View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8621_low_12 (Length: 355)

Name: NF8621_low_12
Description: NF8621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8621_low_12
NF8621_low_12
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (10-334)||(16041155-16041479)
chr7 (10-343)||(31088451-31088784)
chr7 (10-343)||(45733283-45733616)
chr7 (10-334)||(16449985-16450309)
chr7 (45-319)||(16503402-16503679)
chr7 (45-319)||(16518438-16518715)
chr7 (45-292)||(10916890-10917137)
chr7 (10-181)||(2108992-2109163)
chr7 (10-181)||(26484679-26484850)
chr7 (10-181)||(39211010-39211181)
chr7 (10-181)||(2775344-2775515)
chr7 (45-292)||(11424798-11425048)
chr7 (45-337)||(5127818-5128113)
chr7 (18-181)||(18540784-18540947)
chr7 (18-337)||(5159348-5159667)
chr7 (45-295)||(5147362-5147615)
chr7 (45-292)||(2154444-2154694)
chr7 (45-295)||(26435125-26435378)
chr7 (45-292)||(4145145-4145395)
chr7 (45-292)||(16736482-16736732)
chr7 (45-292)||(16751536-16751786)
chr7 (45-292)||(17529562-17529812)
chr7 (45-292)||(17523403-17523653)
chr7 (45-292)||(26319891-26320141)
chr7 (45-292)||(45387214-45387464)
chr7 (45-292)||(26275116-26275366)
chr7 (48-292)||(26669939-26670186)
chr7 (45-292)||(9618522-9618772)
chr7 (45-157)||(3445315-3445427)
chr7 (45-292)||(24592563-24592813)
chr7 (45-159)||(31564412-31564526)
chr7 (45-181)||(31124905-31125041)
chr7 (45-148)||(11441590-11441693)
chr7 (45-295)||(26537892-26538148)
chr7 (216-292)||(11441431-11441507)
chr7 (161-295)||(26485885-26486019)
chr7 (216-292)||(31124782-31124858)
chr7 (216-292)||(31564595-31564671)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (10-334)||(22888310-22888634)
chr5 (10-343)||(13184646-13184979)
chr5 (10-343)||(33877078-33877411)
chr5 (10-343)||(13440492-13440825)
chr5 (10-343)||(11325625-11325958)
chr5 (10-319)||(25198884-25199193)
chr5 (10-319)||(23892058-23892370)
chr5 (45-319)||(24969876-24970147)
chr5 (10-193)||(29889080-29889263)
chr5 (38-292)||(30934515-30934769)
chr5 (45-292)||(23718021-23718271)
chr5 (45-292)||(23752483-23752733)
chr5 (38-319)||(24688183-24688467)
chr5 (45-289)||(11549236-11549483)
chr5 (45-337)||(33777321-33777616)
chr5 (45-292)||(22999147-22999397)
chr5 (18-337)||(33292362-33292681)
chr5 (45-292)||(32599505-32599752)
chr5 (45-292)||(34616400-34616647)
chr5 (45-292)||(8665508-8665758)
chr5 (17-292)||(9548548-9548826)
chr5 (45-338)||(18375445-18375741)
chr5 (45-338)||(30168302-30168598)
chr5 (45-292)||(15658793-15659043)
chr5 (45-292)||(15758890-15759140)
chr5 (45-292)||(12132034-12132284)
chr5 (45-291)||(41674589-41674838)
chr5 (45-338)||(33516189-33516485)
chr5 (45-181)||(2511044-2511180)
chr5 (45-292)||(26480271-26480521)
chr5 (45-292)||(6874181-6874434)
chr5 (45-292)||(5637789-5638039)
chr5 (45-292)||(9317330-9317580)
chr5 (45-292)||(30151897-30152147)
chr5 (45-159)||(37671516-37671630)
chr5 (45-292)||(29967099-29967349)
chr5 (45-292)||(31431307-31431569)
chr5 (45-159)||(28649250-28649364)
chr5 (45-292)||(43078128-43078381)
chr5 (45-181)||(28959819-28959955)
chr5 (45-292)||(30029294-30029544)
chr5 (45-157)||(31826440-31826552)
chr5 (45-181)||(37358676-37358812)
chr5 (45-159)||(37771020-37771134)
chr5 (216-295)||(3789402-3789481)
chr5 (45-159)||(3789556-3789670)
chr5 (45-159)||(18500763-18500877)
chr5 (45-159)||(37754995-37755109)
chr5 (216-292)||(18500955-18501031)
chr5 (216-292)||(28649105-28649181)
chr5 (216-292)||(37358862-37358938)
chr5 (216-292)||(37671699-37671775)
chr5 (222-292)||(24681316-24681386)
chr5 (222-292)||(24723843-24723913)
chr5 (18-159)||(13324835-13324976)
chr5 (216-292)||(13325051-13325127)
chr5 (216-292)||(28960005-28960081)
chr5 (216-292)||(31826626-31826702)
chr5 (216-292)||(37754847-37754923)
chr5 (216-292)||(37771206-37771282)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (10-334)||(21703254-21703578)
chr2 (10-343)||(27118506-27118839)
chr2 (10-343)||(34303393-34303726)
chr2 (10-343)||(34156829-34157162)
chr2 (10-343)||(3784472-3784805)
chr2 (10-343)||(16163417-16163750)
chr2 (45-342)||(31891453-31891750)
chr2 (10-334)||(19456511-19456835)
chr2 (10-319)||(27434534-27434846)
chr2 (45-319)||(23128691-23128968)
chr2 (10-338)||(27392813-27393120)
chr2 (38-292)||(28882080-28882337)
chr2 (45-319)||(12655381-12655658)
chr2 (38-310)||(20837766-20838041)
chr2 (45-292)||(21677307-21677557)
chr2 (45-292)||(34279315-34279565)
chr2 (45-292)||(11635311-11635564)
chr2 (45-289)||(34286223-34286470)
chr2 (45-289)||(34291283-34291530)
chr2 (45-292)||(11641500-11641753)
chr2 (60-292)||(13936684-13936919)
chr2 (45-292)||(22926153-22926403)
chr2 (45-292)||(37925359-37925609)
chr2 (45-292)||(16829463-16829713)
chr2 (45-292)||(16891768-16892018)
chr2 (45-292)||(31876147-31876397)
chr2 (45-292)||(32049664-32049914)
chr2 (45-292)||(37686034-37686284)
chr2 (45-292)||(37701299-37701549)
chr2 (45-295)||(37375024-37375277)
chr2 (45-292)||(34861546-34861796)
chr2 (10-157)||(40233515-40233662)
chr2 (45-292)||(19416624-19416874)
chr2 (161-292)||(261009-261140)
chr2 (45-181)||(39890054-39890190)
chr2 (45-148)||(260878-260981)
chr2 (216-295)||(40233362-40233441)
chr2 (222-292)||(12716910-12716980)
chr2 (60-181)||(12716742-12716863)
chr2 (222-295)||(39052133-39052206)
chr2 (216-292)||(12586667-12586743)
chr2 (216-292)||(27803558-27803634)
chr2 (216-292)||(39889928-39890004)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (10-343)||(2759-3092)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (10-343)||(13522117-13522450)
chr6 (10-343)||(33374300-33374633)
chr6 (10-343)||(8892354-8892687)
chr6 (10-343)||(8903589-8903922)
chr6 (10-342)||(28162477-28162809)
chr6 (10-334)||(22477317-22477644)
chr6 (12-295)||(20160568-20160851)
chr6 (12-295)||(22171980-22172263)
chr6 (10-205)||(22456978-22457176)
chr6 (10-193)||(27290414-27290597)
chr6 (10-319)||(22934924-22935233)
chr6 (10-319)||(23857369-23857678)
chr6 (10-181)||(14143329-14143500)
chr6 (10-181)||(26787925-26788096)
chr6 (10-181)||(27196298-27196469)
chr6 (10-181)||(27252771-27252942)
chr6 (45-337)||(24304697-24304992)
chr6 (45-319)||(13299030-13299307)
chr6 (45-319)||(15424396-15424673)
chr6 (45-292)||(26988868-26989118)
chr6 (45-292)||(26999940-27000190)
chr6 (45-337)||(29549300-29549592)
chr6 (45-292)||(16749721-16749971)
chr6 (45-319)||(24863557-24863834)
chr6 (45-337)||(26918202-26918497)
chr6 (45-292)||(4525156-4525403)
chr6 (45-292)||(27044257-27044504)
chr6 (10-258)||(27272624-27272878)
chr6 (45-338)||(30558095-30558391)
chr6 (45-292)||(29572880-29573130)
chr6 (45-337)||(29501228-29501532)
chr6 (45-159)||(4773009-4773123)
chr6 (45-292)||(4757628-4757881)
chr6 (45-157)||(3696086-3696198)
chr6 (45-181)||(26777694-26777830)
chr6 (45-148)||(4545854-4545957)
chr6 (45-148)||(4724213-4724316)
chr6 (161-292)||(27629907-27630038)
chr6 (45-148)||(28207468-28207571)
chr6 (45-157)||(16674144-16674256)
chr6 (45-292)||(16944106-16944356)
chr6 (45-181)||(27485110-27485246)
chr6 (45-159)||(27007730-27007844)
chr6 (45-181)||(27360071-27360207)
chr6 (45-181)||(27450414-27450550)
chr6 (45-159)||(26116489-26116603)
chr6 (216-292)||(3695930-3696006)
chr6 (216-292)||(4546037-4546113)
chr6 (216-292)||(4724396-4724472)
chr6 (216-292)||(17025129-17025205)
chr6 (216-292)||(26777880-26777956)
chr6 (216-292)||(27007579-27007655)
chr6 (216-292)||(28207309-28207385)
chr6 (45-157)||(34463425-34463537)
chr6 (216-295)||(16673991-16674070)
chr6 (60-159)||(17025280-17025379)
chr6 (171-292)||(27484984-27485105)
chr6 (216-292)||(4772864-4772940)
chr6 (216-292)||(26116672-26116748)
chr6 (216-292)||(27360263-27360339)
chr6 (216-292)||(27450606-27450682)
chr6 (216-292)||(34463614-34463690)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (10-343)||(20340436-20340769)
chr1 (10-299)||(16208132-16208418)
chr1 (17-334)||(20460935-20461228)
chr1 (10-181)||(28151845-28152016)
chr1 (45-292)||(41793444-41793694)
chr1 (45-337)||(28584805-28585100)
chr1 (45-292)||(10962539-10962789)
chr1 (45-292)||(51638087-51638337)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (10-334)||(15227716-15228040)
chr4 (10-343)||(24460706-24461039)
chr4 (10-334)||(1900103-1900427)
chr4 (10-334)||(15285029-15285353)
chr4 (10-334)||(14235626-14235953)
chr4 (10-338)||(15391439-15391764)
chr4 (17-310)||(17013867-17014163)
chr4 (45-337)||(24592450-24592742)
chr4 (45-337)||(14664858-14665153)
chr4 (45-295)||(14763440-14763693)
chr4 (18-337)||(34189069-34189388)
chr4 (18-336)||(24112506-24112824)
chr4 (45-292)||(6569738-6569988)
chr4 (45-295)||(36344651-36344901)
chr4 (45-337)||(14098381-14098676)
chr4 (45-292)||(27163453-27163703)
chr4 (45-337)||(31126654-31126949)
chr4 (45-337)||(54833230-54833522)
chr4 (45-292)||(5005755-5006008)
chr4 (45-159)||(18800749-18800863)
chr4 (123-292)||(21969586-21969758)
chr4 (45-157)||(30753777-30753889)
chr4 (45-292)||(40105774-40106024)
chr4 (45-157)||(33673934-33674046)
chr4 (236-337)||(19373101-19373202)
chr4 (216-292)||(18800932-18801008)
chr4 (216-292)||(30753627-30753703)
chr4 (216-295)||(33674120-33674199)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (10-343)||(9354444-9354777)
chr8 (10-343)||(19659099-19659432)
chr8 (10-343)||(44562923-44563256)
chr8 (10-319)||(16283292-16283604)
chr8 (10-338)||(22080938-22081263)
chr8 (10-181)||(33244649-33244820)
chr8 (45-292)||(27609000-27609250)
chr8 (45-319)||(2137354-2137631)
chr8 (45-292)||(14557497-14557744)
chr8 (38-319)||(16277397-16277681)
chr8 (45-337)||(19687923-19688218)
chr8 (17-337)||(18710411-18710734)
chr8 (45-292)||(31354394-31354644)
chr8 (45-337)||(31489845-31490140)
chr8 (45-337)||(19286290-19286582)
chr8 (45-292)||(19208455-19208705)
chr8 (45-292)||(28362050-28362300)
chr8 (45-292)||(19674308-19674561)
chr8 (45-159)||(3329602-3329716)
chr8 (45-292)||(33258593-33258843)
chr8 (45-159)||(12092819-12092933)
chr8 (36-159)||(29829328-29829451)
chr8 (216-292)||(3329788-3329864)
chr8 (216-292)||(19518412-19518488)
chr8 (216-292)||(29829183-29829259)
chr8 (216-292)||(12093002-12093078)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (10-343)||(17993926-17994259)
chr3 (10-343)||(4625727-4626060)
chr3 (10-343)||(5652170-5652503)
chr3 (10-334)||(16626648-16626972)
chr3 (10-334)||(18530186-18530504)
chr3 (45-343)||(5713007-5713308)
chr3 (45-343)||(5723917-5724218)
chr3 (45-343)||(5757259-5757560)
chr3 (45-343)||(5768150-5768451)
chr3 (45-337)||(8301444-8301736)
chr3 (38-337)||(15892876-15893178)
chr3 (10-181)||(32292697-32292868)
chr3 (10-181)||(31034259-31034430)
chr3 (38-319)||(8295779-8296060)
chr3 (45-337)||(22387755-22388047)
chr3 (38-319)||(18051066-18051350)
chr3 (45-292)||(4796830-4797080)
chr3 (45-337)||(35880552-35880847)
chr3 (45-292)||(29148932-29149182)
chr3 (45-337)||(18330460-18330750)
chr3 (45-295)||(18277229-18277482)
chr3 (45-295)||(18292530-18292783)
chr3 (45-295)||(18307831-18308084)
chr3 (45-338)||(17985133-17985429)
chr3 (18-336)||(32438944-32439262)
chr3 (45-337)||(4721417-4721712)
chr3 (60-337)||(4892999-4893276)
chr3 (45-337)||(6192102-6192397)
chr3 (45-337)||(8211527-8211819)
chr3 (45-292)||(4346864-4347111)
chr3 (45-289)||(10395970-10396214)
chr3 (45-292)||(5466816-5467066)
chr3 (45-292)||(7996393-7996643)
chr3 (45-292)||(10642901-10643151)
chr3 (60-292)||(20065877-20066109)
chr3 (45-292)||(15741271-15741509)
chr3 (45-292)||(28021109-28021356)
chr3 (45-292)||(7073043-7073293)
chr3 (45-292)||(47023284-47023534)
chr3 (45-292)||(28116131-28116384)
chr3 (45-292)||(5609499-5609749)
chr3 (45-292)||(31964650-31964900)
chr3 (45-292)||(50134248-50134498)
chr3 (45-337)||(18224977-18225272)
chr3 (45-337)||(21674479-21674774)
chr3 (45-292)||(28339133-28339383)
chr3 (45-159)||(6542639-6542753)
chr3 (45-292)||(4416747-4417000)
chr3 (45-337)||(5596534-5596838)
chr3 (45-292)||(5013543-5013793)
chr3 (45-157)||(36997254-36997366)
chr3 (216-295)||(29665336-29665415)
chr3 (45-157)||(11110526-11110638)
chr3 (45-181)||(18242684-18242820)
chr3 (45-292)||(24327990-24328240)
chr3 (216-292)||(11110712-11110788)
chr3 (45-157)||(48465896-48466008)
chr3 (45-97)||(51782052-51782104)
chr3 (41-97)||(51797141-51797197)
chr3 (45-160)||(22871033-22871148)
chr3 (45-160)||(22886092-22886207)
chr3 (216-292)||(6542825-6542901)
chr3 (216-292)||(36997440-36997516)
chr3 (60-181)||(20577039-20577160)
chr3 (216-337)||(22871225-22871346)
chr3 (216-337)||(22886284-22886405)
chr3 (216-292)||(20577213-20577289)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (10-334)||(20240-20543)
scaffold0124 (45-319)||(30296-30572)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (10-193)||(129-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-338)||(21391-21716)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (45-311)||(29614-29883)
scaffold0089 (38-311)||(40198-40474)
scaffold0089 (45-292)||(47121-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (45-319)||(27135-27412)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (38-337)||(258-561)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (10-95)||(2018-2103)
scaffold0415 (45-97)||(6080-6132)
scaffold0415 (216-292)||(5859-5936)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (45-338)||(15066-15362)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (45-292)||(7375-7625)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (45-292)||(9202-9452)
scaffold0159 (45-292)||(19885-20135)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (45-181)||(26338-26474)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (45-189)||(9542-9686)
scaffold0336 (182-292)||(8102-8212)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (45-148)||(7966-8069)
scaffold0038 (216-292)||(7807-7883)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (216-292)||(43-119)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16041479 - 16041155
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041479 gatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16041380  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041379 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16041280  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16041279 acgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 16041180  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16041179 acgacggaggtaactgggcagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 31088451 - 31088784
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31088451 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 31088550  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  31088551 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 31088650  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45733616 - 45733283
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45733616 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 45733517  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
       |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  45733516 taagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 45733417  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 16449985 - 16450309
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449985 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16450084  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16450085 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctga 16450184  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16450185 acgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggt 16450284  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16450285 acgacggaggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 16503402 - 16503679
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  16503402 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 16503501  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16503502 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacc 16503601  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16503602 cggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 16518438 - 16518715
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  16518438 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 16518537  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16518538 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacc 16518637  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16518638 cggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 10916890 - 10917137
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  10916890 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 10916989  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  10916990 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccgg 10917089  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917090 tggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 2108992 - 2109163
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108992 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2109091  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2109092 cgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26484850 - 26484679
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484850 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 26484751  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26484750 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 39211010 - 39211181
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211010 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 39211109  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  39211110 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2775515 - 2775344
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775515 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2775416  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    ||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  2775415 cgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 11424798 - 11425048
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  11424798 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 11424897  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  11424898 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 11424997  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424998 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 11425048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5128113 - 5127818
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  5128113 ggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 5128014  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  5128013 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacc 5127914  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5127913 cggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18540947 - 18540784
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18540947 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 18540848  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18540847 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5159667 - 5159348
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  5159667 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 5159568  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 217  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  5159567 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 5159468  T
Q  218 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 317  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  5159467 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 5159368  T
