View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8610_high_1 (Length: 486)

Name: NF8610_high_1
Description: NF8610
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8610_high_1
NF8610_high_1
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (16-486)||(34644629-34645099)
chr6 (16-486)||(19880066-19880536)
chr6 (16-486)||(18795458-18795928)
chr6 (16-486)||(21563175-21563645)
chr6 (16-486)||(21569034-21569504)
chr6 (25-486)||(21472378-21472839)
chr6 (19-486)||(5296249-5296716)
chr6 (19-486)||(19454191-19454658)
chr6 (24-485)||(15460112-15460573)
chr6 (19-486)||(8761976-8762443)
chr6 (16-407)||(25768959-25769350)
chr6 (16-486)||(19488315-19488785)
chr6 (16-486)||(14380510-14380980)
chr6 (16-482)||(10467896-10468362)
chr6 (16-486)||(19435770-19436240)
chr6 (66-486)||(14378960-14379380)
chr6 (16-486)||(23079237-23079707)
chr6 (16-485)||(28281857-28282326)
chr6 (16-482)||(22443035-22443501)
chr6 (16-482)||(15896862-15897328)
chr6 (16-482)||(22434637-22435103)
chr6 (16-485)||(27188204-27188673)
chr6 (16-485)||(27260567-27261036)
chr6 (16-485)||(5838263-5838732)
chr6 (34-379)||(18196875-18197220)
chr6 (25-486)||(20636344-20636805)
chr6 (16-482)||(16625764-16626230)
chr6 (16-486)||(29590963-29591433)
chr6 (16-485)||(1542128-1542597)
chr6 (25-486)||(24365189-24365650)
chr6 (16-486)||(22761498-22761968)
chr6 (16-482)||(19865455-19865921)
chr6 (16-485)||(16926684-16927153)
chr6 (25-485)||(28262241-28262701)
chr6 (25-485)||(28340990-28341450)
chr6 (16-451)||(22077768-22078203)
chr6 (16-482)||(25113320-25113786)
chr6 (16-482)||(25608908-25609374)
chr6 (34-335)||(18966486-18966787)
chr6 (16-485)||(16962489-16962958)
chr6 (16-482)||(2873850-2874316)
chr6 (16-482)||(24312215-24312681)
chr6 (16-182)||(27566327-27566493)
chr6 (25-425)||(27330537-27330937)
chr6 (25-425)||(27391277-27391677)
chr6 (209-482)||(27564868-27565141)
chr6 (34-125)||(18436395-18436486)
chr6 (349-482)||(18406991-18407124)
chr6 (31-123)||(16098833-16098925)
chr6 (40-191)||(18407280-18407431)
chr6 (36-122)||(16381780-16381866)
chr6 (349-446)||(14624440-14624537)
chr6 (37-122)||(14624764-14624849)
chr6 (36-122)||(1648221-1648307)
chr6 (36-122)||(23997036-23997122)
chr6 (36-101)||(15077794-15077859)
chr6 (349-446)||(16649052-16649149)
chr6 (401-482)||(18196780-18196861)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (16-486)||(19613569-19614039)
chr7 (15-486)||(11387313-11387784)
chr7 (16-486)||(19148105-19148575)
chr7 (16-486)||(20747504-20747974)
chr7 (16-486)||(15101488-15101958)
chr7 (16-486)||(14263129-14263599)
chr7 (16-486)||(16071180-16071649)
chr7 (16-486)||(12205685-12206155)
chr7 (16-486)||(16949357-16949826)
chr7 (16-486)||(291-762)
chr7 (19-482)||(14285265-14285728)
chr7 (16-486)||(13022251-13022721)
chr7 (19-486)||(13666434-13666901)
chr7 (19-482)||(15341328-15341791)
chr7 (16-479)||(11771155-11771618)
chr7 (16-482)||(18052842-18053308)
chr7 (24-486)||(12457542-12458004)
chr7 (16-482)||(23504759-23505225)
chr7 (19-364)||(12456599-12456944)
chr7 (15-317)||(14434584-14434886)
chr7 (25-486)||(26117490-26117951)
chr7 (25-486)||(11305148-11305609)
chr7 (34-482)||(320948-321396)
chr7 (25-471)||(15625454-15625902)
chr7 (25-482)||(49153204-49153661)
chr7 (16-482)||(8708498-8708964)
chr7 (16-482)||(15204512-15204978)
chr7 (16-486)||(44790258-44790728)
chr7 (15-151)||(14130766-14130902)
chr7 (16-482)||(10871888-10872354)
chr7 (16-482)||(11236124-11236590)
chr7 (16-454)||(14040588-14041026)
chr7 (16-454)||(14350618-14351056)
chr7 (16-482)||(15159968-15160434)
chr7 (16-482)||(9596950-9597416)
chr7 (25-486)||(13967553-13968014)
chr7 (25-486)||(14955460-14955917)
chr7 (55-482)||(14333328-14333755)
chr7 (16-482)||(8199521-8199987)
chr7 (16-482)||(18178635-18179101)
chr7 (16-482)||(18550669-18551135)
chr7 (16-482)||(13686957-13687423)
chr7 (16-482)||(23202524-23202990)
chr7 (16-482)||(23508651-23509117)
chr7 (36-480)||(12688414-12688857)
chr7 (16-482)||(16229-16693)
chr7 (56-486)||(11552009-11552439)
chr7 (25-482)||(14212576-14213033)
chr7 (16-225)||(15153825-15154034)
chr7 (25-152)||(8211347-8211474)
chr7 (318-477)||(15147801-15147960)
chr7 (16-95)||(21662854-21662933)
chr7 (36-123)||(17924564-17924651)
chr7 (36-122)||(27107045-27107131)
chr7 (34-123)||(4440839-4440928)
chr7 (36-122)||(7824813-7824899)
chr7 (36-101)||(13354063-13354128)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (16-486)||(32578-33048)
scaffold0076 (19-486)||(55801-56268)
scaffold0076 (36-122)||(41213-41299)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (16-486)||(21679858-21680328)
chr5 (19-486)||(24619375-24619842)
chr5 (19-486)||(24715606-24716073)
chr5 (19-486)||(24748634-24749101)
chr5 (24-482)||(20822279-20822737)
chr5 (24-482)||(22462778-22463235)
chr5 (16-392)||(21889933-21890309)
chr5 (24-475)||(20774585-20775036)
chr5 (16-449)||(21830878-21831311)
chr5 (24-485)||(28894023-28894484)
chr5 (24-485)||(28915494-28915955)
chr5 (24-485)||(28922849-28923310)
chr5 (19-486)||(22235000-22235467)
chr5 (16-486)||(21563053-21563523)
chr5 (25-486)||(24797477-24797938)
chr5 (25-482)||(23079173-23079630)
chr5 (25-486)||(14886071-14886532)
chr5 (15-481)||(17268419-17268885)
chr5 (25-486)||(37542461-37542922)
chr5 (16-451)||(26737842-26738277)
chr5 (25-486)||(20343109-20343570)
chr5 (16-482)||(23441046-23441512)
chr5 (16-486)||(16357338-16357808)
chr5 (16-486)||(27519243-27519712)
chr5 (16-482)||(27611190-27611656)
chr5 (16-482)||(27684484-27684950)
chr5 (16-486)||(34567330-34567800)
chr5 (16-482)||(23574573-23575031)
chr5 (25-482)||(25848902-25849359)
chr5 (16-482)||(14998823-14999289)
chr5 (16-482)||(22331971-22332437)
chr5 (16-482)||(27667574-27668040)
chr5 (16-225)||(21496891-21497100)
chr5 (16-482)||(20467182-20467647)
chr5 (16-482)||(29475157-29475623)
chr5 (25-482)||(22135513-22135970)
chr5 (301-485)||(28930762-28930946)
chr5 (16-485)||(19770796-19771265)
chr5 (16-377)||(20800284-20800645)
chr5 (16-486)||(40709616-40710086)
chr5 (16-485)||(41771678-41772147)
chr5 (25-482)||(21881794-21882251)
chr5 (16-479)||(21338384-21338847)
chr5 (52-422)||(23517398-23517768)
chr5 (25-486)||(22503506-22503967)
chr5 (16-486)||(37290576-37291046)
chr5 (318-486)||(23472366-23472534)
chr5 (16-251)||(18776606-18776841)
chr5 (390-486)||(21872130-21872226)
chr5 (390-486)||(21876410-21876506)
chr5 (16-116)||(22349259-22349359)
chr5 (367-484)||(21497118-21497228)
chr5 (16-181)||(25424025-25424189)
chr5 (349-482)||(25427602-25427735)
chr5 (16-166)||(23472065-23472215)
chr5 (349-482)||(18776965-18777098)
chr5 (349-485)||(21408307-21408443)
chr5 (16-112)||(21407974-21408070)
chr5 (432-482)||(873-923)
chr5 (36-122)||(24582048-24582134)
chr5 (34-122)||(27011920-27012008)
chr5 (36-122)||(21936632-21936718)
chr5 (36-122)||(23504280-23504366)
chr5 (349-446)||(24582361-24582458)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (24-486)||(23954-24416)
scaffold0090 (24-486)||(19792-20254)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (16-486)||(113494-113964)
scaffold0029 (24-323)||(95066-95365)
scaffold0029 (16-485)||(108713-109182)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (16-486)||(49415-49885)
scaffold0028 (16-485)||(44089-44555)
scaffold0028 (16-482)||(9409-9875)
scaffold0028 (37-285)||(718-966)
scaffold0028 (16-482)||(15871-16337)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (16-486)||(13971246-13971716)
chr3 (16-486)||(14087206-14087676)
chr3 (16-485)||(14574456-14574925)
chr3 (34-482)||(10419175-10419623)
chr3 (19-486)||(12359653-12360135)
chr3 (19-486)||(17493166-17493633)
chr3 (19-486)||(31939439-31939906)
chr3 (19-486)||(31694312-31694779)
chr3 (19-486)||(18133472-18133939)
chr3 (16-486)||(16827329-16827799)
chr3 (19-486)||(13319628-13320095)
chr3 (16-486)||(15228182-15228652)
chr3 (25-486)||(47124486-47124947)
chr3 (15-482)||(16835640-16836107)
chr3 (16-482)||(41178055-41178521)
chr3 (25-486)||(28754860-28755321)
chr3 (16-394)||(11302991-11303369)
chr3 (16-482)||(44777780-44778246)
chr3 (25-482)||(16380058-16380515)
chr3 (16-486)||(11960295-11960765)
chr3 (16-449)||(4678971-4679404)
chr3 (94-486)||(15234128-15234520)
chr3 (16-482)||(13942557-13943023)
chr3 (35-482)||(14580083-14580530)
chr3 (16-482)||(5424071-5424537)
chr3 (16-486)||(16337638-16338108)
chr3 (16-486)||(13253213-13253683)
chr3 (16-486)||(16636296-16636766)
chr3 (16-486)||(43163620-43164090)
chr3 (16-485)||(15347383-15347852)
chr3 (274-486)||(17187165-17187377)
chr3 (16-486)||(10006123-10006593)
chr3 (16-486)||(10906733-10907203)
chr3 (16-486)||(15588529-15588999)
chr3 (16-486)||(20061191-20061661)
chr3 (16-486)||(48425970-48426440)
chr3 (16-482)||(14875640-14876105)
chr3 (16-200)||(8758494-8758678)
chr3 (25-486)||(16328786-16329247)
chr3 (25-482)||(17490382-17490839)
chr3 (16-482)||(15401658-15402124)
chr3 (16-482)||(15724075-15724541)
chr3 (57-482)||(12498812-12499237)
chr3 (16-166)||(15248670-15248820)
chr3 (16-482)||(15339792-15340258)
chr3 (25-203)||(10384510-10384688)
chr3 (16-485)||(53384156-53384625)
chr3 (16-482)||(14125735-14126201)
chr3 (25-485)||(6601268-6601728)
chr3 (70-245)||(13299889-13300064)
chr3 (70-245)||(13310547-13310722)
chr3 (16-166)||(15209414-15209564)
chr3 (16-482)||(16692687-16693153)
chr3 (265-482)||(15260402-15260619)
chr3 (16-452)||(16411453-16411889)
chr3 (16-404)||(26791618-26792006)
chr3 (16-451)||(16755757-16756192)
chr3 (348-486)||(16491318-16491456)
chr3 (57-371)||(16371976-16372290)
chr3 (379-486)||(12179234-12179341)
chr3 (16-185)||(16806364-16806533)
chr3 (16-124)||(15015255-15015363)
chr3 (16-182)||(15062267-15062433)
chr3 (33-101)||(16491703-16491771)
chr3 (34-101)||(9523260-9523327)
chr3 (36-123)||(16257697-16257784)
chr3 (36-122)||(8273900-8273986)
chr3 (36-122)||(13966841-13966927)
chr3 (208-450)||(15062433-15062675)
chr3 (36-122)||(16742204-16742290)
chr3 (318-452)||(16806118-16806252)
chr3 (36-122)||(30138359-30138445)
chr3 (36-122)||(30147910-30147996)
chr3 (36-123)||(6711909-6711996)
chr3 (349-446)||(8273576-8273673)
chr3 (349-446)||(13966521-13966618)
chr3 (349-446)||(25767184-25767281)
chr3 (50-122)||(12792708-12792780)
chr3 (50-122)||(15610670-15610742)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (98-486)||(6586-6974)
scaffold0117 (349-446)||(365-462)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (24-482)||(826-1284)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (16-486)||(19852381-19852851)
chr8 (16-486)||(19858417-19858887)
chr8 (16-486)||(21841387-21841857)
chr8 (27-486)||(20984888-20985347)
chr8 (19-485)||(23655900-23656366)
chr8 (16-486)||(31415812-31416285)
chr8 (16-486)||(20009262-20009730)
chr8 (19-482)||(1267211-1267674)
chr8 (19-486)||(20974997-20975459)
chr8 (15-482)||(22051832-22052299)
chr8 (16-486)||(22371910-22372371)
chr8 (16-486)||(20389069-20389539)
chr8 (16-482)||(31570187-31570653)
chr8 (16-482)||(19978937-19979403)
chr8 (16-482)||(20395477-20395943)
chr8 (25-451)||(22376830-22377256)
chr8 (25-451)||(22383005-22383431)
chr8 (25-486)||(14566121-14566582)
chr8 (25-482)||(6680090-6680547)
chr8 (25-436)||(803064-803475)
chr8 (16-482)||(19483409-19483875)
chr8 (16-486)||(29302767-29303237)
chr8 (25-482)||(6604637-6605094)
chr8 (57-486)||(21165879-21166308)
chr8 (16-482)||(18857547-18858013)
chr8 (16-482)||(17673368-17673834)
chr8 (25-482)||(30312489-30312946)
chr8 (25-485)||(16270566-16271026)
chr8 (16-486)||(22247774-22248228)
chr8 (16-482)||(23651011-23651477)
chr8 (16-485)||(12305728-12306197)
chr8 (18-362)||(22988168-22988512)
chr8 (16-482)||(19113660-19114126)
chr8 (57-377)||(16407495-16407815)
chr8 (16-482)||(22128303-22128769)
chr8 (16-481)||(21921082-21921547)
chr8 (130-482)||(23886108-23886460)
chr8 (55-482)||(15534392-15534819)
chr8 (16-179)||(23949889-23950052)
chr8 (25-197)||(27355527-27355698)
chr8 (16-482)||(22040829-22041295)
chr8 (25-482)||(22119519-22119976)
chr8 (16-486)||(32601114-32601584)
chr8 (25-486)||(21043424-21043885)
chr8 (238-482)||(20017608-20017852)
chr8 (25-486)||(21251920-21252384)
chr8 (301-482)||(21324614-21324794)
chr8 (16-486)||(22132382-22132852)
chr8 (348-482)||(21393210-21393344)
chr8 (348-482)||(21787704-21787838)
chr8 (36-123)||(25283120-25283207)
chr8 (36-123)||(25283346-25283433)
chr8 (25-191)||(21393501-21393667)
chr8 (25-191)||(21787995-21788161)
chr8 (52-123)||(23156716-23156787)
chr8 (36-122)||(16876800-16876886)
chr8 (54-124)||(22623567-22623637)
chr8 (36-123)||(21196206-21196293)
chr8 (36-123)||(22316181-22316268)
chr8 (36-122)||(21850042-21850128)
chr8 (412-446)||(23156393-23156427)
chr8 (349-446)||(16876476-16876573)
chr8 (274-326)||(22623492-22623544)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (16-486)||(27459-27929)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (15-482)||(68304-68771)
scaffold0034 (19-486)||(3854-4321)
scaffold0034 (16-486)||(12809-13272)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (16-486)||(2231-2701)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (16-486)||(89346-89816)
scaffold0001 (16-486)||(90024-90494)
scaffold0001 (16-98)||(390489-390571)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (15-482)||(27901289-27901756)
chr4 (16-486)||(15002262-15002732)
chr4 (34-485)||(15246846-15247297)
chr4 (16-479)||(15413931-15414394)
chr4 (16-482)||(15358022-15358488)
chr4 (15-479)||(1648182-1648646)
chr4 (16-486)||(8706822-8707294)
chr4 (16-395)||(15078539-15078918)
chr4 (16-482)||(33223827-33224293)
chr4 (16-486)||(15320054-15320510)
chr4 (25-486)||(3263692-3264153)
chr4 (19-486)||(16148618-16149085)
chr4 (19-486)||(16152764-16153231)
chr4 (25-486)||(29452435-29452896)
chr4 (16-479)||(14850011-14850474)
chr4 (25-486)||(11206129-11206590)
chr4 (52-482)||(14695053-14695483)
chr4 (52-482)||(15146527-15146957)
chr4 (16-486)||(19777431-19777901)
chr4 (16-482)||(8052265-8052731)
chr4 (16-486)||(8387316-8387786)
chr4 (16-486)||(12477504-12477974)
chr4 (16-486)||(29038042-29038512)
chr4 (25-482)||(44660768-44661225)
chr4 (16-485)||(23956651-23957120)
chr4 (16-482)||(40473944-40474410)
chr4 (16-482)||(14302620-14303086)
chr4 (52-482)||(16354087-16354517)
chr4 (16-482)||(18226088-18226554)
chr4 (16-486)||(14160374-14160844)
chr4 (16-486)||(14681471-14681941)
chr4 (16-485)||(27712240-27712709)
chr4 (25-486)||(20891895-20892356)
chr4 (16-486)||(12524580-12525050)
chr4 (16-486)||(18298109-18298579)
chr4 (355-486)||(15071602-15071733)
chr4 (16-189)||(1639360-1639533)
chr4 (231-482)||(51605694-51605945)
chr4 (144-486)||(18614462-18614804)
chr4 (16-191)||(7091336-7091511)
chr4 (34-122)||(15292420-15292508)
chr4 (36-92)||(16029035-16029091)
chr4 (301-446)||(9292024-9292169)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (16-486)||(5365-5835)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (34-486)||(47935-48387)
scaffold0053 (15-485)||(56749-57219)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (16-486)||(28992-29462)
scaffold0026 (61-482)||(29925-30346)
scaffold0026 (439-486)||(50168-50215)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (15-482)||(10962-11429)
scaffold0298 (15-482)||(14732-15199)
scaffold0298 (16-414)||(20918-21316)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (129-486)||(23099456-23099813)
chr2 (23-486)||(23277318-23277781)
chr2 (16-290)||(27364713-27364987)
chr2 (24-482)||(27209614-27210072)
chr2 (16-486)||(23111270-23111741)
chr2 (19-486)||(23294473-23294940)
chr2 (16-479)||(19651495-19651960)
chr2 (25-486)||(1064295-1064756)
chr2 (19-486)||(24949127-24949595)
chr2 (25-486)||(31831202-31831663)
chr2 (16-482)||(27788276-27788741)
chr2 (28-482)||(20828806-20829260)
chr2 (16-481)||(24676024-24676489)
chr2 (16-482)||(12574888-12575354)
chr2 (16-479)||(21324711-21325174)
chr2 (16-482)||(21144483-21144949)
chr2 (16-482)||(27371804-27372270)
chr2 (16-486)||(16923424-16923894)
chr2 (16-486)||(16925895-16926365)
chr2 (16-486)||(16982687-16983157)
chr2 (16-486)||(16999535-17000005)
chr2 (16-486)||(17064252-17064722)
chr2 (16-482)||(41607827-41608293)
chr2 (16-482)||(24710569-24711035)
chr2 (16-486)||(10869385-10869855)
chr2 (16-482)||(24876191-24876657)
chr2 (28-486)||(27218563-27219021)
chr2 (16-482)||(44385011-44385477)
chr2 (16-377)||(21890265-21890626)
chr2 (28-203)||(20833532-20833707)
chr2 (16-482)||(24262905-24263371)
chr2 (16-451)||(24706955-24707390)
chr2 (16-482)||(22324298-22324764)
chr2 (25-482)||(23066935-23067391)
chr2 (57-482)||(23107172-23107597)
chr2 (16-485)||(30210357-30210824)
chr2 (16-116)||(45530046-45530146)
chr2 (57-251)||(22756138-22756332)
chr2 (16-344)||(9610671-9610999)
chr2 (34-270)||(24819340-24819576)
chr2 (16-191)||(17067910-17068085)
chr2 (25-110)||(11357688-11357773)
chr2 (295-485)||(45533159-45533349)
chr2 (174-485)||(30011623-30011932)
chr2 (36-122)||(12640035-12640121)
chr2 (38-123)||(21905970-21906055)
chr2 (36-122)||(24830990-24831075)
chr2 (349-446)||(12639711-12639808)
chr2 (36-101)||(22276833-22276898)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (16-486)||(10728-11198)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (16-485)||(804-1273)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (16-485)||(5685-6154)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (73-485)||(48096-48508)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (16-486)||(24098573-24099043)
chr1 (222-485)||(20060923-20061186)
chr1 (15-486)||(19662107-19662578)
chr1 (19-486)||(20939033-20939500)
chr1 (28-482)||(20855734-20856188)
chr1 (25-486)||(19855233-19855694)
chr1 (94-486)||(23197216-23197608)
chr1 (16-486)||(20834870-20835328)
chr1 (19-482)||(16373451-16373915)
chr1 (16-482)||(22109941-22110407)
chr1 (16-482)||(22113790-22114256)
chr1 (25-486)||(31538967-31539428)
chr1 (25-486)||(37678008-37678469)
chr1 (16-482)||(41352636-41353102)
chr1 (25-486)||(20295340-20295801)
chr1 (16-486)||(51332463-51332933)
chr1 (16-482)||(21025092-21025558)
chr1 (16-485)||(33390000-33390469)
chr1 (16-479)||(21749860-21750322)
chr1 (16-191)||(50619509-50619684)
chr1 (16-482)||(16077630-16078096)
chr1 (16-486)||(19107287-19107757)
chr1 (16-482)||(19759847-19760313)
chr1 (16-482)||(21831222-21831688)
chr1 (25-486)||(21951837-21952298)
chr1 (16-482)||(21837869-21838335)
chr1 (25-454)||(22361246-22361675)
chr1 (16-486)||(16349566-16350039)
chr1 (348-486)||(431086-431224)
chr1 (16-101)||(20139749-20139834)
chr1 (381-486)||(21744522-21744627)
chr1 (149-482)||(21234705-21235038)
chr1 (25-486)||(17043985-17044446)
chr1 (35-191)||(20250739-20250895)
chr1 (36-122)||(20830726-20830812)
chr1 (409-482)||(24793591-24793664)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (16-485)||(3111-3580)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (19-486)||(194605-195072)
scaffold0011 (16-486)||(149505-149974)
scaffold0011 (25-481)||(25439-25895)
scaffold0011 (36-123)||(180879-180966)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (16-486)||(32345-32816)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (19-448)||(1-430)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (15-482)||(2260-2727)
scaffold0222 (19-486)||(7998-8465)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (104-486)||(1-383)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (34-486)||(4729-5181)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (19-482)||(4357-4820)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (19-486)||(46300-46767)
scaffold0010 (25-486)||(41234-41695)
scaffold0010 (16-481)||(2849-3314)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (16-486)||(874-1343)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (25-482)||(268-725)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (34-486)||(2386-2838)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (24-482)||(138-597)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (19-486)||(323642-324109)
scaffold0004 (32-486)||(202369-202823)
scaffold0004 (418-482)||(118563-118627)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (19-482)||(20058-20521)
scaffold0058 (432-485)||(58093-58146)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (15-482)||(13132-13601)
scaffold0124 (36-122)||(7073-7159)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-486)||(249551-250018)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (82-486)||(1755-2159)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (52-485)||(18320-18753)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (25-486)||(43727-44188)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (16-486)||(23980-24443)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (16-482)||(593-1057)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (19-486)||(41855-42322)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (52-486)||(453-886)
scaffold0120 (38-486)||(13015-13463)
scaffold0120 (16-486)||(6958-7425)
scaffold0120 (349-446)||(23444-23541)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (19-486)||(6139-6606)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (16-486)||(9709-10179)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (16-486)||(50776-51234)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (16-486)||(2523-2993)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (16-482)||(20329-20795)
scaffold0104 (16-482)||(23149-23615)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (38-467)||(11690-12119)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (25-482)||(45461-45918)
scaffold0114 (16-482)||(20835-21288)
scaffold0114 (25-486)||(19242-19703)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (16-482)||(16882-17348)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (19-482)||(51085-51548)
scaffold0067 (19-482)||(60119-60582)
scaffold0067 (19-482)||(66507-66970)
scaffold0067 (178-486)||(27722-28029)
scaffold0067 (73-175)||(26392-26494)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (16-486)||(3686-4154)
scaffold0035 (295-482)||(43012-43199)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (19-486)||(13200-13667)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (15-482)||(6147-6614)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (19-486)||(10358-10825)
scaffold0235 (19-486)||(20572-21039)
scaffold0235 (36-122)||(26761-26847)
[»] scaffold0403 (3 HSPs)
scaffold0403 (16-334)||(3726-4044)
scaffold0403 (348-482)||(7639-7773)
scaffold0403 (19-101)||(7310-7392)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (163-486)||(5990-6315)
scaffold0585 (16-101)||(6322-6407)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (16-486)||(24777-25236)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (19-482)||(5241-5703)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (16-383)||(28160-28527)
scaffold0156 (390-486)||(35422-35518)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (16-482)||(218322-218788)
scaffold0012 (16-225)||(229978-230187)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (154-479)||(3180-3505)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (154-479)||(30193-30518)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (81-486)||(1-406)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (25-486)||(7046-7507)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (37-486)||(28173-28622)
scaffold0139 (37-486)||(34426-34875)
scaffold0139 (64-450)||(95-472)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (164-485)||(40781-41102)
scaffold0102 (16-116)||(40673-40773)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (25-482)||(15821-16278)
scaffold0040 (16-479)||(112396-112859)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (16-452)||(39694-40130)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (15-482)||(11691-12158)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (19-482)||(261246-261709)
scaffold0005 (16-482)||(277735-278201)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (19-404)||(48189-48574)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (19-486)||(32220-32687)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (34-486)||(18116-18568)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (16-482)||(4806-5272)
scaffold0270 (16-482)||(11936-12402)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (16-482)||(31658-32124)
scaffold0180 (301-486)||(12428-12613)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (16-171)||(34123-34278)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (25-486)||(6958-7419)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (16-482)||(79399-79865)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (16-482)||(102168-102634)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (145-486)||(10501-10842)
scaffold0089 (25-486)||(15614-16075)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (16-475)||(100474-100923)
scaffold0020 (16-437)||(181134-181555)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (16-486)||(50367-50837)
scaffold0081 (52-482)||(19573-20003)
scaffold0081 (52-482)||(34997-35427)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (16-486)||(4254-4724)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (25-482)||(80737-81194)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (16-479)||(975-1438)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (16-482)||(9905-10370)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (256-486)||(15287-15517)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (16-452)||(4966-5402)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (16-361)||(20467-20812)
scaffold0077 (360-446)||(16505-16591)
scaffold0077 (36-122)||(27531-27617)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (16-482)||(13403-13869)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (16-482)||(16590-17055)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (235-453)||(6264-6482)
scaffold0149 (235-453)||(10695-10913)
scaffold0149 (16-113)||(6510-6607)
scaffold0149 (16-113)||(10941-11038)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (16-479)||(6799-7262)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (16-244)||(14340-14568)
scaffold0261 (16-244)||(22519-22747)
scaffold0261 (350-486)||(14201-14336)
scaffold0261 (350-486)||(22380-22515)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (42-482)||(9921-10361)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (16-482)||(1843-2309)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (16-482)||(115810-116276)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (16-486)||(25846-26315)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (16-481)||(3129-3594)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (154-482)||(15387-15715)
scaffold0282 (16-72)||(15738-15794)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (187-479)||(177170-177462)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (16-482)||(8301-8767)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (34-404)||(17634-18003)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-479)||(7995-8458)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (16-482)||(7874-8340)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (16-482)||(32478-32944)
scaffold0109 (16-482)||(9531-9997)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (16-482)||(66340-66806)
scaffold0042 (52-482)||(38725-39155)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (16-482)||(18972-19438)
scaffold0017 (16-482)||(56952-57418)
scaffold0017 (16-482)||(196383-196849)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (16-482)||(13986-14450)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (19-113)||(802-896)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (247-433)||(16446-16632)
scaffold0348 (24-95)||(7127-7198)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (28-486)||(8344-8802)
scaffold0080 (57-191)||(49159-49293)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (52-482)||(25945-26375)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (64-482)||(62936-63354)
scaffold0031 (308-486)||(108857-109035)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (145-482)||(29476-29813)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (25-197)||(27205-27377)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (34-454)||(6174-6594)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (25-482)||(2209-2670)
scaffold0319 (349-486)||(34-171)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (16-482)||(3361-3828)
scaffold0023 (57-486)||(28269-28702)
scaffold0023 (25-452)||(131051-131477)
scaffold0023 (22-124)||(59696-59798)
scaffold0023 (427-485)||(60099-60157)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (16-377)||(1611-1972)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (25-486)||(6993-7454)
scaffold0358 (130-452)||(3544-3866)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (16-295)||(4075-4354)
scaffold0074 (328-482)||(4359-4513)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (16-482)||(1828-2294)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (25-486)||(14112-14573)
scaffold0324 (25-191)||(19198-19364)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (25-180)||(640-795)
scaffold0228 (349-434)||(964-1049)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (349-479)||(7561-7691)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (172-482)||(24558-24868)
scaffold0198 (34-101)||(24451-24518)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (253-479)||(23093-23319)
scaffold0100 (16-100)||(25006-25090)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (25-486)||(7232-7693)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (16-482)||(3310-3776)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (136-486)||(13-367)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (34-270)||(11314-11550)
scaffold0018 (34-270)||(17506-17742)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (16-179)||(142-305)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (349-486)||(2704-2841)
scaffold0621 (34-101)||(2420-2487)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (16-101)||(1349-1434)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (16-124)||(4855-4963)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (52-251)||(2950-3149)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (16-158)||(3309-3451)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (295-485)||(85421-85611)
scaffold0007 (16-124)||(85782-85889)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (16-101)||(22802-22887)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (353-482)||(38853-38982)
scaffold0122 (72-175)||(39115-39218)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (318-482)||(1655-1819)
scaffold0044 (318-482)||(15395-15559)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (52-182)||(28-158)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (74-203)||(27926-28055)
scaffold0088 (298-486)||(28150-28338)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (36-123)||(8220-8307)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (355-482)||(96438-96565)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (348-482)||(39824-39958)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-101)||(8725-8810)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (36-124)||(3207-3295)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (36-123)||(10249-10336)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (412-479)||(12900-12967)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (36-122)||(3140-3226)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (36-122)||(24349-24435)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (349-482)||(39647-39780)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (36-123)||(3497-3584)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (52-123)||(15047-15118)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (36-123)||(19002-19089)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (36-123)||(32677-32764)
scaffold0021 (36-123)||(72144-72231)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (36-122)||(13863-13949)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (427-485)||(343-401)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (421-486)||(1735-1800)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (349-446)||(730-827)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (16-85)||(17839-17908)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (412-452)||(24008-24048)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 34645099 - 34644629
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34645099 acatcacgcttcaaaccaacccaccaaaacagctttttcaagtcgtggtacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttctt 34645000  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34644999 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttatcaggaatgcaaattctgcctctgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 34644900  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644899 ttgattgctatcaatcattaaatccacaaacttgacgtccactagttgcgcttctctaatactatccaagaattcactattgattttcaacatacccaac 34644800  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644799 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 34644700  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34644699 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccggatgatagttcaacccaaactcataatccttc 34644629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19880066 - 19880536
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19880066 acatcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtggctttctt 19880165  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||    
T  19880166 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgttaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagt 19880265  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19880266 ctgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgtgcttctctgatactactcaagaattcattattgattttcaacatgcccaac 19880365  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19880366 tgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgcaacgtct 19880465  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19880466 ttctactcaaagcatctgcaactacgttggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 19880536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 18795458 - 18795928
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795458 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttctt 18795557  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||| |||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||     
T  18795558 ccaagatcaactttttcaactcatcattgtccggaatacaaattctacctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcaga 18795657  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795658 ttgattactataaaacattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 18795757  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18795758 tgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtctctaaactattcaagcaactcaaattcctttaccattaaagccgacatgtgtaacgtct 18795857  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18795858 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatccttc 18795928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21563645 - 21563175
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||| |||| ||||| |    
T  21563645 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcct 21563546  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||| ||   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| | | | ||||     
T  21563545 ctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagc 21563446  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21563445 ttgattactagtaaccaatatatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagc 21563346  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563345 tgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtct 21563246  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21563245 tcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 21563175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21569504 - 21569034
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||| |||| ||||| |    
T  21569504 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcct 21569405  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||| ||   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| | | | ||||     
T  21569404 ctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagc 21569305  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21569304 ttgattactagtaaccaatacatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagc 21569205  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569204 tgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtct 21569105  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21569104 tcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 21569034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 21472378 - 21472839
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  21472378 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatacttaagctgcttctgtgactttcttctaaaatca 21472477  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  21472478 actttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattattcctctgaacctcaacacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattact 21472577  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21472578 agcaaccatcaaatccacaaacttgacatcaattttctgcgcttccctaatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactc 21472677  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||    
T  21472678 tgaggtggcaactcgcaaacaagactcaagtctctaaattgttcaaggaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctca 21472777  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21472778 aagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 21472839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5296716 - 5296249
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5296716 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaagctactcttgtaactttcttcta 5296617  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || ||||     
T  5296616 aaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttc 5296517  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    |||||   ||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||||| ||     
T  5296516 attacccgcaaacattaaatcaacaaactttacatccagttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaattctcagcatccccaattgt 5296417  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  5296416 atactctgaggtgataactcacaaacaaggctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcc 5296317  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5296316 tgctcaacgcatcaacaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 5296249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 19454191 - 19454658
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |    
T  19454191 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgttacattttcgtagctcccggatgaatacttaagttactcttgtgactttcctcga 19454290  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||| |||||| ||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||       
T  19454291 aaatcaattttttcaactcgtcatcatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgcc 19454390  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  19454391 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatccacttgttgtgcttctctgatattattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgc 19454490  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || ||||| || || ||||| |    
T  19454491 acactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctaaattgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcc 19454590  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19454591 tgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 19454658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Original strand, 15460112 - 15460573
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15460112 cttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatc 15460211  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  15460212 aacttcttcaattcttcattgtcgggaatacaaattctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattac 15460311  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15460312 tatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaactcgttgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaaatgcacact 15460411  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | |||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15460412 ttgcgatgacaattcacacactagactcaagtctctaaactgttcaagcaattcgaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 15460511  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15460512 aacgcatctgcaactacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatcctt 15460573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 8762443 - 8761976
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  8762443 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttttgtgactttattcta 8762344  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || ||||     
T  8762343 aaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttc 8762244  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    |||||   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  8762243 attacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcggttctcggatactattcaggaaatcactattaattttcagcatccccaactga 8762144  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |  || ||||| || | ||| || |    
T  8762143 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcc 8762044  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8762043 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 8761976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 407
Target Start/End: Original strand, 25768959 - 25769350
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25768959 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttaaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 25769058  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| |    
T  25769059 ccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatacaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcatt 25769158  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||  |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25769159 ttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaattttctgcgcttccctgatattgtttaagaaatcactattgatcttcaacataccctac 25769258  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtg 407  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  25769259 tgcacactctgaggtgataactcacaaagaagactcaagtctctaaattgttcaagaaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtg 25769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19488785 - 19488315
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19488785 acatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 19488686  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  19488685 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacgaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctggaagtcaccatcttcagt 19488586  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| |||    
T  19488585 ttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatactattcaagaactctctgctgatcttcaacatacctaac 19488486  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| |  |||||||    
T  19488485 ttcacactttgaggcgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcagacatattcaacgtct 19488386  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19488385 tcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 19488315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14380980 - 14380510
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14380980 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcct 14380881  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||| ||  |||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| || |   | |||||    
T  14380880 ctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagt 14380781  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | |||  || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || | ||| |||||     
T  14380780 gccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaat 14380681  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||| || || || ||||| |||||||| | ||| ||||| || | ||| |    
T  14380680 tgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctgaactactctagcaaatcgaattctttcaccattaaggcagacatatgcagcgttt 14380581  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14380580 tcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 14380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10468362 - 10467896
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10468362 acatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctctt 10468263  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || | | | || ||    
T  10468262 ctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaactttgaagtcactatcctctgt 10468163  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||  || |||| ||| ||||||    
T  10468162 ctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaac 10468063  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||  || ||||| || || || |    
T  10468062 tgtatactctgaggtgacaattctcagacaagactcaagtctctaaattgctccagcaactcaaattcttttatcatcaaagcagacatatgcaatgttt 10467963  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10467962 ttctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 10467896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19435770 - 19436240
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19435770 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttatt 19435869  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || | | | |||||    
T  19435870 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagt 19435969  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | |||  || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |  ||     
T  19435970 gccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgagcttctcagatactattcaagaaatcactatgaattttcagcatcctgaat 19436069  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||| | |||||||| || || || ||||||| ||||||||  || ||||| || || ||||    
T  19436070 tgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctttgaactgctctagcaaatcgaattcctccaccatcaaagcagacatatgcaatgtct 19436169  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |  ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  19436170 tccggctcaacgcattagcaaccacattggctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttc 19436240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14379380 - 14378960
Alignment:
Q  66 catcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcct 165  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  14379380 catctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaattcttcct 14379281  T
Q  166 ctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcg 265  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| || |   | |||||   ||||| | |||  || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  14379280 ctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcg 14379181  T
Q  266 cttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactg 365  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||| || |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||     
T  14379180 cttctctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctgaacta 14379081  T
Q  366 ctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttc 465  Q
    ||| || || || ||||| |||||||| | ||| ||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  14379080 ctctagcaaatcgaattctttcaccattaaggcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattc 14378981  T
Q  466 aagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14378980 aaaccaaaatcatagtccttc 14378960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 23079237 - 23079707
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  23079237 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctctt 23079336  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| | | ||||||    
T  23079337 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtcaggaatagaaattctccctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcag 23079435  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  ||||| |||||| | || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||| ||| || |     
T  23079436 tctgattactagcaaccaacaaatctacaaacctaacatcaactttatgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaattttcagcattcctag 23079535  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    |  ||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || | ||| || || |||||||| || ||||| || ||||||    
T  23079536 cctcacactctgagatgacaactcgcagactaaactcaaatctctaaactgttccagaaaattaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtc 23079635  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  23079636 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagtttaaactaaaatcataatccttc 23079707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28282326 - 28281857
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  28282326 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 28282227  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | ||| |    
T  28282226 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaat 28282127  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| |  || ||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || || || || | ||| ||||||    
T  28282126 actattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaac 28282027  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |  || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  28282026 tgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtct 28281927  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28281926 tcctactcaatgcatccgcgactacatttgcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatcctt 28281857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 22443035 - 22443501
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  22443035 acatcgcgtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 22443134  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||| || || |   ||||||| |||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  22443135 caagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagt 22443234  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |||   || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||      
T  22443235 ctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactatctgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagt 22443334  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | || ||||| || ||||| || |||||||    
T  22443335 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaactatcatagcggacatatgcaacgtct 22443434  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  22443435 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaagtcataatc 22443501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 15896862 - 15897328
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  15896862 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaataacctcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatggatactcaagatacttgtgtgactctctt 15896961  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
      | ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||  || | |||||| || || ||||||||||| || || | | ||||||    
T  15896962 taagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacgaattctgcctcgtaatcgcaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatcttcag 15897060  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| | | |||  | |||||| |||||||| || || |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| || ||    
T  15897061 tctgatttccaccaacaagtaaatctacaaactttacatcaactttttgtgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctaa 15897160  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||  || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| || ||||| ||||  ||     
T  15897161 cttcacactctgaggtgacacttcacagactaagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaattctttgatcatcatcgcggacatatgtagagtt 15897260  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  15897261 ttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 15897328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 22434637 - 22435103
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  22434637 acatcgcgtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 22434736  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||| || || |   ||||||| |||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  22434737 caagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagt 22434836  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |||   || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  22434837 ctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactctctgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 22434936  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | || ||||| || ||||| || |||||||    
T  22434937 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaactatcatagcggacatatgcaacgtct 22435036  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  22435037 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaagtcataatc 22435103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 27188204 - 27188673
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27188204 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 27188303  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |  ||||| |   | |||||||   ||||||    
T  27188304 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattctaaaatcgctgtcttcag 27188402  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| || ||||||||||||||| || || |||  ||| |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  27188403 cctgatctctagcaaccaataaatccacaaactttacatcaactctttgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 27188502  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  27188503 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtagctcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtc 27188602  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27188603 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 27188673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27261036 - 27260567
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27261036 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 27260937  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |  ||||| |   | |||||||   ||||||    
T  27260936 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattctaaaatcgctgtcttcag 27260838  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| || ||||||||||||||| || || |||  ||| |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  27260837 cctgatctctagcaaccaataaatccacaaactttacatcaactctttgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 27260738  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  27260737 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtagctcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtc 27260638  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27260637 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 27260567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5838732 - 5838263
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  5838732 acatcacgtttcaatccaaaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcct 5838633  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||||   |||  ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  5838632 cgagaatcattttcttcatctcttcattgtcagggatacaaatttgaccttggaatcttaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcttcagt 5838533  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| | |  |  ||||||||||||||||| || ||||  || |||||  | ||||||||||  || |||||||  || |||| ||||||||      
T  5838532 ctgattactagcgactaacaaatccacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatactattcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccagt 5838433  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  5838432 ttcacactatgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgctcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaaagtct 5838333  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  | |||||||| |||||    
T  5838332 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaattcgaaatcatagtcctt 5838263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18197220 - 18196875
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttc 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| |||| |||    
T  18197220 gaccaccaaaacaaatttttcaaatcatgatacatcttggtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatca-tcttcttc 18197122  T
Q  133 atctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatca 232  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||| || || | | | | ||| ||||||||| ||| ||    
T  18197121 atctcatcgtcgtctggaatacaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactatccttagtgtgattactagcaacca 18197022  T
Q  233 ttaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtga 332  Q
      || ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| || | || ||||||||| | |||    
T  18197021 acaagtccacaaacttaacgtcaactttctgcgcttcaataatacttttcaagaaatcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctgagatga 18196922  T
Q  333 caactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaa 379  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18196921 caattcgcaaactaaactcaaatctctaacctgttcaagtaactcaa 18196875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20636805 - 20636344
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  20636805 ttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 20636706  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| |||||  |||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  20636705 ttttcttcatctcatcatcgtctggaataaaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgccttcagtctgattact 20636606  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || ||||||||||| || || || | |||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||     
T  20636605 agcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaaccttttgcgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactt 20636506  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  | |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  20636505 tcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcgaacatatgtaaggtcttcctactca 20636406  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  20636405 aagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 20636344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16626230 - 16625764
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16626230 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16626131  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16626130 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16626032  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16626031 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16625932  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16625931 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16625832  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16625831 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 16625764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29591433 - 29590963
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  29591433 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 29591334  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| |  || ||||| |   ||||||    
T  29591333 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcag 29591235  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  29591234 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 29591135  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  29591134 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 29591035  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  29591034 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 29590963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1542597 - 1542128
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1542597 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctctt 1542498  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  1542497 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattctctctcggaatctcaacagaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 1542399  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | || | |||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  || |||||  | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| ||||||||     
T  1542398 tctggtcactagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatactcttcaggaactcactatcaatcttcagcatacccag 1542299  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  1542298 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtc 1542199  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  1542198 ttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaagtcgtaatcctt 1542128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 24365189 - 24365650
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||    
T  24365189 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatca 24365288  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | || || | |||||     
T  24365289 acttcttcaactcttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacc 24365388  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  24365389 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 24365488  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| || || ||||| || |  ||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| |  || |||||||| || || || || ||||    
T  24365489 tgagatgacaattcacagacaagactaatgtctctgaactgttctaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatgtgcaaggttttcctgctca 24365588  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24365589 aagcatcagcaacaacgttggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 24365650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22761968 - 22761498
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  22761968 acatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctctt 22761869  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| |  || || || |   |||||||    
T  22761868 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaagtcactgtcttcagt 22761769  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||| |||| ||| ||  || || |||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  || |||| ||| || | |    
T  22761768 ctgatcactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatactcttcaggaattcattatcaatcttcagcattcctagc 22761669  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| |  | | |||  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  22761668 ttcacactttcagataacatttcacaaactaaactcaaatctctgaattgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatggcagacatatgcaaggtct 22761569  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  22761568 tcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 22761498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 19865455 - 19865921
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  19865455 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagataatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctctt 19865554  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| |||||||   |||  || ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  19865555 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgaactcgaaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 19865654  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || | ||||||||| || ||||  || |||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  19865655 ctgattactagcaaccaacaagtctataaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 19865754  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || | |||| | || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| | ||| || || || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  19865755 ttcacactttgagatgaccagtcacaaactaagctcatatctctaaactgttcaagcagctcgaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgttt 19865854  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  19865855 tcctactcaaggcatcagcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 19865921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16927153 - 16926684
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||   ||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16927153 acatcgcgcttcaatccagaccaccaaaatctcttctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctctt 16927054  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | |  |||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| |||||||    
T  16927053 caagaatcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 16926954  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||  ||| ||||      
T  16926953 ctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttccgcattcccagt 16926854  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||| |||| ||| ||   || ||||| |  |||| |||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| || | ||    
T  16926853 ttcacattctgaggtaaccgttcacaaaccaaactcatatctctaaactgttccagtaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgcaatgact 16926754  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16926753 tcctactcaatgcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcataatcctt 16926684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28262701 - 28262241
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  28262701 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 28262602  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| |  |||| ||  ||||  |    
T  28262601 -tcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgccttgagcctgatctc 28262503  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  |||||||| ||||| || || ||||  || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | ||||||    
T  28262502 tagcaaccaacaaatccacgaacttcacatcaactttctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacact 28262403  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||| || ||| | || ||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  28262402 ctgaggcgaccattcacaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcagacatatgcaatgtcttcctactc 28262303  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  28262302 aaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataatttaaaccaaagtcataatcctt 28262241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28341450 - 28340990
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  28341450 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 28341351  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| |  |||| ||  ||||  |    
T  28341350 -tcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgccttgagcctgatctc 28341252  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  |||||||| ||||| || || ||||  || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | ||||||    
T  28341251 tagcaaccaacaaatccacgaacttcacatcaactttctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacact 28341152  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||| || ||| | || ||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  28341151 ctgaggcgaccattcacaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcagacatatgcaatgtcttcctactc 28341052  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  28341051 aaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataatttaaaccaaagtcataatcctt 28340990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22078203 - 22077768
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  22078203 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaataatttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 22078104  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | |||  || | |||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||  || ||||| ||| ||| ||    
T  22078103 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtctagagtacaaattcttcctcgaaacctcaacataccttgatcatcaattttaaaatcaccatctttag 22078005  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  ||| || |||  || |||| |||||| |     
T  22078004 tctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttctttaatacttttcagaaatacaatatcaatcttcagcatacctag 22077905  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||  | ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||||| || || |||    
T  22077904 cttcacactctcagatgacatctcgcaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttatcattatagcggacatatgcaaagtc 22077805  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22077804 ttcctactcaaagtatctgcaacaacattagctttac 22077768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 25113320 - 25113786
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  25113320 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 25113419  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  25113420 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgaatttaaaatcactgtcttcag 25113518  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || |||||||| || || || ||||  || |||||  | |||||  |||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  25113519 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaattttacatcgactttctgtgcttccttgatacttctcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 25113618  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     |  || ||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  25113619 ttttacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 25113718  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  25113719 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 25113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25609374 - 25608908
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  25609374 acatcacatttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 25609275  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||  ||||||    
T  25609274 caagaatc-atcttcttcatctcttcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaatacaccttggtcatcgatcttaaaatcaccgtcttcag 25609176  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  |  |||||| ||||| |  |||  ||||||||||  || |||| ||| || |     
T  25609175 tctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctatgcttctttaatatttctcagaaattcactatcaatcttcagcattcctag 25609076  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  ||| |||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| || |  ||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  25609075 ctttacaatctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctaaactgttccaacaactcgaactctctaaccatcatagcagacatatgcaaagtc 25608976  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||||    
T  25608975 ttcctactcaaggcgtctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcataatc 25608908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18966787 - 18966486
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttc 132  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||| |||||  ||    
T  18966787 gaccagcaaaacaaatttttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatc-atcttcctc 18966689  T
Q  133 atctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatca 232  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||| || || ||||||||||| || || | | ||| ||| ||||| | | |||| |    
T  18966688 atctcatcattgtcaggaatacaaattctacctcgaaatcacaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatctttagtctgatttccaccaataa 18966589  T
Q  233 ttaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtga 332  Q
     |||||| |||||||| || | |||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  || |||| ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  18966588 ataaatctacaaactttacattcactttctgcgcttctttaatactattgagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtga 18966489  T
Q  333 caa 335  Q
    |||    
T  18966488 caa 18966486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16962958 - 16962489
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |  || || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16962958 acatcgcgcttcaatccagaccaccaaaatatattctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16962859  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | |  |||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| || || ||||| || || || || ||| |||||||    
T  16962858 caagaatcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacgccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 16962759  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || | | ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  16962758 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttatgtgcctttttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 16962659  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||||||  || ||   || ||||| |  |||| |||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| || | ||    
T  16962658 ttcacactctgacgtaaccgttcacaaaccaaactcatatctctaaactgttccagtaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgcaatgact 16962559  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16962558 tcctactcaatgcatctccaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcataatcctt 16962489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2874316 - 2873850
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  2874316 acatctcgtttcaaaccagaccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 2874217  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || |||||  | ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  2874216 caagaatc-atcttcttaatctctccattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcag 2874118  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||| ||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  || |||||||  || |||| ||||||||     
T  2874117 tctgatctctagcaaccaacaagtcctcaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaactcactatcaatcttcagcatacccag 2874018  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  2874017 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 2873918  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  2873917 ttcctactcaaggcatctgcgacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 2873850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24312681 - 24312215
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  24312681 acatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 24312582  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  24312581 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 24312483  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | || || ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  24312482 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatgcttttcaaaaattcactatcaatcttcagcatacccag 24312383  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | || |||||||| ||||| || || |||    
T  24312382 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaacaatcatggcggacatatgcaatgtc 24312283  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  24312282 ttcctactcaaggaatctgaaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 24312215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27566493 - 27566327
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  27566493 acatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctctt 27566394  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacacc 182  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||    
T  27566393 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacacc 27566327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27330937 - 27330537
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||     
T  27330937 ttcaacccagaccaccaaaataacttctttagatcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatc- 27330839  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| || |||||   |   |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| |||||||    
T  27330838 atcttcttcatctcatcatcgtctggaatacatattctattttgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattac 27330739  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || || |||    
T  27330738 tagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcaaact 27330639  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||    
T  27330638 cttagatgacatctcgcaaactaggctcaaatctttgaactattcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatatgaaaagtcttcctactc 27330539  T
Q  424 aa 425  Q
    ||    
T  27330538 aa 27330537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27391677 - 27391277
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||     
