View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8610_low_15 (Length: 227)

Name: NF8610_low_15
Description: NF8610
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8610_low_15
NF8610_low_15
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (7-214)||(29888897-29889104)
chr5 (1-212)||(22888604-22888815)
chr5 (1-212)||(25199163-25199374)
chr5 (10-214)||(23892349-23892553)
chr5 (1-209)||(33877381-33877589)
chr5 (1-204)||(11325928-11326131)
chr5 (1-204)||(13184473-13184676)
chr5 (1-204)||(13440319-13440522)
chr5 (7-214)||(9548358-9548565)
chr5 (13-214)||(24687972-24688173)
chr5 (10-214)||(23752265-23752469)
chr5 (13-214)||(22998929-22999130)
chr5 (13-214)||(11549500-11549701)
chr5 (13-214)||(23717803-23718004)
chr5 (13-214)||(24970164-24970365)
chr5 (13-214)||(30934779-30934980)
chr5 (7-214)||(15658575-15658782)
chr5 (10-214)||(33777630-33777834)
chr5 (7-214)||(28649375-28649582)
chr5 (7-214)||(37671298-37671505)
chr5 (7-214)||(13324644-13324851)
chr5 (7-214)||(31431580-31431787)
chr5 (7-214)||(31826222-31826429)
chr5 (7-215)||(32599286-32599494)
chr5 (7-214)||(9317591-9317798)
chr5 (7-214)||(12132295-12132502)
chr5 (7-206)||(18500553-18500752)
chr5 (19-214)||(24681592-24681787)
chr5 (19-214)||(24724119-24724314)
chr5 (7-214)||(30152158-30152365)
chr5 (19-214)||(33516508-33516703)
chr5 (19-214)||(40473364-40473559)
chr5 (7-214)||(43078392-43078599)
chr5 (7-214)||(18375227-18375434)
chr5 (7-214)||(37358458-37358665)
chr5 (7-214)||(3789681-3789888)
chr5 (7-214)||(8665290-8665497)
chr5 (7-214)||(15758672-15758879)
chr5 (7-214)||(26480532-26480739)
chr5 (7-214)||(29966881-29967088)
chr5 (7-214)||(30029555-30029762)
chr5 (7-214)||(37755120-37755327)
chr5 (7-214)||(37770802-37771009)
chr5 (7-214)||(2511191-2511398)
chr5 (7-214)||(6874445-6874652)
chr5 (7-214)||(30168609-30168816)
chr5 (7-214)||(34616658-34616865)
chr5 (7-214)||(5638050-5638257)
chr5 (7-215)||(28959600-28959808)
chr5 (7-183)||(41674849-41675025)
chr5 (7-183)||(33292665-33292841)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-212)||(16207951-16208162)
chr1 (1-214)||(20340253-20340466)
chr1 (7-214)||(28151992-28152199)
chr1 (1-212)||(20461205-20461416)
chr1 (7-214)||(51638348-51638555)
chr1 (7-214)||(10962800-10963007)
chr1 (7-214)||(28585111-28585318)
chr1 (7-214)||(41793226-41793433)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-214)||(2576-2789)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-212)||(21703073-21703284)
chr2 (1-209)||(19456333-19456541)
chr2 (1-205)||(27118809-27119013)
chr2 (1-209)||(27393090-27393298)
chr2 (1-204)||(3784775-3784978)
chr2 (1-214)||(34303210-34303423)
chr2 (1-204)||(16163720-16163923)
chr2 (1-204)||(34157132-34157334)
chr2 (7-214)||(40233638-40233845)
chr2 (10-214)||(27434351-27434555)
chr2 (19-214)||(9349889-9350084)
chr2 (13-214)||(23128473-23128674)
chr2 (13-214)||(28882347-28882548)
chr2 (10-214)||(20838048-20838252)
chr2 (7-214)||(22925935-22926142)
chr2 (13-214)||(12655675-12655876)
chr2 (19-214)||(12586949-12587144)
chr2 (19-214)||(13936451-13936646)
chr2 (19-214)||(27777361-27777556)
chr2 (19-214)||(27817119-27817314)
chr2 (13-204)||(31891245-31891436)
chr2 (7-214)||(37375288-37375495)
chr2 (7-214)||(260660-260867)
chr2 (19-214)||(12716509-12716704)
chr2 (19-214)||(16829245-16829440)
chr2 (19-214)||(16892041-16892236)
chr2 (7-214)||(32049925-32050132)
chr2 (19-214)||(39051729-39051924)
chr2 (19-211)||(27803846-27804038)
chr2 (7-214)||(37925620-37925827)
chr2 (7-179)||(34286481-34286653)
chr2 (7-179)||(34291541-34291713)
chr2 (7-214)||(21677089-21677296)
chr2 (7-214)||(31876408-31876615)
chr2 (7-214)||(34861807-34862014)
chr2 (7-214)||(37685816-37686023)
chr2 (7-214)||(37701081-37701288)
chr2 (8-214)||(39890202-39890408)
chr2 (7-214)||(11635093-11635300)
chr2 (7-214)||(11641282-11641489)
chr2 (7-214)||(19416406-19416613)
chr2 (7-129)||(34279576-34279698)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (6-206)||(16449810-16450010)
chr7 (7-214)||(26484826-26485033)
chr7 (7-206)||(2108817-2109016)
chr7 (7-214)||(2775491-2775698)
chr7 (1-212)||(16041449-16041660)
chr7 (7-214)||(39210827-39211034)
chr7 (10-214)||(4200682-4200886)
chr7 (10-214)||(26682804-26683008)
chr7 (1-204)||(31088278-31088481)
chr7 (1-204)||(45733586-45733789)
chr7 (7-216)||(5128124-5128333)
chr7 (13-213)||(16518221-16518421)
chr7 (13-214)||(10916672-10916873)
chr7 (13-214)||(11424580-11424781)
chr7 (13-213)||(16503185-16503385)
chr7 (13-214)||(2154711-2154912)
chr7 (7-214)||(3445438-3445645)
chr7 (7-214)||(26274898-26275105)
chr7 (7-214)||(26435389-26435596)
chr7 (7-214)||(5147144-5147351)
chr7 (7-214)||(31564194-31564401)
chr7 (7-214)||(4144927-4145134)
chr7 (7-214)||(11441704-11441911)
chr7 (7-214)||(24592345-24592552)
chr7 (7-214)||(26537674-26537881)
chr7 (7-214)||(26319673-26319880)
chr7 (7-214)||(26669718-26669925)
chr7 (7-214)||(9618783-9618990)
chr7 (7-214)||(16736264-16736471)
chr7 (7-214)||(16751318-16751525)
chr7 (7-214)||(17523664-17523871)
chr7 (7-214)||(17529344-17529551)
chr7 (7-214)||(45387475-45387682)
chr7 (7-214)||(31125052-31125259)
chr7 (7-183)||(18540931-18541107)
chr7 (7-183)||(5159651-5159827)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-212)||(1838-2048)
scaffold0415 (7-206)||(6143-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-212)||(20513-20723)
scaffold0124 (19-214)||(30595-30790)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (7-214)||(14143146-14143353)
chr6 (7-214)||(26788072-26788279)
chr6 (7-214)||(27196445-27196652)
chr6 (7-214)||(27252588-27252795)
chr6 (1-209)||(13521939-13522147)
chr6 (1-214)||(22456795-22457008)
chr6 (1-214)||(27290231-27290444)
chr6 (1-204)||(33374127-33374330)
chr6 (1-204)||(28162779-28162982)
chr6 (1-204)||(8892182-8892384)
chr6 (1-204)||(8903417-8903619)
chr6 (7-211)||(16749982-16750186)
chr6 (10-214)||(22934741-22934945)
chr6 (10-214)||(23857186-23857390)
chr6 (13-214)||(24304479-24304680)
chr6 (13-214)||(24863851-24864052)
chr6 (13-214)||(26989135-26989336)
chr6 (7-214)||(29549603-29549810)
chr6 (13-214)||(13298812-13299013)
chr6 (10-214)||(27272441-27272645)
chr6 (7-214)||(26918508-26918715)
chr6 (13-200)||(27000207-27000394)
chr6 (13-214)||(15424178-15424379)
chr6 (7-215)||(27359852-27360060)
chr6 (7-215)||(27450195-27450403)
chr6 (7-214)||(4757892-4758099)
chr6 (7-214)||(4773134-4773341)
chr6 (7-214)||(16674267-16674474)
chr6 (7-214)||(4545636-4545843)
chr6 (7-214)||(29573141-29573348)
chr6 (19-214)||(30557877-30558072)
chr6 (7-214)||(34463207-34463414)
chr6 (7-214)||(3696209-3696416)
chr6 (19-214)||(4525426-4525621)
chr6 (7-214)||(4723995-4724202)
chr6 (19-214)||(17025417-17025612)
chr6 (7-214)||(27007855-27008062)
chr6 (7-214)||(28207582-28207789)
chr6 (13-209)||(20160835-20161031)
chr6 (13-209)||(22171800-22171996)
chr6 (7-214)||(26116271-26116478)
chr6 (7-214)||(29501543-29501750)
chr6 (7-215)||(26777475-26777683)
chr6 (7-214)||(27044515-27044723)
chr6 (7-214)||(16943888-16944095)
chr6 (1-108)||(22477240-22477347)
chr6 (85-214)||(17092301-17092430)
chr6 (7-214)||(27485257-27485464)
chr6 (64-214)||(27629561-27629711)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (7-214)||(31034076-31034283)
chr3 (7-214)||(32292844-32293051)
chr3 (1-209)||(16626470-16626678)
chr3 (1-212)||(18530474-18530685)
chr3 (1-205)||(5652473-5652677)
chr3 (1-204)||(4626030-4626233)
chr3 (1-204)||(17993753-17993956)
chr3 (7-204)||(5713319-5713516)
chr3 (7-204)||(5724229-5724426)
chr3 (7-204)||(5757051-5757248)
chr3 (7-204)||(5767942-5768139)
chr3 (13-214)||(8296070-8296271)
chr3 (13-214)||(15741053-15741254)
chr3 (13-214)||(18051360-18051561)
chr3 (7-214)||(22387537-22387744)
chr3 (13-214)||(15892665-15892866)
chr3 (10-214)||(6192411-6192615)
chr3 (7-214)||(29148714-29148921)
chr3 (13-214)||(18330767-18330968)
chr3 (13-214)||(4796612-4796813)
chr3 (13-214)||(8301226-8301427)
chr3 (7-214)||(4417011-4417218)
chr3 (7-214)||(7073304-7073511)
chr3 (7-214)||(11110308-11110515)
chr3 (7-214)||(28115913-28116120)
chr3 (19-214)||(29664929-29665124)
chr3 (13-214)||(35880864-35881065)
chr3 (7-214)||(8211830-8212037)
chr3 (7-214)||(10396225-10396432)
chr3 (7-214)||(28021367-28021574)
chr3 (7-214)||(48466019-48466226)
chr3 (7-214)||(4346646-4346853)
chr3 (7-214)||(18277011-18277218)
chr3 (7-214)||(18292312-18292519)
chr3 (7-214)||(18307613-18307820)
chr3 (19-214)||(20576806-20577001)
chr3 (10-214)||(4721726-4721930)
chr3 (7-214)||(5467077-5467284)
chr3 (7-214)||(21674785-21674992)
chr3 (7-214)||(22870815-22871022)
chr3 (7-214)||(22885874-22886081)
chr3 (7-214)||(36997036-36997243)
chr3 (7-214)||(51782115-51782322)
chr3 (7-214)||(51797205-51797412)
chr3 (7-214)||(5596316-5596523)
chr3 (7-214)||(6542421-6542628)
chr3 (7-214)||(31964432-31964639)
chr3 (7-214)||(50134030-50134237)
chr3 (7-214)||(5609281-5609488)
chr3 (19-214)||(17984915-17985110)
chr3 (7-214)||(18242831-18243038)
chr3 (7-214)||(24328251-24328458)
chr3 (7-214)||(28339394-28339601)
chr3 (7-214)||(5013804-5014011)
chr3 (7-214)||(7996654-7996861)
chr3 (7-214)||(10643162-10643369)
chr3 (7-214)||(47023545-47023752)
chr3 (7-214)||(18225283-18225490)
chr3 (7-183)||(32439246-32439422)
chr3 (7-183)||(20066135-20066311)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (6-212)||(1900402-1900608)
chr4 (1-212)||(15228010-15228221)
chr4 (7-209)||(15284851-15285053)
chr4 (1-204)||(24460533-24460736)
chr4 (1-209)||(14235448-14235656)
chr4 (1-179)||(15391291-15391469)
chr4 (10-214)||(17014149-17014353)
chr4 (13-214)||(14665170-14665371)
chr4 (13-214)||(24592232-24592433)
chr4 (7-214)||(36344433-36344640)
chr4 (7-214)||(5006019-5006226)
chr4 (7-214)||(6569999-6570206)
chr4 (7-214)||(14763222-14763429)
chr4 (7-214)||(18800531-18800738)
chr4 (7-214)||(31126436-31126643)
chr4 (7-214)||(27163235-27163442)
chr4 (7-214)||(33673716-33673923)
chr4 (7-214)||(40105556-40105763)
chr4 (8-214)||(14098688-14098894)
chr4 (19-214)||(21969859-21970054)
chr4 (7-214)||(54833533-54833740)
chr4 (7-214)||(30753900-30754107)
chr4 (19-214)||(39850796-39850991)
chr4 (7-183)||(34188909-34189085)
chr4 (7-183)||(24112808-24112984)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (7-214)||(18710717-18710924)
chr8 (10-214)||(16283583-16283787)
chr8 (1-204)||(44563226-44563427)
chr8 (1-205)||(19658926-19659129)
chr8 (1-179)||(22080790-22080968)
chr8 (13-214)||(27608782-27608983)
chr8 (1-205)||(33244790-33244994)
chr8 (13-214)||(19688235-19688436)
chr8 (13-214)||(14557761-14557962)
chr8 (13-214)||(16277691-16277892)
chr8 (7-214)||(12092601-12092808)
chr8 (13-214)||(2137136-2137337)
chr8 (7-214)||(3329384-3329591)
chr8 (7-214)||(19674572-19674779)
chr8 (19-214)||(29829465-29829660)
chr8 (7-214)||(31489627-31489834)
chr8 (38-214)||(189256-189432)
chr8 (7-214)||(19286593-19286800)
chr8 (7-214)||(31354655-31354862)
chr8 (1-214)||(9354747-9354961)
chr8 (7-214)||(19208237-19208444)
chr8 (7-214)||(28361832-28362039)
chr8 (7-214)||(33258854-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-159)||(1-159)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-214)||(39987-40188)
scaffold0089 (13-214)||(46903-47104)
scaffold0089 (13-214)||(29900-30101)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (22-214)||(536-728)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (13-213)||(27429-27629)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-179)||(21686-21864)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-214)||(47-248)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (7-214)||(9697-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (7-214)||(7157-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (7-214)||(26119-26326)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (7-214)||(8080-8287)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (7-214)||(14848-15055)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (7-214)||(8984-9191)
scaffold0159 (7-214)||(20146-20353)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (13-170)||(46764-46927)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (64-214)||(277-427)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29889104 - 29888897
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29889104 tctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29889005  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29889004 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagact 29888905  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29888904 tgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22888604 - 22888815
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22888604 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 22888703  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888704 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 22888803  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
     ||||| |||||    
T  22888804 tagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 25199163 - 25199374
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25199163 ttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatc 25199262  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25199263 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccc 25199362  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    ||||||||||||    
T  25199363 cagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 23892349 - 23892553
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892349 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 23892448  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892449 taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 23892548  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  23892549 tgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33877381 - 33877589
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  33877381 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 33877480  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877481 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33877580  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    | |||||||    
T  33877581 cggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11325928 - 11326131
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11325928 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaacc 11326027  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326028 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  11326128 caga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13184676 - 13184473
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  13184676 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13184577  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184576 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  13184476 caga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13440522 - 13440319
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  13440522 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13440423  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440422 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  13440322 caga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9548565 - 9548358
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  9548565 tctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 9548466  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9548465 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9548366  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  9548365 tgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24688173 - 24687972
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24688173 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 24688074  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24688073 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24687974  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  24687973 cc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23752469 - 23752265
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  23752469 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23752370  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23752369 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23752270  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  23752269 tgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22999130 - 22998929
