View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8621_high_4 (Length: 388)

Name: NF8621_high_4
Description: NF8621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8621_high_4
NF8621_high_4
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (17-376)||(2136963-2137322)
chr8 (17-376)||(14557776-14558135)
chr8 (17-376)||(27608609-27608968)
chr8 (17-376)||(16277706-16278065)
chr8 (17-376)||(19688250-19688609)
chr8 (17-376)||(16283601-16283960)
chr8 (17-375)||(29829474-29829832)
chr8 (32-375)||(19674608-19674951)
chr8 (17-375)||(19286614-19286972)
chr8 (17-375)||(31354676-31355034)
chr8 (17-375)||(31489455-31489813)
chr8 (32-375)||(3329212-3329555)
chr8 (17-375)||(19208065-19208423)
chr8 (17-375)||(28361660-28362018)
chr8 (29-294)||(189258-189523)
chr8 (32-375)||(12092429-12092772)
chr8 (17-375)||(33258875-33259233)
chr8 (17-375)||(9354774-9355133)
chr8 (17-348)||(18710738-18711069)
chr8 (257-376)||(18791099-18791218)
chr8 (17-366)||(19658754-19659102)
chr8 (17-366)||(33244817-33245166)
chr8 (17-348)||(44563253-44563582)
chr8 (17-315)||(22080643-22080941)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (17-376)||(10916499-10916858)
chr7 (17-376)||(2154726-2155085)
chr7 (17-376)||(16503011-16503370)
chr7 (17-372)||(11424412-11424766)
chr7 (17-376)||(16518047-16518406)
chr7 (17-372)||(5128145-5128500)
chr7 (17-375)||(26435410-26435768)
chr7 (17-375)||(26537502-26537860)
chr7 (17-375)||(5146972-5147330)
chr7 (17-375)||(3445459-3445817)
chr7 (17-375)||(4144755-4145113)
chr7 (17-375)||(24592173-24592531)
chr7 (32-375)||(16736092-16736435)
chr7 (32-375)||(16751146-16751489)
chr7 (32-375)||(17523700-17524043)
chr7 (32-375)||(17529172-17529515)
chr7 (32-375)||(31564022-31564365)
chr7 (17-375)||(45387496-45387854)
chr7 (17-333)||(11441725-11442041)
chr7 (17-375)||(26319501-26319859)
chr7 (17-375)||(26669546-26669904)
chr7 (17-375)||(9618804-9619162)
chr7 (17-375)||(26274726-26275084)
chr7 (17-375)||(31125073-31125431)
chr7 (17-376)||(16449629-16449988)
chr7 (17-376)||(16041476-16041835)
chr7 (213-375)||(26513130-26513292)
chr7 (17-348)||(26484847-26485178)
chr7 (17-348)||(39210682-39211013)
chr7 (17-315)||(4200700-4200998)
chr7 (17-348)||(2775512-2775843)
chr7 (17-348)||(2108664-2108995)
chr7 (17-348)||(26682659-26682990)
chr7 (17-315)||(45733613-45733911)
chr7 (17-254)||(18540952-18541189)
chr7 (17-315)||(31088156-31088454)
chr7 (17-254)||(5159672-5159909)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (17-376)||(15424005-15424364)
chr6 (17-376)||(24863866-24864225)
chr6 (17-376)||(26989150-26989510)
chr6 (17-376)||(22934568-22934927)
chr6 (17-376)||(23857013-23857372)
chr6 (17-376)||(24304306-24304665)
chr6 (17-375)||(16750003-16750361)
chr6 (17-372)||(26918529-26918884)
chr6 (17-376)||(13298639-13298998)
chr6 (17-375)||(29549624-29549982)
chr6 (17-376)||(27272268-27272627)
chr6 (17-376)||(27290058-27290417)
chr6 (17-375)||(3696230-3696588)
chr6 (17-375)||(34463035-34463393)
chr6 (17-375)||(16674288-16674646)
chr6 (17-375)||(27485278-27485636)
chr6 (17-375)||(29501564-29501922)
chr6 (32-375)||(4545464-4545807)
chr6 (17-375)||(4723823-4724181)
chr6 (32-375)||(4773170-4773513)
chr6 (17-375)||(27044536-27044895)
chr6 (17-375)||(4757913-4758271)
chr6 (17-375)||(27007876-27008234)
chr6 (17-375)||(29573162-29573520)
chr6 (17-375)||(30557705-30558063)
chr6 (17-375)||(4525435-4525793)
chr6 (17-376)||(27359680-27360039)
chr6 (17-376)||(27450023-27450382)
chr6 (17-375)||(16943716-16944074)
chr6 (17-375)||(26116099-26116457)
chr6 (17-375)||(28207603-28207961)
chr6 (17-375)||(26777299-26777662)
chr6 (17-249)||(17025426-17025658)
chr6 (193-375)||(27019461-27019643)
chr6 (17-197)||(27000222-27000402)
chr6 (17-366)||(14142983-14143332)
chr6 (17-366)||(22456641-22456981)
chr6 (17-366)||(26788093-26788442)
chr6 (17-366)||(27196466-27196815)
chr6 (17-366)||(27252425-27252774)
chr6 (17-348)||(13521789-13522120)
chr6 (32-198)||(20160865-20161031)
chr6 (32-198)||(22171800-22171966)
chr6 (17-315)||(8892060-8892357)
chr6 (17-315)||(8903295-8903592)
chr6 (77-375)||(17092129-17092427)
chr6 (17-237)||(33374083-33374303)
chr6 (17-315)||(28162806-28163104)
chr6 (17-97)||(22477240-22477320)
chr6 (17-234)||(27629530-27629747)
chr6 (323-375)||(27629389-27629441)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (17-376)||(14665185-14665544)
chr4 (17-376)||(17014167-17014526)
chr4 (17-376)||(24592059-24592418)
chr4 (17-375)||(36344261-36344619)
chr4 (17-375)||(14763050-14763408)
chr4 (17-375)||(18800359-18800717)
chr4 (17-375)||(33673544-33673902)
chr4 (32-375)||(6570035-6570378)
chr4 (17-375)||(30753921-30754279)
chr4 (32-375)||(39850820-39851163)
chr4 (17-375)||(54833554-54833912)
chr4 (17-375)||(5006040-5006398)
chr4 (17-375)||(14098708-14099066)
chr4 (17-375)||(21969868-21970226)
chr4 (17-375)||(31126264-31126622)
chr4 (17-375)||(40105384-40105742)
chr4 (17-375)||(27163063-27163421)
chr4 (17-375)||(1900424-1900782)
chr4 (17-376)||(15284673-15285032)
chr4 (17-376)||(15228037-15228396)
chr4 (17-315)||(24460411-24460709)
chr4 (17-254)||(24112829-24113066)
chr4 (35-254)||(34188827-34189046)
chr4 (17-261)||(14235385-14235629)
chr4 (17-315)||(15391144-15391442)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (17-376)||(27434178-27434537)
chr2 (17-376)||(28882362-28882721)
chr2 (17-376)||(20838066-20838425)
chr2 (17-376)||(12655690-12656049)
chr2 (17-376)||(23128300-23128659)
chr2 (17-375)||(27777370-27777728)
chr2 (17-375)||(27817128-27817486)
chr2 (17-375)||(37375309-37375667)
chr2 (17-375)||(13936279-13936637)
chr2 (17-375)||(12716337-12716695)
chr2 (17-375)||(27803855-27804213)
chr2 (17-375)||(260488-260846)
chr2 (17-375)||(12586958-12587316)
chr2 (17-375)||(39051557-39051915)
chr2 (32-375)||(11634921-11635264)
chr2 (32-375)||(11641110-11641453)
chr2 (17-375)||(39890222-39890580)
chr2 (17-375)||(21676917-21677275)
chr2 (17-375)||(32049946-32050304)
chr2 (17-375)||(40233659-40234017)
chr2 (17-375)||(16829073-16829431)
chr2 (17-375)||(16892050-16892408)
chr2 (17-375)||(34861828-34862186)
chr2 (17-375)||(37685644-37686002)
chr2 (17-375)||(37700909-37701267)
chr2 (17-375)||(37925641-37925999)
chr2 (17-375)||(34286502-34286860)
chr2 (17-375)||(34291562-34291920)
chr2 (17-376)||(31876429-31876788)
chr2 (17-375)||(19416234-19416592)
chr2 (17-375)||(9349717-9350075)
chr2 (17-376)||(21702898-21703257)
chr2 (17-348)||(22925790-22926121)
chr2 (17-376)||(19456155-19456514)
chr2 (17-315)||(34303098-34303396)
chr2 (17-366)||(27118836-27119185)
chr2 (17-118)||(34279597-34279698)
chr2 (17-315)||(31891123-31891421)
chr2 (17-315)||(3784802-3785100)
chr2 (17-348)||(16163747-16164081)
chr2 (17-315)||(34157159-34157456)
chr2 (17-171)||(27393117-27393271)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (17-376)||(23717630-23717989)
chr5 (17-376)||(24687799-24688158)
chr5 (17-372)||(11549515-11549870)
chr5 (17-376)||(22998756-22999115)
chr5 (17-376)||(30934794-30935153)
chr5 (17-373)||(23752095-23752451)
chr5 (17-373)||(33777648-33778004)
chr5 (17-376)||(24970179-24970538)
chr5 (17-376)||(15658402-15658761)
chr5 (17-375)||(18500373-18500731)
chr5 (17-375)||(28649396-28649754)
chr5 (32-375)||(13324472-13324815)
chr5 (17-375)||(3789702-3790060)
chr5 (17-375)||(24681601-24681959)
chr5 (17-375)||(24724128-24724486)
chr5 (17-375)||(43078413-43078771)
chr5 (17-375)||(8665118-8665476)
chr5 (17-375)||(31826050-31826408)
chr5 (17-375)||(2511212-2511570)
chr5 (17-375)||(6874466-6874824)
chr5 (17-375)||(15758500-15758858)
chr5 (17-375)||(34616679-34617037)
chr5 (17-376)||(18375054-18375413)
chr5 (17-375)||(37755141-37755499)
chr5 (17-375)||(12132316-12132674)
chr5 (17-375)||(40473192-40473550)
chr5 (17-375)||(9317612-9317970)
chr5 (17-375)||(30152179-30152537)
chr5 (17-375)||(31431601-31431959)
chr5 (17-375)||(33516517-33516875)
chr5 (17-375)||(37358286-37358644)
chr5 (32-375)||(32599115-32599458)
chr5 (17-375)||(28959429-28959787)
chr5 (17-375)||(37671126-37671484)
chr5 (17-375)||(5638071-5638429)
chr5 (17-375)||(30029576-30029934)
chr5 (17-375)||(37770630-37770988)
chr5 (17-375)||(30168630-30168988)
chr5 (17-375)||(26480553-26480910)
chr5 (17-375)||(41674870-41675228)
chr5 (17-375)||(23892367-23892725)
chr5 (17-315)||(9548246-9548544)
chr5 (17-366)||(29888734-29889083)
chr5 (17-291)||(29966793-29967067)
chr5 (17-376)||(22888631-22888990)
chr5 (17-376)||(25199190-25199549)
chr5 (17-348)||(33877408-33877739)
chr5 (17-315)||(11325955-11326253)
chr5 (17-314)||(13184352-13184649)
chr5 (17-315)||(13440197-13440495)
chr5 (17-254)||(33292686-33292923)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (17-376)||(4796439-4796798)
chr3 (17-376)||(15892492-15892851)
chr3 (17-376)||(8296085-8296444)
chr3 (17-376)||(6192429-6192788)
chr3 (17-373)||(15740883-15741239)
chr3 (17-372)||(35880879-35881234)
chr3 (17-376)||(8301053-8301412)
chr3 (17-372)||(18330782-18331137)
chr3 (17-376)||(4721744-4722103)
chr3 (17-372)||(22387368-22387723)
chr3 (17-376)||(29148541-29148900)
chr3 (18-376)||(18051376-18051734)
chr3 (17-375)||(7073325-7073683)
chr3 (17-375)||(28021388-28021746)
chr3 (17-375)||(18276839-18277197)
chr3 (17-375)||(18307441-18307799)
chr3 (17-375)||(48466040-48466398)
chr3 (17-375)||(4346474-4346832)
chr3 (17-375)||(18292140-18292498)
chr3 (17-375)||(20576634-20576992)
chr3 (32-375)||(28115741-28116084)
chr3 (17-375)||(8211851-8212209)
chr3 (17-375)||(11110136-11110494)
chr3 (17-375)||(21674806-21675164)
chr3 (17-375)||(36996864-36997222)
chr3 (17-375)||(51782136-51782494)
chr3 (17-375)||(10396246-10396604)
chr3 (32-375)||(4417047-4417390)
chr3 (32-375)||(29664757-29665100)
chr3 (17-375)||(5467098-5467456)
chr3 (17-375)||(18242852-18243210)
chr3 (17-375)||(5596144-5596502)
chr3 (17-375)||(22870643-22871001)
chr3 (17-375)||(22885702-22886060)
chr3 (17-375)||(31964260-31964618)
chr3 (17-375)||(5609109-5609467)
chr3 (17-375)||(18225304-18225662)
chr3 (32-375)||(28339430-28339773)
chr3 (17-375)||(6542249-6542607)
chr3 (17-375)||(5013825-5014183)
chr3 (17-375)||(7996675-7997033)
chr3 (17-375)||(10643183-10643541)
chr3 (17-375)||(17984743-17985101)
chr3 (17-375)||(24328272-24328630)
chr3 (17-375)||(47023566-47023924)
chr3 (17-253)||(51797226-51797462)
chr3 (17-243)||(50133990-50134216)
chr3 (17-315)||(17993631-17993929)
chr3 (17-376)||(18530501-18530860)
chr3 (17-376)||(16626292-16626651)
chr3 (17-348)||(31033931-31034262)
chr3 (17-348)||(32292865-32293196)
chr3 (17-315)||(5713340-5713638)
chr3 (17-315)||(5724250-5724548)
chr3 (17-315)||(5767820-5768118)
chr3 (17-237)||(5757007-5757227)
chr3 (17-366)||(5652500-5652849)
chr3 (17-168)||(32439267-32439418)
chr3 (17-168)||(20066156-20066307)
chr3 (17-315)||(4626057-4626355)
chr3 (17-81)||(4893323-4893387)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (17-376)||(39814-40173)
scaffold0089 (17-376)||(46730-47089)
scaffold0089 (20-376)||(29918-30274)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (17-376)||(27444-27804)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-376)||(30604-30964)
scaffold0124 (17-208)||(20540-20730)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (17-375)||(6165-6524)
scaffold0415 (17-208)||(1831-2021)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (17-375)||(8812-9170)
scaffold0159 (17-375)||(20167-20526)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (17-376)||(51638369-51638728)
chr1 (17-375)||(10962821-10963179)
chr1 (17-375)||(41793054-41793412)
chr1 (17-375)||(28585132-28585490)
chr1 (17-376)||(16207776-16208135)
chr1 (17-376)||(20340080-20340439)
chr1 (17-376)||(20461232-20461591)
chr1 (17-348)||(28152013-28152344)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (17-375)||(25947-26305)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (17-375)||(9718-10076)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (17-376)||(14675-15034)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (17-375)||(6985-7343)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-375)||(8101-8459)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (17-370)||(46545-46912)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-249)||(1-233)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (17-376)||(2403-2762)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (29-356)||(383-710)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (17-144)||(5-132)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-348)||(21713-22044)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (17-234)||(241-458)
scaffold2173 (298-375)||(518-595)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2137322 - 2136963
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137322 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2137223  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137222 tctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2137123  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137122 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 2137023  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137022 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 14557776 - 14558135
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557776 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 14557875  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557876 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14557975  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557976 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 14558075  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558076 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27608968 - 27608609
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608968 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27608869  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608868 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27608769  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27608768 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 27608669  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608668 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 16277706 - 16278065
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277706 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16277805  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277806 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 16277905  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16277906 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctat 16278005  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278006 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 19688250 - 19688609
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19688250 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 19688349  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688350 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 19688449  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688450 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 19688549  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  19688550 actgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 16283601 - 16283960
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283601 catcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16283700  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  16283701 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaac 16283800  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283801 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 16283900  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16283901 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 29829474 - 29829832
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29829474 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29829573  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  29829574 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 29829673  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  29829674 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctat 29829773  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29829774 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 19674608 - 19674951
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 19674807  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19674808 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 19674907  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19674908 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 19286614 - 19286972
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19286614 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19286713  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  19286714 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 19286813  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19286814 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccat 19286913  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  19286914 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 31354676 - 31355034
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31354676 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31354775  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31354776 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31354875  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  31354876 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 31354975  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31354976 gctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctcctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31489813 - 31489455
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31489813 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31489714  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31489713 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31489614  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  31489613 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctat 31489514  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31489513 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3329555 - 3329212
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  3329555 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttg 3329456  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3329455 acaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctct 3329356  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3329355 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgac 3329256  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  3329255 atccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagtgatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19208423 - 19208065
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19208423 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19208324  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19208323 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19208224  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  19208223 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 19208124  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19208123 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28362018 - 28361660
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28362018 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28361919  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28361918 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28361819  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  28361818 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 28361719  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28361718 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189523
Alignment:
Q  29 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  129 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 228  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 189457  T
Q  229 tctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 294  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189458 tctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12092772 - 12092429
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  12092772 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 12092673  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||    
T  12092672 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctct 12092573  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12092572 gcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgac 12092473  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12092472 atccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagtgatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 33258875 - 33259233
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33258875 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 33258974  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33258975 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33259074  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  33259075 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 33259174  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33259175 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 9354774 - 9355133
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaag-ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataat 115  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| || |||||  ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9354774 catcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataat 9354873  T
Q  116 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 215  Q
    || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9354874 gttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaa 9354973  T
Q  216 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  9354974 ctcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgcca 9355073  T
Q  316 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9355074 tactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 18710738 - 18711069
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710738 catcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18710837  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  18710838 tcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 18710937  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  18710938 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 18711037  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18711038 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 18711069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 257 - 376