T  27391677 ttcaacccagaccaccaaaataacttctttagatcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatc- 27391579  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||| || |||||   |   |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| |||||||    
T  27391578 atcttcttcatctcatcatcgtctggaatacatattctattttgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattac 27391479  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || || |||    
T  27391478 tagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcaaact 27391379  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||  | ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||    
T  27391378 cttagatgacatctcgcaaactaggctcaaatctttgaactattcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatatgaaaagtcttcctactc 27391279  T
Q  424 aa 425  Q
    ||    
T  27391278 aa 27391277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27565141 - 27564868
Alignment:
Q  209 cttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacat 308  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||  ||||  ||||||||||  || |||| |||    
T  27565141 cttcagtttgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatacccttcagaaattcactatcaatcttcagcat 27565042  T
Q  309 acccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgt 408  Q
     ||||  | ||||||||| |||||| | || ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || || |   | |||||||  || ||||| ||     
T  27565041 tcccagtttcacactctgaggtgactattcacaaaccaagctcatatctctaaactgttcaagtaattcgaactttctaaccatcaaagcggacatatgc 27564942  T
Q  409 aacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  27564941 aatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 27564868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 18436395 - 18436486
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaa 125  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18436395 gaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccagaatcaa 18436486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18407124 - 18406991
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||||    
T  18407124 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctgctcaaagcgtctacaacaacgttagctt 18407025  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  18407024 tacccggatgatagctcaactcaaaatcataatc 18406991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 16098833 - 16098925
Alignment:
Q  31 ccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  16098833 ccgggccaccaaaacaacttcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctatgaccttcgtccaaaatc 16098925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18407431 - 18407280
Alignment:
Q  40 caaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcat 139  Q
    ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| |    
T  18407431 caaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctt 18407332  T
Q  140 cgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    | |  || ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||    
T  18407331 catcatctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 18407280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16381866 - 16381780
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  16381866 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 16381780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14624537 - 14624440
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| || |||||||  || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14624537 ctcaaatctcgaaactgctcaattaattccaattctttaaccatcaaagcagaaatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 14624440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14624849 - 14624764
Alignment:
Q  37 caccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  14624849 caccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 14624764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1648307 - 1648221
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  1648307 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcttggatgaatactcaaactacttctatgaccttcatccaaaat 1648221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 23997036 - 23997122
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  23997036 ccaccaaaacaaccttttaaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 23997122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15077859 - 15077794
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15077859 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactact 15077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16649149 - 16649052
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16649149 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 16649052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18196861 - 18196780
Alignment:
Q  401 acatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||    
T  18196861 acatatgtaaagtcttcctacttaaggcatctataacaacattagctttacctgaatgataattcaacccaaaatcataatc 18196780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19613569 - 19614039
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19613569 acatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 19613668  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  19613669 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 19613768  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19613769 ttgattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaac 19613868  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613869 tgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 19613968  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19613969 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 19614039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11387784 - 11387313
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||     
T  11387784 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatacttaagttactcctgtggctttcc 11387685  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  11387684 tctaaaattaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactatcctcag 11387585  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11387584 cttgattactagtaaccattaaatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaa 11387485  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11387484 cttcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtc 11387385  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11387384 ttcctactcaaagcatctacaactacattagctttacccggatggtaattcaatccaaaatcataatccttc 11387313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19148105 - 19148575
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  19148105 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttctt 19148204  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19148205 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 19148304  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |    
T  19148305 ttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatc 19148404  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19148405 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacccaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 19148504  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19148505 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataattcaatccaaaatcatagtccttc 19148575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 20747504 - 20747974
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  20747504 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttctt 20747603  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20747604 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 20747703  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |    
T  20747704 ttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatc 20747803  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  20747804 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacccaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 20747903  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20747904 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataattcaatccaaaatcatagtccttc 20747974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15101958 - 15101488
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15101958 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 15101859  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  15101858 ctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 15101759  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  15101758 gtcattaccaacaaccatcaaatcaataaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcaacatacccaac 15101659  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15101658 tgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 15101559  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15101558 tcctgctcagagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 15101488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14263599 - 14263129
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |  |||||||||| |    
T  14263599 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatctttgtagttcctggatgaatacttaggctatttctgtgactttcct 14263500  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  14263499 ctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 14263400  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||||  || ||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  14263399 ttcattactagtaaccattaaatcaacgaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 14263300  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  14263299 tgtaaactctgaggtgacaactcacaaacaagacttaagtctctaaactgttcaagtaactcaaactcctttaccattatagtagacatgtgtaacgtct 14263200  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14263199 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcatagtccttc 14263129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16071649 - 16071180
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |    
T  16071649 acatcacgtttcaacctagaccaccaaaataatttcttcaaatcatggtatatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatggctttcct 16071550  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |||||||| ||||| |  ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  16071549 ctaaaatcaa-ctttttaaatcatcattatcatgaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagc 16071451  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||  | |||||||  |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||    
T  16071450 ttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatccatttgacgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatacccaac 16071351  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  16071350 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgttctagtaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaatgtct 16071251  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16071250 tcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttaccagaatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 16071180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12206155 - 12205685
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12206155 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgaaacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 12206056  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  12206055 ctaaaatcaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 12205956  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||| || ||| | | ||  |||||||||||||| || || || |  || |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  12205955 ttggttgctagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaacctcctgtgcttctttaatactattcaaaaactcactgttgatcttcaacatacccaat 12205856  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||    
T  12205855 ttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgaccaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgatatatgcaatgtct 12205756  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||||||||| ||||||    
T  12205755 tcctactcaaggcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcatagtccttc 12205685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16949826 - 16949357
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16949826 acatcacgcttgaaaccggaccaccaaaacag-tttctcaaatcgtggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttctt 16949728  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | |||||    
T  16949727 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaatacaaattcttcctctaaatctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagt 16949628  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||| || |||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||    
T  16949627 gtcattaccaataatcattaaatcaacaaacttcaaatccacttgctgagcttctcagatactattctagaagtcactattaatcctcagcatccccaac 16949528  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||    
T  16949527 tgtatactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtccctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcagagcagacatatgcaatgtct 16949428  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16949427 tcctgctcaacgcatcagcaaccacattggttttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 16949357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 762 - 291
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  762 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgttgctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 663  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||  ||||| || |||||||||||||| || | | | |||||    
T  662 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaatttttcttctgaacctcataacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagt 563  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||    | |||| ||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  562 gtcattacccgtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaac 463  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||| ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||    
T  462 tgaatactctgaggtgtcaactcatagacaagactcaagtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtct 363  T
Q  416 ttctactcaaggcatct-gcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || | ||| |||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  362 tcctgcgcaacgcatttagcaacaacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14285728 - 14285265
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14285728 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcta 14285629  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | || ||       
T  14285628 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaatcctccctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgcc 14285529  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| |||| ||| || ||||||| |||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  14285528 attaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccagttgctgtgcttctcgaatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgt 14285429  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| || |||||||| || || |||||||  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  14285428 atactctgaggcgacaactcacataccaggctcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcc 14285329  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14285328 tgctcaacgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatc 14285265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 13022251 - 13022721
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13022251 acatcacacttcaaaacggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctctt 13022350  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||| || | | | || ||    
T  13022351 caagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgt 13022450  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||| || |||| ||| |||||     
T  13022451 ctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatccccaat 13022550  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||  || ||||| ||||| || |    
T  13022551 tgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcaaagcagacatatgtaatgttt 13022650  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13022651 tcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccagggtggtaattcaagccaaaatcataatccttc 13022721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 13666434 - 13666901
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  13666434 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 13666533  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || || | | | | |||       
T  13666534 aaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgcc 13666633  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  || ||||||||||| | ||| || || |||| ||| ||||||||     
T  13666634 attaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctacttgttgtgcttctcggatgctattcaagaaataactgttaatcttcagcatccccaactga 13666733  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    ||||| || |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |  || |||||||  || |||||||  || ||||| || ||||| || |    
T  13666734 acactttgaggtgtcaattcacagacaaagctcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattattttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcc 13666833  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  13666834 tactcaaggcatttgcaaccacgttggctttactaggatggtaattcaaactaaaatcataatccttc 13666901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 15341328 - 15341791
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15341328 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaatttcttcta 15341427  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | |  |||  |       
T  15341428 aaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactattttctttgcc 15341527  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |  |||||||  |||||| ||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  15341528 attaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgctttgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgt 15341627  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |  |||||||| || || || ||||  || |||||||| || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || | |||||| |    
T  15341628 atactctgagtcgacaactcacataccagactcatgtccctaaactgttccagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagcgtcttcc 15341727  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15341728 tgctcaatgcatcagcaactacattagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaataataatc 15341791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11771618 - 11771155
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  11771618 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 11771519  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| || || ||||| |  || ||||| | | ||||||    
T  11771518 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcgaaatctcaccacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcag 11771420  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||||||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  11771419 tctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccag 11771320  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| || |||||||| || ||||| || ||| ||    
T  11771319 tttcacactctgaggtgacaactcgcagactaagctcaaatctctaaattgttcaagcaattcaatttcttttaccatcatagcggacatatgcaacatc 11771220  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  11771219 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagttcaacccaaaatcata 11771155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18053308 - 18052842
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  18053308 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 18053209  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | || || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||      
T  18053208 ctaagattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaac 18053109  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||| |||  || ||||| || || || | ||| ||||||    
T  18053108 gccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaac 18053009  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  18053008 tgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtct 18052909  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18052908 tcctactcaaagcatccgcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 18052842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 486
Target Start/End: Original strand, 12457542 - 12458004
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||    
T  12457542 cttcaaatcggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatc 12457641  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | ||||| | |||||    
T  12457642 aacttcttcaaatcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctaaacctcagcacaccttggtcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattac 12457741  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
        | | || |||||||||||||| |  || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||  | |||    
T  12457742 ccgtatttatcaaatccacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactatatact 12457841  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||| |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||  || ||||| || || || ||||| |||    
T  12457842 ctgaggtgacaattcacggacaagactcaagtctctaaattgctccagcaactcaaattcttttatcatcaaagcagacatatgcaatgtttttctgctc 12457941  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12457942 aaagcatcagcaactacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 12458004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23505225 - 23504759
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  23505225 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 23505126  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| ||   | ||||| |    
T  23505125 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcaat 23505026  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || || || || || | ||| ||||||    
T  23505025 accattaccagcaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaac 23504926  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || || || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| || | |||||    
T  23504925 tgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcatgtctctaaactgttccagtaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagcgtct 23504826  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23504825 tcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 23504759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 364
Target Start/End: Original strand, 12456599 - 12456944
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12456599 tcacgtttcaaactggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactttcttcta 12456698  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || | | | ||| | |     
T  12456699 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaaccttagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatgtc 12456798  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| |  | |||| ||||| ||||||||    ||||||||  | |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||||||     
T  12456799 attaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcgaatccacttgccgagcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaactga 12456898  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaact 364  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12456899 acactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtctctaaact 12456944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 14434584 - 14434886
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14434584 gacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcc 14434683  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||||    
T  14434684 tctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcag 14434783  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| | |||  || | ||| || |||||||| ||||| || || |||||||  |||||| ||| ||| ||||| || || |||| ||| |||||    
T  14434784 tgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatactactcaggaaatcactgttaatcttcagcatgcccaa 14434883  T
Q  315 ctg 317  Q
    |||    
T  14434884 ctg 14434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26117951 - 26117490
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  26117951 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 26117852  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || || |||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | ||||| | |||||     
T  26117851 acttcttcaactcttcattatcaggaatacaaactttacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacc 26117752  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26117751 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaaatgtatactc 26117652  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |||  |||||| || || ||||| ||||  ||||| || || || || || |||||||||||||||||||  || |||||||| || || || || ||||    
T  26117651 tggaatgacaattcacagacaagactcatgtctctgaaatgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctca 26117552  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26117551 aagcatcagccacaacattggcttaacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 26117490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11305609 - 11305148
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  11305609 ttcaaatcggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatca 11305510  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| |  ||||     
T  11305509 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttacc 11305410  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  11305409 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 11305310  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || ||||| |||||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  11305309 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 11305210  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11305209 aagcatcagcaaccacattagccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 11305148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 321396 - 320948
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||| | ||||| | | ||||    
T  321396 gaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatggatactcaagctacttctatcactttcttcaagaatcattttcttca 321297  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| |   ||||||| ||||||||| ||| ||     
T  321296 tctcatcatcgtctggaatacaaattctatctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaa 321197  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     || || |||| ||| || || |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| || |||| ||||||||  | ||||    
T  321196 caagtctacaagcttaacatcaactttttgtgcttctttaatactcttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccctaacttcacactcttagatgac 321097  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    || |  || || |  ||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |    
T  321096 aattaacataccaaactcaaatctctgaactactccagcaactcgaactccttcaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatccg 320997  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  320996 caacaacattagctttacccggatgatagctcaattcaaaatcataatc 320948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 471
Target Start/End: Original strand, 15625454 - 15625902
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||     
T  15625454 ttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatc- 15625552  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttca--tcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgatt 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| || || |||  || ||||| || || | | ||||||| |||||    
T  15625553 atcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatctcgaccttaaagtcactatcttcagtctgatt 15625652  T
Q  222 actaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcaca 321  Q
     | | ||||   |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  || |||| ||| || |||| ||||    
T  15625653 tccaccaatatataaatctacaaactttacatccactttttgcgcttctttaatactattgagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcaca 15625752  T
Q  322 ctctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctac 421  Q
     |||| |||||||| || || || || |||| |||||||||||| || || | ||| || || || |||||||| || ||||| ||||  || || ||||    
T  15625753 atctgaggtgacaattcacagactagactcagatctctaaactgttcgagcagctccaactctttaaccatcatagcagacatatgtagagttttcctac 15625852  T
Q  422 tcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagcca 471  Q
    | || ||||||||||| |||||| ||||||| || || || |||||||||    
T  15625853 ttaaagcatctgcaacaacattatctttacctggatgataattcaagcca 15625902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 49153204 - 49153661
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  49153204 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 49153303  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  49153304 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagaacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 49153403  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||  ||||| |||||||| |  ||| |||  || |||||||  ||||| ||||| || | |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  49153404 agaagtcaacaaatcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgttcaaaaagttactatcaattttcaacattcccaactgaatactc 49153503  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||  ||||| ||||| || || || || || |||||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  49153504 tggggtgaccattcacagacaaggctcatgtctctgaactgttctagcaattcgaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 49153603  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49153604 aagcgtccgcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 49153661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 8708498 - 8708964
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  8708498 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 8708597  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  8708598 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 8708696  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  8708697 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 8708796  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  8708797 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtc 8708896  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8708897 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 8708964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 15204512 - 15204978
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15204512 acatcacgtttcaacctagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcttccggatgaatactcaagctacttttgtgactctctt 15204611  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || || ||||| |||||||| || | | ||||||    
T  15204612 caagaatc-atcttctttatctcttcatcgtcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacattccctgatcatcgaccttgaagtcactatcttcag 15204710  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | | ||||||| ||| ||  ||  |||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| || |     
T  15204711 tctaattactagcaaccaacaagcccacaaacttaacatcaactttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctag 15204810  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  | ||| || || ||||  ||||| || |  ||||  ||||||||||  || || | ||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  15204811 ctttatactatgaggcgacagttcgcagactaaactcaggtctctaaactattcgagcagctccaactctttaaccatcatagcagacatatgtaaagtt 15204910  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  15204911 ttcctacttaaggcatctgcaacaacgttagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 15204978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 44790728 - 44790258
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  44790728 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 44790629  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  44790628 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 44790530  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  44790529 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 44790430  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | |||||| || |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || |||    
T  44790429 tttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 44790330  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  44790329 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 44790258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 14130766 - 14130902
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14130766 gacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcc 14130865  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    || ||||| ||  ||||||  || || ||||||||||    
T  14130866 tctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaa 14130902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 10871888 - 10872354
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  10871888 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 10871987  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  10871988 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 10872086  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||| ||||    
T  10872087 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatatccaa 10872186  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||| | | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  10872187 tttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 10872286  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||    
T  10872287 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataatccaacccaaagtcataatc 10872354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11236590 - 11236124
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  11236590 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 11236491  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  11236490 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 11236392  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||    ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  11236391 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaaccctctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaattttcagcatacccag 11236292  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  11236291 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 11236192  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  11236191 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 11236124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 14040588 - 14041026
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  14040588 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctctt 14040687  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | | ||| | | |||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | |||||||    
T  14040688 caagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 14040787  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || || | ||  |  |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| || | |    
T  14040788 ctgattactaacaaccaacaaatctacaaacttaacatcaaatttctctgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcctagc 14040887  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | ||||||||| || || |  || |||||| ||||||| || |  ||||| || || || |||||||| || | ||| || || ||||    
T  14040888 ttcacactctaagatgacaactcacatactaaacttaaatctgtaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatagcgggcatatgcaatgtct 14040987  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14040988 tcctacttaaggcatctacaacaacattagctttacccg 14041026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 14350618 - 14351056
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  14350618 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctctt 14350717  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | | ||| | | |||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | |||||||    
T  14350718 caagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 14350817  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || || | ||  |  |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| || | |    
T  14350818 ctgattactaacaaccaacaaatctacaaacttaacatcaaatttctctgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcctagc 14350917  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | ||||||||| || || |  || |||||| ||||||| || |  ||||| || || || |||||||| || | ||| || || ||||    
T  14350918 ttcacactctaagatgacaactcacatactaaacttaaatctgtaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatagcgggcatatgcaatgtct 14351017  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14351018 tcctacttaaggcatctacaacaacattagctttacccg 14351056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15160434 - 15159968
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||    
T  15160434 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactaaatatactcctatgactctctt 15160335  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| |||| |||||| || |  || |  || ||||| |   |||||||    
T  15160334 caagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagt 15160235  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||  ||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||      
T  15160234 ctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagt 15160135  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
      ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  15160134 ctcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtct 15160035  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  15160034 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 15159968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 9596950 - 9597416
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  9596950 acatcacgtttcaaaccagaccaccataaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 9597049  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || || || ||  ||||||    
T  9597050 caagaatc-atcttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaagtcaccgtcttcag 9597148  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| ||  ||| ||| || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  9597149 tctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcagctttttgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccag 9597248  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||  || ||||| || || |||    
T  9597249 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtaattcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtc 9597348  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  9597349 ttcatgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 9597416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13968014 - 13967553
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  13968014 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcgagaatca 13967915  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  |||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || ||||| | | | ||||| | |||||     
T  13967914 aattcttcaaatcatcactgtcaagaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcattacc 13967815  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  ||| |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  13967814 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactc 13967715  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  |||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || |||||||| ||||||||||  || |||||||| || || || |   | |    
T  13967714 taaggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttccgggtta 13967615  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13967614 aagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaatttaagccaaaatcataatccttc 13967553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 14955460 - 14955917
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| | |||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||    
T  14955460 ttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctc----atgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatca 14955555  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||  |    
T  14955556 -tcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctc 14955654  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||    
T  14955655 tagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacact 14955754  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||    
T  14955755 ctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactc 14955854  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14955855 aaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatccttc 14955917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 482
Target Start/End: Original strand, 14333328 - 14333755
Alignment:
Q  55 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatg 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| |||| || ||||| || ||| | || ||     
T  14333328 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca-tcttcttaatctcttcattgcctgggata 14333426  T
Q  154 caaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgt 253  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||  | ||||| |  || ||||| ||  ||||||| ||||  ||| ||| ||  || |||||| |||| || |    
T  14333427 caaattcttcctcggaatctcaacacacctagatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacacactttacat 14333526  T
Q  254 ccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaa 353  Q
    | ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||| |  ||||     
T  14333527 caactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 14333626  T
Q  354 atctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttaccc 453  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  14333627 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14333726  T
Q  454 gggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  14333727 ggatgataattcaaaccaaagtcataatc 14333755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 8199521 - 8199987
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  8199521 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 8199620  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  8199621 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 8199719  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  8199720 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 8199819  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  8199820 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 8199919  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8199920 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 8199987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 18178635 - 18179101
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18178635 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactttctt 18178734  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |   | ||||| |   ||| ||    
T  18178735 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattctaaaatcactgtctttag 18178833  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  18178834 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 18178933  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||| || || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  18178934 tttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctgaaatgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 18179033  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  18179034 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 18179101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18551135 - 18550669
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  18551135 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 18551036  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||| | |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  18551035 caagaatta-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 18550937  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  18550936 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 18550837  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18550836 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtc 18550737  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  18550736 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 18550669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 13686957 - 13687423
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  13686957 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 13687056  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| |||| |||||| || |  || |  || ||||| |   |||||||    
T  13687057 caagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagt 13687156  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||  ||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||||||||      
T  13687157 ctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcatacccagt 13687256  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
      ||||||||| ||||||   |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  13687257 ctcacactctgaggtgacctttcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtct 13687356  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  13687357 tcctactcaaggcatatgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 13687423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23202990 - 23202524
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  23202990 acatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 23202891  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||     | ||||| | | ||||||    
T  23202890 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcggttctaaaatcactatcttcag 23202792  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| |    | ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  23202791 tctgatctctagcaaccgacgagtccacaaacttcacatctactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 23202692  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  23202691 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 23202592  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||    
T  23202591 ttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttacccggatgatgattcaaaccaaagtcataatc 23202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23509117 - 23508651
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  23509117 acatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 23509018  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||     | ||||| | | ||||||    
T  23509017 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcggttctaaaatcactatcttcag 23508919  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| |    | ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  23508918 tctgatctctagcaaccgacgagtccacaaacttcacatctactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 23508819  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  23508818 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 23508719  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||    
T  23508718 ttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttacccggatgatgattcaaaccaaagtcataatc 23508651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 480
Target Start/End: Original strand, 12688414 - 12688857
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcat 134  Q
    ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||| || ||    
T  12688414 ccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatca-tcttcttaat 12688512  T
Q  135 ctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcatt 234  Q
    ||| || | |||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || |||||     ||||||| ||||  ||| ||| ||      
T  12688513 ctcttcat-gtctagaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaatgtcttcagtctgatctctagcaaccaac 12688611  T
Q  235 aaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgaca 334  Q
    || ||||||||||| |  || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||||| ||||||     
T  12688612 aagtccacaaactttaaatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgacc 12688711  T
Q  335 actcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgc 434  Q
    | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  12688712 attcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgc 12688811  T
Q  435 aactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataa 480  Q
    ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||    
T  12688812 aacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataa 12688857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16693 - 16229
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16693 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacat--tcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16596  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||| ||||| |  |||| ||| |||||||||| ||| || || || || || || ||  |||||||    
T  16595 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacactgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagt 16496  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  |   | ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  16495 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttcttttcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 16396  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  16395 ttcactctctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 16296  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16295 tcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 16229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11552439 - 11552009
Alignment:
Q  56 aatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgc 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | |||| ||||| || ||||| || ||||  ||||| |    
T  11552439 aatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcctcaagaatc-atcttcttaatctcttcattgtatggaatac 11552341  T
Q  155 aaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtc 254  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||| || ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || |     
T  11552340 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcggtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatg 11552241  T
Q  255 cacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaa 354  Q
     ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||| | ||||||||  |||||| | | |||||| |  |||| |    
T  11552240 aactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccaatttcacactctaaggtgaccatttgcaaaccaaactcata 11552141  T
Q  355 tctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    | ||| ||||| |||| |||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  11552140 tatctgaactgttcaactaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtctttttactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccta 11552041  T
Q  455 ggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  11552040 gatgataattcaaaccaaagttataatccttc 11552009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 14212576 - 14213033
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||| | |||||    
T  14212576 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttcgatgactctcttcaagaatca 14212675  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||| ||  | | ||| ||||| ||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||  ||||||| ||||||||    
T  14212676 ttttcttcatttctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattact 14212775  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| || |  |||||| |||  || |||| ||| ||||  | |||  ||    
T  14212776 agcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactctttagaaattcattatcaatcttcagcattcccagtttcactttc 14212875  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||| | || ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| || ||||    
T  14212876 tgaggtgaccattcacaaaccaagctcaaatctctgaattgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctca 14212975  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  14212976 aagcatctgcaacaaaattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 14213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15154034 - 15153825
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  15154034 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaaattcttcagatcatgatacatcttcatagctcccggatggatactcaagctactcctatgactctctt 15153935  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | |||||||    
T  15153934 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 15153835  T
Q  216 ttgattacta 225  Q
     |||||||||    
T  15153834 ctgattacta 15153825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8211474 - 8211347
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  8211474 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttctttaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatca 8211375  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaat 152  Q
    |  | |||| ||| || |||||||||||    
T  8211374 acttcttcaactcttcattgtcaggaat 8211347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15147960 - 15147801
Alignment:
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| || ||||| || || |||||     
T  15147960 cacactctgaggtgaccattcacaaactaagctcaaatcactaaactgttcaagcaactcgaactccctaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttc 15147861  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatca 477  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||    
T  15147860 ctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatca 15147801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 21662854 - 21662933
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 95  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  21662854 acatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatatatttttgtagctcccggatgaatactcaa 21662933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 17924564 - 17924651
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17924564 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctaatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcagactactcctgtgaccttcgtccaaaatc 17924651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27107131 - 27107045
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  27107131 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 27107045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 123
Target Start/End: Original strand, 4440839 - 4440928
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||||| | | || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  4440839 gaccaccaaaacaacctctttaaatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 4440928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 7824813 - 7824899
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  7824813 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctaatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 7824899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 13354063 - 13354128
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    |||||||||||   | |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  13354063 ccaccaaaacaatctcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactact 13354128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 33048 - 32578
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33048 acatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 32949  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  32948 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 32849  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32848 ttgattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaac 32749  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32748 tgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 32649  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32648 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 32578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 56268 - 55801
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56268 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 56169  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || | | | |||||       
T  56168 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgcc 56069  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | |||| || ||||| ||||||||  | |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  56068 attaccagcaattatcaaatcaacaaacttcccatccaattgctgagcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaactgt 55969  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||| |    
T  55968 atactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcc 55869  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  55868 tgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattgaagccaaaatcataatccttc 55801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 41213 - 41299
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  41213 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 41299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21680328 - 21679858
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680328 acatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 21680229  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  21680228 ccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 21680129  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21680128 ttgattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaac 21680029  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680028 tgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 21679929  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21679928 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 21679858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24619842 - 24619375
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24619842 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 24619743  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| | | ||||| |     
T  24619742 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtc 24619643  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  24619642 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 24619543  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  24619542 acactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaagtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcc 24619443  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24619442 tgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttc 24619375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24716073 - 24715606
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24716073 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 24715974  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| | | ||||| |     
T  24715973 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtc 24715874  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  24715873 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 24715774  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  24715773 acactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaagtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcc 24715674  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24715673 tgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttc 24715606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24749101 - 24748634
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24749101 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 24749002  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| | | ||||| |     
T  24749001 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtc 24748902  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  24748901 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 24748802  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  24748801 acactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaagtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcc 24748702  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24748701 tgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttc 24748634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Original strand, 20822279 - 20822737
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20822279 cttcaatccggaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatc 20822378  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  20822379 aacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaattctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattac 20822478  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20822479 tagcgactatcaaatctacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcgctattgatcttcaacatacccaactgcacact 20822578  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20822579 ttgagatgataactcacacactagacttaagtctctaaactgttcaagcaattcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 20822678  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20822679 aacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 20822737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Original strand, 22462778 - 22463235
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22462778 cttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttccaaaatc 22462877  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |   || | ||||||||    
T  22462878 aacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgtt-atcaaccttgaaatcactattctctgcttgattac 22462976  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
     | ||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22462977 cagcaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacact 22463076  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | |||||| || || || || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22463077 ttgagatgacaattcacacacgagacttaaatccctaaactgttcgagcaattcaaactcctttaccattaaggccgacatgtgcaacgtcttcctactc 22463176  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22463177 aacgcatctgcaactacattaactttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 22463235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21890309 - 21889933
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21890309 acatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactaaagctacttttgtggctttctt 21890210  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||| ||||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || | |  || |||    
T  21890209 ccaaactcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcaccaaccttgaagtcactatatttagt 21890110  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21890109 ttgattactagcaaccattaaatcgacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaac 21890010  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccat 392  Q
    || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  21890009 tgtacactctgaggtgacaactcataaacaagactcaagtctctaaacttctctagcaactcaaactcctttaccat 21889933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 475
Target Start/End: Original strand, 20774585 - 20775036
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||    
T  20774585 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccaggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatc 20774684  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |   | || | ||||||||    
T  20774685 aacttcttcaattcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattac 20774784  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20774785 tcacaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgatactacccaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacact 20774884  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20774885 ttgagatgataattcacacacgagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 20774984  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaat 475  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20774985 aacgcatctgcaactactttagctttatctggatggtagttcaagccaaaat 20775036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21831311 - 21830878
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  21831311 acatcacgcttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaaactacttttgtgactttctt 21831212  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||| |||    
T  21831211 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagggatacaaattctgcctcagaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatctttagt 21831112  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21831111 ttgattactagcaaccaacaattctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaac 21831012  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||| || |||||||    
T  21831011 ttcacactcttaggcgacaactcacaaacgagactcaggtctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcaaacatatgcaacgtct 21830912  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagcttt 449  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21830911 tcctgctcaaagcatctgcaacaacattagcttt 21830878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28894484 - 28894023
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||    
T  28894484 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatc 28894385  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |   | || | ||||||||    
T  28894384 aacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattac 28894285  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
      |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28894284 ccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacact 28894185  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28894184 ttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 28894085  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28894084 aacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatcctt 28894023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28915955 - 28915494
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||    
T  28915955 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatc 28915856  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |   | || | ||||||||    
T  28915855 aacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattac 28915756  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
      |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28915755 ccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacact 28915656  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28915655 ttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 28915556  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28915555 aacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatcctt 28915494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28923310 - 28922849
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||    
T  28923310 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatc 28923211  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |   | || | ||||||||    
T  28923210 aacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattac 28923111  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
      |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28923110 ccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacact 28923011  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  28923010 ttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactc 28922911  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28922910 aacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatcctt 28922849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22235467 - 22235000
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  22235467 tcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaaatcatggtacatctttgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 22235368  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  |||||| ||| || || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| || || | | | |||| ||     
T  22235367 aaattaactttttcaactcttcattatcatgaatacaaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcgaccttaaagtcactatcctcagcttc 22235268  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| || || || | ||| ||||||||     
T  22235267 attaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacctgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatccccaactga 22235168  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || |    
T  22235167 atactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcc 22235068  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22235067 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaattcatagtccttc 22235000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21563523 - 21563053
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  21563523 acatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 21563424  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||  || | |||||| |||||| ||  || ||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21563423 ctaaaatcaactttttcaactcataattataaggaatacaaattatgtgtcggaatctcaacacacgttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 21563324  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21563323 ttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttgatactgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaac 21563224  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||| || |||||||    
T  21563223 ttcacactctaaggcgacaactcacaaacgagactcaggtctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcatacatatgcaacgtct 21563124  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  21563123 tcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaactaaaatcatagtccttc 21563053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24797938 - 24797477
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  24797938 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 24797839  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  24797838 acttcttcaactcttcattgtcaggaatgcaaactctacctctgaacctcaaaacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 24797739  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  24797738 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatccctatcaattttcaacattcccaactgtatactc 24797639  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| || ||||| |||||||    
T  24797638 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagtcttcctactca 24797539  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24797538 aagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 24797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23079630 - 23079173
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||    
T  23079630 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactacttttgtgactctcttcaagaatca 23079531  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||   | | || || | |||||     
T  23079530 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcctccgtgtcattacc 23079431  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||  | ||||    
T  23079430 agtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgttgagcttctcagatactattcaagaaattactgttaatcttcaacatccccaactatatactc 23079331  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||    
T  23079330 tgaagtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctca 23079231  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23079230 acgcattagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 23079173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14886532 - 14886071
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  14886532 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 14886433  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  14886432 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcaccccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 14886333  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| ||||| || |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  14886332 agaagtcatcaaatcaacaaatttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 14886233  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  14886232 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 14886133  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14886132 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 14886071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17268885 - 17268419
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17268885 gacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgctcaagctactcttgtgactttcc 17268786  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||     
T  17268785 tctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaa 17268686  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| | ||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||  |||||| |||  || ||||| || || || | ||| |||||    
T  17268685 tgccattaccagcaaccatcagatcaacaaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaa 17268586  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| || || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| || ||||| || |  |||    
T  17268585 ctgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcatgtctctaaactgttccagcaaatcgaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtc 17268486  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17268485 ttcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataat 17268419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37542922 - 37542461
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  37542922 ttcataccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 37542823  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    || | |||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  37542822 atttcttcaactcttcgttgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 37542723  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||| |||  || |||||||  ||||| || ||||| | |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  37542722 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgtttaagaagttactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 37542623  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || ||||| |||||||||||||  || |||| ||| || || || ||||| |    
T  37542622 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacacgtgcaaagttttcctactta 37542523  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37542522 aagcgtcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 37542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 26738277 - 26737842
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  26738277 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctatgactctctt 26738178  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||  || |||||| |||| || ||||| |  || ||||| ||| |||||||    
T  26738177 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacgcaccatgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagt 26738078  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  ||   |||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| |||| |    
T  26738077 ctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaactttatgtctttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagc 26737978  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| |  ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  26737977 ttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaactgctccaacaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtct 26737878  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26737877 tcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttac 26737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 20343109 - 20343570
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  20343109 ttcaaactggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtatatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 20343208  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | ||||| | |||||     
T  20343209 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacc 20343308  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  |||||||  || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  20343309 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactc 20343408  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| ||  | ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || |||||||| |||| |||||  || |||||||| || || || || ||||    
T  20343409 tgagatgacaattcatagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcatcatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctca 20343508  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20343509 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 20343570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 23441046 - 23441512