Q  318 ggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || | |||||||||||||||    
T  5159367 ggaaactgagcagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 5147362 - 5147615
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5147362 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5147461  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5147462 gaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacc 5147561  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5147562 cggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2154694 - 2154444
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  2154694 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 2154595  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||| |||||||||| ||||  |||||||   |||||||  |   ||||||||  || || ||| | |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  2154594 ggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacc 2154495  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2154494 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 2154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26435378 - 26435125
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  26435378 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 26435279  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26435278 gaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacc 26435179  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435178 cggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 4145145 - 4145395
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  4145145 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 4145244  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  4145245 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 4145344  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4145345 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4145395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 16736482 - 16736732
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  16736482 ggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 16736581  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16736582 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 16736681  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16736682 cggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16736732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 16751536 - 16751786
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  16751536 ggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 16751635  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16751636 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 16751735  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16751736 cggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16751786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 17529562 - 17529812
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  17529562 ggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 17529661  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  17529662 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 17529761  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529762 cggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17529812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17523653 - 17523403
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  17523653 ggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 17523554  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  17523553 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 17523454  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17523453 cggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17523403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 26319891 - 26320141
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  26319891 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 26319990  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  26319991 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 26320090  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26320091 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26320141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45387464 - 45387214
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  45387464 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 45387365  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  45387364 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 45387265  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  45387264 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 45387214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 26275116 - 26275366
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  26275116 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 26275215  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  26275216 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 26275315  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26275316 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26275366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 292
Target Start/End: Original strand, 26669939 - 26670186
Alignment:
Q  48 ggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaa 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |    
T  26669939 ggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggga 26670038  T
Q  148 aggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||     
T  26670039 aagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccgg 26670138  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26670139 cggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26670186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9618772 - 9618522
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  9618772 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 9618673  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  9618672 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 9618573  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9618572 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 9618522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3445427 - 3445315
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  3445427 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 3445328  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  3445327 gaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 24592563 - 24592813
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  24592563 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 24592662  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  24592663 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 24592762  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  24592763 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 24592813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 31564412 - 31564526
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  31564412 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 31564511  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  31564512 gaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31125041 - 31124905
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  31125041 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 31124942  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  31124941 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11441693 - 11441590
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||||  |||    
T  11441693 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggag 11441594  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  11441593 gaaa 11441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 26537892 - 26538148
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  26537892 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggag 26537991  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgc------tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    |||| || ||||| |  | ||| |||      |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26537992 gaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttg 26538091  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26538092 acccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26538148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441431
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 295
Target Start/End: Original strand, 26485885 - 26486019
Alignment:
Q  161 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  26485885 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactga 26485984  T
Q  261 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26485985 tggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26486019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31124858 - 31124782
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31124858 gcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31124782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 31564595 - 31564671
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31564595 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 31564671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22888634 - 22888310
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888634 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagt 22888535  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888534 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 22888435  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22888434 acgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 22888335  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  22888334 acgacggaggtaactgggcagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 13184646 - 13184979
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13184646 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13184745  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13184746 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13184845  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33877411 - 33877078
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877411 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33877312  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  33877311 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33877212  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 13440492 - 13440825
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13440492 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13440591  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13440592 cgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13440691  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11325958 - 11325625
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11325958 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 11325859  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  11325858 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 11325759  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11325758 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 11325659  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325658 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25199193 - 25198884
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199193 gatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 25199094  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199093 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 25198994  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25198993 acgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggt 25198894  T
Q  310 acaacggagg 319  Q
    || |||||||    
T  25198893 acgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23892370 - 23892058
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892370 gatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 23892271  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgc 206  Q
    ||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23892270 cggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgc 23892171  T
Q  207 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  23892170 tgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 23892071  T
Q  307 ggtacaacggagg 319  Q
    ||||| |||||||    
T  23892070 ggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24970147 - 24969876
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  24970147 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 24970048  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | || ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24970047 ggaaagtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgg 24969951  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||    
T  24969950 tggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 29889080 - 29889263
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29889080 gatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagt 29889179  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 193  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  29889180 tgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30934769 - 30934515
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  30934769 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 30934670  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 237  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  30934669 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 30934570  T
Q  238 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934569 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 30934515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 23718021 - 23718271
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  23718021 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 23718120  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23718121 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 23718220  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23718221 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 23752483 - 23752733
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  23752483 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 23752582  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23752583 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 23752682  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23752683 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23752733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 319
Target Start/End: Original strand, 24688183 - 24688467
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  24688183 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggt 24688282  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  | |||||||||||| ||||    
T  24688283 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgag 24688382  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24688383 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11549483 - 11549236
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  11549483 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 11549384  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  11549383 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 11549284  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 289  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11549283 cggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctg 11549236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33777616 - 33777321
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  33777616 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 33777517  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  33777516 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 33777417  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  33777416 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 22999147 - 22999397
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22999147 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 22999246  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22999247 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 22999346  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22999347 cggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 22999397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33292681 - 33292362
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  33292681 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 33292582  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 217  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  33292581 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 33292482  T
Q  218 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 317  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  33292481 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 33292382  T
Q  318 ggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || | |||||||||||||||    
T  33292381 ggaaactgagcagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 32599505 - 32599752
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  32599505 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 32599604  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || |     
T  32599605 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccggg 32599704  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  32599705 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 32599752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34616647 - 34616400
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  34616647 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 34616548  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||  || |     
T  34616547 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccggg 34616448  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34616447 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 8665508 - 8665758
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  8665508 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 8665607  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  8665608 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacc 8665707  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || || || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8665708 cggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 8665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Original strand, 9548548 - 9548826
Alignment:
Q  17 atcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 116  Q
    |||||||||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  9548548 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 9548647  T
Q  117 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 213  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  9548648 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 9548747  T
Q  214 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9548748 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 9548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 18375445 - 18375741
