View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8618_low_3 (Length: 343)

Name: NF8618_low_3
Description: NF8618
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8618_low_3
NF8618_low_3
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (1-328)||(45395631-45395956)
chr3 (22-191)||(29644899-29645068)
chr3 (23-191)||(12114560-12114728)
chr3 (21-188)||(29644577-29644744)
chr3 (2-190)||(35946515-35946703)
chr3 (24-192)||(54017815-54017983)
chr3 (24-191)||(42342387-42342554)
chr3 (34-191)||(37990986-37991143)
chr3 (42-191)||(43346808-43346957)
chr3 (24-191)||(37990638-37990805)
chr3 (36-191)||(39914244-39914399)
chr3 (34-173)||(39934964-39935103)
chr3 (34-191)||(15772846-15773003)
chr3 (21-190)||(33803248-33803417)
chr3 (24-191)||(25755386-25755553)
chr3 (3-191)||(41359743-41359927)
chr3 (65-191)||(49336727-49336853)
chr3 (62-190)||(8327897-8328025)
chr3 (36-191)||(52634668-52634822)
chr3 (24-191)||(54018197-54018364)
chr3 (34-183)||(22304569-22304718)
chr3 (35-191)||(32462910-32463067)
chr3 (34-191)||(42342099-42342256)
chr3 (24-187)||(1634314-1634477)
chr3 (67-191)||(15773184-15773308)
chr3 (67-183)||(39389070-39389186)
chr3 (65-191)||(3135113-3135237)
chr3 (25-191)||(45901705-45901872)
chr3 (69-183)||(4823655-4823769)
chr3 (22-191)||(25739422-25739591)
chr3 (20-192)||(44160542-44160711)
chr3 (65-191)||(32462598-32462725)
chr3 (24-191)||(32589696-32589862)
chr3 (65-191)||(53577356-53577482)
chr3 (62-191)||(53118012-53118140)
chr3 (67-174)||(42584864-42584971)
chr3 (42-191)||(31190009-31190150)
chr3 (24-190)||(33175658-33175829)
chr3 (8-191)||(22303938-22304114)
chr3 (27-190)||(47964521-47964683)
chr3 (77-190)||(21832395-21832508)
chr3 (118-183)||(37726504-37726569)
chr3 (34-190)||(9240142-9240298)
chr3 (24-116)||(54017547-54017639)
chr3 (24-191)||(3135453-3135627)
chr3 (35-191)||(11661943-11662099)
chr3 (36-113)||(22303670-22303747)
chr3 (58-190)||(47964948-47965080)
chr3 (65-183)||(50612487-50612610)
chr3 (76-186)||(3384317-3384427)
chr3 (118-187)||(11661531-11661600)
chr3 (127-191)||(43346642-43346706)
chr3 (75-135)||(46546375-46546435)
chr3 (100-183)||(51886561-51886644)
chr3 (63-113)||(53596030-53596080)
chr3 (63-113)||(53596345-53596395)
chr3 (63-113)||(53596545-53596595)
chr3 (47-104)||(39335992-39336049)
chr3 (64-167)||(33362334-33362435)
chr3 (128-183)||(22304246-22304301)
chr3 (48-103)||(25413125-25413180)
chr3 (86-193)||(33809069-33809176)
chr3 (64-98)||(11661605-11661639)
chr3 (71-113)||(17731950-17731992)
chr3 (71-113)||(19033181-19033223)
chr3 (94-187)||(7767383-7767476)
chr3 (151-192)||(12747878-12747919)
chr3 (64-181)||(25991405-25991522)
chr3 (64-113)||(48127854-48127903)
chr3 (73-133)||(52634990-52635050)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (25-191)||(7517572-7517738)
chr7 (24-191)||(40094773-40094940)
chr7 (24-191)||(1085615-1085782)
chr7 (24-191)||(30244262-30244429)
chr7 (24-181)||(6054562-6054719)
chr7 (64-191)||(7554017-7554144)
chr7 (34-191)||(34218043-34218200)
chr7 (24-191)||(45433233-45433400)
chr7 (35-191)||(45434628-45434784)
chr7 (36-191)||(45754708-45754862)
chr7 (65-191)||(30245069-30245195)
chr7 (24-191)||(22567038-22567204)
chr7 (65-191)||(24838741-24838868)
chr7 (34-183)||(14681510-14681657)
chr7 (65-191)||(22566703-22566828)
chr7 (65-191)||(24177427-24177553)
chr7 (34-183)||(29157565-29157714)
chr7 (34-191)||(36939742-36939899)
chr7 (24-191)||(23376-23543)
chr7 (65-188)||(40230331-40230454)
chr7 (65-191)||(16569188-16569314)
chr7 (65-191)||(16596348-16596474)
chr7 (25-191)||(118299-118467)
chr7 (34-188)||(36622955-36623109)
chr7 (66-191)||(36534825-36534950)
chr7 (62-191)||(47129087-47129216)
chr7 (35-190)||(8128451-8128606)
chr7 (24-191)||(30032559-30032726)
chr7 (24-183)||(37533010-37533168)
chr7 (36-161)||(11845213-11845338)
chr7 (118-191)||(36109010-36109083)
chr7 (24-153)||(37533363-37533492)
chr7 (65-191)||(1085288-1085415)
chr7 (65-180)||(9901648-9901761)
chr7 (35-161)||(19122753-19122879)
chr7 (95-190)||(28301613-28301708)
chr7 (34-124)||(37167840-37167930)
chr7 (118-191)||(30245486-30245559)
chr7 (118-191)||(30255331-30255404)
chr7 (65-132)||(30253543-30253610)
chr7 (118-191)||(30244693-30244766)
chr7 (94-191)||(41910663-41910760)
chr7 (102-170)||(44361541-44361608)
chr7 (42-188)||(41854630-41854775)
chr7 (65-191)||(43241487-43241613)
chr7 (65-135)||(28300293-28300364)
chr7 (65-180)||(20599317-20599434)
chr7 (47-113)||(21619067-21619133)
chr7 (64-113)||(21416180-21416229)
chr7 (60-190)||(37345909-37346041)
chr7 (25-98)||(47129454-47129527)
chr7 (131-191)||(36967335-36967395)
chr7 (66-113)||(23569043-23569090)
chr7 (24-102)||(15902381-15902458)
chr7 (34-92)||(37532760-37532818)
chr7 (43-97)||(40094431-40094485)
chr7 (141-190)||(40094510-40094559)
chr7 (34-82)||(30244453-30244501)
chr7 (34-82)||(30253671-30253719)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (35-188)||(45122067-45122220)
chr8 (24-191)||(9309347-9309513)
chr8 (13-191)||(147443-147621)
chr8 (65-191)||(30359263-30359389)
chr8 (34-191)||(34834868-34835025)
chr8 (46-191)||(30359601-30359746)
chr8 (24-191)||(6876861-6877029)
chr8 (24-183)||(3669687-3669846)
chr8 (25-191)||(25561815-25561982)
chr8 (23-188)||(1513913-1514078)
chr8 (34-191)||(3038299-3038456)
chr8 (34-183)||(3670060-3670209)
chr8 (34-158)||(9483196-9483320)
chr8 (24-187)||(45123002-45123165)
chr8 (34-191)||(45121665-45121821)
chr8 (34-190)||(9608738-9608894)
chr8 (36-187)||(34835205-34835356)
chr8 (65-191)||(8794103-8794229)
chr8 (34-183)||(1013880-1014029)
chr8 (42-174)||(18372011-18372143)
chr8 (34-183)||(30441081-30441234)
chr8 (24-159)||(45122648-45122783)
chr8 (24-190)||(9308970-9309140)
chr8 (24-191)||(40518061-40518230)
chr8 (34-183)||(1014254-1014403)
chr8 (34-191)||(37544499-37544656)
chr8 (33-189)||(12283867-12284022)
chr8 (75-173)||(70324-70422)
chr8 (34-191)||(9482613-9482768)
chr8 (65-191)||(33113407-33113533)
chr8 (36-154)||(34835504-34835622)
chr8 (36-154)||(34835770-34835888)
chr8 (70-191)||(43274824-43274945)
chr8 (75-191)||(8918814-8918930)
chr8 (38-183)||(20870586-20870733)
chr8 (42-188)||(40518577-40518723)
chr8 (65-190)||(41972151-41972279)
chr8 (42-191)||(147821-147961)
chr8 (34-191)||(5420643-5420800)
chr8 (25-191)||(5915864-5916025)
chr8 (34-173)||(18371670-18371804)
chr8 (67-185)||(45121952-45122070)
chr8 (34-191)||(9507769-9507931)
chr8 (24-157)||(32305503-32305636)
chr8 (14-191)||(32640521-32640693)
chr8 (25-193)||(4154281-4154448)
chr8 (102-170)||(20130462-20130529)
chr8 (26-106)||(20995417-20995497)
chr8 (65-160)||(9609108-9609203)
chr8 (118-185)||(18372349-18372416)
chr8 (67-181)||(40579548-40579662)
chr8 (94-180)||(3037777-3037865)
chr8 (34-183)||(6731904-6732044)
chr8 (67-179)||(18380059-18380171)
chr8 (105-173)||(41416251-41416319)
chr8 (24-190)||(9620677-9620841)
chr8 (118-185)||(18372792-18372859)
chr8 (118-173)||(25561737-25561792)
chr8 (23-105)||(41129066-41129148)
chr8 (34-179)||(43398077-43398225)
chr8 (26-190)||(4154669-4154831)
chr8 (24-89)||(43274634-43274699)
chr8 (24-122)||(6651555-6651653)
chr8 (34-108)||(40579278-40579352)
chr8 (75-112)||(12156708-12156745)
chr8 (36-112)||(2467571-2467647)
chr8 (45-97)||(16524451-16524503)
chr8 (151-190)||(18645713-18645752)
chr8 (144-190)||(20995520-20995566)
chr8 (94-146)||(18373239-18373291)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (22-191)||(36608656-36608825)
chr4 (24-191)||(50002418-50002585)
chr4 (34-191)||(25483328-25483485)
chr4 (23-191)||(22183260-22183428)
chr4 (25-190)||(52884688-52884854)
chr4 (42-191)||(4955332-4955481)
chr4 (34-190)||(36629230-36629386)
chr4 (33-190)||(3244457-3244614)
chr4 (14-183)||(41370357-41370526)
chr4 (22-183)||(55933119-55933280)
chr4 (35-191)||(36572011-36572167)
chr4 (64-191)||(52884879-52885007)
chr4 (61-192)||(41707499-41707629)
chr4 (34-188)||(3340802-3340956)
chr4 (65-191)||(34646687-34646813)
chr4 (34-191)||(10245912-10246068)
chr4 (34-190)||(20825829-20825985)
chr4 (14-191)||(22028356-22028535)
chr4 (34-190)||(39792867-39793023)
chr4 (27-183)||(50630755-50630911)
chr4 (34-186)||(54017602-54017754)
chr4 (35-190)||(54108908-54109060)
chr4 (34-166)||(54936213-54936344)
chr4 (34-191)||(22027968-22028125)
chr4 (35-191)||(39404390-39404546)
chr4 (42-191)||(1731662-1731811)
chr4 (25-161)||(44620375-44620511)
chr4 (15-191)||(51768048-51768224)
chr4 (62-190)||(54741213-54741341)
chr4 (24-190)||(2740693-2740857)
chr4 (52-191)||(3341120-3341259)
chr4 (65-191)||(16888854-16888981)
chr4 (65-191)||(16889574-16889701)
chr4 (34-173)||(20826227-20826366)
chr4 (65-191)||(4390139-4390265)
chr4 (65-183)||(49880160-49880278)
chr4 (14-180)||(50459724-50459890)
chr4 (25-161)||(44621024-44621160)
chr4 (65-161)||(45496827-45496923)
chr4 (24-191)||(49076448-49076612)
chr4 (75-191)||(54017750-54017868)
chr4 (24-190)||(28034222-28034388)
chr4 (34-185)||(49302902-49303055)
chr4 (35-160)||(18932757-18932882)
chr4 (120-192)||(3700356-3700428)
chr4 (34-190)||(32941130-32941286)
chr4 (24-188)||(39404013-39404177)
chr4 (22-189)||(44620654-44620820)
chr4 (34-189)||(49076838-49076992)
chr4 (34-191)||(43174498-43174656)
chr4 (74-190)||(2741064-2741180)
chr4 (2-129)||(23817655-23817783)
chr4 (67-191)||(45489372-45489495)
chr4 (24-173)||(54343005-54343147)
chr4 (65-183)||(6975494-6975612)
chr4 (42-112)||(15841383-15841453)
chr4 (64-164)||(3271803-3271905)
chr4 (102-190)||(10246340-10246428)
chr4 (24-91)||(43174233-43174300)
chr4 (118-189)||(44621420-44621491)
chr4 (47-185)||(23556886-23557024)
chr4 (35-188)||(34004593-34004744)
chr4 (2-155)||(54108564-54108717)
chr4 (64-113)||(11197296-11197345)
chr4 (64-132)||(31691203-31691271)
chr4 (141-192)||(45050592-45050643)
chr4 (76-113)||(1868121-1868158)
chr4 (24-113)||(11783550-11783639)
chr4 (60-129)||(15841018-15841086)
chr4 (60-193)||(34544094-34544230)
chr4 (118-191)||(44620288-44620361)
chr4 (65-113)||(922488-922536)
chr4 (75-135)||(18879854-18879914)
chr4 (37-113)||(19504766-19504842)
chr4 (131-183)||(50788087-50788139)
chr4 (62-129)||(2891857-2891924)
chr4 (148-191)||(6876218-6876261)
chr4 (24-131)||(43827492-43827598)
chr4 (64-113)||(10396201-10396250)
chr4 (64-113)||(10396486-10396535)
chr4 (46-110)||(50788013-50788077)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (34-191)||(34364499-34364656)
chr1 (25-183)||(41759483-41759641)
chr1 (34-191)||(17294569-17294727)
chr1 (2-191)||(39066179-39066366)
chr1 (34-191)||(34364917-34365074)
chr1 (25-191)||(37850600-37850766)
chr1 (26-192)||(41157366-41157532)
chr1 (22-191)||(41156983-41157152)
chr1 (51-190)||(22077521-22077660)
chr1 (24-191)||(26661521-26661688)
chr1 (24-183)||(44290823-44290983)
chr1 (65-191)||(26661938-26662064)
chr1 (65-182)||(3550721-3550838)
chr1 (34-191)||(3875340-3875497)
chr1 (14-183)||(48588477-48588646)
chr1 (24-191)||(41142364-41142532)
chr1 (23-183)||(45493972-45494137)
chr1 (35-190)||(30630648-30630803)
chr1 (60-183)||(32594751-32594874)
chr1 (24-183)||(44290457-44290616)
chr1 (65-180)||(50052063-50052178)
chr1 (25-178)||(3537599-3537752)
chr1 (34-190)||(24600323-24600479)
chr1 (34-191)||(37556103-37556260)
chr1 (42-192)||(38804372-38804522)
chr1 (42-191)||(5319982-5320131)
chr1 (34-191)||(40082399-40082555)
chr1 (65-146)||(44043812-44043893)
chr1 (15-187)||(11977276-11977448)
chr1 (24-191)||(34649430-34649597)
chr1 (65-191)||(29798191-29798317)
chr1 (89-191)||(41184489-41184591)
chr1 (42-191)||(66489-66638)
chr1 (24-157)||(14318893-14319026)
chr1 (22-191)||(31767158-31767327)
chr1 (25-191)||(9955899-9956067)
chr1 (34-179)||(5528763-5528908)
chr1 (23-187)||(45084378-45084536)
chr1 (25-190)||(19283455-19283620)
chr1 (23-158)||(22077108-22077243)
chr1 (36-190)||(24131999-24132150)
chr1 (74-190)||(66136-66254)
chr1 (34-192)||(5575097-5575251)
chr1 (104-183)||(3537226-3537305)
chr1 (25-112)||(47380167-47380254)
chr1 (34-188)||(22077838-22077991)
chr1 (25-190)||(1188588-1188753)
chr1 (34-191)||(37555722-37555878)
chr1 (42-193)||(22793268-22793420)
chr1 (34-113)||(32168707-32168786)
chr1 (102-191)||(21378118-21378207)
chr1 (65-113)||(50051728-50051776)
chr1 (33-115)||(5996880-5996961)
chr1 (60-110)||(9956208-9956258)
chr1 (141-191)||(35154155-35154205)
chr1 (54-190)||(44685449-44685585)
chr1 (60-188)||(1187399-1187527)
chr1 (35-135)||(45839679-45839779)
chr1 (60-135)||(10351208-10351283)
chr1 (65-112)||(11977015-11977062)
chr1 (33-112)||(24448348-24448427)
chr1 (60-90)||(30697310-30697340)
chr1 (48-98)||(47379801-47379851)
chr1 (75-156)||(4956218-4956299)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (24-191)||(16107670-16107837)
chr6 (25-190)||(10073991-10074156)
chr6 (24-183)||(29518503-29518662)
chr6 (24-183)||(29518920-29519079)
chr6 (24-183)||(32741179-32741338)
chr6 (25-183)||(1127360-1127518)
chr6 (25-191)||(2579872-2580038)
chr6 (25-183)||(35210204-35210362)
chr6 (14-183)||(3058226-3058395)
chr6 (34-190)||(10074372-10074528)
chr6 (34-190)||(10073625-10073779)
chr6 (35-183)||(3409259-3409407)
chr6 (24-191)||(2377746-2377913)
chr6 (24-191)||(2578442-2578608)
chr6 (24-183)||(1846748-1846907)
chr6 (24-183)||(2378126-2378285)
chr6 (24-191)||(16454567-16454734)
chr6 (24-191)||(16454899-16455066)
chr6 (24-183)||(3409660-3409819)
chr6 (22-179)||(3415462-3415621)
chr6 (36-191)||(5832038-5832192)
chr6 (65-191)||(5958643-5958769)
chr6 (25-190)||(12092482-12092647)
chr6 (64-184)||(593748-593868)
chr6 (24-191)||(2843546-2843714)
chr6 (67-190)||(2578877-2578999)
chr6 (42-180)||(1950202-1950340)
chr6 (34-180)||(6999805-6999951)
chr6 (73-183)||(14748386-14748496)
chr6 (65-183)||(26544049-26544167)
chr6 (94-191)||(16108055-16108152)
chr6 (75-178)||(32460630-32460733)
chr6 (47-192)||(6071123-6071268)
chr6 (60-173)||(9062385-9062497)
chr6 (34-190)||(10911558-10911715)
chr6 (35-191)||(2579119-2579271)
chr6 (67-190)||(2975544-2975668)
chr6 (23-179)||(17135067-17135223)
chr6 (65-192)||(8481918-8482044)
chr6 (34-178)||(2579501-2579645)
chr6 (35-98)||(12071701-12071764)
chr6 (37-112)||(12085046-12085121)
chr6 (25-135)||(30618618-30618725)
chr6 (65-113)||(11637761-11637809)
chr6 (60-91)||(10902465-10902496)
chr6 (71-113)||(22605301-22605343)
chr6 (57-98)||(33605731-33605772)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (33-188)||(26074607-26074762)
chr5 (33-190)||(26074154-26074311)
chr5 (23-187)||(40296313-40296477)
chr5 (34-183)||(624196-624345)
chr5 (23-195)||(41632770-41632942)
chr5 (24-191)||(12662651-12662818)
chr5 (61-188)||(35150002-35150128)
chr5 (23-183)||(6500451-6500610)
chr5 (24-191)||(15370091-15370258)
chr5 (13-183)||(32487394-32487563)
chr5 (34-171)||(33747783-33747920)
chr5 (34-191)||(34753034-34753191)
chr5 (34-191)||(36492226-36492383)
chr5 (24-191)||(11416976-11417141)
chr5 (42-190)||(13415777-13415925)
chr5 (65-191)||(26075201-26075328)
chr5 (24-190)||(36568568-36568732)
chr5 (42-183)||(623818-623959)
chr5 (67-191)||(299481-299605)
chr5 (23-183)||(6500823-6500982)
chr5 (34-181)||(18603129-18603276)
chr5 (24-183)||(27502035-27502194)
chr5 (24-190)||(1028516-1028682)
chr5 (65-187)||(3295055-3295176)
chr5 (65-183)||(9498694-9498812)
chr5 (65-191)||(25327927-25328053)
chr5 (34-191)||(35167847-35168004)
chr5 (24-191)||(3295344-3295509)
chr5 (72-191)||(6224188-6224307)
chr5 (65-191)||(26074821-26074948)
chr5 (42-173)||(41170644-41170775)
chr5 (26-190)||(24489207-24489369)
chr5 (46-191)||(41635212-41635357)
chr5 (34-157)||(15370428-15370551)
chr5 (67-191)||(42405638-42405762)
chr5 (25-190)||(36522237-36522402)
chr5 (34-146)||(26590919-26591031)
chr5 (34-178)||(38427553-38427696)
chr5 (22-97)||(26900014-26900089)
chr5 (88-191)||(42508604-42508707)
chr5 (65-183)||(5723831-5723949)
chr5 (51-183)||(29549281-29549413)
chr5 (65-191)||(35914841-35914967)
chr5 (64-113)||(13042609-13042658)
chr5 (64-113)||(13112607-13112656)
chr5 (61-162)||(13786037-13786137)
chr5 (118-190)||(39309677-39309749)
chr5 (140-191)||(35150739-35150790)
chr5 (140-191)||(35151030-35151081)
chr5 (110-188)||(300954-301032)
chr5 (120-181)||(7768852-7768913)
chr5 (151-192)||(31509614-31509655)
chr5 (60-115)||(36527130-36527185)
chr5 (123-173)||(6225054-6225104)
chr5 (47-113)||(32445955-32446021)
chr5 (48-190)||(36521919-36522061)
chr5 (64-109)||(13042328-13042373)
chr5 (64-109)||(13112322-13112367)
chr5 (59-103)||(13042784-13042828)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (36-178)||(33731653-33731795)
chr2 (2-191)||(6712968-6713158)
chr2 (34-191)||(15880255-15880412)
chr2 (42-183)||(36178622-36178763)
chr2 (34-191)||(15511504-15511659)
chr2 (34-190)||(962591-962747)
chr2 (34-190)||(28531323-28531479)
chr2 (24-188)||(35580723-35580886)
chr2 (24-191)||(6421377-6421544)
chr2 (24-190)||(42514642-42514808)
chr2 (34-183)||(37106188-37106337)
chr2 (34-190)||(40679638-40679794)
chr2 (23-183)||(41283473-41283633)
chr2 (65-183)||(14745707-14745825)
chr2 (34-183)||(5543007-5543156)
chr2 (34-191)||(36005889-36006045)
chr2 (44-191)||(28254258-28254403)
chr2 (64-188)||(40733512-40733636)
chr2 (24-183)||(37105924-37106083)
chr2 (2-183)||(5542603-5542783)
chr2 (35-186)||(1769889-1770040)
chr2 (67-191)||(31259658-31259785)
chr2 (36-161)||(36178182-36178307)
chr2 (34-190)||(23346228-23346385)
chr2 (60-190)||(33561486-33561616)
chr2 (65-190)||(5367448-5367573)
chr2 (118-191)||(38796311-38796384)
chr2 (78-191)||(38796673-38796786)
chr2 (34-161)||(6422132-6422259)
chr2 (76-183)||(36178320-36178427)
chr2 (34-191)||(29676895-29677057)
chr2 (42-192)||(30313169-30313318)
chr2 (65-190)||(37632637-37632762)
chr2 (36-172)||(40163383-40163520)
chr2 (34-190)||(9231242-9231398)
chr2 (95-191)||(31899496-31899592)
chr2 (71-191)||(37895107-37895227)
chr2 (24-188)||(40733878-40734041)
chr2 (35-186)||(7598225-7598376)
chr2 (34-186)||(7598606-7598750)
chr2 (60-191)||(16542441-16542572)
chr2 (65-183)||(14745334-14745452)
chr2 (24-113)||(6421801-6421890)
chr2 (75-191)||(31468800-31468912)
chr2 (52-173)||(29676545-29676660)
chr2 (24-113)||(29874022-29874111)
chr2 (126-191)||(36785664-36785729)
chr2 (141-191)||(6421296-6421346)
chr2 (34-111)||(3672773-3672850)
chr2 (24-129)||(3673122-3673227)
chr2 (65-130)||(36784300-36784365)
chr2 (64-188)||(37894731-37894855)
chr2 (34-113)||(6421696-6421775)
chr2 (57-115)||(8904496-8904554)
chr2 (65-191)||(12529068-12529194)
chr2 (78-164)||(28254165-28254251)
chr2 (64-113)||(28226407-28226456)
chr2 (47-112)||(29873559-29873624)
chr2 (60-190)||(41678403-41678534)
chr2 (64-112)||(28226726-28226773)
chr2 (27-190)||(33953774-33953936)
chr2 (66-192)||(30323455-30323581)
chr2 (61-110)||(15689435-15689484)
chr2 (60-113)||(31385807-31385860)
chr2 (58-91)||(33954295-33954328)
chr2 (151-192)||(43443108-43443149)
chr2 (121-161)||(42515038-42515078)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (34-191)||(5388-5546)
scaffold0734 (51-191)||(5769-5914)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (34-191)||(4974-5131)
scaffold0078 (65-191)||(5349-5475)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (24-191)||(513-680)
scaffold0702 (118-183)||(235-300)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (24-187)||(47356-47519)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (34-191)||(1115-1272)
scaffold0391 (64-135)||(1730-1801)
scaffold0391 (132-191)||(3092-3151)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (67-191)||(17496-17622)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (118-191)||(10204-10277)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 45395631 - 45395956
Alignment:
Q  1 cgttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagac 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45395631 cgttggatcacgggg--aactttgggagaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagac 45395728  T
Q  101 aatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaattattacgt 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45395729 aatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaattattacgt 45395828  T
Q  201 tattgcaactcaatgtgttgatttctttaataaaaatagatggatgcagccgtaggattgtgaggatcagagttcatagttgagggacctatgcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45395829 tattgcaactcaatgtgttgatttctttaataagaatagatggatgcagccgtaggattgtgaggatcagagttcacagttgagggacctatgcatttga 45395928  T
Q  301 gatttaggtaaaactaagttgcagattt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45395929 gatttaggtaaaactaagttgcagattt 45395956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 29644899 - 29645068
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||    
T  29644899 ttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctt 29644998  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29644999 acttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 29645068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 12114560 - 12114728
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||    
T  12114560 tgggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctta 12114659  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12114660 cttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 12114728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 29644577 - 29644744
Alignment:
Q  21 tttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatct 120  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||| | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  29644577 tttgggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctct 29644676  T
Q  121 tacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  29644677 tacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 29644744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35946703 - 35946515
Alignment:
Q  2 gttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaca 101  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||   || |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  35946703 gttgggtcactgggggagctttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggca 35946604  T
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  35946603 acgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 35946515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 54017815 - 54017983
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||  |  ||||||    
T  54017815 gggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttac 54017914  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54017915 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaat 54017983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 42342387 - 42342554
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  42342387 gggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttac 42342486  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  42342487 ttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 42342554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 37990986 - 37991143
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| | |  ||||||||||||||||    
T  37990986 ccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtg 37991085  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  37991086 ttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaa 37991143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 43346808 - 43346957
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |    
T  43346808 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacct 43346907  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  43346908 ttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 43346957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 37990638 - 37990805
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||||||    
T  37990638 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttac 37990737  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  37990738 ttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaa 37990805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914244
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || | ||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     ||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 39914244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Original strand, 39934964 - 39935103
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39934964 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtg 39935063  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  39935064 ttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataact 39935103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15773003 - 15772846
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15773003 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtg 15772904  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15772903 ttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgcacacgacaa 15772846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 33803248 - 33803417
