View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8617_low_16 (Length: 218)

Name: NF8617_low_16
Description: NF8617
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8617_low_16
NF8617_low_16
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-203)||(21703073-21703284)
chr2 (1-205)||(34303210-34303423)
chr2 (1-196)||(27118809-27119013)
chr2 (1-130)||(27393090-27393219)
chr2 (1-195)||(3784775-3784978)
chr2 (1-195)||(16163720-16163923)
chr2 (1-195)||(34157132-34157334)
chr2 (1-200)||(19456333-19456541)
chr2 (10-205)||(27434351-27434555)
chr2 (7-205)||(40233638-40233845)
chr2 (13-205)||(23128473-23128674)
chr2 (13-195)||(31891245-31891436)
chr2 (13-205)||(12655675-12655876)
chr2 (13-205)||(28882347-28882548)
chr2 (10-205)||(20838048-20838252)
chr2 (19-205)||(9349889-9350084)
chr2 (7-130)||(260744-260867)
chr2 (19-205)||(12586949-12587144)
chr2 (19-205)||(12716509-12716704)
chr2 (7-205)||(22925935-22926142)
chr2 (19-205)||(27777361-27777556)
chr2 (19-205)||(27817119-27817314)
chr2 (7-130)||(37375288-37375411)
chr2 (7-129)||(34279576-34279698)
chr2 (19-205)||(13936451-13936646)
chr2 (19-205)||(16829245-16829440)
chr2 (19-205)||(16892041-16892236)
chr2 (7-205)||(32049925-32050132)
chr2 (19-205)||(39051729-39051924)
chr2 (19-202)||(27803846-27804038)
chr2 (7-128)||(34286481-34286602)
chr2 (7-128)||(34291541-34291662)
chr2 (7-130)||(37925620-37925743)
chr2 (7-128)||(21677175-21677296)
chr2 (7-130)||(31876408-31876531)
chr2 (7-130)||(34861807-34861930)
chr2 (7-130)||(37685900-37686023)
chr2 (7-130)||(37701165-37701288)
chr2 (125-205)||(39890328-39890408)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-203)||(16207951-16208162)
chr1 (1-205)||(20340253-20340466)
chr1 (7-205)||(28151992-28152199)
chr1 (1-203)||(20461205-20461416)
chr1 (7-205)||(51638348-51638555)
chr1 (7-130)||(10962800-10962923)
chr1 (125-205)||(41793226-41793306)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-203)||(22888604-22888815)
chr5 (1-203)||(25199163-25199374)
chr5 (10-205)||(23892349-23892553)
chr5 (7-205)||(29888897-29889104)
chr5 (1-195)||(11325928-11326131)
chr5 (1-195)||(13184473-13184676)
chr5 (1-200)||(33877381-33877589)
chr5 (1-195)||(13440319-13440522)
chr5 (13-205)||(24687972-24688173)
chr5 (13-205)||(22998929-22999130)
chr5 (13-205)||(23717803-23718004)
chr5 (10-205)||(23752265-23752469)
chr5 (7-205)||(9548358-9548565)
chr5 (13-205)||(11549500-11549701)
chr5 (13-205)||(24970164-24970365)
chr5 (13-205)||(30934779-30934980)
chr5 (10-205)||(33777630-33777834)
chr5 (7-205)||(37671298-37671505)
chr5 (7-205)||(13324644-13324851)
chr5 (7-130)||(15658659-15658782)
chr5 (7-130)||(18500629-18500752)
chr5 (19-205)||(24681592-24681787)
chr5 (19-205)||(24724119-24724314)
chr5 (7-205)||(31431580-31431787)
chr5 (7-128)||(37770888-37771009)
chr5 (7-206)||(32599286-32599494)
chr5 (7-205)||(28649375-28649582)
chr5 (19-205)||(33516508-33516703)
chr5 (19-205)||(40473364-40473559)
chr5 (7-205)||(43078392-43078599)
chr5 (7-128)||(37755120-37755241)
chr5 (7-130)||(31826306-31826429)
chr5 (7-205)||(8665290-8665497)
chr5 (7-130)||(9317591-9317714)
chr5 (7-130)||(12132295-12132418)
chr5 (7-205)||(30152158-30152365)
chr5 (7-130)||(30168609-30168732)
chr5 (7-205)||(37358458-37358665)
chr5 (7-128)||(2511191-2511312)
chr5 (7-128)||(15758758-15758879)
chr5 (125-205)||(18375227-18375307)
chr5 (7-205)||(3789681-3789888)
chr5 (7-130)||(29966965-29967088)
chr5 (7-130)||(30029555-30029678)
chr5 (7-128)||(28959687-28959808)
chr5 (7-128)||(34616658-34616779)
chr5 (125-205)||(6874572-6874652)
chr5 (125-205)||(15658575-15658655)
chr5 (125-205)||(31826222-31826302)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-205)||(2576-2789)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-205)||(27290231-27290444)
chr6 (1-205)||(22456795-22457008)
chr6 (7-205)||(14143146-14143353)
chr6 (7-205)||(26788072-26788279)
chr6 (7-205)||(27196445-27196652)
chr6 (7-205)||(27252588-27252795)
chr6 (1-200)||(13521939-13522147)
chr6 (1-195)||(28162779-28162982)
chr6 (1-195)||(33374127-33374330)
chr6 (1-195)||(8892182-8892384)
chr6 (1-195)||(8903417-8903619)
chr6 (10-205)||(22934741-22934945)
chr6 (10-205)||(23857186-23857390)
chr6 (1-95)||(22477253-22477347)
chr6 (13-205)||(26989135-26989336)
chr6 (13-205)||(13298812-13299013)
chr6 (13-205)||(24304479-24304680)
chr6 (13-205)||(24863851-24864052)
chr6 (7-202)||(16749982-16750186)
chr6 (7-205)||(26918508-26918715)
chr6 (7-205)||(4545636-4545843)
chr6 (7-205)||(29549603-29549810)
chr6 (13-205)||(15424178-15424379)
chr6 (10-205)||(27272441-27272645)
chr6 (7-206)||(27359852-27360060)
chr6 (7-206)||(27450195-27450403)
chr6 (19-205)||(4525426-4525621)
chr6 (7-205)||(4723995-4724202)
chr6 (7-205)||(4757892-4758099)
chr6 (7-205)||(4773134-4773341)
chr6 (7-205)||(34463207-34463414)
chr6 (13-130)||(27000207-27000324)
chr6 (19-205)||(30557877-30558072)
chr6 (7-128)||(26116357-26116478)
chr6 (7-128)||(27007855-27007976)
chr6 (7-130)||(16674267-16674390)
chr6 (19-205)||(17025417-17025612)
chr6 (7-130)||(3696209-3696332)
chr6 (7-130)||(29573141-29573264)
chr6 (125-205)||(17092301-17092381)
chr6 (7-130)||(16943972-16944095)
chr6 (7-130)||(26777560-26777683)
chr6 (7-205)||(28207582-28207789)
chr6 (7-205)||(29501543-29501750)
chr6 (13-95)||(20160835-20160917)
chr6 (13-95)||(22171914-22171996)
chr6 (125-205)||(27044643-27044723)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (6-197)||(16449810-16450010)
chr7 (1-203)||(16041449-16041660)
chr7 (7-205)||(26484826-26485033)
chr7 (1-195)||(31088278-31088481)
chr7 (1-195)||(45733586-45733789)
chr7 (7-197)||(2108817-2109016)
chr7 (7-205)||(2775491-2775698)
chr7 (7-205)||(39210827-39211034)
chr7 (10-205)||(4200682-4200886)
chr7 (13-205)||(2154711-2154912)
chr7 (7-207)||(5128124-5128333)
chr7 (13-205)||(10916672-10916873)
chr7 (13-204)||(16503185-16503385)
chr7 (13-204)||(16518221-16518421)
chr7 (10-205)||(26682804-26683008)
chr7 (13-205)||(11424580-11424781)
chr7 (7-205)||(26435389-26435596)
chr7 (7-130)||(5147228-5147351)
chr7 (7-205)||(31564194-31564401)
chr7 (7-205)||(3445438-3445645)
chr7 (7-205)||(26274898-26275105)
chr7 (7-130)||(4145011-4145134)
chr7 (7-205)||(11441704-11441911)
chr7 (7-130)||(26319757-26319880)
chr7 (7-130)||(26537758-26537881)
chr7 (7-128)||(16736350-16736471)
chr7 (7-128)||(16751404-16751525)
chr7 (7-128)||(17523664-17523785)
chr7 (7-128)||(17529430-17529551)
chr7 (7-130)||(26669802-26669925)
chr7 (7-130)||(45387475-45387598)
chr7 (125-205)||(26537674-26537754)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-203)||(1838-2048)
scaffold0415 (85-130)||(6223-6268)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-203)||(20513-20723)
scaffold0124 (19-205)||(30595-30790)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (6-203)||(1900402-1900608)
chr4 (1-203)||(15228010-15228221)
chr4 (7-200)||(15284851-15285053)
chr4 (1-195)||(24460533-24460736)
chr4 (1-130)||(15391340-15391469)
chr4 (1-200)||(14235448-14235656)
chr4 (10-205)||(17014149-17014353)
chr4 (13-205)||(24592232-24592433)
chr4 (13-205)||(14665170-14665371)
chr4 (7-205)||(36344433-36344640)
chr4 (7-130)||(14763306-14763429)
chr4 (7-205)||(31126436-31126643)
chr4 (7-128)||(33673802-33673923)
chr4 (7-130)||(6569999-6570122)
chr4 (19-128)||(21969859-21969968)
chr4 (19-128)||(39850796-39850905)
chr4 (7-205)||(18800531-18800738)
chr4 (8-130)||(14098688-14098810)
chr4 (7-205)||(5006019-5006226)
chr4 (7-130)||(40105640-40105763)
chr4 (7-205)||(54833533-54833740)
chr4 (7-205)||(30753900-30754107)
chr4 (7-128)||(34188964-34189085)
chr4 (125-205)||(14763222-14763302)
chr4 (125-205)||(27163235-27163315)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-196)||(19658926-19659129)
chr8 (1-196)||(33244790-33244994)
chr8 (1-195)||(44563226-44563427)
chr8 (1-130)||(22080839-22080968)
chr8 (10-205)||(16283583-16283787)
chr8 (7-205)||(18710717-18710924)
chr8 (1-86)||(9354747-9354832)
chr8 (13-205)||(16277691-16277892)
chr8 (13-205)||(27608782-27608983)
chr8 (13-205)||(14557761-14557962)
chr8 (13-205)||(19688235-19688436)
chr8 (7-205)||(12092601-12092808)
chr8 (13-205)||(2137136-2137337)
chr8 (19-205)||(29829465-29829660)
chr8 (38-205)||(189256-189432)
chr8 (7-128)||(3329470-3329591)
chr8 (7-205)||(19286593-19286800)
chr8 (7-205)||(19674572-19674779)
chr8 (7-205)||(31354655-31354862)
chr8 (7-130)||(31489711-31489834)
chr8 (7-130)||(33258854-33258977)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-196)||(5652473-5652677)
chr3 (1-203)||(18530474-18530685)
chr3 (7-205)||(31034076-31034283)
chr3 (7-205)||(32292844-32293051)
chr3 (1-200)||(16626470-16626678)
chr3 (1-195)||(4626030-4626233)
chr3 (1-195)||(17993753-17993956)
chr3 (13-205)||(15741053-15741254)
chr3 (13-205)||(15892665-15892866)
chr3 (10-205)||(6192411-6192615)
chr3 (7-205)||(29148714-29148921)
chr3 (7-195)||(5713319-5713516)
chr3 (7-195)||(5724229-5724426)
chr3 (7-195)||(5757051-5757248)
chr3 (7-195)||(5767942-5768139)
chr3 (13-205)||(8296070-8296271)
chr3 (13-205)||(18051360-18051561)
chr3 (13-205)||(18330767-18330968)
chr3 (7-205)||(7073304-7073511)
chr3 (7-205)||(22387537-22387744)
chr3 (13-205)||(8301226-8301427)
chr3 (13-205)||(4796612-4796813)
chr3 (7-205)||(11110308-11110515)
chr3 (7-130)||(4346730-4346853)
chr3 (7-205)||(4417011-4417218)
chr3 (7-130)||(18277095-18277218)
chr3 (7-130)||(18292396-18292519)
chr3 (7-130)||(18307697-18307820)
chr3 (19-205)||(20576806-20577001)
chr3 (19-130)||(29665013-29665124)
chr3 (7-128)||(6542507-6542628)
chr3 (7-128)||(22870901-22871022)
chr3 (7-128)||(22885960-22886081)
chr3 (13-205)||(35880864-35881065)
chr3 (7-205)||(8211830-8212037)
chr3 (7-205)||(10396225-10396432)
chr3 (7-205)||(28021367-28021574)
chr3 (7-130)||(28115997-28116120)
chr3 (7-205)||(36997036-36997243)
chr3 (7-130)||(48466019-48466142)
chr3 (10-205)||(4721726-4721930)
chr3 (7-205)||(21674785-21674992)
chr3 (7-205)||(51782115-51782322)
chr3 (7-205)||(51797205-51797412)
chr3 (7-205)||(5467077-5467284)
chr3 (7-128)||(5609367-5609488)
chr3 (7-128)||(28339394-28339515)
chr3 (7-205)||(5596316-5596523)
chr3 (7-205)||(31964432-31964639)
chr3 (7-205)||(50134030-50134237)
chr3 (7-128)||(5013804-5013925)
chr3 (7-128)||(47023545-47023666)
chr3 (125-205)||(18242958-18243038)
chr3 (125-205)||(18277011-18277091)
chr3 (125-205)||(18292312-18292392)
chr3 (125-205)||(18307613-18307693)
chr3 (125-205)||(28115913-28115993)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-130)||(30-159)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-130)||(21686-21815)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (22-130)||(620-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-205)||(46903-47104)
scaffold0089 (13-205)||(39987-40188)
scaffold0089 (13-205)||(29900-30101)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-205)||(47-248)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (13-204)||(27429-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (7-205)||(9697-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (7-130)||(7241-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (7-130)||(26203-26326)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (7-130)||(9068-9191)
scaffold0159 (7-130)||(20146-20269)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (7-205)||(8080-8287)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21703284 - 21703073
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  21703284 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 21703185  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703184 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 21703085  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    |||||| |||||    
T  21703084 cagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34303423 - 34303210
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  34303423 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 34303324  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303323 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34303224  T
Q  192 cagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||    
T  34303223 cagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27118809 - 27119013
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  27118809 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 27118908  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118909 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 27119008  T
Q  192 cagac 196  Q
    |||||    
T  27119009 cagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 27393090 - 27393219
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27393090 ttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatc 27393189  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27393190 agggaaagttaacttttgagaacaatgtcc 27393219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3784775 - 3784978
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  3784775 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 3784874  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784875 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  3784975 caga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16163720 - 16163923
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  16163720 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 16163819  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163820 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  16163920 caga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34157132 - 34157334
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  34157132 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagacc 34157230  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157231 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  34157331 caga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19456541 - 19456333
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  | |    
T  19456541 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 19456442  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19456441 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 19456342  T
Q  192 cagacttga 200  Q
    |||||||||    
T  19456341 cagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27434555 - 27434351
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  27434555 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 27434456  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27434455 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27434356  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  27434355 tgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 40233638 - 40233845
