View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8586_low_9 (Length: 391)

Name: NF8586_low_9
Description: NF8586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8586_low_9
NF8586_low_9
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (35-386)||(141703-142050)
chr7 (34-380)||(15824189-15824529)
chr7 (35-380)||(26071949-26072290)
chr7 (35-380)||(26095736-26096077)
chr7 (35-380)||(13867898-13868244)
chr7 (35-375)||(12545619-12545959)
chr7 (35-380)||(2192618-2192963)
chr7 (35-315)||(44863348-44863625)
chr7 (22-375)||(12753017-12753366)
chr7 (35-380)||(7286340-7286686)
chr7 (40-380)||(18305658-18305995)
chr7 (22-377)||(3893229-3893581)
chr7 (35-377)||(7290746-7291089)
chr7 (41-377)||(368981-369318)
chr7 (35-377)||(15952871-15953213)
chr7 (43-301)||(49049549-49049806)
chr7 (35-245)||(47287950-47288158)
chr7 (35-316)||(16480848-16481131)
chr7 (138-348)||(45455499-45455709)
chr7 (39-301)||(15628921-15629182)
chr7 (35-374)||(14253083-14253422)
chr7 (150-348)||(16571983-16572182)
chr7 (150-348)||(16593480-16593679)
chr7 (22-348)||(112978-113291)
chr7 (95-283)||(15762322-15762509)
chr7 (148-283)||(11582770-11582904)
chr7 (148-348)||(13039044-13039237)
chr7 (155-350)||(2024560-2024757)
chr7 (185-375)||(12249908-12250100)
chr7 (152-301)||(3054901-3055049)
chr7 (35-283)||(1938452-1938693)
chr7 (148-348)||(16209852-16210045)
chr7 (148-282)||(32496381-32496514)
chr7 (150-283)||(122706-122838)
chr7 (148-301)||(16416421-16416581)
chr7 (174-293)||(13375930-13376049)
chr7 (167-301)||(11285260-11285402)
chr7 (167-294)||(9058420-9058549)
chr7 (176-293)||(16915896-16916017)
chr7 (173-301)||(15914224-15914354)
chr7 (177-301)||(18255663-18255788)
chr7 (174-293)||(13388232-13388356)
chr7 (200-294)||(10862754-10862849)
chr7 (198-348)||(2435748-2435892)
chr7 (200-281)||(5617714-5617797)
chr7 (176-283)||(9609499-9609610)
chr7 (176-283)||(9837071-9837182)
chr7 (35-126)||(45453937-45454028)
chr7 (176-293)||(17229913-17230034)
chr7 (39-221)||(13272975-13273154)
chr7 (39-125)||(2024753-2024842)
chr7 (205-294)||(48345832-48345923)
chr7 (229-294)||(18920963-18921028)
chr7 (200-283)||(13912975-13913059)
chr7 (207-274)||(14938975-14939043)
chr7 (207-274)||(15366568-15366636)
chr7 (207-301)||(47482781-47482876)
chr7 (35-117)||(16571839-16571921)
chr7 (35-117)||(16593741-16593823)
chr7 (216-274)||(31499506-31499564)
chr7 (205-305)||(10987808-10987908)
chr7 (200-304)||(15518719-15518823)
chr7 (207-294)||(34242981-34243070)
chr7 (200-294)||(9322896-9322992)
chr7 (200-283)||(11514341-11514425)
chr7 (35-91)||(12545565-12545621)
chr7 (200-283)||(13756796-13756880)
chr7 (200-283)||(15443419-15443503)
chr7 (200-283)||(27103407-27103491)
chr7 (200-283)||(27110755-27110839)
chr7 (200-283)||(27174834-27174918)
chr7 (200-283)||(38785499-38785583)
chr7 (200-283)||(42060152-42060236)
chr7 (207-301)||(15687803-15687898)
chr7 (200-305)||(18981844-18981949)
chr7 (229-294)||(4482517-4482582)
chr7 (229-274)||(20587504-20587549)
chr7 (200-283)||(7821142-7821226)
chr7 (200-283)||(7828453-7828537)
chr7 (200-283)||(26011053-26011137)
chr7 (200-279)||(30263984-30264064)
chr7 (246-301)||(3047980-3048035)
chr7 (38-84)||(12249862-12249908)
chr7 (230-283)||(16370226-16370279)
chr7 (176-253)||(16917835-16917916)
chr7 (200-304)||(25294139-25294243)
chr7 (225-271)||(3193897-3193943)
chr7 (286-380)||(6320817-6320908)
chr7 (255-301)||(10002387-10002433)
chr7 (249-283)||(16929846-16929880)
chr7 (249-283)||(16935229-16935263)
chr7 (204-301)||(25122430-25122527)
chr7 (207-304)||(48624221-48624318)
chr7 (229-274)||(28388706-28388751)
chr7 (215-294)||(4444521-4444601)
chr7 (207-301)||(13319505-13319601)
chr7 (215-273)||(4437141-4437200)
chr7 (233-283)||(12113966-12114016)
chr7 (229-274)||(39294008-39294053)
chr7 (343-380)||(44863313-44863350)
chr7 (35-91)||(2192490-2192546)
chr7 (229-273)||(13452456-13452500)
chr7 (237-273)||(13460598-13460634)
chr7 (35-91)||(16480720-16480776)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (1-375)||(45460675-45461053)
chr4 (1-375)||(20813675-20814044)
chr4 (35-380)||(12838010-12838351)
chr4 (35-377)||(18166711-18167055)
chr4 (35-377)||(21961257-21961597)
chr4 (22-375)||(12901447-12901786)
chr4 (35-380)||(34393221-34393568)
chr4 (35-380)||(7134322-7134668)
chr4 (35-377)||(8372444-8372788)
chr4 (35-380)||(26678013-26678358)
chr4 (35-283)||(53909567-53909814)
chr4 (35-380)||(33738319-33738645)
chr4 (35-301)||(30236237-30236493)
chr4 (41-380)||(15274488-15274829)
chr4 (35-283)||(44054104-44054341)
chr4 (30-348)||(53706645-53706949)
chr4 (146-380)||(8874272-8874503)
chr4 (34-262)||(44345015-44345248)
chr4 (35-301)||(19699425-19699694)
chr4 (35-301)||(19710010-19710279)
chr4 (38-377)||(16366450-16366776)
chr4 (148-375)||(18246017-18246250)
chr4 (141-354)||(13752082-13752291)
chr4 (148-377)||(19998354-19998589)
chr4 (35-305)||(22356436-22356707)
chr4 (148-377)||(54120125-54120345)
chr4 (148-380)||(16520635-16520874)
chr4 (207-377)||(23272036-23272204)
chr4 (148-380)||(9293548-9293784)
chr4 (39-283)||(47355445-47355683)
chr4 (149-283)||(109684-109817)
chr4 (148-380)||(10642210-10642446)
chr4 (155-301)||(27959288-27959436)
chr4 (174-293)||(41167723-41167843)
chr4 (35-283)||(13244542-13244775)
chr4 (148-301)||(15211427-15211587)
chr4 (39-250)||(13811380-13811589)
chr4 (168-294)||(14867622-14867749)
chr4 (51-282)||(18496169-18496397)
chr4 (184-301)||(34197988-34198108)
chr4 (112-347)||(5684701-5684930)
chr4 (174-301)||(42706943-42707074)
chr4 (200-380)||(17150228-17150413)
chr4 (138-229)||(18294664-18294755)
chr4 (131-380)||(55378676-55378919)
chr4 (255-380)||(37474567-37474689)
chr4 (164-301)||(43283236-43283382)
chr4 (194-283)||(15853114-15853204)
chr4 (177-283)||(41258155-41258264)
chr4 (177-283)||(19824284-19824392)
chr4 (215-296)||(7187777-7187859)
chr4 (185-293)||(37958862-37958972)
chr4 (174-273)||(12246044-12246147)
chr4 (207-283)||(7966437-7966515)
chr4 (229-294)||(38763021-38763086)
chr4 (207-301)||(14503377-14503472)
chr4 (215-283)||(41919091-41919159)
chr4 (200-274)||(50223994-50224070)
chr4 (205-283)||(26337700-26337779)
chr4 (198-283)||(15288885-15288971)
chr4 (198-283)||(15296052-15296138)
chr4 (207-301)||(15676809-15676903)
chr4 (41-91)||(34393616-34393666)
chr4 (207-298)||(9793537-9793629)
chr4 (207-294)||(13448877-13448965)
chr4 (200-283)||(16329781-16329865)
chr4 (39-141)||(55378550-55378652)
chr4 (207-283)||(8043244-8043321)
chr4 (200-305)||(14950213-14950317)
chr4 (200-279)||(10486890-10486970)
chr4 (164-301)||(33240570-33240708)
chr4 (229-274)||(5407413-5407458)
chr4 (207-283)||(12732432-12732509)
chr4 (207-283)||(13050029-13050106)
chr4 (193-305)||(14994397-14994509)
chr4 (229-294)||(18275056-18275121)
chr4 (200-274)||(10239269-10239345)
chr4 (235-283)||(12136163-12136211)
chr4 (35-91)||(18167103-18167159)
chr4 (200-274)||(47470169-47470247)
chr4 (329-380)||(30457719-30457769)
chr4 (229-295)||(17213732-17213798)
chr4 (35-108)||(13751915-13751988)
chr4 (215-267)||(19557607-19557660)
chr4 (26-91)||(19998913-19998977)
chr4 (229-282)||(24237148-24237201)
chr4 (35-91)||(16521021-16521077)
chr4 (35-91)||(19998786-19998842)
chr4 (207-301)||(32462397-32462493)
chr4 (157-351)||(7848535-7848720)
chr4 (247-281)||(13814725-13814759)
chr4 (206-274)||(17378030-17378100)
chr4 (22-72)||(22356230-22356279)
chr4 (207-283)||(22736718-22736795)
chr4 (329-377)||(53909837-53909883)
chr4 (39-91)||(8372860-8372912)
chr4 (253-293)||(15116188-15116228)
chr4 (39-91)||(26678430-26678482)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (22-381)||(37605123-37605476)
chr8 (22-374)||(20655748-20656098)
chr8 (41-380)||(25120586-25120920)
chr8 (57-380)||(41243789-41244107)
chr8 (35-386)||(24108477-24108828)
chr8 (35-380)||(13664562-13664908)
chr8 (35-380)||(13723837-13724183)
chr8 (34-379)||(19994887-19995233)
chr8 (35-380)||(22909354-22909699)
chr8 (35-380)||(24719335-24719678)
chr8 (35-378)||(22323237-22323569)
chr8 (37-377)||(20479739-20480078)
chr8 (35-374)||(269793-270127)
chr8 (41-380)||(16043071-16043409)
chr8 (39-380)||(22008371-22008711)
chr8 (35-301)||(41508939-41509210)
chr8 (35-374)||(645793-646128)
chr8 (35-374)||(831528-831863)
chr8 (41-380)||(16041395-16041733)
chr8 (37-386)||(16416376-16416722)
chr8 (35-301)||(18610340-18610609)
chr8 (35-380)||(23508904-23509249)
chr8 (98-380)||(6776303-6776588)
chr8 (148-377)||(3433646-3433881)
chr8 (148-380)||(23631101-23631337)
chr8 (59-377)||(17343319-17343635)
chr8 (131-348)||(28543024-28543238)
chr8 (148-377)||(28835817-28836052)
chr8 (148-283)||(43375421-43375557)
chr8 (62-301)||(38531799-38532038)
chr8 (154-283)||(21695835-21695965)
chr8 (147-292)||(39448573-39448719)
chr8 (153-348)||(29758436-29758624)
chr8 (166-348)||(21679305-21679488)
chr8 (39-301)||(17731210-17731470)
chr8 (147-301)||(22737759-22737916)
chr8 (148-283)||(24387523-24387657)
chr8 (176-273)||(17283500-17283599)
chr8 (174-281)||(21192535-21192644)
chr8 (174-281)||(21199962-21200070)
chr8 (179-348)||(16204138-16204302)
chr8 (186-293)||(23229114-23229223)
chr8 (62-227)||(18768536-18768698)
chr8 (207-294)||(5851745-5851833)
chr8 (215-301)||(23154456-23154543)
chr8 (215-301)||(29296114-29296201)
chr8 (173-293)||(23835471-23835595)
chr8 (174-282)||(37655448-37655560)
chr8 (176-294)||(15931569-15931691)
chr8 (198-347)||(24547342-24547485)
chr8 (148-301)||(24930938-24931095)
chr8 (229-294)||(18263274-18263339)
chr8 (229-298)||(17500087-17500156)
chr8 (176-294)||(26009676-26009799)
chr8 (200-305)||(22090301-22090405)
chr8 (200-305)||(21846348-21846453)
chr8 (200-305)||(21853753-21853858)
chr8 (200-283)||(273059-273143)
chr8 (200-283)||(642706-642790)
chr8 (200-283)||(828512-828596)
chr8 (200-283)||(5236411-5236495)
chr8 (200-283)||(24663103-24663187)
chr8 (200-283)||(43683870-43683954)
chr8 (221-279)||(18769992-18770051)
chr8 (207-301)||(21496168-21496263)
chr8 (215-272)||(21233875-21233933)
chr8 (208-301)||(22884684-22884778)
chr8 (205-305)||(17148093-17148193)
chr8 (229-294)||(24266241-24266306)
chr8 (200-283)||(33170512-33170597)
chr8 (225-273)||(11542242-11542290)
chr8 (200-283)||(16676182-16676266)
chr8 (208-283)||(16874791-16874867)
chr8 (230-274)||(20708057-20708101)
chr8 (200-294)||(23118678-23118774)
chr8 (168-231)||(31196395-31196459)
chr8 (215-278)||(33612857-33612920)
chr8 (35-117)||(28543270-28543352)
chr8 (200-347)||(701433-701573)
chr8 (229-294)||(24554434-24554499)
chr8 (200-283)||(225020-225104)
chr8 (200-283)||(738643-738727)
chr8 (200-283)||(862538-862622)
chr8 (230-274)||(11600319-11600363)
chr8 (200-283)||(15320917-15321000)
chr8 (200-283)||(15501286-15501369)
chr8 (242-294)||(25293774-25293825)
chr8 (242-294)||(25755763-25755814)
chr8 (235-274)||(7468562-7468601)
chr8 (229-267)||(22499162-22499200)
chr8 (229-301)||(24237258-24237331)
chr8 (242-283)||(45561575-45561616)
chr8 (35-91)||(3433393-3433449)
chr8 (35-91)||(13664434-13664490)
chr8 (35-91)||(13723709-13723765)
chr8 (198-283)||(24906189-24906277)
chr8 (245-283)||(19333910-19333948)
chr8 (233-273)||(22884033-22884073)
chr8 (39-91)||(23509321-23509373)
chr8 (35-67)||(28836223-28836255)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (22-377)||(59709-60059)
[»] chr3 (145 HSPs)
chr3 (35-380)||(50113809-50114151)
chr3 (35-376)||(17098757-17099095)
chr3 (25-380)||(319292-319643)
chr3 (35-380)||(6148541-6148888)
chr3 (36-386)||(12351527-12351874)
chr3 (35-380)||(11812635-11812982)
chr3 (35-348)||(38166079-38166395)
chr3 (35-348)||(14287194-14287508)
chr3 (35-347)||(47786554-47786861)
chr3 (35-386)||(19944634-19944986)
chr3 (35-375)||(35121764-35122101)
chr3 (35-380)||(22145968-22146304)
chr3 (35-301)||(30204614-30204877)
chr3 (35-377)||(30140822-30141165)
chr3 (35-348)||(11199232-11199544)
chr3 (35-380)||(17936288-17936637)
chr3 (39-347)||(7851551-7851861)
chr3 (35-380)||(16818879-16819222)
chr3 (35-375)||(14296575-14296912)
chr3 (35-375)||(14302202-14302539)
chr3 (36-377)||(19572517-19572845)
chr3 (35-380)||(13815701-13816058)
chr3 (39-353)||(14523098-14523410)
chr3 (131-375)||(53900375-53900617)
chr3 (35-301)||(18737892-18738155)
chr3 (35-344)||(12796596-12796905)
chr3 (35-281)||(51160154-51160403)
chr3 (148-377)||(18908516-18908751)
chr3 (148-377)||(22272871-22273106)
chr3 (131-301)||(17536834-17537006)
chr3 (141-315)||(11062941-11063113)
chr3 (147-281)||(39654101-39654237)
chr3 (166-348)||(40937814-40937997)
chr3 (149-348)||(19230195-19230387)
chr3 (149-281)||(14061039-14061172)
chr3 (149-348)||(19262838-19263032)
chr3 (161-293)||(12563338-12563471)
chr3 (147-293)||(17137625-17137773)
chr3 (148-348)||(23490647-23490840)
chr3 (147-294)||(15515851-15516000)
chr3 (148-380)||(33339872-33340107)
chr3 (154-283)||(55443682-55443812)
chr3 (35-377)||(8629905-8630224)
chr3 (152-348)||(10736701-10736890)
chr3 (179-301)||(15548745-15548870)
chr3 (177-348)||(2048200-2048366)
chr3 (162-283)||(11884026-11884147)
chr3 (82-301)||(17958169-17958385)
chr3 (148-305)||(25056950-25057107)
chr3 (149-283)||(45581037-45581170)
chr3 (147-293)||(25769460-25769606)
chr3 (34-232)||(16183750-16183957)
chr3 (138-301)||(54045621-54045792)
chr3 (201-348)||(2045471-2045613)
chr3 (184-293)||(11330803-11330914)
chr3 (176-293)||(17202884-17203005)
chr3 (194-293)||(18008944-18009043)
chr3 (246-377)||(38527714-38527842)
chr3 (176-301)||(12020160-12020290)
chr3 (184-293)||(15874434-15874543)
chr3 (148-283)||(2451370-2451506)
chr3 (255-380)||(14695625-14695748)
chr3 (35-128)||(11062779-11062872)
chr3 (177-301)||(15940299-15940424)
chr3 (198-377)||(18905608-18905782)
chr3 (176-294)||(34558112-34558234)
chr3 (95-213)||(54686529-54686647)
chr3 (215-294)||(4164092-4164171)
chr3 (229-294)||(6230520-6230585)
chr3 (193-305)||(14846495-14846607)
chr3 (95-213)||(9304724-9304841)
chr3 (193-347)||(12490645-12490808)
chr3 (35-90)||(7851968-7852023)
chr3 (193-283)||(12266346-12266437)
chr3 (148-215)||(49230251-49230318)
chr3 (198-347)||(23082060-23082203)
chr3 (194-281)||(48419898-48419991)
chr3 (229-294)||(4147554-4147619)
chr3 (207-294)||(14819683-14819772)
chr3 (200-283)||(41659863-41659948)
chr3 (35-91)||(11813185-11813241)
chr3 (243-377)||(15861110-15861234)
chr3 (207-374)||(54686338-54686504)
chr3 (200-305)||(8270260-8270364)
chr3 (228-283)||(17320435-17320490)
chr3 (205-305)||(44227619-44227719)
chr3 (200-283)||(1469509-1469593)
chr3 (200-283)||(8277371-8277455)
chr3 (200-283)||(8306180-8306264)
chr3 (200-283)||(16746028-16746112)
chr3 (35-91)||(18908898-18908954)
chr3 (200-283)||(30151550-30151634)
chr3 (200-283)||(41268455-41268539)
chr3 (200-283)||(53768874-53768958)
chr3 (229-299)||(8602521-8602592)
chr3 (207-301)||(14283516-14283611)
chr3 (207-301)||(23888047-23888142)
chr3 (207-301)||(11480940-11481033)
chr3 (207-283)||(15574219-15574296)
chr3 (207-283)||(15613238-15613315)
chr3 (316-380)||(54042879-54042944)
chr3 (200-283)||(13977494-13977578)
chr3 (193-280)||(15470309-15470397)
chr3 (200-283)||(55314595-55314679)
chr3 (193-283)||(16935822-16935913)
chr3 (221-283)||(5225698-5225760)
chr3 (207-295)||(11988026-11988116)
chr3 (229-283)||(15988788-15988842)
chr3 (207-275)||(33371204-33371274)
chr3 (207-301)||(9304866-9304966)
chr3 (229-274)||(10902725-10902770)
chr3 (229-274)||(43429396-43429441)
chr3 (23-79)||(7852107-7852162)
chr3 (35-91)||(7852229-7852285)
chr3 (207-298)||(12903740-12903832)
chr3 (229-267)||(11636782-11636820)
chr3 (200-305)||(27838910-27839015)
chr3 (242-283)||(12950823-12950864)
chr3 (207-299)||(25607235-25607328)
chr3 (175-301)||(51963056-51963184)
chr3 (233-273)||(5230472-5230512)
chr3 (46-94)||(7851860-7851908)
chr3 (23-75)||(7852177-7852228)
chr3 (194-230)||(11381072-11381108)
chr3 (35-91)||(11813054-11813110)
chr3 (200-279)||(13956661-13956741)
chr3 (242-274)||(15551777-15551809)
chr3 (62-94)||(17137824-17137856)
chr3 (200-283)||(45859233-45859317)
chr3 (35-91)||(49230515-49230571)
chr3 (246-281)||(38813290-38813325)
chr3 (225-274)||(17391248-17391298)
chr3 (225-266)||(18968350-18968392)
chr3 (225-301)||(25106204-25106282)
chr3 (22-72)||(38166432-38166481)
chr3 (229-283)||(38378139-38378193)
chr3 (229-274)||(14182264-14182309)
chr3 (35-67)||(2451167-2451199)
chr3 (242-294)||(6817514-6817566)
chr3 (62-94)||(14060951-14060983)
chr3 (148-211)||(15861043-15861104)
chr3 (39-91)||(16819294-16819346)
chr3 (35-67)||(22273277-22273309)
chr3 (238-274)||(31416123-31416159)
chr3 (229-273)||(40041439-40041483)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-365)||(13821-14182)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (35-377)||(36892446-36892784)
chr2 (35-380)||(25877704-25878039)
chr2 (35-380)||(12638006-12638351)
chr2 (39-315)||(28972175-28972451)
chr2 (35-380)||(21276354-21276701)
chr2 (39-301)||(7319635-7319896)
chr2 (35-352)||(24966288-24966603)
chr2 (131-375)||(4450082-4450326)
chr2 (39-380)||(21139975-21140316)
chr2 (35-301)||(42180221-42180490)
chr2 (39-348)||(31925-32230)
chr2 (148-377)||(3801234-3801469)
chr2 (148-377)||(19888848-19889083)
chr2 (141-347)||(25600048-25600252)
chr2 (35-380)||(6877563-6877921)
chr2 (35-373)||(269276-269603)
chr2 (139-350)||(22691829-22692038)
chr2 (139-350)||(22696476-22696685)
chr2 (148-380)||(38706921-38707157)
chr2 (147-281)||(22654278-22654412)
chr2 (167-348)||(22581805-22581986)
chr2 (148-301)||(8886368-8886520)
chr2 (148-283)||(8941648-8941784)
chr2 (148-348)||(34822182-34822387)
chr2 (148-305)||(25210808-25210965)
chr2 (35-232)||(12643824-12644012)
chr2 (150-348)||(22273042-22273233)
chr2 (178-283)||(9654750-9654856)
chr2 (182-301)||(22137633-22137753)
chr2 (150-348)||(22282275-22282466)
chr2 (148-281)||(22861734-22861866)
chr2 (177-301)||(23806441-23806565)
chr2 (184-276)||(24296382-24296476)
chr2 (193-294)||(19812896-19812997)
chr2 (153-283)||(43644829-43644958)
chr2 (149-281)||(460770-460901)
chr2 (162-293)||(720608-720740)
chr2 (185-283)||(23823315-23823414)
chr2 (185-283)||(23825259-23825358)
chr2 (152-348)||(20629257-20629447)
chr2 (174-301)||(5076-5205)
chr2 (35-116)||(25600309-25600389)
chr2 (147-294)||(24089201-24089356)
chr2 (186-283)||(19655198-19655297)
chr2 (176-281)||(40642140-40642249)
chr2 (207-298)||(22254514-22254605)
chr2 (198-347)||(24828457-24828600)
chr2 (198-347)||(24832909-24833052)
chr2 (146-301)||(15631550-15631705)
chr2 (229-294)||(32738711-32738776)
chr2 (233-283)||(24868797-24868847)
chr2 (174-345)||(25303766-25303943)
chr2 (200-278)||(9782734-9782814)
chr2 (207-298)||(23779788-23779880)
chr2 (229-301)||(23837284-23837355)
chr2 (200-283)||(5890154-5890238)
chr2 (200-283)||(11233108-11233192)
chr2 (200-283)||(14908295-14908379)
chr2 (200-283)||(17398453-17398537)
chr2 (200-283)||(22514955-22515039)
chr2 (200-283)||(23772752-23772836)
chr2 (200-283)||(23818395-23818479)
chr2 (200-283)||(24687526-24687610)
chr2 (200-283)||(28777557-28777641)
chr2 (200-301)||(22692491-22692592)
chr2 (200-301)||(22697138-22697239)
chr2 (40-221)||(24573144-24573321)
chr2 (215-299)||(25132450-25132535)
chr2 (229-294)||(30994853-30994918)
chr2 (207-274)||(6092712-6092780)
chr2 (200-283)||(12726267-12726351)
chr2 (242-294)||(19435811-19435863)
chr2 (200-283)||(20013338-20013422)
chr2 (35-115)||(22691695-22691775)
chr2 (35-115)||(22696342-22696422)
chr2 (242-294)||(43640594-43640646)
chr2 (242-301)||(7509878-7509937)
chr2 (207-301)||(25255175-25255270)
chr2 (207-301)||(28032932-28033027)
chr2 (229-274)||(25593418-25593463)
chr2 (200-294)||(24272296-24272392)
chr2 (207-301)||(24343234-24343328)
chr2 (200-301)||(19657697-19657805)
chr2 (184-232)||(19670970-19671019)
chr2 (35-91)||(3800981-3801037)
chr2 (35-91)||(12643696-12643752)
chr2 (44-120)||(15631716-15631791)
chr2 (207-298)||(17202791-17202883)
chr2 (229-273)||(18533604-18533648)
chr2 (35-79)||(25211124-25211168)
chr2 (225-274)||(23614440-23614489)
chr2 (41-93)||(4449966-4450018)
chr2 (39-91)||(12637882-12637934)
chr2 (62-94)||(24089111-24089143)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (35-380)||(22407980-22408321)
chr1 (22-380)||(5676342-5676694)
chr1 (35-377)||(41217381-41217727)
chr1 (34-377)||(35052985-35053313)
chr1 (35-348)||(35524170-35524476)
chr1 (41-386)||(9786141-9786479)
chr1 (35-380)||(20252178-20252523)
chr1 (43-377)||(18505495-18505817)
chr1 (35-348)||(21716305-21716619)
chr1 (35-348)||(2422819-2423124)
chr1 (148-377)||(22352122-22352357)
chr1 (178-380)||(22080027-22080232)
chr1 (39-281)||(51658079-51658318)
chr1 (148-348)||(21857630-21857823)
chr1 (146-378)||(20895613-20895837)
chr1 (200-347)||(27331084-27331229)
chr1 (62-349)||(27672976-27673268)
chr1 (147-348)||(22837186-22837391)
chr1 (155-301)||(20956820-20956969)
chr1 (148-283)||(17146756-17146892)
chr1 (148-380)||(22364779-22365015)
chr1 (183-301)||(44036754-44036872)
chr1 (178-348)||(22837420-22837594)
chr1 (149-348)||(20443883-20444074)
chr1 (149-348)||(20529623-20529814)
chr1 (148-283)||(20929683-20929815)
chr1 (149-283)||(37846297-37846430)
chr1 (184-281)||(36358137-36358236)
chr1 (174-345)||(37235762-37235939)
chr1 (148-301)||(15863436-15863596)
chr1 (176-279)||(17607184-17607290)
chr1 (184-281)||(38035421-38035520)
chr1 (257-380)||(49965893-49966014)
chr1 (184-293)||(17021801-17021914)
chr1 (200-294)||(41213499-41213594)
chr1 (173-281)||(19601451-19601559)
chr1 (35-133)||(22250788-22250884)
chr1 (198-347)||(35935478-35935621)
chr1 (207-294)||(5770043-5770131)
chr1 (193-348)||(22226141-22226290)
chr1 (200-274)||(5472224-5472299)
chr1 (215-294)||(21042030-21042109)
chr1 (175-294)||(21193407-21193529)
chr1 (229-294)||(29217339-29217404)
chr1 (237-293)||(22148259-22148315)
chr1 (200-274)||(40555633-40555709)
chr1 (35-91)||(41217799-41217855)
chr1 (207-274)||(18164439-18164509)
chr1 (35-106)||(20895526-20895596)
chr1 (200-283)||(45049860-45049943)
chr1 (70-187)||(20589963-20590078)
chr1 (200-305)||(41392645-41392749)
chr1 (207-291)||(49999186-49999272)
chr1 (200-283)||(5074167-5074251)
chr1 (200-283)||(20827088-20827172)
chr1 (200-283)||(22034061-22034145)
chr1 (242-377)||(24498469-24498603)
chr1 (200-305)||(7642448-7642553)
chr1 (229-274)||(52397926-52397971)
chr1 (35-91)||(15863233-15863289)
chr1 (200-283)||(17003039-17003123)
chr1 (200-283)||(18602910-18602994)
chr1 (193-283)||(21651871-21651962)
chr1 (229-274)||(40438147-40438192)
chr1 (229-294)||(46144014-46144075)
chr1 (35-87)||(49966013-49966065)
chr1 (200-283)||(51450827-51450911)
chr1 (193-283)||(29137043-29137134)
chr1 (22-91)||(5676282-5676349)
chr1 (229-274)||(20191995-20192040)
chr1 (35-91)||(22352504-22352560)
chr1 (244-274)||(78389-78419)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (39-380)||(5684-6022)
[»] chr6 (96 HSPs)
chr6 (35-380)||(25646604-25646946)
chr6 (22-377)||(18775351-18775699)
chr6 (35-348)||(22428346-22428658)
chr6 (35-380)||(31626580-31626921)
chr6 (22-377)||(16104694-16105045)
chr6 (35-377)||(35017463-35017807)
chr6 (35-380)||(18843720-18844065)
chr6 (35-348)||(18128212-18128520)
chr6 (37-380)||(13016526-13016858)
chr6 (35-380)||(18578670-18579015)
chr6 (35-377)||(33316425-33316769)
chr6 (35-380)||(18004869-18005216)
chr6 (35-380)||(14628380-14628725)
chr6 (35-301)||(32896201-32896455)
chr6 (35-380)||(13622943-13623283)
chr6 (22-377)||(25745979-25746314)
chr6 (35-377)||(23975545-23975890)
chr6 (35-301)||(35011135-35011404)
chr6 (150-348)||(18421987-18422185)
chr6 (95-377)||(23151556-23151828)
chr6 (35-301)||(19627410-19627679)
chr6 (145-380)||(17787589-17787821)
chr6 (86-380)||(16827873-16828169)
chr6 (148-348)||(18740522-18740717)
chr6 (148-380)||(18835474-18835709)
chr6 (166-348)||(22866279-22866462)
chr6 (148-283)||(25173454-25173590)
chr6 (39-302)||(25369107-25369379)
chr6 (95-283)||(1553866-1554053)
chr6 (148-300)||(19985026-19985176)
chr6 (154-349)||(33322911-33323106)
chr6 (39-270)||(18397107-18397342)
chr6 (147-380)||(4988822-4989061)
chr6 (174-293)||(7829717-7829838)
chr6 (193-283)||(25917917-25918008)
chr6 (148-301)||(940904-941061)
chr6 (194-377)||(16235605-16235794)
chr6 (185-283)||(16889621-16889721)
chr6 (207-301)||(14150813-14150908)
chr6 (35-153)||(18825659-18825774)
chr6 (176-283)||(21621362-21621473)
chr6 (197-290)||(25649501-25649596)
chr6 (174-283)||(12310808-12310921)
chr6 (173-293)||(18383474-18383598)
chr6 (215-301)||(17085403-17085490)
chr6 (223-348)||(15080702-15080827)
chr6 (177-283)||(17344101-17344208)
chr6 (184-301)||(17790971-17791092)
chr6 (214-301)||(6092760-6092848)
chr6 (200-301)||(22846358-22846462)
chr6 (207-281)||(33540071-33540147)
chr6 (193-283)||(18088640-18088731)
chr6 (193-305)||(19608622-19608733)
chr6 (176-278)||(22364041-22364147)
chr6 (193-301)||(11214346-11214454)
chr6 (193-347)||(1659547-1659695)
chr6 (199-305)||(15860958-15861064)
chr6 (231-294)||(22595521-22595584)
chr6 (200-305)||(23987242-23987347)
chr6 (200-305)||(29871332-29871437)
chr6 (200-283)||(1651847-1651931)
chr6 (200-283)||(10487101-10487185)
chr6 (200-283)||(16229802-16229886)
chr6 (35-83)||(16238711-16238759)
chr6 (200-283)||(16378142-16378226)
chr6 (200-283)||(16385466-16385550)
chr6 (200-283)||(16645737-16645821)
chr6 (200-283)||(16651103-16651187)
chr6 (200-274)||(19852531-19852607)
chr6 (207-301)||(16301962-16302057)
chr6 (225-283)||(17375582-17375640)
chr6 (200-305)||(26087969-26088074)
chr6 (200-305)||(27655944-27656048)
chr6 (229-294)||(29162772-29162837)
chr6 (207-294)||(31469377-31469466)
chr6 (229-274)||(34965203-34965248)
chr6 (215-274)||(22467950-22468010)
chr6 (193-305)||(22227530-22227643)
chr6 (147-203)||(15738499-15738556)
chr6 (207-274)||(21929710-21929779)
chr6 (35-91)||(4989207-4989263)
chr6 (35-91)||(16827675-16827731)
chr6 (226-298)||(29603801-29603873)
chr6 (229-283)||(4174581-4174636)
chr6 (207-301)||(32278478-32278573)
chr6 (229-274)||(4230210-4230256)
chr6 (229-283)||(16131521-16131575)
chr6 (229-301)||(23219208-23219281)
chr6 (35-91)||(14628326-14628382)
chr6 (231-283)||(17858252-17858304)
chr6 (22-72)||(18825501-18825550)
chr6 (22-72)||(18843562-18843611)
chr6 (229-274)||(15006511-15006556)
chr6 (35-67)||(18422185-18422217)
chr6 (39-91)||(23975962-23976014)
chr6 (35-67)||(25173761-25173793)
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (34-380)||(21392273-21392613)
chr5 (22-356)||(21661399-21661728)
chr5 (35-377)||(28257626-28257958)
chr5 (1-380)||(4863394-4863771)
chr5 (35-377)||(10144-10488)
chr5 (35-386)||(25211802-25212153)
chr5 (35-386)||(25275954-25276305)
chr5 (35-377)||(11579762-11580101)
chr5 (35-380)||(10780124-10780471)
chr5 (35-380)||(19497770-19498117)
chr5 (35-348)||(24184957-24185266)
chr5 (35-380)||(17473713-17474056)
chr5 (35-377)||(43445720-43446064)
chr5 (35-377)||(1221650-1221989)
chr5 (35-380)||(22885053-22885398)
chr5 (35-380)||(9732604-9732946)
chr5 (35-301)||(34937483-34937752)
chr5 (200-377)||(20710616-20710791)
chr5 (22-348)||(27185509-27185822)
chr5 (35-350)||(11338608-11338931)
chr5 (148-377)||(11340436-11340671)
chr5 (39-377)||(23986180-23986508)
chr5 (148-377)||(18780163-18780398)
chr5 (166-348)||(19403686-19403867)
chr5 (148-374)||(35793273-35793505)
chr5 (148-348)||(24470430-24470626)
chr5 (144-373)||(29192781-29193016)
chr5 (147-301)||(7726836-7726993)
chr5 (39-283)||(23453120-23453361)
chr5 (39-283)||(23460364-23460605)
chr5 (39-283)||(23464625-23464866)
chr5 (148-283)||(22368602-22368738)
chr5 (148-283)||(25424600-25424736)
chr5 (62-224)||(1171309-1171468)
chr5 (148-301)||(25944678-25944837)
chr5 (174-283)||(37189918-37190030)
chr5 (148-298)||(111101-111258)
chr5 (148-308)||(16534304-16534463)
chr5 (175-283)||(21615266-21615377)
chr5 (173-301)||(13793375-13793508)
chr5 (95-213)||(17907853-17907970)
chr5 (184-293)||(23492156-23492273)
chr5 (184-281)||(32967971-32968071)
chr5 (229-294)||(6454952-6455017)
chr5 (194-294)||(28888134-28888242)
chr5 (35-91)||(10560-10616)
chr5 (200-283)||(20614830-20614914)
chr5 (176-279)||(21228186-21228293)
chr5 (152-241)||(23510211-23510299)
chr5 (229-294)||(3420692-3420757)
chr5 (83-283)||(11213478-11213676)
chr5 (35-91)||(11582272-11582328)
chr5 (200-283)||(21934136-21934220)
chr5 (200-283)||(21940306-21940390)
chr5 (200-283)||(23327170-23327254)
chr5 (200-283)||(24594718-24594802)
chr5 (200-283)||(25902302-25902386)
chr5 (200-283)||(35580472-35580556)
chr5 (200-283)||(37011140-37011224)
chr5 (200-283)||(37051202-37051286)
chr5 (193-283)||(7423818-7423909)
chr5 (205-283)||(21235388-21235467)
chr5 (207-347)||(4201951-4202084)
chr5 (230-283)||(16837618-16837671)
chr5 (229-274)||(19872184-19872229)
chr5 (229-294)||(24082361-24082426)
chr5 (207-274)||(26561623-26561692)
chr5 (207-297)||(32949318-32949410)
chr5 (242-301)||(17907727-17907786)
chr5 (200-305)||(21075466-21075570)
chr5 (35-91)||(22368349-22368405)
chr5 (208-283)||(27008229-27008305)
chr5 (35-90)||(1170407-1170462)
chr5 (207-301)||(7527358-7527453)
chr5 (329-386)||(111270-111328)
chr5 (243-281)||(5453181-5453219)
chr5 (26-91)||(19498188-19498252)
chr5 (329-377)||(23512875-23512924)
chr5 (242-283)||(24227816-24227857)
chr5 (35-91)||(110900-110955)
chr5 (35-91)||(1221522-1221578)
chr5 (151-211)||(21647196-21647255)
chr5 (35-91)||(25944474-25944530)
chr5 (35-91)||(43445592-43445648)
chr5 (242-273)||(3671689-3671720)
chr5 (229-272)||(11765583-11765626)
chr5 (37-67)||(29192581-29192611)
chr5 (35-64)||(11340895-11340924)
chr5 (35-84)||(16534617-16534666)
chr5 (229-274)||(23236268-23236313)
chr5 (207-274)||(29912314-29912383)
chr5 (39-91)||(9732504-9732556)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (35-377)||(37604-37942)
scaffold0102 (242-380)||(45841-45976)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (35-380)||(13560-13899)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (35-301)||(6900-7163)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (35-380)||(138492-138832)
scaffold0021 (35-380)||(76428-76767)
scaffold0021 (156-348)||(9747-9940)
scaffold0021 (174-282)||(19618-19729)
scaffold0021 (174-282)||(29194-29305)
scaffold0021 (39-108)||(10007-10076)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (111-386)||(26708-26982)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (35-380)||(256646-256984)
scaffold0011 (148-348)||(72247-72440)
scaffold0011 (148-348)||(125228-125421)
scaffold0011 (148-348)||(192646-192838)
scaffold0011 (148-348)||(76628-76821)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (35-373)||(28298-28632)
scaffold0008 (35-380)||(20716-21042)
scaffold0008 (148-348)||(130017-130209)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (31-374)||(68438-68781)
scaffold0031 (41-348)||(30185-30488)
scaffold0031 (200-294)||(99024-99120)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (34-380)||(7098-7444)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (35-380)||(12332-12678)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (35-380)||(26287-26631)
scaffold0138 (58-348)||(15116-15394)
scaffold0138 (184-301)||(24243-24363)
scaffold0138 (229-294)||(18876-18941)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (35-377)||(118-465)
scaffold0269 (35-315)||(2955-3237)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (35-304)||(236327-236593)
scaffold0009 (98-380)||(270163-270448)
scaffold0009 (331-386)||(236044-236099)
scaffold0009 (331-386)||(236269-236324)
scaffold0009 (22-89)||(236600-236666)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (35-375)||(113970-114307)
scaffold0022 (62-301)||(107826-108069)
scaffold0022 (174-301)||(106708-106838)
scaffold0022 (193-348)||(59286-59435)
scaffold0022 (206-283)||(130138-130215)
scaffold0022 (193-348)||(6999-7148)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (35-380)||(505-847)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (35-377)||(30882-31218)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (35-377)||(4650-4992)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (35-377)||(49490-49832)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (35-348)||(3950-4258)
scaffold0342 (35-301)||(2477-2746)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (22-375)||(4272-4613)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (35-380)||(1132-1464)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (131-380)||(3925-4171)
scaffold0673 (39-141)||(3797-3899)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (35-380)||(77434-77781)
scaffold0034 (70-118)||(35999-36047)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (35-299)||(27864-28133)
scaffold0116 (39-91)||(28131-28183)
scaffold0116 (34-94)||(28182-28242)
scaffold0116 (329-380)||(27770-27820)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (35-380)||(156195-156541)
scaffold0023 (152-380)||(86081-86313)
scaffold0023 (172-350)||(92123-92300)
scaffold0023 (200-283)||(11121-11205)
scaffold0023 (205-279)||(34552-34627)
scaffold0023 (242-301)||(53388-53447)
scaffold0023 (35-91)||(156067-156123)
scaffold0023 (242-301)||(58581-58640)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (35-315)||(30549-30832)
scaffold0049 (177-301)||(44343-44467)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (35-301)||(2825-3089)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (150-380)||(26590-26820)
scaffold0037 (22-302)||(66397-66674)
scaffold0037 (35-106)||(26502-26572)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (35-349)||(17602-17917)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (46-377)||(384-705)
[»] scaffold0195 (5 HSPs)
scaffold0195 (35-348)||(17404-17704)
scaffold0195 (35-231)||(19545-19734)
scaffold0195 (147-241)||(8466-8561)
scaffold0195 (147-241)||(13855-13950)
scaffold0195 (22-91)||(19806-19874)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (35-283)||(33331-33568)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (35-283)||(39276-39513)
scaffold0078 (193-283)||(36331-36422)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (147-348)||(144859-145060)
scaffold0014 (38-155)||(145231-145342)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (35-377)||(16607-16949)
scaffold0315 (316-377)||(20598-20660)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (43-281)||(56138-56370)
scaffold0051 (39-78)||(56369-56408)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (35-232)||(14837-15029)
scaffold0253 (148-293)||(3984-4141)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (35-315)||(90814-91119)
scaffold0028 (174-350)||(77884-78064)
scaffold0028 (229-301)||(70167-70239)
scaffold0028 (35-91)||(90686-90742)
scaffold0028 (35-91)||(128736-128792)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (22-251)||(75542-75759)
scaffold0001 (249-375)||(78251-78375)
scaffold0001 (316-365)||(79948-79997)
scaffold0001 (242-301)||(166982-167041)
scaffold0001 (242-301)||(166444-166503)
scaffold0001 (237-294)||(141148-141205)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (39-301)||(1570-1829)
scaffold0092 (242-380)||(13118-13255)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (35-380)||(7280-7619)
scaffold0622 (35-91)||(7691-7747)
scaffold0622 (22-91)||(7848-7916)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (35-227)||(21645-21834)
scaffold0077 (242-301)||(24604-24663)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (35-347)||(4533-4851)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (151-380)||(16213-16445)
scaffold0158 (69-301)||(22952-23187)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (173-348)||(7170-7346)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (35-298)||(29553-29818)
[»] scaffold0383 (5 HSPs)
scaffold0383 (148-380)||(164-400)
scaffold0383 (131-301)||(5251-5427)
scaffold0383 (35-91)||(5607-5663)
scaffold0383 (39-90)||(5480-5531)
scaffold0383 (35-91)||(647-703)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (148-377)||(15167-15402)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (180-348)||(8258-8427)
scaffold0190 (35-88)||(8503-8556)
[»] scaffold0396 (3 HSPs)
scaffold0396 (141-301)||(14075-14236)
scaffold0396 (35-141)||(13926-14031)
scaffold0396 (193-305)||(15641-15753)
[»] scaffold0130 (4 HSPs)
scaffold0130 (148-377)||(30957-31192)
scaffold0130 (95-192)||(12990-13085)
scaffold0130 (207-301)||(13116-13216)
scaffold0130 (38-67)||(31363-31392)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (39-278)||(3217-3453)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (174-349)||(6762-6937)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (35-380)||(2911-3248)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (39-305)||(25454-25713)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (148-377)||(376-611)
[»] scaffold0407 (5 HSPs)
scaffold0407 (146-377)||(45-268)
scaffold0407 (146-377)||(6509-6732)
scaffold0407 (35-106)||(6422-6492)
scaffold0407 (248-293)||(4227-4272)
scaffold0407 (248-293)||(10693-10738)
[»] scaffold0032 (7 HSPs)
scaffold0032 (152-348)||(53808-53997)
scaffold0032 (35-91)||(109909-109965)
scaffold0032 (200-294)||(106446-106541)
scaffold0032 (208-298)||(29340-29431)
scaffold0032 (228-290)||(121836-121898)
scaffold0032 (242-301)||(110244-110303)
scaffold0032 (237-283)||(101669-101715)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (148-380)||(640-876)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (148-283)||(7045-7178)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (35-301)||(9942-10210)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (147-292)||(7416-7562)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (35-188)||(94335-94485)
scaffold0044 (242-301)||(94179-94238)
scaffold0044 (200-305)||(67284-67390)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (148-283)||(37563-37697)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (148-283)||(19417-19553)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (147-315)||(2438-2608)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (148-348)||(1176-1368)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (35-348)||(249224-249517)
scaffold0012 (207-301)||(35663-35758)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (149-348)||(45-237)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (149-348)||(1342-1534)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (141-350)||(31647-31853)
scaffold0103 (41-108)||(31932-31999)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (148-347)||(27036-27241)
scaffold0026 (177-301)||(106195-106320)
scaffold0026 (200-283)||(66370-66451)
[»] scaffold0447 (5 HSPs)
scaffold0447 (131-301)||(2387-2563)
scaffold0447 (35-91)||(2743-2799)
scaffold0447 (35-91)||(2871-2927)
scaffold0447 (35-91)||(2999-3055)
scaffold0447 (39-90)||(2616-2667)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (86-301)||(40898-41105)
scaffold0132 (200-298)||(12018-12116)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (148-301)||(5133-5293)
scaffold0003 (148-283)||(217566-217699)
scaffold0003 (230-296)||(99372-99438)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (193-283)||(21303-21394)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (35-301)||(21170-21432)
scaffold0039 (35-91)||(21042-21098)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (182-278)||(5005-5102)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (167-293)||(2881-3008)
scaffold0409 (167-293)||(11136-11263)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (182-301)||(3515-3635)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (242-380)||(28416-28553)
scaffold0222 (338-380)||(28854-28897)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (174-283)||(5208-5319)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (205-294)||(9609-9699)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (148-348)||(12434-12626)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (176-293)||(51558-51679)
scaffold0025 (164-299)||(7951-8086)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (193-349)||(12478-12634)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (176-294)||(29349-29471)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (255-380)||(7310-7432)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (147-251)||(72093-72198)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (39-279)||(6042-6293)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (159-301)||(4037-4177)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (229-301)||(31510-31582)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (207-294)||(199210-199298)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (174-293)||(33723-33846)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (184-272)||(4274-4364)
scaffold0327 (229-294)||(6751-6816)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (207-301)||(7028-7122)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (207-282)||(1506-1583)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (217-294)||(834-911)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (148-283)||(5388-5521)
scaffold0266 (148-283)||(12990-13123)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (177-294)||(1926-2047)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (150-289)||(11857-11996)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (193-348)||(27982-28131)
scaffold0225 (193-348)||(14461-14610)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (184-272)||(78643-78734)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (193-283)||(51252-51342)
[»] scaffold0066 (4 HSPs)
scaffold0066 (97-213)||(44266-44381)
scaffold0066 (207-301)||(52315-52410)
scaffold0066 (98-213)||(52435-52549)
scaffold0066 (207-301)||(44146-44241)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (229-294)||(5975-6040)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (207-301)||(3653-3748)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (193-283)||(17074-17165)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (184-294)||(11682-11795)
scaffold0107 (200-283)||(29567-29651)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (35-91)||(15947-16003)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (174-294)||(25415-25539)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (193-283)||(15799-15890)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (207-291)||(25807-25892)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (207-274)||(3545-3614)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (229-294)||(25802-25867)
scaffold0004 (246-347)||(331054-331153)
scaffold0004 (200-294)||(84658-84754)
scaffold0004 (216-348)||(197976-198102)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (200-283)||(25119-25203)
scaffold0141 (200-281)||(20866-20948)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (242-294)||(7016-7068)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (200-283)||(37505-37589)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (242-301)||(5314-5373)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (215-301)||(16156-16243)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (207-301)||(67540-67635)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (231-274)||(104222-104265)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (200-305)||(25123-25228)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (193-281)||(9776-9865)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (207-294)||(822-911)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (207-298)||(7956-8048)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (226-294)||(1835-1903)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (200-283)||(3433-3517)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (207-301)||(75421-75516)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (207-348)||(41960-42094)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (205-301)||(17429-17527)
scaffold0162 (200-289)||(9953-10041)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (232-294)||(36144-36206)
[»] scaffold0725 (1 HSPs)
scaffold0725 (233-274)||(7324-7365)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (233-274)||(13254-13295)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (207-274)||(11586-11655)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (229-274)||(22999-23044)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (229-274)||(20387-20432)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (215-294)||(2882-2962)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (242-301)||(975-1034)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (204-301)||(411-508)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (207-283)||(17945-18022)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (233-274)||(19585-19626)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (200-283)||(55693-55778)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (184-224)||(118403-118444)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (207-274)||(1435-1503)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (234-274)||(45469-45509)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (200-251)||(113537-113589)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 142050 - 141703
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  142050 ttggttattgtgtatgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 141953  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141952 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 141855  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141854 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattgggatctttct 141755  T
Q  335 ccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141754 ccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 141703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 380
Target Start/End: Original strand, 15824189 - 15824529
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  15824189 tttggtgattatgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtat 15824286  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15824287 atg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccct 15824384  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||||    
T  15824385 agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagcttt 15824482  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15824483 ctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 15824529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 26071949 - 26072290
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  26071949 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtata 26072047  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-ca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26072048 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccaca 26072145  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  26072146 gtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-tttaatgcttgg-tggatatcgggagctttc 26072243  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26072244 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctttgatctaggcttcgt 26072290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 26095736 - 26096077
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  26095736 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtata 26095834  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-ca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26095835 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccaca 26095932  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  26095933 gtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-tttaatgcttgg-tggatatcgggagctttc 26096030  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26096031 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctttgatctaggcttcgt 26096077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 13867898 - 13868244
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13867898 ttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattgagattatgatataagtata 13867996  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13867997 ta--tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccta 13868094  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||| || ||||    
T  13868095 gtggatctgtgatggattgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttttgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggaaatcagga 13868192  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13868193 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctagacttcgt 13868244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Original strand, 12545619 - 12545959
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  12545619 ttggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attgttgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtat 12545717  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca 233  Q
    ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12545718 atgtataag--aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgtaatacttacccta 12545815  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  12545816 gtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatccgga 12545911  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12545912 gctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggc 12545959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 2192618 - 2192963
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  2192618 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 2192715  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2192716 ga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgtaatacttaccccag 2192813  T
Q  235 tggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    ||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||     
T  2192814 tggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatattgggag 2192911  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2192912 c-ttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 2192963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44863625 - 44863348
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  44863625 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 44863527  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44863526 ag--tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgtaatacttaccccca 44863429  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||    
T  44863428 gtggttttgacagcatacctgtctgtgtggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctcgttgagt-ttttgtgcttggt 44863348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12753366 - 12753017
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| |  |     
T  12753366 tgtgattggtgatt-ggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatg 12753268  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    ||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12753267 tgatataagtatt---atttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgta 12753171  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||    
T  12753170 atacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-ttttgtgctt-gatggat 12753073  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  12753072 atcaggagctttctccaatatcggtgttgtagagtctaggtggctctgatctaggc 12753017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 7286340 - 7286686
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  7286340 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 7286438  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7286439 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgtaatacttaccccta 7286536  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| | | || ||||||| |||||||  |||    
T  7286537 gtggatctgtgatggaccgcctaactatctgtatggatgggtagaagttgtgcagaattagttgtttggtgaat-tattgtgcttgg-tggatatcggga 7286634  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7286635 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 7286686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 380
Target Start/End: Original strand, 18305658 - 18305995
Alignment:
Q  40 gattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacat 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  |  |    
T  18305658 gattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtt-tggtgtaagtattga--t 18305753  T
Q  140 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggt 238  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18305754 atgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccctagtgga 18305850  T
Q  239 tttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    | ||      || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||    
T  18305851 tctgtgatggactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagcttt 18305948  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18305949 ctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 18305995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3893581 - 3893229
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||     
T  3893581 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttt 3893483  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgt----gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatga 217  Q
    |||| |||||||||| |||| |    | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893482 tgatgtaagtatatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatga 3893384  T
Q  218 tgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggtt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | |    
T  3893383 tgtaatacttacccctagtggttttgaccgtctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgtaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gat 3893288  T
Q  317 ggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3893287 ggatatcgggagctttctccgatatccgtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 3893229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7291089 - 7290746
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  7291089 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagtatt 7290992  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7290991 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 7290894  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||  |||| ||||||| |||||||   ||    
T  7290893 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttgttgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgaga 7290797  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7290796 gctttctccaatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 7290746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 369318 - 368981
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |     
T  369318 attgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtg-atgattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tg 369223  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttt 240  Q
    || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  369222 tgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccagtggatc 369123  T
Q  241 tg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  369122 tgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttct 369025  T
Q  335 ccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  369024 ccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 368981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 15952871 - 15953213
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  15952871 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gaatattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 15952966  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-cca 233  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15952967 ttgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttacctcca 15953064  T
Q  234 g------tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |      |||| | |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  15953065 gtggatctggtatggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 15953162  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15953163 gccttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 15953213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 301
Target Start/End: Original strand, 49049549 - 49049806
Alignment:
Q  43 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatg 142  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||||||| ||||| ||| | ||||||    ||    
T  49049549 tgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatggtatgaatatata----tg 49049644  T
Q  143 tgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttt 240  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49049645 tggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttt 49049744  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  49049745 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 49049806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47288158 - 47287950
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  47288158 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtata 47288060  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47288059 tg--tacgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 47287962  T
Q  234 gtggttttgacc 245  Q
    ||||||||||||    
T  47287961 gtggttttgacc 47287950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Original strand, 16480848 - 16481131
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  16480848 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 16480945  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16480946 ga--tgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 16481043  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggtt 316  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  16481044 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagatacttggtgagt-ttttgtgcttggtt 16481131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 348
Target Start/End: Original strand, 45455499 - 45455709
Alignment:
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45455499 atatatgaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttatccctagtg 45455598  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||| | ||  | |||||||  ||| |||||||    
T  45455599 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacagaagtagttgctctggtgagtcttttgtact--ggtggatatcgggagctttctc 45455696  T
Q  336 cgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||    
T  45455697 cgatatcggtgtt 45455709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15629182 - 15628921
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||| | |||||||| ||||| ||| | |||||| |    
T  15629182 tgattgtgcatgaataaatgtgagttgatgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatggtatgaatatatata 15629083  T
Q  139 tatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
    |    | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15629082 t----ggatattatgatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 15628987  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||    
T  15628986 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgtaggattagttgctctggtgagt 15628921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 14253083 - 14253422
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  14253083 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggtt-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 14253179  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14253180 ga--tttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 14253277  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  || ||| |||| |||||| | |||    
T  14253278 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtgtagtagcttggtgagttcttgctg-ttgg-tggatagtggga 14253375  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
     ||||||||| ||||||   |||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  14253376 gctttctccgctatcgggtcttagagtagagttggctctgatctagg 14253422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572182
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcc 16572082  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||| |||||    
T  16572083 tacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgatctggtgagtcctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtattggtgt 16572181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593480
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcc 16593580  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||| |||||    
