View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8591_low_10 (Length: 393)

Name: NF8591_low_10
Description: NF8591
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8591_low_10
NF8591_low_10
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (26-375)||(19038199-19038548)
chr5 (26-375)||(28238769-28239118)
chr5 (24-375)||(28879268-28879619)
chr5 (26-373)||(30707719-30708066)
chr5 (26-375)||(8577575-8577924)
chr5 (26-325)||(8739-9038)
chr5 (29-375)||(7760012-7760351)
chr5 (29-375)||(38407887-38408226)
chr5 (29-375)||(5199442-5199781)
chr5 (29-375)||(511646-511985)
chr5 (38-375)||(42538477-42538814)
chr5 (53-367)||(8699470-8699784)
chr5 (29-375)||(38970716-38971062)
chr5 (29-392)||(42937675-42938019)
chr5 (53-375)||(15939344-15939666)
chr5 (305-375)||(40623041-40623111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (26-375)||(17423138-17423487)
chr2 (26-375)||(30493997-30494346)
chr2 (26-375)||(5354643-5354992)
chr2 (26-375)||(15833928-15834277)
chr2 (26-375)||(43981193-43981542)
chr2 (26-375)||(43536740-43537089)
chr2 (26-375)||(28471200-28471549)
chr2 (26-375)||(45431177-45431526)
chr2 (26-375)||(39950166-39950515)
chr2 (29-375)||(29398641-29398987)
chr2 (38-363)||(7189497-7189822)
chr2 (29-375)||(10825954-10826293)
chr2 (26-187)||(22680191-22680351)
chr2 (29-371)||(36653536-36653878)
chr2 (46-375)||(7416474-7416803)
chr2 (50-279)||(40538235-40538464)
chr2 (272-375)||(20067493-20067596)
chr2 (317-352)||(22529914-22529949)
chr2 (305-375)||(40538476-40538546)
chr2 (29-103)||(45292545-45292619)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (26-375)||(46401377-46401726)
chr3 (26-375)||(42901192-42901541)
chr3 (26-375)||(46698347-46698696)
chr3 (26-375)||(49141550-49141899)
chr3 (26-375)||(50477809-50478158)
chr3 (26-375)||(54388797-54389146)
chr3 (26-375)||(34048097-34048446)
chr3 (26-375)||(2272088-2272437)
chr3 (26-392)||(36130157-36130523)
chr3 (26-375)||(4005443-4005791)
chr3 (29-375)||(47071219-47071558)
chr3 (70-375)||(599583-599888)
chr3 (64-375)||(17562375-17562686)
chr3 (109-375)||(9473034-9473300)
chr3 (29-375)||(20353216-20353562)
chr3 (29-375)||(41614944-41615282)
chr3 (38-375)||(49266401-49266738)
chr3 (29-375)||(16646183-16646516)
chr3 (38-375)||(44232402-44232732)
chr3 (38-375)||(48565560-48565890)
chr3 (50-375)||(48891213-48891538)
chr3 (29-375)||(42759337-42759676)
chr3 (50-282)||(50758795-50759027)
chr3 (185-375)||(52388630-52388820)
chr3 (26-152)||(52388827-52388953)
chr3 (263-375)||(2648608-2648720)
chr3 (50-375)||(42804993-42805318)
chr3 (29-154)||(51807851-51807976)
chr3 (139-375)||(50214199-50214428)
chr3 (50-375)||(30253126-30253451)
chr3 (26-98)||(3495550-3495622)
chr3 (212-375)||(6927989-6928146)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (30-375)||(27638424-27638769)
chr6 (26-375)||(6203821-6204170)
chr6 (26-375)||(11690788-11691137)
chr6 (26-375)||(30826654-30827003)
chr6 (26-375)||(22303902-22304251)
chr6 (26-375)||(31770746-31771088)
chr6 (38-297)||(26440125-26440384)
chr6 (38-373)||(26172594-26172936)
chr6 (29-375)||(2406918-2407257)
chr6 (50-375)||(24085850-24086177)
chr6 (212-375)||(2406059-2406222)
chr6 (29-375)||(32642567-32642912)
chr6 (50-375)||(18005475-18005800)
chr6 (65-375)||(3384140-3384449)
chr6 (252-348)||(21603282-21603378)
chr6 (317-375)||(32641897-32641955)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (26-375)||(1055198-1055547)
chr8 (26-375)||(23019323-23019672)
chr8 (26-375)||(26662119-26662468)
chr8 (26-375)||(15033801-15034150)
chr8 (26-375)||(22532-22881)
chr8 (26-375)||(42482542-42482891)
chr8 (26-375)||(486769-487118)
chr8 (29-375)||(34367646-34367992)
chr8 (29-375)||(39603963-39604308)
chr8 (26-375)||(43214075-43214405)
chr8 (38-375)||(34819646-34819983)
chr8 (29-375)||(20858688-20859034)
chr8 (29-375)||(41243120-41243447)
chr8 (29-375)||(39831787-39832125)
chr8 (39-375)||(5301343-5301679)
chr8 (53-375)||(45132438-45132760)
chr8 (53-375)||(40075736-40076051)
chr8 (62-375)||(35554303-35554609)
chr8 (29-375)||(21176349-21176695)
chr8 (53-375)||(5679558-5679882)
chr8 (50-375)||(51778-52103)
chr8 (212-373)||(30761310-30761485)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (26-375)||(41883212-41883561)
chr7 (26-375)||(48406030-48406379)
chr7 (26-375)||(9368438-9368787)
chr7 (26-375)||(17460298-17460647)
chr7 (26-375)||(17592567-17592916)
chr7 (26-375)||(35607427-35607776)
chr7 (27-375)||(42504970-42505318)
chr7 (26-375)||(15071319-15071655)
chr7 (26-375)||(17837632-17837974)
chr7 (38-392)||(10521515-10521868)
chr7 (29-375)||(5538587-5538933)
chr7 (26-375)||(13322706-13323055)
chr7 (29-375)||(16680134-16680480)
chr7 (29-375)||(17654370-17654716)
chr7 (29-375)||(27450723-27451069)
chr7 (70-375)||(34741444-34741742)
chr7 (29-245)||(11630427-11630643)
chr7 (53-375)||(47670239-47670561)
chr7 (96-375)||(37342992-37343271)
chr7 (216-375)||(47522013-47522172)
chr7 (29-233)||(11632680-11632884)
chr7 (50-282)||(9491989-9492221)
chr7 (305-375)||(11630317-11630387)
chr7 (50-167)||(36980256-36980373)
chr7 (263-375)||(16488281-16488394)
chr7 (212-282)||(41734630-41734700)
chr7 (339-375)||(41734713-41734749)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (26-375)||(6178840-6179189)
chr4 (26-375)||(41796075-41796424)
chr4 (26-375)||(49168183-49168532)
chr4 (26-375)||(31424412-31424761)
chr4 (26-375)||(1306170-1306521)
chr4 (26-375)||(49093093-49093443)
chr4 (26-375)||(21018628-21018977)
chr4 (26-375)||(40355453-40355802)
chr4 (26-297)||(30723877-30724148)
chr4 (29-375)||(44677020-44677366)
chr4 (29-375)||(50277829-50278175)
chr4 (29-375)||(37016633-37016967)
chr4 (38-375)||(8109835-8110172)
chr4 (53-375)||(10730030-10730352)
chr4 (53-375)||(10943799-10944121)
chr4 (29-323)||(51685810-51686104)
chr4 (38-375)||(50904047-50904377)
chr4 (41-375)||(71624-71958)
chr4 (53-375)||(50020734-50021044)
chr4 (50-375)||(13624569-13624894)
chr4 (29-171)||(50196076-50196218)
chr4 (53-279)||(41931108-41931334)
chr4 (53-363)||(14317308-14317618)
chr4 (38-240)||(46438752-46438954)
chr4 (107-392)||(30706657-30706942)
chr4 (305-375)||(30723777-30723847)
chr4 (252-375)||(50196224-50196351)
chr4 (268-375)||(55278820-55278927)
chr4 (290-372)||(46438956-46439038)
chr4 (97-178)||(21535449-21535530)
chr4 (275-366)||(12891833-12891924)
chr4 (252-348)||(40886693-40886789)
chr4 (29-167)||(40886874-40887012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (26-375)||(3729379-3729729)
chr1 (26-375)||(13637036-13637385)
chr1 (26-375)||(26878388-26878730)
chr1 (26-375)||(19158692-19159041)
chr1 (26-375)||(95132-95474)
chr1 (26-375)||(31780697-31781039)
chr1 (38-375)||(22526686-22527016)
chr1 (29-373)||(19522316-19522653)
chr1 (57-375)||(52804570-52804888)
chr1 (29-364)||(47505016-47505350)
chr1 (41-375)||(11196549-11196883)
chr1 (29-375)||(47660547-47660893)
chr1 (29-375)||(45828251-45828596)
chr1 (50-392)||(49855036-49855377)
chr1 (29-147)||(50341407-50341525)
chr1 (252-375)||(50617929-50618052)
chr1 (188-375)||(21143770-21143950)
chr1 (57-138)||(21143682-21143763)
chr1 (95-375)||(38120195-38120475)
chr1 (50-152)||(35256520-35256622)
chr1 (29-120)||(23273541-23273632)
chr1 (218-375)||(16269827-16269984)
chr1 (277-356)||(23273427-23273506)
chr1 (335-392)||(35256425-35256482)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (29-375)||(12025-12371)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (252-355)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (290-358)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19038548 - 19038199
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038548 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 19038449  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038448 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 19038349  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038348 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 19038249  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038248 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19038199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28239118 - 28238769
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239118 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgcccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28239019  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28239018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 28238919  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28238918 cactcacacgcttaaggcggacgctcgaggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtacactagggtgtctcac 28238819  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238818 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28238769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 375
Target Start/End: Original strand, 28879268 - 28879619
Alignment:
Q  24 aggaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879268 aggaggagcacagagagatccaggacttcgaggagattttctggtattcaggctggatcatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 28879367  T
Q  124 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28879368 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgattgatgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttc 28879467  T
Q  224 ggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 323  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28879468 cgcactcacacgattaaggcggacgatcgggatgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 28879567  T
Q  324 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879568 accctcagatctttccacctctttcaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28879619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 373
Target Start/End: Original strand, 30707719 - 30708066
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707719 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattatgggtggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30707818  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  30707819 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattatgcaggtgttcgttgacttccg 30707918  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  30707919 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 30708018  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30708019 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 30708066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8577924 - 8577575
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577924 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8577825  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||  |||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  8577824 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagatcccattcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 8577725  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  8577724 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 8577625  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8577624 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 8577575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9038 - 8739
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattttggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8939  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8938 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccgccgcctcccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 8839  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8838 cactcacacgcttaaggcagacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcac 8739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 7760012 - 7760351
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760012 gagcacagggagatccaagactttgaacaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 7760111  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7760112 tgaggcagtgcgaatacgtccagaccatccccagacatctaacggatgttgtagacctgccaccgctttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 7760211  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  7760212 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 7760304  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7760305 caaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 7760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38408226 - 38407887
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38408226 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 38408127  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38408126 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccatacatctaacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 38408027  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  38408026 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 38407934  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38407933 tagatcttgccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38407887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 5199442 - 5199781
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199442 gagcacagggagatccaggattttgaagaggttttctggtattcaggctgaattatgtgcgatgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 5199541  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  5199542 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcaaattgtgtaggcattcgtcgacttccgcac 5199641  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  5199642 tcacacgtttaaggcggccgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 5199734  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5199735 cagattttgccatctcttctaggagatcttccgaggccagcaaatga 5199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 511985 - 511646
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  511985 gagcacagggagatctaggattttgaggaggttttctggtattcatgctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 511886  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||||   || || |||||||||   ||||| |||   ||| |||||||| ||||    
T  511885 tgaggcagtacggatacgtccagagcgtccctagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtacaggcattcatcgacttccgcac 511786  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| | ||||       ||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  511785 tcacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagaatacat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 511693  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  511692 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 42538477 - 42538814
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538477 gagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 42538576  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    ||| ||| || |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || ||||| |||   |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||    
T  42538577 acgaatatgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccacctcagattgtgcaggcatttgtcgacttccgcactcacacgct 42538676  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    ||  |||  ||   ||||||||||||||  |||| ||| |||   |  || ||||||||||||  | |||||| |||  |||| |||||||||||| |||    
T  42538677 tacagcgaccgattggggtgagcaggcacaagagcagatatgatagatggtggatggctatgtgttatggtacactaaagtgtttcaccctcagattttg 42538776  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42538777 ccacctcttccaggagatcttccgagaccagcaaatga 42538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8699784 - 8699470
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8699784 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtctaga 8699685  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    ||  ||| ||||||||| | ||||||   || ||  | ||| ||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |    
T  8699684 ccgcccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcgccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggaggccgattg 8699585  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||   | | |||| |||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8699584 gggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtttgacagatgcctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccagga 8699485  T
Q  353 gatcttccgaggcct 367  Q
    ||| |||||||||||    
T  8699484 gatattccgaggcct 8699470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 38970716 - 38971062
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||  || |||||| | || |||||||| || |||||||| ||| | || | || |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38970716 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattatggtattcaggctggattatttgcagtgttcataaggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgt 38970815  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||| |||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  38970816 tgaggcagtacagatacgtacagaagatccctggacatctgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcaagcattcgtcgacttccgcac 38970915  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |  ||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38970916 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagcagacagcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttgtggtacactaaggtgtctcaccct 38971015  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38971016 cagatttttccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38971062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42938019 - 42937675