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  40233638 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 40233737  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  40233738 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 40233837  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  40233838 tgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23128674 - 23128473
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  23128674 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23128575  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23128574 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 23128475  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  23128474 cc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31891436 - 31891245
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||  | |    
T  31891436 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 31891337  T
Q  113 cttttgagaacaatgtcc---------tcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 195  Q
    | ||| |||| || ||||         ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891336 cctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 12655675 - 12655876
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  12655675 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 12655774  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12655775 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 12655874  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  12655875 cc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 28882347 - 28882548
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  28882347 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 28882446  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28882447 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 28882546  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  28882547 cc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 20838048 - 20838252
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  20838048 gaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 20838147  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20838148 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 20838247  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  20838248 tgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9350084 - 9349889
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  9350084 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 9349985  T
Q  119 agaacaa---------tgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||||||         |||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9349984 agaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtcc 9349889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 260867 - 260744
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  260867 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 260768  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  260767 agctgacttttgagaataatgtcc 260744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 12586949 - 12587144
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  12586949 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 12587048  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12587049 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12716704 - 12716509
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12716704 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 12716605  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12716604 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22926142 - 22925935
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  22926142 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 22926043  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt---------cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||         ||||||||||||  | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22926042 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 22925943  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  22925942 tgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 27777361 - 27777556
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27777361 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27777460  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27777461 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 27817119 - 27817314
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27817119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27817218  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27817219 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 37375288 - 37375411
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||||||| || |||||||||    
T  37375288 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 37375387  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  37375388 agctgacttttgagaataatgtcc 37375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 34279576 - 34279698
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  34279576 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34279675  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtc 129  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34279676 agctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13936646 - 13936451
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| |||||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  13936646 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 13936547  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13936546 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16829440 - 16829245
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16829440 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16829341  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16829340 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 16892041 - 16892236
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16892041 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16892140  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16892141 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 32049925 - 32050132
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  32049925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32050024  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || |||||||| || | |||||||| ||| |||||    
T  32050025 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagact 32050124  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  32050125 tgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39051924 - 39051729
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39051924 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 39051825  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39051824 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 27803846 - 27804038
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27803846 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27803945  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatg 202  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||    
T  27803946 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 34286481 - 34286602
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  34286481 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34286580  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||| ||||| |||||    
T  34286581 agctgactttcgagaataatgt 34286602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 34291541 - 34291662
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  34291541 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34291640  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||| ||||| |||||    
T  34291641 agctgactttcgagaataatgt 34291662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 37925620 - 37925743
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  37925620 tctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37925719  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  37925720 agctgacttttgagaataatgtcc 37925743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21677296 - 21677175
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  21677296 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 21677197  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  21677196 agctgacttttgagaataatgt 21677175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 31876408 - 31876531
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  31876408 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31876507  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  31876508 agctgacttttgagaataatgtcc 31876531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 34861807 - 34861930
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  34861807 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 34861906  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  34861907 agctgacttttgagaataatgtcc 34861930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37686023 - 37685900
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  37686023 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37685924  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  37685923 agctgacttttgagaataatgtcc 37685900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37701288 - 37701165
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  37701288 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37701189  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  37701188 agctgacttttgagaataatgtcc 37701165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 39890328 - 39890408
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39890328 atgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16208162 - 16207951
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  16208162 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 16208063  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16208062 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 16207963  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    ||||||||||||    
T  16207962 cagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20340466 - 20340253
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  20340466 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 20340367  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340366 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 20340267  T
Q  192 cagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||| ||||    
T  20340266 cagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 28151992 - 28152199
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  28151992 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 28152091  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28152092 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggact 28152191  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  28152192 tgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20461205 - 20461416
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  | |    
T  20461205 ttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 20461304  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || ||||| || |         |||||||||| |||||  |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20461305 aaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcg 20461404  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    ||||||||||||    
T  20461405 cagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 51638348 - 51638555
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  51638348 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 51638447  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51638448 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51638547  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  51638548 tgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 10962800 - 10962923
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  10962800 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 10962899  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  10962900 agctgacttttgagaataatgtcc 10962923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41793306 - 41793226
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  41793306 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22888604 - 22888815
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22888604 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 22888703  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888704 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 22888803  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
     ||||| |||||    
T  22888804 tagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 25199163 - 25199374
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  25199163 ttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatc 25199262  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25199263 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccc 25199362  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    ||||||||||||    
T  25199363 cagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 23892349 - 23892553
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||     
T  23892349 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 23892448  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892449 taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 23892548  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  23892549 tgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29889104 - 29888897
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  29889104 tctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29889005  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||||         ||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29889004 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagact 29888905  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  29888904 tgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 11325928 - 11326131
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | |    
T  11325928 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaacc 11326027  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326028 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  11326128 caga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13184676 - 13184473
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  13184676 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13184577  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184576 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  13184476 caga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 33877381 - 33877589