T  16593579 tacctgtctctatggatgggtagacgttgtgaaggattagttgatctggtgagtcctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtattggtgt 16593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 112978 - 113291
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| | ||     
T  112978 tgtgattggtgatt-gataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggtt-attattgatgtgagatattgagttt- 113074  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| |||||||  |  ||||||| || ||||   |||||||| ||| ||||||   ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  113075 tgatgtaagtattga--tatgtgactactatt---gatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgta 113169  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||    
T  113170 atacttacccccagtggttttaaccgtctacctatctatatggatgggtagacgttgtgctggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gat 113263  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  113264 atcgggagctttctccgatatcggtgtt 113291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 283
Target Start/End: Original strand, 15762322 - 15762509
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt 194  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  15762322 gattattgatgtgagatattgaggttttgatgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgtt 15762419  T
Q  195 aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15762420 aactgttattttgattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15762509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 11582770 - 11582904
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11582770 attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 11582867  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582868 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 11582904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 13039044 - 13039237
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13039044 attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccg 13039141  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  13039142 cctacctgcctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtg 13039235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024560
Alignment:
Q  155 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggtt------ttgaccgcc 248  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      | |||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggatctgtgatggaccgcc 2024658  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    | ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  2024657 tgcctgtc--tctggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggaagctttctccggtatcggtgtt 2024562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 12249908 - 12250100
Alignment:
Q  185 tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249908 tattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 12250007  T
Q  284 gatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
      ||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  12250008 attagttgctccggtgagttctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtgttgtagagtctaggtggctctgatctaggc 12250100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3055049 - 3054901
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgccta 250  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3055049 ttattgatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgccta 3054951  T
Q  251 cctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3054950 cctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 3054901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Original strand, 1938452 - 1938693
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||   ||  |||||||     
T  1938452 ttggtgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgg-ttattgatgtgagatattggagtgc-gacgtaagtatt 1938549  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     | || |||     || |||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1938550 gaaatgtgtt----tttttattgattaaatgcatgatctt--aattgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttaccccta 1938643  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1938644 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcagg 1938693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209852
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aatagaattattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttatccccagtgattttaaccg 16209948  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||| || ||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16209947 cctacctgtctgtatggatgggtaaacgctgtgtaggagtag-tggttggtgag---tttttgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtg 16209854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Original strand, 32496381 - 32496514
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32496381 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttaactgctgtttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccg 32496478  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32496479 cctacctgtctgtatggatggatagacgttgtgcag 32496514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 122838 - 122706
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  122838 tattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcgtgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgattttaaccgcc 122741  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  122740 tacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcagg 122706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16416581 - 16416421
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  16416581 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 16416482  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16416481 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt 16416421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13376049 - 13375930
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13376049 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtattacttaccctagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 13375951  T
Q  273 cgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    || ||||||||  ||||||||    
T  13375950 cgctgtgcaggattagttgct 13375930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11285402 - 11285260
Alignment:
Q  167 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtttt------gaccgcctacctgtctg 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||      |||||||||||||||||    
T  11285402 atgatttttgaattgaattattcatgtttaactgttatgtggattatcatgatgtaatacttacccccagtggatttgtgatggaccgcctacctgtctg 11285303  T
Q  259 tatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  11285302 tatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt 11285260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 9058420 - 9058549
Alignment:
Q  167 atgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgg 263  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9058420 atgatgcttgaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttaccctagtg-ttttgaccgcctacctgtctgtatgg 9058518  T
Q  264 atgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9058519 atgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 9058549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16916017 - 16915896
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16916017 gaattgaattattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 16915918  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  16915917 acgttgtgcaggattagttgct 16915896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 15914224 - 15914354
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914224 tttgaattgttttattgatgtctaactgttatgtggattataatgatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggta 15914322  T
Q  271 gacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15914323 gacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 15914354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 18255663 - 18255788
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  18255663 aattgaattattcaagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgt 18255762  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||    
T  18255763 tgtgcaggactagtagcttggtgagt 18255788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13388356 - 13388232
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatggg 268  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13388356 ttgaattggtttattcatgtctaactgttcatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctacctgtctgtatggatggg 13388257  T
Q  269 tagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  13388256 tagacgttgtgcaggattagttgct 13388232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 10862754 - 10862849
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  10862754 ttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggtttcgactgcctacctgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctt 10862849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2435892 - 2435748
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  2435892 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 2435794  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||   ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2435793 tgagtctt---tgcttg---ggatatcaggagctttctccgatatcggtgtt 2435748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5617797 - 5617714
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5617797 ttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 5617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9609610 - 9609499
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9609610 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtag 9609511  T
Q  272 acgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||    
T  9609510 acgttgtgcagg 9609499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9837182 - 9837071
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9837182 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtag 9837083  T
Q  272 acgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||    
T  9837082 acgttgtgcagg 9837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 45453937 - 45454028
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgata 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  45453937 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattaggattatgata 45454028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 293
Target Start/End: Original strand, 17229913 - 17230034
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17229913 gaattgatttgttcatgcttaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgagtag 17230012  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||| ||||||||  ||||||||    
T  17230013 acgctgtgcaggattagttgct 17230034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13273154 - 13272975
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||| ||||| ||| | | ||||      
T  13273154 tgattgtgcatggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatggtatgaatgtata-- 13273057  T
Q  139 tatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
      |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  13273056 --tgtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgta 13272975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2024842 - 2024753
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgat---ggattattgatgtgaaatattggggttatgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2024842 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggttttgat 2024753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48345923 - 48345832
Alignment:
Q  205 tggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48345923 tggattatgattgatgtaatgcttacccccaatgattttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 48345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 18920963 - 18921028
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18920963 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 18921028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 13912975 - 13913059
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13912975 ttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 13913059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14939043 - 14938975
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14939043 gattatgattgatgtaaagcttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 14938975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15366636 - 15366568
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15366636 gattatgattgatgtaaagcttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 15366568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 47482781 - 47482876
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  47482781 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaactgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 47482876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Original strand, 16571839 - 16571921
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||    
T  16571839 ttggtgattgtgtatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16593823 - 16593741
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||    
T  16593823 ttggtgattgtgtatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31499564 - 31499506
Alignment:
Q  216 gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31499564 gatgtaaagcttaccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 31499506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10987908 - 10987808
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtct 303  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  10987908 tggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtct 10987810  T
Q  304 tt 305  Q
    ||    
T  10987809 tt 10987808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Original strand, 15518719 - 15518823
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag-tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  15518719 ttatctggattatgataatgtaatacttacccccggtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 15518817  T
Q  299 agtctt 304  Q
    ||||||    
T  15518818 agtctt 15518823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 34242981 - 34243070
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  34242981 gattatgattgatgtaatgtttaccccgagtggttttgactgcctacctgtttgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgctt 34243070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 9322896 - 9322992
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  9322896 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatcgatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 9322992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11514425 - 11514341
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  11514425 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 11514341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 12545565 - 12545621
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  12545565 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattg 12545621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13756880 - 13756796
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13756880 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 13756796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 15443419 - 15443503
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15443419 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15443503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 27103407 - 27103491
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27103407 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 27103491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 27110755 - 27110839
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27110755 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 27110839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27174918 - 27174834
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27174918 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 27174834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 38785499 - 38785583
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  38785499 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 38785583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 42060152 - 42060236
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  42060152 ttatctggattatgataatgtaatgcttaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 42060236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15687898 - 15687803
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  15687898 gattatgctgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctcggtgagt 15687803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 18981844 - 18981949
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  18981844 ttatctggattatgataatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 18981942  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  18981943 agtcttt 18981949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4482582 - 4482517
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  4482582 ccccagtgatttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 4482517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 20587504 - 20587549
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20587504 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacg 20587549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7821226 - 7821142
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  7821226 ttatctggactatgataatgtaatgcttatccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 7821142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7828537 - 7828453
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  7828537 ttatctggactatgataatgtaatgcttatccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 7828453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 26011053 - 26011137
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  26011053 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctgcttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 26011137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 30263984 - 30264064
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  30263984 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 30264064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3048035 - 3047980
Alignment:
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3048035 gcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatagtagcttggtgagt 3047980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 12249862 - 12249908
Alignment:
Q  38 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacat 84  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12249862 gtgaatgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 16370226 - 16370279
Alignment:
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16370226 cccagtgggtttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggagtgcagg 16370279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16917916 - 16917835
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacct 253  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16917916 gaattgaattattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacct 16917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Original strand, 25294139 - 25294243
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || || | |||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  25294139 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgccaacttgccggtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 25294237  T
Q  299 agtctt 304  Q
    ||||||    
T  25294238 agtctt 25294243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 3193897 - 3193943
Alignment:
Q  225 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3193897 cttaccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtag 3193943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 380
Target Start/End: Original strand, 6320817 - 6320908
Alignment:
Q  286 tagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| | ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  6320817 tagttgcttggtgagt-tcttgtgcttggtag-atatcgggagctttcttcgatatcggtgtttagaatt-agtcggctctgatctaggcttcgt 6320908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 301
Target Start/End: Original strand, 10002387 - 10002433
Alignment:
Q  255 tctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  10002387 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 10002433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 283
Target Start/End: Original strand, 16929846 - 16929880
Alignment:
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929846 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 16929880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 283
Target Start/End: Original strand, 16935229 - 16935263
Alignment:
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935229 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 16935263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25122527 - 25122430
Alignment:
Q  204 ttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| | || |||||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  25122527 ttggattatgttgatgtaatactcacccccagtggttt-gtccgcctgcttgcctgtatgggtaagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 25122430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 304
Target Start/End: Original strand, 48624221 - 48624318
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtctt 304  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  48624221 gattatgttgatgtaatgctcacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtctt 48624318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28388751 - 28388706
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28388751 ccccaggggttttgaccgcctacctgtttatatggatgggtagacg 28388706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4444601 - 4444521
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  4444601 tgatgtaaatcttacccctagtggttttgatcgcctacatgtgtgtatagatgggtagacgacgtgcaggattagttgctt 4444521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13319601 - 13319505
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  13319601 gattatgttgatgtaatactcacccccagtgatttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 13319505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4437200 - 4437141
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4437200 tgatgtaaatcttacccctagtgattttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagac 4437141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12114016 - 12113966
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12114016 agtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 12113966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 39294008 - 39294053
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39294008 ccccagtggttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggcagacg 39294053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44863350 - 44863313
Alignment:
Q  343 ggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863350 ggtgttgagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 44863313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 2192490 - 2192546
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  2192490 ttggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 2192546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13452500 - 13452456
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  13452500 ccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaattggtagac 13452456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13460634 - 13460598
Alignment:
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13460634 gttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagac 13460598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 16480720 - 16480776
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16480720 ttggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 16480776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 45460675 - 45461053
Alignment:
Q  1 catgagtcttacgttgagaactgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45460675 catgagtcttatgttgagaactgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattat 45460774  T
Q  101 tgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45460775 tgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 45460874  T
Q  201 tatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctac----ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  45460875 tatttggattattatgatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtctgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgctcg 45460974  T
Q  296 gtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    ||| || |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  45460975 gtgtgt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtgttgtagagtctaggtggctctgatctaggc 45461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 20813675 - 20814044
Alignment:
Q  1 catgagtcttacgttgagaactgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattat 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20813675 catgagtcttatgttgagaattgtgattggtgaat-ggtgtttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattat 20813773  T
Q  101 tgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20813774 tgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgtgtgaa---tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactat 20813870  T
Q  201 tatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||    
T  20813871 tatttggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacaggattaattgctcggtga 20813970  T
Q  300 gtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    || |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  20813971 gt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagagtctaggtggctctgatctaggc 20814044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 12838010 - 12838351
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  12838010 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtg-attattgatgtgagctattggggttttgatataagtata 12838108  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12838109 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 12838206  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  12838207 gtggttttaacggcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaaggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 12838304  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12838305 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 12838351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18167055 - 18166711
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  18167055 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 18166958  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18166957 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 18166860  T
Q  234 gtggtttt------gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |||      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  18166859 gtggatttgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 18166762  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18166761 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 18166711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 21961257 - 21961597
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||  |||||| |||||||     
T  21961257 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaagtatt 21961356  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt-acccca 233  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  21961357 gatatatg--aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaataattaacccta 21961454  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  21961455 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggaactttc 21961552  T
Q  334 tccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  21961553 tccggtatcggtgttatagagtctaggtggctctgatctaggctt 21961597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Original strand, 12901447 - 12901786
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  12901447 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggtta 12901545  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||||||||  |||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901546 tgatgtaagtatatatttat------------attgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 12901632  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  12901633 atacttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattag-tgcttggtgagt-tcttatgcttgg-tggat 12901729  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtt--tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    ||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12901730 atcgggagctttctccaatatcggtgtttatagagtttagttggctctgatctaggc 12901786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34393568 - 34393221
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  34393568 ttggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtat 34393470  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-cc 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34393469 atg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacctcc 34393372  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||    
T  34393371 agtggatctatgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggg 34393274  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
      |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34393273 ggctttctccaatatcagtgtttagtg-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 34393221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 7134322 - 7134668
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||     
T  7134322 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgggatattggggtt-tgatgtaattatt 7134419  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta--cccc 232  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  7134420 ga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccc 7134517  T
Q  233 agtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    |||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||    
T  7134518 agtggatatgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgg 7134615  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7134616 agctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 7134668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8372788 - 8372444
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  8372788 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 8372691  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8372690 ga--tgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 8372593  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  |||    
T  8372592 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttacgcttgg-tggatatccgga 8372495  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8372494 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 8372444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26678358 - 26678013
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  26678358 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggt-gaatattgatgtgacatattggggtt-tgatgtaag--ta 26678263  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26678262 ttgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 26678165  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  |||    
T  26678164 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgcgcttgg-tggatatccgga 26678067  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26678066 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 26678013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Original strand, 53909567 - 53909814
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggt-tatgatataagtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  53909567 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtgtttgatgtaagtat 53909665  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53909666 atg--tatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttaccccc 53909763  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53909764 agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcagg 53909814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33738645 - 33738319
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33738645 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 33738547  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    |                 |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  33738546 tg----------------tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactacccacag 33738463  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  33738462 tggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatattgggagctttat 33738365  T
Q  335 ccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33738364 ctgatatcggtgtttggtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 33738319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 30236237 - 30236493
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  30236237 ttggtgactgtgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtata 30236336  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    || ||||           ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30236337 tatatat-----------tattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 30236425  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  30236426 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgcttggtgagt 30236493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 380
Target Start/End: Original strand, 15274488 - 15274829
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |     
T  15274488 attgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tg 15274583  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg-- 237  Q
    || |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  15274584 tgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggat 15274683  T
Q  238 ----ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
        | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  15274684 ctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttc 15274781  T
Q  334 tccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15274782 tccgatatcgacgtttagatgtttagttggctctgatctaggcttcgt 15274829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44054341 - 44054104
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  44054341 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtata 44054242  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||            || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44054241 tatttat------------atcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 44054154  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44054153 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 44054104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Original strand, 53706645 - 53706949
Alignment:
Q  30 gtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataa 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||    
T  53706645 gtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaa 53706742  T
Q  130 gtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 229  Q
    |||   |  |||||     ||| |||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53706743 gtactaatttatgt-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta- 53706836  T
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatc 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |    
T  53706837 cccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagc 53706930  T
Q  330 tttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||    
T  53706931 tttctccgatatcggtgtt 53706949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 380
Target Start/End: Original strand, 8874272 - 8874503
Alignment:
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgac 244  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  8874272 atatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatatttactcccattggttttaac 8874371  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcgg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  8874372 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcgg 8874467  T
Q  345 tgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8874468 tgtttagtgtttagtcgactctgatctaggcttcgt 8874503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44345248 - 44345015
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  44345248 tttggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtat 44345150  T
Q  134 atac------atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt 227  Q
    |||       ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44345149 atatgtatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgtaatactt 44345050  T
Q  228 accccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatg 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44345049 accccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatg 44345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 19699425 - 19699694
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||     
T  19699425 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtatt 19699522  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19699523 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 19699620  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19699621 atggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 19699694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 19710010 - 19710279
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||     
T  19710010 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtatt 19710107  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19710108 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 19710205  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19710206 atggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 19710279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 377
Target Start/End: Original strand, 16366450 - 16366776
Alignment:
Q  38 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||| ||     
T  16366450 gtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatg-attattgatgtgagatattagggtg-tgatgtaagtat-ta- 16366545  T
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
    || |||||   ||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16366546 atgtgtga---ttattattgatcaaacgcatgatgtta-aattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtg 16366641  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctcc 336  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | ||||||| | || ||||||||    
T  16366642 gttttatccgcctgcctgtctgtatggacgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcatgagctttctcc 16366737  T
Q  337 gatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16366738 gatatcgatgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 16366776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246017
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 18246151  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  18246150 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 18246053  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18246052 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggc 18246017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 354
Target Start/End: Original strand, 13752082 - 13752291
Alignment:
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt 239  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13752082 tgtgaatcttattattgatcaaatgcatgaagttcgg-ttgaattattcatgttaa-tgttatgtgaattatgctgatgtaatacttacccccagtggtt 13752179  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgat 339  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  13752180 ttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgat 13752276  T
Q  340 atcggtgtttagagt 354  Q
    |||||||| ||||||    
T  13752277 atcggtgtatagagt 13752291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19998589 - 19998354
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  19998589 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 19998490  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  19998489 ggaccgcctgcctatctgtatggatgagtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 19998392  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19998391 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 19998354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 22356436 - 22356707
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||  ||    
T  22356436 ttggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggt-gattattgatgtgagatattggggtcttgatgcaag--ta 22356532  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   ||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22356533 ttgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 22356630  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    ||||      | | |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  22356631 gtggatctgttatggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtcttt 22356707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 54120125 - 54120345
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54120125 attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaaatatccatgttaattgttaattggattatgttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccg 54120222  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||   || ||| ||||||||||||||    
T  54120223 tctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggaatag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgagagcttcctccgatatcggtg 54120316  T
Q  347 tttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  54120317 tt--gagtttagtcggctctgatttaggctt 54120345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16520874 - 16520635
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaa-ttgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg--- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||       
T  16520874 attattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgtaatacttacccccagtggatctgtta 16520775  T
Q  243 ---accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgat 339  Q
       || |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||  ||||||||||    
T  16520774 tgaactgtatgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttatgcttgg-aggatatcaggagttttctccgat 16520677  T
Q  340 atcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16520676 atcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 16520635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 377
Target Start/End: Original strand, 23272036 - 23272204
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtctttt 306  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  23272036 gattatgttgatgtaatactcaccccagtggttttgaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagggttagttgctcggtaagt-tttt 23272134  T
Q  307 ctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23272135 gtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcagtgtttagagtttagttggctctgatctaggctt 23272204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9293784 - 9293548
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||        
T  9293784 attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaaatatccatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttaccccaagtggatctgtaat 9293685  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  9293684 ggaccacctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgata 9293587  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9293586 ttggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 9293548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47355683 - 47355445
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||         
T  47355683 tgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatg-attattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtattgt-- 47355587  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||   ||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  47355586 tatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttatt-ggattatgataatgtaatgcttacccccagtgg 47355491  T
Q  238 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||  ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  47355490 tttaaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 47355445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 109817 - 109684
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  109817 ttattattgatcagatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgctatttgtattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgc 109720  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109719 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 109684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10642446 - 10642210
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  10642446 attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgtgat 10642347  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  10642346 ggaccacctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgata 10642249  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10642248 tcggtgtttaga-attaatcggctctgatctaggcttcgt 10642210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27959436 - 27959288
Alignment:
Q  155 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacct 253  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  27959436 ttgattaagtacatgatatttgaattaaattattcatgcttaactgttatgtggattatggtgatgtaatacttacccaaatggttttgactgcctacct 27959337  T
Q  254 gtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  27959336 gtctgtatggatgagtagacgttgtgcaagattagttgctctggtgagt 27959288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Original strand, 41167723 - 41167843
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41167723 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattgtgatgatgtaatacttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 41167822  T
Q  273 cgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  41167823 cgttgtgcaggattagttgct 41167843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13244775 - 13244542
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||       ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||     
T  13244775 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatg-attattgatgtgagatattgaggtg-tgatgtaagtat- 13244686  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    || || |||||   |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13244685 ta-atgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 13244592  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13244591 atggttttaaccacctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgcagg 13244542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15211587 - 15211427
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt------t 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |      |    
T  15211587 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgtgct 15211488  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15211487 ggaccgcctgcttatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt 15211427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 13811380 - 13811589
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| | |||||||| ||||| ||| | | ||||      
T  13811380 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatggtatgaatttata-- 13811477  T
Q  139 tatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
      | || ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13811478 --tttggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtg 13811575  T
Q  237 gttttgaccgccta 250  Q
    ||||||| ||||||    
T  13811576 gttttgatcgccta 13811589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14867749 - 14867622
Alignment:
Q  168 tgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggat 265  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14867749 tgatatttgaattgaattatttatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttt-gaccgtctacctgtctgtatggat 14867651  T
Q  266 gggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14867650 gggtagacgttgtgcaggattagttgctt 14867622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 18496169 - 18496397
Alignment:
Q  51 aataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatatt 150  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| | ||||| ||| | |||||     ||||| ||||    
T  18496169 aataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatt----tgtga-tatt 18496263  T
Q  151 attattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    ||||| | || || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18496264 attatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgtgatacttacccctagtggttttgaccgcc 18496363  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18496364 tacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcag 18496397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 301
Target Start/End: Original strand, 34197988 - 34198108
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34197988 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccgcagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 34198087  T
Q  282 gggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||  |||||||| ||||||||    
T  34198088 ggattagttgctctggtgagt 34198108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 347
Target Start/End: Original strand, 5684701 - 5684930
Alignment:
Q  112 attggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggatta 211  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5684701 attggggataggatataagtat-ta-atatgggagtattagtgttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggatta 5684798  T
Q  212 tgatgatgtaatacttacccc-agtggttt-tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctg 309  Q
    |||| || |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||   ||| ||    
T  5684799 tgataatataatgcttacccctagtggtttctaaccgcctacttgtctgtatggatgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgag---tttatg 5684894  T
Q  310 cttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  5684895 cttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgt 5684930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42707074 - 42706943
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42707074 ttgaattgaattattcatgcttaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgactatctgtctgtatggatgggt 42706975  T
Q  270 agacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42706974 agacgttgtgcaggagtagttgcttggtgagt 42706943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 380
Target Start/End: Original strand, 17150228 - 17150413
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  17150228 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatttgtatggatgagtagacgttgtgcaggtttagatgc 17150327  T
Q  293 ttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17150328 ttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcaggagctttctccaatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 17150413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 18294664 - 18294755
Alignment:
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18294664 atatgagaatattattattgatcaagtagatgatatttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 18294755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 380
Target Start/End: Original strand, 55378676 - 55378919
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-c 229  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| |    
T  55378676 tatatatatatatggatattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagtta-ttggattatgtttatgtaatacttacc 55378774  T
Q  230 cccagtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatatt 323  Q
    |||||||| |      | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||     
T  55378775 cccagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagatgcttggtgag--ttttatgcttgg-tggatatc 55378871  T
Q  324 aggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||         ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  55378872 ggga---------gatatcggtgtttagtgtgtagtcggctctgatctaggcttcgt 55378919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37474689 - 37474567
Alignment:
Q  255 tctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  37474689 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgatatcggtgtttaga-a 37474593  T
Q  355 ttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37474592 ttagtcggctctgatctaggcttcgt 37474567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 301
Target Start/End: Original strand, 43283236 - 43283382
Alignment:
Q  164 tacatgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt------ttgaccgcctacctgt 255  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |      | ||||||||||||||    
T  43283236 tacatgctatttgaattgaattattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtagatctgtgatggaccgcctacctgt 43283335  T
Q  256 ctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  43283336 ctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgctctggtgagt 43283382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 283
Target Start/End: Original strand, 15853114 - 15853204
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15853114 taactgttatgtggattatgatgatataatacttacccccagtggttttgaccacatacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 15853204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 41258155 - 41258264
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41258155 aattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtaaac 41258254  T
Q  274 gttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||    
T  41258255 gttgtgcagg 41258264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 19824284 - 19824392
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19824284 aattgatttattcacgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatctccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagaag 19824383  T
Q  275 ttgtgcagg 283  Q
     ||||||||    
T  19824384 ctgtgcagg 19824392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 7187777 - 7187859
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  7187777 tgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgattgg 7187859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 293
Target Start/End: Original strand, 37958862 - 37958972
Alignment:
Q  185 tattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37958862 tattcatgtctatctgctatgtggattatgatgatgtaatacttacctccggtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgttcag 37958961  T
Q  283 ggatagttgct 293  Q
    |  ||||||||    
T  37958962 gattagttgct 37958972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Original strand, 12246044 - 12246147
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12246044 ttgaagtgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 12246143  T
Q  270 agac 273  Q
    ||||    
T  12246144 agac 12246147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 7966437 - 7966515
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7966437 gattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 7966515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38763086 - 38763021
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  38763086 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgctt 38763021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 14503377 - 14503472
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14503377 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtagcttggtgagt 14503472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Original strand, 41919091 - 41919159
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  41919091 tgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcagg 41919159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 50223994 - 50224070
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50223994 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 50224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26337779 - 26337700
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26337779 tggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 26337700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 15288885 - 15288971
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  15288885 tgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtattggtgagtagacgttgtgcagg 15288971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 15296052 - 15296138
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15296052 tgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15296138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 15676809 - 15676903
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  15676809 gattatgttgatgtaatgctcaccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctcggtgagt 15676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393616
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 34393616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9793629 - 9793537
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  9793629 gattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaagactagtagcttggtg 9793537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 13448877 - 13448965
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13448877 gattatgattgatgtaaagcttaccctattgattttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 13448965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16329781 - 16329865
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16329781 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccacagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16329865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 141
Target Start/End: Original strand, 55378550 - 55378652
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  55378550 tgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaagtatatata 55378649  T
Q  139 tat 141  Q
    |||    
T  55378650 tat 55378652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8043321 - 8043244
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8043321 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 8043244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14950317 - 14950213
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  14950317 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtaaacgttgtgcaggagtag-tgctcggtga 14950219  T
Q  300 gtcttt 305  Q
    ||||||    
T  14950218 gtcttt 14950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10486970 - 10486890
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  10486970 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 10486890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33240708 - 33240570
Alignment:
Q  164 tacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtat 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33240708 tacatgatatttgaattga-ttattcatgcttatctgttatatg-attatgttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtat 33240611  T
Q  262 -ggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     || || ||||||||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  33240610 gggttgagtagacgttatgcatgagtagttgctcggtgagt 33240570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5407458 - 5407413
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5407458 ccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgagtagacg 5407413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12732509 - 12732432
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||    
T  12732509 gattatgattgatgtgaaacttaccccagtgattttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacggagtgcagg 12732432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 13050029 - 13050106