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  18375445 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggag 18375544  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  18375545 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 18375644  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  18375645 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30168598 - 30168302
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  30168598 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 30168499  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  30168498 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 30168399  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30168398 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 15658793 - 15659043
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  15658793 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggag 15658892  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15658893 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 15658992  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  15658993 cggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgaga 15659043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 15758890 - 15759140
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  15758890 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 15758989  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  15758990 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 15759089  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15759090 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 15759140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12132284 - 12132034
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  12132284 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 12132185  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  12132184 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 12132085  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12132084 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 12132034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41674838 - 41674589
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||    
T  41674838 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggag 41674739  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  41674738 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacc 41674639  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgag 291  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  41674638 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33516485 - 33516189
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  33516485 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 33516386  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  33516385 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 33516286  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  33516285 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2511180 - 2511044
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  2511180 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 2511081  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  2511080 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26480521 - 26480271
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  26480521 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 26480422  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  26480421 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 26480322  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26480321 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26480271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6874434 - 6874181
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  6874434 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggag 6874335  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| ||    
T  6874334 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctg 6874235  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6874234 gcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5638039 - 5637789
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5638039 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5637940  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  5637939 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 5637840  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5637839 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5637789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9317580 - 9317330
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  9317580 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 9317481  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  9317480 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 9317381  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9317380 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 9317330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30152147 - 30151897
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  30152147 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 30152048  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  30152047 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 30151948  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  30151947 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 30151897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 37671516 - 37671630
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37671516 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 37671615  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  37671616 gaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 29967099 - 29967349
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  29967099 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 29967198  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  29967199 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 29967298  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29967299 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29967349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31431569 - 31431307
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  31431569 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 31431470  T
Q  145 gaaaggtaggtctag---------------cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtac 229  Q
    |||| || || ||||                |||||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||||||    
T  31431469 gaaaagttggcctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtac 31431370  T
Q  230 ctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31431369 ttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31431307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28649364 - 28649250
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  28649364 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 28649265  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  28649264 gaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43078381 - 43078128
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  43078381 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 43078282  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctg------ttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    |||| || ||||| |  | ||| |||||      |||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  43078281 gaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttg 43078182  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  43078181 acccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 43078128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 28959819 - 28959955
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  28959819 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 28959918  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  28959919 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 28959955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30029544 - 30029294
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  30029544 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 30029445  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  30029444 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 30029345  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  30029344 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 30029294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 31826440 - 31826552
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  31826440 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 31826539  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  31826540 gaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 37358676 - 37358812
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  37358676 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggag 37358775  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  37358776 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 37771020 - 37771134
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37771020 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 37771119  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  37771120 gaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789402
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 3789402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3789670 - 3789556
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  3789670 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 3789571  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  3789570 gaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 18500763 - 18500877
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  18500763 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggag 18500862  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  18500863 gaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37755109 - 37754995
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37755109 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 37755010  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  37755009 gaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501031
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 18501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28649181 - 28649105
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28649181 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37358938
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 37671699 - 37671775
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37671699 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37671775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24681386 - 24681316
Alignment:
Q  222 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  24681386 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 24681316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24723913 - 24723843
Alignment:
Q  222 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  24723913 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 24723843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 13324835 - 13324976
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  13324835 tcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 13324934  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
      || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  13324935 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 13325051 - 13325127
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13325051 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 13325127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 28960005 - 28960081
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28960005 gcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28960081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 31826626 - 31826702
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31826626 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31826702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37754923 - 37754847
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37754923 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37754847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 37771206 - 37771282
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37771206 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37771282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 21703254 - 21703578
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703254 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 21703353  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21703354 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttga 21703453  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21703454 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 21703553  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||  ||||||||    
T  21703554 acgacggaggtaactaggcagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27118839 - 27118506
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27118839 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 27118740  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  27118739 cgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 27118640  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27118639 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggt 27118540  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118539 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 34303393 - 34303726
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34303393 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34303492  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  34303493 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34303592  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34303593 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34303692  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303693 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34157162 - 34156829
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34157162 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34157063  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  34157062 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34156963  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3784805 - 3784472
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3784805 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 3784706  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  3784705 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 3784606  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16163750 - 16163417
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16163750 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 16163651  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  16163650 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 16163551  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Original strand, 31891453 - 31891750
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  31891453 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagag 31891552  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31891553 gaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccga 31891652  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891653 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 19456511 - 19456835
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456511 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagt 19456610  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19456611 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaa 19456710  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19456711 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggt 19456810  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  19456811 acgacggaggtaactgggcagcatt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 27434534 - 27434846
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||     
T  27434534 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagc 27434633  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 206  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||     
T  27434634 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 27434733  T
Q  207 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
    ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  27434734 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 27434833  T
Q  307 ggtacaacggagg 319  Q
    ||||| |||||||    
T  27434834 ggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 23128691 - 23128968
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  23128691 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 23128790  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23128791 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 23128890  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  23128891 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27393120 - 27392813
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  27393120 gatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 27393021  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||                     |||||||||||||    
T  27393020 cgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttg---------------------ttgcatttgctga 27392942  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  27392941 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 27392842  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    ||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  27392841 acggtggaggtagctgagcagcatcgatg 27392813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28882337 - 28882080
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  28882337 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28882238  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  28882237 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 28882138  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28882137 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 28882080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12655658 - 12655381
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  12655658 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 12655559  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12655558 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 12655459  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  12655458 cggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20838041 - 20837766
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  20838041 gaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20837942  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  20837941 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 20837842  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 310  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  20837841 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 20837766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 21677307 - 21677557
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  21677307 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 21677406  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21677407 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacc 21677506  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21677507 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 21677557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34279565 - 34279315