Target Start/End: Original strand, 18791099 - 18791218
Alignment:
Q  257 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18791099 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 18791198  T
Q  357 ttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18791199 ttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19659102 - 19658754
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  19659102 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19659004  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||  || || |||||||| |||||    
T  19659003 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 19658904  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || | ||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  19658903 tcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 19658804  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  19658803 gttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 19658754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 33244817 - 33245166
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  33244817 catcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 33244916  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||  ||||  || ||  ||||||| |||||    
T  33244917 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaac 33245016  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  33245017 tcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 33245116  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  33245117 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 33245166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 44563253 - 44563582
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  44563253 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 44563351  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  |||||||  ||||    
T  44563352 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaac 44563450  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  44563451 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 44563550  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44563551 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 44563582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22080941 - 22080643
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  22080941 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 22080842  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 215  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| |  ||| | || ||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  22080841 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaa 22080743  T
Q  216 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  22080742 ctcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgccgccataatccttggggttgcta 22080643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10916858 - 10916499
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916858 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 10916759  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916758 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 10916659  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916658 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 10916559  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916558 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2155085
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2154825  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154826 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2154925  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154926 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 2155025  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155026 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16503370 - 16503011
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503370 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16503271  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16503270 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16503171  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16503170 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 16503071  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503070 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11424766 - 11424412
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424766 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11424667  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424666 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11424567  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424566 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 11424467  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424466 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-ttttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16518406 - 16518047
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16518406 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 16518307  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16518306 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16518207  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16518206 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 16518107  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518106 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 5128145 - 5128500
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128145 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 5128244  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5128245 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaac 5128344  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5128345 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 5128444  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128445 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 26435410 - 26435768
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26435410 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26435509  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26435510 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26435609  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26435610 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 26435709  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26435710 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26537860 - 26537502
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26537860 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26537761  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26537760 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26537661  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  26537660 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccat 26537561  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26537560 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5147330 - 5146972
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5147330 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 5147231  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5147230 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 5147131  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5147130 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5147031  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5147030 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 3445459 - 3445817
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3445459 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3445558  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3445559 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 3445658  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3445659 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 3445758  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3445759 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4145113 - 4144755
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4145113 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 4145014  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4145013 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4144914  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  4144913 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 4144814  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4144813 actgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24592531 - 24592173
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24592531 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24592432  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24592431 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24592332  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  24592331 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 24592232  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24592231 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16736435 - 16736092
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16736435 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16736336  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16736335 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16736236  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16736235 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 16736136  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16736135 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16751489 - 16751146
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16751489 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16751390  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16751389 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16751290  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16751289 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 16751190  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16751189 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 17523700 - 17524043
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17523700 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17523799  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17523800 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17523899  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17523900 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 17523999  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17524000 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17529515 - 17529172
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17529515 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17529416  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17529415 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17529316  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17529315 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 17529216  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  17529215 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31564365 - 31564022
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  31564365 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 31564266  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  31564265 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctct 31564166  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  31564165 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgac 31564066  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31564065 atccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 45387496 - 45387854
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45387496 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 45387595  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  45387596 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 45387695  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  45387696 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 45387795  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  45387796 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Original strand, 11441725 - 11442041
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11441725 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 11441824  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11441825 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 11441924  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11441925 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 11442024  T
Q  317 actgttcaagacgacat 333  Q
     ||||||||||||||||    
T  11442025 gctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26319859 - 26319501
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26319859 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26319760  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26319759 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26319660  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26319659 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26319560  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26319559 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26669904 - 26669546
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26669904 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26669805  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26669804 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26669705  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26669704 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26669605  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  26669604 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctcctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 9618804 - 9619162
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9618804 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9618903  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9618904 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9619003  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  9619004 tcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 9619103  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9619104 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26275084 - 26274726
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26275084 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26274985  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26274984 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26274885  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  26274884 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 26274785  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26274784 actgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 31125073 - 31125431
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31125073 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31125172  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||    
T  31125173 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccac 31125272  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31125273 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccat 31125372  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  31125373 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16449988 - 16449629
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  16449988 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacg 16449889  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  16449888 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaac 16449789  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||     
T  16449788 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 16449689  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16449688 gttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 16041476 - 16041835
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  16041476 catcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 16041575  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | ||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  16041576 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 16041675  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |  || |||||| |||| |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  16041676 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctac 16041775  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16041776 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  213 caactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  313 ctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485178
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  26484847 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26484946  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26484947 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26485046  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26485047 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26485146  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26485147 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26485178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39211013 - 39210682
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  39211013 catcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 39210914  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  39210913 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 39210814  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||| |    
T  39210813 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgt 39210714  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39210713 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 39210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 4200700 - 4200998
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  4200700 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 4200799  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  4200800 tccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 4200899  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||||    
T  4200900 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgcta 4200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 2775512 - 2775843
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  2775512 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2775611  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  2775612 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 2775711  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |   |||||||||||||||||      
T  2775712 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgc 2775811  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2775812 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2108995 - 2108664
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  2108995 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2108896  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||  ||||    
T  2108895 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaac 2108796  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  2108795 tcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 2108696  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  2108695 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 2108664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26682990 - 26682659
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  26682990 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 26682891  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26682890 tccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26682791  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26682790 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26682691  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26682690 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 45733613 - 45733911
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  45733613 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 45733712  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  45733713 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 45733812  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  45733813 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 45733911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18540952 - 18541189
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18540952 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 18541051  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  18541052 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 18541151  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 254  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  18541152 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 18541189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31088454 - 31088156
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  31088454 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 31088355  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  31088354 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31088255  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||  |||||||||    
T  31088254 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgcta 31088156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 5159672 - 5159909
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  5159672 catcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 5159771  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||||| || ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  5159772 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 5159871  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 254  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  5159872 tcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctt 5159909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15424364 - 15424005
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424364 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15424265  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424264 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15424165  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424164 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 15424065  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424064 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 24863866 - 24864225
