View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8606_low_4 (Length: 367)

Name: NF8606_low_4
Description: NF8606
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8606_low_4
NF8606_low_4
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (22-348)||(22191494-22191820)
chr7 (22-348)||(26812422-26812748)
chr7 (22-348)||(32129703-32130032)
chr7 (22-348)||(36518806-36519131)
chr7 (76-348)||(40301948-40302220)
chr7 (22-348)||(22656962-22657287)
chr7 (22-278)||(35028641-35028896)
chr7 (22-227)||(25218398-25218603)
chr7 (22-196)||(1940279-1940453)
chr7 (22-98)||(45549301-45549377)
chr7 (22-112)||(114813-114903)
chr7 (14-81)||(114761-114828)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (22-348)||(631802-632127)
chr6 (22-348)||(6379959-6380285)
chr6 (22-348)||(17960720-17961045)
chr6 (22-348)||(24932720-24933046)
chr6 (22-348)||(34838870-34839195)
chr6 (22-348)||(8219231-8219556)
chr6 (22-348)||(29427993-29428319)
chr6 (43-98)||(26654068-26654123)
chr6 (43-98)||(26760037-26760092)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (22-348)||(25790237-25790562)
chr3 (22-348)||(17466802-17467127)
chr3 (22-348)||(33748967-33749293)
chr3 (22-348)||(43474176-43474501)
chr3 (22-347)||(30691877-30692202)
chr3 (22-348)||(6048152-6048477)
chr3 (22-348)||(25832194-25832520)
chr3 (22-348)||(30417886-30418211)
chr3 (22-348)||(42600975-42601301)
chr3 (22-348)||(47144457-47144778)
chr3 (22-348)||(28154411-28154737)
chr3 (43-348)||(42561210-42561514)
chr3 (22-348)||(51427377-51427703)
chr3 (50-348)||(50017307-50017604)
chr3 (82-346)||(21225634-21225898)
chr3 (22-214)||(49028157-49028349)
chr3 (22-290)||(51973800-51974070)
chr3 (22-223)||(6832672-6832872)
chr3 (80-238)||(49357093-49357251)
chr3 (22-251)||(21231718-21231947)
chr3 (22-169)||(33935267-33935414)
chr3 (22-152)||(25450300-25450430)
chr3 (207-345)||(50034023-50034161)
chr3 (22-168)||(10426066-10426211)
chr3 (246-348)||(49028055-49028157)
chr3 (22-146)||(7008304-7008427)
chr3 (22-98)||(51304641-51304717)
chr3 (22-120)||(20139647-20139744)
chr3 (22-98)||(36178393-36178469)
chr3 (22-96)||(50033945-50034019)
chr3 (22-77)||(26165262-26165317)
chr3 (22-81)||(47700796-47700855)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (22-348)||(12855305-12855630)
chr2 (22-348)||(8852343-8852668)
chr2 (22-348)||(7587959-7588284)
chr2 (22-348)||(5146181-5146507)
chr2 (22-348)||(22351070-22351395)
chr2 (22-348)||(30822039-30822364)
chr2 (50-348)||(2780258-2780556)
chr2 (84-348)||(39433453-39433716)
chr2 (82-280)||(6363272-6363470)
chr2 (22-306)||(31192511-31192779)
chr2 (22-217)||(36855374-36855569)
chr2 (100-345)||(40881203-40881429)
chr2 (22-119)||(31173885-31173982)
chr2 (22-98)||(39433732-39433808)
chr2 (22-101)||(926876-926955)
chr2 (22-95)||(7763203-7763276)
chr2 (22-88)||(1987395-1987461)
chr2 (22-88)||(16218581-16218647)
chr2 (42-103)||(44280289-44280349)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (22-348)||(31468413-31468738)
chr1 (22-348)||(17680722-17681047)
chr1 (22-348)||(10266418-10266743)
chr1 (22-348)||(33164718-33165044)
chr1 (22-348)||(47299958-47300283)
chr1 (22-348)||(2477785-2478110)
chr1 (22-348)||(36230791-36231116)
chr1 (22-348)||(45239426-45239751)
chr1 (22-348)||(48387564-48387889)
chr1 (22-348)||(48404616-48404941)
chr1 (22-348)||(17783649-17783975)
chr1 (87-348)||(51520544-51520805)
chr1 (22-348)||(8468605-8468933)
chr1 (24-245)||(45455716-45455936)
chr1 (22-126)||(43739259-43739362)
chr1 (22-96)||(44929007-44929081)
chr1 (22-112)||(23093054-23093143)
chr1 (22-95)||(45362979-45363052)
chr1 (22-61)||(29523996-29524035)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (22-348)||(35099719-35100044)
chr8 (22-348)||(38206452-38206778)
chr8 (22-348)||(1634279-1634605)
chr8 (22-348)||(17741990-17742316)
chr8 (22-348)||(15053921-15054246)
chr8 (22-348)||(1957679-1958004)
chr8 (22-348)||(13815222-13815548)
chr8 (22-347)||(5212566-5212891)
chr8 (35-348)||(30532006-30532319)
chr8 (82-348)||(7511534-7511800)
chr8 (22-267)||(34955219-34955464)
chr8 (22-228)||(5735560-5735766)
chr8 (22-152)||(18029164-18029294)
chr8 (228-324)||(13784114-13784210)
chr8 (22-96)||(26244805-26244879)
chr8 (22-96)||(40283783-40283857)
chr8 (50-92)||(35099703-35099745)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (22-348)||(2214745-2215070)
chr4 (22-348)||(46916972-46917297)
chr4 (22-348)||(16174476-16174801)
chr4 (22-348)||(3532765-3533090)
chr4 (22-348)||(28899620-28899945)
chr4 (22-348)||(3617910-3618235)
chr4 (22-348)||(8992074-8992399)
chr4 (22-348)||(13110852-13111177)
chr4 (22-348)||(53183566-53183892)
chr4 (50-342)||(19409389-19409681)
chr4 (22-348)||(12158412-12158736)
chr4 (22-277)||(53347593-53347848)
chr4 (22-211)||(36656833-36657022)
chr4 (42-190)||(7401302-7401449)
chr4 (249-348)||(36657018-36657117)
chr4 (22-148)||(4981814-4981934)
chr4 (142-336)||(32462920-32463114)
chr4 (22-98)||(13094076-13094152)
chr4 (22-98)||(35809473-35809549)
chr4 (19-98)||(27863984-27864063)
chr4 (22-96)||(19273092-19273166)
chr4 (22-96)||(47749950-47750023)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (22-348)||(27942781-27943106)
chr5 (22-348)||(30647574-30647899)
chr5 (22-348)||(4577280-4577606)
chr5 (14-348)||(10569230-10569564)
chr5 (86-348)||(31013316-31013578)
chr5 (22-348)||(25032630-25032956)
chr5 (22-348)||(27406503-27406827)
chr5 (22-348)||(40889185-40889510)
chr5 (82-348)||(32976026-32976292)
chr5 (22-180)||(34710149-34710306)
chr5 (22-129)||(29618671-29618778)
chr5 (42-143)||(23648845-23648945)
chr5 (42-143)||(23809627-23809727)
chr5 (22-98)||(13479508-13479584)
chr5 (22-96)||(39238722-39238796)
chr5 (22-92)||(3455041-3455111)
chr5 (22-80)||(10569542-10569600)
chr5 (50-92)||(31013608-31013650)
chr5 (125-237)||(2299846-2299958)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (27-348)||(169987-170308)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (22-348)||(30006-30321)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (22-285)||(4860-5106)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (247-348)||(2229-2330)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (22-128)||(56811-56916)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 22191494 - 22191820
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191494 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 22191593  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22191594 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 22191693  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22191694 cacatgatttgcaaaagttggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 22191793  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22191794 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 22191820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 26812422 - 26812748
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812422 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaaacatacaacacacaactaatttatttagtacgatacaaatcatc 26812521  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812522 ttcaatcactatactttccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 26812621  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812622 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtggagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 26812721  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26812722 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 26812748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32130032 - 32129703
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgc----aacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaat 117  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32130032 acaacaaactaaacacgcgac-cacaaataacttaaaatggaagacaacaaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaat 32129934  T
Q  118 catcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctag 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129933 catcttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctag 32129834  T
Q  218 cacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129833 cacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtggagtatggttgcggtgtactggattcacttccatcagattgctcaaaatcggtccaacgttg 32129734  T
Q  318 agcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129733 agcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 32129703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 36518806 - 36519131
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36518806 acaacaaactaaatacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 36518904  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36518905 ttcaatcgtgaaacattccaaactttatccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 36519004  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36519005 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgatgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaatgttgagca 36519104  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36519105 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 36519131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 76 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40302220 - 40301948
Alignment:
Q  76 aagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgctt 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40302220 aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacagatcatcttcaatcacgaaacatttcaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgctt 40302121  T
Q  176 gcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtact 275  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  40302120 gcaatttgtgatgaacatgtggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggcgtact 40302021  T
Q  276 agatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40302020 agatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcgacaatc 40301948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 22656962 - 22657287
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22656962 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcata 22657060  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22657061 ttcaatcacgaaacatttcaaactttgtccatatgtgcttcactagatttgcttgcaattcgcgatgaacatttggatcacgtaactcggatctggcacg 22657160  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22657161 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacattgagca 22657260  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22657261 tatgtatctaattcatcctcaacaatc 22657287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35028896 - 35028641
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028896 acaacaaactaagcacgcaacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 35028798  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35028797 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 35028698  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactaga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35028697 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtattaga 35028641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25218603 - 25218398