Alignment:
Q  21 tttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatct 120  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |  |||    
T  33803248 tttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctct 33803347  T
Q  121 tacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  33803348 tacttatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25755553 - 25755386
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |  ||||||    
T  25755553 gggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttac 25755454  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25755453 ttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaa 25755386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 41359743 - 41359927
Alignment:
Q  3 ttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaa 102  Q
    |||| |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  41359743 ttgggtcactgggggagctcggggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaa 41359842  T
Q  103 tgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| |    |||||| |||||||||||||||||    
T  41359843 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgcacacaacaa 41359927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 49336727 - 49336853
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  49336727 agagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgaga 49336826  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     || ||||| ||||||| |||||||||    
T  49336827 catgtaactcacacttgtacacaacaa 49336853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8328025 - 8327897
Alignment:
Q  62 gtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  8328025 gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtg 8327926  T
Q  162 agatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||    
T  8327925 ggacatataactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52634822 - 52634668
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||    
T  52634822 acatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgtt 52634724  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  52634723 caacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 52634668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 54018197 - 54018364
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||| |  ||||||    
T  54018197 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttac 54018296  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  54018297 ttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgcacataacaa 54018364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22304718 - 22304569
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||     
T  22304718 ccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggta 22304619  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22304618 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgca 22304569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Original strand, 32462910 - 32463067
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |    
T  32462910 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtat 32463009  T
Q  135 ttaa-catttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  32463010 tcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 32463067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 42342099 - 42342256
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||      
T  42342099 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggca 42342198  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  | |||| | | |||||||||||||||||    
T  42342199 ttgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaa 42342256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 1634314 - 1634477
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  1634314 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttac 1634412  T
Q  124 ttataaggtgtttaa-catttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    |||||| |||||||| | |||| | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  1634413 ttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 1634477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15773308 - 15773184
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |    
T  15773308 agagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggaca 15773209  T
Q  167 tataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15773208 tataactcacacttgcacacaacaa 15773184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39389186 - 39389070
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |    
T  39389186 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggaca 39389087  T
Q  167 tataacttacacttgca 183  Q
    ||||||| |||||||||    
T  39389086 tataactcacacttgca 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 3135113 - 3135237
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3135113 agagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggga 3135212  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     ||||||||  |||||| |||||||||    
T  3135213 catataact--cacttgtacacaacaa 3135237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45901872 - 45901705
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| | | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||  |  |||||||    
T  45901872 ggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttact 45901773  T
Q  125 tataaggtgtttaa-catttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||| || | |||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45901772 tataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 45901705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823655
Alignment:
Q  69 agacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  169 taacttacacttgca 183  Q
    ||||| |||||||||    
T  4823669 taactcacacttgca 4823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 25739422 - 25739591
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||| |  ||||    
T  25739422 ttgggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctctt 25739521  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  25739522 acttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 25739591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 44160542 - 44160711
Alignment:
Q  20 ctttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatc 119  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| | ||  ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  44160542 ctttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctc 44160638  T
Q  120 ttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44160639 ttatttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgcatacaacaat 44160711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 32462598 - 32462725
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaa-catttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||||| |    
T  32462598 agagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtggg 32462697  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  32462698 acatataactcacacttgtacacaacaa 32462725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32589862 - 32589696
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || |||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  32589862 gggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 32589763  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||||  ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  32589762 ttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgcacacaacaa 32589696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 53577482 - 53577356
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||   |||| || |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  53577482 agagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtga 53577383  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  53577382 catataactcacacttgcacacaacaa 53577356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Original strand, 53118012 - 53118140
Alignment:
Q  62 gtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| || ||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  53118012 gtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatg 53118110  T
Q  162 agatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
      | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  53118111 gaacatataactcacacttgcccacaacaa 53118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584971
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| || |    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  167 tataactt 174  Q
    ||||||||    
T  42584964 tataactt 42584971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31190150 - 31190009
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||          ||| |||||||||||||| ||| |    
T  31190150 aggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtcc--------tctaacttataaggtgttcaacct 31190059  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  31190058 ttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaa 31190009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 33175658 - 33175829
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacac--tcttacccaaaactttaagacaatgggtttat---ggattat 118  Q
    |||||||  |||||| | |||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||   || || |    
T  33175658 gggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttct 33175757  T
Q  119 cttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33175758 cttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaaca 33175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 22303938 - 22304114
Alignment:
Q  8 tcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggt 107  Q
    |||| |||||| | |||||||||   ||||||| |||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  22303938 tcactgggggagccttgggggacaatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggt 22304037  T
Q  108 ttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| |   ||||||||||||       || |||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22304038 ttatgggtccgcttacttataag-------acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 22304114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Original strand, 47964521 - 47964683
Alignment:
Q  27 ggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactta 126  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||| |||||    
T  47964521 ggaccacccacatcaagg-tggagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcactta 47964619  T
Q  127 taaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||  | ||| ||| |  ||  || ||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  47964620 tatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcgggacatacaactcacacttgcacacaaca 47964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Original strand, 21832395 - 21832508
Alignment:
Q  77 cactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttac 176  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  21832395 cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcac 21832494  T
Q  177 acttgcacacaaca 190  Q
    ||||||||| ||||    
T  21832495 acttgcacataaca 21832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37726569 - 37726504
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37726569 tcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 37726504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9240298 - 9240142
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||  | |||||||||||||||| ||||| || |||  |||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9240298 ccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtg 9240199  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || | | ||||||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  9240198 ttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 54017547 - 54017639
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggatt 116  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54017547 gggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatt 54017639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 3135453 - 3135627
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttat--ggattatctt 121  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  || |  ||||    
T  3135453 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctt 3135552  T
Q  122 ac-----ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||     | |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  3135553 actaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 3135627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11662099 - 11661943
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||     ||| |||| |||||||    
T  11662099 cacatcgaggctagaacaaccacacaa-tgagagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtg 11662001  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||| || |||||||    
T  11662000 ttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacacttacatacaacaa 11661943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Original strand, 22303670 - 22303747
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||| |||||||| ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22303670 acatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 22303747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Original strand, 47964948 - 47965080
Alignment:
Q  58 ataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccga 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||     ||| |||||||   |||||||| |  ||| || |||||||    
T  47964948 ataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccga 47965047  T
Q  158 tgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  47965048 tgtaaaacatataactcacacttgcacacaaca 47965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 50612487 - 50612610
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtt-----tatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  |||     ||||  |  |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  50612487 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatg 50612586  T
Q  160 tgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || || |||||||| |||||||||    
T  50612587 tgggacatataactcacacttgca 50612610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384427
Alignment:
Q  76 acactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataactta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |  |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||| || |||||||| |    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  176 cacttgcacac 186  Q
    | |||||||||    
T  3384417 cgcttgcacac 3384427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11661600 - 11661531
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  11661600 tcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacaca 11661531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346642
Alignment:
Q  127 taaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaa 43346642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 135
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546435
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgtt 46546435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51886644 - 51886561
Alignment:
Q  100 caatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51886644 caatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 51886561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53596080 - 53596030
Alignment:
Q  63 tgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  53596080 tgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgg 53596030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53596395 - 53596345
Alignment:
Q  63 tgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  53596395 tgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgg 53596345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53596595 - 53596545
Alignment:
Q  63 tgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53596595 tgagagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgg 53596545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 39335992 - 39336049
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatg 104  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39335992 agagcaatcacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 39336049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Original strand, 33362334 - 33362435
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||  |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||  ||||    
T  33362334 gagagagacgccacact--tacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccgacatgag 33362431  T
Q  164 atat 167  Q
    ||||    
T  33362432 atat 33362435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304246
Alignment:
Q  128 aaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22304246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25413180 - 25413125
Alignment:
Q  48 gagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaat 103  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  25413180 gagcaaccacctaaatgagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaat 25413125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 193
Target Start/End: Original strand, 33809069 - 33809176
Alignment:
Q  86 ccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcaca 185  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||   || ||||||| |||| ||||| || ||  | | || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33809069 ccaaaaccttaagacaacgagtttattagttttcttactcataaagtgttcaatatgcaattttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcaca 33809168  T
Q  186 caacaatt 193  Q
    ||||||||    
T  33809169 caacaatt 33809176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11661639 - 11661605
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11661639 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 11661605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731992
Alignment:
Q  71 acaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 17731992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033223
Alignment:
Q  71 acaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 19033223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Original strand, 7767383 - 7767476
Alignment:
Q  94 ttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||| |||||| ||||  ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||    
T  7767383 ttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagacttacacaca 7767476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747919
Alignment:
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaat 12747919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25991522 - 25991405
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || | ||||||| | || ||| ||||||||  ||||||||||| |||  |||||  |||||| |    
T  25991522 gagagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggg 25991423  T
Q  164 atatataacttacacttg 181  Q
    | |||| ||| |||||||    
T  25991422 acatattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 48127854 - 48127903
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  48127854 gagaaagacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgg 48127903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  73 accacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7517738 - 7517572
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  7517738 ggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 7517639  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7517638 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 7517572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 40094773 - 40094940
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  40094773 gggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttac 40094872  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40094873 ttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 40094940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 1085615 - 1085782
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  1085615 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 1085714  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  1085715 ttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 1085782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30244429 - 30244262
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||    
T  30244429 gggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttac 30244330  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30244329 ttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 30244262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6054719 - 6054562
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||    
T  6054719 gggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttac 6054620  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttg 181  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6054619 ttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7554144 - 7554017
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |    
T  7554144 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 7554045  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  7554044 acatataactcacacttgcacacaacaa 7554017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 34218043 - 34218200
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||    
T  34218043 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtg 34218142  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  34218143 ttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 34218200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45433400 - 45433233
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||  || ||||||    
T  45433400 gggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttac 45433301  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagat-atataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45433300 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gatcatataactcacacttgtacacaacaa 45433233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45434784 - 45434628
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45434784 cacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 45434685  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  45434684 tcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaa 45434628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754708
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgtacacaacaa 45754708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30245195 - 30245069
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |    
T  30245195 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaa 30245096  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30245095 catataactcacacttgtacacaacaa 30245069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 22567038 - 22567204
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||    
T  22567038 gggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttac 22567137  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22567138 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gacatattactcacacttgcatacaacaa 22567204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 24838741 - 24838868
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattat-cttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24838741 agagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttactcttttattcgatgtgag 24838840  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||    
T  24838841 acatataacttacacttatacacaacaa 24838868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14681657 - 14681510
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  14681657 ccacatcaaggctagaacaaccacacttgtgagaga--caccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtg 14681560  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14681559 ttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgca 14681510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 22566703 - 22566828
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22566703 agagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 22566801  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22566802 catattactcacacttgcatacaacaa 22566828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24177553 - 24177427
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||    
T  24177553 agagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtggga 24177454  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| | |||||||||||||||    
