302 gagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataa 401  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12781089 gagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 12780990  T
Q  402 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  ||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  12780989 gctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctccttggactacaggcaacatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 12780890  T
Q  502 ttgtcattc 510  Q
    |||||||||    
T  12780889 ttgtcattc 12780881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 506
Target Start/End: Original strand, 22843792 - 22844285
Alignment:
Q  22 gaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22843792 gaattttcacccgatcgacaaacagaaacagaacttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 22843891  T
Q  122 caagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacgg 211  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||| |    
T  22843892 caagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacag 22843991  T
Q  212 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccac 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||     
T  22843992 atttgttgtgtcagatatgagcaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgacgttgccttctctaattaagagtatccaa 22844090  T
Q  312 atgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatct 411  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22844091 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 22844190  T
Q  412 ttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22844191 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaacttttgtc 22844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12786218 - 12785790
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  12786218 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 12786119  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  12786118 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 12786019  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12786018 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 12785919  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  12785918 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 12785830  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  12785829 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 12785790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Original strand, 42232210 - 42232486
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42232210 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaccgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 42232309  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42232310 ctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 42232409  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacat-aaaactattgtcattc 510  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  42232410 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaaactattgtcattc 42232486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 42232063 - 42232210
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  42232063 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacaaaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 42232162  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42232163 caactgaatcaagcgttggtgagagtattcccctttcttggaaaaata 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2202419 - 2201912
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  2202419 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 2202320  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  2202319 ctactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 2202220  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2202219 catcaacggatttattgtgttcgatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccttctccaattgag 2202120  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |    
T  2202119 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatg 2202020  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  2202019 cctatatctttgatgaattgatcgaggcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaactac 2201920  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  2201919 tgtcattc 2201912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 465
Target Start/End: Original strand, 10187523 - 10187985
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10187523 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10187622  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  10187623 caattgaatcaagtgttggagcgagtattcccttttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 10187722  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187723 catcaacggattttttgtgtccaatatgagcaaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 10187822  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  10187823 agcatccacgtgcgaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataag 10187922  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaa 465  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  10187923 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggacaa 10187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 18344104 - 18344611
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||    
T  18344104 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaatagaatcaaagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgtcaacatgct 18344203  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  18344204 caactgaatcaagcgttggtgcaagtattcccctttcttggaaaaatagatggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 18344303  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18344304 catgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattgag 18344403  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18344404 agtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgtagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataag 18344503  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18344504 cccatatctttgataaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 18344603  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  18344604 tgtcattc 18344611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 506
Target Start/End: Original strand, 30881315 - 30881808
Alignment:
Q  22 gaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30881315 gaattttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaat 30881414  T
Q  122 caagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacgg 211  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          ||||||||||    
T  30881415 caagcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacgg 30881514  T
Q  212 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||     
T  30881515 atttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccat 30881613  T
Q  312 atgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatct 411  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  30881614 ttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatct 30881713  T
Q  412 ttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30881714 ttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtc 30881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 15333622 - 15334019
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  15333622 tggacatcagaattttcacctgatctacaaacagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 15333721  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  15333722 caactgaatcaagtgttggtgcgagtattcccatttgttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctattagtga 15333821  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333822 catcaacggatttgttacgtacgatatcaacaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 15333921  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15333922 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtatcgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaata 15334019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29640266 - 29639947
Alignment:
Q  15 gacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  29640266 gacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctca 29640167  T
Q  115 actgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gaca 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||    
T  29640166 actgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcaggatacacaaagtctataagtgaca 29640067  T
Q  205 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 304  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29640066 tcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagag 29639967  T
Q  305 tatccacatgccaaaattag 324  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  29639966 tatccacttgcaaaaattag 29639947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31510437 - 31510118
Alignment:
Q  15 gacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  31510437 gacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctca 31510338  T
Q  115 actgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gaca 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||          ||||    
T  31510337 actgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagattaggatacacaaagtctataagtgaca 31510238  T
Q  205 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 304  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31510237 tcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttaagaaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaaacatcgttgccgtctccaattgagag 31510138  T
Q  305 tatccacatgccaaaattag 324  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  31510137 tatccacttgcaaaaattag 31510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 270 - 510
Target Start/End: Original strand, 12517520 - 12517760
Alignment:
Q  270 tcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctca 369  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  12517520 tcatccgaagtgtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggaacagaagatgcacccaatctca 12517619  T