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218603 acaacaaactaagcacacgacacacaaataacataaaatgcaatacaaaaaactaatcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 25218504  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25218503 ttcaatcacgatacattccaaactttgtcgatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctagatcacgcaacccggatctagcacg 25218404  T
Q  222 cacatg 227  Q
    ||||||    
T  25218403 cacatg 25218398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1940453 - 1940279
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  1940453 acaataaactaagcacgcgacacacaaataacttaagatgcaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtatgatacaaatcatc 1940354  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttg 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1940353 ttcaatcacgaaacattccaaactttgcccatatgtctttcactagatctgcttgcaattcatgatcaacatttg 1940279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 45549377 - 45549301
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45549377 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 45549301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 114813 - 114903
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgata 112  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  114813 acaacaaactaagcatgtggcacacaaataacttaaaatgcaagaaaacaaactaagcatacaacacacaagtattttatttagtacgata 114903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 114761 - 114828
Alignment:
Q  14 aattcaaaacaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcat 81  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  114761 aattcaatacaacaaactaagcatgcgataaacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcat 114828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 631802 - 632127
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631802 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 631900  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631901 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 632000  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  632001 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 632100  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  632101 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6380285 - 6379959
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6380285 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 6380186  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6380185 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacg 6380086  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6380085 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagca 6379986  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6379985 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 6379959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17961045 - 17960720
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17961045 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 17960947  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960946 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 17960847  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960846 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 17960747  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17960746 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 17960720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24933046 - 24932720
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933046 acaacaaactaaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatagaacgcacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatc 24932947  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932946 ttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatttgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 24932847  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932846 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatgattgcagtgtattggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 24932747  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24932746 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 24932720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 34838870 - 34839195
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34838870 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 34838968  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34838969 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 34839068  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34839069 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 34839168  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34839169 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 34839195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 8219231 - 8219556
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219231 acaacaaactaagcactcgacacacaaatagcttaaaatgtaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 8219329  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219330 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgcgcttcacaatatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 8219429  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8219430 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggctgcggtgtactagatccacttccctcaaattgctcaaaatctttccaacgttgagca 8219529  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8219530 tatgtatttcgttcatcctcaacaatc 8219556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29428319 - 29427993
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29428319 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatacaatacaaaaaactaagcatacagcacacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatc 29428220  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29428219 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagaacg 29428120  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29428119 cacatgatttgcaaatgctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtattagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttaagca 29428020  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29428019 tatgcatctcgttcatcctcaacaatc 29427993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26654123 - 26654068
Alignment:
Q  43 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654123 acacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 26654068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26760092 - 26760037
Alignment:
Q  43 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26760092 acacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 26760037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25790562 - 25790237
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790562 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 25790464  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790463 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 25790364  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790363 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 25790264  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25790263 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 25790237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 17466802 - 17467127
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17466802 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacagcaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 17466900  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17466901 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 17467000  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17467001 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 17467100  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17467101 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 17467127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 33748967 - 33749293
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33748967 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 33749066  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33749067 ttcaaccacgatacattccaaactttgtccatatctgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 33749166  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33749167 cacatgatttgcaaaagttggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 33749266  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33749267 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 33749293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 43474176 - 43474501
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43474176 acaacaaactaagcacgcgtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatataaatcatc 43474274  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43474275 ttcaatcacgaaacatttcaaactttgtccatatgtccttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcaca 43474374  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43474375 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtttactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 43474474  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43474475 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 43474501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30692202 - 30691877
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30692202 acaacaaactaagcatgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacgcaagtaatttatttagtacgatagaaatcatc 30692103  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30692102 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactaggtctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 30692003  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692002 cacatgatttgcaaaagttggtaacacctcggtcgagcatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 30691903  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30691902 tatgtatctcgttcatcctcaacaat 30691877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6048477 - 6048152
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6048477 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 6048379  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6048378 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 6048279  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6048278 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcatattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 6048179  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6048178 tatgtatcgcgttcatcctcaacaatc 6048152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25832520 - 25832194
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25832520 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 25832421  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25832420 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacg 25832321  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25832320 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagca 25832221  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25832220 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 25832194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30418211 - 30417886