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22999130 ctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 22999031  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22999030 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 22998931  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  22998930 cc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 11549500 - 11549701
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11549500 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11549599  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11549600 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgt 11549699  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  11549700 cc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23718004 - 23717803
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23718004 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23717905  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23717904 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 23717805  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  23717804 cc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 24970164 - 24970365
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24970164 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcgga 24970263  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  24970264 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgt 24970363  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  24970364 cc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 30934779 - 30934980
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30934779 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 30934878  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30934879 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 30934978  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  30934979 cc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15658782 - 15658575
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  15658782 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 15658683  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| |||||    
T  15658682 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagact 15658583  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  15658582 tgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 33777630 - 33777834
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||     
T  33777630 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagc 33777729  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  33777730 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 33777829  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  33777830 tgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28649375 - 28649582
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  28649375 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28649474  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28649475 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28649574  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28649575 tgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37671505 - 37671298
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  37671505 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37671406  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37671405 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37671306  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37671305 tgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13324851 - 13324644
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13324851 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 13324752  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  13324751 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 13324652  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  13324651 tgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 31431580 - 31431787
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31431580 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31431679  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31431680 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31431779  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31431780 tgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31826429 - 31826222
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31826429 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 31826330  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  31826329 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 31826230  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31826229 tgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32599494 - 32599286
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  32599494 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32599395  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||| || |||||    
T  32599394 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagact 32599295  T
Q  207 tgatgtcca 215  Q
    |||||||||    
T  32599294 tgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 9317591 - 9317798
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9317591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9317690  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  9317691 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 9317790  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  9317791 tgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 12132295 - 12132502
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  12132295 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 12132394  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  12132395 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 12132494  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  12132495 tgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18500752 - 18500553
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18500752 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18500653  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18500652 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 24681592 - 24681787
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24681592 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24681691  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24681692 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 24724119 - 24724314
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24724119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24724218  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24724219 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 30152158 - 30152365
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  30152158 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30152257  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30152258 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30152357  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  30152358 tgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 33516508 - 33516703
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33516508 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 33516607  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33516608 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40473559 - 40473364
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40473559 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 40473460  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  40473459 agaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 43078392 - 43078599
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  43078392 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 43078491  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  43078492 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 43078591  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  43078592 tgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18375434 - 18375227
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  18375434 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 18375335  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  18375334 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18375235  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18375234 tgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37358665 - 37358458
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37358665 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 37358566  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37358565 agctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37358466  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37358465 tgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 3789681 - 3789888
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  3789681 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 3789780  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  3789781 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 3789880  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  3789881 tgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8665497 - 8665290
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  8665497 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 8665398  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  8665397 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 8665298  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  8665297 tgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15758879 - 15758672
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  15758879 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 15758780  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  15758779 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 15758680  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  15758679 tgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 26480532 - 26480739
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26480532 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26480631  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26480632 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26480731  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26480732 tgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29967088 - 29966881
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29967088 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29966989  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  29966988 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 29966889  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29966888 tgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 30029555 - 30029762
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  30029555 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30029654  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  30029655 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 30029754  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  30029755 tgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 37755120 - 37755327
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  37755120 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37755219  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37755220 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37755319  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37755320 tgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37771009 - 37770802
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  37771009 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaa 37770910  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||| | |||||    
T  37770909 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagact 37770810  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37770809 tgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 2511191 - 2511398
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  2511191 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 2511290  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  2511291 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 2511390  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  2511391 tgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 6874445 - 6874652
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |    
T  6874445 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaaggga 6874544  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6874545 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6874644  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  6874645 tgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 30168609 - 30168816
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  30168609 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 30168708  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| |||||    
T  30168709 agctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagact 30168808  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  30168809 tgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 34616658 - 34616865
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  34616658 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 34616757  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  34616758 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 34616857  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  34616858 tgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 5638050 - 5638257
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  5638050 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5638149  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  5638150 agctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 5638249  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5638250 tgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28959808 - 28959600
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  28959808 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 28959709  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||  |||| |||||    
T  28959708 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagact 28959609  T
Q  207 tgatgtcca 215  Q
    |||||||||    
T  28959608 tgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 41674849 - 41675025
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  41674849 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 41674948  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41674949 agctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 33292665 - 33292841
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  33292665 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 33292764  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  33292765 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16208162 - 16207951
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16208162 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 16208063  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16208062 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 16207963  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    ||||||||||||    
T  16207962 cagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20340466 - 20340253
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  20340466 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 20340367  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340366 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 20340267  T
Q  201 cagacttgatgtcc 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  20340266 cagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28151992 - 28152199
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28151992 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 28152091  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28152092 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggact 28152191  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  28152192 tgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20461205 - 20461416