Q  370 tattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacggg 469  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| ||    
T  12517620 tattaacagtaagcttcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacagg 12517719  T
Q  470 caatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12517720 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 12517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 12517367 - 12517522
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  12517367 tggacatcagaattttcaccccatcatcaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 12517466  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtca 168  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12517467 caactgaatcaagcgttggtgcaaatattcccctttcttggaaaaatagctggtca 12517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 477
Target Start/End: Original strand, 18814054 - 18814199
Alignment:
Q  332 ttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggca 431  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18814054 ttcctgctctacaggtaccaacgatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattaaggga 18814153  T
Q  432 tcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatct 477  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18814154 tcaacaatatcatgtctcgttccttttcggacaacatgcaatatct 18814199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 1860656 - 1861163
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1860656 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacccagaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 1860755  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  1860756 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 1860855  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  1860856 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcag 1860955  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  1860956 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataag 1861055  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | | |||||    
T  1861056 cccatatctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccaccttacactat 1861155  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  1861156 tgtcattc 1861163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 35855886 - 35856393
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  35855886 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 35855985  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  35855986 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 35856085  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35856086 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 35856185  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35856186 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 35856285  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  35856286 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 35856385  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  35856386 tgtcattc 35856393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 49710152 - 49710658
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  49710152 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 49710251  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  49710252 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 49710351  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49710352 catcaa-ggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattttcatccgaagcatcgttgccgtgtccaattgag 49710450  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  49710451 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgttctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 49710550  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  49710551 ctcatatctttaacgaattgacggaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcgaacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactat 49710650  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  49710651 tgtcattc 49710658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 501
Target Start/End: Original strand, 38518075 - 38518573
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  38518075 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 38518174  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |    
T  38518175 caattgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtctataagtga 38518274  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  38518275 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccaaagcatcgttgccgtctccaattgag 38518374  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38518375 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 38518474  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||   || ||||||  ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  38518475 cccatatctttgacgaattgaccgaggcattaacaatatccggtctcgttcctcctcagacaacagttaatatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 38518573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49787068 - 49786640
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  49787068 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaatatgct 49786969  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |          ||    
T  49786968 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 49786869  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49786868 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 49786769  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  49786768 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 49786680  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  49786679 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 49786640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 119 - 510
Target Start/End: Original strand, 13337320 - 13337721
Alignment:
Q  119 aatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaa 208  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||| ||    
T  13337320 aatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacataaa 13337419  T
Q  209 cggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatc 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337420 cggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcatgaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 13337519  T
Q  309 cacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccata 408  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  13337520 cacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaaacctcaacacattacaataatatcata 13337619  T
Q  409 tctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcat 508  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13337620 tctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcat 13337719  T
Q  509 tc 510  Q
    ||    
T  13337720 tc 13337721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 201 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 618266 - 617957
Alignment:
Q  201 gacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  618266 gacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattg 618167  T
Q  301 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 400  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  618166 agagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagttagcctcaacaaattacaata 618067  T
Q  401 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 500  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||| ||    
T  618066 agcctatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaaagct 617967  T
Q  501 attgtcattc 510  Q
    ||||||||||    
T  617966 attgtcattc 617957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 55559131 - 55558856
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55559131 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 55559032  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55559031 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 55558932  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  55558931 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 55558856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55559278 - 55559131
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  55559278 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 55559179  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55559178 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24269310 - 24268803
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24269310 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 24269211  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  24269210 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 24269111  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24269110 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 24269011  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24269010 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacaataagcgtcaacacattaaaataag 24268911  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  24268910 cacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactat 24268811  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  24268810 tgtcattc 24268803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 27509353 - 27509860
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27509353 tggacattagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 27509452  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac--------- 203  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |             
T  27509453 caactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 27509552  T
Q  204 -atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27509553 tatcaacgaatttgttgtgtccgacatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatctcaccattctcatctgaagcgtcgttgctgtctccaattgag 27509652  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  27509653 agtatctacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtagcaaagatgcacccaatcttatattaacagtaagcctcaatacattacaataag 27509752  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  27509753 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 27509852  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  27509853 tgtcattc 27509860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 501