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  34279565 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 34279466  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  34279465 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 34279366  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34279365 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 34279315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 11635311 - 11635564
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  11635311 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 11635410  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  11635411 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttg 11635510  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11635511 acccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11635564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34286470 - 34286223
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  34286470 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggag 34286371  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  34286370 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacc 34286271  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 289  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34286270 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34286223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34291530 - 34291283
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  34291530 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggag 34291431  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  34291430 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacc 34291331  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 289  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34291330 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 11641500 - 11641753
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||| |||    
T  11641500 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggag 11641599  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  11641600 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttg 11641699  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11641700 acccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11641753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 292
Target Start/End: Original strand, 13936684 - 13936919
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13936684 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgg 13936783  T
Q  160 cttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 256  Q
    |||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  13936784 cttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggta 13936883  T
Q  257 ctgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13936884 ctgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 13936919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 22926153 - 22926403
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  22926153 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 22926252  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  22926253 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 22926352  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22926353 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 22926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37925609 - 37925359
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  37925609 ggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggag 37925510  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37925509 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacc 37925410  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37925409 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 16829463 - 16829713
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  16829463 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 16829562  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  16829563 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 16829662  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16829663 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16892018 - 16891768
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  16892018 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 16891919  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  16891918 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 16891819  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16891818 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16891768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31876397 - 31876147
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||||  |||    
T  31876397 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggag 31876298  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  31876297 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 31876198  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31876197 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31876147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32049914 - 32049664
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  32049914 ggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 32049815  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  32049814 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 32049715  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32049714 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 32049664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 37686034 - 37686284
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  37686034 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 37686133  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  37686134 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 37686233  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37686234 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37686284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 37701299 - 37701549
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  37701299 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 37701398  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  37701399 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 37701498  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37701499 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37701549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37375277 - 37375024
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  37375277 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggag 37375178  T
Q  145 gaaaggtaggtctag---cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || |||||||    ||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||| ||| | |||| || || ||||||||||| ||    
T  37375177 gaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcc 37375078  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  37375077 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagta 37375024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34861796 - 34861546
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  34861796 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 34861697  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  34861696 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 34861597  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34861596 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34861546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40233662 - 40233515
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||    
T  40233662 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagt 40233563  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 157  Q
     || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233562 tggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 19416624 - 19416874
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  19416624 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 19416723  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  19416724 ggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 19416823  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19416824 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19416874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261140
Alignment:
Q  161 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 260  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  261 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  261109 tgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 261140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39890190 - 39890054
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  39890190 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 39890091  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  39890090 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 39890054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 260878 - 260981
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  260878 ggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 260977  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  260978 gaaa 260981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40233441 - 40233362
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40233441 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 40233362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 12716910 - 12716980
Alignment:
Q  222 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12716910 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 12716980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Original strand, 12716742 - 12716863
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  12716742 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 12716841  T
Q  160 cttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  12716842 tatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 295
Target Start/End: Original strand, 39052133 - 39052206
Alignment:
Q  222 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39052133 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 39052206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12586743 - 12586667
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12586743 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 12586667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27803634 - 27803558
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27803634 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 27803558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39890004 - 39889928
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  39890004 gcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 39889928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 2759 - 3092
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2759 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 2858  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
     ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  2859 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 2958  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2959 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 3058  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 13522117 - 13522450
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522117 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13522216  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  13522217 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13522316  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 33374300 - 33374633
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33374300 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33374399  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  33374400 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33374499  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 8892354 - 8892687
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8892354 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8892453  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  8892454 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8892553  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8892554 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8892653  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892654 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 8903589 - 8903922
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8903589 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8903688  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  8903689 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8903788  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8903789 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8903888  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903889 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28162809 - 28162477
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28162809 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 28162710  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  28162709 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 28162610  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162609 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 28162510  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 342  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162509 acgatggaggtagctgagcagcattgatgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 22477317 - 22477644
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22477317 gatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagt 22477416  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  22477417 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgt 22477516  T
Q  207 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
    ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22477517 tgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacg 22477616  T
Q  307 ggtacaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    ||||| || ||||||  || ||||||||    
T  22477617 ggtacgacagaggtaattgggcagcatt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20160851 - 20160568
Alignment:
Q  12 tggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 111  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  20160851 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 20160752  T
Q  112 ggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaac 211  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  20160751 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 20160652  T
Q  212 gacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20160651 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 20160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Original strand, 22171980 - 22172263
Alignment:
Q  12 tggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 111  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  22171980 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 22172079  T
Q  112 ggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaac 211  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  22172080 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 22172179  T
Q  212 gacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22172180 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 22172263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 22456978 - 22457176
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22456978 gatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagt 22457077  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22457078 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 27290414 - 27290597
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290414 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 27290513  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 193  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  27290514 cgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 22934924 - 22935233
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  22934924 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 22935023  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || |||    
T  22935024 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 22935123  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
     | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  22935124 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 22935223  T
Q  310 acaacggagg 319  Q
    |  |||||||    
T  22935224 atgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 23857369 - 23857678
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  23857369 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 23857468  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || |||    
T  23857469 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 23857568  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
     | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  23857569 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 23857668  T
Q  310 acaacggagg 319  Q
    |  |||||||    
T  23857669 atgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 14143329 - 14143500
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14143329 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 14143428  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14143429 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26788096 - 26787925
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26788096 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 26787997  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26787996 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27196469 - 27196298
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27196469 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27196370  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27196369 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 27252771 - 27252942
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27252771 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27252870  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27252871 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 24304697 - 24304992
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  24304697 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 24304796  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  24304797 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 24304896  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  24304897 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 13299030 - 13299307
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  13299030 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 13299129  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  13299130 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 13299229  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  13299230 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 15424396 - 15424673