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863866 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24863965  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863966 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24864065  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24864066 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 24864165  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24864166 actgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 26989150 - 26989510
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989150 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26989249  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989250 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26989349  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989350 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 26989449  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26989450 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22934927 - 22934568
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22934927 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 22934828  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934827 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22934728  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22934727 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 22934628  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22934627 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23857372 - 23857013
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23857372 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 23857273  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857272 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23857173  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23857172 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 23857073  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23857072 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24304665 - 24304306
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304665 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24304566  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24304565 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24304466  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304465 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 24304366  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304365 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 16750003 - 16750361
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750003 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16750102  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16750103 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaac 16750202  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16750203 tcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 16750302  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750303 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 26918529 - 26918884
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918529 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26918628  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918629 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26918728  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918729 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 26918828  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26918829 actgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13298998 - 13298639
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298998 catcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 13298899  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298898 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 13298799  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13298798 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtat 13298699  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  13298698 actgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattatttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 29549624 - 29549982
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549624 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29549723  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29549724 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaac 29549823  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29549824 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 29549923  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29549924 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27272627 - 27272268
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27272627 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 27272528  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27272527 ttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaac 27272428  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27272427 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgcttt 27272328  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272327 attgttcaagatgacatccagagcttgatgaatgataagtttttgactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27290417 - 27290058
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27290417 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 27290318  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290317 tccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27290218  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290217 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 27290118  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290117 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 3696230 - 3696588
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3696230 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3696329  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3696330 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3696429  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3696430 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccat 3696529  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3696530 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34463393 - 34463035
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34463393 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 34463294  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34463293 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34463194  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  34463193 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 34463094  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34463093 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 16674288 - 16674646
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16674288 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16674387  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16674388 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 16674487  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  16674488 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 16674587  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16674588 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27485278 - 27485636
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27485278 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27485377  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27485378 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 27485477  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27485478 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27485577  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27485578 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagtgatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 29501564 - 29501922
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29501564 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29501663  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29501664 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29501763  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  29501764 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 29501863  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29501864 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4545807 - 4545464
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  4545807 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttg 4545708  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  4545707 acaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctct 4545608  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4545607 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgac 4545508  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4545507 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4724181 - 4723823
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4724181 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4724082  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  4724081 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4723982  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||    
T  4723981 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccat 4723882  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4723881 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 4773170 - 4773513
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  4773170 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 4773269  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||    
T  4773270 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctct 4773369  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4773370 gcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgac 4773469  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4773470 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27044536 - 27044895
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct-atgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataat 115  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27044536 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataat 27044635  T
Q  116 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 215  Q
    || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |    
T  27044636 gttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcca 27044735  T
Q  216 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27044736 ctcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgcca 27044835  T
Q  316 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27044836 tactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 4757913 - 4758271
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4757913 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4758012  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  4758013 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 4758112  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  4758113 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 4758212  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  4758213 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagtgatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27007876 - 27008234
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27007876 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatg 27007975  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  27007976 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27008075  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27008076 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27008175  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27008176 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 29573162 - 29573520
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29573162 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29573261  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29573262 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29573361  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  29573362 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 29573461  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29573462 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30558063 - 30557705
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30558063 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30557964  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30557963 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30557864  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  30557863 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 30557764  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30557763 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 4525435 - 4525793
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4525435 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4525534  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  4525535 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 4525634  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  4525635 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 4525734  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4525735 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27360039 - 27359680
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27360039 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27359940  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||    
T  27359939 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27359840  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27359839 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27359740  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27359739 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27450382 - 27450023
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27450382 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27450283  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || ||    
T  27450282 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27450183  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27450182 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 27450083  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27450082 actgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16944074 - 16943716
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16944074 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16943975  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16943974 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16943875  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  16943874 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 16943775  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16943774 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26116457 - 26116099
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26116457 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26116358  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||    
T  26116357 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 26116258  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  26116257 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 26116158  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  26116157 gctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 28207603 - 28207961
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28207603 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28207702  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  28207703 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 28207802  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  28207803 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 28207902  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28207903 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26777662 - 26777299
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26777662 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26777563  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || || || ||    
T  26777562 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccac 26777463  T
Q  217 tcctctggtgcctctgc-----acattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggtt 311  Q
    |||||||||||||||||     || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |    
T  26777462 tcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggct 26777363  T
Q  312 gctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26777362 gctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 17025426 - 17025658
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17025426 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 17025525  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025526 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17025625  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025626 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  193 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  293 cttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 27000222 - 27000402
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000222 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27000321  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 197  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000322 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14143332 - 14142983
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  14143332 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 14143233  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  14143232 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 14143133  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  14143132 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 14143033  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  14143032 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 14142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22456981 - 22456641
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||     
T  22456981 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatt 22456882  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22456881 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 22456782  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||         ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| || | || |||| |  |||||||||||||||||||     
T  22456781 tcc---------tctgcacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctac 22456691  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      ||||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  22456690 gttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgt 22456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 26788093 - 26788442
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  26788093 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26788192  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  26788193 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26788292  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  26788293 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 26788392  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  26788393 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 26788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 27196466 - 27196815
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  27196466 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27196565  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  27196566 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27196665  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  27196666 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 27196765  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27196766 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27196815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27252774 - 27252425
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  27252774 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27252675  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  27252674 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27252575  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  27252574 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 27252475  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27252474 gttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27252425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13522120 - 13521789
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  13522120 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 13522021  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  ||||    
T  13522020 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 13521921  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |      
T  13521920 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgc 13521821  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13521820 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 13521789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 20160865 - 20161031
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  20160865 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 20160964  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 198  Q
    | ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20160965 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171800
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  22171966 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 22171867  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 198  Q
    | ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171866 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8892357 - 8892060
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  8892357 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8892259  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8892258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8892159  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8892158 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8892060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8903592 - 8903295
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  8903592 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8903494  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  8903493 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8903394  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8903393 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8903295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092129
Alignment:
