View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8586_low_4 (Length: 455)

Name: NF8586_low_4
Description: NF8586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8586_low_4
NF8586_low_4
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (13-444)||(19773030-19773461)
chr5 (13-444)||(16359572-16360003)
chr5 (13-444)||(34569564-34569995)
chr5 (13-444)||(41773912-41774343)
chr5 (13-444)||(22329772-22330203)
chr5 (13-444)||(40711850-40712281)
chr5 (13-444)||(27682285-27682716)
chr5 (13-444)||(14996624-14997055)
chr5 (13-444)||(27521476-27521907)
chr5 (13-444)||(27613426-27613857)
chr5 (13-444)||(37288381-37288812)
chr5 (20-444)||(27665388-27665799)
chr5 (13-444)||(29472958-29473389)
chr5 (13-444)||(22137738-22138169)
chr5 (13-444)||(22350989-22351420)
chr5 (29-444)||(18782200-18782618)
chr5 (20-425)||(20803674-20804082)
chr5 (229-444)||(23537097-23537312)
chr5 (23-375)||(23461051-23461406)
chr5 (23-429)||(23526131-23526540)
chr5 (20-381)||(21882851-21883218)
chr5 (171-384)||(25429648-25429864)
chr5 (185-396)||(25851296-25851510)
chr5 (182-387)||(23077844-23078052)
chr5 (182-396)||(22505900-22506117)
chr5 (185-396)||(14883921-14884135)
chr5 (185-396)||(20345506-20345720)
chr5 (269-384)||(21331931-21332046)
chr5 (281-388)||(21870216-21870323)
chr5 (281-388)||(21874496-21874603)
chr5 (189-384)||(21631341-21631539)
chr5 (278-387)||(23474532-23474641)
chr5 (269-384)||(26735670-26735785)
chr5 (55-106)||(22505773-22505824)
chr5 (42-105)||(25851153-25851216)
chr5 (23-96)||(25429501-25429574)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (13-444)||(15157769-15158200)
chr7 (13-444)||(8710732-8711163)
chr7 (13-444)||(14335523-14335954)
chr7 (13-444)||(18586883-18587314)
chr7 (13-444)||(13689168-13689599)
chr7 (13-444)||(18180870-18181300)
chr7 (13-444)||(44788063-44788494)
chr7 (13-444)||(11233925-11234356)
chr7 (76-444)||(10873652-10874019)
chr7 (20-444)||(12690635-12691059)
chr7 (20-444)||(11549814-11550238)
chr7 (30-444)||(14957652-14958066)
chr7 (29-444)||(11984135-11984553)
chr7 (29-438)||(9591507-9591919)
chr7 (62-444)||(17703164-17703549)
chr7 (62-444)||(16726150-16726535)
chr7 (185-396)||(26091533-26091747)
chr7 (171-384)||(15145692-15145908)
chr7 (185-396)||(40924552-40924766)
chr7 (281-388)||(16947215-16947322)
chr7 (185-396)||(26115325-26115539)
chr7 (282-388)||(13004865-13004971)
chr7 (185-393)||(49155601-49155812)
chr7 (185-384)||(14042994-14043196)
chr7 (185-384)||(14353024-14353226)
chr7 (281-444)||(14145060-14145223)
chr7 (281-388)||(14260989-14261096)
chr7 (182-387)||(12459925-12460133)
chr7 (188-388)||(19150314-19150517)
chr7 (188-388)||(20749713-20749916)
chr7 (185-380)||(13965419-13965617)
chr7 (290-388)||(12712406-12712504)
chr7 (281-387)||(12798248-12798354)
chr7 (182-387)||(13024641-13024849)
chr7 (269-380)||(15627910-15628021)
chr7 (281-387)||(11385173-11385279)
chr7 (278-384)||(14283121-14283227)
chr7 (42-106)||(12459785-12459849)
chr7 (182-357)||(21755709-21755887)
chr7 (42-149)||(13965653-13965760)
chr7 (185-225)||(14261155-14261195)
chr7 (281-369)||(15099365-15099453)
chr7 (180-216)||(15099521-15099557)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (13-444)||(16574892-16575323)
chr6 (13-444)||(16620057-16620488)
chr6 (13-444)||(24292630-24293061)
chr6 (13-444)||(29589287-29589718)
chr6 (13-444)||(27205624-27206055)
chr6 (13-444)||(27243173-27243604)
chr6 (13-444)||(28312632-28313063)
chr6 (20-444)||(28260045-28260469)
chr6 (20-444)||(28285447-28285871)
chr6 (20-444)||(28338794-28339218)
chr6 (13-444)||(2871650-2872081)
chr6 (18-438)||(25115559-25115981)
chr6 (13-444)||(22829234-22829665)
chr6 (23-444)||(5836076-5836497)
chr6 (23-384)||(22436881-22437245)
chr6 (29-444)||(25756460-25756878)
chr6 (29-444)||(27558814-27559232)
chr6 (182-438)||(21764983-21765242)
chr6 (23-285)||(18404948-18405213)
chr6 (185-396)||(24367574-24367788)
chr6 (281-387)||(19438275-19438381)
chr6 (267-396)||(14376809-14376938)
chr6 (23-147)||(19867699-19867823)
chr6 (182-387)||(10465750-10465958)
chr6 (278-384)||(18660189-18660295)
chr6 (231-369)||(19867879-19868017)
chr6 (282-388)||(19881670-19881776)
chr6 (290-388)||(34642486-34642584)
chr6 (275-384)||(23081690-23081799)
chr6 (269-384)||(18182293-18182408)
chr6 (23-65)||(16924867-16924909)
chr6 (269-387)||(19456284-19456402)
chr6 (269-387)||(19466429-19466547)
chr6 (281-387)||(21566893-21566999)
chr6 (42-106)||(10466034-10466098)
chr6 (281-388)||(18797963-18798070)
chr6 (185-230)||(16813814-16813859)
chr6 (185-225)||(8720772-8720812)
chr6 (185-225)||(19456197-19456237)
chr6 (185-225)||(19466342-19466382)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (13-444)||(27714474-27714905)
chr4 (13-444)||(23958885-23959316)
chr4 (20-444)||(19775236-19775660)
chr4 (13-444)||(17091592-17092023)
chr4 (13-444)||(8389550-8389981)
chr4 (13-444)||(12479738-12480169)
chr4 (13-444)||(16233435-16233866)
chr4 (13-444)||(8050066-8050497)
chr4 (13-444)||(14300422-14300853)
chr4 (13-444)||(19635274-19635705)
chr4 (13-444)||(40476178-40476609)
chr4 (20-444)||(14683712-14684136)
chr4 (25-438)||(13513500-13513916)
chr4 (113-444)||(18604259-18604593)
chr4 (124-443)||(18223914-18224236)
chr4 (185-438)||(16248122-16248378)
chr4 (229-438)||(16350188-16350397)
chr4 (185-396)||(3261542-3261756)
chr4 (23-384)||(14162618-14162982)
chr4 (182-429)||(7357574-7357824)
chr4 (185-444)||(29450237-29450499)
chr4 (171-384)||(8332-8548)
chr4 (182-357)||(20893338-20893516)
chr4 (185-396)||(44658614-44658828)
chr4 (185-384)||(15536-15738)
chr4 (257-384)||(15144448-15144575)
chr4 (278-370)||(14697507-14697599)
chr4 (20-102)||(15144677-15144759)
chr4 (71-165)||(16250572-16250666)
chr4 (281-388)||(18259850-18259957)
chr4 (182-375)||(11204001-11204197)
chr4 (281-399)||(14993112-14993230)
chr4 (269-387)||(16219585-16219703)
chr4 (269-387)||(16222905-16223023)
chr4 (267-399)||(15073754-15073886)
chr4 (265-388)||(16151029-16151152)
chr4 (265-388)||(16155175-16155298)
chr4 (42-105)||(7357434-7357497)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (13-444)||(12889466-12889897)
chr3 (13-444)||(15345187-15345618)
chr3 (13-444)||(43165432-43165863)
chr3 (20-444)||(5421872-5422296)
chr3 (13-444)||(10008357-10008788)
chr3 (13-444)||(16638530-16638961)
chr3 (13-444)||(48428204-48428635)
chr3 (13-444)||(20058996-20059427)
chr3 (13-444)||(26790355-26790786)
chr3 (20-444)||(6603499-6603923)
chr3 (20-444)||(16753643-16754067)
chr3 (13-444)||(3688700-3689131)
chr3 (13-444)||(10908967-10909398)
chr3 (13-444)||(13255447-13255878)
chr3 (13-444)||(15586334-15586765)
chr3 (13-444)||(15712998-15713429)
chr3 (13-444)||(53381961-53382391)
chr3 (13-444)||(15399460-15399890)
chr3 (20-444)||(24185954-24186378)
chr3 (111-444)||(5110351-5110684)
chr3 (170-444)||(6596969-6597243)
chr3 (196-444)||(15358992-15359240)
chr3 (29-444)||(16803886-16804304)
chr3 (24-426)||(11861121-11861526)
chr3 (29-444)||(16694937-16695355)
chr3 (29-444)||(23414729-23415147)
chr3 (13-169)||(15358840-15358996)
chr3 (31-410)||(12501708-12502090)
chr3 (20-438)||(15065835-15066256)
chr3 (23-384)||(23079016-23079380)
chr3 (171-384)||(17497606-17497822)
chr3 (185-429)||(10408907-10409154)
chr3 (130-384)||(14578420-14578677)
chr3 (171-441)||(14873527-14873800)
chr3 (185-396)||(28757258-28757472)
chr3 (185-396)||(47126883-47127097)
chr3 (171-384)||(12843102-12843318)
chr3 (383-444)||(5108481-5108542)
chr3 (275-384)||(16326695-16326804)
chr3 (287-387)||(16825264-16825364)
chr3 (137-384)||(19727641-19727890)
chr3 (265-388)||(31692169-31692292)
chr3 (185-378)||(14290526-14290722)
chr3 (278-384)||(16831516-16831622)
chr3 (267-351)||(11958202-11958286)
chr3 (281-444)||(16384300-16384463)
chr3 (265-388)||(31941925-31942048)
chr3 (269-399)||(12857469-12857599)
chr3 (290-388)||(17189421-17189519)
chr3 (292-384)||(13028345-13028437)
chr3 (42-125)||(28757115-28757198)
chr3 (281-399)||(12357500-12357618)
chr3 (344-388)||(10417029-10417073)
chr3 (42-106)||(16326978-16327042)
chr3 (185-225)||(17494585-17494625)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (13-444)||(27374038-27374469)
chr2 (13-444)||(9338351-9338782)
chr2 (13-444)||(9486985-9487416)
chr2 (13-444)||(24712803-24713234)
chr2 (13-444)||(22322585-22323016)
chr2 (13-444)||(16984009-16984440)
chr2 (13-444)||(44382813-44383244)
chr2 (13-444)||(17001769-17002200)
chr2 (13-444)||(24265139-24265570)
chr2 (13-444)||(10871619-10872050)
chr2 (13-444)||(24873993-24874424)
chr2 (28-444)||(23116299-23116718)
chr2 (13-276)||(21139392-21139655)
chr2 (20-438)||(24704728-24705149)
chr2 (30-444)||(22462721-22463138)
chr2 (23-441)||(24678266-24678687)
chr2 (24-384)||(22742266-22742629)
chr2 (23-438)||(23028708-23029125)
chr2 (29-444)||(24656898-24657316)
chr2 (287-387)||(16931598-16931698)
chr2 (23-384)||(23105027-23105392)
chr2 (35-384)||(23039877-23040229)
chr2 (29-264)||(23205099-23205337)
chr2 (29-264)||(23676703-23676941)
chr2 (23-384)||(22733074-22733438)
chr2 (173-395)||(21320292-21320517)
chr2 (20-230)||(11351168-11351378)
chr2 (281-387)||(23274633-23274739)
chr2 (26-273)||(23065195-23065445)
chr2 (26-273)||(23074645-23074895)
chr2 (261-444)||(20848606-20848789)
chr2 (295-433)||(23029815-23029953)
chr2 (23-77)||(21322876-21322930)
chr2 (185-230)||(28350816-28350861)
chr2 (288-324)||(19716377-19716413)
chr2 (288-324)||(19720940-19720976)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (13-444)||(21833455-21833886)
chr1 (13-444)||(33387804-33388235)
chr1 (13-444)||(51330267-51330698)
chr1 (13-444)||(16347369-16347801)
chr1 (13-444)||(41350444-41350874)
chr1 (13-444)||(21842365-21842796)
chr1 (18-444)||(22400478-22400904)
chr1 (20-444)||(19109528-19109953)
chr1 (261-444)||(16354018-16354201)
chr1 (35-444)||(21228328-21228740)
chr1 (20-406)||(24784667-24785056)
chr1 (29-444)||(17041788-17042205)
chr1 (20-438)||(22435521-22435932)
chr1 (23-369)||(20081223-20081572)
chr1 (23-388)||(22401755-22402123)
chr1 (23-384)||(22496088-22496452)
chr1 (182-408)||(21176689-21176918)
chr1 (185-396)||(48426229-48426443)
chr1 (267-384)||(16379504-16379621)
chr1 (185-396)||(37680405-37680619)
chr1 (23-384)||(21752210-21752574)
chr1 (182-375)||(20074550-20074746)
chr1 (185-396)||(20297739-20297953)
chr1 (182-337)||(52989094-52989252)
chr1 (185-375)||(38909667-38909860)
chr1 (281-387)||(22015574-22015680)
chr1 (269-366)||(22117126-22117223)
chr1 (290-388)||(21742380-21742478)
chr1 (182-375)||(21961380-21961576)
chr1 (182-375)||(31536838-31537034)
chr1 (185-379)||(19857630-19857827)
chr1 (299-388)||(21738864-21738953)
chr1 (278-384)||(20921860-20921966)
chr1 (55-125)||(37680275-37680345)
chr1 (29-102)||(21176597-21176670)
chr1 (185-225)||(21739030-21739070)
chr1 (185-225)||(21742546-21742586)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (13-444)||(17671168-17671599)
chr8 (13-444)||(19115604-19116035)
chr8 (13-444)||(20015409-20015840)
chr8 (13-444)||(19481219-19481649)
chr8 (13-444)||(18859781-18860212)
chr8 (13-444)||(22126105-22126536)
chr8 (13-444)||(22117321-22117752)
chr8 (29-444)||(22043047-22043465)
chr8 (29-444)||(30310287-30310705)
chr8 (29-444)||(15536603-15537021)
chr8 (113-444)||(32603449-32603783)
chr8 (23-384)||(19981181-19981545)
chr8 (23-384)||(18880860-18881224)
chr8 (13-384)||(21391064-21391438)
chr8 (13-384)||(21780390-21780764)
chr8 (23-438)||(21163679-21164105)
chr8 (29-258)||(22031323-22031554)
chr8 (81-384)||(21671787-21672093)
chr8 (171-384)||(22421096-22421312)
chr8 (262-387)||(29300626-29300751)
chr8 (42-396)||(16268415-16268772)
chr8 (185-429)||(28984287-28984534)
chr8 (269-384)||(22523973-22524088)
chr8 (240-381)||(19985614-19985755)
chr8 (267-387)||(21928889-21929009)
chr8 (278-426)||(22054335-22054483)
chr8 (353-444)||(17830113-17830204)
chr8 (281-324)||(22027543-22027586)
chr8 (290-387)||(3274589-3274686)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (13-444)||(22414-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (13-444)||(7403-7834)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (13-444)||(3591-4022)
scaffold0044 (29-443)||(17343-17760)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (18-444)||(10540-10965)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (13-444)||(41322-41753)
scaffold0109 (30-444)||(12827-13244)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (13-444)||(21164-21578)
scaffold0028 (13-444)||(11636-12050)
scaffold0028 (13-407)||(55171-55565)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (20-444)||(8432-8856)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (13-443)||(105-524)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (20-444)||(424482-424909)
scaffold0003 (281-384)||(203819-203922)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (18-407)||(48837-49226)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (231-444)||(107480-107693)
scaffold0029 (172-438)||(8540-8809)
scaffold0029 (344-388)||(93653-93697)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (29-444)||(33-450)
scaffold0008 (119-444)||(139313-139641)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (29-444)||(229555-229973)
scaffold0009 (188-387)||(251961-252163)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (29-444)||(5181-5599)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (29-410)||(217-601)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (23-438)||(36675-37093)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (29-444)||(14607-15025)
scaffold0010 (269-384)||(5341-5456)
scaffold0010 (185-230)||(39253-39298)
scaffold0010 (344-388)||(180598-180642)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (29-444)||(13733-14153)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (40-410)||(14778-15151)
scaffold0177 (40-410)||(11093-11466)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (29-443)||(473-890)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (62-438)||(4-383)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (23-438)||(15288-15706)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (30-444)||(9942-10358)
scaffold0080 (30-444)||(12597-13013)
scaffold0080 (20-438)||(32053-32474)
scaffold0080 (23-384)||(54814-55178)
scaffold0080 (20-210)||(37519-37709)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (20-441)||(7363-7787)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (30-444)||(63-480)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (23-429)||(21781-22190)
scaffold0081 (23-429)||(37205-37614)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (29-444)||(7482-7900)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (29-444)||(171301-171719)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (23-441)||(36526-36947)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (23-382)||(30464-30826)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (23-384)||(217-581)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (23-396)||(291-667)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (23-384)||(17112-17476)
scaffold0114 (281-322)||(40496-40537)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (29-444)||(3047-3465)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (113-426)||(3-319)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (23-382)||(101-463)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (184-426)||(121897-122142)
scaffold0034 (275-387)||(11666-11778)
scaffold0034 (185-399)||(1700-1917)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (23-384)||(2166-2530)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (23-384)||(8400-8764)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (172-384)||(141-356)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (23-384)||(8587-8952)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (23-372)||(30349-30701)
scaffold0023 (56-384)||(43216-43547)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (24-384)||(69-432)
scaffold0490 (281-385)||(3303-3407)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (23-273)||(10032-10285)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (26-384)||(50108-50469)
scaffold0102 (267-327)||(43122-43182)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (23-384)||(10643-11007)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (23-384)||(11441-11804)
scaffold0120 (23-369)||(14261-14610)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (13-384)||(15078-15452)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (23-438)||(16775-17193)
scaffold0017 (205-441)||(194574-194813)
scaffold0017 (23-105)||(194883-194965)
scaffold0017 (310-438)||(21297-21425)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-369)||(3728-4077)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (54-384)||(4318-4651)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (23-384)||(194-558)
scaffold0621 (23-384)||(4611-4975)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (23-368)||(1159-1507)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (130-438)||(801-1112)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (23-381)||(9124-9485)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (171-370)||(9220-9422)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (229-384)||(6886-7041)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (23-384)||(40270-40634)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (23-384)||(110670-111034)
scaffold0040 (278-384)||(18280-18386)
scaffold0040 (134-230)||(18133-18229)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (35-444)||(330-742)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (131-444)||(28631-28947)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (185-396)||(42074-42288)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (23-384)||(18827-19190)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (171-384)||(23708-23924)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (185-396)||(23674-23888)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (23-285)||(2125-2390)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (257-384)||(19812-19939)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (182-396)||(797-1014)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (171-384)||(48055-48271)
scaffold0075 (185-384)||(55234-55436)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (23-384)||(41809-42173)
scaffold0022 (23-384)||(75529-75893)
scaffold0022 (257-384)||(34534-34661)
scaffold0022 (20-102)||(34763-34845)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (229-438)||(66239-66448)
scaffold0064 (20-206)||(69366-69551)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (185-388)||(21153-21359)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (182-384)||(1067-1272)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (269-384)||(11454-11569)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (182-387)||(1247-1455)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (182-387)||(30086-30294)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (266-396)||(30333-30463)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (278-368)||(216199-216289)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (182-375)||(514125-514321)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (290-399)||(66856-66965)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (267-387)||(1071-1191)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (267-387)||(8168-8288)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (185-384)||(104565-104767)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (269-384)||(14028-14143)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (269-384)||(15836-15951)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (281-388)||(62531-62638)
scaffold0053 (278-388)||(65081-65191)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (281-387)||(50543-50649)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (185-429)||(11461-11708)
scaffold0523 (296-388)||(5890-5982)
scaffold0523 (180-216)||(5774-5810)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (179-387)||(33132-33343)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (290-387)||(98343-98440)
scaffold0020 (290-399)||(176434-176543)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (185-396)||(1358-1572)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (130-384)||(9903-10160)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (281-387)||(1608-1714)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (281-387)||(5662-5768)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (281-399)||(17232-17350)
scaffold0348 (287-324)||(4672-4709)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (278-384)||(9550-9656)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (275-396)||(13805-13926)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (278-378)||(53-152)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (182-335)||(615-771)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (281-387)||(305-411)
scaffold0476 (54-147)||(10994-11087)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (290-384)||(17686-17780)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (281-387)||(30062-30168)
scaffold0067 (281-324)||(49003-49046)
scaffold0067 (281-324)||(58037-58080)
scaffold0067 (281-324)||(64425-64468)
scaffold0067 (180-216)||(29958-29994)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (291-384)||(5536-5629)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (275-396)||(11409-11530)
scaffold0310 (42-106)||(11173-11237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (23-208)||(24654-24839)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (275-384)||(16372-16481)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (185-384)||(17740-17942)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (275-399)||(29959-30083)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (281-324)||(6080-6123)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (281-388)||(3810-3917)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (269-384)||(23296-23411)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (281-324)||(263664-263707)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (290-388)||(7485-7583)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (281-387)||(116062-116168)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (287-324)||(2275-2312)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (265-326)||(9036-9097)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (290-375)||(17084-17169)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (281-386)||(8223-8328)
scaffold0235 (281-386)||(18437-18542)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (290-387)||(6251-6348)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (275-387)||(621-732)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (281-388)||(15510-15617)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (309-388)||(63298-63377)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (290-384)||(2199-2292)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (185-227)||(12136-12178)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (278-384)||(1185-1291)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (278-375)||(13246-13343)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (267-388)||(54471-54592)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (180-225)||(808-853)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 19773030 - 19773461
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19773030 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 19773129  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19773130 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 19773229  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773230 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 19773329  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19773330 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 19773429  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19773430 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19773461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 16359572 - 16360003
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  16359572 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 16359671  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359672 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16359771  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359772 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16359871  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16359872 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 16359971  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16359972 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16360003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 34569564 - 34569995
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  34569564 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 34569663  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569664 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 34569763  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569764 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 34569863  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34569864 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 34569963  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34569964 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 34569995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 41773912 - 41774343
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41773912 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 41774011  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41774012 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 41774111  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774112 aacacacaatctcagcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 41774211  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41774212 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 41774311  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41774312 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 41774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22330203 - 22329772
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22330203 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgcgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacga 22330104  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22330103 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 22330004  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22330003 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 22329904  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22329903 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctc 22329804  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  22329803 agctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 40711850 - 40712281
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40711850 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 40711949  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711950 ttgcaatcagccaccacacgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 40712049  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40712050 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 40712149  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40712150 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctc 40712249  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40712250 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 40712281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27682716 - 27682285
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27682716 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacga 27682617  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27682616 ttgcaatcagctacagcatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 27682517  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27682516 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 27682417  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27682416 ctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgtagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 27682317  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27682316 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14997055 - 14996624
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14997055 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 14996956  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14996955 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 14996856  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14996855 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 14996756  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14996755 ctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtctggaaaaactctc 14996656  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  14996655 aactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 14996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 27521476 - 27521907
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  27521476 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 27521575  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27521576 ttgcaatcagctacaacatgatctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 27521675  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27521676 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 27521775  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27521776 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 27521875  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27521876 aactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 27613426 - 27613857
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27613426 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgagcctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 27613525  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27613526 ttgcaatcagctaccacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacattgctcttgtggcccttctcaccacaattga 27613625  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27613626 aacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 27613725  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27613726 ctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 27613825  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27613826 agttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37288812 - 37288381
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  37288812 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 37288713  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37288712 ttgcattcagctacaatgtgaactttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 37288613  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37288612 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggagcactgtacggcttaggacgact 37288513  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37288512 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 37288413  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37288412 agttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 37288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27665799 - 27665388
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27665799 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtatgattgcaat 27665700  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  27665699 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaat---------- 27665610  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665609 ---ctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 27665513  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27665512 cccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgtt 27665413  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  27665412 gatacccaatcgccctcttgatgtc 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29473389 - 29472958
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  29473389 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 29473290  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29473289 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacatcgaacacacttcttgatttcttcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 29473190  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29473189 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcggggacactgtacggcttaggacgact 29473090  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29473089 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctt 29472990  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29472989 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 29472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 22137738 - 22138169
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  22137738 agcaaagactctaccagtattcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtccgtacgc 22137837  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22137838 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 22137937  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137938 aacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 22138037  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  22138038 ctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactcta 22138137  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138138 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 22350989 - 22351420
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  22350989 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgttcgtacgc 22351088  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22351089 ttgcattaagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttcatttcttcggggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacagttga 22351188  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22351189 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttatgacgact 22351288  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22351289 ctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatctggaaaaactcta 22351388  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22351389 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22351420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 18782200 - 18782618
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| || || ||   ||| ||||||||||||||||    
T  18782200 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaacctcttcattacaattgaagcatacgatatcattacgcttgcaatcagctacaa 18782299  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  18782300 tatgacccttcttgccacaccggacacattttttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgc 18782399  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||    
T  18782400 aggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggcccttg 18782499  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  18782500 gtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatc 18782599  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18782600 caatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 20803674 - 20804082
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||  | ||||| |||| ||| |||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||   | | ||||| |    
T  20803674 acccttccagtagtcagcaccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgactctcttccttgccattgaagcacacaatatcactatgcttgcagt 20803773  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    |||||| |  |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |  |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20803774 cagctaaagtatgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagac 20803873  T
Q  220 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  |||| ||     
T  20803874 aatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgt 20803973  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    || |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  | ||    
T  20803974 tggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactcggatct 20804073  T
Q  417 gttggtatc 425  Q
    |||||||||    
T  20804074 gttggtatc 20804082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23537312 - 23537097
Alignment:
Q  229 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||   |    
T  23537312 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagtc 23537213  T
Q  329 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaa 428  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| |    
T  23537212 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccga 23537113  T
Q  429 tcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| |||| |||||    
T  23537112 tcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 23461051 - 23461406
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||| ||| | ||||||| | |||||||  || |||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  23461051 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgtttgcactgggaaccaatattaccctcttccttgcaatcgaaacacacaatatcaccatgcttgcattcag 23461150  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    ||| |  |||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  23461151 ctaaagtatgactcttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaat 23461250  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     || ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23461251 ttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctattttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 23461350  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23461351 cccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcttcata 23461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 429
Target Start/End: Original strand, 23526131 - 23526540
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||  |    
T  23526131 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacggttgcaattgg 23526230  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| | || |||  | || |  ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  23526231 ctaatgcatgacccttcttaccacatctgaaacatctttttacctctctaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 23526330  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||| ||| || || |||||  | ||||| || |||||||  |||||||||||     
T  23526331 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctatttgcccttgtcagcaagagcactatagggcttagtgcgactctgctgg 23526430  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |  |||||||  | |||||    
T  23526431 cccttagtcttccactcattcacaatcttgtaatgagcctttgtgtcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgtt 23526530  T
Q  420 ggtatccaat 429  Q
    ||||||||||    
T  23526531 ggtatccaat 23526540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 381
Target Start/End: Original strand, 21882851 - 21883218
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||  | |    