Target Start/End: Original strand, 24245812 - 24246302
Alignment:
Q  21 agaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24245812 agaattttcacccgatcgacaaacagaatcagatcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaa 24245911  T
Q  121 tcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacg 210  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |          ||||| |||    
T  24245912 tcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaggtctataagtgacatccacg 24246011  T
Q  211 gatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatcca 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24246012 gatttgttgtgtccgttatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttgccgtctccaattgagagaatcca 24246111  T
Q  311 catgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatc 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24246112 catgccaacattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagattcacc-aatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatc 24246210  T
Q  411 tttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttcc-ttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  24246211 tttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcatcattcctttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaaacta 24246302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 27192468 - 27192975
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27192468 tggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 27192567  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  27192568 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 27192667  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27192668 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgag 27192767  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||    
T  27192768 agtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataag 27192867  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27192868 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 27192967  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  27192968 tgtcattc 27192975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 27842282 - 27842789
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27842282 tggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 27842381  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  27842382 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 27842481  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27842482 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgag 27842581  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||    
T  27842582 agtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataag 27842681  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27842682 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 27842781  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  27842782 tgtcattc 27842789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 21395349 - 21395856
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  21395349 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 21395448  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||          |    
T  21395449 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatatacaaagtctataagcga 21395548  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21395549 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 21395648  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21395649 agtatccacttgccgaaattagcaatttcttcctgatctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 21395748  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  21395749 cccataactttgacgaattgacggaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 21395848  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
     |||||||    
T  21395849 ggtcattc 21395856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17684069 - 17683597
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17684069 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacaaaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 17683970  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  17683969 caattgaatcaagcgttggagcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 17683870  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17683869 catcaacggatttgttgtgtccaatatgagcgaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 17683770  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  17683769 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagccttaacacattacaataag 17683670  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatat 475  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  17683669 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatat 17683597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28666412 - 28665984
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  28666412 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 28666313  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  28666312 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 28666213  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28666212 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 28666113  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  28666112 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 28666024  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  28666023 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 28665984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37825246 - 37824818
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  37825246 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 37825147  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||| ||          |    
T  37825146 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacagagtctataagtga 37825047  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37825046 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 37824947  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  37824946 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 37824858  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  37824857 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 37824818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41920413 - 41919986
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  41920413 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttatcttcacctggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgct 41920314  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
     || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||    
T  41920313 taattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 41920214  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41920213 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 41920114  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  41920113 agtatccacttgcaaaaattatcaatttcttcctgctctacaggtaccaaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 41920025  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatat 441  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  41920024 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatat 41919986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 238 - 510
Target Start/End: Original strand, 35609867 - 35610139
Alignment:
Q  238 cttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctg 337  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35609867 cttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctg 35609966  T
Q  338 ctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaaca 437  Q
    ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35609967 ctctaaaggtaccgaagatgcacccaatgtcatattaacagtaagcctcaacacattataataagtccatatctttaatgaattgattggggcatcaaca 35610066  T
Q  438 atatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  35610067 atatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattc 35610139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 35609664 - 35609852
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  35609664 tggacatcagaattttcactcgatcgacaaacataatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatact 35609763  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  35609764 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcggaatacacaaag 35609852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 352 - 503
Target Start/End: Original strand, 3642920 - 3643071
Alignment:
Q  352 aagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagt 451  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3642920 aagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgt 3643019  T
Q  452 tccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactatt 503  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3643020 tccttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactatt 3643071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2453357 - 2452850
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2453357 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatatattcgttaacatgct 2453258  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||          |    
T  2453257 caactcaataaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcggaattcacaaagtctataagtga 2453158  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2453157 catcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 2453058  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |    
T  2453057 agtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcatgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatg 2452958  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2452957 cctatatctttgatgaattgattgaagcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaactac 2452858  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  2452857 tgtcattc 2452850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 36207194 - 36207701