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | |    
T  33877381 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 33877480  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877481 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33877580  T
Q  192 cagacttga 200  Q
    | |||||||    
T  33877581 cggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13440522 - 13440319
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  13440522 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13440423  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440422 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  13440322 caga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24688173 - 24687972
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  24688173 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 24688074  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24688073 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24687974  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  24687973 cc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22999130 - 22998929
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  22999130 ctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 22999031  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| || ||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22999030 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 22998931  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  22998930 cc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23718004 - 23717803
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  23718004 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23717905  T
Q  113 cttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23717904 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 23717805  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  23717804 cc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23752469 - 23752265
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  23752469 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23752370  T
Q  110 taacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23752369 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23752270  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  23752269 tgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9548565 - 9548358
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  9548565 tctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 9548466  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9548465 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9548366  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  9548365 tgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 11549500 - 11549701
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  11549500 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11549599  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11549600 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgt 11549699  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  11549700 cc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 24970164 - 24970365
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||  |    
T  24970164 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcgga 24970263  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||  | |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  24970264 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgt 24970363  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  24970364 cc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 30934779 - 30934980
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  30934779 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 30934878  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30934879 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 30934978  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  30934979 cc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 33777630 - 33777834
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||    
T  33777630 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagc 33777729  T
Q  110 taacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||   |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  33777730 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 33777829  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  33777830 tgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37671505 - 37671298
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  37671505 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37671406  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| |||||||||||||         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37671405 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37671306  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  37671305 tgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13324851 - 13324644
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  13324851 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 13324752  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  13324751 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 13324652  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  13324651 tgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15658782 - 15658659
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  15658782 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 15658683  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  15658682 agctgacttttgagaataatgtcc 15658659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18500752 - 18500629
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  18500752 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18500653  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  18500652 agctgacttttgagaataatgtcc 18500629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 24681592 - 24681787
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24681592 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24681691  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24681692 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 24724119 - 24724314
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24724119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24724218  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24724219 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 31431580 - 31431787
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  31431580 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31431679  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31431680 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31431779  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  31431780 tgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37771009 - 37770888
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||  | |||||||||||| |||||||||    
T  37771009 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaa 37770910  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37770909 agctgacttttgagaacaatgt 37770888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32599494 - 32599286
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  32599494 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32599395  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| || ||||| || || | ||||||||| || |||||    
T  32599394 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagact 32599295  T
Q  198 tgatgtcca 206  Q
    |||||||||    
T  32599294 tgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 28649375 - 28649582
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  28649375 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28649474  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28649475 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28649574  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  28649575 tgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 33516508 - 33516703
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33516508 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 33516607  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33516608 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40473559 - 40473364
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40473559 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 40473460  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  40473459 agaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 43078392 - 43078599
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||||||| || |||||||||    
T  43078392 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 43078491  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  43078492 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 43078591  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  43078592 tgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 37755120 - 37755241
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  37755120 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37755219  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  37755220 agctgacttttgagaataatgt 37755241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31826429 - 31826306
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  31826429 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 31826330  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  31826329 agctgacttttgagaataatgtcc 31826306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8665497 - 8665290
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  8665497 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 8665398  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  8665397 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 8665298  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  8665297 tgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 9317591 - 9317714
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  9317591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9317690  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  9317691 agctgacttttgagaataatgtcc 9317714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 12132295 - 12132418
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  12132295 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 12132394  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  12132395 agctgacttttgagaataatgtcc 12132418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 30152158 - 30152365
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  30152158 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30152257  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30152258 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30152357  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  30152358 tgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 30168609 - 30168732
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  30168609 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 30168708  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  30168709 agctcacttttgagaataatgtcc 30168732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37358665 - 37358458
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  37358665 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 37358566  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37358565 agctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37358466  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  37358465 tgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 2511191 - 2511312
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  2511191 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 2511290  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  2511291 agctgacttttgagaataatgt 2511312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15758879 - 15758758
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  15758879 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 15758780  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  15758779 agctgacttttgagaataatgt 15758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18375307 - 18375227
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18375307 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 3789681 - 3789888
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  3789681 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 3789780  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  3789781 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 3789880  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  3789881 tgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29967088 - 29966965
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  29967088 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29966989  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  29966988 agctgacttttgagaataatgtcc 29966965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 30029555 - 30029678
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  30029555 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30029654  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  30029655 agctgacttttgagaataatgtcc 30029678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28959808 - 28959687
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  28959808 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 28959709  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  28959708 agctgacttttgagaataatgt 28959687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 34616658 - 34616779
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  34616658 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 34616757  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  34616758 agctgacttttgagaataatgt 34616779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 6874572 - 6874652
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6874572 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15658655 - 15658575
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15658655 atgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31826302 - 31826222
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  31826302 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2789 - 2576
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  2789 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 2690  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2689 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 2590  T