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  23441046 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcct 23441145  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | |||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| |||||||    
T  23441146 caagaatcattttcttcatctcttcatcgtcacgaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 23441245  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  23441246 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttttgtgcctctttaatactcttcataaattcactatcaatcttcagcattcccact 23441345  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||| | | || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  23441346 ttcacactctgaggtgtccattcacaaactaaactcaaatctctaaactgttcaagtaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 23441445  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23441446 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagttttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 23441512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16357338 - 16357808
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16357338 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16357437  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16357438 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16357536  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16357537 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16357636  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16357637 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16357736  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16357737 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16357808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 27519243 - 27519712
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27519243 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 27519342  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  27519343 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 27519441  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  27519442 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 27519541  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  27519542 tt-cacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 27519640  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27519641 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 27519712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 27611190 - 27611656
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27611190 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 27611289  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| |  || ||||| |   ||||||    
T  27611290 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcag 27611388  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||| ||||  || |||| |||||||||    
T  27611389 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcgctatcaatcttcagcatacccaa 27611488  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||  || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  27611489 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtagttcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 27611588  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  27611589 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 27611656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27684950 - 27684484
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27684950 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 27684851  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || |||||  | || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  27684850 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 27684752  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  27684751 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 27684652  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  27684651 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 27684552  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  27684551 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 27684484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 34567330 - 34567800
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  34567330 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 34567429  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  34567430 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 34567528  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  34567529 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 34567628  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  34567629 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 34567728  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  34567729 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 34567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 23574573 - 23575031
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  23574573 acatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 23574672  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | || || | | ||||||         |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||| |    
T  23574673 caataaacattttcttcatca--------tcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcctcaat 23574764  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || | || ||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  23574765 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaattttttgtgcttctttgatactcttcaggaattcactatcaatcttcagcattcccagt 23574864  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || | ||    
T  23574865 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgcct 23574964  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23574965 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 23575031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 25848902 - 25849359
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || | |||||    
T  25848902 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactatcatcaagaatca 25849001  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| | | | ||||| | |||||     
T  25849002 acttcttcaactcatcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacc 25849101  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| | |||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || || | ||| |||||||| | ||||    
T  25849102 tgaagtcatcaaatcaataaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatctttagcatccccaactgtatactc 25849201  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||  || |||||||| || || || || ||||    
T  25849202 tgagatgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactattctagcaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctca 25849301  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25849302 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 25849359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14999289 - 14998823
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  14999289 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 14999190  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||  || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  14999189 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacactttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 14999091  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  14999090 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatgaatcttcagcatacccag 14998991  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  14998990 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 14998891  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  14998890 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 14998823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22332437 - 22331971
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  22332437 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttatttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 22332338  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  22332337 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 22332239  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  22332238 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 22332139  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  22332138 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 22332039  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22332038 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22331971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27668040 - 27667574
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27668040 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 27667941  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  27667940 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 27667842  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  27667841 cctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 27667742  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||| | | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  27667741 tttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 27667642  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  27667641 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 27667574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 21496891 - 21497100
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  21496891 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaggtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 21496990  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21496991 ctaaaatcaactttttcaaatcatccttattaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 21497090  T
Q  216 ttgattacta 225  Q
    || |||||||    
T  21497091 ttcattacta 21497100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20467647 - 20467182
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||    
T  20467647 acatcacgtttcaaccccgaccaccaaaccaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgttactctctt 20467548  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||  || | |||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||||    
T  20467547 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcatcaggaatacaaattttgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcag 20467449  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| | | |||| | |||||| |||||||| || |||||||  ||| ||| | |||||||| |||  ||||||||||  || || | ||| || ||    
T  20467448 tctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacatccactttctgc-cttttttaatactagtcagaaattcactatcaatctttagcattcctaa 20467350  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||| || || | ||| || || || | |||||| || ||||| ||||  ||     
T  20467349 cttcacgctctgaggtgacaactcacaaactaaactcaggtctctaaactgttcgagcagctctaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagtt 20467250  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || | ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  20467249 ttccgacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 20467182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 29475623 - 29475157
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  | | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  29475623 acatctcgtttcaaaccagaccaccaggaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 29475524  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  29475523 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 29475425  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  29475424 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 29475325  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  29475324 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaatctgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 29475225  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  29475224 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 29475157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 22135513 - 22135970
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||     
T  22135513 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaatc- 22135611  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| |||||||    
T  22135612 atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatcctttctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagtctgattac 22135711  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | ||||||    
T  22135712 tagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacact 22135811  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || |  || ||    |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||    
T  22135812 ctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaatttgaactctccgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactc 22135911  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22135912 aaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22135970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28930946 - 28930762
Alignment:
Q  301 ttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28930946 ttcaacatacccaactgtacactttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccg 28930847  T
Q  401 acatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28930846 acatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatcctt 28930762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 19770796 - 19771265
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  19770796 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 19770895  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  19770896 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 19770994  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  19770995 cctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 19771094  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||| | | || ||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  19771095 tttcacgctctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 19771194  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19771195 ttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcgtaatcctt 19771265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 20800284 - 20800645
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| ||||    
T  20800284 acatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaggttacttctatgactctctt 20800383  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | ||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| |||||||    
T  20800384 caagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 20800483  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  |||||||| |  || |||| ||| | ||      
T  20800484 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactgtcaatcttcagcattctcagt 20800583  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactc 377  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20800584 ttcacactctgaggtgaccactcgcaaactaggctcatatctctaaactgttcaagtaactc 20800645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 40709616 - 40710086
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  40709616 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 40709715  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||| |    
T  40709716 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccg 40709814  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||     
T  40709815 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcaacatacccag 40709914  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  40709915 tttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 40710014  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  40710015 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 40710086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 41771678 - 41772147
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  41771678 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 41771777  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  41771778 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 41771876  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctcta-atactattcaagaattcactattgattttcaacataccca 313  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||  || || | |||||| |    
T  41771877 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc-ctagatatttttcaaaaattcactatcaatcttgagcataccta 41771975  T
Q  314 actgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgt 413  Q
      | ||| ||||| |||||| | ||  |||| |  |||| |||||  ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||    
T  41771976 gtttcacgctctgaggtgaccattcataaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgt 41772075  T
Q  414 ctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  41772076 cttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 41772147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 21881794 - 21882251
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || |||||||| || | ||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||| | |||||    
T  21881794 ttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagattatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctattcaagaatca 21881893  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||  | |  |||||||| ||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||| ||||||||    
T  21881894 ttttcttcatctctacataatcaggaatacaaatacgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgacattaaagtcaccatcttcagtctgattact 21881993  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || |  ||||||||||| || ||||  || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| | ||  | |||||||    
T  21881994 agcaaccaacaagtatacaaacttgacatcaactttctgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcacagtttcacactc 21882093  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||    
T  21882094 tgaggtgaccactcacaaactaggctcatatctgtaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcggacatattcaatgtcttcctactca 21882193  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21882194 aggcatcaacaacaacattagctttacctagatgataattcaaaccaaagtcataatc 21882251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21338847 - 21338384
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21338847 acatcacgtttcaacccagaccacgaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 21338748  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | |||  |||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||||| |  || |||||      ||||||    
T  21338747 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctagaatacaaattctacctcggaatctcaatactccctgatcatcgattttaaaatcattgttttcagt 21338648  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||  ||| || | |    
T  21338647 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttctgcattcctagc 21338548  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||| |||| | ||||| || |||||| |  ||||||||| ||||||| || || ||||| |  || || |||||||| || ||||| || | | |||    
T  21338547 ttcacattctgagatgacatcttgcaaactaaactcaaatctttaaactgttccagcaactcgagctctttaaccatcatagctgacatatgcagcatct 21338448  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  21338447 tcctgctcaaagcatttgcaacaacattagctttacctggatgatagttcaacccaaaatcata 21338384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 422
Target Start/End: Original strand, 23517398 - 23517768
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || |  | |||||    
T  23517398 ttcagatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatctttaggaa 23517497  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| || ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||    
T  23517498 tacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttctgtctgattactagcaaccaataagtctacaaacttgac 23517597  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||  || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||    
T  23517598 atcaactttatgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgatcactcacaaactaagctc 23517697  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctact 422  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| |||||    
T  23517698 atatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctact 23517768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 22503506 - 22503967
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || | |||||    
T  22503506 ttcaaaccggaccactaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttagtagccccgggctgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatca 22503605  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||     | ||||| | | |||     
T  22503606 acttcttcaactcatcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcattgtcctcagtgtcactacc 22503705  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| || || || |  ||  |||  |  |||||||  ||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  22503706 agtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctgctttctaagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactc 22503805  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||    
T  22503806 tgaggtgacaactcacagactagactcaagtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctca 22503905  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22503906 atgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 22503967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37291046 - 37290576
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  37291046 acatctcgtttcaaactagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtggctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 37290947  T
Q  116 ccaaaatcaatcttt-tcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| ||||  | ||||| ||  |||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||| | || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  37290946 caagaatca-tcttcctaatctcttcaatgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacagcttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 37290848  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||   || ||| ||  || ||||||||||| || || |||| ||| ||||   | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  37290847 tctgatctttagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgctttcttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 37290748  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||  | |||| | || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  37290747 tttcacactctaagatgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaattctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 37290648  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  37290647 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcgtaatccttc 37290576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 486
Target Start/End: Original strand, 23472366 - 23472534
Alignment:
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||||||||     
T  23472366 cacactctgaggtgacatttcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttc 23472465  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||||||||||||||||    
T  23472466 ctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctagatgataatttaacccaaaatcataatccttc 23472534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 18776606 - 18776841
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  18776606 acatctcgtttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 18776705  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || ||  |  |||||||    
T  18776706 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcatcgtcttcagt 18776805  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
     ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||    
T  18776806 ctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgac 18776841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21872226 - 21872130
Alignment:
Q  390 catcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21872226 catcatagcagacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 21872130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21876506 - 21876410
Alignment:
Q  390 catcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21876506 catcatagcagacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 21876410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Original strand, 22349259 - 22349359
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22349259 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcccgtgactctctt 22349358  T
Q  116 c 116  Q
    |    
T  22349359 c 22349359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 484
Target Start/End: Original strand, 21497118 - 21497228
Alignment:
Q  367 tcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttca 466  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||       || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21497118 tcaagtaactcaaactcctttaccatcat-------atatgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattca 21497210  T
Q  467 agccaaaatcataatcct 484  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  21497211 aaccaaaatcatagtcct 21497228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Original strand, 25424025 - 25424189
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||    
T  25424025 acatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa-ttacttctatgactctctt 25424123  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacac 181  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||    
T  25424124 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacac 25424189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Original strand, 25427602 - 25427735
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25427602 ctcaaatttctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 25427701  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||| ||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  25427702 tacacggatgatagctcaactcaaaatcataatc 25427735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 23472065 - 23472215
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||  | | | | ||||    
T  23472065 acataacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcgttctagctcccggatgaatacttaagctacttctataaatctctt 23472164  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctc 166  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  23472165 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctc 23472215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Original strand, 18776965 - 18777098
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18776965 ctcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctt 18777064  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||  | || || ||||| ||||||||||||||    
T  18777065 tacctagatgataattcaaaccaaaatcataatc 18777098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 485
Target Start/End: Original strand, 21408307 - 21408443
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| |    
T  21408307 ctcaagtctctgaactgttcaagcaactccaactctttaaccatcatagcagacatatgtaatgttttcctacttaaagtatctgcaacaacattagcct 21408406  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  21408407 tacccggatggtaattcaatccgaattcataatcctt 21408443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 21407974 - 21408070
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgacttt 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  21407974 acatctcgcttcaacccggaccaccaaaataaattcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctgcatgaatactcaaattacttctgtgacttt 21408070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 873
Alignment:
Q  432 tgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  923 tgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 24582048 - 24582134
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  24582048 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 24582134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 27011920 - 27012008
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  27011920 gaccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactaaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 27012008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21936718 - 21936632
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  21936718 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctgggtgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 21936632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 23504280 - 23504366
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  23504280 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 23504366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Original strand, 24582361 - 24582458
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24582361 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 24582458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 24 - 486
Target Start/End: Original strand, 23954 - 24416
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  23954 cttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 24053  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||    
T  24054 aactttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattac 24153  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
     |  || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24154 aataaaacattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 24253  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  24254 ctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgtaacgtcttcctgctc 24353  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24354 aaagcatctgtaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 24416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 486
Target Start/End: Original strand, 19792 - 20254
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  19792 cttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 19891  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||    
T  19892 aactttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagcttgattac 19991  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
     |  || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19992 cattaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcagcatacccaactgcacact 20091  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20092 ctggggtgacaattcgcaaaccagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgtaacgtcttcctgctc 20191  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20192 aaagcatctgtaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 20254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 113494 - 113964
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  113494 acatcacgcttcaaactagaccaccaaaatagcttcttcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctattcttgtgactttctt 113593  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  113594 ccaaaatcagccttttcatctcatcgttgtcaagaatacaaattctgcctccgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgcaatcactatcttcagt 113693  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  113694 ttgattactattaaccattaaatccacaagcttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcattattgattttcaacatgcccaac 113793  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113794 tgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 113893  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  113894 tcctactcaaagcatctgcaactacattggcgttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 113964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 95365 - 95066
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||     
T  95365 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatt 95266  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | || |  || || ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  95265 aacttctttaattcttcattgtcgggaacacaaattctacctctaaatctcaatacaccttgctcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattac 95166  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  95165 tatcaaccattaaatccacaaacttgatgtcaacttgttgtgcttctctgatgctattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgtacact 95066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 109182 - 108713
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  109182 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 109083  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  109082 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatataaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 108984  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  108983 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 108884  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  108883 tttcacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcagacatatgcaatgtc 108784  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  108783 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 108713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 49885 - 49415
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49885 acatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 49786  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  49785 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttatcaggaatgcaaattctgcatctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 49686  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49685 ttcattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttctacatacccaac 49586  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49585 tgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 49486  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49485 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccgaatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 49415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 44089 - 44555
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  44089 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgagtgaatactcaagctacttctgtgactctctt 44188  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| | ||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  44189 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgtaatacaaattctctctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 44287  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | || | |||| ||| ||   | |||||||||||||| || ||||  || |||||  | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| ||||||||     
T  44288 tctggtcactagcaacca---agtccacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatactcttcaggaactcactatcaatcttcagcatacccag 44384  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  44385 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctgaactgttcgagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtc 44484  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  44485 ttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaagtcgtaatcctt 44555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 9409 - 9875
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9409 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctctt 9508  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  9509 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttcaaatcattgtcttcag 9607  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |  ||| |||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||||| |     
T  9608 tccgatcactagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacctag 9707  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  9708 tttcacactctcaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 9807  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  9808 ttcctacttaaggcatctgcaacaacactagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 9875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 718
Alignment:
Q  37 caccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcatc 135  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || |||    
T  966 caccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttccagaatc-atcttctttatc 868  T
Q  136 tcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcatta 235  Q
    || || | |||  |||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||||||| ||| ||  |    
T  867 tcttcatcgtctagaatacaaattctacctcgaaacctcaatacaccatgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaaca 768  T
Q  236 aatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaag 285  Q
    |  ||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  767 aggccacaaacttgacatcaactttttgtgcttctttaatacttttcaag 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 15871 - 16337
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15871 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctctt 15970  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  15971 caagaatc-atcttcttaatctctttattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcag 16069  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |  |||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| |||||| |     
T  16070 tccgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttaagaaattcactatcaatcttcagcatacctag 16169  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||  |||||| | |||||||| |  |||  |||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||| |  ||||| || || |||    
T  16170 tttcacactctcaggtgaccattcgcaaaccaaactcttatctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagaagacatatgcaatgtc 16269  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16270 ttccaactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 16337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13971716 - 13971246
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13971716 acatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 13971617  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  13971616 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcgggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 13971517  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13971516 ttgattactattaactattaaatccacaaactcgacatcaacctgttgcgcttatttgatactattcaagaattcactattgatttttaacatacccaac 13971417  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971416 tgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 13971317  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13971316 tcctactcaaggcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaagtcataatccttc 13971246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 14087206 - 14087676
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14087206 acatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 14087305  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  14087306 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtctggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 14087405  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14087406 ttgattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaac 14087505  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14087506 ttctcactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaatgtct 14087605  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14087606 tcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagtttaacccaaaatcataatccttc 14087676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 14574456 - 14574925
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||  || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14574456 acatctcgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttctt 14574555  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  14574556 ctagaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccatgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 14574655  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || | ||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  14574656 ttcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 14574755  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  14574756 tgcacactctgaggtgacaactcgcaaacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattcatttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 14574855  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14574856 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 14574925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10419623 - 10419175
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||    
T  10419623 gaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttca 10419524  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
      || || ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||| |||    
T  10419523 attcttcattgtcgggaacacaaattctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccat 10419424  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||     
T  10419423 taaatccacaaacttgacatcaactcgttgtgcttctctgatactattcaagaagtcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgagatgat 10419324  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    || || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  10419323 aattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctg 10419224  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  10419223 caactacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatc 10419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12360135 - 12359653
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12360135 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcta 12360036  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa---------------tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatc 203  Q
    |||||||  ||||||  ||||| |  |||||||               |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  12360035 aaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaacatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtc 12359936  T
Q  204 gccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttc 303  Q
     | | | |||||   ||||| ||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12359935 actatcctcagtgccattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatctacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttc 12359836  T
Q  304 aacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgaca 403  Q
    | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||  ||||||||||  || ||||    
T  12359835 agcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattatttcaccatcaaagcagaca 12359736  T
Q  404 tgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12359735 tatgcaacgtctttctactcaaggaatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 12359653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 17493166 - 17493633
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  17493166 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctccagaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 17493265  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || | | ||||||| |     
T  17493266 aaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaatacaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaacctttaagtcactatcttcagtgtc 17493365  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    | ||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||     
T  17493366 actaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaaatgt 17493465  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||| | ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  17493466 acactctgaggtgtcaattcacagacacgactcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcc 17493565  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  17493566 tcctcaaggcatctgcaaccacgttggctttacccggatggtaactcaaaccaaaatcataatccttc 17493633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 31939439 - 31939906
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  31939439 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacccttgtgactttcctcta 31939538  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  31939539 aaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 31939638  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| |||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  31939639 attaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 31939738  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || ||  |||||||| | ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||  || ||||| || | ||| || |    
T  31939739 acactctgaggtgtcaattcacaggcaaggctcgagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcc 31939838  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31939839 tactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaagtcataatccttc 31939906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31694779 - 31694312
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31694779 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaacttcttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcta 31694680  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  31694679 aaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 31694580  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| |||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  31694579 attaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 31694480  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||| |||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||  || ||||| || | ||| || |    
T  31694479 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggttcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcc 31694380  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31694379 tactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatgttaattcaaaccaaagtcataatccttc 31694312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18133939 - 18133472
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18133939 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttcca 18133840  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  |||||| ||| || || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||||     
T  18133839 aaattaactttttcaactcgtcattatcaggaatactaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttc 18133740  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| || || || | |||  |||||||     
T  18133739 attaccaacaatcatcaaatgaacaaacttcacatctacttgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatcgccaactga 18133640  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    ||||| || |||| ||| || || || |||||||| ||||||||| |||| |  || |||||||| || |||||||  || ||||| || ||||| || |    
T  18133639 acactatgaggtgtcaattcacagacgaggctcaagtctctaaacggctctaacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcc 18133540  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18133539 tacttaaggtatatgcaaccacattagctttacccggatggtaattcatgccaaaatcataatccttc 18133472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16827799 - 16827329
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |    
T  16827799 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagctccctgatgaatacttaagctacttttgtgggtttcct 16827700  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   | |||||||    
T  16827699 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcatgaatacaaatttttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagt 16827600  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  16827599 ttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgatgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 16827500  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||| ||| ||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  16827499 tgtacaccctgaggtgacaactcacagataagactcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 16827400  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16827399 tcctgctcaaagcatctgcaaacacattagctttacccggatggtaattcaaactaaaatcataatccttc 16827329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13320095 - 13319628
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  13320095 tcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccgggtgaatactcaatctactcttgtgactttcctcta 13319996  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||   |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |   |||||||     
T  13319995 aaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttc 13319896  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    || || | ||||||||||||| ||||| || || || || || || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||     
T  13319895 ataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatctacctgctgagcttcacggatactattcaagaaatcactgttaatcttcaacatccccgactga 13319796  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  | |||||||  || ||||| ||||| ||||| |    
T  13319795 atactttgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctttaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcagtgcagacatatgtaaggtcttcc 13319696  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13319695 tgctcaacgcattcgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaagtcataatccttc 13319628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 15228182 - 15228652
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  15228182 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 15228281  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || ||||||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  15228282 ctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaattcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 15228381  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    ||| |||||| | | ||  |||||||||||||| || || || |  || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  15228382 ttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaaccttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaat 15228481  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || || ||||    
T  15228482 ttcacactttgagttgacaactcacaaactagactcaagtctctaaattgctcaagcaactcaaaatctttaactatcatagctgacatatgcaaagtct 15228581  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||||||||| ||||||    
T  15228582 tcctgctgaaagcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcatagtccttc 15228652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 47124486 - 47124947
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  47124486 ttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 47124585  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  47124586 acttcttcaactcctcattgtcaggaatgcaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 47124685  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  47124686 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 47124785  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  47124786 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 47124885  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47124886 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 47124947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16836107 - 16835640
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16836107 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaactcatgatacatcttcgtagctccgggatgaatactcaagctactcttgtgactttcc 16836008  T
Q  115 tccaaaatcaa-tcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttca 213  Q
    || ||||| || | |||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||||| || | | |||||    
T  16836007 tctaaaattaacttttttgat-tcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatcttaatactccctgatcatcaactttgaagtcactatcttca 16835909  T
Q  214 gtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacataccca 313  Q
    ||   ||||| | |||  || | ||| || |||||||| ||||| || || |||||||  |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16835908 gtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatactactcaagaaatcactgttaattttcaacataccca 16835809  T
Q  314 actgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgt 413  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |  || |||||||| || ||    
T  16835808 actgaacactcttcggtgtcaactcacacacaagactcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattctcttaccattaatgcagacatgtgcaaagt 16835709  T
Q  414 ctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16835708 ctttctgctcaacgcatccgcaactacattggctttatcaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 16835640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 41178055 - 41178521
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  41178055 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 41178154  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  |||||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||      
T  41178155 ctaggatcaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgattctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaac 41178254  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||| |||  || ||||| || || || | ||| ||||||    
T  41178255 gccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaac 41178354  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  41178355 tgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtct 41178454  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41178455 tcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 41178521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 28754860 - 28755321
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  28754860 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 28754959  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  28754960 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 28755059  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||| |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| | ||||    
T  28755060 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactc 28755159  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  28755160 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 28755259  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  28755260 aagcatccgcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcaaaatccttc 28755321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11303369 - 11302991
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11303369 acatcacatttcaacccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgcctttcct 11303270  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||    
T  11303269 ctaaactcaaccttttgaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 11303170  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| |  || ||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||    
T  11303169 gccattaccattaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaac 11303070  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatca 394  Q
    || |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  11303069 tgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctaaactgctctagcagatcaaattctttcaccatca 11302991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 44777780 - 44778246
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  44777780 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 44777879  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||| ||||  |    
T  44777880 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcgat 44777979  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| ||||| || || || | ||| ||||||    
T  44777980 accattaccagcaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgcgcttcccggatactattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaac 44778079  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |  ||||| || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  44778080 tgtatgctctgaggcgacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccagtaaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgcagtgtct 44778179  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44778180 tcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 44778246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16380515 - 16380058
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16380515 ttcaacccgtaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatta 16380416  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||   |||||     
T  16380415 actttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattacc 16380316  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  ||  || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||  || ||||| || || || | ||| |||||||| |  ||     
T  16380315 agtaacaatcaaatcaaccaacttgacatccacctgttgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatgcccaactgtatgctt 16380216  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || |  ||||| || ||||    
T  16380215 tgaggcgacaactcacataccaaactcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctca 16380116  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16380115 atgcatcagcaactacgttagctttgctaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 16380058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11960765 - 11960295
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||    
T  11960765 acatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttatagcccctgggtgaatactcaaactactatcgtgactctctt 11960666  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || | | | |||||    
T  11960665 caagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaaatcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 11960566  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||| |  | |||| ||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||  ||| ||| ||||||    
T  11960565 gtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcctcatcatccccaac 11960466  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  || ||||| || || || |    
T  11960465 tgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtccctaaactgctctagcaactcaaattcctttaccatcaaagcagacatatgcaatgttt 11960366  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11960365 tcctcctcaatgcatcagcaaccacattggccttactaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 11960295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Original strand, 4678971 - 4679404
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  4678971 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 4679070  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||      
T  4679071 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaac 4679170  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||| |||  || ||||| || || || | ||| ||||||    
T  4679171 gccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaac 4679270  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  4679271 tgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtct 4679370  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagcttt 449  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4679371 tcctactcaatgcatccgcgactacattagcttt 4679404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 486
Target Start/End: Original strand, 15234128 - 15234520
Alignment:
Q  94 aagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaa 193  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| || ||||||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  15234128 aagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaattcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaa 15234227  T
Q  194 ccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcact 293  Q
    ||||||| || | | |||||||||| |||||| | | ||  |||||||||||||| || || || |  || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15234228 ccttgaagtcactatcttcagtttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaaccttctgtgcttctttaatactattcaagaactcact 15234327  T
Q  294 attgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatc 393  Q
     ||||| |||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || |||    
T  15234328 gttgatcttcaacatacccaatttcacactttgagttgacaactcacaaactagactcaagtctctaaattgctcaagcaactcaaaatctttaactatc 15234427  T
Q  394 atggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || || ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||||||||| ||||||    
T  15234428 atagctgacatatgcaaagtcttcctgctgaaagcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcatagtccttc 15234520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 13942557 - 13943023
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  13942557 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 13942656  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||| || |||||||||| ||| || | | ||||| |    
T  13942657 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaacctggaagtcactatcttcaat 13942756  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||||| ||| || | |||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| || || || | ||| ||||||    
T  13942757 gccattaccagcaaccattagatcaaccagcttgacatccacttgttgtgcttcccggatactattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaac 13942856  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || || || || |  |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| || ||||| || |  ||||    
T  13942857 tgtacgctttgagacgacaactcacataccaaactcatgtctctaaactgttccagcaaatcgaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtct 13942956  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13942957 tcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 13943023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14580530 - 14580083
Alignment:
Q  35 accaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttca 133  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| || || | ||||| |||| || |    
T  14580530 accaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcctcaagaatca-tcttcttaa 14580432  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
    |||| || | ||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| | | ||||| | |||||||||  || ||     
T  14580431 tctcttcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaaccttaatacaccttgatcatcgatcttgaaatcactatcttcaatctgattactagtaaccaa 14580332  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     ||||||||||||||||| || ||||  || |||||  ||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||| || | ||  |||||||| | ||||    
T  14580331 caaatccacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttaatacttttcaaaaattcattatcaatcttcaacattcctagcttaacactctgagatgac 14580232  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    |  || || || |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14580231 atttcacagactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgtaaattcttcctactcaaggcatctg 14580132  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  14580131 caacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatc 14580083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5424537 - 5424071
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  5424537 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 5424438  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  5424437 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 5424339  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  5424338 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 5424239  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||| | | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  5424238 tttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 5424139  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  5424138 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 5424071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16338108 - 16337638
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  16338108 acatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcatggtacatctttgtagcccccaggtgaatactcaacctactcttatgactctcct 16338009  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || | |   |||||    
T  16338008 caagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactattctcagt 16337909  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||    | |||| ||||| |||||||| |     || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||||    
T  16337908 gtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaaaatacctgctgagcttctctgatactgttcaagaaatcactatcaatcctcaacattcccaac 16337809  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |    
T  16337808 tgtatactctgaggtgacaattcacataccagactcaagtctctaaactgttctaacaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttt 16337709  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16337708 tcctgctcaatgcatcagcaaccacatcggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 16337638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 13253213 - 13253683
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  13253213 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 13253312  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  13253313 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 13253411  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  |  |||| ||||||||     
T  13253412 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaaccttcagcatacccag 13253511  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | ||||||||    |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  13253512 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccgaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 13253611  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13253612 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataatccttc 13253683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16636296 - 16636766
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16636296 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16636395  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16636396 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16636494  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16636495 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16636594  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16636595 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16636694  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16636695 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16636766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 43163620 - 43164090
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  43163620 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 43163719  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  43163720 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 43163818  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  43163819 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 43163918  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  43163919 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 43164018  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  43164019 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 43164090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15347852 - 15347383
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15347852 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 15347753  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  15347752 cgagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 15347654  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  15347653 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 15347554  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || ||  ||    
T  15347553 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatttc 15347454  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15347453 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcgtaatcctt 15347383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 486
Target Start/End: Original strand, 17187165 - 17187377
Alignment:
Q  274 atactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagta 373  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  17187165 atactactcaagaaatcactgttaattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgttaattcacaaaccagactcaagtctctgaactgttcaagca 17187264  T
Q  374 actcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaa 473  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || || | ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  17187265 actcaaattcctttaccatcatagccgacatatgcaatgccttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccgggtgatagttcaaactaaa 17187364  T
Q  474 atcataatccttc 486  Q
    |||||||||||||    
T  17187365 atcataatccttc 17187377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 10006123 - 10006593
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  10006123 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 10006222  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || | ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  10006223 caagaatca-tcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 10006321  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  10006322 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 10006421  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  10006422 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 10006521  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||||    
T  10006522 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatccttc 10006593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 10906733 - 10907203
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  10906733 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 10906832  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| |   ||||||    
T  10906833 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcag 10906931  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  10906932 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 10907031  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  | || |||||||||||| || || || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  10907032 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaacacatatctctaaactgttctagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 10907131  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||||    
T  10907132 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatccttc 10907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15588999 - 15588529
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15588999 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 15588900  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  15588899 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 15588801  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  15588800 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 15588701  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  15588700 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 15588601  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  15588600 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 15588529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20061661 - 20061191
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  20061661 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcct 20061562  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  20061561 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 20061463  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  20061462 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 20061363  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  20061362 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 20061263  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20061262 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 20061191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 48425970 - 48426440
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  48425970 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 48426069  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  48426070 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 48426168  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||| ||||||||||  || || | ||||||||     
T  48426169 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcaaaaattcactatcaatcttgagcatacccag 48426268  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  48426269 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 48426368  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  48426369 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 48426440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14876105 - 14875640
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |  || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||| | ||    
T  14876105 acatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaattttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctataactctttt 14876006  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  14876005 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgacctt-aagtcaccatcttcagt 14875907  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||  ||| ||  || || ||||||||||  || |||| ||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||      
T  14875906 ctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttgatatcaactttttgtgcctctttaatacttttcaaaaattcactatcaattttcagcattcccagt 14875807  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||| || ||  | || ||||| |  ||||| || || ||||    
T  14875806 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactattcaagcaactcgaactctctaactatcatagtggacatatgcaatgtct 14875707  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||  |||| ||||||||    
T  14875706 tcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaatcaaagtcataatc 14875640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8758678 - 8758494
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  8758678 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 8758579  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaa 200  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8758578 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaa 8758494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16329247 - 16328786
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  16329247 ttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcagatcatggtacatctttgtagaccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 16329148  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |   | ||||| | | |||     
T  16329147 acttcttcaactcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactacc 16329048  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| ||||| || |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || ||||  || |||||||| | ||||    
T  16329047 agtagtcatcaaatcaacaaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcttcattatccccaactgtatactc 16328948  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||  || || ||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| || || || ||||    
T  16328947 tgagatgacagttcacagacaagactcaagtctctaaactgttccaacaactcaaattcttttaccattaaagcagacatatgtaatgttttcctgctca 16328848  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16328847 atgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttc 16328786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 17490382 - 17490839
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  17490382 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 17490481  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||| | |  || |||||     ||||||| |||| |||    
T  17490482 ttttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcaacgattttaaaatcattgtcttcagtctgatcact 17490581  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || ||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||||||| |  | || |||||      
T  17490582 agcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcaacattcttagcttcacacat 17490681  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |    |||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17490682 tcatatgacatttcacaaactaagctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactactttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactca 17490781  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||||    
T  17490782 aagcatctgcaacaacattagctttaccaggatgatagctcaactcaaaatcataatc 17490839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15402124 - 15401658
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |  || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15402124 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatattctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 15402025  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| |   ||||||    
T  15402024 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttccttggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcag 15401926  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||   || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  15401925 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 15401826  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  15401825 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagaaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 15401726  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15401725 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 15401658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15724541 - 15724075