Q  77 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 176  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||  || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  177 gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 276  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||      
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatag 17092228  T
Q  277 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||  |||| |  || | | ||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || | | ||||||||||||||||    
T  17092227 cagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgatgt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33374303 - 33374083
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  33374303 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacg 33374204  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  33374203 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 33374104  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacat 237  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  33374103 tcctctggtgccactacacat 33374083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 28162806 - 28163104
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  28162806 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 28162905  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  28162906 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 28163005  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||   | | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  28163006 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 28163104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22477320 - 22477240
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  22477320 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27629747 - 27629530
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| || ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |     
T  27629747 catcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagta 27629648  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
      || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || ||    
T  27629647 ctcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgac 27629548  T
Q  217 tcctctggtgcctctgca 234  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  27629547 tcctttggtgcccctgca 27629530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27629441 - 27629389
Alignment:
Q  323 caagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27629441 caagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 27629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 14665185 - 14665544
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14665185 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataata 14665284  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665285 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14665384  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665385 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 14665484  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665485 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 17014167 - 17014526
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 17014366  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17014367 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 17014466  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014467 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24592418 - 24592059
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592418 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24592319  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592318 tcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24592219  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24592218 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctac 24592119  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24592118 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36344619 - 36344261
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36344619 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 36344520  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36344519 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 36344420  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36344419 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 36344320  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36344319 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14763408 - 14763050
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14763408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 14763309  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14763308 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14763209  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14763208 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 14763109  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14763108 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18800717 - 18800359
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18800717 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18800618  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18800617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18800518  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18800517 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 18800418  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18800417 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33673902 - 33673544
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33673902 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33673803  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33673802 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33673703  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  33673702 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 33673603  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33673602 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 6570035 - 6570378
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6570035 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 6570134  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6570135 acaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 6570234  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6570235 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgac 6570334  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6570335 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 30753921 - 30754279
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30753921 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30754020  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30754021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30754120  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  30754121 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 30754220  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30754221 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 39850820 - 39851163
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  39850820 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 39850919  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39850920 acaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctct 39851019  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39851020 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgac 39851119  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39851120 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 54833554 - 54833912
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54833554 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 54833653  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  54833654 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 54833753  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  54833754 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccat 54833853  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  54833854 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 5006040 - 5006398
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5006040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatg 5006139  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5006140 tcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5006239  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  5006240 tcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttat 5006339  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5006340 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 14098708 - 14099066
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14098708 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14098807  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14098808 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14098907  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  14098908 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 14099007  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  14099008 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataaccttctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 21969868 - 21970226
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21969868 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 21969967  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21969968 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21970067  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21970068 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 21970167  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21970168 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31126622 - 31126264
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31126622 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31126523  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31126522 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31126423  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  31126422 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 31126323  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31126322 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40105742 - 40105384
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40105742 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40105643  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40105642 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40105543  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  40105542 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 40105443  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40105442 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27163421 - 27163063
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27163421 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27163322  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  27163321 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27163222  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  27163221 tcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 27163122  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27163121 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 1900424 - 1900782
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1900424 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatg 1900523  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||    
T  1900524 tcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| |||||||  |||| || |||  | | |||| |||||||||||||     
T  1900624 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctac 1900723  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
      ||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  1900724 gttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15285032 - 15284673
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  15285032 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 15284933  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  15284932 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 15284833  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||||||||||     
T  15284832 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 15284733  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | |||||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  15284732 gttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 15228037 - 15228396
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |    
T  15228037 catcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacg 15228136  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  | || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15228137 tccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaac 15228236  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||| || | || |||| | ||||||||||| |||||| |     
T  15228237 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccac 15228336  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||| | | |||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| || ||||||    
T  15228337 gttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24460709 - 24460411
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  24460709 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 24460610  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  24460609 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 24460510  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  24460509 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 24460411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 24112829 - 24113066
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  24112829 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 24112928  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  24112929 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 24113028  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 254  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  24113029 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 24113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34189046 - 34188827
Alignment:
Q  35 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34189046 catgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgata 34188947  T
Q  135 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 234  Q
    |||| || ||||||||||| || || |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  34188946 atccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactcca 34188847  T
Q  235 cattaagctgtgcaaagctt 254  Q
     || ||| ||||| ||||||    
T  34188846 tatcaagttgtgccaagctt 34188827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14235629 - 14235385
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || |||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  14235629 catcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 14235530  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||    | ||| | |||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  14235529 tccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgac 14235430  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 261  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  14235429 tcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtt 14235385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15391442 - 15391144
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| ||||    
T  15391442 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatg 15391343  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat-gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 215  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||||| ||| |  ||| | || ||| || |||||  ||||||| || ||||    
T  15391342 tccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agagtcatgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaa 15391244  T
Q  216 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||| |||||||||| |||| || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  15391243 ctcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgcta 15391144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27434537 - 27434178
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434537 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27434438  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434437 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27434338  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27434337 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 27434238  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27434237 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 28882362 - 28882721
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882362 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 28882461  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882462 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 28882561  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882562 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 28882661  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28882662 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 20838066 - 20838425
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaac 20838265  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20838266 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 20838365  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20838366 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 12655690 - 12656049
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655690 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 12655789  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655790 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 12655889  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12655890 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctat 12655989  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12655990 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23128659 - 23128300
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128659 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23128560  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128559 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23128460  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128459 tcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 23128360  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23128359 actattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27777370 - 27777728
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27777370 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27777469  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27777470 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27777569  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27777570 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27777669  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27777670 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27817128 - 27817486
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27817128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27817227  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27817228 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27817327  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27817328 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27817427  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27817428 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 37375309 - 37375667
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37375309 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37375408  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37375409 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37375508  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37375509 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 37375608  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37375609 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13936637 - 13936279
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13936637 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 13936538  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13936537 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13936438  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  13936437 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccat 13936338  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13936337 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12716695 - 12716337
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12716695 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12716596  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12716595 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 12716496  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12716495 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 12716396  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12716395 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 27803855 - 27804213
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27803855 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27803954  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27803955 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaac 27804054  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27804055 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 27804154  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27804155 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 260846 - 260488
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  260846 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 260747  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  260746 tcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 260647  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  260646 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 260547  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  260546 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 12586958 - 12587316
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12586958 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12587057  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12587058 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12587157  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12587158 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 12587257  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12587258 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39051915 - 39051557
