View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8615_low_1 (Length: 577)

Name: NF8615_low_1
Description: NF8615
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8615_low_1
NF8615_low_1
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (25-563)||(26871357-26871895)
chr2 (25-564)||(21127009-21127549)
chr2 (46-564)||(21167971-21168489)
chr2 (25-563)||(24421013-24421554)
chr2 (48-564)||(43086927-43087443)
chr2 (48-564)||(24333816-24334333)
chr2 (48-564)||(29248449-29248966)
chr2 (48-564)||(9903640-9904156)
chr2 (48-564)||(34796284-34796800)
chr2 (48-564)||(40244838-40245354)
chr2 (48-564)||(4214124-4214641)
chr2 (48-564)||(9768830-9769346)
chr2 (48-564)||(39176161-39176679)
chr2 (106-564)||(22939724-22940184)
chr2 (93-564)||(10271259-10271732)
chr2 (48-564)||(11401239-11401757)
chr2 (93-564)||(35257277-35257750)
chr2 (93-564)||(35267902-35268375)
chr2 (93-564)||(27225711-27226184)
chr2 (89-564)||(43349671-43350148)
chr2 (58-564)||(22768005-22768509)
chr2 (49-524)||(22747635-22748109)
chr2 (295-564)||(28727384-28727653)
chr2 (258-563)||(19308491-19308795)
chr2 (43-251)||(28727651-28727859)
chr2 (268-564)||(28707161-28707455)
chr2 (315-564)||(24719840-24720085)
chr2 (65-299)||(24810450-24810689)
chr2 (470-564)||(18943728-18943822)
chr2 (46-146)||(18942102-18942203)
chr2 (50-163)||(19308850-19308966)
chr2 (352-412)||(18943633-18943693)
chr2 (59-146)||(24719586-24719676)
chr2 (58-117)||(28707603-28707663)
chr2 (350-401)||(21148632-21148683)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (25-563)||(11212142-11212681)
chr3 (25-563)||(4408543-4409080)
chr3 (25-563)||(1789919-1790459)
chr3 (48-564)||(16386935-16387451)
chr3 (25-563)||(9386631-9387171)
chr3 (48-563)||(14317104-14317616)
chr3 (41-564)||(29467252-29467775)
chr3 (48-564)||(6216099-6216616)
chr3 (48-564)||(19782695-19783212)
chr3 (26-563)||(9001837-9002372)
chr3 (48-564)||(37870734-37871251)
chr3 (48-564)||(37879252-37879769)
chr3 (44-564)||(7800108-7800629)
chr3 (48-564)||(6496389-6496907)
chr3 (44-563)||(1057851-1058369)
chr3 (48-564)||(9987934-9988452)
chr3 (48-564)||(12243606-12244123)
chr3 (58-563)||(16666490-16666994)
chr3 (48-564)||(13378714-13379230)
chr3 (48-564)||(13389308-13389824)
chr3 (48-564)||(23761568-23762084)
chr3 (42-488)||(17905668-17906114)
chr3 (48-564)||(20679244-20679761)
chr3 (48-564)||(14469893-14470411)
chr3 (46-563)||(15222123-15222639)
chr3 (48-564)||(5623443-5623961)
chr3 (89-564)||(13126004-13126481)
chr3 (48-564)||(24389565-24390082)
chr3 (48-564)||(39376357-39376874)
chr3 (89-564)||(510217-510694)
chr3 (120-564)||(10632870-10633320)
chr3 (93-564)||(4748036-4748509)
chr3 (89-564)||(5543068-5543545)
chr3 (93-564)||(24664187-24664660)
chr3 (93-564)||(41687966-41688439)
chr3 (48-564)||(5871743-5872262)
chr3 (93-564)||(12292236-12292709)
chr3 (58-563)||(29939602-29940105)
chr3 (58-563)||(29988756-29989259)
chr3 (48-564)||(5514945-5515463)
chr3 (93-564)||(16425204-16425678)
chr3 (89-564)||(28320285-28320762)
chr3 (93-564)||(38198969-38199442)
chr3 (89-564)||(11278432-11278921)
chr3 (89-564)||(8778975-8779453)
chr3 (58-524)||(29897681-29898145)
chr3 (50-563)||(17010408-17010923)
chr3 (50-563)||(17021214-17021729)
chr3 (65-562)||(13143421-13143922)
chr3 (58-563)||(17963984-17964490)
chr3 (65-563)||(15837532-15838031)
chr3 (46-564)||(5197394-5197891)
chr3 (43-200)||(13075257-13075415)
chr3 (48-564)||(17219376-17219886)
chr3 (282-564)||(30992407-30992685)
chr3 (352-564)||(17250808-17251017)
chr3 (481-564)||(17902136-17902219)
chr3 (366-507)||(12393536-12393673)
chr3 (334-413)||(12389558-12389638)
chr3 (48-146)||(12389798-12389898)
chr3 (48-134)||(17251232-17251320)
chr3 (312-399)||(18137224-18137311)
chr3 (44-104)||(15657098-15657157)
chr3 (49-117)||(12393913-12393983)
chr3 (48-96)||(12954448-12954496)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (25-563)||(16309378-16309915)
chr4 (25-563)||(3377196-3377733)
chr4 (48-564)||(40462796-40463311)
chr4 (43-563)||(15202855-15203386)
chr4 (39-563)||(14842134-14842660)
chr4 (48-564)||(27820982-27821499)
chr4 (48-564)||(19950446-19950963)
chr4 (100-564)||(27192236-27192702)
chr4 (89-564)||(22000746-22001221)
chr4 (48-564)||(17922385-17922902)
chr4 (48-564)||(24023520-24024037)
chr4 (48-564)||(30932541-30933056)
chr4 (48-564)||(18758541-18759059)
chr4 (48-564)||(55751303-55751820)
chr4 (48-564)||(454850-455366)
chr4 (58-563)||(10294970-10295474)
chr4 (48-564)||(16260152-16260669)
chr4 (48-564)||(4993846-4994364)
chr4 (48-564)||(4997974-4998492)
chr4 (89-564)||(14845995-14846469)
chr4 (89-564)||(27660939-27661416)
chr4 (48-513)||(11540307-11540771)
chr4 (93-564)||(10746649-10747122)
chr4 (93-564)||(10960418-10960891)
chr4 (93-564)||(36022622-36023095)
chr4 (93-564)||(49511866-49512340)
chr4 (93-564)||(24644662-24645135)
chr4 (317-564)||(14909035-14909279)
chr4 (44-239)||(39516594-39516791)
chr4 (359-564)||(19606947-19607148)
chr4 (282-564)||(15010017-15010296)
chr4 (25-153)||(19575279-19575406)
chr4 (451-563)||(43246109-43246220)
chr4 (398-564)||(16848632-16848795)
chr4 (89-159)||(15010413-15010484)
chr4 (44-76)||(11519400-11519432)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (25-564)||(23402081-23402620)
chr5 (25-563)||(34058104-34058642)
chr5 (43-564)||(20786215-20786736)
chr5 (25-561)||(17450883-17451400)
chr5 (42-564)||(20557917-20558440)
chr5 (43-564)||(34778066-34778588)
chr5 (85-564)||(24933864-24934344)
chr5 (48-564)||(5294716-5295233)
chr5 (48-564)||(39358666-39359183)
chr5 (25-524)||(19470108-19470607)
chr5 (48-564)||(40396532-40397049)
chr5 (48-564)||(31839591-31840107)
chr5 (48-564)||(15997471-15997987)
chr5 (41-564)||(1115450-1115993)
chr5 (48-564)||(14562227-14562744)
chr5 (48-564)||(22152686-22153203)
chr5 (48-564)||(39495060-39495578)
chr5 (89-564)||(23702950-23703427)
chr5 (93-564)||(24814083-24814556)
chr5 (89-564)||(30231640-30232117)
chr5 (89-564)||(42048950-42049427)
chr5 (48-564)||(6981975-6982493)
chr5 (48-564)||(22682286-22682804)
chr5 (48-564)||(23302447-23302965)
chr5 (89-564)||(9342125-9342602)
chr5 (44-563)||(21418543-21419058)
chr5 (89-564)||(14451226-14451703)
chr5 (93-564)||(24821094-24821567)
chr5 (93-564)||(14036212-14036685)
chr5 (93-564)||(27046454-27046928)
chr5 (89-564)||(23368106-23368583)
chr5 (93-564)||(27466332-27466805)
chr5 (48-564)||(36586690-36587208)
chr5 (93-564)||(17613232-17613705)
chr5 (93-564)||(24573242-24573715)
chr5 (48-563)||(13527488-13528002)
chr5 (89-564)||(17725088-17725565)
chr5 (89-564)||(15746139-15746616)
chr5 (89-564)||(31354704-31355181)
chr5 (89-564)||(35221672-35222149)
chr5 (89-564)||(36693868-36694345)
chr5 (89-564)||(37734181-37734658)
chr5 (43-563)||(21672023-21672545)
chr5 (65-563)||(23482388-23482892)
chr5 (93-415)||(24592280-24592603)
chr5 (48-357)||(27607595-27607905)
chr5 (353-564)||(27616652-27616863)
chr5 (46-564)||(21612726-21613242)
chr5 (48-146)||(23433770-23433869)
chr5 (48-146)||(23445135-23445236)
chr5 (42-87)||(24932394-24932439)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (25-564)||(23465396-23465937)
chr8 (25-564)||(19229029-19229569)
chr8 (42-564)||(19422594-19423116)
chr8 (41-564)||(30320788-30321310)
chr8 (25-564)||(25680070-25680610)
chr8 (48-564)||(19132954-19133471)
chr8 (48-564)||(26115546-26116062)
chr8 (49-563)||(3837127-3837639)
chr8 (48-564)||(6155340-6155857)
chr8 (89-564)||(32083778-32084255)
chr8 (48-564)||(44485388-44485905)
chr8 (89-564)||(29080705-29081182)
chr8 (89-564)||(13694652-13695129)
chr8 (48-563)||(22152372-22152887)
chr8 (93-564)||(9345416-9345889)
chr8 (93-564)||(36297242-36297717)
chr8 (93-564)||(3354717-3355190)
chr8 (89-564)||(246122-246599)
chr8 (89-564)||(809242-809719)
chr8 (48-564)||(23787690-23788207)
chr8 (222-563)||(16741118-16741463)
chr8 (89-564)||(36082225-36082712)
chr8 (50-563)||(21292581-21293094)
chr8 (46-564)||(22667336-22667850)
chr8 (326-564)||(15786792-15787030)
chr8 (51-564)||(19933400-19933910)
chr8 (89-280)||(15787033-15787225)
chr8 (46-549)||(24649176-24649674)
chr8 (48-564)||(17263636-17264149)
chr8 (365-563)||(20377894-20378089)
chr8 (352-564)||(22467224-22467431)
chr8 (419-564)||(17294169-17294312)
chr8 (490-564)||(24490737-24490811)
chr8 (49-146)||(20378182-20378281)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (26-564)||(25207181-25207717)
chr7 (42-564)||(9163812-9164336)
chr7 (41-564)||(15883953-15884477)
chr7 (43-564)||(20983507-20984029)
chr7 (48-564)||(9437519-9438036)
chr7 (48-564)||(6873361-6873878)
chr7 (48-564)||(17956245-17956761)
chr7 (89-564)||(2711744-2712219)
chr7 (48-564)||(22093397-22093913)
chr7 (48-564)||(8621617-8622135)
chr7 (49-563)||(18432784-18433294)
chr7 (48-564)||(4216263-4216780)
chr7 (48-564)||(26396225-26396742)
chr7 (48-564)||(171143-171662)
chr7 (93-564)||(9089533-9090006)
chr7 (89-564)||(40048235-40048713)
chr7 (89-564)||(24738396-24738873)
chr7 (89-564)||(26691873-26692350)
chr7 (48-564)||(463117-463621)
chr7 (93-564)||(8008197-8008670)
chr7 (89-564)||(1991851-1992328)
chr7 (89-564)||(11009480-11009959)
chr7 (89-564)||(42870128-42870620)
chr7 (108-563)||(13180243-13180697)
chr7 (50-564)||(4420965-4421476)
chr7 (317-564)||(14138175-14138419)
chr7 (313-564)||(4823594-4823842)
chr7 (352-564)||(10651409-10651618)
chr7 (355-564)||(13661032-13661238)
chr7 (48-146)||(21695068-21695168)
chr7 (46-162)||(14137906-14138021)
chr7 (475-550)||(16159340-16159415)
chr7 (48-146)||(13660851-13660951)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (39-563)||(38968-39493)
scaffold0047 (89-564)||(42830-43305)
scaffold0047 (317-557)||(3014-3250)
scaffold0047 (48-146)||(2747-2848)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (41-564)||(7683356-7683880)
chr1 (41-564)||(149768-150291)
chr1 (48-564)||(19183133-19183649)
chr1 (48-564)||(5645797-5646315)
chr1 (48-564)||(4171517-4172034)
chr1 (48-564)||(12734744-12735260)
chr1 (48-564)||(12619245-12619763)
chr1 (48-564)||(21867878-21868395)
chr1 (48-564)||(7511488-7512006)
chr1 (89-564)||(36242523-36243001)
chr1 (48-564)||(51651966-51652484)
chr1 (89-564)||(7695564-7696041)
chr1 (89-564)||(38099340-38099817)
chr1 (89-564)||(35644131-35644607)
chr1 (93-564)||(35396589-35397062)
chr1 (89-564)||(47614025-47614502)
chr1 (89-564)||(5837459-5837936)
chr1 (93-564)||(3175850-3176333)
chr1 (50-563)||(19165744-19166258)
chr1 (46-563)||(20879092-20879607)
chr1 (58-564)||(21211770-21212275)
chr1 (50-564)||(21130396-21130908)
chr1 (312-564)||(22447655-22447904)
chr1 (312-564)||(22452889-22453138)
chr1 (317-564)||(22125978-22126222)
chr1 (352-562)||(20933741-20933945)
chr1 (49-146)||(20933522-20933620)
chr1 (49-146)||(22125711-22125810)
chr1 (46-160)||(22460559-22460674)
chr1 (366-408)||(16325264-16325306)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (66-564)||(4868-5371)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (42-564)||(38418-38940)
scaffold0133 (48-564)||(35389-35906)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (42-564)||(20035962-20036483)
chr6 (48-564)||(27377018-27377537)
chr6 (48-564)||(27467375-27467894)
chr6 (48-564)||(9118549-9119065)
chr6 (25-563)||(25798057-25798591)
chr6 (48-564)||(27497930-27498447)
chr6 (48-564)||(26037840-26038358)
chr6 (47-564)||(32968003-32968520)
chr6 (49-563)||(18830368-18830881)
chr6 (48-564)||(34813220-34813736)
chr6 (89-564)||(3665694-3666170)
chr6 (43-564)||(25730916-25731434)
chr6 (48-563)||(13917474-13917989)
chr6 (48-564)||(12859150-12859675)
chr6 (48-564)||(26869029-26869546)
chr6 (44-563)||(22290211-22290728)
chr6 (89-564)||(12722893-12723370)
chr6 (89-564)||(25791982-25792458)
chr6 (93-564)||(26029691-26030164)
chr6 (25-413)||(12369901-12370292)
chr6 (93-564)||(27346014-27346489)
chr6 (93-564)||(27406754-27407229)
chr6 (93-564)||(16953278-16953752)
chr6 (89-564)||(4635193-4635670)
chr6 (89-564)||(32307103-32307580)
chr6 (50-563)||(21123715-21124228)
chr6 (25-371)||(18921686-18922030)
chr6 (44-564)||(18547605-18548124)
chr6 (101-559)||(19457459-19457915)
chr6 (58-485)||(25682257-25682682)
chr6 (50-563)||(22380263-22380777)
chr6 (101-563)||(1655062-1655524)
chr6 (50-563)||(17051676-17052192)
chr6 (65-563)||(14065553-14066056)
chr6 (302-564)||(22809560-22809819)
chr6 (50-564)||(16880403-16880916)
chr6 (193-415)||(11239925-11240147)
chr6 (26-236)||(17783732-17783943)
chr6 (432-563)||(18921562-18921693)
chr6 (338-424)||(7665830-7665916)
chr6 (366-552)||(25630554-25630734)
chr6 (59-170)||(7665537-7665649)
chr6 (50-146)||(11239823-11239920)
chr6 (487-564)||(20138949-20139026)
chr6 (487-564)||(22193843-22193920)
chr6 (46-95)||(22809510-22809559)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (49-564)||(49025-49544)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (26-563)||(179717-180254)
scaffold0017 (108-563)||(49323-49776)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (46-563)||(5720-6236)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (48-536)||(5-495)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (48-532)||(2515-2998)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (89-564)||(43042-43519)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (44-563)||(5458-5977)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (44-563)||(54798-55317)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (192-507)||(195413-195729)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (59-490)||(31149-31582)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (58-563)||(131946-132450)
scaffold0012 (108-563)||(259-712)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (44-563)||(6210-6729)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (43-564)||(73839-74361)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (51-410)||(1-360)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (44-562)||(83-602)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (46-563)||(6287-6805)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (108-529)||(109230-109650)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (48-410)||(69063-69426)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (63-490)||(10835-11262)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (57-333)||(1-278)
scaffold0398 (57-328)||(8261-8533)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (65-562)||(161054-161555)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (101-559)||(13417-13872)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (101-563)||(5979-6439)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (101-560)||(20966-21424)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (43-293)||(1-251)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (26-273)||(1810-2057)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (43-307)||(6603-6868)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (189-563)||(11396-11767)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (101-563)||(8332-8825)
scaffold0099 (42-87)||(10345-10390)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (101-563)||(11433-11895)
[»] scaffold1078 (1 HSPs)
scaffold1078 (50-404)||(1-357)
[»] scaffold0132 (4 HSPs)
scaffold0132 (317-559)||(20627-20867)
scaffold0132 (317-559)||(33828-34068)
scaffold0132 (101-236)||(20948-21084)
scaffold0132 (101-236)||(34149-34285)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (65-563)||(24723-25215)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (25-226)||(18426-18627)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (90-564)||(13420-13890)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (44-353)||(62782-63093)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (49-273)||(220565-220788)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (46-564)||(10999-11514)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (59-564)||(10997-11501)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (46-564)||(3174-3691)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (261-564)||(12026-12325)
scaffold0324 (48-104)||(11809-11868)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (51-555)||(30287-30791)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (50-563)||(161678-162192)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (51-278)||(30302-30528)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (285-564)||(30870-31146)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (317-564)||(2707-2951)
scaffold0004 (48-493)||(7961-8401)
scaffold0004 (48-146)||(2439-2539)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (317-564)||(3525-3769)
[»] scaffold1365 (2 HSPs)
scaffold1365 (282-564)||(720-997)
scaffold1365 (51-146)||(1075-1173)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (350-564)||(7372-7583)
scaffold0193 (48-134)||(7073-7161)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (352-564)||(22271-22479)
[»] scaffold0594 (2 HSPs)
scaffold0594 (323-564)||(3133-3371)
scaffold0594 (48-146)||(3545-3643)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (352-567)||(42374-42585)
scaffold0084 (46-146)||(42094-42198)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (352-564)||(2143-2351)
scaffold0379 (43-146)||(1836-1940)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (317-564)||(2953-3196)
scaffold0183 (48-82)||(2685-2719)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (261-564)||(130724-131008)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (352-564)||(27775-27983)
[»] scaffold0537 (1 HSPs)
scaffold0537 (26-180)||(1471-1626)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (359-539)||(13196-13372)
scaffold0302 (48-146)||(13580-13683)
[»] scaffold1362 (1 HSPs)
scaffold1362 (25-118)||(1-93)
[»] scaffold2124 (2 HSPs)
scaffold2124 (366-564)||(809-1002)
scaffold2124 (87-146)||(536-597)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (370-557)||(73015-73198)
scaffold0037 (370-557)||(85205-85388)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (470-564)||(5927-6021)
scaffold0780 (325-415)||(6048-6138)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (65-299)||(2394-2633)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (49-161)||(1-114)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (48-415)||(487-851)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (282-406)||(1355-1479)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (487-564)||(73625-73702)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (93-169)||(5617-5693)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (48-146)||(372-471)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Original strand, 26871357 - 26871895
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871357 agcagagaaggttgaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 26871455  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26871456 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcacgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 26871555  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871556 agaccacgtcagaaacttttcagagaactaccctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 26871655  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26871656 gtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttttgatggaccagatgcttc 26871755  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26871756 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaattaaatcttt 26871855  T
Q  524 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871856 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 26871895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21127549 - 21127009
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 122  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  21127549 agcagagaaggtttgaaatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttg-aagtgtttttataaaaaacgtttgcaattcaaatga 21127451  T
Q  123 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21127450 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 21127351  T
Q  223 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127350 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 21127251  T
Q  323 agcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 422  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127250 agcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 21127151  T
Q  423 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21127150 ctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctt 21127051  T
Q  523 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21127050 tcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 21127009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21168489 - 21167971
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168489 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaat 21168391  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168390 gacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 21168291  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21168290 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaa 21168191  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168190 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaa 21168091  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21168090 ctccttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 21167991  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21167990 atatatcagcccattgatgt 21167971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24421554 - 24421013
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24421554 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 24421456  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24421455 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagat 24421356  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421355 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 24421256  T
Q  324 gc-aaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 422  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421255 acaaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 24421156  T
Q  423 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 520  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24421155 ctgaattgacttcagagccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaaatttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatc 24421056  T
Q  521 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24421055 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccactgatg 24421013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 43086927 - 43087443
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086927 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 43087025  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  43087026 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 43087125  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43087126 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 43087225  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43087226 tttagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 43087325  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43087326 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 43087425  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43087426 atatcagcccattgatgt 43087443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24334333 - 24333816
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24334333 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatg 24334235  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24334234 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24334135  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24334134 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccacttctgaag 24334035  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334034 ttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactaaac 24333935  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24333934 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 24333835  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24333834 tatatcagcccattgatgt 24333816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 29248449 - 29248966
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248449 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 29248547  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29248548 acaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatacttcaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 29248647  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29248648 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 29248747  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29248748 ttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 29248847  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248848 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 29248947  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29248948 tatatcagcccattgatgt 29248966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9904156 - 9903640
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9904156 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatga 9904058  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9904057 caaattaggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9903958  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  9903957 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaagt 9903858  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  9903857 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatattcttctgaataaacttcagacccaaact 9903758  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9903757 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 9903658  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9903657 atatcagcccattgatgt 9903640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 34796800 - 34796284
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34796800 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatga 34796702  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  34796701 caaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34796602  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  34796601 aaaactacattttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 34796502  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34796501 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaacaaact 34796402  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34796401 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 34796302  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34796301 atatcagcccattgatgt 34796284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 40244838 - 40245354
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40244838 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 40244936  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  40244937 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 40245036  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  40245037 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 40245136  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40245137 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 40245236  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40245237 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 40245336  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40245337 atatcagcccattgatgt 40245354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 4214124 - 4214641
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4214124 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 4214222  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4214223 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4214322  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  4214323 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 4214422  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4214423 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 4214522  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4214523 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4214622  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4214623 tatatcagcccattgatgt 4214641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9769346 - 9768830
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9769346 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 9769248  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9769247 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaataaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9769148  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||||||     
T  9769147 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacaattctgaagt 9769048  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9769047 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 9768948  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9768947 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 9768848  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9768847 atatcagcccattgatgt 9768830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 39176679 - 39176161
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39176679 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39176581  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  39176580 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39176481  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  39176480 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 39176381  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39176380 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 39176281  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39176280 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 39176181  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39176180 atatatcagcccattgatgt 39176161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 106 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22940184 - 22939724
Alignment:
Q  106 gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt- 204  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22940184 gtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttt 22940085  T
Q  205 -gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatccc 303  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  22940084 tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttccc 22939985  T
Q  304 actagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagct 403  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22939984 actaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagct 22939885  T
Q  404 tctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattttt 503  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22939884 tctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttt 22939785  T
Q  504 ctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22939784 cttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 22939724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 10271259 - 10271732
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10271259 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10271358  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10271359 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactctttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10271458  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10271459 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10271558  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10271559 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10271658  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10271659 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10271732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 11401757 - 11401239
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11401757 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 11401659  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11401658 caaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 11401559  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  11401558 gaaaactactttttgggtaatgggacggctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 11401459  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11401458 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 11401359  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11401358 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 11401259  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11401258 atatatcagcccattgatgt 11401239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 35257277 - 35257750
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35257277 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35257376  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35257377 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35257476  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35257477 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35257576  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35257577 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35257676  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35257677 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 35267902 - 35268375
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35267902 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35268001  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35268002 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35268101  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35268102 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35268201  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35268202 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35268301  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35268302 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 27225711 - 27226184
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  27225711 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggtgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 27225810  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  27225811 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 27225910  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27225911 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27226010  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27226011 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 27226110  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27226111 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 27226184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 43349671 - 43350148
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || |||||| |||||||    
T  43349671 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacattaaaaagcgaataaaa 43349770  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  43349771 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagagaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43349870  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43349871 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttctcaga 43349970  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  43349971 acctcagttaagagcttttgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 43350070  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43350071 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 43350148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 58 - 564
Target Start/End: Original strand, 22768005 - 22768509
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  22768005 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 22768102  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||     
T  22768103 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataagacatcattgccctttctattatactccaatacaaatacaccacgtcagagacttttcagacta-aaaa 22768201  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||    
T  22768202 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactagcgttgctattcagaagtaaagaacacaacttatgaagttttagcgc 22768301  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22768302 tgacgtcatcttcataagcatattttcctcagaacctcagttgagagcttttgatggacca-aagcttttgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 22768400  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22768401 agaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtacatggtcaaatttttcttgataaaatcaaatctttccaaagataaaggttttgtaaatatatcagc 22768499  T
Q  555 ccattgatgt 564  Q
    ||||||||||    
T  22768500 ccattgatgt 22768509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 49 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 22748109 - 22747635
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22748109 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatga 22748011  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22748010 cag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcataaatttttca 22747912  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||  | |||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  22747911 gactaataac-tttggttaatgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcataagtaaagaacacagcttctgaa 22747813  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22747812 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaa 22747714  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22747713 cttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttc 22747635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 295 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28727653 - 28727384
Alignment:
Q  295 aacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaa 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  28727653 aacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgttgacatcatcttcaaaagcacattttcctcagaacttcag 28727554  T
Q  395 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgtt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28727553 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtt 28727454  T
Q  495 caaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28727453 caaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 28727384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 258 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 19308795 - 19308491
Alignment:
Q  258 ttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctg 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19308795 ttggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgctg 19308696  T
Q  357 acgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccg 456  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  19308695 acgacatcttcataagcacattttcctcggaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcggaaccaaactttttattcag 19308597  T
Q  457 agacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccc 556  Q
    || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19308596 aggcaagcaaa-tcttaatcaaacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggttttgtaaatatatcagccc 19308498  T
Q  557 attgatg 563  Q
    |||||||    
T  19308497 attgatg 19308491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28727859 - 28727651
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28727859 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 28727761  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28727760 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcagtgtcctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 28727661  T
Q  242 ttcagaaaac 251  Q
    ||||||||||    
T  28727660 ttcagaaaac 28727651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 268 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28707455 - 28707161
Alignment:
Q  268 ggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatctt 366  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| | |||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  28707455 ggacaggtgttactgaagagtgacttccaacgtttccactaacactgctatttagaagcaaataatacaacttctaaagtttaagtgctgacgtcatctt 28707356  T
Q  367 cagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaa 466  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||    
T  28707355 cagaagcacattttccttagagtctcaattaagagcttctgatggaccaaa-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaagcaa 28707257  T
Q  467 atttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28707256 attt--aatcagacacaaagtgcatgttcaattttttctttataaaatcaaatattttcacagataaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 28707161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 564
Target Start/End: Original strand, 24719840 - 24720085
Alignment:
Q  315 tattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc 414  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||     
T  24719840 tattcaggagcaaagagtccaacttctgaagttaaggtgctgacgtcatctttagaagcacatattcctcagaatctcagttaagagcttctaatgaact 24719939  T
Q  415 agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaa 514  Q
    | | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24719940 ata-gcttctgaaca-acttcagaacctaacttcttattcaaaagcaagtaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaat 24720035  T
Q  515 caaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24720036 caaatatttccacaggtaaaggcttagtaaatatatcagctcattgatgt 24720085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24810689 - 24810450
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24810689 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 24810590  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 258  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |   ||   |    
T  24810589 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagaca--caatgct 24810492  T
Q  259 tggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacga 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24810491 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcaacga 24810450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 564
Target Start/End: Original strand, 18943728 - 18943822
Alignment:
Q  470 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18943728 tttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccactattaaaggcttagtaaatatatcagcctattgatgt 18943822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 18942102 - 18942203
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  18942102 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaatgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 18942201  T
Q  145 ga 146  Q
    ||    
T  18942202 ga 18942203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19308966 - 19308850
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19308966 aagtgtaggttttgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttaaagtaaaaacgttagcaattcagaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 19308867  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtg 163  Q
     |||||||| |||||||    
T  19308866 caaattgggagcgcgtg 19308850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Original strand, 18943633 - 18943693
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgga 412  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18943633 tgctgatgtcatcttcataagaacattttcctcagagcctcaattaagatcttctgatgga 18943693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Original strand, 24719586 - 24719676
Alignment:
Q  59 ttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24719586 ttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctacgtatttttagtaaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacagcattaatga 24719676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28707663 - 28707603
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28707663 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttggctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattca 28707603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21148683 - 21148632
Alignment:
Q  350 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagag 401  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21148683 agtgttgatgtcatctttagaagcgcattttcctcagaatctcaattaagag 21148632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 11212681 - 11212142
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11212681 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttattaaaacgtttgcaattcaaaagag 11212583  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11212582 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 11212483  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212482 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 11212383  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212382 gcaaagaataccgcttctgaagttttagagctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttc 11212283  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc-aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11212282 tgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctt 11212183  T
Q  523 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212182 tgaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 11212142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Original strand, 4408543 - 4409080
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4408543 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 4408641  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4408642 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 4408741  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408742 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaag 4408841  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408842 caaagaatacaacttctgaagttttagtgctaacgtcaccttcagaagcacattttcctcaaaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttct 4408941  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4408942 gaatgaacttcagaaccaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttc 4409041  T
Q  525 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4409042 aacagataaaggctttgtaaatatatcagctcattgatg 4409080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 1790459 - 1789919
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1790459 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 1790361  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1790360 caaacaaacatagcattaatgacaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagata 1790261  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  1790260 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacattcggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaatgatcccactaggcttgctattcagaaa 1790161  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1790160 caaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttct 1790061  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc---aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1790060 gaattgacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatct 1789961  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  1789960 ttcaacagataaaggctttttaaatatattagcccactgatg 1789919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 16387451 - 16386935