Q  192 cagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||| ||||    
T  2589 cagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27290444 - 27290231
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  27290444 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 27290345  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| |||||||||||||||||         |||||| ||||||   |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290344 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcc 27290245  T
Q  192 cagacttgatgtcc 205  Q
     |||||||||||||    
T  27290244 tagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22457008 - 22456795
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||  | |    
T  22457008 ttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagacc 22456909  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| ||||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22456908 aaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcc 22456809  T
Q  192 cagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||    
T  22456808 cagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14143353 - 14143146
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  14143353 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 14143254  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14143253 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 14143154  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  14143153 tgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 26788072 - 26788279
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  26788072 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26788171  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26788172 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26788271  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  26788272 tgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 27196445 - 27196652
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  27196445 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27196544  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27196545 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27196644  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  27196645 tgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27252795 - 27252588
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  27252795 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27252696  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27252695 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27252596  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  27252595 tgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13522147 - 13521939
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | |    
T  13522147 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 13522048  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522047 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13521948  T
Q  192 cagacttga 200  Q
    | |||||||    
T  13521947 cggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 28162779 - 28162982
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  28162779 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 28162878  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162879 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  28162979 caga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33374330 - 33374127
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  33374330 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33374231  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | ||||||||||| |         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374230 aaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  33374130 caga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8892384 - 8892182
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  8892384 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagacc 8892286  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8892285 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  8892185 caga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8903619 - 8903417
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  8903619 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagacc 8903521  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8903520 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  8903420 caga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22934945 - 22934741
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  22934945 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 22934846  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    ||||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22934845 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22934746  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  22934745 tgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23857390 - 23857186
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  23857390 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23857291  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    ||||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23857290 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23857191  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  23857190 tgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22477347 - 22477253
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcat 95  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  22477347 ttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcat 22477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 26989135 - 26989336
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  26989135 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctga 26989234  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26989235 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 26989334  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  26989335 cc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13299013 - 13298812
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  13299013 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 13298914  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13298913 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 13298814  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  13298813 cc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24304680 - 24304479
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |  |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  24304680 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24304581  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24304580 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24304481  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  24304480 cc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 24863851 - 24864052
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  24863851 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24863950  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24863951 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24864050  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  24864051 cc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 16749982 - 16750186
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  16749982 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 16750081  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  16750082 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 16750181  T
Q  198 tgatg 202  Q
    |||||    
T  16750182 tgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 26918508 - 26918715
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || || ||||| ||| |||| ||||    
T  26918508 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaa 26918607  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  26918608 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 26918707  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  26918708 tgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4545843 - 4545636
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  4545843 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4545744  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| |||||||||||||         ||||||| ||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4545743 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4545644  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  4545643 tgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 29549603 - 29549810
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  29549603 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29549702  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||| || || | ||||||||||||  ||||    
T  29549703 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggact 29549802  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  29549803 tgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15424379 - 15424178
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  15424379 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 15424280  T
Q  113 cttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15424279 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15424180  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  15424179 cc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27272645 - 27272441
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||  |||| || ||||    
T  27272645 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagc 27272546  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | || |||||||| |         |||||||||| |||||  |||| ||||||| |||||| || ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27272545 tgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttga 27272446  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  27272445 tgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27360060 - 27359852
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  27360060 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27359961  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27359960 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27359861  T
Q  198 tgatgtcca 206  Q
    |||||||||    
T  27359860 tgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27450403 - 27450195
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  27450403 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27450304  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27450303 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27450204  T
Q  198 tgatgtcca 206  Q
    |||||||||    
T  27450203 tgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 4525426 - 4525621
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4525426 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 4525525  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||         ||||||| ||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4525526 agaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4724202 - 4723995
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||||||||    
T  4724202 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaa 4724103  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4724102 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4724003  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  4724002 tgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 4757892 - 4758099
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  4757892 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4757991  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4757992 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4758091  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  4758092 tgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 4773134 - 4773341
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  4773134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4773233  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4773234 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4773333  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  4773334 tgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34463414 - 34463207
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  34463414 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 34463315  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  34463314 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 34463215  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  34463214 tgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 27000207 - 27000324
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  27000207 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 27000306  T
Q  113 cttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||||| |||||||    
T  27000307 cttttgagaataatgtcc 27000324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30558072 - 30557877
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30558072 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30557973  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30557972 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26116478 - 26116357
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  26116478 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26116379  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  26116378 agctgacttttgagaataatgt 26116357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 27007855 - 27007976
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| | |||||||    
T  27007855 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaa 27007954  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  27007955 agctgacttttgagaataatgt 27007976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 16674267 - 16674390
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  16674267 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16674366  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  16674367 agctgacttttgagaataatgtcc 16674390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 17025417 - 17025612
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17025417 tgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 17025516  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  17025517 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 3696209 - 3696332
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  3696209 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 3696308  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  3696309 agctgacttttgagaataatgtcc 3696332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 29573141 - 29573264