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  15424396 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 15424495  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  15424496 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 15424595  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  15424596 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26989118 - 26988868
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  26989118 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 26989019  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || || ||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  26989018 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 26988919  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26988918 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27000190 - 26999940
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27000190 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 27000091  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27000090 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacc 26999991  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26999990 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26999940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29549592 - 29549300
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  29549592 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 29549493  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  29549492 gaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 29549393  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29549392 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16749971 - 16749721
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  16749971 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 16749872  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  16749871 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 16749772  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16749771 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16749721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24863834 - 24863557
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  24863834 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 24863735  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| || |||||||     
T  24863734 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgact 24863635  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24863634 cggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26918497 - 26918202
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  26918497 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 26918398  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| | | || ||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26918397 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacc 26918298  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  26918297 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4525403 - 4525156
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4525403 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 4525304  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || |     
T  4525303 gaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctgg 4525204  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4525203 tggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4525156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27044504 - 27044257
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  27044504 ggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggag 27044405  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  27044404 gaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 27044305  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27044304 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 27044257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27272624 - 27272878
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  27272624 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagt 27272723  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgt------tgaactggtggctgttgttgcatt 203  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||  |||| |||| ||||||||||      ||||||||||| |||||| || |     
T  27272724 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttc 27272823  T
Q  204 tgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 258  Q
    ||||| || |  ||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  27272824 tgctgcacaatagcattcacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggatact 27272878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 30558095 - 30558391
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  30558095 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 30558194  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  30558195 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 30558294  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30558295 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29573130 - 29572880
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  29573130 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 29573031  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  29573030 gaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 29572931  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29572930 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29572880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29501532 - 29501228
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  29501532 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 29501433  T
Q  145 gaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctg 232  Q
    | ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || |||||    
T  29501432 ggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctg 29501333  T
Q  233 aggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagca 332  Q
    |||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| |||    
T  29501332 aggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgca 29501233  T
Q  333 ttgat 337  Q
    |||||    
T  29501232 ttgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4773123 - 4773009
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4773123 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 4773024  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  4773023 gaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4757881 - 4757628
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4757881 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 4757782  T
Q  145 gaaaggtaggtctag----ct--tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    |||| || |||||||    ||  || || || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| ||    
T  4757781 gaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctg 4757682  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4757681 gcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 4757628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3696198 - 3696086
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3696198 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 3696099  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  3696098 gaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 26777694 - 26777830
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||||||||| |||||  |||    
T  26777694 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggag 26777793  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    | ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  26777794 ggaaggttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 26777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 4545854 - 4545957
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4545854 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 4545953  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  4545954 gaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 4724213 - 4724316
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  4724213 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 4724312  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  4724313 gaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630038
Alignment:
Q  161 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 260  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || | || || || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  261 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28207571 - 28207468
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  28207571 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 28207472  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  28207471 gaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16674256 - 16674144
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  16674256 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 16674157  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  16674156 gaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 16944106 - 16944356
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  16944106 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 16944205  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| |||   || ||||| |||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  16944206 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 16944305  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16944306 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16944356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27485246 - 27485110
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  27485246 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 27485147  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27485146 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27007844 - 27007730
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  27007844 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 27007745  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  27007744 gaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 27360071 - 27360207
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  27360071 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 27360170  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27360171 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 27450414 - 27450550
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  27450414 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 27450513  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27450514 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 26116489 - 26116603
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  26116489 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 26116588  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  26116589 gaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695930
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 3695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546113
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4546113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724472
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4724472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17025129
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17025129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26777956
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 26777956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007579
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207309
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28207309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 34463425 - 34463537
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||    
T  34463425 ggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggag 34463524  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  34463525 gaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16674070 - 16673991
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16674070 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 16673991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17025379 - 17025280
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  17025379 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27485105 - 27484984
Alignment:
Q  171 tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatg 270  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || |    
T  27485105 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacg 27485006  T
Q  271 gtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  27485005 gtgggaagaacggatgctgaga 27484984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4772940 - 4772864
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4772940 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 4772864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 26116672 - 26116748
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||    
T  26116672 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgaga 26116748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 27360263 - 27360339
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27360263 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 27360339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 27450606 - 27450682
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27450606 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgaga 27450682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 34463614 - 34463690
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34463614 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 34463690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 20340436 - 20340769
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20340436 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 20340535  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
     ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20340536 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 20340635  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20340636 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 20340735  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340736 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 16208132 - 16208418
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208132 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16208231  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208232 cgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16208328  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 299  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16208329 acgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20461228 - 20460935
Alignment:
Q  17 atcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461228 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 20461129  T
Q  117 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 216  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||                     |||||||||||||| ||    
T  20461128 aactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgttgttg---------------------catttgctgaacgatgg 20461053  T
Q  217 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20461052 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcgg 20460953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28152016 - 28151845
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152016 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 28151917  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28151916 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 41793444 - 41793694
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  41793444 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 41793543  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||  || | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  41793544 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 41793643  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  41793644 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgaga 41793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28585100 - 28584805
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  28585100 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 28585001  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  28585000 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 28584901  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  |||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  28584900 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 28584805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10962789 - 10962539
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  10962789 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 10962690  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  10962689 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 10962590  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  10962589 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 10962539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51638337 - 51638087
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||||||||||  ||    
T  51638337 ggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaag 51638238  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||  || || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  51638237 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 51638138  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  51638137 gggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 51638087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15228040 - 15227716
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15228040 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagt 15227941  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15227940 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 15227841  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227840 acgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 15227741  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  15227740 acgacggaggtaactgggcagcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 24460706 - 24461039
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24460706 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 24460805  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  24460806 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 24460905  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1900427 - 1900103
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900427 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 1900328  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900327 cgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 1900228  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1900227 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 1900128  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1900127 acgacggaggtaactgggcagcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 15285029 - 15285353