T  21882851 accctaccagtagtcggcaccttcttaggctgcttacactgagaaccaatgtgaccttcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttctact 21882950  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggaca-cacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaca 218  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||| | || | ||  |||| |  ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  21882951 cagctattgcatgacccttcttaccacatctgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacaga 21883050  T
Q  219 caatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 315  Q
    ||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21883051 caatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctg 21883150  T
Q  316 ctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc--cttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    ||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  21883151 ctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctcttagtatcctcctcatagatcct 21883218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 25429648 - 25429864
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| | || |||||| |    
T  25429648 caggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatcct 25429747  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    || ||| || |||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  25429748 ctatttgcccttattagcaggggcactgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 25429847  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| ||||||||    
T  25429848 tcctcataaatcctgca 25429864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 25851296 - 25851510
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  25851296 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 25851395  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  25851396 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 25851495  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  25851496 gcacctattaaccaa 25851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23078052 - 23077844
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||||||||| |||||||    
T  23078052 ttgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctt 23077953  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  23077952 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatat 23077853  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    |||||||||    
T  23077852 cctgcagct 23077844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 396
Target Start/End: Original strand, 22505900 - 22506117
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  22505900 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 22505999  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||| ||    
T  22506000 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaat 22506099  T
Q  379 cctgcagctattaaccaa 396  Q
     ||||| || ||||||||    
T  22506100 tctgcacctgttaaccaa 22506117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14884135 - 14883921
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||| || ||||| |    
T  14884135 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 14884036  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  14884035 cagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 14883936  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  14883935 gcacctattaaccaa 14883921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 20345506 - 20345720
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  20345506 ctcttgtgggctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 20345605  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| || ||    
T  20345606 cagcaggagcactataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaattct 20345705  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  20345706 gcacctattaaccaa 20345720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21332046 - 21331931
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||    
T  21332046 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatcct 21331947  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| ||||||||    
T  21331946 cctcataaatcctgca 21331931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21870323 - 21870216
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21870323 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21870224  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  21870223 tgcagcta 21870216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21874603 - 21874496
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21874603 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21874504  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  21874503 tgcagcta 21874496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21631539 - 21631341
Alignment:
Q  189 tgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagc 285  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||| |   || |||||  |||||| ||| |||||   || | | ||||| || ||||||||    
T  21631539 tgtggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctcacatcattcaccctttgtttacccttatcagc 21631440  T
Q  286 gggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  21631439 aggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgca 21631341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 387
Target Start/End: Original strand, 23474532 - 23474641
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||  |    
T  23474532 ttatcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatgta 23474631  T
Q  378 tcctgcagct 387  Q
    | ||||||||    
T  23474632 ttctgcagct 23474641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26735785 - 26735670
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||    
T  26735785 tgttttcctttatcagtaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcct 26735686  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  26735685 cctcataaattctgca 26735670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 106
Target Start/End: Original strand, 22505773 - 22505824
Alignment:
Q  55 acactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  22505773 acactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtcc 22505824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 25851153 - 25851216
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtc 105  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  25851153 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtc 25851216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 25429501 - 25429574
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagca 96  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  25429501 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcattgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagca 25429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15158200 - 15157769
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15158200 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 15158101  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15158100 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 15158001  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15158000 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 15157901  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15157900 ctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 15157801  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15157800 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 8710732 - 8711163
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  8710732 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 8710831  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8710832 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 8710931  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710932 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 8711031  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8711032 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 8711131  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  8711132 agctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 8711163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 14335523 - 14335954
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  14335523 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 14335622  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335623 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 14335722  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14335723 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgact 14335822  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14335823 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 14335922  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  14335923 agctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 14335954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18587314 - 18586883
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18587314 agcaaagaccctactagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtccgtacga 18587215  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587214 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 18587115  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18587114 agcacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgact 18587015  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18587014 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 18586915  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  18586914 agctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 18586883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 13689168 - 13689599
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13689168 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctatccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 13689267  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13689268 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 13689367  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13689368 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagtaggggcactgtacggcttaggacgact 13689467  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13689468 ctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtctggaaaaactctc 13689567  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13689568 agctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 13689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 18180870 - 18181300
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180870 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 18180969  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  18180970 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctttcgtggcctttctcgccacaattga 18181069  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18181070 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggaagact 18181169  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181170 ctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 18181269  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || ||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  18181270 agttgttaat-cccaatcgccctcttgatgtc 18181300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44788494 - 44788063
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||     
T  44788494 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 44788395  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44788394 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattga 44788295  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44788294 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagtaggggcactgtacggcttaggacgact 44788195  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44788194 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 44788095  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44788094 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 44788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11234356 - 11233925
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  11234356 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 11234257  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11234256 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 11234157  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234156 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 11234057  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  11234056 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactcta 11233957  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11233956 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 76 - 444
Target Start/End: Original strand, 10873652 - 10874019
Alignment:
Q  76 ctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagga 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873652 ctctccatt-caattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagga 10873750  T
Q  176 caggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873751 caggcgttgctcttgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 10873850  T
Q  276 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10873851 ctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 10873950  T
Q  376 gatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  10873951 gatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 10874019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 12690635 - 12691059
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||    
T  12690635 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaatacacaatgtccttacgcttgcaat 12690734  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  12690735 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggactttcacaccacaattgaaacacac 12690834  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690835 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 12690934  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  12690935 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgtt 12691034  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  12691035 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 12691059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11550238 - 11549814
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  11550238 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 11550139  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    || |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11550138 caactacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacac 11550039  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11550038 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgt 11549939  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11549938 cccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgtt 11549839  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  11549838 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 11549814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Original strand, 14957652 - 14958066
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||     
T  14957652 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaat 14957751  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  14957752 atgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggta 14957851  T
Q  230 gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 329  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14957852 gtatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgccct 14957951  T
Q  330 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaat 429  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14957952 tcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaat 14958051  T
Q  430 cgccttcttgatgtc 444  Q
    | || |||| |||||    
T  14958052 caccctcttaatgtc 14958066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 11984135 - 11984553
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  11984135 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgaaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 11984234  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  11984235 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcagtacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 11984334  T
Q  229 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
       ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11984335 tggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttg 11984434  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||    
T  11984435 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcttcgtagatcctacaactgttaaccaaatcaggaaaaactcggatttgttggtatc 11984534  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  11984535 cgatcgccctcttaatgtc 11984553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 438
Target Start/End: Original strand, 9591507 - 9591919
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||| ||    
T  9591507 gtagtaggctccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataa 9591606  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  9591607 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgc 9591706  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| || || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9591707 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 9591806  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  9591807 gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 9591906  T
Q  426 caatcgccttctt 438  Q
    | |||||| ||||    
T  9591907 cgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17703549 - 17703164
Alignment:
Q  62 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 161  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  17703549 gaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttct 17703450  T
Q  162 tgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatc 258  Q
    |||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17703449 tgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatc 17703350  T
Q  259 gaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 358  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  17703349 gaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagct 17703250  T
Q  359 ttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |  |||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17703249 ctggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16726535 - 16726150
Alignment:
Q  62 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 161  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  16726535 gaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttct 16726436  T
Q  162 tgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatc 258  Q
    |||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16726435 tgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatc 16726336  T
Q  259 gaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 358  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||||| |||||     
T  16726335 gaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagct 16726236  T
Q  359 ttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |  |||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16726235 ctggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26091747 - 26091533
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  26091747 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 26091648  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  26091647 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 26091548  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  26091547 gcacctattaaccaa 26091533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15145908 - 15145692
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || |   |    
T  15145908 caggacaagcattactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactct 15145809  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||     
T  15145808 ctgtttgcccttatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatct 15145709  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| ||||||||||    
T  15145708 tcctcaaagatcctgca 15145692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40924766 - 40924552
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  40924766 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 40924667  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  40924666 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 40924567  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  40924566 gcacctattaaccaa 40924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16947322 - 16947215
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16947322 tcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattc 16947223  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  16947222 tgcagcta 16947215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26115539 - 26115325
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||   ||||||||| || ||||| |    
T  26115539 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgt 26115440  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  26115439 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 26115340  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
     || || ||||||||    
T  26115339 acacctgttaaccaa 26115325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 388
Target Start/End: Original strand, 13004865 - 13004971
Alignment:
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  13004865 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 13004964  T
Q  382 gcagcta 388  Q
    |||||||    
T  13004965 gcagcta 13004971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 393
Target Start/End: Original strand, 49155601 - 49155812
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| | ||  ||||| |||| || ||||| |    
T  49155601 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttcctttgt 49155700  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  49155701 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 49155800  T
Q  382 gcagctattaac 393  Q
    ||| ||||||||    
T  49155801 gcatctattaac 49155812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 14042994 - 14043196
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   |||||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||||    
T  14042994 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 14043093  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||| |||||| || || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14043094 cagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcct 14043193  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  14043194 gca 14043196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 14353024 - 14353226
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   |||||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||||    
T  14353024 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 14353123  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||| |||||| || || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14353124 cagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcct 14353223  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  14353224 gca 14353226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 444
Target Start/End: Original strand, 14145060 - 14145223
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  14145060 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcatagatcc 14145159  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||| | | | |||||||| || |||| ||| | |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  14145160 tgcaacgactcaccaaatcagggaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 14145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14261096 - 14260989
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14261096 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 14260997  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  14260996 tgcagcta 14260989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Original strand, 12459925 - 12460133
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| ||||| || || |    
T  12459925 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttccct 12460024  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  12460025 tgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 12460124  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    |||||||||    
T  12460125 cctgcagct 12460133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 388
Target Start/End: Original strand, 19150314 - 19150517
Alignment:
Q  188 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||   ||||  || ||||||||| |||  ||||   || | |||| || || || ||||    
T  19150314 ttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcag 19150413  T
Q  285 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19150414 caggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgca 19150513  T
Q  385 gcta 388  Q
    ||||    
T  19150514 gcta 19150517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 388
Target Start/End: Original strand, 20749713 - 20749916
Alignment:
Q  188 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||   ||||  || ||||||||| |||  ||||   || | |||| || || || ||||    
T  20749713 ttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcag 20749812  T
Q  285 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  20749813 caggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgca 20749912  T
Q  385 gcta 388  Q
    ||||    
T  20749913 gcta 20749916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13965617 - 13965419
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  13965617 ctcttgtggtctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 13965518  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||| || || ||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  13965517 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcc 13965419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12712504 - 12712406
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||| | |||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12712504 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttggaatgagcctttgaatcttcctcatagattctgcagcta 12712406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12798354 - 12798248
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12798354 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcc 12798255  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  12798254 tacagct 12798248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Original strand, 13024641 - 13024849
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   |||| |||| |||||||    
T  13024641 ttgcttttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctt 13024740  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  13024741 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatat 13024840  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    |||||||||    
T  13024841 cctgcagct 13024849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 380
Target Start/End: Original strand, 15627910 - 15628021
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15627910 tgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatcct 15628009  T
Q  369 cttcatagatcc 380  Q
    | ||||||||||    
T  15628010 cctcatagatcc 15628021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11385279 - 11385173
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||  | |||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  11385279 tcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 11385180  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    |||||||    
T  11385179 tgcagct 11385173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14283227 - 14283121
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | | |||||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  14283227 ttatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcataga 14283128  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    |||||||    
T  14283127 tcctgca 14283121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 12459785 - 12459849
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  12459785 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtcc 12459849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 357
Target Start/End: Original strand, 21755709 - 21755887
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |    ||||||  || ||||||||| | |  ||||   ||| ||||| || ||||    
T  21755709 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggagcatctctcctcttaggcctcatgtcatcactcatattctgctttcctt 21755808  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc 357  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| |||||    
T  21755809 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagc 21755887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13965760 - 13965653
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 141  Q
    |||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |   ||||| ||||     
T  13965760 tcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtgacccttctg 13965661  T
Q  142 accacacc 149  Q
    ||||||||    
T  13965660 accacacc 13965653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14261195 - 14261155
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  14261195 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctc 14261155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15099453 - 15099365
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15099453 tcagcaggagcactatacggcgtcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctc 15099365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15099557 - 15099521
Alignment:
Q  180 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15099557 cgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 15099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 16574892 - 16575323
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16574892 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 16574991  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574992 ttgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16575091  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575092 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16575191  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16575192 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 16575291  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16575292 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16620488 - 16620057
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16620488 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 16620389  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620388 ttgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16620289  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620288 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16620189  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16620188 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 16620089  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16620088 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24293061 - 24292630
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24293061 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 24292962  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24292961 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattga 24292862  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292861 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 24292762  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24292761 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 24292662  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24292661 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24292630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29589718 - 29589287
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  29589718 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 29589619  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589618 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 29589519  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29589518 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagtgggggcactgtacggcttaggacgact 29589419  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29589418 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 29589319  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29589318 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 29589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 27205624 - 27206055
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27205624 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcacacaatgtccgaacga 27205723  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27205724 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 27205823  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27205824 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtacggcttaggacgact 27205923  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  27205924 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcttgaaaaactctc 27206023  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  27206024 agctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27243604 - 27243173
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27243604 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcacacaatgtccgaacga 27243505  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243504 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 27243405  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27243404 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtacggcttaggacgact 27243305  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  27243304 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcttgaaaaactctc 27243205  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  27243204 agctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27243173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 28312632 - 28313063
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28312632 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 28312731  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312732 ttgcaatcagctactacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcctcggaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 28312831  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312832 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 28312931  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28312932 ctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 28313031  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  28313032 agctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 28313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28260469 - 28260045
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28260469 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28260370  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28260369 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28260270  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28260269 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28260170  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28260169 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28260070  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || |||| |||| ||||||||||    
T  28260069 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28260045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 28285447 - 28285871
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28285447 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28285546  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28285547 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28285646  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28285647 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28285746  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28285747 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28285846  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || |||| |||| ||||||||||    
T  28285847 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28339218 - 28338794
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28339218 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28339119  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28339118 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28339019  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28339018 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28338919  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28338918 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28338819  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || |||| |||| ||||||||||    
T  28338818 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28338794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2872081 - 2871650
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2872081 agcaaagactctaccagtagtcggtgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacaa 2871982  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2871981 ttgcagtcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 2871882  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2871881 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacagcttaggacgact 2871782  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  2871781 ctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactcta 2871682  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2871681 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 2871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 25115559 - 25115981
Alignment:
Q  18 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25115559 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatatccgtacgattgca 25115658  T
Q  118 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcac 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25115659 atcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacac 25115758  T
Q  218 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 317  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115759 acaatctcagtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgct 25115858  T
Q  318 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcc-ggaaaaactct-cagc 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  25115859 gtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccgggaaaaactctccagt 25115958  T
Q  416 tgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  25115959 tgttggtatccaattgccctctt 25115981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22829665 - 22829234
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  22829665 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacacggtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccttacgc 22829566  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  22829565 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggccttttccaccacaattga 22829466  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22829465 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 22829366  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  22829365 ctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactcta 22829266  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22829265 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5836497 - 5836076