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  42938019 gagcacagggagatccaagatttttaggaggttttctggttttcaggctggatcatgtgcggtgttcgtagggtgttc-gtcacttgcccgagggggttt 42937921  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||| ||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  42937920 tgaggcagtacagatacgtccagactgtccctaggcatctgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 42937821  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgt-ggtacgctagggtgtctcaccc 327  Q
    ||||||||||||||||  ||   |||||||||            ||||||       ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  42937820 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtgctatgggtacactagggtgtctcaccc 42937740  T
Q  328 tcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||| |||||||||    
T  42937739 tcagattttgccacctcttccaggagatcttcccaggctagcaaatgaggagcatatcattgcag 42937675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 15939344 - 15939666
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15939344 gaggagcttttctagtattcaggatgaattatgtgtggtgttcgtagagtgtactgtcatctgctcaagaggattttgaggcagtacggatatgtccaga 15939443  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||   || || |||||||||   |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   |    
T  15939444 cggtccctagacatccgattgatgttgttgagctgccaccgcctcatattgtgcaggcttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattg 15939543  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| ||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15939544 ggatgagcaggcagtagagcagacaaggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaagttgtctcacccttagattttgccacctcttccagga 15939643  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||||| ||||||| ||||||||    
T  15939644 tatctttcgaggccagcaaatga 15939666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40623111 - 40623041
Alignment:
Q  305 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40623111 tggtacactaaggtgcctcatcctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 40623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 17423138 - 17423487
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423138 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17423237  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423238 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 17423337  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423338 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 17423437  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423438 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30494346 - 30493997
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494346 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30494247  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30494246 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30494147  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494146 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30494047  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494046 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 5354643 - 5354992
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354643 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 5354742  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5354743 ttttgaggcagtacggatacgtgtagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 5354842  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5354843 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 5354942  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354943 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 5354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 15833928 - 15834277
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15833928 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 15834027  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15834028 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15834127  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15834128 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15834227  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15834228 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 15834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 43981193 - 43981542
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981193 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43981292  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43981293 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 43981392  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43981393 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43981492  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981493 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 43981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43537089 - 43536740
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537089 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43536990  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43536989 ttttgaggcagtacggatacatgcagactatccccagacatctgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 43536890  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43536889 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43536790  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43536789 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 43536740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 28471200 - 28471549
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471200 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttttggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28471299  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28471300 ttttgaggtagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggatctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 28471399  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  28471400 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 28471499  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28471500 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatga 28471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 45431177 - 45431526
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431177 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 45431276  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  45431277 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatcctactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcaggtgttcgtcaacttccg 45431376  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  45431377 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 45431476  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45431477 cctcagatcttgccaccttttctaggagatcttccgaggcctgcaaatga 45431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 39950166 - 39950515
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950166 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 39950265  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  39950266 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttacattgtacaggcgttcgtcgacttccg 39950365  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39950366 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 39950465  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950466 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 39950515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29398987 - 29398641
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29398987 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttt 29398888  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  29398887 tgaggcagtacggatacgtcctgaccatccccagacatccgacggatgttgtagacttgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 29398788  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  29398787 tcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 29398688  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29398687 cagattttgtcatctcttccaggaaatcttcctaggcctgcaaatga 29398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 363
Target Start/End: Original strand, 7189497 - 7189822
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189497 gagatccaggactttgaagaggttttctggtattctgactggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 7189596  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7189597 acggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgtactcacacgct 7189696  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7189697 taaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttg 7189796  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgag 363  Q
    |||||| || ||||||||||||||||    
T  7189797 ccacctctttcaggagatcttccgag 7189822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10826293 - 10825954
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10826293 gagcacagggagatccaagactttgatgaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 10826194  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10826193 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 10826094  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | || |||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10826093 tcacatgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcagaatagcagacatg-------gcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 10826001  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10826000 cagattttgccacctcttccaggagatattccgaggcctgcaaatga 10825954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 22680191 - 22680351
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680191 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22680290  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680291 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat-cccagacatccgactgatgttagggacctc 22680351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36653878 - 36653536
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36653878 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttttggtattcaggttggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttt 36653779  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||    ||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  36653778 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagtttgtgaaggcattcgtcgacttccgcac 36653679  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||  | |||||  || ||||||||| ||||    
T  36653678 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtatactcgggtgtctcgccct 36653579  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 371  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36653578 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaa 36653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 375
Target Start/End: Original strand, 7416474 - 7416803
Alignment:
Q  46 ggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatac 145  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7416474 ggacttccaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcaatgatcgtaaggtgcaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatat 7416573  T
Q  146 gtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcgg 245  Q
    || |||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7416574 gtccagaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatactttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcag 7416673  T
Q  246 acgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctat 345  Q
     ||   | |||||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |  |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  7416674 ccgattgcggtgagcatgcaggagaggagacatggcatatggcagatggctatgtacgatggtacgccattgcgtctcactctcagattttgccacttct 7416773  T
Q  346 tccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7416774 tccaggagatattccgaggcctccaaatga 7416803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 279
Target Start/End: Original strand, 40538235 - 40538464
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40538235 ttcgaggaggtattttggtattcaggctggattatgtgcgatgatcgtagggtgcaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 40538334  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    |||||||||| ||||||| |   || |||   || ||  ||||| ||   |||||| ||   || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||     
T  40538335 agaccatccctagacatctgttggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgtaggcttttgtcgacttccacactcacacgcttaaggcggccga 40538434  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatg 279  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40538435 ttggggtgagcatgcaggagaggagacatg 40538464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20067596 - 20067493
Alignment:
Q  272 gagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 371  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |    
T  20067596 gagaaatggcggatggaggatggctatgtaatatggtacattagggtgtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatcttccgaggccagcta 20067497  T
Q  372 atga 375  Q
    ||||    
T  20067496 atga 20067493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22529949 - 22529914
Alignment:
Q  317 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22529949 gtgtctcaccctcagattttgccacctattccagga 22529914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Original strand, 40538476 - 40538546
Alignment:
Q  305 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  40538476 tggtacgccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaagagatattctgaggcctccaaatga 40538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Original strand, 45292545 - 45292619
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtg 103  Q
    ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || |||||||||    
T  45292545 gagcacagggagatccgggattttgaggaggttttctagtattcaggctggattatgtgcagtgttcgtagggtg 45292619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 46401377 - 46401726
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401377 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46401476  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401477 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 46401576  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401577 cactcacacgcttaaggcggacgtccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 46401676  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401677 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46401726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42901541 - 42901192
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901541 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 42901442  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42901441 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42901342  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42901341 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 42901242  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901241 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42901192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46698696 - 46698347
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698696 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46698597  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46698596 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 46698497  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46698496 cactcacacgcttaagacggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 46698397  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698396 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46698347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49141899 - 49141550
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141899 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49141800  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  49141799 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgatttccg 49141700  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49141699 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49141600  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141599 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49141550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50478158 - 50477809