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  20461205 ttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 20461304  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20461305 aaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcg 20461404  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    ||||||||||||    
T  20461405 cagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 51638348 - 51638555
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  51638348 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 51638447  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51638448 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51638547  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  51638548 tgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10962800 - 10963007
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  10962800 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 10962899  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  10962900 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagact 10962999  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  10963000 tgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28585111 - 28585318
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  28585111 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28585210  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28585211 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28585310  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28585311 tgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41793433 - 41793226
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |    
T  41793433 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaaggga 41793334  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  41793333 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 41793234  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  41793233 tgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2789 - 2576
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  2789 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 2690  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2689 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 2590  T
Q  201 cagacttgatgtcc 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  2589 cagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21703284 - 21703073
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21703284 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 21703185  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703184 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 21703085  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    |||||| |||||    
T  21703084 cagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19456541 - 19456333
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  19456541 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 19456442  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19456441 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 19456342  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  19456341 cagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27118809 - 27119013
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  27118809 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 27118908  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118909 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 27119008  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  27119009 cagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27393090 - 27393298
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27393090 ttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatc 27393189  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||| |||    
T  27393190 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcc 27393289  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    ||| |||||    
T  27393290 cagtcttga 27393298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 3784775 - 3784978
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  3784775 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 3784874  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784875 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  3784975 caga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34303423 - 34303210
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  34303423 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 34303324  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303323 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34303224  T
Q  201 cagacttgatgtcc 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34303223 cagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16163720 - 16163923
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  16163720 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 16163819  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163820 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  16163920 caga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 34157132 - 34157334
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  34157132 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 34157230  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157231 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  34157331 caga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 40233638 - 40233845
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  40233638 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 40233737  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  40233738 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 40233837  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  40233838 tgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27434555 - 27434351
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  27434555 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 27434456  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27434455 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27434356  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  27434355 tgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9350084 - 9349889
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9350084 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 9349985  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9349984 agaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtcc 9349889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23128674 - 23128473
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23128674 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23128575  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23128574 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 23128475  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  23128474 cc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 28882347 - 28882548
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28882347 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 28882446  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28882447 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 28882546  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  28882547 cc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 20838048 - 20838252
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  20838048 gaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 20838147  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20838148 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 20838247  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  20838248 tgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22926142 - 22925935
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  22926142 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 22926043  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22926042 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 22925943  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  22925942 tgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 12655675 - 12655876
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12655675 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 12655774  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12655775 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 12655874  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  12655875 cc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 12586949 - 12587144
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12586949 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 12587048  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12587049 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13936646 - 13936451
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13936646 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 13936547  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13936546 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 27777361 - 27777556
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27777361 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27777460  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27777461 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 27817119 - 27817314
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27817119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27817218  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27817219 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31891436 - 31891245
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  31891436 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 31891337  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    | ||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891336 cctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 37375288 - 37375495
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37375288 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 37375387  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | || ||||||||| |||||    
T  37375388 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagact 37375487  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37375488 tgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 260867 - 260660
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  260867 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 260768  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||| ||| |||||    
T  260767 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagact 260668  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  260667 tgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12716704 - 12716509
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12716704 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 12716605  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12716604 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16829440 - 16829245
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16829440 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16829341  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16829340 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 16892041 - 16892236
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16892041 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16892140  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16892141 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 32049925 - 32050132
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  32049925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32050024  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| ||| |||||    
T  32050025 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagact 32050124  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  32050125 tgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39051924 - 39051729
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39051924 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 39051825  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39051824 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Original strand, 27803846 - 27804038
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27803846 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27803945  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatg 211  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||    
T  27803946 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 37925620 - 37925827
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37925620 tctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37925719  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37925720 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37925819  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37925820 tgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 34286481 - 34286653
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  34286481 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34286580  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286581 agctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 34291541 - 34291713
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  34291541 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34291640  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291641 agctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21677296 - 21677089
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  21677296 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 21677197  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  21677196 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 21677097  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  21677096 tgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 31876408 - 31876615
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  31876408 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31876507  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  31876508 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 31876607  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31876608 tgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 34861807 - 34862014
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  34861807 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 34861906  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  34861907 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 34862006  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
     |||||||    
T  34862007 agatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37686023 - 37685816
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37686023 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37685924  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37685923 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37685824  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37685823 tgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37701288 - 37701081
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37701288 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37701189  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37701188 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37701089  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  37701088 tgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 39890202 - 39890408
Alignment:
Q  8 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 107  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||| |||| || || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  39890202 ctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaa 39890301  T
Q  108 gttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 207  Q
    | ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  39890302 gctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 39890401  T
Q  208 gatgtcc 214  Q
    |||||||    
T  39890402 gatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11635300 - 11635093
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  11635300 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaaggga 11635201  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  11635200 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 11635101  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  11635100 tgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11641489 - 11641282