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |    
T  5836497 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcgttgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcgg 5836398  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5836397 ctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttctggacaaacattgctttcgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaat 5836298  T
Q  223 ctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 322  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5836297 ctcagcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtccc 5836198  T
Q  323 ttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggt 422  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  5836197 ttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctaatctattggt 5836098  T
Q  423 atccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | ||||||||| |||| |||||    
T  5836097 acccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 22436881 - 22437245
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||    
T  22436881 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgtttgcactcag 22436980  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22436981 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctcacccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 22437080  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  | |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||     
T  22437081 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctatttggccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctgg 22437180  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22437181 cccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 22437245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25756878 - 25756460
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |    
T  25756878 gtagtaggcgccctcttaggctgtttgcattgggaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacta 25756779  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  25756778 tatgacccttcttgccgcaccggacacatttctttatctcttctggaaaaacattgcacttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgc 25756679  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  25756678 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaactagggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 25756579  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      |||||  ||||| || |||||||| |||||    || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||   | |||||||||||    
T  25756578 gtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcctgaaaaacttggacctgttggtatc 25756479  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  25756478 ctatcgccctcttaatgtc 25756460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27559232 - 27558814
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||||       
T  27559232 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgcttgcagtcagctaatg 27559133  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  27559132 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 27559033  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||| ||| ||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  27559032 aggaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 27558933  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||  |  ||||||||||    
T  27558932 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcagctattctccaaatctggaaaaactcggatttgttggtatc 27558833  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  27558832 cgatcgccctcttaatgtc 27558814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 438
Target Start/End: Original strand, 21764983 - 21765242
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  || || |    
T  21764983 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaattgccct 21765082  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||     |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21765083 tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagat 21765182  T
Q  379 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
      | ||||| || |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21765183 tttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21765242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18405213 - 18404948
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||  | | ||||| ||||    
T  18405213 ctaccagtagtcgacgccttcttaggcttcttgcactgagaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcatactatatcctcatgtttgcactcag 18405114  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  18405113 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtgaaacagacaat 18405014  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagc 285  Q
    || |||   |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  18405013 ctttgcaggagcatccttcttgttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagc 18404948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 24367574 - 24367788
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  24367574 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 24367673  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||| |||||| ||    
T  24367674 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttgatagattct 24367773  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
     || || ||||||||    
T  24367774 acacctgttaaccaa 24367788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 19438275 - 19438381
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19438275 tcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcc 19438374  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  19438375 tacagct 19438381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14376938 - 14376809
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  14376938 tctgttttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtc 14376839  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14376838 ctcctcatagatcctgcagctactaaccaa 14376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 19867699 - 19867823
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  19867699 ctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcactcag 19867798  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccaca 147  Q
    |||   ||||||| |||||||||||    
T  19867799 ctagtgcatgacccttcttaccaca 19867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10465958 - 10465750
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| ||||| || || |    
T  10465958 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttccct 10465859  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  10465858 tgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 10465759  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    |||||||||    
T  10465758 cctgcagct 10465750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Original strand, 18660189 - 18660295
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18660189 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttcgtatcctcctcataga 18660288  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    | |||||    
T  18660289 ttctgca 18660295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 369
Target Start/End: Original strand, 19867879 - 19868017
Alignment:
Q  231 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 330  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||     
T  19867879 catctttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggctctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctg 19867978  T
Q  331 cctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  19867979 ccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctc 19868017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 388
Target Start/End: Original strand, 19881670 - 19881776
Alignment:
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  19881670 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 19881769  T
Q  382 gcagcta 388  Q
    |||||||    
T  19881770 gcagcta 19881776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34642584 - 34642486
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34642584 gcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcccttgaatcttcttcatagattctgcagcta 34642486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Original strand, 23081690 - 23081799
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23081690 cctttatcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcat 23081789  T
Q  375 agatcctgca 384  Q
    | || |||||    
T  23081790 aaattctgca 23081799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18182408 - 18182293
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    |||||| | |||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||     
T  18182408 tgtttctccttatcagcaggagcacggtaaggcttaggatgactctgctgacctttacctttcctctcattcacaaccttctaatgagccttagtatccg 18182309  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  18182308 cctcataaattctgca 18182293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16924909 - 16924867
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaac 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16924909 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaac 16924867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Original strand, 19456284 - 19456402
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19456284 tgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcct 19456383  T
Q  369 cttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19456384 cttcatatatcctgcagct 19456402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Original strand, 19466429 - 19466547
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19466429 tgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcct 19466528  T
Q  369 cttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19466529 cttcatatatcctgcagct 19466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21566999 - 21566893
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  21566999 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 21566900  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  21566899 tacagct 21566893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10466098 - 10466034
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  10466098 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtcc 10466034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Original strand, 18797963 - 18798070
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| |  || |||||||||||||| |    
T  18797963 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttctgtgtcctcttcatagattc 18798062  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  18798063 tgcagcta 18798070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Original strand, 16813814 - 16813859
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  16813814 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 16813859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8720812 - 8720772
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  8720812 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 8720772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 19456197 - 19456237
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  19456197 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 19456237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 19466342 - 19466382
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  19466342 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 19466382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 27714474 - 27714905
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27714474 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttagactgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 27714573  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714574 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 27714673  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714674 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 27714773  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27714774 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 27714873  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27714874 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27714905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 23958885 - 23959316
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  23958885 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatatctgtacga 23958984  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958985 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 23959084  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959085 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 23959184  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23959185 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 23959284  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23959285 agctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 23959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19775660 - 19775236
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19775660 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 19775561  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19775560 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaatcacac 19775461  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775460 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 19775361  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19775360 cccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgtt 19775261  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  19775260 gatacccaatcgccctcttgatgtc 19775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17092023 - 17091592
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  17092023 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 17091924  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091923 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 17091824  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091823 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 17091724  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17091723 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctc 17091624  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17091623 agctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 17091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 8389550 - 8389981
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  8389550 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 8389649  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389650 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 8389749  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389750 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 8389849  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8389850 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctc 8389949  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8389950 agctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 8389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 12479738 - 12480169
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  12479738 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 12479837  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12479838 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttatggcctttctcaccacaattga 12479937  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479938 aacacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 12480037  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12480038 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 12480137  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  12480138 agctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 12480169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16233866 - 16233435
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||     
T  16233866 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 16233767  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233766 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16233667  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233666 agtacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16233567  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16233566 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcttcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 16233467  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16233466 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8050497 - 8050066
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8050497 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 8050398  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8050397 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcccttctcaccacaattga 8050298  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8050297 aacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 8050198  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8050197 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctc 8050098  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8050097 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 8050066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14300853 - 14300422
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14300853 agcaaagactctacctgtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtccgtacga 14300754  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14300753 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcaaggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 14300654  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14300653 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 14300554  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  14300553 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcttgaaaaactcta 14300454  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14300453 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 14300422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 19635274 - 19635705
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  19635274 agcaaagactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 19635373  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19635374 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 19635473  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19635474 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacaact 19635573  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19635574 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactattaaccaaatccggaaaaactctc 19635673  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19635674 agttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 19635705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 40476178 - 40476609
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  40476178 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggccgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 40476277  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40476278 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacactgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 40476377  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40476378 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 40476477  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40476478 ccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctc 40476577  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40476578 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 40476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 14683712 - 14684136
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  14683712 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 14683811  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14683812 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacatagcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacac 14683911  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14683912 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgctgt 14684011  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  14684012 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcaactattgaccaaatctggaaaaactctaatctgtt 14684111  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  14684112 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 14684136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 438
Target Start/End: Original strand, 13513500 - 13513916
Alignment:
Q  25 accagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagct 124  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||    
T  13513500 accagtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagct 13513599  T
Q  125 acaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 224  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  13513600 ataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatct 13513699  T
Q  225 ctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcc 321  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| || || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  13513700 ctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcc 13513799  T
Q  322 cttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttgg 421  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  13513800 cttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttgg 13513899  T
Q  422 tatccaatcgccttctt 438  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  13513900 tatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18604593 - 18604259
Alignment:
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18604593 ttgcaatcagctacaataagaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaa 18604494  T
Q  213 agcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    | || | |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||    
T  18604493 aacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcg 18604394  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 409  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  18604393 actctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaact 18604294  T
Q  410 ctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18604293 cggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18224236 - 18223914
Alignment:
Q  124 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatc 223  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || | ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  18224236 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatc 18224137  T
Q  224 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 320  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18224136 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggc 18224037  T
Q  321 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttg 420  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||   | ||||||    
T  18224036 ccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaactgggatctgttg 18223937  T
Q  421 gtatccaatcgccttcttgatgt 443  Q
    |||||| |||||| |||| ||||    
T  18223936 gtatccgatcgccatcttcatgt 18223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16248378 - 16248122
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  || ||||    
T  16248378 ctcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgttggcccttat 16248279  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  16248278 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctccttatagatcct 16248179  T
Q  382 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||  |||||| ||||    
T  16248178 gcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16350397 - 16350188
Alignment:
Q  229 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  16350397 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 16350298  T
Q  329 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaa 428  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16350297 ttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaa 16350198  T
Q  429 tcgccttctt 438  Q
    | ||| ||||    
T  16350197 ttgccctctt 16350188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3261756 - 3261542
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  3261756 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 3261657  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  3261656 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 3261557  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  3261556 gcacctattaaccaa 3261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 14162618 - 14162982
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||   | | || || ||||    
T  14162618 ctaccagtagtctgcgccttcttaggctgtttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaacatcttcatgcttacactcag 14162717  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    | |    |||||||||||||||||| || | |||  |||| |  ||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||    
T  14162718 caagtgtatgacctttcttaccacagcgaaaacatctcttcacatccccaggacaagcatcactcttgtggcctttcacaccacaagcatagcagacaat 14162817  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   |||| ||| |  |||| |||||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14162818 ctcaacaggagcatctttccttctagggcgcctatcctcgaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgt 14162917  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | |||   || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14162918 cccttaactttctgttcgttcacaaccttgtagtgagccttagtatccttttcataaatcctgca 14162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 429
Target Start/End: Original strand, 7357574 - 7357824
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||    
T  7357574 ttgctcttgtggcctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctt 7357673  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  7357674 tgtcagcaggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaat 7357773  T
Q  379 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaat 429  Q
    ||| || || |||||||| || | ||| ||||| | |||||| || |||||    
T  7357774 cctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaat 7357824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29450499 - 29450237
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  29450499 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 29450400  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || |||||||| ||  |    
T  29450399 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaatttt 29450300  T
Q  382 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||| ||||||||||| || | ||| | ||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  29450299 gcacctattaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagcccttttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 8332 - 8548
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  |    
T  8332 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattct 8431  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||    
T  8432 ctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcc 8531  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| || |||||    
T  8532 tcctcataaattctgca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 357
Target Start/End: Original strand, 20893338 - 20893516
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  20893338 ttgctcttgttgcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 20893437  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc 357  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||    
T  20893438 tgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagc 20893516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44658828 - 44658614
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| |||   |||||||||| || ||||| |    
T  44658828 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttcctttgt 44658729  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    | || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  44658728 ccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 44658629  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
     || || ||||||||    
T  44658628 acacctgttaaccaa 44658614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15536
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||||    
T  15738 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 15639  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  15638 cagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattct 15539  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  15538 gca 15536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15144575 - 15144448
Alignment:
Q  257 tcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgag 356  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15144575 tcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgag 15144476  T
Q  357 ccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||    
T  15144475 ccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 15144448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 14697507 - 14697599
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctct 370  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  14697507 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctct 14697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15144759 - 15144677
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  15144759 accctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaat 15144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16250666 - 16250572
Alignment:
Q  71 tgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgat 165  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16250666 tgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgat 16250572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Original strand, 18259850 - 18259957
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||  |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18259850 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattttgtatcttcttcatagatcc 18259949  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    || |||||    
T  18259950 tgtagcta 18259957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11204197 - 11204001
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||   ||||||||  || ||||    
T  11204197 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttcctt 11204098  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  11204097 tgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 11204001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14993230 - 14993112
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  14993230 tcagcaggggcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcatatcctcttcataaattc 14993131  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatc 399  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  14993130 tgcaactacttaccaaatc 14993112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Original strand, 16219585 - 16219703
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||| |    
T  16219585 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatctt 16219684  T
Q  369 cttcatagatcctgcagct 387  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  16219685 ccacatagattctgcagct 16219703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Original strand, 16222905 - 16223023
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||| |    
T  16222905 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatctt 16223004  T
Q  369 cttcatagatcctgcagct 387  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  16223005 ccacatagattctgcagct 16223023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 399
Target Start/End: Original strand, 15073754 - 15073886
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||    
T  15073754 tctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatc 15073853  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatc 399  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  15073854 ctcttcatagatcctacagctactcaccaaatc 15073886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 388
Target Start/End: Original strand, 16151029 - 16151152
Alignment:
Q  265 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgta 364  Q
    |||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| || ||     
T  16151029 cttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtg 16151128  T
Q  365 tcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  16151129 tcctcctcatagattctgcagcta 16151152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 388
Target Start/End: Original strand, 16155175 - 16155298
Alignment:
Q  265 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgta 364  Q
    |||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| || ||     
T  16155175 cttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtg 16155274  T
Q  365 tcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  16155275 tcctcctcatagattctgcagcta 16155298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 7357434 - 7357497
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtc 105  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  7357434 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtc 7357497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 12889466 - 12889897
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  12889466 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 12889565  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889566 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 12889665  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889666 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 12889765  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12889766 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 12889865  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12889866 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12889897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15345618 - 15345187
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15345618 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 15345519  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15345518 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 15345419  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15345418 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggaggact 15345319  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15345318 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 15345219  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15345218 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 43165432 - 43165863
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  43165432 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 43165531  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165532 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 43165631  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165632 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 43165731  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43165732 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 43165831  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43165832 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 43165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5422296 - 5421872
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5422296 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 5422197  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422196 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 5422097  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422096 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 5421997  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5421996 cccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgtt 5421897  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  5421896 gatacccaatcgccctcttgatgtc 5421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 10008357 - 10008788
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  10008357 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 10008456  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10008457 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 10008556  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10008557 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 10008656  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10008657 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagtcctgaaaaactctc 10008756  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10008757 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 16638530 - 16638961
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16638530 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccttctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 16638629  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638630 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcttcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16638729  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638730 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16638829  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16638830 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 16638929  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16638930 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 48428204 - 48428635
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  48428204 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 48428303  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428304 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 48428403  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428404 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 48428503  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48428504 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctc 48428603  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48428604 agctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 48428635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20059427 - 20058996
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  20059427 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 20059328  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20059327 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 20059228  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20059227 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 20059128  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20059127 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 20059028  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20059027 agctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 20058996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26790786 - 26790355