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478158 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 50478059  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50478058 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgttgacttccg 50477959  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50477958 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 50477859  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50477858 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 50477809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 54388797 - 54389146
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54388797 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggcgtaccgtcacttgcccgagaggg 54388896  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  54388897 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgattttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 54388996  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54388997 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 54389096  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389097 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 54389146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 34048097 - 34048446
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048097 gaggagcacatagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccatagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 34048196  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  34048197 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgattttcg 34048296  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34048297 cactcacacgcttaaggcggtagcttggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 34048396  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048397 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 34048446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2272437 - 2272088
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272437 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 2272338  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  2272337 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgctttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 2272238  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2272237 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 2272138  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2272137 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttttgaggcctgcaaatga 2272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 392
Target Start/End: Original strand, 36130157 - 36130523
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36130157 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 36130256  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  36130257 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 36130356  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  36130357 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 36130456  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  36130457 cctcagattttgccacctctccctggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcatatcattgcag 36130523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4005791 - 4005443
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005791 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggatgttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 4005692  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4005691 ttttgaggcagtacggatacatgcagaccatccctagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 4005592  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  4005591 cactcacacgcttaaagcgg-cgattggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 4005493  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| |  ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4005492 cctcatactttgccacctctccctagagatcttccgaggcctgcaaatga 4005443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47071558 - 47071219
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47071558 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctgactggattatatgcggcgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattt 47071459  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  47071458 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacggatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcac 47071359  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||| |||||||||||  |   | |||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  47071358 tcacatgcttaaggcggctgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcactct 47071266  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
      ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071265 tggatcttgccacctttaccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 47071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Original strand, 599583 - 599888
Alignment:
Q  70 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 169  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  599583 ttctggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatcctcagacatctc 599682  T
Q  170 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggag 269  Q
    || ||||||   || || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  599683 acggatgttgtagagctgccattgccttacattgtgcaggtgttcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggag 599782  T
Q  270 aggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgc 369  Q
    || || ||||||||  ||| |||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  599783 agcagtcatggcggatggctgatggctattagctatggtacactaggatgtctcaccctcagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgc 599882  T
Q  370 aaatga 375  Q
    ||||||    
T  599883 aaatga 599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 64 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17562686 - 17562375
Alignment:
Q  64 ctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaga 163  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17562686 ctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctaga 17562587  T
Q  164 catccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcagg 263  Q
    |||| | | ||||||   || ||  || || |||  |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  17562586 catctgtcggatgttgtagagctgtcatcgtcttagattgtgcagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagg 17562487  T
Q  264 caggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 363  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17562486 caggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatctcgccatctcttccaggagatcttccgag 17562387  T
Q  364 gcctgcaaatga 375  Q
    ||| ||||||||    
T  17562386 gccagcaaatga 17562375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 109 - 375
Target Start/End: Original strand, 9473034 - 9473300
Alignment:
Q  109 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    | || |||||| ||  |||||| |||    
T  9473034 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgatcgatgttgtacagctgccaccgtctcacattgtccag 9473133  T
Q  209 atgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggt 308  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9473134 gcgttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatggt 9473233  T
Q  309 acgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473234 acactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 20353216 - 20353562
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20353216 gagcatagggagatccaggattttgaggagattttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggggtt 20353315  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   | |||||||   ||||||||||||  |||    
T  20353316 tgaggcagtacggatacgtccagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgcctcagactgtgcaggcattcgtcgacttccacac 20353415  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20353416 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20353515  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| || |||||| || || ||||||||| ||||||  |||||||    
T  20353516 cagatttttccacctctttcacgagatcttctgaggccaacaaatga 20353562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 41614944 - 41615282
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41614944 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 41615043  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  41615044 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatctggcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 41615143  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  41615144 tcacacgcttagggcggccg-atggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 41615235  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41615236 cagattttgccacctcttacaggagatcttccgaggccagcaaatga 41615282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49266738 - 49266401
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49266738 gagatccagaattttgaggaggttttctggtatttaggctggattatgtgaggtggtcgtagggtctaccgtcatttgcccgagagggttttgaggcagt 49266639  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||    
T  49266638 acggagacgtccagaccgtccccaaacatctgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcacacgct 49266539  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    ||||| || ||    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  49266538 taaggtggccgattagggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttg 49266439  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49266438 ccacctcttccaggagatcttccgaggtcagcaaatga 49266401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 16646183 - 16646516
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16646183 gagcacagggagatccaggactttgagaaggtattctggtattctggctg-attatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcactttcccgatagggttt 16646281  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||   |||||   ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16646282 tgaggcagtacggatacatccagaccatcccaagacatctgaagtatgttgtagacctgccaccgccttacattatgcaggcgttcgtcgacttccgcac 16646381  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||            | |||||||||  |||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  16646382 tcacacgcttaaggcagacgattggggtgagc------------acacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtaaactagggtgtctcaccct 16646469  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16646470 ttgattttgccacctcttccaggagatcttccgagacttgcaaatga 16646516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 44232402 - 44232732
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  44232402 gagatccaggattttaaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcatagggtgtactgtcactttttcgagagggttttgaggcagt 44232501  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  44232502 gcggatacgtccagaccgtccccagacatctgacagatgttgtagagctgccaccgcctcagattatgcagatattcgtcggcttccgcactcacacgct 44232601  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||| ||||| | ||||       ||| |||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  44232602 taaggcggccgattggggtgagcaggcaagagagcatacat-------ggctgatgacaatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttg 44232694  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44232695 ccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 44232732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 48565560 - 48565890
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48565560 gagatccaggattttgaggaggttttctggtgttcaggctagattatgtgtggtgttcgtagggtgtactgtcacttacccgagcgggttttgaggcagt 48565659  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    || ||||||| |||| | ||   ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  48565660 acagatacgtccagagcgtctttagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgct 48565759  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||  |||||||||||||||||| |||    
T  48565760 taaggcggtcgaatggggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactgaggtgtctcaccctcagattttg 48565852  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48565853 ccacctcttccagaagatcttccgaggccagcaaatga 48565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Original strand, 48891213 - 48891538
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48891213 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatatgcagtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 48891312  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  || || ||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  48891313 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcatcggctgagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 48891412  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      || ||||||| ||| ||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  48891413 ttggagtgagcatgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 48891512  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| || |||||||| |||||||    
T  48891513 ggagatattacgaggcctccaaatga 48891538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 42759337 - 42759676
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42759337 gagcacagggagatccaagattttgaggagcctttctggtattcaggctgaattatgtgcggtgttcgtagggtgtagcgtcacttgcccgagagggttt 42759436  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||  |||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  42759437 tgaggcagtacggatacatccagagcgtccctagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcatgcattcgtcgacttccgcac 42759536  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||| ||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  42759537 tcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagcagacacaagagcagacat-------ggcggatggctatgttttatggtacactaaggtgtctcaccct 42759629  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    || || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42759630 caaattttgccacctcttctaagagatcttccgaggccagcaaatga 42759676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 50758795 - 50759027
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50758795 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgattgtagggtgtaccgtcacttgaccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 50758894  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  50758895 agaccgtccctagacatccgccggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 50758994  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 282  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50758995 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcg 50759027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52388820 - 52388630
Alignment:
Q  185 ctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggg 284  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  52388820 ctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcgga 52388721  T
Q  285 cggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||| ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52388720 tggctgatggctatatgctatggtagactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatga 52388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52388953 - 52388827
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52388953 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggataatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 52388854  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  52388853 ttttgaggtagtatagatacgtgcaga 52388827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2648720 - 2648608
Alignment:
Q  263 gcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 362  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648720 gcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 2648621  T
Q  363 ggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||    
T  2648620 ggcctgcaaatga 2648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42805318 - 42804993
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  42805318 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcatacggtgcaccgtcactagcccgagaggattttgaggcagtacagatacgttc 42805219  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
     |||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||   |||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  42805218 ggaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgttaccggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggcgggcga 42805119  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      |||||||||| ||| |||||||||||||| |   ||| ||||||||||| |  |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  42805118 ttggggtgagcatgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 42805019  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42805018 ggagatattctgaggcctccaaatga 42804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 51807851 - 51807976
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807851 gagcacagggagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 51807950  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagacc 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51807951 tgaggcagtacggatacgtccagacc 51807976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50214428 - 50214199