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||| || ||||||    
T  13050029 gattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacattatgcagg 13050106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14994509 - 14994397
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| || |||||||| || ||||||||| ||| ||  ||| ||    
T  14994509 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacctctagtggttttaaccgtctacttgcctgtatgggtgagtagacgttctgctggagtag-tg 14994411  T
Q  292 cttggtgagtcttt 305  Q
    ||||||||||||||    
T  14994410 cttggtgagtcttt 14994397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18275121 - 18275056
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  18275121 ccccagtggttttgaccgcttaccagtctgtatgtatgggtagacaacgtgcagggatatttgctt 18275056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 10239269 - 10239345
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10239269 ttatgtggattatgattgttgtaaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacg 10239345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 12136163 - 12136211
Alignment:
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12136163 tggtttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 12136211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18167159 - 18167103
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18167159 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattg 18167103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 47470169 - 47470247
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc---agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47470169 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccctagtggttttgaccacctacttgtctgtatggatgggtagacg 47470247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30457769 - 30457719
Alignment:
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30457769 ctttttccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 30457719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 17213732 - 17213798
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||   |||||||  ||||||||||    
T  17213732 ccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatggatagacagagtgcaggattagttgcttg 17213798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 13751915 - 13751988
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtga 108  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||    
T  13751915 ttggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgattaattgatgtga 13751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19557660 - 19557607
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgg 267  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19557660 tgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtcagtatggatgg 19557607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19998977 - 19998913
Alignment:
Q  26 attggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  19998977 attggtgatt-ggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 19998913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24237201 - 24237148
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  24237201 ccccagttgttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacgtggtgcag 24237148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16521077 - 16521021
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  16521077 ttggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattg 16521021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19998842 - 19998786
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  19998842 ttggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattg 19998786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 32462397 - 32462493
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  32462397 gattatgttgatgtaatactcacctccagtgatttttaaccgcctacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 32462493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7848720 - 7848535
Alignment:
Q  157 gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgt 255  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| | || | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |      
T  7848720 gatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgtttaatgctttt--gtttatgatgatgtaatacttacccccagtgg-ttcgtccgcctacttac 7848626  T
Q  256 ctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttag 351  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||   ||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  7848625 ctgtacgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgag---tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccggtatcggtttttag 7848535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 281
Target Start/End: Original strand, 13814725 - 13814759
Alignment:
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13814725 cctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 13814759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Original strand, 17378030 - 17378100
Alignment:
Q  206 ggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17378030 ggattatgattgatgtgaaacttacccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatcaatgggtagacg 17378100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 22356230 - 22356279
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22356230 tgtgattggtgatt-ggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 22356279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22736795 - 22736718
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| | || |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22736795 gattatgttgatgtaatactcaccctcaatggttttaaccgcctgcttgcctgtatgggtaagtagacgttgtgcagg 22736718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Original strand, 53909837 - 53909883
Alignment:
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53909837 ctttcttcgatatcggtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 53909883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8372912 - 8372860
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  8372912 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 8372860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 293
Target Start/End: Original strand, 15116188 - 15116228
Alignment:
Q  253 tgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15116188 tgtctgtatggatgtgtagacgttgtgcaggattagttgct 15116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26678482 - 26678430
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26678482 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 26678430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37605476 - 37605123
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  37605476 tgtgattgatgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgaaatattggggtt- 37605380  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37605379 tgatgtaagtatata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgta 37605282  T
Q  222 atacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggata 321  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  37605281 ataattaccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgctt-gatggata 37605183  T
Q  322 ttaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtg 381  Q
    | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37605182 tcagaagctttctccgatatcggtgcttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgtg 37605123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Original strand, 20655748 - 20656098
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| | |    
T  20655748 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatca 20655846  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20655847 tgatataagtata--catatgtggatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgta 20655944  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20655945 atacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagtcttttgtgcttgg-tggat 20656043  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20656044 atcaggagctttctccggtatcggtgttatagagtttaggtggctctgatctagg 20656098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 41 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25120920 - 25120586
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  25120920 attgtgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attatttatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatg--ta 25120825  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt-accccagtggtt 239  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25120824 tgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaaccccagtggtt 25120725  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  25120724 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgat 25120627  T
Q  340 atcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25120626 atcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 25120586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 57 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 41244107 - 41243789
Alignment:
Q  57 tgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattatt 156  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||||||||    
T  41244107 tgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatatg--tatgagaatattattatt 41244012  T
Q  157 gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt-accccagtggttttgaccgcctacctgt 255  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41244011 gatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaacccaagtggttttaaccgcctacctgt 41243912  T
Q  256 ctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||    
T  41243911 ctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcatgagctttctccgatatcggtgtttaatgtt 41243814  T
Q  356 tagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  41243813 tagtcggctctgatctaggcttcgt 41243789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 24108477 - 24108828
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  24108477 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgacatattggagttttgatgtaagtata 24108575  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24108576 t--atatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 24108671  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  24108672 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 24108768  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24108769 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgtggtgtc 24108828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 13664562 - 13664908
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  13664562 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 13664657  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13664658 ttgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 13664757  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  | || ||||||| |||||||   ||    
T  13664758 gtggatctgttatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttggtgag--tattgtgcttgg-tggatatcgaga 13664854  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13664855 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgctctaggcttcgt 13664908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 13723837 - 13724183
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  13723837 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 13723932  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13723933 ttgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 13724032  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  | || ||||||| |||||||   ||    
T  13724033 gtggatctgttatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttggtgag--tattgtgcttgg-tggatatcgaga 13724129  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13724130 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgctctaggcttcgt 13724183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 379
Target Start/End: Original strand, 19994887 - 19995233
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgat------at 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||      ||    
T  19994887 tttggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagttattggggttttgatgtatatat 19994985  T
Q  128 aagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt 227  Q
    |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19994986 atatatatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgtaatactt 19995085  T
Q  228 acccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||    
T  19995086 accccaagtggatgtaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt-tgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggg 19995180  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcg 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19995181 agctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcg 19995233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 22909354 - 22909699
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| || |||| |||||||     
T  22909354 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatttgagatattgggatt-tgatgtaagtatt 22909451  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22909452 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttaccccca 22909549  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  22909550 gtggatctgttatggaccgtctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgtaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 22909647  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22909648 gctttctccgatatcgttgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 22909699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 24719335 - 24719678
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||     
T  24719335 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgcaagtatt 24719432  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-- 232  Q
     |  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24719433 ga--tatgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccctc 24719527  T
Q  233 agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||    
T  24719528 agtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggg 24719625  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24719626 agctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 24719678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 378
Target Start/End: Original strand, 22323237 - 22323569
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||| |||| ||     
T  22323237 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaat-attgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagcatt 22323334  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
        |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  22323335 gt--tatgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttattttgtttatgatgatgtaatacttaccccca 22323428  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  22323429 gtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagagtag-tgcttggtga--cttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 22323524  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttc 378  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22323525 tccaatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttc 22323569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20480078 - 20479739
Alignment:
Q  37 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 136  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  20480078 ggtgattatgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatata 20479980  T
Q  137 c----atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
         ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20479979 tgtatatatgagaatatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgtaatacttacccc 20479881  T
Q  233 -agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctt 331  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  | |  ||    
T  20479880 tagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggtagttt 20479785  T
Q  332 tctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20479784 tctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggctt 20479739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 270127 - 269793
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||     
T  270127 ttggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatg-attattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtatt 270030  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
     |  | |||||||||||||   |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270029 ga--tgtgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgttata-ttgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 269936  T
Q  235 tggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    ||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||     
T  269935 tggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggag 269838  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  269837 ctttccccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctagg 269793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 380
Target Start/End: Original strand, 16043071 - 16043409
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     ||    
T  16043071 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtattgt--ta 16043167  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16043168 tgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccgagtggat 16043265  T
Q  240 tt------gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  16043266 ttgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttcttgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 16043363  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16043364 ttagatattggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 16043409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 380
Target Start/End: Original strand, 22008371 - 22008711
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |      
T  22008371 tgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga-- 22008466  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggt 238  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||     
T  22008467 tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgtaatattacccccagtgga 22008566  T
Q  239 tttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22008567 tctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagatgttgcgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcaggagcttt 22008664  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22008665 ctccgatatcggtatttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 22008711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 41508939 - 41509210
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  41508939 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtg-attattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtat 41509037  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-c 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41509038 atg--tatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccctc 41509135  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41509136 agtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt 41509210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 645793 - 646128
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||     
T  645793 ttggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatg-attattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtatt 645890  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | |||||||||||||   |||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  645891 ga--tgtgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgttata-ttgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 645984  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  645985 gtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 646082  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  646083 gctttccccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctagg 646128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 831528 - 831863
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||     
T  831528 ttggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatg-attattgatgtgagatatttgggtt-tgatgtaagtatt 831625  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-ca 233  Q
     |  | |||||||||||||   |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  831626 ga--tgtgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgttata-ttgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccnca 831719  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  831720 gtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 831817  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  831818 gctttccccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctagg 831863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 380
Target Start/End: Original strand, 16041395 - 16041733
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     ||    
T  16041395 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtattgt--ta 16041491  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  16041492 tgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccaagtggat 16041589  T
Q  240 ------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
          | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  16041590 atgtaatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttcttgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 16041687  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16041688 ttagatattggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 16041733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16416722 - 16416376
Alignment:
Q  37 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 136  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16416722 ggtgattgtgtgtgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt-attgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatata 16416624  T
Q  137 c----atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
         |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16416623 tgtatatatttgaatatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgtaatacttacccc 16416525  T
Q  233 -agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctt 331  Q
     || ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||   || ||||||||  |||||  ||| |||    
T  16416524 cagaggttttagctgtctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtagt-gcttggtgagt---ttgtgcttggt--gatatcgggagctt 16416431  T
Q  332 tctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16416430 tctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgttatgtc 16416376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18610609 - 18610340
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||     
T  18610609 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtatt 18610512  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18610511 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 18610414  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  18610413 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 18610340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23509249 - 23508904
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||     
T  23509249 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtg-atgattgatgtgcgatattggggtt-tgatgtaagtatt 23509152  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |  | ||||||||||||||| ||| |  | |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23509151 ga--tgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 23509054  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   ||    
T  23509053 gtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgaga 23508956  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23508955 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 23508904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776588
Alignment:
Q  98 tattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatc 6776399  T
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagtt 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  6776400 tgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagat 6776499  T
Q  291 gcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6776500 gcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatattgggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 6776588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 3433646 - 3433881
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  3433646 attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 3433745  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  3433746 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 3433843  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3433844 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 3433881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 23631101 - 23631337
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||      |||    
T  23631101 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgtttt 23631200  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  23631201 ggatcgcctgcctatttgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttctgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 23631298  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23631299 tcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 23631337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17343635 - 17343319
Alignment:
Q  59 tgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattga 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||||    |  |||  || || |||||||||||||||    
T  17343635 tgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggcg-attattgatgtgggatattggggtt-tgat----gagtattgatgtgggaatattattattga 17343542  T
Q  159 tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt------ttgaccgcctac 251  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |      | |||||||| |    
T  17343541 tcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgtaatggaccgcctgc 17343442  T
Q  252 ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttag 351  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||   | || ||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  17343441 ctatctgtatggatgggtagacgttgtgca-ggttagatgcttggtga--atattgtgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggtgtttag 17343346  T
Q  352 a-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  17343345 atgtttagtcggctctgatctaggctt 17343319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28543238 - 28543024
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28543238 tatatatatatgggaatgttatt-tggatcaagtacatgatgttt-aattgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 28543141  T
Q  231 -ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatc 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |    
T  28543140 tccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggatttgttgtttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagc 28543043  T
Q  330 tttctccgatatcggtgtt 348  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  28543042 tatcttcgatatcggtgtt 28543024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28836052 - 28835817
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  28836052 attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 28835953  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  28835952 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 28835855  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28835854 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 28835817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 43375421 - 43375557
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43375421 attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 43375520  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43375521 cctacctgtctgtatggatggatagacgttgtgcagg 43375557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38532038 - 38531799
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggatta-ttgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattatt-gat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| ||    | ||||| ||||| |||    
T  38532038 attgatgattgttcatgacacatgtgattggtg-attacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat----ggatattcttatttgat 38531944  T
Q  160 caagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtct 257  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38531943 taagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatct 38531844  T
Q  258 gtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||    
T  38531843 gtatggatgggtagacgatgtgcatgattagttgctctggtgagt 38531799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21695965 - 21695835
Alignment:
Q  154 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacc 252  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21695965 attgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacc 21695866  T
Q  253 tgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21695865 tgtctgtatgaatgggtagacgctgtgcagg 21695835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 292
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448719
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgacc 245  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctcaatggttttgatc 39448672  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc 292  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  39448673 gcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgc 39448719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29758624 - 29758436
Alignment:
Q  153 tattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctac 251  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29758624 tattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctac 29758527  T
Q  252 ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  29758526 ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatccggagctttctccgatatcggtgtt 29758436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21679488 - 21679305
Alignment:
Q  166 catgatgtttgaattgaattattcatgttaactg-ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgg 263  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21679488 catgatatttgaattgaactattcatgataaattattatatggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatgg 21679390  T
Q  264 atgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||| ||||||||||    
T  21679389 atgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttgtgcttgg-tggatgtcaggagttttctccggtatcggtgtt 21679305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Original strand, 17731210 - 17731470
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||| ||||||   ||||  | | |    |||||    
T  17731210 tgattgtgtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattgaaattatagtgtga----ataca 17731305  T
Q  139 tatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
    | ||||| | ||||||| | || || |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17731306 tttgtgatt-ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtg 17731404  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17731405 gttttgaccgactacctatctgtatggatgtgtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 17731470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 301
Target Start/End: Original strand, 22737759 - 22737916
Alignment:
Q  147 tattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga 243  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22737759 tattattatttgattaagtgcatgatatttgaattgaactattcatgtttaactgttatgtagattatgatgatgtaatacttacccctagtgattttga 22737858  T
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22737859 ccgcctacctgtctgtatgg-tgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 22737916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 24387523 - 24387657
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  24387523 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttatctgctatttggattatgataatgtaataattacccccagtggttttaaccg 24387620  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24387621 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 24387657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17283599 - 17283500
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17283599 gaattgaattattcatgattaactgttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagac 17283500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 21192535 - 21192644
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21192535 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtag 21192634  T
Q  272 acgttgtgca 281  Q
    ||||||||||    
T  21192635 acgttgtgca 21192644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 21199962 - 21200070
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21199962 ttgaattgttttatccatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatcctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 21200061  T
Q  273 cgttgtgca 281  Q
    || ||||||    
T  21200062 cgatgtgca 21200070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Original strand, 16204138 - 16204302
Alignment:
Q  179 ttgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttg 277  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  16204138 ttgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagaagctg 16204237  T
Q  278 tgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||  ||| |||||||||||   ||| || |||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  16204238 tgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgtttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 16204302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 293
Target Start/End: Original strand, 23229114 - 23229223
Alignment:
Q  186 attcatgttaa-ctgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23229114 attcatgttaaacttttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtgtgtatggatgggtagacgctgtgcagg 23229213  T
Q  284 gatagttgct 293  Q
      ||||||||    
T  23229214 attagttgct 23229223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 227
Target Start/End: Original strand, 18768536 - 18768698
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatca 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |  || |||| | |||||||  ||||| ||| ||||||||    | || |||||||||||||  |    
T  18768536 attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtatata----tttggatattattattgagta 18768631  T
Q  162 agtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18768632 agtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatactt 18768698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5851833 - 5851745
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5851833 gattatgattgatgtaatgcttaccccagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgacgtgcagggatagttgctt 5851745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Original strand, 23154456 - 23154543
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23154456 tgatgtaatgcttatccctagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt 23154543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29296201 - 29296114
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29296201 tgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgcttggtgagt 29296114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23835595 - 23835471
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggg 268  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23835595 tttgaattggtttattcatgtctaactatttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctatctgtatggatggg 23835496  T
Q  269 tagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||    
T  23835495 tagacgctgtgcaggattagttgct 23835471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 37655448 - 37655560
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgt-tatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37655448 ttgaattgatttattcatgtctaactgtctatgtgggttatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgaccgccaacctgtctgtatggatgggt 37655547  T
Q  270 agacgttgtgcag 282  Q
    |||||||||||||    
T  37655548 agacgttgtgcag 37655560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15931691 - 15931569
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  15931691 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctatatggatcagtag 15931592  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  15931591 acgttgtgcaggattagttgctt 15931569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24547485 - 24547342
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  24547485 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 24547387  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24547386 tgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 24547342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 24930938 - 24931095
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  24930938 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattgaaatattcatgttatctactatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 24931035  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24931036 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattag-tgcttggtgagt 24931095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 18263274 - 18263339
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18263274 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 18263339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17500156 - 17500087
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  17500156 ccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttggtg 17500087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26009799 - 26009676
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26009799 gaattgatttattcatgtttaactatttatttagattatgattgatgtaatgcttagcccctagtggttttgactgcctacctgtctctatggatgggta 26009700  T
Q  271 gacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
     ||||||||||||  |||||||||    
T  26009699 aacgttgtgcaggattagttgctt 26009676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 22090301 - 22090405
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||    
T  22090301 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagt--cttggtg 22090398  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  22090399 agtcttt 22090405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 21846348 - 21846453
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  21846348 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 21846446  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  21846447 agtcttt 21846453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 21853753 - 21853858
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  21853753 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 21853851  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  21853852 agtcttt 21853858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 273059 - 273143
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  273059 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 273143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 642790 - 642706
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  642790 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 642706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 828596 - 828512
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  828596 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 828512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5236495 - 5236411
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5236495 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 5236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 24663103 - 24663187
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24663103 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 24663187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43683954 - 43683870
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  43683954 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 43683870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 18769992 - 18770051
Alignment:
Q  221 aatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18769992 aatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgtgtagacgctgtg 18770051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 21496168 - 21496263
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21496168 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtttgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 21496263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Original strand, 21233875 - 21233933
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctg-tctgtatggatgggtaga 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21233875 tgatgtaaaacttaccccagtggttttgaccgcctacctgttttgtatggatgggtaga 21233933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22884778 - 22884684
Alignment:
Q  208 attatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  22884778 attatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtaagggtgagtagacgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 22884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 17148093 - 17148193
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtct 303  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  17148093 tggattatgataatgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtct 17148191  T
Q  304 tt 305  Q
    ||    
T  17148192 tt 17148193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24266306 - 24266241
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  24266306 ccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggatagacgaagtgcagggttagatgctt 24266241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33170597 - 33170512
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33170597 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacgccaagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 33170512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11542290 - 11542242
Alignment:
Q  225 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11542290 cttaccccagtggtttcgaccgcctacctgtctctatggatgggtagac 11542242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16676182 - 16676266
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16676182 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtagttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16676266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 16874791 - 16874867
Alignment:
Q  208 attatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16874791 attatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16874867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20708101 - 20708057
Alignment:
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20708101 cccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20708057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 23118678 - 23118774
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||    
T  23118678 ttatgtggattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctacttgtccgtatggatgagtagacgaagtgcaggattagttgctt 23118774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Original strand, 31196395 - 31196459
Alignment:
Q  168 tgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31196395 tgatatttgaattgaattattcatgtttaacgtttatgtggattatgatgatgtaatacttaccc 31196459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 278
Target Start/End: Original strand, 33612857 - 33612920
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
    ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33612857 tgatgtaatgctaacctaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggacagacgttgt 33612920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28543352 - 28543270
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggg 117  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||    
T  28543352 ttggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 347
Target Start/End: Original strand, 701433 - 701573
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||  ||||  || ||||    
T  701433 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagt--ctcggtg 701530  T
Q  299 agtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||   ||||||   ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  701531 agtctt---tgcttg---ggatattgggagcttcctccgatatcggtgt 701573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 24554434 - 24554499
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  24554434 ccccagtggttttaaccgcttacctttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 24554499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 225020 - 225104
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  225020 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcagg 225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 738643 - 738727
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  738643 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcagg 738727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 862538 - 862622
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  862538 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgtctacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcagg 862622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11600363 - 11600319
Alignment:
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11600363 cccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 11600319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 15320917 - 15321000
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15320917 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtg-ttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15321000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 15501286 - 15501369
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15501286 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtg-ttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15501369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25293825 - 25293774
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25293825 gaccgcctacctgtctgtatg-atgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 25293774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25755814 - 25755763
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25755814 gaccgcctacctgtctgtatg-atgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 25755763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7468601 - 7468562
Alignment:
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7468601 tggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 7468562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 267
Target Start/End: Original strand, 22499162 - 22499200
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgg 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22499162 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgg 22499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24237331 - 24237258
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatag-ttgcttggtgagt 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||    
T  24237331 ccccaatggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgcttggtgagt 24237258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 283
Target Start/End: Original strand, 45561575 - 45561616
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45561575 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 45561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 3433393 - 3433449
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||| ||||    
T  3433393 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattg 3433449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 13664434 - 13664490
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13664434 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 13664490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 13723709 - 13723765
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13723709 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 13723765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24906277 - 24906189
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  24906277 tgttatttggattctgattgatgtaaatcttacccccagtggtttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcagg 24906189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 283
Target Start/End: Original strand, 19333910 - 19333948
Alignment:
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19333910 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 19333948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22884073 - 22884033
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22884073 agtggttttgactgcctacctgtttgtatgaatgggtagac 22884033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23509373 - 23509321
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  23509373 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 23509321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 28836255 - 28836223
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28836255 ttggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgat 28836223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 60059 - 59709
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||  ||    
T  60059 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaata 59961  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    ||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59960 tgatataagtatt---atttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 59864  T
Q  222 atacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  59863 atacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgctt-gatggat 59765  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  59764 atcgggagctttctccgatatcggtg-ttagagtttagtcggctctgatctaggctt 59709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 145)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 50113809 - 50114151
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| | || |||||||     
T  50113809 ttggtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtatt 50113908  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50113909 ga---atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 50114005  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  50114006 gtggttttgactgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 50114104  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50114105 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 50114151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17099095 - 17098757
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  17099095 ttggtgattgtgtgtgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 17098997  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  17098996 tt--tatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttttcccta 17098899  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  17098898 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggataattgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 17098800  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggct 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17098799 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggct 17098757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 380
Target Start/End: Original strand, 319292 - 319643
Alignment:
Q  25 gattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  319292 gattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttga 319390  T
Q  125 tataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaata 224  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  319391 tgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaata 319490  T
Q  225 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatatta 324  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||      
T  319491 cttaccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgagcaggagtag-tgcttggtgagtcttttgtgct--ggtggatatcg 319587  T
Q  325 ggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  319588 ggagctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 319643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 6148541 - 6148888
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  6148541 ttggtgattgtgtgtgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatg 6148639  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6148640 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 6148737  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgag----tcttttctgcttggttggatattaggatc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||| ||||||| |||||||  ||| |    
T  6148738 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctcggtgagttttttttttgtgcttgg-tggatatcgggagc 6148836  T
Q  330 tttctccgat-atcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6148837 tttctccgataatcagtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 6148888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 386
Target Start/End: Original strand, 12351527 - 12351874
Alignment:
Q  36 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattatt-gatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||| ||| || |||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||     
T  12351527 tggtgattgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtg-attatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtatt 12351625  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
     |  ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12351626 ga--tatgtgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccctag 12351723  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  12351724 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtccagggatagtttcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatattgggagctttct 12351822  T
Q  335 ccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12351823 ctgatatcggtgtttagagtttagtcagctctgatataggcttcgtggtgtc 12351874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11812982 - 11812635
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11812982 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 11812885  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11812884 aa--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 11812787  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |||    
T  11812786 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgagtagacgttgtgcagaattagatgcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcggga 11812689  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11812688 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctagacttcgt 11812635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38166395 - 38166079
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  38166395 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggagttttgatgtaagtata 38166297  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta--cccc 232  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38166296 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccc 38166199  T
Q  233 agtggtttt------gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| |||      |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||  ||    
T  38166198 agtggatttgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgtgtagacgttgtgcaggactagatgcttgatgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcggg 38166101  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  38166100 agctttctccgatataggtgtt 38166079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14287508 - 14287194
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||  | ||| ||||||||||    
T  14287508 ttggtgattttgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtata 14287409  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14287408 tatatatgtgaacgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccta 14287309  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||| || |    
T  14287308 gtggttttgaccgcctacctgtctttatggatgggtagactttgtgcaggattagttgctctggtgagttctttgtgcttgg-tggatatcgggagctat 14287210  T
Q  333 ctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||  ||||||||||    
T  14287209 ctcctgtatcggtgtt 14287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 47786554 - 47786861
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||  | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  47786554 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtata 47786653  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786654 ta--tatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgtaatactaaccccca 47786749  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||| |||| || ||    
T  47786750 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcaggagctatc 47786847  T
Q  334 tccgatatcggtgt 347  Q
    |||| |||||||||    
T  47786848 tccggtatcggtgt 47786861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19944986 - 19944634
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  19944986 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 19944889  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19944888 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 19944791  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  19944790 gtggatatgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 19944694  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  19944693 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggatctgatctaggcttcgtggtgtc 19944634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35122101 - 35121764
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||||| || ||||||||||||     
T  35122101 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatt 35122002  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |  |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35122001 t--atatgtaaa---tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtattacttaccccaa 35121907  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||    
T  35121906 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgagtagttgctctggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagcttt 35121808  T
Q  333 ctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  35121807 ctccaatatcggtgttgtagagtctaggtggctctgatctaggc 35121764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 22145968 - 22146304
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||||   ||| || ||||     
T  22145968 ttggtgattgcatatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtg-attattgatgttagatattggggtg--gatgtatgtatt 22146064  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22146065 ga--tatgtgaatatt---attgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttatcccca 22146159  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  22146160 gtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaaaagtagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 22146258  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22146259 tccgatatcggtg-ttagagtttagttggctctgatctaggcttcgt 22146304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30204877 - 30204614
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  30204877 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 30204780  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-ccca 233  Q
    |   |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30204779 tg--tatgagaacattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgtaatacttactccca 30204682  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  30204681 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgcttgatgagt 30204614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30141165 - 30140822