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26790786 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccgtcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacga 26790687  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790686 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggtagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 26790587  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26790586 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcattgggggcactgtacggcttaggacgact 26790487  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26790486 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 26790387  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26790386 agttgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 26790355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 6603499 - 6603923
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6603499 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagagctaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 6603598  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603599 cagctacaacatgatccttcttaccacaccggacacagttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 6603698  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603699 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 6603798  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6603799 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgtt 6603898  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || || |||||| ||||||||||    
T  6603899 gatacccgatcgccctcttgatgtc 6603923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16754067 - 16753643
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16754067 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacattgagaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 16753968  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753967 cagctacaacatgacccttcttaccacaccagacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 16753868  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16753867 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactatgctgt 16753768  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16753767 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctagaaaaactctcagctgtt 16753668  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || ||||||||| ||||||||||    
T  16753667 gatacccaatcgccctcttgatgtc 16753643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 3688700 - 3689131
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  3688700 agcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcacacaatgtctgcacga 3688799  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688800 ttacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 3688899  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688900 agcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 3688999  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3689000 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 3689099  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3689100 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 10908967 - 10909398
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  10908967 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgggaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 10909066  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10909067 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 10909166  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10909167 aacacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 10909266  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  10909267 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagtcctgaaaaactcta 10909366  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10909367 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10909398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 13255447 - 13255878
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||     
T  13255447 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 13255546  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255547 ttgcaatcagctaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaagcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 13255646  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255647 agcacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 13255746  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13255747 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 13255846  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13255847 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 13255878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15586765 - 15586334
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||     
T  15586765 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 15586666  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586665 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 15586566  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586565 agcacacaatctccgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 15586466  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15586465 ttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 15586366  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15586365 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15586334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15713429 - 15712998
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  15713429 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 15713330  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15713329 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 15713230  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713229 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 15713130  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713129 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 15713030  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15713029 agttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 15712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 53382391 - 53381961
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  53382391 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctgcattgcaattaaagcacacagtgtctgtacga 53382292  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53382291 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacagacgttgctcttgtggcctttctcgccacagttga 53382192  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53382191 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag-gggggcactgtacggcttaggacgact 53382093  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53382092 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctc 53381993  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  53381992 agctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 53381961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15399890 - 15399460
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  15399890 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaacta-tgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 15399792  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15399791 ttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 15399692  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399691 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 15399592  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||     
T  15399591 ctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagatcctgcagctattgaccaaattctgaaaaactcta 15399492  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15399491 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 24185954 - 24186378
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  24185954 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 24186053  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24186054 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacac 24186153  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186154 aatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgtgggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 24186253  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||    
T  24186254 cccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaattctggaaaaactctaatctgtt 24186353  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  24186354 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 24186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 111 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5110684 - 5110351
Alignment:
Q  111 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5110684 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttaatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaatt 5110585  T
Q  211 gaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacga 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5110584 gaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcggggacactgtacggcttaggacga 5110485  T
Q  311 ctctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 410  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5110484 ctctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactc 5110385  T
Q  411 tcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5110384 tcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 170 - 444
Target Start/End: Original strand, 6596969 - 6597243
Alignment:
Q  170 tcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttct 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596969 tcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttct 6597068  T
Q  270 gtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6597069 gtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 6597168  T
Q  370 ttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  6597169 ctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6597243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 196 - 444
Target Start/End: Original strand, 15358992 - 15359240
Alignment:
Q  196 tttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactg 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358992 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactg 15359091  T
Q  296 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15359092 tacggcttagggcgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 15359191  T
Q  396 aatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15359192 aatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16804304 - 16803886
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  16804304 gtagtaggcgacttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 16804205  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  16804204 tatgacctttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 16804105  T
Q  229 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16804104 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttg 16804005  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||     
T  16804004 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatt 16803905  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  16803904 cgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 426
Target Start/End: Original strand, 11861121 - 11861526
Alignment:
Q  24 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||   | | |||||||||||    
T  11861121 taccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttccttggaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagc 11861220  T
Q  124 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatc 223  Q
    || |  |||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  11861221 taaagtatgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatc 11861320  T
Q  224 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 320  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |    
T  11861321 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggc 11861420  T
Q  321 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttg 420  Q
    |||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||  | ||||||    
T  11861421 ccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttg 11861520  T
Q  421 gtatcc 426  Q
    ||||||    
T  11861521 gtatcc 11861526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 16694937 - 16695355
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  16694937 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatgtcatttcgcttgcaatcagctacaa 16695036  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  | || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||    
T  16695037 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctccaccggacaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagc 16695136  T
Q  229 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  16695137 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttg 16695236  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  16695237 gtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatc 16695336  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  16695337 cgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23415147 - 23414729
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  23415147 gtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 23415048  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||  | || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||    
T  23415047 tatgacccttcttgtcacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgc 23414948  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || ||||||    
T  23414947 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggcccttg 23414848  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  23414847 gtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatc 23414748  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  23414747 cgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 15358840 - 15358996
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||     
T  15358840 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtctgtacgc 15358939  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcc 169  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15358940 ttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcc 15358996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 410
Target Start/End: Original strand, 12501708 - 12502090
Alignment:
Q  31 agtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaaca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||| |  |||||| | |||||||| || |||||||| ||   | | |||||||||||||         
T  12501708 agtcggcgccctcttcggctgcttgcactgagaaccaatatttccctcttccttgcaattgaaacacacaatatcaccatgcttgcaatcagctaatgtg 12501807  T
Q  131 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  12501808 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcag 12501907  T
Q  231 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 327  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||      
T  12501908 gaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggt 12502007  T
Q  328 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 410  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  12502008 cttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcaccaaatctgaaaaaactc 12502090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Original strand, 15065835 - 15066256
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||   | | |||||||    
T  15065835 accctacctgtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttctttgcaattgaagaacacaatatcattatgcttgcaat 15065934  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |||  | || |  || || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  15065935 cagttaatgcatgacccttcttaccacaccggaaacatctttttacctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagac 15066034  T
Q  220 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||| | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  15066035 aatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgc 15066134  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || |  |||||||  | ||    
T  15066135 tggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcaccaactcggagaaaactcggatct 15066234  T
Q  417 gttggtatccaatcgccttctt 438  Q
     |||||||||||| ||| ||||    
T  15066235 attggtatccaattgccctctt 15066256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23079380 - 23079016
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| | | | ||  || |||| ||||||||||||  | | || || ||||    
T  23079380 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctttgtacactgtgaaccaatatgaccttgttctttagaactaaaacacacaatgtccttatgcttacactcag 23079281  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||| | ||||||||| | || | |||  |||| |  ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  23079280 ctagtgcatgaaccttcttaccatagcgaaaacatctctttacctcccccggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaat 23079181  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    | | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23079180 cacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgg 23079081  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23079080 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 23079016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 17497606 - 17497822
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   |||||||||||||||||   ||| | |||||||||||    
T  17497606 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgaccatctt 17497705  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  17497706 ctgtttgcccttatcagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 17497805  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || || |||||||||||    
T  17497806 tcctcctagatcctgca 17497822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 10408907 - 10409154
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| || || |    
T  10408907 ctcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgt 10409006  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  10409007 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 10409106  T
Q  382 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaat 429  Q
    ||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| || ||||||||    
T  10409107 gcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaat 10409154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14578677 - 14578420
Alignment:
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||    
T  14578677 atgacctttcttaccacaacggaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaaca 14578578  T
Q  230 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |   |||| |||||  |||| |||||| |||| |||||  ||||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||     
T  14578577 ggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttgg 14578478  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14578477 ccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaatcctgca 14578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14873800 - 14873527
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||   |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| |    
T  14873800 caggacaagcattgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcct 14873701  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || ||||||||  ||||| | || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| | ||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  14873700 ctgtttgcccttatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 14873601  T
Q  368 tcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgat 441  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||| || |  |||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||    
T  14873600 tcctcatatatcctgcaactgttcaccaactcagagaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgat 14873527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 28757258 - 28757472
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  28757258 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 28757357  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  28757358 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 28757457  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  28757458 gcacctattaaccaa 28757472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 47126883 - 47127097
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||| || ||||| |    
T  47126883 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 47126982  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  47126983 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 47127082  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  47127083 gcacctattaaccaa 47127097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12843318 - 12843102
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| ||||||||||  |||| | |||  |    
T  12843318 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattct 12843219  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  12843218 ctgtttgcccttatcagcaggagcactataaagctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcc 12843119  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| ||||||||    
T  12843118 tcctcataaatcctgca 12843102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5108542 - 5108481
Alignment:
Q  383 cagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5108542 cagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5108481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16326804 - 16326695
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||    
T  16326804 cctttgtcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcat 16326705  T
Q  375 agatcctgca 384  Q
    | ||||||||    
T  16326704 aaatcctgca 16326695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16825364 - 16825264
Alignment:
Q  287 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagc 386  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16825364 ggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagc 16825265  T
Q  387 t 387  Q
    |    
T  16825264 t 16825264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Original strand, 19727641 - 19727890
Alignment:
Q  137 ttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---t 233  Q
    ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||| ||   |    
T  19727641 ttcttaccacaacgaaaacacctctttacatccccaggacaagcgttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcaacaacat 19727740  T
Q  234 ccttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcc 332  Q
    | ||||| ||||||| |||  ||||   || |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || |    
T  19727741 ctttctttttaggcctcctctcatcattcaatctt-tgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggaagactttgctgacc-ttgccttttc 19727838  T
Q  333 tctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  19727839 tctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatatattctgca 19727890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31692292 - 31692169
Alignment:
Q  265 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgta 364  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  ||||| || ||||| |||||     
T  31692292 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtg 31692193  T
Q  365 tcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  31692192 tcctcctcatagattctgcagcta 31692169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14290722 - 14290526
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||  ||||   || | ||||||| ||||| |    
T  14290722 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgt 14290623  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  || || || ||||| || |||||||||||||||||    
T  14290622 cagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagat 14290526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16831622 - 16831516
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  16831622 ttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 16831523  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    |||||||    
T  16831522 tcctgca 16831516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11958286 - 11958202
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgta 351  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||  ||||||||    
T  11958286 tctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgta 11958202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16384463 - 16384300
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  16384463 tcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcc 16384364  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||| | | |||||||| |  |||| ||| | |||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  16384363 tacagcaacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 16384300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 388
Target Start/End: Original strand, 31941925 - 31942048
Alignment:
Q  265 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgta 364  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | |  ||| |||  ||||| || ||||| |||||     
T  31941925 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctatcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtg 31942024  T
Q  365 tcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  31942025 tcctcctcatagattctgcagcta 31942048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12857599 - 12857469
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||    
T  12857599 tgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcct 12857500  T
Q  369 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatc 399  Q
    | |||||||| || |||||| | ||||||||    
T  12857499 cctcatagattctacagctactcaccaaatc 12857469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Original strand, 17189421 - 17189519
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||    
T  17189421 gcactgtacggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcttcatagattctacagcta 17189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13028437 - 13028345
Alignment:
Q  292 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || || | | || |||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  13028437 actgtaaggctttggacgactctgctggcctttactcctcttctcattcactatcttgaaatgagctttggtatcctcctcctagatcctgca 13028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Original strand, 28757115 - 28757198
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 125  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  28757115 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagcta 28757198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12357618 - 12357500
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  12357618 tcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgatgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcc 12357519  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatc 399  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  12357518 tgcagctactcaccaaatc 12357500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10417073 - 10417029
Alignment:
Q  344 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  10417073 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 10417029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16327042 - 16326978
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 106  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  16327042 tcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtcc 16326978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 17494585 - 17494625
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17494585 ctcttgtggcctttttcaccacatttgaagcaaacaatctc 17494625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 27374038 - 27374469
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  27374038 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 27374137  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374138 ttgcaatcagctaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 27374237  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374238 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 27374337  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27374338 ctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 27374437  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27374438 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 9338351 - 9338782
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  9338351 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 9338450  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338451 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 9338550  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338551 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 9338650  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9338651 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 9338750  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9338751 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 9486985 - 9487416
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  9486985 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 9487084  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487085 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 9487184  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487185 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 9487284  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9487285 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 9487384  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9487385 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 24712803 - 24713234
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24712803 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 24712902  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24712903 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 24713002  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713003 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 24713102  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24713103 ctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 24713202  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24713203 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22323016 - 22322585
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22323016 agcaaagatcctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 22322917  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22322916 ttgcaatcagctataacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 22322817  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322816 aacacacaatctccgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 22322717  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22322716 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 22322617  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22322616 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 16984009 - 16984440
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  16984009 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 16984108  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984109 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16984208  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984209 aacacacaatctctgcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16984308  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16984309 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactctc 16984408  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16984409 agctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 16984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44383244 - 44382813
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44383244 agcaaagaccctacccgtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaacgtccgtacga 44383145  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383144 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 44383045  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383044 agcacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 44382945  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44382944 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctc 44382845  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  44382844 agccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 44382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 17001769 - 17002200
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||     
T  17001769 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 17001868  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17001869 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattga 17001968  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17001969 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 17002068  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17002069 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 17002168  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17002169 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17002200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 24265139 - 24265570
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24265139 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacga 24265238  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24265239 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 24265338  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24265339 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 24265438  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24265439 ctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtctgaaaaaactctc 24265538  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  24265539 agctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 24265570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 10871619 - 10872050
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  10871619 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtgcga 10871718  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10871719 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 10871818  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10871819 aacacacaagctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 10871918  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10871919 ctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 10872018  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10872019 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24874424 - 24873993
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  24874424 agcaaagaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatttgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 24874325  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24874324 ttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttaatttcttcatggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacagttga 24874225  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24874224 aacacacaatctcagtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttagaacgact 24874125  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  24874124 ctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactatttaccaaatctggaaaaactcta 24874025  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  24874024 agctgttgatacccaatcgcccttttgatgtc 24873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23116718 - 23116299
Alignment:
Q  28 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||     
T  23116718 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttgcaatcagctacg 23116619  T
Q  128 acatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctct- 226  Q
    | ||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||     
T  23116618 atatgacccctcttgctacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctg 23116519  T
Q  227 --gcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||    
T  23116518 aaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctt 23116419  T
Q  325 gcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtat 424  Q
       |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  || |||||||||    
T  23116418 agtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtat 23116319  T
Q  425 ccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  23116318 ccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21139655 - 21139392
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||     
T  21139655 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctattaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtcttcacgc 21139556  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21139555 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacggttcttgatctcttcacgacagacattgcttttgtggccttttccaccacaattga 21139456  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccc 276  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21139455 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24705149 - 24704728
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||    
T  24705149 accctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaat 24705050  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    |||||| |   ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  24705049 cagctaaagtgtgacccttcttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagat 24704950  T
Q  220 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24704949 aatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcctatgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgc 24704850  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    || |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  | ||    
T  24704849 tggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcaccaaatctggaaaaacacgtatct 24704750  T
Q  417 gttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||  |||||| ||||    
T  24704749 gttggtatctgatcgccctctt 24704728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22463138 - 22462721
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |     
T  22463138 tagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacgat 22463039  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||     
T  22463038 atgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgca 22462939  T
Q  229 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
      |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  || |||| ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  22462938 ggagcatccttcttcttaggccacctatcatcgaccattctctgttcgcccttattagaaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttgg 22462839  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     ||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||  |  ||||||||||     