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16387451 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgttagttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatgac 16387352  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16387351 aaattgggggcacgtgttagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 16387252  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  16387251 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcctcgctgatcagaagcaaggaataccgcttctgaagtt 16387152  T
Q  348 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaactt 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16387151 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactgaactt 16387052  T
Q  448 cttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaata 547  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16387051 cttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaata 16386952  T
Q  548 tatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||    
T  16386951 tatcagcccattgatgt 16386935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9387171 - 9386631
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
T  9387171 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgtagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaagggg 9387073  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9387072 acaaacaaacatagcattaatgacaaatagggggcgcgtgatagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 9386973  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9386972 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaa 9386873  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9386872 gcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagttgcttc 9386773  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaa--atttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9386772 tgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagacattttttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaattt 9386673  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  9386672 ttcaacagataaaggtttagtaaatatatcagctcattgatg 9386631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14317616 - 14317104
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  14317616 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttattt-aagtgtctttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 14317518  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14317517 caaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 14317418  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14317417 actaataacctt-ggttaatgggacatgtgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaagt 14317319  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14317318 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactaaact 14317219  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14317218 tcttatttagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaaatgcatgttc-aagttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 14317121  T
Q  547 atatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||    
T  14317120 atatcagcccattgatg 14317104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 29467775 - 29467252
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29467775 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 29467676  T
Q  140 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29467675 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcactgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 29467576  T
Q  240 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29467575 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggtaactgccaacgttcccactagccaa-ctattcagaagcaaagaataccgctt 29467477  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  29467476 ctgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgaaggactaaatgcttctgaatggactttagaa 29467377  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  29467376 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacgaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttcaacagataaaggttt 29467277  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29467276 tgtaaatatatcagcccattgatgt 29467252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6216616 - 6216099
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6216616 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6216518  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6216517 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6216418  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6216417 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 6216318  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6216317 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacgttttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 6216218  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6216217 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6216118  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6216117 tatatcagcccattgatgt 6216099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 19782695 - 19783212
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19782695 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 19782793  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19782794 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgcccttttggttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19782893  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
     ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19782894 taaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 19782993  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19782994 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctggatagacttcagaaccaaac 19783093  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19783094 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatggatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19783193  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19783194 tatatcagcccattgatgt 19783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9002372 - 9001837
Alignment:
Q  26 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9002372 gcagagaaggttggagaagaaattaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 9002274  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9002273 acaaacacacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 9002174  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9002173 agaccacgtcagaaacttttcagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactg-caacgatcccactagccttgctattcaga 9002076  T
Q  323 agcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 422  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||    
T  9002075 agtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagatt 9001977  T
Q  423 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 522  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9001976 ctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttagtcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctt 9001878  T
Q  523 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001877 tcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 9001837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 37870734 - 37871251
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37870734 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37870832  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  37870833 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37870932  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37870933 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 37871032  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37871033 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 37871132  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37871133 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatccatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 37871232  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37871233 tatatcagcccattgatgt 37871251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 37879252 - 37879769
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37879252 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37879350  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  37879351 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37879450  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37879451 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 37879550  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879551 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 37879650  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37879651 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatccatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 37879750  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37879751 tatatcagcccattgatgt 37879769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 7800629 - 7800108
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 142  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7800629 aaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagtatta 7800531  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  7800530 atgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaacctat 7800431  T
Q  243 tcagaaaa-ctaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  7800430 tcagaaaaactaacctttgggtaatgggacaactgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcca-gctgtttagaagcacagaataccgcttc 7800332  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7800331 tgaagttttagtgctgacatcattttcagaagcactttttcttcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaatggacttcagaac 7800232  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7800231 caaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 7800132  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7800131 gtaaatatatcagcccattgatgt 7800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6496907 - 6496389
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6496907 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 6496809  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6496808 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccgcgtcagagacttttcag 6496709  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  6496708 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 6496609  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  6496608 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 6496509  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6496508 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 6496409  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6496408 atatatcagcccattgatgt 6496389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Original strand, 1057851 - 1058369
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1057851 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 1057949  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1057950 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgctctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagaaactt 1058049  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1058050 ttcagactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagcaaagaacacagcttc 1058148  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  1058149 tgaagttatagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcaaaac 1058247  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1058248 caaacttcttattcagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 1058346  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1058347 gtaaatatatcagcccattgatg 1058369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9988452 - 9987934
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988452 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttaattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 9988354  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9988353 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 9988254  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  9988253 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 9988154  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  9988153 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 9988054  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9988053 cttcttattcagaagccagcaattttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaa 9987954  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9987953 atatatcagcccattgatgt 9987934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12244123 - 12243606
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12244123 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataaaagacaaacaaacatagcattaatga 12244025  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  12244024 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagagacttttcag 12243925  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||     
T  12243924 aaaact-acctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 12243826  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  12243825 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 12243726  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12243725 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcatacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 12243626  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12243625 atatatcagcccattgatgt 12243606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16666994 - 16666490
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16666994 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 16666896  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  | ||||    
T  16666895 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaacaagtcagaaacttttcagactaataac 16666796  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16666795 ctt-ggttaatgggacaggtgttacaaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaagttttagtgc 16666697  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16666696 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 16666598  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16666597 agaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 16666499  T
Q  555 ccattgatg 563  Q
    |||||||||    
T  16666498 ccattgatg 16666490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 13379230 - 13378714
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13379230 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13379132  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  13379131 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13379032  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  13379031 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 13378932  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13378931 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 13378832  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13378831 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 13378732  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13378731 atatcagcccattgatgt 13378714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 13389824 - 13389308
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13389824 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13389726  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  13389725 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13389626  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  13389625 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 13389526  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13389525 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 13389426  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13389425 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 13389326  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13389325 atatcagcccattgatgt 13389308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 23761568 - 23762084
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23761568 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgg 23761666  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  23761667 caaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgcccggtttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23761766  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  23761767 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 23761866  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23761867 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 23761966  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23761967 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 23762066  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23762067 atatcagcccattgatgt 23762084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17906114 - 17905668
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17906114 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 17906016  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17906015 taatgacaaattgggg-cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 17905917  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17905916 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggaccgctgttacaaaagagtaactgtaaacgatcccactagccatgctattcaggagcaaagaataccgctt 17905817  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17905816 ctgaagttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 17905717  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17905716 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtg 17905668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20679761 - 20679244
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20679761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 20679663  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20679662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 20679563  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  20679562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 20679463  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  20679462 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttaagaataaacttcagaaccaaac 20679363  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20679362 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 20679263  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20679262 tatatcagcccattgatgt 20679244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 14469893 - 14470411
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14469893 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 14469991  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14469992 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14470091  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  14470092 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 14470191  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14470192 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 14470291  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14470292 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 14470391  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14470392 atatatcagcccattgatgt 14470411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 46 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15222639 - 15222123
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaa 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15222639 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgcgtgttt-ttctatgtgtttttagtgaaaacgattacaattcaaaaagggacaaacaaacaaagcattaa 15222541  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15222540 tgaaaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattaccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagaaactttt 15222441  T
Q  244 cagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    ||||  | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15222440 cagactaataacctt-ggttaatggaacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactgaccctgttattcagaagtaaagaatacagcttctg 15222342  T
Q  343 aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  15222341 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaaactcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctgaataaacttcagaacca 15222243  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15222242 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgt 15222144  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15222143 aaatatatcagcccattgatg 15222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 5623961 - 5623443
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5623961 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 5623863  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  5623862 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 5623763  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  5623762 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 5623663  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5623662 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 5623563  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5623562 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 5623463  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5623462 atatatcagcccattgatgt 5623443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 13126004 - 13126481
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13126004 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaa 13126103  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  13126104 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 13126203  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13126204 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagat 13126303  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  13126304 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattccgaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 13126403  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13126404 tgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 13126481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24390082 - 24389565
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24390082 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 24389984  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  24389983 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 24389884  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  24389883 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 24389784  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24389783 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 24389684  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24389683 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 24389584  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24389583 tatatcagcccattgatgt 24389565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 39376357 - 39376874
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39376357 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacacacatagcattaatga 39376455  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  39376456 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcag 39376555  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  39376556 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 39376655  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39376656 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 39376755  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39376756 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 39376855  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  39376856 tatgtcagcccattgatgt 39376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 510694 - 510217
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  510694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 510595  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  510594 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 510495  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  510494 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 510395  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  510394 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 510295  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  510294 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 510217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 120 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10633320 - 10632870
Alignment:
Q  120 agagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactcca 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  10633320 agagacaaacaaacatagaattaatgacaaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttttttgttatactcca 10633221  T
Q  216 atactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgct 315  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10633220 atacaaatagaccacgtcagagactttttagaaaactaacctttgagtaatgggacagctgtcacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgct 10633121  T
Q  316 attcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 415  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10633120 attcagaagcaaataataccttttctgaagtattagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggacca 10633021  T
Q  416 gatgcttctgaatagacttcagaacc--aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10633020 gatgcttctgaataaacttcagaaccaaaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaa 10632921  T
Q  514 acaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10632920 tcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10632870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 4748036 - 4748509
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  4748036 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 4748135  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  4748136 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 4748235  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4748236 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 4748335  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  4748336 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 4748435  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4748436 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 4748509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 5543545 - 5543068
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5543545 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 5543446  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  5543445 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 5543346  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543345 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 5543246  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  5543245 acatcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttaagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 5543146  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5543145 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 5543068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 24664187 - 24664660
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24664187 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24664286  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24664287 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24664386  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24664387 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24664486  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24664487 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24664586  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24664587 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24664660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 41687966 - 41688439
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  41687966 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 41688065  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  41688066 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 41688165  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41688166 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 41688265  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  41688266 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 41688365  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41688366 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 41688439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 5872262 - 5871743
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5872262 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5872164  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5872163 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5872064  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgtt-actaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  5872063 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 5871964  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| || ||||||||||    
T  5871963 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacatcagaaccaa 5871864  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5871863 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgta 5871764  T
Q  544 aatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5871763 aatatatcagcccattgatgt 5871743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12292709 - 12292236
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  12292709 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 12292610  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12292609 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 12292510  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12292509 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 12292410  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  12292409 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 12292310  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12292309 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 12292236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29940105 - 29939602
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29940105 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29940008  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | ||||    
T  29940007 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataac 29939908  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  29939907 -tttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29939809  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29939808 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29939710  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29939709 agagtcaagcaaatctt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcagc 29939611  T
Q  555 ccattgatg 563  Q
    |||||||||    
T  29939610 ccattgatg 29939602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29989259 - 29988756
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29989259 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29989162  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | ||||    
T  29989161 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataac 29989062  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  29989061 -tttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29988963  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29988962 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29988864  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29988863 agagtcaagcaaatctt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcagc 29988765  T
Q  555 ccattgatg 563  Q
    |||||||||    
T  29988764 ccattgatg 29988756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 5514945 - 5515463
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5514945 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5515043  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5515044 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5515143  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  5515144 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaag 5515243  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5515244 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 5515343  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5515344 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttttttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 5515443  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5515444 atatatcagcccattgatgt 5515463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 16425678 - 16425204
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16425678 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16425579  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgtt-actaaaagtaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16425578 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16425479  T
Q  291 tgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 390  Q
    | |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16425478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 16425379  T
Q  391 tcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 489  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  16425378 tcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgc 16425279  T
Q  490 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16425278 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 16425204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28320762 - 28320285
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28320762 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 28320663  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  28320662 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 28320563  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28320562 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 28320463  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  28320462 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 28320363  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28320362 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 28320285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 38198969 - 38199442
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  38198969 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 38199068  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  38199069 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 38199168  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38199169 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 38199268  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  38199269 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 38199368  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38199369 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 38199442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 11278921 - 11278432
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11278921 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11278822  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  11278821 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 11278722  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11278721 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 11278622  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa------------tttttaa 474  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||            |||||||    
T  11278621 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttttaa 11278522  T
Q  475 tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11278521 tcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 11278432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 8778975 - 8779453
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaa 187  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||| || ||||||    
T  8778975 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaaagcgaataaa 8779074  T
Q  188 a-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaag 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||    
T  8779075 aacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaag 8779174  T
Q  287 taactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 386  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8779175 taacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatattcagaagcacattttcctcag 8779274  T
Q  387 aacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  8779275 aacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 8779374  T
Q  486 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8779375 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 8779453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 58 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 29898145 - 29897681
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29898145 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29898048  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  | |||     
T  29898047 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29897949  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  29897948 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29897849  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29897848 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29897750  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29897749 agagtcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttc 29897681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 17010408 - 17010923
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17010408 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17010507  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17010508 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17010607  T
Q  246 gaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || ||  ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17010608 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagcttctga 17010705  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||    
T  17010706 agttttagtgctgatgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctaaacagacttcaaaaccaa 17010804  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17010805 actttttattcagagacaagc-aagttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagataaaggctttgta 17010903  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17010904 aatatatcagcccattgatg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 17021214 - 17021729
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17021214 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17021313  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17021314 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17021413  T
Q  246 gaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || ||  ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17021414 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagcttctga 17021511  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||    
T  17021512 agttttagtgctgatgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctaaacagacttcaaaaccaa 17021610  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17021611 actttttattcagagacaagc-aagttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagataaaggctttgta 17021709  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17021710 aatatatcagcccattgatg 17021729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 65 - 562
Target Start/End: Original strand, 13143421 - 13143922
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  13143421 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 13143520  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 258  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | | |  |||    
T  13143521 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcagaca-caatgctt 13143619  T
Q  259 tggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctga 357  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||   |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13143620 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctga 13143719  T
Q  358 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 457  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13143720 tgtcatctttagaagtgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcaga 13143818  T
Q  458 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13143819 gacaagc-aagttttaatcagacacaaagagcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccg 13143917  T
Q  558 ttgat 562  Q
    |||||    
T  13143918 ttgat 13143922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Original strand, 17963984 - 17964490
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaa--aagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | | ||||||   | | |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17963984 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttaaataaaacgatagaaattcatgtaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgg 17964082  T
Q  155 gggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaacta 253  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |  |     
T  17964083 gggcgcgtgaaagtaaatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagacacgtt 17964182  T
Q  254 acctttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagt 352  Q
    ||  |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||| |||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17964183 ac--taagttagtgggacagttgtaattaagaagtaacttccaacgtttccactaatcctgctattcagaagcaaagaacacagcttctgaagttttagt 17964280  T
Q  353 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagat-gcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17964281 gctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcataatctcagtgaagagcttctgatggatt-gatagcttctgaacgaacttcagaaccaaacttctta 17964379  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  17964380 ttcagaggcaagcaagcttt-aatcagacacaaaatgcatgttcaaaattttcttaataaaatcaaatctttcaacagttagaggttttgtaaatatatc 17964478  T
Q  552 agcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||    
T  17964479 agcccattgatg 17964490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 563
Target Start/End: Original strand, 15837532 - 15838031
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    ||||||| |||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  15837532 agtgagttgtgtgtgtttggtatttatagtgtttttgagtaaaacgtttgcaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatgacaa-ttgggggcgc 15837630  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 258  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||||||| || ||||| | ||||     |    
T  15837631 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaaatcaccatagcccttttaagttatacaccaatacaaacaaaccacgtcagagacgtttcaaacaactgc---t 15837727  T
Q  259 tggttaatgggacagctgttactaaaag-taactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctga 357  Q
    | |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||    
T  15837728 tagttagtgggacaggtgttacttaaaggtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaaccaaagaacacagcttctgaagttctggtactga 15837827  T
Q  358 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||| || | ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  15837828 cgtcatcatcagaagcacattttcgtcagaaccttagttaaaagcttctgacggaacata-gcttctgaacagatttcagactcaaacttcttattcaga 15837926  T
Q  458 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15837927 gacaagcaaatttt-aatcagacaaaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatccaatctttccacagttaaaggctttgtaaatatatcagccca 15838025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Original strand, 5197394 - 5197891
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  5197394 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 5197493  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    || || |||||||||| ||  |||| ||| |||   ||| ||| |||||||||||  |   || |||| ||||||| |||||| |||||||||  | |||    
T  5197494 gacaa-ttgggggcgcatgaaagtacgttcaaagctaaaaaaatcatcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagatcacgtcagaggcattt 5197592  T
Q  244 caga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    |||| ||||||    || |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5197593 cagacaaactac---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaagcaaggaatacaacttct 5197689  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 441  Q
    |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||                  | |||||||||||||    
T  5197690 gaagtttaagtgctgatg-catcttcaaaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctga------------------acagacttcagaacc 5197770  T
Q  442 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 541  Q
    ||||||||| ||| |   |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||      
T  5197771 aaacttcttgttcaggagcaagcaaattt--actcaaacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatgtttccacagttaaaggtttat 5197868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 13075257 - 13075415
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13075257 gaaatgaaagtgtgagatgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 13075355  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13075356 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 13075415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17219886 - 17219376
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  17219886 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 17219787  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     | |  ||||||||| | |||||  || ||| ||  | ||| |||||||||||| |   || |||| | |||||  |||  |||||||||||  ||||||    
T  17219786 cata--gggggcgcgagatagtacattcaaa-gctta-aaatcatcattgccctctcaagtaatacactaatacacataagccacgtcagaagtttttca 17219691  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || ||   ||   | |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||      ||  || || |||||||| | ||||||||||    