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  11641489 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaaggga 11641390  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  11641389 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 11641290  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  11641289 tgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19416613 - 19416406
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |    
T  19416613 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaaggga 19416514  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  19416513 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 19416414  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  19416413 tgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 34279576 - 34279698
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  34279576 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34279675  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtc 129  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  34279676 agctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16450010 - 16449810
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaagga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16450010 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggga 16449911  T
Q  106 aagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 aagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 16449811  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  16449810 t 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 26484826 - 26485033
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26484826 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26484925  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26484926 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26485025  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  26485026 tgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2109016 - 2108817
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2109016 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2108917  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108916 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 2775491 - 2775698
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2775491 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2775590  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2775591 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2775690  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  2775691 tgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16041449 - 16041660
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16041449 ttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatc 16041548  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041549 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcc 16041648  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    |||||| |||||    
T  16041649 cagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39211034 - 39210827
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39211034 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 39210935  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39210934 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 39210835  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  39210834 tgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200886
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  210 tgtcc 214  Q
     ||||    
T  4200882 cgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682804
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || ||||| || |||||||| |    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T
Q  210 tgtcc 214  Q
     ||||    
T  26682808 cgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31088481 - 31088278
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  31088481 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 31088382  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088381 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  31088281 caga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45733586 - 45733789
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  45733586 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 45733685  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733686 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  45733786 caga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 5128124 - 5128333
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  5128124 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 5128223  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  5128224 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 5128323  T
Q  207 tgatgtccat 216  Q
    ||||||||||    
T  5128324 tgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16518421 - 16518221
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518421 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 16518322  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16518321 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16518222  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  16518221 c 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10916873 - 10916672
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10916873 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 10916774  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10916773 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 10916674  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  10916673 cc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11424781 - 11424580
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11424781 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11424682  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  11424681 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgt 11424582  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  11424581 cc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16503385 - 16503185
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16503385 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16503286  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16503285 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16503186  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  16503185 c 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 2154711 - 2154912
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2154711 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 2154810  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2154811 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 2154910  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  2154911 cc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 3445438 - 3445645
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3445438 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 3445537  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  3445538 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 3445637  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  3445638 tgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26275105 - 26274898
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26275105 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26275006  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  26275005 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 26274906  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26274905 tgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 26435389 - 26435596
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26435389 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26435488  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26435489 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26435588  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26435589 tgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5147351 - 5147144
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  5147351 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 5147252  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  5147251 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 5147152  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5147151 tgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31564401 - 31564194
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31564401 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31564302  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31564301 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31564202  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31564201 tgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4145134 - 4144927
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  4145134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 4145035  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  4145034 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 4144935  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4144934 tgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 11441704 - 11441911
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  11441704 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 11441803  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  11441804 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 11441903  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  11441904 tgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24592552 - 24592345
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  24592552 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 24592453  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  24592452 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 24592353  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  24592352 tgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26537881 - 26537674
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  26537881 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 26537782  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26537781 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26537682  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26537681 tgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26319880 - 26319673
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26319880 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26319781  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26319780 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26319681  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26319680 tgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26669925 - 26669718
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26669925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26669826  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26669825 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26669726  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26669725 tgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 9618783 - 9618990
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9618783 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9618882  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  9618883 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 9618982  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  9618983 tgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16736471 - 16736264
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  16736471 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16736372  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  16736371 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 16736272  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  16736271 tgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16751525 - 16751318
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  16751525 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16751426  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  16751425 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 16751326  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  16751325 tgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 17523664 - 17523871
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  17523664 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17523763  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  17523764 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 17523863  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  17523864 tgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17529551 - 17529344
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  17529551 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17529452  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  17529451 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 17529352  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  17529351 tgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 45387475 - 45387682
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  45387475 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 45387574  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  45387575 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggct 45387674  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  45387675 tgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 31125052 - 31125259
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |    
T  31125052 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaaggga 31125151  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31125152 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31125251  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31125252 tgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 18540931 - 18541107
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  18540931 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 18541030  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18541031 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 5159651 - 5159827
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||  | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  5159651 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 5159750  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  5159751 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1838
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2048 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 1949  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1948 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 1850  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    |||||| |||||    
T  1849 cagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 6143 - 6344
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt-gaaatacattgtgaagaagctcattgatcaagg 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  6143 tctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaggg 6242  T
Q  105 aaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||    
T  6243 aaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaga 6342  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  6343 ct 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20723
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20513 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 20612  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20613 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 20711  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    |||||| |||||    
T  20712 cagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 30595 - 30790
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30595 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30694  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30695 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14143353 - 14143146