T  22462838 tcttccgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagcgaaaactcggatttgttggtatct 22462739  T
Q  427 aatcgccttcttgatgtc 444  Q
     |||||| ||||||||||    
T  22462738 gatcgccctcttgatgtc 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 24678266 - 24678687
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||  ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||    
T  24678266 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgactctcttcaatgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcactcag 24678365  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24678366 ctagtgcatgacccttcttaccacaacggaaacatctcttaacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 24678465  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||  ||     
T  24678466 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctattgg 24678565  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||   ||||||||  | || ||    
T  24678566 cccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcgtcataaattctgcaactgttcaccaactcgcaaaaaactcggatctatt 24678665  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgat 441  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  24678666 ggtatccaattgccctcttgat 24678687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22742629 - 22742266
Alignment:
Q  24 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||| |||||    
T  22742629 taccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcagc 22742530  T
Q  124 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatc 223  Q
    ||   ||||||| |||||||| || |||| |||  | || |  ||  | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22742529 tagtgcatgacccttcttaccgcatcggaaacatctatttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatc 22742430  T
Q  224 tctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 320  Q
    ||  |||||   ||||||||| | ||||| ||| | || |||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  22742429 tcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgac 22742330  T
Q  321 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22742329 ccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcctgca 22742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23029125 - 23028708
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  23029125 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcaatcag 23029026  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||    
T  23029025 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaa-taaaacagacaat 23028927  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||   ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23028926 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 23028827  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    || ||    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |  |||||||  | |||||    
T  23028826 cctttagtattccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctacaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgtt 23028727  T
Q  420 ggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  23028726 ggtatccaattgccctctt 23028708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24657316 - 24656898
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | |||| |||||| ||||| || ||   | | |||||||||||||       
T  24657316 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgccattaaaacacacgatatcaccatgtttgcaatcagctaatg 24657217  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  24657216 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 24657117  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  24657116 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 24657017  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  24657016 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatc 24656917  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  24656916 cgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931698
Alignment:
Q  287 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagc 16931697  T
Q  387 t 387  Q
    |    
T  16931698 t 16931698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23105392 - 23105027
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgacc-ctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatca 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| |||    
T  23105392 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgacctctcttcattgcaattgaagcacacaatatcatcatgtttgcactca 23105293  T
Q  122 gctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa 221  Q
    ||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  || | |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||    
T  23105292 gctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtcttaaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagagaaacaaataa 23105193  T
Q  222 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 318  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23105192 tctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggtgcactgtaaggcttagggcggctctgctg 23105093  T
Q  319 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23105092 gcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 23105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23040229 - 23039877
Alignment:
Q  35 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 134  Q
    |||||| |||||||||   | |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| || || || ||   | | ||||| |||||||   ||||||    
T  23040229 ggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgacgctcttcattgcagttaaaacatactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgac 23040130  T
Q  135 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---c 231  Q
    | ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||| ||   |    
T  23040129 ccttctttccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagc 23040030  T
Q  232 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||   ||||    
T  23040029 atccttcttcttaggccgtctaccttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttc 23039930  T
Q  332 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  23039929 cgctcattcacaatcttgtaatgagccttaatatcctcctcgtagatcctgca 23039877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 264
Target Start/End: Original strand, 23205099 - 23205337
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  23205099 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 23205198  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc--- 225  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||       
T  23205199 tatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccga 23205298  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 264  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23205299 aggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 264
Target Start/End: Original strand, 23676703 - 23676941
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  23676703 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 23676802  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc--- 225  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||       
T  23676803 tatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccga 23676902  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 264  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23676903 aggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23676941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22733438 - 22733074
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  | ||   | | ||||| ||||    
T  22733438 ctaccagtagtcggcaccttcttaggtttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactttatcatcatgtttgcactcag 22733339  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||    
T  22733338 ctagtgcatgacccttctttccacattgtaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 22733239  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     |||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||     
T  22733238 ttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagcttagggcgactctgctga 22733139  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22733138 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22733074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21320517 - 21320292
Alignment:
Q  173 ggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttct 269  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |    
T  21320517 ggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattcttt 21320418  T
Q  270 gtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    |||| || |||||||| ||||  || || |||||||| | ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||    
T  21320417 gtttgcccttatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatc 21320318  T
Q  370 ttcatagatcctgcagctattaacca 395  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||    
T  21320317 ctcataaattctgcagctattcacca 21320292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11351378 - 11351168
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||    
T  11351378 accctaccagtagtcggcaccctcttaggctgcttggactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaat 11351279  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||    |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||  |  ||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11351278 cagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacctcctttggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagac 11351179  T
Q  220 aatctctgcag 230  Q
    |||||| ||||    
T  11351178 aatctccgcag 11351168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 23274633 - 23274739
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274633 tcagcaggagcactatactgcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcc 23274732  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  23274733 tacagct 23274739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 23065195 - 23065445
Alignment:
Q  26 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||| |    
T  23065195 ccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcattcagcca 23065294  T
Q  126 caacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
       ||||||| ||||| ||||| || | |||  | ||||  ||| ||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| || | ||  | ||||||||    
T  23065295 gtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatcttttgacatccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctc 23065394  T
Q  226 tgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttt 273  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  23065395 tgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgttt 23065445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 23074645 - 23074895
Alignment:
Q  26 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||| |    
T  23074645 ccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcattcagcca 23074744  T
Q  126 caacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
       ||||||| ||||| ||||| || | |||  | ||||  ||| ||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| || | ||  | ||||||||    
T  23074745 gtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatcttttgacatccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctc 23074844  T
Q  226 tgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttt 273  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  23074845 tgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgttt 23074895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Original strand, 20848606 - 20848789
Alignment:
Q  261 ccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 360  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| ||    
T  20848606 ccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagcttt 20848705  T
Q  361 cgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
     || || |||||||| || ||||| || |||||||| || | ||| | ||| | |||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  20848706 ggtgtcttcttcataaattctgcacctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 433
Target Start/End: Original strand, 23029815 - 23029953
Alignment:
Q  295 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | |||    
T  23029815 gtacggcttaggacgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgcaactactcacc 23029914  T
Q  395 aaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgcc 433  Q
    || || |  |||||||  | || |||||| |||||||||    
T  23029915 aactcggagaaaactcgaatcttttggtaaccaatcgcc 23029953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21322930 - 21322876
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccct 77  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  21322930 ctaccagtagttggcgccttcttaggttgcgtacattgtgaaccaatgtgaccct 21322876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Original strand, 28350816 - 28350861
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  28350816 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 28350861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19716413 - 19716377
Alignment:
Q  288 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19716413 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19716377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19720976 - 19720940
Alignment:
Q  288 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19720976 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19720940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 21833455 - 21833886
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21833455 agcaaagaccctacgagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacga 21833554  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21833555 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 21833654  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833655 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 21833754  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21833755 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctt 21833854  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21833855 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 21833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33388235 - 33387804
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33388235 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 33388136  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33388135 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctccgggcaaacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 33388036  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388035 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 33387936  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33387935 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaattcggaaaaactctc 33387836  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33387835 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 33387804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51330698 - 51330267
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  51330698 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacga 51330599  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  51330598 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctctctctccacaattga 51330499  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51330498 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 51330399  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51330398 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 51330299  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  51330298 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 51330267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16347801 - 16347369
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  16347801 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcacacaatgtctgcacga 16347702  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347701 ttacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 16347602  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347601 agcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 16347502  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc-aaatccggaaaaactct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16347501 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaaatcctgaaaaactct 16347402  T
Q  412 cagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16347401 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41350874 - 41350444
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  41350874 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcacacaatgtctgcacga 41350775  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350774 ttgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 41350675  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350674 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 41350575  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  41350574 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagtcctgaaaaactctc 41350476  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  41350475 agctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 41350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 21842365 - 21842796
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  21842365 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 21842464  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21842465 ttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacatcggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 21842564  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842565 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 21842664  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  21842665 ctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactcta 21842764  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21842765 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21842796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Original strand, 22400478 - 22400904
Alignment:
Q  18 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  22400478 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacgatgtccgtacgcttgca 22400577  T
Q  118 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcac 217  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | || || || ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  22400578 atccgctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcagggcagacattacttttatggcctttccctccacaattgaaacac 22400677  T
Q  218 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 317  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22400678 acaatctcagtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacagcttaggacgactctgct 22400777  T
Q  318 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctg 417  Q
     |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  22400778 ctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccagaaaaactctaagctg 22400877  T
Q  418 ttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  22400878 ttggcatccaatcgcccttttgatgtc 22400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 19109528 - 19109953
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  19109528 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 19109627  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaag--cac 217  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| | ||| |||||| ||| |||||||||   |||    
T  19109628 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgctttagtgacctttcacacaacaattgaaaaacac 19109727  T
Q  218 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 317  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19109728 acaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgtt 19109827  T
Q  318 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctg 417  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||    
T  19109828 gtcccttgcccttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccgg-aaaactctaatctg 19109926  T
Q  418 ttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  19109927 ttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16354201 - 16354018
Alignment:
Q  261 ccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 360  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354201 ccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 16354102  T
Q  361 cgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16354101 cgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21228740 - 21228328
Alignment:
Q  35 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 134  Q
    |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||  ||||    
T  21228740 ggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatttgac 21228641  T
Q  135 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---c 231  Q
    | ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  || ||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |    
T  21228640 ccttcttgccacacctgacacatttcttgatctctacaagacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagc 21228541  T
Q  232 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||    
T  21228540 atccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttc 21228441  T
Q  332 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcg 431  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  21228440 tgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcg 21228341  T
Q  432 ccttcttgatgtc 444  Q
    || |||| |||||    
T  21228340 ccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24785056 - 24784667
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| ||||| |    
T  24785056 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaaacacacaatatcattacgcttgcagt 24784957  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    |||||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  24784956 cagctaccgtatgacccttcttgccacaccgggcacatttctttatctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagac 24784857  T
Q  220 aatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||| || ||||||||  |||||||     
T  24784856 aatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgt 24784757  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaa 406  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  24784756 tggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaa 24784667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17042205 - 17041788
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  | ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  17042205 gtagtaggcgtcctcttcggctgcttgcactgggaacttatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 17042106  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || | |||||| |     
T  17042105 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggataaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccga 17042007  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  17042006 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta 17041907  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||  || ||||||||||    
T  17041906 gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatc 17041807  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  17041806 cgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22435932 - 22435521
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||    
T  22435932 accctaccagtagtcggcgccctcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaat 22435833  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||    |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22435832 cagctaatgtatgacccttcttgccacatcggaaacatttctttacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagac 22435733  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||  |||| | | | |||||       |||| ||| ||||||  ||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  22435732 aatcttcgcaggagcatccttct-------cctatcattgaccattctctgttttcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 22435640  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||||   | |||||    
T  22435639 cccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctacagttgttcaccaactcgggaaaaacttggatctgtt 22435540  T
Q  420 ggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  22435539 ggtatccaatcgccctctt 22435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20081572 - 20081223
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| || || ||||    
T  20081572 ctaccagtagtcggcgccttcttaggccgcgtacactgcgaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttacactcag 20081473  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
     ||    |||||| ||||| ||||| || | |||  |||| |  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20081472 atagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 20081373  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| |||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||     
T  20081372 ctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttaaggcgactctgctgg 20081273  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  20081272 ccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 20081223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 388
Target Start/End: Original strand, 22401755 - 22402123
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  22401755 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 22401854  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||| | ||||| ||||| || | |||  ||||| | ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || | |||    
T  22401855 ctagtgcatgatccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagaaaat 22401954  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     |||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  22401955 ttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctga 22402054  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||   ||||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22402055 cccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcagcta 22402123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22496452 - 22496088
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  22496452 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaactaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcactcag 22496353  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   | ||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  | ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  22496352 ctagtgcgtgacccttcttaccacatcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcatcgctcttgtggcctttctcaccataattaaagcagacaat 22496253  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   ||||||||||| | ||||| |||   ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||     
T  22496252 ctcaacaggaacatccttcttccttggccgtctatactcgaccattctctgttttcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctggtgg 22496153  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22496152 cccttcgtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 408
Target Start/End: Original strand, 21176689 - 21176918
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||   | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |    
T  21176689 ttgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccct 21176788  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21176789 tatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagat 21176888  T
Q  379 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaac 408  Q
     || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  21176889 tctacaactattcaccaaatcaggaaaaac 21176918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 48426229 - 48426443
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  48426229 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 48426328  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  48426329 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 48426428  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  48426429 gcacctattaaccaa 48426443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 384
Target Start/End: Original strand, 16379504 - 16379621
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16379504 tctgtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 16379603  T
Q  367 ctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  16379604 ctcctcataaatcctgca 16379621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 37680405 - 37680619
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| |   ||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  37680405 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 37680504  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  37680505 cagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 37680604  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  37680605 gcacctattaaccaa 37680619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 21752210 - 21752574
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| || || |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| || |||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  21752210 ctaccagtagtctgcaccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcgttgcaattgaaacacacaatatcatcatgtttgcactcag 21752309  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  21752310 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccagtacaagcattgctcttttggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 21752409  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   |||| |||||  | ||  ||||| | || ||||   ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21752410 ctcatcaggagcatctttctttctcgggtgcctatcttcaaccactctctgttttcccttatcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctga 21752509  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  21752510 cccttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcataaatcctgca 21752574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20074746 - 20074550
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |    ||||||  || ||||| ||| |||  ||||   ||||||||| || ||||    
T  20074746 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctt 20074647  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    | ||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  20074646 tgtcagcagaagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 20074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 20297739 - 20297953
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||  ||||||||||||| || || |    
T  20297739 ctcttgtggcatttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgt 20297838  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  20297839 cagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 20297938  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
     || || ||||||||    
T  20297939 acacctgttaaccaa 20297953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 337
Target Start/End: Original strand, 52989094 - 52989252
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  52989094 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 52989193  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctca 337  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  52989194 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctca 52989252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38909860 - 38909667
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||| || ||||| |    
T  38909860 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 38909761  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  38909760 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 38909667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22015680 - 22015574
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22015680 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcc 22015581  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  22015580 tacagct 22015574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 366
Target Start/End: Original strand, 22117126 - 22117223
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  22117126 tgttttcccttatcagcaggaacactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcaaaaccttgtaatgagccttagtatc 22117223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21742478 - 21742380
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21742478 gcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 21742380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Original strand, 21961380 - 21961576
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  21961380 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 21961479  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    | ||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  21961480 tgtcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 21961576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31537034 - 31536838
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||   |||| |||| || ||||    
T  31537034 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgctttcctt 31536935  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  31536934 tgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 31536838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 379
Target Start/End: Original strand, 19857630 - 19857827
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    | ||||||  || ||||||||| |||  ||||   || | |||| || || || |    
T  19857630 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcggtagaagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgt 19857729  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatc 379  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19857730 cagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagccttagtatcctcttcatagatc 19857827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21738953 - 21738864
Alignment:
Q  299 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21738953 ggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 21738864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Original strand, 20921860 - 20921966
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||||| | ||| | ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20921860 ttatcagcgggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgattcttacccttcttttcacttacagctttgtaatgtgctttggtatcctcttcataga 20921959  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    | |||||    
T  20921960 ttctgca 20921966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Original strand, 37680275 - 37680345
Alignment:
Q  55 acactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  37680275 acactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagcta 37680345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 21176597 - 21176670
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21176597 gtagtaggcgtcctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaat 21176670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21739070 - 21739030
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21739070 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctc 21739030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21742586 - 21742546
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21742586 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctc 21742546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17671599 - 17671168
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17671599 agcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 17671500  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17671499 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccagacacacttcttgatttcctccgggcagacattgcttttgtggcctttctcaccacaattga 17671400  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671399 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 17671300  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17671299 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 17671200  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17671199 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 19115604 - 19116035
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19115604 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctctttggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 19115703  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115704 ttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattga 19115803  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19115804 agcacacaacctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 19115903  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19115904 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctc 19116003  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19116004 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19116035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20015840 - 20015409
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20015840 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacga 20015741  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20015740 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttactcttgtggcccttctcaccacaattga 20015641  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20015640 aacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 20015541  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20015540 ctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctc 20015441  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20015440 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 20015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19481649 - 19481219
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19481649 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcacacaatgtctgcacga 19481550  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481549 ttgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 19481450  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481449 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 19481350  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  19481349 ctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagtcctgaaaaactctc 19481251  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  19481250 agctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 19481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 18859781 - 18860212
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||     
T  18859781 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtctgtacgc 18859880  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18859881 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 18859980  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859981 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 18860080  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18860081 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctattaaccaaatccggaaaaactctc 18860180  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18860181 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22126536 - 22126105