T  24177453 catataactcatacttgcacacaacaa 24177427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29157714 - 29157565
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29157714 ccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtg 29157615  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  29157614 ttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgca 29157565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 36939742 - 36939899
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36939742 ccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtg 36939841  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  36939842 ttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgcacagaacaa 36939899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 23376 - 23543
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||||    
T  23376 gggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttac 23475  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  23476 ttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaa 23543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 40230331 - 40230454
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  40230331 agagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtggga 40230430  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaa 188  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40230431 catataacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16569314 - 16569188
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  16569314 agagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgaga 16569215  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16569214 catataactcacacttgcatacaacaa 16569188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 16596348 - 16596474
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  16596348 agagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgaga 16596447  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16596448 catataactcacacttgcatacaacaa 16596474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 118299 - 118467
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagaga--gacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| || |||  |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||  |||||    
T  118299 ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctctta 118398  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  118399 cttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaa 118467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36623109 - 36622955
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||  ||| ||| | || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||  || |||||||||  ||    
T  36623109 ccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatg 36623010  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  36623009 tttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 36622955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 191
Target Start/End: Original strand, 36534825 - 36534950
Alignment:
Q  66 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagat 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||| ||     
T  36534825 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggac 36534924  T
Q  166 atataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  36534925 atataagttacacttgcacacaacaa 36534950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47129216 - 47129087
Alignment:
Q  62 gtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||| |  |||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  47129216 gtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtg 47129117  T
Q  162 agatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  47129116 agacatataactcacacttgtgcacaacaa 47129087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 8128451 - 8128606
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  8128451 cacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgt 8128550  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    | ||| |||| | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  8128551 tcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30032726 - 30032559
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||  ||||||    
T  30032726 gggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttac 30032627  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| || || ||||||    
T  30032626 ttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacatgtacgcaacaa 30032559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Original strand, 37533010 - 37533168
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||| | || |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||    
T  37533010 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttac 37533108  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37533109 ttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 37533168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11845338 - 11845213
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||  || |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11845338 acatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 11845239  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11845238 caacctttactattttatccgatgtg 11845213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Original strand, 36109010 - 36109083
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36109010 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaa 36109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 37533363 - 37533492
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||    
T  37533363 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttac 37533462  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttat 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  37533463 ttataaggtgttcaacctttactattttat 37533492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 1085288 - 1085415
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||| || ||    
T  1085288 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccgatatggga 1085387  T
Q  165 tat-ataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     || | |||| |||||||||||||||||    
T  1085388 cataaaaactcacacttgcacacaacaa 1085415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9901761 - 9901648
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  9901761 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-ga 9901664  T
Q  165 tatataacttacactt 180  Q
     |||||||| ||||||    
T  9901663 catataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122753
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| || ||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |  |||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgtg 19122753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301708
Alignment:
Q  95 taagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37167930 - 37167840
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  37167930 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact 37167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30245559 - 30245486
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  30245559 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 30245486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30255404 - 30255331
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  30255404 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaa 30255331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30253610 - 30253543
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  30253610 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggt 30253543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30244766 - 30244693
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  30244766 tcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 30244693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Original strand, 41910663 - 41910760
Alignment:
Q  94 ttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  41910663 ttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacacaacaa 41910760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Original strand, 44361541 - 44361608
Alignment:
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatata 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44361541 atgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatata 44361608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41854775 - 41854630
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || |   ||||| | | ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  41854775 aggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgttcaacct 41854676  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  41854675 ttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgcacacaa 41854630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43241613 - 43241487
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||  |  | |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |    
T  43241613 agagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaa 43241514  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  43241513 catataactcacacttgcacacaacaa 43241487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Original strand, 28300293 - 28300364
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttat-ggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  28300293 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttataaggtgtt 28300364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20599434 - 20599317
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactct--tacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtga 162  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||   |  ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||     
T  20599434 agagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgg 20599335  T
Q  163 gatatataacttacactt 180  Q
    || |||||||| ||||||    
T  20599334 gacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 21619067 - 21619133
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||  | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21619067 agagcaaccatacaagtgaaagatacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgg 21619133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 21416180 - 21416229
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  21416180 gagagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgg 21416229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37346041 - 37345909
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccg--a 157  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |  ||| ||||||||  |||||||| |  ||| || |||| |  |    
T  37346041 aagtgagagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagata 37345942  T
Q  158 tgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37345941 tatgacatatataactcacacttgcacacaaca 37345909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47129527 - 47129454
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 98  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47129527 ggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 47129454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967395
Alignment:
Q  131 gtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaa 36967395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569090
Alignment:
Q  66 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 23569090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15902458 - 15902381
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaa 102  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  15902458 gggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaa 15902381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 37532760 - 37532818
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaac 92  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532760 ccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaac 37532818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 97
Target Start/End: Original strand, 40094431 - 40094485
Alignment:
Q  43 ggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaa 97  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40094431 ggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaa 40094485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Original strand, 40094510 - 40094559
Alignment:
Q  141 tttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40094510 tttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcacacaaca 40094559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30244501 - 30244453
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactct 82  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30244501 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30253719 - 30253671
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactct 82  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30253719 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122220
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9309513 - 9309347
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| || |  ||||||    
T  9309513 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatac-tgagagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttac 9309415  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  9309414 ttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 9309347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 147621 - 147443
Alignment:
Q  13 gggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  147621 gggggagctatgggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatg 147522  T
Q  113 gattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  147521 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacgcaacaa 147443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30359389 - 30359263
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359389 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgaga 30359290  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30359289 catataactcacacttgtacacaacaa 30359263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34835025 - 34834868
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  34835025 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtg 34834926  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  34834925 tttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 34834868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30359746 - 30359601
Alignment:
Q  46 tagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttac 145  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30359746 tagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttac 30359647  T
Q  146 tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30359646 tcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaa 30359601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 6876861 - 6877029
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  6876861 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttat 6876960  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga-tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6876961 ttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaacaa 6877029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3669846 - 3669687
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||||||    
T  3669846 gggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttac 3669747  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  3669746 ttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3669687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 25561815 - 25561982
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttaccc-aaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  25561815 ggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 25561914  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||    
T  25561915 ttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaa 25561982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 1513913 - 1514078
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| || |  |||||    
T  1513913 tgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctctta 1514012  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  1514013 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttgtacacaa 1514078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 3038299 - 3038456
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||| |||    
T  3038299 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtg 3038398  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  3038399 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 3038456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3670209 - 3670060
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |  || |||||||||||||    
T  3670209 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtg 3670110  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3670109 ttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3670060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Original strand, 9483196 - 9483320
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9483196 ccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 9483295  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgat 158  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  9483296 ttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45123165 - 45123002
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactct--tacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||    
T  45123165 gggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctt 45123066  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  45123065 actta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 45123002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 45121665 - 45121821
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |  | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45121665 ccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtg 45121764  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||| |||||||||    
T  45121765 atcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaa 45121821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9608894 - 9608738
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  ||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9608894 ccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 9608795  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  9608794 ttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34835356 - 34835205
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| ||||||||  |||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  34835356 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835257  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
     ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| || |||| |||||    
T  34835256 caacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacaca 34835205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794103
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  8794129 catataactcacacttgtacacaacaa 8794103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 1013880 - 1014029
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  1013880 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtg 1013979  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  1013980 ttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgca 1014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Original strand, 18372011 - 18372143
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  18372011 aggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 18372110  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataactt 174  Q
    ||||| ||||||  ||||||  | |||||||||    
T  18372111 ttactattttattggatgtggtacatataactt 18372143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30441234 - 30441081
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactta----taa 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||    |||    
T  30441234 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaa 30441135  T
Q  130 ggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  30441134 ggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgca 30441081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45122783 - 45122648
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| || |||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  45122783 gggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 45122684  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  45122683 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9309140 - 9308970
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacact---cttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatct 120  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||| |  |||    
T  9309140 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctct 9309042  T
Q  121 tacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg--agatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  9309041 tacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40518230 - 40518061
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    ||||    
T  40518230 gggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttac 40518131  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttac--tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | |||||||| |||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  40518130 ttataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttgaacacaacaa 40518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 1014254 - 1014403
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  1014254 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtg 1014353  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||  || |||||||| |||||||||    
T  1014354 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgca 1014403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 37544499 - 37544656
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||    
T  37544499 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtg 37544598  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||  ||||||||    
T  37544599 ttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttgtgcacaacaa 37544656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12284022 - 12283867
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||  | || |||||| |||| |    
T  12284022 cccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagat 12283924  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaac 189  Q
     || |||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12283923 attcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgcacacaac 12283867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 70324 - 70422
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  70324 cacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataact 70422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 9482613 - 9482768
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||||||||  |||||  || || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9482613 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 9482712  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||| |||||||||    
T  9482713 ttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataact--cacttgtacacaacaa 9482768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 33113407 - 33113533
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  33113407 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtagga 33113506  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| | ||||| |||||||||    
T  33113507 catataactcaaacttgtacacaacaa 33113533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34835622 - 34835504
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| ||||||||  |||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  34835622 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835523  T
Q  136 taacatttactcttttatc 154  Q
     ||| |||||| |||||||    
T  34835522 aaacctttactattttatc 34835504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34835888 - 34835770
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| ||||||||  |||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  34835888 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835789  T
Q  136 taacatttactcttttatc 154  Q
     ||| |||||| |||||||    
T  34835788 aaacctttactattttatc 34835770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 191