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15724541 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 15724442  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  15724441 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacagattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 15724343  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || ||||||||||  || ||||  ||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  15724342 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgaaatcaactttctgcgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 15724243  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  15724242 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 15724143  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15724142 ttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 15724075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 482
Target Start/End: Original strand, 12498812 - 12499237
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||||| | | |||||||| || | |||||||||||||    
T  12498812 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaa 12498911  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    || |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||| | ||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |    
T  12498912 atccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccaacttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 12499011  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatc 356  Q
     ||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||||||| ||||  | |||||| || |||||| |||| ||||| |  |||| |||    
T  12499012 atttctgtgcctctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcaacattcccagtttcacactttgaggtgaccactcacaaaccaaactcatatc 12499111  T
Q  357 tctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccggg 456  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |     
T  12499112 tctaaactgttcaagtaaatcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaagccatctgcaacgacgttagctttacctaga 12499211  T
Q  457 tggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||    
T  12499212 tgataattcaaaccaaagtcataatc 12499237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 15248670 - 15248820
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15248670 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttctt 15248769  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctc 166  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15248770 caagaatc-atcttcttcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattctgcctc 15248820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 15339792 - 15340258
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15339792 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 15339891  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  15339892 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcag 15339990  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||   || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  15339991 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 15340090  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  15340091 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 15340190  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15340191 ttcctactcaaggcatctgcaacagcattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 15340258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 10384510 - 10384688
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  10384510 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 10384609  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatc 203  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  10384610 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatc 10384688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 53384625 - 53384156
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  53384625 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 53384526  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  53384525 caagaatca-tcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 53384427  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || ||  |    || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  53384426 cctgatctctagcaaccaacaaatccacaaacttcacatcatccctctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatccatcttcagcatacccag 53384327  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  53384326 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 53384227  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  53384226 ttcctactcaaggcatctgcaataacattagctttacccggatgttaattcaaaccaaagtcataatcctt 53384156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14126201 - 14125735
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||||    
T  14126201 acatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcttgatacatcttcgtagctcccggttgaatgctcaagctacttctatgactctctt 14126102  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | |  |||||||  | | || |||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || | ||| || || || || ||| |||||||    
T  14126101 caagaatcattttcatcatctctacatcgtaaggaatgcaaatacaacctcggaatctcaacacaccatgataatcgactttaaagtcaccatcttcagt 14126002  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |||  ||| || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  14126001 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactatttgtgcctctttaatactcttaagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 14125902  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||| | |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  14125901 ttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaacggttcaagtaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 14125802  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  14125801 tcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 14125735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Original strand, 6601268 - 6601728
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  6601268 ttcaaactagaccaccaaaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 6601367  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |  ||||| |  || ||||| |   ||||||  ||||  |    
T  6601368 -tcttcttaatctcttcattgtcgggaatgcaaattctccctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctc 6601466  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    |  ||| ||  |||||||||||||| || || |||   || |||||| | ||  | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | ||||||    
T  6601467 tggcaaccagcaaatccacaaactttacatcaactctctgtgcttctttgatgtttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacact 6601566  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||| |||| | | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  6601567 ctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactc 6601666  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6601667 aaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 6601728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13300064 - 13299889
Alignment:
Q  70 ttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctga 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||   |||| |  |||||||| |||||||| |||||||    
T  13300064 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13299965  T
Q  170 acctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaa 245  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |   ||||||| || || | ||||||||||||| |||||    
T  13299964 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13299889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13310722 - 13310547
Alignment:
Q  70 ttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctga 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||   |||| |  |||||||| |||||||| |||||||    
T  13310722 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13310623  T
Q  170 acctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaa 245  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |   ||||||| || || | ||||||||||||| |||||    
T  13310622 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13310547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 15209414 - 15209564
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  15209414 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcacccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 15209513  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctc 166  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  15209514 caagaatcattttcttcatctcatcgtcgtcaagaaaacaaattctgcctc 15209564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 16692687 - 16693153
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| || || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16692687 acatctcgcttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaagtcctgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16692786  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || |  || || || || ||| |||||||    
T  16692787 caagaatcatttttttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgttgactttaaagtctccatcttcagt 16692886  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||||| ||| ||  |  |  || |||||||| || ||||  |  || ||| ||||||  |||| |||||||||||  || || | ||  ||||      
T  16692887 ctaattactagcaaccaacaggtgtacgaacttgacatcaactttctatgcctctttaatacccttcatgaattcactatcaatctttagcactcccagt 16692986  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||| |||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  16692987 ttcactttctgaggtgaccattcgcaaactaaactcaagtctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaggcagacatatgcaatgtct 16693086  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  16693087 tcctgctcaacgcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataatc 16693153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 15260402 - 15260619
Alignment:
Q  265 gcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaact 364  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| || | || |||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15260402 gcttctttaatacttttcataaattcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactttgagatgacaactcgcaaactaaactcaaatctctaaact 15260501  T
Q  365 gctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagtt 464  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15260502 gttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaaagttttcctacttaaggcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaatt 15260601  T
Q  465 caagccaaaatcataatc 482  Q
    |||  |||||||||||||    
T  15260602 caactcaaaatcataatc 15260619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16411889 - 16411453
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16411889 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16411790  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16411789 caagaatc-atcttcttaacctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16411691  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| |  || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16411690 actgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttaaatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16411591  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | |||||||| |  |||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  16411590 tttcacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatccctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 16411491  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16411490 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacc 16411453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26792006 - 26791618
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  26792006 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 26791907  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  26791906 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 26791808  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||| ||| |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  26791807 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 26791708  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacat 404  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| |||||    
T  26791707 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacat 26791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16756192 - 16755757
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||| || | |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16756192 acatctcgtttcaaaccagacccccagaaaatcttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 16756093  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||||    ||||||    
T  16756092 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcgatgtcttcag 16755994  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||  ||| ||  |||||||||||||| || ||  ||   || |||||  | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16755993 tctgatctctggcaaccaacaaatccacaaactttacatcatctctctgtgcttccttgatgctcttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16755894  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||| | | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16755893 tttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16755794  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16755793 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattcgctttac 16755757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16491456 - 16491318
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  16491456 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatcttcaacaacattagct 16491357  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16491356 ttacccggatgatagctcaacccaaaatcataatccttc 16491318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 371
Target Start/End: Original strand, 16371976 - 16372290
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| |  |  |||||||| |||    
T  16371976 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctttatcatcaggaatacaa 16372075  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    |||| | ||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || |  ||||||||||| || |    
T  16372076 attcgggctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagccaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtatacaaacttgacatcaa 16372175  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatc 356  Q
    |||  || || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||    ||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||| |||    
T  16372176 ctttatgtgcctctttaatactttttagcaattcactatcaatcttcagcattcccagtgtcacactctgaggtgatcactcacaaactaagctcatatc 16372275  T
Q  357 tctaaactgctcaag 371  Q
    ||||||||| |||||    
T  16372276 tctaaactgttcaag 16372290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 486
Target Start/End: Original strand, 12179234 - 12179341
Alignment:
Q  379 aattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcat 478  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12179234 aattctttcaccatcatagcagacatatgcaacgttttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttgcccggctggtaattcaaaccaaaatcat 12179333  T
Q  479 aatccttc 486  Q
    ||||||||    
T  12179334 aatccttc 12179341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16806533 - 16806364
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16806533 acatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16806434  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtg 185  Q
    | | ||||| | | ||||||||    | ||||||||||||||| |   ||| ||| ||||||||||||||    
T  16806433 caagaatcattttcttcatctctggatcgtcaggaatgcaaatccgatctcggaatctcaacacaccgtg 16806364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15015363 - 15015255
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||    
T  15015363 acatctcgcttcaacctgaaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgaatttctt 15015264  T
Q  116 ccaaaatca 124  Q
    ||| |||||    
T  15015263 ccataatca 15015255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 15062267 - 15062433
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  15062267 acatcaagtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcctatgactctctt 15062366  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacacc 182  Q
    | | ||||| | | |||||| | || |  ||| |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  15062367 caagaatcattttcttcatcccttcatcatcatgaatacaaatttggcctcggaatctcaacacacc 15062433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16491771 - 16491703
Alignment:
Q  33 ggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||||||||||||  || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16491771 ggaccaccaaaacaaattctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttact 16491703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 9523260 - 9523327
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9523260 gaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttact 9523327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 16257697 - 16257784
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  16257697 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttatatgaccttcgtccaaaatc 16257784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8273986 - 8273900
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  8273986 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 8273900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13966927 - 13966841
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  13966927 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 13966841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 450
Target Start/End: Original strand, 15062433 - 15062675
Alignment:
Q  208 ccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaaca 307  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  ||  | ||| ||||||| || |  |||| ||||| ||| |||| ||    
T  15062433 ccttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtacctctttaatactcttgagaaatttactatcgatcttcagca 15062532  T
Q  308 tacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtg 407  Q
    | ||||  | ||||||||| |||||| ||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| ||    
T  15062533 ttcccagtttcacactctgaggtgaccactcataaactaagctcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatg 15062632  T
Q  408 taacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttta 450  Q
     || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  15062633 caatgtcttcctacttaaggcatctaccacaacattagcttta 15062675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16742290 - 16742204
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  16742290 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 16742204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16806252 - 16806118
Alignment:
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || |||||     
T  16806252 cacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatccctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttc 16806153  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16806152 ctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacc 16806118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 30138359 - 30138445
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  30138359 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 30138445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 30147910 - 30147996
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  30147910 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 30147996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6711996 - 6711909
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || | ||  |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  6711996 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttagttgttcttggatgaatactcagactactcctgtgaccttcttccaaaatc 6711909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8273673 - 8273576
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8273673 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 8273576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13966618 - 13966521
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||||| || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  13966618 ctcaaatctcgaaacttctcaatcaattcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 13966521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Original strand, 25767184 - 25767281
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25767184 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 25767281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Original strand, 12792708 - 12792780
Alignment:
Q  50 ttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  12792708 ttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 12792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Original strand, 15610670 - 15610742
Alignment:
Q  50 ttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  15610670 ttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 15610742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6974 - 6586
Alignment:
Q  98 tactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6974 tactcttgtgactttcttctaaaatcagccttttcatctcatcattgtcaggaacacaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacctt 6875  T
Q  198 gaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattg 297  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6874 gaaatcactatcttcagtttgattactattaacccttaaatccacaagcttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcattattg 6775  T
Q  298 attttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6774 attttcaacatacccaactgcacactctggggcgacaactcacaaacaagactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatgg 6675  T
Q  398 ccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6674 ccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatccgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttc 6586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 365
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  462 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattcgaactctttaaccatcaaagcggacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Original strand, 826 - 1284
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  826 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatc 925  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   |||| ||||||||    
T  926 aacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctcagcttgattac 1025  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1026 tagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaatatacccaactgcacact 1125  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1126 ttgaggtgacaattcacaaacgagactcaagtctctaaactgttcaagcaattcgaattccttcaccatcatggccgacatgtgcaatgtctttctactc 1225  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1226 aacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19852381 - 19852851
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19852381 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 19852480  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  19852481 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagt 19852580  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  19852581 ttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaattttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaat 19852680  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19852681 tgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 19852780  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19852781 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggtgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 19852851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19858417 - 19858887
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19858417 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 19858516  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  19858517 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagt 19858616  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  19858617 ttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaattttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaat 19858716  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  19858717 tgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctgaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 19858816  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19858817 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggtgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 19858887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 21841387 - 21841857
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  21841387 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 21841486  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  21841487 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagt 21841586  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  21841587 ttaattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 21841686  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21841687 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacttaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtttaacgtct 21841786  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  21841787 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaacagaaatcataatccttc 21841857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20985347 - 20984888
Alignment:
Q  27 caaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||     
T  20985347 caaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctctcgggtgaatacttaagatacttctgtgactttcttccaaaatcaac 20985248  T
Q  127 cttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaa 226  Q
     |||||| |||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  20985247 tttttcaactcatcatttttaggaatacaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactag 20985148  T
Q  227 caatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctg 326  Q
     ||  |||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20985147 taactattaaatcaacaaacttgacatcaactttctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctg 20985048  T
Q  327 gggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaag 426  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  20985047 aggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctatagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtctttctgctcaaa 20984948  T
Q  427 gcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20984947 gcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcatagtccttc 20984888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 485
Target Start/End: Original strand, 23655900 - 23656366
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23655900 tcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgaccttcttcca 23655999  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     ||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||||     
T  23656000 gaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttc 23656099  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||     
T  23656100 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgt 23656199  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23656200 atactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcc 23656299  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23656300 tgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatagtaattcaaaccaaaatcataatcctt 23656366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31416285 - 31415812
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31416285 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 31416186  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | | | |||||    
T  31416185 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaatacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagt 31416086  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||| |  |||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  31416085 gtcattaccagtaatcattaaatcaacaaacttcaaatccacttgctgagcttctcggatactattcaagaattcactattaatcttcagcatccccaac 31415986  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatca---tggccgacatgtgtaacg 412  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |  ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||     || ||||| || || |    
T  31415985 tgcacactctgaggtgtcaactcactgacaagactcaagtccctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagcagacatatgcaatg 31415886  T
Q  413 tctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31415885 tcttcctgctcaacgcgtcagcaaccacattggctttaccagaatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 31415812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20009730 - 20009262
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20009730 acatcacgtttcaaac-ggaccaccaaaataatttcttcaaatcatgatacatatttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 20009632  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |||||||    
T  20009631 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaagaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcagt 20009532  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    | ||||||||  || |||||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||| | ||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  20009531 tcgattactagtaaccattaaatccacaagcttgacatcaattttctgcgcttctatgatattgttcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaat 20009432  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  20009431 tgcacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctgaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 20009332  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  20009331 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattag-tttaccggggtgataattcaaaccaaaatcacagtccttc 20009262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 1267211 - 1267674
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1267211 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatctttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 1267310  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | | ||||| |     
T  1267311 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtc 1267410  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| || | |||||| |||||||| || |||||||  |||||  ||||||| ||||| || || |||| ||| || || ||     
T  1267411 attaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacatccacttgatgtgcttctcggatactgctcaagaaatcactgttaatcttcagcatccctaattgt 1267510  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | ||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | |||||| || || || || |  ||||| |    
T  1267511 atactttgaggtgataactcacagactagactcaaatctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagatatatgcagtgtcttcc 1267610  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1267611 tcctcaacgcatctgcaaccacattgactttacccagatggtaattcaaaccaaaatcataatc 1267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20975459 - 20974997
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20975459 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcctcaaatcatgatacattttcgtagctcccgtatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcta 20975360  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  20975359 aaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 20975260  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  20975259 attaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccacttgttttgcttctcttatactattcaagaaatcacttttaatcttcagcatccccaactga 20975160  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||     || ||||| || | ||| || |    
T  20975159 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaactctctaaactgttctagaaaatggaattctttcacca-----gcagacatatgcagcgttttcc 20975065  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  20975064 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttc 20974997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Original strand, 22051832 - 22052299
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22051832 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaacctactcttgtgactttcc 22051931  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | | | || |    
T  22051932 tctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctccg 22052031  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| || |||||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| |||||    
T  22052032 tgccattactagcaatcattaaatcaaccagcttgacatccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaa 22052131  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  |  || || || |||||||| || || || ||||  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |  |||    
T  22052132 ctatatgctttgaggcgacaactcacataccagactcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtc 22052231  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22052232 ttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 22052299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 22371910 - 22372371
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22371910 acatcatgtttcaatctggaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccaggtgaatacttaagctacttctgtgactttctt 22372009  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  |||||| ||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||   ||| ||    
T  22372010 ctataatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaatattcttcctctgaacctcaacacacacagatcatcaaccttgaaatcacccttttcggt 22372109  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||         | ||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22372110 ttgattactagcaaccattaaatccacaaac---------agtttctgcgcttctctgatactgtttaagaaatcactattgatcttcaacatacccaac 22372200  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| | |||||||   |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  22372201 tgcacactctgagatgacaacaaacaaacaagactcaggtctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 22372300  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  22372301 tcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaatttaaactaaaatcatagtccttc 22372371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 20389069 - 20389539
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  20389069 acatcacgcttcaatccggaccactaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacgtatgtgactttctt 20389168  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  20389169 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 20389268  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||| ||||| ||| ||  || || |||||||| |  || || |  |  |||||| | ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  20389269 ttgaatactagcaaccaacaagtcgacaaacttaatatcaaccttctatgcttctttgatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatactcaac 20389368  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || | ||| || || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389369 ttcacactctgaggcgacaactcacaaactaggctcaagtccctaaactgttcaagcaaataaaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgtct 20389468  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20389469 tcctgctcaaagaatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 20389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 31570653 - 31570187
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  31570653 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 31570554  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||| |    
T  31570553 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaat 31570454  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| |  || ||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || || || || | ||| ||||||    
T  31570453 actattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaac 31570354  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |  || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  31570353 tgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccagtaaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgaagtgtct 31570254  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31570253 tcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 31570187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 19978937 - 19979403
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| || || || |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  19978937 acatcacgttttaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 19979036  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |||||| |||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||     
T  19979037 caagaatcattttcttcatctcttcattgtcaagaatacaaattcgacctcggaatctcaatacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagc 19979136  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || |||||| | ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||      
T  19979137 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttctttgatactcttcaaaaattcactatcaattttcagcattcccagt 19979236  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  19979237 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 19979336  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  19979337 ttatactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 19979403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20395943 - 20395477
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20395943 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttctt 20395844  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  || | |||||  || || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  20395843 caagaatca-tcttctttatctcatcattgtcgggaatataaattctgcctcgaaatcgcaacaatccctgatcatcaacttttaagtcaccatcctcag 20395745  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| | | ||||||   |||| |||||||| || |||||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20395744 tctgattcccaccaatcaaataatctacaaactttacatccactttctgtgcttccttaatactattcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaa 20395645  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||||| |  ||||  ||||||||||| || || | ||| || || || ||||||||  | ||||| ||||| ||     
T  20395644 cttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactcaggtctctaaactgttcgagcagctccaactctttaaccatcataactgacatatgtaaagtt 20395545  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  20395544 ttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 20395477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22377256 - 22376830
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| | |||||    
T  22377256 ttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatca 22377157  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||  | ||||| |  || ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  22377156 ttttcttcatctcatcatcgttaggaatacaaattctgcctcagaatctcaacactcccagatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattact 22377057  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  || ||  || | ||||||||| || || | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| | || || |||||||    
T  22377056 agaaaccaacaagtgcacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactc 22376957  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||| |    
T  22376956 tgaggtgacaattcacaaactaaactcagatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacatctttctactta 22376857  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22376856 aggcatctgcaacaacattagctttac 22376830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22383431 - 22383005
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| | |||||    
T  22383431 ttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatca 22383332  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||  | ||||| |  || ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  22383331 ttttcttcatctcatcatcgttaggaatacaaattctgcctcagaatctcaacactccccgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattact 22383232  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  || ||  || | ||||||||| || || | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| | || || |||||||    
T  22383231 agaaaccaacaagtgcacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactc 22383132  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || ||| |||||||||| |    
T  22383131 tgaggtgacaattcacaaactaaactcagatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacatctttctactta 22383032  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22383031 aggcatctgcaacaacattagctttac 22383005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 14566121 - 14566582
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||    
T  14566121 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctacttttgtgactctcctcaagaatca 14566220  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || ||||| | | | ||||| |  ||||     
T  14566221 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcgttacc 14566320  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  14566321 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 14566420  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || ||||| |||||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  14566421 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 14566520  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14566521 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 14566582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 6680090 - 6680547
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  6680090 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 6680189  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | | | ||||| | |||||     
T  6680190 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 6680289  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||  ||||| |||||||| |  ||| | | ||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  6680290 tgaagtcaccaaatcaacaaacttcaaatcctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 6680389  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  6680390 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaactcgaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 6680489  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6680490 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 6680547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 803475 - 803064
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  803475 ttcaaaccagaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctctagaatca 803376  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| |  ||||     
T  803375 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttacc 803276  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  803275 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 803176  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  803175 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 803076  T
Q  425 aggcatctgcaa 436  Q
    | ||||| ||||    
T  803075 aagcatcagcaa 803064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19483875 - 19483409
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  19483875 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 19483776  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |   ||||||    
T  19483775 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcag 19483677  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  || |||||| | || ||  |||  || |||||||  || |||| ||||||||     
T  19483676 tctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttctttgatgcttctcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccag 19483577  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  19483576 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 19483477  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19483476 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaagtcataatc 19483409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29303237 - 29302767
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  29303237 acatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagttccttcaaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcta 29303138  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || | | | |||||    
T  29303137 caagaatcaatttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcatctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 29303038  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||| | |    |||| ||||| |||||||| |  || | ||| || |||||||  ||||| || ||||| |||||||  || |||| ||| ||||||    
T  29303037 gtcattgccagatgtcatcaaatcaacaaacttcaaatctatttgctgagcttctcggatactgtttaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaac 29302938  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
     | | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| || || || |    
T  29302937 cgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgttccaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgttt 29302838  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29302837 tcctgcttaacgcatctgcaaccacattagccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 29302767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 6604637 - 6605094
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  6604637 ttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 6604736  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | | | ||||| | |||||     
T  6604737 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 6604836  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||  ||||| |||||||| |  ||| | | ||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| | ||||    
T  6604837 tgaagtcaccaaatcaacaaacttcaaatcctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactc 6604936  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  6604937 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaactcgaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 6605036  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6605037 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 6605094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21166308 - 21165879
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || | ||  ||||| |||    
T  21166308 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgttgggaatacaa 21166209  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    ||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |    
T  21166208 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtctccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 21166109  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatc 356  Q
    |||  || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||||| |||||| |||| || || | ||||| |||    
T  21166108 ctttatgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacacactaagctcatatc 21166009  T
Q  357 tctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccggg 456  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  21166008 tctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 21165909  T
Q  457 tggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  21165908 tgataattcaaaccaaagtcataatccttc 21165879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 18857547 - 18858013
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  18857547 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 18857646  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  18857647 ctagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcag 18857745  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |  |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| || |||   || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  18857746 tccgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactctctgtgcttccttaatacttttcataaattcactatcaatcttcagcatacccag 18857845  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  18857846 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaaagtc 18857945  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  18857946 ttcctactcaaggcatctgcaacgacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 18858013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17673834 - 17673368
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  17673834 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 17673735  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  17673734 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 17673636  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  17673635 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 17673536  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | ||| |||| |  |||| |||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  17673535 tttcacactctgaggtgaccattcggaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 17673436  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  17673435 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatc 17673368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30312946 - 30312489
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  30312946 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 30312847  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  ||||||| ||||||||    
T  30312846 ttttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattact 30312747  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | |||  |  ||||| ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||  | |||  ||    
T  30312746 agcaactaacaaatctacaaacttgacatcaactttatgtgcctctttaatactcttcagaaattcactattaatcttcagcattcccagtttcactttc 30312647  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30312646 tgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactca 30312547  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  30312546 aagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 30312489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16271026 - 16270566
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  16271026 ttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 16270927  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| |   | || || | | |||     
T  16270926 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagtacaccctgatcatcaaccttaaaatcacggtcctcggtgtcactacc 16270827  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |    |||| ||||| || || || || ||| |||  || |||||||  ||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  16270826 agttgtcatcaaatcaaccaatttcacatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactc 16270727  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |  || |||||||| || || || || ||||    
T  16270726 tgaggtgacagttcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatgtgcaatgttttcctgctca 16270627  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16270626 atgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcctt 16270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22248228 - 22247774
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||    
T  22248228 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcctcgtagctcccggatgaatacacaagctacttctatgactctctt 22248129  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| | | |||||||    
T  22248128 caagaatcattttcttcatctcgtcaatgtcaggaatacaaattctgccttggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 22248029  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||||||  || ||||||||||| || || | ||  ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| || | |    
T  22248028 ctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcacttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagc 22247929  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||| | ||  || |  ||||||||||||||||| ||||| |||                |||| || ||||| || |||||||    
T  22247928 ttcacactctgaggtgacaatttgccgactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaac----------------tcatagcggacatatgcaacgtct 22247845  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22247844 tcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaacccaaaatcataatccttc 22247774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 23651011 - 23651477
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  23651011 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagatacttctatgactctctt 23651110  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | |||   ||| ||||| || ||||  |||||||||||||  || ||||| | ||| ||||| |   ||| |||    
T  23651111 caagaatcattttcttcatctcttcatcgtctaaaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacacattgatcatcgatcttaaaatcactgtctttagt 23651210  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || |||||| ||||| | ||||  ||||||||||  |  |||| ||| || |      
T  23651211 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttctttaatatttttcagaaattcactatcaagcttcagcattcctagt 23651310  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||||||||||| || |  ||||| || ||| | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  23651311 ttcacactctgaggtgaccattcacaaactaagctcaaatctctaaactgttccaacaactcgaactccctaaccatcatagcagacatatgcaaagtct 23651410  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||||    
T  23651411 tcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcataatc 23651477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 12305728 - 12306197
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12305728 acatcacaattcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctctt 12305827  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||| ||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |   | |||||    
T  12305828 caagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaatgcatactcttcatctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagt 12305927  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | | ||| |  | |||| ||||| || || || |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| | |||||  || |||||||| ||||||    
T  12305928 gtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcaacatccccaac 12306027  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |    
T  12306028 tgtatactctgaggtgacaattcacagactagactcaagtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttt 12306127  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | |  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12306128 tacagctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcctt 12306197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 362
Target Start/End: Original strand, 22988168 - 22988512
Alignment:
Q  18 atcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcc 117  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||     
T  22988168 atcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttca 22988267  T
Q  118 aaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagttt 217  Q
    | ||||| | | ||||||||||| | || ||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| | | ||||||| |    
T  22988268 agaatcattttcttcatctcatcatcgtaaggaatagaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtct 22988367  T
Q  218 gattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactg 317  Q
    ||||||||  |||||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  || |||| ||| || ||||     
T  22988368 gattactagaaatcaacaattccacaaacttaacatcaattttatgcgcttctttaatactcttcaggaattcactatcaatcttcagcattcctaactt 22988467  T
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaa 362  Q
     |||||||| | |||||| ||||| || |  ||||||||||||||    
T  22988468 tacactctgagatgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaa 22988512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 19113660 - 19114126
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  19113660 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 19113759  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| |  || ||||| |   ||| ||    
T  19113760 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtctttag 19113858  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  19113859 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 19113958  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||  ||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  19113959 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 19114058  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  19114059 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 19114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16407815 - 16407495
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || | |||||||||||||    
T  16407815 atcatgatacatcttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttattcatctcttcatcgtcaggaatgcaa 16407716  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    || |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || |    
T  16407715 atccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 16407616  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatc 356  Q
    ||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||  | ||||||||| | |||| | || ||||| | ||||| |||    
T  16407615 ctttttgtgcttctttaatactcttcagaaattcactattaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgaccattcacaaaccaagctcatatc 16407516  T
Q  357 tctaaactgctcaagtaactc 377  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  16407515 tctaaactgctcaattaactc 16407495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22128769 - 22128303
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  22128769 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaaactacttctatgactctctt 22128670  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || || || || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  22128669 caagaatca-tcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 22128571  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  ||||| ||||||||||| || |||   || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  22128570 tctgatctctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactctctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 22128471  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || ||||||    
T  22128470 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaacgtc 22128371  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22128370 ttcctactcaagacatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22128303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21921547 - 21921082
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21921547 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctctt 21921448  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | || |||||||| | |||  |||| ||||| || ||||  ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||||    |||||||    
T  21921447 caagaatcattttctttatctcatcatcgtcttgaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcgttgtcttcagt 21921348  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || || ||| ||||||| || |  |||||  |||  || |||| |||| | | |    
T  21921347 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcctctttaatactctttagaaattcgttatcaatcttcagcataactagc 21921248  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| |  | |||||  || ||||| |   |||||||||| ||||  ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21921247 ttcacactttcagatgacatttcacaaactaaagtcaaatctctgaactattcaagcaacttgaactcctttaccatcatggcagacatgtgaaaagtct 21921148  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  21921147 tcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaactcaaaatcataat 21921082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 482
Target Start/End: Original strand, 23886108 - 23886460
Alignment:
Q  130 ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||| || |  ||||| |||||  | || | | ||||||| ||||| | | |||    
T  23886108 ttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcggaattgcaacactccctaatcatcgaccttagagtcactatcttcagtctgatttccaccaa 23886207  T
Q  230 tcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgggg 329  Q
    | | |||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||  || |||| ||| || |||| ||||||||| ||    
T  23886208 taaataaatctacaaactttacatccacttcatgcgcctctttaatactattcagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgagg 23886307  T
Q  330 tgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggca 429  Q
    |||||| || || || |  |||||||||||||| || ||||| | ||| || || || | ||||||||| ||||||||||  || || ||||| || |||    
T  23886308 tgacaattcacagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcagctccaactctttgatcatcatggcggacatgtgtagagttttcctacttaaagca 23886407  T
Q  430 tctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  23886408 tctgcaacaacattagttttaccaggatgataattcaacccaaaatcataatc 23886460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 482
Target Start/End: Original strand, 15534392 - 15534819
Alignment:
Q  55 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatg 153  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| |||| || || ||  | |  ||| |||||    
T  15534392 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca-tcttctttatttctgcatcatcatgaatg 15534490  T
Q  154 caaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgt 253  Q
    ||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||  ||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| |    
T  15534491 caaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacat 15534590  T
Q  254 ccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaa 353  Q
    | ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||  |||| |||||| | |||||||| |  |||||    
T  15534591 ctactttctgtgcctctataatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcaa 15534690  T
Q  354 atctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttaccc 453  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||  || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  15534691 atctctaaattgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatgtgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacct 15534790  T
Q  454 gggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |  || ||||| ||||| ||||||||    
T  15534791 ggatcataattcaaaccaaagtcataatc 15534819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 23949889 - 23950052
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  23949889 acatcacttttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatgtgactctctt 23949988  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacac 179  Q
    | | ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  23949989 caagaatc-gtcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaatttctgcctcggaatcgcaacac 23950052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 27355527 - 27355698
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  27355527 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgtatactcaatctactcttgtgactatcttcaagaatca 27355626  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacctt 197  Q
    | |  |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||| || |||||||||||    
T  27355627 a-cccttcaactcatcgctgtcaggaatacaaactctccctctgaatctcagtacaccctgatcatcaacctt 27355698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 22040829 - 22041295
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  22040829 acatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 22040928  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||| |   | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || || ||  |  |||| ||    
T  22040929 caagaatcattttcttcatatttgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcatcgtcttccgt 22041028  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || ||||  || ||||      
T  22041029 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcaggattcccagt 22041128  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  22041129 ttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatcactgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 22041228  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22041229 tcctgctcaaggcatccgcaacaacattggctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22041295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22119976 - 22119519
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||| | || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||| | ||| | |||||    
T  22119976 ttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcaacttctatgactctattcaagaatca 22119877  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| || || || || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||| ||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||  |    
T  22119876 -tcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctc 22119778  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    || ||| ||  ||||| ||||||||||| || |||   ||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | ||||||    
T  22119777 tagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactctctgcgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacact 22119678  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
    ||| |||||| | |||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  22119677 ctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctttaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactc 22119578  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22119577 aagccatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22119519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 32601114 - 32601584
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  32601114 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttatttatatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctctt 32601213  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| |   ||||||||  | | ||| ||||| ||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||    
T  32601214 caagaatcatttccttcatctctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagt 32601313  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  ||||| ||| ||||||| || |||| ||| || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  32601314 ctgattactagcaaccaacaaatctacatacttgacatcaactttttgtgcctctttaatactttttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 32601413  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  32601414 ttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctgaattgttcaagtaactcgaactctataaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 32601513  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |  ||||| ||||| || |||||||||    
T  32601514 tcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatgattcaaaccaaagtcgtaatccttc 32601584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 21043424 - 21043885
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  21043424 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 21043523  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  ||||||| ||| |  || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||||||    
T  21043524 ttttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcactctttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattact 21043623  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
      ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || || ||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||     
T  21043624 tgcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcatcattcctagcttcacactt 21043723  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  | |||||  || || || | ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  21043724 tcagatgacatttcacacactaagctcagatctctgaactgttcaagcaactcgaactctttcaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactca 21043823  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  21043824 gagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 21043885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20017852 - 20017608
Alignment:
Q  238 tccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaact 337  Q
    ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | |    
T  20017852 tccacaaactttacatcaacttcctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccatt 20017753  T
Q  338 cgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaac 437  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20017752 cgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaac 20017653  T
Q  438 tacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
     |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  20017652 aacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 20017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 21251920 - 21252384
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgt---agctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||  |||| || ||||| | ||    
T  21251920 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtcgtagctcccggatgaatactcaggttacttctgtggctctcttcaagaa 21252019  T
Q  122 tcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgatt 221  Q
    ||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||  ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||     
T  21252020 tcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatc 21252119  T
Q  222 actaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcaca 321  Q
     ||||||| ||  || ||||||||||| || ||  |||  || || ||| ||||||| |||   |||||| |||  || |||| ||| || | ||  |||    
T  21252120 tctaacaaccaacaagtccacaaacttaacatcggctttctgtgcctctttaatacttttctgaaattcattatcaatcttcagcattcctagctttaca 21252219  T
Q  322 ctctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctac 421  Q
    || |  | |||||  || || || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  21252220 ctttcagatgacatttcacacactaagctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctac 21252319  T
Q  422 tcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21252320 tcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttc 21252384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21324794 - 21324614
Alignment:
Q  301 ttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccg 400  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| | | |    
T  21324794 ttcagcatccccaactaaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaag-cag 21324696  T
Q  401 acatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21324695 acacatgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcgtaatc 21324614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22132852 - 22132382
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || |    
T  22132852 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttcaatgactctcct 22132753  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||| ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  |||||||    
T  22132752 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcgggaatgcaaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagt 22132653  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  22132652 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 22132553  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||  |||||| | || || || |  ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  | ||||| |  || ||||| || || ||||    
T  22132552 ttcactttctaaggtgaccattcacagactaaactcaaatctctgaatggttcaagtaactcaaactctctaaccatgaaagcggacatatgcaatgtct 22132453  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||  |||  ||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22132452 tcctgctcaacgcatctataacatcattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 22132382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21393344 - 21393210
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21393344 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcatactcaaagcatctgcaacaacattagct 21393245  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||||| ||||    
T  21393244 ttacccggatgatagctcaactcaaaatcagaatc 21393210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21787838 - 21787704
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21787838 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcatactcaaagcatctgcaacaacattagct 21787739  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||||| ||||    
T  21787738 ttacccggatgatagctcaactcaaaatcagaatc 21787704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 25283120 - 25283207
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  25283120 ccaccaaaacaacttcttcaaatcctgatacatcttcgtcgctcctagatgaatacttaaactactcctgtgaccttcttccaaaatc 25283207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 25283346 - 25283433
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||  || |||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25283346 ccaccaaaacaatttcttcaaatcctgatacatcttcgtcactcctagatgaatacttaaactactcttgtgaccttcttccaaaatc 25283433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21393667 - 21393501
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  21393667 ttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 21393568  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
     |   ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  21393567 tttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21393501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21788161 - 21787995
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  21788161 ttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 21788062  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
     |   ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  21788061 tttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21787995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23156787 - 23156716
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  23156787 ttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcttatgaccttcgtccaaaatc 23156716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16876886 - 16876800
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  16876886 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 16876800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22623637 - 22623567
Alignment:
Q  54 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  22623637 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgacttttttccagaatca 22623567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21196293 - 21196206
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  21196293 ccaccaaaacaacatcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 21196206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 22316181 - 22316268
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||||||||   | |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  22316181 ccaccaaaacaatctcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 22316268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21850128 - 21850042
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  21850128 ccaccgaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 21850042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23156427 - 23156393
Alignment:
Q  412 gtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23156427 gtctttctactcaaggcatctgcaacaacattagc 23156393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16876573 - 16876476
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16876573 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagc 16876476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22623544 - 22623492
Alignment:
Q  274 atactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctg 326  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  22623544 atactgttcaagaattcactgttgatcttcaacattcccaatttcacactctg 22623492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 27459 - 27929
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27459 acatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 27558  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||  ||||||    
T  27559 ccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaacattgaagtcatcattttcagt 27658  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27659 ttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaattttctgcgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaac 27758  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  27759 tgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactgaagtctctaaattgttcaagtagctcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgaaacgtct 27858  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27859 tcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 27929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Original strand, 68304 - 68771