T  17219690 gagaa---actgctagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaacgtttccactaatacaacttgtttaggagcaaagagtccagcttctga 17219594  T
Q  344 agctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  17219593 ag-ttaagatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggacca 17219496  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
     ||||||  ||| |   ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   || ||||| ||| ||    
T  17219495 tacttctagttcaggagcaaacaga--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatgaaatatttccttagttaaagacttagt 17219398  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17219397 aaatatatcagcccattgatgt 17219376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 282 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 30992685 - 30992407
Alignment:
Q  282 aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatttt 380  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||| |||| | ||  ||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30992685 aaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcacaaaacccagcttctggag-ttcagatgctgatgtcatcttcagaagcacatttt 30992587  T
Q  381 cctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagac 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||| || ||  | ||| |    ||||||||||  ||||||||    
T  30992586 cctcagaacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttcagaacctaaatttctgttcaggagtaagcaaattt--aatcagac 30992491  T
Q  481 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30992490 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaagacttagtaaatatatgagcccattgatgt 30992407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17251017 - 17250808
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  17251017 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaatctcagttaagagcttctgctggaccata-gtttctgaacagacttcaggaccaaacttctaa 17250919  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| |   ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  17250918 ttcaggagcaaacaaa--tttaatcagacacaaattgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatc 17250821  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||    
T  17250820 agcccattgatgt 17250808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17902219 - 17902136
Alignment:
Q  481 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17902219 acaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17902136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 366 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12393673 - 12393536
Alignment:
Q  366 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| ||    
T  12393673 tcagaatcacattttcctcagaaccttagtgaagagcttctaatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggcaatca 12393576  T
Q  466 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttt 507  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12393575 a--ttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttt 12393536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12389638 - 12389558
Alignment:
Q  334 cagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcaca-ttttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggac 413  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12389638 cagcttctgaagttaaggtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttcctcagaacctcagttaagatcttctgatggac 12389558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12389898 - 12389798
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||    
T  12389898 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtatgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaggggaaaaacaaacacaacattaatg 12389799  T
Q  146 a 146  Q
    |    
T  12389798 a 12389798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17251320 - 17251232
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17251320 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgtgttttctctaagtgttttaagcaaaaacgtttgcaattcagaaagcgacaaacaaaca 17251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18137311 - 18137224
Alignment:
Q  312 tgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaag 399  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  18137311 tgctattcaggagcaaagaatttagcttctgaagttaaagtgttggcgtcatcttcagaagcacatttttctcagaatctcagttaag 18137224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15657157 - 15657098
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa 104  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  15657157 aaataaaagtgttagttgtgaagtgagtagtgtgtgattg-tctaagtgtttttagtaaaa 15657098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12393983 - 12393913
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgt-tttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12393983 aaagtgtaggttgtgaagtgagaaatgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattca 12393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12954496 - 12954448
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12954496 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttt 12954448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Original strand, 16309378 - 16309915
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  16309378 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgatgtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaaggga 16309476  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16309477 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 16309576  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16309577 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 16309676  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16309677 caaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacctgatgcttct 16309776  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16309777 gaatggacttcagaaacaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttc 16309876  T
Q  525 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16309877 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 16309915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Original strand, 3377196 - 3377733
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3377196 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgttttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 3377294  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3377295 acaaacaaacatagcattaaggacaaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaat 3377394  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3377395 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactattactaaaagtaactgctaacgatcccactaaccttgctattcagaa 3377494  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3377495 gtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagttgcttc 3377594  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 523  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3377595 ttaacagacttcagaaccaaacttcttattcaaaggcaagcaaa-ttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 3377693  T
Q  524 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3377694 caacagataaaggctttgtaaatatatcaccccattgatg 3377733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40463311 - 40462796
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40463311 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgac 40463212  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40463211 aaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaatttttcaga 40463112  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40463111 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgcttctgaagtt 40463013  T
Q  348 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaactt 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40463012 ttagtcctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaactt 40462913  T
Q  448 cttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaata 547  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462912 cttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaata 40462813  T
Q  548 tatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||| |||||||||    
T  40462812 tatcagctcattgatgt 40462796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15203386 - 15202855
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15203386 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaagagagacaaacaaacatagcatta 15203288  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15203287 atgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 15203188  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15203187 ttttagagaactaacctttagttaatgggacaactgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaatacaacttc 15203088  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203087 tgaagttttagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 15202988  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaat----------ttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacaga 530  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15202987 caaacttcttattcagagacaagcaaatttttttttttttttaatcagacgcaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacaga 15202888  T
Q  531 taaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202887 taaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 15202855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14842660 - 14842134
Alignment:
Q  39 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842660 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 14842562  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 238  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14842561 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 14842462  T
Q  239 -cttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 337  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14842461 acttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaataccgc 14842362  T
Q  338 ttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 437  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14842361 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaattgacttcag 14842262  T
Q  438 aaccaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaag 535  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14842261 aaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaattttaatcagacacaaagtgcatgctcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaag 14842162  T
Q  536 gctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14842161 gctttgtcaatatatcagcccactgatg 14842134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27821499 - 27820982
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821499 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataagagacaaacaaacatagcattaatga 27821401  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27821400 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 27821301  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27821300 aaaactaacttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 27821201  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821200 cttagtgctgacgtcatcttcagaatcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 27821101  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaattttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27821100 tcttattcagaggcaaccaattttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 27821001  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27821000 tatatcagcccattgatgt 27820982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19950963 - 19950446
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19950963 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatg 19950865  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19950864 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19950765  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19950764 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagagtaccacttctgaag 19950665  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19950664 ttttagtgctgacgtcatcttcggaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 19950565  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19950564 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19950465  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19950464 tatatcagcccattgatgt 19950446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 564
Target Start/End: Original strand, 27192236 - 27192702
Alignment:
Q  100 taaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27192236 taaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccc 27192335  T
Q  200 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacga 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  27192336 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgt 27192435  T
Q  300 tcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaag 399  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27192436 tcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaag 27192535  T
Q  400 agcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc--aa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  27192536 agcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttctaaa 27192635  T
Q  498 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27192636 ttttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27192702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 22000746 - 22001221
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22000746 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 22000845  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  22000846 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 22000945  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000946 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 22001045  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  22001046 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 22001145  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001146 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 22001221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 17922385 - 17922902
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17922385 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 17922483  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17922484 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 17922583  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17922584 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaag 17922683  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17922684 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaac 17922783  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17922784 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaattagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacatataaaggttttgtaaa 17922883  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17922884 tatatcagcccattgatgt 17922902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24024037 - 24023520
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24024037 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatg 24023939  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  24023938 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24023839  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24023838 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaag 24023739  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24023738 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 24023639  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24023638 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagatacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 24023539  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24023538 tatatcagcccattgatgt 24023520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 30933056 - 30932541
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30933056 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 30932958  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  30932957 caaattgggg-cgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 30932859  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  30932858 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 30932759  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30932758 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccacatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 30932659  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30932658 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 30932559  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30932558 atatcagcccattgatgt 30932541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18759059 - 18758541
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18759059 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacgaacaaacatagcattaatga 18758961  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18758960 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 18758861  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||     
T  18758860 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagt 18758761  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18758760 attagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaatagacttcagaatcaaaaa 18758661  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18758660 cttcttattcagaagccagcaattttctaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaa 18758561  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18758560 atatatcagcccattgatgt 18758541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 55751820 - 55751303
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55751820 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 55751722  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  55751721 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 55751622  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  55751621 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 55751522  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55751521 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 55751422  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55751421 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 55751322  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55751321 tatatcagcccattgatgt 55751303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 454850 - 455366
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  454850 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacacacaaacacagcattaatga 454948  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  454949 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacatcagagactcttcag 455048  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  455049 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacattcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 455148  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  455149 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 455248  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  455249 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 455348  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  455349 atatcagcccattgatgt 455366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Original strand, 10294970 - 10295474
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10294970 gttgtgaagtgagtagtgtgtatttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 10295068  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  10295069 ggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcagactaataac 10295168  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10295169 ctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaactaaagaatacagcttctgaagttttagtgc 10295267  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10295268 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatagacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 10295366  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10295367 agaggcaagcaaa-tcttaatcagacacagagtgcatgttcaattttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 10295465  T
Q  555 ccattgatg 563  Q
    |||||||||    
T  10295466 ccattgatg 10295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 16260152 - 16260669
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16260152 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 16260250  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16260251 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 16260350  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  16260351 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 16260450  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16260451 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 16260550  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260551 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 16260650  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16260651 tatatcagcccattgatgt 16260669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4994364 - 4993846
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4994364 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4994266  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4994265 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4994166  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  4994165 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 4994066  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  4994065 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttttgaataaacttcagaaccaaaaa 4993966  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||| | ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4993965 cttcttatccagaggccagcagtttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatatttcaacagataagggttttgtaa 4993866  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4993865 atatatcagcccattgatgt 4993846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 4997974 - 4998492
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4997974 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4998072  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4998073 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4998172  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  4998173 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 4998272  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  4998273 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttttgaataaacttcagaaccaaaaa 4998372  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||| | ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4998373 cttcttatccagaggccagcagtttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatatttcaacagataagggttttgtaa 4998472  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4998473 atatatcagcccattgatgt 4998492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14846469 - 14845995
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  14846469 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaa- 14846371  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  14846370 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 14846271  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14846270 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaaacacatattcctcagaa 14846171  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  14846170 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 14846071  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14846070 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 14845995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 27660939 - 27661416
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  27660939 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 27661038  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  27661039 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 27661138  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661139 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 27661238  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  27661239 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 27661338  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27661339 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 27661416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 48 - 513
Target Start/End: Original strand, 11540307 - 11540771
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11540307 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaagaggacaaacaaacaaagcattaatt 11540405  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11540406 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 11540505  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  11540506 gactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactaaccttgctatttagaagtaaagaacacagcttctgaa 11540604  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11540605 gttttagtcctgacgtcatctttagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaa 11540703  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 513  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11540704 cttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaa 11540771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10747122 - 10746649
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10747122 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10747023  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10747022 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10746923  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10746922 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10746823  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10746822 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10746723  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10746722 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10746649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10960891 - 10960418
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10960891 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10960792  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10960791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10960692  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10960691 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10960592  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10960591 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10960492  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10960491 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10960418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 36022622 - 36023095
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36022622 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36022721  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  36022722 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 36022821  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36022822 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 36022921  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  36022922 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 36023021  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36023022 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36023095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 49511866 - 49512340
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  49511866 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 49511965  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49511966 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 49512065  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49512066 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 49512165  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 489  Q
    || |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  49512166 cagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatgc 49512265  T
Q  490 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49512266 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 49512340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 24644662 - 24645135
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  24644662 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 24644761  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  24644762 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 24644861  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24644862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24644961  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24644962 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24645061  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24645062 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 24645135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14909279 - 14909035
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  14909279 ttcagaagcaaagaattcagcttctgaagttaaagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttccacagaatctcagttaagagcttctgatggaccat 14909180  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14909179 a-gcttctgaatagacttcagaatcaaacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaattca 14909083  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14909082 aatctttccacagttaaaggtttagtaaatatatcagcccattgatgt 14909035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39516791 - 39516594
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  39516791 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcat 39516693  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39516692 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 39516594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19607148 - 19606947
Alignment:
Q  359 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| || ||| | ||| |      
T  19607148 gtcatcttcagaagcacattttcttcaaaacctcaataaggagcttctgatggactata-gcttctaaat-gacttcagaacctaaattcatgttcagga 19607051  T
Q  459 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccat 558  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19607050 gcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccat 19606953  T
Q  559 tgatgt 564  Q
    ||||||    
T  19606952 tgatgt 19606947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 282 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15010296 - 15010017
Alignment:
Q  282 aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatttt 380  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |  | |||||||| |||||||| | |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15010296 aaaagtaacttccaacgtttccactaactcttctattcaggagcaaagagtccagcttctgaag-ttaagatgctgatgtcatcttcagaagcacatttt 15010198  T
Q  381 cctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagac 480  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| |   ||| ||| |||  ||||||||    
T  15010197 cctcagaatcttagttaagagcttctgatggactata-gcttctgaacaaacttcatgacctaacttcttgttcaggagcaaccaacttt--aatcagac 15010101  T
Q  481 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15010100 acaaagtgcatgttcaatcttttttttataaaatcaaatcttttcacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 15010017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 19575279 - 19575406
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19575279 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 19575377  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19575378 caaacaaacatagcattaatgacaaattg 19575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 451 - 563
Target Start/End: Original strand, 43246109 - 43246220
Alignment:
Q  451 attccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 550  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43246109 attcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatat 43246207  T
Q  551 cagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||    
T  43246208 cagcccattgatg 43246220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 564
Target Start/End: Original strand, 16848632 - 16848795
Alignment:
Q  398 agagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaa 497  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16848632 agagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaaacaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaa 16848728  T
Q  498 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16848729 atttttctttataaaatcaaatatttcaactgttaaaggcttaataaatatatcagcccattgatgt 16848795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15010484 - 15010413
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| | | ||||||||    
T  15010484 agtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacaaaattaatgacatagtgggggcg 15010413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 11519400 - 11519432
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgt 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11519400 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgt 11519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23402620 - 23402081
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23402620 agcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 23402522  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23402521 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 23402422  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23402421 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttactaaaagtaactgcaaacgatctcactagccttgctattcagaa 23402322  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402321 gcaaagaataccgcttttgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttc 23402222  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 523  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23402221 tgaatggactccagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 23402122  T
Q  524 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23402121 caacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23402081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34058642 - 34058104
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34058642 agcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttgtgaggtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 34058544  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34058543 acaaacaaacatagcattaatgacaaatagagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 34058444  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34058443 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggatagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctatttagaa 34058344  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34058343 gcaaagaatacagcttctaaagttttagtgttgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcatttatgagcttctgatgaaccagatgcttc 34058244  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 523  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34058243 tgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaaacaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 34058144  T
Q  524 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34058143 caacagataaaggctttgtaaatatatcaacccattgatg 34058104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20786736 - 20786215
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786736 gaaatgaaagtgtgagtagtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 20786638  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20786637 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 20786538  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20786537 ttcagaaaactaacccttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttct 20786438  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20786437 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctgagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaacc 20786338  T
Q  442 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 541  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20786337 aaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttg 20786238  T
Q  542 taaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20786237 taaatatatcagcccattgatgt 20786215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 561
Target Start/End: Original strand, 17450883 - 17451400
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17450883 agcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagaga 17450981  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17450982 caaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaata 17451081  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17451082 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaag 17451181  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||                  ||||||    
T  17451182 caaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaaga------------------gcttct 17451263  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17451264 gaatggacttcagaaccaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttc 17451363  T
Q  525 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattga 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17451364 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattga 17451400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20558440 - 20557917
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20558440 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 20558342  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20558341 taatgacaaatttggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 20558242  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20558241 tttcagaaaactaacatttgggtaatgagacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgctt 20558142  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20558141 ctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacttcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaa 20558042  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20558041 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttt 20557942  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20557941 tataaatatatcagcccattgatgt 20557917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 34778588 - 34778066
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34778588 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 34778490  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  34778489 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 34778390  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34778389 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaatagcgcttc 34778290  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  34778289 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttatgaatagacttcagaac 34778190  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  34778189 caaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 34778090  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34778089 gtaaatatatcagcccattgatgt 34778066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 564
Target Start/End: Original strand, 24933864 - 24934344
Alignment:
Q  85 tttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 183  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24933864 tttaagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 24933963  T
Q  184 taaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24933964 taaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa 24934063  T
Q  284 aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcct 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24934064 aagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcct 24934163  T
Q  384 cagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacaca 483  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24934164 cagaaccttagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacaca 24934263  T
Q  484 aagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24934264 aagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24934344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 5294716 - 5295233
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294716 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 5294814  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||    
T  5294815 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaaatcagagactcttca 5294914  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5294915 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaatgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 5295014  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5295015 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 5295114  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5295115 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 5295214  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5295215 tatatcagcccattgatgt 5295233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 39359183 - 39358666
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39359183 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 39359085  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39359084 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 39358985  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39358984 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 39358885  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39358884 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 39358785  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    || |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39358784 tttttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 39358685  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39358684 tatatcagcccattgatgt 39358666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19470607 - 19470108
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||    
T  19470607 agcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgtaattcggaagag 19470509  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19470508 acaaacaa---tagcattaatgacaaattgggggcgcgtgctagtatgttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 19470412  T
Q  224 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 323  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470411 agaccacgtcagagactcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 19470312  T
Q  324 gcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 423  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470311 gcaaagaataccgctcctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttc 19470212  T
Q  424 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaat---ttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 520  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19470211 tgaatggacatcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaattttttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatc 19470112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40397049 - 40396532
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40397049 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 40396951  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40396950 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtcaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 40396851  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  40396850 gaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatatcacttctgaag 40396751  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40396750 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagaacttctgatggaccagatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 40396651  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40396650 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 40396551  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40396550 tatatcagcccattgatgt 40396532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 31840107 - 31839591
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31840107 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 31840009  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  31840008 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 31839909  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  31839908 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 31839809  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31839808 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 31839709  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31839708 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 31839609  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31839608 atatcagcccattgatgt 31839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 15997471 - 15997987
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15997471 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtgtttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 15997569  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  15997570 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 15997669  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  15997670 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 15997769  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15997770 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 15997869  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15997870 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 15997969  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15997970 atatcagcccattgatgt 15997987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Original strand, 1115450 - 1115993
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 138  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115450 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 1115549  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1115550 attaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaa 1115649  T
Q  239 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
T  1115650 cttttcagaaaaccaacctttgggtaatgagacagctgttacacaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgct 1115748  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctg-------------------atggaccagatg 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                   |||||| | |||    
T  1115749 tctgaagttttagtgctgacgtcgtcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatggactaaatg 1115848  T
Q  420 cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  1115849 cttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacgaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaat 1115948  T