Alignment:
Q  139 cggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgctt 238  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    | ||  ||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50214428 cggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatattgtaaagctgtcaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttcctcactcacacgctt 50214329  T
Q  239 aaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgc 338  Q
    ||| ||  ||   |||||||||||  | ||||| |||||||||||       |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50214328 aagacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcgg-------atggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgc 50214236  T
Q  339 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50214235 cacctcttccaggagatattccgaggccagcaaatga 50214199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30253451 - 30253126
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  30253451 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgtggtgatcagagggtataccgtcacttgctcgagagggttttgaggcagtacagatacatcc 30253352  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    | ||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |     
T  30253351 aaaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcactgcctgagattgtgcaggttttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggctga 30253252  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
    | |||||||||| ||| ||||  | ||||||||   ||| ||||||||||| |  ||||||      ||||||||  ||||||| ||||||| | |||      
T  30253251 ctggggtgagcatgcaagagaacaaacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacatcgttgtgtctcatgctcagattttgccacttcttctg 30253152  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  30253151 ggagatattccgaggcctccaaatga 30253126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3495622 - 3495550
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgta 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3495622 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgta 3495550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 6927989 - 6928146
Alignment:
Q  212 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctg-tggtac 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||   |||| |||||||||||       ||||||||||  |  ||||||    
T  6927989 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcgg-------atggctatgtgtttatggtac 6928081  T
Q  311 gctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6928082 actaaggtgtgtcaccctcaaattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 6928146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 27638424 - 27638769
Alignment:
Q  30 agcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638424 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 27638523  T
Q  130 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638524 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 27638623  T
Q  230 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638624 cacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 27638723  T
Q  330 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27638724 agatcttgccacctattccaagagatcttccgaggcctgcaaatga 27638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 6203821 - 6204170
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203821 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6203920  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6203921 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6204020  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204021 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6204120  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204121 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6204170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 11690788 - 11691137
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690788 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 11690887  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11690888 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 11690987  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11690988 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 11691087  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691088 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 11691137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30827003 - 30826654
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30827003 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30826904  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30826903 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30826804  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30826803 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30826704  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826703 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 22303902 - 22304251
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303902 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22304001  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22304002 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22304101  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304102 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22304201  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22304202 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 22304251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 31770746 - 31771088
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31770746 gaggagcacagagagatccatgattttgaggaggttttatggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggg 31770845  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  31770846 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttccg 31770945  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31770946 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31771038  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31771039 cctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 31771088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 297
Target Start/End: Original strand, 26440125 - 26440384
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26440125 gagatccatgactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcaat 26440224  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26440225 acggatacgtccagaccatccctagacatctgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaagcgttcgtcgacttccgcactcacacgct 26440324  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggcta 297  Q
    |||||||   |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26440325 taaggcgactgattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcta 26440384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 373
Target Start/End: Original strand, 26172594 - 26172936
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26172594 gagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagagttttgaggcagt 26172693  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccg--------actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||        || ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26172694 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgaacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcact 26172793  T
Q  230 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 329  Q
    |||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26172794 cacacgcttaaggcggccgattgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgtgttatggtacactagggtgtctca-cctc 26172892  T
Q  330 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 373  Q
    | || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26172893 aaattttgccacctcttcgaggagatcttccgacgccagcaaat 26172936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 2406918 - 2407257
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  2406918 gagcacagggagatccaggactttgagtaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgtacgtagggtctactgtcacttgctcgagagggttt 2407017  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2407018 taaggcaatacggatacgtctagaccgtccctaaacatccgacggatgttgtagagctgccactacctcaaattgtgcagacattcgtcgacttccgcac 2407117  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    | ||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||| ||| ||       ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  2407118 ttacacgcttaaggcggccgatcgaggtgaacaggcaggagagcagaaat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 2407210  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2407211 cggattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 2407257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24086177 - 24085850
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttg-cccgagagggttttgaggcagtacggatacgtg 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24086177 ttcgaggaggtattctggtattcaggatggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgccccgagagggttttgaggcagtacagatacgtc 24086078  T
Q  149 cagaccatccc-cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggac 247  Q
    |||||| ||||  |||||| || | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24086077 cagaccgtcccttagacattcgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatgttttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggcc 24085978  T
Q  248 gcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 347  Q
    |   |||||||||| ||||||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  24085977 gattggggtgagcatgcaggagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttg 24085878  T
Q  348 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24085877 taggagatattcggaggcctccaaatga 24085850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2406222 - 2406059
Alignment:
Q  212 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacg 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||  | ||||||     
T  2406222 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtaca 2406123  T
Q  312 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2406122 caagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 2406059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 32642567 - 32642912
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32642567 gagcacagagacttccaggctttcgaggaggtattctggtattcaggctgaattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 32642666  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| | ||    
T  32642667 tgaggcagtacggatacgtcctgaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagttgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgtac 32642766  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| |     ||||||||| | ||||| | ||||||||||   | | ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||    
T  32642767 tcacacgcttaaggcgg-ctgattgggtgagcatgtaggagggtagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccct 32642865  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    || || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32642866 caaattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18005800 - 18005475
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||| || |   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18005800 ttcgaggaggtattctagtattcaggctggattacgtgtggtgattgtagggtgcaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 18005701  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    ||||| |||| ||||||| |   | ||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18005700 agaccgtccctagacatctgttagctgttgtagagatgtcaccgactgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 18005601  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||| |   ||| ||||||||||| |   ||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  18005600 ttggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggctatgtacgaaggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 18005501  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18005500 ggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Original strand, 3384140 - 3384449
Alignment:
Q  65 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 164  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  3384140 tggtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgcaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccatacgatccctagac 3384239  T
Q  165 atccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggc 264  Q
    |||| || ||||||   ||  |  ||| ||||   ||||||||||  ||||| |||||   || |||||||||||||| |  ||   |  ||||||||||    
T  3384240 atcctacggatgttgtagagatgacactgcctcagattgtgcagacattcgtagactttcacattcacacgcttaaggagaccgattgaagtgagcaggc 3384339  T
Q  265 aggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagg 364  Q
    || |||| |||||||||    |  ||| ||||||||  | || ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  3384340 agcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatgatacactaagatgtctcaccctcagattttgccatctcttcca-gagatcttccgagg 3384438  T
Q  365 cctgcaaatga 375  Q
    || ||||||||    
T  3384439 ccagcaaatga 3384449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 348
Target Start/End: Original strand, 21603282 - 21603378
Alignment:
Q  252 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 348  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||  |  ||  ||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21603282 ggggtgagccagcaggagaggcgacatggaagatggatgatggctatatactatggtacactacggtgtctcaccctcagatttttccacctattcc 21603378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32641955 - 32641897
Alignment:
Q  317 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32641955 gtgtctcaccctcaaattttgtcacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32641897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 1055198 - 1055547
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055198 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1055297  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1055298 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1055397  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055398 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 1055497  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055498 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1055547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23019672 - 23019323
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019672 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 23019573  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23019572 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 23019473  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019472 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 23019373  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019372 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 23019323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 26662119 - 26662468
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662119 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26662218  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26662219 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26662318  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26662319 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 26662418  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662419 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 26662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15034150 - 15033801
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034150 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 15034051  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15034050 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaggaacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15033951  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15033950 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15033851  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15033850 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15033801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22881 - 22532
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22881 gaggagcacagagagatctaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgtggcatccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22782  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22781 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22682  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22681 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22582  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22581 cctcagatcttgccacctattccaggagatattccgaggcctgcaaatga 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42482891 - 42482542