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  30141165 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagtatt 30141068  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-ccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30141067 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacaccca 30140970  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||  |||| ||||||| |||||||   ||    
T  30140969 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagatgttgtgcaggtttagatgcttgttgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgaga 30140873  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30140872 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 30140822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 11199232 - 11199544
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||    
T  11199232 ttggtgattgtgcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtata 11199331  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11199332 ta--tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccca 11199429  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||||  ||| || |    
T  11199430 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgctcttgtgagttctttgtgcttgg-tggatatcgggagctat 11199528  T
Q  333 ctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11199529 ctccggtatcggtgtt 11199544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17936637 - 17936288
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg-gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17936637 ttggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt--tgagattattgatgtgagatattggggtt-tgatataagtat 17936541  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
    ||   |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17936540 atg--tatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccc 17936443  T
Q  233 -agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattag 325  Q
     ||||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| ||    
T  17936442 cagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgctcggtgagtttttggtgcttgg-tggatatcag 17936344  T
Q  326 gatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17936343 gagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 17936288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7851861 - 7851551
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||      
T  7851861 tgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggttgtcatataagtatata-- 7851765  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7851764 tatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 7851665  T
Q  238 tt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctt 331  Q
     |      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||    
T  7851664 atctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcattattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctt 7851567  T
Q  332 tctccgatatcggtgt 347  Q
    | |||| |||||||||    
T  7851566 tttccggtatcggtgt 7851551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16819222 - 16818879
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  16819222 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaat-attgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 16819125  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16819124 ga--tgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 16819029  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  | |    
T  16819028 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgaa 16818931  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  16818930 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctaatctaggcttcgt 16818879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14296912 - 14296575
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  14296912 ttggtgattgtgcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtata 14296813  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14296812 ta--tatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtta-aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaacacttaccccca 14296716  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  | | |||||    
T  14296715 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgctcggtgagt-ttttatgcttgg-tggatatcggaagctttc 14296618  T
Q  334 tccgatatcggtg-tttagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||  |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  14296617 tccagtatcggtgttttagagtctaggtggctctgatctaggc 14296575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14302539 - 14302202
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  14302539 ttggtgattgtgcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtata 14302440  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14302439 ta--tatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtta-aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaacacttaccccca 14302343  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  | | |||||    
T  14302342 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgctcggtgagt-ttttatgcttgg-tggatatcggaagctttc 14302245  T
Q  334 tccgatatcggtg-tttagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||  |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  14302244 tccagtatcggtgttttagagtctaggtggctctgatctaggc 14302202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 377
Target Start/End: Original strand, 19572517 - 19572845
Alignment:
Q  36 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatat 135  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |    
T  19572517 tggtgattgtgaatgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagtat-t 19572613  T
Q  136 acatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccag 234  Q
    | || |||||   ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19572614 a-atgtgtga---ttattattgatcaaacacatgatgtta-aattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacctccag 19572708  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | |||||||  ||| ||||||    
T  19572709 tggttttatccgtctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcgggagctttct 19572804  T
Q  335 ccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19572805 ccgatatcggtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 19572845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13816058 - 13815701
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  ||||    
T  13816058 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgacgtgagatattggagttttgatatatatata 13815960  T
Q  135 tacatatgt------------------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatg 216  Q
    || |||| |                  |||||| |||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13815959 tatatatatatatatatatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatg 13815860  T
Q  217 atgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||   ||| ||||||||    
T  13815859 atgtaatacttacccccagaagttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt 13815764  T
Q  316 tggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
      |||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13815763 --gatatcgggagctttctccaatatcagtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 13815701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 353
Target Start/End: Original strand, 14523098 - 14523410
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtt-atgatataagtatatac 137  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||   ||| |  | ||| |||| |||| ||     
T  14523098 tgattgtgcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctgaatctttgagaatgatggtatatgtattta- 14523196  T
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14523197 -tacgtgaatattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 14523295  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctcc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| || |||||    
T  14523296 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctcc 14523393  T
Q  337 gatatcggtgtttagag 353  Q
    | |||||||||||||||    
T  14523394 ggtatcggtgtttagag 14523410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 131 - 375
Target Start/End: Original strand, 53900375 - 53900617
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53900375 tatatatatgtgtgaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatgt-aactgttgtttggattatgatgatgtaatacttacc 53900473  T
Q  231 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| || | ||    
T  53900474 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcagaagct 53900571  T
Q  331 ttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    || |||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  53900572 ttatccggtatcggtgttatagagtctaggtggctctgatctaggc 53900617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18738155 - 18737892
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18738155 ttggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaag-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 18738058  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-cca 233  Q
    |   |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  18738057 tg--tatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatggttacctccg 18737960  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  18737959 gtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagaagtagtagcttggtgagt 18737892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12796905 - 12796596
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  12796905 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 12796810  T
Q  135 tacatatgtg-aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    |  || || | ||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  12796809 ttgatgtgggaaattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatataatacttaccccc 12796710  T
Q  233 agtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    |||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||   ||||||  ||    
T  12796709 agtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttg---ggatatcggg 12796614  T
Q  327 atctttctccgatatcgg 344  Q
    | ||||||||||||||||    
T  12796613 agctttctccgatatcgg 12796596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 281
Target Start/End: Original strand, 51160154 - 51160403
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||     
T  51160154 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattgaggtt-tgatgtaagtatt 51160251  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  51160252 ga--tttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccaa 51160349  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||| |      | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  51160350 gtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagatgttgtgca 51160403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18908751 - 18908516
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  18908751 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 18908652  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  18908651 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 18908554  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18908553 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 18908516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22273106 - 22272871
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  22273106 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 22273007  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  22273006 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 22272909  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22272908 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 22272871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 17536834 - 17537006
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-- 228  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  17536834 tatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 17536933  T
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17536934 ccccagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgcttggtgagt 17537006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 315
Target Start/End: Original strand, 11062941 - 11063113
Alignment:
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11062941 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggtt 11063040  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  11063041 ttgaccg----tctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagctgctctggtgagttctttgtgcttggt 11063113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654101
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgac 244  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 39654138  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39654137 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 39654101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40937997 - 40937814
Alignment:
Q  166 catgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgga 264  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40937997 catgatatttgaattgagctattcatgttaattattatatggattattatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatgga 40937898  T
Q  265 tgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40937897 tgggtagacgttgtgtaggattagttgctctggtgagtcttttgtgctt-gttggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 40937814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19230387 - 19230195
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  19230387 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccac 19230290  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19230289 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgt 19230196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061172
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgtt-gaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccg 14061137  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14061138 actacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 14061172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 19262838 - 19263032
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19262838 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 19262935  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||  |||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19262936 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 19263031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 293
Target Start/End: Original strand, 12563338 - 12563471
Alignment:
Q  161 aagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgt 259  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12563338 aagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgtaatacttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgt 12563437  T
Q  260 atggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  12563438 atggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 12563471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17137773 - 17137625
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgac 244  Q
    |||||| |||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17137773 tattatcattgactaagtatgtgatatttgaattgaattattcatggttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 17137674  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17137673 cgcctacctgcctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 17137625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23490840 - 23490647
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgc 247  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23490840 attactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatactcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttaccctagtggttttaaccgc 23490741  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  23490740 ctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 23490648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15516000 - 15515851
Alignment:
Q  147 tattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgac 244  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15516000 tattattatttgattaagtaaatgatatttgaattgatttattcatgtttaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttaccgtagtggttttgcc 15515901  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15515900 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 15515851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33340107 - 33339872
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttg---- 242  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||        
T  33340107 attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgataactgttatt-ggattatgataatgtaatacttacctccagtggatatgtgat 33340011  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  33340010 gaacctcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttgatgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgata 33339913  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33339912 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 33339872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 55443682 - 55443812
Alignment:
Q  154 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacc 252  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55443682 attgattaagtatatgaaatttgaattgaatcattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacc 55443781  T
Q  253 tgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  55443782 tgtctgtatggatgggtaaacgctgtgcagg 55443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8630224 - 8629905
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8630224 ttggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggag-attatgaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 8630127  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
    |   |||||| ||||| |||||||||||               |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8630126 tg--tatgtggatattgttattgatcaa---------------attgaaatatccatgattaactgttatttggattatgatgatgtaatatttaccccc 8630044  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||| || || | |||||||  ||| ||||    
T  8630043 agcggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgtagtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtg-tttgatggatatcgggagcttt 8629948  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  8629947 cttcgatatcggtgtt--gagtttactcggctttgatctaggctt 8629905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10736890 - 10736701
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgccta 250  Q
    |||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  10736890 ttattggtcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccaccta 10736793  T
Q  251 cctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  10736792 tctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcagtgtt 10736701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15548870 - 15548745
Alignment:
Q  179 ttgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15548870 ttgaattattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 15548771  T
Q  277 gtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  15548770 gtgcatgattagttgctctggtgagt 15548745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2048366 - 2048200
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2048366 aattgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaacctcctacttgtctgtatggatgggtagacgt 2048267  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2048266 tgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 2048200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 283
Target Start/End: Original strand, 11884026 - 11884147
Alignment:
Q  162 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgta 260  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11884026 agtacatgatatttgaattgatttattcatgttaactgttatgtggattatgatcatataatacttacccctagtgg-tttgaccgcctacctgtctgta 11884124  T
Q  261 tggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  11884125 tggatgggtagacgctgtgcagg 11884147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 301
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958385
Alignment:
Q  82 catgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggt-tatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaatt 180  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17958169 catgtgattggtg-attattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtat-ta-atatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttacttt 17958265  T
Q  181 gaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||    
T  17958266 gaaatatccatgttaactgttatt--gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatg 17958363  T
Q  280 cagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  17958364 catgaatagtagcttggtgagt 17958385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25057107 - 25056950
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25057107 attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 25057008  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  25057007 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtcttt 25056950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45581170 - 45581037
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  45581170 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatatttacccccaatggttttaaccgc 45581073  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581072 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 45581037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25769606 - 25769460
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgacc 245  Q
    |||||| || ||| |||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25769606 tattatcatcgattaagtatgtgatatttgaatttaatcattcatgcttaaccgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccc-agtggttttgacc 25769508  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  25769507 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 25769460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Original strand, 16183750 - 16183957
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||    
T  16183750 tttggtgattgtctgtgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtaagatattggggttttgatatatatat 16183848  T
Q  134 atacatatgt----------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaat 223  Q
    ||| |||| |          |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183849 atatatatatatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgtaat 16183948  T
Q  224 acttacccc 232  Q
    |||||||||    
T  16183949 acttacccc 16183957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 301
Target Start/End: Original strand, 54045621 - 54045792
Alignment:
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54045621 atatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 54045720  T
Q  237 gttttg-------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    | | ||        ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  54045721 gatatgtgatggacccgtctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttggtgagt 54045792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2045613 - 2045471
Alignment:
Q  201 tatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  2045613 tatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtga 2045515  T
Q  300 gtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2045514 g---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 2045471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Original strand, 11330803 - 11330914
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11330803 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatagttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 11330902  T
Q  282 gggatagttgct 293  Q
    ||  ||||||||    
T  11330903 ggattagttgct 11330914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17203005 - 17202884
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17203005 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtag 17202906  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  17202905 acgttgtgcaggattagttgct 17202884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 293
Target Start/End: Original strand, 18008944 - 18009043
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18008944 taactgctatgtggattatgatgatgtaatacttaccttagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 18009043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38527842 - 38527714
Alignment:
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  38527842 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagtcttttgtgctt-gatggatatcagaagctttctccgatatcagt 38527745  T
Q  346 gtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38527744 g-ttagagtttagtcggctctgatctaggctt 38527714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12020290 - 12020160
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12020290 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtag 12020191  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  12020190 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 12020160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15874543 - 15874434
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15874543 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccaatggttt-gaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcag 15874445  T
Q  283 ggatagttgct 293  Q
    |  ||||||||    
T  15874444 gattagttgct 15874434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 2451370 - 2451506
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  2451370 attattaatgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatctggattaagataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccg 2451469  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  2451470 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 2451506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14695748 - 14695625
Alignment:
Q  255 tctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-g 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  14695748 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatattgggagc-ttctccgatatcggtgtttagatg 14695652  T
Q  354 tttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14695651 tttagtcggctctgatctaggcttcgt 14695625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 11062779 - 11062872
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  11062779 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggatcatgatata 11062872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 15940299 - 15940424
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15940299 aattgaattattcaagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgt 15940398  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||   ||| |||||||||||    
T  15940399 tgtgcaggacgagtagcttggtgagt 15940424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 377
Target Start/End: Original strand, 18905608 - 18905782
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18905608 tgttatttagattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctatttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttgg 18905706  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||   ||| ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18905707 tgag---tttgtgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 18905782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34558234 - 34558112
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgttaa-ctgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34558234 gaattgatttattcatgttaaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcccacctttctgtatggatgggtag 34558135  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||| |  |||||||||    
T  34558134 acgttgtgcatgattagttgctt 34558112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54686647 - 54686529
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg- 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||     
T  54686647 gattattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatga 54686550  T
Q  193 ttaactgttatttggattatg 213  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  54686549 gtaactgttatttggattatg 54686529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 294
Target Start/End: Original strand, 4164092 - 4164171
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  4164092 tgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaaggttagttgctt 4164171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 6230520 - 6230585
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  6230520 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 6230585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 14846495 - 14846607
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||    
T  14846495 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tg 14846593  T
Q  292 cttggtgagtcttt 305  Q
    || |||||||||||    
T  14846594 ctcggtgagtcttt 14846607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 9304724 - 9304841
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-t 193  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  9304724 gattattgatgtgagatattgaggttttgatgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgat 9304821  T
Q  194 taactgttatttggattatg 213  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  9304822 taactattatttggattatg 9304841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 347
Target Start/End: Original strand, 12490645 - 12490808
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggga 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  12490645 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccacctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaggat 12490744  T
Q  286 tagttgct-tggtgag-tcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  12490745 tagttgctctggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctacctccgatatcggtgt 12490808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7852023 - 7851968
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgatt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852023 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 12266346 - 12266437
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12266346 ttaattgttatctggattatgataatgtaatacttacacccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 12266437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49230318 - 49230251
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49230318 attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattgtgat 49230251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 23082060 - 23082203
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  23082060 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcatacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 23082158  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  23082159 tgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 23082203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48419991 - 48419898
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48419991 taactgttttgtggattatgatgatgtaatacttaccccaatggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 48419898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 4147554 - 4147619
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4147554 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 4147619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 14819683 - 14819772
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  14819683 gattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctt 14819772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41659948 - 41659863
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41659948 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 41659863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11813241 - 11813185
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11813241 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattg 11813185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 377
Target Start/End: Original strand, 15861110 - 15861234
Alignment:
Q  243 accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||   ||| |||    | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15861110 accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttagtgag---tttgtgc----tcggatatcgggagctttctccgatatc 15861201  T
Q  343 ggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15861202 ggtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 15861234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54686504 - 54686338
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||   |    
T  54686504 gattatgatgatgtaatactcacccctagtggtttt-accggctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagttcct 54686406  T
Q  306 tctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
      || |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  54686405 gttgattgg-tggatagtaggagctttctccactatcgggtcttagagtatagtcggctctgatctagg 54686338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 8270260 - 8270364
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||    
T  8270260 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagt--cttggtg 8270357  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  8270358 agtcttt 8270364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 17320435 - 17320490
Alignment:
Q  228 accccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17320435 accccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 17320490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44227719 - 44227619
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtct 303  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  44227719 tggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtct 44227621  T
Q  304 tt 305  Q
    ||    
T  44227620 tt 44227619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 1469509 - 1469593
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1469509 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 1469593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 8277371 - 8277455
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8277371 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 8277455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 8306180 - 8306264
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8306180 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 8306264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16746028 - 16746112
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16746028 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16746112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18908954 - 18908898
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18908954 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattg 18908898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30151634 - 30151550
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30151634 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 30151550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41268539 - 41268455
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  41268539 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 41268455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53768958 - 53768874
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  53768958 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 53768874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8602592 - 8602521
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagt-tgcttggtga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  8602592 ccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtctgcttggtga 8602521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14283611 - 14283516
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14283611 gattatgttgatgtaatactcacccatagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 14283516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 23888047 - 23888142
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  23888047 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtggacgttgtgcaagaatagtagcttggtgagt 23888142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 11480940 - 11481033
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  11480940 gattatgttgatgtaatacttaccccagtgg-tttacccgtctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 11481033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15574296 - 15574219
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15574296 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15574219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15613315 - 15613238
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15613315 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15613238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 380
Target Start/End: Original strand, 54042879 - 54042944
Alignment:
Q  316 tggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54042879 tggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 54042944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 13977494 - 13977578
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13977494 ttatctggattatgttaatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 13977578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 280
Target Start/End: Original strand, 15470309 - 15470397
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 280  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||| || |||||||||||||    
T  15470309 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctatttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 15470397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55314679 - 55314595
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  55314679 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 55314595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 16935822 - 16935913
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16935822 ttaattgttatctggattatgagaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16935913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5225760 - 5225698
Alignment:
Q  221 aatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5225760 aatactcaccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 5225698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Original strand, 11988026 - 11988116
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttg 295  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11988026 gattatgttgatgtaatactcacccctagtggtttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtagcttg 11988116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15988842 - 15988788
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  15988842 ccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcagg 15988788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 33371204 - 33371274
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33371204 gattatgattgatgtaaagcttaccaccagtggttttgaccgcctaccggtctgtatggatgagtagacgt 33371274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 9304866 - 9304966
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgag 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  9304866 gattatgttgatgtaatacttaccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtacggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagattggtgag 9304965  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  9304966 t 9304966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10902770 - 10902725
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10902770 ccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 10902725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 43429396 - 43429441
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43429396 ccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatagatgggtagacg 43429441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7852162 - 7852107
Alignment:
Q  23 gtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatga 79  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  7852162 gtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatga 7852107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7852285 - 7852229
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  7852285 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattg 7852229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 12903740 - 12903832
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| || |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  12903740 gattatgttgaagtaatactcactcccagtggttttaacagcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggattagtagcttggtg 12903832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11636820 - 11636782
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11636820 ccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgg 11636782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27839015 - 27838910
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || |||| | |||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||  ||| |||| ||||    
T  27839015 ttatctggattatgataatgtaatgctaacccaaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgaaggagtag-tgctcggtg 27838917  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  27838916 agtcttt 27838910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12950864 - 12950823
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12950864 gaccgcctacctgtctgtatagatgggtaaacgttgtgcagg 12950823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 299
Target Start/End: Original strand, 25607235 - 25607328
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  25607235 gattatgttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctcggtga 25607328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Original strand, 51963056 - 51963184
Alignment:
Q  175 tgaattgaattattcatg-ttaactg-ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || | || |||||||| |  ||||    
T  51963056 tgaatttaattattcatgcttaattgattaattggattatgttgatgtaatactcacccccagtggttt-gtccgtctgcttgcctgtatgggtaagtag 51963154  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  51963155 acgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 51963184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 273
Target Start/End: Original strand, 5230472 - 5230512
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5230472 agtggttttgaccgcctacctgtttgtatggaagggtagac 5230512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7851908 - 7851860
Alignment:
Q  46 gtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7851908 gtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatg 7851860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7852228 - 7852177
Alignment:
Q  23 gtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttc 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  7852228 gtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttc 7852177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11381108 - 11381072
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11381108 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacc 11381072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11813110 - 11813054
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  11813110 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattg 11813054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 13956661 - 13956741
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  13956661 ttatctggattatgttaatgtaatgcttaccccttgtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 13956741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 274
Target Start/End: Original strand, 15551777 - 15551809
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551777 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 15551809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17137856 - 17137824
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137856 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 17137824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45859317 - 45859233
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  45859317 ttatctggattatgttaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgactacttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcagg 45859233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 49230571 - 49230515
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||| ||||    
T  49230571 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattg 49230515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 281
Target Start/End: Original strand, 38813290 - 38813325
Alignment:
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38813290 gcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgca 38813325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17391298 - 17391248
Alignment:
Q  225 cttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17391298 cttacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacg 17391248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18968392 - 18968350
Alignment:
Q  225 cttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatg 266  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18968392 cttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatg 18968350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 301
Target Start/End: Original strand, 25106204 - 25106282
Alignment:
Q  225 cttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatag-ttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||    
T  25106204 cttacccctagtagttttgaccgcctacctgtttgtgtgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgcttggtgagt 25106282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38166481 - 38166432
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38166481 tgtgattggtgatt-ggtgattatgtatgaataattatgaattgatgtttg 38166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Original strand, 38378139 - 38378193
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||  |||||||    
T  38378139 ccccagtggttttgaccgcctacccgtttgtatgaatgagtagacggagtgcagg 38378193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 14182264 - 14182309
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14182264 ccccaatggttttgaccgcctatctgtttgtatgaatgggtagacg 14182309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 2451167 - 2451199
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2451167 ttggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgat 2451199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 6817514 - 6817566
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  6817514 gaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagttgctt 6817566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 94
Target Start/End: Original strand, 14060951 - 14060983
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14060951 attgatgattgttcatgacacatgtgattgatg 14060983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 15861043 - 15861104
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggatta 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15861043 attattattgatcaaatgcatgatttt--aattgaaatatccatgttaactgttaattggatta 15861104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16819346 - 16819294
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16819346 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 16819294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22273309 - 22273277
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22273309 ttggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgat 22273277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Original strand, 31416123 - 31416159
Alignment:
Q  238 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31416123 ttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacg 31416159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Original strand, 40041439 - 40041483
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40041439 ccccagtggttttgagcgcctacttgtttgtatgaatgggtagac 40041483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14182 - 13821
Alignment:
Q  1 catgagtcttacgttgagaactgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattat 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  14182 catgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgatt-gacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttat 14084  T
Q  101 tgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgt 200  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14083 taatgtgagatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgt 13984  T
Q  201 tatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgag 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||    
T  13983 tatttggattatgttgatgtaatacttacccaagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttggttgctcgatgag 13884  T
Q  301 tcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctc 365  Q
    | ||||  |||||| |||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13883 t-ttttgggcttgg-tggatatcggcagctttctccgatatcagtgtttagagtttagtcggctc 13821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 36892446 - 36892784
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||    
T  36892446 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtg-attattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtata 36892544  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-ca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36892545 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaatacttacccgca 36892642  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  36892643 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatggatagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcaggagctttc 36892741  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36892742 tccgatatcagtg-ttagagtttagtcggctctgatctaggctt 36892784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 25877704 - 25878039
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||     
T  25877704 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgcgagatattggggat-tgatgtaagtatt 25877801  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
        ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25877802 gt--tatgtgaatatt---attgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatatttaccccca 25877896  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  25877897 atggtttttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 25877992  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25877993 tccgataccggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 25878039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 12638006 - 12638351
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||     
T  12638006 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtg-attattgatgtgagacattggggtt-tgatgtaagtatt 12638103  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12638104 ga--tgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggtttatgataatgtaatacttaccccca 12638201  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||    
T  12638202 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagtc-cttgtgcttgg-tggatatcggga 12638299  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12638300 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 12638351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28972451 - 28972175
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattgggg-ttatgatataagtatatac 137  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||     
T  28972451 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatata- 28972353  T
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28972352 -tgtgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt-aattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtg 28972255  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  28972254 attttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttgtgcttggt 28972175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 21276354 - 21276701
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  21276354 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attatcgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 21276451  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || |||||| |||||||||||| | ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21276452 ga--tgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttatcccca 21276549  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  21276550 gtggatctgttatggactgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 21276647  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21276648 gctttctccgatatcggcgtttagatgtttagttggctctgatctaggcttcgt 21276701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7319896 - 7319635
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||     
T  7319896 tgattgtgtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatggtatgaatatatac- 7319798  T
Q  139 tatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtg 236  Q
       ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7319797 ---gtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctcagtg 7319701  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  7319700 attttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 7319635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24966603 - 24966288
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  24966603 ttggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggt-gattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 24966508  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24966507 ttgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 24966411  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  24966410 gtggatctgttatggaccgcctgcctatcagtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 24966313  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga 352  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24966312 gctttctccgatatcggtgtttaga 24966288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 131 - 375
Target Start/End: Original strand, 4450082 - 4450326
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4450082 tatatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 4450181  T
Q  231 -ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatc 329  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||  ||| |    
T  4450182 tctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgaat-gtttgtgcttgg-tggatatcgggagc 4450279  T
Q  330 tttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  4450280 tttctccggtatcggtgttatagagtctaggtggctctgatctaggc 4450326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21140316 - 21139975
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |      
T  21140316 tgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga-- 21140221  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg 237  Q
    | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21140220 tgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgg 21140121  T
Q  238 ttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctt 331  Q
     | ||      |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||    
T  21140120 atctgttatggaccgactgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctt 21140023  T
Q  332 tctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21140022 tctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 21139975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 42180221 - 42180490
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||     
T  42180221 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtatt 42180318  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42180319 ga--tatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 42180416  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  42180417 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 42180490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 348
Target Start/End: Original strand, 31925 - 32230
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattatt-gatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||| ||||||   ||||  ||| | ||||||     
T  31925 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtg-attatttgatgtgagatattgaaattatagtatgaatatata- 32022  T
Q  138 atatgtgaatattattattga-tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtg 236  Q
       ||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32023 ---tgtga-tattattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctagtg 32118  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctc 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||| || ||||    
T  32119 gttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagttgtttttgcttgg-tggatatcgggagctatctc 32217  T
Q  336 cgatatcggtgtt 348  Q
    || ||||||||||    
T  32218 cggtatcggtgtt 32230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 3801234 - 3801469
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  3801234 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 3801333  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||    
T  3801334 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccaata 3801431  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3801432 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 3801469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19889083
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 19888947  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  19888948 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 19889045  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19889046 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 19889083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25600252 - 25600048
Alignment:
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600252 tgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttt 25600153  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||| ||| || |||||| ||    
T  25600152 tggccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatattgggagctatctccggta 25600055  T
Q  341 tcggtgt 347  Q
    || ||||    
T  25600054 tcagtgt 25600048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6877921 - 6877563
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||| | ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  6877921 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtata 6877822  T
Q  135 tacatatgtgaatat---------------tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatg 219  Q
    || |||| |  ||||               |||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6877821 tatatatatatatatatatatatatatatatattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatg 6877722  T
Q  220 taatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttgg 318  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||||  |    
T  6877721 taatacttacccccagaggtgttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt-tcttgtgcttggt--g 6877626  T
Q  319 atattaggatctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||   | ||||| ||||||||| ||||    
T  6877625 atattggaagctttctccggtatcggtgttatagagttagattggctctgatctaggcgtcgt 6877563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 269603 - 269276
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| |||||| || ||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| | | ||| |||| ||||     
T  269603 ttggtaattgtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtat- 269505  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||     
T  269504 ---atatgtgaatattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgta------cccccaa 269414  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  269413 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacaggattaattgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttct 269316  T
Q  335 ccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctag 373  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||    