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39051915 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39051816  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39051815 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 39051716  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39051715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 39051616  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39051615 gctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11635264 - 11634921
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11635065  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11635064 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgac 11634965  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11634964 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11641453 - 11641110
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11641254  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11641253 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgac 11641154  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  11641153 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 39890222 - 39890580
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39890222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 39890321  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39890322 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39890421  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  39890422 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 39890521  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39890522 gttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21677275 - 21676917
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21677275 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21677176  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21677175 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21677076  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  21677075 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 21676976  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  21676975 gctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 32049946 - 32050304
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32049946 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32050045  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32050046 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 32050145  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32050146 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 32050245  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32050246 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 40233659 - 40234017
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40233659 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40233758  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40233759 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 40233858  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  40233859 tcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 40233958  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40233959 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16829431 - 16829073
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16829431 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16829332  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16829331 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16829232  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16829231 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 16829132  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16829131 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 16892050 - 16892408
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16892050 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16892149  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16892150 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16892249  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16892250 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 16892349  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16892350 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 34861828 - 34862186
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34861828 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34861927  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34861928 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaac 34862027  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  34862028 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 34862127  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34862128 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37686002 - 37685644
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37686002 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37685903  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37685902 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37685803  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37685802 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37685703  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37685702 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37701267 - 37700909
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37701267 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37701168  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37701167 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37701068  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37701067 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37700968  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37700967 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 37925641 - 37925999
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37925641 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37925740  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37925741 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37925840  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  37925841 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 37925940  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37925941 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 34286502 - 34286860
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34286502 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34286601  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  34286602 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34286701  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34286702 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 34286801  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34286802 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 34291562 - 34291920
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34291562 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34291661  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  34291662 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34291761  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34291762 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 34291861  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34291862 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 31876429 - 31876788
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31876429 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31876528  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31876529 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31876628  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| ||    
T  31876629 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccat 31876728  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  31876729 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19416592 - 19416234
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19416592 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19416493  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19416492 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19416393  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19416392 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctat 19416293  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  19416292 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9350075 - 9349717
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  9350075 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 9349976  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  | ||||| |||||||| ||  ||||    
T  9349975 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaac 9349876  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  9349875 ccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 9349776  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9349775 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21703257 - 21702898
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  21703257 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 21703158  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||    
T  21703157 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 21703058  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||| | ||| |||||| |||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||     
T  21703057 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctac 21702958  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| || ||||||    
T  21702957 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttgactgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22926121 - 22925790
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22926121 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 22926022  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  22926021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 22925922  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||| ||||||||||||      
T  22925921 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgc 22925822  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22925821 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 22925790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19456514 - 19456155
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  19456514 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19456415  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  19456414 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 19456315  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||  | |||| |  |||||||||||||||||||     
T  19456314 tcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctac 19456215  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  19456214 gttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34303396 - 34303098
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  34303396 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34303297  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  34303296 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 34303197  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   | ||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  34303196 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgcta 34303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 27118836 - 27119185
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  27118836 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 27118935  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||  || ||  ||||| | |||||    
T  27118936 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaac 27119035  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  27119036 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 27119135  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  27119136 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 27119185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 34279597 - 34279698
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279597 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 34279696  T
Q  117 tc 118  Q
    ||    
T  34279697 tc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31891421 - 31891123
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||| ||||||| |    
T  31891421 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacg 31891322  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  31891321 tccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31891222  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| |  |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  31891221 tcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 31891123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 3784802 - 3785100
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  3784802 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 3784901  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  3784902 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 3785001  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  3785002 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 3785100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 16163747 - 16164081
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  16163747 catcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16163846  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  16163847 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 16163946  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttcc---ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgc 313  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| |||   |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||    
T  16163947 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgc 16164046  T
Q  314 tatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
    |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16164047 tgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 16164081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 34157159 - 34157456
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  34157159 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34157257  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  34157258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 34157357  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  34157358 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 34157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 27393117 - 27393271
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27393117 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 27393216  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 171  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||    
T  27393217 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23717989 - 23717630
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717989 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23717890  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717889 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23717790  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717789 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 23717690  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23717689 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24688158 - 24687799
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688158 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24688059  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24688058 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 24687959  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687958 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 24687859  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24687858 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 11549515 - 11549870
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549515 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11549614  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549615 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11549714  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 11549814  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11549815 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgctagtga 11549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22999115 - 22998756
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999115 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22999016  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999015 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22998916  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 22998816  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22998815 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 30934794 - 30935153
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934794 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 30934893  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30934894 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaac 30934993  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30934994 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 30935093  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935094 accgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23752451 - 23752095
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752451 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23752352  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752351 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23752252  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23752251 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctat 23752152  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752151 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 33777648 - 33778004
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777648 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 33777747  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777748 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 33777847  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33777848 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 33777947  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777948 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 24970179 - 24970538
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24970179 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatg 24970278  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24970279 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24970378  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24970379 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 24970478  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970479 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15658761 - 15658402
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658761 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15658662  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15658661 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15658562  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15658561 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccat 15658462  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15658461 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18500731 - 18500373
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18500731 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18500632  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18500631 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaac 18500532  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500531 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 18500432  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18500431 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 28649396 - 28649754
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28649396 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28649495  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28649496 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28649595  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28649596 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctat 28649695  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28649696 accgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13324815 - 13324472
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  13324815 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 13324716  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13324715 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctct 13324616  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13324615 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgac 13324516  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13324515 atccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 3789702 - 3790060
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3789702 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3789801  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3789802 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3789901  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  3789902 tcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 3790001  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3790002 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 24681601 - 24681959
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24681601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24681700  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24681701 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24681800  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24681801 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24681900  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24681901 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 24724128 - 24724486
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24724128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24724227  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24724228 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24724327  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24724328 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24724427  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24724428 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 43078413 - 43078771