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42482891 gaggagcacagaaagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagga 42482792  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42482791 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42482692  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42482691 cactcacacgcttgaggcggacgctcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtacactagggtgtctcac 42482592  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482591 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 487118 - 486769
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487118 gaggagcacaaagagattcaggacttcgaggaggtttcctggtattctggatggattatgtgcggcgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 487019  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  487018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgtttatcgacttccg 486919  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  486918 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 486819  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  486818 cctcagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggcctgcaaatga 486769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34367992 - 34367646
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34367992 gagcatagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtatggtgtaccttcacttgcccgagagggttt 34367893  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  34367892 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatcctcagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgactttcgcac 34367793  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  34367792 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccct 34367693  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34367692 cagatcttgccacctctttcaggagatcttctgaggcctgcaaatga 34367646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 39603963 - 39604308
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39603963 gagcacagggagatccaggactttgaggtggttttctcgtattctggatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 39604062  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  39604063 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatccc-agacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 39604161  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39604162 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 39604261  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39604262 cagatcttgccacctcttccaggaaatcttctgaggcctgcaaatga 39604308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 43214075 - 43214405
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43214075 gaggagcacagggagatgcaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtaggatgtaccgtcacttgcccgagaggg 43214174  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  43214175 ttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 43214274  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||            ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43214275 cactcacacgcttaaggcgaacgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 43214355  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43214356 cctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgaggcctgcaaatga 43214405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34819983 - 34819646
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34819983 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 34819884  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  34819883 acggatacgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgct 34819784  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||| | ||   ||||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||     
T  34819783 taaggcagccgattggggtgagcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagattttt 34819684  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34819683 ccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 34819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 20858688 - 20859034
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858688 gagcatagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 20858787  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||  |  |||||||||  |||||||||   |||||| |||||  |||    
T  20858788 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccaaacatccgacggatgttgtagagttgtcaccgccttagattgtgcaggcattcgtcaacttccacac 20858887  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||||| | ||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20858888 tcacacccttaaggcggcctattggagtgagcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20858987  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  20858988 cagatttttccacctcttccaggagatctttcgaggcaagcaaatga 20859034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41243447 - 41243120
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41243447 gagcacagggagatccatgactttgaggagattttatggtattctggctggattatgtgcgctgttcgtagggtgtaccgtcacttgccagagagtgttt 41243348  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41243347 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacagatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 41243248  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||                    ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  41243247 tgacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaggca-------------------tggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 41243167  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41243166 cagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcctgcaaatga 41243120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39832125 - 39831787
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39832125 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttgtggtattcaggctggattatgtgcggtgttcctaaggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 39832026  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  39832025 taaggcagtacggatacgtccagaccgtctccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 39831926  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||  |||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  39831925 tcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatgattatgtgttatggtacacta-ggtgtctcaccct 39831834  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39831833 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 39831787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5301679 - 5301343
Alignment:
Q  39 agatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 138  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  5301679 agatccaggattttgaggaggttttctggtattcaagctggattatgtgcggtgtttgttgggtctaccgtcacttgtccaagtggattttgaggtagta 5301580  T
Q  139 cggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgctt 238  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||   || |||||||  |||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5301579 cggatacgtccataccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctcccactacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgctt 5301480  T
Q  239 aaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgc 338  Q
    ||||||| ||   | || ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5301479 aaggcggccgattgaggcgagcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgc 5301380  T
Q  339 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5301379 cacctcttccaggagatcttccaaggccagcaaatga 5301343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 45132438 - 45132760
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45132438 gaggaggttttttggtattcaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgacatctgcccgagagggttttgaggtagtacggatacgtccaga 45132537  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
       |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||   |    
T  45132538 tggtccctagacatccgacggatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcaagctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggccgattg 45132637  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45132638 gggtgagcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 45132737  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  45132738 gatcttccgaggccagcaaatga 45132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40076051 - 40075736
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  40076051 gaggagattttctagtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacatccaga 40075952  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
      ||||| ||||||| ||| ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||   |    
T  40075951 gaatccctagacatcagacggatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattg 40075852  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40075851 gggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 40075759  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  40075758 gatcttccgaggccagcaaatga 40075736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 375
Target Start/End: Original strand, 35554303 - 35554609
Alignment:
Q  62 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 161  Q
    ||||||||| | || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |    
T  35554303 ttctggtatccaggctggattatttgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagggtcccta 35554402  T
Q  162 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagca 261  Q
    |||||||||| |||  |   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||    
T  35554403 gacatccgacggataatgtagagctgacaccgcctcagattgtgcaggaattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 35554502  T
Q  262 ggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccg 361  Q
    ||||  | || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35554503 ggcacaaaagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccg 35554595  T
Q  362 aggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||    
T  35554596 aggccagcaaatga 35554609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21176695 - 21176349
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  21176695 gagcacagggagatccagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtaggatgtaccgtcactttcttgagagggttt 21176596  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||   || || | | |||||   |||||| ||   ||| |||||||| ||||    
T  21176595 tgcggcagtaaggatacgtccagagcatccctagacatccgacggatgttgtagagctgcgatcgcctcagattgtggaggcattcatcgacttccgcac 21176496  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| |||||| || |||||| ||  |||||| ||||||    
T  21176495 tcacacgcttaaggagcacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtgtcacaccct 21176396  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21176395 cagattttgacacctcttccagaagatcttctgaggccagcaaatga 21176349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 5679558 - 5679882
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgta--ccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgca 150  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5679558 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtacggtgtttgtagggtgtataccgtcacttgcctgagagggttttgcggcagtacggatacgtcca 5679657  T
Q  151 gaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcc 250  Q
    || | |||| ||||| |  || ||||||   || |  | |||||||   |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||      
T  5679658 gagcgtccctagacaactaacggatgttgtagagcggcgaccgcctcagattgtgcagccattcatcgacttccgcactcacacgcttaaggagcccgat 5679757  T
Q  251 cggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccag 350  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5679758 tggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggtatactacggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccag 5679857  T
Q  351 gagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||||||||||||||  ||||||||    
T  5679858 tagatcttccgaggctagcaaatga 5679882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Original strand, 51778 - 52103
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  | | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51778 ttcgagggggtattctgatattcatgctagattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 51877  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    || || |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  51878 agtccgtccctagacatccgtcagatgttgtagagctgtcaccgactcagattgtgcaggatttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcga 51977  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      |||||||||| ||| ||||| |||||||||    | | ||||||||||| |  |||||| |    |||||||||||||| || || |||| | || ||    
T  51978 ttggggtgagcatgcatgagagcagacatggcatatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcacatttttccacttctttca 52077  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||    
T  52078 tgagatattccgaggcctccaaatga 52103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30761485 - 30761310
Alignment:
Q  212 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagac--------------atggcgggcggcggatggcta 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||              |||||||  |||||||| |||    
T  30761485 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggcagatggcggatggcggatgacta 30761386  T
Q  298 tgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 373  Q
    |||  | |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30761385 tgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaatttttccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaat 30761310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 41883212 - 41883561
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883212 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 41883311  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41883312 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 41883411  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41883412 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 41883511  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883512 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41883561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 48406030 - 48406379
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406030 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 48406129  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48406130 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 48406229  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48406230 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 48406329  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406330 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 48406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9368787 - 9368438
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368787 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 9368688  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9368687 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 9368588  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9368587 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgtgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 9368488  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368487 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9368438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17460647 - 17460298
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460647 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17460548  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17460547 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17460448  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17460447 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17460348  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460347 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17460298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 17592567 - 17592916
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592567 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17592666  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17592667 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17592766  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17592767 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17592866  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592867 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17592916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35607776 - 35607427