T  269315 ccggtatcggtgttatagagtctaggtggctctgatctag 269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 350
Target Start/End: Original strand, 22691829 - 22692038
Alignment:
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22691829 tatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgtaatatttaccccaatggt 22691928  T
Q  239 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccga 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||| || ||||||     
T  22691929 tttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttgtttggtgagt-tcttatgcttgg-tggatatcaggagctatctccgg 22692026  T
Q  339 tatcggtgttta 350  Q
    |||| |||||||    
T  22692027 tatcagtgttta 22692038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 350
Target Start/End: Original strand, 22696476 - 22696685
Alignment:
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22696476 tatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgtaatatttaccccaatggt 22696575  T
Q  239 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccga 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||| || ||||||     
T  22696576 tttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttgtttggtgagt-tcttatgcttgg-tggatatcaggagctatctccgg 22696673  T
Q  339 tatcggtgttta 350  Q
    |||| |||||||    
T  22696674 tatcagtgttta 22696685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 38706921 - 38707157
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||      | |    
T  38706921 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgttat 38707020  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||    
T  38707021 ggaccgtctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgtttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctctgata 38707118  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38707119 tcgatgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 38707157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654278
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttaatcg 22654313  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22654312 cctacatgtatgtatggatgggtagacgctgtgca 22654278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 22581805 - 22581986
Alignment:
Q  167 atgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggat 265  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22581805 atgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggat 22581904  T
Q  266 gggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||    
T  22581905 gggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt-tcttttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtgtt 22581986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8886520 - 8886368
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtttt-gacc 245  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8886520 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaacc 8886423  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  8886422 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 8886368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941648
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccg 8941685  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8941684 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 8941648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34822387 - 34822182
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  34822387 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttct 34822288  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||    
T  34822287 ggaccgcctgcctatctatatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagcttcctccgata 34822190  T
Q  341 tcggtgtt 348  Q
    ||||||||    
T  34822189 tcggtgtt 34822182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25210965 - 25210808
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25210965 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 25210866  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  25210865 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtcttt 25210808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Original strand, 12643824 - 12644012
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||     
T  12643824 ttggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagacattggggtt-tgatgtaagtat- 12643920  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
         |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12643921 ---tgatgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccc 12644012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273042
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcc 22273135  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22273134 tacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 22273042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 283
Target Start/End: Original strand, 9654750 - 9654856
Alignment:
Q  178 attgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9654750 attgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 9654849  T
Q  277 gtgcagg 283  Q
    |||||||    
T  9654850 gtgcagg 9654856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 22137633 - 22137753
Alignment:
Q  182 aattattcatgttaa-ctgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 280  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137633 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgctaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 22137732  T
Q  281 agggatagttgcttggtgagt 301  Q
    | |  |||||| |||||||||    
T  22137733 aagattagttgtttggtgagt 22137753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22282466 - 22282275
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22282466 tattattgatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcc 22282368  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22282367 tacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 22282275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22861866 - 22861734
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22861866 attattattgatcaaatgcctgatgtt--aattgaaaatattcatgataattgttattttgattatgataatgtaatacttaccccagtggttttaaccg 22861769  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22861768 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 22861734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Original strand, 23806441 - 23806565
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23806441 aattgaaatattcatgttaactgttatttgtattatgataatttaatacttacccccagtggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacgt 23806540  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  23806541 tgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 23806565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 276
Target Start/End: Original strand, 24296382 - 24296476
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 276  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24296382 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 24296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Original strand, 19812896 - 19812997
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19812896 ttaactgttatatggattatgatgatgtaatatttaccccagtggttttgactgcctagctgtctgtatggatggatagacgttgtgcaggattagttgc 19812995  T
Q  293 tt 294  Q
    ||    
T  19812996 tt 19812997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Original strand, 43644829 - 43644958
Alignment:
Q  153 tattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctac 251  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  43644829 tattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctttttggattgtgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgtctac 43644926  T
Q  252 ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644927 ctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 43644958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 460901 - 460770
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  460901 ttattactgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataattgctatttggattatgataatgtaatacttacccccagttgttttaaccgc 460804  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460803 ctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 460770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 720740 - 720608
Alignment:
Q  162 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgt 259  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  720740 agtacataatatttgaattgatttattcacgtttaactgttatatggattatgaggatgtaatacttacccccagtggttt-gacctcctacctgtctgt 720642  T
Q  260 atggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  720641 atggatgggtagacgctgtgcaggattagttgct 720608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 283
Target Start/End: Original strand, 23823315 - 23823414
Alignment:
Q  185 tattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23823315 tattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttga-cgcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 23823413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 283
Target Start/End: Original strand, 23825259 - 23825358
Alignment:
Q  185 tattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23825259 tattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttga-cgcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 23825357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Original strand, 20629257 - 20629447
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc--agtggttttgaccgcct 249  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20629257 ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatacttaccccctagtggttttaaccgcct 20629354  T
Q  250 acctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    || |  |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  20629355 acttacctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcggaagctttctccgatatcggtgtt 20629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Original strand, 5076 - 5205
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5076 ttgaattgttttattcatgtctaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccg-ctacctgcctgtatggatgggtag 5174  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5175 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25600389 - 25600309
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  25600389 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Original strand, 24089201 - 24089356
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggtt----- 239  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |         
T  24089201 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgatttattcatgtttaactgttatacggattatgatgatgtaatatttacccgcagtggatctgtg 24089300  T
Q  240 -ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
     | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  24089301 atggaccgcctacatgtatgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctt 24089356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19655297 - 19655198
Alignment:
Q  186 attcatgttaa-ctgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19655297 attcatgttaaactgttatgtagattatgatgatgtaatgcttacccccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagg 19655198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 281
Target Start/End: Original strand, 40642140 - 40642249
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40642140 gaattgatttattcatgattaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctacctgtttgtatggatgggtag 40642239  T
Q  272 acgttgtgca 281  Q
    ||||||||||    
T  40642240 acgttgtgca 40642249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22254605 - 22254514
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22254605 gattatgttgatgtaatactcaccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtagcttggtg 22254514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 24828457 - 24828600
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  24828457 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 24828555  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24828556 tgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 24828600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 24832909 - 24833052
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  24832909 tgttatctggattatgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 24833007  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24833008 tgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 24833052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15631705 - 15631550
Alignment:
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttga 243  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  15631705 atattgttattgatcaaatgcatgatgttata-ttgaaatatccatgattaactgttatttgaattatgatgatgtaatacttacccccagtgg-tttgt 15631608  T
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| | || || ||||| || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15631607 ccgcctgcttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagttgctcggtgagt 15631550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32738776 - 32738711
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32738776 cccctgtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 32738711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24868847 - 24868797
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24868847 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 24868797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25303943 - 25303766
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgatg-atgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  25303943 ttgaagtgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgatttatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcttacctgtcaatatggatgggt 25303844  T
Q  270 agacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtc-ttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||    
T  25303843 agatgctgtgcaggattagttgctctggtgagtcgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggt 25303766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 9782734 - 9782814
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9782734 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccactggttttgaccgcctgcctgtctgtatggataggtagacgttgt 9782814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 23779788 - 23779880
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23779788 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaggactagtagcttggtg 23779880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Original strand, 23837284 - 23837355
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  23837284 ccccagtggttttaaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 23837355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 5890154 - 5890238
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5890154 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 5890238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 11233108 - 11233192
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  11233108 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 11233192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 14908295 - 14908379
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  14908295 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 14908379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 17398453 - 17398537
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17398453 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtaagtagacgttgtgcagg 17398537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 22514955 - 22515039
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22514955 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 22515039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23772836 - 23772752
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  23772836 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 23772752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23818479 - 23818395
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  23818479 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 23818395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 24687526 - 24687610
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24687526 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 24687610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 28777557 - 28777641
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  28777557 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 28777641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22692592 - 22692491
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  22692592 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccattggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgctgtgcaggagtag-tgcttggtg 22692494  T
Q  299 agt 301  Q
    |||    
T  22692493 agt 22692491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22697239 - 22697138
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  22697239 ttatttggattatgataatgtaatacttacccccattggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgctgtgcaggagtag-tgcttggtg 22697141  T
Q  299 agt 301  Q
    |||    
T  22697140 agt 22697138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 24573144 - 24573321
Alignment:
Q  40 gattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacat 139  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| | ||||  | | | |||||        
T  24573144 gattgtgcataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatt--- 24573240  T
Q  140 atgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
     ||||| | ||||||| | || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24573241 -tgtgatt-ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgta 24573321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25132535 - 25132450
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  25132535 tgatgtaaagcttaccccagtggtttttgatcgcctacctgtctgtatggaagggtagacgaagtgcaggattagttacttggtga 25132450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 30994853 - 30994918
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||    
T  30994853 ccccagtggttttgaccgcctacctgactgtatggatggatagacgaagtgcaggattagttgctt 30994918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6092780 - 6092712
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6092780 gattatgattgatgtaaagcttaccccattggttttgaccgcctatctgtctatatggatgggtagacg 6092712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12726351 - 12726267
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12726351 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 12726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 19435811 - 19435863
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19435811 gaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 19435863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20013422 - 20013338
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20013422 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggggagtagacgttgtgcagg 20013338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 22691695 - 22691775
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattg 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  22691695 ttggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaattattg 22691775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 22696342 - 22696422
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattg 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  22696342 ttggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaattattg 22696422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43640646 - 43640594
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43640646 gaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 43640594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 7509878 - 7509937
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  7509878 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 7509937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 25255175 - 25255270
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgac-cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  25255175 gattatgttgatgtaatactccccccagtggtttttaatcgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 25255270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 28032932 - 28033027
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |  |||| |||||||||||    
T  28032932 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagaagttgtgcaagactagtagcttggtgagt 28033027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25593463 - 25593418
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25593463 ccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 25593418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24272392 - 24272296
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  24272392 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctaatggttttgactgcctacttgtctgtattgatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 24272296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 24343234 - 24343328
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || || |||||| ||||||   ||||||| |||||||    
T  24343234 gattatgttgatgaaatgctcaccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtcgacgttatgcaggagcagttgctcggtgagt 24343328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19657805 - 19657697
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||      ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  19657805 ttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccccagtggatctgtgatggaccgcatgcctgtctgtatggataggtagacgttgtgtaggtttagttgc 19657706  T
Q  293 ttggtgagt 301  Q
    | |||||||    
T  19657705 tcggtgagt 19657697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 19670970 - 19671019
Alignment:
Q  184 ttattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19670970 ttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatgcttacccc 19671019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 3800981 - 3801037
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||| ||||    
T  3800981 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattg 3801037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 12643696 - 12643752
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12643696 ttggtgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 12643752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15631791 - 15631716
Alignment:
Q  44 gtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtt 120  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15631791 gtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattg-gagattattgatgtgagatattggagtt 15631716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17202883 - 17202791
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  17202883 gattatgttgatgtaatactcactcccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgagtgagtagacgttgtgcatgactagtagcttggtg 17202791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18533648 - 18533604
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18533648 ccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagac 18533604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 25211168 - 25211124
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatga 79  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  25211168 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatga 25211124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 23614440 - 23614489
Alignment:
Q  225 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  23614440 cttaccctagttgttttgaccgcctacctttttgtatgaatgggtagacg 23614489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 93
Target Start/End: Original strand, 4449966 - 4450018
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgat 93  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4449966 attgtgcatgaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattgat 4450018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 12637882 - 12637934
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12637882 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 12637934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 94
Target Start/End: Original strand, 24089111 - 24089143
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24089111 attgatgattgttcatgacacatgtgattgatg 24089143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 22407980 - 22408321
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22407980 ttggtgattgtgtgtgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 22408078  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22408079 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 22408176  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  22408177 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 22408274  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22408275 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 22408321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Original strand, 5676342 - 5676694
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  5676342 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt- 5676438  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5676439 tgatgtaagtatatgcat--gagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgta 5676536  T
Q  222 atacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5676537 atacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgctcgg-tggat 5676635  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5676636 atcgggagctttctccgatatcggtgtttagag-ttagttggctctgatctaggcttcgt 5676694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41217727 - 41217381
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  41217727 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtat 41217629  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41217628 att--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccct 41217531  T
Q  233 -agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattag 325  Q
     ||||| |      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |    
T  41217530 tagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagtgatagtttcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgg 41217432  T
Q  326 gatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41217431 gagctttctccgatatcggtg-ttagagtttagtcggctctgatctaggctt 41217381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35053313 - 35052985
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||         
T  35053313 tttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtg-attattgatgtgagatattgtggtt-tgatgta----- 35053221  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
           || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  35053220 -------tgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacctaccccc 35053128  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||    
T  35053127 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggacagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagcttt 35053029  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  35053028 ctccgatatcggtg-ttagtgtttagttggctctgatctaggctt 35052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 35524170 - 35524476
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||     
T  35524170 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatt 35524269  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    ||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35524270 ta--tatgtgaatatt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgtaatacttaccccag 35524364  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  35524365 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttct 35524462  T
Q  335 ccgatatcggtgtt 348  Q
    ||| ||||||||||    
T  35524463 ccggtatcggtgtt 35524476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 386
Target Start/End: Original strand, 9786141 - 9786479
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||| ||   ||    
T  9786141 attgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggag-attattgatgtgagacattggggtt--gatgtaagtacatg--ta 9786235  T
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttt 240  Q
    || | |||||||||||||||||||  |||||||||    |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9786236 tgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttt 9786335  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||  |||| |  |||||||||    
T  9786336 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaaggttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggataccaggagcaatctccgata 9786433  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  9786434 tcggtgtttagagtttagttggctctgatctaggctttgttatgtc 9786479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20252523 - 20252178
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  20252523 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 20252426  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20252425 ga--tatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 20252328  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    || | |      | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  20252327 gtagatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 20252230  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20252229 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcgactctgatctaggcttcgt 20252178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505495
Alignment:
Q  43 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatg 142  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||  | || ||    
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgtgagatatttggg-tgtgatgtaagtattaatatgtg 18505720  T
Q  143 tgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttg 242  Q
    ||   ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18505719 tg---attattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttg 18505624  T
Q  243 accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatc 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  18505623 accacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgatatc 18505528  T
Q  343 ggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18505527 ggtgtt--gagtttaatcggctctgatctaggctt 18505495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21716619 - 21716305
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat- 133  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| | ||||| |||  || |     
T  21716619 ttggtaattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgtgtgtg 21716520  T
Q  134 ---atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
       ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21716519 tgtatatatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaaaacttacc 21716420  T
Q  231 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatct 330  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||    
T  21716419 caagtggttttgaccgccta-cagtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcagtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcaggagct 21716323  T
Q  331 ttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21716322 ttctccggtatcggtgtt 21716305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 2422819 - 2423124
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  2422819 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 2422916  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| |||   |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||    
T  2422917 t--gtatgagaa---tattattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgtaatgctcaccccca 2423011  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
     ||| |||| |||||| | ||  ||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  2423012 atgg-tttgtccgcctgcttgcttgtatgggtaagtagacgttgtgcaggagtagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 2423109  T
Q  334 tccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||    
T  2423110 tccgatatcggtgtt 2423124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22352357 - 22352122
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||        
T  22352357 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttagccccagtggatctgtgat 22352258  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  22352257 ggaccgcctacctttctgtatggatggatagacgttgtgcaggtttagttgtttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 22352160  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22352159 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 22352122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22080232 - 22080027
Alignment:
Q  178 attgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||      ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22080232 attgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacgcccagtggatctgtgatggaccgcctacctttctgtatggatgggta 22080133  T
Q  271 gacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatc 370  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  22080132 gacgttgtgcaggtttagttgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtgcttagag-ttggtcggctctgatc 22080037  T
Q  371 taggcttcgt 380  Q
    ||||||||||    
T  22080036 taggcttcgt 22080027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 51658079 - 51658318
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| ||  | |||||||| | |||||||  ||||| ||| | | ||||      
T  51658079 tgattgtgtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtata-- 51658176  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagt-g 236  Q
      |||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51658177 --tgtagatattattgt-gattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtgg 51658273  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51658274 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 51658318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21857823 - 21857630
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  21857823 attattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaactg 21857726  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  21857725 cctacctgtctgtatggaagggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctctgatatcggtg 21857632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 378
Target Start/End: Original strand, 20895613 - 20895837
Alignment:
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgac 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20895613 atattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgtaaacagttaattgaattatgttgatgtaatacttacccctagtggttttaac 20895712  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcgg 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20895713 cgcctacctgtcggtatggatgggtagacgttgtgcaggagta-ctggttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcgg 20895806  T
Q  345 tgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttc 378  Q
    | || ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  20895807 tattgag---ttagtcggctcagatctaggcttc 20895837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 347
Target Start/End: Original strand, 27331084 - 27331229
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  27331084 ttatttggattatgatgatgtaatactaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgcttggtga 27331183  T
Q  300 gtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    || | || ||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  27331184 gt-tcttgtgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatcggtgt 27331229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27673268 - 27672976
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattatt---ga 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |  || |||| | ||||| |  ||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||   |     
T  27673268 attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattagtattatggtatgagtatgtatatatgtggatattattattattgg 27673169  T
Q  159 tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtct 257  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27673168 ttaagtacatgatatttggatt-atttattcatgtttaactgtcatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgcct 27673070  T
Q  258 gtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgag-tcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttt 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |   |||||||  |||||| |  ||  |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  27673069 gtatggatgggtagatgttgtgcaagatcagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatattgggagctatctccggtatcggtgttt 27672976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 22837186 - 22837391
Alignment:
Q  147 tattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga 243  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22837186 tattattatttgattaagtacatgatatt-gaattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttga 22837284  T
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt-ggtgagtct-tttctgcttggttggatattaggatctttctccgatat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||  ||| || |||||| |||    
T  22837285 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcaagattagttgcttcggtgagtttcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtat 22837384  T
Q  342 cggtgtt 348  Q
    |||||||    
T  22837385 cggtgtt 22837391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 301
Target Start/End: Original strand, 20956820 - 20956969
Alignment:
Q  155 ttgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacc 252  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20956820 ttgattaagtacatgatatttggattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccacctacc 20956919  T
Q  253 tgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20956920 tgtctgtatggatggttagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 20956969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17146892 - 17146756
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  17146892 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccg 17146793  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17146792 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 17146756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22365015 - 22364779
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  22365015 attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatatgtgat 22364916  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  22364915 ggaccgtctgcctatctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgag-ctcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgata 22364818  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22364817 tcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 22364779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 44036754 - 44036872
Alignment:
Q  183 attattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036754 attattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccacagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 44036853  T
Q  282 gggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||  ||| ||||||||||||    
T  44036854 ggagtag-tgcttggtgagt 44036872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 348
Target Start/End: Original strand, 22837420 - 22837594
Alignment:
Q  178 attgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22837420 attgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactt 22837519  T
Q  276 tgtgcagggatagttgctt-ggtgagtct-tttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||  ||| || |||||| ||||||||||    
T  22837520 tgtgcaagattagttgcttcggtgagtttcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtgtt 22837594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20444074 - 20443883
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20444074 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactactatttggattgt-ataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 20443978  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20443977 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatagggagctttctccgatatcggtgt 20443884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20529814 - 20529623
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20529814 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactactatttggattgt-ataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 20529718  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20529717 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatagggagctttctccgatatcggtgt 20529624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20929815 - 20929683
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgc 247  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20929815 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattga-ttattcaagtgaactgctatttggattatgataatgtaatacttacccaagtggttttaaccgc 20929719  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929718 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 20929683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Original strand, 37846297 - 37846430
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    ||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  37846297 ttattattgatcaaaatcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttggattatgataatgtaatacttacccccaatggttttaaccgc 37846394  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846395 atacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 37846430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 36358137 - 36358236
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36358137 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtcgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 36358236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 345
Target Start/End: Original strand, 37235762 - 37235939
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235762 ttgaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 37235861  T
Q  270 agacgttgtgcagggatagttgct-tggtgag-tcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  |||||| |  ||  |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  37235862 agacattgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggtcggatattgggagctatctccgatatcggt 37235939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 15863436 - 15863596
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  15863436 attattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 15863535  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  15863536 ggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggattagtagcttggtgagt 15863596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17607290 - 17607184
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17607290 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccaagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtaga 17607191  T
Q  273 cgttgtg 279  Q
    |||||||    
T  17607190 cgttgtg 17607184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 38035421 - 38035520
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38035421 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgattgcctacctgtctgtatggttgggtagatgttgtgca 38035520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49966014 - 49965893
Alignment:
Q  257 tgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagttt 356  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966014 tgtatggatgggtaaacattgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttggt-ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagagttt 49965917  T
Q  357 agtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  49965916 agtcggttctgatctaggtttcgt 49965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17021914 - 17021801
Alignment:
Q  184 ttattcatg-ttaactg-ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17021914 ttattcatgcttaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtg 17021815  T
Q  280 cagggatagttgct 293  Q
    ||||  ||||||||    
T  17021814 caggattagttgct 17021801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 41213499 - 41213594
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  41213499 ttatctggattatgattgatgtaaagcttaccccagtggtttggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 41213594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19601559 - 19601451
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19601559 tttgaattgtttcattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttatccccaatgg-tttgaccg-ctacctgtctgtatggatgggta 19601462  T
Q  271 gacgttgtgca 281  Q
    |||| ||||||    
T  19601461 gacgctgtgca 19601451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 133
Target Start/End: Original strand, 22250788 - 22250884
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22250788 ttggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggt-gatcattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtat 22250884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 35935478 - 35935621
Alignment:
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  35935478 tgttatctggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcgg 35935576  T
Q  297 tgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    ||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  35935577 tgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 35935621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 5770043 - 5770131
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  5770043 gattatgattgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 5770131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22226290 - 22226141
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  22226290 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttactcccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgcaggagtag-tg 22226192  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    || ||||||||||   ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22226191 ctcggtgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 22226141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 5472224 - 5472299
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5472224 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggatagacg 5472299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21042109 - 21042030
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||    
T  21042109 tgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgaagtgcaggattagttgctt 21042030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21193529 - 21193407
Alignment:
Q  175 tgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21193529 tgaattgatttattcatctctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctatctg-atggatgggta 21193431  T
Q  271 gacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||    
T  21193430 gacgttgtgcaggattagttgctt 21193407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29217404 - 29217339
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  29217404 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctt 29217339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 22148259 - 22148315
Alignment:
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22148259 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 22148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40555709 - 40555633
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40555709 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 40555633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41217855 - 41217799
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41217855 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 41217799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18164509 - 18164439
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164509 gattatgattgatgtaaaacttaccccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 18164439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 20895526 - 20895596
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20895526 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggt-gattattgatgt 20895596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45049943 - 45049860
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  45049943 ttatctggattatgataatgtaatgcttaccccagtgattttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 45049860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  70 ttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatg 169  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || |||    
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatac--atgtggatattattattgattaaatatatg 20590060  T
Q  170 atgtttgaattgaattat 187  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  20590061 agatttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41392749 - 41392645
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  41392749 ttatttgg-ttatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 41392652  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  41392651 agtcttt 41392645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Original strand, 49999186 - 49999272
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  49999186 gattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgaagttcagggttagttg 49999272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 5074167 - 5074251
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5074167 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 5074251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 20827088 - 20827172
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20827088 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 20827172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22034145 - 22034061
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22034145 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 22034061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 377
Target Start/End: Original strand, 24498469 - 24498603
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatat 341  Q
    |||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  24498469 gaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggtttagttacttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagccttctccgatat 24498566  T
Q  342 cggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  24498567 cggtgttaagatgtttagtcgactctgatctaggctt 24498603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 7642448 - 7642553
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||  ||| |||| ||||    
T  7642448 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgtaggagtag-tgctcggtg 7642546  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  7642547 agtcttt 7642553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52397971 - 52397926
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52397971 ccccagtggttttgaccgccgacctgtctgtatggatgggtagacg 52397926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 15863233 - 15863289
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15863233 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattg 15863289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17003123 - 17003039
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17003123 ttatctggattatgttaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 17003039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 18602910 - 18602994
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  18602910 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 18602994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 21651871 - 21651962
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  21651871 ttaattgttatctggattatgataatataatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctttatgggtgagtagacgttgtgcagg 21651962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 40438147 - 40438192
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40438147 ccccagtggttttaaccgcctacctgtccgtatggatgggtagacg 40438192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46144075 - 46144014
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  46144075 ccccagtggttttgaccgcctacctgt----atggatgggtagacgaggtgcagggttagttgctt 46144014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 49966065 - 49966013
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtg 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49966065 ttggtgattgtgtatgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51450911 - 51450827
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  51450911 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgccttcttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 51450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29137134 - 29137043
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||    
T  29137134 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaatcgcctacttgctggtatgggtgagtagacgttgtgcagg 29137043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 5676282 - 5676349
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5676282 tgtgattggtaatt-ggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcatgacacatgtgattg 5676349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20192040 - 20191995
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20192040 ccccagtggtttcgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 20191995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22352560 - 22352504
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  22352560 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 22352504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 274
Target Start/End: Original strand, 78389 - 78419
Alignment:
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78389 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 78419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5684
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||       
T  6022 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-taatgtaactatatg-- 5927  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg 237  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5926 tatgagaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgtaatacttatccccagtgg 5827  T
Q  238 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggt-tggatattaggatctttctcc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  5826 ttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-ttttgtgcttggtgtggatatcgggagctttctcc 5728  T
Q  337 gatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5727 gatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 5684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 96)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 25646604 - 25646946
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25646604 ttggtgattgtgtgtgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtata 25646702  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25646703 tg--tatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 25646800  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  25646801 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 25646898  T
Q  334 tccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25646899 tccgatatcagtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 25646946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18775699 - 18775351
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  18775699 tgtgaatggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt- 18775603  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||||| |   | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18775602 tgatgtaagtatttt--tttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgta 18775505  T
Q  222 atacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggata 321  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  18775504 atacttaccctagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgcttggtgagtattttgtgcttgg-tggata 18775406  T
Q  322 ttaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |   || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18775405 tcgagagctttctccgatatcggtg-ttagggtttagtcggctctgatctaggctt 18775351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22428658 - 22428346
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattatt-gatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||| || |||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||    
T  22428658 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtg-attatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtat 22428560  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca 233  Q
      | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428559 tgatatatttgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca 22428460  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| |||||    
T  22428459 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgcgtgg-tggatatcgggagctttc 22428361  T
Q  334 tccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||| |||||    
T  22428360 tccgatatcagtgtt 22428346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31626921 - 31626580
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  31626921 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtata 31626823  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31626822 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgtaatacttaccccta 31626725  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||  ||  |||||    
T  31626724 gtggttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcaacgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggggctttc 31626627  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31626626 tccgatatcagtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 31626580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16105045 - 16104694
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||  | |||||||||| ||||||||| ||    
T  16105045 tgtgattagtgatt-ggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggta 16104947  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16104946 tgatgtaagtattgt--tatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 16104849  T
Q  222 atacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||    
T  16104848 atacttacccctagtggttttaatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcagtgagt-ttttgtgcttgg-tggat 16104751  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||    
T  16104750 attgggagctttctccgatatcggtgtttagagtctaggtgactctgatctaggctt 16104694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 35017463 - 35017807
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  35017463 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 35017561  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017562 tc--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 35017659  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||  |||||| ||||||| ||||    
T  35017660 gtggatctgtgatggaccgcctgcttatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtgtagatgcttggtgag--ttttgcgcttgg-tggatatcagga 35017756  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  35017757 gctttctccgatatcggtggttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 35017807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 18843720 - 18844065
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18843720 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 18843818  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18843819 t--atatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 18843914  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | || ||||||| |||||||  |||    
T  18843915 gtggatctgttatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgag--tattgtgcttgg-tggatatcggga 18844011  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18844012 gctttctccgatatcggtgtttaaatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 18844065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18128520 - 18128212