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274945
Alignment:
Q  70 gacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatat 169  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  | || ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  170 aacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||| ||||||  |||||||||    
T  43274924 aactcacacttatacacaacaa 43274945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 8918814 - 8918930
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataactt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| |||||| || || |||||     
T  8918814 cacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactc 8918913  T
Q  175 acacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||    
T  8918914 acacttgcacacaacaa 8918930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Original strand, 20870586 - 20870733
Alignment:
Q  38 atcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgttta 137  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |    
T  20870586 atcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttca 20870685  T
Q  138 acatttactcttttatccgatgtg--agatatataacttacacttgca 183  Q
    || |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  20870686 acctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgca 20870733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40518723 - 40518577
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||| |||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| |    
T  40518723 aggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacct 40518624  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||| || |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  40518623 ttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaa 40518577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41972279 - 41972151
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaa---aactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| |  | | |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  41972279 agagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtg 41972180  T
Q  162 agatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972179 ggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 147961 - 147821
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||          ||||| | |||| |||||    
T  147961 aggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgg---------gttatatgttgttcaacat 147871  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  147870 ttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 147821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5420800 - 5420643
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  5420800 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatg 5420701  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| |||||||    
T  5420700 ttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgcatacaacaa 5420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915864
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |    ||    
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----ct 5915930  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||| ||| |||||  |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5915929 tataaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 5915864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Original strand, 18371670 - 18371804
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| | |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||     ||    
T  18371670 ccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttcttactta----atg 18371764  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  18371765 ttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataact 18371804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 45121952 - 45122070
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||  |  |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||| || |    
T  45121952 agagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggaca 45122051  T
Q  167 tataacttacacttgcaca 185  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  45122052 tataactcacacttgcaca 45122070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9507931 - 9507769
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || |||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||||||     
T  9507931 ccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggta 9507832  T
Q  134 tttaacatttact---cttttatccgatgtg--agatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||   ||||||||| || ||   || |||||||| |||||||||||||||||    
T  9507831 ttcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgcacacaacaa 9507769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32305636 - 32305503
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||  ||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||| | |  ||||||    
T  32305636 gggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttac 32305537  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccga 157  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  32305536 ttataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 32640521 - 32640693
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||| |||||||| ||| | || |||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  32640521 ggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcg 32640620  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |  |||||| ||     |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||    
T  32640621 gtcctcttaccta-----tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacacttccacgcaacaa 32640693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 4154281 - 4154448
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||  | ||| |||    
T  4154281 ggggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgg-gtctctcact 4154379  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaatt 193  Q
    ||||| ||||| ||| |  ||| || |||| |||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4154380 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgcacacaacaatt 4154448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20130529 - 20130462
Alignment:
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatata 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20130529 atgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatata 20130462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Original strand, 20995417 - 20995497
Alignment:
Q  26 gggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatggg 106  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20995417 gggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9609203 - 9609108
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||| |||||    
T  9609203 agagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttacttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372416
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcaca 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactttcaca 18372416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Original strand, 40579548 - 40579662
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| | |    
T  40579548 agagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaaca 40579647  T
Q  167 tataacttacacttg 181  Q
    ||||| | |||||||    
T  40579648 tataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Original strand, 3037777 - 3037865
Alignment:
Q  94 ttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg--agatatataacttacactt 180  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  3037777 ttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6732044 - 6731904
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||             
T  6732044 ccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact--------- 6731954  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6731953 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 6731904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Original strand, 18380059 - 18380171
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||| |     ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  18380059 agaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggata 18380158  T
Q  167 tataacttacact 179  Q
    ||||||| |||||    
T  18380159 tataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416319
Alignment:
Q  105 ggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 41416319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 9620677 - 9620841
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| || |||||||   ||||  ||||| ||||| |||||||| |  ||| ||    
T  9620677 gggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcac 9620774  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| ||| | ||| | |||| || |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9620775 ttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 9620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Original strand, 18372792 - 18372859
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcaca 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  18372792 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactttcaca 18372859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Original strand, 25561737 - 25561792
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25561737 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41129148 - 41129066
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgg 105  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | || ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41129148 tgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatc---ttacttataag 130  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |  ||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  131 gtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacact 179  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Original strand, 4154669 - 4154831
Alignment:
Q  26 gggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactt 125  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |  | | ||||    
T  4154669 gggaccactcacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcactt 4154766  T
Q  126 ataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||| ||||| ||| |  ||| || |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  4154767 ataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 4154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 43274634 - 43274699
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaa 89  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43274634 gggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6651653 - 6651555
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  6651653 gggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta 6651555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 40579278 - 40579352
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtt 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  40579278 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 112
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2467647 - 2467571
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    ||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  2467647 acatctaggctaaagcaaccatacaagtgagagagacgtcacacttttaccaaaaactttaagacaacgagtttatg 2467571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524451
Alignment:
Q  45 ctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaa 97  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaa 16524451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 190
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645752
Alignment:
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 18645752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 190
Target Start/End: Original strand, 20995520 - 20995566
Alignment:
Q  144 actcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20995520 acttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 20995566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Original strand, 18373239 - 18373291
Alignment:
Q  94 ttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttact 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18373239 ttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttact 18373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 36608656 - 36608825
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||    
T  36608656 ttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctctt 36608755  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36608756 acttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgcacacaacaa 36608825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50002585 - 50002418
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  50002585 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttac 50002486  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  50002485 ttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaa 50002418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25483485 - 25483328
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  25483485 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatg 25483386  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25483385 ttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 25483328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 22183260 - 22183428
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  | |||    
T  22183260 tgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttta 22183359  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183360 cttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaa 22183428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52884854 - 52884688
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttaccc-aaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  52884854 ggggaccacgcacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttac 52884755  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  52884754 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955481
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgcacacaacaa 4955481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36629386 - 36629230
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36629386 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtg 36629287  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36629286 tttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 36629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 3244457 - 3244614
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |    
T  3244457 cccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagat 3244556  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3244557 gttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41370526 - 41370357
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41370526 ggggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgg 41370427  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
     |  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  41370426 gtcctcttacttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgca 41370357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Original strand, 55933119 - 55933280
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  55933119 ttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 55933218  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  55933219 acttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 55933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36572167 - 36572011
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  36572167 cacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgt 36572068  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36572067 tcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 36572011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 52885007 - 52884879
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttaccc-aaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtga 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||     
T  52885007 gagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 52884908  T
Q  163 gatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  52884907 gacatataactcacacttgcacacaacaa 52884879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 41707499 - 41707629
Alignment:
Q  61 agtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41707499 agtgagagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgt 41707597  T
Q  161 gagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    | || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41707598 gggacatataactcacacttgtacacaacaat 41707629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3340956 - 3340802
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  3340956 ccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 3340857  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
     | ||| |||||||||| ||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  3340856 ctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgcacacaa 3340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 34646687 - 34646813
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34646687 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtggga 34646786  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  34646787 catataactcacacttgtacacaacaa 34646813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10246068 - 10245912
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10246068 ccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtg 10245970  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10245969 ttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaa 10245912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20825985 - 20825829
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  20825985 ccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtg 20825886  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20825885 ttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacatttgtacacaaca 20825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 22028356 - 22028535
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22028356 ggggagctttgggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgg 22028455  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacattta--ctcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |  ||||||| |||||||||| ||| ||||   | |||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||    
T  22028456 gtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgcacacaacaa 22028535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 39792867 - 39793023
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  |||| |||||||||||    
T  39792867 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtg 39792966  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || |||||||||| || |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39792967 ttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 39793023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 50630755 - 50630911
Alignment:
Q  27 ggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactta 126  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  50630755 ggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 50630854  T
Q  127 taaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||||    
T  50630855 taatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgca 50630911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 186
Target Start/End: Original strand, 54017602 - 54017754
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  54017602 ccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatg 54017701  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacac 186  Q
    || ||| |||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  54017702 ttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgcacac 54017754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108908
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtggg--acataactgacacttgcacacaaca 54108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 54936344 - 54936213
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  54936344 ccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtg 54936246  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  54936245 ttcaacctttactattttatctgatgtgggata 54936213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 22027968 - 22028125
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| || ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22027968 ccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtg 22028067  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||  | |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  22028068 ttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaa 22028125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39404546 - 39404390
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  39404546 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 39404447  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |  || |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39404446 tccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 39404390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 1731662 - 1731811
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||| ||| |    
T  1731662 aggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaacct 1731761  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  1731762 ttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgcacacaacaa 1731811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620375
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtg 44620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 51768048 - 51768224
Alignment:
Q  15 gggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgga 114  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||      
T  51768048 gggaagtttgggagaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgag 51768147  T
Q  115 ttatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  51768148 tcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgcacacaacaa 51768224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Original strand, 54741213 - 54741341
Alignment:
Q  62 gtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  54741213 gtgagagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtg 54741312  T
Q  162 agatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  54741313 agacatataattcacacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2740857 - 2740693
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||| | |  ||||||    
T  2740857 gggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttac 2740760  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  2740759 ttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3341259 - 3341120
Alignment:
Q  52 aaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactctttt 151  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||   |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3341259 aaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactctttt 3341160  T
Q  152 atccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3341159 atccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 3341120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 16888854 - 16888981
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  16888854 agagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtggga 16888953  T
Q  165 tatataacttacacttg-cacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16888954 catataactcacacttgccacacaacaa 16888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 16889574 - 16889701
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| |||||| || |||||||| |||||    
T  16889574 agagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgaga 16889673  T
Q  165 tatataacttacacttg-cacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16889674 catataactcacacttgccacacaacaa 16889701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20826366 - 20826227
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  20826366 ccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtg 20826267  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  20826266 ttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataact 20826227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 4390139 - 4390265