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||     
T  22126536 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgactttctccattgcagttaaaacacacaatgtctgtacgc 22126437  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22126436 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcaaggaagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 22126337  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126336 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 22126237  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22126236 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactcta 22126137  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22126136 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22117752 - 22117321
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  22117752 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 22117653  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22117652 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacgattga 22117553  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22117552 aacacacaatctctatagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagtgggggcactgtacggcttaggacgact 22117453  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22117452 ttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactcta 22117353  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22117352 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 22043047 - 22043465
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  22043047 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 22043146  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc--- 225  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||       
T  22043147 tatgacccttcttgccacaccgaacacatttcttgatctcttctggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagt 22043246  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || || ||||  |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22043247 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttg 22043346  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  22043347 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatc 22043446  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  22043447 cgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30310705 - 30310287
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  |||| || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  30310705 gtagtaggcgccttcttcggctgcttacattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 30310606  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  30310605 tatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgc 30310506  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30310505 aggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttg 30310406  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||||    
T  30310405 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaactattcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatc 30310306  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
      |||||| ||||||||||    
T  30310305 tgatcgccctcttgatgtc 30310287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 15536603 - 15537021
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||    || ||||||||||||||||    
T  15536603 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacagtatcatttcgcttgcaatcagctacaa 15536702  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc--- 225  Q
     |||||| || || |||||||||||||| |||||||| || | ||||||  | || |||||||||||||  || |||||||| || || | ||||||       
T  15536703 tatgaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccga 15536802  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15536803 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 15536902  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||||    
T  15536903 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatc 15537002  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  15537003 cgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 444
Target Start/End: Original strand, 32603449 - 32603783
Alignment:
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||  | || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32603449 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttga 32603548  T
Q  213 agcacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    | || ||||| ||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  32603549 aacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcg 32603648  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 409  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  32603649 actctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaact 32603748  T
Q  410 ctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |  || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  32603749 cggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 19981181 - 19981545
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||||| ||||    
T  19981181 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcag 19981280  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttc-ctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  | || |  || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  19981281 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatcttttcacctctctc-ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagaagacaa 19981379  T
Q  222 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 318  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | || |||||| | ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  19981380 tctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctctatttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctg 19981479  T
Q  319 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  19981480 gcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 19981545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18881224 - 18880860
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  18881224 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 18881125  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||    
T  18881124 ctagtgcatgacccttctttccacagtgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 18881025  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     | |||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  18881024 ttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctga 18880925  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18880924 cccttagtcttccgctcattcactatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgca 18880860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21391438 - 21391064
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | |     
T  21391438 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgt 21391339  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||   |    
T  21391338 ttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaa 21391239  T
Q  213 agcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    | || |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| ||    
T  21391238 aacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcg 21391139  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21391138 actctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21391064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21780764 - 21780390
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | |     
T  21780764 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgt 21780665  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||   |    
T  21780664 ttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaa 21780565  T
Q  213 agcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    | || |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||| ||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| ||    
T  21780564 aacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcg 21780465  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21780464 actctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21780390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21164105 - 21163679
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||  | || || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||    
T  21164105 ctaccagtagttggcgccttcttaggttgcttgcattgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacagttgcaatcag 21164006  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcct--------caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaag 214  Q
    | |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || || |        || |||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||     
T  21164005 ccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctttatctctccatgacaagcattgctcttgtggtctttctcgccacaattaaaa 21163906  T
Q  215 cacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 311  Q
    || |||||||| ||||   ||||||||||| | || || ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  21163905 cagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgac 21163806  T
Q  312 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactct 411  Q
    | || || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |  |||||||     
T  21163805 tttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcg 21163706  T
Q  412 cagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21163705 gatctgttggtatccaattgccctctt 21163679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 22031323 - 22031554
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  22031323 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccttcttcattacaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 22031422  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---c 225  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || | ||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   |||||   |    
T  22031423 tatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctctttaggacaaacattgctcttatggccttt-tcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 22031521  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatc 258  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22031522 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 22031554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 384
Target Start/End: Original strand, 21671787 - 21672093
Alignment:
Q  81 cattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggc 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |   ||||| |||||||   ||||||| || |||||||| || | |||| |||| |  ||| ||||||| ||    
T  21671787 cattgcaattaaagcacacaatatcatcatctttgcactcagctagtgcatgaccctttttaccacagcgaaaacacctcttcacatccccaggacaagc 21671886  T
Q  181 gttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccct 277  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  |||  |||||| |||| |||||  ||||||| ||     
T  21671887 attactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctaccattctctgtttaccc 21671986  T
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| | |||||| ||||| |    
T  21671987 ttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggcatcctcctcataaa 21672086  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    |||||||    
T  21672087 tcctgca 21672093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22421312 - 22421096
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||  |   |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||  |    
T  22421312 caggacaagcattacttttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatatcaaccgaagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaaccattct 22421213  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  22421212 ctgtttgcccttattagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcc 22421113  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| ||||||||    
T  22421112 tcctcataaatcctgca 22421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29300751 - 29300626
Alignment:
Q  262 catcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttc 361  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||     
T  29300751 catcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttt 29300652  T
Q  362 gtatcctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29300651 gtgtcctcctcatatatcctgcagct 29300626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16268772 - 16268415
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 141  Q
    |||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  ||| ||||| |||||||    |||||| ||||     
T  16268772 tcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatgacccttctg 16268673  T
Q  142 accacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttc 238  Q
    |||||||| ||  |||||| |    || | |  |||  | || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  ||    
T  16268672 accacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctc 16268573  T
Q  239 ttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcat 338  Q
    |||||||||| |||  ||||   ||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||     
T  16268572 ttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaagagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcac 16268473  T
Q  339 tcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16268472 tcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacaactattaaccaa 16268415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 28984287 - 28984534
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||   || ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||| || || || |    
T  28984287 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcccttgt 28984386  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    | || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | |||||| ||||| || || || |||||||| |||||    
T  28984387 ccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcct 28984486  T
Q  382 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaat 429  Q
     || || |||||||| || | ||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  28984487 acacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaat 28984534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 22523973 - 22524088
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  22523973 tgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcct 22524072  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | | ||| ||||||||    
T  22524073 ccttataaatcctgca 22524088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 381
Target Start/End: Original strand, 19985614 - 19985755
Alignment:
Q  240 tcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcatt 339  Q
    ||||||||| |||  |||| | |||| ||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | |||| |    
T  19985614 tcttaggcctcctctcatcaatcatcctctgtttacccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcact 19985713  T
Q  340 cactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    ||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19985714 catcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcct 19985755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Original strand, 21928889 - 21929009
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||    
T  21928889 tctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatc 21928988  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  21928989 ctcttcatagattctacagct 21929009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 426
Target Start/End: Original strand, 22054335 - 22054483
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||| |||    
T  22054335 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcacaga 22054434  T
Q  378 tcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
    ||||||| | | | |||||||| |  |||| ||| | ||||||||||||    
T  22054435 tcctgcaacgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 22054483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17830204 - 17830113
Alignment:
Q  353 tgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  17830204 tgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtc 17830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22027586 - 22027543
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22027586 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 22027543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 387
Target Start/End: Original strand, 3274589 - 3274686
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  || ||||||||||||  ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3274589 gcactgtaaggctttggacgactttgctggcctttacctctcttctcattcactattttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgcagct 3274686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 22414 - 22845
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  22414 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 22513  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 22613  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22614 aacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 22713  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22714 ctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 22813  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22814 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 7403 - 7834
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  7403 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacgg 7502  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7503 ttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 7602  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7603 aacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 7702  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7703 ctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 7802  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7803 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 3591 - 4022
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  3591 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtccgtacgc 3690  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3691 ttgcattcagctacaataggacctttcttaccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 3790  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791 aacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 3890  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3891 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 3990  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3991 agctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 4022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 443
Target Start/End: Original strand, 17343 - 17760
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |   |||||||||| |    
T  17343 gtagtaggcgccctcttaggttgtttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgctaaaaatcagctacta 17442  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  17443 tatgacccttattgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgc 17542  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  17543 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 17642  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  17643 gtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 17742  T
Q  426 caatcgccttcttgatgt 443  Q
    | || ||| |||| ||||    
T  17743 cgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Original strand, 10540 - 10965
Alignment:
Q  18 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  10540 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccattgcagttaaaacacataatgtccgtacgcttgca 10639  T
Q  118 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcac 217  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10640 ttcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacac 10739  T
Q  218 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 317  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10740 acaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgct 10839  T
Q  318 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctg 417  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10840 gtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccgg-aaaactctaagctg 10938  T
Q  418 ttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10939 ttggtatccaatcgccctcttgatgtc 10965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 41322 - 41753
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  41322 agcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 41421  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41422 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgctctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccacaattga 41521  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  41522 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttattagcaggggcaatgtacggcttaggacaact 41621  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  41622 ctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattctcttcatagatcctgcagctattgaccaaattcggaaaaactcta 41721  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41722 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 41753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13244 - 12827
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||     
T  13244 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaat 13145  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc- 228  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||     
T  13144 atgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgca 13045  T
Q  229 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
      ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||     
T  13044 ggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttgg 12945  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||  | ||||||||||||    
T  12944 tcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatcaacgaaaactcggatctgttggtatcc 12845  T
Q  427 aatcgccttcttgatgtc 444  Q
     || ||| |||| |||||    
T  12844 gattgccctcttaatgtc 12827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 21164 - 21578
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  21164 agcaaagaccctactagtagtcggcgtcctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 21263  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21264 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 21363  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21364 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggacgact 21446  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21447 ctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaactcta 21546  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21547 agctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 444
Target Start/End: Original strand, 11636 - 12050
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  11636 agcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 11735  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11736 ttgcattcagctacaatatgacctttcttgcgacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattga 11835  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11836 aacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggacgact 11918  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11919 ctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaactcta 12018  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12019 atctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 407
Target Start/End: Original strand, 55171 - 55565
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| || |||||||||  |||     
T  55171 agcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacatacaatgtcctgacgc 55270  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  55271 ttgcaatcagatactatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggccttttccaccacagttga 55370  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55371 agcacacaatttcagaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgact 55470  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaa 407  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55471 ctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccggaaaaa 55565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 8432 - 8856
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  8432 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcatcattgtagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 8531  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  8532 cagctacaatatgacccttcttgccacactggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctctcccaccacaattgaaacacac 8631  T
Q  220 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8632 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagttggggcactgtacggcttaggacgactctgatgt 8731  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8732 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgtt 8831  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  8832 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 443
Target Start/End: Original strand, 105 - 524
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  105 agcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgc 204  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  205 ttgcaatcagctacaaaatgacccttcttgccacaccggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccataattga 304  T
Q  213 agcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 312  Q
    | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||    
T  305 aacacacaatttcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttcccttcatcagc-----------acggcttaggacgact 393  T
Q  313 ctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  394 ctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctacagatattgaccaaatctggaaaaactcta 493  T
Q  413 agctgttggtatccaatcgccttcttgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  494 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgt 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 424482 - 424909
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  424482 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactgatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtcctcacgcttgcaat 424581  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  424582 cagctacaatatgacccttcttgccacatcggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcacaccacagttgaagcacac 424681  T
Q  220 aatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    ||||||    | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  424682 aatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatattttgtttccctttatcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgc 424781  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  424782 tgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctattaaccaaatccagaaaaactctaatct 424881  T
Q  417 gttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  424882 gttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 384
Target Start/End: Original strand, 203819 - 203922
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  203819 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcc 203918  T
Q  381 tgca 384  Q
    ||||    
T  203919 tgca 203922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 407
Target Start/End: Original strand, 48837 - 49226
Alignment:
Q  18 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||   ||| |||||    
T  48837 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatttgtccctcttcattgcagttaaaacatacaatgtcttgacgcttgca 48936  T
Q  118 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcac 217  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  48937 atcagctactatatgacccttcttgccacattggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggcctttcccaccatagttgaaacac 49036  T
Q  218 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 317  Q
    | ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49037 aaaatttcagaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattctctgtttccctttatcagtaggggcattgtacggtttaggacgactctgct 49136  T
Q  318 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaa 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49137 gtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccgtaaaaa 49226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107480
Alignment:
Q  231 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  331 cctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatc 430  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatc 107494  T
Q  431 gccttcttgatgtc 444  Q
     || ||||||||||    
T  107493 tccctcttgatgtc 107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 438
Target Start/End: Original strand, 8540 - 8809
Alignment:
Q  172 aggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttc 268  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| |||   || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||    
T  8540 aggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctc 8639  T
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |    
T  8640 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcat 8739  T
Q  369 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    | ||||| || ||||| || || ||||  || |  |||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8740 cctcataaattctgcaactgttcaccagctcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 8809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 93697 - 93653
Alignment:
Q  344 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  93697 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 93653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 33 - 450
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  33 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 132  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---c 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   |    
T  133 catgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcaac 232  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  233 tggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggctta-gacgactctgctggcccttg 331  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  332 gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatc 431  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  432 cgatcgccctcttgatgtc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 139641 - 139313
Alignment:
Q  119 tcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaca 218  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  139641 tcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaag 139542  T
Q  219 caatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 315  Q
     |||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  139541 taatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 139442  T
Q  316 ctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagc 415  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||  |||    
T  139441 ctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagc 139342  T
Q  416 tgttggtatccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  139341 tgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 229973 - 229555
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||||||||  |    
T  229973 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattaagcttgcaatcagctatta 229874  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  229873 tatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgc 229774  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||     
T  229773 aggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtcctta 229674  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  229673 gtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 229574  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
      |||||| |||| |||||    
T  229573 tgatcgccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 387
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252163
Alignment:
Q  188 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 284  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||   |||||| ||||| ||| |  |||    
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcag 252060  T
Q  285 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | || |||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  252061 caggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgca 252160  T
Q  385 gct 387  Q
    |||    
T  252161 gct 252163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5599
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  5181 gtagtaggtgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaaccacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 5280  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  5281 tatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgc 5380  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5381 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 5480  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  5481 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcatcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 5580  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  5581 cgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 217
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||    || ||||||||| ||||||    
T  601 gtagtaggcgccctctttggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcatctacaa 502  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc--- 225  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||       
T  501 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgt 402  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  401 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttg 302  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 410  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  301 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcttcatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactc 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 36675 - 37093
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||    
T  36675 ctaccagtagtcggcgccctcttaaactgcttgcattgagaaccaatatgaccctcttccttgcaattaaagcacacaatatcactacgcttgcaatcag 36774  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  36775 ctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgat 36874  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||     
T  36875 ctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctgg 36974  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||  | |||||    
T  36975 cccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgtt 37074  T
Q  420 ggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  37075 ggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 14607 - 15025
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   ||| ||||||||||||||||    
T  14607 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcatacgatatcattacgcttgcaatcagctacaa 14706  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||  | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  14707 tatgactcttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgc 14806  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14807 aggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 14906  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  14907 gtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 15006  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  15007 cgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 5341 - 5456
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  5341 tgtttgcccttatcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 5440  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  5441 cctcatatattctgca 5456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39298 - 39253
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  39298 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 39253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 180642 - 180598
Alignment:
Q  344 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  180642 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 180598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14153 - 13733
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |    
T  14153 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacta 14054  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  14053 tacgacccttcttgccacacctgacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgc 13954  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||     
T  13953 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggccctta 13854  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt--ggta 423  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | |||||  ||||    
T  13853 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagatcctgcagctattcactaaatctggaaaaactcgaatctgttgcggta 13754  T
Q  424 tccaatcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  13753 tccaatcgccctcttaatgtc 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15151 - 14778
Alignment:
Q  40 cctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttc 139  Q
    ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  15151 cctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttc 15052  T
Q  140 ttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatcct 236  Q
    || |||||||||||||| ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    | ||||||||    
T  15051 ttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatcct 14952  T
Q  237 tcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 336  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||    
T  14951 tcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctc 14852  T
Q  337 attcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 410  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14851 attcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactc 14778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11466 - 11093
Alignment:
Q  40 cctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttc 139  Q
    ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  11466 cctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttc 11367  T
Q  140 ttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatcct 236  Q
    || |||||||||||||| ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    | ||||||||    
T  11366 ttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatcct 11267  T
Q  237 tcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 336  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||   ||| || || |||||   ||||| |||    
T  11266 tcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctc 11167  T
Q  337 attcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 410  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  11166 attcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactc 11093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 890 - 473
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  890 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 791  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  790 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 691  T