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607776 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctagatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 35607677  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35607676 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 35607577  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35607576 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 35607477  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607476 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 35607427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42505318 - 42504970
Alignment:
Q  27 aggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42505318 aggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggt 42505219  T
Q  127 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42505218 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattgtgcagatgttcgtcgacttccgc 42505119  T
Q  227 actcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcacc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42505118 actcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcacc 42505019  T
Q  327 ctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505018 ctcatatcttgctgcctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42504970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15071655 - 15071319
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||          |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071655 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggttt---tg----------agggtgtaccatcacttgcccgagaggg 15071569  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15071568 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15071469  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15071468 cactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 15071369  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071368 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15071319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 17837632 - 17837974
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17837632 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtatggtgtaccgtcacttgcccgagatgg 17837731  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  17837732 ttttgaggcagtatggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 17837831  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17837832 cacttacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaagcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 17837924  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837925 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17837974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 38 - 392
Target Start/End: Original strand, 10521515 - 10521868
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10521515 gagatgcatgactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagg-ttttgaggcagt 10521613  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10521614 acggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgcctgacattgtacaggcgttcgtcgactttcgcactcacacgct 10521713  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10521714 taaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcatatcttg 10521813  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10521814 ccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcatatcattgcag 10521868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5538933 - 5538587
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5538933 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgttcgtacggtgtaccgtcacttgcccgagtgggttt 5538834  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||| ||| ||||||||||  ||||||   || || ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5538833 tgaggcagtacaaatacatctagaccaaccctagacatccgatggatgttgtagagctgccatcgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 5538734  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  5538733 tcacacacttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 5538634  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5538633 cagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggccagcaaatga 5538587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 13322706 - 13323055
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13322706 gaggagaatagagagatccaggattttgaggaggttttatggtattctggctggataatgtgtggtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 13322805  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||   || || ||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||  |    
T  13322806 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgaaagatgttgtagagctgccaccacctcacattgtgcaggcgttcatcgactttag 13322905  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  13322906 cactcacacgcttaagggggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctcac 13323005  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13323006 cctcagatattgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 13323055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 16680134 - 16680480
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16680134 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 16680233  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  16680234 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 16680333  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  16680334 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 16680433  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16680434 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 16680480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 17654370 - 17654716
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17654370 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 17654469  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  17654470 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 17654569  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  17654570 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 17654669  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17654670 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 17654716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27451069 - 27450723
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27451069 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgtttatagggtgtaccgtcactttcccaagagggttt 27450970  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||  ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  27450969 tgaggtagtacggatacgtccaaaccgtctccagatatccgaacgatgttgtagagctgtcaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 27450870  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  27450869 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 27450770  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27450769 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 27450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Original strand, 34741444 - 34741742
Alignment:
Q  70 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 169  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  34741444 ttctggctggattatgtgcggtgttcgtagaatgtactgtcacttgcccgatagggttttgaagcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatctg 34741543  T
Q  170 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggag 269  Q
    || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  34741544 acggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggag 34741643  T
Q  270 aggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgc 369  Q
    || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  34741644 agcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaggctgtctcaacctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagaccagc 34741736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11630643 - 11630427
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11630643 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11630544  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11630543 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11630444  T
Q  229 tcacacgcttaaggcgg 245  Q
    |||||||||||||||||    
T  11630443 tcacacgcttaaggcgg 11630427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47670561 - 47670239
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47670561 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgcaccgtcacttgcccgaaagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 47670462  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    || | || ||||||||| | || |||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   |    
T  47670461 ccgtacctagacatccgtcggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtcggccgattg 47670362  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    ||  ||||||||||    |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  47670361 gggtgagcatccaggagaggagacatggcgtatagcatatggctatgtatgatggtacgccattgtgtctcaccctcagaatttgccacttcttccagga 47670262  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||| || |||||||| |||||||    
T  47670261 gatatttcgaggcctccaaatga 47670239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 375
Target Start/End: Original strand, 37342992 - 37343271
Alignment:
Q  96 gtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||   || ||  |||||||    
T  37342992 gtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttaaggcaatacggatacgtccagacaaaccctagacatccggcggatgttgtagagctgacaccgcc 37343091  T
Q  196 ttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggc 295  Q
    |   ||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| |||    
T  37343092 tcagattgtgcagacattcgtatacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggc 37343191  T
Q  296 tatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37343192 tatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 37343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47522172 - 47522013
Alignment:
Q  216 tcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctag 315  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||    
T  47522172 tcgacttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactag 47522073  T
Q  316 ggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47522072 ggtgtctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaatga 47522013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11632884 - 11632680
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11632884 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11632785  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11632784 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11632685  T
Q  229 tcaca 233  Q
    |||||    
T  11632684 tcaca 11632680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9492221 - 9491989
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    |||||| |||| |||| | |||| || | ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  9492221 ttcgagaaggtattctagcattcaggtttgattatgtgtggtgatcgtagagtgtaccgtcactttcccgagagggttttaaggcagtacggatacaccc 9492122  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |      
T  9492121 agaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccaa 9492022  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 282  Q
      |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9492021 ttggggtgagcatgtaggagaggagacatggcg 9491989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11630387 - 11630317
Alignment:
Q  305 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11630387 tggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 11630317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 167
Target Start/End: Original strand, 36980256 - 36980373
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36980256 ttcgaggaggtattcctgtattcaggctgaattatgtgtggtgatcgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtcc 36980355  T
Q  150 agaccatccccagacatc 167  Q
    ||||  |||| |||||||    
T  36980356 agactgtccctagacatc 36980373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Original strand, 16488281 - 16488394
Alignment:
Q  263 gcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccc-tcagatcttgccacctattccaggagatcttccg 361  Q
    ||||||||| |||||||||||     |||||| |||||  | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16488281 gcaggagagcagacatggcggataagggatggatatgtgttatggtacactaaggtgtttcacccctcagattgtgccacctcttccaggagatcttccg 16488380  T
Q  362 aggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||    
T  16488381 aggccagcaaatga 16488394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Original strand, 41734630 - 41734700
Alignment:
Q  212 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 282  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41734630 ttcgtagacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 375
Target Start/End: Original strand, 41734713 - 41734749
Alignment:
Q  339 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41734713 cacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 41734749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6179189 - 6178840
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179189 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6179090  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6179089 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6178990  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178989 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6178890  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178889 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6178840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41796424 - 41796075
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41796424 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtactgtcacttgcccgagaggg 41796325  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796324 ttttgaggcaatacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 41796225  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41796224 cactcacacgcttaaggcggacgcctggggtgagcaggtaggagaggagacatggcgggcgggggatggctatgtcttgtggtacgctagggtgtctcac 41796125  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796124 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41796075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 49168183 - 49168532
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168183 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49168282  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49168283 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 49168382  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49168383 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49168482  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168483 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 31424412 - 31424761
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424412 gaggagcacagagagattcaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 31424511  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31424512 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaaggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 31424611  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31424612 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcacactagggtgtctcac 31424711  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424712 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 31424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1306521 - 1306170
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306521 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1306422  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1306421 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1306322  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatg--gcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306321 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 1306222  T
Q  324 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306221 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 49093093 - 49093443
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093093 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49093192  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  49093193 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccctagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 49093292  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacat-ggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49093293 cactcacatgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 49093392  T
Q  325 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093393 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49093443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21018977 - 21018628
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21018977 gaggagcatagagagatccaggacttagaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagcgtgtaccgtcactttcccgagaagg 21018878  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |    