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  29573141 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29573240  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  29573241 agctgacttttgagaataatgtcc 29573264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17092381 - 17092301
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||||||||| |||||  |||| || || | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  17092381 atgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtatgtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16944095 - 16943972
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  16944095 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 16943996  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  16943995 agctgacttttgagaataatgtcc 16943972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26777683 - 26777560
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  26777683 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 26777584  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  26777583 agctgacttttgagaataatgtcc 26777560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 28207582 - 28207789
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  28207582 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 28207681  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28207682 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28207781  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  28207782 tgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 29501543 - 29501750
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  29501543 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 29501642  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  29501643 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 29501742  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  29501743 tgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 20160835 - 20160917
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcat 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  20160835 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 20160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22171996 - 22171914
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcat 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  22171996 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 22171914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 27044643 - 27044723
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27044643 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16450010 - 16449810
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcaggga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16450010 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggga 16449911  T
Q  106 aagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 196  Q
    ||| ||||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 aagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 16449811  T
Q  197 t 197  Q
    |    
T  16449810 t 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16041449 - 16041660
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||    
T  16041449 ttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatc 16041548  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041549 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcc 16041648  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    |||||| |||||    
T  16041649 cagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 26484826 - 26485033
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  26484826 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26484925  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26484926 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26485025  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  26485026 tgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31088481 - 31088278
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  31088481 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 31088382  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088381 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  31088281 caga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 45733586 - 45733789
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  45733586 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 45733685  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733686 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  45733786 caga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2109016 - 2108817
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  2109016 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2108917  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108916 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 2775491 - 2775698
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  2775491 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2775590  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2775591 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2775690  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  2775691 tgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39211034 - 39210827
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  39211034 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 39210935  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39210934 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 39210835  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  39210834 tgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200886
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | || ||||||     
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | |||||||||||||         |||||||||| || ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  201 tgtcc 205  Q
     ||||    
T  4200882 cgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 2154711 - 2154912
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  2154711 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 2154810  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2154811 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 2154910  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  2154911 cc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 5128124 - 5128333
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  5128124 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 5128223  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  5128224 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 5128323  T
Q  198 tgatgtccat 207  Q
    ||||||||||    
T  5128324 tgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10916873 - 10916672
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  10916873 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 10916774  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10916773 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 10916674  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  10916673 cc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16503385 - 16503185
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| |  |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  16503385 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16503286  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16503285 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16503186  T
Q  204 c 204  Q
    |    
T  16503185 c 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16518421 - 16518221
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| |  |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||| | |    
T  16518421 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 16518322  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16518321 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16518222  T
Q  204 c 204  Q
    |    
T  16518221 c 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682804
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||| |||| || |||||  | || |||||      
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | || |||||||| |         ||||| ||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T
Q  201 tgtcc 205  Q
     ||||    
T  26682808 cgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11424781 - 11424580
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  11424781 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11424682  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  11424681 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgt 11424582  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  11424581 cc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 26435389 - 26435596
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  26435389 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26435488  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26435489 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26435588  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  26435589 tgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5147351 - 5147228
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  5147351 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 5147252  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  5147251 agctgacttttgagaataatgtcc 5147228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31564401 - 31564194
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  31564401 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31564302  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31564301 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31564202  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  31564201 tgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 3445438 - 3445645
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  3445438 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 3445537  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  3445538 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 3445637  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  3445638 tgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26275105 - 26274898
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  26275105 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26275006  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  26275005 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 26274906  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  26274905 tgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4145134 - 4145011
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  4145134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 4145035  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  4145034 agctgacttttgagaataatgtcc 4145011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 11441704 - 11441911
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  11441704 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 11441803  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt---------cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||         ||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  11441804 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 11441903  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  11441904 tgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26319880 - 26319757
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  26319880 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26319781  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  26319780 agctgacttttgagaataatgtcc 26319757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26537881 - 26537758
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  26537881 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 26537782  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  26537781 agctgacttttgagaataatgtcc 26537758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16736471 - 16736350
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  16736471 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16736372  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  16736371 agctgacttttgagaataatgt 16736350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16751525 - 16751404
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  16751525 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16751426  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  16751425 agctgacttttgagaataatgt 16751404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 17523664 - 17523785
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  17523664 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17523763  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  17523764 agctgacttttgagaataatgt 17523785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17529551 - 17529430
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  17529551 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17529452  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  17529451 agctgacttttgagaataatgt 17529430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26669925 - 26669802
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  26669925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26669826  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  26669825 agctgacttttgagaataatgtcc 26669802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 45387475 - 45387598
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  45387475 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 45387574  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  45387575 agctgacttttgagaataatgtcc 45387598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26537754 - 26537674
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26537754 atgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1838
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  2048 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 1949  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1948 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 1850  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    |||||| |||||    
T  1849 cagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 6223 - 6268
Alignment:
Q  85 aagaagctcattcatcagggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6223 aagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcc 6268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20723