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36207194 tggacatcataattttcacccgatcgacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 36207293  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  36207294 caactgaatcaattgttggggcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 36207393  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36207394 catcaacggatttgttgtgtcggatatgagaaaatcatcaggaatttctaccttcaattcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtcttcaattgag 36207493  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  36207494 agtatccacttgccaaaattatcaatttcttcctgctttgcaggtaccgaagatgaacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaa 36207593  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  36207594 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaataatatcctgcctctttccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaactac 36207693  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  36207694 tgtcattc 36207701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 16042004 - 16042511
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  16042004 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 16042103  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||          |    
T  16042104 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagattgggatacacaaagtctataagcga 16042203  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042204 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 16042303  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16042304 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 16042403  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    || |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  16042404 ccaatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactac 16042503  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  16042504 tgtcattc 16042511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 499
Target Start/End: Original strand, 2329148 - 2329641
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2329148 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 2329247  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacac-------aaagacat 205  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||       |  |||||    
T  2329248 cgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgtctataagtgacat 2329347  T
Q  206 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2329348 caacggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctctaattgagagt 2329447  T
Q  306 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagccc 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  2329448 atccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaacgaagaggcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagccc 2329547  T
Q  406 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaac 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||  | |||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2329548 atatctttgatgaattgattaaggcattaacaatatcgtgcctcgttgcttcacggacaacaggtagtatctgcctgaaatcaccacctaaaac 2329641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 37390389 - 37389885
Alignment:
Q  16 acatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37390389 acatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaa 37390290  T
Q  116 ctgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acat 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          ||||    
T  37390289 ctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacat 37390190  T
Q  206 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  37390189 caacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatctttgccgtctccaattgagaat 37390090  T
Q  306 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagccc 405  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37390089 atccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagccc 37389990  T
Q  406 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgt 505  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37389989 atatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccagcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgt 37389890  T
Q  506 cattc 510  Q
    |||||    
T  37389889 cattc 37389885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 48775575 - 48775068
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  48775575 tggacatcagactttttgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcatttacatcatatattcgttaacatgct 48775476  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||  ||||| ||||||          |    
T  48775475 caaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagcaggtcaccaatgttatcattctaatcgggatatacaaagtgtattagtga 48775376  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775375 catcaaagaatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 48775276  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48775275 agtatccacttgccaaaattagcagtttctttctgctctgtaggtcccgaagatgcacccaatctgatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 48775176  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   |||||| |  ||||||||||||| ||||||||     
T  48775175 cccatatatttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaactac 48775076  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
     |||||||    
T  48775075 cgtcattc 48775068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6311235 - 6310731
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcg-acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  6311235 tggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgc 6311136  T
Q  112 tcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag---------- 201  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||              
T  6311135 tcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtg 6311036  T
Q  202 acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattga 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6311035 acatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaatgga 6310936  T
Q  302 gagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataa 401  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6310935 gactatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 6310836  T
Q  402 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||  |||||  || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  6310835 gcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatcaggcctcattcctcctcggacaacagacaatatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 6310736  T
Q  502 ttgtc 506  Q
    |||||    
T  6310735 ttgtc 6310731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 410
Target Start/End: Original strand, 18148667 - 18149074
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18148667 tggacataagaattttcatccgatcgacaaacagaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 18148766  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||          ||    
T  18148767 caaatgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaattgagatacacaaagtcgataagtga 18148866  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  18148867 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcataaatttctaccttcatttcaccattctccttcgaagcgttattgccgtctccaattcag 18148966  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  18148967 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 18149066  T
Q  403 cccatatc 410  Q
     |||||||    
T  18149067 tccatatc 18149074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 154 - 510
Target Start/End: Original strand, 48233498 - 48233864
Alignment:
Q  154 aaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcgg 243  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  48233498 aaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgttcgatatgagtaaatcttcag 48233597  T
Q  244 aaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 343  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48233598 gaatttctaccttcatttccccattctcatctgaagcgtcgttgtcgtctcaagttgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgc 48233697  T
Q  344 acgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 443  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233698 aggtaccaaagatgcacccaatctcatatcaacagtaagcctcaacaaattacaataaacacatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 48233797  T
Q  444 tacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |  || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48233798 tgtctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 48233864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Original strand, 52500795 - 52501063
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  52500795 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 52500887  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52500888 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 52500987  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52500988 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 52501063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48238717 - 48238529
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  48238717 tggacatcaaagttttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 48238618  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48238617 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaag 48238529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 52500648 - 52500795
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  52500648 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 52500747  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500748 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 510
Target Start/End: Original strand, 18988 - 19491
Alignment:
Q  16 acatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18988 acatcagaattttcactcgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaa 19087  T