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30418211 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 30418113  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30418112 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 30418013  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30418012 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 30417913  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30417912 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 30417886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42601301 - 42600975
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42601301 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 42601202  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42601201 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacg 42601102  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42601101 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagca 42601002  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42601001 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 42600975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 47144457 - 47144778
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    |||| ||||||||||||    
T  47144457 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaaataattta----gtacaatacaaatcatc 47144551  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144552 ttcaatcatgaaacattccaaattttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 47144651  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47144652 cacatgatttgcaaatgtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 47144751  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47144752 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 47144778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28154737 - 28154411
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28154737 acaacaaactaaacacgtgacacacaaataacttaaaatgcaagataataaactaaacatacaacacacaaggaatttatttagtacaatacaaatcatc 28154638  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28154637 ttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttgaatcacgcaactcggatctagcacg 28154538  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  28154537 cacatgatttgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgaacc 28154438  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28154437 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 28154411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 348
Target Start/End: Original strand, 42561210 - 42561514
Alignment:
Q  43 acacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaa 142  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42561210 acacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacagaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacatttcaa 42561308  T
Q  143 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtggg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42561309 actttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatatagcacacacatgatttgcaaaagtggg 42561408  T
Q  243 taacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561409 taacacctcagtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccatcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 42561508  T
Q  343 acaatc 348  Q
    ||||||    
T  42561509 acaatc 42561514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 51427377 - 51427703
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51427377 acaacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 51427476  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51427477 ttcaatcgcgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgtaattcgtgataaacatctggatcacgcaactcggatctaacacg 51427576  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51427577 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacgtgatccacttcccgctggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 51427676  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  51427677 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 51427703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 348
Target Start/End: Original strand, 50017307 - 50017604
Alignment:
Q  50 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 149  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  50017307 taacttaaaatacaatacaa-aaactaaacatacaatacgcaagtaatatatttagtacgatacaaatcattttcaatcacaatacattccaaactttat 50017405  T
Q  150 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50017406 ccatatgtgtttcactagatctgcttgcaatttgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagttggtaacacc 50017505  T
Q  250 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50017506 tcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacattgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 50017604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 346
Target Start/End: Original strand, 21225634 - 21225898
Alignment:
Q  82 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 181  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21225634 acaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgagcttcactagatctgcttgcaatt 21225733  T
Q  182 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21225734 cgtgatgaacatttggatcacgtaactcagatctagcacgtacatgatttgtaaaagcgggtaacacctcggttgagtatggttgcggtgtactagatcc 21225833  T
Q  282 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 346  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21225834 attttcctcagattgctcaaaatcggtccaatgttgagcataagtatctcgttcatccttaacaa 21225898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49028349 - 49028157
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028349 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 49028250  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatc 214  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028249 ttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatc 49028157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 51973800 - 51974070
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| || | | || ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  51973800 acaacaaactaagcatgtgacatacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagaacacaacacacaagtaacttaattagtacaatacaaatcatc 51973899  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatat--gtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagca 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51973900 ttcaatcacgaaacatttcaaacattgtccatatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttagatcacgcaactcggatctagca 51973999  T
Q  220 cgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctc 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  51974000 cgcacatgatttgcaaaagcgggtaactccttggtcgagtatggttgcggtgttttagatccactttcctc 51974070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 6832672 - 6832872
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6832672 acaacaaactaagcacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 6832770  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6832771 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatttgcttcactagatctgcttgtaattcgtgatgaacatttgcatcacgcaactcggatctagcacg 6832870  T
Q  222 ca 223  Q
    ||    
T  6832871 ca 6832872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49357251 - 49357093
Alignment:
Q  80 atacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49357251 atacaacacacaagtaatttatttagtacaatacaaatcatcttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaa 49357152  T
Q  180 ttcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49357151 ttcgtgatgaacatatggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaag 49357093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21231947 - 21231718
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21231947 acaataaactaagaacgcggcacacaaataccttaaaatgtaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatc 21231848  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||     
T  21231847 ttcaatcacgaaacattccaaattgtgtccatatattcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacagttggataacgcaactcagatctagcaca 21231748  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctc 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21231747 cacatgatttgcaaaagcggctaacacctc 21231718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 169
Target Start/End: Original strand, 33935267 - 33935414
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935267 acaacaaactaaacacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 33935366  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagat 169  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33935367 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagat 33935414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25450430 - 25450300
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25450430 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 25450331  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtcca 152  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25450330 ttcaatcacgatacattccaaactttgtcca 25450300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 345
Target Start/End: Original strand, 50034023 - 50034161
Alignment:
Q  207 ctcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50034023 ctcggatctagcacgcacatgatttgaaaaagctagtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtgctagatccacttcccccaggttgctcaaaatcg 50034122  T
Q  307 gtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50034123 gtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 50034161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10426211 - 10426066
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10426211 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 10426113  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactaga 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10426112 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactaga 10426066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49028157 - 49028055
Alignment:
Q  246 cacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49028157 cacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 49028058  T
Q  346 atc 348  Q
    |||    
T  49028057 atc 49028055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 7008304 - 7008427
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||| | ||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7008304 acaacaaactaagcacgggtcacacaaatagcttaaaacgcaagacaagaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 7008402  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactt 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  7008403 ttcaatcacgaaacattccaaactt 7008427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Original strand, 51304641 - 51304717
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51304641 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 51304717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 20139647 - 20139744