Q  520 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1115949 ctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 1115993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 14562227 - 14562744
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14562227 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 14562325  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14562326 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14562425  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  14562426 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 14562525  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14562526 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaacatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 14562625  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14562626 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 14562725  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14562726 tatatcagcccattgatgt 14562744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22153203 - 22152686
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22153203 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacatcattaatga 22153105  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22153104 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22153005  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  22153004 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 22152905  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22152904 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcataacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 22152805  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152804 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 22152705  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22152704 tatatcagcccattgatgt 22152686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 39495060 - 39495578
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39495060 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39495158  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  39495159 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39495258  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  39495259 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 39495358  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39495359 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 39495458  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39495459 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 39495558  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39495559 atatatcagcccattgatgt 39495578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23703427 - 23702950
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  23703427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23703328  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  23703327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23703228  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23703227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 23703128  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  23703127 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 23703028  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23703027 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23702950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24814556 - 24814083
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  24814556 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 24814457  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24814456 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 24814357  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814356 gccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24814257  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24814256 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 24814157  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24814156 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24814083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 30231640 - 30232117
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  30231640 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 30231739  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  30231740 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 30231839  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30231840 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 30231939  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  30231940 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 30232039  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30232040 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 30232117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 42049427 - 42048950
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42049427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 42049328  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  42049327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 42049228  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42049227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 42049128  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  42049127 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 42049028  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42049027 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 42048950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6982493 - 6981975
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6982493 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 6982395  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6982394 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6982295  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  6982294 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 6982195  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6982194 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 6982095  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6982094 cttcttattcagaggcaatcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 6981995  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6981994 atatatcagcccattgatgt 6981975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22682804 - 22682286
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22682804 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 22682706  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22682705 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22682606  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    ||||||    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22682605 aaaactgctttttggataatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 22682506  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22682505 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 22682406  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22682405 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 22682306  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22682305 atatatcagcccattgatgt 22682286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23302965 - 23302447
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23302965 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 23302867  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  23302866 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23302767  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23302766 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 23302667  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23302666 ttttagtgttgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 23302567  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23302566 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 23302467  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23302466 atatatcagcccattgatgt 23302447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9342602 - 9342125
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9342602 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 9342503  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  9342502 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 9342403  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342402 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 9342303  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  9342302 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaa 9342203  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9342202 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9342125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Original strand, 21418543 - 21419058
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21418543 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgttttaagtaaaaacgattgcaattcaaaaaggagacaaacaaacaaagcat 21418641  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21418642 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatt 21418741  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    |||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  21418742 tttcagactaataaccttta-ttaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacaactt 21418840  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  21418841 ctgaagtgttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcatcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagattctgaataaacttcagaa 21418939  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21418940 ccaaacttcttattcagaggcaag-aaaatcttaat----cacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctt 21419034  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21419035 tgtaaatatatcagcccattgatg 21419058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 14451226 - 14451703
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14451226 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 14451325  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  14451326 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 14451425  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14451426 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 14451525  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||     
T  14451526 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaatttttcaatcagacacaaaa 14451625  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14451626 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 14451703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 24821094 - 24821567
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24821094 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24821193  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24821194 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24821293  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24821294 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24821393  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24821394 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 24821493  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24821494 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24821567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14036685 - 14036212
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14036685 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 14036586  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  14036585 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 14036486  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036485 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 14036386  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  14036385 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 14036286  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14036285 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 14036212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 27046454 - 27046928
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27046454 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27046553  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27046554 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27046653  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046654 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27046753  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 489  Q
    || |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  27046754 cagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatgc 27046853  T
Q  490 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27046854 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27046928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23368583 - 23368106
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  23368583 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23368484  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  23368483 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23368384  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23368383 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 23368284  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  23368283 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 23368184  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23368183 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27466805 - 27466332
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27466805 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 27466706  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27466705 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 27466606  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27466605 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcattttcagaagcacattttcctcagaacct 27466506  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27466505 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 27466406  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27466405 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27466332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 36586690 - 36587208
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36586690 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 36586788  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36586789 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 36586888  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||| |||||    
T  36586889 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttttgaag 36586988  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36586989 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 36587088  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36587089 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 36587188  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36587189 atatatcagcccattgatgt 36587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17613705 - 17613232
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  17613705 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 17613606  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  17613605 cattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 17613506  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613505 tccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 17613406  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  17613405 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 17613306  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17613305 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17613232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24573715 - 24573242
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24573715 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24573616  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24573615 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24573516  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24573515 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24573416  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24573415 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24573316  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24573315 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24573242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 48 - 563
Target Start/End: Original strand, 13527488 - 13528002
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13527488 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgaaattcataaggggacgaacaaacatagcattaatga 13527587  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13527588 caaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaaacttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaaattttca 13527687  T
Q  246 gaaaactaac--ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    ||   |||||  | |||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  13527688 ga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagacgcaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttctg 13527784  T
Q  343 aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  13527785 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctaaacagacttcagaacca 13527883  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13527884 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaat-tttcaacagttaaaggctttgt 13527981  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13527982 aaatatatcagcccattgatg 13528002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17725565 - 17725088
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  17725565 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtcaaaaagcgaataaaa 17725466  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  17725465 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 17725366  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17725365 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 17725266  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  17725265 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 17725166  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17725165 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17725088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15746616 - 15746139
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  15746616 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacagacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 15746517  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  15746516 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 15746417  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15746416 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 15746317  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||     
T  15746316 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacccaaaa 15746217  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15746216 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 15746139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 31355181 - 31354704
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  31355181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 31355082  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  31355081 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 31354982  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354981 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 31354882  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  31354881 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 31354782  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31354781 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 31354704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35222149 - 35221672
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  35222149 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 35222050  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  35222049 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 35221950  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35221949 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 35221850  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  35221849 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttatttagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 35221750  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35221749 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 35221672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 36694345 - 36693868
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36694345 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36694246  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  36694245 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36694146  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36694145 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaggcacattttcctcaga 36694046  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  36694045 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 36693946  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36693945 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36693868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 37734181 - 37734658
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  |||||| |||||||    
T  37734181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaattacgtcaaaaagcgaataaaa 37734280  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  37734281 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 37734380  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37734381 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 37734480  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  37734481 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaactttagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 37734580  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37734581 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 37734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 21672545 - 21672023
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 138  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  21672545 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcagaaaaggggacaaacaaacatagc 21672447  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  21672446 attaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagag 21672347  T
Q  238 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacag 336  Q
    |||| |||||     |||||| ||||| ||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| | | |||| || || |||||||||| |||||| ||||    
T  21672346 acttatcagacttacaacctt-ggttagtggcacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcttcaactaaccctgttattcagaagtaaagaacacag 21672248  T
Q  337 cttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttca 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21672247 cttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcgcattttcctcataacctcagttaagagcttctaatggaccata-gcttctgaataaacttca 21672149  T
Q  437 gaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 536  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21672148 gaaccaaacttcttaatcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaagg 21672050  T
Q  537 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21672049 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 21672023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 65 - 563
Target Start/End: Original strand, 23482388 - 23482892
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggc 158  Q
    |||||||  |||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  23482388 agtgagttatgtgtgtttggtttatatagtgttttgagtaaaaacgttagcaattcagaaaggggacaaacaaacacagtattaatgacaaattgagggc 23482487  T
Q  159 gcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacc 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||  |||     
T  23482488 gcgtgttagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagatcacgtcggagacttttcagacaa--aact 23482585  T
Q  257 t-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
      ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||||| |  |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23482586 gcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacatttccactaactctgctgttcagaagtaaagaatagaacttctgaagttttagtgc 23482685  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  23482686 tgacgtcaccttcagaagcgcattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacaaacatcagaaccaaaattcttattc 23482784  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     ||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23482785 agaagcaaggaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatcttttaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 23482883  T
Q  555 ccattgatg 563  Q
    |||||||||    
T  23482884 ccattgatg 23482892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 93 - 415
Target Start/End: Original strand, 24592280 - 24592603
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24592280 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24592379  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24592380 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24592479  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592480 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24592579  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacca 415  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  24592580 cagttaagagcttctgatgaacca 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 357
Target Start/End: Original strand, 27607595 - 27607905
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27607595 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 27607693  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |    
T  27607694 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttta 27607793  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27607794 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttccaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcaaaagcaaagaataccgcttctgaag 27607893  T
Q  346 ctttagtgctga 357  Q
     |||||||||||    
T  27607894 ttttagtgctga 27607905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 353 - 564
Target Start/End: Original strand, 27616652 - 27616863
Alignment:
Q  353 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttat 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27616652 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttat 27616751  T
Q  453 tccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 552  Q
    || ||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27616752 tcagaggcaagcagtttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatca 27616851  T
Q  553 gcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||    
T  27616852 gcccattgatgt 27616863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21613242 - 21612726
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 143  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  21613242 atgaaagtgtaggttttaaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 21613143  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 242  Q
    ||| || ||||||||||| | |||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||    
T  21613142 tgacaa-ttgggggcgcgagatagtac-tttcaaagctaaaaaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagcgtt 21613045  T
Q  243 tcagaaaactaacctttg-gttaatgggacagctgttactaaaag--taactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    |||||    ||||   |  |||| |||||||| |||||||  |||  ||||| |||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21613044 tcagag---taactgctaagttagtgggacaggtgttacttgaagggtaacttccaacgtttccactaatcctgctattcaggagcaaagaattcagctt 21612948  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  21612947 ctgaagttaaagtgctgacatcatcttcagaagcccattttcctcagaatctcagttaaaagcttctgatggaccata-gcttctgagaagacttcagaa 21612849  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||  ||| |   ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  21612848 ccaaacttctagttcaggagcaagcaaa--ttcaatcagacacaaggtgcatgttcaaatttttctttataaattcaaatctttccagagttaaaggctt 21612751  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21612750 agtaaatatatcagcccattgatgt 21612726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23433869 - 23433770
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23433869 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 23433770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23445236 - 23445135
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  23445236 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacaacattaat 23445137  T
Q  145 ga 146  Q
    ||    
T  23445136 ga 23445135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Original strand, 24932394 - 24932439
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 87  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932394 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 24932439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23465937 - 23465396
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 122  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  23465937 agcagagaaggtttgagatgaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatga 23465839  T
Q  123 gacaaacaaacatagcattaatga-aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacta 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23465838 gacaaacaaacatagcattaatgacaaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 23465739  T
Q  222 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23465738 atagaccatgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 23465639  T
Q  322 aagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465638 aagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgatgtcaccttcagaagcacattttcctcagaaccttagttaagagcttctgatggaccagatgct 23465539  T
Q  422 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23465538 tctgaatggactccagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatct 23465439  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465438 ttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23465396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 564
Target Start/End: Original strand, 19229029 - 19229569
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 122  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19229029 agcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 19229128  T
Q  123 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19229129 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattaggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaaa 19229228  T
Q  223 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  19229229 tagaccacgtcagaaatttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcca-gctattcaga 19229327  T
Q  323 agcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 422  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19229328 agcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 19229427  T
Q  423 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 522  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19229428 ctaaatggacttcagaaccaagcttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctt 19229527  T
Q  523 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19229528 tcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 19229569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 564
Target Start/End: Original strand, 19422594 - 19423116
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19422594 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagggagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 19422692  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19422693 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaact 19422792  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19422793 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcca-gctattcagaagcaaagaatgccgctt 19422891  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19422892 ctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagagacacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttttgaatggacttcagaa 19422991  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19422992 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttt 19423091  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  19423092 agtaaatatatcagcccattgatgt 19423116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 30321310 - 30320788
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30321310 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 30321211  T
Q  140 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30321210 ttaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 30321111  T
Q  240 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  30321110 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgctt 30321012  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  30321011 atgaagttttagtgccgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttatgaatggacttcagaa 30320912  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30320911 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaat-aaaataaatctttcaacagataaaggttt 30320813  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30320812 tgtaaatatatcagcccattgatgt 30320788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25680610 - 25680070
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga 122  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  25680610 agcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacttttgcaattcaaaaga 25680512  T
Q  123 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25680511 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgagtgttaatacgtttaaaagctaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaaa 25680412  T
Q  223 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaa-ctaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25680411 tagaccacatcagaaacttttcagaaaaactaacatttgggtaatgggacagctgttac-aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 25680313  T
Q  322 aagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 421  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||  ||||    
T  25680312 aagcaaaaaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaaggccttctaatgaaccaagtgct 25680213  T
Q  422 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25680212 tctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatct 25680113  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25680112 ttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25680070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 19132954 - 19133471
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19132954 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 19133052  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19133053 acaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 19133152  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19133153 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 19133252  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19133253 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 19133352  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19133353 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19133452  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19133453 tatatcagcccattgatgt 19133471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 26115546 - 26116062
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26115546 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 26115644  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  26115645 acaaattgggg-cgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 26115743  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26115744 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatatcgcttctgaag 26115843  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26115844 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 26115943  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115944 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 26116043  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  26116044 tatatcagctcattgatgt 26116062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 563
Target Start/End: Original strand, 3837127 - 3837639
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3837127 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataagggacaaacaaacatagcattaatgac 3837225  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3837226 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctctttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcaga 3837325  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
      | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  3837326 ctaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagt 3837424  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3837425 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagtaaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcagaaccaaact 3837523  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3837524 tcttattcagaggcaagcaaa-tcttaaccagacacaaagtgcatgttcaaattttacttgataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaat 3837622  T
Q  547 atatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||    
T  3837623 atatcagcccattgatg 3837639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 6155340 - 6155857
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6155340 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 6155438  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6155439 caaattggaggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6155538  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  6155539 aaaactatcttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 6155638  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6155639 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 6155738  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6155739 ttcttactcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6155838  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6155839 tatatcagcccattgatgt 6155857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 32084255 - 32083778
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  32084255 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 32084156  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  32084155 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 32084056  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32084055 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 32083956  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  32083955 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaa 32083856  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32083855 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 32083778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 44485388 - 44485905
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44485388 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 44485486  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  44485487 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcag 44485586  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  44485587 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 44485686  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44485687 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 44485786  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44485787 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttttttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 44485886  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44485887 tatatcagcccattgatgt 44485905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 29080705 - 29081182
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29080705 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 29080804  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  29080805 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 29080904  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29080905 aactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 29081004  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  29081005 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccagacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 29081104  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29081105 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 29081182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 13695129 - 13694652
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  13695129 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 13695030  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  13695029 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 13694930  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13694929 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttacctcaga 13694830  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  13694829 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 13694730  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13694729 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 13694652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 48 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22152887 - 22152372
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22152887 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 22152788  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22152787 caaattgggggtgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 22152688  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||     |||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22152687 gacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgagacgtaactgccaacgtttccaataaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaa 22152589  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22152588 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagatcttctgatggaccaga-gcttctgaataaacttcagaaccaaa 22152490  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22152489 cttcttattcagaggcaagcgaa-tctcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttcataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaa 22152391  T
Q  545 atatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22152390 atatatcagcccattgatg 22152372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 9345416 - 9345889
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  9345416 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 9345515  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  9345516 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 9345615  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345616 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 9345715  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  9345716 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 9345815  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9345816 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9345889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 36297242 - 36297717
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36297242 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36297341  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36297342 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactg 36297441  T
Q  293 ccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc 392  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36297442 ccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc 36297541  T
Q  393 aattaagagcttctgatggacc--agatgcttctg-aatagacttcagaacc-aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    | |||||||||||||||| |||  | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  36297542 agttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaaataaacttcagaaccaaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 36297641  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36297642 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3355190 - 3354717
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  3355190 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 3355091  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  3355090 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactattttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 3354991  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3354990 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 3354891  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3354890 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 3354791  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3354790 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 3354717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 246122 - 246599
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  246122 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 246221  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  246222 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 246321  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  246322 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 246421  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  246422 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 246521  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  246522 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 246599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 809242 - 809719
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  809242 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 809341  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  809342 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 809441  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  809442 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 809541  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  809542 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 809641  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  809642 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 809719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 23787690 - 23788207