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14143353 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 14143254  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14143253 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 14143154  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  14143153 tgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 26788072 - 26788279
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26788072 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26788171  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26788172 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26788271  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  26788272 tgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27196445 - 27196652
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27196445 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27196544  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27196545 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27196644  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  27196645 tgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27252795 - 27252588
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27252795 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27252696  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27252695 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27252596  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  27252595 tgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13522147 - 13521939
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  13522147 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 13522048  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522047 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13521948  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    | |||||||    
T  13521947 cggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22457008 - 22456795
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  22457008 ttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagacc 22456909  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22456908 aaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcc 22456809  T
Q  201 cagacttgatgtcc 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22456808 cagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27290444 - 27290231
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27290444 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 27290345  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290344 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcc 27290245  T
Q  201 cagacttgatgtcc 214  Q
     |||||||||||||    
T  27290244 tagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33374330 - 33374127
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  33374330 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33374231  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374230 aaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  33374130 caga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28162779 - 28162982
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  28162779 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 28162878  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162879 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  28162979 caga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8892384 - 8892182
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  8892384 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 8892286  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8892285 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  8892185 caga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8903619 - 8903417
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  8903619 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 8903521  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8903520 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  8903420 caga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 16749982 - 16750186
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16749982 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 16750081  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  16750082 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 16750181  T
Q  207 tgatg 211  Q
    |||||    
T  16750182 tgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22934945 - 22934741
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  22934945 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 22934846  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22934845 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22934746  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  22934745 tgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23857390 - 23857186
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  23857390 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23857291  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23857290 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23857191  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  23857190 tgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24304680 - 24304479
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24304680 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24304581  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24304580 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24304481  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  24304480 cc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 24863851 - 24864052
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24863851 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24863950  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24863951 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24864050  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  24864051 cc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 26989135 - 26989336
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26989135 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctga 26989234  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26989235 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 26989334  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  26989335 cc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 29549603 - 29549810
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  29549603 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29549702  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||    
T  29549703 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggact 29549802  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29549803 tgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13299013 - 13298812
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13299013 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 13298914  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13298913 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 13298814  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  13298813 cc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27272645 - 27272441
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||     
T  27272645 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagc 27272546  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27272545 tgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttga 27272446  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  27272445 tgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 26918508 - 26918715
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26918508 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaa 26918607  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  26918608 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 26918707  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26918708 tgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 27000207 - 27000394
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27000207 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 27000306  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000307 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15424379 - 15424178
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15424379 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 15424280  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15424279 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15424180  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  15424179 cc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27360060 - 27359852
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27360060 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27359961  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27359960 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27359861  T
Q  207 tgatgtcca 215  Q
    |||||||||    
T  27359860 tgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27450403 - 27450195
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27450403 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27450304  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27450303 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27450204  T
Q  207 tgatgtcca 215  Q
    |||||||||    
T  27450203 tgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 4757892 - 4758099
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4757892 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4757991  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4757992 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4758091  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4758092 tgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 4773134 - 4773341
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4773134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4773233  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4773234 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4773333  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4773334 tgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 16674267 - 16674474
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  16674267 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16674366  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  16674367 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 16674466  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  16674467 tgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4545843 - 4545636
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4545843 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4545744  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4545743 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4545644  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4545643 tgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 29573141 - 29573348
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29573141 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29573240  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  29573241 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 29573340  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29573341 tgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30558072 - 30557877
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30558072 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30557973  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30557972 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34463414 - 34463207
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34463414 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 34463315  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  34463314 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 34463215  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  34463214 tgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 3696209 - 3696416
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  3696209 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 3696308  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  3696309 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagact 3696408  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  3696409 tgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 4525426 - 4525621
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4525426 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 4525525  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4525526 agaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4724202 - 4723995
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4724202 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaa 4724103  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4724102 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4724003  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4724002 tgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 17025417 - 17025612
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17025417 tgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 17025516  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  17025517 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27007855 - 27008062
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  27007855 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaa 27007954  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||    
T  27007955 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagact 27008054  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  27008055 tgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28207582 - 28207789
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28207582 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 28207681  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28207682 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28207781  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28207782 tgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20160835 - 20161031
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||    
T  20160835 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctga 20160934  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20160935 ctttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22171996 - 22171800
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||    
T  22171996 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctga 22171897  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171896 ctttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26116478 - 26116271
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26116478 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26116379  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26116378 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26116279  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26116278 tgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 29501543 - 29501750
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  29501543 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 29501642  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  29501643 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 29501742  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29501743 tgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26777683 - 26777475
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  26777683 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 26777584  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||  ||| |||||    
T  26777583 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagact 26777484  T
Q  207 tgatgtcca 215  Q
    |||||||||    
T  26777483 tgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27044515 - 27044723
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct-atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaagga 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || | |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||     
T  27044515 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggg 27044614  T