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcat 120  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||  |||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139647 acaagaaactaaacatgtggcacacaaatagtttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcat 20139744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36178469 - 36178393
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36178469 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacgacaaactaatcatacaacacacaagtaatt 36178393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 50033945 - 50034019
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50033945 acaacaaattaagcacgcggcacacaaaaaatttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 50034019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26165317 - 26165262
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaa 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26165317 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaa 26165262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 47700855 - 47700796
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcat 81  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47700855 acaacaaactaagcacgcgaagcacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcat 47700796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 12855305 - 12855630
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855305 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 12855403  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855404 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 12855503  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855504 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 12855603  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12855604 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 12855630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 8852343 - 8852668
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852343 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacataagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 8852441  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852442 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 8852541  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8852542 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 8852641  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8852642 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 8852668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7588284 - 7587959
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7588284 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 7588186  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588185 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 7588086  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7588085 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 7587986  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7587985 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 7587959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5146507 - 5146181
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5146507 acaacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaaataatttatttagtatgatacaaatcatc 5146408  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146407 ttcaatcacgatacattccaaactttgttcatacgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 5146308  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5146307 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 5146208  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5146207 tatgtatctcgtttatcctcaacaatc 5146181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22351395 - 22351070
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22351395 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgtaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 22351297  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351296 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 22351197  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351196 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggccgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 22351097  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22351096 tatgtatcgcgttcatcctcaacaatc 22351070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30822364 - 30822039
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30822364 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 30822266  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822265 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 30822166  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30822165 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 30822066  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30822065 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 30822039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 50 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2780556 - 2780258
Alignment:
Q  50 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 149  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2780556 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatttcaaactttgt 2780457  T
Q  150 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2780456 ccatatgtgtttcactagatctacttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcaaatctagcacgcacatgatttgcaaaagctggtaacacc 2780357  T
Q  250 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2780356 tcggtcgagtatggttgcattgtactagatccaattcccctaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 2780258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 84 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39433716 - 39433453
Alignment:
Q  84 aacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcg 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  39433716 aacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcacgatacatttcaaactttgtccatatgtgtttcattatatctccttgcaattcg 39433617  T
Q  184 tgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccac 283  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  39433616 tgatgaacatctggatcacacaattcggatctaccacgcacatgatttgcaaaagctagtaacacctcggttaagtatggttgcgatgtattagatccac 39433517  T
Q  284 ttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433516 ttccc-caggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 39433453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 6363272 - 6363470
Alignment:
Q  82 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6363272 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcacgaaacattccaaactctgtccatatgcgcttcactagatctgcttgcaatt 6363371  T
Q  182 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatc 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6363372 cgtgatgaacatttgaatcacgcaactcggatctagcacacacatgattttcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatc 6363470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31192779 - 31192511
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31192779 acaacaaactaaacacgcggcacacaaataacttaaaatgaaat----------------acaacacacaaataatttatttagtacgatagaaatcatc 31192696  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31192695 ttcaatcatgatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctacttgcagttcgtgacgaacatctggatgacgcaactcggatctagcacg 31192596  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcg 306  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31192595 cacatgatttgcaaaagctggtaacaccccggtcgagtatggttgcggtgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcg 31192511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36855569 - 36855374
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36855569 acaacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacagcacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 36855470  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctag 217  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36855469 ttcaatcacgatacattccaaactttgttcatatgtgtttcaatagatttgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctag 36855374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40881429 - 40881203
Alignment:
Q  100 atttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||               
T  40881429 atttagtacgatacaaatcatcttcaaa----atacattctaaactttgtccacgtgtgcttcactagatctacttgtaattcgtgatg----------- 40881345  T
Q  200 cacgcaactcgg-atctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgct 298  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40881344 ----caactcgggatctagcacgcacatgatttgcaaaagctagtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccc-caggttgct 40881250  T
Q  299 caaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaaca 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  40881249 caaaatcggtccaactttgagcatatatatcttgtccatcctcaaca 40881203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31173982 - 31173885
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatca 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31173982 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaattaagcatacaatacacaaataatttatttaatacgatagaaatca 31173885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 39433808 - 39433732
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433808 acaacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 39433732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 926955 - 926876
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  926955 acaacaaactaatcacacggaacacaaataacttaaaatgcattacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttat 926876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7763276 - 7763203
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagta 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763276 acaacaaactaaacacgcgacacacatataagttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagta 7763203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 1987395 - 1987461
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacac 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1987395 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataactcaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacac 1987461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16218647 - 16218581
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacac 88  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  16218647 acaataaattaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcacacaacac 16218581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 44280289 - 44280349
Alignment:
Q  42 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttattt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44280289 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttattt 44280349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 31468413 - 31468738