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43078413 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 43078512  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43078513 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 43078612  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  43078613 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 43078712  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43078713 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8665476 - 8665118
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8665476 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8665377  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665376 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8665277  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8665276 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8665177  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  8665176 gctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31826408 - 31826050
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31826408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31826309  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31826308 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 31826209  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  31826208 tcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaa 31826109  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31826108 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 2511212 - 2511570
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2511212 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 2511311  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  2511312 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 2511411  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  2511412 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 2511511  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2511512 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 6874466 - 6874824
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6874466 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6874565  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6874566 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6874665  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  6874666 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 6874765  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6874766 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15758858 - 15758500
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15758858 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 15758759  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15758758 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15758659  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  15758658 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccat 15758559  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  15758558 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 34616679 - 34617037
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34616679 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34616778  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34616779 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34616878  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34616879 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 34616978  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34616979 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18375413 - 18375054
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18375413 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18375314  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18375313 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18375214  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18375213 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 18375114  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18375113 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 37755141 - 37755499
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37755141 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37755240  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37755241 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37755340  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  37755341 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttat 37755440  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37755441 actgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 12132316 - 12132674
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12132316 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12132415  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12132416 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12132515  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  12132516 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 12132615  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12132616 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40473550 - 40473192
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40473550 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 40473451  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40473450 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40473351  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  40473350 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 40473251  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40473250 gctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 9317612 - 9317970
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9317612 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9317711  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9317712 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9317811  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  9317812 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 9317911  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9317912 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 30152179 - 30152537
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30152179 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30152278  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  30152279 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 30152378  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  30152379 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 30152478  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30152479 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 31431601 - 31431959
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31431601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31431700  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  31431701 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31431800  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  31431801 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctat 31431900  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31431901 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 33516517 - 33516875
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33516517 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33516616  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33516617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33516716  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  33516717 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 33516816  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33516817 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37358644 - 37358286
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  37358644 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataata 37358545  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  37358544 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 37358445  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  37358444 tcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 37358345  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37358344 gctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32599458 - 32599115
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599458 ggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 32599359  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  32599358 acaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctct 32599259  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32599258 gcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgac 32599159  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  32599158 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28959787 - 28959429
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28959787 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28959688  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||    
T  28959687 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccac 28959588  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||    
T  28959587 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccat 28959488  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28959487 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37671484 - 37671126
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37671484 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37671385  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   |    
T  37671384 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgc 37671285  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  37671284 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccat 37671185  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  37671184 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 5638071 - 5638429
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5638071 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatg 5638170  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5638171 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5638270  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  5638271 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 5638370  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5638371 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 30029576 - 30029934
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30029576 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30029675  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30029676 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30029775  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |     
T  30029776 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccac 30029875  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30029876 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37770988 - 37770630
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37770988 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37770889  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||    
T  37770888 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctac 37770789  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  37770788 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 37770689  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  37770688 actgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 30168630 - 30168988
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30168630 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatg 30168729  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30168730 tcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30168829  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  30168830 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 30168929  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30168930 gctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 26480553 - 26480910
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26480553 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26480652  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26480653 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26480752  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| |||    
T  26480753 t-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttat 26480851  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26480852 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 41674870 - 41675228
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41674870 catcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41674969  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  41674970 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 41675069  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41675070 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctat 41675169  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  41675170 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 23892367 - 23892725
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23892367 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 23892466  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23892467 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 23892566  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23892567 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctac 23892666  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
       |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23892667 ttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattatttaactgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9548544 - 9548246
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548544 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 9548445  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9548444 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9548345  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    ||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||| ||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  9548344 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 9548246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29889083 - 29888734
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29889083 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 29888984  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  29888983 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 29888884  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29888883 tcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctat 29888784  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  29888783 gctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 29888734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29967067 - 29966793
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29967067 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29966968  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29966967 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29966868  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatg 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  29966867 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 22888631 - 22888990
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22888631 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 22888730  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  22888731 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaac 22888830  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||  ||||   |||||||||||| |  |||| || |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  22888831 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttac 22888930  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  22888931 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 25199190 - 25199549
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  25199190 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 25199289  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  25199290 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 25199389  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||| ||| |||||     
T  25199390 tcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctac 25199489  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
       |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  25199490 gtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 33877408 - 33877739
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  33877408 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 33877507  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  ||||    
T  33877508 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 33877607  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |      
T  33877608 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgc 33877707  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33877708 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 33877739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 11325955 - 11326253
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  11325955 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 11326054  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  11326055 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 11326154  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  11326155 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 11326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13184649 - 13184352
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  13184649 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13184550  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  13184549 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13184450  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 314  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    
T  13184449 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13440495 - 13440197
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  13440495 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13440396  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  13440395 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13440296  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    ||||||||||||||| |||||  || | ||| |||| |  |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  13440295 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 13440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 33292686 - 33292923
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  33292686 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 33292785  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||    
T  33292786 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 33292885  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 254  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  33292886 tcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 33292923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4796798 - 4796439
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796798 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 4796699  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796698 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 4796599  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4796598 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttat 4796499  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796498 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15892851 - 15892492
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892851 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15892752  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15892751 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 15892652  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15892651 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgcttt 15892552  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892551 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 8296085 - 8296444
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8296085 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 8296184  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296185 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8296284  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296285 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 8296384  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8296385 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgattttttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 6192429 - 6192788
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192429 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 6192528  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192529 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 6192628  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6192629 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 6192728  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6192729 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15741239 - 15740883
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741239 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15741140  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741139 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15741040  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741039 tcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 15740940  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15740939 actgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataattttttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 35880879 - 35881234
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880879 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 35880978  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880979 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 35881078  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881079 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 35881178  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35881179 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaatttttttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8301412 - 8301053