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285029 gatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 15285128  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15285129 cgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctga 15285228  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15285229 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggt 15285328  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15285329 acaatggaggtaactgggcagcatt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 14235626 - 14235953
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14235626 gatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagt 14235725  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgc 206  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  14235726 cgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgc 14235825  T
Q  207 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
    ||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  14235826 tgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatact 14235925  T
Q  307 ggtacaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||    
T  14235926 ggtacggcagaggtaactgagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 15391439 - 15391764
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15391439 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 15391538  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||   | |  | |||||||| ||||||||||||    
T  15391539 cgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg---agccagcggctgttgctgcatttgctga 15391635  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
     | | |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||     
T  15391636 gcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 15391732  T
Q  307 ggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15391733 gatacggcggaggtagctgagcaacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17014163 - 17013867
Alignment:
Q  17 atcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 116  Q
    |||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  17014163 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagc 17014064  T
Q  117 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 213  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  17014063 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 17013964  T
Q  214 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 310  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  17013963 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 17013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 24592450 - 24592742
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  24592450 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 24592549  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||     
T  24592550 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccgg 24592649  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  24592650 tggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14665153 - 14664858
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  14665153 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 14665054  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14665053 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 14664954  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  14664953 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 14763440 - 14763693
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  14763440 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 14763539  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  14763540 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 14763639  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14763640 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 14763693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Original strand, 34189069 - 34189388
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  34189069 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 34189168  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 217  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  34189169 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 34189268  T
Q  218 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 317  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  34189269 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 34189368  T
Q  318 ggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || | |||||||||||||||    
T  34189369 ggaaactgagcagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24112824 - 24112506
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  24112824 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 24112725  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 217  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  24112724 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 24112625  T
Q  218 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 317  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  24112624 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 24112525  T
Q  318 ggtagctgagcagcattga 336  Q
    || | ||||||||||||||    
T  24112524 ggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6569988 - 6569738
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||| |||    
T  6569988 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggag 6569889  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  6569888 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacc 6569789  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6569788 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 6569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 36344651 - 36344901
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  36344651 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggag 36344750  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  36344751 gaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 36344850  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36344851 tggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagta 36344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14098676 - 14098381
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  14098676 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 14098577  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  14098576 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 14098477  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14098476 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 27163453 - 27163703
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  27163453 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 27163552  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  27163553 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 27163652  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27163653 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 27163703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 31126654 - 31126949
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  31126654 ggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 31126753  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  31126754 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 31126853  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31126854 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54833522 - 54833230
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  54833522 ggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggag 54833423  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  54833422 gaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 54833323  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  54833322 tggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5006008 - 5005755
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5006008 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5005909  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  5005908 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttg 5005809  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5005808 acccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 5005755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 18800749 - 18800863
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  18800749 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 18800848  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  18800849 gaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21969758 - 21969586
Alignment:
Q  123 gcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 219  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||    
T  21969758 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 21969659  T
Q  220 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21969658 tgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgaga 21969586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30753889 - 30753777
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  30753889 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 30753790  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  30753789 gaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 40105774 - 40106024
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||| |||||| |||    
T  40105774 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggag 40105873  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  40105874 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 40105973  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  40105974 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 40106024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 33673934 - 33674046
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  33673934 ggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 33674033  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  33674034 gaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  236 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattg 335  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  336 at 337  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 18800932 - 18801008
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18800932 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 18801008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753627
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 30753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 33674120 - 33674199
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33674120 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagta 33674199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9354777 - 9354444
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9354777 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 9354678  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  9354677 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 9354578  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 19659099 - 19659432
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19659099 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 19659198  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||     
T  19659199 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctgg 19659298  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44563256 - 44562923
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44563256 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 44563157  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  44563156 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 44563057  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563056 acggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 44562957  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44562956 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16283604 - 16283292
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||    
T  16283604 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagt 16283505  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgc 206  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| ||     
T  16283504 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 16283405  T
Q  207 tgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
    ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  16283404 tgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 16283305  T
Q  307 ggtacaacggagg 319  Q
    ||||| |||||||    
T  16283304 ggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 22080938 - 22081263
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22080938 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 22081037  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||| || |||||| |    |||||||| ||||||||||||    
T  22081038 cgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgt---tgctgctgctgttgagccaacggctgttgctgcatttgctga 22081134  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacg 306  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||     
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 22081231  T
Q  307 ggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22081232 gatacggcggaggtagctgagcagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33244820 - 33244649
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33244820 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 33244721  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33244720 cgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 27609000 - 27609250
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  27609000 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 27609099  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27609100 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 27609199  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609200 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 27609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Original strand, 2137354 - 2137631
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  2137354 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 2137453  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  2137454 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 2137553  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  2137554 cggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14557744 - 14557497
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  14557744 ggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggag 14557645  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||     
T  14557644 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccgg 14557545  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557544 tggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 14557497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16277681 - 16277397
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  16277681 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 16277582  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  16277581 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 16277482  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16277481 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19688218 - 19687923
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  19688218 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 19688119  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| |    |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  19688118 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacc 19688019  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  19688018 cggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18710734 - 18710411
Alignment:
Q  17 atcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 116  Q
    |||||||||||| ||| | | |||| | ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18710734 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18710635  T
Q  117 aactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacga 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |    
T  18710634 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 18710535  T
Q  214 cggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaa 313  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  |    
T  18710534 ctgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18710435  T
Q  314 cggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  18710434 cggaggcatttgagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31354644 - 31354394
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  31354644 ggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggag 31354545  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  31354544 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 31354445  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31354444 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31354394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 31489845 - 31490140
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  31489845 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 31489944  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31489945 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacc 31490044  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31490045 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19286582 - 19286290
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  |||    
T  19286582 ggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggag 19286483  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  19286482 gaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 19286383  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19286382 tggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 19208455 - 19208705
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  19208455 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 19208554  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  19208555 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 19208654  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19208655 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 28362050 - 28362300
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  28362050 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 28362149  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  28362150 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 28362249  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28362250 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28362300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19674561 - 19674308
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  19674561 ggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 19674462  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  19674461 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttg 19674362  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19674361 acccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 19674308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 3329602 - 3329716
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3329602 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 3329701  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  3329702 gaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33258843 - 33258593