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18128520 ttggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggag-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 18128423  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca- 233  Q
    |   |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18128422 tg--tatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttagat-gaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccaaa 18128326  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  18128325 gtggttttaaccgcctacatgtatgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttgtgcttgg-tggacattgggagctttc 18128227  T
Q  334 tccgatatcggtgtt 348  Q
    | | |||||||||||    
T  18128226 ttcaatatcggtgtt 18128212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 380
Target Start/End: Original strand, 13016526 - 13016858
Alignment:
Q  37 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||     
T  13016526 ggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaat-attaatgtgagatattggggtt--gatgtaagtatatt 13016622  T
Q  137 catatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtg 236  Q
      | |  ||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13016623 --ttttagaatattattattgatcaaatgcttgatgtta-aattgaaatattcatgttaactgt-atttggattatgatgatgtaatacttaccccagtg 13016718  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctcc 336  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||  |||||||    
T  13016719 gttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagttttctcc 13016814  T
Q  337 gatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13016815 gatatcggtgtttactgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 13016858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18579015 - 18578670
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  18579015 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 18578918  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18578917 ga--tatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgtaatacttaccccca 18578820  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  18578819 gtggatctgtgatgaaccgactgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 18578722  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18578721 gcattctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 18578670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 33316425 - 33316769
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  33316425 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 33316522  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  33316523 ga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgctatttggtttatgataatgtaatacttaccccca 33316620  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  33316621 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 33316718  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33316719 gctttctccgatgtcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 33316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 18004869 - 18005216
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  18004869 ttggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 18004966  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-ccca 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18004967 ga--tgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgtaatacttacaccca 18005064  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  18005065 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 18005162  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18005163 gctttctccgatatcggcgtttagatgtttagttggctctgatctaggcttcgt 18005216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 14628380 - 14628725
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  14628380 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 14628477  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  14628478 ga--tgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatcttaatgtaatacttaccccta 14628575  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  14628576 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatccgga 14628673  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14628674 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 14628725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32896455 - 32896201
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  32896455 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagttattggggttatgatgtaagtata 32896356  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||            || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32896355 tatttat------------atcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactgttatttggattatgatgatgtaatacttatcccta 32896268  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  32896267 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgtaggagtag-tgcttggtgagt 32896201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 13622943 - 13623283
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  13622943 ttggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 13623038  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta--cccc 232  Q
    |  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13623039 ttgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccc 13623135  T
Q  233 agtggttttg--accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatct 330  Q
    ||||| | ||  |  | |  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||    
T  13623136 agtggatctgttatggaccgcctgcctgtatggatgggtacacgttgtgcatgtttagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcaggagct 13623232  T
Q  331 ttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13623233 ttctccgatatcggtgtttagatgtttagttggctctgatctaggcttcgt 13623283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Original strand, 25745979 - 25746314
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||| |||||| |||||||||||     
T  25745979 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt 25746077  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    ||||                | | |||| |||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25746078 tgat----------------gaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgta 25746161  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | |||||    
T  25746162 atacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gatggat 25746257  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25746258 atcgggagctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctatgatctaggctt 25746314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23975890 - 23975545
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  23975890 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 23975795  T
Q  135 tacatatgtg-aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    |  || || | ||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23975794 ttgatgtgggaaattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttaccccc 23975695  T
Q  233 agtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    |||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || | ||||| |||||||   |    
T  23975694 agtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgaat-tcttgtacttgg-tggatatcgag 23975597  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23975596 agctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 23975545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 35011135 - 35011404
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  35011135 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 35011232  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35011233 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 35011330  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||| |      | |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  35011331 gtggatctgtgatggaccgcctgcctatctttatagatgggtcgacgttgtgcaggtttagatgcttggtgagt 35011404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18421987
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgac 18422086  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18422085 tacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagggatagttgcttggtgagtctttcgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 18421987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23151828 - 23151556
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  23151828 gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaatatccatgct 23151732  T
Q  195 aactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  23151731 aactgttatttggattatgatgatgtaatacatacccccagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtaaacgttgtgcaggagtag-tgct 23151633  T
Q  294 tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||   ||| | ||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23151632 tggtgag---tttgtacttggt--gatatcgggagctttctctgatatcggtgtt--gagtttagtcggctatgatctaggctt 23151556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19627679 - 19627410
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||     
T  19627679 ttggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgggagatattggggtt-tgatgtaagtatt 19627582  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19627581 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccccca 19627484  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19627483 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 19627410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17787821 - 17787589
Alignment:
Q  145 aatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttga 243  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  17787821 aatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgtaatacttacccccaatggttttaa 17787722  T
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  17787721 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgttatcg 17787626  T
Q  344 gtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17787625 gtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 17787589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 380
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828169
Alignment:
Q  86 tgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatt 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||  || |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  16827873 tgattgatg-attattgatgtgagataatggggtt-tgatgtaagtattgacgt--gggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 16827968  T
Q  186 attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16827969 atccatattaactgttatttggattatgataatgtaatacttaaccccaatggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgt 16828068  T
Q  279 gcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||  |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16828069 gcaggtttagttgtttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 16828166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18740717 - 18740522
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18740717 attattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttatctccagtggttttaaccg 18740618  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  18740617 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatattgggagctttctccggtatcggtg 18740524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835709
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtgggtctgttat 18835571  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  18835572 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttggttgcttggtgag--tattgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgata 18835668  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18835669 tcggtgtttagatgtttagtgggctgtgatctaggcttcgt 18835709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22866462 - 22866279
Alignment:
Q  166 catgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgga 264  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22866462 catgatatttgaatggaattattcatgttaattattatttgaattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgacctcctacctgtctgtatggg 22866363  T
Q  265 tgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  22866362 tgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtcttttgtacttgg-tggatatcgggagctttctccggtataggtgtt 22866279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173454
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 25173491  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25173490 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 25173454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 302
Target Start/End: Original strand, 25369107 - 25369379
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggatta-ttgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| || |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||     
T  25369107 tgattgtgcatgaataaatgtga-ttgatgattgttcatgacacttgtgattggtg-attacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatat 25369204  T
Q  138 atatgt------gaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttac 229  Q
    |||| |      | ||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25369205 atatatatatatggatattcttatttgattaagtacatgataattgaattgaattattcatgtttaactgttatgtcgattatgatgatgtaatacttac 25369304  T
Q  230 ccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtc 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  25369305 ccctagtggttttgaccgcctacctatctaaatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtc 25369379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1554053 - 1553866
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt 194  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1554053 gattattgatgtgagatattgaggttttgatgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgtt 1553956  T
Q  195 aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  1553955 aactgttattttgattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 1553866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Original strand, 19985026 - 19985176
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19985026 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 19985123  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgag 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  19985124 cctacccgtctgtatggatgggtagacgttttgcaggagtag-tgcttggtgag 19985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33323106 - 33322911
Alignment:
Q  154 attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacct 253  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33323106 attgattaagtatatgaaatttgaattaaattattcatgttaactgttgtgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacat 33323007  T
Q  254 gtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttt 349  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||| | ||||||  ||   |||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  33323006 gtctgtatggatgggtaaacgctgtgtaggattagttgctctagtgagttcttgtggcttgg-tggatattgggagctatctccggtatcggtgttt 33322911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18397342 - 18397107
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||  | ||| | |  ||||||| |||||||      
T  18397342 tgattttgcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatata-- 18397245  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggt 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18397244 tatgtgaatattattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtgga 18397145  T
Q  239 t------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |      | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18397144 tctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggta 18397107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4989061 - 4988822
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------tt 239  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||      |     
T  4989061 tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatttgtattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgtta 4988962  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggata-gttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccga 338  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||  | || ||||||| |||||||   || ||||||||||    
T  4988961 tggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagtgtaggatgcttggtgag--tattgtgcttgg-tggatatcgcgagctttctccga 4988865  T
Q  339 tatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4988864 tatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 4988822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Original strand, 7829717 - 7829838
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7829717 ttgaattgatttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtag 7829816  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||| ||||||||  ||||||||    
T  7829817 acgctgtgcaggattagttgct 7829838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25918008 - 25917917
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25918008 ttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagg 25917917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 940904 - 941061
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatga-tgatgtaatacttacccc-agtggttttgac 244  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  940904 attactatggattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgcctaactgctatgtggattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgac 941003  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  941004 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 941061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16235794 - 16235605
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggat 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16235794 taactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggttt 16235695  T
Q  287 agttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  16235694 agttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctcctatatccgtgtttagatgtttagttggctctgatctaggctt 16235605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 283
Target Start/End: Original strand, 16889621 - 16889721
Alignment:
Q  185 tattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889621 tattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgaatgggtagacgttgtgcag 16889720  T
Q  283 g 283  Q
    |    
T  16889721 g 16889721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14150908 - 14150813
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14150908 gattatgttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt 14150813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Original strand, 18825659 - 18825774
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18825659 ttggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 18825757  T
Q  135 tacatatgtgaatattatt 153  Q
    |  ||||| ||||||||||    
T  18825758 t--atatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21621473 - 21621362
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactg-ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21621473 gaattgatttattcatgcttaactacttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 21621374  T
Q  272 acgttgtgcagg 283  Q
    ||| ||||||||    
T  21621373 acgctgtgcagg 21621362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25649596 - 25649501
Alignment:
Q  197 ctgttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagtt 290  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25649596 ctgttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtttggatgggtagacgttgtgcagggttagtt 25649501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Original strand, 12310808 - 12310921
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12310808 ttgaattgacttattcatgtctaaatgtttatgtggattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctacctgtcggtatggatgggt 12310907  T
Q  270 agacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||    
T  12310908 agacgttgtgcagg 12310921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Original strand, 18383474 - 18383598
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggg 268  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18383474 tttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatggg 18383573  T
Q  269 tagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||    
T  18383574 tagacgctgtgcaggattagttgct 18383598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Original strand, 17085403 - 17085490
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17085403 tgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt 17085490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 348
Target Start/End: Original strand, 15080702 - 15080827
Alignment:
Q  223 tacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggata 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||  ||||||| ||||||    
T  15080702 tacttaccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttattcttgcttgg-tggata 15080800  T
Q  322 ttaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||    
T  15080801 tcgggagctatctccggtatcggtgtt 15080827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 17344101 - 17344208
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  17344101 aattgaattattcaagataattgttatttgaattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgt 17344200  T
Q  276 tgtgcagg 283  Q
    ||||||||    
T  17344201 tgtgcagg 17344208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 301
Target Start/End: Original strand, 17790971 - 17791092
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 280  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  17790971 ttattcatgtataactgttatatggattatgatgatgtaacgcttaaccccagtggtttttgaccgcctccctgtctgtacggatgggtagacactgtgc 17791070  T
Q  281 agggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||  |||||||| ||||||||    
T  17791071 aggattagttgctctggtgagt 17791092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6092848 - 6092760
Alignment:
Q  214 atgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||    
T  6092848 atgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattacttgctcggtgagt 6092760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22846462 - 22846358
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc-ttgg 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  22846462 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttatcccaagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcgttgg 22846363  T
Q  297 tgagt 301  Q
    |||||    
T  22846362 tgagt 22846358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Original strand, 33540071 - 33540147
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33540071 gattatgattgatgtaaagcttacgcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 33540147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 18088640 - 18088731
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18088640 ttaattgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 18088731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19608733 - 19608622
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||      
T  19608733 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagt-- 19608636  T
Q  292 cttggtgagtcttt 305  Q
    || |||||||||||    
T  19608635 ctcggtgagtcttt 19608622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 278
Target Start/End: Original strand, 22364041 - 22364147
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||     
T  22364041 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccctgtggttttgaccgcctacctatctgtgtggaagggtat 22364140  T
Q  272 acgttgt 278  Q
    |||||||    
T  22364141 acgttgt 22364147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11214454 - 11214346
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||| ||    
T  11214454 ttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacttgcctgtacgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tg 11214356  T
Q  292 cttggtgagt 301  Q
    ||||||||||    
T  11214355 cttggtgagt 11214346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 347
Target Start/End: Original strand, 1659547 - 1659695
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||| ||    
T  1659547 ttaattgttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtacgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tg 1659645  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    || ||||||||||   ||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  1659646 ctcggtgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgt 1659695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15861064 - 15860958
Alignment:
Q  199 gttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggt 297  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  15861064 gttatctgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggt 15860966  T
Q  298 gagtcttt 305  Q
    ||||||||    
T  15860965 gagtcttt 15860958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 294
Target Start/End: Original strand, 22595521 - 22595584
Alignment:
Q  231 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  22595521 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 22595584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23987347 - 23987242
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  23987347 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 23987249  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  23987248 agtcttt 23987242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 29871332 - 29871437
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  29871332 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 29871430  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  29871431 agtcttt 29871437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 1651847 - 1651931
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1651847 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 1651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10487185 - 10487101
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  10487185 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 10487101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16229886 - 16229802
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16229886 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16229802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16238759 - 16238711
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16238759 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16378142 - 16378226
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16378142 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16378226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16385466 - 16385550
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16385466 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16385550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16645737 - 16645821
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16645737 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16645821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 16651103 - 16651187
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16651103 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 16651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19852607 - 19852531
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19852607 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 19852531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 16301962 - 16302057
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  16301962 gattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcatgactagtagcttggtgagt 16302057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 17375582 - 17375640
Alignment:
Q  225 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  17375582 cttaccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcagg 17375640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26088074 - 26087969
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  26088074 ttatctggattatgataatgtaatgcttaccctcagtggttttaacagcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 26087976  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  26087975 agtcttt 26087969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 27655944 - 27656048
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  27655944 ttatttgg-ttatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 27656041  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  27656042 agtcttt 27656048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 29162772 - 29162837
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  29162772 ccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtggacgaagtgcaggactagttgctt 29162837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 31469377 - 31469466
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  31469377 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtctctatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctt 31469466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34965248 - 34965203
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34965248 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacg 34965203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Original strand, 22467950 - 22468010
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22467950 tgatgtaaagcttaccctcagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 22468010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 22227530 - 22227643
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagtt 290  Q
    |||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||  ||| |    
T  22227530 ttaattgttatatagattatgataatgtaatgcttaccccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacattgtgcaggagtag-t 22227628  T
Q  291 gcttggtgagtcttt 305  Q
    ||| |||||||||||    
T  22227629 gctcggtgagtcttt 22227643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15738556 - 15738499
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttat 203  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15738556 tattataattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttat 15738499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21929779 - 21929710
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21929779 gattatgattgatgtaaaccttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 21929710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4989263 - 4989207
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  4989263 ttggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattg 4989207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 16827675 - 16827731
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16827675 ttggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattg 16827731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29603873 - 29603801
Alignment:
Q  226 ttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||||||||||    
T  29603873 ttaccgcagtggttttgactgcctacatgtctgtatggacgggtagacgacgtgcatgtttagttgcttggtg 29603801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Original strand, 4174581 - 4174636
Alignment:
Q  229 ccccagtggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4174581 ccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggcgtgcagg 4174636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 32278478 - 32278573
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  32278478 gattatgttgatgtaatactcacccccagttgttttaaccacctacttgcctgtatgtgtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 32278573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 4230210 - 4230256
Alignment:
Q  229 ccccagtggt-tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4230210 ccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 4230256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16131575 - 16131521
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  16131575 ccccagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcagg 16131521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23219281 - 23219208
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatag-ttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||  ||| |||||||||||||    
T  23219281 ccccagcggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgcttggtgagt 23219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 14628326 - 14628382
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  14628326 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 14628382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 17858252 - 17858304
Alignment:
Q  231 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||    
T  17858252 ccagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggtagacggagtgcagg 17858304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 18825501 - 18825550
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18825501 tgtgattggtgatt-ggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 18825550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 18843562 - 18843611
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18843562 tgtgattggtgatt-ggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 18843611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 15006511 - 15006556
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15006511 ccccagaggttttgaccgcctacatgtctgtacggatgagtagacg 15006556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18422217 - 18422185
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18422217 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgat 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23976014 - 23975962
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  23976014 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 23975962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25173793 - 25173761
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25173793 ttggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgat 25173761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21392613 - 21392273
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  21392613 tttggtgattgtgtatgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt--gatgtaagtat 21392517  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
    ||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21392516 atg--tatgagaatatttttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccct 21392419  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  |||  |||    
T  21392418 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagtttt 21392321  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21392320 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 21392273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Original strand, 21661399 - 21661728
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||      
T  21661399 tgtgaatggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgttgtgagatattggggtct 21661496  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| |||| ||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661497 tgatgtaagcatatg--tatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgta 21661594  T
Q  222 atacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggata 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  21661595 atacttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagctgcttggtgagtgtgttgtgcttgg-tggata 21661693  T
Q  322 ttaggatctttctccgatatcggtgtttagagttt 356  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21661694 tcatgagctttctctgatatcggtgtttagagttt 21661728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28257958 - 28257626
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||     
T  28257958 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagtatt 28257861  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28257860 ga--tatgtgaatattatt---gatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgtaatacttaccccca 28257767  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  28257766 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 28257670  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28257669 tccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggctt 28257626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4863771 - 4863394
Alignment:
Q  1 catgagtcttacgttgagaactgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattat 100  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4863771 catgagtctta--ttgataaatgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtg-attat 4863676  T
Q  101 tgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac----atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-tta 195  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||     ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| |||    
T  4863675 tgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgatta 4863576  T
Q  196 actgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  4863575 actgttgttttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgctt 4863477  T
Q  295 ggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4863476 ggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 4863394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10488 - 10144
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  10488 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 10391  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10390 ga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 10293  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  10292 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 10195  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10194 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 10144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 25211802 - 25212153
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  25211802 ttggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggagttttgatgtaagtata 25211900  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25211901 ta--tatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 25211996  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  25211997 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 25212093  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25212094 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgtggtgtc 25212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 25275954 - 25276305
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  25275954 ttggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggagttttgatgtaagtata 25276052  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25276053 ta--tatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 25276148  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  25276149 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 25276245  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25276246 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgtggtgtc 25276305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11580101 - 11579762
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11580101 ttggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attactgatgtgagatattggagttttgatgtaagtata 11580003  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    ||    || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11580002 ta----tgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtta-aattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacttaccccta 11579908  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  11579907 gtggatcagtgatggaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 11579810  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11579809 gctttctccgatatcggtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 11579762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 10780124 - 10780471
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  10780124 ttggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 10780221  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10780222 ga--tgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 10780319  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  10780320 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 10780417  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  10780418 gctttctccgatatcggcgtttagatgtttagttggctcttatctaggcttcgt 10780471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19498117 - 19497770
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  19498117 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 19498020  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  19498019 ga--tgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttgcattatgataatgtaatacttaccccca 19497922  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  19497921 gtggatctgttttggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 19497824  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19497823 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 19497770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 24184957 - 24185266
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||  |||| ||  | |||||||||| | |||| | |||||||||  ||||     
T  24184957 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatt 24185056  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24185057 ta--tatgtgaatatt---attgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 24185151  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| ||||    
T  24185152 gtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgctctggtgagtcttttgtgcttgg-tgaatatcgggagcttt 24185250  T
Q  333 ctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||| |||||    
T  24185251 ctccgatatcagtgtt 24185266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 17473713 - 17474056
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||     
T  17473713 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtg-attattgatgtgagctattggggtt-tgatgtaagtatt 17473810  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17473811 ga----tgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 17473906  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
     ||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  17473907 ttggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 17474004  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17474005 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 17474056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 43445720 - 43446064
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  43445720 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 43445817  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43445818 ga--tgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 43445915  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||  | |    
T  43445916 gtggatctgttatggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggtttagttgtttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgaa 43446013  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43446014 gccttttccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 43446064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 1221650 - 1221989
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||     
T  1221650 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagctattggggtt-tgatgtaagtatt 1221747  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1221748 ga----tgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 1221840  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||    
T  1221841 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatattggga 1221938  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1221939 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 1221989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 22885053 - 22885398
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  22885053 ttggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcg-atcattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 22885150  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22885151 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 22885248  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || | ||||| |||||||  |||    
T  22885249 gtggatctgttatggaccacctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtacttgg-tggatatcggga 22885346  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22885347 gctttctccgatatcgatgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 22885398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 9732604 - 9732946
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| |  |||| |||||||     
T  9732604 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgcgagatattgggatg-tgatgtaagtat- 9732700  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    || || |||||   |||||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9732701 ta-atgtgtga---ttattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 9732796  T
Q  234 gtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| | ||      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  9732797 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tattgtgcttgg-tggatatctgga 9732894  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9732895 gctttctccgatatcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 9732946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34937752 - 34937483
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||     
T  34937752 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgttagatattggggtt-tgatgtaagtatt 34937655  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34937654 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 34937557  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||| |      | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  34937556 gtggatctgtgatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 34937483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20710791 - 20710616
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20710791 ttatatggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatggatagttgcttggtga 20710692  T
Q  300 gtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20710691 gtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtg-ttagagtttagtcggctctgatctaggctt 20710616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 27185509 - 27185822
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||     
T  27185509 tgtgattggtgatt-gataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt- 27185605  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||  |||  |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27185606 tgatgtaag--tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgta 27185700  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggat 320  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||   ||| ||||||||  |||    
T  27185701 atacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgtttggtgag---tttgtgcttggt--gat 27185794  T
Q  321 attaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27185795 attgggaactttctccgatatcggtgtt 27185822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 350
Target Start/End: Original strand, 11338608 - 11338931
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||    
T  11338608 ttggtgattgtgcatgaataaatgtga-ttgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagttattgggatcatgatatatatata 11338706  T
Q  135 tacatatgt----------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaata 224  Q
    || |||| |          |||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11338707 tatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaata 11338806  T
Q  225 ctta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatatt 323  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | || || |||| |||||||     
T  11338807 cttacccccagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-tcttgtgtttgg-tggatatc 11338904  T
Q  324 aggatctttctccgatatcggtgttta 350  Q
     ||| || |||||| ||||||||||||    
T  11338905 gggagctatctccggtatcggtgttta 11338931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11340671 - 11340436
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  11340671 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 11340572  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  11340571 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 11340474  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11340473 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 11340436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 377
Target Start/End: Original strand, 23986180 - 23986508
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggatta-ttgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |     
T  23986180 tgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtg-attacttgatgtgaaacattgggggtatgatgtaagtattga- 23986277  T
Q  138 atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
     |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23986278 -tatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatgcttacccccagtg 23986376  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctcc 336  Q
    | |||| |||||  | || |||||||| || ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||   ||| |||||||   |||||  ||| ||||||||    
T  23986377 g-tttgtccgccagcttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgctggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttgg--agatatcgggagctttctcc 23986469  T
Q  337 gatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23986470 gatatcggtgtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 23986508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 18780163 - 18780398
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  18780163 attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 18780262  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   || ||||||||||||    
T  18780263 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgagagctttctccgata 18780360  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  18780361 tcggtgtttagatgtttagtaggctctgatctaggctt 18780398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19403867 - 19403686
Alignment:
Q  166 catgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggat 265  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19403867 catgatatttgaattgaactattcatgttaattattatatggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccg-ctacctgtttgtatggat 19403769  T
Q  266 gggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  19403768 gagtagacgttgtgcaggattagttgctctagtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcaggagctttctccggtatcggtgtt 19403686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 374
Target Start/End: Original strand, 35793273 - 35793505
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  35793273 attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 35793372  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   || ||||||||||||    
T  35793373 ggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgagagctttctccgata 35793470  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctagg 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35793471 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctagg 35793505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24470626 - 24470430
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24470626 attattattgatcaaatgcatgatgtta-aattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccg 24470528  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||  |||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  24470527 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgag--ttttgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgatatcggtg 24470432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 373
Target Start/End: Original strand, 29192781 - 29193016
Alignment:
Q  144 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttg 242  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||    
T  29192781 gaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccacactggatctg 29192880  T
Q  243 ------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctcc 336  Q
          ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  29192881 ttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctcc 29192978  T
Q  337 gatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctag 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29192979 gatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctag 29193016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726836
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgac 244  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttgac 7726894  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  7726893 cgcctacctgtctgtatagatgggtagacgatgtgcaggattagttgctctggtgagt 7726836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23453361 - 23453120
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||| |||||| | ||| |||    ||| ||| |    
T  23453361 tgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagatta-gatt---gtaaatata 23453266  T
Q  139 tatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
    | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23453265 tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 23453167  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23453166 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 23453120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23460605 - 23460364
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||| |||||| | ||| |||    ||| ||| |    
T  23460605 tgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagatta-gatt---gtaaatata 23460510  T
Q  139 tatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
    | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23460509 tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 23460411  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460410 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 23460364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23464866 - 23464625
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||| |||||| | ||| |||    ||| ||| |    
T  23464866 tgattgtgcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagatta-gatt---gtaaatata 23464771  T
Q  139 tatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtg 236  Q
    | ||||| ||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23464770 tttgtga-tattattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtg 23464672  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23464671 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 23464625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368738
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccg 22368701  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22368702 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 22368738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424600
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccg 25424637  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25424636 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 25424600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 1171309 - 1171468
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatca 161  Q
    ||||||| || ||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  1171309 attgatgattattcatgataaatgtgattgatgt-ttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatata--tatgagaatattattattgatca 1171405  T
Q  162 agtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaata 224  Q
    ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171406 agtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgtaata 1171468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 25944678 - 25944837
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt------t 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |      |    
T  25944678 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgtgat 25944777  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25944778 ggaccaccaacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 25944837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Original strand, 37189918 - 37190030
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37189918 ttgaattgttttattcatgtctaactgttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 37190017  T
Q  271 gacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||    
T  37190018 gacgttgtgcagg 37190030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Original strand, 111101 - 111258
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  111101 attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 111200  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  111201 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagatgcttggtg 111258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16534463 - 16534304
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  16534463 attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccg 16534364  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttct 308  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||    
T  16534363 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagt--ctcggtgagtcttttct 16534304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21615377 - 21615266
Alignment:
Q  175 tgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21615377 tgaattgatttgttcatgtctaactgtttatgttgattatgattgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtag 21615278  T
Q  272 acgttgtgcagg 283  Q
    ||| ||||||||    
T  21615277 acgctgtgcagg 21615266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13793508 - 13793375
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggg 268  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13793508 tttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgga 13793409  T
Q  269 tagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    || ||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  13793408 taaacgctgtgcaggattagttgctctggtgagt 13793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17907970 - 17907853
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-t 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  17907970 gattattgatgtgagatattggggttttggtgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgat 17907873  T
Q  194 taactgttatttggattatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17907872 taactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23492273 - 23492156
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23492273 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggctgggtagacgt 23492174  T
Q  276 tgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  23492173 tgtgcaggattagttgct 23492156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 281
Target Start/End: Original strand, 32967971 - 32968071
Alignment:
Q  184 ttattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgccta--cctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32967971 ttattcatgtttaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttacccactgtggttt-gaccgcctatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 32968069  T
Q  280 ca 281  Q
    ||    
T  32968070 ca 32968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6455017 - 6454952
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  6455017 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacggagtgcagggttagttgctt 6454952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28888242 - 28888134
Alignment:
Q  194 taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc--agtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggga 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28888242 taactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccccagtggatctgtgatggaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggat 28888143  T