Q  229 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
       ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||   |||||    
T  690 tggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgtccttg 591  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||  || |||||||  || ||||||||||    
T  590 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagatcctgcagttattcactaaataagggaaaactcggagttgttggtatc 491  T
Q  426 caatcgccttcttgatgt 443  Q
    | |||||| |||||||||    
T  490 cgatcgccctcttgatgt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 438
Target Start/End: Original strand, 4 - 383
Alignment:
Q  62 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 161  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||    |||||||||||| |||| ||| | ||  ||||    
T  4 gaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcaactaatgtatgacctttcttgccacgccgaaaacttttct 103  T
Q  162 tgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatc 258  Q
    | |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  104 tcacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 203  T
Q  259 gaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 358  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  204 gaccattctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagct 303  T
Q  359 ttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||  | |||||| |||||||| ||| ||||    
T  304 ttggtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctctt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15706 - 15288
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     | ||||||||||    
T  15706 ctaccagtagttggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagcacacaatgtcattgtgcttgcaatcag 15607  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  15606 ctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgat 15507  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||     
T  15506 ctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggcactatagggcttagggcaactctgctgg 15407  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    | |||   ||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||    
T  15406 cgcttagtcttccactcatttacaacattgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactcagatctgtt 15307  T
Q  420 ggtatccaatcgccttctt 438  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  15306 ggtatccaattgccctctt 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10358 - 9942
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||     
T  10358 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaat 10260  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| || |||    
T  10259 atgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgca 10160  T
Q  230 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||     
T  10159 ggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttgg 10060  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     || | ||||||| || | |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||   | || |||||||||    
T  10059 tctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatcagcgaaaacttggatctattggtatcc 9960  T
Q  427 aatcgccttcttgatgtc 444  Q
     |||||| | ||||||||    
T  9959 gatcgccctgttgatgtc 9942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13013 - 12597
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||     
T  13013 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaat 12915  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| || |||    
T  12914 atgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgca 12815  T
Q  230 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||     
T  12814 ggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttgg 12715  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     || | ||||||| || | |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||   | || |||||||||    
T  12714 tctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatcagcgaaaacttggatctattggtatcc 12615  T
Q  427 aatcgccttcttgatgtc 444  Q
     |||||| | ||||||||    
T  12614 gatcgccctgttgatgtc 12597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 438
Target Start/End: Original strand, 32053 - 32474
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||  || |||||||| ||   | | |||||||    
T  32053 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatatcattatgtttgcaat 32152  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  32153 cagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagac 32252  T
Q  220 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||    
T  32253 aatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaagggcgctatagggcttagggcgactctgc 32352  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |  |  |||||||  | ||    
T  32353 tggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatct 32452  T
Q  417 gttggtatccaatcgccttctt 438  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  32453 gttggtatccaattgccctctt 32474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 54814 - 55178
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||   ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  54814 ctactagtagccggcgccttcttaggcttcttacactacgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacacacaatatcatcatgtttgcactcag 54913  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    ||    ||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  |||  ||||||  | || ||||||||||| ||||||| | ||   || || |||||    
T  54914 ctcgtgcatgacctttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccctaggacaaccattactcttgtggcccttctcacaataagaaaaacaaacaat 55013  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||  ||||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||| || |||||| | ||||| || ||     
T  55014 cttagcaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgctcttatcagcaggggcactataaggcttatggcgactttgttgg 55113  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | |||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  55114 cacttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 55178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 37519 - 37709
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||  || |||||||| ||   | | |||||||    
T  37519 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatatcattatgtttgcaat 37618  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaatt 210  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37619 cagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaatt 37709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7787 - 7363
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| |    
T  7787 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcaccgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattaagtttgcact 7688  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 219  Q
    || |||   ||||||| ||||||||||| |||| | |  |||| |  || || |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7687 catctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaatatctctttacctcttccggacaaatattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagac 7588  T
Q  220 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 316  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7587 aatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgc 7488  T
Q  317 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagct 416  Q
    || || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || |  |||||||  | ||    
T  7487 tggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatct 7388  T
Q  417 gttggtatccaatcgccttcttgat 441  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  7387 gttggtaaccaattgccctcttgat 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 444
Target Start/End: Original strand, 63 - 480
Alignment:
Q  30 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||     
T  63 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaat 162  T
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc- 228  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||     
T  163 atgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgca 262  T
Q  229 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
      ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||     
T  263 ggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttgg 362  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||  | ||||||||||||    
T  363 tcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatcaacgaaaactcggatctgttggtatcc 462  T
Q  427 aatcgccttcttgatgtc 444  Q
     || ||| |||| |||||    
T  463 gattgccctcttaatgtc 480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 429
Target Start/End: Original strand, 21781 - 22190
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  21781 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatggttgcaatcag 21880  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  21881 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 21980  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||  ||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||     
T  21981 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctgg 22080  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |  |  |||||||  | |||||    
T  22081 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatctgtt 22180  T
Q  420 ggtatccaat 429  Q
    ||||||||||    
T  22181 ggtatccaat 22190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 429
Target Start/End: Original strand, 37205 - 37614
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  37205 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatggttgcaatcag 37304  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  37305 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 37404  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||  ||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||     
T  37405 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctgg 37504  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |  |  |||||||  | |||||    
T  37505 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaacttggagaaaactcggatctgtt 37604  T
Q  420 ggtatccaat 429  Q
    ||||||||||    
T  37605 ggtatccaat 37614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7900 - 7482
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||||||| ||    
T  7900 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacttttgcaatcagctataa 7801  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  7800 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgc 7701  T
Q  229 agcat---ccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    || |    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  7700 aggagtagccttattctttggccgcctatcgtcgaccattctctatttgcctttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttg 7601  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| |  | |||||  | |||||||||||    
T  7600 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctacagatgttcactaaatcagcgacaactcggatctgttggtatc 7501  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  7500 cgatcgccctcttgatgtc 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 171301 - 171719
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||||||||| |||| || || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  171301 gtagtaggcgccctcttcggctgcgtgcattgggaaccgatatgaccctcttcattacagttgaagcacgcaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 171400  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---c 225  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||   |    
T  171401 tatgacctttcttgccacaccgaacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaac 171500  T
Q  226 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  171501 tggagcatccttcttctttggccgcctatcaacgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttg 171600  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||    |||||    | |||||||||||    
T  171601 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctatagctattcactaaatcaacgaaaacatggatctgttggtatc 171700  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  171701 cgatcgccctcttgatgtc 171719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 36947 - 36526
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||| |    
T  36947 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacggttgcaatcgg 36848  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    | |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||  || ||   |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||    
T  36847 ccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctgtatctctctaggacaagcattgctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaat 36748  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  36747 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 36648  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    ||||| | ||||| || |||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||  | |||||    
T  36647 cccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcagatctgtt 36548  T
Q  420 ggtatccaatcgccttcttgat 441  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  36547 ggtatccaattgccctcttgat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Original strand, 30464 - 30826
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||  | | ||| ||||| ||||||||||||  | | || || ||||    
T  30464 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctccgtacactgtgaaccaatatgaccttcctcttcgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttacactcag 30563  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30564 ctagtgtatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggtctttctcaccacaattaaagcagacaat 30663  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30664 ctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgt 30763  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctg 382  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||    
T  30764 cccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcctcctcataaatcctg 30826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 217 - 581
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||||| ||||    
T  217 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcag 316  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctca-ggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa 221  Q
    |||    |||||| ||||||||| | |||| |||  | || |  || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  317 ctagtgaatgacccttcttaccaaatcggaaacatcttttaacctc-tcacggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaa 415  T
Q  222 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 318  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  416 tctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctg 515  T
Q  319 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     |||||   ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  516 gcccttagtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgca 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 396
Target Start/End: Original strand, 291 - 667
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  291 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaactaatatgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcag 390  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || |  ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  391 ctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctctttcggaaaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 490  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  491 ctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctgg 590  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  591 cccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcgtcataaattctacagctgttcaccaa 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17476 - 17112
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  17476 ctaccagtagtcggcgcctgcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 17377  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || |||||    
T  17376 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 17277  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  17276 ctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttga 17177  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17176 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 17112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 322
Target Start/End: Original strand, 40496 - 40537
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 322  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40496 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtccc 40537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 444
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3465
Alignment:
Q  29 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||       
T  3047 gtagtaggcgccctattaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgtttgcaatcagctaatg 3146  T
Q  129 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc 228  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||    
T  3147 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttctccacctcctcaggacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagc 3246  T
Q  229 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 325  Q
    ||   ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  3247 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta 3346  T
Q  326 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatc 425  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| | ||| || ||| || |||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  3347 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctccttataaattctgtagttattcaccaaatctggaaaaactcggatctgttggtatc 3446  T
Q  426 caatcgccttcttgatgtc 444  Q
    | |||||| |||| |||||    
T  3447 cgatcgccctcttaatgtc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 426
Target Start/End: Original strand, 3 - 319
Alignment:
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||  |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3 ttgcaatcagctaaagtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatga 102  T
Q  213 agcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    | || |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  103 aacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcg 202  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 409  Q
    ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||  ||||| || || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  203 actctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaact 302  T
Q  410 ctcagctgttggtatcc 426  Q
    || | || |||||||||    
T  303 ctgatcttttggtatcc 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Original strand, 101 - 463
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  | | ||| ||||  |||||||||||   | | || || ||||    
T  101 ctaccagtagtcggcaccttcttaggcttcgtacactgtgaactaatatgaccttcctcttcgcagttaagacacacaatgtctttatgcttacactcag 200  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  201 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccagacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 300  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  301 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctattgt 400  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctg 382  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || || || ||||| ||||||    
T  401 cccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcatcctcataaatcctg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 122142 - 121897
Alignment:
Q  184 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcccttta 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||    
T  122142 gctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccctta 122043  T
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || |||||   | ||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  122042 tcagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattc 121943  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  121942 tgcagctattcaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatcc 121897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11778 - 11666
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||  ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  11778 cctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagccttagtgtcctcttcat 11679  T
Q  375 agatcctgcagct 387  Q
    | |||||||||||    
T  11678 atatcctgcagct 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1700
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||   || | ||||||| ||||| |    
T  1917 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatttcagcaggagcatctatcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgt 1818  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || ||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |    
T  1817 cagcaggagcactatatggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcat 1718  T
Q  382 gcagctattaaccaaatc 399  Q
    || |||| | ||||||||    
T  1717 gctgctactcaccaaatc 1700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 2166 - 2530
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||  | | ||||| ||||    
T  2166 ctaccagtagtctgcgcattcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaaacacacaatatcctcatgtttgcactcag 2265  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| | || |  ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  2266 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctattaacatccccatgacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcacacaat 2365  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| | ||   |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||  ||| ||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  2366 ctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaaccattctctattttcccttatcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttga 2465  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||    
T  2466 cccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 2530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 8400 - 8764
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  8400 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttccactgtgaaccaatgtgaccttcttcatcgcaattaaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 8499  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| |  |||  |||||| || || |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  8500 ctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacacctcttaacatccctaggacaagcattactcttgtggcctttctgaccacaagtaaagcagacaat 8599  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    || |||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  8600 ctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgaccattctctgtttgcccttatcggcaagagcactgtaaggcttagggcgactctgctga 8699  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  8700 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaattctgca 8764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 356 - 141
Alignment:
Q  172 aggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttc 268  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||    
T  356 aggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctc 257  T
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  256 tgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcct 157  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| ||||||||    
T  156 catcataaatcctgca 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 8587 - 8952
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagta-cactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatca 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||   | | ||||| |||    
T  8587 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactca 8686  T
Q  122 gctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa 221  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||| | |||  |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || ||||    
T  8687 gctagagcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaa 8786  T
Q  222 tctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 318  Q
    |||| | || |   |||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8787 tctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgttg 8886  T
Q  319 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8887 acccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatccttctcatagatcctgca 8952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30701 - 30349
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||  | ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | | ||||||||||    
T  30701 ctactagtagtcggcgccttcttagattgcttgcactgagaaccaatgtaaccctcttcattgcaattgaagcacacaaggtcattatgtttgcaatcag 30602  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  30601 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctcctggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 30502  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | |||||  || | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||||||     
T  30501 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggtactatagggcctagggcgactctgctgg 30402  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttc 372  Q
    || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  30401 cctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttc 30349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43547 - 43216
Alignment:
Q  56 cactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacac 155  Q
    |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||  | | ||    
T  43547 cactgtgaaccaatgtgacctttctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacctttcttaccacaatgaaaac 43448  T
Q  156 acttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcct 252  Q
    ||  ||| |  ||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| || ||   | |||| |||||||| ||||||||    
T  43447 accacttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcagcaagaccatctttcttcttgggccgcct 43348  T
Q  253 aacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtag 352  Q
    | |||| || ||  ||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  || |||   |||| ||||||||| | ||||||     
T  43347 atcatcaactattctctgtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggcgactctgcttacctttggttttccgctcattcacaatcttgtat 43248  T
Q  353 tgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  43247 tgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 43216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 384
Target Start/End: Original strand, 69 - 432
Alignment:
Q  24 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 123  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| |||||    
T  69 taccagtagtcggcgtcttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcagc 168  T
Q  124 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatc 223  Q
    ||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || ||||||    
T  169 tagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatc 268  T
Q  224 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 320  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  269 tctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgac 368  T
Q  321 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  369 ccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcatagatcctgca 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 385
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3407
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3303 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 3402  T
Q  381 tgcag 385  Q
    |||||    
T  3403 tgcag 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10285 - 10032
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | || |||||||    
T  10285 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttacaatcag 10186  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10185 ctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctagacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaat 10086  T
Q  223 ctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttt 273  Q
    |||    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  10085 ctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgttt 10032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 50469 - 50108
Alignment:
Q  26 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 125  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||| || || |||||||    
T  50469 ccagtagtcggcgcctttttaggcttcgtacattgtgaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttacactcagcta 50370  T
Q  126 caacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
         || || ||||| ||||| || | |||  ||||    ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50369 gtgtgtgtcccttcttcccacagcgaaaacatctctttccctctcccggacaagcattgcttttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctc 50270  T
Q  226 tgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 322  Q
     ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||  |||    
T  50269 agcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctgctagccc 50170  T
Q  323 ttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     |  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  50169 atagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 50108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 327
Target Start/End: Original strand, 43122 - 43182
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 327  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43122 tctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcc 43182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10643
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  11007 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 10908  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || |||||    
T  10907 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctgttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 10808  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||     
T  10807 ctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttttga 10708  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  10707 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgaatcttggtatcctcctcatagatcttgca 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 11441 - 11804
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||   | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || || ||   | | ||||| ||||    
T  11441 ctaccagtagccggcaccttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtg-ccctcttcattgcaattaaaacatactatatcatcatgtttgcactcag 11539  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||    
T  11540 ctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 11639  T
Q  223 ctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  11640 ctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggagcactgtaaggcttagggcgactctgctga 11739  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11740 cccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttggtatcctcctcataaattctgca 11804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14610
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||   | | || || ||||    
T  14261 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacatactatatcaacatgcttacactcag 14360  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||| ||||| ||||| || | |||  |||| |  ||| || |||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||    
T  14361 ctagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttaacatccccaagacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaat 14460  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  14461 ctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttga 14560  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  14561 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctc 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 15078 - 15452
Alignment:
Q  13 agcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacga 112  Q
    |||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    | |     
T  15078 agcaaagactctaccagtagccgacgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatattatcatgt 15177  T
Q  113 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 212  Q
    ||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  |||||| || || | ||||||||| ||||||||||||   |    
T  15178 ttgcactcagctagtgcataacccttcttcccacatcggaaacatctattggtatccctaggacaagcattacccttgtggcccttctcaccacaagaaa 15277  T
Q  213 agcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 309  Q
    |  | |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15278 aaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcg 15377  T
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||| || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15378 actctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 15452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17193 - 16775
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || ||   | | ||||| ||||    
T  17193 ctacccgtagtcggcgccctcttaggctgcttacactgggacccaatatgaccctcttctttgcagttgaaacacacgatatcaccatgcttgcagtcag 17094  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||     ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  17093 ctaatgtgtgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacagtgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaat 16994  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   ||||||| |||||||| ||  |  | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||     
T  16993 ctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatatggcttagggctactctgctgg 16894  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgtt 419  Q
    |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||   | |||||    
T  16893 cccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaactgggatctgtt 16794  T
Q  420 ggtatccaatcgccttctt 438  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  16793 ggtatccgatcgccctctt 16775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 194813 - 194574
Alignment:
Q  205 acaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggc 301  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  194813 acaattaaagcagacaatctcagcagggacatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggc 194714  T
Q  302 ttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccg 401  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||  ||||| || | |||||| | |||||| || ||||| || || |||||||| ||  | ||||| || |    
T  194713 ttagggcgactctgctggcccttagtcttccgttcatttacaatcttgtaataagccttagtgtcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccaactcgg 194614  T
Q  402 gaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccttcttgat 441  Q
      |||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||    
T  194613 agaaaactcggatcttttggtaaccaattgccttcttgat 194574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 194965 - 194883
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  194965 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcgtacactacgaaccaatgtgaccctccttattgcaattaaagcacacaatgtc 194883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21425 - 21297
Alignment:
Q  310 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 409  Q
    ||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  21425 actctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 21326  T
Q  410 ctcagctgttggtatccaatcgccttctt 438  Q
       | |||||||||||| |||||| ||||    
T  21325 gggatctgttggtatccgatcgccctctt 21297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 3728 - 4077
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   |   ||||| ||||    
T  3728 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatttttgcactcag 3827  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||| |  ||| ||||||| || || ||||||||| ||||| ||||| || |  |||| |||||    
T  3828 ctagtgcatgacctttcttaccacaacgaaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggtctttcacaccataagtatagcagacaat 3927  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     || ||   |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||     
T  3928 ttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagacttaggacgactctgctga 4027  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 369  Q
    || |||   ||||||||||| || | |||||| |||| ||  ||||||||    
T  4028 cctttggttttcctctcatttacaatcttgtaatgagtctaggtatcctc 4077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4651 - 4318
Alignment:
Q  54 tacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggac 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| || |     
T  4651 tacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacaacgaaa 4552  T
Q  154 acacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgc 250  Q
    |||  |||| |  ||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||||||||||||    
T  4551 acatctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgc 4452  T
Q  251 ctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgt 350  Q
    ||| |||| |||||  |||||||  | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||| | |||||    
T  4451 ctatcatcaaccattctctgtttatccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggttttccgctcattcacaatcttgt 4352  T
Q  351 agtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | | || ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4351 aataagtcttggtatcctcctcatatatcctgca 4318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 194 - 558
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||| | ||||    
T  194 ctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttggactcag 293  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || |  ||  |||| |  ||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  294 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 393  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |   |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  394 ctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 493  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  494 cctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 4611 - 4975
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||| | ||||    
T  4611 ctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttggactcag 4710  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || |  ||  |||| |  ||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  4711 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 4810  T
Q  223 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |   |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  || |||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4811 ctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 4910  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4911 cctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1507
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     | || || ||||    