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| | | | ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  4390139 agagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtggga 4390238  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4390239 tatgtaactcacacttgcacacaacaa 4390265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49880278 - 49880160
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||| ||    
T  49880278 agagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtggga 49880179  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| |||||||||    
T  49880178 catataactcacacttgca 49880160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50459890 - 50459724
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  50459890 ggggagctttgagggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatga 50459791  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacactt 180  Q
     |  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||    
T  50459790 gtcctcttacttataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621024
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||  |||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     |||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtg 44621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45496923 - 45496827
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  45496923 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccgatgtg 45496827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 49076448 - 49076612
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| | ||| | |||||| |||| ||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  49076448 gggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttac 49076544  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  49076545 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaacaa 49076612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017868
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt--gagatatataac 172  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatatataac 54017849  T
Q  173 ttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  54017850 tcacatttgcacacaacaa 54017868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28034388 - 28034222
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||| || ||| ||    
T  28034388 gggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcac 28034289  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| ||||| ||| |  ||| || ||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  28034288 ttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49303055 - 49302902
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac--ttataagg 131  Q
    ||||||| ||| |||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||     
T  49303055 ccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataaga 49302956  T
Q  132 tgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcaca 185  Q
    |||| ||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  49302955 tgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacacttacaca 49302902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 18932757 - 18932882
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |    
T  18932757 cacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtat 18932856  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||    
T  18932857 tcaacctttactattttatccgatgt 18932882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3700428 - 3700356
Alignment:
Q  120 ttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3700428 ttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaat 3700356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 32941130 - 32941286
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     ||||| ||||||||||    
T  32941130 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtg 32941229  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  32941230 ttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgcagacaaca 32941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39404177 - 39404013
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||  |  ||||||    
T  39404177 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttac 39404078  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  39404077 ttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgtacacaa 39404013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44620820 - 44620654
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || | ||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| |  ||||    
T  44620820 ttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttatgggtcctctt 44620722  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaac 189  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  44620721 acttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaac 44620654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 49076838 - 49076992
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  49076838 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtg 49076936  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaac 189  Q
    || ||| |||||| ||||| || || ||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  49076937 ttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgcacacaac 49076992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 43174656 - 43174498
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  43174656 ccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtg 43174557  T
Q  134 tttaacatttactc-ttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  43174556 ttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaa 43174498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741064
Alignment:
Q  74 ccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  174 tacacttgcacacaaca 190  Q
     ||||||||||| ||||    
T  2741080 cacacttgcacataaca 2741064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 23817655 - 23817783
Alignment:
Q  2 gttggatca-cggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagac 100  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23817655 gttggatcatcgaggggagctatgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 23817754  T
Q  101 aatgggtttatggattatcttacttataa 129  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  23817755 aatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 45489372 - 45489495
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| | |||||| |  || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  45489372 agagacatcacactcttaccaaaaatcttaa-acagtaggtttaagagttctcttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaca 45489470  T
Q  167 tataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||    
T  45489471 tataattcacacttgtacacaacaa 45489495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 54343005 - 54343147
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||       || |  ||||||    
T  54343005 gggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttac 54343097  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  54343098 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 6975494 - 6975612
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||| | || ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  6975494 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgaga 6975593  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| ||| |||||    
T  6975594 catataactcacatttgca 6975612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841453
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatg 15841453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3271905 - 3271803
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactt---ataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||   |||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  3271905 gagagagacac-acactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgt 3271807  T
Q  161 gaga 164  Q
    ||||    
T  3271806 gaga 3271803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10246428 - 10246340
Alignment:
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  10246428 atgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaaca 10246340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43174300 - 43174233
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 91  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43174300 gggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44621491 - 44621420
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaac 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  44621491 tcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaac 44621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 23556886 - 23557024
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttact 146  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||  |||| ||| |  |||    
T  23556886 agagcaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccact 23556985  T
Q  147 cttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcaca 185  Q
     || |||||||||| | | || ||||| |||||||||||    
T  23556986 tttctatccgatgtaaaacatttaactcacacttgcaca 23557024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Original strand, 34004593 - 34004744
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||||| | ||||| |||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  34004593 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgt 34004691  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    | ||| |||| | |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  34004692 tcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 34004744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54108717 - 54108564
Alignment:
Q  2 gttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaca 101  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  54108717 gttgggtcactgggggagctatgggggaccgcc-acattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggca 54108619  T
Q  102 atg-ggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatcc 155  Q
    |||   ||||||| |  | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  54108618 atgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc 54108564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11197345 - 11197296
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  11197345 gagagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgg 11197296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31691271 - 31691203
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  31691271 gagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45050643 - 45050592
Alignment:
Q  141 tttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45050643 tttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaat 45050592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868121
Alignment:
Q  76 acactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgg 1868121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 11783550 - 11783639
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   | ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  11783550 gggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaataggtgtatgg 11783639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 15841018 - 15841086
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataa 129  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  15841018 aagtgagagagacaatacactcttacccaaaacttaaag-caatgggtttatagatcctctcacttataa 15841086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34544230 - 34544094
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttaccc-aaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgat 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||| | |||||| ||| | ||| |  ||| || ||| ||||    
T  34544230 aagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgat 34544131  T
Q  159 gtgag--atatataacttacacttgcacacaacaatt 193  Q
    |||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  34544130 gtgagatatatataactcacacttactcacaacaatt 34544094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44620361 - 44620288
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| | | ||| |||||||||    
T  44620361 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaa 44620288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 922536 - 922488
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  922536 agagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgg 922488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18879914 - 18879854
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  18879914 cacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttacttataaggtgtt 18879854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504766
Alignment:
Q  37 catcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgg 19504766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788139
Alignment:
Q  131 gtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 50788139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 129
Target Start/End: Original strand, 2891857 - 2891924
Alignment:
Q  62 gtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataa 129  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  2891857 gtgagaaagacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 191
Target Start/End: Original strand, 6876218 - 6876261
Alignment:
Q  148 ttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6876218 ttttatccgatgtaagatatataaatcacacttgcacacaacaa 6876261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43827598 - 43827492
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||  ||||||| |  |||||     
T  43827598 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttat 43827500  T
Q  124 ttataagg 131  Q
    ||||||||    
T  43827499 ttataagg 43827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10396250 - 10396201
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  10396250 gagagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgg 10396201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10396535 - 10396486
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10396535 gagagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgg 10396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 50788013 - 50788077
Alignment:
Q  46 tagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttta 110  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||    
T  50788013 tagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatggattta 50788077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34364656 - 34364499
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  34364656 ccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtg 34364557  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34364556 ttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 34364499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759483
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 41759483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17294727 - 17294569
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccc-cataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||    
T  17294727 ccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagt 17294628  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  17294627 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 17294569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 39066179 - 39066366
Alignment:
Q  2 gttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaca 101  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39066179 gttggatcactgggggag-tttgggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagaca 39066276  T
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||  ||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39066277 atgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaacaa 39066366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34365074 - 34364917
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34365074 ccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 34364975  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  34364974 ttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaa 34364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 37850600 - 37850766
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| | ||||||||| || |||||||    
T  37850600 ggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttact 37850699  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  37850700 tataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 37850766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157366
Alignment:
Q  26 gggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactt 125  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  126 ataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaat 41157366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41157152 - 41156983
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||    
T  41157152 ttgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctctt 41157053  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||| | |||||||||||||||||    
T  41157052 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgcacacaacaa 41156983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 190
Target Start/End: Original strand, 22077521 - 22077660
Alignment:
Q  51 caaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  22077521 caaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttc 22077620  T
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22077621 tatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 26661521 - 26661688
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||| ||    
T  26661521 gggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcac 26661620  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  26661621 ttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 26661688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Original strand, 44290823 - 44290983
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactctt-acccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||    
T  44290823 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 44290922  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  44290923 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 26661938 - 26662064
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  26661938 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatggga 26662037  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26662038 tatataactcacacttgtacacaacaa 26662064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3550838 - 3550721
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  3550838 agagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 3550739  T
Q  165 tatataacttacacttgc 182  Q
     |||||||| ||||||||    
T  3550738 catataactcacacttgc 3550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 3875340 - 3875497
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  3875340 ccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 3875439  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  3875440 tacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacacaacaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 48588477 - 48588646
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||    
T  48588477 ggggaactttgggcgaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgg 48588576  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
     |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  48588577 gtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgca 48588646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41142532 - 41142364
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactctt-acccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  | |||    
T  41142532 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttta 41142433  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  41142432 cttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacagaacaa 41142364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 45493972 - 45494137
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  45493972 tgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatctta 45494071  T
Q  123 cttataa----ggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatat-aacttacacttgca 183  Q
    ||||||     |||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  45494072 cttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgca 45494137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630803
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
      ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgcacataaca 30630803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Original strand, 32594751 - 32594874
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  32594751 aagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatg 32594850  T
Q  160 tgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |  || |||||||| |||||||||    
T  32594851 taggacatataactcacacttgca 32594874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Original strand, 44290457 - 44290616
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  44290457 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 44290556  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  44290557 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Original strand, 50052063 - 50052178
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  50052063 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtggga 50052162  T
Q  165 tatataacttacactt 180  Q
     |||||||| ||||||    
T  50052163 catataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 3537599 - 3537752
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||    
T  3537599 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttact 3537698  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacac 178  Q
     |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  3537699 cataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 24600323 - 24600479
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  ||    
T  24600323 ccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatg 24600422  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24600423 ttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556103
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgg-tcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  134 tttaacatttact-cttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 37556103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 192
Target Start/End: Original strand, 38804372 - 38804522
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |    
T  38804372 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacct 38804471  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38804472 ttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaat 38804522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 5319982 - 5320131
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| ||| |    
T  5319982 aggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaactt 5320081  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5320082 ttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgcatacaacaa 5320131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40082555 - 40082399
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||| | || |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40082555 ccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatg-atcctcttacttataaggtg 40082457  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  40082456 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcgcacaacaa 40082399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 146
Target Start/End: Original strand, 44043812 - 44043893
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44043812 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11977448 - 11977276
Alignment:
Q  15 gggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgga 114  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||   |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||      
T  11977448 gggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgag 11977349  T
Q  115 ttatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  11977348 tgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacaca 11977276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34649597 - 34649430
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||  ||  |||||||| || |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |   ||    
T  34649597 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcac 34649498  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||    