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  20513 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 20612  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  |||||||||||||||         ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20613 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 20711  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    |||||| |||||    
T  20712 cagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 30595 - 30790
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30595 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30694  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30695 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 1900402 - 1900608
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcaggga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  1900402 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagga 1900501  T
Q  106 aagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 196  Q
    ||| ||||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900502 aagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 1900601  T
Q  197 ttgatgt 203  Q
    | |||||    
T  1900602 tcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15228010 - 15228221
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  15228010 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 15228109  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    |||||||| |||| |||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  15228110 agggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcc 15228209  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    ||||||||||||    
T  15228210 cagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15285053 - 15284851
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  | || ||||    
T  15285053 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 15284954  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |  | || |||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15284953 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagact 15284854  T
Q  198 tga 200  Q
    |||    
T  15284853 tga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24460736 - 24460533
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  24460736 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 24460637  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24460636 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  24460536 caga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15391469 - 15391340
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |      
T  15391469 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgact 15391370  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15391369 agggaaagttaacttttgagaacaatgtcc 15391340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14235656 - 14235448
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |    
T  14235656 ttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagacc 14235557  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  14235556 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcc 14235457  T
Q  192 cagacttga 200  Q
    ||| |||||    
T  14235456 cagtcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 17014149 - 17014353
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  17014149 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 17014248  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17014249 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 17014348  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  17014349 tgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24592433 - 24592232
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  24592433 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24592334  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24592333 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 24592234  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  24592233 cc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 14665170 - 14665371
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  14665170 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14665269  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14665270 cttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 14665369  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  14665370 cc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36344640 - 36344433
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||||||| || |||||||||    
T  36344640 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 36344541  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  36344540 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 36344441  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  36344440 tgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14763429 - 14763306
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  14763429 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 14763330  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  14763329 agctgacttttgagaataatgtcc 14763306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31126643 - 31126436
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  31126643 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31126544  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  31126543 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 31126444  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  31126443 tgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33673923 - 33673802
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  33673923 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 33673824  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  33673823 agctgacttttgagaataatgt 33673802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 6569999 - 6570122
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  6569999 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 6570098  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  6570099 agctgacttttgagaataatgtcc 6570122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 21969859 - 21969968
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21969859 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 21969958  T
Q  119 agaacaatgt 128  Q
    |||| |||||    
T  21969959 agaataatgt 21969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 39850796 - 39850905
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  39850796 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttg 39850895  T
Q  119 agaacaatgt 128  Q
    |||| |||||    
T  39850896 agaataatgt 39850905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18800738 - 18800531
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  18800738 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 18800639  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18800638 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18800539  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  18800538 tgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 14098688 - 14098810
Alignment:
Q  8 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || ||    
T  14098688 ctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaa 14098787  T
Q  108 gctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  14098788 gctgacttttgagaataatgtcc 14098810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 5006019 - 5006226
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  5006019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5006118  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | ||||||||||| |||         ||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5006119 agttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5006218  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  5006219 tgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40105763 - 40105640
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  40105763 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 40105664  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  40105663 agctgacttttgagaataatgtcc 40105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 54833533 - 54833740
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  54833533 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 54833632  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  54833633 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 54833732  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  54833733 tgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 30753900 - 30754107
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  30753900 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 30753999  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30754000 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30754099  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  30754100 tgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34189085 - 34188964
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| || || ||||| ||  | | |||||| || |||||||| ||  |||| || |    
T  34189085 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 34188986  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  34188985 agttaacttttgagaacaatgt 34188964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14763302 - 14763222
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14763302 atgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27163315 - 27163235
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27163315 atgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19659129 - 19658926
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  19659129 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagacc 19659031  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659030 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 19658931  T
Q  192 cagac 196  Q
    |||||    
T  19658930 cagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33244790 - 33244994
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  33244790 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33244889  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33244890 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctct 33244989  T
Q  192 cagac 196  Q
    |||||    
T  33244990 cagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44563226 - 44563427
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  44563226 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa-aaactcatagacc 44563324  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||| | ||||||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563325 aaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 44563423  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  44563424 caga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22080968 - 22080839
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  22080968 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgacc 22080869  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080868 agggaaagttaacttttgagaacaatgtcc 22080839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 16283583 - 16283787
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  16283583 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 16283682  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  16283683 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgt 16283782  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  16283783 tgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 18710717 - 18710924
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  18710717 tctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 18710816  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18710817 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 18710916  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  18710917 tgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 9354747 - 9354832
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa 86  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354747 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaa 9354832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 16277691 - 16277892
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  16277691 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16277790  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16277791 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 16277890  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  16277891 cc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27608983 - 27608782
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  27608983 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 27608884  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27608883 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 27608784  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  27608783 cc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 14557761 - 14557962
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  14557761 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14557860  T
Q  113 cttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||  |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14557861 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 14557960  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  14557961 cc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 19688235 - 19688436
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||| | |    
T  19688235 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttga 19688334  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19688335 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgt 19688434  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  19688435 cc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12092808 - 12092601
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  12092808 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 12092709  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  12092708 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 12092609  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  12092608 tgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2137337 - 2137136
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  2137337 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 2137238  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || | || |||| ||||||| |||||||||||    
T  2137237 cttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgt 2137138  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  2137137 cc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 29829465 - 29829660