T  1159 ctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttacactgtgaaccaatgtgaccctcctaattgcaattaaagcacacaatgtcatcgtgcttacactcag 1258  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    ||||||||||||||||||  | | |||  |||| |  ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||    
T  1259 ctagtgtatgacctttcttaccacagggaaaacatctctttacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaat 1358  T
Q  223 ct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||   | | ||| ||| ||||  | || |||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  1359 ctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttgg 1458  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  1459 cccttggtcttccgttcattcacaatcttgtaatgagccttcgtatcct 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1112 - 801
Alignment:
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||  |  |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| | |    
T  1112 atgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctggacaaacaatgctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagta 1013  T
Q  230 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||  | || |||||| ||||| | |  |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||      
T  1012 ggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgtgtgcgcttatcagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggcccttag 913  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcc 426  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||  | ||||||||||||    
T  912 tcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcatcatagattctacagctattcaccaaatatggaaaaactcggatctgttggtatcc 813  T
Q  427 aatcgccttctt 438  Q
    || |||| ||||    
T  812 aaacgccctctt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 381
Target Start/End: Original strand, 9124 - 9485
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||   | | ||||| |||     
T  9124 ctaccagtagccggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcgtacaatatcatcatgtttgcactcaa 9223  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||   || || |||||    
T  9224 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 9323  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    || |||||   ||||||||||||||||    ||| | ||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| || || ||||  |||||||| ||     
T  9324 ctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcaccaggggcactataaggattagcgcgactctgttga 9423  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||||  | |||| ||| ||||| | || ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9424 cccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcct 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9422 - 9220
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  9422 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgaccattct 9323  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    | |||| || |||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  9322 cggtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcc 9223  T
Q  368 tct 370  Q
    |||    
T  9222 tct 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 229 - 384
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7041
Alignment:
Q  229 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 328  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  6886 agcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtc 6985  T
Q  329 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6986 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcctgca 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40634 - 40270
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| || | || |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||   | | ||||| ||||    
T  40634 ctaccagtagccgacaccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacatactatatcatcatgtttgcactcag 40535  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||| |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||    
T  40534 ctagtgcatgacccttctttccacagcaaaaacatctcttaacatccccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagaattcaat 40435  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    ||| ||||   |||| |||||  | || |||||| |||| ||||   ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  40434 ctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgttga 40335  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||    
T  40334 cccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 40270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 111034 - 110670
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||   | | || || ||||    
T  111034 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcatactatatcatcatgtttacactcag 110935  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||    |||||||||||||||||| || | |||  |||| || ||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  110934 ctagtgtatgacctttcttaccacatcgaaaacatctcttcatgtccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 110835  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  110834 ctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgcttccccttatcggcaggagcactgtgaggcttaggacggctctgctga 110735  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  110734 cctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 110670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Original strand, 18280 - 18386
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  18280 ttatcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttggtatcttcttcataaa 18379  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    | |||||    
T  18380 ttctgca 18386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 18133 - 18229
Alignment:
Q  134 cctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||| |  ||| ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  18133 cctttcttaccacaacggaaacaccgcttcacatccccagaacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcag 18229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 444
Target Start/End: Original strand, 330 - 742
Alignment:
Q  35 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 134  Q
    |||||| ||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||     ||||    
T  330 ggcgccttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgcttgcaatcaactaatgtgtgac 429  T
Q  135 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---c 231  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||  |||   |    
T  430 ccttcttgccacaccggaaacactccttcacctcctcacgacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaac 529  T
Q  232 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 331  Q
    |||||| ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| || |||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||    
T  530 atcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcaacaggggaactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttc 629  T
Q  332 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaatcg 431  Q
    | |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |  |||||||  | |||||||||||| |||     
T  630 cgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcaactattcaccaactcggagaaaactcagatctgttggtatccgatcc 729  T
Q  432 ccttcttgatgtc 444  Q
    || |||| |||||    
T  730 ccctcttaatgtc 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28631
Alignment:
Q  131 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||  ||||    
T  28947 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcag 28848  T
Q  231 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 327  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| | || |||||| |||||       
T  28847 gaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggcccttagt 28748  T
Q  328 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatcca 427  Q
    ||||  |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||     
T  28747 cttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccg 28648  T
Q  428 atcgccttcttgatgtc 444  Q
    |||||| |||| |||||    
T  28647 atcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Original strand, 42074 - 42288
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  42074 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 42173  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  42174 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 42273  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  42274 gcacctattaaccaa 42288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 18827 - 19190
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| | |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  18827 ctaccaatagtctgcgccttcttaggcttcttacacagcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcag 18926  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  18927 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttcacatccccgggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 19026  T
Q  223 ct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
     |   | | ||| || ||||| || || |||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |     
T  19027 ttcaacaggagcttctttctttttggggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactttgc-ga 19125  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19126 cctttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgca 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23924 - 23708
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   | ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |    
T  23924 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattct 23825  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||    
T  23824 ctgtttgcccttatcagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcc 23725  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| ||||||||    
T  23724 tcctcataaatcctgca 23708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23888 - 23674
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  23888 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 23789  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||  || || || ||||||||||| ||    
T  23788 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtcttcttcatagattct 23689  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
    ||| |||||||||||    
T  23688 gcacctattaaccaa 23674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2125
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  2390 ctaccagtagccggcaccttcttaggctacttacactatgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 2291  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||| || |||||||||   || || |||||    
T  2290 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttgtcaccacaagaaaaacaaacaat 2191  T
Q  223 ctct---gcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagc 285  Q
    ||||   | ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  2190 ctctacaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagc 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Original strand, 19812 - 19939
Alignment:
Q  257 tcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgag 356  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  19812 tcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgag 19911  T
Q  357 ccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19912 tcttggtatcctcctcatagatcctgca 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 396
Target Start/End: Original strand, 797 - 1014
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| |||| | || |||||  || ||||    
T  797 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttcctt 896  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| ||    
T  897 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaat 996  T
Q  379 cctgcagctattaaccaa 396  Q
     ||||| || ||||||||    
T  997 tctgcatctgttaaccaa 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 48055 - 48271
Alignment:
Q  171 caggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctt 267  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  |    
T  48055 caggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattct 48154  T
Q  268 ctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 367  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||    
T  48155 ctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcc 48254  T
Q  368 tcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||||| || |||||    
T  48255 tcctcataaattctgca 48271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 55436 - 55234
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||||    
T  55436 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 55337  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  55336 cagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattct 55237  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  55236 gca 55234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 41809 - 42173
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | || || ||||    
T  41809 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttacactcag 41908  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    | |   ||||||||||||| ||||| || |  ||  | || |  ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |   | | | |||    
T  41909 caagtgcatgacctttcttcccacaacgaaagcatcttttcacgtccccaggacaagcattactcttgtgacctttctcaccacaagtattgtagaaaat 42008  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  42009 ctcaacaggggcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 42108  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42109 cctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgca 42173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 75529 - 75893
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | || || ||||    
T  75529 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttacactcag 75628  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 222  Q
    | |   ||||||||||||| ||||| || |  ||  | || |  ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |   | | | |||    
T  75629 caagtgcatgacctttcttcccacaacgaaagcatcttttcacgtccccaggacaagcattactcttgtgacctttctcaccacaagtattgtagaaaat 75728  T
Q  223 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 319  Q
    |||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  75729 ctcaacaggggcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 75828  T
Q  320 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  75829 cctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgca 75893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34661 - 34534
Alignment:
Q  257 tcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgag 356  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  34661 tcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgag 34562  T
Q  357 ccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||    
T  34561 ccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 34534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34845 - 34763
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  34845 accctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaat 34763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 66448 - 66239
Alignment:
Q  229 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 328  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  66448 agcatccttcttccttggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 66349  T
Q  329 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaa 428  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || || || |  |||||||  | ||||||||||||||    
T  66348 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcacgaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaa 66249  T
Q  429 tcgccttctt 438  Q
    | ||| ||||    
T  66248 ttgccctctt 66239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 69551 - 69366
Alignment:
Q  20 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 119  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    | | |||||||    
T  69551 accctaccagtagtcggcaccttcttaggctacttgcactgagaaccaatgtgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatat-attatgcttgcaat 69453  T
Q  120 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccac 206  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  69452 cagctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctcttccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccac 69366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 388
Target Start/End: Original strand, 21153 - 21359
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||   || | ||||||| ||||| |    
T  21153 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgt 21252  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| || ||    
T  21253 cagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcctatcttcctcatatattct 21352  T
Q  382 gcagcta 388  Q
    |||||||    
T  21353 gcagcta 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 1067
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| || | |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  1272 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 1173  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||| || ||    
T  1172 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaat 1073  T
Q  379 cctgca 384  Q
    ||||||    
T  1072 cctgca 1067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 11454 - 11569
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11454 tgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 11553  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  11554 cctcatatattctgca 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1247
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| |||||||| || |    
T  1455 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttccct 1356  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  1355 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 1256  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    ||| |||||    
T  1255 cctacagct 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30294 - 30086
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||||   |||| ||| |||| |||| |||  ||||   |||||||||||||||||    
T  30294 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccctt 30195  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 378  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || || ||| ||||| || || ||||| ||||| ||    
T  30194 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatatat 30095  T
Q  379 cctgcagct 387  Q
    |||||||||    
T  30094 cctgcagct 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 396
Target Start/End: Original strand, 30333 - 30463
Alignment:
Q  266 ttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtat 365  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||| ||||| || || |    
T  30333 ttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgt 30432  T
Q  366 cctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  30433 cttcttcataaattctgcaactgttaaccaa 30463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 216289 - 216199
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  216289 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 216199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 514321 - 514125
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || ||||    
T  514321 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttcctt 514222  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  514221 tgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 514125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 66965 - 66856
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 389  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |    
T  66965 gcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgt 66866  T
Q  390 taaccaaatc 399  Q
    | ||||||||    
T  66865 ttaccaaatc 66856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1191 - 1071
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  1191 tctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatc 1092  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  1091 ctcttcatagatcctacagct 1071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 387
Target Start/End: Original strand, 8168 - 8288
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  8168 tctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatc 8267  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  8268 ctcttcatagatcctacagct 8288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 104565 - 104767
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||  ||||||||||  |||| | |||  ||||||| || ||||    
T  104565 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttcccttat 104664  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  104665 cagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaatcct 104764  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  104765 gca 104767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14143 - 14028
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  14143 tgttttcccttatcatcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 14044  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  14043 cctcatatattctgca 14028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 15836 - 15951
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  15836 tgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 15935  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | |||||||| |||||    
T  15936 cctcatagattctgca 15951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 62638 - 62531
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  62638 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 62539  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  62538 tgcagcta 62531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 65191 - 65081
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||   | | |||||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  65191 ttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 65092  T
Q  378 tcctgcagcta 388  Q
    | |||||||||    
T  65091 ttctgcagcta 65081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 50543 - 50649
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50543 tcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 50642  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  50643 tacagct 50649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11708 - 11461
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||   ||  |||||  || |||| |||  |||| ||||  |||||||||| || ||||| |    
T  11708 ctcttgtggcctttcttaccacacttgtatcatacaatctcatctggtgcatctctcctcttgggcttcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 11609  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    ||||  | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| |||||    
T  11608 cagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcct 11509  T
Q  382 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtatccaat 429  Q
     || || |||||||| |||| ||| ||||| | |||||| || |||||    
T  11508 acacctgttaaccaactccgaaaagactctgatctgttgatacccaat 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 388
Target Start/End: Original strand, 5890 - 5982
Alignment:
Q  296 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5890 tacggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 5774 - 5810
Alignment:
Q  180 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5774 cgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 5810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33343 - 33132
Alignment:
Q  179 gcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  |||   ||||  || |||| |||| |||  ||||   |||| ||||||| |    
T  33343 gcgttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttc 33244  T
Q  276 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| || || || || |||||    
T  33243 ctttgtcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcata 33144  T
Q  376 gatcctgcagct 387  Q
     |||||||||||    
T  33143 tatcctgcagct 33132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 98440 - 98343
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  98440 gcactatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagct 98343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 399
Target Start/End: Original strand, 176434 - 176543
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 389  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||     
T  176434 gcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagctac 176533  T
Q  390 taaccaaatc 399  Q
    | ||||||||    
T  176534 tcaccaaatc 176543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1572 - 1358
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||| || ||||| |    
T  1572 ctcttgtgtcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgt 1473  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  1472 cagcaggagcactgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 1373  T
Q  382 gcagctattaaccaa 396  Q
     || || ||||||||    
T  1372 acacctgttaaccaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 384
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10160
Alignment:
Q  130 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca 229  Q
    |||||||||||||||||| || | |||  | || |  ||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||    
T  9903 atgacctttcttaccacagcgaaaacatcttttcacatccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgaca 10002  T
Q  230 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |   |||| |||||| |||| |||||  |||| |||||  | ||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||     
T  10003 ggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgtttacccttattagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctgtgg 10102  T
Q  327 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||    
T  10103 ctttccgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattctgca 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1608
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  1714 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 1615  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    |||||||    
T  1614 tgcagct 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5768 - 5662
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5768 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 5669  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  5668 tacagct 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17232
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17350 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcc 17251  T
Q  381 tgcagctattaaccaaatc 399  Q
    |||| | ||| ||||||||    
T  17250 tgcaacgatttaccaaatc 17232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4672
Alignment:
Q  287 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4709 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9656 - 9550
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  9656 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 9557  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    |||||||    
T  9556 tcctgca 9550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13926 - 13805
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||    
T  13926 cctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtcttcttcat 13827  T
Q  375 agatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    |||| || || || ||||||||    
T  13826 agattctacacctgttaaccaa 13805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 53 - 152
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  53 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacc-ttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttggtatcttcctcataga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 771 - 615
Alignment:
Q  182 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   ||||||||| || ||||    
T  771 ttgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 672  T
Q  279 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctct 335  Q
    | |||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  671 tgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctct 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 305
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || ||||| |    
T  411 tcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattc 312  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    |||||||    
T  311 tgcagct 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Original strand, 10994 - 11087
Alignment:
Q  54 tacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccaca 147  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  10994 tacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccaca 11087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 384
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17780
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||| || |||||    
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgca 17780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 30062 - 30168
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcc 30161  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  30162 tacagct 30168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49046 - 49003
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49046 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 49003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 58080 - 58037
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58080 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 58037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 64468 - 64425
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64468 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 64425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 29958 - 29994
Alignment:
Q  180 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29958 cgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 29994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 384
Target Start/End: Original strand, 5536 - 5629
Alignment:
Q  291 cactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  5536 cactgtaaggctttagacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgca 5629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 396
Target Start/End: Original strand, 11409 - 11530
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||    
T  11409 cctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcat 11508  T
Q  375 agatcctgcagctattaaccaa 396  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  11509 aaatcctgcagctgtttaccaa 11530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 11173 - 11237
Alignment:
Q  42 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||    
T  11173 tcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtcc 11237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24839 - 24654
Alignment:
Q  23 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 122  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  24839 ctacaagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgacgctcctcattgcagttaaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 24740  T
Q  123 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaa 208  Q
    |||   ||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| ||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||    
T  24739 ctagtgcatgacctttctttccacaacggaaacatctcttggtatccccaggacaagaattacttttgtggcccttctcaccacaa 24654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16481 - 16372
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  16481 cctttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcat 16382  T
Q  375 agatcctgca 384  Q
    ||||||||||    
T  16381 agatcctgca 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17942 - 17740
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| ||| || ||||    
T  17942 ctcttgtggcctttctcaccacaagaatagtagacaatctcaacagaagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctatttacccttat 17843  T
Q  282 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 381  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||  || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  17842 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaattct 17743  T
Q  382 gca 384  Q
    |||    
T  17742 gca 17740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 399
Target Start/End: Original strand, 29959 - 30083
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  29959 cctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcctttgtatcctcttcat 30058  T
Q  375 agatcctgcagctattaaccaaatc 399  Q
    |||| || || ||| | ||||||||    
T  30059 agattctacaactactcaccaaatc 30083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6123 - 6080
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6123 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3917 - 3810
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  3917 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattc 3818  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  3817 tgcagcta 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23411 - 23296
Alignment:
Q  269 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 368  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |    
T  23411 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgagtttactgacctttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgacccttagtatctt 23312  T
Q  369 cttcatagatcctgca 384  Q
    | ||||| || |||||    
T  23311 cctcatatattctgca 23296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 324
Target Start/End: Original strand, 263664 - 263707
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  263664 tcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtccctt 263707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7583
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  7485 gcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagcta 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 116062 - 116168
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||  ||| |||||| ||||||    
T  116062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcaaatcttcttcacagatcc 116161  T
Q  381 tgcagct 387  Q
    | |||||    
T  116162 tacagct 116168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 324
Target Start/End: Original strand, 2275 - 2312
Alignment:
Q  287 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2275 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 326
Target Start/End: Original strand, 9036 - 9097
Alignment:
Q  265 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 326  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9036 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgc 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 375
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17169
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  17084 gcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtattctcttcata 17169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8328 - 8223
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |    
T  8328 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 8229  T
Q  381 tgcagc 386  Q
    ||||||    
T  8228 tgcagc 8223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18542 - 18437
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |    
T  18542 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 18443  T
Q  381 tgcagc 386  Q
    ||||||    
T  18442 tgcagc 18437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 387
Target Start/End: Original strand, 6251 - 6348
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 387  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6251 gcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagct 6348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 732 - 621
Alignment:
Q  275 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcat 374  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  732 cctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacactcactcatcaccttat-gtgagcttttgtatcctcttcat 634  T
Q  375 agatcctgcagct 387  Q
    | ||||| |||||    
T  633 aaatcctacagct 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 388
Target Start/End: Original strand, 15510 - 15617
Alignment:
Q  281 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 380  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  15510 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcctttgctcattcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtttcctcctcatagattc 15609  T
Q  381 tgcagcta 388  Q
    ||||||||    
T  15610 tgcagcta 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 63377 - 63298
Alignment:
Q  309 gactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||||||||||| |||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  63377 gactctgctgtaccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcataaatcctacagcta 63298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 384
Target Start/End: Original strand, 2199 - 2292
Alignment:
Q  290 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 384  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| |  || || |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2199 gcactgtaaggcttag-acgactttgctgactattacctttcctctccttcaaaaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagattctgca 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Original strand, 12136 - 12178
Alignment:
Q  185 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  12136 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctctg 12178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1291 - 1185
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 377  Q
    |||||||| || | |||||| ||||| |||||| |||| || | ||| || ||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  1291 ttatcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttgtgatgagctttcgtatcctcctcataga 1192  T
Q  378 tcctgca 384  Q
    | |||||    
T  1191 ttctgca 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13343 - 13246
Alignment:
Q  278 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 375  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| || |||||    
T  13343 ttatcagcaggagcactgcaagactttggacaactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaacctcgtaacgagccttagtatcttcctcata 13246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 388
Target Start/End: Original strand, 54471 - 54592
Alignment:
Q  267 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 366  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | | |  ||| |||  ||||| || ||||| ||| | ||    
T  54471 tctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggctttggacgactctgatgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcatgtc 54570  T
Q  367 ctcttcatagatcctgcagcta 388  Q
    ||| |||||||| |||||||||    
T  54571 ctcctcatagattctgcagcta 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 853 - 808
Alignment:
Q  180 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 225  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  853 cgttactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University