T  34649497 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtatacaacaa 34649430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29798317 - 29798191
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||  ||    
T  29798317 agagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtagga 29798218  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  29798217 catataactcacacttgcatacaacaa 29798191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184591
Alignment:
Q  89 aaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T
Q  189 caa 191  Q
    |||    
T  41184589 caa 41184591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 66489 - 66638
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  66489 aggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 66588  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| || |||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  66589 ttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14319026 - 14318893
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |  ||||||    
T  14319026 gggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttac 14318927  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccga 157  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14318926 ttataaggtgttcaacctttactattttatccga 14318893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Original strand, 31767158 - 31767327
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt 121  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || |||  ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| |  ||||    
T  31767158 ttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctctt 31767257  T
Q  122 acttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||||    
T  31767258 acttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgcacacaacaa 31767327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9956067 - 9955899
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttt-atggattatcttac 123  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |  ||||||    
T  9956067 ggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttac 9955968  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttac-tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||    
T  9955967 ttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacactaacacacaacaa 9955899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 5528763 - 5528908
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||   |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||  |  ||||| ||||||| ||    
T  5528763 ccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatg 5528862  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacact 179  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5528863 ttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataacttccact 5528908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45084536 - 45084378
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  || |||| ||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||       |||||| |  |||||    
T  45084536 tgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctctta 45084443  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  45084442 cttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgcacaca 45084378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 19283455 - 19283620
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||  |  ||| | |    
T  19283455 ggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatt 19283554  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || || ||| | ||| |  ||| || |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19283555 tacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 19283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Original strand, 22077108 - 22077243
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| |  |||||    
T  22077108 tgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctctta 22077207  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgat 158  Q
    |||||||||| || ||| |||||| || ||||||||    
T  22077208 cttataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 24131999 - 24132150
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  24131999 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaacctt-aaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgtt 24132095  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
     ||| |||||| || ||||||||| | || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24132096 caacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaaca 24132150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 190
Target Start/End: Original strand, 66136 - 66254
Alignment:
Q  74 ccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt-taacatttactcttttatccgatgtgagatat-ataa 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||| || || |    
T  66136 ccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgatta 66235  T
Q  172 cttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||||||||||||||||    
T  66236 ctcacacttgcacacaaca 66254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5575251 - 5575097
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  | |||| ||||| | |  ||||||||||||||||    
T  5575251 ccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtg 5575154  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||  | ||| |||||||||||||    
T  5575153 ttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataa--ttcacatgcacacaacaat 5575097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537305
Alignment:
Q  104 gggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3537305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 47380167 - 47380254
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47380167 ggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 188
Target Start/End: Original strand, 22077838 - 22077991
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| | ||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || | ||| |||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  22077838 ccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctt-aggctatgagtttatgggtcctcttacttataagatg 22077936  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    || ||| |||| | || |||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||    
T  22077937 ttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 1188588 - 1188753
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |  ||| |||    
T  1188588 ggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcact 1188687  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||  | || ||| |  ||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  1188688 tataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555722
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||| || |  |||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| || ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacacttttacacaacaa 37555722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22793420 - 22793268
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaa-tgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaaca 140  Q
    |||| ||| ||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||| || || |||     
T  22793420 aggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacc 22793321  T
Q  141 tttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaatt 193  Q
    | |||| || ||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22793320 tctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgctcacaacaatt 22793268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 32168707 - 32168786
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32168707 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgg 32168786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 21378118 - 21378207
Alignment:
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||| |||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  21378118 atgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaa 21378207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 50051728 - 50051776
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  50051728 agagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 5996880 - 5996961
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggat 115  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  5996880 cccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggat 5996961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 110
Target Start/End: Original strand, 9956208 - 9956258
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttta 110  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9956208 aagtaagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Original strand, 35154155 - 35154205
Alignment:
Q  141 tttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  35154155 tttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 35154205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44685585 - 44685449
Alignment:
Q  54 ccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaa-catttactctttta 152  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||| || || | |||||| || ||    
T  44685585 ccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttcta 44685487  T
Q  153 tccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  44685486 tccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Original strand, 1187399 - 1187527
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| |||||  |||||  |||| |||||||| |  ||| ||||||||  |||||||| |  ||| || ||| |||||    
T  1187399 aagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatg 1187498  T
Q  160 tgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1187499 tgagacatataattcacacttgcacacaa 1187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839679
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |   ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  135 t 135  Q
    |    
T  45839679 t 45839679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10351283 - 10351208
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||| |||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  10351283 aagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgtt 10351208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11977062 - 11977015
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  11977062 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24448427 - 24448348
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  24448427 cccacatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatg 24448348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30697340 - 30697310
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaa 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30697340 aagtgagagagacaccacactcttacccaaa 30697310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Original strand, 47379801 - 47379851
Alignment:
Q  48 gagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 98  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  47379801 gagcaatcacataagtgagagagacgccacactcttatccaaaattttaag 47379851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4956299 - 4956218
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccg 156  Q
    |||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||    
T  4956299 cacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16107837 - 16107670
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||    
T  16107837 ggggtaccacccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttac 16107738  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  16107737 ttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttgtacacaacaa 16107670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 10073991 - 10074156
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  |||| || |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  10073991 ggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 10074090  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  10074091 tataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29518662 - 29518503
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  29518662 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 29518563  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  29518562 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29519079 - 29518920
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  29519079 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 29518980  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  29518979 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32741338 - 32741179
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  32741338 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 32741239  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32741238 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127360
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgca 1127360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580038
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |  |||||||    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttact 2579971  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  2579972 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 2580038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35210362 - 35210204
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  |||||||    
T  35210362 ggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttact 35210263  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35210262 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 35210204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3058395 - 3058226
Alignment:
Q  14 ggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||| ||| |||| | |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3058395 ggggagctttgggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 3058296  T
Q  114 attatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3058295 atcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgca 3058226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 10074372 - 10074528
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10074372 ccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtg 10074471  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  10074472 ttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 10073625 - 10073779
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10073625 ccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtg 10073724  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| ||||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  10073725 ttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409259
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3409259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2377913 - 2377746
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  2377913 gggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 2377814  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  2377813 ttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaa 2377746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 2578442 - 2578608
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||    
T  2578442 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 2578541  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  2578542 ttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 2578608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1846907 - 1846748
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||    
T  1846907 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttac 1846808  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  1846807 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgca 1846748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2378285 - 2378126
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  2378285 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 2378186  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2378185 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2378126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16454734 - 16454567
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  16454734 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 16454635  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || | |||||| ||||||| |||||||||    
T  16454634 ttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttgtacacaacaa 16454567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16455066 - 16454899
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  | ||||    
T  16455066 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattac 16454967  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || | |||||| ||| ||| |||||||||    
T  16454966 ttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaa 16454899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3409819 - 3409660
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  3409819 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 3409720  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||    
T  3409719 ttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgca 3409660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3415621 - 3415462
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagag--caaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatc 119  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||    
T  3415621 ttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 3415522  T
Q  120 ttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacact 179  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  3415521 ttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Original strand, 5832038 - 5832192
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5832038 acatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttacttataaggtgtt 5832136  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5832137 caacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtgcacaacaa 5832192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 5958643 - 5958769
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |    
T  5958643 agagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaaca 5958742  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  5958743 catataactcacaattgcacaccacaa 5958769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 12092482 - 12092647
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| |||    
T  12092482 ggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcact 12092581  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||||| ||| | ||| |  ||| || ||||||||||| || || ||||  || |||||||||||||    
T  12092582 tataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgcacacaaca 12092647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Original strand, 593748 - 593868
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  593748 gagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 593847  T
Q  164 atatataacttacacttgcac 184  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  593848 acatacaactcacacttgcac 593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2843714 - 2843546
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttat-ggattatctta 122  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |  |||||    
T  2843714 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctctta 2843615  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  ||||||||    
T  2843614 cttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgtgcacaacaa 2843546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Original strand, 2578877 - 2578999
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | || |    
T  2578877 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggaca 2578975  T
Q  167 tataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||||| | |||||||| |||||||    
T  2578976 tataaatcacacttgctcacaaca 2578999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 180
Target Start/End: Original strand, 1950202 - 1950340
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || | | ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| |    
T  1950202 aggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacct 1950301  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacactt 180  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  1950302 ttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 6999805 - 6999951
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6999805 ccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtg 6999904  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacactt 180  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  6999905 ttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Original strand, 14748386 - 14748496
Alignment:
Q  73 accacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataac 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  14748386 accacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 14748485  T
Q  173 ttacacttgca 183  Q
    | |||||||||    
T  14748486 tcacacttgca 14748496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26544167 - 26544049
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  26544167 agagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 26544068  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| |||||||||    
T  26544067 catataactcacacttgca 26544049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16108152 - 16108055
Alignment:
Q  94 ttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  16108152 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaa 16108055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 178
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataactt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||     
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  175 acac 178  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6071268 - 6071123
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttact 146  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |  |||    
T  6071268 agagcaaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccact 6071169  T
Q  147 cttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
     || ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6071168 tttctattcaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaat 6071123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Original strand, 9062385 - 9062497
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  9062385 aagtaagagagataccacacttttacccaaaactt-aagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatg 9062483  T
Q  160 tgagatatataact 173  Q
    || || ||||||||    
T  9062484 tgggacatataact 9062497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10911715 - 10911558
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  10911715 ccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtg 10911616  T
Q  134 tttaacatttac-tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| ||||| | ||||||| |||||  || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  10911615 ttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaaca 10911558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Original strand, 2579119 - 2579271
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||    |||||||||||| |  |||||    ||||||||    
T  2579119 cacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcctctta----taaggtgt 2579214  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  2579215 tcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaa 2579271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975544
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||| || |    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  167 t-ataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    | || ||||||||||  ||||||||    
T  2975568 taattacttacacttaaacacaaca 2975544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 17135067 - 17135223
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||||||||  || ||||| || ||| || |||| |  |||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||| ||  ||||     
T  17135067 tgggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttg 17135166  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacact 179  Q
    |||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17135167 cttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8482044 - 8481918
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||| | |||||| ||||| ||| |  ||| || |||| |||||| ||    