Q  286 tagttgctt 294  Q
    |||||||||    
T  28888142 tagttgctt 28888134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10616 - 10560
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10616 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattg 10560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20614914 - 20614830
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20614914 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacctgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 20614830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Original strand, 21228186 - 21228293
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  21228186 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtcaaccaacctgtctgtatggatgggtag 21228285  T
Q  272 acgttgtg 279  Q
    || |||||    
T  21228286 acattgtg 21228293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23510299 - 23510211
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtttt 241  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23510299 ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatatttatgttaactgtcatttggattatgataatgtaatacttaccccaagtggtttt 23510211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 3420692 - 3420757
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  3420692 ccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 3420757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 283
Target Start/End: Original strand, 11213478 - 11213676
Alignment:
Q  83 atgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattga 182  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||||| || |||||||  ||||||||| | |||     
T  11213478 atgtgattgatgattaattgttgtgggacattggggatatgatataagtat-ta-atatgggatcattattgttaatcaagtgtatgatgtttaatttgt 11213575  T
Q  183 attattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    | |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||    
T  11213576 aatattcatgttgattgatatttggattatgataatgtaatacttacccccaatgg-tttgtccgcctacttgcctgtaggggtgagtagacgctgtgca 11213674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11582328 - 11582272
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11582328 ttggagattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattg 11582272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 21934136 - 21934220
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  21934136 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 21934220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 21940306 - 21940390
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  21940306 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 21940390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23327254 - 23327170
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  23327254 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 23327170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24594802 - 24594718
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24594802 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 24594718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 25902302 - 25902386
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25902302 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 25902386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35580556 - 35580472
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  35580556 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 35580472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 37011140 - 37011224
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  37011140 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 37011224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37051286 - 37051202
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37051286 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttatctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 37051202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7423909 - 7423818
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  7423909 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 7423818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Original strand, 21235388 - 21235467
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  21235388 tggattatgataatgtaatgcttaccaccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 21235467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Original strand, 4201951 - 4202084
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||     
T  4201951 gattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagt--ctcggtgagtctt- 4202047  T
Q  306 tctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
      ||||||   ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4202048 --tgcttg---ggatattgggagcttcctccgatatcggtgt 4202084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 16837618 - 16837671
Alignment:
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16837618 cccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagg 16837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19872229 - 19872184
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19872229 ccccagttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 19872184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24082426 - 24082361
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  24082426 ccccagtggttttgactgcctacctatctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctt 24082361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 26561623 - 26561692
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26561623 gattatgattgatgtaaagcttaccctcagtggatttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 26561692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32949410 - 32949318
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggt 297  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32949410 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggtttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtagcttggt 32949318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17907786 - 17907727
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  17907786 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtagcttggtgagt 17907727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 21075466 - 21075570
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  21075466 ttatttgg-ttatgataatgtaatgtttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 21075563  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  21075564 agtcttt 21075570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 22368349 - 22368405
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  22368349 ttggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattg 22368405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27008305 - 27008229
Alignment:
Q  208 attatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27008305 attatgataatgtaatgcttacccccagtgattttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 27008229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 1170407 - 1170462
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgatt 90  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1170407 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatt 1170462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7527453 - 7527358
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||    
T  7527453 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttctaaccgcctacttgcctgtatgggggagtagacgttgtgcaggactagtagcttgttgagt 7527358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 386
Target Start/End: Original strand, 111270 - 111328
Alignment:
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  111270 ctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggatctgatctaggcttagtggtgtc 111328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 281
Target Start/End: Original strand, 5453181 - 5453219
Alignment:
Q  243 accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5453181 accgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgca 5453219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19498252 - 19498188
Alignment:
Q  26 attggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  19498252 attggtgatt-ggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 19498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23512924 - 23512875
Alignment:
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23512924 ctttctctgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 23512875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 283
Target Start/End: Original strand, 24227816 - 24227857
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24227816 gaccacctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgcagg 24227857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 110900 - 110955
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  110900 ttggtgattgtgtatgaataactgttaattgat-attgttcatgatacatgtaattg 110955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 1221522 - 1221578
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  1221522 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 1221578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21647255 - 21647196
Alignment:
Q  151 attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggatta 211  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21647255 attattgatcaaatgcatgatgatt-aattgaaatattcatgttaactgctatttggatta 21647196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 25944474 - 25944530
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  25944474 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattg 25944530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 43445592 - 43445648
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  43445592 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 43445648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3671720 - 3671689
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671720 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 3671689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 272
Target Start/End: Original strand, 11765583 - 11765626
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  11765583 ccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtaga 11765626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 67
Target Start/End: Original strand, 29192581 - 29192611
Alignment:
Q  37 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192581 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 29192611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11340924 - 11340895
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaatt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11340924 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaatt 11340895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16534666 - 16534617
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacat 84  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  16534666 ttggtgattgcgtatgaataactgtgaatagataattgttcatgatacat 16534617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 23236268 - 23236313
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23236268 ccccaatggttttagccacctacctgtctgtatggatgggtagacg 23236313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29912383 - 29912314
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29912383 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggtttggaccatctacctgtctgtatggatgagtagacg 29912314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 9732504 - 9732556
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9732504 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 9732556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37942 - 37604
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  37942 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacttgttattggtg-attattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtata 37844  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37843 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccaa 37746  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  37745 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgccgggttagtcgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 37648  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37647 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggctt 37604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 380
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45976
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  45841 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatat 45938  T
Q  342 cggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  45939 cagtgtttagag-ttagtcggctctaatctaggcttcgt 45976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 13560 - 13899
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13560 ttggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaat-attgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 13656  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13657 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 13754  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  13755 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtacacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 13852  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13853 tccaatatcggtgtttagtgtttagtcggctctgatctagtcttcgt 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7163 - 6900
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  7163 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtg-attattgatgtgagatatcgggattatgagataagtata 7065  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7064 --catgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgacgtaatacttaccccag 6967  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  6966 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtacaggtttagttgcttggtgagt 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 138492 - 138832
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  138492 ttggtgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 138589  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
        ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138590 ag--tatgaaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 138687  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  138688 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagggatagttactcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 138785  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  138786 tccgatgtcggtgtttagattttagttggctctgatctaggcttcgt 138832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 76767 - 76428
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  76767 ttggtgattgtgcatgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 76672  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-- 232  Q
    |  |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  76671 ttgatatatgaatattatta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 76575  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  || | | |||||||  ||| ||||    
T  76574 agtggttttaaccgcgtacctatctgtatggatgggtagacgatgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgagcattggtggatatcgggagcttt 76476  T
Q  333 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  76475 ctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 76428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9940 - 9747
Alignment:
Q  156 tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctg 254  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9940 tgattaagtatatgagttttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctacctg 9841  T
Q  255 tctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||    
T  9840 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtgtt 9747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 19618 - 19729
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgttaact-gttatttggattatga-tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618 ttgaattgaattattcatgcctactatttatatggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggta 19717  T
Q  271 gacgttgtgcag 282  Q
    ||| ||||||||    
T  19718 gacattgtgcag 19729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 29194 - 29305
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgttaact-gttatttggattatga-tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29194 ttgaattgaattattcatgcctactatttatatggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggta 29293  T
Q  271 gacgttgtgcag 282  Q
    ||| ||||||||    
T  29294 gacattgtgcag 29305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10076 - 10007
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtga 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  10076 tgattgtgtatgaataaatgtgatttgatgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtga 10007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26982 - 26708
Alignment:
Q  111 tattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggatt 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26982 tattggggatatgatataaatatatacatatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggact 26883  T
Q  211 atgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctg 309  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||    
T  26882 atgttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttctgtg 26784  T
Q  310 cttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    ||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26783 ctt-gatggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttcgagtttagtcggctctgatctaggctttgttatgtc 26708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 256646 - 256984
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  256646 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtata 256743  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256744 tg--tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 256841  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| | || ||||||||  ||||   |||||||||    
T  256842 gtggttttaaccacctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgtttggtgagt-tcttgtgcttggt--gataccgggatctttc 256937  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  256938 tccggtatcggtgtttagagttagattggctctgatctaggcttcgt 256984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 72247 - 72440
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  72247 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccctagttgttttaaccg 72344  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||   ||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  72345 cctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtag-tgcttcgtgag---tttgtgcttgg--ggatatcgggagctttctccgatatcggtg 72438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 125228 - 125421
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  125228 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttagattatgatgatgtattacttacacccaatggttttaaccg 125325  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  125326 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtg 125419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 192838 - 192646
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgc 247  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  192838 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccctagtggttttaactgc 192741  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  192740 ctacctgtctgtgtggataggtagacgttgtgcaggagtagtt-cttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcggtgt 192647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 76628 - 76821
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  76628 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcttgataactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccctagttgttttaaccg 76725  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||   ||| |||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  76726 cctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggagtag-tgcttcgtgag---tttgtgcttgg--ggatatcgggagctttctccgatatcggtg 76819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28632 - 28298
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||  | | ||||| ||||| ||    
T  28632 ttggtgtttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtg-attattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtcta 28534  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28533 tg--tatgagaatattattgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 28436  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  28435 gtggttttgactgcctaactgtctgtatggattggtagacgttttgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 28338  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctag 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28337 tccgatatcggtgtttacagtttagtcggctctgatctag 28298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21042 - 20716
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  21042 ttggtgtttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtg-attattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtata 20944  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| |||||||||| || ||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20943 tg--tatgagaatattattgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 20846  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              ||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||| |||||    
T  20845 gtgcttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt-gacgttgt--------------ttggtgagt-ttttgtgcttgg-tagatatcgggagctttc 20763  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20762 tccgatatcggtgtttagagtttagtcagctctaatctaggcttcgt 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Original strand, 130017 - 130209
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  130017 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgttaaatgctatttggattctgataatgtaatacttaccccaagtggttttaaccg 130113  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  130114 cctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctacgatatcggtg 130207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 68781 - 68438
Alignment:
Q  31 tgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  68781 tgatttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataag 68682  T
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-c 229  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |    
T  68681 tattta--tatgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgacataatacttacc 68584  T
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||   |||     
T  68583 cccagtggttttgactgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtgagtcttttgtgcttgg-tggataccgggag 68485  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctagg 374  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||    
T  68484 ctttctccggtatcggtgttgtagagtctaggaggctctgatctagg 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30488 - 30185
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacata 140  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||  | |||||||||| |||| ||| ||||  ||| | ||||||        
T  30488 attgtgtgtgaataaatgtga-ttgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgattgattgatgtgagatatggggattatagtatgaatatata---- 30394  T
Q  141 tgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggt 238  Q
    ||||| ||||||||| | || || | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30393 tgtga-tattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaattattatatagattatgatgatgtaatacttacccctagtggt 30295  T
Q  239 tttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccg 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||||||  ||| || ||||||    
T  30294 tttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttctttgtgcttgg-gggatatcgggagctatctccg 30196  T
Q  338 atatcggtgtt 348  Q
     ||||||||||    
T  30195 gtatcggtgtt 30185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 99024 - 99120
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  99024 ttatgtggattatgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 99120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 380
Target Start/End: Original strand, 7098 - 7444
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7098 tttggtgattgtgtgtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtat 7196  T
Q  134 atac----atatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta- 228  Q
    |||     ||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7197 atatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgtaatacttac 7296  T
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||     
T  7297 ccccggtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggag 7392  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  7393 ctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcggttctgatctaggcttcgt 7444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12332
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattgggg--ttatgatataagta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||  || |||| ||||||    
T  12678 ttggtgattgtgtatgaataattttgaattaatgtt-gttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagta 12580  T
Q  133 tatacatatgt----gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta 228  Q
    |||| |||| |    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12579 tatatatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta 12480  T
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||  |||| ||||||| |||||||  | |     
T  12479 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacattgtgcaggagtag-tgtttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggaag 12384  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12383 ctttctccgatatcggtgtttagtgtttagtcgactctgatctaggcttcgt 12332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26631 - 26287
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||     
T  26631 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attatgaatgtgagatattggggtt--gatgtaagtatt 26535  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-ccca 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26534 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttactccaa 26437  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  26436 gtggatctgtgatggaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatgggga 26339  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26338 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtgggctctgatctaggcttcgt 26287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 348
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15394
Alignment:
Q  58 gtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattg 157  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||  |  ||||     ||||||||||    
T  15116 gtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatt-attattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagtattaatgtatg-----attattattg 15208  T
Q  158 atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttgaccgcctacctgtc 256  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||    
T  15209 atcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacctccaatgattttaaccgccgacctgtc 15308  T
Q  257 tgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    | || | |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15309 tatacgaatgggtagacgttgtgcatgagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatattgggagctttctccgatatcggtgtt 15394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 301
Target Start/End: Original strand, 24243 - 24363
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24243 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtagtgctcacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 24342  T
Q  282 gggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||  |||||||| ||||||||    
T  24343 ggattagttgctctggtgagt 24363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18941 - 18876
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18941 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 18876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 465 - 118
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| || | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  465 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtg-attgttgaggtaagatattggggttttgatgtaagtata 367  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  366 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 267  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||  ||     
T  266 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctatatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-ttttgtgattgg-tggatatcgggg 169  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  168 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3237 - 2955
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  3237 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 3139  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3138 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccag 3041  T
Q  235 tggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    ||| |      | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3040 tggatctgtgatggaccgcctgcctgcctgtatggatgggtagacgttatgcaggattagttgcttggtgagt-ttttgtgcttggt 2955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 236593 - 236327
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  236593 ttggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtcagatattggggttc-gatgtaagtata 236496  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  236495 tg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgtaatacttatcccta 236398  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtctt 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  236397 gtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgctgtgcagggatagttgcttggttagtctt 236327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 270448 - 270163
Alignment:
Q  98 tattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  270448 tattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaac 270352  T
Q  198 tgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  270351 tgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagat 270252  T
Q  291 gcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  270251 gcttggtgagt-ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 270163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 236099 - 236044
Alignment:
Q  331 ttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  236099 ttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgtggtgtc 236044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 236324 - 236269
Alignment:
Q  331 ttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgtgatgtc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  236324 ttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctctgatctaggcttcgtggtgtc 236269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 236666 - 236600
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgat 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||    
T  236666 tgtgattggtgatt-ggtgattgtctatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgat 236600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Original strand, 113970 - 114307
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  113970 ttggtgattgtgtataaataactatgatttggtgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatt 114069  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  114070 ta--tatgtgaatatt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgtaatacataccccca 114164  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||    
T  114165 gtggttttgaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgatgtgcaggagtagttgctctggtgagtcttttgtccttgg-tggatatcgggagcttt 114263  T
Q  333 ctccgatatcggtgtt-tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  114264 ctccgatatcagtgttgtagagtctaggtggctctgatctaggc 114307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 108069 - 107826
Alignment:
Q  62 attgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattatt-gatc 160  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |  || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||     
T  108069 attgatggttgttcatgatccatgtgattgatgattgcttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatatatatggatattattatttgatt 107970  T
Q  161 aagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctg 258  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  107969 aagtatatgatattcgaattgatctattcatgtttaactgatatgcggattatgatgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctg 107870  T
Q  259 tatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    |||  |||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  107869 tattaatgggtagacgtggtgcatgattagttgctctggtgagt 107826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Original strand, 106708 - 106838
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  106708 ttgaattgctttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccaatgattttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtag 106807  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  106808 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagt 106838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Original strand, 59286 - 59435
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  59286 ttaattgttgtttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgcaggagtag-tg 59384  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    || ||||||||||   ||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59385 ctcggtgagtctt---tgcttg---ggatattgggagctttctccgatatcggtgtt 59435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 130215 - 130138
Alignment:
Q  206 ggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  130215 ggattatgattgatgtaaagcttaccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagg 130138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7148
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  6999 ttaattgttgtttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgcaggagtag-tg 7097  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    || ||| ||||||   ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  7098 ctcggttagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 7148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 505 - 847
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  505 ttggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattaatatgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 600  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  601 ttgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccca 697  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  698 gtggatctgtgatggaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 795  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  796 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31218 - 30882
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||     
T  31218 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtt--gatgtaagtatt 31122  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31121 tt--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccaa 31024  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    |||| |      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  |||    
T  31023 gtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatccgga 30930  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  30929 gctttctccgatatcggtgtt--gggtttagtcgactctgatctaggctt 30882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 4650 - 4992
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  4650 ttggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 4747  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4748 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 4845  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    || | |      | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  4846 gtagatctgtgatggaccgactgcctatctgtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 4943  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4944 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctcttatctaggctt 4992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 49490 - 49832
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  49490 ttggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 49587  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49588 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 49685  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    || | |      | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  49686 gtagatctgtgatggaccgactgcctatctgtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcggga 49783  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  49784 gctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcggctcttatctaggctt 49832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4258 - 3950
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |   | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  4258 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatg 4159  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    ||  |||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4158 ta--tatgtgaatactatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgtaataattaccccag 4064  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||  ||||    
T  4063 tggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgtagcagtagttgctctggtgagtcttttgtgcttgg-tggatatcgggagttttc 3965  T
Q  334 tccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||    
T  3964 tccgatatcggtgtt 3950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 2477 - 2746
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  2477 ttggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaat-attgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 2574  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2575 ga--tttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgtaatacttaccccca 2672  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  2673 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtagcttggtgagt 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4613 - 4272
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||       |||||| ||  | |||||||||| ||||||||  ||    
T  4613 tgtgattggtgatt-ggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatg-------tgattggtgattaattgatgtgagatattgggagta 4522  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4521 tgatgtaagtattga--tatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgta 4424  T
Q  222 atacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggata 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  4423 atacttaacccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtggagagttagttgctcggtgagt-ttttgtgcttgg-tggata 4326  T
Q  322 ttaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  4325 tcgggagctttctacgatatcggtgtatagagtctaggtggctctgatctaggc 4272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 1132 - 1464
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||     
T  1132 ttggtgattgggtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaat-attgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagtatt 1229  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
     |  || |||||||||      |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1230 ga--tacgtgaatatt------gatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgtaatacttaccccca 1321  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttc 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||    
T  1322 gtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttc 1417  T
Q  334 tccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  1418 tccgatatcggtgtttagtgtttagttggctatgatctaggcttcgt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 380
Target Start/End: Original strand, 3925 - 4171
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3925 tatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgtaatacttacc 4024  T
Q  231 cc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatc 329  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  4025 cctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggttgggtagacgttgtgcaggggtag-tgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcaggagc 4120  T
Q  330 tttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4121 tttctccgatatcgatgtttagtgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 4171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 141
Target Start/End: Original strand, 3797 - 3899
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgttt-gttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||     
T  3797 tgatggtgtgtgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatat 3895  T
Q  138 atat 141  Q
    ||||    
T  3896 atat 3899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 77781 - 77434
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||    
T  77781 ttggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgg-ttatggatgtgagatattagggtttttgatgtaagtat 77683  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  77682 atg--tatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgatataatacttaccccc 77585  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   |    
T  77584 agtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagtcgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgag 77487  T
Q  327 atctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  77486 agctttcttcgatatcggtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 77434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  70 ttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattgggg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28133 - 27864
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggt-tatgatataagtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  28133 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtgtttgatgtaagtat 28035  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28034 atg--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccc 27937  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  27936 agtggatctatgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttgtttggtga 27864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28183 - 28131
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  28183 tgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattg 28131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28242 - 28182
Alignment:
Q  34 tttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatg 94  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||    
T  28242 tttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatg 28182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27820 - 27770
Alignment:
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  27820 ctttctccgatatcggtgtttagag-ttagtcgactctgatctaggattcgt 27770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 156195 - 156541
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||     
T  156195 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtg-attattgatgtgagatattggagtt-tgatgtaagtatt 156292  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  156293 ga--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccag 156390  T
Q  235 tgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggat 328  Q
    |||      | | |||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||  |||     
T  156391 tggatctgttatggaccgcctacttgcctgtatcggtgagtagacgttgtgcaggtttagttgcttgatgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggag 156488  T
Q  329 ctttctccgatatcggtgtttag-agtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  156489 ctttctctgatattggtgtttagttatttagtcggctctgatctaggcttcgt 156541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 380
Target Start/End: Original strand, 86081 - 86313
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg------ac 244  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||      ||    
T  86081 ttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggac 86180  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcgg 344  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  86181 cgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttatgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcgg 86278  T
Q  345 tgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  86279 tgttta-aaattagtcggctctgatctaggcttcgt 86313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 92300 - 92123
Alignment:
Q  172 gtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 270  Q
    |||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  92300 gtttaaatttaaatatttatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggta 92201  T
Q  271 gacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttta 350  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||    
T  92200 gacgctgtgcaggaatagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtgttta 92123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 11121 - 11205
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  11121 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34627 - 34552
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  34627 tggattatgataatgtaatgcttacccccagttgttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 34552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 53388 - 53447
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  53388 gaccgcctgcctatctgtttggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 53447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 156067 - 156123
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  156067 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 156123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 58581 - 58640
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  58581 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtaaacgttgtgtaggtttagtagcttggtgagt 58640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30832 - 30549
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  30832 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtg-attattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 30734  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30733 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccca 30636  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    |||| |      | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30635 gtggatctgtgatggaccgcctgcctgtctgtatggattggtagacgttatgcaggattagttgcttggtgagt-ttttgtgcttggt 30549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44467 - 44343
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  44467 aattgaattattcaagataattgttatttggattatgatgatgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgt 44368  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  44367 tgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 44343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3089 - 2825
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||||||  ||  |||||| |||||    
T  3089 ttggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtg-actattgctgtgagatattggaattgggatataggtata 2991  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    |   |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2990 tt--tatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 2893  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  2892 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttcttggtgagt 2825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26820
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcc 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgtaatacttaccctgagtggttttaaccgcc 26689  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| | | |||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  26690 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctcggtgagt-ttttgtgcattggtggatatcgggagttttctccgatatcggtgtt 26788  T
Q  349 tagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26789 tagagtttagtcggctctgatctaggcttcgt 26820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 66397 - 66674
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||| |||||| | |||    
T  66397 tgtgattggtgattggga-attgtgtatgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagatta 66495  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66496 tgatgtaagtattga--tatgtgaatattattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgta 66593  T
Q  222 atacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtc 302  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  66594 atacttaccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgcttggtgagtc 66674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 26502 - 26572
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26502 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgat-gattattgatgt 26572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17917 - 17602
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  17917 ttggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtg-attattaatgtgaggtattgggataatgatataagtata 17819  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17818 ta--tatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgtaatacttaccccca 17721  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
     ||| |      | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  17720 ttggatctgtgatggaccgcctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgtttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 17624  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgttt 349  Q
     ||  ||||| |||||||||||    
T  17623 gctacctccggtatcggtgttt 17602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 384
Alignment:
Q  46 gtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |||| ||    
T  705 gtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tatgaga 610  T
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgacc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  609 atattattattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgtaatacataccccagtggttttatct 510  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||| | | |||||||  ||| ||||||| |||||| ||    
T  509 gtctgtctgtctgtatggataggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag--ttttgtgcct-gatggatatcgggagctttctctgatatcagt 414  T
Q  346 gtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  413 gtt--gagtttagtcggctctgatctaggctt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17704 - 17404
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  17704 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 17609  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
    |  |||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  17608 ttgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtagtacttaccctag 17512  T
Q  235 tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttct 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||    
T  17511 tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttct 17418  T
Q  335 ccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||||    
T  17417 ccgatatcggtgtt 17404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19734 - 19545
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  19734 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 19639  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc 231  Q
    |  |||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19638 ttgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtagtacttaccc 19545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8561
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtttt 241  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggtttt 8561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13950
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtttt 241  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgtaatacttacccccagtggtttt 13950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19874 - 19806
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  19874 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattg 19806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33568 - 33331
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  33568 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagtat- 33472  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
             ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  33471 ---------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttaccccca 33381  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  33380 gtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 33331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Original strand, 39276 - 39513
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||     
T  39276 ttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattgggatt-tgatgtaagtat- 39372  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
             ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  39373 ---------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatgcttaccccca 39463  T
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  39464 gtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 39513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36422 - 36331
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36422 ttaactgctgtttggactatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcagg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144859
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgtaatacttaccccagtggttttaaccg 144961  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| |||||||    
T  144960 cctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 144862  T
Q  346 gtt 348  Q
    |||    
T  144861 gtt 144859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 145342 - 145231
Alignment:
Q  38 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    ||||||||||  ||||| | | ||| |||||||||||      
T  145342 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtg----attgatgtgaggtattgagatcatggtataagtatat-- 145249  T
Q  138 atatgtgaatattattat 155  Q
    ||||||||||||||||||    
T  145248 atatgtgaatattattat 145231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16949 - 16607
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  16949 ttggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggt-gatcattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--ta 16854  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccca 233  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16853 ttgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgacgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttagattatgataatgtactacttaccccca 16756  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  |||    
T  16755 gtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagatgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctgga 16658  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16657 gctttctccaatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 16607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20660 - 20598
Alignment:
Q  316 tggatattaggatctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20660 tggatatctggagctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 20598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56138
Alignment:
Q  43 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||     
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtatatatttat- 56273  T
Q  143 tgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt-- 239  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |      
T  56272 -----------attgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccctagtggatct 56184  T
Q  240 ----ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56183 gtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 56138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 56408 - 56369
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatg 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56408 tgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15029 - 14837
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  15029 ttggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 14931  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc 232  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14930 t--atatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccc 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4141 - 3984
Alignment:
Q  148 attattat-tgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggtt------ 239  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  4141 attattatctgattaagtacatgatatttgaattgatttattcatgtttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagtggatcagtga 4042  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtc----tgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    | |||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4041 tggaccgcctacctttctttatggatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Original strand, 90814 - 91119
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  90814 ttggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaat-attaatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 90912  T
Q  135 tacatatgt--------------------gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatga 214  Q
    ||||||| |                    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90913 tacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatga 91012  T
Q  215 tgatgtaatactta-ccccagtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||     
T  91013 tgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttgcttggtgagt-ttttg 91111  T
Q  308 tgcttggt 315  Q
    ||||||||    
T  91112 tgcttggt 91119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 78064 - 77884
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  78064 ttgaattgttttattcatgcctaactgctatgtggattatgatgatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtattgatgagtag 77965  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgag-tcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttta 350  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| |  ||  ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||    
T  77964 acgttgtgcagcattagttgctctggtgagttggttgatgcttgggtggatatcgggagctatctccggtatcggtgttta 77884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Original strand, 70167 - 70239
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  70167 ccccattggttttgaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtcgcttggtgagt 70239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 90686 - 90742
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  90686 ttggagattgtgtaagaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 90742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 128792 - 128736
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  128792 ttggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattg 128736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Original strand, 75542 - 75759
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggtta 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  75542 tgtgattggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggtta 75640  T
Q  122 tgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgta 221  Q
    |||| ||||||||||  ||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75641 tgatgtaagtatatatttatg------------acgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgta 75728  T
Q  222 atactta-ccccagtggttttgaccgcctac 251  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  75729 atacttacccccagtgattttgaccgcctac 75759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 375