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  33258843 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 33258744  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  33258743 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 33258644  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  33258643 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 33258593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 12092819 - 12092933
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  12092819 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggag 12092918  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  12092919 gaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29829451 - 29829328
Alignment:
Q  36 cggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattg 135  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || ||||||||||    
T  29829451 cggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattg 29829352  T
Q  136 gtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||  ||||||| || |||||||    
T  29829351 gtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3329864
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 3329864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518488
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 19518488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29829183
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 12093002 - 12093078
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12093002 gcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 12093078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 17993926 - 17994259
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17993926 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 17994025  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  17994026 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 17994125  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4626060 - 4625727
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4626060 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 4625961  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  4625960 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 4625861  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4625860 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 4625761  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625760 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5652503 - 5652170
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5652503 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 5652404  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     
T  5652403 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 5652304  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 16626648 - 16626972
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626648 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagt 16626747  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
     |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16626748 agggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 16626847  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626848 acgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggt 16626947  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  16626948 acgacggaggtaactgggcagcatt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18530504 - 18530186
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530504 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 18530405  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18530404 caggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 18530311  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530310 acgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 18530211  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||    
T  18530210 acgatggaggtaactgggcagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5713308 - 5713007
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5713308 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5713209  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  5713208 ggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacc 5713109  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 341  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713108 cggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 5713009  T
Q  342 at 343  Q
    ||    
T  5713008 at 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5724218 - 5723917
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5724218 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5724119  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  5724118 ggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacc 5724019  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 341  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724018 cggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 5723919  T
Q  342 at 343  Q
    ||    
T  5723918 at 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 5757259 - 5757560
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5757259 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5757358  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  5757359 ggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacc 5757458  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 341  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757459 cggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 5757558  T
Q  342 at 343  Q
    ||    
T  5757559 at 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 5768150 - 5768451
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5768150 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5768249  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  5768250 ggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacc 5768349  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 341  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768350 cggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcc 5768449  T
Q  342 at 343  Q
    ||    
T  5768450 at 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 8301444 - 8301736
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  8301444 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 8301543  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||     
T  8301544 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccgg 8301643  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||| ||||||| |  || |||||||||||    
T  8301644 tggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 15892876 - 15893178
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15892876 gaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggt 15892975  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  15892976 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 15893075  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||    
T  15893076 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcatt 15893175  T
Q  335 gat 337  Q
    |||    
T  15893176 gat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32292868 - 32292697
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292868 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 32292769  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32292768 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 31034259 - 31034430
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034259 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 31034358  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31034359 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8296060 - 8295779
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  8296060 gaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8295961  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 237  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  8295960 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 8295861  T
Q  238 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    |||||| || || ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  8295860 gacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 22387755 - 22388047
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  22387755 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggag 22387854  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  22387855 gaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccgg 22387954  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  22387955 tggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18051350 - 18051066
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  18051350 gaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 18051251  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  18051250 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18051151  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  18051150 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 4796830 - 4797080
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  4796830 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 4796929  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4796930 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacc 4797029  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4797030 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 4797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35880847 - 35880552
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  35880847 ggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 35880748  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  35880747 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 35880648  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  35880647 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 29148932 - 29149182
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  29148932 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 29149031  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  29149032 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacc 29149131  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29149132 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 29149182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18330750 - 18330460
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  18330750 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 18330651  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18330650 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 18330551  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18330550 cggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18330460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 18277229 - 18277482
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  18277229 ggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 18277328  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  18277329 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 18277428  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18277429 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18277482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 18292530 - 18292783
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  18292530 ggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 18292629  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  18292630 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 18292729  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18292730 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18292783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 18307831 - 18308084
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  18307831 ggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 18307930  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  18307931 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 18308030  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18308031 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18308084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 17985133 - 17985429
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  17985133 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 17985232  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  17985233 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 17985332  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  17985333 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32439262 - 32438944
Alignment:
Q  18 tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 117  Q
    |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  32439262 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 32439163  T
Q  118 actcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggc 217  Q
      || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||    
T  32439162 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 32439063  T
Q  218 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacgga 317  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||     
T  32439062 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 32438963  T
Q  318 ggtagctgagcagcattga 336  Q
    || | ||||||||||||||    
T  32438962 ggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4721712 - 4721417
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  4721712 ggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 4721613  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   ||||||||  || || ||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4721612 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacc 4721513  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4721512 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 4721417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4893276 - 4892999
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  4893276 ggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4893177  T
Q  160 cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactg 259  Q
    | | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4893176 catattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactg 4893077  T
Q  260 atgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  4893076 atgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6192397 - 6192102
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  6192397 ggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 6192298  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6192297 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacc 6192198  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || ||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  6192197 cggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8211819 - 8211527
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  8211819 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 8211720  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| ||  ||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||     
T  8211719 gaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccgg 8211620  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8211619 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 4346864 - 4347111
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  4346864 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 4346963  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || |     
T  4346964 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccggg 4347063  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4347064 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4347111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10396214 - 10395970
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||| |||    
T  10396214 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggag 10396115  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||   |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  10396114 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgt---acctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 10396018  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 289  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10396017 cggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 10395970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5467066 - 5466816
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  5467066 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggtataagag 5466967  T
Q  145 gaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || |||||| |   ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  |||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  5466966 gaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcc 5466867  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5466866 gggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgaga 5466816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7996643 - 7996393
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  7996643 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 7996544  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  7996543 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 7996444  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  7996443 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 7996393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10643151 - 10642901
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  10643151 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 10643052  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  10643051 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 10642952  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  10642951 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 10642901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20066109 - 20065877
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  20066109 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T
Q  160 cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactg 259  Q
      | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  20066009 tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactg 20065910  T
Q  260 atgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20065909 atgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 20065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 15741271 - 15741509
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  15741271 ggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 15741370  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||            |||  || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  15741371 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg------------gcaactgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 15741458  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15741459 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 15741509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28021356 - 28021109
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  28021356 ggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 28021257  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccga 244  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || |     
T  28021256 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccggg 28021157  T
Q  245 tggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28021156 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7073293 - 7073043