T  8482044 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg-ga 8481946  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8481945 catataactcacacttgcacacaacaat 8481918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Original strand, 2579501 - 2579645
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||     
T  2579501 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggta 2579600  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacac 178  Q
    |   || |||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  2579601 tccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 12071701 - 12071764
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 98  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12071701 cacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 12071764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085121
Alignment:
Q  37 catcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  12085046 catcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatg 12085121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 30618618 - 30618725
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  30618618 ggggaccacccacatta-ggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaa-cggtttatgg-tcatcttact 30618714  T
Q  125 tataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||    
T  30618715 tataaagtgtt 30618725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 113
Target Start/End: Original strand, 11637761 - 11637809
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11637761 agagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgg 11637809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 91
Target Start/End: Original strand, 10902465 - 10902496
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10902465 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 113
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605343
Alignment:
Q  71 acaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 22605343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33605772 - 33605731
Alignment:
Q  57 cataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33605772 cataagcgagagagataccacacacttacccaaaactttaag 33605731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26074762 - 26074607
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26074762 cccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 26074663  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||| ||||||    
T  26074662 gttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgtacacaa 26074607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 26074154 - 26074311
Alignment:
Q  33 cccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||| ||||    
T  26074154 cccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggt 26074253  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  26074254 gttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 40296313 - 40296477
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |  |||||    
T  40296313 tgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctctta 40296412  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40296413 cttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 40296477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 624345 - 624196
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  624345 ccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtg 624246  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| |||||| | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  624245 ttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgca 624196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41632942 - 41632770
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| || ||| | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| |  |||||    
T  41632942 tgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctctta 41632843  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaattat 195  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41632842 cttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgcacacaacacttat 41632770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 12662651 - 12662818
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  12662651 gggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttac 12662750  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  12662751 ttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 12662818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35150128 - 35150002
Alignment:
Q  61 agtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  35150128 agtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgt 35150030  T
Q  161 gagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||    
T  35150029 gggacatataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6500610 - 6500451
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |  |||||    
T  6500610 tgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctctta 6500511  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6500510 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15370258 - 15370091
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||| |  ||||||    
T  15370258 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttac 15370159  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15370158 ttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 15370091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32487563 - 32487394
Alignment:
Q  13 gggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32487563 gggggaagcttgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 32487464  T
Q  113 gattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    | |  |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32487463 ggtcctcttacttat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32487394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33747920 - 33747783
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||     
T  33747920 ccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagta 33747821  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataa 171  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  33747820 tttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 34753034 - 34753191
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34753034 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtg 34753133  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34753134 ttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaa 34753191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 36492226 - 36492383
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||| |||||| | |  ||||||||||||||||    
T  36492226 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtg 36492325  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  36492326 ttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaa 36492383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 11416976 - 11417141
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||| ||| |||| |||  ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  11416976 gggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttac 11417075  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  11417076 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataact--cacttgcacacaacaa 11417141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Original strand, 13415777 - 13415925
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |    
T  13415777 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 13415876  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  13415877 ttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 13415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 26075201 - 26075328
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactctt-acccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26075201 agagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgag 26075300  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||| | ||||||| |||||||||    
T  26075301 acatataaatcacacttgtacacaacaa 26075328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 36568568 - 36568732
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||| ||    
T  36568568 gggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcac 36568665  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  36568666 ttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 623959 - 623818
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||  |||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||| |    
T  623959 aggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacct 623860  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  623859 ttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgca 623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 299605 - 299481
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |    
T  299605 agagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggaca 299506  T
Q  167 tataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  299505 tataactcacacttgcgcacaacaa 299481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6500982 - 6500823
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |  | |||    
T  6500982 tgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctttta 6500883  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6500882 tttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 18603129 - 18603276
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| | ||| || |||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18603129 ccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 18603228  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttg 181  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  18603229 ttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Original strand, 27502035 - 27502194
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |  ||||||    
T  27502035 gggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttac 27502134  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  27502135 ttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 27502194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 1028516 - 1028682
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||| |  ||||||    
T  1028516 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttac 1028615  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| ||||| | | |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  1028616 ttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 1028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 3295055 - 3295176
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  3295055 agagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 3295154  T
Q  165 tatataacttacacttgcacaca 187  Q
     |||| ||| |||||||||||||    
T  3295155 catat-actcacacttgcacaca 3295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 9498694 - 9498812
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||    
T  9498694 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgaga 9498793  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| ||| |||||    
T  9498794 catataactcacatttgca 9498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25328053 - 25327927
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  25328053 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtagga 25327954  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||  |||||||||    
T  25327953 catataactcacacttagacacaacaa 25327927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 35167847 - 35168004
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| | |||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  35167847 ccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggtg 35167946  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  35167947 ttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttgtacacaacaa 35168004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 3295344 - 3295509
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||||    
T  3295344 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttac 3295442  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  3295443 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacacttccacacaacaa 3295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6224307 - 6224188
Alignment:
Q  72 caccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataa 171  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  6224307 caccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataa 6224208  T
Q  172 cttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  6224207 ctcacacttgtacacaacaa 6224188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 26074821 - 26074948
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactctt-acccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |  || ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26074821 agagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 26074920  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  26074921 acatataactcacacttgtacacaacaa 26074948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41170775 - 41170644
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |    
T  41170775 aggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacct 41170676  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41170675 ttactattttatccgatgtgggacatataact 41170644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Original strand, 24489207 - 24489369
Alignment:
Q  26 gggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactt 125  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||| | |||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||     
T  24489207 gggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttacta 24489304  T
Q  126 ataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  24489305 ataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 24489369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635357
Alignment:
Q  46 tagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttac 145  Q
    ||||||||||  | |||| | ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  146 tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||| | ||||  |||||||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatacttatacacaacaa 41635357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15370551 - 15370428
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15370551 ccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 15370452  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccga 157  Q
    || |||||||||| ||| ||||||    
T  15370451 ttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 42405638 - 42405762
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  |  | |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || |    
T  42405638 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggaca 42405737  T
Q  167 tataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42405738 tataactcacacttgtacacaacaa 42405762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 36522237 - 36522402
Alignment:
Q  25 ggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttact 124  Q
    ||||||| |||||||  |||| | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  ||| |||    
T  36522237 ggggaccacccacattcaggccaaagcagccgcacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcact 36522336  T
Q  125 tataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||  |||| ||| |  | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  36522337 tataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagacatataactcacactttcatacaaca 36522402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 26590919 - 26591031
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  26590919 ccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtg 26591018  T
Q  134 tttaacatttact 146  Q
    || ||| ||||||    
T  26591019 ttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38427696 - 38427553
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| |  || |||||||||| ||    
T  38427696 ccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagatg 38427598  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacac 178  Q
    || ||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  38427597 ttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 26900014 - 26900089
Alignment:
Q  22 ttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaa 97  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26900014 ttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508604
Alignment:
Q  88 aaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgtacaca 42508608  T
Q  188 acaa 191  Q
    ||||    
T  42508607 acaa 42508604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 5723831 - 5723949
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||   || |||| || |||||| ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  5723831 agagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttattattttatccgatgtggga 5723930  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| |||||||||    
T  5723931 catataactcacacttgca 5723949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 29549281 - 29549413
Alignment:
Q  51 caaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttt 150  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| | | |||||| |||    
T  29549281 caaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattt 29549380  T
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||| ||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  29549381 tatctgatatggaacatataactcacacttgca 29549413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35914967 - 35914841
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| | |||| | |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  35914967 agagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtga 35914868  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| | ||||  |||||||||    
T  35914867 catataactcatacttatacacaacaa 35914841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13042658 - 13042609
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13042658 gagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 13042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13112656 - 13112607
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13112656 gagaaagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgg 13112607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 162
Target Start/End: Original strand, 13786037 - 13786137
Alignment:
Q  61 agtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgt 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| || | ||||||||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||||||    
T  13786037 agtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgt 13786135  T
Q  161 ga 162  Q
    ||    
T  13786136 ga 13786137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39309749 - 39309677
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||    
T  39309749 tcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaaca 39309677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35150790 - 35150739
Alignment:
Q  140 atttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  35150790 atttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 35150739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35151081 - 35151030
Alignment:
Q  140 atttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  35151081 atttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 35151030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 301032 - 300954
Alignment:
Q  110 atggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||  ||||||| ||||||    
T  301032 atggattctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttgtacacaa 300954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7768913 - 7768852
Alignment:
Q  120 ttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttg 181  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  7768913 ttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttg 7768852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31509655 - 31509614
Alignment:
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31509655 tatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaat 31509614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 115
Target Start/End: Original strand, 36527130 - 36527185
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggat 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  36527130 aagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggat 36527185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225054
Alignment:
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataact 173  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataact 6225054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32446021 - 32445955
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  32446021 agagcaacctaacaagtgagagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgg 32445955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 190
Target Start/End: Original strand, 36521919 - 36522061
Alignment:
Q  48 gagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactc 147  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||| | ||| |  ||||| ||| |  |||     
T  36521919 gagcaaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaactt 36522018  T
Q  148 ttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || |||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  36522019 ttctatctgatgtgggacatataactcacacttgcgcacaaca 36522061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13042373 - 13042328
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttt 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13042373 gagagagacatcacactcttaccaaaaactctaagacgatgggttt 13042328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13112367 - 13112322
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttt 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13112367 gagagagacatcacactcttaccaaaaactctaagacgatgggttt 13112322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13042828 - 13042784
Alignment:
Q  59 taagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaat 103  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13042828 taagagagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33731795 - 33731653
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  33731795 acatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgct 33731696  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacac 178  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33731695 caacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6713158 - 6712968
Alignment:
Q  2 gttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaagac 100  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |    
T  6713158 gttggatcagtgagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagc 6713059  T
Q  101 aatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  6713058 aataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaa 6712968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15880412 - 15880255
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15880412 ccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 15880313  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15880312 ttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaa 15880255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Original strand, 36178622 - 36178763
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |    
T  36178622 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 36178721  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  36178722 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 15511504 - 15511659
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  15511504 ccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtg 15511603  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  15511604 ttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataact--cacttgcacacaacaa 15511659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 962747 - 962591
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  962747 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtg 962648  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  962647 ttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcatacaaca 962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 28531323 - 28531479