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  68304 gacatccctcttcaaaccagaccacaaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttactcttatgactttct 68403  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||||||  | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  68404 tctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcag 68503  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  68504 cttgattactagtaaccattaaatccacaaacttagcatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaa 68603  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  68604 ctgtacactctgaggtgacaattcacaaacgagactcaagtctctaaactgttcaagaaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtc 68703  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  68704 ttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 68771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 3854
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  4321 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccgaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 4222  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| || ||||| |  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || | | | |||||       
T  4221 aaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgcc 4122  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  4121 attaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgt 4022  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||| |    
T  4021 acactctaaggtgtcaattcacaaacaagactcaagtctctaaaatgctctagcaactcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttgc 3922  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3921 tactcaaggcatctgcaaccacattagctttacccgggtggtaattcaagccaaaatcataatccttc 3854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13272 - 12809
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13272 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 13173  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | |||||    
T  13172 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagt 13073  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       |||||   ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  13072 gccattacccgcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttgtgcttctcgtatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 12973  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || | |||||| ||||||||||| || |||||        |||||||| | || || || ||||||| |||||||||||  |  ||||| || || ||||    
T  12972 tgtatactctgaggtgacaactcacagacaag-------actctaaacagttctagcaattcaaattgcttcaccatcaaaggagacatatgcaatgtct 12880  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12879 tcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccatgatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 12809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2701 - 2231
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2701 acatcacgcttcaaaccggaccacgaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 2602  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  2601 ccaaaatcaactttttcaacccatcattgtcagggatacaaattctgcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 2502  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | |||  || | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2501 gccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcaagaattcactgttaattttcaacatacccaac 2402  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| |||| ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| || || | ||    
T  2401 tgcacactctgaggtgtcaattcacaaaccagactcaagtctctgaactgctcaagcaactcaaattctttcaccatcaacgccgacatatgcaatgcct 2302  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2301 tcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatgatagttcaaactaaaatcataatccttc 2231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 89816 - 89346
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  89816 acatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttctt 89717  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  89716 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 89617  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  89616 ttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaac 89517  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  89516 tgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcgtttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 89417  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  89416 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 89346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 90494 - 90024
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  90494 acatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttctt 90395  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  90394 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 90295  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  90294 ttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaac 90195  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  90194 tgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 90095  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  90094 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 90024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 390571 - 390489
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagct 98  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  390571 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagct 390489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Original strand, 27901289 - 27901756
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27901289 gacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccggatgaatactcaagttactcttatgactttct 27901388  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||||||  | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  27901389 tctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcag 27901488  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
     ||||||||||  || ||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  27901489 cttgattactagtaaccattaaatccacaaactttgcatcaacttgttgtgcttctcttatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaa 27901588  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  27901589 ctttacactttgaggtgacaattcacaaacgagactcaagtctctaaactgttcaagtaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtc 27901688  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27901689 ttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 27901756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15002732 - 15002262
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15002732 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttctt 15002633  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   | |||||||    
T  15002632 ctagaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagt 15002533  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  15002532 ttcattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcatcttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 15002433  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15002432 tgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactaaagtctctaaactgctatagcaactcaaactcttttaccatcatagccgacatgtgcaacgtct 15002333  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15002332 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 15002262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 485
Target Start/End: Original strand, 15246846 - 15247297
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  15246846 gaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttca 15246945  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
     ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| | ||| |||    
T  15246946 actcgtcattatcaggaatacaaattcttcccctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccagcaaccat 15247045  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||  ||| |    
T  15247046 caaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaagtgtc 15247145  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||  ||||||    
T  15247146 aactcatagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaaacatctg 15247245  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15247246 caaccacattagctttacccgaatggtaattcaaaccaaagtcataatcctt 15247297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15414394 - 15413931
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  15414394 acatcacgtttaaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaaactacttctgtgactttctt 15414295  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| || | |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |   |||||||    
T  15414294 ccaaaatcaactttttcaactcatcattatgaggaatacaaattcttcctcagaatctcaacacaccctgatcatgaaccttgaaatcactttcttcagt 15414195  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  || || |  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15414194 ttgattactaacaaccaacaaatccacaaacttaatatcaaccttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactattgatcttcaacatacccaac 15414095  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||    
T  15414094 ttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctaaaatgctccagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtct 15413995  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15413994 tcctgcttaaagcatctgcaacaacattggctttacccggatgataattcaaaccaaaatcata 15413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15358488 - 15358022
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  15358488 acatcacgtttcaaaccagaccaccaaaatagtttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttact 15358389  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||    
T  15358388 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 15358289  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| || |||    
T  15358288 gccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaagtcactattaatcttcagcatccctaac 15358189  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || ||||| || |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||  | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15358188 tgtacactatgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaagctgctatattaaatcaaattcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 15358089  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358088 tcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 15358022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1648646 - 1648182
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1648646 gacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcc 1648547  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || | ||| || ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  1648546 tctagaattaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcttctgaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcaccattctcag 1648447  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||    
T  1648446 tttcattaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatccacctgttgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatcccaaa 1648347  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     |  | ||| || ||||||||||| ||||| |  || || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  1648346 tttaatactttgaggtgacaactcacaaactaaacttaagtctctaagctgttcaagcaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtc 1648247  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    || |||||||| ||||| || || |||||||| |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1648246 ttcctactcaacgcatccgccacaacattagccttattagggtggtaattcaaaccaaagtcata 1648182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 8706822 - 8707294
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || || || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8706822 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaatttctttaagtcatgatacatctttgtagctctcggatgaatacttaagttacttttgtgactttctt 8706921  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  8706922 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 8707021  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgtt--gcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacataccca 313  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  |  |||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  8707022 ttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgcgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcagcataccca 8707121  T
Q  314 actgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgt 413  Q
    ||| |||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||| || |||||    
T  8707122 acttcacactatgaggcgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcagacatatgcaacgt 8707221  T
Q  414 ctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8707222 cttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 8707294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 395
Target Start/End: Original strand, 15078539 - 15078918
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  15078539 acatcacgtttcaatccgaaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctatgactttctt 15078638  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |  |||||||    
T  15078639 ccagaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaaattcttcctctgaaccttaacacaccctgctcatcgaccttgaaatcttcctcttcagt 15078738  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || | ||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15078739 ttgattactagcatccattaaatccacaaacttgacatcaattttctgtgcttccctgatactattcaagaattcactattgatcttcaacatacccaac 15078838  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcat 395  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15078839 tgcacactttgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcat 15078918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 33223827 - 33224293
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33223827 acatctcgtttcaaactggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctctt 33223926  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| |||  | | |||||    
T  33223927 ctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaaccacagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagt 33224026  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||||  | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||    
T  33224027 gtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctgagcttctcgggtactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaac 33224126  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||    
T  33224127 tgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtccctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtct 33224226  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33224227 tcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 33224293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 15320054 - 15320510
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  15320054 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcgtgatacatctttgtaggtcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 15320153  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
      ||||||||  |||||| |||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||    
T  15320154 ttaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgtaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaggtcaccatcttcagt 15320253  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||    ||  ||||||||||||||| |||| || | ||  || |||||  | ||              |||||||||| |||||||||||||||    
T  15320254 ttaattacgggtaactattaaatccacaaacctgacatcaattttctgagcttccttgat--------------cactattgatcttcaacatacccaac 15320339  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  15320340 tacacactctgaggtgacaactcataaactagactcaagtctctaaactgctcaagcaactcaaaatcctttaccatcaaagcagacatgtgcaacgtct 15320439  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  15320440 tcctgctcaaagcatctgcaatcacattagctttacctgggtgataattcataccaaaatcataatccttc 15320510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 3264153 - 3263692
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  3264153 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 3264054  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  3264053 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 3263954  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  3263953 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 3263854  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| || || || |||||||    
T  3263853 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactca 3263754  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3263753 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 3263692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 16148618 - 16149085
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16148618 tcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctcca 16148717  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     | ||||  |||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || || || || | | | |||||       
T  16148718 gagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgcc 16148817  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || | |||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  16148818 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgagtttctcgtatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgt 16148917  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| |    
T  16148918 atactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcgaattcttttaccatcaaggcggacatatgcaatgtcttcc 16149017  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16149018 tgctcaacgtatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 16149085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 16152764 - 16153231
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16152764 tcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctcca 16152863  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     | ||||  |||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || || || || | | | |||||       
T  16152864 gagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgcc 16152963  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || | |||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  16152964 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgagtttctcgtatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgt 16153063  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| |    
T  16153064 atactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcgaattcttttaccatcaaggcggacatatgcaatgtcttcc 16153163  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16153164 tgctcaacgtatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 16153231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29452896 - 29452435
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  29452896 ttcaaaccagaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 29452797  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||   | | ||||| | |||||     
T  29452796 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcattatcctcagtgtcattacc 29452697  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  29452696 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 29452597  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  29452596 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 29452497  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29452496 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 29452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14850474 - 14850011
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||    
T  14850474 acatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctctt 14850375  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||| |    
T  14850374 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgaccttaaagtctctatcttcaat 14850275  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| | ||      
T  14850274 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagt 14850175  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||  || ||||| || |||||||    
T  14850174 tttacactctgaggtgacaactcgcagactaacctcagatctctaaactgctcaagcaactcaaactcttttaccatcacagcggacatatgcaacgtct 14850075  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| || || || || || |||||||||||    
T  14850074 tcctacttaaagcatctgcaacaacagtagctttacctggatgataattaaacccaaaatcata 14850011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11206590 - 11206129
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||    
T  11206590 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatca 11206491  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | || || | |||||     
T  11206490 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaacccttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacc 11206391  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| | ||||    
T  11206390 tgaagtcatcaaatcaacaaactttaaatccactttctgagcttctcagatactgttcaagaaatcactatcaatcttcaacatccccaactgtatactc 11206291  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || |||||||| ||||||||||  || |||||||| || || || || ||||    
T  11206290 tgagatgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctca 11206191  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11206190 aagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 11206129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Original strand, 14695053 - 14695483
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||||| | ||||||||    
T  14695053 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgagtactcaagctacttatatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaa 14695152  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| | | ||||||||| |||||||  || ||  || ||||||||||| ||    
T  14695153 tacaaattctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtttaattactagaaaccaacaagtccacaaacttaac 14695252  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || | ||  | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||    
T  14695253 atctattttctacgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactc 14695352  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    ||||||||||| |  | ||| |||||||| || || | |||||| || ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14695353 aaatctctaaattttttaagcaactcaaactcttttaacatcatagcggacatatgcaacttcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttac 14695452  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || || ||||| ||||||||||||||    
T  14695453 ctggatgataattcaacccaaaatcataatc 14695483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15146957 - 15146527
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || |  |||||||    
T  15146957 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaa 15146858  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | || ||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||  ||||||| ||||||||| | | || ||| || |||||||||||    
T  15146857 tacatattcgacctcggaatctcaacacaccatgtttatcgaccttaaattcaccttcttcagtctgattactagctaccaataagtctacaaacttgac 15146758  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||||||| || |  | ||||||||| | |||| |||| ||||| | ||||    
T  15146757 atcaactttctgtgcttccttcatacttttcagaaattcactatcaatcttcaacattcctagtttcacactctgagatgaccactcacaaactaagctc 15146658  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15146657 aaatctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcgaggcatctacaacaacattagctttac 15146558  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15146557 ctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 15146527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19777901 - 19777431
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  19777901 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 19777802  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  19777801 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 19777703  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  19777702 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 19777603  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  19777602 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 19777503  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19777502 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 19777431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8052731 - 8052265
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||    
T  8052731 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctctt 8052632  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||  ||||||    
T  8052631 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcag 8052533  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  8052532 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 8052433  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  8052432 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 8052333  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8052332 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 8052265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 8387316 - 8387786
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  8387316 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 8387415  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  8387416 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 8387514  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||   |||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  8387515 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctctcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 8387614  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  8387615 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 8387714  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8387715 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 8387786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 12477504 - 12477974
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  12477504 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 12477603  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  12477604 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 12477702  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  12477703 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 12477802  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  12477803 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 12477902  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12477903 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 12477974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29038512 - 29038042
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  29038512 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 29038413  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  29038412 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 29038314  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  29038313 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 29038214  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  29038213 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 29038114  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  29038113 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 29038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44661225 - 44660768
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  44661225 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 44661126  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | || || | |||||     
T  44661125 acttcttcaactcttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtatcattacc 44661026  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  44661025 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcgctatcaattttcaacattcccaactgtatactc 44660926  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || ||||||||||| ||||| |  || ||||| || || || ||  | ||||    
T  44660925 tgagatgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaattcctttaccattaaagcagacatatgcaaagttttcttgctca 44660826  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44660825 aagcatcagcaacaacgttggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 44660768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 23956651 - 23957120
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  23956651 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 23956750  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || |||||  | || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  23956751 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtcctggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 23956849  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  23956850 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 23956949  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  23956950 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 23957049  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23957050 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcgtaatcctt 23957120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 40473944 - 40474410
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  40473944 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 40474043  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  40474044 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 40474142  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || ||  |||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |     
T  40474143 tctgattactagcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttatgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaattttcagcatacctag 40474242  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||    
T  40474243 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 40474342  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  40474343 ttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 40474410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14303086 - 14302620
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  14303086 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 14302987  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || | ||| |  ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  14302986 caagaatca-tcttcttaaactctttattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactgtcttcag 14302888  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || ||| |  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| |||||||||    
T  14302887 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgctcccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccaa 14302788  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || ||  ||    
T  14302787 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagaaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatatc 14302688  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||    
T  14302687 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgaatgataattcaaaccaaagtcataatc 14302620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16354517 - 16354087
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | | | |||||||| ||   || |||||    
T  16354517 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcaccgttaggaa 16354418  T
Q  152 tgcaaattctg-cctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttga 250  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| | || ||||| ||||| || || ||| |||| || |||||| || | | ||  || || ||||||||||    
T  16354417 ttcaaat-ctgacctcggaatcttaacacatcatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcggtctgattattagctaccaacaagtctacaaacttga 16354319  T
Q  251 cgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggct 350  Q
    | || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||    
T  16354318 catcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagct 16354219  T
Q  351 caaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttta 450  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16354218 catatctctaaactgcttaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagcttta 16354119  T
Q  451 cccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16354118 cctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 16354087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18226554 - 18226088
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  18226554 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 18226455  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||| ||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  |||||||    
T  18226454 caagaatcattttcttcatatctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgctcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagt 18226355  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || | ||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| |||||     
T  18226354 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaaatttatgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccaat 18226255  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |   | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  18226254 ttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaaccgttcaagtaactcaaactttctaaccatcaaagctgacatatgcaatgtct 18226155  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||    
T  18226154 tcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccatagtcataatc 18226088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 14160374 - 14160844
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || || ||||    
T  14160374 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactccgatggctctctt 14160473  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||| || || || | | |||| |    
T  14160474 caagaatc-atcttcttcatctcatcattgtctggaatacaaattctaccgcggaatctcaacactccttggtcatcaactttaaagtcactatcttctg 14160572  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||||  | ||| ||  || |||||||| || || ||  |||  || |||||  ||||||| || |  |||||| |||  || |||| ||| || ||    
T  14160573 actgattatcagcaaccaacaagtccacaaatttaacatcatctttctgtgcttccttaatactctttagaaattcattatcaatcttcagcattcctaa 14160672  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  |||||||| |  ||||| ||||| || |  |||||||||||||| |  || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||    
T  14160673 ctttacactctgagacgacaattcgcagaccaaactcaaatctctaaattattctagcaattcaaactccttaaccatcatagcggacatatgcaaggtc 14160772  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14160773 tttctacttaaggcatcagctacgacattcgctttacccggatgataattcaagccaaaatcaaaatccttc 14160844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 14681471 - 14681941
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  14681471 acatctcgtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctctt 14681570  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  14681571 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 14681669  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  |||  ||  |  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  14681670 tctgatctctagaaactaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccag 14681769  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||   | ||||| || || |||    
T  14681770 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaaacggacatatgcaatgtc 14681869  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14681870 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 14681941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 27712240 - 27712709
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27712240 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 27712339  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  27712340 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 27712438  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  || |||||| | || || ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  27712439 cctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttctttgatgcttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 27712538  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||| | | || ||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  27712539 tttcacgctctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 27712638  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27712639 ttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcgtaatcctt 27712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 20891895 - 20892356
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  20891895 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatca 20891994  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||  | ||| || ||||||||||| ||||| | | | ||||  | | |||     
T  20891995 acttcttcaaatcatcgttgtcagaaatacaaactctttctctgaacctcaggaaaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagcgtcactacc 20892094  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| ||||| || |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| | ||||   || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  20892095 agtagtcatcaaatcaacaaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactaacaatcttcagcatccccaactgtatactc 20892194  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||    
T  20892195 tgaggtgacaattcacagaccagactcaagtctctaaactgttccaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctca 20892294  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20892295 atgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttc 20892356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 12524580 - 12525050
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  12524580 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcttccggatggatactcaagctacttctgtgactctctt 12524679  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||  || |||||  | | ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |  || ||||| |   ||| ||    
T  12524680 caagaatca-tctccttaatctctccatcgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttcatcatcgattttaaaatcactgtctttag 12524778  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  12524779 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 12524878  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  |||| || || |||    
T  12524879 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcgaacatatgcaatgtc 12524978  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12524979 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 12525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 18298109 - 18298579
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  18298109 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 18298208  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| || |||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||| |    
T  18298209 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctaaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccg 18298307  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  18298308 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 18298407  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  18298408 tttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 18298507  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18298508 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 18298579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 355 - 486
Target Start/End: Original strand, 15071602 - 15071733
Alignment:
Q  355 tctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071602 tctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccg 15071701  T
Q  455 ggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  15071702 gatggtaatttaaactaaaatcatagtccttc 15071733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1639533 - 1639360
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  1639533 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 1639434  T
Q  116 ccaaaatcaatct-tttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttca 189  Q
    | | |||| ||||  || ||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  1639433 caagaatc-atctccttaatctcttcattgtctgaaatacaaattctacctcgaaacctcaacacaccttgttca 1639360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 51605945 - 51605694
Alignment:
Q  231 cattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggt 330  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || || || || | ||| |||||||| |  || || ||     
T  51605945 cattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggc 51605846  T
Q  331 gacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcat 430  Q
    |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| ||||    
T  51605845 gacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaacgcat 51605746  T
Q  431 ctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51605745 ccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 51605694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18614804 - 18614462
Alignment:
Q  144 gtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccaca 243  Q
    |||| |||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || ||||| |   ||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||    
T  18614804 gtcaagaatgcaaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaaatcacagtcttcagtctgattactagcaaccaataaatctaca 18614705  T
Q  244 aacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaa 343  Q
    |||||||| || | ||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||  |||| |||||| | || ||||    
T  18614704 aacttgacatcaaatttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcacaaa 18614605  T
Q  344 caaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacatt 443  Q
      |  ||||||||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||| |||||    
T  18614604 ttaaactcaaatctctgaattgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcatgctcaaggcatcagcaacaacatt 18614505  T
Q  444 agctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18614504 agctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 18614462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 7091336 - 7091511
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| | | || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  | || || ||||    
T  7091336 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacctctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggataaatacttaagttacttctatggctctctt 7091435  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| |||||  | ||||  |||||||||||||| || |||||    
T  7091436 caataatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcatacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 7091511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15292508 - 15292420
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  15292508 gaccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 15292420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 92
Target Start/End: Original strand, 16029035 - 16029091
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatact 92  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16029035 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatact 16029091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 446
Target Start/End: Original strand, 9292024 - 9292169
Alignment:
Q  301 ttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccg 400  Q
    |||||||||||||||  |||||  |  |||| |||||| | |||||  ||||| |||| |||||||||||  || || || || || |||||||  || |    
T  9292024 ttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaacaaaactcaagtctcgaaactgctcaaccaattccaactctttaaccatcaaagcag 9292123  T
Q  401 acatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9292124 acatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 9292169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 5365 - 5835
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||    
T  5365 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagtttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgtatttctt 5464  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  5465 ccaaaatcgactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 5564  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||||  || ||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  5565 ttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaactttttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 5664  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  5665 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 5764  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5765 tccttctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 48387 - 47935
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||    
T  48387 gaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctactcctatggctttcttccaaaatcaactttttca 48288  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
     |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  48287 actcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttgattactagcaaccat 48188  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  48187 taaatcaacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgataatgttcaagaaatcactattgattttcaacatacccaactatacactctgaggtgac 48088  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  48087 aactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctaacaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctg 47988  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47987 cgaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 47935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 57219 - 56749
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  57219 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttttttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcc 57120  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  ||||||     || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||| || | | |||||     
T  57119 tctaaaattaactttttcaaactgtcatcatcaggaatgcaaattcttcccctgaacctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaa 57020  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| ||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  57019 tgccattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacatccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcagcattcccaa 56920  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||  |||||  |||||||| || |||||||| | ||||    
T  56919 ctgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaactctctaaactgttctagcaaatcatgttcctataccatcatagcagacatgtgcagcgtc 56820  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56819 ttcttgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 56749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 28992 - 29462
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  28992 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttctt 29091  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29092 ccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 29191  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  29192 ttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatattattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaac 29291  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  29292 tgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagaatcaactctctaaactgctctagcaactcaaacttctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 29391  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29392 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 29462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 482
Target Start/End: Original strand, 29925 - 30346
Alignment:
Q  61 tggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||||| | ||  ||||| ||||| |    
T  29925 tggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcc 30024  T
Q  161 tgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttg 260  Q
    | ||||  |||||||||||||  || ||||| | ||| ||||| |   ||||||| |||| ||||  || ||  ||||  |||||||| || || ||||     
T  30025 tacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagaaaccaacaaatgtacaaacttaacatcaacttt 30124  T
Q  261 ttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctcta 360  Q
    ||| || ||| | ||||| || |  |||||  |||  || |||| ||| || | || |||||| |  | |||||  || ||||| |  |||||||||||     
T  30125 ttgtgcctcttttatactctttagaaattcgttatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctg 30224  T
Q  361 aactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggt 460  Q
    ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || || |    
T  30225 aactgttcaaccaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaaaaacattagctttacctggatgat 30324  T
Q  461 agttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||  |||||||||||||    
T  30325 agctcaactcaaaatcataatc 30346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 486
Target Start/End: Original strand, 50168 - 50215
Alignment:
Q  439 acattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50168 acattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 50215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11429 - 10962
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  11429 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcc 11330  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| || || | | ||||||    
T  11329 tccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcag 11230  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||    
T  11229 tttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacttgctgcgcttctcgaatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaa 11130  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||    
T  11129 ctgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcgtagcagacatgtgcaacgtc 11030  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  11029 ttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatc 10962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15199 - 14732
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  15199 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcc 15100  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| || || | | ||||||    
T  15099 tccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcag 15000  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||    
T  14999 tttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacttgctgcgcttctcgaatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaa 14900  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||    
T  14899 ctgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcttagcagacatgtgcaacgtc 14800  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  14799 ttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatc 14732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 414
Target Start/End: Original strand, 20918 - 21316
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20918 acatcacgtttcaacccagacaaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 21017  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| |||| | ||| || |||| ||||||||| || | | ||||| |    
T  21018 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaatccttcctgtgaacttcaatataccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcaat 21117  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| | || || |||| ||| ||||||    
T  21118 ttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaac 21217  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  21218 tgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaattctctaaatggctctagcaaatcaaattctttcaccatcatagcagacatatgcaacgtc 21316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 129 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23099813 - 23099456
Alignment:
Q  129 tttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaaca 228  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||  |    
T  23099813 tttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagta 23099714  T
Q  229 atcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggg 328  Q
    | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23099713 accaataaatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgag 23099614  T
Q  329 gtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggc 428  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  23099613 gtgacaattcacaaaccagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctactcaaagc 23099514  T
Q  429 atctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23099513 atctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 23099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 486
Target Start/End: Original strand, 23277318 - 23277781
Alignment:
Q  23 gcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23277318 gcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaat 23277417  T
Q  123 caatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgatta 222  Q
     ||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  23277418 taactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttcatta 23277517  T
Q  223 ctaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacac 322  Q
    | ||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||||| ||||    
T  23277518 ccaacaaccatcaaatcaacgaacttcacatctacttgctgcgcttctcggatactattcaagaagtcactgttaatcttcagaatccccaactgaacac 23277617  T
Q  323 tctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctact 422  Q
    |||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || |  |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  23277618 tctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctatagcagatcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctact 23277717  T
Q  423 caaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23277718 caacgcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 23277781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27364987 - 27364713
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27364987 acatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 27364888  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | ||||     
T  27364887 ccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagc 27364788  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattc 290  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27364787 ttgattactattaactattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctttgatactattcaagaattc 27364713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27210072 - 27209614
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||    
T  27210072 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaatatc 27209973  T
Q  124 aatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
    ||  | ||||  || |  ||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |   ||||  |||||||    
T  27209972 aacttcttcaattctttattgtcaggaatacagattttgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaatcttgaaatcactattctcagcctgattac 27209873  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27209872 tagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacact 27209773  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     || | ||| || || || || || ||||| ||||||||||  || || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  27209772 ttgagatgataattcacatacgagactcaagtctctaaactattcgagcaattcgaattcctttaccatcaaggcggacatgtgcaatgtctttctactc 27209673  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27209672 aacgcatctgcgactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 27209614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 23111270 - 23111741
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa-gctactcttgtgactttct 114  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||     
T  23111270 acatcacacttaaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaaagctacttatgtgactttcc 23111369  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || ||| ||  ||    
T  23111370 tctaaaatcaactttttcaactcatcactgtcaagaatgaaaattctgcctcagaatctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcaccatctctag 23111469  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| || || | ||  || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23111470 tttgattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacatcaaatttctgtgcttctttaatactgttcaagaattcactgttgatcttcaacatacccaa 23111569  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||| ||| || || |||||||| || ||||| || ||||||    
T  23111570 cttcacaatctgaggtgacaactcacaaacaagactcagatctctaaactcttcaagcaactaaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtc 23111669  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || || || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  23111670 ttcctactcaaagcatctgcaacaacattggctttacttggatgataattcaaactaaaatcatagtccttc 23111741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 23294473 - 23294940
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  23294473 tcacacttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgttgctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcctcta 23294572  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     ||| ||  ||||||  | ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||| ||     
T  23294573 gaattaactttttcaaattatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagcttc 23294672  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||      
T  23294673 attaccagcaaccattaaatccacaaacttcacatccacttactgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactta 23294772  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||  |  || |||||||| || ||||| |  || ||||| || |||||||| |    
T  23294773 atactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctataacaaatcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaacgtcttcc 23294872  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| |||||||| || | ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23294873 tgctcaacgcatctgccaccaaattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 23294940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19651960 - 19651495
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19651960 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaatcagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttctt 19651861  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaat--cgccaccttca 213  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| |  | | | | |||    
T  19651860 ctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaatacaccccgatcatccaccttgaagtcacactatcctca 19651761  T
Q  214 gtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacataccca 313  Q
     |   ||||| | |||  || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  19651760 atgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatcccca 19651661  T
Q  314 actgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgt 413  Q
    | || |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||    || ||||| || | |||    
T  19651660 attgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctgaactgctatagcaaatcgaattctttcaccattgaagcagacatatgcagcgt 19651561  T
Q  414 ctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
     || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19651560 tttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttcctaggatggtaattcaaaccaaaatcata 19651495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 1064295 - 1064756
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  1064295 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatca 1064394  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  1064395 acttcttcaactcttcattgttaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 1064494  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  ||| |||  || ||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  1064495 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 1064594  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  1064595 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 1064694  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1064695 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 1064756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 24949127 - 24949595
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  24949127 tcacgcttcaaactggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 24949226  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacac-accgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagttt 217  Q
    |||||||  ||||||   |||| |  | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||| || | | | | |||      
T  24949227 aaatcaactttttcaaaccatcatcatgaggaatgcaaattcttcctctgaatctcatcacaaccatgatcatcaaccttgaagtcacgatccttagtgc 24949326  T
Q  218 gattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactg 317  Q
     ||||| | ||| | ||||||  ||| |||| || |||||||  || |||||||  |||||||  ||||| |||||  | || |||| ||| ||||||||    
T  24949327 cattaccagcaacccttaaattaacatacttcacatccactttctgtgcttctcggatactatctaagaaatcactgataatcttcagcatccccaactg 24949426  T
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
     ||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| ||     
T  24949427 aacactctgaagtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctaacaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttc 24949526  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24949527 ctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccagaatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 24949595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 31831202 - 31831663
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  31831202 ttcataccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 31831301  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | || | ||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  31831302 acttctttaactcctcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 31831401  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || ||| |||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  31831402 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagctcctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 31831501  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| || || |||||||    
T  31831502 tggggtgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgtaaagttttcctactca 31831601  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31831602 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 31831663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 27788276 - 27788741
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  27788276 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 27788375  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||| |    
T  27788376 ctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaat 27788475  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| |  || ||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || || || || | ||| ||||||    
T  27788476 actattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaac 27788575  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |  || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  27788576 tgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatg-agtgtct 27788674  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27788675 tcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 27788741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 482
Target Start/End: Original strand, 20828806 - 20829260
Alignment:
Q  28 aaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatc 127  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||      
T  20828806 aaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaact 20828905  T
Q  128 ttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaac 227  Q
    | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| |  |||| |      
T  20828906 tcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccaga 20829005  T
Q  228 aatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgg 327  Q
    | |||| | ||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  20829006 agtcatcagatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctgg 20829105  T
Q  328 ggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaagg 427  Q
    |||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  20829106 ggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaag 20829205  T
Q  428 catctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20829206 catcagcaaccacattggcctcaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 20829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 481
Target Start/End: Original strand, 24676024 - 24676489
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||    
T  24676024 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaggctacttctatgactctctt 24676123  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  24676124 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 24676223  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  24676224 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactttttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 24676323  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  24676324 ttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcatatctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 24676423  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  24676424 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 24676489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 12574888 - 12575354
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  12574888 acatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctctttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcct 12574987  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | |  || ||  ||||||| || || || ||||| || |||| ||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || | | ||||| |    
T  12574988 ctaggattaactttttcatttcttcattatcagggatacaaactctacctctgaatctaagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaat 12575087  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       | ||| | ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||| ||| ||||| || || || | ||| ||||||    
T  12575088 accactaccagcaaccattagatcaactaacttgacatccacttgttgtgcttctcggattctattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaac 12575187  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || || || || || |||||||| || || |  ||||  ||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| || |  ||||    
T  12575188 tgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcatgtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgcagtgtct 12575287  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12575288 tcctactcaatgcatccgcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 12575354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21325174 - 21324711
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21325174 acatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 21325075  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  21325074 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 21324975  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||||||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  21324974 ctgattactagcaatcaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 21324875  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  21324874 ttcacactctgaggtgaccactcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaaagtct 21324775  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  21324774 tcctactcaaggcgtctacaacaacattagccttacctggatgataattcaaaccaaagtcata 21324711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21144949 - 21144483
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21144949 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 21144850  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  21144849 caagaatca-tcttcttaatctcctcattgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 21144751  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| || ||| ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||| ||||  || |||| ||||||||     
T  21144750 tctgatctctagcaaccaataagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcgctatcaatcttcagcatacccag 21144651  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  21144650 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 21144551  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21144550 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 21144483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 27371804 - 27372270
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  27371804 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 27371903  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  27371904 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 27372002  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  27372003 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 27372102  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  27372103 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 27372202  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  27372203 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 27372270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16923424 - 16923894
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16923424 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16923523  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16923524 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16923622  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16923623 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16923722  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16923723 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16923822  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16923823 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16923894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16925895 - 16926365
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16925895 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16925994  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16925995 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16926093  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16926094 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16926193  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | |||||| || |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16926194 tttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16926293  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16926294 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16926365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16982687 - 16983157
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16982687 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16982786  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16982787 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16982885  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16982886 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16982985  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16982986 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16983085  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16983086 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16983157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 16999535 - 17000005
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16999535 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16999634  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  16999635 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 16999733  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  16999734 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 16999833  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | |||||| || |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  16999834 tttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 16999933  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16999934 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 17000005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 17064252 - 17064722
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  17064252 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 17064351  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  17064352 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 17064450  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  17064451 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 17064550  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  17064551 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 17064650  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17064651 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 17064722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41608293 - 41607827
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  41608293 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 41608194  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  41608193 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 41608095  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  41608094 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 41607995  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  41607994 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 41607895  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  41607894 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 41607827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 24710569 - 24711035
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  24710569 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 24710668  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  24710669 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 24710767  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  24710768 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 24710867  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  24710868 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 24710967  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  24710968 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 24711035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 10869385 - 10869855
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  10869385 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctctt 10869484  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || | ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  10869485 caagaatca-tcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 10869583  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  10869584 tctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 10869683  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  10869684 tttcactctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 10869783  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  10869784 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcagaccaaagtcataatccttc 10869855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24876657 - 24876191
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24876657 acatctcgtttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctctt 24876558  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | |||| |    
T  24876557 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcgg 24876459  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |  |||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  24876458 tccgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 24876359  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||  | |||||||| |  |||| |||||| ||||| |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  24876358 tttcacactctgaggtgatcattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 24876259  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  24876258 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaaaccaaagtcataatc 24876191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 486
Target Start/End: Original strand, 27218563 - 27219021
Alignment:
Q  28 aaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatc 127  Q
    ||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||    
T  27218563 aaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca-tc 27218661  T
Q  128 tt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaa 226  Q
    || || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||| || ||||  |||     