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  7073293 ggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 7073194  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  7073193 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacc 7073094  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7073093 cggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 7073043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47023534 - 47023284
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  47023534 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 47023435  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47023434 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacc 47023335  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  47023334 cggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 47023284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 28116131 - 28116384
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||    
T  28116131 ggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggag 28116230  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  28116231 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttg 28116330  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28116331 acccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28116384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 5609499 - 5609749
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5609499 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 5609598  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  5609599 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 5609698  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5609699 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5609749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 31964650 - 31964900
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  31964650 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 31964749  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  31964750 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 31964849  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31964850 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31964900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 50134248 - 50134498
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  50134248 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 50134347  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  50134348 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 50134447  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  50134448 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 50134498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18225272 - 18224977
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  18225272 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 18225173  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | |||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  18225172 ggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 18225073  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18225072 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21674774 - 21674479
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  21674774 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 21674675  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  || || | ||| || |||||||||||    
T  21674674 gaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacc 21674575  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    || |||||  || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21674574 cggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 21674479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28339383 - 28339133
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  28339383 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 28339284  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  28339283 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 28339184  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28339183 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28339133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 6542639 - 6542753
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  6542639 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 6542738  T
Q  145 gaaaggtaggtctag 159  Q
    |||| || |||||||    
T  6542739 gaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4417000 - 4416747
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  4417000 ggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 4416901  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat------gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttg 238  Q
    | || ||||| |||||||| ||||      | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| ||    
T  4416900 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctg 4416801  T
Q  239 acccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4416800 gcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4416747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 5596534 - 5596838
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  5596534 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 5596633  T
Q  145 gaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctg 232  Q
    | ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || |||||    
T  5596634 ggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctg 5596733  T
Q  233 aggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagca 332  Q
    |||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| |||    
T  5596734 aggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgca 5596833  T
Q  333 ttgat 337  Q
    |||||    
T  5596834 ttgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5013793 - 5013543
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || ||||||||||||||  |||    
T  5013793 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggag 5013694  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  5013693 gaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcc 5013594  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5013593 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 36997254 - 36997366
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  36997254 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 36997353  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  36997354 gaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665415
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 11110526 - 11110638
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  11110526 ggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 11110625  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  11110626 gaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18242820 - 18242684
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  18242820 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 18242721  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  18242720 gaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24328240 - 24327990
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  24328240 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggag 24328141  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | ||||| || || ||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  24328140 ggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 24328041  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  24328040 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 24327990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110788
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11110788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48466008 - 48465896
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  48466008 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 48465909  T
Q  145 gaaaggtaggtct 157  Q
    |||| || |||||    
T  48465908 gaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 51782104 - 51782052
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782104 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 51797197 - 51797141
Alignment:
Q  41 cttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797197 cttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22871033 - 22871148
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  22871033 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 22871132  T
Q  145 gaaaggtaggtctagc 160  Q
    |||| || ||||||||    
T  22871133 gaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22886092 - 22886207
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  22886092 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 22886191  T
Q  145 gaaaggtaggtctagc 160  Q
    |||| || ||||||||    
T  22886192 gaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 6542825 - 6542901
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6542825 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6542901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997516
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 36997516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Original strand, 20577039 - 20577160
Alignment:
Q  60 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 159  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  20577039 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 20577138  T
Q  160 cttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  20577139 tatattgatgctgctgttgttg 20577160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Original strand, 22871225 - 22871346
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 315  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  22871225 gcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 22871324  T
Q  316 gaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    |||| | |||||| ||||||||    
T  22871325 gaggcatctgagctgcattgat 22871346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Original strand, 22886284 - 22886405
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 315  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  22886284 gcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 22886383  T
Q  316 gaggtagctgagcagcattgat 337  Q
    |||| | |||||| ||||||||    
T  22886384 gaggcatctgagctgcattgat 22886405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 20577213 - 20577289
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  20577213 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 20577289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20543 - 20240
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20543 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 20444  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||                     |||||||||||||    
T  20443 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg---------------------ttgcatttgctga 20365  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20364 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 20265  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcatt 334  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  20264 acgacggaggtaactgggcagcatt 20240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30572 - 30296
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  30572 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggag 30473  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30472 gaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 30374  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  30373 cggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 129 - 312
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagt 228  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  229 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21716 - 21391
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  21716 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagt 21617  T
Q  110 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 209  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||   || |||| | |  |  ||||||||||||||||||||    
T  21616 cgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgc---tgctgttaagccagcagctgttgttgcatttgctga 21520  T
Q  210 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 309  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  21519 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 21420  T
Q  310 acaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21419 acggcggaggtagctgagaagcattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29883 - 29614
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  29883 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 29784  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  29783 ggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacc 29684  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 311  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29683 cggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtac 29614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 40198 - 40474
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggt 137  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  40198 gaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 40297  T
Q  138 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgag 234  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||    
T  40298 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgag 40397  T
Q  235 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 311  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  40398 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtac 40474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 47121 - 47371
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  47121 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggag 47220  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  47221 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 47320  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    || |||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47321 cggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27412 - 27135
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  27412 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 27313  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27312 ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacc 27213  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 319  Q
    || ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  27212 cggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 258 - 561
Alignment:
Q  38 gaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcg-gcatacaacattgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||| ||||| ||    
T  258 gaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcgg 357  T
Q  137 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctga 233  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| |||    
T  358 tatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttga 457  T
Q  234 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcat 333  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||    
T  458 ggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcat 557  T
Q  334 tgat 337  Q
    ||||    
T  558 tgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 2018 - 2103
Alignment:
Q  10 gatggacatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 95  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2018 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6132 - 6080
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6132 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5936 - 5859
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgat-agaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5936 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 5859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 338
Target Start/End: Original strand, 15066 - 15362
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||    
T  15066 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggag 15165  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    |||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  15166 gaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 15265  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 338  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  15266 cggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 7375 - 7625
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  7375 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 7474  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  7475 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 7574  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7575 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Original strand, 9202 - 9452
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  9202 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 9301  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  9302 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 9401  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9402 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 9452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20135 - 19885
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20135 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggag 20036  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc 241  Q
    | || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  20035 ggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 19936  T
Q  242 cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19935 cggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 26338 - 26474
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  |||    
T  26338 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 26437  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 181  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26438 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9686 - 9542
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||    
T  9686 ggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggag 9587  T
Q  145 gaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtg 189  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||    
T  9586 gaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggtg 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8212 - 8102
Alignment:
Q  182 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 281  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  8212 aactggcggctgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaac 8113  T
Q  282 ggatgctgaga 292  Q
    |||||||||||    
T  8112 ggatgctgaga 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8069 - 7966
Alignment:
Q  45 ggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  8069 ggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggag 7970  T
Q  145 gaaa 148  Q
    ||||    
T  7969 gaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7807
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 43 - 119
Alignment:
Q  216 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 292  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  43 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University