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  28531323 ccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtg 28531422  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| ||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  28531423 ttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 35580723 - 35580886
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||    
T  35580723 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-tcctctcac 35580821  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  35580822 ttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35580886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6421544 - 6421377
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||  |  ||||||    
T  6421544 gggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttac 6421445  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  6421444 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaa 6421377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42514808 - 42514642
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |  ||||||    
T  42514808 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttac 42514709  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||  || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  42514708 ttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaaca 42514642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37106337 - 37106188
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||| | || |||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  37106337 ccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 37106238  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37106237 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 37106188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 40679638 - 40679794
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40679638 ccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtg 40679737  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || |||  ||||| || |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  40679738 ttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 41283473 - 41283633
Alignment:
Q  23 tgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctta 122  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    
T  41283473 tgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta 41283572  T
Q  123 cttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  41283573 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgca 41283633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 14745707 - 14745825
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||    
T  14745707 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtggga 14745806  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| |||||||||    
T  14745807 catataactcacacttgca 14745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 5543007 - 5543156
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5543007 ccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtg 5543106  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  5543107 ttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 5543156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 36005889 - 36006045
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36005889 ccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtg 36005988  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36005989 ttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 36006045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254403
Alignment:
Q  44 gctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacattt 143  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  144 actcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacactggcacacaacaa 28254403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40733636 - 40733512
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    
T  40733636 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtggg 40733537  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||    
T  40733536 acatataactcacacttgtacacaa 40733512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37106083 - 37105924
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |   |||||    
T  37106083 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttac 37105984  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37105983 ttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 37105924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 5542603 - 5542783
Alignment:
Q  2 gttggatcacggggggaactttgggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaca 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||| || || || ||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  5542603 gttggatcatggggggagctc-gggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 5542701  T
Q  102 atgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    || ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| || || |||||||| |||||||||    
T  5542702 ataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgca 5542783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769889
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||  | ||| |||||||  |  |||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacac 186  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacac 1769889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259785
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatcc---gatgtgag 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31259758 acatataactcgcacttacacacaacaa 31259785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 36178182 - 36178307
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36178182 acatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgtt 36178281  T
Q  136 taacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  36178282 caacctttactattttatccgatgtg 36178307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23346385 - 23346228
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  23346385 ccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtg 23346287  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgag--atatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||| |||||| || ||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23346286 tttaacctttacttttctatacgatgtgagacatatataactcacactcgcacacaaca 23346228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 33561486 - 33561616
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||| |  ||| || |||| ||||    
T  33561486 aagtgagagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatg 33561585  T
Q  160 tgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  33561586 tggaacatataactcacacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5367573 - 5367448
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||    
T  5367573 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttgctcttttatccgatctggga 5367474  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
     |||||  | ||||||| ||||||||    
T  5367473 catatatatcacacttgtacacaaca 5367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Original strand, 38796311 - 38796384
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  38796311 tcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 38796384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Original strand, 38796673 - 38796786
Alignment:
Q  78 actcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  38796673 actcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcaca 38796772  T
Q  178 cttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||||    
T  38796773 cttgcacacaacaa 38796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6422259 - 6422132
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||| |||    
T  6422259 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtg 6422160  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    || ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  6422159 ttcaacctttacttttttatctgatgtg 6422132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178427
Alignment:
Q  76 acactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataactta 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||| || |||||||| |    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  176 cacttgca 183  Q
    ||||||||    
T  36178420 cacttgca 36178427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29677057 - 29676895
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatctt-----acttata 128  Q
    ||||||| ||| | || |||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||| |  |||      || ||||    
T  29677057 ccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctata 29676958  T
Q  129 aggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  29676957 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaa 29676895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30313318 - 30313169
Alignment:
Q  42 aggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacat 141  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |  ||| |||||||| ||||| ||| |    
T  30313318 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacct 30313220  T
Q  142 ttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
      ||| || |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  30313219 ccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgcacacaacaat 30313169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Original strand, 37632637 - 37632762
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  37632637 agagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtagga 37632736  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  37632737 catataactcacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Original strand, 40163383 - 40163520
Alignment:
Q  36 acatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaa-gacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  40163383 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgt 40163482  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataac 172  Q
    | ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  40163483 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9231398 - 9231242
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||  ||||| ||||||  ||    
T  9231398 ccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatg 9231299  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    || ||| |||||| || |||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  9231298 ttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatacttacacacaaca 9231242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899592
Alignment:
Q  95 taagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaacaa 31899592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 191
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895227
Alignment:
Q  71 acaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatata 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||| || ||| |||| | || ||||||||||| || |||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  171 acttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| | ||| |||||||||||    
T  37895207 actcaaactcgcacacaacaa 37895227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40734041 - 40733878
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| || || || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||     ||||||    
T  40734041 gggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtaggtt-atgagccctcttac 40733943  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  40733942 ttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 40733878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7598376 - 7598225
Alignment:
Q  35 cacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgt 134  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  7598376 cacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgt 7598277  T
Q  135 ttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacac 186  Q
    | ||| |||||| || ||| ||||||   | |||||| | ||||||||||||    
T  7598276 tgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgcacac 7598225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7598750 - 7598606
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||         |||||| |  ||||||||||||||||    
T  7598750 ccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggtg 7598659  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacac 186  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  7598658 ttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacac 7598606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16542572 - 16542441
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16542572 aagtgagagagatgctacactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 16542473  T
Q  160 tgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16542472 tgggacttataactcacacttgcacacaacaa 16542441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 14745334 - 14745452
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||| ||| |||| |||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  14745334 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtggga 14745433  T
Q  165 tatataacttacacttgca 183  Q
     |||||||| ||| |||||    
T  14745434 catataactcacagttgca 14745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6421890 - 6421801
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  6421890 gggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgg 6421801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468912
Alignment:
Q  75 cacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataactt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||    |||| | || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  175 acacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaa 31468912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29676660 - 29676545
Alignment:
Q  52 aaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactctttt 151  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||      | ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  29676660 aaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactctttt 29676567  T
Q  152 atccgatgtgagatatataact 173  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  29676566 atccaatgtgagacatataact 29676545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 29874022 - 29874111
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||||| || ||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29874022 gggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 29874111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785729
Alignment:
Q  126 ataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 36785729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6421346 - 6421296
Alignment:
Q  141 tttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  6421346 tttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaa 6421296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3672850 - 3672773
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttat 111  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3672850 ccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3673227 - 3673122
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  ||||| ||||||||||  ||||||    
T  3673227 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttac 3673128  T
Q  124 ttataa 129  Q
    ||||||    
T  3673127 ttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Original strand, 36784300 - 36784365
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataag 130  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  36784300 agagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 188
Target Start/End: Original strand, 37894731 - 37894855
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgag 163  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| ||||||  |  ||||||||||||||| |||| | |||||| || ||| | ||||| |    
T  37894731 gagagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggg 37894830  T
Q  164 atatataacttacacttgcacacaa 188  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||    
T  37894831 acatataactcacatttgcacacaa 37894855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6421775 - 6421696
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||| ||||  || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  6421775 ccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgg 6421696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8904554 - 8904496
Alignment:
Q  57 cataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||| |||||||||||    
T  8904554 cataagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatggat 8904496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 12529068 - 12529194
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||  |||||  ||    
T  12529068 agagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttactgttttatttgatgtagga 12529167  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12529168 catataactcacacttgcatacaacaa 12529194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 164
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254251
Alignment:
Q  78 actcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||||  |  |||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 28254251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28226456 - 28226407
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  28226456 gagagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgg 28226407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 29873559 - 29873624
Alignment:
Q  47 agagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29873559 agagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 41678403 - 41678534
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatg 159  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||| |  ||| |||||||| ||||||||| |   || || |||| ||||    
T  41678403 aagtgagagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatg 41678501  T
Q  160 tgaga--tatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41678502 tgagacatatataactcacacttgcacacaaca 41678534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28226773 - 28226726
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28226773 gagagagacaccacactcttaccaaaaac-ctaagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Original strand, 33953774 - 33953936
Alignment:
Q  27 ggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttactta 126  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |  ||| |||||    
T  33953774 ggaccacccacatcaagg-tggagcaaccataaaagtaagagggacgtcacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcactta 33953872  T
Q  127 taaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaaca 190  Q
    ||  ||||| ||| |  ||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  33953873 tatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactcacatttgcacacaaca 33953936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323455
Alignment:
Q  66 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagat 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |  ||| |||| ||| ||||| ||| |  | | || |||| ||| || ||     
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  166 atataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgcacacaacaat 30323455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Original strand, 15689435 - 15689484
Alignment:
Q  61 agtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggttta 110  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15689435 agtgatagagacaccacatttttacccaaaaccttaagacaatgagttta 15689484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31385860 - 31385807
Alignment:
Q  60 aagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatgg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31385860 aagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 31385807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 91
Target Start/End: Original strand, 33954295 - 33954328
Alignment:
Q  58 ataagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33954295 ataagtgagagagacgccacactcttacccaaaa 33954328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Original strand, 43443108 - 43443149
Alignment:
Q  151 tatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaat 192  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43443108 tatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaat 43443149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515038
Alignment:
Q  121 tacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtg 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtg 42515038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5388
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggt 132  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  133 gtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 5388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5914 - 5769
Alignment:
Q  51 caaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactt-----taagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttac 145  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||     |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5914 caaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 5815  T
Q  146 tcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5814 tattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaa 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5131 - 4974
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |  | ||||||||||| |     
T  5131 ccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagata 5032  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| |||||| || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  5031 ttaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaacaa 4974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5475 - 5349
Alignment:
Q  65 agagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  |    
T  5475 agagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaa 5376  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  5375 catataactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 513 - 680
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  513 gggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 612  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  613 ttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaa 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Original strand, 235 - 300
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgca 183  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  235 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47519 - 47356
Alignment:
Q  24 gggggaccccccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttac 123  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| |  |||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47519 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttac 47420  T
Q  124 ttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacaca 187  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  47419 ttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgcacaca 47356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 1115 - 1272
Alignment:
Q  34 ccacatcaaggctagagcaaccccataagtgagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtg 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  | || |||||||||||    
T  1115 ccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtg 1214  T
Q  134 tttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  1215 ttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 1272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 135
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1801
Alignment:
Q  64 gagagagacaccacactcttacccaaaactttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  1730 gagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3151
Alignment:
Q  132 tgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaa 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17622
Alignment:
Q  67 agagacaccacactcttacccaaaa--ctttaagacaatgggtttatggattatcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgaga 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  165 tatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgcacacaacaa 17622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Original strand, 10204 - 10277
Alignment:
Q  118 tcttacttataaggtgtttaacatttactcttttatccgatgtgagatatataacttacacttgcacacaacaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  10204 tcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtgcacaacaa 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University