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23787690 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatg 23787789  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
    | ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23787790 acaaatttggggcgtgtgtaagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 23787889  T
Q  245 agaaaactaac--ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    |||   |||||  | |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  23787890 aga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttct 23787986  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  23787987 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagtagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaacc 23788085  T
Q  442 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 541  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23788086 aaacttcttattcagaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaaattttcttgataatatcaaatctttcaacagttaaaggctttg 23788184  T
Q  542 taaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23788185 taaatatatcagcccattgatgt 23788207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 222 - 563
Target Start/End: Original strand, 16741118 - 16741463
Alignment:
Q  222 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741118 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctattacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 16741217  T
Q  322 aagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 421  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16741218 aaacaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgct 16741317  T
Q  422 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----tttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaa 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16741318 tctgaattgacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaatttttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaa 16741417  T
Q  518 atctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16741418 atctttcaacaaataaaggctttgtaaatatatcagcccactgatg 16741463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 36082225 - 36082712
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36082225 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36082324  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  36082325 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36082424  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36082425 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 36082524  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatc 476  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||          |||||||||    
T  36082525 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttaatc 36082624  T
Q  477 agacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36082625 agacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 36082712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 21292581 - 21293094
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 148  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21292581 aagtgtagcttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21292680  T
Q  149 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
    |||| |||| |||||  |||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||    
T  21292681 aattaggggtgcgtgaaagtacgtttaaa-gctattaaaatcatcattgccctttaaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcatttcag 21292779  T
Q  247 aaa-actaacctttggttaatgggacagctgttacta-aaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc-tga 343  Q
    | | |||     || |||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  21292780 agagactgc---ttagttggtgggacaggtgttactagaaagtaacttccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaattcagcttcctaa 21292876  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  21292877 agttttaatgctgatgtcatcttcagaagcatattttcctcagaatctcagttaagagcctctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaactaa 21292975  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21292976 acttcttattcagaggcaagcaagtttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgta 21293074  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  21293075 aatatatcagcatattgatg 21293094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Original strand, 22667336 - 22667850
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22667336 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 22667435  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    || || |||||| ||| || ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||     || |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  22667436 gataa-ttggggacgcatgatagtatgttcaaa-gcaaa-aaagcatcattgccctccaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaagcgttt 22667532  T
Q  244 cagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    |||||   ||||   || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22667533 cagaa---taactgcttagttagtgggacagatgttactgaaaagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaagcaaggaatacaacttct 22667629  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctga-atagacttcagaac 440  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| || |||    
T  22667630 gaagtttaagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatggaccata-gcttttgataaagactacataac 22667728  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||| ||| |    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||| ||     
T  22667729 caaacttcttgttcaggagtaagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttccatagttaaaggttta 22667826  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22667827 gtgaatatatcagcccattgatgt 22667850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 326 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15787030 - 15786792
Alignment:
Q  326 aaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctg 425  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15787030 aaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctg 15786931  T
Q  426 aatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttca 525  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15786930 aataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttca 15786831  T
Q  526 acagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15786830 acagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 15786792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 564
Target Start/End: Original strand, 19933400 - 19933910
Alignment:
Q  51 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||| ||||| | ||||||||||| |    
T  19933400 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagacggggacagacaaatacagcattaatgaca 19933499  T
Q  149 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    | ||||||||||||| |||||  || ||| ||||| ||| |||||||||||  |   || |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  19933500 a-ttgggggcgcgtgatagtacattcaaa-gcaaa-aaatcatcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttcaga 19933596  T
Q  248 aaactaacc-tttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
        ||||  ||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19933597 g---taactgttttgttagtgggacaggtgttactgaatagtaacttccaacgtttccactaacactacttgttcagaaacaaagaatacatcttctgaa 19933693  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  19933694 gtttaagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatagaccata-gcttctgagtagacttcagaaccaaa 19933792  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||  ||| |   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19933793 cttctagttcaggagcaagcaa--gtttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaa 19933890  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19933891 atatatcagcccattgatgt 19933910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15787225 - 15787033
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15787225 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 15787126  T
Q  189 catcattgccct-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttac 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15787125 catcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttac 15787033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 549
Target Start/End: Original strand, 24649176 - 24649674
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  24649176 atgaaagtgtaggttgttaagtgtgtagtgtgtgatttgtcaaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 24649275  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    || |  ||||||||||| | |||||  || ||| || || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  24649276 gacat-ttgggggcgcgagatagtacattcaaa-gctaa-aaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagctttt 24649372  T
Q  244 cagaa-aactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgct-attcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    ||||  |||| |   |  |||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||    | || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24649373 cagagtaactga---taagttagtgggacatgtgttactaagagttacttccaacgtttccactaatactacttattcataagcaaagaattcagcttct 24649469  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 441  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  24649470 gaagttaaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaatctcagttacgagcttctgatggacca-tggcttctgaacagacttcagaacc 24649568  T
Q  442 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 541  Q
    |||||||| |||  |   ||| || |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||      
T  24649569 aaacttctaattaaggagcaaacaga--tttaatcaaacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttat 24649666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 17263636 - 17264149
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||    
T  17263636 gaaaatgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaattgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacatcattaat 17263735  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    || | |  ||||||||| | |||||  || ||| || || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||    
T  17263736 gacata--gggggcgcgagatagtacattcaaa-gctaa-aaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataagccacgtcagaagttttt 17263831  T
Q  244 cagaaaactaacctttg-gttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||   || |||| | |  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||  | ||||||    | ||  ||||| |||||||||| ||||| |    
T  17263832 ca---aagtaacttctaagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaacatttccactaatactacttgttcaggagcaaagaattcagctac 17263928  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  17263929 tgaagttaaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggac 17264027  T
Q  441 caaacttcttattc-cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    |||||||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17264028 caaacttctagttcatgag-caagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaggttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggctt 17264124  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17264125 agtaaatataccagtccattgatgt 17264149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 365 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 20378089 - 20377894
Alignment:
Q  365 ttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgaga-caag 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||  ||| ||||    
T  20378089 ttcagaagcacattttcctcagaatcacaattaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacacacttcaggaccaaacttctagttca-agagcaag 20377992  T
Q  464 caaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20377991 caaattt--aatcatacacaaagttcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacaattaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatg 20377894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22467431 - 22467224
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| | || ||||||| |||||| | | | ||||||| | ||||||||||| || ||| ||    
T  22467431 tgctgacgtcatcctcagaagtacatttttctcagaatctcagtgaatagcttctaatggactata-gtttctgaaca-acttcagaacctaaattccta 22467334  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| |||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||    
T  22467333 ttcagagataagca---ttttaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttactgaatatatc 22467237  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    | |||||||||||    
T  22467236 atcccattgatgt 22467224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 419 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17294312 - 17294169
Alignment:
Q  419 gcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17294312 gcttctgaacagacctcagaaccaaacttcttgttcaacagcaagcaaa--tttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaa 17294215  T
Q  519 tctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  17294214 tctttcaacatttaaagacttagtaaatatatccgtccattgatgt 17294169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 490 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24490811 - 24490737
Alignment:
Q  490 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24490811 atgttcgaatttttctttataaaatcaaatctttcttcagttaagggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24490737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20378281 - 20378182
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||| | | ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  20378281 aaagtgtaggttgtgtagtgagtagtgtgtgatttgtctaagagttttgaataaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 20378182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25207717 - 25207181
Alignment:
Q  26 gcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207717 gcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttttgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 25207619  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25207618 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggctcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 25207519  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25207518 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagcctttctattcagaag 25207419  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25207418 taaaaaatacagcttctgaagttttagtgctgaggtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca-ttgcttct 25207320  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 524  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25207319 gaatagacttcagatccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttc 25207221  T
Q  525 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25207220 aacagataatggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25207181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 564
Target Start/End: Original strand, 9163812 - 9164336
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt---agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9163812 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttg-tttaagtgtttttataaaaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagc 9163910  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9163911 attaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaa 9164010  T
Q  239 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9164011 cttttcaaaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgct 9164110  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9164111 tctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcaga 9164210  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 538  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9164211 accaaacttcttattcagaggcaaacaaattttcaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtt 9164310  T
Q  539 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9164311 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 9164336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15884477 - 15883953
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884477 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttgtcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 15884378  T
Q  140 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15884377 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 15884278  T
Q  240 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15884277 ttttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacttaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaaaaataccgctt 15884178  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15884177 ctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaa 15884078  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  15884077 ccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttt 15883978  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15883977 tgtaaatatatcagcccattgatgt 15883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 564
Target Start/End: Original strand, 20983507 - 20984029
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20983507 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 20983605  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20983606 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 20983705  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20983706 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttc 20983805  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  20983806 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaggacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatagacttcaaaac 20983905  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20983906 caaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 20984005  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20984006 gtaaatatatcagcccattgatgt 20984029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 9437519 - 9438036
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9437519 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 9437617  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9437618 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 9437717  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9437718 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 9437817  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9437818 ttttagtgctgacgtcatctttagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 9437917  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    | ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9437918 tccttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 9438017  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9438018 tatatcagcccattgatgt 9438036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6873878 - 6873361
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6873878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6873780  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  6873779 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6873680  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  6873679 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctatttagaagcaaagaataccacttctgaag 6873580  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873579 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 6873480  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6873479 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6873380  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6873379 tatatcagcccattgatgt 6873361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17956761 - 17956245
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17956761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 17956663  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  17956662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagagactcttcag 17956563  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||   |||||||||     
T  17956562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgttattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 17956463  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17956462 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 17956363  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17956362 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 17956263  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17956262 atatcagcccattgatgt 17956245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 2712219 - 2711744
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2712219 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 2712120  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  2712119 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 2712020  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2712019 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttctggtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 2711920  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  2711919 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 2711820  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2711819 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 2711744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 22093397 - 22093913
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22093397 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 22093495  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  22093496 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22093595  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  22093596 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 22093695  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22093696 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 22093795  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22093796 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 22093895  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22093896 atatcagcccattgatgt 22093913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 8621617 - 8622135
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8621617 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 8621715  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttt--tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  8621716 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 8621815  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8621816 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 8621915  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8621916 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 8622015  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8622016 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 8622115  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8622116 atatatcagcccattgatgt 8622135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 563
Target Start/End: Original strand, 18432784 - 18433294
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  18432784 aaagtgcatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 18432882  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18432883 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 18432982  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
      | ||||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  18432983 ctaataacctt-ggttaatgggacaggtgt--ctaacaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagt 18433079  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18433080 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggacca-aagcttctgaataaactttagaaccaaact 18433178  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18433179 tcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagttcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaat 18433277  T
Q  547 atatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||    
T  18433278 atatcagcccattgatg 18433294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 4216263 - 4216780
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  4216263 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtaatgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcaaaagggataaacaaacacagcattaatga 4216361  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  4216362 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 4216461  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  4216462 aaaactaccttttgggtaatggaacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 4216561  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4216562 tttagtgctgacgtcatcttcagaaacacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 4216661  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4216662 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4216761  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4216762 tatatcagcccattgatgt 4216780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26396742 - 26396225
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtt-tgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26396742 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaaatgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 26396644  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  26396643 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 26396544  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  26396543 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 26396444  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26396443 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 26396344  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26396343 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 26396244  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26396243 tatatcagcccattgatgt 26396225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 171143 - 171662
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  171143 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 171241  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca--aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  171242 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaaaaacgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaacagaccacgtcagagactcttc 171341  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  171342 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 171441  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  171442 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaa 171541  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  171542 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgta 171641  T
Q  544 aatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  171642 aatatatcagcccattgatgt 171662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 9089533 - 9090006
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  9089533 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 9089632  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9089633 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 9089732  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9089733 gccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 9089832  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9089833 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 9089932  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9089933 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40048713 - 40048235
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40048713 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 40048614  T
Q  189 -catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaag 286  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  40048613 acatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaag 40048514  T
Q  287 taactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048513 taactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 40048414  T
Q  387 aacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  40048413 aacctcagttaagagcttctgattaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 40048314  T
Q  486 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40048313 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 40048235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 24738396 - 24738873
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24738396 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 24738495  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  24738496 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 24738595  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24738596 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 24738695  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  24738696 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 24738795  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24738796 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24738873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26692350 - 26691873
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  26692350 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 26692251  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  26692250 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 26692151  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26692150 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttctcaga 26692051  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  26692050 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 26691951  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26691950 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 26691873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 463621 - 463117
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  463621 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 463523  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  463522 caaattgggggcgcgtgatagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 463423  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||     
T  463422 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaaaaataccacttctgaagt 463323  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || |  |||       |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  463322 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc-----agaactaccaatg-------tgcttctgaataaacttcagaaccaaact 463235  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  463234 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 463135  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  463134 atatcagcccattgatgt 463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 8008670 - 8008197
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  8008670 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 8008571  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  8008570 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 8008471  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8008470 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 8008371  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8008370 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaattttttaatcagacacaaaatgca 8008271  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8008270 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 8008197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 1991851 - 1992328
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  1991851 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 1991950  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  1991951 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 1992050  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1992051 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 1992150  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||     
T  1992151 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcgagcaatttttcaatcagacacaaaa 1992250  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1992251 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 1992328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 11009480 - 11009959
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11009480 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11009579  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  11009580 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 11009679  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11009680 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 11009779  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatg-ga--ccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11009780 acctcaattaagagcttctgatgagaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaa 11009879  T
Q  485 agtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11009880 aatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 11009959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 42870128 - 42870620
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  42870128 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 42870227  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  42870228 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 42870327  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || || ||||| ||  | |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42870328 aacttccaccgttctcactaaccaagttattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 42870427  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa---------------tttt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||               ||||    
T  42870428 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttttttttttttttttt 42870527  T
Q  472 taatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42870528 taatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 42870620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 108 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 13180697 - 13180243
Alignment:
Q  108 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-g 205  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  |    
T  13180697 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaag 13180598  T
Q  206 ttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatccca 304  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |||||||| | | |  | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  13180597 ttatacaccaatacaaatagaccatgtcagaggtttttcagaca-caatgcattggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcaacgttccca 13180499  T
Q  305 ctagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 404  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13180498 ctaactctgctattcagaagcaaagaatacagcttct-aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttaaaacctcagttaagagctt 13180400  T
Q  405 ctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 504  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13180399 ctgatggaccaaa-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatctt-aatcagacacaaagtccatgttcaaatttttc 13180302  T
Q  505 tttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13180301 ttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatattagtccattgatg 13180243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4421476 - 4420965
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  4421476 aagtgtaggttgtgaagtaagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 4421377  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||   ||||| |||||| |||||||  ||| |||| |||||||  |||| |||||| |||  | |||||    
T  4421376 aaattgggggcgcgtgaaagtacgtttaa--gcttttaaaatcatcatagccctttaatgtcatacaccaatacacataggccacgttagagtcatttca 4421279  T
Q  246 ga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || ||||||    || |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4421278 gagaaactac---ttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaacgtttccactaacactgttattcagaggcaaagaattcagcttctga 4421182  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||    
T  4421181 agttttagtgctgacgtcatcttcagaggcatattttcctcagagtctcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctggacagacttcagaaccaa 4421083  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| || |||    
T  4421082 acttcttattcagaggcaagcaa--ttttaatcagacacatagtgcatgttc-aatttttctttatgaaatcaaatctttcgacagttaaaggtttagta 4420986  T
Q  544 aatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4420985 aatatatcagcccattgatgt 4420965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Original strand, 14138175 - 14138419
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||     
T  14138175 ttcagaagcaaagaatacatcttctgaagtttaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcataatctcagttaagagcttctgatggaccat 14138274  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | | |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14138275 a-gattctgaatagacttaaaaaccaaacttctagttcaggagcaagcaa--gtttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatca 14138371  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14138372 aatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 14138419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 313 - 564
Target Start/End: Original strand, 4823594 - 4823842
Alignment:
Q  313 gctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  4823594 gctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatcttagttaagagcttctgatgga 4823693  T
Q  413 ccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc-cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 511  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4823694 ccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcatgag-caagcaa--gtttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatatttctttataa 4823789  T
Q  512 aaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    || |||||||||| |||   |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4823790 aatcaaatctttccacaatcaaagacttagtaaatatatcatctcattgatgt 4823842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Original strand, 10651409 - 10651618
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||    
T  10651409 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcattttagagcttctgatggaccata-gcttctgaac-gacttcaggacctaaattccta 10651506  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| |   |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  10651507 ttcaggagcaagcaaatttt-aatcactcacaaagtgcatgttcaattttttctttataaaatcaaatctttctacagttaaaggcttactaaatatatc 10651605  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    | | |||||||||    
T  10651606 aactcattgatgt 10651618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 355 - 564
Target Start/End: Original strand, 13661032 - 13661238
Alignment:
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||    
T  13661032 tgacgtcatcctcagaagcacattttcctatgaatctcagttaagagcttatgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggacctaacttctagttc 13661130  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 554  Q
     |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||    
T  13661131 aggagcaaacaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaaaatattagc 13661228  T
Q  555 ccattgatgt 564  Q
    ||||||||||    
T  13661229 ccattgatgt 13661238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 21695068 - 21695168
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||    
T  21695068 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaataaacacatcattaatg 21695167  T
Q  146 a 146  Q
    |    
T  21695168 a 21695168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 14137906 - 14138021
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||  || ||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||    
T  14137906 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttatctaagtg--ttgagtaaaaaggtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 14138003  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgcgt 162  Q
    || | ||||||||||||||    
T  14138004 tg-acaattgggggcgcgt 14138021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16159415 - 16159340
Alignment:
Q  475 tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 550  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| | ||||| |||||||    
T  16159415 tcagatacaaaatgaatgtttaaatttttctttataaaatcaaacctttcaatagttaaacgttttgtgaatatat 16159340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 13660851 - 13660951
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  13660851 gaaagtgtgggttgtgaagtgggtaatgtgtgatttgtataagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaaacattaatg 13660950  T
Q  146 a 146  Q
    |    
T  13660951 a 13660951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 39493 - 38968
Alignment:
Q  39 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39493 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 39395  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaa 238  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39394 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 39295  T
Q  239 cttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39294 cttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaataccgct 39195  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39194 tctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaattgacttcaga 39095  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 536  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39094 accaaacttcttattcagagacaagcaaaaaattttaatcagacacaaagtgcatgctcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaagg 38995  T
Q  537 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  38994 ctttgtcaatatatcagcccactgatg 38968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 43305 - 42830
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43305 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 43206  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  43205 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 43106  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43105 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaaacacatattcctcagaa 43006  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  43005 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 42906  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42905 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 42830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 317 - 557
Target Start/End: Original strand, 3014 - 3250
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |     
T  3014 ttcaggagcaaagaatccagcttctgaagttaaggtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatgaactat 3113  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | | |||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3114 a-gattctgaact-acttcagaacctaacttcttattcaaaagcaagcaaattt--aatcaaacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatca 3209  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3210 aatctctccacagttaaaggcttagtaaatatataagccca 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 2747 - 2848
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  | | |||||||||||| | |||||||    
T  2747 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgattttgtctaaatgtttttagtaaaaacgtttgcaagtcatgaggggacaaacaaacacaacattaat 2846  T
Q  145 ga 146  Q
    ||    
T  2847 ga 2848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Original strand, 7683356 - 7683880
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7683356 atgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgattgcaattcaaatgagacaaacaaacatagca 7683454  T
Q  140 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7683455 ttaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 7683554  T
Q  240 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7683555 tcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcataagcaaagaataccgctt 7683654  T
Q  340 ctg-aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7683655 ctgaaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttatgatggaccagatgcttctgaatggacttcaga 7683754  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 538  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7683755 accaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtacatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtt 7683854  T
Q  539 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  7683855 ttgtgaatatatcagcccattgatgt 7683880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 150291 - 149768
Alignment:
Q  41 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150291 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 150192  T
Q  140 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaac 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  150191 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 150092  T
Q  240 ttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  150091 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggttattgccaacgttcccactagccaa-ctattcagaagcaaagaataccgctt 149993  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  149992 ctgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatggacttcagaa 149893  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  149892 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttt 149793  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  149792 tgtaaatatatcagcccattgatgt 149768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 19183133 - 19183649
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19183133 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 19183231  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  19183232 caaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctatttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 19183331  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19183332 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 19183431  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19183432 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 19183531  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19183532 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 19183631  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19183632 atatcagcccattgatgt 19183649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 5646315 - 5645797