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29829465 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29829564  T
Q  119 agaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29829565 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189432
Alignment:
Q  38 ctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttgagaaca---------atgt 128  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || || ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| |         ||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  129 cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||   |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3329591 - 3329470
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||||||| || |||| || |    
T  3329591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaaggga 3329492  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  3329491 agctgacttttgagaacaatgt 3329470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 19286593 - 19286800
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  19286593 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 19286692  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19286693 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19286792  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  19286793 tgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 19674572 - 19674779
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | ||||||||||||  | || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  19674572 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 19674671  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt---------cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||         ||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19674672 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19674771  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  19674772 tgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 31354655 - 31354862
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  31354655 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31354754  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt---------cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||         ||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  31354755 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagact 31354854  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  31354855 tgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31489834 - 31489711
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  31489834 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 31489735  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  31489734 agctgacttttgagaataatgtcc 31489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 33258854 - 33258977
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  33258854 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 33258953  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  33258954 agctgacttttgagaataatgtcc 33258977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 5652473 - 5652677
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  5652473 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 5652572  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5652573 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 5652672  T
Q  192 cagac 196  Q
    |||||    
T  5652673 cagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18530474 - 18530685
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  | |    
T  18530474 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 18530573  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaa---------tgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| ||         |||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530574 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcc 18530673  T
Q  192 cagacttgatgt 203  Q
    ||||||| ||||    
T  18530674 cagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31034283 - 31034076
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  31034283 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 31034184  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31034183 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 31034084  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  31034083 tgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 32292844 - 32293051
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  32292844 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 32292943  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    || | |||||||||||||         ||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32292944 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 32293043  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||| ||||    
T  32293044 tgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16626678 - 16626470
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  | |    
T  16626678 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 16626579  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||||| ||||||||  ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626578 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16626479  T
Q  192 cagacttga 200  Q
    |||||||||    
T  16626478 cagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 4626030 - 4626233
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  4626030 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 4626129  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4626130 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 4626229  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  4626230 caga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17993956 - 17993753
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |    
T  17993956 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 17993857  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 191  Q
    | |||||  | || |||||||| |         ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993856 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T
Q  192 caga 195  Q
    ||||    
T  17993756 caga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15741254 - 15741053
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  15741254 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15741155  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15741154 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15741055  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  15741054 cc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15892866 - 15892665
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  15892866 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15892767  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15892766 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 15892667  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  15892666 cc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 6192411 - 6192615
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||    
T  6192411 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 6192510  T
Q  110 taacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6192511 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 6192610  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  6192611 tgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29148921 - 29148714
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  29148921 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29148822  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  29148821 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 29148722  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  29148721 tgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 5713319 - 5713516
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  5713319 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5713418  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc---------tcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713419 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 5724229 - 5724426
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  5724229 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5724328  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc---------tcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724329 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5757248 - 5757051
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  5757248 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5757149  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc---------tcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757148 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5768139 - 5767942
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  5768139 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5768040  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc---------tcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 195  Q
    |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768039 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 8296070 - 8296271
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||| | |    
T  8296070 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 8296169  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8296170 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 8296269  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  8296270 cc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 18051360 - 18051561
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  18051360 ctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18051459  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  18051460 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgt 18051559  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  18051560 cc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 18330767 - 18330968
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  18330767 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18330866  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18330867 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 18330966  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  18330967 cc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 7073304 - 7073511
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  7073304 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 7073403  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||||||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  7073404 agctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 7073503  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  7073504 tgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22387744 - 22387537
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  22387744 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 22387645  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  22387644 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 22387545  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  22387544 tgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8301427 - 8301226
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  8301427 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 8301328  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||    
T  8301327 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 8301228  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  8301227 cc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4796813 - 4796612
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  4796813 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 4796714  T
Q  113 cttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4796713 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 4796614  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  4796613 cc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11110515 - 11110308
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  11110515 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 11110416  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || |||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  11110415 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagact 11110316  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  11110315 tgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4346853 - 4346730
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  4346853 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4346754  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  4346753 agctgacttttgagaataatgtcc 4346730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 4417011 - 4417218
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  4417011 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 4417110  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4417111 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4417210  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  4417211 tgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18277218 - 18277095
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  18277218 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18277119  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  18277118 agctgacttttgagaataatgtcc 18277095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18292519 - 18292396
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  18292519 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18292420  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  18292419 agctgacttttgagaataatgtcc 18292396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18307820 - 18307697
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  18307820 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18307721  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  18307720 agctgacttttgagaataatgtcc 18307697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20577001 - 20576806
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20577001 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 20576902  T
Q  119 agaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    |||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20576901 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29665124 - 29665013
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29665124 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29665025  T
Q  119 agaacaatgtcc 130  Q
    |||| |||||||    