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301412 catcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 8301313  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301312 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8301213  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8301212 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcttt 8301113  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8301112 actgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 18330782 - 18331137
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330782 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18330881  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330882 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 18330981  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18330982 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctat 18331081  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18331082 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaattttttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 4721744 - 4722103
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4721744 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatg 4721843  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721844 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaac 4721943  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4721944 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 4722043  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4722044 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22387723 - 22387368
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387723 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22387624  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22387623 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22387524  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22387523 tcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctat 22387424  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387423 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29148900 - 29148541
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148900 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29148801  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29148800 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 29148701  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29148700 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 29148601  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  29148600 actgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattctttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 18051376 - 18051734
Alignment:
Q  18 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051376 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 18051475  T
Q  118 cccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaact 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18051476 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaact 18051575  T
Q  218 cctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctata 317  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18051576 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctaca 18051675  T
Q  318 ctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051676 ccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 7073325 - 7073683
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7073325 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 7073424  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7073425 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7073524  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7073525 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctat 7073624  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7073625 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 28021388 - 28021746
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28021388 catcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28021487  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021488 tcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28021587  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021588 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctat 28021687  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28021688 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18277197 - 18276839
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18277197 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18277098  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18277097 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18276998  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18276997 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18276898  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18276897 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18307799 - 18307441
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18307799 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18307700  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18307699 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18307600  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18307599 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18307500  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18307499 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 48466040 - 48466398
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 48466139  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48466140 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 48466239  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  48466240 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccat 48466339  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48466340 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4346832 - 4346474
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4346832 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4346733  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4346732 tcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4346633  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  4346632 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 4346533  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  4346532 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18292498 - 18292140
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18292498 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18292399  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18292398 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18292299  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18292298 tcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccat 18292199  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18292198 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20576992 - 20576634
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20576992 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 20576893  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20576892 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 20576793  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20576792 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 20576693  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20576692 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28116084 - 28115741
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28116084 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcg 28115985  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28115984 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 28115885  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28115884 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgac 28115785  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28115784 atccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 8211851 - 8212209
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8211851 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8211950  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8211951 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8212050  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8212051 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8212150  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212151 gatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11110494 - 11110136
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11110494 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 11110395  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11110394 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 11110295  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11110294 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 11110195  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11110194 gctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 21674806 - 21675164
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21674806 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21674905  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
      || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21674906 ctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21675005  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  21675006 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 21675105  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21675106 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36997222 - 36996864
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36997222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 36997123  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36997122 tcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 36997023  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  36997022 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 36996923  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36996922 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 51782136 - 51782494
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51782136 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51782235  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51782236 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51782335  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  51782336 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 51782435  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  51782436 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 10396246 - 10396604
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396246 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 10396345  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10396346 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaac 10396445  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10396446 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 10396545  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10396546 gctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 4417047 - 4417390
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4417047 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 4417146  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4417147 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 4417246  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4417247 acacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagac 4417346  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4417347 atccaaaacttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29665100 - 29664757
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29665100 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 29665001  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29665000 acaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctct 29664901  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  29664900 acacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgac 29664801  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29664800 atccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 5467098 - 5467456
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5467098 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatg 5467197  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5467198 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5467297  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5467298 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5467397  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  5467398 gctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 18242852 - 18243210
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18242852 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18242951  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  18242952 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 18243051  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18243052 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 18243151  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  18243152 actgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5596502 - 5596144
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5596502 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5596403  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  5596402 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 5596303  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  5596302 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 5596203  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5596202 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22871001 - 22870643
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22871001 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22870902  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22870901 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22870802  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22870801 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 22870702  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22870701 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22886060 - 22885702
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22886060 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22885961  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22885960 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22885861  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22885860 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 22885761  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  22885760 actgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31964618 - 31964260
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31964618 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31964519  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31964518 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31964419  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  31964418 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 31964319  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||    
T  31964318 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5609467 - 5609109
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5609467 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5609368  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5609367 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 5609268  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5609267 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 5609168  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5609167 actgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 18225304 - 18225662
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18225304 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18225403  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18225404 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 18225503  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  18225504 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttat 18225603  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  18225604 accgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 28339430 - 28339773
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 131  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  28339430 ggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 28339529  T
Q  132 ataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28339530 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctct 28339629  T
Q  232 gcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  28339630 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgac 28339729  T
Q  332 atccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28339730 atccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6542607 - 6542249
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6542607 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 6542508  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  6542507 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 6542408  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  6542407 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 6542308  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  6542307 gctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagtgatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 5013825 - 5014183
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5013825 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5013924  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5013925 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5014024  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  5014025 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 5014124  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5014125 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 7996675 - 7997033
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7996675 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7996774  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  7996775 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 7996874  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  7996875 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 7996974  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7996975 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 10643183 - 10643541
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10643183 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10643282  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  10643283 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 10643382  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  10643383 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 10643482  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10643483 actgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17985101 - 17984743
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17985101 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 17985002  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17985001 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17984902  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17984901 tcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccat 17984802  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| || ||||||||    
T  17984801 attgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgatgatcttctgaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 24328272 - 24328630
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24328272 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24328371  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24328372 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24328471  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  24328472 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 24328571  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24328572 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 47023566 - 47023924
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47023566 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 47023665  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47023666 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 47023765  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  47023766 tcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 47023865  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  47023866 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 51797226 - 51797462
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51797226 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51797325  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51797326 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51797425  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagct 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51797426 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50134216 - 50133990
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50134216 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 50134117  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50134116 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 50134017  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagct 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50134016 tcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17993929 - 17993631
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  17993929 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 17993830  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  17993829 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 17993730  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993729 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgcta 17993631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 18530501 - 18530860
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  18530501 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 18530600  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||    
T  18530601 tccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaac 18530700  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||||| || | || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  18530701 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctat 18530800  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  18530801 gttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16626651 - 16626292