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt--agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5646315 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaat 5646217  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  5646216 gacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 5646117  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5646116 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaa 5646017  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5646016 gttttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 5645917  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5645916 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 5645817  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5645816 atatatcagcccattgatgt 5645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 4171517 - 4172034
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4171517 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 4171615  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  4171616 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4171715  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4171716 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccacttctgaag 4171815  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4171816 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 4171915  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4171916 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4172015  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4172016 tatatcagcccattgatgt 4172034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 12734744 - 12735260
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12734744 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 12734842  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  12734843 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 12734942  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  12734943 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 12735042  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12735043 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 12735142  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12735143 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 12735242  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12735243 atatcagcccattgatgt 12735260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12619763 - 12619245
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12619763 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12619665  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgtta--tactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  12619664 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgtttattactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 12619565  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12619564 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaaagttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 12619465  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12619464 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 12619365  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12619364 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 12619265  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12619264 atatatcagcccattgatgt 12619245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 21867878 - 21868395
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21867878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatg 21867976  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21867977 acaaattgggggcgcttgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 21868076  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  21868077 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 21868176  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21868177 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 21868276  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21868277 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 21868376  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21868377 tatatcagcccattgatgt 21868395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 7511488 - 7512006
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7511488 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 7511586  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  7511587 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 7511686  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  7511687 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 7511786  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7511787 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 7511886  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7511887 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 7511986  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7511987 atatatcagcccattgatgt 7512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 36243001 - 36242523
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36243001 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 36242902  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  36242901 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 36242802  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36242801 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 36242702  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 485  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  36242701 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 36242602  T
Q  486 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36242601 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 51652484 - 51651966
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51652484 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacataacattaatga 51652386  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  51652385 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 51652286  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    ||||||    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  51652285 aaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 51652186  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51652185 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 51652086  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51652085 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 51651986  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51651985 atatatcagcccattgatgt 51651966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 7696041 - 7695564
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  7696041 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 7695942  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  7695941 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 7695842  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7695841 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 7695742  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  7695741 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 7695642  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7695641 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 7695564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 38099340 - 38099817
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  38099340 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaatttggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 38099439  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  38099440 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 38099539  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38099540 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 38099639  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  38099640 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 38099739  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38099740 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 38099817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35644607 - 35644131
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35644607 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 35644508  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  35644507 catcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagta 35644408  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    ||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35644407 acttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 35644308  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 487  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  35644307 cctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaat 35644208  T
Q  488 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35644207 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35644131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35397062 - 35396589
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35397062 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35396963  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35396962 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35396863  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35396862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35396763  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35396762 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35396663  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35396662 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35396589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 47614502 - 47614025
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  47614502 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 47614403  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  47614402 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 47614303  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47614302 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 47614203  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  47614202 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 47614103  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47614102 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 47614025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 5837459 - 5837936
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  5837459 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 5837558  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  5837559 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 5837658  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837659 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 5837758  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  5837759 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttatttagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 5837858  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5837859 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 5837936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 3175850 - 3176333
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  3175850 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 3175949  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  3175950 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 3176049  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3176050 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 3176149  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatcagac 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||          |||||||||||||    
T  3176150 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttaatcagac 3176249  T
Q  481 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3176250 acaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 3176333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 19166258 - 19165744
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||     
T  19166258 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaatacagaatgggacaaacaaacacagcattaatgac 19166159  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19166158 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcacttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 19166059  T
Q  246 gaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    || ||  ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19166058 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgccaacgttcccactaactctactattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 19165961  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| || |||| |||||||||||    
T  19165960 gttttagtgttgacgtcatcttcagaagcgtattttcctcagaacctcagttaagtgcttctgatggacca-aaccttctaaacagacatcagaaccaaa 19165862  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    ||||||||||  |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19165861 cttcttattcataagcaagtaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaa 19165763  T
Q  545 atatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19165762 atatatcagcccattgatg 19165744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 46 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 20879607 - 20879092
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20879607 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgtttttaactaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaa 20879508  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttt 242  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  20879507 tgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcttgaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatatac---gtcagaaacttt 20879411  T
Q  243 tcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttct 341  Q
    |||||     |||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||   |||||| || || |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  20879410 tcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcctccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttct 20879312  T
Q  342 gaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  20879311 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgtaccata-gcttctgaatatacttcaaaacc 20879213  T
Q  442 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 541  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20879212 aaacttcttattcagaagcaagcaaa-tcttaatcagacacatggtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacaattaaaggctttg 20879114  T
Q  542 taaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20879113 taaatatatcagcccattgatg 20879092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21212275 - 21211770
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21212275 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattggg 21212176  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaact 252  Q
    ||||||||  ||||  |||||| ||   ||||| |||||||||||  |   || |||| ||||||| || || ||||||||||  | ||||| | |||||    
T  21212175 ggcgcgtgaaagtacatttaaa-gcttttaaaatcatcattgcccgctaaagtcatacaccaatacaaagaggccacgtcagaggcgtttcaaacaaact 21212077  T
Q  253 aacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag 351  Q
         || |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21212076 gc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcataagcaaagaatacagcttttgaagttttag 21211980  T
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21211979 tactgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttg 21211881  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||  |    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| || || ||||||||    
T  21211880 ttgaggaggaagaaaa--tttaatcagacacatagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacatttaaaggtttagtgaatatatc 21211783  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    |||| ||||||||    
T  21211782 agcctattgatgt 21211770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21130908 - 21130396
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | |||||||||||||||| | ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  21130908 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgaataaaacgtttgcaattaagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 21130809  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    |||||||||||| |||  |||| |||  |||||   | ||| |||||||||||  |   || |||| || |||| ||||  ||||||||||  | |||||    
T  21130808 aaattgggggcgtgtgaaagtacgtt--aaagcttttgaaatcatcattgcccgctaaagtcatacacctatacaaataagccacgtcagaggcgtttca 21130711  T
Q  246 ga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || |||||     || |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21130710 gacaaactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacattgctattcagaagcaaggaatacagcttgtga 21130614  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21130613 agttttagtactgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaatctcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctgaacagacttcaaaaccaa 21130515  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||| ||  |   ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||| || ||     
T  21130514 acttcttgtttaggagcaagcaaa--tttaatcagacacatagtgcatgttcaaatttttccttataaaatcaaatttttccacagttaaaggtttagtg 21130417  T
Q  544 aatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21130416 aatatatcagcccattaatgt 21130396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22447904 - 22447655
Alignment:
Q  312 tgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgg 411  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||| ||| |  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22447904 tgctattcatgaacaaagaattcagcttctaaagttaaagtactgatgtcatcttcagaagtacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatgg 22447805  T
Q  412 accagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 511  Q
    || | | |||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22447804 actata-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaagcaaa--tttagtcagacaaaaagtgcacgttcaaatttttctttatta 22447708  T
Q  512 aaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    || ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  22447707 aatcaaatttttccactgttaaaggcttagtaaatatatcagttcattgatgt 22447655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22453138 - 22452889
Alignment:
Q  312 tgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgg 411  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||| ||| |  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22453138 tgctattcatgaacaaagaattcagcttctaaagttaaagtactgatgtcatcttcagaagtacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatgg 22453039  T
Q  412 accagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 511  Q
    || | | |||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22453038 actata-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaagcaaa--tttagtcagacaaaaagtgcacgttcaaatttttctttatta 22452942  T
Q  512 aaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    || ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  22452941 aatcaaatttttccactgttaaaggcttagtaaatatatcagttcattgatgt 22452889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Original strand, 22125978 - 22126222
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||     
T  22125978 ttcaggagcaaaggattcaacttctgaagttaaaatgttgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaggatctcagttaagagcttttgatggaccat 22126077  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | ||||||||| |||||||   ||  ||| |||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22126078 a-gcttctgaacagacttctagacataacctctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaacca 22126174  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  22126175 aatctttccacagttaaaggtttcgtaaatatatcagaccgttgatgt 22126222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 352 - 562
Target Start/End: Original strand, 20933741 - 20933945
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |      
T  20933741 tgctgacgtcatctgcagaaacacattttcctcagaatctcagttaagagcttttgatggatcata-gcttctgaacagacttcaggacctaacttatag 20933839  T
Q  452 ttccgaga-caagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 550  Q
    |||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20933840 ttca-agagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgtt---atttttctttataaaatcaaatatctccacagttaaaggcttagtaaatatat 20933933  T
Q  551 cagcccattgat 562  Q
    ||||||||||||    
T  20933934 cagcccattgat 20933945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Original strand, 20933522 - 20933620
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||||    
T  20933522 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaatacaacattaatga 20933620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Original strand, 22125711 - 22125810
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  22125711 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 22125810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22460674 - 22460559
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| |  |||||    
T  22460674 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaatattaa 22460575  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgc 160  Q
    || | ||||||||||||    
T  22460574 tg-acaattgggggcgc 22460559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16325306 - 16325264
Alignment:
Q  366 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16325306 tcagaagcacattttcctcagaacctcagtgaagagcttctga 16325264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 5371 - 4868
Alignment:
Q  66 gtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaac-----gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5371 gtgagtagtgtgtgtttgtttataagtgttttta-taaaacaaaatgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacatattgggggcg 5273  T
Q  160 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaaccttt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5272 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaattaaccttt 5173  T
Q  260 ggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacg 359  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5172 gggtaatgggacagctgttacaaagagtaactgccaacgttcccactagccttgcttttcagaagcaaagaataccgcttctgaagctttagtgctgacg 5073  T
Q  360 tcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgaga 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5072 tcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagg 4973  T
Q  460 caagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4972 caagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccatt 4873  T
Q  560 gatgt 564  Q
    |||||    
T  4872 gatgt 4868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38418
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  38940 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacgtagcac 38842  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38841 taatgacaaattaggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 38742  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38741 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggatagctgttacaaaaagtaactgcttacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgcttc 38642  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38641 tgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcatctgatggaccaaatgcttctgaatggacttcagaac 38542  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  38541 caaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaattcttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 38442  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38441 gtaaatatatcagcccattgatgt 38418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 35389 - 35906
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35389 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 35487  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  35488 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 35587  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  35588 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 35687  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35688 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 35787  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35788 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 35887  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35888 tatatcagcccattgatgt 35906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20036483 - 20035962
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20036483 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtctgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 20036385  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20036384 taatgacaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 20036285  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20036284 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactaacca-gctattcaaaagcaaagaataccgcttc 20036186  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20036185 tgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaggcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaac 20036086  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20036085 caaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 20035986  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20035985 gtaaatatatcagcccattgatgt 20035962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 27377018 - 27377537
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27377018 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27377117  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27377118 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27377217  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||     
T  27377218 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 27377317  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27377318 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaaaa 27377417  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27377418 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaaccgataaaggttttgtaa 27377517  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27377518 atatatcagcccattgatgt 27377537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 27467375 - 27467894
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27467375 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27467474  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27467475 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27467574  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||     
T  27467575 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 27467674  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27467675 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaaaa 27467774  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27467775 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaaccgataaaggttttgtaa 27467874  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27467875 atatatcagcccattgatgt 27467894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9119065 - 9118549
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9119065 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 9118967  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9118966 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 9118867  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9118866 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 9118767  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9118766 cttagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 9118667  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9118666 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttcaacagataaaggttttgtaaat 9118567  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9118566 atatcagcccattgatgt 9118549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 563
Target Start/End: Original strand, 25798057 - 25798591
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  25798057 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgattttatcaaaacgtttgcaattcagaagaga 25798155  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25798156 caaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 25798255  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||             |  | ||| ||||    
T  25798256 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacg-------------tcatcttctgaag 25798342  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25798343 caaagaataccgcttctgaagtattagtgctgacgttatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctttt 25798442  T
Q  425 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25798443 gaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaatttttttttttttttaatcagacgcaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaat 25798542  T
Q  515 caaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25798543 caaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 25798591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 27497930 - 27498447
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27497930 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttgttaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 27498029  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27498030 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaattgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 27498129  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||      
T  27498130 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagta 27498229  T
Q  348 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaact 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27498230 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagtcaagagtttctgatggaccagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaact 27498329  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27498330 tcttattcagaagccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcaagttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaaat 27498429  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27498430 atatcagcccattgatgt 27498447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 26037840 - 26038358
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26037840 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaatcgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagtattaatga 26037938  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26037939 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaagtgcagataaaacatcattgccctttttgtcatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 26038038  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||     
T  26038039 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 26038138  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  26038139 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaactttagaaccaaaaa 26038238  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 544  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26038239 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 26038338  T
Q  545 atatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26038339 atatatcagcccattgatgt 26038358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 32968520 - 32968003
Alignment:
Q  47 tgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  32968520 tgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatc 32968422  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32968421 acaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 32968322  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  32968321 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 32968222  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32968221 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 32968122  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32968121 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 32968022  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32968021 tatatcagcccattgatgt 32968003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 18830881 - 18830368
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18830881 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaagagggaacaaacaaacatagcattaatga 18830783  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18830782 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 18830683  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18830682 actaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctatttagtagtaaagaatacagcttctgaag 18830584  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  18830583 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttatgatggacca-aagcttctgaataaatttcagaaccaagc 18830485  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18830484 ttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaa 18830386  T
Q  546 tatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18830385 tatatcagcccattgatg 18830368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 34813736 - 34813220
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34813736 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 34813638  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  34813637 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacattattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34813538  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  34813537 aaaactaccttttggataatgggacagctgttacatgaagtaactgccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 34813438  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34813437 tttagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgattctgaataaacttcagaaccaaact 34813338  T
Q  447 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 546  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34813337 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 34813238  T
Q  547 atatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34813237 atatcagcccattgatgt 34813220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 3665694 - 3666170
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3665694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 3665793  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  3665794 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 3665893  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    |||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3665894 actgccaacgttcccgctaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 3665993  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3665994 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaat 3666093  T
Q  488 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3666094 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 3666170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 43 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25731434 - 25730916
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25731434 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacatagcatt 25731336  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  25731335 aatgacag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatactt 25731237  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||  |  || ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25731236 ttcagacta-aaaactttggttagttggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagcttc 25731138  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  25731137 tgaagttttagtgctgacgtgatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctggtggaccata-gcttctgaacacacttcagaac 25731039  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  25731038 caaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaggtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggtttt 25730940  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25730939 gtaaatatatcagcccattgatgt 25730916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 48 - 563
Target Start/End: Original strand, 13917474 - 13917989
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13917474 gaaagtgtgatttgtgaagtaagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacatagcattaatga 13917572  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13917573 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataagtcatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 13917672  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt-aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    | |  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13917673 aaactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacagaattggcaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaatacagcttctga 13917771  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  13917772 agttttagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgga-caaaagcttctgaataaacttcagaaccaa 13917870  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13917871 acttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatcattcaacagttaaaggctttgta 13917969  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13917970 aatatatcagcccattgatg 13917989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 12859150 - 12859675
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12859150 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12859248  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc---------tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 237  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12859249 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccccttttttttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 12859348  T
Q  238 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagc 337  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   |    
T  12859349 actcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacac 12859448  T
Q  338 ttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 437  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  12859449 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcag 12859548  T
Q  438 aaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggc 537  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12859549 aaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttattaataaaatcaaatctttcaacagataaaggt 12859648  T
Q  538 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12859649 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 12859675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 564
Target Start/End: Original strand, 26869029 - 26869546
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26869029 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 26869127  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26869128 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 26869227  T
Q  247 aaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  26869228 aaacctaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 26869327  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26869328 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaac 26869427  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26869428 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 26869527  T
Q  546 tatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26869528 tatatcagcccattgatgt 26869546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Original strand, 22290211 - 22290728
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  22290211 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaatttaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 22290309  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | ||    
T  22290310 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgccctttttgttctactccaatacaaatagacaacgtcggagattt 22290409  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22290410 ttcagactaataacctt-ggttaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagcttc 22290508  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  22290509 tgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctg-ataaacttcagaac 22290606  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22290607 caaacttcttattcataggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 22290705  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22290706 gtaaatatatcagcccattgatg 22290728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12723370 - 12722893
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12723370 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 12723271  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  12723270 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 12723171  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723170 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 12723071  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  12723070 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 12722971  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12722970 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 12722893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 25791982 - 25792458
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25791982 agtgttttttttaaaacgtttgtaattcagaggggactaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 25792081  T
Q  189 catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagta 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  25792082 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 25792181  T
Q  289 actgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 388  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25792182 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 25792281  T
Q  389 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  25792282 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaat 25792381  T
Q  488 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25792382 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25792458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 26029691 - 26030164
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  26029691 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 26029790  T
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctg-ttactaaaagtaact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26029791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 26029890  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
     |||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26029891 accaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 26029990  T
Q  392 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  26029991 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaataca 26030090  T
Q  491 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26030091 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 26030164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 25 - 413
Target Start/End: Original strand, 12369901 - 12370292
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag 121  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  12369901 agcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaag 12370000  T
Q  122 agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12370001 agacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 12370100  T
Q  222 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 321  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12370101 atagaccacgttagagacttttcagaaaactatcctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcag 12370200  T
Q  322 aagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggac 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12370201 aagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggac 12370292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 27346014 - 27346489
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27346014 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27346113  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27346114 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27346213  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27346214 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27346313  T
Q  392 ca-attaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||  |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||    
T  27346314 cagtttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatg 27346413  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27346414 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgcaaatatatcagcccattgatgt 27346489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 27406754 - 27407229
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27406754 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27406853  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27406854 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27406953  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406954 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27407053  T
Q  392 ca-attaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 488  Q
    ||  |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||    
T  27407054 cagtttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatg 27407153  T
Q  489 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27407154 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgcaaatatatcagcccattgatgt 27407229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 93 - 564
Target Start/End: Original strand, 16953278 - 16953752
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16953278 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16953377  T
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgtt-actaaaagtaac 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16953378 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16953477  T
Q  291 tgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 390  Q
    | |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16953478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 16953577  T
Q  391 tcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 489  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  16953578 tcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgc 16953677  T
Q  490 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16953678 atgttcaagtttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtcaatatatcagcccattgatgt 16953752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Original strand, 4635193 - 4635670
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  4635193 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 4635292  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  4635293 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 4635392  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635393 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 4635492  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  4635493 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaagcttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 4635592  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4635593 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 4635670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 32307580 - 32307103