T  27218662 ttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctag 27218761  T
Q  227 caatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctg 326  Q
    ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||  | ||| |||||    
T  27218762 caaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcaacatacccagtttcacgctctg 27218861  T
Q  327 gggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaag 426  Q
     |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||  ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  27218862 aggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactattcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaag 27218961  T
Q  427 gcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27218962 gcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 27219021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44385477 - 44385011
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  44385477 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 44385378  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| |||  |||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  44385377 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatttcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 44385279  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || || | ||||||||     
T  44385278 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatctttagcatacccag 44385179  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  44385178 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 44385079  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  44385078 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 44385011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21890626 - 21890265
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21890626 acatcgcgcttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 21890527  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || ||||||||    
T  21890526 caagaatcattttcttcatctcatcgtcgtctagaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcacctccttcagt 21890427  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || |||| |||||| || || |||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || |||    
T  21890426 ctgattactagcaaccaacaagtccataaacttaacatcaactttttgcgcctctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctaac 21890327  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactc 377  Q
    | |||||| |  | |||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21890326 ttcacactttcagatgacatttcacaaactagactcaaatctctgaactgttcaagcaactc 21890265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Original strand, 20833532 - 20833707
Alignment:
Q  28 aaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatc 127  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||      
T  20833532 aaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaact 20833631  T
Q  128 ttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatc 203  Q
    | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||    
T  20833632 tcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatc 20833707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 24262905 - 24263371
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||    
T  24262905 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaccctctt 24263004  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  24263005 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 24263103  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||||||||    
T  24263104 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccaa 24263203  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  |   |||||| || ||||| || || |||    
T  24263204 tttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctggtcatcatagcggacatatgcaatgtc 24263303  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  24263304 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataatc 24263371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24707390 - 24706955
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  24707390 acatcgcgtttcaatccggaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 24707291  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | || || | | ||||||   || |  |||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| |||||||    
T  24707290 caagaaccattttcttcatcaattcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 24707191  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||||||||||  |  ||||  | ||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  24707190 ctgattactaacaactaacaaataaaaaaacttgacatcaactttatgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 24707091  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  24707090 ttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcatatctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaatgcggacatatgcaatgtct 24706991  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  24706990 tcctgctcaaggcatctgcaaaaacattagccttac 24706955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22324764 - 22324298
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  22324764 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctctt 22324665  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || || || || |  |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  22324664 caagaatca-tcttcttaatctcttcattatctgggacacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 22324566  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
      ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  ||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||||| |     
T  22324565 cctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgcgcttccttgatactgttcagaaattcactatcaatcttcagcatacctag 22324466  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  22324465 tttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 22324366  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  22324365 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatc 22324298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 23066935 - 23067391
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  23066935 ttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 23067034  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||| || ||||| |  || ||||| ||  ||||||| |||| |||    
T  23067035 ttttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaaccgcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatcact 23067134  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  || ||  || || |||||||| || || ||||   | |||||| ||||||| || |  |||||  |||  || |||| ||| || | || |||||||    
T  23067135 agaaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttccgtgcttctttaatactctttagaaattcgttatcaatcttcagcattcctagcttcacactc 23067234  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |    |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  23067235 tcaaatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtctttctactca 23067334  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  23067335 aagcgtctgcaacaacattagctttacccggatgatag-tcaactcaaaatcataatc 23067391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23107597 - 23107172
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | || || |||||   ||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23107597 atcatgatacatcttcgtagctcccggattaatactcaagttacttctatggctctcttcaggaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaa 23107498  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    || |  ||||  ||||||| |||||| || |||||||  || |||||     ||||||| |||| |||| ||| ||  || ||||||||| | || ||      
T  23107497 atccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcaattttaaaatcattgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtccacaaacattacatcag 23107398  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatc 356  Q
    |||  || || ||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || |||||| | || |||||  || || || | |||||||||    
T  23107397 ctttatgtgcctctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcggatgacatttcacacactaagctcaaatc 23107298  T
Q  357 tctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccggg 456  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  23107297 tctgaactgttcaagtaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgtaacaacattagctttacgcgga 23107198  T
Q  457 tggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||| ||||  |||||||||||||    
T  23107197 tgatagctcaactcaaaatcataatc 23107172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30210824 - 30210357
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30210824 acatctcgcttcaacccggaccaccaaa-caacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttttgtgactttctt 30210726  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctg-aacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||||   ||||||| ||    |  |||||||| ||||||||  | ||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||| | | ||||||    
T  30210725 ctagaatcatctttttcatttctgtatcatcaggaatacaaattctatc-ctgaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcag 30210627  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | |||||| |  ||| ||| ||||| || ||||| || ||||| |  || || ||| | ||||||| ||| ||||   | ||||| |||||||| |||||    
T  30210626 tctgattattgccaaccatgaaatctaccaacttcacatccaccttctgagcctctttgatactatccaaaaatttgttgttgatcttcaacatccccaa 30210527  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| || ||||  || ||||| |  ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||| | ||     
T  30210526 tttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgttaaagcaactccaactctctaaccatcatagcagacatatgt-atgtt 30210428  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || ||||| || ||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30210427 ttcctacttaaagcatctgtaacaacattagccatacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 30210357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Original strand, 45530046 - 45530146
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  45530046 acatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttctt 45530145  T
Q  116 c 116  Q
    |    
T  45530146 c 45530146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22756332 - 22756138
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | | | |||||||| || |  |||||||| |||    
T  22756332 atcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 22756233  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    ||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || |||||||||||    
T  22756232 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgac 22756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 9610671 - 9610999
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  9610671 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 9610770  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  9610771 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 9610869  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||  ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  9610870 tctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacctttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 9610969  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaac 344  Q
     | ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  9610970 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaac 9610999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24819576 - 24819340
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttc 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  | | || ||||| |||    
T  24819576 gaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtc-atcttcttc 24819478  T
Q  133 atctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatca 232  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||| || | | |||||||  |||||||| ||| ||    
T  24819477 atctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaacca 24819378  T
Q  233 ttaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttct 270  Q
      |||||||||||||| || || ||||  |||||||||    
T  24819377 acaaatccacaaacttaacatctactttctgcgcttct 24819340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 17067910 - 17068085
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  17067910 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 17068009  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  17068010 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 17068085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11357773 - 11357688
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11357773 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaagtcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgact 11357688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 485
Target Start/End: Original strand, 45533159 - 45533349
Alignment:
Q  295 ttgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatca 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |  ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || ||  | |||||||    
T  45533159 ttgatcttcaacatccccaatttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactattcaagcaactccaactctctaaccatca 45533258  T
Q  395 tggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  45533259 tagcagacatatttaatgttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 45533349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30011932 - 30011623
Alignment:
Q  174 caacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctcta 273  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| |  ||| ||||||||| || ||||| || ||||| |  || || ||| |     
T  30011932 caacactccttgatcatcaactttaaaatcaccatcttcagtctgattattcccaaacattaaatctaccaacttcacatccaccttctgagcctctttg 30011833  T
Q  274 atactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagta 373  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  30011832 atactatccaaaaattcgttgttgatcttcaacatccccaatttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgttcaagca 30011733  T
Q  374 actcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaa 473  Q
    |||| || ||  | |||||||| || |||||||  || || || ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||    
T  30011732 actccaactctctaaccatcatagcagacatgt--aatgttttcctacttaaaacatctgcaacaacattagccttactcggatggtaatttaacccgaa 30011635  T
Q  474 atcataatcctt 485  Q
    ||||||||||||    
T  30011634 atcataatcctt 30011623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12640121 - 12640035
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  12640121 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 12640035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21906055 - 21905970
Alignment:
Q  38 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||| | | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  21906055 accaaaacaacctctttaaatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatactaagactactcctgtgaccttcttccaaaatc 21905970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24831075 - 24830990
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  24831075 ccaccaaaacaaccttttcaaatc-tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 24830990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12639808 - 12639711
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||| ||||  || || || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12639808 ctcaaatctcgaaactgttcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatctgcaacaacattagc 12639711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 22276833 - 22276898
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22276833 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 22276898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 10728 - 11198
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  10728 acatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagtttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaggctacttctgtgactttctt 10827  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||    
T  10828 ctagaatcaactttttcaaatcatcattatcaagaatgcaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccattttcagt 10927  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || |  ||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10928 ttcattgctagcaaccattaaatcaacaaactttacataaactttatgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaac 11027  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  11028 tgcacactctgaggcgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtct 11127  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11128 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 11198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 804 - 1273
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||     
T  804 acatcacgtttcaacccaaaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttcta 903  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||||||||||  ||||||  |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  904 ccaaaatcaactttttcaaatcattgttatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 1003  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  1004 ttcattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaat 1103  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||  || |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||  || || |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1104 tgtacactctaaggcgacaactcacaaacaagactcaagtctctttactattctagaaactcaaactcctttaccatcatagtagacatgtgtaacgtct 1203  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1204 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 5685 - 6154
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5685 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttctt 5784  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || | | ||||| |    
T  5785 ccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaat 5884  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  5885 ttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaac 5984  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||| ||||| |    
T  5985 tgtacactctgaggtgacaactcatagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcataacaaacatgtgcaacgttt 6084  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6085 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 73 - 485
Target Start/End: Original strand, 48096 - 48508
Alignment:
Q  73 gtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacc 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48096 gtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacc 48195  T
Q  173 tcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctct 272  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  48196 tcaacacaccttcatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacctgatgtgcttctct 48295  T
Q  273 aatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagt 372  Q
     |||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  48296 gatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagc 48395  T
Q  373 aactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaa 472  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  48396 aactcaaaatcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaa 48495  T
Q  473 aatcataatcctt 485  Q
    |||||||||||||    
T  48496 aatcataatcctt 48508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24099043 - 24098573
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24099043 acatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttctt 24098944  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || | | | |||||    
T  24098943 ctaaaatcaactttttcaacccatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcgtcaaccttgaagtcactatcctcagt 24098844  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  24098843 gtcattaccagtaatcatcaaatcaacaaacttcaaatccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaac 24098744  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||    
T  24098743 tgaacactctgaggtgtcaactcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtct 24098644  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24098643 tcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 24098573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 222 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20061186 - 20060923
Alignment:
Q  222 actaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcaca 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061186 actatcaatcattaaatccacaaacttgacatcaatctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcaca 20061087  T
Q  322 ctctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctac 421  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20061086 ctctggggtaacaaatcacaaacaaggctcaaatctctaaaatgctcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctac 20060987  T
Q  422 tcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060986 tcaacgcatctgcaactacattagctttacccgaatggtagttcaagccaaaatcataatcctt 20060923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19662578 - 19662107
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19662578 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagcttccggacgaatacttaagctactcttgtgactttcc 19662479  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||||||  |||||| ||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | | | | ||    
T  19662478 tctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatccttag 19662379  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| | ||| ||| ||||| || | |||||| |||||||  || |||||||  |||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||    
T  19662378 tgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacatccacttcctgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaa 19662279  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  || ||||| || || |||    
T  19662278 ctgtacactctggggtgtcaattcacaaacaagactcaaatctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtc 19662179  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  19662178 ttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatccttc 19662107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20939500 - 20939033
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20939500 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 20939401  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  |||| |  ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  20939400 aaattaacttttttaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcttctgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 20939301  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| ||     
T  20939300 attaccagcaaccattaaatcaacaaccttcacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaattgt 20939201  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||  |  || |||||||| || |||||||  || ||||| || ||| | || |    
T  20939200 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctataacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacattttcc 20939101  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20939100 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaatttaagccaaaatcataatccttc 20939033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20856188 - 20855734
Alignment:
Q  28 aaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatc 127  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||      
T  20856188 aaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaact 20856089  T
Q  128 ttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaac 227  Q
    | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |   || | | |||||||| |    
T  20856088 tcttcaattcctcattgtcaggaatacaaattctgcctcttaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactattctccgctagattactagc 20855989  T
Q  228 aatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgg 327  Q
     | ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  20855988 gaccatcaaatccacaaacttaacatcaacttgttgcgcttctctgatactatccaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttga 20855889  T
Q  328 ggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaagg 427  Q
    | |||||| || || || || || ||||| |||||||| || || || | ||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  20855888 gatgacaattcacacacgagacttaaatccctaaactgttcgagcaattaaaactcctttaccattaaggccgacatgtgcaacgtcttcctactcaacg 20855789  T
Q  428 catctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20855788 catctgcaactacattaactttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 20855734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 19855233 - 19855694
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19855233 ttcaacccagaccaccaaaacagcgtcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctattcttgtgactttcctctaaaatca 19855332  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | | | |||||   |||||     
T  19855333 actttttcaactcgtcattatcaggaatacaaatccttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattacc 19855432  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | |||  || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  19855433 agcaacaatcaaatcaacaaacttaacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactc 19855532  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| || || ||||| || ||||    
T  19855533 tgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctagtaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctca 19855632  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19855633 acgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 19855694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 94 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23197608 - 23197216
Alignment:
Q  94 aagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23197608 aagctactcttgtcactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaa 23197509  T
Q  194 ccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcact 293  Q
    | || || || | | ||||||||| | ||| | ||| ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23197508 ctttaaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaatccacaaacttaacatccacttgctgtgcttcacggatactattcaagaaatcact 23197409  T
Q  294 attgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatc 393  Q
    ||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  23197408 attaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatc 23197309  T
Q  394 atggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23197308 atagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 23197216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20835328 - 20834870
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20835328 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcct 20835229  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    |  ||  | ||| |  ||||  ||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | | | |||||    
T  20835228 ctgaa--ccatcat--catc--atcg------ggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagt 20835141  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||||    
T  20835140 gccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaac 20835041  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |  || ||||| || | ||| |    
T  20835040 tgaacactctgaggtgttaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttt 20834941  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20834940 tcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 20834870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 16373451 - 16373915
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |    
T  16373451 tcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgcagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaa 16373550  T
Q  119 aaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagttt 217  Q
     ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |   ||||||| |    
T  16373551 gaatca-tcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactgtcttcagtct 16373649  T
Q  218 gattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcg-cttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaact 316  Q
    |||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| |||| ||    
T  16373650 gattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgtcttttttaatacttttcaagaattcactatcaatcttcagcattcccagct 16373749  T
Q  317 gcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctt 416  Q
     ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||    
T  16373750 tcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcagatctctaaactgttcaagcaactcgaactccttaaccatcatagcagacatatgcaaagtctt 16373849  T
Q  417 tctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  16373850 cctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatc 16373915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 22109941 - 22110407
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  22109941 acatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctctt 22110040  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| | | |||||||    
T  22110041 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagt 22110140  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||||||  || ||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || || | ||| |||| |    
T  22110141 ctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaacatcgattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagc 22110240  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||||||  ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  22110241 ttcacactctgatgtgacatttcgcatactaaactcaaatctctaaactattcaagcaactcaaactcttttaccatcatagaggacatatgcaacgtct 22110340  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22110341 tcctacttaaggcatctgcaacaaatttagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 22110407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 22113790 - 22114256
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  22113790 acatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctctt 22113889  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| | | |||||||    
T  22113890 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagt 22113989  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||||||  || ||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || || | ||| |||| |    
T  22113990 ctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaacatcgattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagc 22114089  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||||||  ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  22114090 ttcacactctgatgtgacatttcgcatactaaactcaaatctctaaactattcaagcaactcaaactcttttaccatcatagaggacatatgcaacgtct 22114189  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  22114190 tcctacttaaggcatctgcaacaaatttagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 22114256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31539428 - 31538967
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  31539428 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacattttcgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatca 31539329  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||| | | |  |||| | |||||     
T  31539328 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctgtgaacctcagcacaccctgatcatcaattttgaaatcactatccccagtgtcattacc 31539229  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||  ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  31539228 agaagtcaccaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 31539129  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||| ||| ||||| || |||||||    
T  31539128 tgaggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagctgacacgtgcaacgttttcctactca 31539029  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31539028 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 31538967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 37678008 - 37678469
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  37678008 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatca 37678107  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  37678108 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 37678207  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| | ||||    
T  37678208 ggaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactc 37678307  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  37678308 tgaggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 37678407  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||  |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  37678408 aagcatcaacaaccacattggccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcaaaatccttc 37678469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41353102 - 41352636
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  41353102 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 41353003  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |   ||||||    
T  41353002 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcag 41352904  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  |||||||||||||| || || ||||  || |||||| | || ||  |||  || |||||||  || |||| ||||||||     
T  41352903 tctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttctttgatgcttctcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccag 41352804  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  41352803 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 41352704  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41352703 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaagtcataatc 41352636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 20295340 - 20295801
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  20295340 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatca 20295439  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |   | || || | | |||     
T  20295440 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcggtgtcactacc 20295539  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |    ||||  |||| || || || || ||| |||  || |||||||  ||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  20295540 agtcgtcatccaatcaaccaatttcacatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgaatactc 20295639  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||||||||  || |  || |||||||| ||| ||||||  || |||||||| || || || || ||||    
T  20295640 tgaggtgacaattcacagaccaaactcaagtctctaaactattctaacaattcaaattctttcgccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctca 20295739  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20295740 aagcatcagcaactacattggccttaccagggtggtaattcaagccaaaatcataatccttc 20295801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 51332933 - 51332463
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  51332933 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 51332834  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||| |    
T  51332833 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccg 51332735  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| |||||||||    
T  51332734 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccaa 51332635  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||    
T  51332634 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 51332535  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  51332534 ttcctaatcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 51332463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 21025092 - 21025558
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||    
T  21025092 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctttt 21025191  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||| || | || |  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| || || ||| |||||||    
T  21025192 caagaatcattttcttcctcccttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcattgaccttaaagtcaccatcttcagt 21025291  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || | ||  || || ||| ||||||| || |  ||||||||||  ||||||| ||| ||||      
T  21025292 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaattttctgtgcctctttaatactttttagaaattcactatcaattttcagcattcccagt 21025391  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  21025392 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 21025491  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21025492 tcctactcaaggcatctgcaacaccattagctttacctggatgataattcaaaccaaattcataatc 21025558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33390469 - 33390000
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  33390469 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 33390370  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || ||||| |   ||||||    
T  33390369 cgagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcag 33390271  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  33390270 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 33390171  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  33390170 tttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 33390071  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33390070 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcgtaatcctt 33390000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 21749860 - 21750322
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  21749860 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctctt 21749959  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||  |  || ||||| ||||| || ||||  || ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||||||    
T  21749960 caagaatcattttcttcatctcata-tcatctggaatacaaatcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatctctgtcttcagt 21750058  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | || |||| | | ||  || ||||||||||| || || |||| ||| |||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || |||    
T  21750059 ctaatcactagccaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgtgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagcatccctaac 21750158  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | |||||  || || || |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  21750159 ttcacactctcagatgacatttcacatactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtct 21750258  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||    
T  21750259 tcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcata 21750322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50619684 - 50619509
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  50619684 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctctt 50619585  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||    
T  50619584 caagaatcattttcttcatctcatcattgtatggaatacaaattctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 50619509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16078096 - 16077630
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  |||||||| |||||| | || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16078096 acatcacatttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16077997  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||| | | | ||||||||  | | |||||| |||||||| |  |||  ||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||    
T  16077996 caagaattattttcttcatctctgcatcgtcagggatgcaaatccgaccttggaatctcaacacaccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtcttcagt 16077897  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  |  || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  16077896 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctatgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 16077797  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  16077796 ttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 16077697  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  16077696 tcctcctcaaggcatctgcaacaacattaactttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 16077630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 19107287 - 19107757
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  19107287 acatctcgcttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtggctctctt 19107386  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||| ||    
T  19107387 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctttag 19107485  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | || |  ||| |||  |  || ||||||||||| || |  ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  19107486 tctgttctctagcaactaacaagtccacaaactttacattaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccag 19107585  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| | |||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| |  || |||    
T  19107586 tttcacactctgagatgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatacaatgtc 19107685  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19107686 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 19107757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19760313 - 19759847
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  19760313 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatctttatagctcctggatggatactcaagctacttatgtgactctctt 19760214  T
Q  116 ccaaaatcaatcttt-tcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||||    
T  19760213 caagaatca-tctttctcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattctacctcggaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcag 19760115  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||| | |   |||| | |||||| |||||||| || ||  | |  || |||||| | ||||||||||  ||||||||||  || |||| |||  | ||    
T  19760114 tctgagtccctccaataaataaatctacaaactttacatcagccttctgtgcttcttttatactattcataaattcactatcaatcttcagcatttctaa 19760015  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||  || || || |  ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |  | |||||| || ||||| ||||  ||     
T  19760014 cttcacactctgaggtgacacttcacagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcagctccaattcttagatcatcatagcggacatatgtagagtt 19759915  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||    
T  19759914 ttcctacttaacgcatctgcaacaacattagcttttcctggatgataattcaacccaaaatcataatc 19759847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 21831222 - 21831688
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21831222 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 21831321  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || |||||  | || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  21831322 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 21831420  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||   || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  21831421 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 21831520  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  21831521 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 21831620  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21831621 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 21831688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 21951837 - 21952298
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  21951837 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgaaacatatttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaaggatca 21951936  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |   | ||||| | | |||     
T  21951937 acttcttcaaatcatcattgttaggaatacaaactcttcctctgaatctcagtacaccctgatcatccaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactacc 21952036  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| || || || |  ||  |||  || ||||||| |||||| ||||| || | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  21952037 agtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctgctttctgggcttctcgaatactgttcaaaaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactc 21952136  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||  || || ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||| || ||||    
T  21952137 tgagatgacagttcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctca 21952236  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21952237 acgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttc 21952298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 21837869 - 21838335
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21837869 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 21837968  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |  || |  || |||||     ||||||    
T  21837969 caagaatca-tcttattaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcattgtcttcag 21838067  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  |||  || ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||  | ||| | ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||     
T  21838068 tctgatctctagaaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttccttgatatttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccag 21838167  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || || |||    
T  21838168 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtc 21838267  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21838268 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 21838335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22361675 - 22361246
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||| ||||| | |||||    
T  22361675 ttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatagatcttcgtagctcccggatgaatactcaagtttcttctatgactctcttcaagaatca 22361576  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||  ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||| ||  ||||||| |||| |||    
T  22361575 ttttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatcact 22361476  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || || |||||||| || || |||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||     
T  22361475 agcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttatgcttctttaatactcttcaaaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactt 22361376  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  | |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||| || || || || || ||||| |||||||    
T  22361375 taagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactattttaccatcatagcagatatatgcaaggtcttcctactca 22361276  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22361275 aagcatctgcaacaacattagctttacccg 22361246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16350039 - 16349566
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16350039 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16349940  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaatt-ctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttca 213  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || ||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||||| || | ||| |  || ||||| |   ||||     
T  16349939 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattacttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcc 16349841  T
Q  214 gtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctct--aatactattcaagaattcactattgattttcaacatacc 311  Q
    || ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || ||||  ||  | |||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||    
T  16349840 gtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgctttccttgattacttttcagaaattcactatcaatcttcaacatacc 16349741  T
Q  312 caactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaac 411  Q
    ||  | ||| ||||| |||||| | || ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| || ||     
T  16349740 cagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaat 16349641  T
Q  412 gtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16349640 gtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 16349566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 431224 - 431086
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  431224 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaattcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagct 431125  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  431124 ttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttc 431086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 20139749 - 20139834
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139749 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 20139834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21744627 - 21744522
Alignment:
Q  381 ttccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataa 480  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  21744627 ttcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaacccaaaatcataa 21744528  T
Q  481 tccttc 486  Q
    ||||||    
T  21744527 tccttc 21744522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21235038 - 21234705
Alignment:
Q  149 gaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaactt 248  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||    
T  21235038 gaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaactt 21234939  T
Q  249 gacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaagg 348  Q
    ||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| | ||| | |||  |||| |||||| | || ||||| |      
T  21234938 gacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatctatcttcagcattctcaatttcactttctgaggtgaccattcacaaactaaa 21234839  T
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21234838 ctcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctt 21234739  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  21234738 tacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 21234705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17044446 - 17043985
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  17044446 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 17044347  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||  | | ||| ||||| ||||| |  |||| ||| |||||||   |||| ||||| || || || || ||  ||||||| ||||||||    
T  17044346 ttttcttcatctctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacatgtcgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattact 17044247  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||  ||    
T  17044246 agcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactttttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttc 17044147  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||| | ||  |||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| || ||||    
T  17044146 tgaggtgaccattcataaaccaaactcaaatctctgaattgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctca 17044047  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||    
T  17044046 aggcatctgcaacaacgttagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcgtaatccttc 17043985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Original strand, 20250739 - 20250895
Alignment:
Q  35 accaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcat 134  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||    
T  20250739 accaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcat 20250838  T
Q  135 ctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||    
T  20250839 ctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcaaaacctcaacataccttgatcatc 20250895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20830812 - 20830726
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  20830812 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 20830726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24793664 - 24793591
Alignment:
Q  409 aacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  24793664 aacgttttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 24793591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 485
Target Start/End: Original strand, 3111 - 3580
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  3111 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgacattctt 3210  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| |||||   |||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3211 ccagaatcatctttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctcaccatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 3310  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  3311 ttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttggcatcaacttgctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 3410  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |  |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  3411 tatacactcttaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaaatgctctagcaactcaaactcctttaccataatagcagacatgtgcaacgtct 3510  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  3511 tcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaatttaaaccaaaatcataatcctt 3580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 195072 - 194605
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  195072 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 194973  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  194972 aaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 194873  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  194872 attaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatccacttgttgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgt 194773  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||| |    
T  194772 acactcagaggtgtcaattcgcaaacaagactcaagtatctaaactactctagcaactcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttcc 194673  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||||   ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  194672 tactcaaggcatcaataaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 194605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 149505 - 149974
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  149505 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 149604  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |   | |||||    
T  149605 ccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaatttttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactttcctcagt 149704  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||| | ||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  149705 ttcattaccagcaaccatcaagtccacaaacttgacatccactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaac 149804  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  || ||||| |  || ||||    
T  149805 tgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatattcaatgtct 149904  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  149905 tcctgctcaacgcatctgcaaccacatt-gctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 149974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25895 - 25439
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  25895 ttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 25796  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||| || |  ||||| |  || ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  25795 ttttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctccctcgaaaacgcaacactccctaatcatcgattttaaaatcgctatcttcagtctgattact 25696  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||||||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||  || || | ||| || |  | |||||||    
T  25695 agcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttttttaatactgttcaggaattcactatcaatctttagcattccaagtttcacactc 25596  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  25595 tgaggtgacatttcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactta 25496  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||||    
T  25495 gggcatctgcaacaacattaactttacctggatgataattcaacccaaaatcataat 25439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 180879 - 180966
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  180879 ccaccaaaacaacatattaaaatcatgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 180966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 32345 - 32816
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaa-cagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32345 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaaacagtttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcc 32444  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    |||| ||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||||    
T  32445 tccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcag 32544  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||| ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  32545 tttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttgcgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaa 32644  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||     
T  32645 ctgtacactctgaggtgacaattcacagacaagactcaaatctctaaaccgcgctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtt 32744  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || || ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32745 ttcctgctcagagtatccgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 32816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 1
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |    
T  430 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactttcttcta 331  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| ||||||  | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  330 aaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaagttcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttg 231  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || | ||  || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  230 attactagcaaccattaaatccacaaacatgacatcaattttatgtgcttctctgatattgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgc 131  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  130 acactctgaggtgacaactcacaaactagagtcacgtctctaaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcc 31  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30 tgctcaaagcatctgcaaccacattagctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2727 - 2260
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2727 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 2628  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||||||  ||||||  || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || | | | || |    
T  2627 tctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaatccttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcgaccttgaagtcactatcctctg 2528  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| |||||    
T  2527 tttcattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatctacttgttgcgcttctcggatactgttcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaa 2428  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| |  ||||| || |||||     
T  2427 ctgaacactctgaggtgtcaactcacacacaagactcaagtctctaaattgctctagcaaatcgaattcttttaccatcatagtagacatatgcaacgtt 2328  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2327 ttcctacgcaaggcatctgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8465
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  7998 tcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttattcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgactctcctcta 8097  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||   |||| |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  8098 aaattaactttttcaaaccatcatcatcaggaatgaaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 8197  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
     |||| |  || ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  8198 cttaccagtaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacatgctgcgcttctcgaatactattcaagaagtcactgttaatcttcagcatccccaactga 8297  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |  |  ||||| || |||||||| |    
T  8298 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagtagacatatgcaacgtcttcc 8397  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8398 tattcaagacatctgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 8465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 104 - 486
Target Start/End: Original strand, 1 - 383
Alignment:
Q  104 tgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatc 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1 tgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcgttatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacaccccctgatcatcaaccttgaaatc 100  T
Q  204 gccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttc 303  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  101 accctcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttc 200  T
Q  304 aacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgaca 403  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  201 agcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaagtctctgaactattcaagcaacacaaactcctttaccatcatagcagaca 300  T
Q  404 tgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  301 tatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccatattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 486
Target Start/End: Original strand, 4729 - 5181
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||   ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||  || |||    
T  4729 gaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgaatcatctttttagctcccggatgaatacttaagctacttctgtggctttcttctaaaatcaactttatca 4828  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
      ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  4829 aatcatcattattaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcggtttgattactagcaaccat 4928  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  4929 taaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatactcaactgtacactttgaggtgac 5028  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  5029 aactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctccagcaactcaaactcctttaccatcatagcagaaatgtgcaacgtcttcttgctcaaagcatctg 5128  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  5129 caaccacattagctttacccggatggtaatttaaaccaaaatcataatccttc 5181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4357
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4820 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacattttcgtagcttccggatgaatactcaagctactcttatgactttcttcta 4721  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||   | | || ||||     
T  4720 aaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctaatcatcaaccttgaagtcattatcctctgtttc 4621  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    |||||   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||     
T  4620 attacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcgaatattattcaagaaatcactattaattctcagcatccccaactgt 4521  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||  || ||||| ||||| ||||| |    
T  4520 atactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaagtctctaaactattctagtaaatcaaattcttttaccatcaatgcagacatatgtaaggtcttcc 4421  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4420 tgctcaacgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 4357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 46767 - 46300
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46767 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgattcatttttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 46668  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | |||| ||     
T  46667 aaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacagattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagcttc 46568  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  46567 attactagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 46468  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||  || ||||| || ||||| || |    
T  46467 acactctgaggtgtcaattcacagacaaggatcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcc 46368  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46367 tactcaaggcatgtgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 46300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 41695 - 41234
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  41695 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 41596  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| | | | ||||| | |||||     
T  41595 acttcttcaactcttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 41496  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| |  ||  |||  || |||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  41495 agaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactc 41396  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||    
T  41395 tggggtgacaattcacagacaagactcatatctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactca 41296  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41295 aagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttc 41234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 481
Target Start/End: Original strand, 2849 - 3314
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  2849 acatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 2948  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| | | |||||||    
T  2949 caagaatcattttcttcatctcatcatcattaggaatacaaattctgcctcagaatctcaacaccccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 3048  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||||||  || ||  || ||||||||||| || ||   ||  ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || || | ||| ||||||    
T  3049 ctgattactagtaaccaacaagtccacaaacttaacatcggttttctgcgcttctttgatactatttaagaattcactatcaatctttagcattcccaac 3148  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||  || ||||| || |||||||    
T  3149 ttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcaactcaaactcttttaccatcaatgcggacatatgcaacgtct 3248  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||| |||||||||    
T  3249 tcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacctggataataattcaacccacaatcataat 3314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 1343 - 874
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  1343 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 1244  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | | |||||||    
T  1243 ctaaaatcaacattttcaactcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacactccttgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagt 1144  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  1143 cc-attactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcggcttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaac 1045  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||| |||| |||||||    
T  1044 tgtacactctgaggtttcaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaagtcatttaccatcatagcagacttgtgcaacgtct 945  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || || ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  944 tcctgcttaaagcatctgcaaccacattagctttaaccgaatggtaatttaaaccaaaatcataatccttc 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 268 - 725
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  268 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatca 367  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  ||||||  || || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || |||| |||||     
T  368 actttttcaattcttcattttcaggaatataaattctacctctgaatctcaatacaccctggtcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacc 467  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
      ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||| | ||||    
T  468 cgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttcttggatactattcaagaaatcactattaattctcagcatccccaactgtatactc 567  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  568 tgaggtgacaactcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgctca 667  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  668 acgcatccgcaaccacattggctttaccagggtggtaattcaaaccaaaatcataatc 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2838 - 2386
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  2838 gaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaaatttttca 2739  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
     |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| | ||| |||    
T  2738 actcatcattatcaggaatgcaaattctttctccgaacctcaacacaccctcatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccat 2639  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     ||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||     
T  2638 caaatcaacaaacttgacatccagttgctgtgcttctcggatactattcaagaaattacaattaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgag 2539  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||    
T  2538 aactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctg 2439  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2438 caaccacattagcttcacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 2386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 597 - 138
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaa-t 122  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |    
T  597 cttcaaaccagaccactaaaacagcttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaaat 498  T
Q  123 caatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgatta 222  Q
    |||  | ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   || | |||||||    
T  497 caacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctccgcttgatta 398  T
Q  223 ctaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacac 322  Q
    |||  || |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  397 ctagtaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacac 298  T
Q  323 tctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctact 422  Q
    |||| | |||||| || || || || || || || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  297 tctgagatgacaattcacacacgagacttaagtccctaaactgttcgagcaattcaaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctact 198  T
Q  423 caaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  197 caacgcatctgcaactactttagctttatctggatggtatttcaagccaaaatcataatc 138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 323642 - 324109
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  323642 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcca 323741  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  ||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | ||| |       
T  323742 aaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcattgcc 323841  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||| | || || |||| ||| ||||||||     
T  323842 attaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacacccacttgttgtgcttctcggatactcttcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactga 323941  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||  |||||||| |  || |||||||| |||||||| |    
T  323942 acactctgaggtgtcaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattatttcaccattaaagcagacatgtgcaacgtcttcc 324041  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  324042 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 324109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 202823 - 202369
Alignment:
Q  32 cggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctttt 131  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  202823 cggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacttttt 202724  T
Q  132 catctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatc 231  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||  || ||| |    
T  202723 taactcatcattatcaggaatacaaattctaccgcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgatttttagcaacc 202624  T
Q  232 attaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtg 331  Q
    |  || ||||||||||| || || ||||  ||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  202623 aacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcacttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggcg 202524  T
Q  332 acaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatc 431  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  202523 acaactcacaaactagactcaagtctctaaaatgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatc 202424  T
Q  432 tgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  202423 tgcaacaacatttgctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 202369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 482
Target Start/End: Original strand, 118563 - 118627
Alignment:
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  118563 ctacttaaagcatctgcaacaacgttagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 118627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 20058 - 20521
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20058 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacaaattagtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactctcttcta 20157  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||   | |||||| ||     
T  20158 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttcagcttc 20257  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| |  || ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  20258 attaccagtaaccatcaaatcaacaaacttaacatccacttgttgcgcttctcggatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactga 20357  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||  || ||||| || || ||||| |    
T  20358 atactctgaggtgtcaattcacaaacaagactcaagtctctaaattgttctagtaaatcgaattccttcaccatcaacgcagacatatgcaatgtcttcc 20457  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20458 tgctcaacgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 20521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 58146 - 58093
Alignment:
Q  432 tgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  58146 tgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 58093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Original strand, 13132 - 13601
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggacca-ccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagct-cccggatgaatactcaagctactcttgtgacttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13132 gacatcacgcttcaaaccggaccaaccaaaacagcttctttaaatcatgatacattttcgtagcttcccggatgaatacttaagctactcttgtgacttt 13231  T
Q  113 cttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttc 212  Q
    | || ||||| || ||||| |  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || | | | ||    
T  13232 cctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctc 13331  T
Q  213 agtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacataccc 312  Q
    |||   ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||    
T  13332 agtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatcccc 13431  T
Q  313 aactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacg 412  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||    
T  13432 aactgtacactctaaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcgtagcagacatgtgcaacg 13531  T
Q  413 tctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  13532 tcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatc 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7159 - 7073
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  7159 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 249551 - 250018
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  249551 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgacttttttcta 249650  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| || | | | ||||| |     
T  249651 aaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtc 249750  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| |  | |||  ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||  || ||||||||||| ||| |||| || |||| ||| | ||||||     
T  249751 attaccagtagtcaccaaatcaacaaacttcaaatccacttgctgagcttctcggatgctattcaagaaatcattattaatcttcagcatccgcaactga 249850  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || |    
T  249851 acactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcc 249950  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  249951 tgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 250018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2159 - 1755
Alignment:
Q  82 ggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacac 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2159 ggatgaatacttaagctactcttgtgacttttctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctcggaacctcaacacac 2060  T
Q  182 cgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactatt 281  Q
    | || |||| ||||||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  2059 cctgatcattaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaatcatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatattgtt 1960  T