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  16626651 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16626552  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16626551 tccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaac 16626452  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  ||||  | |||| | | ||||||||||||||||||     
T  16626451 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctac 16626352  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||||    
T  16626351 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31034262 - 31033931
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  31034262 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 31034163  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  31034162 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 31034063  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  31034062 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 31033963  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31033962 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 31033931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 32292865 - 32293196
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  32292865 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 32292964  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  32292965 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 32293064  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  32293065 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 32293164  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32293165 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 32293196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 5713340 - 5713638
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  5713340 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5713439  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5713440 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5713539  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5713540 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 5724250 - 5724548
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  5724250 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5724349  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5724350 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5724449  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5724450 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5724548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5768118 - 5767820
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  5768118 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5768019  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5768018 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5767919  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5767918 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5767820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5757227 - 5757007
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  5757227 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5757128  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  5757127 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5757028  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacat 237  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  5757027 tcctctggtgccactacacat 5757007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 5652500 - 5652849
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  5652500 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 5652599  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| |||||    
T  5652600 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 5652699  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||     
T  5652700 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctac 5652799  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 366  Q
      ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  5652800 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 5652849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 32439267 - 32439418
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  32439267 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 32439366  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 168  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  32439367 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 20066156 - 20066307
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| |||     
T  20066156 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaata 20066255  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 168  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  20066256 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 4626057 - 4626355
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |    
T  4626057 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 4626156  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||  |||||| |||   || ||  ||||||| |||||    
T  4626157 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 4626256  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||| || |||||  || | |||  ||| || |||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  4626257 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 4626355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 4893323 - 4893387
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 81  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  4893323 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39814
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40173 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 40074  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40073 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 39974  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39973 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 39874  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39873 actgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataattttttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47089 - 46730
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47089 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 46990  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46989 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaac 46890  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46889 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctac 46790  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46789 actgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Original strand, 29918 - 30274
Alignment:
Q  20 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  120 cgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 30117  T
Q  220 tctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatact 319  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30118 tctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttact 30217  T
Q  320 gttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30218 gttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 27444 - 27804
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27543  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27544 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 27643  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27644 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctatttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 27743  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27744 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 30604 - 30964
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30604 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30703  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30704 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaac 30803  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30804 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 30903  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataa-ttttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30904 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttttttgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20730
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  20540 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 20638  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 208  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20639 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 6165 - 6524
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt-gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataat 115  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6165 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataat 6264  T
Q  116 gtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaa 215  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6265 gtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaa 6364  T
Q  216 ctcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 315  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6365 ctcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 6464  T
Q  316 tactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6465 tactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2021 - 1831
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  2021 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 1923  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 208  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1922 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9170 - 8812
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9170 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9071  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9070 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 8971  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  8970 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 8871  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8870 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 20167 - 20526
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20167 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 20266  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20267 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 20366  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20367 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 20466  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat-tttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20467 gctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctttctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 51638369 - 51638728
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51638369 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 51638468  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51638469 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 51638568  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  51638569 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 51638668  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51638669 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 10962821 - 10963179
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10962821 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10962920  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10962921 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 10963020  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10963021 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccat 10963120  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  10963121 actgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41793412 - 41793054
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41793412 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41793313  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41793312 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 41793213  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  41793212 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccat 41793113  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  41793112 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 28585132 - 28585490
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28585132 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28585231  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28585232 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28585331  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  28585332 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccat 28585431  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28585432 gctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16208135 - 16207776
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16208135 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 16208036  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  16208035 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 16207936  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16207935 tcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctat 16207836  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
       |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16207835 gtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20340439 - 20340080
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||     
T  20340439 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 20340340  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||    
T  20340339 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 20340240  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||      
T  20340239 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgc 20340140  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20340139 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 20461232 - 20461591
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||  |    
T  20461232 catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcg 20461331  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || | || ||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  20461332 tccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaac 20461431  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||  ||||   ||||||||||||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  20461432 tcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctac 20461531  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  20461532 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 28152013 - 28152344
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  28152013 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 28152112  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||   || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  ||||    
T  28152113 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 28152212  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||      
T  28152213 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgc 28152312  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28152313 gttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 28152344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26305 - 25947
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26305 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26206  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26205 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26106  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  26105 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttat 26006  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26005 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 9718 - 10076
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9718 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9817  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  9818 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 9917  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  9918 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccat 10017  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10018 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14675
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15034 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14935  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14934 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14835  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  14834 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 14735  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14734 actgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 6985
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7343 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7244  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7243 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7144  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  7143 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttat 7044  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  7043 actgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 8101 - 8459
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8101 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8200  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||    
T  8201 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 8300  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  8301 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccat 8400  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8401 gctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46912 - 46545
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc-tatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa-gctgactttt-gaga 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  46912 catcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgaga 46813  T
Q  111 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatga-tcgaagaatgtgaggca-gctccta-gacttgatgtccgtaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  46812 ataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaa 46713  T
Q  208 cgtcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg-atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tt 305  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46712 catcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttt 46613  T
Q  306 tgggttgctatactgttcaaga-cgacatcc-aaagcttgatgaatgataa-ttttttgactgttagt 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46612 tgggttgctttactgttcaagattgacatccaaaagcttgatgaatgataatttttttgactgttagt 46545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 1
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233 catcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 134  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 34  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 249  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2403
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||     
T  2762 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 2663  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||    
T  2662 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 2563  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||      
T  2562 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgc 2463  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 376  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  2462 gttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 383
Alignment:
Q  29 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 128  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  710 ctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatgtccctcatgttc 611  T
Q  129 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 228  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    | ||| | || ||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  610 ttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtacc 511  T
Q  229 tctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagac 328  Q
     || ||||| ||||| ||| |||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||| ||   ||||||  |     
T  510 gctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggttgttacgttgttcagaat 411  T
Q  329 gacatccaaagcttgatgaatgataatt 356  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  410 gacatccagagcctgatgaatgacaatt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 5
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || |    
T  132 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacg 33  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttcc 144  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  32 tccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 21713 - 22044
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |||||| |||| ||||    
T  21713 catcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatg 21812  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    | |||   || |||  | |||||||||||||| || |||||    
T  21813 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaac 21912  T
Q  217 tcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctat 316  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||| || |||||  | |||||||| |||||||||     
T  21913 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctac 22012  T
Q  317 actgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 348  Q
      ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  22013 gttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 241 - 458
Alignment:
Q  17 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 116  Q
    ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| || ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |     
T  241 catcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagta 340  T
Q  117 tcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 216  Q
      || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || ||    
T  341 ctcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtccgtaatgttgcgac 440  T
Q  217 tcctctggtgcctctgca 234  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  441 tcctttggtgcccctgca 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 518 - 595
Alignment:
Q  298 taatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 375  Q
    |||||| |||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  518 taatcccttgggttgccgcattgtgcaagaggatatccagagcttgatgaatgataatcatctgactgttagtgatgt 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University