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  32307580 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 32307481  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  32307480 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 32307381  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307380 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 32307281  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  32307280 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 32307181  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32307180 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 32307103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 21123715 - 21124228
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21123715 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21123814  T
Q  149 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21123815 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 21123914  T
Q  247 aaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 345  Q
    | ||  ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21123915 acaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgacaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 21124012  T
Q  346 ctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21124013 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagagtattttcctcagaacctcagttaagtgcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaac 21124111  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 545  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21124112 ttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattattcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaa 21124210  T
Q  546 tatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21124211 tatatcagcccattgatg 21124228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18922030 - 18921686
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||    
T  18922030 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaag-gaga 18921933  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18921932 caaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactctaatacaaata 18921833  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921832 gaccaagtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaag 18921733  T
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaa 371  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18921732 caaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaa 18921686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 44 - 564
Target Start/End: Original strand, 18547605 - 18548124
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  18547605 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 18547704  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18547705 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatggaccacgtcagaaa-tt 18547803  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||     |||||| ||||||||||||||  |||||| | | | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18547804 ttcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggagttactgagacgcaactgccaacgattccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttc 18547902  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18547903 tgaagttttggtgctcacgtcatcttcagaagcacattttcctgagaacctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcagaac 18548001  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18548002 caaacttcttattcagaggcacgcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattttttttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 18548100  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  18548101 gtaaatatatcagccttttgatgt 18548124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 101 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19457915 - 19457459
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaac-atcattgccc 199  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||  ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  19457915 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaacgacaaat-gggggcgtgtgaaagtacatttaaaagcttataaaaatatcattgccc 19457817  T
Q  200 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaac 297  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19457816 ttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaac 19457719  T
Q  298 gatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatta 397  Q
      | ||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19457718 atttccactaatcctgccattcaaaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtta 19457619  T
Q  398 agagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaa 497  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19457618 agagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaga-tcttaatcagacaaaaagtgcatgttcaa 19457521  T
Q  498 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    ||| ||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457520 attcttcttaataaagtcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 19457459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25682682 - 25682257
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  25682682 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggaacaaacaaacataacattaatgacag-ttggg 25682585  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||    
T  25682584 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagtatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatacttttcagactaaaaac 25682485  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgc 354  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25682484 -ttaggttagttggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgc 25682386  T
Q  355 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25682385 tgacgtaatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacacacttcagaaccaaacttcttattc 25682287  T
Q  455 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 485  Q
      || |||||||| | |||||||||||||||    
T  25682286 aaaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaa 25682257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 22380263 - 22380777
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||     
T  22380263 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 22380362  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22380363 aaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaa-gcttataaaatcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttca 22380461  T
Q  246 gaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || ||  |||   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22380462 gacaa--aactgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcatcgtttccactaactctgccgttcataagcaaagaatacagcttctga 22380559  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  22380560 agtcttagtgctgatgtcatcttcataagcatattttccttagagtcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccac 22380658  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  22380659 acttcctattcagaggcaagcaaatctt-aatcagatacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggttttgtg 22380757  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22380758 aatatatcagaccattgatg 22380777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 101 - 563
Target Start/End: Original strand, 1655062 - 1655524
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 199  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  1655062 aaaacgtttgcgattcagaggagacaaacaaacacggcattaatgacag-ttgggggcgcgtgatagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 1655160  T
Q  200 ttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaa 296  Q
    ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||  |||   ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  1655161 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagaggcttttcagacaa--aactgcttggttagtgggacaggtgttactgaatagtaactaccaa 1655258  T
Q  297 cgatcccactagccttgctattca-gaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaat 395  Q
    || | |||||| |  | || || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |    
T  1655259 cgtttccactaacactactgtttaagaatcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcatattttcctcagaatttcagt 1655358  T
Q  396 taagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc 495  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1655359 taagagcttcagatggaccata-gcttctgaacagacttcagtcccaaacttcctattcagaggcaagcaaatttt-aatcagatacaaagtgcatgttc 1655456  T
Q  496 aaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1655457 aaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 1655524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Original strand, 17051676 - 17052192
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaa-gtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | || ||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||    
T  17051676 aagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgcgtttttgtaaaagtgtttaaagtaaaaacgttaccaattcaggaaggggacaagcaaacacagcattaatg 17051775  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
    | ||||||||||||||||  ||||  || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |||||    
T  17051776 acaaattgggggcgcgtgaaagtacattcaaact-aaataaaatcatcattgcccttttagttatacgccaataccaatagaccatgtcagaggtttttc 17051874  T
Q  245 agaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    ||  |  |  |  |  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||| | ||||||    | ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17051875 aggcacgttgc--taagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactcctaacgtttccactaatactactattcagaggcagagaaaacagcttctga 17051972  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt-aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||   |||||||| | |||||||||||||    
T  17051973 agttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagtttaagagcttctgatagatcaatagcttctgattggacttcagaacca 17052072  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  17052073 aacttattattcagaggcaagcaagcttt-agtcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttagaggttttgt 17052171  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17052172 aaatatatcagcccattgatg 17052192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14066056 - 14065553
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 159  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  14066056 agtgagtagtgtgtgtttggtatttatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaaagagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggagcg 14065957  T
Q  160 cgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcag-aaacttttcagaaaactaacc 256  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||        
T  14065956 cgtgatagtacgttt-aaagcaaaaataatcatcattgccctttttagttatacgccaatacaactaaaccacgtcagaaaacttttcagaaaact---g 14065861  T
Q  257 tttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgcc-aacgatcccac-tagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tg 353  Q
     |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||   |||||||||||| | |   | |||||||||| || || ||    
T  14065860 ctaagttagtgggacaggtgttactaaaagtaactgccaaacgattccacttattctgcttattcagaagcacaaagatccgcttctgaag-ttcagatg 14065762  T
Q  354 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttat 452  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  14065761 ctaatgtcaacatcagaagcatattttcctcagaatctcaataaagagcttctgatgggcta-ttgcttctgaaccaacttcagaacctaaacttcttat 14065663  T
Q  453 tccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 552  Q
    || |   ||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  14065662 tcaggagcaagc-aactgttattcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaattgttaaaggttttgtaaatatatca 14065564  T
Q  553 gcccattgatg 563  Q
    |||||||||||    
T  14065563 gcccattgatg 14065553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 302 - 564
Target Start/End: Original strand, 22809560 - 22809819
Alignment:
Q  302 ccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagag 401  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22809560 ccactaactttgctattcaggagcaaagaattcagcgtctgaagttaaagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagag 22809659  T
Q  402 cttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattt 501  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | |||||  ||| |    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22809660 cttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaacttatcttctagttcaggaggaagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattt 22809756  T
Q  502 ttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22809757 ttctttataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 22809819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 564
Target Start/End: Original strand, 16880403 - 16880916
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  16880403 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttgttagtaaaaatgtttgcaactcggaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 16880502  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    || ||||||||||||| |||||  || ||| || || ||  ||||||||||| ||    || |||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||    
T  16880503 aa-ttgggggcgcgtgatagtaaattcaaa-gctaaaaagtcatcattgcccgttaaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcgtttca 16880600  T
Q  246 gaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    ||    ||||   || |||| |||| | | ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16880601 gag---taactgcttagttagtgggtctggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactatcactacttgttcagaagcaaggaatacatcttctg 16880697  T
Q  343 aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  16880698 aagtttaagtgctgacatcatcatcagaagcacattttcttcagaatcttagttaagagcttctgatggaccaaa-gcttatgaacggacttcagaacca 16880796  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
    |||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  16880797 aacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatattcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacacttaaaggcttagt 16880894  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16880895 aaatatatcagcccattgatgt 16880916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 193 - 415
Target Start/End: Original strand, 11239925 - 11240147
Alignment:
Q  193 attgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt--tggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaa 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  11239925 attgcccttttagttatactccaatacgaatagaccacgtcagagacttttcaga---ctaacaatattggttaatgggacaggtgttactaagacgtaa 11240021  T
Q  290 ctgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaac 389  Q
    ||||||| | | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11240022 ctgccaatgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaac 11240121  T
Q  390 ctcaattaagagcttctgatggacca 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11240122 ctcaattaagagcttctgatgaacca 11240147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 17783732 - 17783943
Alignment:
Q  26 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag-aga 124  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17783732 gcagagaaagtttaga-gaaaagaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggaga 17783830  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca-aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17783831 caaacaaacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 17783930  T
Q  224 agaccacgtcaga 236  Q
    |||||||||||||    
T  17783931 agaccacgtcaga 17783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 432 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 18921693 - 18921562
Alignment:
Q  432 cttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagat 531  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18921693 cttcagaacaaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagat 18921594  T
Q  532 aaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921593 aaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 18921562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7665916 - 7665830
Alignment:
Q  338 ttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 424  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7665916 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatacgcttct 7665830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 366 - 552
Target Start/End: Original strand, 25630554 - 25630734
Alignment:
Q  366 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 465  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||| |   ||||||||| |  |||||||| | || ||| ||||| |||  |||||    
T  25630554 tcagaagcacattttcctcataatctcagtgaagagcttttgatggactatg-gcttctgaaaa--cttcagaatccaaattcctattcagaggaaagca 25630650  T
Q  466 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 552  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || || |||||||||    
T  25630651 c---tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacaattaaagggttagtgaatatatca 25630734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 170
Target Start/End: Original strand, 7665537 - 7665649
Alignment:
Q  59 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 156  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7665537 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaatgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggg 7665635  T
Q  157 gcgcgtgttagtat 170  Q
    ||||||||| ||||    
T  7665636 gcgcgtgtttgtat 7665649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Original strand, 11239823 - 11239920
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  11239823 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaggtgttttgagtaaagcgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 11239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20139026 - 20138949
Alignment:
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20139026 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 20138949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 564
Target Start/End: Original strand, 22193843 - 22193920
Alignment:
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22193843 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 22193920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 95
Target Start/End: Original strand, 22809510 - 22809559
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttt 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22809510 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtattttgtctaagtgttt 22809559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 49544 - 49025
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  49544 aaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttggtaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgac 49446  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49445 aaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttttttgttatagtccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 49346  T
Q  244 cagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49345 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaatcaaagaatacggcttctga 49246  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49245 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccga 49146  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49145 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttttgta 49046  T
Q  544 aatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49045 aatatatcagcccattgatgt 49025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 563
Target Start/End: Original strand, 179717 - 180254
Alignment:
Q  26 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  179717 gcagagaaggttggagaagaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttactaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 179815  T
Q  124 -acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaa 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  179816 gacaaacaaacagagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaatcatcattgtcctttttgttatactccaatacaaa 179915  T
Q  223 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  179916 tagaccacgtcagaaactttttagactaataatctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactaccaacgatcccactagccttgctattcag 180014  T
Q  322 aagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 421  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  180015 aagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgctgacgtaatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagct 180113  T
Q  422 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  180114 tctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatct 180212  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180213 ttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 180254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 108 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 49776 - 49323
Alignment:
Q  108 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgccctttttgt 206  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  49776 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacaaaattaaagacaa-ttgggggcacgtgagagtacgtttaaaagcttatagaaacatcattgcccttttagt 49678  T
Q  207 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccac 305  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| | | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49677 tatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagata-caatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccac 49579  T
Q  306 tagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 405  Q
    || |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  49578 taactctgctatttagaagcatagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatctttagaagtacattttcctcagaacctcggtaaagagcttc 49479  T
Q  406 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 505  Q
    |||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49478 tgatggacca-aagcatctgaacatacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 49381  T
Q  506 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49380 taataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatattagcccattgatg 49323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 5720
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6236 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaa 6138  T
Q  144 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactttt 243  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6137 tgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactttt 6038  T
Q  244 cagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    ||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6037 cagactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaacgctgctattcagaagtaaagaacacagcttctg 5939  T
Q  343 aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  5938 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aaacttctgaataaacttcagaacca 5840  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 542  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5839 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgt 5741  T
Q  543 aaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  5740 aaatatattagcacattgatg 5720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 495 - 5
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  495 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 396  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  395 aaattgggggcgcgtgatagtatatttaatatcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcaga 296  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||      
T  295 aaactaacctttgggtaatgggacagttgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaatgataccttttctgaagta 196  T
Q  348 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaac 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  195 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaac 96  T
Q  446 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 536  Q
    ||||||||| ||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  95 ttcttattcagaggccaacaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaagg 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 48 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2515
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2998 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaaaga 2900  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2899 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttta 2800  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2799 gactaataaactt-ggttaatgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccctactattcagaagtaaagaatacaacttctgaa 2701  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 444  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  2700 gttttagtgctgacgtcatcttcagaaggacattttcctcagaacatcagttaagagcttctgatggatca-atgcttctgaatagtctttagaactaaa 2602  T
Q  445 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagata 532  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2601 cttcttactcagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagata 2515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 89 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 43519 - 43042
Alignment:
Q  89 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  43519 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 43420  T
Q  189 -catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  43419 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43320  T
Q  288 aactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43319 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 43220  T
Q  388 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  43219 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 43120  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43119 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 43042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 5977 - 5458
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  5977 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 5878  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5877 atgacaaattgggggcgcatgtaagtatgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 5778  T
Q  242 ttcagaaaactaac--ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||   |||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  5777 ttcaga---ctaacaacattggttagtgggacaggtgttactaagatgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaact 5681  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5680 tctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-atgcttctgaacagacttcaga 5582  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 538  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  5581 accaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctctcaacagttaaaggct 5483  T
Q  539 ttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5482 ttgtaaatatatcagcccattgatg 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 55317 - 54798
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  55317 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagggtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 55218  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55217 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacatatagaccacgtcagaaactt 55118  T
Q  242 ttcagaaaactaac--ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||   |||||  | |||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  55117 ttcaga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagatgcaactgccaacgattccactaaccctactattcagaagtaaagaacacagct 55021  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  55020 tctgaagttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcaga 54922  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 538  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  54921 accaaacttcttattcggagggaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaattgttaaaggct 54823  T
Q  539 ttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  54822 ttgtaaatatatcaggccattgatg 54798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 192 - 507
Target Start/End: Original strand, 195413 - 195729
Alignment:
Q  192 cattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  195413 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 195512  T
Q  292 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195513 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 195612  T
Q  392 caattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaa-atttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  195613 cagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagaaatttttttaatcagacacaaagtgca 195712  T
Q  491 tgttcaaatttttcttt 507  Q
    |||||||||||||||||    
T  195713 tgttcaaatttttcttt 195729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 59 - 490
Target Start/End: Original strand, 31149 - 31582
Alignment:
Q  59 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggggg 157  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31149 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgttttaagtgttttaattaaaacgtttgcaattcagaacaaaaaaacaaacatagcattaatgacaaattgaggg 31248  T
Q  158 cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31249 cgcgtgttagtatgtttaaaaccaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct 31348  T
Q  258 ttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctga 357  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||||||||    
T  31349 ttgggtaatgggacagctgtaacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagtattagtgctga 31448  T
Q  358 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttattccg 456  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31449 cgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagtcaagagtttctgatggaccagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaacttcttattcag 31548  T
Q  457 agacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31549 aagccagcaatttttcaatcagacacaaagtgca 31582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 58 - 563
Target Start/End: Original strand, 131946 - 132450
Alignment:
Q  58 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  131946 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 132043  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaa 254  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  | |||    
T  132044 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcatgaccctttttcgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcagactaataa 132143  T
Q  255 cctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtg 353  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  132144 c-tttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgcgaacgatcccactaactctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtg 132242  T
Q  354 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 453  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  132243 ccgacgttatcttgagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttatt 132341  T
Q  454 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 553  Q
    | ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  132342 cagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcaa 132440  T
Q  554 cccattgatg 563  Q
    ||||||||||    
T  132441 cccattgatg 132450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 108 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 259
Alignment:
Q  108 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 206  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  712 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaaagacaa-tggggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaaaacatcatttcccttttagt 614  T
Q  207 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacgatcccac 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |   | |  | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  613 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcacacg-caatgcattggttaatgggacaggtgtcactgaaaagtaattgccaacgttcccac 515  T
Q  306 tagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 405  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  514 taactctgctattcagaagcaaagaatacaacttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttc 415  T
Q  406 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 505  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  414 tgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttct 317  T
Q  506 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  316 taataaaatcaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagctcattgatg 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 563
Target Start/End: Original strand, 6210 - 6729
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  6210 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 6309  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  6310 ataaaaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcatagactt 6409  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||  |  |||||| ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  6410 ttcagactaacaacctt-ggttagtgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaactaaagaacacagcttc 6508  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  6509 tgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaac 6607  T
Q  441 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 540  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||| ||    
T  6608 caaacttcttattcagaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgaatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctatcaaaagttaaaggcatt 6706  T
Q  541 gtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6707 gtaaatatatcagcccattgatg 6729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 43 - 564
Target Start/End: Original strand, 73839 - 74361
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 138  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  73839 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttg--tttaagtgttttttgtaaaaacgattgcaattcagaagaggggacaaacaaacatagc 73936  T
Q  139 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaa 237  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||  || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  73937 attaatgacaaattaggggcgcgtgaaagtacattgaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagag 74036  T
Q  238 acttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacag 336  Q
    ||||||||||     |||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||| || || || |||||||||| |||||| ||||    
T  74037 acttttcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcttccattaaccctgttattcagaagtaaagaacacag 74135  T
Q  337 cttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttca 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  74136 cttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccata-acttctgaataaacttca 74234  T
Q  437 gaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 536  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  74235 gaaccaaacttcttaatcagaggcaagcaaa-ttttaattagacacaaagtgcatcttcaagtttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaagg 74333  T
Q  537 ctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  74334 ctttgtaaatatatcagcccattgatgt 74361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 51 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 360 - 1
Alignment:
Q  51 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  360 agtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaa 261  T
Q  150 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaa 249  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  260 aatgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagacaacgtcagaaacttttcagaaa 161  T
Q  250 actaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagcttt 349  Q
    | |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  160 aataacctttgggtaatgggacaattgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agctattcagaagcaaagaatactgcttctgaagtttt 62  T
Q  350 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 44 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 83
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||    
T  602 aaatgaaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggggacaaacaaacacaacatta 503  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  502 atgacaaattgggggcgcgtgtaagctagtttaaaagcatataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagaaactt 403  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||     |||||| |||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||| | |||||| || || |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  402 ttcagacttacaacctt-ggttaatggggcaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttc 304  T
Q  341 tgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaa-gcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  303 tgaagatttagtgctgacgtcatcttcagaaagcacatttttctcagaactttagttaagagcttctgatggaccaaa-gcttctgaataaacttcagaa 205  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  204 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaatctt-aatcagacacaaagttcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggatt 106  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgat 562  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  105 tttaaatatatcagcccattgat 83  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 46 - 563
Target Start/End: Original strand, 6287 - 6805
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcatta 142  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||    
T  6287 atgaaagtgtgagttatgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacggttgcaattcagaaaggggacaagcaaagatagcatta 6385  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  6386 atgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagagactt 6485  T
Q  242 ttcagaaaactaac--ctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||   |||| ||  | ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||   | |||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  6486 ttca---aacttacagccttggttaatgg-acaggtgttactgaaacgtaactgccaatccttccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacagct 6581  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa-cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 437  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  6582 tctaaagttttagtgctgatgtcatcctcagaagcacattttcctcagaatcctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcag 6680  T
Q  438 aaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggc 537  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6681 aaccaaacttcttattcaaaggcaagcaaatctt-aatcagacccaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatcattcaacagttaaaggc 6779  T
Q  538 tttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6780 tttgtaaatatatcagcccattgatg 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 108 - 529
Target Start/End: Original strand, 109230 - 109650
Alignment:
Q  108 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 206  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  109230 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgt 109329  T
Q  207 tatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatccca 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  109330 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttcca 109427  T
Q  305 ctagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 404  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  109428 ctaatcctgccattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtactgacgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaaccttagttaagagctt 109527  T
Q  405 ctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 504  Q
    || |||||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109528 ctcatggacca-aagcttctgaacaaacaacagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 109625  T
Q  505 tttataaaaacaaatctttcaacag 529  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  109626 ttaataaaatcaaatctttcaacag 109650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 48 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 69426 - 69063
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  69426 gaaagtgtgagttgcgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagagtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaaggattaatg 69328  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  69327 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgcccttttttttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 69228  T
Q  246 gaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 344  Q
    ||  | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  69227 gactaataaccttgggt-aatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaa 69129  T
Q  345 gctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatg 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  69128 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatg 69063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 63 - 490
Target Start/End: Original strand, 10835 - 11262
Alignment:
Q  63 gaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10835 gaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtatttagtaaaaacgattgcaattcataaggggataaacaaacatagcattaatgacaaattgtgggcgc 10933  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaaccttt 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||   | ||    
T  10934 gtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaca-ctgtacatt 11032  T
Q  260 ggttaatgggacagctgttactaa-aagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgac 358  Q
     |||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11033 agttagtggaaaaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgac 11132  T
Q  359 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 458  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |    
T  11133 gtaatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgttggacca-aagcttctgaacatacttcagaaccaaacttcttattcagtg 11231  T
Q  459 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 490  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11232 gcaagcaaa-ttttaatcagacacaaagtgca 11262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 57 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 1
Alignment:
Q  57 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 179  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  178 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 79  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 333  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78 ctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8261
Alignment:
Q  57 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8533 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 8434  T
Q  156 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 8334  T
Q  256 ctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaa 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8333 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaa 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 65 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 161555 - 161054
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  161555 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 161456  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 258  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | | |  |||    
T  161455 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcagaca-caatgctt 161357  T
Q  259 tggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctga 357  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||   |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  161356 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctga 161257  T
Q  358 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 457  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  161256 tgtcatctttagaagtgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcaga 161158  T
Q  458 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  161157 gacaagcaagtttt-aatcagacacaaagagcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccg 161059  T
Q  558 ttgat 562  Q
    |||||    
T  161058 ttgat 161054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 101 - 559
Target Start/End: Original strand, 13417 - 13872
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 199  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| ||||   |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  13417 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacaacattaatgacaa-tcgggggcacgtgaacgtacatttaaaagcttataaaatcatcatttccc 13515  T
Q  200 tttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacg 298  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||   || ||||| |   ||   ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13516 ttttagttatacaccaatacagatagaccacgtcagaggtttatcagacac--aatgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactcccaacg 13613  T
Q  299 atcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaa 398  Q
    || ||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13614 attccactaatcctaccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctccattaa 13713  T
Q  399 gagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13714 gagcttctgatggacca-aggcttctgaaaaaacttcagaaccaaacttcttattcggagacaagc-aagttttgatcagacacaaagtgcatgttcaaa 13811  T
Q  499 tttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812 tttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 13872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 101 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 5979
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||  |||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  6439 aaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacacagcattaatgacaact-gggggcgcgtgaaagtacgtttaaa-gcttataaaatcatcattgccc 6342  T
Q  200 ttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaa 296  Q