T  21018877 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattatgcaggtgttcgtcgacttccg 21018778  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21018777 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 21018678  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018677 cctaagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 21018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40355802 - 40355453
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355802 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttatggtattctgggtggattatgtgtagtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 40355703  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40355702 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 40355603  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  40355602 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcgaatggcaatgtcatatggtacactagggtgtctaac 40355503  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40355502 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagacctgcaaatga 40355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30724148 - 30723877
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724148 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30724049  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30724048 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttcaattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30723949  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggcta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30723948 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44677366 - 44677020
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44677366 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttttggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 44677267  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  44677266 tgaggcagtacggatacatccagaccatccccaggcatctgactgatgttgtaaacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 44677167  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  44677166 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 44677067  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  44677066 cagatcttgccacctcttccaggagatttttcgaggcctgtaaatga 44677020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 50277829 - 50278175
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50277829 gagcacagagagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50277928  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||  | |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  50277929 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagttgccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 50278028  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  50278029 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcacactagggtgtctcaccct 50278128  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50278129 catattttgtcacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37016967 - 37016633
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016967 gagcatagggagatccagaactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 37016868  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  37016867 tgaggcaatacggatacgtcaagaccatccccagacatctgacggatgttgtagacctcccatcgccttacattgtgcagacgttcgttgacttccgcac 37016768  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||            |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37016767 tcacacacttaaggcggacgattggggtgagc------------agacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 37016680  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37016679 aagatcttgccacctctttcagtagatcttccgaggcctgcaaatga 37016633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 8109835 - 8110172
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109835 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 8109934  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||| |||||    
T  8109935 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgtctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcatacgct 8110034  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||| | ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  8110035 taaggcagccgattggggtgagcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttt 8110134  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8110135 ccacatcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 8110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10730352 - 10730030
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10730352 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10730253  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10730252 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10730153  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10730152 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10730053  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10730052 gatcttccgaggccagcaaatga 10730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10944121 - 10943799
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10944121 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10944022  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10944021 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10943922  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10943921 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10943822  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10943821 gatcttccgaggccagcaaatga 10943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 51685810 - 51686104
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51685810 gagcacagagagatctaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccgagagggttt 51685909  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||| ||||| ||||    
T  51685910 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcaacttctgcac 51686009  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 323  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  51686010 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcggatgacagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctc 51686104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 50904047 - 50904377
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50904047 gagatccaggattttgaggagggtttttggttttcaggttggatcatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagt 50904146  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50904147 acagatacgtccagaccgtccccaggcatccgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgatttccgcactcacacgct 50904246  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    ||||| || ||   | |||||||||| ||||||| ||||||       |||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  50904247 taaggtggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagacat-------ggcggacggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagattttg 50904339  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
     ||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50904340 tcacctctttcagaagatcttcccaggccagcaaatga 50904377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Original strand, 71624 - 71958
Alignment:
Q  41 atccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacg 140  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71624 atccaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttggccgagagggttttgaggcagtacg 71723  T
Q  141 gatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaa 240  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||   || ||  || || ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71724 gatacgtccagaccatccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcatcggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 71823  T
Q  241 ggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgcca 340  Q
    ||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||| ||    
T  71824 ggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgtca 71923  T
Q  341 cctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    | | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  71924 cttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 71958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50021044 - 50020734
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  50021044 gaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgggtacgtccata 50020945  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    || |||||||||||||||| ||||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||| |||   ||||||||| ||| |||| || ||   |    
T  50020944 ccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgactcagattgtgcaggcattcgtcaactctcgcactcacatgctcaaggaggccgattg 50020845  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    ||||||||            ||||||||| |  ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  50020844 gggtgagc------------agacatggctgatggcggatggctatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccaaga 50020757  T
Q  353 gatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  50020756 gatcttccgaggccagcaaatga 50020734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13624894 - 13624569
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13624894 ttcgaggaagtattctggtattcaggttggattatgtgcggtgatcgtagggcgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 13624795  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  13624794 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagatctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 13624695  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      |||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    ||||||      ||||||||||||||||| || |||| | |||||    
T  13624694 ttggggtgagcatgcaagagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtatgatggtacatcgttgtgtctcaccctcagatttttccacatcttcca 13624595  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||    
T  13624594 ggagatattctgatgcctccaaatga 13624569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Original strand, 50196076 - 50196218
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196076 gagcacagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50196175  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgac 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  50196176 tgaggcagtacggatacgttcaggccgtccccagacattcgac 50196218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41931334 - 41931108
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  41931334 gaggaggttttctggtattaaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgttatctacccaagagggttttgaggcagcacggatacgtccaaa 41931235  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||   |    
T  41931234 cagtccctagacatccgactgatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggccgattg 41931135  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatg 279  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  41931134 gggtgagcaggcagcagagcagacatg 41931108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 363
Target Start/End: Original strand, 14317308 - 14317618
Alignment:
Q  53 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 152  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  14317308 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtataccatcacttgcccgagagggttttgaggcggtacagatacgtccaaa 14317407  T
Q  153 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 252  Q
    |  |||| || |||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||    ||  | |||||| |||||||||||||||||| |   |   |    
T  14317408 ctgtccctagtcatccgacggatgttgtagagctgccactacctcagattgtgcaagcatttcttgacttccgcactcacacgcttaaggagcctgaatg 14317507  T
Q  253 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 352  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14317508 gggtgagccggcgggagagcaaacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcatattttgccacctcttccagga 14317607  T
Q  353 gatcttccgag 363  Q
    |||||||||||    
T  14317608 gatcttccgag 14317618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Original strand, 46438752 - 46438954
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    ||||||||||  || |||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46438752 gagatccagggatttgaggagatattctagtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttttgaggcagt 46438851  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    || ||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  46438852 acagatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtcgacttccgcactcacacgct 46438951  T
Q  238 taa 240  Q
    |||    
T  46438952 taa 46438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Original strand, 30706657 - 30706942
Alignment:
Q  107 cgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgc 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||    
T  30706657 cgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacgaatacgtctagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgc 30706756  T
Q  207 agatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtg 306  Q
    ||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||   |  |||  | | |||  | ||    
T  30706757 aggcattcgtagacttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatgagggaatgttgtgtgttatg 30706856  T
Q  307 gtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||| |||||||||    
T  30706857 atacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcggaggccaacaaatgaagagcatatcattgcag 30706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30723847 - 30723777
Alignment:
Q  305 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723847 tggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgtaaatga 30723777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 50196224 - 50196351
Alignment:
Q  252 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgct----agggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 347  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||  | |||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50196224 ggggtgtgcaggtaggagagcagacatggctgatggtggatggctatgtgttatggtacactcactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 50196323  T
Q  348 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50196324 caggagatcttccgaggccagcaaatga 50196351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 55278927 - 55278820
Alignment:
Q  268 agaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcct 367  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  55278927 agaggagacatggcggatggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgattttgccacttcttccaggatatcttccgaggcca 55278828  T
Q  368 gcaaatga 375  Q
    || |||||    
T  55278827 gctaatga 55278820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 372
Target Start/End: Original strand, 46438956 - 46439038
Alignment:
Q  290 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaa 372  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46438956 gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccatgagatcttccgaggccagcaaa 46439038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21535530 - 21535449
Alignment:
Q  97 tagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgtt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21535530 tagggtgtatcgtcacttgcctgagagagttttgcggctgtacggatatgtcgagaccgtccctagacatccgacggatgtt 21535449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 366
Target Start/End: Original strand, 12891833 - 12891924
Alignment:
Q  275 acatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcc 366  Q
    |||||||||  || |||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || | ||||||||| |||||||    
T  12891833 acatggcggatggaggatggctatatacggtggtacactagggtgtatcaccctcagattttgccacttctttcgggagatctttcgaggcc 12891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40886789 - 40886693
Alignment:
Q  252 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 348  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |  ||  ||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40886789 ggggtgagccggcatgagaggtgacatggcagatggatgatggttatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacttattcc 40886693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40887012 - 40886874
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    |  ||||| |||||||| |  ||||| |||     
T  40887012 gagcatagagagatccaagattttgaggagattttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttgacaacgtgtatcgtcactttcttgagagagtta 40886913  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatc 167  Q
     | ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40886912 ggcggcagtaaggatacgtgcagaacgtccctagacatc 40886874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3729729 - 3729379