Q  282 caagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaat 381  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||| |||||||  |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  1959 caagaaatcactattaatcttcagcatccccaactttacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaac 1860  T
Q  382 tccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1859 tcctttaccatcatagtagacatgtgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacatttgctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataat 1760  T
Q  482 ccttc 486  Q
    |||||    
T  1759 ccttc 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 485
Target Start/End: Original strand, 18320 - 18753
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  | ||| |||    
T  18320 ttcaaatgatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgttactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcatgaa 18419  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  18420 tgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgac 18519  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||| |||    
T  18520 atcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaaccttcagcatacccaactgtacactttgaagtgacaactcacagacaagactc 18619  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    || |||||||| |  || || |||||||| || || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  18620 aagtctctaaaatattctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagagatgtgaaatgtcttcctgctcaaagcatctacaacgacattagctttac 18719  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  18720 ccggatggtaattaaaaccaaaatcataatcctt 18753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 43727 - 44188
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  43727 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcattgtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatta 43826  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | ||||| | |||||     
T  43827 acttcttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattacc 43926  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | || |||| ||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  43927 agcagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactc 44026  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||  || ||||| || || ||||| |||||||    
T  44027 tgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtctctaaaatgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctactca 44126  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44127 acgcattagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 44188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24443 - 23980
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24443 acatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcattatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttctt 24344  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  24343 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 24244  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24243 ttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatactcaac 24144  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| ||  ||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  24143 ttcacactctgaggctacatctcacaaactagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgtct 24044  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||       |||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24043 tcctactca-------tgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttc 23980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1057 - 593
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1057 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccgggtgaatactctagctactcttgtgactttctt 958  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  ||| || ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||   | |||| ||    
T  957 ctagaatcaacttttccaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttccgt 858  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||| || ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||||    
T  857 ttcattattagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcac-attaatcttcatcatccccaac 759  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || ||| |||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  758 tgtacagtctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtct 659  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  658 tcctacttatggcatctgcaaccacatttgctttaccc-gatggtaattcaaaccaaaatcataatc 593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 41855 - 42322
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  41855 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 41954  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  |||||| ||| || || | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | ||  |       
T  41955 aaatcaactttttcaactcgtcattattaggaatacaaattcttcctctggacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctatgcc 42054  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| || || ||| |||||||| || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  42055 attaccagcaaccaatatatcaacaaacttcacatccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgt 42154  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |  || ||||| || | ||| || |    
T  42155 atactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcc 42254  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  42255 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttacctggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 42322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 886 - 453
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||| ||| || || |||||||    
T  886 ttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactc-tcattatcaggaa 788  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | | | |||||   ||||| | ||| ||| ||||| || | ||||||    
T  787 tacaaattcttcctctgaacctcaatacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgac 688  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||||    
T  687 atccacttgttgtgcttcccggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctc 588  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    || |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  587 aagtctctaaactgctctaacaaatcaaattctttcaccatcatagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttac 488  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  487 ccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 486
Target Start/End: Original strand, 13015 - 13463
Alignment:
Q  38 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctc 137  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||    
T  13015 accaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctccagggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctc 13114  T
Q  138 atcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaa 237  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |   ||||||| ||||||||| ||| ||  ||     
T  13115 atcattgtctggaatacaaatcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaag 13214  T
Q  238 tccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaact 337  Q
    ||||||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||||  | |||||  |    
T  13215 tccacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactctcagatgacattt 13314  T
Q  338 cgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaac 437  Q
    | || || | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13315 cacacactaagctcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactcctttaccatcatggcagacttatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaac 13414  T
Q  438 tacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
     |||||||||| |||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  13415 aacattagcttgacccggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 13463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7425
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||   | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  6958 acatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttt---agatcgtggtacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 7054  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||| |  || ||||| |   |||||||    
T  7055 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctctaaaccttaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 7154  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||| |||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | |    
T  7155 ctgatcactagcaaccaacaagtcaacaaacttaacatcgactttctgtgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagc 7254  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| |  | |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||    
T  7255 ttcacactttcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcatttaccatcatagcggacatatgcaaagtct 7354  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  7355 tcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 7425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Original strand, 23444 - 23541
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| || || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23444 ctcaaatctcgaaactgctcaatcaactccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 23541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6606 - 6139
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6606 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatgcactttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctcta 6507  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || | | | |||||       
T  6506 aaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctaaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 6407  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||||||||| || ||||| ||  ||||||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||     
T  6406 attaccagcaaccattaaatcaactaacttcacagccacttgctttgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgt 6307  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||| | |||| ||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  || | |||||| |||||||| |  || ||||| || ||| | || |    
T  6306 acactcagaggtgtcaattcacatacaaggcttaagtctctaaactgctctaacaaataaaattctttcaccattaaagcagacatatgcaacattttcc 6207  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6206 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 6139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10179 - 9709
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  10179 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttttagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttctt 10080  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| || |||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| || | | ||| |||    
T  10079 ctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagaaatacaaattcttcctcggaatctcaacacacccagatcatcaaccttgaagtcactatctttagt 9980  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    | |||||||| ||| ||  |||||||||||||| || || || |  || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9979 tggattactaccaaccaacaaatccacaaacttaacatcaaccttctgtgcttctctaatactatccaagaactcactgttgatcttcaacatacccaac 9880  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  || || ||||    
T  9879 ttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctttaaactgctcaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacaaatgcaatgtct 9780  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||||||| ||||||||    
T  9779 tcctgcttaaagcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcacaatccttc 9709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 51234 - 50776
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  51234 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatctcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagttacttctgtgactttctt 51135  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | || ||||    
T  51134 ctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatctccagt 51035  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||||  || ||||            ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||    
T  51034 ttcattactagaaaccatt------------ttgacatcaacttgatgtgcttctctaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatagccaac 50947  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  50946 tgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgttctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgttt 50847  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50846 tcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcataatccttc 50776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 2523 - 2993
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  2523 acatcacttttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaataattaagctactcttgtgactttcct 2622  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || || | | | |||||    
T  2623 ctaaaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaaccttaacacaccctaatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 2722  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| |||||  ||||||| |  || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  2723 gccattaccagcaaccatcaaatcatcaaacttaagatctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaac 2822  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||| |||    
T  2823 tgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaaactactctagcaaatcgaattctttcaccatcatagcagacatatgcaacatct 2922  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || ||||  ||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2923 tcctgctcagcgcatctgcaaccatattggctttacccagatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 20329 - 20795
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20329 acatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctctt 20428  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||  | | |||||    
T  20429 ctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaatacaaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagt 20528  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||||  | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||    
T  20529 gtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaac 20628  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||    
T  20629 tgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggcttaagtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtct 20728  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20729 tcctgctcaacgcatcaacaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 20795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 23149 - 23615
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23149 acatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctctt 23248  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||||  | ||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||  | | |||||    
T  23249 ctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaatacaaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagt 23348  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | |||||||  | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||    
T  23349 gtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaac 23448  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||    
T  23449 tgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggcttaagtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtct 23548  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23549 tcctgctcaacgcatcatcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 23615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 467
Target Start/End: Original strand, 11690 - 12119
Alignment:
Q  38 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctc 137  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||  ||    
T  11690 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttatgactttcttctaagatcaactttttcaattc 11789  T
Q  138 atcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaa 237  Q
     || ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || |||| ||||| | ||| |||||||    
T  11790 ttcattgtcaggaatacaaattctacctatgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccagcaaccattaaa 11889  T
Q  238 tccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaact 337  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |    
T  11890 tcaacaaactttacatccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaatt 11989  T
Q  338 cgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaac 437  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| || |||||||  |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11990 cacaaacaaggctcaagtcactaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcaacgtagacatatgtaaggtcttcctactcaacgcatctgcaac 12089  T
Q  438 tacattagctttacccgggtggtagttcaa 467  Q
     ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  12090 cacattggctttaccaggatggtaattcaa 12119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 45461 - 45918
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45461 ttcaaaccggaccaccgaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatca 45560  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  ||||||  || || |||||| || | |||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || |||| ||||      
T  45561 actttttcaattcttcattgtcaagattacaaattctacatctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattatc 45660  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
      ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||| || || |||| ||| |||||||| | ||||    
T  45661 cgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcattcccaactgtatactc 45760  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||  || ||||| ||||  ||||| || || |    
T  45761 tgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcaacgcagacatatgtagggtcttcctgctta 45860  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45861 acgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 45918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 20835 - 21288
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20835 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcatgctactcttgtgactttctt 20934  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  || || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | | | || ||    
T  20935 ctaaaatcaactttttcaattcttcattgtaaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgt 21034  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || |||||   ||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||     
T  21035 ttcattacccgcaaccattaaatcaacaatctttacatccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaa- 21133  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
                |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||  | |||||||  || ||||| ||||| ||||    
T  21134 ------------ggtgacaactcagaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagaagatcaaattctcttaccatcaacgcagacatatgtaaggtct 21221  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21222 tcctgctcaacgcatccgcaaccacattagctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19703 - 19242
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | || || ||||| | |||||    
T  19703 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacatctatggctctcttcaagaatca 19604  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||  |||||||  ||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| |||| |||    
T  19603 ttttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcact 19504  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || || |||||||| || ||  |||  || || ||| ||||||| ||||| |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||     
T  19503 agcaaccaacaagtctacaaacttaacatcagctttctgtgcctctttaatactcttcaaaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactt 19404  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  | |||||  || || || |  || |||||| | ||||| ||||| ||||  || || || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  19403 tcagatgacatttcacacactaatcttaaatctttgaactgttcaagcaacttgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactca 19304  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  19303 aagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaacacaaaatcatagtccttc 19242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17348 - 16882
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17348 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttgtgactctctt 17249  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||  | || |||||||||||||| ||   | ||||||    
T  17248 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcttcaagaatacaaattctgcctcagaatcgcaacacctcctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcag 17150  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  || |||| ||| || ||    
T  17149 tctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatattgttcaagaattcattatcaatcttcagcattcctaa 17050  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||  || || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||     
T  17049 cttcacactctgaggtgacacttcacagactaagctcaaatctctaaactgttcaagtaactcaaattccttgaccatcatagcggacatatgtagagtt 16950  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||  |||||||||||||    
T  16949 ttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggttgataattcaactcaaaatcataatc 16882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 51548 - 51085
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51548 tcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 51449  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | || ||       
T  51448 aaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgcc 51349  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  51348 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgt 51249  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||| |    
T  51248 atactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcc 51149  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |  |||| ||||| ||| | |||||  ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51148 tgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 51085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 60582 - 60119
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  60582 tcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 60483  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | || ||       
T  60482 aaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgcc 60383  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  60382 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgt 60283  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||| |    
T  60282 atactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcc 60183  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |  |||| ||||| ||| | |||||  ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  60182 tgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 60119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 66970 - 66507
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66970 tcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 66871  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | | || ||       
T  66870 aaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgcc 66771  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  66770 attaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgt 66671  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||  || ||||| ||||| ||||| |    
T  66670 atactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcc 66571  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |  |||| ||||| ||| | |||||  ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  66570 tgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 66507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 486
Target Start/End: Original strand, 27722 - 28029
Alignment:
Q  178 acaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatac 277  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||   | ||||||| | ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||    
T  27722 acaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatac 27821  T
Q  278 tattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactc 377  Q
    |||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  27822 tattcaagaaatcattgttaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgacaactcgcaaacaagactcaagtctttaaactgctctagcaactc 27921  T
Q  378 aaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatca 477  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| |  |||||| |||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  27922 aaattcttttaccatcatagcagacatatccaacgtc-ttctgctcagagcatctacaaccacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaaatca 28020  T
Q  478 taatccttc 486  Q
    |||||||||    
T  28021 taatccttc 28029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 26392 - 26494
Alignment:
Q  73 gtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacc 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26392 gtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaatacaaattcttcctctaaacc 26491  T
Q  173 tca 175  Q
    |||    
T  26492 tca 26494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 3686 - 4154
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3686 acatcacgtttcaacccagaccactaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 3785  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | ||| |    
T  3786 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaat 3885  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||   |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  3886 gccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcattcccaac 3985  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    ||   |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||| || |||||||| || ||||| || |||| ||    
T  3986 tg--tactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaattgaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgcct 4083  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4084 tcatgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 4154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43199 - 43012
Alignment:
Q  295 ttgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatca 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  43199 ttgatcttcaacattcccaatttcacactttgtggtgatacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgttcaagaaactccaactctttaaccatca 43100  T
Q  395 tggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |  | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  43099 taacagacatatgtaatgttttcctacttaaagcatctgcaacgacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 43012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13667 - 13200
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  13667 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 13568  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     ||| ||  ||||||  ||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || | | | |||||       
T  13567 gaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacacccttttcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcc 13468  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| || ||||||| ||| ||||||||     
T  13467 attactagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattacttttaattttcagcatccccaactga 13368  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||  |||| ||| || || ||||||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| |  ||  |||| || | ||| || |    
T  13367 acactctaaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaattgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcaaacatatgcagcgttttcc 13268  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  13267 tactcaaggcatctgcaaccacattggctttatcaggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttc 13200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Original strand, 6147 - 6614
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6147 gacatctcgcttcaaactggaccaccaaaatagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcc 6246  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  ||||||  || || ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | | | || |    
T  6247 tctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctatctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctg 6346  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || |||||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| |||||    
T  6347 tgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaa 6446  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||| |  ||||| || |||||||| || || || ||||  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||  |||| || |  |||    
T  6447 ctgtatgctctgaggcgacaactcacataccagactcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcatacatatgaagtgtc 6546  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6547 ttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10825 - 10358
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  10825 tcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 10726  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||   |||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || | | | ||||| |     
T  10725 aaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaattctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtc 10626  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| || || ||| ||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||     
T  10625 attaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccacttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattga 10526  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    ||| |||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||  |  || ||||| || | ||| || |    
T  10525 acaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaattgaattctttcaccactaaagcggacatatgcagcgttttcc 10426  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10425 tactcaaggcatctgtaaccacattggctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatccttc 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21039 - 20572
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  21039 tcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctcta 20940  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||   |||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || | | | ||||| |     
T  20939 aaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaattctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtc 20840  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| || || ||| ||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||     
T  20839 attaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccacttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattga 20740  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    ||| |||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||  |  || ||||| || | ||| || |    
T  20739 acaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaattgaattctttcaccactaaagcggacatatgcagcgttttcc 20640  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20639 tactcaaggcatctgtaaccacattggctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatccttc 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 26761 - 26847
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  26761 ccaccaaaacaacctcttcaaatcatgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcatccaaaat 26847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 334
Target Start/End: Original strand, 3726 - 4044
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3726 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttctt 3825  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| ||| ||  |||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |   |||||||    
T  3826 ccagaataaactttttcaactcatcattatctggaatgcaaattctccctctgaacctcaacacaccctgaacatcaaccttgaagtcactctcttcagt 3925  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||     
T  3926 ttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcgctattaatcttcaacatacccaat 4025  T
Q  316 tgcacactctggggtgaca 334  Q
    || |||||||| |||||||    
T  4026 tgtacactctgaggtgaca 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7773
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7639 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagct 7738  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  7739 ttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatc 7773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7392
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | | || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7310 tcacgtttcaattcggaccaccaaaacaacctctttagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttact 7392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 163 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6315 - 5990
Alignment:
Q  163 cctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgtt 262  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | || | ||  |    
T  6315 cctctgaaccttaacacaccttgatcatcaactttgaagtcaccatcttcagtttgattactagtaaccattaaatccacaaacttggcatcgattttct 6216  T
Q  263 gcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaa 362  Q
    | | |||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  6215 gtgtttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctaaa 6116  T
Q  363 ctgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaac--tacattagctttacccgggtggt 460  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |    
T  6115 ctgctcaagcaactccaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccgtacattagctttaccggggtgat 6016  T
Q  461 agttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  6015 aattcaaaccaaaatcatagtccttc 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6407 - 6322
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6407 acatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctact 6322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 25236 - 24777
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25236 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcaggatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 25137  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||| ||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |           ||||||||||| || || | | | | |||    
T  25136 ctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctga-----------tcatcaaccttaaagtcactatccttagt 25048  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  25047 gccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgatgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatccccaac 24948  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    || |||||||  |||| ||| || || ||||| | |||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||  |||| || |||||||    
T  24947 tgtacactctcaggtgtcaattcacagacaagacacaaatctctaaactgctctagcaaatcgaattctttcaccatcaaagcaaacatatgcaacgtct 24848  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24847 ttctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 24777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5703 - 5241
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5703 tcacgtttcaaactggaccaccaaaatagctttt-caaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcta 5605  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||| ||||| || | | | |  ||||     
T  5604 aaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctaatcatcaactttgaagtcactatcctgtgtttc 5505  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    | |||  |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||| || || |||| ||| ||||||||     
T  5504 actacatacaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcatccccaactgt 5405  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||    ||||||   || ||||| ||||| ||||| |    
T  5404 atactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcataccatctacgcagacatatgtaaggtcttcc 5305  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  5304 tcctcaacgcatccgcaactacattggctttaccaagatggtaatccaaaccaaaatcataatc 5241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 383
Target Start/End: Original strand, 28160 - 28527
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28160 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcgtgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcct 28259  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | || | | | |||||    
T  28260 ccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttatagtcactatcctcagt 28359  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
    || ||||| | |||  || |  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||    
T  28360 ttcattaccagcaactatcaggtcaacaaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaac 28459  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattc 383  Q
    || |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  28460 tgtacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattc 28527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Original strand, 35422 - 35518
Alignment:
Q  390 catcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35422 catcatagcagacatgtgcaacatcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 35518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 218788 - 218322
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  218788 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 218689  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || || ||||  |  || |||||     |||||||    
T  218688 caagaatcattttcttcatctcatcattatcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacaatccctgatcattgattttaaaatcattgtcttcagt 218589  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| | ||| | ||||||||||||||||  || || | ||| ||||||    
T  218588 ctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttgatattgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccaac 218489  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |  ||||| || |||||||    
T  218488 ttcacactctgaggtgacaattcgtagactaaactcaaatctctaaactgctcaagcaactcaaactcttttaccatcatagtggacatatgcaacgtct 218389  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  218388 tcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacctggattatagttcaacccaaaatcataatc 218322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 229978 - 230187
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  229978 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaccaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttctt 230077  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||    
T  230078 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtctggaatataaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcaccatcttcag 230176  T
Q  215 tttgattacta 225  Q
    | |||||||||    
T  230177 tctgattacta 230187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3505 - 3180
Alignment:
Q  154 caaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  3505 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 3406  T
Q  254 ccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaa 353  Q
    ||| ||  ||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3405 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 3306  T
Q  354 atctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttaccc 453  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||     
T  3305 gtctctaaattgttcaagaaactcaaactctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttacca 3206  T
Q  454 gggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
     | ||||| ||||| |||||||||||    
T  3205 agatggtaattcaaaccaaaatcata 3180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30193
Alignment:
Q  154 caaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgt 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30518 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 30419  T
Q  254 ccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaa 353  Q
    ||| ||  ||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30418 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 30319  T
Q  354 atctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttaccc 453  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||     
T  30318 gtctctaaattgttcaagaaactcaaactctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttacca 30219  T
Q  454 gggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
     | ||||| ||||| |||||||||||    
T  30218 agatggtaattcaaaccaaaatcata 30193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 81 - 486
Target Start/End: Original strand, 1 - 406
Alignment:
Q  81 cggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacaca 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1 cggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacaca 100  T
Q  181 ccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactat 280  Q
    || || ||||||||||| || || | | | ||| |   ||||| | |||  || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||    
T  101 ccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaataacattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggatactat 200  T
Q  281 tcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaa 380  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  201 tcaggaaatcactattaattttcaacatcccaaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcgaa 300  T
Q  381 ttccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataa 480  Q
    ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  301 ttctttaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgctaccacattggctttacctggatggtaattcaaacaaaaatcataa 400  T
Q  481 tccttc 486  Q
    ||||||    
T  401 tccttc 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7507 - 7046
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  7507 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagccctcgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatca 7408  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||| || | | | || || | |||||     
T  7407 acttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacc 7308  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
      ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| || | ||| || || |||||||| |||||||| | ||||    
T  7307 cgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcggatactattcaaaaaattactgttaatcttcaacatccccaactgtatactc 7208  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||    
T  7207 tgaggtgacaattcacaaacaaggctcaggtctctaaactgttctagcaaatccaattctcttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctca 7108  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7107 atgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 7046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 486
Target Start/End: Original strand, 28173 - 28622
Alignment:
Q  37 caccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatct 136  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |    
T  28173 caccaaaacagcttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaat 28272  T
Q  137 catcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaa 236  Q
    |||| || | || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||   ||||||||| || || | | | |||||   ||||| | ||| ||| ||    
T  28273 catcattattagaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaa 28372  T
Q  237 atccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaac 336  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||     
T  28373 atcaacaagcttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaat 28472  T
Q  337 tcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaa 436  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||  ||||||||||  ||  | || || |  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  28473 tcacaaacaagactcaaatctctaaactactctagcaaatcaaattatttcaccatcaaagcacatatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatctgcaa 28572  T
Q  437 ctacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28573 ccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 28622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 486
Target Start/End: Original strand, 34426 - 34875
Alignment:
Q  37 caccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatct 136  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |    
T  34426 caccaaaacagcttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaat 34525  T
Q  137 catcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaa 236  Q
    |||| || | || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||   ||||||||| || || | | | |||||   ||||| | ||| ||| ||    
T  34526 catcattattagaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaa 34625  T
Q  237 atccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaac 336  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||     
T  34626 atcaacaagcttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaat 34725  T
Q  337 tcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaa 436  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||  ||||||||||  ||  | || || |  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  34726 tcacaaacaagactcaaatctctaaactactctagcaaatcaaattatttcaccatcaaagcacatatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatctgcaa 34825  T
Q  437 ctacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34826 ccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 34875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 95
Alignment:
Q  64 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgc 163  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  472 tacatctttgtagctcctaaatgaatacttaagctacttctgtgactttcttcgaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttc 373  T
Q  164 ctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| || | | ||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||| || || |  ||    
T  372 ctctgaacctcaacacaccctaatcgtcaaccttgaagtcacgatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaacattctg 273  T
Q  264 cgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaac 363  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||         ||| |||| || ||| |||||||| ||||| ||| | |      
T  272 ggcttctctaatactattcaagaaatcactattaatctttagcatacccaa---------ctgaggtggcagctcacaaacaagactcaagtctttgagt 182  T
Q  364 tgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttta 450  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  181 tgttcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcaaacatgtgcaacgtcttcctgcttaaagcatctgcaaccacattagcttta 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 164 - 485
Target Start/End: Original strand, 40781 - 41102
Alignment:
Q  164 ctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttg 263  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||| ||||||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  40781 ctctgaatctcaacacaccctgataatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattgttagtaaccatcaaatcaacaaacttgatatccacttgatg 40880  T
Q  264 cgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaac 363  Q
     |||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  40881 tgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaac 40980  T
Q  364 tgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagt 463  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  40981 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataat 41080  T
Q  464 tcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
      || |||||||||||||||||    
T  41081 caaaaccaaaatcataatcctt 41102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Original strand, 40673 - 40773
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40673 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaaaaatttcttcaaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatacttaagctactcttgtgactttctt 40772  T
Q  116 c 116  Q
    |    
T  40773 c 40773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 15821 - 16278
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||    
T  15821 ttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttagtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatca 15920  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | | |||| || ||||||||    
T  15921 ttttcttcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattatatctcgaaatctcaacacaccctgatcatcgactttgaagtcactatcttccgtctgattact 16020  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
      ||| ||  || ||||||||||| || ||| |||  ||||||||   |||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| |||| ||  ||||||    
T  16021 tgcaaccaacaagtccacaaacttaacatcctctttctgcgcttcatgaatactctttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagctttacactc 16120  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  16121 tgaggtgacaactcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcagctcaaactccttaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttcctactta 16220  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  16221 aggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 112859 - 112396
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  112859 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 112760  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | ||||| |  || ||||| ||| ||||||    
T  112759 caagaatc-atcttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacacctcgatcatcgattttaaaatcaccatcttcag 112661  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||   |  || || |||||||| || || || |  || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| || |     
T  112660 tatgattactagcagctaacaagtctacaaacttaacatcgaccttctgtgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcctag 112561  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||  | |||||  || || || |  ||||||||||||||||| || |  ||||| || || || |||||||||| |||||| || || |||    
T  112560 cttcacactcttagatgacatttcacagactaaactcaaatctctaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatggtcgacatatgcaatgtc 112461  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||    
T  112460 ttcctacttaaagcatctgctacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcata 112396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 40130 - 39694
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||    
T  40130 acatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgataaatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgaatatctt 40031  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || | |||||| |||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  40030 ctaaaatcaactttttcaattcatcattataaggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 39931  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||||||| |  || |||| ||| |||||| | ||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  39930 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaatatcaactttttgtgcttctttgatactgttcaagaactcattgttgatcttcaacatacccaac 39831  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | || |||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  39830 ttcatactctgaggcgacaactcacaaactagactcaagtctctaaattgttcaagcaactcaaactccttaaccatcatagcagacatatgcaacgtct 39731  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39730 tcatgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacc 39694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12158 - 11691
Alignment:
Q  15 gacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttct 114  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12158 gacatcacaattcaaaccgaaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttca 12059  T
Q  115 tccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    || ||||| ||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | | | || |    
T  12058 tctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctg 11959  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |   ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |  |||||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| |||||    
T  11958 tgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgatatgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaa 11859  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    | | |  ||||| || |||| ||| || || |  ||||  ||||||||||| || || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |  |||    
T  11858 ccgtatgctctgaggcgacagctcacataccacactcatgtctctaaactgttccagcatatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtc 11759  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11758 ttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 11691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 261246 - 261709
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  261246 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaccttcttcta 261345  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||| ||  ||||||  || || |||||| |||  |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||   |  |||  |       
T  261346 aaattaactttttcaattcttcattgtcaagaacacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtctttattttctttgcc 261445  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |  |||||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||     
T  261446 attaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgctttgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgt 261545  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    | |||||| |  |||||||| || || || ||||  || |||||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  261546 atactctgagtcgacaactcacataccagactcatgtccctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcc 261645  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  261646 tgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacctggatggtaattcaaacaaaaatcataatc 261709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 278201 - 277735
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  278201 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaacctacttctatgactctctt 278102  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  278101 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 278002  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||   | || ||||  ||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || || | ||| ||||      
T  278001 ctgattactagcaaccaaagagtctacaattttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttaagcattcccagt 277902  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    |  |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||    
T  277901 tttacactctgaggtgaccactcacaaaccaaactcatgtctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtct 277802  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  277801 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 277735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48574 - 48189
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  48574 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttatgactttcctcta 48475  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
    |||||||  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || | | | || ||||     
T  48474 aaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctctgtttc 48375  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| | ||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| || |||||     
T  48374 attaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgttgtgcctctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcctaactgt 48275  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacat 404  Q
    | |||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||| | || || || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  48274 atactctgaggcgacaactcacataccagactcaagtctctaaaccgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacat 48189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 32687 - 32220
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttcca 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  32687 tcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcacggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttcta 32588  T
Q  119 aaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttg 218  Q
     ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| || | | | ||||| |     
T  32587 gaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcattacaccctgatcatctaccttgaagtcactatcctcagtgtc 32488  T
Q  219 attactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgc 318  Q
    ||||| |  | |||| ||||| |||||||| |  || || || || || ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||     
T  32487 attaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacctgctgagcgtctcggatactgttcaagaaatcactattaatccgcaacatccccaactga 32388  T
Q  319 acactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttc 418  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||  || |  || || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || |    
T  32387 acactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtctctagactattctaacaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttgc 32288  T
Q  419 tactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32287 tgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 32220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18568 - 18116
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||    
T  18568 gaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttca 18469  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||  || | |||||| || || ||||| |  || ||||| | | ||||||| |||||||||  || ||     
T  18468 tctcatcatcgtcaggaatacaaattctgaatcgaaaacgcaacactccctgatcatcgattttaaaatcacaatcttcagtctgattactagaaaccaa 18369  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     || ||||||||||| || || | ||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||  || || | ||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  18368 caagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttttgtgatactattcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgac 18269  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    || ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18268 aattcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctg 18169  T
Q  434 caactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| |||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  18168 caacaacattagctttacctgaatgataattcaacccaaaatcacaatccttc 18116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 4806 - 5272
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  4806 acatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 4905  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || || ||||| |  || || || | | ||||||    
T  4906 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcag 5004  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  5005 tctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcatcattcccag 5104  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||| |  ||||| || ||||||    
T  5105 cttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcaactcaaacttttttaccatcatagtggacatatgcaacgtc 5204  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5205 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaacccaaaatcataatc 5272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 11936 - 12402
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  11936 acatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 12035  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || || ||||| |  || || || | | ||||||    
T  12036 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcag 12134  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||     
T  12135 tctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcatcattcccag 12234  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||| |  ||||| || ||||||    
T  12235 cttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcaactcaaacttttttaccatcatagtggacatatgcaacgtc 12334  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||    
T  12335 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaacccaaaatcataatc 12402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 32124 - 31658
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  32124 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcacatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagttacttctatgactctctt 32025  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | ||||||    
T  32024 caagaatca-tcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcag 31926  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| |||  |  || || ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || || | ||| ||||     
T  31925 tctgattactagcaactaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcattatcaatctttagcattcccag 31826  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || |||||| |  | |||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || ||||||    
T  31825 cttcacactttaagatgacaacttgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtc 31726  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||    
T  31725 ttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttacctggatgatagtttaaactaaaatcataatc 31658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12613 - 12428
Alignment:
Q  301 ttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccg 400  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||| |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||    || |    
T  12613 ttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattcaagcag 12514  T
Q  401 acatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  12513 acatatgcagcgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttc 12428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34278
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34123 acatcacgcttcaaaccagaccaccaaaaaagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttctt 34222  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaac 171  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34223 ccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaac 34278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7419
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  6958 ttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 7057  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | |||||||| || |  |||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  7058 ttttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccaaggtcatcgactttaaaatcaccatcttcagtttgattgct 7157  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || || ||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||  || |||| ||| ||||  | || ||||    
T  7158 agcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttttgtgcctctttaatacttttcaaaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcagactc 7257  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  7258 tgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgatcaagtaactcgaactctctaaccatcatagaggacatatgcaatgtcttactactca 7357  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  7358 aggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 7419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 79865 - 79399
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  79865 acatctcgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctctt 79766  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| ||||||    |||  || ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||    
T  79765 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaatttgatctcgtaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaattcaccttcttcagt 79666  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| | | || ||| || ||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||||||| || |      
T  79665 ctgattactagctaccaataagtctacaaacttgacatcaactttttgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcaacattcctagt 79566  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  79565 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgctcaagtaactcgaactctctaaccatcatggcggacatatgcaatgtct 79466  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  79465 ttctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 79399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 102168 - 102634
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  102168 acatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctctt 102267  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| | |  ||||||    
T  102268 caagaatcattttcttcatctcctcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactattttcagt 102367  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     | ||||||| ||| ||  ||||| |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||  | | |    
T  102368 ctcattactatcaaccaacaaatctacaaacttaacatcgactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatttctagc 102467  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| | |||||| || || || | |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| | ||| || || ||||    
T  102468 ttcacactctgagatgacaattcacagactaagctcaaatctataaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggcgggcatatgcaaagtct 102567  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  102568 tcctactcaatgcatctgcaacaaaattagctttacctggatgatagttcaaaccaaaatcataatc 102634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 486
Target Start/End: Original strand, 10501 - 10842
Alignment:
Q  145 tcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaa 244  Q
    ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||    
T  10501 tcagggatacaaattctgcctcggtatctcaacacaccttcatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaa 10600  T
Q  245 acttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaac 344  Q
    |||| || || ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  10601 acttaacatcaactttctgcgcttctttaatactgttcaagaattcactgttgatcttcaacatacacaacttcacactctgaggcgacaactcacaaac 10700  T
Q  345 aaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacatta 444  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |  |||||   ||||||||| ||||||    
T  10701 tagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtcttcccgctcaaaatatctgcaacaacatta 10800  T
Q  445 gctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10801 gctttacctggatgataattcaaaccaaaatcacagtccttc 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16075 - 15614
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  16075 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 15976  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  | |||| ||| || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | | | |  || | |||||     
T  15975 acttcttcaactcttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatccttggtatcattacc 15876  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
       | |||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||||||  | ||||    
T  15875 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttttgagcttctcggatactattcaagaagtcattatcaattttcaaccttcccaactatatactc 15776  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || | |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| |  || ||||| || || ||||| || ||||    
T  15775 tgagatgacaattcacagacaagactcatgtctctgaactgttctaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaaagtcttcctgctca 15676  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15675 aagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 15614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 100923 - 100474
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaata---ctcaagctactcttgtgacttt 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  100923 acatcacgcttcaaatcagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccagatgaataatacttaagctactcttgtgacttt 100824  T
Q  113 cttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttc 212  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||             |||||||| || | | | |     
T  100823 cttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaatacaaattcttcctctgaatctcaacac-------------accttgaagtcactatcctt 100737  T
Q  213 agtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacataccc 312  Q
    |||   ||||| | |||  || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||    
T  100736 agtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaattttcagcatcccc 100637  T
Q  313 aactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacg 412  Q
    || || | |||||  |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||  || ||||| || || |    
T  100636 aattgaatactctaaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctgaactgctctagcaaatcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatg 100537  T
Q  413 tctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaat 475  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  100536 tcttcctgctcaatgcatctgcaaccacattggctttaccatgatggtaattcaaaccaaaat 100474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 437
Target Start/End: Original strand, 181134 - 181555
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  181134 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 181233  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  181234 caagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcggcctcggaatttcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 181333  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||| || ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || || | ||| ||||      
T  181334 ctgattattagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatctttagcattcccagt 181433  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| | |||| | || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  181434 ttcacactctgagatgaccattcacaaactaagctcaaatctctcaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtct 181533  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaac 437  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  181534 tcctactcaaggcatctgcaac 181555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 50367 - 50837
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  50367 acatcacgtttcaatccagaccagcaaaataacttctttagatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 50466  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |   |||||||    
T  50467 caagaatcattttcttcatctcatcatcttctggaatacaaattctacctcgaaacctcaatacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagt 50566  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     |||||||||  || ||  || || |||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||  || |||| |||||| | |    
T  50567 ctgattactagtaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatactcttcagaaatacactatcaatcttcagcatacctagc 50666  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | ||||| ||| ||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  50667 ttcacactcttagatgacatctcacaaactaagctcaaatctttgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatgtgcaaagtct 50766  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||| || ||||||    
T  50767 tcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcgtagtccttc 50837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Original strand, 19573 - 20003
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || | ||||||||    
T  19573 ttcagatcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaa 19672  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| |   || || |||||||| ||    
T  19673 tacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaac 19772  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||  || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||| |||| ||| || |||| ||||| | ||||    
T  19773 atcaactttctgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacattctgaggtaaccactcacaaactaagctc 19872  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19873 atatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttac 19972  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  19973 ctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 20003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Original strand, 34997 - 35427
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || |  |||||||    
T  34997 ttcagatcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaa 35096  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | |||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| |   || || |||||||| ||    
T  35097 tacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaac 35196  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||  || |||||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||| |||| ||| || |||| ||||| | ||||    
T  35197 atcaactttctgtgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacattctgaggtaaccactcacaaactaagctc 35296  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35297 atatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttac 35396  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  35397 ctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 35427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4254
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||  ||||    
T  4724 acatcgcgtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgaccctctt 4625  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||||||    
T  4624 caagaatcattatcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcaaccttaaagtcaccatcttcagt 4525  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || | ||||||||| || ||||  || |||||| | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| |||| |    
T  4524 ctgattactagcaaccaacaagtctaaaaacttgacatcaactttctgtgcttctttgatactctttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagc 4425  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||| ||||| || ||  | |||||||  || ||||| |  || ||||    
T  4424 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgtttaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatattcaatgtct 4325  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4324 tcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 4254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 81194 - 80737
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  81194 ttcaaaccggaccgccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttcaagaatca 81095  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
    |  ||||||  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |   | || |||| |||||     
T  81094 actttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactgtcctctgtttcattacc 80995  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | |||||||  |||| || | |||||| |||||||| || |||||||  ||||||  |||||| |||||||| || |||| ||| |||||||  |  ||     
T  80994 agcaatcatcgaatcaaccagcttgacatccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactttattctt 80895  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    || ||  ||||||| || || || ||||  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||    
T  80894 tgaggctacaactcacataccagactcatgtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgtagtgtcttcctgctca 80795  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  80794 acgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 80737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 975
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1438 acatcacgtttcaacccagatcaccaaaacaactttttcagatcatgatatatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctctt 1339  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | || |||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||||||    
T  1338 caaatatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 1239  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| || | |    
T  1238 ctgattactagcaaccaaaaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattcctagc 1139  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| | ||||||||| || |  |  ||||||||||||||||| || |  || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  1138 ttcacactctgagatgacaactctcagaataaactcaaatctctaaactgttcgaacaattcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtct 1039  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||    
T  1038 tcctattcaaggcatctgctacaagattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcata 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 9905 - 10370
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||    
T  9905 acatcacgtttcagtccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatgaatgctcaagctacttctatgactctctt 10004  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||   | |||  |    
T  10005 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaattcttcctcagaatctcaacacaccttggtcatcgaccttaaagtcattatcttttg 10103  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || | ||||||||| || || ||||  ||||||| | ||||| | ||||  || || |||||||| || | ||| || |     