Q  116 ctgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acat 205  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          ||||    
T  19088 ctgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacat 19187  T
Q  206 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  19188 caacatatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcaaagt 19287  T
Q  306 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagccc 405  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  19288 atccccttgccaaa-ttagcaatttctttctgctctgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagccc 19386  T
Q  406 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgt 505  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19387 atatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattgt 19486  T
Q  506 cattc 510  Q
    |||||    
T  19487 cattc 19491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21113984 - 21113477
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21113984 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 21113885  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  21113884 caactgaatcaagcgttggtgcaagtattccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtga 21113785  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21113784 catcaacagatttgttgtgtccgatataagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 21113685  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  21113684 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacagtaagcgtcaacacattaaaataag 21113585  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  21113584 cacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactat 21113485  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  21113484 tgtcattc 21113477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25218805 - 25218298
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  25218805 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 25218706  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  25218705 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 25218606  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25218605 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 25218506  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25218505 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 25218406  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  25218405 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 25218306  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  25218305 tgtcattc 25218298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25209272 - 25208780
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  25209272 tggacatcagaattttcgcccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 25209173  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacgga 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || | |  |||   |  ||||||||||||    
T  25209172 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattaaagtct--ata---agtgacatcaacgga 25209078  T
Q  213 tttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccaca 312  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25209077 tttgttgtgtctgacatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccact 25208978  T
Q  313 tgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctt 412  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  25208977 tgcaaaaattagtaatttcgtcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacattaagcctcaacacattacaataagctcatatctt 25208878  T
Q  413 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || || ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25208877 tgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 25208780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 7821817 - 7822324
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  7821817 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 7821916  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||          |    
T  7821917 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcggaatacacaaagtctataagtga 7822016  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7822017 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgag 7822116  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7822117 agtatccacttacaaaaattcgcaatttcttcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 7822216  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  7822217 ctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaataatcggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 7822316  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  7822317 tgtcattc 7822324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 422
Target Start/End: Original strand, 30307156 - 30307575
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  30307156 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcggagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 30307255  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||          |    
T  30307256 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcgttcagatcgggatacacaaagtctataagtga 30307355  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30307356 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctacattcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgag 30307455  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30307456 agtatctacttgcaaaaattagcaatttcttcccactctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 30307555  T
Q  403 cccatatctttgatgaattg 422  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30307556 cccatatctttgacgaattg 30307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31978767 - 31978579
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||    
T  31978767 tggacatctgaattttcccccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgct 31978668  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 201  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  31978667 caactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaag 31978579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 510
Target Start/End: Original strand, 30325877 - 30325961
Alignment:
Q  426 gaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30325877 gaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattc 30325961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18109 - 17610
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18109 tggacatcataattttcacccgatcggcaaacagaatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 18010  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  18009 caactaaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttg-------agcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 17917  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17916 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaacttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcttcgttgctgtctccaattgag 17817  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  17816 agtatccacttgctaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa-aag 17718  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  17717 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaactct 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Original strand, 31912 - 32418
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||    
T  31912 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagcaacatcataaattcgttaacatgct 32011  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  32012 caactgaatcaagcgttggtgcaagtat-cccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 32110  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32111 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgag 32210  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32211 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 32310  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  32311 cacatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcgtcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 32410  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  32411 tgtcattc 32418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 19436 - 19670
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||    
T  19436 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgct 19535  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||    
T  19536 caactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtga 19635  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaat 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19636 catcaacagatttgttgtgtccgatatcagcaaat 19670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 274 - 510
Target Start/End: Original strand, 1 - 237
Alignment:
Q  274 ccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatatt 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 ccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatatt 100  T
Q  374 aacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaat 473  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  || || ||  ||||||    
T  101 aacagtaagcctcaaaacattacaataagccaatatatttgacgaattgaccgagacatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaaaaggcaat 200  T
Q  474 atcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  201 atctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 314
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  812 tggacatcagaattttcacccaatctacaaacagaatcagaggttaaatactctttcttttcacctggaatcagcgacatcataaattcattaacatgct 713  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |    
T  712 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagctggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtttataagtga 613  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  612 catcaacgggtttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 513  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  512 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataag 413  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  412 cccatatctttgacgaattgattgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5499 - 4993