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729729 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 3729630  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccg-ccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3729629 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgcccttccattgtgcagatgttcgttgacttcc 3729530  T
Q  225 gcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3729529 gcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 3729430  T
Q  325 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729429 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 3729379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13637385 - 13637036
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13637385 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 13637286  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13637285 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggagctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 13637186  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13637185 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 13637086  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13637085 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 13637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 26878388 - 26878730
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878388 gaggagcacagagagatccatgacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26878487  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26878488 ttttgagacagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26878587  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26878588 cactcacacgcttaaggcggaagctcggggtgagcaagcaggagaggatacat-------ggcgaatggctatgtcctgtggtacactggggtgtctcac 26878680  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26878681 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttctgaggcctgcaaatga 26878730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 19158692 - 19159041
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19158692 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 19158791  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  19158792 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaaacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 19158891  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19158892 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 19158991  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158992 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19159041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 95474 - 95132
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  95474 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgataggg 95375  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  95374 ttttgaggcagtacggatatttccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 95275  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  95274 cactcacacgcttaaggcggatgattggggtgagcagacaggagagtagacatg-------gcggatggctatgtcctatagtacactagggtgtctcac 95182  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  95181 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 95132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31781039 - 31780697
Alignment:
Q  26 gaggagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 125  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31781039 gaggagcacagggagatccaggactttgaggggattttctggtattctggttggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 31780940  T
Q  126 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31780939 ttatgaggcagtacggatacgtccagaccatccccaaacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcagacgttcgtcgacttccg 31780840  T
Q  226 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31780839 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagtaggcaggagagcagacatg-------gcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31780747  T
Q  326 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31780746 cctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgaggcctgcaaatga 31780697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 22526686 - 22527016
Alignment:
Q  38 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 137  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526686 gagatctaggactttgaggaggttttctagtactctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 22526785  T
Q  138 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 237  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  22526786 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgccctcacacgct 22526885  T
Q  238 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 337  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22526886 taaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcaaacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttg 22526978  T
Q  338 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526979 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 22527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19522653 - 19522316
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19522653 gagcacagagagatacaggatattgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 19522554  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  19522553 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcaacttccgccc 19522454  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19522453 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 19522361  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 373  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19522360 cagattttgccacctcttccaggagatctttcgaggccagcaaat 19522316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 375
Target Start/End: Original strand, 52804570 - 52804888
Alignment:
Q  57 aggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat 156  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  52804570 aggttttctggtattatgcttggattatgtgaggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgt 52804669  T
Q  157 ccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||   || || |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |   |||||    
T  52804670 ccccagacatccgacggatgttgtagagctgccactgcctcacattgtgcagacgttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggt 52804769  T
Q  257 gagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 356  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  52804770 gagcaggcaggagagcagacatggaggatgacggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagata 52804869  T
Q  357 ttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  52804870 ttccgaggccagcaaatga 52804888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 47505016 - 47505350
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47505016 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtaatcaggctggattatgtgcggtgttcgt-gggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 47505114  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||   || |   ||||||||   |||||||||   |||||||||||| || |    
T  47505115 tgaggcagtacaaatacgtccagactgtccccagacatccgacggatgttgtagagcgatcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcgc 47505214  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  47505215 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 47505314  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgagg 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47505315 cagatcttgccacctcttccaggagatctttcgagg 47505350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 375
Target Start/End: Original strand, 11196549 - 11196883
Alignment:
Q  41 atccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacg 140  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  11196549 atccaggattttgaggaggttttttggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtagggtgtaccgtcacttgtctgagagggtgttgaggcagtacg 11196648  T
Q  141 gatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaa 240  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  11196649 gatacgtccagatgatccctagacatccgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcagacattcgtcgatttccgcactcacatgcttaa 11196748  T
Q  241 ggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgcca 340  Q
    ||||| ||    |||||||||||||| |||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  11196749 ggcggccgattagggtgagcaggcagcagagcagacatgtcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcgtattttgcca 11196848  T
Q  341 cctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11196849 cctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 11196883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 47660547 - 47660893
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||  || |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47660547 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattctggtattcaggctggattatctgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 47660646  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  47660647 tgaggaagtacggatacgtccagagggtccctagacatcggacgaatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttctgcac 47660746  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||| | || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  47660747 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagccgacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 47660846  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47660847 cagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatga 47660893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 45828251 - 45828596
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45828251 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtataccgtcacttgcccaagagggttt 45828350  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    ||||| |||||  |||||| || | | |||| |||||||| || ||||||   || || |||| ||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  45828351 tgaggtagtacaaatacgttcatagcgtccctagacatcctacagatgttgtagagctgccactgcctcagattgtgcag-cattcgtcgacttccgcac 45828449  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||   || ||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||    
T  45828450 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccct 45828549  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  45828550 cagattttgccacctctttcatgagatcttatgaggccagcaaatga 45828596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 49855377 - 49855036
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  49855377 ttcgagggggtattctggtattcaagttggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtgacttgcccgagaggg-tttgaggcactacagatacgtcc 49855279  T
Q  150 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 249  Q
    ||||| |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  49855278 agaccgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccggctcaaattgtgcagactttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggcggccga 49855179  T
Q  250 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 349  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | || |     
T  49855178 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttctttcg 49855079  T
Q  350 ggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  49855078 ggagatattccaaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 49855036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 50341525 - 50341407
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50341525 gagcacagggagatccaggatttagaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50341426  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgt 147  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50341425 tgaggcagtacggatacgt 50341407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50618052 - 50617929
Alignment:
Q  252 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50618052 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 50617953  T
Q  352 agatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  50617952 agatcttccgaggccagcaaatga 50617929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 375
Target Start/End: Original strand, 21143770 - 21143950
Alignment:
Q  188 ccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcgg 287  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||   |||||||||| |||| |||| ||||| ||||         
T  21143770 ccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagacaaggcg----- 21143864  T
Q  288 cggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
      ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21143865 --gatggctatgtgctatggtacacttgggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagttcttccgaggccagcaaatga 21143950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 138
Target Start/End: Original strand, 21143682 - 21143763
Alignment:
Q  57 aggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143682 aggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 21143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38120475 - 38120195
Alignment:
Q  95 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||   || ||  ||| ||    
T  38120475 cgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagacgatccctaaacatctgacggatgttgtagagctgacactgc 38120376  T
Q  195 cttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatgg 294  Q
    ||   |||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||| || |||| ||||||||||   |  ||| ||    
T  38120375 ctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcgtatgagggaggg 38120276  T
Q  295 ctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||  | |||||| ||| |||  | || |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38120275 ctatgtgttatggtacactaaggtaacccatcctcagatttttccacctcttctaggagatcttccgatgccagcaaatga 38120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35256622 - 35256520
Alignment:
Q  50 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  35256622 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagagttttgagacagtacggatacgttc 35256523  T
Q  150 aga 152  Q
    |||    
T  35256522 aga 35256520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23273632 - 23273541
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccga 120  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23273632 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttttggtattccggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccga 23273541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16269984 - 16269827
Alignment:
Q  218 gacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctaggg 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||  | |||||| ||| |     
T  16269984 gacttccgcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacga 16269885  T
Q  318 tgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16269884 tgtctcacccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatga 16269827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23273506 - 23273427
Alignment:
Q  277 atggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 356  Q
    |||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  23273506 atggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatc 23273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35256482 - 35256425
Alignment:
Q  335 ttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  35256482 ttgccacttattccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 35256425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 12025 - 12371
Alignment:
Q  29 gagcagagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 128  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12025 gagcacagggagatccaggcttttgaggacgtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcatttgctcgagagggttt 12124  T
Q  129 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 228  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  12125 tgaggcagtacgaatacgtcctgaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgtagtctttcgtcgacttccgcac 12224  T
Q  229 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 328  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    |||||| | |  ||||||||||||    
T  12225 tcacacgcttaaggaggtcgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtaggatggtacaccattgtgtctcaccct 12324  T
Q  329 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 375  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  12325 cagattttgccacttcttccaggaaatattccgaggccaccaaatga 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Original strand, 56476 - 56579
Alignment:
Q  252 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  56476 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 56575  T
Q  352 agat 355  Q
    ||||    
T  56576 agat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22411 - 22343
Alignment:
Q  290 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 358  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  22411 gatggctatatactatggtacactagggtgtctcaacctctgattttgccacttcttctaggagatctt 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University