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468413 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 31468511  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468512 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 31468611  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468612 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 31468711  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31468712 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 31468738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17681047 - 17680722
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681047 acaacaaactaagcacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 17680949  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680948 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 17680849  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680848 cacatgattttcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtctactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 17680749  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17680748 tatgtatctctttcatcctcaacaatc 17680722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10266743 - 10266418
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10266743 acaacaaactaagcacgcgtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaacaaa-cacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaataatc 10266645  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266644 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 10266545  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266544 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggttgagtatggttgcgatgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 10266445  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10266444 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 10266418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 33164718 - 33165044
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164718 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 33164817  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164818 ttcaaccactgtacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 33164917  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33164918 cacatgatttgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatctacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 33165017  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33165018 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 33165044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47300283 - 47299958
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47300283 acaacaaactaagcacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagataacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 47300185  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47300184 ttcaatcacgaaacattccaaactttgttcatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcagatctagcacg 47300085  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47300084 cacatgatttgcaaaagtaggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagaaccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 47299985  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47299984 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 47299958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2478110 - 2477785
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2478110 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 2478012  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2478011 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 2477912  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477911 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 2477812  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2477811 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 2477785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 36230791 - 36231116
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36230791 acaacaaactaagcacgcgacatacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacataagtaatttatttagtacgatataaatcatc 36230889  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36230890 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgacgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 36230989  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36230990 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatgattgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaatgttgagca 36231089  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36231090 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 36231116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 45239426 - 45239751
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45239426 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 45239524  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239525 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 45239624  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239625 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 45239724  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45239725 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 45239751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 48387889 - 48387564
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48387889 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 48387791  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387790 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 48387691  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48387690 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 48387591  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48387590 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 48387564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 48404616 - 48404941
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48404616 acaacaaactaaatacggatcacacaaatagcttaaaatgcaacacaacaaac-aagcacacaacacacaggtaatttatttagtacgatacaaatcatc 48404714  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48404715 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgtttgcaattcgtgatgaacatttggatcacacaactcggatctagcacg 48404814  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48404815 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtctaacgttgagca 48404914  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48404915 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 48404941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 17783649 - 17783975
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17783649 acaacaaactaagcacacggcacacaaataacttaaaatgcaatacagaaaactaagcatccagcacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 17783748  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17783749 ttcaatcacgatacattccaaattttgtccatatgtgtttcactagatttgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatatagcacg 17783848  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17783849 cacatgatttgcaaatgctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccaaagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 17783948  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17783949 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 17783975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 87 - 348
Target Start/End: Original strand, 51520544 - 51520805
Alignment:
Q  87 acacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtga 186  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520544 acacaagtagtttatttagtaccatacaaatcatcttcaatcacgaaacatcccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtga 51520643  T
Q  187 tgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttc 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51520644 tgaacatttggatcacacaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacatctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttc 51520743  T
Q  287 cctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520744 ccttagattgctcaaaatcggtccaacgttgatcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 51520805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 8468605 - 8468933
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8468605 acaacaaactaagcacacgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtcatttatttagcacgatacaaatcatc 8468703  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8468704 ttcaatcacgaaacattccaaactttatcaatatgagcttcacaaaatatgcttgcaattcatgatgaacatttagatcaagcaactcggatctagcacg 8468803  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt---ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468804 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttga 8468903  T
Q  319 gcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8468904 acatatgtatctggttcatcctcaacaatc 8468933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45455936 - 45455716
Alignment:
Q  24 aacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatctt 123  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45455936 aacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacataacacacaagtaatttatttagtacgatacaaataatctt 45455838  T
Q  124 caatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgca 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45455837 caatcacaaaacattccaaactttgtccatatgtggttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaattcggatctagcacgca 45455738  T
Q  224 catgatttgcaaaagtgggtaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45455737 catgatttgcaaaagtgggtaa 45455716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 43739259 - 43739362
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43739259 acaacaaactaaacacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtatgatacaaatcatc 43739357  T
Q  122 ttcaa 126  Q
    |||||    
T  43739358 ttcaa 43739362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44929081 - 44929007
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  44929081 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaataaaaaaaactaagcatacatcacacaagtaa 44929007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 23093054 - 23093143
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgata 112  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23093054 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgata 23093143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Original strand, 45362979 - 45363052
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagta 95  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45362979 acaacaaactaaacacacgacacacatataagttaaaatgcaagacaacaaactatgcatacaacacacaagta 45363052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 61
Target Start/End: Original strand, 29523996 - 29524035
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatg 61  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29523996 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatg 29524035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 35099719 - 35100044