T  29665024 agaataatgtcc 29665013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6542628 - 6542507
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  6542628 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 6542529  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6542528 agctgacttttgagaacaatgt 6542507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22871022 - 22870901
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  22871022 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22870923  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  22870922 agctgacttttgagaataatgt 22870901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22886081 - 22885960
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  22886081 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22885982  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  22885981 agctgacttttgagaataatgt 22885960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 35880864 - 35881065
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || || ||||||||| |||| |||||||| |    
T  35880864 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 35880963  T
Q  113 cttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  35880964 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgt 35881063  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  35881064 cc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 8211830 - 8212037
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  8211830 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 8211929  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8211930 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8212029  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  8212030 tgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 10396225 - 10396432
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  10396225 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 10396324  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| || |||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  10396325 agctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 10396424  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  10396425 tgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 28021367 - 28021574
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | | |||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  28021367 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28021466  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  28021467 agctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 28021566  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  28021567 tgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28116120 - 28115997
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  28116120 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 28116021  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| || |||||||| |||||||    
T  28116020 agctgacatttgagaataatgtcc 28115997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36997243 - 36997036
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  36997243 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 36997144  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| || ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  36997143 agctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 36997044  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  36997043 tgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 48466019 - 48466142
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| ||||    
T  48466019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 48466118  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  48466119 agctgacttttgagaataatgtcc 48466142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 4721726 - 4721930
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagc 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||| | |||| ||| || || || || |||||| |||| |||||||    
T  4721726 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagc 4721825  T
Q  110 taacttttgagaacaatgt---------cctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 200  Q
    | |||||| |||| |||||         ||||||||||||  |||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  4721826 tgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcga 4721925  T
Q  201 tgtcc 205  Q
    |||||    
T  4721926 tgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 21674785 - 21674992
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  21674785 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 21674884  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  21674885 agctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 21674984  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  21674985 tgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 51782115 - 51782322
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||||||||    
T  51782115 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51782214  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51782215 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51782314  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  51782315 tgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 51797205 - 51797412
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||||||||    
T  51797205 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51797304  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51797305 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51797404  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  51797405 tgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 5467077 - 5467284
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||| |||| || |    
T  5467077 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5467176  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    | || ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5467177 aactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5467276  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  5467277 tgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5609488 - 5609367
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  5609488 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5609389  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  5609388 agctgacttttgagaataatgt 5609367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 28339394 - 28339515
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  28339394 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28339493  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  28339494 agctgacttttgagaataatgt 28339515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5596523 - 5596316
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || ||||| |||||| |||| || |    
T  5596523 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 5596424  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5596423 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5596324  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  5596323 tgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31964639 - 31964432
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  31964639 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31964540  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31964539 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31964440  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  31964439 tgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 50134237 - 50134030
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  50134237 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 50134138  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  50134137 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 50134038  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  50134037 tgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 5013804 - 5013925
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  5013804 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5013903  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  5013904 agctgacttttgagaataatgt 5013925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 47023545 - 47023666
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  47023545 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 47023644  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgt 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  47023645 agctgacttttgagaataatgt 47023666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Original strand, 18242958 - 18243038
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18242958 atgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18277091 - 18277011
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18277091 atgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18292392 - 18292312
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18292392 atgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18307693 - 18307613
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18307693 atgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28115993 - 28115913
Alignment:
Q  125 atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 205  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  28115993 atgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 30
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  159 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 60  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  59 agggaaagttaaccttcgagaacaacgtcc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21686 - 21815
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |    
T  21686 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgacc 21785  T
Q  101 agggaaagctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21786 agggaaagttaacttttaagaacaatgtcc 21815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 620
Alignment:
Q  22 gatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaacttttgaga 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  122 acaatgtcc 130  Q
    | |||||||    
T  628 ataatgtcc 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47104 - 46903
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  47104 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 47005  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47004 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 46905  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  46904 cc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40188 - 39987
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || ||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  40188 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctga 40089  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40088 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 39989  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  39988 cc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 29900 - 30101
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  29900 ctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 29999  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||   ||||||| ||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  30000 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgt 30099  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  30100 cc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 47
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  248 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 149  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  148 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 49  T
Q  204 cc 205  Q
    ||    
T  48 cc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 27429 - 27629
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaaagctaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  27429 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctga 27528  T
Q  113 cttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgt 203  Q
    |||||||||| |         ||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27529 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgt 27628  T
Q  204 c 204  Q
    |    
T  27629 c 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 9697 - 9904
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  9697 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 9796  T
Q  107 agctaacttttgagaacaat---------gtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |||         ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9797 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9896  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  9897 tgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7241
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  7364 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 7265  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  7264 agctgacttttgagaataatgtcc 7241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26326 - 26203
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  26326 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26227  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  26226 agctgacttttgagaataatgtcc 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9191 - 9068
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  9191 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9092  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  9091 agctgacttttgagaataatgtcc 9068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 20146 - 20269
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || || || |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |    
T  20146 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 20245  T
Q  107 agctaacttttgagaacaatgtcc 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  20246 agctgacttttgagaataatgtcc 20269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 8080 - 8287
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggatcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaagaagctcattcatcagggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  8080 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 8179  T
Q  107 agctaacttttgagaaca---------atgtcctcgacaatccaattccgaatcatgatgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 197  Q
    |||| ||||||||||| |         ||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8180 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8279  T
Q  198 tgatgtcc 205  Q
    ||||||||    
T  8280 tgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University