Q  106 aagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  27044615 aagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 27044714  T
Q  206 ttgatgtcc 214  Q
    |||||||||    
T  27044715 ttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16944095 - 16943888
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  16944095 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 16943996  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  16943995 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 16943896  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  16943895 tgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22477347 - 22477240
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  22477347 ttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagacc 22477248  T
Q  101 aaggaaag 108  Q
    ||||||||    
T  22477247 aaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092301
Alignment:
Q  85 aagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagg 184  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  185 tatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 27485257 - 27485464
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  27485257 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 27485356  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  27485357 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 27485456  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  27485457 tgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27629711 - 27629561
Alignment:
Q  64 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacg 163  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||||  | || |    
T  27629711 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 27629612  T
Q  164 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  27629611 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 27629561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31034283 - 31034076
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31034283 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 31034184  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31034183 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 31034084  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  31034083 tgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 32292844 - 32293051
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32292844 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 32292943  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32292944 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 32293043  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  32293044 tgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16626678 - 16626470
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  16626678 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 16626579  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626578 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16626479  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  16626478 cagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18530474 - 18530685
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  18530474 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 18530573  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530574 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcc 18530673  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    ||||||| ||||    
T  18530674 cagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5652473 - 5652677
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  5652473 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 5652572  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5652573 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 5652672  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  5652673 cagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4626030 - 4626233
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  4626030 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 4626129  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4626130 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 4626229  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  4626230 caga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17993956 - 17993753
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  17993956 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 17993857  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993856 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  17993756 caga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 5713319 - 5713516
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  5713319 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5713418  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713419 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 5724229 - 5724426
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  5724229 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5724328  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724329 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5757248 - 5757051
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  5757248 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5757149  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757148 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5768139 - 5767942
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  5768139 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5768040  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768039 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 8296070 - 8296271
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296070 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 8296169  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8296170 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 8296269  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  8296270 cc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15741254 - 15741053
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15741254 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15741155  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15741154 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15741055  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  15741054 cc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 18051360 - 18051561
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18051360 ctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18051459  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  18051460 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgt 18051559  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  18051560 cc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22387744 - 22387537
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  22387744 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 22387645  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  22387644 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 22387545  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  22387544 tgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15892866 - 15892665
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15892866 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15892767  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15892766 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15892667  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  15892666 cc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 6192411 - 6192615
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  6192411 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 6192510  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6192511 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 6192610  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  6192611 tgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29148921 - 29148714
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  29148921 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29148822  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  29148821 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 29148722  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  29148721 tgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 18330767 - 18330968
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18330767 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18330866  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18330867 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 18330966  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  18330967 cc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4796813 - 4796612
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4796813 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 4796714  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4796713 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 4796614  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  4796613 cc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8301427 - 8301226
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8301427 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 8301328  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||    
T  8301327 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 8301228  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  8301227 cc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 4417011 - 4417218
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4417011 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 4417110  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4417111 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4417210  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4417211 tgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 7073304 - 7073511
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7073304 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 7073403  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  7073404 agctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 7073503  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  7073504 tgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11110515 - 11110308
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11110515 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 11110416  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  11110415 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagact 11110316  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  11110315 tgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28116120 - 28115913
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  28116120 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 28116021  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  28116020 agctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 28115921  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28115920 tgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29665124 - 29664929
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29665124 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29665025  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29665024 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 35880864 - 35881065
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35880864 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 35880963  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  35880964 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgt 35881063  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  35881064 cc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 8211830 - 8212037
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  8211830 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 8211929  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8211930 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8212029  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  8212030 tgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10396225 - 10396432
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  10396225 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 10396324  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  10396325 agctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 10396424  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  10396425 tgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28021367 - 28021574
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  28021367 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28021466  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  28021467 agctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 28021566  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28021567 tgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 48466019 - 48466226
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48466019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 48466118  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  48466119 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 48466218  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  48466219 tgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4346853 - 4346646
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4346853 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4346754  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4346753 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4346654  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  4346653 tgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18277218 - 18277011
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18277218 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18277119  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18277118 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18277019  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18277018 tgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18292519 - 18292312
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18292519 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18292420  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18292419 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18292320  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18292319 tgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18307820 - 18307613
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18307820 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18307721  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18307720 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18307621  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18307620 tgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20577001 - 20576806
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20577001 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 20576902  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20576901 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 4721726 - 4721930
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||     
T  4721726 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagc 4721825  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  4721826 tgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcga 4721925  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  4721926 tgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 5467077 - 5467284
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  5467077 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5467176  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5467177 aactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5467276  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5467277 tgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 21674785 - 21674992
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  21674785 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 21674884  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  21674885 agctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 21674984  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  21674985 tgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22871022 - 22870815