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099719 acaacaaactaagcatgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 35099817  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099818 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 35099917  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35099918 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 35100017  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  35100018 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 35100044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38206778 - 38206452
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206778 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagataacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 38206679  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206678 ttcaatcaccatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 38206579  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38206578 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 38206479  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38206478 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 38206452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1634605 - 1634279
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1634605 acaacaaactaaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgaaacaaatcatc 1634506  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634505 ttcaatcactatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 1634406  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634405 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggattcacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 1634306  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1634305 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 1634279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 17741990 - 17742316
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17741990 acaaaaaactaagcacgcggcacacaaataatttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcatc 17742089  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17742090 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcatgcaactcggatctagcacg 17742189  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742190 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgtggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 17742289  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17742290 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 17742316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 15053921 - 15054246
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15053921 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 15054019  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054020 ttcaatcgcgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 15054119  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15054120 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatacacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 15054219  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15054220 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 15054246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1958004 - 1957679
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1958004 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 1957906  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957905 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 1957806  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957805 cgcatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 1957706  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1957705 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 1957679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 13815222 - 13815548
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13815222 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtaggatacaaatcatc 13815321  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13815322 ttcaatcacgatacatttcaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 13815421  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815422 cacatgatttgcaaaagctagtaacacctcggtcgagtatgattgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 13815521  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13815522 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 13815548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Original strand, 5212566 - 5212891
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212566 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 5212665  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5212666 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccgtatgtgtttcactagatctgcttgtaattcgtaatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 5212765  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212766 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcctgcaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 5212865  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5212866 tatgtatctcgttcatcctcaacaat 5212891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30532319 - 30532006
Alignment:
Q  35 cacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaa 134  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30532319 cacgcgacacacaaataacttaaaatgcaagataacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatctttaatcatgata 30532220  T
Q  135 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30532219 cattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaattcgtgatgaacatttagatcacgcaactcggatctagcacgcatatgatttgca 30532120  T
Q  235 aaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 334  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30532119 aaagctggtaatacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgtt 30532020  T
Q  335 catcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||||||||    
T  30532019 catcctcaacaatc 30532006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7511800 - 7511534
Alignment:
Q  82 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7511800 acaacaaacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgtaatt 7511701  T
Q  182 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  7511700 catgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgtgtaacacctcagtcgagtatggttgcggtataatagatcc 7511601  T
Q  282 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7511600 actttcctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgaacatatgtatctcattcatcctcaacaatc 7511534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34955464 - 34955219
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34955464 acaacaaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaaccataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 34955365  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34955364 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcacttgatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 34955265  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgc 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34955264 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgc 34955219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 5735560 - 5735766
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5735560 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 5735659  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5735660 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctgaatcacgcaactcggatctagcacg 5735759  T
Q  222 cacatga 228  Q
    |||||||    
T  5735760 cacatga 5735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18029294 - 18029164
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18029294 acaacaaactaagctcgcaacacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 18029195  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtcca 152  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18029194 ttcaatcacgatacattccaaactttgtcca 18029164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13784210 - 13784114
Alignment:
Q  228 atttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatat 324  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13784210 atttgcaaaagatggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaagttgctcaaaattggtccaacgttgagcatat 13784114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 26244805 - 26244879
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26244805 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 26244879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 40283783 - 40283857
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40283783 acaacaaactaaacacgcgatacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcgtacaacacacaagtaa 40283857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 35099703 - 35099745
Alignment:
Q  50 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 92  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35099703 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatgcaacacacaa 35099745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2215070 - 2214745
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215070 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 2214972  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214971 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 2214872  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214871 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcagtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 2214772  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2214771 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 2214745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46917297 - 46916972
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917297 acaacaaactaagcacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 46917199  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917198 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 46917099  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46917098 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 46916999  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46916998 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 46916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16174801 - 16174476
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| |  ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174801 acaacaaactaagtacgggtgacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 16174703  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174702 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 16174603  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16174602 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 16174503  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16174502 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 16174476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3533090 - 3532765