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5499 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 5400  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  5399 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaa-tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 5301  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||| | ||    
T  5300 catcaatagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgctgttgtcgtctccaagtcag 5201  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  5200 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctttgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataag 5101  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  5100 cacatatcttttatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaactat 5001  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  5000 tgtcattc 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 321576 - 321069
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  321576 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgatatcataaattcgttaacatgct 321477  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||          |    
T  321476 caactgaatcaagcattggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacaaaaagtctataagtga 321377  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  321376 catcaacggatttgttttgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattatcaaccgaagcataattgccgtctcaaattgag 321277  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  321276 aatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaaaagtaagcctcaacacattacaataag 321177  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 502  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  321176 cccatatcgttgatgaattgattaaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactct 321077  T
Q  503 tgtcattc 510  Q
    ||||||||    
T  321076 tgtcattc 321069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Original strand, 182794 - 183297
Alignment:
Q  17 catcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaac 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  182794 catcagatttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaac 182893  T
Q  117 tgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatc 206  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||          |||||    
T  182894 cgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagtgggtcaccaatgatatcattcaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatc 182993  T
Q  207 aacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagta 306  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182994 aacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagta 183093  T
Q  307 tccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagccca 406  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  183094 tccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatatcatattaactgtaagcctcaacacattacaataaggcca 183193  T
Q  407 tatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 506  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||    
T  183194 tatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcattccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatc 183293  T
Q  507 attc 510  Q
    ||||    
T  183294 attc 183297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 510
Target Start/End: Original strand, 165511 - 166019
Alignment:
Q  15 gacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctc 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  165511 gacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctc 165610  T
Q  114 aactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------ac 203  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||    
T  165611 aaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgac 165710  T
Q  204 atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgaga 303  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  165711 atcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgaga 165810  T
Q  304 gtat--ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataa 401  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  165811 gtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataa 165910  T
Q  402 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  165911 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 166010  T
Q  502 ttgtcattc 510  Q
     | ||||||    
T  166011 ctatcattc 166019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 442
Target Start/End: Original strand, 983 - 1418
Alignment:
Q  17 catcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaac 116  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  983 catcagaattttcgcccgattgacaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgac 1082  T
Q  117 tgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatc 206  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||    
T  1083 tgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatc 1182  T
Q  207 aacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1183 aacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagagtcgttgtcgtctccaattgagagta 1282  T
Q  307 tccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagccca 406  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  1283 tccacttgccaaaattagaaatttcttcctgctatacatgtacctaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctca 1382  T
Q  407 tatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  1383 tatctttgatgaattgattgatgcataaataatatc 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49176 - 48748
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  49176 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 49077  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 202  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  49076 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 48977  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48976 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 48877  T
Q  303 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 402  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||    
T  48876 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 48788  T
Q  403 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 442  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  48787 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 48748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28452
Alignment:
Q  235 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 334  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28727 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgctgtcttcaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 28628  T
Q  335 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28627 ctgctctgcaggtaccaaagatgcatccaatctcatattaacagtaagtctcaactcattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 28528  T
Q  435 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28527 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaactattgtcattc 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28874 - 28727
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  28874 tggacatcaaaattttcacccaagcgacaaacagaatcagagtttaaatactttttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 28775  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28774 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 205 - 443
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40175
Alignment:
Q  205 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39937 tcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaagaatttctacctttatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccatctccaattgagag 40036  T
Q  305 tatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcc 404  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40037 tattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcacacaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcc 40136  T
Q  405 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 443  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40137 catatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatcc 40175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 16663 - 16889
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || ||    
T  16663 tggacatcagaattttcgctcgattgaaaaacagaatcatagcttaaaaactctttctcttcacctagaatcagtgaaatcatatatgcgttaacatact 16762  T
Q  113 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 202  Q
    | ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||          ||    
T  16763 ccactaaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 16862  T
Q  203 catcaacggatttgttgtgtccgatat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 catcaacggatttgttgtgtccgatat 16889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 358 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 14010
Alignment:
Q  358 cacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttt 457  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14162 cacccaatctcatattaatagtaagcctcaacatattaaaataagcccatatatttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcttgcctcgttccttt 14063  T
Q  458 tcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 510  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14062 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattatcattc 14010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 142 - 30
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  142 tggaaatcagaattttcacccgatcgacatacaaaatcagagcttaaatactctttctcgccacctgaaatcagtgacatcgtatattcgttaacatgct 43  T
Q  113 caactgaatcaag 125  Q
    |||||||||||||    
T  42 caactgaatcaag 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1703
Alignment:
Q  13 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtga 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1627 tggacatcaaaattttcacccgatcgataaacataatcagagtttaaatacgctttctcttcacctggaatcagtga 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University