    ||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |   |||   || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6341 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagagccttttcagacag--aactgcttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 6244  T
Q  297 cgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt 396  Q
    || | |||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  6243 cgtttccactaacactactgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcaccttcagaagcatattttcctcagaatcttagtt 6144  T
Q  397 aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttca 496  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6143 aagagcttctgatggaccata-gcttcttaacagacttcagaaccatacttcttattcagagtcaaacaca-ttttaatcagacacaaagtgcatgttca 6046  T
Q  497 aatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 aatttttcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatg 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 101 - 560
Target Start/End: Original strand, 20966 - 21424
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  20966 aaaacgtttgcaattcaaaggagacaaacaaacacaacattaatgacaa-ttgggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 21064  T
Q  200 tttt-tgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaa 296  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| ||  |||   || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21065 ttttatgttatacaccaatacaaacggaccacgtcaaaggctttttagacaa--aactggttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 21162  T
Q  297 cgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt 396  Q
    || | |||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  21163 cgtttccactaacactgctgttcagaagcaaagaattcagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagatgcacattttcctcagaatctcagtt 21262  T
Q  397 aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttca 496  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21263 aagagcttctgatggatca-ttgcttctgaatcgacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaaa-ttttaatcagacacaaaatgcatgttca 21360  T
Q  497 aatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattg 560  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  21361 tatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaagttttagtgaatatatcagcccattg 21424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 43 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 1
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  251 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaatgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 153  T
Q  142 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  152 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 53  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgc 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagttgttacaaaaagtaactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1810
Alignment:
Q  26 gcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 124  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057 gcagagaaggttgaagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 1959  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaata 224  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1958 caaacaaacatagcattaaagacaagttgggggcgcgtgttagtacgtttaaaatcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 1859  T
Q  225 gaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1858 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatgggacag 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 307
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6868
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 6701  T
Q  141 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaact 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6702 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 6801  T
Q  241 tttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccacta 307  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6802 tttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccacta 6868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 189 - 563
Target Start/End: Original strand, 11396 - 11767
Alignment:
Q  189 catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaa-actaacctttggttaatgggacagctgttactaaaag 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| | |||     || |||| |||||||| ||||||| |||     
T  11396 catcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagatgcgtttcagagagactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaaaa 11492  T
Q  287 taactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 386  Q
    ||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11493 taacttccaacgtttccactaaccctgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatatcatcttcagaagcgcattttcctcag 11592  T
Q  387 aacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  11593 aacctcagttaagagcttctgaaggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggaaagcaaa-ttctaatcagacacaaaa 11690  T
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11691 tgcatgttcaaatttttcttaatcaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcaaattgatg 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8825 - 8332
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacat-agcattaatgaaaaa--ttgggggcgcgtgttagt-atgtttaaaagcaaataaaacatcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8825 aaaacgtttgcaattcaaattgagacaaacaaacattagcattaatgaacaaagttgggggggcgtgttagttatgtttaaaagcaaataaaacatcatt 8726  T
Q  196 gccctttttg--ttatactccaa-tactaa-tagaccacgtcagaaac-ttttcagaaaactaacc-tttggttaatgggacagct-gttactaaaagt- 287  Q
    |||||||||   ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||     
T  8725 gcccttttttgtttatactcccagtacaaactagaccacgtcagaaactttttcagaaaactaaccttttgggtaatgggacagctagttacaaaaagta 8626  T
Q  288 aactgccaacgat-cccactagccttgctattc-agaagc-aaagaatacagcttctg-aag-ctttag-tgctgacgtcatc-ttcagaagcaca-ttt 379  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8625 aactgcaaacgatccccactagccatgctattctagaagcaaaagaataccgcttctgtaagtttttagttgctgacgtcatctttcagaagcacatttt 8526  T
Q  380 tcctcagaa--cctcaattaagagcttctga-tggacc-agatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaa 474  Q
    |||||||||  | | | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  8525 tcctcagaaacctttagttaagagcttctgattggaccaaaatgcttctgaatggacttcagaaccaaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaa 8426  T
Q  475 tcagacacaaagtgcatgttc-aaatttttctt-tataaaaacaaa-tctttcaacag-ataaaggctttgt-aaatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8425 tcagacacaaagtgcatgttctaaatttttcttaaataaaatcaaattctttcaacagtataaaggttttgtaaaatatatcagcccattgatg 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10345
Alignment:
Q  42 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 87  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10390 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 10345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 563
Target Start/End: Original strand, 11433 - 11895
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgc 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||  |||  ||||| |||||||||    
T  11433 aaaacgtatgcaattcagaaaggggacaaaaaaacacagcattaatgacaaattgggggcgtgtgaaagtacgtttaa--gcatttaaaatcatcattgc 11530  T
Q  198 ccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgcc 294  Q
    ||| |   ||||||| | ||||| || ||||||||| ||| || ||||||| ||  |||   || |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11531 cctctaaagttatacactaatacaaacagaccacgttagagacgtttcagacaa--aactgcttagttagttggacaggtgttactgaaaagtaactgcc 11628  T
Q  295 aacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaa 394  Q
    ||||   |||||| |  |||| |||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  11629 aacgtctccactaacactgctgttcagaagcaaataatttaggttctgaagttttagtgcttacgtcatcttcagatgcacattttcctcagaatctcag 11728  T
Q  395 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgtt 494  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11729 ttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaatagacttcataaccaaacttcttattcaaaggcaggcaaatttt-aatcagacataaagtgcatgtt 11826  T
Q  495 caaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 563  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11827 caaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 11895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1078 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1078
Description:

Target: scaffold1078; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 50 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 1
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaa 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||| |    
T  357 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagtattaatgaca 258  T
Q  149 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||     
T  257 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcag- 159  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagc 346  Q
    | || |  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  158 acacaatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagactacaacttctgaagt 59  T
Q  347 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  58 tttagtgttgacgtcatcttcagaaccacattttcctcagaacctcagttaagagctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20867 - 20627
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  20867 ttcataagcaaagaattcagcttctgaagttttagagctgacgtcatctttagaggcatattttcctcagaaactcagttaagagcttctgatggaccat 20768  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20767 a-gcttctgaacagacttcagacccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatca 20670  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20669 aatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34068 - 33828
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  34068 ttcataagcaaagaattcagcttctgaagttttagagctgacgtcatctttagaggcatattttcctcagaaactcagttaagagcttctgatggaccat 33969  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33968 a-gcttctgaacagacttcagacccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatca 33871  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33870 aatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 33828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21084 - 20948
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 199  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  21084 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatg-acagttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 20986  T
Q  200 t-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 236  Q
    | |   || |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  20985 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcaga 20948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34285 - 34149
Alignment:
Q  101 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgccc 199  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  34285 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatg-acagttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 34187  T
Q  200 t-ttttgttatactccaatactaatagaccacgtcaga 236  Q
    | |   || |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  34186 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcaga 34149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 563
Target Start/End: Original strand, 24723 - 25215
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaatt-gggggcgc 160  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24723 agtgagttgtgtgtgtttggtatatatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaatttgggggcgc 24822  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa---catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacc 256  Q
    |||  |||| ||||||  || || ||||   |||||||||||| ||  |||| || |  |||| ||||| ||| |||||| || ||||||| ||||        
T  24823 gtgaaagtacgtttaa--gccaagaaaaaatcatcattgccctcttaagttacacgctgatacaaataggccatgtcagagacgtttcagacaactgc-- 24918  T
Q  257 tttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgct 355  Q
     || |||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||| | |||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  24919 -ttagttagtgggacaggtgttacaaaaatgtaacttccaacgtttccactaacactgcttttcagaaccaaagaacacagcttctgaagttctagtact 25017  T
Q  356 gacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcc 455  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  25018 gacgacatcttcagaagcacattttcctcag--------ttaaaagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaactttctattca 25108  T
Q  456 gagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcc 555  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25109 gaggcaagcaaatttt-aatcagatacaaagtgcatgtacaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagca 25207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 226
Target Start/End: Original strand, 18426 - 18627
Alignment:
Q  25 agcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 123  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18426 agcagagaaggttggagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaaatgagtagtgtgtgtttgttt-aactgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagat 18524  T
Q  124 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18525 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 18624  T
Q  224 aga 226  Q
    |||    
T  18625 aga 18627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 564
Target Start/End: Original strand, 13420 - 13890
Alignment:
Q  90 gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||| |||     
T  13420 gtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagtggacaaacaaacacaacattattgacaa-ttgggggggcgtgatagtacgttcaaa-gcaaa-aaat 13516  T
Q  189 catcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacct-ttggttaatgggacagctgttactaaa-a 285  Q
    |||||||||||  |   || |||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||||   ||||   || |||| |||||||| ||||||| || |    
T  13517 catcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagacgagtttcagaa---taactgcttagttagtgggacaggtgttactgaaga 13613  T
Q  286 gtaactgccaacgatcccactagccttgct-attcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 384  Q
    |||||| |||||| | |||||| |  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13614 gtaacttccaacgtttccactaacactgcttattcagaagcaaggaatacaacttctgacgtttaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 13713  T
Q  385 agaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaa 484  Q
    | || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||  |||||||||||||||    
T  13714 ataatcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctttttcaggagcaagcaaa--tttaatcagacacaa 13810  T
Q  485 agtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13811 agtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatatccacagttaaaggtttagtgaatatatcagcccattgatgt 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 353
Target Start/End: Original strand, 62782 - 63093
Alignment:
Q  44 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||    
T  62782 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataagggggcaaataaacatagcatta 62881  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  62882 atgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttattctccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 62981  T
Q  242 ttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttc 340  Q
    ||||||     |||| ||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  62982 ttcagacttacaacc-ttggttaatggaacaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttc 63080  T
Q  341 tgaagctttagtg 353  Q
    ||||| |||||||    
T  63081 tgaagttttagtg 63093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Original strand, 220565 - 220788
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  220565 aaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 220663  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  220664 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 220763  T
Q  248 aaactaacctttggttaatgggacag 273  Q
      | ||||| ||||||||||||||||    
T  220764 ctaataacc-ttggttaatgggacag 220788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Original strand, 10999 - 11514
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt-gttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 142  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||    
T  10999 atgaaagtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcttaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaatatta 11098  T
Q  143 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    |||| || |  |||||||| | |||||  ||||||   |||  || |||||||||||  ||  || |||| ||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  11099 atgacaatt--ggggcgcgagatagtacatttaaagttaaa--aatcatcattgcccacttaagtcatacaccaatataaataaaccacgtcagaagctt 11194  T
Q  242 ttcagaa-aactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgct-attcagaagcaaagaatacagct 338  Q
    ||||||  |||||    |  |||| ||||| || |||||||||| ||||||  |||||| | |||||| |  |||| |||||||||||||||||  || |    
T  11195 ttcagagtaactac---taagttagtgggaaaggtgttactaaagagtaacctccaacgtttccactaactctgcttattcagaagcaaagaattaagtt 11291  T
Q  339 tctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 438  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  11292 tctgaagttaaagtgccgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaaactcagttaagagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcaga 11390  T
Q  439 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 538  Q
    |||||||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  11391 accaaacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagagacaaagtacatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttttcacagttaaaggct 11488  T
Q  539 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11489 tagtaaatatatcagcccattgatgt 11514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 11501 - 10997
Alignment:
Q  59 ttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||     ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  11501 ttgtgaagcgagtagtgtgtgttttgccaaagtgttttgagtaaaaatgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacacatcattaatgacaaattaggg 11402  T
Q  157 gcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcaga-aaactaa 254  Q
    |||||||  |||| ||| |||     | ||| ||||| |||||  |   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||      
T  11401 gcgcgtgaaagtacgttcaaagctttaaaaatcatcaatgcccactaaagtcgtacaccaatacgaatagaccacgtcagaggcatttcagacaaactgc 11302  T
Q  255 cctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtg 353  Q
       || |||| |||| ||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |  ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||     
T  11301 ---ttagttagtggggcaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcataagcaatgaatacatcttttgaagttttagtt 11205  T
Q  354 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11204 ctgacttcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttgtt 11106  T
Q  454 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 553  Q
    | |   ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||    
T  11105 caggagcaagcaaa--tctaattagacacaaagtgcatgttcaattttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggtttagtgaatatatcag 11008  T
Q  554 cccattgatgt 564  Q
    | |||||||||    
T  11007 ctcattgatgt 10997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 564
Target Start/End: Original strand, 3174 - 3691
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 144  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  3174 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtaatgtgtgttttgtctaagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 3273  T
Q  145 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaa--aagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaactt 241  Q
    || || ||||||| |||||  |||| ||| ||  ||  ||| ||| |||||||||||  |   || |||| || |||| |||||| |||  ||||  | |    
T  3274 gacaa-ttgggggtgcgtgaaagtacgttcaagcaaaaaaaaaaatcatcattgcccactaaagtcatacaccgatacaaatagatcacaccagagtcgt 3372  T
Q  242 ttcagaa-aactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagctt 339  Q
    || |||| ||||     || |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||| | | || ||| |  ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  3373 ttaagaacaactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaactaccaatgtttcccctaacactgctatttaaaagcaaggaatacagctt 3469  T
Q  340 ctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 439  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3470 atgaagtttaagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcaaaatcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaatagacttcagaa 3568  T
Q  440 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
    ||||||||||   || |   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  3569 ccaaacttctagctcaggagcaagcaaa--tttaatcagacataaagtgcatgttcaaatatttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggttt 3666  T
Q  540 tgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
     || |||||||||| ||||||||||    
T  3667 agtgaatatatcagtccattgatgt 3691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 564
Target Start/End: Original strand, 12026 - 12325
Alignment:
Q  261 gttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgt 360  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||| | |||||| |  |||||||||  || ||||| || ||||||||||| |   ||||||| ||    
T  12026 gttagtgggacaggtgttaccaaa-gtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaagagaaaagagtatagcttctgaagttaaggtgctgatgt 12124  T
Q  361 catcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagac 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |   |    
T  12125 catctttagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacatacttcaggacctaacttcttgttcaggagc 12223  T
Q  461 aagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattg 560  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12224 aaacaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaaattttctttataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattg 12321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 11809 - 11868
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt---taagtgtttttagtaaaa 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||    
T  11809 gaaagtgtaggttgtgatgtgagtagtgtgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaa 11868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 30791 - 30287
Alignment:
Q  51 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  30791 agtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 30692  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaac-atcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||| ||| ||   |||||  ||||||||||  |   || |||| ||||||| ||||| ||||||||||  | |||||    
T  30691 aaattgggggcgcatgaaagtacgttcaaa-gcttttaaaattatcattgcccgctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcagaggcgtttca 30593  T
Q  246 ga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    || |||||     || |||| ||| |||| |||| || || ||||||| |||||| | |||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  30592 gacaaactgc---ttagttagtggtacaggtgttgctgaagagtaacttccaacgtttccactaaccctgctatttagaagcaagaaataccgcttctga 30496  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  30495 agttttagtactgatgtcatcttcagaagcacattttcatcagaatctcagttgagagcttctaatggaccata-gcttctgaatagatttcagaaccaa 30397  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    ||||||| ||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||| ||  |     
T  30396 acttcttgttcaggagcaagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccactgttaaaggtttaatg 30299  T
Q  544 aatatatcagcc 555  Q
    ||||||||||||    
T  30298 aatatatcagcc 30287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 162192 - 161678
Alignment:
Q  50 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  162192 aagtgtaggttgtgaagtgagtggtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 162093  T
Q  148 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcag 246  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||     | ||| | |||||||||| |   || |||| ||||||  ||||| ||||||||||  | ||||||    
T  162092 aaatttggggcgcgtgaaagtatgtttaaagctttaaaaatcgtcattgccctctaaagtcatacaccaatataaataggccacgtcagagccgtttcag 161993  T
Q  247 a-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctga 343  Q
    | |||||     || |||| ||||| || ||||||| || ||||||| |||||| | ||||||    | ||  |||||||||||| | | || |||||||    
T  161992 acaaactgc---ttagttagtgggataggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaatactacttgttcagaagcaaaaacttcaacttctga 161896  T
Q  344 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 443  Q
    || |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| |||| |||| |||||||  |    
T  161895 agttcaattgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgaaggaccataa-cttttgaacagacctcagaactta 161797  T
Q  444 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 543  Q
    |||| | |||| |   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  161796 acttttaattcaggagcaagcaagcttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatcttttaacagataaaggcttagta 161698  T
Q  544 aatatatcagcccattgatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  161697 aatatatcagcccattgatg 161678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 278
Target Start/End: Original strand, 30302 - 30528
Alignment:
Q  51 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaa 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30302 agtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtctttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaa 30400  T
Q  150 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||      
T  30401 attgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatatatttcatcattgccctttttgttatactccaatccacatagaccacgtcagagatttttcagact 30500  T
Q  250 actaacctttggttaatgggacagctgtt 278  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30501 aataacc-ttggttaatgggacaggtgtt 30528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 285 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 31146 - 30870
Alignment:
Q  285 agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 384  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |  ||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  31146 agtaacttccaacgtttccactaacactgcaattcagaagtaagaaatacagcttttgaagtttaagtgctgtcgtcatcttcaaaagcacattttccta 31047  T
Q  385 agaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccg-agacaagcaaatttttaatcagacaca 483  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31046 agaatctcagttaagagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcagaaccaaacttcttgttcaggaga-aagcaaattt--aatcagacaca 30951  T
Q  484 aagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||  |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  30950 aagtgcatgttcaaatttttctttataacatcaaacctttccacaattaaaggtttagtgaatatatcagcccattgatgt 30870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Original strand, 2707 - 2951
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  2707 ttcaggagcaaacaattcaacttctgaagttgaaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccat 2806  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |  ||| |   |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  2807 aa-cttctgaacagacttcaggacctaacttatagttcaggagcaagcaa--tttaaatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttcttaataaaatca 2903  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2904 aatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagctcattgatgt 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8401 - 7961
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  8401 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttatctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatg 8302  T
Q  146 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttc 244  Q
    |   |  ||||| ||| | |||||  || ||| ||  | |||  ||||||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||| || ||||||    
T  8301 accta--gggggtgcgagatagtacattcaaa-gctta-aaattatcattgcccacttaagttatacaccaatacaaataagccacgtcataagcttttc 8206  T
Q  245 aga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    ||| ||||||    || |||| ||||| |  |||||||||||| |||| |||||| | ||||||    | ||  ||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  8205 agagaaactac---ttagttagtgggatatttgttactaaaagaaacttccaacgtttccactaatactacttgttcaggagcagagaattcagctactg 8109  T
Q  343 aagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 442  Q
    ||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||| || ||||||||| ||||    
T  8108 aagttaaagtgctgatgtcctcttcagaagcacattttgctcagaatctcagttaagggcttttgatagaccata-gcttctaaacagacttcaggacca 8010  T
Q  443 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgt 493  Q
    |||||||  ||| |   ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  8009 aacttctagttcaggagcaagcaaa--tttaatcaaacacaaagtgcatgt 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Original strand, 2439 - 2539
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  2439 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgatttgtctaagtgttttgagaaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatg 2538  T
Q  146 a 146  Q
    |    
T  2539 a 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3769 - 3525
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 416  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| || ||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3769 ttcaggagcaaataattcagctactaaagttaaagtgctgatgtcatcttcagaaacgcattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatgtaccat 3670  T
Q  417 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 516  Q
    | ||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| |   ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3669 a-gcttctgaacatacttcaggaccaaacttctagttcaggagcaaacacattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatca 3573  T
Q  517 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3572 aatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcaacccattgatgt 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold1365
Description:

Target: scaffold1365; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 282 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 720
Alignment:
Q  282 aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatttt 380  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||| |||||||| | || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  997 aaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcaaagagtccaacttctgaa-cttcagatgctgacgtcatcttcagaaacacatttt 899  T
Q  381 cctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatg-cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcaga 479  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |  || ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||  |  | ||||   |||||||||||    
T  898 cctcagaatctcagttaagagcttatgatggacta--tgacttctgaact-acttcaggacctaacttcttattcataagcgagca---ttttaatcaga 805  T
Q  480 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  804 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacaattaaaggcttagttaatatatcagcccattgatgt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1075
Alignment:
Q  51 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  1173 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 350 - 564
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7583
Alignment:
Q  350 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttct 449  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7372 agtgctgacgtcatcttcagaaaaacattttcctcagaatcttagttaagagcttctgatggaccatg-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttct 7470  T
Q  450 tattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatata 549  Q
      ||| |  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  7471 agttcaggaacaagctaattt--aatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcgaatctttccacagttaaaggtttagtaaatata 7568  T
Q  550 tcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||    
T  7569 tcagcccattgatgt 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 7073 - 7161
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  7073 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttctaagtgttttgagcaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaaca 7161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22479 - 22271
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||    
T  22479 tgctgatgccatcttcagaggcacattttcctcagaacctcaataaagagcttctaatggaccata-gcttctgaac-gacttcaggacctaaattccta 22382  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||  |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||    
T  22381 ttaaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacatttaaatgcttagtaaatatatc 22284  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||    
T  22283 agcccattgatgt 22271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3371 - 3133
Alignment:
Q  323 agcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 422  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| | ||||    
T  3371 agcaaagaattcagctactgaagttaaagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatcttagttaagagcttctaatagaccata-gctt 3273  T
Q  423 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcc-gagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 521  Q
    ||||| | ||||||| |  ||||||||  |||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3272 ctgaacaaacttcaggattaaacttctagttcatgag-caagaaaatttat--tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatct 3176  T
Q  522 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3175 ttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagtccattgatgt 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3643 - 3545
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  3643 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgtgtaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaatttagaagggac-aacaaacacaacattaatga 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 567
Target Start/End: Original strand, 42374 - 42585
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||  || ||  |     
T  42374 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaggacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttcagaacgtaaatttatg 42471  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| |   |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  42472 ttcaggagcaagcaaattt--aatgagacacaaagtgcatgttcaaatttttccttataaaatcaaatctttccacagttaaacgcttagtaaatatatc 42569  T
Q  552 agcccattgatgtcca 567  Q
    | ||||||||||||||    
T  42570 atcccattgatgtcca 42585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 42094 - 42198
Alignment:
Q  46 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| | ||||    
T  42094 atgaaagtgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgaatagtaaaacgtttgcaattcagaaggggaaaaacaaacacaacatt 42193  T
Q  142 aatga 146  Q
    |||||    
T  42194 aatga 42198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Original strand, 2143 - 2351
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | | |||||||||  ||||||| |||| || ||| |     
T  2143 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaataaagatcttctgatggattata-gcttctgaac-gacttcataacctaaattcctg 2240  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    ||| |   |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  2241 ttcaggagcaagcaaattt--aatcagaaacaaagtgcatgttcaaatttttatttataaaatcaaatctttccattgttaaaggcttagtaaatatatc 2338  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||    
T  2339 agcccattgatgt 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Original strand, 1836 - 1940
Alignment:
Q  43 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 141  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||    
T  1836 gaaatgaaagtgtatgttatgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacatt 1935  T
Q  142 aatga 146  Q
    |||||    
T  1936 aatga 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 317 - 564
Target Start/End: Original strand, 2953 - 3196
Alignment:
Q  317 ttcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 415  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||| |  |||||||| |    
T  2953 ttcaggagcaaagagtccagcttctgaag-ttaagatgctgacatcatcctcagaagcacattttcctttgaatctcagtaaagagttgttgatggacta 3051  T
Q  416 gatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaac 515  Q
     | ||||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  3052 ta-gcttctgaaca-acatcagaacctaacttcttatttagaggcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatattcaaatttttctttataaaatt 3147  T
Q  516 aaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3148 aaatctttccacacttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 82
Target Start/End: Original strand, 2685 - 2719
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 82  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2685 gaaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 131008 - 130724
Alignment:
Q  261 gttaatgggacagctgttactaaa-agtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacg 359  Q
    |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| | |||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  131008 gttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaaccctactattcagaagcaaggaacacaacttcttaaattttagtgctgacg 130909  T
Q  360 tcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgaga 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||                  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |       
T  130908 tcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagctt------------------ctgaacagacttcagaaccaaacttcttgttcaggag 130827  T
Q  460 caagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 559  Q
    ||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| || || ||  |||||||||||||||    
T  130826 caagcaaa--tttatttatacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccacagttaatggtttagtggatatatcagcccatt 130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 352 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27775
Alignment:
Q  352 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||| |||||| || ||| |     
T  27983 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttaagaacctaaattcctg 27886  T
Q  452 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 551  Q
    | | |   |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27885 tccaggagcaagcagattt--aatcagacataaagtgcatgttcaaacttttctttataaaatcaaatctttccgcagttaaaggcttagtaaatatatc 27788  T
Q  552 agcccattgatgt 564  Q
    | |||||||||||    
T  27787 aacccattgatgt 27775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1471
Alignment:
Q  26 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-a 124  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  1626 gcagagaaagtttagagaaaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcaaaagggga 1527  T
Q  125 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagc 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1526 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagc 1471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13372 - 13196
Alignment:
Q  359 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 458  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||||| || ||| | ||| |      
T  13372 gtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcaataaagagcttttgattgactata-gcttctgaac-gacttcagaacctaaattcctgttcagga 13275  T
Q  459 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 539  Q
     |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  13274 gcaagcaaattt--aatgagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccacagttaaaggctt 13196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13580
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcatta 142  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| | |||||    
T  13683 gaaattgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtagtaaaacgattgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacatta 13584  T
Q  143 atga 146  Q
    ||||    
T  13583 atga 13580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1362 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1362
Description:

Target: scaffold1362; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 1
Alignment:
Q  25 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  93 agcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttg-tttaagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2124 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold2124
Description:

Target: scaffold2124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 366 - 564
Target Start/End: Original strand, 809 - 1002
Alignment:
Q  366 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | | ||||||||| | |||| ||| || || ||| ||||  ||| |||| |    
T  809 tcagaagcacattttcctcagaacctcagtgaagagcttctaatggactata-gcttctgaaca-acttgagagcctaaattcctatttagaggcaagta 906  T
Q  466 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  907 ---ttttaatcatacacaaagtgcatgttcaaatttttcatcataaaatcaaatcactccacaattaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 146
Target Start/End: Original strand, 536 - 597
Alignment:
Q  87 taagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  536 taagtgtttttagtaaaaaagtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 557
Target Start/End: Original strand, 73015 - 73198
Alignment:
Q  370 aagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatt 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||  || |||  |    
T  73015 aagcacattttcctcaaaacctcattgaaaagcttttgatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggaaatcaa--t 73110  T
Q  470 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  73111 tttaatcagatacaaaatgcatgttcgaatttttctttataaattcaaatctttcaacaattaaaggctttgtgaatatatcagccca 73198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 557
Target Start/End: Original strand, 85205 - 85388
Alignment:
Q  370 aagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatt 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||  || |||  |    
T  85205 aagcacattttcctcaaaacctcattgaaaagcttttgatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggaaatcaa--t 85300  T
Q  470 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 557  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  85301 tttaatcagatacaaaatgcatgttcgaatttttctttataaattcaaatctttcaacaattaaaggctttgtgaatatatcagccca 85388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 470 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6021 - 5927
Alignment:
Q  470 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6021 tttaatcagacacaaagtgcgtgttccaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6138 - 6048
Alignment:
Q  325 caaagaatacagcttctgaagctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 415  Q
    |||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6138 caaagaattcagctactgaagttaaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatgtcatataagagcttctgatggacca 6048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2633 - 2394
Alignment:
Q  65 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 160  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2633 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 2534  T
Q  161 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctt 258  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |   ||   |    
T  2533 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagaca--caatgct 2436  T
Q  259 tggttaatgggacagctgttact-aaaagtaactgccaacga 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2435 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcaacga 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 1
Alignment:
Q  49 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  114 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 16  T
Q  147 aaaattgggggcgcg 161  Q
     ||||||||||||||    
T  15 caaattgggggcgcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 415
Target Start/End: Original strand, 487 - 851
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  487 gaaagtgtaggttgtgaagtgcgtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 586  T
Q  147 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatactaatagaccacgtcagaaacttttca 245  Q
     | |  ||||||||| | |||||  || |||     ||||| ||||||| |||| ||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||  ||||||    
T  587 cata--gggggcgcgagatagtacattcaaagt---ataaatcatcattaccctcttaagttatacaccaatacaaataagccacgtcataagtttttca 681  T
Q  246 ga-aaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgcta-ttcagaagcaaagaatacagcttctg 342  Q
    || |||||     |  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| | | ||||||    | ||| ||||  |||||||| | |||||||||    
T  682 gagaaactgc---taagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaatgtttccactaatactactagttcatgagcaaagagttcagcttctg 778  T
Q  343 aagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 415  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  779 aag-ttgagatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatttcagttaagagcttctgatggacca 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1479 - 1355
Alignment:
Q  282 aaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagctttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatttt 380  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||| |||| | ||  ||||||||| || || || |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1479 aaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcataaaacccagcttctggag-ttcagatgctgatgtcatcttcagaaggacatttt 1381  T
Q  381 cctcagaacctcaattaagagcttct 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1380 cctcagaacctcagttaagagcttct 1355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 564
Target Start/End: Original strand, 73625 - 73702
Alignment:
Q  487 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  73625 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 73702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Original strand, 5617 - 5693
Alignment:
Q  93 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagta 169  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5617 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagta 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 372
Alignment:
Q  48 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 146  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  471 gaaagtgtaggtagtgaagtgagttgtgtgtgatttgtccaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University