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3533090 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatc 3532992  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532991 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 3532892  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3532891 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 3532792  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3532791 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 3532765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 28899620 - 28899945
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28899620 acaacaaactaagcacgcgacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 28899718  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28899719 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccgtatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcatg 28899818  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28899819 tacatgattttcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 28899918  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28899919 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 28899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3618235 - 3617910
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3618235 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 3618137  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618136 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 3618037  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3618036 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 3617937  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3617936 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 3617910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 8992074 - 8992399
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8992074 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 8992172  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992173 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 8992272  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8992273 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 8992372  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8992373 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 8992399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 13110852 - 13111177
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13110852 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 13110950  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110951 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 13111050  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111051 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 13111150  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13111151 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 13111177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53183892 - 53183566
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53183892 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 53183793  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53183792 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacg 53183693  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53183692 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggccgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagca 53183593  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53183592 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 53183566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 19409389 - 19409681
Alignment:
Q  50 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgt 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19409389 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatagaaatcatcttcaatcacgatacattccaaactttgt 19409488  T
Q  150 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  19409489 ccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatatggatcatgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagctggtaacgcc 19409588  T
Q  250 tcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctca 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19409589 tcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtctaacgttgagcatatgtacctcgttcatcctca 19409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 12158412 - 12158736
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12158412 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaaaaaattaagcatacagcacacaagtaatttatttagtacg-tacaaatcatc 12158510  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12158511 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcacg 12158610  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12158611 cacatgatttgcaaatgctggtagcaccttggtcgagtatggttgcgatgtactagatccacttccc-caggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 12158709  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12158710 tatgtatctcgtttatcctcaacaatc 12158736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53347848 - 53347593
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53347848 acaacaaactaaacatgcgacacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaaataatttatttagtaccatacaaatcatc 53347749  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53347748 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgggcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 53347649  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactag 277  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53347648 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactag 53347593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Original strand, 36656833 - 36657022
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36656833 acaacaaactaagcacgcgacacacaaacaacttaaaatgcaatacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatc 36656932  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcgg 211  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36656933 ttcaatcacggtacattccaaactttatccatatgtgtttcactagatctgtttgcaatttgtgatgaacatctggatcacgcaactcgg 36657022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Original strand, 7401302 - 7401449
Alignment:
Q  42 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 141  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7401302 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 7401400  T
Q  142 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7401401 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgttgaa 7401449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 249 - 348
Target Start/End: Original strand, 36657018 - 36657117
Alignment:
Q  249 ctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36657018 ctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccatttcccccaggttgctcaaattcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 36657117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 4981814 - 4981934
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4981814 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaa--ga----caacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 4981907  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttg 148  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||    
T  4981908 ttcaatcactatagattccaaactttg 4981934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 32462920 - 32463114
Alignment:
Q  142 aactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgg 241  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  32462920 aactttgcccatatgtgtttgactagatctgcttgccattcgtgatgtacatttgaatcacacatcacagatctagcacgcacatgattcacaaatgtag 32463019  T
Q  242 gtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttca 336  Q
    ||| |||||  || ||  |||| |   |||||||||| ||||||  |||||| || ||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32463020 gtagcaccttagttgaaaatggctcaagtgtactagacccacttgtctcagactgatcataatttgtccaatgttgagcatatgtatcttgttca 32463114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13094152 - 13094076
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13094152 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 13094076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Original strand, 35809473 - 35809549
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35809473 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 35809549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 27863984 - 27864063
Alignment:
Q  19 aaaacaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27863984 aaaataacaaattaaacacgcgacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcgtacaacacacaagtaatt 27864063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 19273092 - 19273166
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19273092 acaacaaactaaacacgcgaaacacaaataaattaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 19273166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 47750023 - 47749950
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47750023 acaacaaattaagcacgcggcac-caaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacagcacacaagtaa 47749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 27942781 - 27943106
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27942781 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 27942879  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942880 ttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 27942979  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942980 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 27943079  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27943080 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 27943106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30647899 - 30647574
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647899 acaataaactaagcacacagcacacaaatagcttaaaatgcaagataacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 30647801  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30647800 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 30647701  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30647700 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactggatccacttccctcagattgctcaaaatcaatccaacgttgagca 30647601  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30647600 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 30647574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 4577280 - 4577606
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4577280 acaacaaactaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcaatacaacaaactaagcataaaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 4577379  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4577380 ttcaattacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctaccacg 4577479  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4577480 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcggtcgagtatggttgcgatgtacttgatccacttcccccaggttgctcaaaatcagtccaacgttgagca 4577579  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4577580 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 4577606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10569564 - 10569230
Alignment:
Q  14 aattcaaaacaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatac 113  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569564 aattcaatacaacaaactaagcacacggcacacaaataacttaaaatgcaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatac 10569465  T
Q  114 aaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggat 213  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569464 aaatcatcttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgtaatacgtgatgaacatttggatcacgcaactcggat 10569365  T
Q  214 ctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaac 313  Q
     |||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10569364 ttagcacacacatgatttgcaaaacctggtaacacatcggtcaagtatggttgcagtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaac 10569265  T
Q  314 gttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10569264 gttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 10569230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 86 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31013578 - 31013316
Alignment:
Q  86 cacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtg 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013578 cacacaaataatttatttagtacaatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaattttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtg 31013479  T
Q  186 atgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013478 atgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 31013379  T
Q  286 ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013378 ccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 31013316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 25032630 - 25032956
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25032630 acaacaaactaagcacgcgacacataaataacttaaaatgcaatacaaaaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 25032729  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25032730 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccatatgtgtttcactagatttgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgcaactcggatctagcaca 25032829  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25032830 cacttgatttgcaaatgctggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagca 25032929  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25032930 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 25032956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27406827 - 27406503
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406827 acaacaaactaagtacgcaacacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 27406729  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406728 ttcaatcgagaa-cattccaaactttatccatatgtgtttcactagatctgcttgcgattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 27406630  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406629 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccactttcctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 27406530  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27406529 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 27406503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Original strand, 40889185 - 40889510
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40889185 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaag-aagcacacaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatc 40889283  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889284 ttcaattgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 40889383  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40889384 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatccacttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 40889483  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40889484 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 40889510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32976292 - 32976026
Alignment:
Q  82 acaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32976292 acaacacacaagtaatttacttagttcgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaatt 32976193  T
Q  182 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatcc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  32976192 cgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgtgctgtactagatcc 32976093  T
Q  282 acttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32976092 acttccctcggattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaatc 32976026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Original strand, 34710149 - 34710306
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34710149 acaacaaactaagcacgcgacacacaaatagtttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttaatacgatacaaatcatc 34710247  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaat 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34710248 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttacaat 34710306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29618778 - 29618671
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29618778 acaacaaattaaacacgcgacacacaaataacttaaaacggaagacaacaaactaagcatacaagacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 29618679  T
Q  122 ttcaatca 129  Q
    ||||||||    
T  29618678 ttcaatca 29618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23648945 - 23648845
Alignment:
Q  42 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 141  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23648945 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 23648847  T
Q  142 aa 143  Q
    ||    
T  23648846 aa 23648845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Original strand, 23809627 - 23809727
Alignment:
Q  42 cacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaatcatgaaacattcca 141  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23809627 cacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttacttagtacgatacaaatcatcttcaatcgtgaaacattcca 23809725  T
Q  142 aa 143  Q
    ||    
T  23809726 aa 23809727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13479584 - 13479508
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13479584 acaacaaactaaacacgcgacgcacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatt 13479508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 39238722 - 39238796
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39238722 acaacaaactaaacacgcgacacacaaataatttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaagtaa 39238796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 3455041 - 3455111
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 92  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3455041 acaacaaactaaacacgcaacacacaaataacttaaaatggaagacaacaaactaagcatacaacacacaa 3455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10569600 - 10569542
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagca 80  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  10569600 acaacgaactaagcacgcgacacacaaataacttaaaattcaatacaacaaactaagca 10569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31013650 - 31013608
Alignment:
Q  50 taacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaa 92  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31013650 taacttaaaatgcaatacaacaaactaagcacacaacacacaa 31013608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Original strand, 2299846 - 2299958
Alignment:
Q  125 aatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcac 224  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||  |||| |||| || | ||| || | | ||||||||| ||||    
T  2299846 aatcatgaaacattctgaaccttgctcatatgtgtttgactagatatgcttgcaattcacgatgtacatctgaaccacacatcacagatctagcatgcac 2299945  T
Q  225 atgatttgcaaaa 237  Q
    || ||| ||||||    
T  2299946 attattcgcaaaa 2299958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 27 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 170308 - 169987
Alignment:
Q  27 aaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatcttcaa 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  170308 aaactaagcacgcggcacacaaataacttagaatgcaagacaacaaactaagcacacaacacacaagtaacttaattagtacgatacaaatcatcttcaa 170209  T
Q  127 tcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacgcacat 226  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  170208 tcgtgaaacattccaaactttgaccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcatgatgaacatttggatcacgcaactcagatatagcacgcacat 170109  T
Q  227 gatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgt 326  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  170108 gatttgcaaaagcagttaacacctcggtcgagtatggttgcggtgtaccatatccactttcctcatatttctcaaaatcgctccaatgttgagcatatgt 170009  T
Q  327 atctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  170008 atctcgttcatcatcaacaatc 169987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30321 - 30006
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |          |||||||    
T  30321 acaacaaattaagcacgcggcacacaaataacttaaaatgcattacaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatgga----------aatcatc 30232  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  30231 ttcaatcacgatacattccaaactttgtccagatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatctggatcacgtaactcggatctagcaca 30132  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagca 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30131 cacatgatttgcaaaagctggtaacacctcagtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttccct-agattgctctaaatcggtccaacgttgagca 30033  T
Q  322 tatgtatctcgttcatcctcaacaatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30032 tatgtatctcgttcatcctcaataatc 30006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5106 - 4860
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5106 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatataaatcatc 5008  T
Q  122 ttcaatcatgaaacattccaaactttgtccatatgtgcttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcggatctagcacg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  5007 ttcaatcacgaaacattccaaactttgtccataggtccttcactagatctgcttgcaattcgtgatgaacatttggatcacgcaactcg----------- 4919  T
Q  222 cacatgatttgcaaaagtgggtaacacctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccactt 285  Q
         ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4918 -----gatttgcaaaagtggataacacctcagtcgagtatgcttgcggtgtactagatccactt 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2229
Alignment:
Q  247 acctcggtcgagtatggttgctgtgtactagatccacttccctcagattgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2330 acctcggtcgagtatggttgcggtgtactagatccacttcccccaggttgctcaaaatcggtccaacgttgagcatatgtatctcgttcatcctcaacaa 2231  T
Q  347 tc 348  Q
    ||    
T  2230 tc 2229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 56916 - 56811
Alignment:
Q  22 acaacaaactaaacacgcggcacacagataacttaaaatgaaatgcaacaaactaagcatacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 121  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56916 acaacaaactaagtacgggtcacacaaatagcttaaaatgcaagacaacaaac-aagcacacaacacacaagtaatttatttagtacgatacaaatcatc 56818  T
Q  122 ttcaatc 128  Q
    |||||||    
T  56817 ttcaatc 56811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University