Target Start/End: Original strand, 78251 - 78375
Alignment:
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| | ||    
T  78251 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgcttggtgagt-tttcgtgcttggtt-gatatcgggagctttctccgatatcgatttt 78348  T
Q  349 tagagtttagtcggctccgatctaggc 375  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||    
T  78349 tcgagtttagtcggctctgatctaggc 78375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Original strand, 79948 - 79997
Alignment:
Q  316 tggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctc 365  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79948 tggatatcgggagctttctccgatatcggtgtttagagtttagtcggctc 79997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 166982 - 167041
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  166982 gaccgcatgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 167041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 166444 - 166503
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  166444 gaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgccggtttagtagcttggtgagt 166503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 141148 - 141205
Alignment:
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||    
T  141148 gttttgaccacctacctgtttgtatggatgggcagacgaagtgcaggattagttgctt 141205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1829 - 1570
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||  ||| | ||||||      
T  1829 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattatagtatgaatatata-- 1732  T
Q  139 tatgtgaatattattattga-tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtgg 237  Q
      ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1731 --tgtga-tattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccccagttg 1635  T
Q  238 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||    
T  1634 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctctggtgagt 1570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 380
Target Start/End: Original strand, 13118 - 13255
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatat 341  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||| | || ||||||||| |||||   || |||||||||||||    
T  13118 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcagatttagttacttggtcagt-tcttgtgcttggtt-gatatcgagagctttctccgatat 13215  T
Q  342 cggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13216 cggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggcttcgt 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7280
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattgggg-ttatgatataagtat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||    
T  7619 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggt-gattattgatgggagatattggggtttttgatgtaagtat 7521  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    ||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||    
T  7520 at--gtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactg---------ttatgatgatgtaatacttaccccc 7432  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagg 326  Q
    ||||| |      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||||  |||||  ||    
T  7431 agtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt-tcttgtgcttggt--gatatcggg 7335  T
Q  327 atctttctccgatatcggtg-tttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    | ||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  7334 agctttctccggtatcggtgatatagagttagattggctctgatctaggcttcgt 7280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7747 - 7691
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7747 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 7691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7916 - 7848
Alignment:
Q  22 tgtgattggtgatttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  7916 tgtgagtggtgatt-ggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattg 7848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Original strand, 21645 - 21834
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  21645 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtata 21743  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactt 227  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21744 ta--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgtaatactt 21834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 24604 - 24663
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24604 gaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgcttggtgagt 24663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 4533 - 4851
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||||   |||| | | ||| |||| |||||    
T  4533 ttggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagtcattgagatcatggtatatgtata 4632  T
Q  135 tacatat--------gtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatact 226  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4633 tatatatatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaagtta-aattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgtaatact 4731  T
Q  227 tacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattag 325  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |    
T  4732 tacccctagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgcttggtgagt-tcttatgcttgg-tggatattgg 4829  T
Q  326 gatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    || || |||| | |||||||||    
T  4830 gagctatctctggtatcggtgt 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16213
Alignment:
Q  151 attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttg------a 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||      |    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccaagtggatctgtgatgga 16346  T
Q  244 ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcg 343  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16345 ccgcctgcctatctgtatggatgggtagaggttgtgcaggattagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcg 16249  T
Q  344 gtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16248 gtgtttagag-ttagtcggctctgatctaggcttcgt 16213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23187 - 22952
Alignment:
Q  69 tttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacat 168  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23187 tttgttcagaacacatgtgattgatg-attattaatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtattga--tatgagaatattattattgatcaagtgcat 23092  T
Q  169 gatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtat 261  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |      | |||||||| ||| |||||||    
T  23091 gatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccaagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtat 22992  T
Q  262 ggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  22991 ggatgggtagaggttgtgcaggattagatgcttggtgagt 22952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7346 - 7170
Alignment:
Q  173 tttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7346 tttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 7247  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||    
T  7246 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagttctttgtgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtgtt 7170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29818 - 29553
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  29818 ttggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtg-attattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaagtatt 29721  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccag 234  Q
     |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  29720 ga--tttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttattttgattatg-ttatgtaatacttacccccg 29624  T
Q  235 -------tggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
           || | | |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  29623 gtggatctgttatggaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtatcttggtg 29553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 164
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttg---- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||        
T  400 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgttat 301  T
Q  243 --accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  300 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggaactttctccgata 203  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  202 tcggtgtttaga-attagtcggctctgatcttggcttcgt 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5427 - 5251
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427 tatatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 5329  T
Q  231 cc-agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    || ||||| |      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  5328 ccgagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggattagttgtttggtgagt 5251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5663 - 5607
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5663 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5480
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgatt 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5531 tgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 703 - 647
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  703 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattg 647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15402
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 15266  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||   || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  15267 ggaccgcctgcctatctgtatggataggtagacgttgtgcaggattagatgcttgatgagt-aattgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgata 15364  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15365 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 15402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8427 - 8258
Alignment:
Q  180 tgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8427 tgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgctgt 8328  T
Q  279 gcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8327 gcaggagtagttgctatggtgagtcttttgtgctt-gatggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 8258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 8556 - 8503
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||    
T  8556 ttggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtga 8503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Original strand, 14075 - 14236
Alignment:
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggtt 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14075 tgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttacccccagtggtt 14174  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  14175 ttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttggtcggtgagt 14236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Original strand, 13926 - 14031
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  13926 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatgttgggattgtggtataagtata 14024  T
Q  135 tacatat 141  Q
    || ||||    
T  14025 tatatat 14031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15753 - 15641
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||    
T  15753 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tg 15655  T
Q  292 cttggtgagtcttt 305  Q
    || |||||||||||    
T  15654 ctcggtgagtcttt 15641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 30957
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg---tttt-- 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||      
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatcttttat 31093  T
Q  242 -gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | | || ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||    
T  31092 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaaatgcttggtgaat-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccaata 30995  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30994 tcggtgtttagatgtttagtcggctctgatctaggctt 30957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13085
Alignment:
Q  95 gattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12990 gattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgc--atgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 13116 - 13216
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggttttg------accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13116 gattatgttgatgtaatacttaccgccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgca-ggatagtagcttggtga 13214  T
Q  300 gt 301  Q
    ||    
T  13215 gt 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31392 - 31363
Alignment:
Q  38 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31392 gtgattgtgtatgaataactgtgaattgat 31363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 3217 - 3453
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||||| | ||||| ||| | ||||||      
T  3217 tgattgcgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatggtatgaatatata-- 3314  T
Q  139 tatgtgaatattattatt-gatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtg 236  Q
      |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3315 --tgtggatattattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtgatacttacccccagtg 3412  T
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3413 attttgacggcctacctgt-tgtatggatgggtagacattgt 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6762
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6937 ttgaattgacttattcatgttaactgttatatggattatgatgatgtaatacttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 6838  T
Q  274 gttgtgcagggatagttgctt-ggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttt 349  Q
    | ||||||||| |||||| || |||||||  ||  ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||    
T  6837 gatgtgcaggggtagttgtttcggtgagtgattgatgcttgg-tggatatcgggagctacctccgatatcggtgttt 6762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 2911 - 3248
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||        |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||     
T  2911 ttggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtg-tgatgtaagtat- 3001  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-a 233  Q
    || || |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3002 ta-atgtgtga---ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccta 3097  T
Q  234 gtgg------ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattagga 327  Q
    ||||      | | ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||    
T  3098 gtggatctgttatggaccgtctgcctatctgtatgtatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgag--ttttgtgcttgg-tggatatcggga 3194  T
Q  328 tctttctccgatatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3195 gctttctccgatatcggtgtttagatgtttagtcggctctgatcaaggcttcgt 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25713 - 25454
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||         
T  25713 tgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatg-attattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtattgt-- 25617  T
Q  139 tatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | || |||||   ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  25616 tatgtgaatatttttattgatcagatgcacgatgt---aattgaaatgttcttgataactgttatttggattatgataatgtaatgcttacccccagtgg 25520  T
Q  238 ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||    
T  25519 ttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgctgtgcaggaatagt--ctcggtgagtcttt 25454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 377
Target Start/End: Original strand, 376 - 611
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||      | |    
T  376 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggatctgttat 475  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   || ||||||||||||    
T  476 ggaccgcctgcctatctgtatggataggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgagagctttctccgata 573  T
Q  341 tcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  574 tcggtgtttagatgttttgtcggctctgatctaggctt 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 377
Target Start/End: Original strand, 45 - 268
Alignment:
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgac 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  45 atattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtaatacttacccccagtggtcttaac 144  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcgg 344  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  145 cccctacctgtctatatggatgggtagatgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcgg 238  T
Q  345 tgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  239 tattgag---ttagtccgctccgatctaggctt 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 377
Target Start/End: Original strand, 6509 - 6732
Alignment:
Q  146 atattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgac 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  6509 atattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgtaatacttacccccagtggtcttaac 6608  T
Q  245 cgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcgg 344  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  6609 cccctacctgtctatatggatgggtagatgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccgatatcgg 6702  T
Q  345 tgtttagagtttagtcggctccgatctaggctt 377  Q
    | || ||   |||||| ||||||||||||||||    
T  6703 tattgag---ttagtccgctccgatctaggctt 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 6422 - 6492
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6422 ttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4272 - 4227
Alignment:
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4272 ctacctgtctgtatgaatgggtagaagttgtgcaggattagttgct 4227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10738 - 10693
Alignment:
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10738 ctacctgtctgtatgaatgggtagaagttgtgcaggattagttgct 10693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 7)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53997 - 53808
Alignment:
Q  152 ttattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgccta 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53997 ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgccta 53900  T
Q  251 cctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||   ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  53899 cctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tggttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcaggagctttctccgatatccgtgtt 53808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 109909 - 109965
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  109909 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 109965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 106446 - 106541
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  106446 ttatgtggattataatgatgtaatgcttacccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtattgatgggtagacgctgtgtaggattagttgctt 106541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Original strand, 29340 - 29431
Alignment:
Q  208 attatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  29340 attatgttgatgtaatactcacccccattggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaagactagtagcttggtg 29431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 121836 - 121898
Alignment:
Q  228 accccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagtt 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  121836 acccaagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagaaggagtgcaggaatagtt 121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 110244 - 110303
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  110244 gaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggattagtagcttggtgagt 110303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Original strand, 101669 - 101715
Alignment:
Q  237 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  101669 gttttgaccgcttacttgtcggtatggatgggtaaacgttgtgcagg 101715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 876 - 640
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  876 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 777  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgata 340  Q
     ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||   || ||||||||||||    
T  776 ggaccgtctgcctatctgtatggataggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgtgagctttctccgata 679  T
Q  341 tcggtgtttagagtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  678 tcggtgtttaga-attagtcggctctgatctaggcttcgt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 7045 - 7178
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgc 247  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7045 attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccagtggttttaaccgc 7142  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7143 ctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagg 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 9942 - 10210
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |     
T  9942 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtgagatattggggtt-tgatgtaag--tg 10037  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-ca 233  Q
    |  || || ||||| |||||| ||| |||| ||||||| || |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10038 ttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgtaatacttacccaca 10136  T
Q  234 gtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     ||| |      | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10137 atggatctgtgatggaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt 10210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 292
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7562
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgacc 245  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttaccctcaatggttttgatc 7515  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgc 292  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  7516 gcctacctgtttgtatggataggtagacgttgtgcaggattagttgc 7562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 94485 - 94335
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  94485 ttggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattaatatgagatattgggattatgatataattata 94387  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattatt 188  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94386 t--atatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 94238 - 94179
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  94238 gaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgcttggtgagt 94179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 67284 - 67390
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggt 297  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  67284 ttatatggattatgataatataatgcttaccccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggt 67382  T
Q  298 gagtcttt 305  Q
    ||||||||    
T  67383 gagtcttt 67390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37563
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaacca 37600  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37599 cctacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcagg 37563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 19417 - 19553
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19417 attattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgtaatactaacccccagtggttttaaccg 19516  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19517 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 19553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 315
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2608
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgacc 245  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgtaatacttacccctagtggttttaaca 2537  T
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtcttttctgcttggt 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  2538 gcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttctttatgcttggt 2608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1176
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgc 247  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1368 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgtaatacttaccctagtggttttaaccgc 1271  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||| ||||||||  |||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  1270 ctacttgtctgtgtggattggtagacgttgtgcaggagtagtt-cttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagttttctccgatatcggtgt 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Original strand, 249224 - 249517
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtata 134  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||       ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||     
T  249224 ttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattaatg-attattgatgtgagatattggggtg-tgatgtaagtat- 249313  T
Q  135 tacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaat-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc- 232  Q
    || || |||||   |||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  249314 ta-atgtgtga---ttattattgatcaaattcctgatgtt--aattgaaaatattcatgataattgttatttggattatgataatgtaatacttaccccc 249407  T
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatcttt 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||    
T  249408 agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttatgcttggt--gatatcgggagcttt 249501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 35663 - 35758
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  35663 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtataggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagctcggtgagt 35758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 45 - 237
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 142  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   || ||||||||  |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  143 ctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagt-gcttggtgagt---ttgtgcttggt--gatatcgggagccttctccgatatcggtgt 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 1342
Alignment:
Q  149 ttattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc 247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1534 ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgctatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgc 1437  T
Q  248 ctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgt 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   || ||||||||  |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  1436 ctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagt-gcttggtgagt---ttgtgcttggt--gatatcgggagccttctccgatatcggtgt 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31853 - 31647
Alignment:
Q  141 tgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc-ccagtggtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  31853 tgtgaatattattattgatcaagtgcatgaagtta-aattgaaatattcatgtaaa-tgttatgtgggttatgatgatgtaatgcttaccgcccgtggtt 31756  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgat 339  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||  ||| || |||||| |    
T  31755 ttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctcggtgagt-tcttatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggt 31658  T
Q  340 atcggtgttta 350  Q
    |||||||||||    
T  31657 atcggtgttta 31647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31999 - 31932
Alignment:
Q  41 attgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtga 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  31999 attgtgtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtga 31932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27241 - 27036
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta--ccccagtggtt------ 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |          
T  27241 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgtaatacttaccccccagtggatctgtga 27142  T
Q  240 ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgat 339  Q
    | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  27141 tggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgtaagtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatctggagctttctccgat 27044  T
Q  340 atcggtgt 347  Q
    ||||||||    
T  27043 atcggtgt 27036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 106320 - 106195
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgt 275  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  106320 aattgaaatattcaagataattgttatttggattataatgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgt 106221  T
Q  276 tgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||   ||| |||||||||||    
T  106220 tgtgcaggacgagtagcttggtgagt 106195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 66370 - 66451
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||    || ||||||||||||||||    
T  66370 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgta---gtgagtagacgttgtgcagg 66451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2563 - 2387
Alignment:
Q  131 tatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 230  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2563 tatatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaat-attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacc 2465  T
Q  231 cc-agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    || ||||| |      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  2464 ccgagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggattagttgtttggtgagt 2387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2743
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2799 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2927 - 2871
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2927 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 2871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3055 - 2999
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3055 ttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 2999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2616
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgatt 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2667 tgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41105 - 40898
Alignment:
Q  86 tgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaatt 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || || ||||| |||||||   |||||| | ||||||  || ||||| | |    
T  41105 tgattgatggat-attgatgtgaaatattggggtg-tgatgtaagtat-ta-atgtgtgactattatt---gatcaaatgcatgatcatt-aattgtaat 41014  T
Q  186 attcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggg 284  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  41013 attcatgttaactgcaattttgattatgataatgtaatacttatccccagtggttttaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcagga 40914  T
Q  285 atagttgcttggtgagt 301  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40913 atag-tgcttggtgagt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12116 - 12018
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| | || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  12116 ttatttggattatgttgatgtaatactcacccccagtgg-tttgtccgcctgcttgcctgtatgggtaagtagacgttgtccaggaatagtagtttggtg 12018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5293 - 5133
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtgg------ttt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      | |    
T  5293 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgtaatacttacccccagtggatctgttat 5194  T
Q  241 tgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  5193 ggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 217566 - 217699
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccca-gtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  217566 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattga-ttattcatgataactgctatttggattttgataatgtaatacttaccccccgtggttttaaccg 217662  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  217663 cctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 217699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 99438 - 99372
Alignment:
Q  230 cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttgg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  99438 cccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgcatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttgg 99372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21303
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgcagg 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Original strand, 21170 - 21432
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttat-gatataagtat 133  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  21170 ttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatg-attattgatgtgagatattggggtttttgatgtaagtat 21261  T
Q  134 atacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-cccc 232  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21262 atg--tatgagaatattattattgatcaaatgtatgatgtt--aattgaaatattcatgataactactatttggattatgataatgtaatacttaccccc 21357  T
Q  233 agtggtt------ttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||| |      | |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  21358 agtggatctgtgatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgattggtgagt 21432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 21042 - 21098
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21042 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 5005
Alignment:
Q  182 aattattcatgttaa-ctgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5102 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgctaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Original strand, 2881 - 3008
Alignment:
Q  167 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgga 264  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2881 atgatatttgaattgtttcattcatgtttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatgga 2979  T
Q  265 tgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2980 tgggtagacgttgtgcaggaatagttgct 3008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Original strand, 11136 - 11263
Alignment:
Q  167 atgatgtttgaattgaattattcatgtt-aactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgga 264  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11136 atgatatttgaattgtttcattcatgtttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatgga 11234  T
Q  265 tgggtagacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11235 tgggtagacgttgtgcaggaatagttgct 11263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3635 - 3515
Alignment:
Q  182 aattattcatgttaa-ctgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 280  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3635 aattattcatgtttatctgttatgtggattatgatgatgtaatgctaactccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtac 3536  T
Q  281 agggatagttgcttggtgagt 301  Q
    | |  |||||| |||||||||    
T  3535 atgattagttgtttggtgagt 3515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28553 - 28416
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatat 341  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||    
T  28553 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccaatat 28456  T
Q  342 cggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28455 cggtgtttagatgtttagtcggctccgatctaggcttcgt 28416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28897 - 28854
Alignment:
Q  338 atatcggtgtttaga-gtttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28897 atatcggtgtttagatgtttagtcggctccgatctaggcttcgt 28854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Original strand, 5208 - 5319
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208 ttgaattgttttattcatgcctaactgttatgtggaatatgatgatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 5307  T
Q  272 acgttgtgcagg 283  Q
    ||| ||||||||    
T  5308 acgctgtgcagg 5319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9699 - 9609
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9699 tggattatgttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 9609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12434
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  12626 attattattgatcaaatgcatgttgtt--aattga-ttattcatgttaaatgctatttggattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaacag 12530  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtg 346  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  12529 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttggt--gatatcgggagctttctccggtatcggtg 12436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51679 - 51558
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51679 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtgaattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatgaatgggtag 51580  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  51579 acgttgtgcaggattagttgct 51558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8086 - 7951
Alignment:
Q  164 tacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtat 261  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  8086 tacatgatatttgaattga-ttattcctgcttatctgttatttg-attaagttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtat 7989  T
Q  262 ggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtga 299  Q
    || || ||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  7988 gggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctcggtga 7951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 349
Target Start/End: Original strand, 12478 - 12634
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12478 ttaactgttatgtg-attatgatgatgtaatgcttacccccactggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttg 12576  T
Q  292 ct-tggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgttt 349  Q
    ||  |||||||  ||  ||||||| |||||||  ||| || |||||| |||||||||||    
T  12577 ctccggtgagt-attgatgcttgggtggatatcgggagctatctccggtatcggtgttt 12634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29471 - 29349
Alignment:
Q  176 gaattgaattattcatg-ttaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29471 gaattgaattattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtag 29372  T
Q  272 acgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||| |||  |||||||||    
T  29371 acgttgtgtaggattagttgctt 29349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7432
Alignment:
Q  255 tctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtttagagt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||      
T  7310 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgcttggtgagt-tcttgtgcttgg-tggatatcgggagcattctccgatatcggtgtttaga-a 7406  T
Q  355 ttagtcggctccgatctaggcttcgt 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7407 ttagtcggctctgatctaggcttcgt 7432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 251
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72198
Alignment:
Q  147 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttac-cccagtggttttgacc 245  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgtaatacttactcacagcggttttgacc 72192  T
Q  246 gcctac 251  Q
    ||||||    
T  72193 gcctac 72198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6293 - 6042
Alignment:
Q  39 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatggattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatataca 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| | ||||  ||| | |||||       
T  6293 tgattgtgcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtatgaatatatg-- 6196  T
Q  139 tatgtgaatattattattg-atcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaact--------------gttatttggattatgatgatgtaat 223  Q
      ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |              ||||| |||||||||||||||||||    
T  6195 --tgtga-tattattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatgttatgtggattatgatgatgtaat 6099  T
Q  224 acttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6098 acttacccccagtggttttgaccgcctaactgtctgtatggatggttagacgctgtg 6042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 4037
Alignment:
Q  159 tcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtct 257  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  4177 tcaaatacatgatgtt--aattgatttattcaagttaattgttatttggattatgatattgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctactttcct 4080  T
Q  258 gtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  4079 gtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgagt 4037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Original strand, 31510 - 31582
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31510 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggagtagttgcttggtgagt 31582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 199210 - 199298
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  199210 gattatgattgatgtaatgcttaccccagtggttttgacatcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggatagttgctt 199298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33846 - 33723
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  33846 ttgaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctacatgtctgtatggattggt 33747  T
Q  270 agacgttgtgcagggatagttgct 293  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  33746 agacgttgtgcaggattagttgct 33723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4364 - 4274
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4364 ttattcatgtataactgttatgtggattatgatgatgtaaagctcagccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 6751 - 6816
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  6751 ccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagctgctt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 7028 - 7122
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
T  7028 gattatgttgatgtaatgcttaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtccatgattagttgctcggtgagt 7122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1583 - 1506
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 282  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583 gattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcag 1506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 911 - 834
Alignment:
Q  217 atgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  911 atgtaatgcttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaaggttagttgctt 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 5388 - 5521
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5388 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgataaatgctatttggattatgataatgtaatacttacccctagcggttttaaccg 5484  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || | |||||| || ||||||||||||||||    
T  5485 cctacttgccagtatgggtgagtagacgttgtgcagg 5521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13123
Alignment:
Q  148 attattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccg 246  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||    
T  12990 attattatttatcaaatgcatgatgtt--aattga-ttattcatgataaatgctatttggattatgataatgtaatatttacccctagtggttttacacg 13086  T
Q  247 cctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13087 cctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 294
Target Start/End: Original strand, 1926 - 2047
Alignment:
Q  177 aattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1926 aattgatttattcatgtctaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgtctatctgtctgtatggatgggtaga 2025  T
Q  273 cgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  2026 cgttgtgcaggattagttgctt 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Original strand, 11857 - 11996
Alignment:
Q  150 tattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcc 248  Q
    |||||| |||||| | ||||||| || ||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  11857 tattatcgatcaaatgcatgatgatt-aattgtaatattcatgttaactactattttgattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcc 11955  T
Q  249 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagt 289  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  11956 tacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagt 11996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28131 - 27982
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||  ||| ||    
T  28131 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggattag-tg 28033  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    |||||||||||||   ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  28032 cttggtgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 27982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14610 - 14461
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |  ||| ||    
T  14610 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctatatgggtgagtagacgctgtgcatgagtag-tg 14512  T
Q  292 cttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
    || ||||||||||   ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  14511 ctcggtgagtctt---tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 14461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Original strand, 78643 - 78734
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 272  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  78643 ttattcatgtctaactgtttatatggattatgattgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtacggatcggtaga 78734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51342 - 51252
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||    
T  51342 ttaattgttatttggattatgataatgtaatacttaccccagtggttttaaccgcctacttgcctttatgggtgagtagacgctgtgcagg 51252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44381 - 44266
Alignment:
Q  97 ttattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-tta 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||     
T  44381 ttattgatgtgagatattggggttttggtgtaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgattg 44284  T
Q  196 actgttatttggattatg 213  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  44283 actgttattcggattatg 44266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52410 - 52315
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  52410 gattatgttgatgtaatactcaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 52315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52549 - 52435
Alignment:
Q  98 tattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatg-ttaa 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||| || |    
T  52549 tattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcat--gtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgattga 52452  T
Q  197 ctgttatttggattatg 213  Q
    |||||||| | ||||||    
T  52451 ctgttattcgaattatg 52435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44241 - 44146
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  44241 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttttctgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 44146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6040 - 5975
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  6040 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctt 5975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3748 - 3653
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3748 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 3653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 17074 - 17165
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17074 ttaattgttatttgaattatgataatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11795 - 11682
Alignment:
Q  184 ttattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 279  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11795 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgat-taatgcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtg 11697  T
Q  280 cagggatagttgctt 294  Q
    ||||  |||||||||    
T  11696 caggattagttgctt 11682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29651 - 29567
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  29651 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 29567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 15947 - 16003
Alignment:
Q  35 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattg 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15947 ttggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattg 16003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 25415 - 25539
Alignment:
Q  174 ttgaattgaattattcatgt-taactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 269  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25415 ttgaattgatttattcatgtctaactgtttaagtggattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctacctatctgtatggatgcgt 25514  T
Q  270 agacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||| |  |||||||||    
T  25515 agacgttgtgcatgattagttgctt 25539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 15799 - 15890
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15799 ttaattgttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Original strand, 25807 - 25892
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttg 291  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  25807 gattatgattgatgtaaagcttaccccagtggttttgaccgcctacctgttggtatggatgggtagacgaagtgcagagttagttg 25892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3614
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3545 gattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 3614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25867 - 25802
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  25867 ccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaggtgcaggattagttgctt 25802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 347
Target Start/End: Original strand, 331054 - 331153
Alignment:
Q  246 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | || ||||||| ||| |||  ||| || ||||||||||||||    
T  331054 gcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctcggtgagt-tcttgtgcttgg-tggttatcgggagctatctccgatatcggt 331151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 84754 - 84658
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccca-gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  84754 ttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccctaagtggttttgaccgcctacccgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 84658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 348
Target Start/End: Original strand, 197976 - 198102
Alignment:
Q  216 gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttttctgcttgg 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||   ||| ||||||     
T  197976 gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgcttggtgag---tttgtgcttg- 198070  T
Q  315 ttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
      ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  198071 --ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 198102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25203 - 25119
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  25203 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20948 - 20866
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  20948 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 20866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 7016 - 7068
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7016 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctt 7068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37589 - 37505
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  37589 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 37505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5373 - 5314
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5373 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttggtgagt 5314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16243 - 16156
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16243 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggaatagtagcttggtgagt 16156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 67540 - 67635
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  67540 gattatgttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtaggcgttgtgcaggactagtagcttggtgagt 67635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 104265 - 104222
Alignment:
Q  231 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104265 ccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 104222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 25123 - 25228
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  25123 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctactagcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtg 25221  T
Q  299 agtcttt 305  Q
    |||||||    
T  25222 agtcttt 25228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Original strand, 9776 - 9865
Alignment:
Q  193 ttaactgttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 281  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  9776 ttaattgttatttgaattatgataatgtagtacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgca 9865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 911 - 822
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttac-cccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  911 gattatgattgatgtaaagcttacacccagtggttttgaccgcctacctgtctttgtggatgggtagatgaggtgcagggttagttgctt 822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8048
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtg 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  7956 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggattagtcgcttggtg 8048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 294
Target Start/End: Original strand, 1835 - 1903
Alignment:
Q  226 ttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||    
T  1835 ttaccccagaggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgaagtgcaggattagttgctt 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 3433 - 3517
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  3433 ttatctggattatggtaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 75516 - 75421
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  75516 gattatgttgatgtaatactcaccccgagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcatgactagtagcttggtgagt 75421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42094 - 41960
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagtcttt 305  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||      
T  42094 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtag-tgctcggtgagtct-- 41998  T
Q  306 tctgcttggttggatattaggatctttctccgatatcggtgtt 348  Q
      ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  41997 --tgcttg---ggatatcgggagctttctccgatatcggtgtt 41960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17527 - 17429
Alignment:
Q  205 tggattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttga-ccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| || |||||||| || |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17527 tggattatgttgatgtaatactcacccctagtggtttttaaccgtctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgtaggaatagtagcttggtgagt 17429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 289
Target Start/End: Original strand, 9953 - 10041
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatacttaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagt 289  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | || |||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  9953 ttatttgaattatgttgatgtaatactcaccccagtgg-tttgtccgcctgcttgcctgtatgggtaagtagacgttgtgcaggaatagt 10041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36206 - 36144
Alignment:
Q  232 cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  36206 cagtggttttgaccgcctacatttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0725 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0725
Description:

Target: scaffold0725; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7365 - 7324
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7365 agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Original strand, 13254 - 13295
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13254 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacg 13295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11655 - 11586
Alignment:
Q  207 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11655 gattatgattgatgtaaaactaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 22999 - 23044
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22999 ccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatgaatgggtagacg 23044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20432 - 20387
Alignment:
Q  229 ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20432 ccccagtggattttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 294
Target Start/End: Original strand, 2882 - 2962
Alignment:
Q  215 tgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctt 294  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  2882 tgatgtaaagcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtatggatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctt 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 975
Alignment:
Q  242 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1034 gaccgcctgcctatctgtttggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagcttggtgagt 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 411 - 508
Alignment:
Q  204 ttggattatgatgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgcttggtgagt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| | || |||||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  411 ttggattatgttgatgtaatactcaccctcagtggttt-gtccgcctgcttgcctgtatgggtaagtagacgttgtgcaggagtagtagcttggtgagt 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 17945 - 18022
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17945 gattatgataatgtaatgcttacccccaatggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcagg 18022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19626 - 19585
Alignment:
Q  233 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19626 agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgtgtagacg 19585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55778 - 55693
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagg 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||  |||||||    
T  55778 ttatgtggattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtttctatgaatgagtagacgaagtgcagg 55693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Original strand, 118403 - 118444
Alignment:
Q  184 ttattcatgt-taactgttatttggattatgatgatgtaata 224  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  118403 ttattcatgtctaactgttatgtggattatgatgatgtaata 118444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 1435 - 1503
Alignment:
Q  207 gattatgatgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||| || |||||||    
T  1435 gattatgttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctactttcctgtatgggtgagtagacg 1503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Original strand, 45469 - 45509
Alignment:
Q  234 gtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  45469 gtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaataggtagacg 45509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 251
Target Start/End: Original strand, 113537 - 113589
Alignment:
Q  200 ttatttggattatgatgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctac 251  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  113537 ttatctggattatgataatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctac 113589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University