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22871022 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22870923  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  22870922 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 22870823  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  22870822 tgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22886081 - 22885874
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22886081 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22885982  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  22885981 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 22885882  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  22885881 tgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36997243 - 36997036
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36997243 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 36997144  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  36997143 agctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 36997044  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  36997043 tgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 51782115 - 51782322
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51782115 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51782214  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51782215 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51782314  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  51782315 tgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 51797205 - 51797412
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  51797205 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51797304  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51797305 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51797404  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  51797405 tgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5596523 - 5596316
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  5596523 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 5596424  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5596423 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5596324  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5596323 tgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6542628 - 6542421
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  6542628 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 6542529  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||    
T  6542528 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagact 6542429  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  6542428 tgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31964639 - 31964432
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  31964639 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31964540  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31964539 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31964440  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31964439 tgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50134237 - 50134030
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  50134237 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 50134138  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  50134137 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 50134038  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  50134037 tgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5609488 - 5609281
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  5609488 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5609389  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  5609388 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 5609289  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5609288 tgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17985110 - 17984915
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  17985110 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttg 17985011  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  17985010 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 18242831 - 18243038
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  18242831 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 18242930  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18242931 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18243030  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18243031 tgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 24328251 - 24328458
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  24328251 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 24328350  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  24328351 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 24328450  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  24328451 tgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 28339394 - 28339601
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  28339394 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28339493  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28339494 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28339593  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28339594 tgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 5013804 - 5014011
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  5013804 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5013903  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  5013904 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 5014003  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5014004 tgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 7996654 - 7996861
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  7996654 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 7996753  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  7996754 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggct 7996853  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  7996854 tgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 10643162 - 10643369
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  10643162 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 10643261  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  10643262 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggct 10643361  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  10643362 tgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 47023545 - 47023752
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  47023545 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 47023644  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  47023645 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 47023744  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  47023745 tgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 18225283 - 18225490
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  18225283 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 18225382  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  18225383 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggct 18225482  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18225483 tgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 32439246 - 32439422
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  32439246 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 32439345  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32439346 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 20066135 - 20066311
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  20066135 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 20066234  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20066235 agttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 1900402 - 1900608
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaagga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900402 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagga 1900501  T
Q  106 aagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900502 aagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 1900601  T
Q  206 ttgatgt 212  Q
    | |||||    
T  1900602 tcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15228010 - 15228221
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15228010 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 15228109  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  15228110 agggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcc 15228209  T
Q  201 cagacttgatgt 212  Q
    ||||||||||||    
T  15228210 cagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15285053 - 15284851
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  15285053 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 15284954  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15284953 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagact 15284854  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  15284853 tga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24460736 - 24460533
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  24460736 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 24460637  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24460636 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  24460536 caga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14235656 - 14235448
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  14235656 ttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagacc 14235557  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  14235556 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcc 14235457  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    ||| |||||    
T  14235456 cagtcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15391469 - 15391291
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||      
T  15391469 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgact 15391370  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15391369 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 17014149 - 17014353
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  17014149 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 17014248  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17014249 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 17014348  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  17014349 tgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 14665170 - 14665371
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14665170 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14665269  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14665270 cttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 14665369  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  14665370 cc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24592433 - 24592232
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24592433 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24592334  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24592333 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24592234  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  24592233 cc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36344640 - 36344433
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  36344640 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 36344541  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  36344540 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 36344441  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  36344440 tgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 5006019 - 5006226
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  5006019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5006118  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5006119 agttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5006218  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  5006219 tgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 6569999 - 6570206
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  6569999 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 6570098  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6570099 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6570198  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  6570199 tgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14763429 - 14763222
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  14763429 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 14763330  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  14763329 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 14763230  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  14763229 tgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18800738 - 18800531
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  18800738 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 18800639  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18800638 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18800539  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  18800538 tgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31126643 - 31126436
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31126643 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31126544  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  31126543 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 31126444  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31126443 tgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27163442 - 27163235
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |    
T  27163442 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 27163343  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27163342 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27163243  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  27163242 tgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33673923 - 33673716
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33673923 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 33673824  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  33673823 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 33673724  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  33673723 tgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40105763 - 40105556
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  40105763 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 40105664  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  40105663 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 40105564  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  40105563 tgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 14098688 - 14098894
Alignment:
Q  8 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14098688 ctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaa 14098787  T
Q  108 gttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 207  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  14098788 gctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 14098887  T
Q  208 gatgtcc 214  Q
    |||||||    
T  14098888 gatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 21969859 - 21970054
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21969859 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 21969958  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21969959 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 54833533 - 54833740
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  54833533 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 54833632  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  54833633 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 54833732  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  54833733 tgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 30753900 - 30754107