T  10104 tctgattactagcaaccaacaagtacacaaacttaacatcaactttctgcgcttatataata-ttttcagaaactcgctattgatctttagcatccctag 10202  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| || || |  |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||    
T  10203 cttcacactctgaggtgacacctcacagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcaactcgaactccttaaccatcatagcagacatatgtaaagtc 10302  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  10303 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatc 10370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 486
Target Start/End: Original strand, 15287 - 15517
Alignment:
Q  256 acttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaat 355  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  15287 acttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagt 15386  T
Q  356 ctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgg 455  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15387 ctctaaactgttctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacctcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccag 15486  T
Q  456 gtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15487 atggtaattcaacccaaaatcataatccttc 15517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 452
Target Start/End: Original strand, 4966 - 5402
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4966 acatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgattactcaagctacttttatgactctctt 5065  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||  || | |||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||||    
T  5066 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcag 5164  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||  ||| ||  || || |||||||| || || | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| | ||     
T  5165 tctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattctcag 5264  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||    
T  5265 cttcacactctgaggtgacaattcacagactaaactcaaatccctaaactgttcaagcaactcaaactctcttaccatcatagcggacatatgtaacgtc 5364  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5365 ttcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacc 5402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20812 - 20467
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20812 acatcacgcttcaacccagaccaccaaaaaagcttcttcaaatcaagatagatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttttt 20713  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || | | | | |||    
T  20712 ctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccatgatcatcaaccttaaagtcactatcctgagt 20613  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
       | ||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |  |||| ||| || |||    
T  20612 gccactaccagcaaccatcaaatcgacaaacttgacatccacttgctgtgcttcccggatactattcaagaaatcactgttaaacttcagcatccctaac 20513  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaa 361  Q
    || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20512 tgtacactctgaggtgtcaattcgcagacaagactcaagtctctaa 20467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16591 - 16505
Alignment:
Q  360 aaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    |||||||||||  |||||||| || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16591 aaactgctcaatcaactcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 16505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27617 - 27531
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  27617 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttatatgaccttcgtccaaaat 27531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 13403 - 13869
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  13403 acatcacatttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 13502  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||  || ||||    
T  13503 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacgccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtctccagt 13602  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||  ||  || ||||||||||| || |  | ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| || | ||| || | |    
T  13603 ctgattactagcatccaacaagtccacaaacttaacattaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcgatctttagcattcctagc 13702  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || || || |    
T  13703 ttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatggcggacatatgcaaagttt 13802  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||| |||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  13803 tcctgcttaaggcatctgcgacaacattagttttacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 13869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 16590 - 17055
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16590 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaataacttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 16689  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| | | |||| ||    
T  16690 caagaatcattttcttcatctca-catcgtctggaatgcaaattctacctcgaaacctcaagacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttctgt 16788  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || |||| ||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  ||| ||||||  || |||| ||| || |      
T  16789 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaccttaacatcaactttctgtgcttctttaatacttttcagaaatacactatcaatcttcagcattcctagg 16888  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | |||||  |||||||| |  ||||||||||||||||| || | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  16889 ttcacactcttagatgacatttcgcaaactaacctcaaatctctaaactgttccaataattcaaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtct 16988  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  16989 tcctactcaaagcatctgctacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatc 17055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 6482 - 6264
Alignment:
Q  235 aaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgaca 334  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6482 aaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaactggacactctgaggtgaca 6383  T
Q  335 actcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgc 434  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  6382 actcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaggaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgc 6283  T
Q  435 aactacattagctttaccc 453  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  6282 aaccacattagctttaccc 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10913 - 10695
Alignment:
Q  235 aaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgaca 334  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10913 aaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaactggacactctgaggtgaca 10814  T
Q  335 actcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgc 434  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  10813 actcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaggaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgc 10714  T
Q  435 aactacattagctttaccc 453  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10713 aaccacattagctttaccc 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6510
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttc 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6607 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttc 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11038 - 10941
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttc 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11038 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttc 10941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 6799
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  7262 acatcacgtttcaaccgagaccaccaaaacatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctt 7163  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||||  || | |||||| || || ||||| ||||| || ||   | ||||||    
T  7162 caagaatca-tcttcttcatttcatcatcgtaaggaatacaaattctacctcaaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcattatcttcag 7064  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | |||| |||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||   || |||| ||| || ||    
T  7063 tctgatcactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatactgttcaagaattcactaacaatcttcatcattcctaa 6964  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||  |||||||  ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| | ||| || || || | |||||| || ||||| ||||  |||    
T  6963 cttcacactctaaggtgacacttcgcagactaagctcaagtctctaaactgttcaagcagctccaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagtc 6864  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  6863 ttcctacttaatgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcata 6799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14568 - 14340
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |    
T  14568 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcct 14469  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  14468 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 14369  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaa 244  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  14368 ttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22747 - 22519
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |    
T  22747 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcct 22648  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | ||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||    
T  22647 ctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 22548  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaa 244  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  22547 ttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 22519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 14201
Alignment:
Q  350 tcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttt 449  Q
    |||| |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  14336 tcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaattcttttaccatcagagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtcttt 14237  T
Q  450 acccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14236 a-ctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 14201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22515 - 22380
Alignment:
Q  350 tcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttt 449  Q
    |||| |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  22515 tcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaattcttttaccatcagagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtcttt 22416  T
Q  450 acccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22415 a-ctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttc 22380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10361 - 9921
Alignment:
Q  42 aaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcg 141  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| | | ||||| ||||||    
T  10361 aaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgtatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatgtcatcg 10262  T
Q  142 ttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatcca 241  Q
    | ||||||||| |||||||||| || ||| | |||||| || || || || ||||| || || | | ||||||| || || | | |||| | |||||| |    
T  10261 tcgtcaggaatacaaattctgcttcggaatcgcaacactccctgatcgtcgaccttaaagtcactatcttcagtctggtttccaccaataaataaatcta 10162  T
Q  242 caaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgca 341  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || |||| ||| || |||| |||||||| ||||||||  || ||    
T  10161 caaactttacatccgctttttgcgcttctttaatactattcagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctagggtgacacttcaca 10062  T
Q  342 aacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactaca 441  Q
     || |  |||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || | |||||| || ||||| ||||  || || ||||| ||  |||||||||| |||    
T  10061 gactaaactcaaatctcaaaactgttcaagcagctccaattctttgatcatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaattcatctgcaacaaca 9962  T
Q  442 ttagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||| |||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  9961 ttggctatacctggatgataattcaacccaaaatcataatc 9921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 1843 - 2309
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1843 acatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttatagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctctt 1942  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||  || | |||||| || || |||||||| || || || | | | ||||    
T  1943 cgagaatc-atcttctttatctcatcattgtcaagaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcaactttaaagtcactatcctcag 2041  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| | | |||||| |||||| |||||||| |  |||  ||  || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  2042 tctgatttccaccaatcaataaatctacaaactttagatccgttttctgtgcttctttaatactgttcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaa 2141  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    ||  |||||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||  ||||||| ||  | | ||| || |  || |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  2142 cttgacactctgaggtgacaattcacaaacaaaactcaggtcaataaactgttcgtgcagctccaactttttaaccatcatagcagacatatgtaaagtt 2241  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| || || || ||||  || |||||||||||    
T  2242 ttcctacttaaagcatctgcaagaacattagctttacctggatgataattcagcccgaaatcataatc 2309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 116276 - 115810
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  116276 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctctt 116177  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||||    
T  116176 caagaatca-tcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcag 116078  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| | | |||| | | |||| |||||||| || || ||||  ||| | ||| |||||| | |||  ||||||||||  ||  ||| ||| || ||    
T  116077 tctgatttccaccaataaatgaatctacaaactttacatcaactttatgcacctctttaataccaatcataaattcactatcaatcatcagcattcctaa 115978  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| |||||||| || || || |  ||||  ||||||||||| || || | ||| |  || || | |||||| || ||||| ||||  ||     
T  115977 cttcacactctgaggtgacaattcacagactaaactcaggtctctaaactgttcgagcagctccagctctttgatcatcatagcggacatatgtagagtt 115878  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  115877 ttcctacttaaagcatctgcaacaacgttagccttacctggatgataattcaatccaaaatcataatc 115810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26315 - 25846
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||    
T  26315 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctctt 26216  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   |||||||    
T  26215 caagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 26116  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| |||  |  || || |||||||| || || ||||  || |||||| |||||||  | |  || |||||||  || |||||||| || | |    
T  26115 ctgattactagcaactaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatacttcttagaaactcactatcaatcttcaacattcctagc 26016  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||  | |||||  || || || |  ||||||||||||||||| || |  ||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  26015 ttcacactcttagatgacatttcacagactaaactcaaatctctaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtct 25916  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  25915 tcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatc-taatccttc 25846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 481
Target Start/End: Original strand, 3129 - 3594
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  3129 acatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 3228  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | |||||||| || |  |||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  3229 caagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattaaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 3328  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||  ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || |||||  | ||| | ||||  |||| |||||  || |||| ||| ||||      
T  3329 ctgattactggcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatagttttcagaaatttactatcaatcttcagcattcccagt 3428  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  3429 ttcacactctgagatgacaactcacaaactaagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtct 3528  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataat 481  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  3529 tcctactcgaggcatctgtaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15387
Alignment:
Q  154 caaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgt 253  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |  || ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || |    
T  15715 caaattctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 15616  T
Q  254 ccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaa 353  Q
    | | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||  | | ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |  |||||    
T  15615 caattttatgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatccttagcattcccaacttcacactctgaggggacaaatcgcaaactaaactcaa 15516  T
Q  354 atctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttaccc 453  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||      
T  15515 atctctaaaccgttcaagtaactcaaactcttttaccatcatagtggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacat 15416  T
Q  454 gggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||    
T  15415 ggatgataattcaacccaaaatcataatc 15387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15794 - 15738
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttc 72  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  15794 acatcatgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttc 15738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 177462 - 177170
Alignment:
Q  187 tcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaaga 286  Q
    |||||||||||||| ||   | ||||||| ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  177462 tcatcaaccttgaagtcattagcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttatgcttctttaatactgttcaaga 177363  T
Q  287 attcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattcctt 386  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||    
T  177362 attcactattgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggcgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgttctagcaattctaattcttt 177263  T
Q  387 caccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  177262 aaccatcatagcagacatatgtaacgtcttcctgcttaaagcttctgcaacgacattagccttacctggatgataattcaaaccaaagtcata 177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 8301 - 8767
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8301 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctctt 8400  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  8401 caagaatc-atcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcag 8499  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    |  |||  ||  |||  |  || ||||||||||| || || ||||  ||||||||  | ||||| ||||  | ||||||||  || |||| ||||||||     
T  8500 tccgatctcttgcaactaacaagtccacaaactttacatcaactttctgcgcttccttgatacttttcagaatttcactatcaatcttcagcatacccag 8599  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  8600 tttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 8699  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8700 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 8767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Original strand, 17634 - 18003
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||    
T  17634 gaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttca 17733  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |  || |||||   | ||||||| ||||||||| ||| ||     
T  17734 tctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcagaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcattatcttcagtctgattactagcaaccaa 17833  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     || ||||||||||| || || | ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || | ||| || | || |||||| || ||||||    
T  17834 caagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagcttcacactatgaggtgac 17933  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacat 404  Q
    || | ||| || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  17934 aa-ttgcatactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacat 18003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8458 - 7995
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| | ||||    
T  8458 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatctgcgtagctcccggatggatacttaagccacttctatgattctctt 8359  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || || || |   ||||||    
T  8358 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaactcactgtcttcag 8260  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || |  |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||  | |     
T  8259 tctgattactagcaaccaacaagtatacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatttctag 8160  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||| | |||||| || || || |  ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||  | ||||||||||||||||| || || ||     
T  8159 cttcacactctgagatgacaattcacatactaaactcaaatctctaaactgttcaaacaactcgaactctcttaccatcatggccgacatatgcaatgtt 8060  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||||||    
T  8059 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcata 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 7874 - 8340
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  7874 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 7973  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| || ||||| || |||||  | || |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||    
T  7974 caagaatca-tcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 8072  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||  ||| ||| ||  || ||||||||||| || || |||   || |||||  | ||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||||     
T  8073 tctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccag 8172  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| || || || ||  | |||||||| || ||||| || || |||    
T  8173 tttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtc 8272  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8273 ttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 32944 - 32478
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  32944 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcct 32845  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  |||||||    
T  32844 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagt 32745  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || | ||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  32744 ctgattactagcaaccaacaagtctagaaacttgacatcaactttttgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 32645  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| || || ||  ||||||| || || || |||||||  |  ||||| || |||||||    
T  32644 ttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctgaattgttccggtaactcgaactctttgaccatcaaagtggacatatgcaacgtct 32545  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  32544 ttctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 32478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 9531 - 9997
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  9531 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 9630  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  ||||| |    
T  9631 caagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcatt 9730  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  9731 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 9830  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||  |||||  | || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  9831 ttcactttctaaggtgatcattcacaaacgaaactcaattctctgaactgttcaggtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 9930  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||    
T  9931 tcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatc 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 66340 - 66806
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  66340 acatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacattttcgtagctcccagatggatactcaagctacttctatgactctctt 66439  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||  |||||||    
T  66440 caagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcaactttaaagtcaccgtcttcagt 66539  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
      |||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| |||| |    
T  66540 ccgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagc 66639  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||| ||||  |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  66640 ttcactctctaaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgtttaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 66739  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  66740 tcttgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaagtcataatc 66806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 39155 - 38725
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||||| | ||||| | | |||||||| || | ||||||||    
T  39155 ttcagatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgagtctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaa 39056  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | |||||||   ||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || | ||| |||||    
T  39055 tacaaattcgatctcggaatctcaacacaccatggtcatcaagcttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctaaaaaattgac 38956  T
Q  252 gtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctc 351  Q
     || ||||  || || ||| ||||||| || |  ||||||||||  || ||||  || ||||  | ||||||||| |||||| |||| || || | ||||    
T  38955 atcaactttctgtgcctctttaatactttttagaaattcactatcaatcttcagaattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacacactaagctc 38856  T
Q  352 aaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttac 451  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855 atatctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctacacaaggcatctgcaacaacattagctttac 38756  T
Q  452 ccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  38755 ctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 38725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19438 - 18972
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||    
T  19438 acatcacgtttcaatccagaccaccagaagatcttctttaaaccatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctatt 19339  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| || |||||||| || || || ||| |||||||    
T  19338 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaacctcaacgcaccatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagt 19239  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||| ||| || |||| ||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||  || ||||      
T  19238 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaactggacatcaactttttgtgcctcattaatactcttcaaaaattcactatcaatcttcagtattcccagt 19139  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||| | ||||| || || || ||  |  ||||||  |  ||||| || || || |    
T  19138 ttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcatatctctaaaccgttcaaggaattcgaactctctacccatcaaagtggacatatgcaatgtat 19039  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  19038 tcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 18972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 56952 - 57418
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  56952 acatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctctt 57051  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | |||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  |||||||    
T  57052 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgtaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagt 57151  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||  |  || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  57152 ctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactttctttgcctctttaatactcttcataaattcactatcaatcttcagcattcccagt 57251  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||  | ||||| |  || ||||| || || ||||    
T  57252 ttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctgaactgttcaagaaactcgaactctctgaccataaaagcggacatatgcaatgtct 57351  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  57352 tcctgctcaaagcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 57418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 196849 - 196383
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || || |    
T  196849 acatctcgtttcaatccagaccaccataaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatggctctcct 196750  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||  || |||||||| || || || ||| |||||||    
T  196749 caagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatacgacctcggaatctcaacacacgatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagt 196650  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  ||  |  || ||||||| ||||  |||||||||   || |||||||| ||||      
T  196649 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtacccctttaatacttttcagaaattcactaccaatcttcaacattcccagt 196550  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  196549 ttcacactctgaggtgaccactcacaaactaaactcatatctctaaattgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 196450  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  196449 tcctactcaaggcgtccgcgacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14450 - 13986
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14450 acatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctgtgactctctt 14351  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| || || ||||| ||||| || || | | ||||||    
T  14350 caagaatca-tcttcttcatctcatcatagtcaggaatacaaattctgcctcgaaaccgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcag 14252  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||| |   |||  | |||||| |||||||| || || ||||  ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||  || |||  ||| || ||    
T  14251 tctgatt-cccccaacaaataaatctacaaactttacatcgactttctgcgcttctttaatac-attaagaaattcactatcaatcttctgcattcctaa 14154  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||  ||||||||||| ||||| |  ||||  ||| ||||||| || || | ||| || || || | |||||| || ||||| ||||  ||     
T  14153 cttcacactctatggtgacaactcacaaactaaactcaggtctttaaactgttcgagcagctccaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagtt 14054  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  || || || ||||| |||||| |||||||    
T  14053 ttcctacttaaagcatctgcaacaacgttagctttactaggatgataattcaacccaaaaccataatc 13986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Original strand, 802 - 896
Alignment:
Q  19 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  802 tcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttc 896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 433
Target Start/End: Original strand, 16446 - 16632
Alignment:
Q  247 ttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaa 346  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| || || || |    
T  16446 ttgacatcaacttgttgtgcttctctgagactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacga 16545  T
Q  347 ggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || || |||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16546 gactcaagtctctaaactgttcgagcaattccaattcccttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtctttctactcaaggcatctg 16632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Original strand, 7127 - 7198
Alignment:
Q  24 cttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7127 cttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaa 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 486
Target Start/End: Original strand, 8344 - 8802
Alignment:
Q  28 aaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatc 127  Q
    ||||| |||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| | ||||| ||    
T  8344 aaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca-tc 8442  T
Q  128 ttt-tcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaa 226  Q
    ||  | |||||  | ||||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||| ||  |||| |  || |||||     ||||||| ||||  |||     
T  8443 ttcgtaatctctccattgtctggaatacaaattcttccttggaatctcaacacaccttgaccatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctag 8542  T
Q  227 caatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctg 326  Q
    ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  |  |||||  | ||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||||||||  | |||||||||    
T  8543 caaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctttgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctg 8642  T
Q  327 gggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaag 426  Q
     |||||| | |||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||    
T  8643 aggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctcaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaag 8742  T
Q  427 gcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8743 gcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttc 8802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Original strand, 49159 - 49293
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || || || ||||| | ||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||    
T  49159 atcatgatacatcttcgtatctgccggatgaatactcaagttacttttatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcattgtcgtcgggaatacaa 49258  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
    || |  ||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  49259 atccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 49293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 482
Target Start/End: Original strand, 25945 - 26375
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | | | |||||||| ||   || |||||    
T  25945 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcaccgttaggaa 26044  T
Q  152 tgcaaattctg-cctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttga 250  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| | || ||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||| || ||| ||  || |  |||||||| |    
T  26045 ttcaaat-ctgacctcggaatcttaacacatcatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattaatagcaaccaacaagtatacaaacttaa 26143  T
Q  251 cgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggct 350  Q
    | || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | |||| |||| |||||| | || |||||||  ||    
T  26144 catcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacaatctgaggtgaccaatcacaaacaaaact 26243  T
Q  351 caaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagcttta 450  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26244 catatctctaaactgataaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagcttta 26343  T
Q  451 cccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  26344 cctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 26375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 63354 - 62936
Alignment:
Q  64 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgc 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||||||| || | ||||||||| |||||||  |    
T  63354 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaattcaaattcgac 63255  T
Q  164 ctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttg 263  Q
    |||  || ||||||||||| ||||  || || || || || ||  ||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  ||    
T  63254 ctcgtaatctcaacacaccttgtttttcgactttaaagtcaccttcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctg 63155  T
Q  264 cgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaac 363  Q
     |||||  | ||||| | ||  ||||||||||  || |||| ||| ||||  |  ||||||||   |||  |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  63154 tgcttccttgatactttgcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagttttacactctgatatgagcactcacaaactaagctcaaatctctaaac 63055  T
Q  364 tgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagt 463  Q
    || ||||| ||||| ||  | || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || || || |    
T  63054 tgttcaagcaactcgaacactttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagacatctgcaacaacagtagctttacctggatgataat 62955  T
Q  464 tcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  62954 tcaaaccaaagtcataatc 62936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 308 - 486
Target Start/End: Original strand, 108857 - 109035
Alignment:
Q  308 tacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtg 407  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  || || |||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  108857 tacccaactgtacgctctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactaatctagaaactcaaaatcatttaccatcatagcagacatgtg 108956  T
Q  408 taacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
     |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  108957 caacgtcttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacccggatgttaattcaaaccaaaatcataatccttc 109035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 29813 - 29476
Alignment:
Q  145 tcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaa 244  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| | || || ||| ||||||| ||||||| | ||| ||  || || ||||    
T  29813 tcaggaatacaaattcgacctcggaatcttaacacaccatggtcatcgaccataaagtcaccatcttcagtctgattacaagcaaccaacaagtctacaa 29714  T
Q  245 acttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaac 344  Q
    ||||||| || ||||  || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||  || |||| |||  |||  | ||||||||| | |||| |||| |||||    
T  29713 acttgacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcaaaaattcactatcaatcttcagcatttccagtttcacactctgagatgaccactcacaaac 29614  T
Q  345 aaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacatta 444  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29613 taagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacatta 29514  T
Q  445 gctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  29513 gctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 29476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 27205 - 27377
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||||    
T  27205 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 27304  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacctt 197  Q
    |  | ||||  ||||| |  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  27305 acttcttcaaatcatcatgatcaggaatacaaactcttcctttgaacctcagcacaccctgatcatcaacctt 27377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 454
Target Start/End: Original strand, 6174 - 6594
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttca 133  Q
    |||||| |||||| ||| || | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| | | ||||    
T  6174 gaccactaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcatagctcccagatggatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcattttcttca 6273  T
Q  134 tctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcat 233  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| || ||||  ||| |||||||||| |  ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||||||| ||| ||     
T  6274 tctcatcattgtctagaatgcaaatcctacctcgaaacttcaacacacctttatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaa 6373  T
Q  234 taaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgac 333  Q
     || || |||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||| |||||| |||  ||  ||| ||| || | || |||||| |  | ||||    
T  6374 caagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatactcttcaaaaattcattatcaatcctcagcattcctagcttcacactttcagatgac 6473  T
Q  334 aactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctg 433  Q
    |  || ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||  ||||||| |||||||    
T  6474 atttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcatactcaaagcatctg 6573  T
Q  434 caactacattagctttacccg 454  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  6574 caacaacattagctttacccg 6594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2670
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact-ct---tgtgactttcttccaaa 120  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||   | ||||| | ||| | |    
T  2209 ttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgctacatcttcggagctcccggatgaatactcaagttacttctatatatgactctattcaaga 2308  T
Q  121 atcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgat 220  Q
    |||| | | |||||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| | | ||||||| ||||    
T  2309 atcattttcttcatctcgtcatcgtctggaagacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgat 2408  T
Q  221 tactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcac 320  Q
    ||||| ||| ||  || | ||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || ||||  || || | || |||    
T  2409 tactagcaaccaacaagtacacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatactcttcagaaattcattatcaatcttcagaattcctagcttcac 2508  T
Q  321 actctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttcta 420  Q
    ||| |  | |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||    
T  2509 actttcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactattcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttccta 2608  T
Q  421 ctcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||| ||||    
T  2609 ctcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcaaaatc 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Original strand, 34 - 171
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34 ctcaaatctctgaactattcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 133  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  134 tacccggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3828 - 3361
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  3828 acatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 3729  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | |||||   |||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||| ||  |||| |  || ||||| | |||||||||    
T  3728 caagaatcatctttttcatctcatcaccgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacgcaccttgagcatcgattttaaaatcactaccttcagt 3629  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgc-ttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
     |||||| || ||| ||  || || |||||||| || || ||||  |  || |||| ||||||| || | ||||| | |||  || || | ||| ||||     
T  3628 ctgattattagcaaccaccaagtctacaaacttaacatcaactttctatgctttctttaatactttttaggaatttattatcaatctttagcattcccag 3529  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
    || ||||||||  | ||| || ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| || | ||| || || |||||||| |  ||||| || || ||     
T  3528 cttcacactctatgatgaaaattcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaattaaaactctttaaccatcatagaagacatatgcaaagtt 3429  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || | |||||| |||||    
T  3428 ttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagtttaaactaaaatcgtaatc 3361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28702 - 28269
Alignment:
Q  57 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | |||| |||  | | || |||||| |||    
T  28702 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcaactctacatcgtaaggaatacaa 28603  T
Q  157 attctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtcca 256  Q
    || |  |||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || | ||||||||| || |    
T  28602 atccgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctataaacttgacatcaa 28503  T
Q  257 cttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaac-aag---gctca 352  Q
    ||| ||| || ||| ||||||| || |  |||||||| |  || || | ||| ||||  | ||||||||| |||||| |||| ||||| |||   |||||    
T  28502 ctttttgtgcctctttaatactttttagaaattcactttcaatctttagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctagctca 28403  T
Q  353 aatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
     | |||||||||| ||||| ||||  || ||  | |||||||| || ||||| || || ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28402 cagctctaaactgttcaagaaactagaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttccaactcaaggaatctgcaacaacattagctttacc 28303  T
Q  453 cgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
     || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  28302 tggatgataattgaaaccaaagtcataatccttc 28269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 452
Target Start/End: Original strand, 131051 - 131477
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | || || ||||| | |||||    
T  131051 ttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacctcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgcttctatggctctcttcaagaatca 131150  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||  |||||||  ||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| |||| |||    
T  131151 ttttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcact 131250  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || ||||||||||| || ||  |||  || || ||| ||||||| |||| ||||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||     
T  131251 agcaaccaacaagtccacaaacttaacatcagctttctgtgcctctttaatacttttca-gaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactt 131349  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |  |  |||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  131350 tcagacgacatctcacaccctaagctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggcagacatatgcaaggtcttcctactca 131449  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  131450 aagcatctgcaacaacattagctttacc 131477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 59696 - 59798
Alignment:
Q  22 cgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaa 121  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||    
T  59696 cgcttcaacccggaccaccaaaataacttcttaaaatcttgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccataa 59795  T
Q  122 tca 124  Q
    |||    
T  59796 tca 59798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 427 - 485
Target Start/End: Original strand, 60099 - 60157
Alignment:
Q  427 gcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  60099 gcatctgcaacaacattacccttacccggatggtaattcaatccgaaatcataatcctt 60157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 1611 - 1972
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||    
T  1611 acatcacgcttcaatccagaccatcaaaacaacatcttcaaatcatggtgcatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttcaatgactctctt 1710  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||| | |||  |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || || |  || ||||| |   ||||||    
T  1711 caagaatc-atcttcttcatctcatcatcgtctagaatacaaatccttcctctaaatctcaacacaccttgatcgtcgattttaaaatcactgtcttcag 1809  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| ||| ||  || ||||||||||| || || ||||  || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||||||| || ||    
T  1810 tctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcaacattcctaa 1909  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactc 377  Q
    || |||||| |  | ||||| ||| || || |  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  1910 cttcacactatcagatgacatctcacataccaaactcaaatctctaaaatgttcaagtaactc 1972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7454
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  6993 ttcaatccggaccaccaaaacaacttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 7092  T
Q  125 atctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattac 223  Q
     |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||  |||||||  ||||| || | ||| |  || ||||| |   ||| ||| |||| ||    
T  7093 -tcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcaaaacctcagtacaccttgattatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatcac 7191  T
Q  224 taacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacact 323  Q
    ||||||  |  || ||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| ||| || | || ||||||    
T  7192 taacaactaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgtgcctctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacact 7291  T
Q  324 ctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactc 423  Q
     |  | |||||  |  || || | |||||||||||| ||||  ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||||| ||||||    
T  7292 ttcagatgacatttaacacactaagctcaaatctctgaactattcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactc 7391  T
Q  424 aaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  7392 aaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttc 7454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3866 - 3544
Alignment:
Q  130 ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaa 229  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |  || | |||||   |||| |||||||||||  |||    
T  3866 ttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaatatcgctgtcttcggtttgattacttgcaa 3767  T
Q  230 tcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgggg 329  Q
     ||  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||  || |||| ||| || | || ||||||||  |     
T  3766 ccaagaagtcaacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaatacactatcaatcttcagcattcctagcttcacactcttaga 3667  T
Q  330 tgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggca 429  Q
    |||||  || || || |  ||||||||||| ||||| || |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||    
T  3666 tgacatttcacataccaaactcaaatctctgaactgttctaacaattcaaactcctttaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaagca 3567  T
Q  430 tctgcaactacattagctttacc 452  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3566 tctgcaacaacattagctttacc 3544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 295
Target Start/End: Original strand, 4075 - 4354
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  4075 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttggtagatcccaaatgaatactcaagctacttctatgactctctt 4174  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||  || |||| |||||| || ||||||||  | || || | | | ||||    
T  4175 ccaaaatc-atcttcttaatctcatcatcgtcatgaatacaaattcggcctcgaaatctcagcacaccttggtcatcaactctaaagtcactatcctcag 4273  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactat 295  Q
    | ||||||||| ||| ||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  4274 tctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactat 4354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 482
Target Start/End: Original strand, 4359 - 4513
Alignment:
Q  328 ggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaagg 427  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  4359 ggtgacaactcgcagactaagctcaaatccctaaattgttcaagaaactcaaactccttaaccatcatagcagacatatgtaaagtcttcctacttaagg 4458  T
Q  428 catctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
     ||| ||||| |||||||||||| |||  || || ||||| ||||||||||||||    
T  4459 tatccgcaacaacattagctttaaccgtttgataattcaacccaaaatcataatc 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 1828 - 2294
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| |  || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  1828 acatcacgtttcaacctagatcaccaaaataactttttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctt 1927  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcag 214  Q
      | |||| ||||| |||||||| || | |||  |||| |||||||| |||| ||| || |||||||| || ||||| |  || |||||     ||||||    
T  1928 tgagaatc-atcttcttcatctcctcatcgtctagaatacaaattctacctcggaatctgaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcag 2026  T
Q  215 tttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaa 314  Q
    | ||||||||| |||  |  || || |||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||  || |||| |||||| |     
T  2027 tctgattactagcaactaccaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcattatcaatcttcagcatacctag 2126  T
Q  315 ctgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtc 414  Q
     | ||||||||| | |||||| || || || |  |||| |||||| ||| | || |  || ||||| || || ||||||||||||||||| || || |||    
T  2127 tttcacactctgagatgacaattcacatactaaactcatatctctcaaccgttccaacaattcaaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtc 2226  T
Q  415 tttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | || ||| ||||  |||||||||||||    
T  2227 ttcctactcaaagcatctgctacaacattagctttacctagatgatagctcaactcaaaatcataatc 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14112
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  14573 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 14474  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||||  ||||||| |||||| || ||||| |  || || ||     |||||||||||| |||    
T  14473 ttttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaattcattgtcttcagtttgatcact 14374  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    | ||| ||  || ||||||||||| || ||  |||  || || ||| ||||||| ||||  || ||| |||  || |||| ||| || | || |||||      
T  14373 agcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttctgtgcctctttaatacttttcagaaactcattatcaatcttcagcattcctagcttcacacgt 14274  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |    |||||  || || || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || |  ||||| |||||||    
T  14273 tcatatgacatttcacacactaagctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcatggtcttcctactca 14174  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  14173 aagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttc 14112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19364 - 19198
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  19364 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 19265  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatc 191  Q
     | | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  19264 ttttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 19198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 640 - 795
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||| ||||| | |||||    
T  640 ttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaataatcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 739  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacaca 180  Q
     | | ||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||  ||||||||||||    
T  740 ttttcttcatctcatcgtcgtctggaatagaaatcctacctcgaaacctcaacaca 795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 964 - 1049
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgc 434  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  964 ctcaaatctcttaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatatgcaaggtcttcctacttaaagcatctgc 1049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7691 - 7561
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7691 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 7592  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    ||||||| || ||| ||||  ||||||||||    
T  7591 tacccggatgatagctcaactcaaaatcata 7561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 482
Target Start/End: Original strand, 24558 - 24868
Alignment:
Q  172 ctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctc 271  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  || || ||| ||||| | || |||| ||| |||||      
T  24558 ctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccagcaagtctacacacttgccatcaactttttgtgcttcct 24657  T
Q  272 taatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaag 371  Q
    | ||||| || |  ||||||||||  || |||| ||| ||||  | ||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24658 tgatactttttagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaactgttcaag 24757  T
Q  372 taactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagcca 471  Q
     ||||| || || || |||||||  || ||||| ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  24758 caactcgaactctttaaccatcaaagcggacatatgtagagtcttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaacca 24857  T
Q  472 aaatcataatc 482  Q
    || ||||||||    
T  24858 aagtcataatc 24868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 24451 - 24518
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    |||||||| || | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24451 gaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcctcgatgaattctcaagctact 24518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23319 - 23093
Alignment:
Q  253 tccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctca 352  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |  ||||    
T  23319 tccactttctgcgcttctttaatactattaaaaaattcactattaatcttcaacattcccaacttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactca 23220  T
Q  353 aatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    | | ||||||||  || || | ||| || || || |||||||| |  ||||| |||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23219 agtgtctaaactattcgagcagctccaactctttaaccatcataggagacatatgtaaaattttcctacttaaggcatctgcaaccacattaactttacc 23120  T
Q  453 cgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
     || || || ||||| |||||||||||    
T  23119 tggatgataattcaacccaaaatcata 23093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25090 - 25006
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctac 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  25090 acatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctccctaatgaatactcaagctac 25006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7693 - 7232
Alignment:
Q  25 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||| | |||||    
T  7693 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 7594  T
Q  125 atcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattact 224  Q
     | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||||||  ||||| || ||||| |  || ||||| |   ||||||| ||||  ||    
T  7593 ttttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatcctacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctct 7494  T
Q  225 aacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactc 324  Q
    ||||| ||  || || |||||||| || ||  |||  || || ||| ||||||| ||||  |||||| ||   || |||| ||| || | || ||||||     
T  7493 aacaaccaacaagtctacaaacttaacatcggctttatgtgcctctttaatacttttcagaaattcattaccaatcttcagcattcctagctacacactt 7394  T
Q  325 tggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactca 424  Q
    |    |||||  || || || |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||  || || ||||| |||||||    
T  7393 tcaaatgacatttcacacactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacaaatgcaaggtcttcctactca 7294  T
Q  425 aggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  7293 aagcgtctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttc 7232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3776 - 3310
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  3776 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctctt 3677  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagt 215  Q
    | | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| || || || || || || ||  ||||| |    
T  3676 caagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcatt 3577  T
Q  216 ttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaac 315  Q
     ||||||||| ||| ||  || || ||||||||||| || ||||  || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||  || |||| ||| ||||      
T  3576 ctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttaatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattcccagt 3477  T
Q  316 tgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtct 415  Q
    | |||  |||  |||||  | || ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||  | |||||||  || ||||| || || ||||    
T  3476 ttcactttctaaggtgatcattcacaaacgaaactcaattctctgaactgttcaggtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtct 3377  T
Q  416 ttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||    
T  3376 tcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatc 3310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 486
Target Start/End: Original strand, 13 - 367
Alignment:
Q  136 tcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcatta 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | || || | | | ||||| | |||||    | |||| |    
T  13 tcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccataaagtcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatca 112  T
Q  236 aatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttctctaatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaa 335  Q
    |||| |||||||| |  |||||||  || |||||||  ||||| |||||||| |||| ||  || |||| ||| |||||||| | |||||| |||||||     
T  113 aatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcacaataaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacag 212  T
Q  336 ctcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgta----acgtctttctactcaaggcatc 431  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||  || ||||| | ||    | || || || ||||| |||||    
T  213 ttcacagacaagactcaagtctctaaactgttatagcaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatatatgcaatgttttcctgctcaatgcatc 312  T
Q  432 tgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
     ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  313 agcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11550 - 11314
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttc 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  | | || ||||| |||    
T  11550 gaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtc-atcttcttc 11452  T
Q  133 atctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatca 232  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||| || | | |||||||  |||||||| ||| ||    
T  11451 atctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaacca 11352  T
Q  233 ttaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttct 270  Q
      |||||||||||||| || || ||||  |||||||||    
T  11351 acaaatccacaaacttaacatctactttctgcgcttct 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17742 - 17506
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttc 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  | | || ||||| |||    
T  17742 gaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtc-atcttcttc 17644  T
Q  133 atctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatca 232  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||| || | | |||||||  |||||||| ||| ||    
T  17643 atctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaacca 17544  T
Q  233 ttaaatccacaaacttgacgtccacttgttgcgcttct 270  Q
      |||||||||||||| || || ||||  |||||||||    
T  17543 acaaatccacaaacttaacatctactttctgcgcttct 17506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 305 - 142
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  305 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctctt 206  T
Q  116 ccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacac 179  Q
    | | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  205 caagaatc-atcttcttaatctcttcgttgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacac 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Original strand, 2704 - 2841
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  2704 ctcaaatctttgaactgttcaagtaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgtaaagtcttcctactcaaagcatccgcaacaacattaactt 2803  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    |||| || || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  2804 tacctggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttc 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Original strand, 2420 - 2487
Alignment:
Q  34 gaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2420 gaccaccaaaatagtttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatcaatacttaagctact 2487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1434
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1349 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 1434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4963 - 4855
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  4963 acatctcgctttaacccggaccaccaaaataacttcttcaaatcgtgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttctt 4864  T
Q  116 ccaaaatca 124  Q
    ||| |||||    
T  4863 ccagaatca 4855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3149 - 2950
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||  | | ||||||||    
T  3149 ttcagatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaa 3050  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcgccaccttcagtttgattactaacaatcattaaatccacaaacttgac 251  Q
    | ||||| |  |||| ||||||||||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||| | ||||||| ||| ||  || || |||||||||||    
T  3049 tacaaatccgacctcggaacctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtcttattactagcaaccaacaagtctacaaacttgac 2950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Original strand, 3309 - 3451
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  3309 acatcacgtttcaatccagaccaccagaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctctt 3408  T
Q  116 ccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaat 158  Q
    | | ||||| | | |||||||| || | ||| ||||| |||||    
T  3409 caagaatcattttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaat 3451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 85611 - 85421
Alignment:
Q  295 ttgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatca 394  Q
    ||||| |||||||| || || | ||||||||| || ||||  || ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  85611 ttgatcttcaacattcctaatttcacactctgcggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatca 85512  T
Q  395 tggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    | || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  85511 tagcagacatatgtaatgttttcctacttaaagcatctgcaataacattagtcttacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 85421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 85889 - 85782
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttctt 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||    
T  85889 acatctcgcttcaacccggaccaccaaataa-cttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggataaatactcaaattgcttatgtgactttctt 85791  T
Q  116 ccaaaatca 124  Q
    |||||||||    
T  85790 ccaaaatca 85782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 22802 - 22887
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802 acatctcgtttcaaaccagaccaccaaaaaattttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38982 - 38853
Alignment:
Q  353 aatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  38982 aatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatccaaggtcttcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacc 38883  T
Q  453 cgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  38882 cggatgatagctcaactcaaaatcataatc 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39218 - 39115
Alignment:
Q  72 cgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaac 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| | ||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||  |||    
T  39218 cgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaac 39119  T
Q  172 ctca 175  Q
    ||||    
T  39118 ctca 39115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 482
Target Start/End: Original strand, 1655 - 1819
Alignment:
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || |||||     
T  1655 cacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttc 1754  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1755 ctgctcaaggcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 482
Target Start/End: Original strand, 15395 - 15559
Alignment:
Q  318 cacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttt 417  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| || || |||||     
T  15395 cacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttc 15494  T
Q  418 ctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  15495 ctgctcaaggcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 15559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 28
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaa 151  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | | | |||||||| || | ||||||||    
T  158 ttcagatcatgaaacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcgtcaggaa 59  T
Q  152 tgcaaattctgcctctgaacctcaacacacc 182  Q
    | |||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  58 tacaaattcgacctcggaatctcaacacacc 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 27926 - 28055
Alignment:
Q  74 tagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacct 173  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||  |  |||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||    
T  27926 tagcccccgggtgaatactcaatctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcctcaattcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctgaatct 28025  T
Q  174 caacacaccgtgttcatcaaccttgaaatc 203  Q
    ||  ||||| |  ||||||| |||||||||    
T  28026 cagtacaccctaatcatcaatcttgaaatc 28055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 486
Target Start/End: Original strand, 28150 - 28338
Alignment:
Q  298 attttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatgg 397  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  || |  || |||||||| |||||||| |  |    
T  28150 attttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaacttttctaacaattcaaattctttcaccattaaag 28249  T
Q  398 ccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    | ||||| || || || || || ||||| |||||  |||| ||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28250 cagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcaacaaccacattggccttaccatgatggtaattcaagccaaaatcataatccttc 28338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8307
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  8220 ccaccaaaacagcctcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctttgaccttcgtccaaaatc 8307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 482
Target Start/End: Original strand, 96438 - 96565
Alignment:
Q  355 tctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccg 454  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  96438 tctctaaactgttccagaaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttcccg 96537  T
Q  455 ggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  96538 gatggtaattcaacccaaaatcataatc 96565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 482
Target Start/End: Original strand, 39824 - 39958
Alignment:
Q  348 gctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagct 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| | |||||  |  |||||||| |||||||||    
T  39824 gctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcccactcagagtgtctgcaacaacattagct 39923  T
Q  448 ttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    ||| |||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  39924 ttaaccggatgatagctcaactcaaaatcataatc 39958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 8725 - 8810
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 101  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8725 acatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtcatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctact 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3295 - 3207
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatca 124  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3295 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatca 3207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10336
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  10249 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctatgaccttcgtccaaaatc 10336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12967 - 12900
Alignment:
Q  412 gtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcata 479  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  12967 gtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcata 12900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 3140
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  3226 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 3140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 24349 - 24435
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  24349 ccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 24435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 482
Target Start/End: Original strand, 39647 - 39780
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctt 448  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||  | |||||||  || ||||| || || ||||| || ||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  39647 ctcaaatctctgaactgttcaagtaacttaaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttactgctcaaagcatcaacaacaacattagctt 39746  T
Q  449 tacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatc 482  Q
    |||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  39747 tacctggatgataattcaaaccaaagtcataatc 39780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 3497 - 3584
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  3497 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 3584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 15047 - 15118
Alignment:
Q  52 ttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  15047 ttcaaatcctggtacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 15118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 19002 - 19089
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  19002 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatc 19089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32764 - 32677
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| || ||||||    
T  32764 ccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttttatgaccttcgtctaaaatc 32677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 72144 - 72231
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatc 123  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  72144 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttatttgctcctggatgaatactcagactactcctgtgaccttcgtccaaaatc 72231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 13863 - 13949
Alignment:
Q  36 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaat 122  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  13863 ccaccaaaacaacctcttcaaatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaat 13949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 427 - 485
Target Start/End: Original strand, 343 - 401
Alignment:
Q  427 gcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatcctt 485  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  343 gcatctgcaacaacattagtcttacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 1800 - 1735
Alignment:
Q  421 ctcaaggcatctgcaactacattagctttacccgggtggtagttcaagccaaaatcataatccttc 486  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1800 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttc 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Original strand, 730 - 827
Alignment:
Q  349 ctcaaatctctaaactgctcaagtaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagc 446  Q
    ||||| |||| |||||||||||  || ||||| || || |||||||  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  730 ctcaagtctcgaaactgctcaaacaaatcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagc 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17908 - 17839
Alignment:
Q  16 acatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggat 85  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17908 acatcacgttttaacccagaccaccaaaacaacatcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggat 17839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 24008
Alignment:
Q  412 gtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacc 452  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24048 gtcttcctactcaaggcatctgcgacaacattagctttacc 24008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University