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  30753900 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 30753999  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30754000 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30754099  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  30754100 tgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 39850796 - 39850991
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  39850796 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttg 39850895  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39850896 agaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34189085 - 34188909
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  34189085 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 34188986  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34188985 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 24112808 - 24112984
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  24112808 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 24112907  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24112908 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 18710717 - 18710924
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  18710717 tctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 18710816  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18710817 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 18710916  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||| ||||    
T  18710917 tgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 16283583 - 16283787
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  16283583 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 16283682  T
Q  110 tgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  16283683 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgt 16283782  T
Q  210 tgtcc 214  Q
    |||||    
T  16283783 tgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44563226 - 44563427
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  44563226 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 44563324  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563325 aaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 44563423  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  44563424 caga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19659129 - 19658926
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  19659129 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 19659031  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659030 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 19658931  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  19658930 cagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22080968 - 22080790
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  22080968 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgacc 22080869  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080868 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27608983 - 27608782
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27608983 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 27608884  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27608883 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 27608784  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  27608783 cc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33244790 - 33244994
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||| || |    
T  33244790 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33244889  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33244890 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctct 33244989  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  33244990 cagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 19688235 - 19688436
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19688235 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttga 19688334  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19688335 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgt 19688434  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  19688435 cc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 14557761 - 14557962
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14557761 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14557860  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14557861 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 14557960  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  14557961 cc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 16277691 - 16277892
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16277691 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16277790  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16277791 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16277890  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  16277891 cc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12092808 - 12092601
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  12092808 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 12092709  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  12092708 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 12092609  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  12092608 tgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2137337 - 2137136
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2137337 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 2137238  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| |||||||||||    
T  2137237 cttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgt 2137138  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  2137137 cc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3329591 - 3329384
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |    
T  3329591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaaggga 3329492  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  3329491 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 3329392  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  3329391 tgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 19674572 - 19674779
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19674572 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 19674671  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19674672 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19674771  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  19674772 tgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 29829465 - 29829660
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29829465 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29829564  T
Q  119 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29829565 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31489834 - 31489627
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  31489834 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 31489735  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  31489734 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 31489635  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31489634 tgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189432
Alignment:
Q  38 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgt 137  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  138 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 19286593 - 19286800
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |    
T  19286593 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 19286692  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19286693 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19286792  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  19286793 tgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 31354655 - 31354862
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  31354655 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31354754  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  31354755 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagact 31354854  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  31354855 tgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9354747 - 9354961
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaag-ctcattgat 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||  ||||| ||     
T  9354747 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagac 9354846  T
Q  100 caaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||    
T  9354847 caaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttc 9354946  T
Q  200 ccagacttgatgtcc 214  Q
    | |||||||||||||    
T  9354947 ctagacttgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19208444 - 19208237
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  19208444 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 19208345  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  19208344 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 19208245  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  19208244 tgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28362039 - 28361832
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  28362039 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28361940  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28361939 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28361840  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  28361839 tgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 33258854 - 33259061
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  33258854 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 33258953  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  33258954 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 33259053  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  33259054 tgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 1
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  159 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 60  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 159  Q
    | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 agggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40188 - 39987
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40188 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctga 40089  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40088 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 39989  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  39988 cc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47104 - 46903
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47104 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 47005  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47004 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 46905  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  46904 cc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 29900 - 30101
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29900 ctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 29999  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  30000 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgt 30099  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  30100 cc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 536
Alignment:
Q  22 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgaga 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  122 acaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtcc 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 27429 - 27629
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27429 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctga 27528  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27529 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 27628  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  27629 c 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21686 - 21864
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  21686 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgacc 21785  T
Q  101 aaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786 agggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 47
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  248 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 149  T
Q  113 cttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 212  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  148 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 49  T
Q  213 cc 214  Q
    ||    
T  48 cc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 9697 - 9904
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9697 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 9796  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9797 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9896  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  9897 tgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7157
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  7364 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 7265  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  7264 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 7165  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  7164 tgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26326 - 26119
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26326 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26227  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  26226 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagact 26127  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  26126 tgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 8080 - 8287
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8080 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 8179  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8180 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8279  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  8280 tgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15055 - 14848
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  15055 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 14956  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||| |||||    
T  14955 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 14856  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  14855 tgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9191 - 8984
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9191 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9092  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  9091 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 8992  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  8991 tgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 20146 - 20353
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  20146 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 20245  T
Q  107 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  20246 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 20345  T
Q  207 tgatgtcc 214  Q
    ||||||||    
T  20346 tgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46927 - 46764
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtc--atg-atgtcgaaggatgc-tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa- 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||| || ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  46927 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaa 46828  T
Q  108 gttgactttt-gagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 170  Q
    |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46827 gcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 277 - 427
Alignment:
Q  64 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacg 163  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||||  | || |    
T  277 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 376  T
Q  164 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 214  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  377 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtcc 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University